DECIPHERING THE SINGULARITIES OF THE UNIVERSAL BIOFILM EXOPOLISACARIDO (PNAG) AND ASSESSING ITS BIOTECHNOLOGICAL POTENTIAL (Q3152786)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3152786 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | DECIPHERING THE SINGULARITIES OF THE UNIVERSAL BIOFILM EXOPOLISACARIDO (PNAG) AND ASSESSING ITS BIOTECHNOLOGICAL POTENTIAL |
Project Q3152786 in Spain |
Statements
158,122.8 Euro
0 references
290,400.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2015
0 references
30 June 2018
0 references
UNIVERSIDAD PUBLICA DE NAVARRA
0 references
31192
0 references
LOS BIOFILMS SON CONSORCIOS DE BACTERIAS QUE CRECEN ADHERIDOS A SUPERFICIES BIOTICAS O ABIOTICAS Y RODEADOS DE UNA MATRIZ EXTRACELULAR QUE ELLOS MISMOS HAN SINTETIZADO. LA VIDA EN COMUNIDAD PRESENTA NUMEROSAS VENTAJAS RESPECTO A LA VIDA UNICELULAR: FACILITA LA RETENCION DE AGUA PROPORCIONANDO UN AMBIENTE HIDRATADO, PERMITE CONCENTRAR NUTRIENTES Y ENZIMAS EXTRACELULARES DEGRADATIVAS, ACTUA DE BARRERA PROTECTORA FRENTE A LA ACCION DE DEPREDADORES, SUSTANCIAS ANTIMICROBIANAS O EL SISTEMA INMUNE Y FACILITA EL INTERCAMBIO DE MATERIAL GENETICO. MUCHAS DE ESTAS PROPIEDADES DEPENDEN DE LA MATRIZ QUE RODEA A LA COMUNIDAD DE BACTERIAS. EL COMPONENTE MAS HABITUAL E IMPORTANTE DE LA MATRIZ DEL BIOFILM SON LOS EXOPOLISACARIDOS. DISTINTOS EXOPOLISACARIDOS SON UTILIZADOS PARA FORMAR LA MATRIZ DEL BIOFILM (CELULOSA, ALGINATO, ACIDO COLANICO), PERO SORPRENDENTEMENTE UNA AMPLIA VARIEDAD DE BACTERIAS FILOGENETICAMENTE MUY DISTANTES RECURREN AL MISMO EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETYLGLUCOSAMINE (PNAG), PARA ESTE PROPOSITO. ESTA OBSERVACION SUGIERE QUE LA MATRIZ FORMADA POR PNAG CONFIERE VENTAJAS ESPECIALES FRENTE A OTRO TIPO DE MATRICES, Y SUBRAYA LA NECESIDAD DE ESTUDIAR ESTE EXOPOLISACARIDO EN PROFUNDIDAD. EN ESTE PROYECTO, PROPONEMOS UTILIZAR LA BACTERIA PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS COMO MODELO PARA ENTENDER LAS SINGULARIDADES QUE EL PNAG TIENE PARA LA FORMACION DEL BIOFILM. PARA ELLO, PROPONEMOS ESTUDIAR LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE REGULAN LA SINTESIS Y ACTIVACION DE LA PNAG SINTASA, EL MECANISMO DE TRANSDUCCION DE SEÑAL QUE CONECTA LAS CONDICIONES AMBIENTALES CON LA PRODUCCION DE PNAG Y EL NUMERO Y LOCALIZACION DE PNAG SINTASAS EN LA MEMBRANA DE LA BACTERIA. ADEMAS, UTILIZAREMOS LA EXPRESION HETEROLOGA DE PNAG EN SALMONELLA ENTERITIDIS, UNA BACTERIA QUE CARECE DEL MISMO, PARA DESCIFRAR LAS PROPIEDADES QUE CONFIERE LA PRESENCIA DE PNAG A LA BACTERIA. FINALMENTE, DISEÑAREMOS Y VALIDAREMOS LA UTILIZACION DE PNAG PARA INDUCIR LA FORMACION DE BIOFILM MIXTOS PARA APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS. (Spanish)
0 references
BIOFILMS ARE CONSORTIA OF BACTERIA THAT GROW ATTACHED TO BIOTIC OR ABIOTIC SURFACES AND SURROUNDED BY AN EXTRACELLULAR MATRIX THAT THEY THEMSELVES HAVE SYNTHESISED. COMMUNITY LIFE HAS MANY ADVANTAGES OVER SINGLE-CELL LIFE: IT FACILITATES WATER RETENTION BY PROVIDING A HYDRATED ENVIRONMENT, ALLOWS TO CONCENTRATE NUTRIENTS AND EXTRACELLULAR DEGRADATIVE ENZYMES, ACTS AS A PROTECTIVE BARRIER AGAINST THE ACTION OF PREDATORS, ANTIMICROBIAL SUBSTANCES OR THE IMMUNE SYSTEM AND FACILITATES THE EXCHANGE OF GENETIC MATERIAL. MANY OF THESE PROPERTIES DEPEND ON THE MATRIX SURROUNDING THE COMMUNITY OF BACTERIA. THE MOST COMMON AND IMPORTANT COMPONENT OF THE BIOFILM MATRIX IS EXOPOLISACARIDS. DIFFERENT EXOPOLISACARIDS ARE USED TO FORM THE BIOFILM MATRIX (CELLULOSE, ALGINATE, COLANIC ACID), BUT SURPRISINGLY A WIDE VARIETY OF PHYLOGENETICALLY DISTANT BACTERIA RESORT TO THE SAME EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETYLGLUCOSAMINE (PNAG), FOR THIS PURPOSE. THIS OBSERVATION SUGGESTS THAT THE MATRIX FORMED BY PNAG CONFERS SPECIAL ADVANTAGES OVER OTHER TYPES OF MATRICES, AND UNDERLINES THE NEED TO STUDY THIS EXOPOLISACARIDO IN DEPTH. IN THIS PROJECT, WE PROPOSE TO USE THE BACTERIUM PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS AS A MODEL TO UNDERSTAND THE SINGULARITIES THAT PNAG HAS FOR THE FORMATION OF THE BIOFILM. FOR THIS, WE PROPOSE TO STUDY THE MOLECULAR MECHANISMS THAT REGULATE THE SYNTHESIS AND ACTIVATION OF PNAG SYNTHASE, THE MECHANISM OF SIGNAL TRANSDUCTION THAT CONNECTS THE ENVIRONMENTAL CONDITIONS WITH THE PRODUCTION OF PNAG AND THE NUMBER AND LOCATION OF PNAG SYNTHASE IN THE MEMBRANE OF THE BACTERIA. IN ADDITION, WE WILL USE THE HETEROLOGOUS EXPRESSION OF PNAG IN SALMONELLA ENTERITIDIS, A BACTERIUM THAT LACKS IT, TO DECIPHER THE PROPERTIES THAT THE PRESENCE OF PNAG CONFERS ON THE BACTERIA. FINALLY, WE WILL DESIGN AND VALIDATE THE USE OF PNAG TO INDUCE THE FORMATION OF MIXED BIOFILM FOR BIOTECHNOLOGICAL APPLICATIONS. (English)
12 October 2021
0.8319848142227044
0 references
LES BIOFILMS SONT DES CONSORTIUMS DE BACTÉRIES QUI POUSSENT ATTACHÉES À DES SURFACES BIOTIQUES OU ABIOTIQUES ET ENTOURÉES D’UNE MATRICE EXTRACELLULAIRE QU’ILS ONT ELLES-MÊMES SYNTHÉTISÉE. LA VIE COMMUNAUTAIRE PRÉSENTE DE NOMBREUX AVANTAGES PAR RAPPORT À LA VIE MONOCELLULAIRE: IL FACILITE LA RÉTENTION D’EAU EN FOURNISSANT UN ENVIRONNEMENT HYDRATÉ, PERMET DE CONCENTRER LES NUTRIMENTS ET LES ENZYMES DÉGRADANTES EXTRACELLULAIRES, AGIT COMME UNE BARRIÈRE PROTECTRICE CONTRE L’ACTION DES PRÉDATEURS, DES SUBSTANCES ANTIMICROBIENS OU DU SYSTÈME IMMUNITAIRE ET FACILITE L’ÉCHANGE DE MATÉRIEL GÉNÉTIQUE. BON NOMBRE DE CES PROPRIÉTÉS DÉPENDENT DE LA MATRICE ENTOURANT LA COMMUNAUTÉ DES BACTÉRIES. LA COMPOSANTE LA PLUS COURANTE ET LA PLUS IMPORTANTE DE LA MATRICE DE BIOFILM EST EXOPOLISACARIDS. DIFFÉRENTS EXOPOLISACARIDS SONT UTILISÉS POUR FORMER LA MATRICE DE BIOFILM (CELLULOSE, ALGINATE, ACIDE COLANIQUE), MAIS ÉTONNAMMENT, UNE GRANDE VARIÉTÉ DE BACTÉRIES PHYLOGÉNÉTIQUEMENT DISTANTES UTILISENT LA MÊME EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACÉTYLGLUCOSAMINE (PNAG), À CETTE FIN. CETTE OBSERVATION SUGGÈRE QUE LA MATRICE FORMÉE PAR PNAG CONFÈRE DES AVANTAGES PARTICULIERS PAR RAPPORT À D’AUTRES TYPES DE MATRICES ET SOULIGNE LA NÉCESSITÉ D’ÉTUDIER EN PROFONDEUR CETTE EXOPOLISACARIDO. DANS CE PROJET, NOUS PROPOSONS D’UTILISER LA BACTÉRIE PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS COMME MODÈLE POUR COMPRENDRE LES SINGULARITÉS DE PNAG POUR LA FORMATION DU BIOFILM. POUR CELA, NOUS PROPOSONS D’ÉTUDIER LES MÉCANISMES MOLÉCULAIRES QUI RÉGULENT LA SYNTHÈSE ET L’ACTIVATION DE LA PNAG SYNTHASE, LE MÉCANISME DE TRANSDUCTION DU SIGNAL QUI RELIE LES CONDITIONS ENVIRONNEMENTALES À LA PRODUCTION DE PNAG ET LE NOMBRE ET LA LOCALISATION DE LA PNAG SYNTHASE DANS LA MEMBRANE DES BACTÉRIES. EN OUTRE, NOUS UTILISERONS L’EXPRESSION HÉTÉROLOGUE DE LA PNAG CHEZ SALMONELLA ENTERITIDIS, UNE BACTÉRIE QUI EN MANQUE, POUR DÉCHIFFRER LES PROPRIÉTÉS QUE LA PRÉSENCE DE PNAG CONFÈRE À LA BACTÉRIE. ENFIN, NOUS ALLONS CONCEVOIR ET VALIDER L’UTILISATION DE PNAG POUR INDUIRE LA FORMATION DE BIOFILMS MIXTES POUR DES APPLICATIONS BIOTECHNOLOGIQUES. (French)
2 December 2021
0 references
BIOFILME SIND KONSORTIEN VON BAKTERIEN, DIE AN BIOTISCHEN ODER ABIOTISCHEN OBERFLÄCHEN BEFESTIGT WERDEN UND VON EINER EXTRAZELLULÄREN MATRIX UMGEBEN SIND, DIE SIE SELBST SYNTHETISIERT HABEN. DAS GEMEINSCHAFTSLEBEN HAT VIELE VORTEILE GEGENÜBER DEM SINGLE-CELL-LEBEN: ES ERLEICHTERT DIE WASSEREINLAGERUNG DURCH BEREITSTELLUNG EINER FEUCHTIGKEITSSPENDENDEN UMGEBUNG, ERMÖGLICHT DIE KONZENTRATION VON NÄHRSTOFFEN UND EXTRAZELLULÄREN DEGRADATIVEN ENZYMEN, WIRKT ALS SCHUTZBARRIERE GEGEN DIE WIRKUNG VON RÄUBERN, ANTIMIKROBIELLEN SUBSTANZEN ODER DEM IMMUNSYSTEM UND ERLEICHTERT DEN AUSTAUSCH VON GENETISCHEM MATERIAL. VIELE DIESER EIGENSCHAFTEN HÄNGEN VON DER MATRIX UM DIE GEMEINSCHAFT DER BAKTERIEN AB. DER HÄUFIGSTE UND WICHTIGSTE BESTANDTEIL DER BIOFILMMATRIX IST EXOPOLISACARIDS. VERSCHIEDENE EXOPOLISACARIDS WERDEN VERWENDET, UM DIE BIOFILMMATRIX (ZELLULOSE, ALGINAT, COLANIC SÄURE) ZU BILDEN, ABER ÜBERRASCHENDERWEISE GREIFEN EINE VIELZAHL VON PHYLOGENETISCH ENTFERNTEN BAKTERIEN ZU DEMSELBEN EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETYLGLUCOSAMIN (PNAG) ZURÜCK. DIESE BEOBACHTUNG DEUTET DARAUF HIN, DASS DIE VON PNAG GEBILDETE MATRIX GEGENÜBER ANDEREN MATRIZENTYPEN BESONDERE VORTEILE BIETET, UND UNTERSTREICHT DIE NOTWENDIGKEIT, DIESE EXOPOLISACARIDO EINGEHEND ZU UNTERSUCHEN. IN DIESEM PROJEKT SCHLAGEN WIR VOR, DAS BAKTERIUM PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS ALS MODELL ZU VERWENDEN, UM DIE SINGULARITÄTEN ZU VERSTEHEN, DIE PNAG FÜR DIE BILDUNG DES BIOFILMS HAT. DAZU SCHLAGEN WIR VOR, DIE MOLEKULAREN MECHANISMEN ZU UNTERSUCHEN, DIE DIE SYNTHESE UND AKTIVIERUNG VON PNAG-SYNTHASE REGULIEREN, DEN MECHANISMUS DER SIGNALTRANSDUKTION, DER DIE UMWELTBEDINGUNGEN MIT DER HERSTELLUNG VON PNAG UND DER ANZAHL UND LAGE DER PNAG-SYNTHASE IN DER MEMBRAN DER BAKTERIEN VERBINDET. DARÜBER HINAUS WERDEN WIR DIE HETEROLOGE EXPRESSION VON PNAG IN SALMONELLA ENTERITIDIS, EINEM BAKTERIUM, DAS ES FEHLT, VERWENDEN, UM DIE EIGENSCHAFTEN ZU ENTSCHLÜSSELN, DIE DAS VORHANDENSEIN VON PNAG DEN BAKTERIEN VERLEIHT. SCHLIESSLICH WERDEN WIR DIE VERWENDUNG VON PNAG ENTWERFEN UND VALIDIEREN, UM DIE BILDUNG VON GEMISCHTEN BIOFILMEN FÜR BIOTECHNOLOGISCHE ANWENDUNGEN INDUZIEREN ZU KÖNNEN. (German)
9 December 2021
0 references
BIOFILMS ZIJN CONSORTIA VAN BACTERIËN DIE GROEIEN GEHECHT AAN BIOTISCHE OF ABIOTISCHE OPPERVLAKKEN EN OMGEVEN DOOR EEN EXTRACELLULAIRE MATRIX DIE ZE ZELF HEBBEN GESYNTHETISEERD. HET GEMEENSCHAPSLEVEN HEEFT VELE VOORDELEN TEN OPZICHTE VAN HET EENCELLIGE LEVEN: HET VERGEMAKKELIJKT HET VASTHOUDEN VAN WATER DOOR EEN GEHYDRATEERDE OMGEVING TE BIEDEN, MAAKT HET MOGELIJK VOEDINGSSTOFFEN EN EXTRACELLULAIRE AFBRAAKENZYMEN TE CONCENTREREN, FUNGEERT ALS EEN BESCHERMENDE BARRIÈRE TEGEN DE WERKING VAN ROOFDIEREN, ANTIMICROBIËLE STOFFEN OF HET IMMUUNSYSTEEM EN VERGEMAKKELIJKT DE UITWISSELING VAN GENETISCH MATERIAAL. VEEL VAN DEZE EIGENSCHAPPEN ZIJN AFHANKELIJK VAN DE MATRIX ROND DE GEMEENSCHAP VAN BACTERIËN. DE MEEST VOORKOMENDE EN BELANGRIJKSTE COMPONENT VAN DE BIOFILMMATRIX IS EXOPOLISACARIDS. VERSCHILLENDE EXOPOLISACARIDS WORDEN GEBRUIKT OM DE BIOFILMMATRIX (CELLULOSE, ALGINAAT, COLANIC ZUUR) TE VORMEN, MAAR VERRASSEND GENOEG IS EEN GROTE VERSCHEIDENHEID AAN FYLOGENETISCH VERRE BACTERIËN TOEVLUCHT TOT DEZELFDE EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETYLGLUCOSAMINE (PNAG), VOOR DIT DOEL. DEZE CONSTATERING SUGGEREERT DAT DE DOOR PNAG GEVORMDE MATRIX SPECIALE VOORDELEN BIEDT TEN OPZICHTE VAN ANDERE SOORTEN MATRICES, EN ONDERSTREEPT DE NOODZAAK OM DEZE EXOPOLISACARIDO GRONDIG TE BESTUDEREN. IN DIT PROJECT STELLEN WE VOOR OM DE BACTERIE PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS ALS MODEL TE GEBRUIKEN OM DE SINGULARITEITEN TE BEGRIJPEN DIE PNAG HEEFT VOOR DE VORMING VAN DE BIOFILM. HIERVOOR STELLEN WE VOOR OM DE MOLECULAIRE MECHANISMEN TE BESTUDEREN DIE DE SYNTHESE EN ACTIVERING VAN PNAG SYNTHASE REGULEREN, HET MECHANISME VAN SIGNAALTRANSDUCTIE DAT DE OMGEVINGSOMSTANDIGHEDEN VERBINDT MET DE PRODUCTIE VAN PNAG EN HET AANTAL EN DE LOCATIE VAN PNAG-SYNTHASE IN HET MEMBRAAN VAN DE BACTERIËN. DAARNAAST ZULLEN WE DE HETEROGENE EXPRESSIE VAN PNAG GEBRUIKEN IN SALMONELLA ENTERITIDIS, EEN BACTERIE DIE HET MIST, OM DE EIGENSCHAPPEN TE ONTCIJFEREN DIE DE AANWEZIGHEID VAN PNAG AAN DE BACTERIËN VERLEENT. TOT SLOT ZULLEN WE HET GEBRUIK VAN PNAG ONTWERPEN EN VALIDEREN OM DE VORMING VAN GEMENGDE BIOFILM VOOR BIOTECHNOLOGISCHE TOEPASSINGEN TE INDUCEREN. (Dutch)
17 December 2021
0 references
I BIOFILM SONO CONSORZI DI BATTERI CHE CRESCONO ATTACCATI A SUPERFICI BIOTICHE O ABIOTICHE E CIRCONDATI DA UNA MATRICE EXTRACELLULARE CHE ESSI STESSI HANNO SINTETIZZATO. LA VITA COMUNITARIA PRESENTA MOLTI VANTAGGI RISPETTO ALLA VITA MONOCELLULARE: FACILITA LA RITENZIONE IDRICA FORNENDO UN AMBIENTE IDRATATO, PERMETTE DI CONCENTRARE NUTRIENTI ED ENZIMI DEGRADATIVI EXTRACELLULARI, FUNGE DA BARRIERA PROTETTIVA CONTRO L'AZIONE DEI PREDATORI, DELLE SOSTANZE ANTIMICROBICHE O DEL SISTEMA IMMUNITARIO E FACILITA LO SCAMBIO DI MATERIALE GENETICO. MOLTE DI QUESTE PROPRIETÀ DIPENDONO DALLA MATRICE CHE CIRCONDA LA COMUNITÀ DEI BATTERI. LA COMPONENTE PIÙ COMUNE E IMPORTANTE DELLA MATRICE DI BIOFILM È EXOPOLISACARIDS. DIVERSI EXOPOLISACARIDS SONO UTILIZZATI PER FORMARE LA MATRICE BIOFILM (CELLULOSA, ALGINATO, ACIDO COLANIC), MA SORPRENDENTEMENTE UN'AMPIA VARIETÀ DI BATTERI FILOGENETICAMENTE DISTANTI RICORRERE ALLO STESSO EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETILGLUCOSAMINA (PNAG), A QUESTO SCOPO. QUESTA OSSERVAZIONE SUGGERISCE CHE LA MATRICE FORMATA DAL PNAG CONFERISCE VANTAGGI SPECIALI RISPETTO AD ALTRI TIPI DI MATRICI E SOTTOLINEA LA NECESSITÀ DI STUDIARE APPROFONDITAMENTE QUESTO EXOPOLISACARIDO. IN QUESTO PROGETTO, PROPONIAMO DI UTILIZZARE IL BATTERIO PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS COME MODELLO PER COMPRENDERE LE SINGOLARITÀ CHE PNAG HA PER LA FORMAZIONE DEL BIOFILM. PER QUESTO, PROPONIAMO DI STUDIARE I MECCANISMI MOLECOLARI CHE REGOLANO LA SINTESI E L'ATTIVAZIONE DELLA PNAG SINTASI, IL MECCANISMO DI TRASDUZIONE DEL SEGNALE CHE COLLEGA LE CONDIZIONI AMBIENTALI CON LA PRODUZIONE DI PNAG E IL NUMERO E LA POSIZIONE DELLA PNAG SINTASI NELLA MEMBRANA DEI BATTERI. INOLTRE, USEREMO L'ESPRESSIONE ETEROLOGO DEL PNAG NELLA SALMONELLA ENTERITIDIS, UN BATTERIO CHE NE MANCA, PER DECIFRARE LE PROPRIETÀ CHE LA PRESENZA DI PNAG CONFERISCE AI BATTERI. INFINE, PROGETTEREMO E CONVALIDAREMO L'USO DI PNAG PER INDURRE LA FORMAZIONE DI BIOFILM MISTI PER APPLICAZIONI BIOTECNOLOGICHE. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΟΙ ΒΙΟΜΕΜΒΡΆΝΕΣ ΕΊΝΑΙ ΚΟΙΝΟΠΡΑΞΊΕΣ ΒΑΚΤΗΡΊΩΝ ΠΟΥ ΑΝΑΠΤΎΣΣΟΝΤΑΙ ΠΡΟΣΑΡΤΗΜΈΝΑ ΣΕ ΒΙΟΤΙΚΈΣ Ή ΑΒΙΟΤΙΚΈΣ ΕΠΙΦΆΝΕΙΕΣ ΚΑΙ ΠΕΡΙΒΆΛΛΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΜΙΑ ΕΞΩΚΥΤΤΑΡΙΚΉ ΜΉΤΡΑ ΠΟΥ ΟΙ ΊΔΙΟΙ ΈΧΟΥΝ ΣΥΝΘΈΣΕΙ. Η ΚΟΙΝΟΤΙΚΉ ΖΩΉ ΈΧΕΙ ΠΟΛΛΆ ΠΛΕΟΝΕΚΤΉΜΑΤΑ ΣΕ ΣΧΈΣΗ ΜΕ ΤΗ ΖΩΉ ΕΝΌΣ ΚΥΤΤΆΡΟΥ: ΔΙΕΥΚΟΛΎΝΕΙ ΤΗΝ ΚΑΤΑΚΡΆΤΗΣΗ ΝΕΡΟΎ ΠΑΡΈΧΟΝΤΑΣ ΕΝΥΔΑΤΩΜΈΝΟ ΠΕΡΙΒΆΛΛΟΝ, ΕΠΙΤΡΈΠΕΙ ΤΗ ΣΥΓΚΈΝΤΡΩΣΗ ΘΡΕΠΤΙΚΏΝ ΟΥΣΙΏΝ ΚΑΙ ΕΞΩΚΥΤΤΑΡΙΚΏΝ ΑΠΟΙΚΟΔΟΜΗΤΙΚΏΝ ΕΝΖΎΜΩΝ, ΛΕΙΤΟΥΡΓΕΊ ΩΣ ΠΡΟΣΤΑΤΕΥΤΙΚΌ ΕΜΠΌΔΙΟ ΚΑΤΆ ΤΗΣ ΔΡΆΣΗΣ ΤΩΝ ΘΗΡΕΥΤΏΝ, ΤΩΝ ΑΝΤΙΜΙΚΡΟΒΙΑΚΏΝ ΟΥΣΙΏΝ Ή ΤΟΥ ΑΝΟΣΟΠΟΙΗΤΙΚΟΎ ΣΥΣΤΉΜΑΤΟΣ ΚΑΙ ΔΙΕΥΚΟΛΎΝΕΙ ΤΗΝ ΑΝΤΑΛΛΑΓΉ ΓΕΝΕΤΙΚΟΎ ΥΛΙΚΟΎ. ΠΟΛΛΈΣ ΑΠΌ ΑΥΤΈΣ ΤΙΣ ΙΔΙΌΤΗΤΕΣ ΕΞΑΡΤΏΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΗ ΜΉΤΡΑ ΓΎΡΩ ΑΠΌ ΤΗΝ ΚΟΙΝΌΤΗΤΑ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΊΩΝ. ΤΟ ΠΙΟ ΚΟΙΝΌ ΚΑΙ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌ ΣΥΣΤΑΤΙΚΌ ΤΗΣ ΜΉΤΡΑΣ ΒΙΟΜΕΜΒΡΑΝΏΝ ΕΊΝΑΙ ΤΟ EXOPOLISACARIDS. ΓΙΑ ΤΟ ΣΚΟΠΌ ΑΥΤΌ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΎΝΤΑΙ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΕΞΟΠΛΙΣΕΣCARIDS ΓΙΑ ΝΑ ΣΧΗΜΑΤΊΣΟΥΝ ΤΗ ΜΉΤΡΑ ΒΙΟΦΊΛΜ (ΚΥΤΤΑΡΊΝΗ, ΑΛΓΙΝΙΚΌ ΟΞΎ, ΚΟΛΑΝΙΚΌ ΟΞΎ), ΑΛΛΆ ΕΚΠΛΗΚΤΙΚΆ ΜΙΑ ΜΕΓΆΛΗ ΠΟΙΚΙΛΊΑ ΑΠΌ ΦΥΛΟΓΕΝΕΤΙΚΆ ΜΑΚΡΙΝΆ ΒΑΚΤΉΡΙΑ ΚΑΤΑΦΕΎΓΟΥΝ ΣΤΗΝ ΊΔΙΑ EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ΑΚΕΤΥΛΟΓΛΥΚΟΖΑΜΊΝΗ (PNAG), ΓΙΑ ΤΟ ΣΚΟΠΌ ΑΥΤΌ. Η ΠΑΡΑΤΉΡΗΣΗ ΑΥΤΉ ΥΠΟΔΗΛΏΝΕΙ ΌΤΙ Ο ΠΊΝΑΚΑΣ ΠΟΥ ΣΧΗΜΑΤΊΖΕΤΑΙ ΑΠΌ ΤΗΝ PNAG ΠΑΡΈΧΕΙ ΕΙΔΙΚΆ ΠΛΕΟΝΕΚΤΉΜΑΤΑ ΣΕ ΣΧΈΣΗ ΜΕ ΆΛΛΟΥΣ ΤΎΠΟΥΣ ΜΗΤΡΏΝ ΚΑΙ ΥΠΟΓΡΑΜΜΊΖΕΙ ΤΗΝ ΑΝΆΓΚΗ ΝΑ ΜΕΛΕΤΗΘΕΊ ΣΕ ΒΆΘΟΣ ΑΥΤΌ ΤΟ EXOPOLISACARIDO. ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΈΡΓΟ, ΠΡΟΤΕΊΝΟΥΜΕ ΝΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΕΊ ΤΟ ΒΑΚΤΉΡΙΟ PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS ΩΣ ΜΟΝΤΈΛΟ ΓΙΑ ΤΗΝ ΚΑΤΑΝΌΗΣΗ ΤΩΝ ΙΔΙΑΙΤΕΡΟΤΉΤΩΝ ΠΟΥ ΈΧΕΙ Η PNAG ΓΙΑ ΤΟ ΣΧΗΜΑΤΙΣΜΌ ΤΗΣ ΒΙΟΜΕΜΒΡΑΝΉΣ. ΓΙΑ ΤΟ ΣΚΟΠΌ ΑΥΤΌ, ΠΡΟΤΕΊΝΟΥΜΕ ΝΑ ΜΕΛΕΤΗΘΟΎΝ ΟΙ ΜΟΡΙΑΚΟΊ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ ΠΟΥ ΡΥΘΜΊΖΟΥΝ ΤΗ ΣΎΝΘΕΣΗ ΚΑΙ ΤΗΝ ΕΝΕΡΓΟΠΟΊΗΣΗ ΤΗΣ ΣΥΝΘΆΣΗΣ PNAG, Ο ΜΗΧΑΝΙΣΜΌΣ ΜΕΤΑΓΩΓΉΣ ΣΉΜΑΤΟΣ ΠΟΥ ΣΥΝΔΈΕΙ ΤΙΣ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΜΕ ΤΗΝ ΠΑΡΑΓΩΓΉ PNAG ΚΑΙ ΤΟΝ ΑΡΙΘΜΌ ΚΑΙ ΤΗ ΘΈΣΗ ΤΗΣ ΣΥΝΘΆΣΗΣ PNAG ΣΤΗ ΜΕΜΒΡΆΝΗ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΊΩΝ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΉΣΟΥΜΕ ΤΗΝ ΕΤΕΡΌΛΟΓΗ ΈΚΦΡΑΣΗ ΤΟΥ PNAG ΣΤΗ SALMONELLA ENTERITIDIS, ΈΝΑ ΒΑΚΤΉΡΙΟ ΠΟΥ ΤΟΥ ΛΕΊΠΕΙ, ΓΙΑ ΝΑ ΑΠΟΚΡΥΠΤΟΓΡΑΦΉΣΟΥΜΕ ΤΙΣ ΙΔΙΌΤΗΤΕΣ ΠΟΥ ΠΡΟΣΔΊΔΕΙ Η ΠΑΡΟΥΣΊΑ PNAG ΣΤΑ ΒΑΚΤΉΡΙΑ. ΤΈΛΟΣ, ΘΑ ΣΧΕΔΙΆΣΟΥΜΕ ΚΑΙ ΘΑ ΕΠΙΚΥΡΏΣΟΥΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΤΟΥ PNAG ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΡΌΚΛΗΣΗ ΤΟΥ ΣΧΗΜΑΤΙΣΜΟΎ ΜΙΚΤΏΝ ΒΙΟΜΕΜΒΡΑΝΏΝ ΓΙΑ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΈΣ ΕΦΑΡΜΟΓΈΣ. (Greek)
17 August 2022
0 references
BIOFILM ER KONSORTIER AF BAKTERIER, DER VOKSER KNYTTET TIL BIOTISKE ELLER ABIOTISKE OVERFLADER OG OMGIVET AF EN EKSTRACELLULÆR MATRIX, SOM DE SELV HAR SYNTETISERET. LIVET I FÆLLESSKABET HAR MANGE FORDELE I FORHOLD TIL ENCELLET LIV: DET LETTER VÆSKEOPHOBNING VED AT SKABE ET HYDRERET MILJØ, GØR DET MULIGT AT KONCENTRERE NÆRINGSSTOFFER OG EKSTRACELLULÆRE NEDBRYDENDE ENZYMER, FUNGERER SOM EN BESKYTTENDE BARRIERE MOD VIRKNINGEN AF ROVDYR, ANTIMIKROBIELLE STOFFER ELLER IMMUNSYSTEMET OG LETTER UDVEKSLINGEN AF GENETISK MATERIALE. MANGE AF DISSE EGENSKABER AFHÆNGER AF MATRICEN OMKRING BAKTERIEFÆLLESSKABET. DEN MEST ALMINDELIGE OG VIGTIGSTE KOMPONENT I BIOFILMMATRIXEN ER EXOPOLISACARIDS. FORSKELLIGE EXOPOLISACARIDS ANVENDES TIL AT DANNE BIOFILMMATRIXEN (CELLULOSE, ALGINAT, COLANIC SYRE), MEN OVERRASKENDE NOK EN BRED VIFTE AF PHYLOGENETISK FJERNE BAKTERIER TY TIL DEN SAMME EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETYLGLUCOSAMIN (PNAG), TIL DETTE FORMÅL. DENNE OBSERVATION TYDER PÅ, AT DEN MATRIX, DER DANNES AF PNAG, GIVER SÆRLIGE FORDELE I FORHOLD TIL ANDRE TYPER MATRICER, OG UNDERSTREGER BEHOVET FOR AT UNDERSØGE DETTE EXOPOLISACARIDO INDGÅENDE. I DETTE PROJEKT FORESLÅR VI AT BRUGE BAKTERIEN PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS SOM MODEL TIL AT FORSTÅ DE SINGULARITETER, SOM PNAG HAR FOR DANNELSEN AF BIOFILMEN. TIL DETTE FORESLÅR VI AT STUDERE DE MOLEKYLÆRE MEKANISMER, DER REGULERER SYNTESEN OG AKTIVERINGEN AF PNAG SYNTHASE, MEKANISMEN FOR SIGNALTRANSDUKTION, DER FORBINDER MILJØFORHOLDENE MED PRODUKTIONEN AF PNAG OG ANTALLET OG PLACERINGEN AF PNAG-SYNTASE I BAKTERIERNES MEMBRAN. DERUDOVER VIL VI BRUGE DET HETEROLOGE UDTRYK AF PNAG I SALMONELLA ENTERITIDIS, EN BAKTERIE, DER MANGLER DET, TIL AT DECHIFRERE DE EGENSKABER, SOM TILSTEDEVÆRELSEN AF PNAG GIVER BAKTERIERNE. ENDELIG VIL VI DESIGNE OG VALIDERE BRUGEN AF PNAG TIL AT FREMKALDE DANNELSEN AF BLANDET BIOFILM TIL BIOTEKNOLOGISKE ANVENDELSER. (Danish)
17 August 2022
0 references
BIOKALVOT OVAT BAKTEERIEN KONSORTIOITA, JOTKA KASVAVAT KIINNITTYNEENÄ BIOOTTISIIN TAI ABIOOTTISIIN PINTOIHIN JA YMPÄRÖIVÄT SOLUNULKOISTA MATRIISIA, JONKA NE ITSE OVAT SYNTETISOINEET. YHTEISÖELÄMÄLLÄ ON MONIA ETUJA YHDEN SOLUN ELÄMÄÄN VERRATTUNA: SE HELPOTTAA VEDENPIDÄTYSTÄ TARJOAMALLA SAMMUTETUN YMPÄRISTÖN, MAHDOLLISTAA RAVINTEIDEN JA SOLUNULKOISTEN HAJOAVIEN ENTSYYMIEN KONSENTRAATIN, TOIMII SUOJAAVANA ESTEENÄ PETOELÄINTEN, MIKROBILÄÄKKEIDEN TAI IMMUUNIJÄRJESTELMÄN TOIMINNALLE JA HELPOTTAA GENEETTISEN MATERIAALIN VAIHTOA. MONET NÄISTÄ OMINAISUUKSISTA RIIPPUVAT BAKTEERIYHTEISÖÄ YMPÄRÖIVÄSTÄ MATRIISISTA. BIOFILMIMATRIISIN YLEISIN JA TÄRKEIN KOMPONENTTI ON EXOPOLISACARIDS. BIOKALVOMATRIISIN (SELLULOOSA, ALGINAATTI, COLANIC-HAPPO) MUODOSTAMISEEN KÄYTETÄÄN ERILAISIA EXOPOLISACARIDS-YHDISTEITÄ, MUTTA YLLÄTTÄVÄN MONENLAISIA FYLOGENETTISESTI KAUKAISIA BAKTEEREJA KÄYTETÄÄN SAMAAN EXOPOLISACARIDOON, -1,6-N-ASETYYLIGLUKOSAMIINIIN (PNAG), TÄTÄ TARKOITUSTA VARTEN. TÄMÄ HAVAINTO VIITTAA SIIHEN, ETTÄ PNAG:N MUODOSTAMA MATRIISI ANTAA ERITYISIÄ ETUJA MUIHIN MATRIISITYYPPEIHIN VERRATTUNA, JA KOROSTAA TARVETTA TUTKIA TÄTÄ EXOPOLISACARIDOA PERUSTEELLISESTI. TÄSSÄ HANKKEESSA EHDOTAMME, ETTÄ KÄYTÄMME PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS -BAKTEERIA MALLINA YMMÄRTÄÄKSEMME PNAG: N BIOFILMIN MUODOSTUMISEN SINGULARITEETIT. TÄTÄ VARTEN EHDOTAMME, ETTÄ TUTKITAAN MOLEKYYLIMEKANISMEJA, JOTKA SÄÄTELEVÄT PNAG-SYNTAASIN SYNTEESIÄ JA AKTIVOINTIA, SIGNAALIN TRANSDUKTIOMEKANISMIA, JOKA YHDISTÄÄ YMPÄRISTÖOLOSUHTEET PNAG: N TUOTANTOON JA PNAG-SYNTAASIN LUKUMÄÄRÄÄ JA SIJAINTIA BAKTEERIEN KALVOSSA. LISÄKSI KÄYTÄMME PNAG: N HETEROLOGISTA ILMAISUA SALMONELLA ENTERITIDIS -BAKTEERISSA, JOLLA EI OLE SITÄ, JOTTA VOIMME TULKITA OMINAISUUKSIA, JOITA PNAG: N ESIINTYMINEN ANTAA BAKTEEREILLE. LOPUKSI SUUNNITTELEMME JA VAHVISTAMME PNAG:N KÄYTÖN BIOTEKNOLOGIAN SOVELLUKSIIN SEKOITETUN BIOKALVON MUODOSTUMISEN KANNUSTAMISEKSI. (Finnish)
17 August 2022
0 references
IL-BIJOFILMS HUMA KONSORZJI TA’ BATTERJI LI JIKBRU MWAĦĦLIN MA’ UĊUĦ BIJOTIĊI JEW ABIJOTIĊI U MDAWRIN B’MATRIĊI EKSTRAĊELLULARI LI HUMA STESS IKUNU SINTETIZZATI. IL-ĦAJJA KOMUNITARJA GĦANDHA ĦAFNA VANTAĠĠI FUQ IL-ĦAJJA TA’ ĊELLULA WAĦDA: DAN JIFFAĊILITA Ż-ŻAMMA TAL-ILMA BILLI JIPPROVDI AMBJENT IDRATAT, JIPPERMETTI L-KONĊENTRAZZJONI TAN-NUTRIJENTI U L-ENZIMI DEGRADATTIVI EXTRAĊELLULARI, JAĠIXXI BĦALA OSTAKLU PROTETTIV KONTRA L-AZZJONI TAL-PREDATURI, IS-SUSTANZI ANTIMIKROBIĊI JEW IS-SISTEMA IMMUNITARJA U JIFFAĊILITA L-ISKAMBJU TA’ MATERJAL ĠENETIKU. ĦAFNA MINN DAWN IL-PROPRJETAJIET JIDDEPENDU FUQ IL-MATRIĊI MADWAR IL-KOMUNITÀ TAL-BATTERJI. L-AKTAR KOMPONENT KOMUNI U IMPORTANTI TAL-MATRIĊI TA’ BIJORITA HUWA EXOPOLISACARIDS. JINTUŻAW EXOPOLISACARIDS DIFFERENTI BIEX JIFFURMAW IL-MATRIĊI TAL-BIJORITA (ĊELLULOŻA, ALĠINAT, AĊIDU COLANIC), IŻDA SORPRENDENTEMENT VARJETÀ WIESGĦA TA’ BATTERJI FILOĠENETIKAMENT IMBIEGĦDA JIRRIKORRU GĦALL-ISTESS EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETYLGLUCOSAMINE (PNAG), GĦAL DAN IL-GĦAN. DIN L-OSSERVAZZJONI TISSUĠĠERIXXI LI L-MATRIĊI FFURMATA MILL-PNAG TAGĦTI VANTAĠĠI SPEĊJALI FUQ TIPI OĦRA TA’ MATRIĊI, U TENFASIZZA L-ĦTIEĠA LI DIN L-EXOPOLISACARIDO TIĠI STUDJATA FIL-FOND. F’DAN IL-PROĠETT, NIPPROPONU LI NUŻAW IL-BATTERJU PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS BĦALA MUDELL BIEX NIFHMU S-SINGULARITAJIET LI L-PNAG GĦANDHA GĦALL-FORMAZZJONI TAL-BIJORITA. GĦAL DAN, AĦNA NIPPROPONU LI NISTUDJAW IL-MEKKANIŻMI MOLEKULARI LI JIRREGOLAW IS-SINTEŻI U L-ATTIVAZZJONI TAS-SINTAŻI TA’ PNAG, IL-MEKKANIŻMU TA’ TRASDUZZJONI TAS-SINJALI LI JGĦAQQAD IL-KUNDIZZJONIJIET AMBJENTALI MAL-PRODUZZJONI TA’ PNAG U N-NUMRU U L-POST TAS-SINTAŻI PNAG FIL-MEMBRANA TAL-BATTERJI. BARRA MINN HEKK, SE NUŻAW L-ESPRESSJONI ETEROLOGA TA’ PNAG FIS-SALMONELLA ENTERITIDIS, BATTERJU LI M’GĦANDUX DAN, BIEX NIDDEĊIFRAW IL-PROPRJETAJIET LI L-PREŻENZA TA’ PNAG TAGĦTI FUQ IL-BATTERJI. FL-AĦĦAR NETT, AĦNA SE NIDDISINJAW U NIVVALIDAW L-UŻU TAL-PNAG BIEX NINDUĊU L-FORMAZZJONI TA’ BIJOFILM IMĦALLAT GĦAL APPLIKAZZJONIJIET BIJOTEKNOLOĠIĊI. (Maltese)
17 August 2022
0 references
BIOFILMAS IR BAKTĒRIJU KONSORCIJI, KAS AUG PIE BIOTISKĀM VAI ABIOTISKĀM VIRSMĀM UN KO IESKAUJ EKSTRACELULĀRA MATRICA, KURU TIE PAŠI SINTEZĒTI. KOPIENAS DZĪVEI IR DAUDZ PRIEKŠROCĪBU SALĪDZINĀJUMĀ AR VIENŠŪNU DZĪVI: TAS ATVIEGLO ŪDENS AIZTURI, NODROŠINOT HIDRATĒTU VIDI, ĻAUJ KONCENTRĒT BARĪBAS VIELAS UN EKSTRACELULĀROS NOĀRDĪŠANĀS FERMENTUS, DARBOJAS KĀ AIZSARGBARJERA PRET PLĒSĒJU, PRETMIKROBU VIELU VAI IMŪNSISTĒMAS DARBĪBU UN VEICINA ĢENĒTISKĀ MATERIĀLA APMAIŅU. DAUDZAS NO ŠĪM ĪPAŠĪBĀM IR ATKARĪGAS NO MATRICAS, KAS APTVER BAKTĒRIJU KOPIENU. VISBIEŽĀK SASTOPAMĀ UN SVARĪGĀKĀ BIOFILMAS MATRICAS SASTĀVDAĻA IR EXOPOLISACARIDS. BIOPLĒVES MATRICI (CELULOZE, ALGINĀTS, COLANIC SKĀBE) VEIDO DAŽĀDAS EXOPOLISACARIDS, BET PĀRSTEIDZOŠI, KA ŠIM NOLŪKAM DAŽĀDAS FILOGĒNISKI ATTĀLAS BAKTĒRIJAS IZMANTO VIENU UN TO PAŠU EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETILGLIKOZAMĪNU (PNAG). ŠIS NOVĒROJUMS LIECINA, KA PNAG IZVEIDOTĀ MATRICA PIEŠĶIR ĪPAŠAS PRIEKŠROCĪBAS SALĪDZINĀJUMĀ AR CITIEM MATRICU VEIDIEM, UN UZSVER NEPIECIEŠAMĪBU PADZIĻINĀTI IZPĒTĪT ŠO EXOPOLISACARIDO. ŠAJĀ PROJEKTĀ MĒS IEROSINĀM IZMANTOT BAKTĒRIJU PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS KĀ MODELI, LAI IZPRASTU PNAG RAKSTURĪGĀS ĪPATNĪBAS BIOPLĒVES VEIDOŠANĀ. ŠIM NOLŪKAM MĒS IEROSINĀM PĒTĪT MOLEKULĀROS MEHĀNISMUS, KAS REGULĒ PNAG SINTĀZES SINTĒZI UN AKTIVIZĒŠANU, SIGNĀLU TRANSDUKCIJAS MEHĀNISMU, KAS SAVIENO VIDES APSTĀKĻUS AR PNAG RAŽOŠANU UN PNAG SINTĀZES SKAITU UN ATRAŠANĀS VIETU BAKTĒRIJU MEMBRĀNĀ. TURKLĀT, LAI ATŠIFRĒTU ĪPAŠĪBAS, KO PNAG KLĀTBŪTNE PIEŠĶIR BAKTĒRIJĀM, MĒS IZMANTOSIM PNAG HETEROLOGO IZTEIKSMI SALMONELLA ENTERITIDIS — BAKTĒRIJAI. VISBEIDZOT, MĒS IZSTRĀDĀSIM UN VALIDĒSIM PNAG IZMANTOŠANU, LAI STIMULĒTU JAUKTAS BIOPLĒVES VEIDOŠANOS BIOTEHNOLOĢISKIEM LIETOJUMIEM. (Latvian)
17 August 2022
0 references
BIOFILMY SÚ KONZORCIÁ BAKTÉRIÍ, KTORÉ RASTÚ PRIPOJENÉ K BIOTICKÝM ALEBO ABIOTICKÝM POVRCHOM A OBKLOPENÉ EXTRACELULÁRNOU MATICOU, KTORÚ SAMOTNÉ SYNTETIZOVALI. KOMUNITNÝ ŽIVOT MÁ MNOHO VÝHOD V POROVNANÍ S JEDNOBUNKOVÝM ŽIVOTOM: UĽAHČUJE ZADRŽIAVANIE VODY TÝM, ŽE POSKYTUJE HYDRATOVANÉ PROSTREDIE, UMOŽŇUJE SÚSTREDIŤ ŽIVINY A EXTRACELULÁRNE DEGRADAČNÉ ENZÝMY, PÔSOBÍ AKO OCHRANNÁ BARIÉRA PROTI PÔSOBENIU DRAVCOV, ANTIMIKROBIÁLNYCH LÁTOK ALEBO IMUNITNÉHO SYSTÉMU A UĽAHČUJE VÝMENU GENETICKÉHO MATERIÁLU. MNOHÉ Z TÝCHTO VLASTNOSTÍ ZÁVISIA OD MATRICE, KTORÁ OBKLOPUJE SPOLOČENSTVO BAKTÉRIÍ. NAJBEŽNEJŠOU A NAJDÔLEŽITEJŠOU ZLOŽKOU BIOFILMOVEJ MATRICE SÚ EXOPOLISACARIDS. RÔZNE EXOPOLISACARIDS SA POUŽÍVAJÚ NA VYTVORENIE BIOFILMOVEJ MATRICE (CELULÓZA, ALGINÁT, KYSELINA COLANIC), ALE PREKVAPIVO SA ŠIROKÁ ŠKÁLA FYLOGENETICKY VZDIALENÝCH BAKTÉRIÍ UCHYĽUJE K ROVNAKÉMU EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETYLGLUKOZAMÍNU (PNAG). TOTO ZISTENIE NAZNAČUJE, ŽE MATICA VYTVORENÁ PNAG POSKYTUJE OSOBITNÉ VÝHODY OPROTI INÝM DRUHOM MATRÍC, A ZDÔRAZŇUJE POTREBU DÔKLADNE PRESKÚMAŤ TOTO EXOPOLISACARIDO. V TOMTO PROJEKTE NAVRHUJEME POUŽIŤ BAKTÉRIU PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS AKO MODEL NA POCHOPENIE SINGULARÍT, KTORÉ MÁ PNAG NA TVORBU BIOFILMU. PRETO NAVRHUJEME ŠTUDOVAŤ MOLEKULÁRNE MECHANIZMY, KTORÉ REGULUJÚ SYNTÉZU A AKTIVÁCIU PNAG SYNTÁZY, MECHANIZMUS PRENOSU SIGNÁLU, KTORÝ SPÁJA PODMIENKY PROSTREDIA S PRODUKCIOU PNAG A POČTOM A UMIESTNENÍM PNAG SYNTÁZY V MEMBRÁNE BAKTÉRIÍ. OKREM TOHO POUŽIJEME HETEROLÓGNU EXPRESIU PNAG V BAKTÉRII SALMONELLA ENTERITIDIS, KTORÁ JU NEMÁ, NA DEŠIFROVANIE VLASTNOSTÍ, KTORÉ SPÔSOBUJE PRÍTOMNOSŤ PNAG BAKTÉRIÁM. NAKONIEC NAVRHNEME A OVERÍME POUŽÍVANIE PNAG NA INDUKOVANIE TVORBY ZMIEŠANÉHO BIOFILMU PRE BIOTECHNOLOGICKÉ APLIKÁCIE. (Slovak)
17 August 2022
0 references
IS ÉARD ATÁ I MBITHSCANNÁIN CUIBHREANNAIS DE BHAICTÉIR A FHÁSANN ATÁ CEANGAILTE LE DROMCHLAÍ BITHEACHA NÓ AIBITHEACHA AGUS ATÁ TIMPEALLAITHE AG MAITRÍS SHEACHCHEALLACH ATÁ SINTÉISITHE ACU FÉIN. TÁ GO LEOR BUNTÁISTÍ AG BAINT LE SAOL AN PHOBAIL THAR AN SAOL AONCHILLE: ÉASCAÍONN SÉ COINNEÁIL UISCE TRÍ THIMPEALLACHT HIODRÁITITHE A SHOLÁTHAR, CEADAÍONN SÉ COTHAITHIGH AGUS EINSÍMÍ DÍGHRÁDAITHEACHA SEACH-CHEALLACHA A CHOMHCHRUINNIÚ, FEIDHMÍONN SÉ MAR BHAC COSANTA I GCOINNE GNÍMH CREACHADÓIRÍ, SUBSTAINTÍ FRITHMHIOCRÓBACHA NÓ AN CHÓRAIS IMDHÍONACHTA AGUS ÉASCAÍONN SÉ MALARTÚ ÁBHAR GÉINITEACH. BRAITHEANN GO LEOR DE NA HAIRÍONNA SEO AR AN MAITRÍS A BHAINEANN LE POBAL NA MBAICTÉAR. IS É EXOPOLISACARIDS AN CHOMHPHÁIRT IS COITIANTA AGUS IS TÁBHACHTAÍ DEN MHAITRÍS BITHSCANNÁIN. ÚSÁIDTEAR EXOPOLISACARIDS ÉAGSÚLA CHUN AN MHAITRÍS BITHSCANNÁIN (CEALLALÓS, AILGIONÁIT, AIGÉAD COLANIC), ACH IS IONADH RÉIMSE LEATHAN BAICTÉIR PHYLOGENETICALLY I BHFAD I GCÉIN RESORT TO THE SAME EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETYLGLUCOSAMINE (PNAG), CHUN NA CRÍCHE SIN. TUGANN AN BHREATHNÓIREACHT SEO LE FIOS GO DTUGANN AN MHAITRÍS A CHRUTHAIGH PNAG BUNTÁISTÍ SPEISIALTA THAR CHINEÁLACHA EILE MAITRÍSÍ, AGUS CUIREANN SÉ BÉIM AR AN NGÁ ATÁ LE STAIDÉAR A DHÉANAMH AR AN EXOPOLISACARIDO SEO GO DOMHAIN. SA TIONSCADAL SEO, MOLAIMID AN BAICTÉAR PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS A ÚSÁID MAR MHÚNLA CHUN TUISCINT A FHÁIL AR NA HUILEACHTAÍ ATÁ AG PNAG CHUN AN BITHSCANNÁN A BHUNÚ. MAR SIN, MOLAIMID STAIDÉAR A DHÉANAMH AR NA MEICNÍOCHTAÍ MÓILÍNEACHA A RIALAÍONN SINTÉIS AGUS GNÍOMHACHTÚ SYNTHASE PNAG, MEICNÍOCHT TRANSDUCTION COMHARTHA A NASCANN NA COINNÍOLLACHA COMHSHAOIL LE TÁIRGEADH PNAG AGUS LÍON AGUS SUÍOMH NA SYNTHASE PNAG I MEMBRANE NA BAICTÉIR. INA THEANNTA SIN, BAINFIMID ÚSÁID AS AN ABAIRT HETEROLOGOUS DE PNAG I SALMONELLA ENTERITIDIS, BAICTÉAR NACH BHFUIL ANN, CHUN NA HAIRÍONNA A THUGANN LÁITHREACHT PNAG DO NA BAICTÉIR A DHEARBHÚ. AR DEIREADH, DÉANFAIMID ÚSÁID PNAG A DHEARADH AGUS A BHAILÍOCHTÚ CHUN FOIRMIÚ BITHSCANNÁIN MHEASCTHA A SPREAGADH LE HAGHAIDH FEIDHMEANNA BITEICNEOLAÍOCHTA. (Irish)
17 August 2022
0 references
BIOFILMY JSOU KONSORCII BAKTERIÍ, KTERÉ ROSTOU NA BIOTICKÝCH NEBO ABIOTICKÝCH POVRCHECH A JSOU OBKLOPENY EXTRACELULÁRNÍ MATICÍ, KTEROU SAMI SYNTETIZOVALI. KOMUNITNÍ ŽIVOT MÁ MNOHO VÝHOD OPROTI JEDNOBUNĚČNÉMU ŽIVOTU: USNADŇUJE ZADRŽOVÁNÍ VODY TÍM, ŽE POSKYTUJE HYDRATOVANÉ PROSTŘEDÍ, UMOŽŇUJE KONCENTROVAT ŽIVINY A EXTRACELULÁRNÍ ROZKLADNÉ ENZYMY, PŮSOBÍ JAKO OCHRANNÁ BARIÉRA PROTI PŮSOBENÍ PREDÁTORŮ, ANTIMIKROBIÁLNÍCH LÁTEK NEBO IMUNITNÍHO SYSTÉMU A USNADŇUJE VÝMĚNU GENETICKÉHO MATERIÁLU. MNOHÉ Z TĚCHTO VLASTNOSTÍ ZÁVISÍ NA MATRICI OBKLOPUJÍCÍ KOMUNITU BAKTERIÍ. NEJČASTĚJŠÍ A NEJDŮLEŽITĚJŠÍ SLOŽKOU BIOFILMOVÉ MATRICE JE EXOPOLISACARIDS. RŮZNÉ EXOPOLISACARIDS SE POUŽÍVAJÍ K VYTVOŘENÍ BIOFILMOVÉ MATRICE (CELULÓZA, ALGINÁT, KYSELINA COLANIC), ALE PŘEKVAPIVĚ ŠIROKÁ ŠKÁLA FYLOGENETICKY VZDÁLENÝCH BAKTERIÍ SE UCHÝLÍ KE STEJNÉMU EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETYLGLUKOSAMINU (PNAG), ZA TÍMTO ÚČELEM. TATO PŘIPOMÍNKA NAZNAČUJE, ŽE MATRICE VYTVOŘENÁ PNAG POSKYTUJE ZVLÁŠTNÍ VÝHODY OPROTI JINÝM TYPŮM MATRIC, A ZDŮRAZŇUJE POTŘEBU HLOUBKOVÉ STUDIE TOHOTO PŘÍPRAVKU EXOPOLISACARIDO. V TOMTO PROJEKTU NAVRHUJEME POUŽÍT BAKTERIE PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS JAKO MODEL K POCHOPENÍ SINGULARIT, KTERÉ MÁ PNAG PRO TVORBU BIOFILMU. ZA TÍMTO ÚČELEM NAVRHUJEME STUDOVAT MOLEKULÁRNÍ MECHANISMY, KTERÉ REGULUJÍ SYNTÉZU A AKTIVACI SYNTÁZY PNAG, MECHANISMUS TRANSDUKCE SIGNÁLU, KTERÝ SPOJUJE PODMÍNKY PROSTŘEDÍ S PRODUKCÍ PNAG A POČTEM A UMÍSTĚNÍM SYNTÁZY PNAG V MEMBRÁNĚ BAKTERIÍ. KROMĚ TOHO POUŽIJEME HETEROLOGNÍ EXPRESE PNAG V SALMONELLA ENTERITIDIS, BAKTERIE, KTERÁ JI POSTRÁDÁ, K ROZLUŠTĚNÍ VLASTNOSTÍ, KTERÉ PŘÍTOMNOST PNAG PROPŮJČUJE BAKTERIÍM. NAKONEC NAVRHNEME A OVĚŘÍME POUŽITÍ PNAG K VYVOLÁNÍ TVORBY SMÍŠENÉHO BIOFILMU PRO BIOTECHNOLOGICKÉ APLIKACE. (Czech)
17 August 2022
0 references
BIOFILMES SÃO CONSÓRCIOS DE BACTÉRIAS QUE CRESCEM LIGADAS A SUPERFÍCIES BIÓTICAS OU ABIÓTICAS E RODEADAS POR UMA MATRIZ EXTRACELULAR QUE ELES PRÓPRIOS SINTETIZARAM. A VIDA DA COMUNIDADE TEM MUITAS VANTAGENS SOBRE A VIDA DE CÉLULA ÚNICA: FACILITA A RETENÇÃO DE ÁGUA, PROPORCIONANDO UM AMBIENTE HIDRATADO, PERMITE CONCENTRAR NUTRIENTES E ENZIMAS DEGRADANTES EXTRACELULARES, ATUA COMO UMA BARREIRA PROTETORA CONTRA A AÇÃO DE PREDADORES, SUBSTÂNCIAS ANTIMICROBIANAS OU O SISTEMA IMUNOLÓGICO E FACILITA A TROCA DE MATERIAL GENÉTICO. MUITAS DESTAS PROPRIEDADES DEPENDEM DA MATRIZ QUE RODEIA A COMUNIDADE DE BACTÉRIAS. O COMPONENTE MAIS COMUM E IMPORTANTE DA MATRIZ DE BIOFILME É EXOPOLISACARIDS. DIFERENTES EXOPOLISACARIDS SÃO USADOS PARA FORMAR A MATRIZ DE BIOFILME (CELULOSE, ALGINATO, ÁCIDO COLANIC), MAS SURPREENDENTEMENTE UMA GRANDE VARIEDADE DE BACTÉRIAS FILOGENÉTICAS DISTANTES RECORREM AO MESMO EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETILGLUCOSAMINA (PNAG), PARA ESTE FIM. ESSA OBSERVAÇÃO SUGERE QUE A MATRIZ FORMADA PELO PNAG CONFERE VANTAGENS ESPECIAIS SOBRE OUTROS TIPOS DE MATRIZES, E RESSALTA A NECESSIDADE DE ESTUDAR ESTE EXOPOLISACARIDO EM PROFUNDIDADE. NESTE PROJETO, PROPOMOS UTILIZAR A BACTÉRIA PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS COMO MODELO PARA COMPREENDER AS SINGULARIDADES QUE A PNAG TEM PARA A FORMAÇÃO DO BIOFILME. PARA ISSO, PROPOMOS ESTUDAR OS MECANISMOS MOLECULARES QUE REGULAM A SÍNTESE E ATIVAÇÃO DA PNAG SINTASE, O MECANISMO DE TRANSDUÇÃO DE SINAL QUE CONECTA AS CONDIÇÕES AMBIENTAIS COM A PRODUÇÃO DO PNAG E O NÚMERO E LOCALIZAÇÃO DA PNAG SINTASE NA MEMBRANA DA BACTÉRIA. ALÉM DISSO, UTILIZAREMOS A EXPRESSÃO HETERÓLOGA DO PNAG EM SALMONELLA ENTERITIDIS, UMA BACTÉRIA QUE LHE FALTA, PARA DECIFRAR AS PROPRIEDADES QUE A PRESENÇA DO PNAG CONFERE À BACTÉRIA. FINALMENTE, VAMOS PROJETAR E VALIDAR O USO DO PNAG PARA INDUZIR A FORMAÇÃO DE BIOFILME MISTO PARA APLICAÇÕES BIOTECNOLÓGICAS. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
BIOKILED ON BAKTERITE KONSORTSIUMID, MIS KASVAVAD BIOOTILISTE VÕI ABIOOTILISTE PINDADE KÜLGE JA MIDA ÜMBRITSEB RAKUVÄLINE MAATRIKS, MILLE NAD ISE ON SÜNTEESINUD. KOGUKONNA ELUL ON PALJU EELISEID VÕRRELDES ÜHERAKULISE ELUGA: SEE HÕLBUSTAB VEEPEETUST, LUUES HÜDRAATUNUD KESKKONNA, VÕIMALDAB KONTSENTREERIDA TOITAINEID JA RAKUVÄLISEID LAGUNDAVAID ENSÜÜME, TOIMIB KAITSEBARJÄÄRINA KISKJATE, ANTIMIKROOBSETE AINETE VÕI IMMUUNSÜSTEEMI TOIME VASTU NING HÕLBUSTAB GENEETILISE MATERJALI VAHETUST. PALJUD NEIST OMADUSTEST SÕLTUVAD BAKTERITE ÜHENDUSE ÜMBRITSEVAST MAATRIKSIST. BIOKILE MAATRIKSI KÕIGE TAVALISEM JA OLULISEM KOMPONENT ON EXOPOLISACARIDS. BIOKILE MAATRIKSI (TSELLULOOS, ALGINAAT, COLANICHAPE) MOODUSTAMISEKS KASUTATAKSE ERINEVAID EXOPOLISACARIDSE, KUID ÜLLATAVALT KASUTAVAD SEL EESMÄRGIL MITMESUGUSEID FÜLOGENEETILISELT KAUGEID BAKTEREID SAMA EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ATSETÜÜLGLÜKOOSAMIINI (PNAG). SEE TÄHELEPANEK VIITAB SELLELE, ET PNAGI MAATRIKS ANNAB ERILISI EELISEID MUUD TÜÜPI MAATRIKSITE EES, NING RÕHUTAB VAJADUST SEDA EXOPOLISACARIDOT PÕHJALIKULT UURIDA. SELLES PROJEKTIS TEEME ETTEPANEKU KASUTADA BAKTERIT PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS MUDELINA, ET MÕISTA PNAGI AINULAADSUST BIOKILE MOODUSTAMISEL. SELLEKS TEEME ETTEPANEKU UURIDA MOLEKULAARMEHHANISME, MIS REGULEERIVAD PNAG SÜNTAASI SÜNTEESI JA AKTIVEERIMIST, SIGNAALITRANSDUKTSIOONI MEHHANISMI, MIS ÜHENDAB KESKKONNATINGIMUSI PNAG TOOTMISEGA NING PNAG SÜNTAASI ARVU JA ASUKOHTA BAKTERITE MEMBRAANIS. LISAKS KASUTAME PNAG HETEROLOOGSET EKSPRESSIOONI BAKTERIS SALMONELLA ENTERITIDIS, MILLEL SEE PUUDUB, ET DEŠIFREERIDA OMADUSI, MIDA PNAG OLEMASOLU BAKTERITELE ANNAB. LÕPUKS KAVANDAME JA VALIDEERIME PNAGI KASUTAMISE BIOTEHNOLOOGILISTES RAKENDUSTES SEGABIOKILE TEKKE ESILEKUTSUMISEKS. (Estonian)
17 August 2022
0 references
A BIOFILMEK OLYAN BAKTÉRIUMOK KONZORCIUMAI, AMELYEK BIOTIKUS VAGY ABIOTIKUS FELÜLETEKHEZ KAPCSOLÓDNAK, ÉS AZOKAT EGY EXTRACELLULÁRIS MÁTRIX VESZI KÖRÜL, AMELYET ŐK MAGUK SZINTETIZÁLTAK. A KÖZÖSSÉGI ÉLETNEK SZÁMOS ELŐNYE VAN AZ EGYSEJTES ÉLETHEZ KÉPEST: HIDRATÁLT KÖRNYEZET BIZTOSÍTÁSÁVAL MEGKÖNNYÍTI A VÍZVISSZATARTÁST, LEHETŐVÉ TESZI A TÁPANYAGOK ÉS AZ EXTRACELLULÁRIS DEGRADATÍV ENZIMEK KONCENTRÁLÁSÁT, VÉDŐGÁTKÉNT SZOLGÁL A RAGADOZÓK, AZ ANTIMIKROBIÁLIS ANYAGOK VAGY AZ IMMUNRENDSZER HATÁSÁVAL SZEMBEN, ÉS ELŐSEGÍTI A GENETIKAI ANYAGOK CSERÉJÉT. E TULAJDONSÁGOK KÖZÜL SOK A BAKTÉRIUMOK KÖZÖSSÉGÉT KÖRÜLVEVŐ MÁTRIXTÓL FÜGG. A BIOFILM MÁTRIX LEGGYAKORIBB ÉS LEGFONTOSABB ÖSSZETEVŐJE AZ EXOPOLISACARIDS. A BIOFILM MÁTRIX (CELLULÓZ, ALGINÁT, COLANIC-SAV) ELŐÁLLÍTÁSÁHOZ KÜLÖNBÖZŐ EXOPOLISACARIDS-EKET HASZNÁLNAK, DE MEGLEPŐ MÓDON SZÁMOS FILOGENETIKAILAG TÁVOLI BAKTÉRIUMOK UGYANAZT AZ EXOPOLISACARIDO-T, -1,6-N-ACETIL-GLÜKOZAMINT (PNAG) HASZNÁLJÁK ERRE A CÉLRA. EZ A MEGFIGYELÉS ARRA UTAL, HOGY A PNAG ÁLTAL LÉTREHOZOTT MÁTRIX KÜLÖNLEGES ELŐNYÖKET BIZTOSÍT MÁS MÁTRIXOKKAL SZEMBEN, ÉS HANGSÚLYOZZA, HOGY EZT AZ EXOPOLISACARIDO-T ALAPOSAN MEG KELL VIZSGÁLNI. EBBEN A PROJEKTBEN AZT JAVASOLJUK, HOGY A PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS BAKTÉRIUMOT HASZNÁLJUK MODELLKÉNT, HOGY MEGÉRTSÜK A PNAG SZINGULARITÁSAIT A BIOFILM KÉPZŐDÉSÉHEZ. EHHEZ JAVASOLJUK A PNAG SZINTÁZ SZINTÉZISÉT ÉS AKTIVÁLÁSÁT SZABÁLYOZÓ MOLEKULÁRIS MECHANIZMUSOK TANULMÁNYOZÁSÁT, A JELÁTVITEL MECHANIZMUSÁT, AMELY ÖSSZEKÖTI A KÖRNYEZETI FELTÉTELEKET A PNAG TERMELÉSÉVEL, VALAMINT A PNAG SZINTÁZ SZÁMÁT ÉS HELYÉT A BAKTÉRIUMOK MEMBRÁNJÁBAN. EZENKÍVÜL A PNAG HETEROLÓG EXPRESSZIÓJÁT HASZNÁLJUK A SALMONELLA ENTERITIDISBEN, EGY OLYAN BAKTÉRIUMBAN, AMELY HIÁNYZIK, HOGY MEGFEJTSÜK AZOKAT A TULAJDONSÁGOKAT, AMELYEKET A PNAG JELENLÉTE A BAKTÉRIUMOKRA RUHÁZ. VÉGÜL MEGTERVEZZÜK ÉS VALIDÁLJUK A PNAG HASZNÁLATÁT, HOGY BIOTECHNOLÓGIAI ALKALMAZÁSOKHOZ KEVERT BIOFILMEK KÉPZŐDÉSÉT IDÉZZÜK ELŐ. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
БИОФИЛМИТЕ СА КОНСОРЦИУМИ ОТ БАКТЕРИИ, КОИТО РАСТАТ ПРИВЪРЗАНИ КЪМ БИОТИЧНИ ИЛИ АБИОТИЧНИ ПОВЪРХНОСТИ И СА ЗАОБИКОЛЕНИ ОТ ИЗВЪНКЛЕТЪЧНА МАТРИЦА, КОЯТО САМИТЕ ТЕ СА СИНТЕЗИРАЛИ. ЖИВОТЪТ НА ОБЩНОСТТА ИМА МНОГО ПРЕДИМСТВА ПРЕД ЕДНОКЛЕТЪЧНИЯ ЖИВОТ: ТОЙ УЛЕСНЯВА ЗАДЪРЖАНЕТО НА ВОДА ЧРЕЗ ОСИГУРЯВАНЕ НА ХИДРАТИРАНА СРЕДА, ПОЗВОЛЯВА КОНЦЕНТРИРАНЕ НА ХРАНИТЕЛНИ ВЕЩЕСТВА И ИЗВЪНКЛЕТЪЧНИ ДЕГРАДИРАЩИ ЕНЗИМИ, ДЕЙСТВА КАТО ЗАЩИТНА БАРИЕРА СРЕЩУ ДЕЙСТВИЕТО НА ХИЩНИЦИ, АНТИМИКРОБНИ ВЕЩЕСТВА ИЛИ ИМУННАТА СИСТЕМА И УЛЕСНЯВА ОБМЕНА НА ГЕНЕТИЧЕН МАТЕРИАЛ. МНОГО ОТ ТЕЗИ СВОЙСТВА ЗАВИСЯТ ОТ МАТРИЦАТА ОКОЛО ОБЩНОСТТА НА БАКТЕРИИТЕ. НАЙ-ЧЕСТИЯТ И ВАЖЕН КОМПОНЕНТ НА БИОФИЛМОВАТА МАТРИЦА Е EXOPOLISACARIDS. ЗА ТАЗИ ЦЕЛ СЕ ИЗПОЛЗВАТ РАЗЛИЧНИ EXOPOLISACARIDS (ЦЕЛУЛОЗА, АЛГИНАТ, COLANIC КИСЕЛИНА), НО ИЗНЕНАДВАЩО ГОЛЯМО РАЗНООБРАЗИЕ ОТ ФИЛОГЕНЕТИЧНО ОТДАЛЕЧЕНИ БАКТЕРИИ ПРИБЯГВАТ ДО СЪЩОТО EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-АЦЕТИЛГЛЮКОЗАМИН (PNAG). ТОВА НАБЛЮДЕНИЕ ПРЕДПОЛАГА, ЧЕ МАТРИЦАТА, ОБРАЗУВАНА ОТ PNAG, ПРЕДОСТАВЯ СПЕЦИАЛНИ ПРЕДИМСТВА ПРЕД ДРУГИ ВИДОВЕ МАТРИЦИ И ПОДЧЕРТАВА НЕОБХОДИМОСТТА ОТ ЗАДЪЛБОЧЕНО ПРОУЧВАНЕ НА ТОВА EXOPOLISACARIDO. В ТОЗИ ПРОЕКТ ПРЕДЛАГАМЕ ДА СЕ ИЗПОЛЗВА БАКТЕРИЯТА PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS КАТО МОДЕЛ ЗА РАЗБИРАНЕ НА СИНГУЛЯРНОСТТА НА PNAG ЗА ОБРАЗУВАНЕТО НА БИОФИЛМА. ЗА ТАЗИ ЦЕЛ ПРЕДЛАГАМЕ ДА СЕ ПРОУЧАТ МОЛЕКУЛЯРНИТЕ МЕХАНИЗМИ, КОИТО РЕГУЛИРАТ СИНТЕЗА И АКТИВИРАНЕТО НА PNAG СИНТАЗА, МЕХАНИЗМЪТ НА СИГНАЛНА ТРАНСДУКЦИЯ, КОЙТО СВЪРЗВА УСЛОВИЯТА НА ОКОЛНАТА СРЕДА С ПРОИЗВОДСТВОТО НА PNAG И БРОЯ И МЕСТОПОЛОЖЕНИЕТО НА PNAG СИНТАЗА В МЕМБРАНАТА НА БАКТЕРИИТЕ. ОСВЕН ТОВА ЩЕ ИЗПОЛЗВАМЕ ХЕТЕРОЛОЖНИЯ ИЗРАЗ НА PNAG В SALMONELLA ENTERITIDIS, БАКТЕРИЯ, КОЯТО ЛИПСВА, ЗА ДА ДЕШИФРИРА СВОЙСТВАТА, КОИТО ПРИСЪСТВИЕТО НА PNAG ПРИДАВА НА БАКТЕРИИТЕ. И НАКРАЯ, ЩЕ ПРОЕКТИРАМЕ И ВАЛИДИРАМЕ ИЗПОЛЗВАНЕТО НА PNAG, ЗА ДА ПРЕДИЗВИКАМЕ ОБРАЗУВАНЕТО НА СМЕСЕН БИОФИЛМ ЗА БИОТЕХНОЛОГИЧНИ ПРИЛОЖЕНИЯ. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
BIOFILMAI YRA BAKTERIJŲ KONSORCIUMAI, KURIE AUGA PRISIRIŠĘ PRIE BIOTINIŲ AR ABIOTINIŲ PAVIRŠIŲ IR APSUPTI EKSTRALĄSTELINĖS MATRICOS, KURIĄ JIE PATYS SINTEZAVO. BENDRUOMENĖS GYVENIMAS TURI DAUG PRIVALUMŲ, PALYGINTI SU VIENOS LĄSTELĖS GYVENIMU: JIS PALENGVINA VANDENS SUSILAIKYMĄ, SUTEIKDAMAS HIDRATUOTĄ APLINKĄ, LEIDŽIA KONCENTRUOTI MAISTINES MEDŽIAGAS IR EKSTRALĄSTELINIUS SKILIMO FERMENTUS, VEIKIA KAIP APSAUGINIS BARJERAS NUO PLĖŠRŪNŲ, ANTIMIKROBINIŲ MEDŽIAGŲ AR IMUNINĖS SISTEMOS VEIKIMO IR PALENGVINA GENETINĖS MEDŽIAGOS MAINUS. DAUGELIS ŠIŲ SAVYBIŲ PRIKLAUSO NUO BAKTERIJŲ BENDRIJĄ SUPANČIOS MATRICOS. DAŽNIAUSIA IR SVARBIAUSIA BIOLOGINĖS PLĖVELĖS MATRICOS SUDEDAMOJI DALIS YRA EXOPOLISACARIDS. BIOFILMŲ MATRICAI (CELIULIOZEI, ALGINATUI, COLANIC RŪGŠČIAI) FORMUOJAMI ĮVAIRŪS EXOPOLISACARIDS, TAČIAU STEBINA, KAD ŠIUO TIKSLU ĮVAIRIOS FYLOGENETIŠKAI NUTOLUSIOS BAKTERIJOS NAUDOJASI TA PAČIA EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETILGLIUKOZAMINU (PNAG). ŠIS PASTEBĖJIMAS RODO, KAD PNAG SUFORMUOTA MATRICA SUTEIKIA SPECIALIŲ PRANAŠUMŲ KITŲ RŪŠIŲ MATRICOMS, IR PABRĖŽIA, KAD REIKIA IŠSAMIAI IŠTIRTI ŠIĄ EXOPOLISACARIDO. ŠIAME PROJEKTE SIŪLOME NAUDOTI BAKTERIJĄ PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS KAIP MODELĮ, KAD SUPRASTUME IŠSKIRTINIUS PNAG BIOFILMŲ FORMAVIMO BŪDUS. DĖL TO SIŪLOME IŠTIRTI MOLEKULINIUS MECHANIZMUS, KURIE REGULIUOJA PNAG SINTAZĖS SINTEZĘ IR AKTYVAVIMĄ, SIGNALŲ PERDAVIMO MECHANIZMĄ, KURIS JUNGIA APLINKOS SĄLYGAS SU PNAG GAMYBA IR PNAG SINTETAZĖS SKAIČIŲ IR VIETĄ BAKTERIJŲ MEMBRANOJE. BE TO, MES NAUDOSIME HETEROLOGINĘ PNAG IŠRAIŠKĄ SALMONELLA ENTERITIDIS, BAKTERIJA, KURIOS JOS TRŪKSTA, KAD IŠŠIFRUOTUME SAVYBES, KURIAS PNAG BUVIMAS SUTEIKIA BAKTERIJOMS. GALIAUSIAI, SUKURSIME IR PATVIRTINSIME PNAG NAUDOJIMĄ, KAD PASKATINTUME MIŠRIOS BIOFILMOS SUSIDARYMĄ BIOTECHNOLOGIJOMS. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
BIOFILMI SU KONZORCIJI BAKTERIJA KOJE RASTU PRIČVRŠĆENE NA BIOTIČKE ILI ABIOTIČKE POVRŠINE I OKRUŽENE IZVANSTANIČNOM MATRICOM KOJU SU SAMI SINTETIZIRALI. ŽIVOT ZAJEDNICE IMA MNOGE PREDNOSTI U ODNOSU NA ŽIVOT S JEDNIM STANICAMA: OLAKŠAVA ZADRŽAVANJE VODE PRUŽANJEM HIDRIRANOG OKOLIŠA, OMOGUĆUJE KONCENTRIRANJE HRANJIVIH TVARI I IZVANSTANIČNIH DEGRADATIVNIH ENZIMA, DJELUJE KAO ZAŠTITNA BARIJERA PROTIV DJELOVANJA GRABEŽLJIVACA, ANTIMIKROBNIH TVARI ILI IMUNOSNOG SUSTAVA TE OLAKŠAVA RAZMJENU GENETSKOG MATERIJALA. MNOGA OD TIH SVOJSTAVA OVISE O MATRICI KOJA OKRUŽUJE ZAJEDNICU BAKTERIJA. NAJČEŠĆA I NAJVAŽNIJA KOMPONENTA MATRICE BIOFILMA JE EXOPOLISACARIDS. RAZLIČITI EXOPOLISACARIDS KORISTE SE ZA FORMIRANJE MATRICE BIOFILMA (CELULOZA, ALGINAT, COLANIC KISELINA), ALI IZNENAĐUJUĆE JE DA U TU SVRHU DOLAZI DO ISTOG EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETILGLUKOZAMINA (PNAG) OD FILOGENETSKI UDALJENIH BAKTERIJA. TO OPAŽANJE UPUĆUJE NA TO DA MATRICA KOJU OBLIKUJE PNAG DAJE POSEBNE PREDNOSTI U ODNOSU NA DRUGE VRSTE MATRICA TE NAGLAŠAVA POTREBU DA SE TAJ EXOPOLISACARIDO TEMELJITO PROUČI. U OVOM PROJEKTU PREDLAŽEMO KORIŠTENJE BAKTERIJE PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS KAO MODELA ZA RAZUMIJEVANJE SINGULARNOSTI KOJE PNAG IMA ZA FORMIRANJE BIOFILMA. U TU SVRHU PREDLAŽEMO PROUČAVANJE MOLEKULARNIH MEHANIZAMA KOJI REGULIRAJU SINTEZU I AKTIVACIJU PNAG SINTEZE, MEHANIZMA TRANSDUKCIJE SIGNALA KOJI POVEZUJE OKOLIŠNE UVJETE S PROIZVODNJOM PNAG-A TE BROJ I POLOŽAJ PNAG SINTAZE U MEMBRANI BAKTERIJA. OSIM TOGA, UPOTRIJEBIT ĆEMO HETEROLOŠKU EKSPRESIJU PNAG-A U SALMONELLA ENTERITIDIS, BAKTERIJA KOJOJ NEDOSTAJE, KAKO BISMO DEŠIFRIRALI SVOJSTVA KOJA PRISUTNOST PNAG-A DAJE BAKTERIJAMA. KONAČNO, OSMISLIT ĆEMO I POTVRDITI KORIŠTENJE PNAG-A KAKO BISMO POTAKNULI FORMIRANJE MIJEŠANOG BIOFILMA ZA BIOTEHNOLOŠKE PRIMJENE. (Croatian)
17 August 2022
0 references
BIOFILM ÄR KONSORTIER AV BAKTERIER SOM VÄXER FAST VID BIOTISKA ELLER ABIOTISKA YTOR OCH OMGES AV EN EXTRACELLULÄR MATRIS SOM DE SJÄLVA HAR SYNTETISERAT. SAMHÄLLSLIVET HAR MÅNGA FÖRDELAR JÄMFÖRT MED ENCELLSLIV: DET UNDERLÄTTAR VATTENRETENTION GENOM ATT TILLHANDAHÅLLA EN HYDRERAD MILJÖ, GÖR DET MÖJLIGT ATT KONCENTRERA NÄRINGSÄMNEN OCH EXTRACELLULÄRA NEDBRYTNINGSENZYMER, FUNGERAR SOM EN SKYDDANDE BARRIÄR MOT VERKAN AV ROVDJUR, ANTIMIKROBIELLA SUBSTANSER ELLER IMMUNSYSTEMET OCH UNDERLÄTTAR UTBYTET AV GENETISKT MATERIAL. MÅNGA AV DESSA EGENSKAPER BEROR PÅ DEN MATRIS SOM OMGER BAKTERIEGEMENSKAPEN. DEN VANLIGASTE OCH VIKTIGASTE KOMPONENTEN I BIOFILMMATRISEN ÄR EXOPOLISACARIDS. OLIKA EXOPOLISACARIDS ANVÄNDS FÖR ATT BILDA BIOFILMMATRISEN (CELLULOSA, ALGINAT, COLANIC SYRA), MEN FÖRVÅNANSVÄRT EN MÄNGD OLIKA FYLOGENETISKT AVLÄGSNA BAKTERIER TILLGRIPER SAMMA EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETYLGLUKOSAMIN (PNAG), FÖR DETTA ÄNDAMÅL. DENNA OBSERVATION TYDER PÅ ATT DEN MATRIS SOM BILDAS AV PNAG GER SÄRSKILDA FÖRDELAR JÄMFÖRT MED ANDRA TYPER AV MATRISER, OCH UNDERSTRYKER BEHOVET AV ATT STUDERA DENNA EXOPOLISACARIDO PÅ DJUPET. I DETTA PROJEKT FÖRESLÅR VI ATT BAKTERIEN PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS ANVÄNDS SOM MODELL FÖR ATT FÖRSTÅ DE SINGULARITETER SOM PNAG HAR FÖR BILDANDET AV BIOFILMEN. FÖR DETTA FÖRESLÅR VI ATT STUDERA DE MOLEKYLÄRA MEKANISMER SOM REGLERAR SYNTESEN OCH AKTIVERINGEN AV PNAG-SYNTAS, MEKANISMEN FÖR SIGNALTRANSDUKTION SOM FÖRBINDER MILJÖFÖRHÅLLANDENA MED PRODUKTIONEN AV PNAG OCH ANTALET OCH PLACERINGEN AV PNAG-SYNTAS I BAKTERIENS MEMBRAN. DESSUTOM KOMMER VI ATT ANVÄNDA DET HETEROLOGA UTTRYCKET AV PNAG I SALMONELLA ENTERITIDIS, EN BAKTERIE SOM SAKNAR DET, FÖR ATT DECHIFFRERA DE EGENSKAPER SOM FÖREKOMSTEN AV PNAG GER BAKTERIERNA. SLUTLIGEN KOMMER VI ATT DESIGNA OCH VALIDERA ANVÄNDNINGEN AV PNAG FÖR ATT FRAMKALLA BILDANDET AV BLANDAD BIOFILM FÖR BIOTEKNISKA TILLÄMPNINGAR. (Swedish)
17 August 2022
0 references
BIOFILMELE SUNT CONSORȚII DE BACTERII CARE CRESC ATAȘATE LA SUPRAFEȚE BIOTICE SAU ABIOTICE ȘI ÎNCONJURATE DE O MATRICE EXTRACELULARĂ PE CARE EI ÎNȘIȘI AU SINTETIZAT-O. VIAȚA COMUNITARĂ ARE MULTE AVANTAJE FAȚĂ DE VIAȚA MONOCELULARĂ: FACILITEAZĂ RETENȚIA APEI PRIN ASIGURAREA UNUI MEDIU HIDRATAT, PERMITE CONCENTRAREA NUTRIENȚILOR ȘI ENZIMELOR DEGRADANTE EXTRACELULARE, ACȚIONEAZĂ CA O BARIERĂ DE PROTECȚIE ÎMPOTRIVA ACȚIUNII PRĂDĂTORILOR, A SUBSTANȚELOR ANTIMICROBIENE SAU A SISTEMULUI IMUNITAR ȘI FACILITEAZĂ SCHIMBUL DE MATERIAL GENETIC. MULTE DINTRE ACESTE PROPRIETĂȚI DEPIND DE MATRICEA DIN JURUL COMUNITĂȚII BACTERIILOR. CEA MAI COMUNĂ ȘI IMPORTANTĂ COMPONENTĂ A MATRICEI BIOFILMULUI ESTE EXOPOLISACARIDS. DIFERITE EXOPOLISACARIDS SUNT UTILIZATE PENTRU A FORMA MATRICEA BIOFILMELOR (CELULOZĂ, ALGINAT, ACID COLANIC), DAR SURPRINZĂTOR O MARE VARIETATE DE BACTERII FILOGENETICE ÎNDEPĂRTATE LA ACELAȘI EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETILGLUCOZAMINĂ (PNAG), ÎN ACEST SCOP. ACEASTĂ OBSERVAȚIE SUGEREAZĂ CĂ MATRICEA FORMATĂ DIN PNAG CONFERĂ AVANTAJE SPECIALE FAȚĂ DE ALTE TIPURI DE MATRICE ȘI SUBLINIAZĂ NECESITATEA DE A STUDIA ÎN PROFUNZIME ACEST EXOPOLISACARIDO. ÎN ACEST PROIECT, PROPUNEM UTILIZAREA BACTERIEI PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS CA MODEL PENTRU A ÎNȚELEGE SINGULARITĂȚILE PE CARE PNAG LE ARE PENTRU FORMAREA BIOFILMULUI. PENTRU ACEASTA, PROPUNEM STUDIEREA MECANISMELOR MOLECULARE CARE REGLEAZĂ SINTEZA ȘI ACTIVAREA PNAG SINTETAZĂ, MECANISMUL DE TRANSDUCȚIE A SEMNALULUI CARE CONECTEAZĂ CONDIȚIILE DE MEDIU CU PRODUCȚIA DE PNAG ȘI NUMĂRUL ȘI LOCALIZAREA SINTAZEI PNAG ÎN MEMBRANA BACTERIILOR. ÎN PLUS, VOM FOLOSI EXPRESIA HETEROLOGĂ A PNAG ÎN SALMONELLA ENTERITIDIS, O BACTERIE CARE ÎI LIPSEȘTE, PENTRU A DESCIFRA PROPRIETĂȚILE PE CARE PREZENȚA PNAG LE CONFERĂ BACTERIILOR. ÎN CELE DIN URMĂ, VOM PROIECTA ȘI VALIDA UTILIZAREA PNAG PENTRU A INDUCE FORMAREA DE BIOFILM MIXT PENTRU APLICAȚII BIOTEHNOLOGICE. (Romanian)
17 August 2022
0 references
BIOFILMI SO KONZORCIJI BAKTERIJ, KI RASTEJO, PRITRJENE NA BIOTSKE ALI ABIOTIČNE POVRŠINE IN OBDANE Z ZUNAJCELIČNO MATRIKO, KI SO JO SAMI SINTETIZIRALI. SKUPNOSTNO ŽIVLJENJE IMA VELIKO PREDNOSTI PRED ENOCELIČNIM ŽIVLJENJEM: OLAJŠUJE ZADRŽEVANJE VODE Z ZAGOTAVLJANJEM HIDRIRANEGA OKOLJA, OMOGOČA KONCENTRIRANJE HRANIL IN ZUNAJCELIČNIH DEGRADACIJSKIH ENCIMOV, DELUJE KOT ZAŠČITNA OVIRA PRED DELOVANJEM PLENILCEV, PROTIMIKROBNIH SNOVI ALI IMUNSKEGA SISTEMA TER OLAJŠUJE IZMENJAVO GENSKEGA MATERIALA. MNOGE OD TEH LASTNOSTI SO ODVISNE OD MATRIKE, KI OBKROŽA SKUPNOST BAKTERIJ. NAJPOGOSTEJŠA IN NAJPOMEMBNEJŠA SESTAVINA BIOFILMSKE MATRIKE JE EXOPOLISACARIDS. RAZLIČNI EXOPOLISACARIDS SE UPORABLJAJO ZA OBLIKOVANJE BIOFILM MATRIKS (CELULOZA, ALGINAT, COLANIC KISLINA), VENDAR PRESENETLJIVO ŠIROKO PALETO FILOGENETSKO ODDALJENIH BAKTERIJ ZATEČEJO K ISTEMU EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETILGLUKOZAMINA (PNAG), ZA TA NAMEN. TA UGOTOVITEV KAŽE, DA MATRIKA, KI JO TVORI PNAG, DAJE POSEBNE PREDNOSTI PRED DRUGIMI VRSTAMI MATRIK, IN POUDARJA POTREBO PO POGLOBLJENI PREUČITVI TEGA ZDRAVILA EXOPOLISACARIDO. V TEM PROJEKTU PREDLAGAMO UPORABO BAKTERIJE PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS KOT MODELA ZA RAZUMEVANJE SINGULARNOSTI, KI JO IMA PNAG ZA TVORBO BIOFILMA. ZA TO PREDLAGAMO, DA PREUČIMO MOLEKULARNE MEHANIZME, KI UREJAJO SINTEZO IN AKTIVACIJO PNAG SINTAZE, MEHANIZEM TRANSDUKCIJE SIGNALA, KI POVEZUJE OKOLJSKE POGOJE S PROIZVODNJO PNAG TER ŠTEVILO IN LOKACIJO PNAG SINTAZE V MEMBRANI BAKTERIJ. POLEG TEGA BOMO UPORABILI HETEROLOGNO IZRAŽANJE PNAG V SALMONELLA ENTERITIDIS, BAKTERIJI, KI JE PRIMANJKUJE, ZA DEŠIFRIRANJE LASTNOSTI, KI JIH PRISOTNOST PNAG DAJE BAKTERIJI. NA KONCU BOMO ZASNOVALI IN POTRDILI UPORABO PNAG ZA INDUCIRANJE NASTAJANJA MEŠANEGA BIOFILMA ZA BIOTEHNOLOŠKE APLIKACIJE. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
BIOFILMY SĄ KONSORCJAMI BAKTERII, KTÓRE ROSNĄ NA POWIERZCHNIACH BIOTYCZNYCH LUB ABIOTYCZNYCH I OTOCZONE MATRYCĄ POZAKOMÓRKOWĄ, KTÓRĄ SAME SYNTETYZOWAŁY. ŻYCIE SPOŁECZNOŚCI MA WIELE ZALET W PORÓWNANIU Z ŻYCIEM JEDNOKOMÓRKOWYM: UŁATWIA ZATRZYMYWANIE WODY POPRZEZ ZAPEWNIENIE UWODNIONEGO ŚRODOWISKA, POZWALA NA KONCENTRACJĘ SKŁADNIKÓW ODŻYWCZYCH I POZAKOMÓRKOWYCH ENZYMÓW ROZKŁADAJĄCYCH, DZIAŁA JAKO BARIERA OCHRONNA PRZED DZIAŁANIEM DRAPIEŻNIKÓW, SUBSTANCJI PRZECIWDROBNOUSTROJOWYCH LUB UKŁADU ODPORNOŚCIOWEGO ORAZ UŁATWIA WYMIANĘ MATERIAŁU GENETYCZNEGO. WIELE Z TYCH WŁAŚCIWOŚCI ZALEŻY OD MATRYCY OTACZAJĄCEJ WSPÓLNOTĘ BAKTERII. NAJCZĘSTSZYM I NAJWAŻNIEJSZYM SKŁADNIKIEM MACIERZY BIOFILMOWEJ SĄ EXOPOLISACARIDS. RÓŻNE EXOPOLISACARIDS SĄ WYKORZYSTYWANE DO TWORZENIA MATRYCY BIOFILMOWEJ (CELULOZA, ALGINIAN, KWAS COLANIC), ALE ZASKAKUJĄCO SZEROKI WYBÓR ODLEGŁYCH FILOGENETYCZNIE BAKTERII UCIEKA SIĘ DO TEGO SAMEGO EXOPOLISACARIDO, -1,6-N-ACETYLOGLUKOZAMINY (PNAG). UWAGA TA SUGERUJE, ŻE MATRYCA UTWORZONA PRZEZ PNAG DAJE SZCZEGÓLNE KORZYŚCI W STOSUNKU DO INNYCH TYPÓW MATRYC I PODKREŚLA POTRZEBĘ DOGŁĘBNEGO ZBADANIA TEGO EXOPOLISACARIDO. W TYM PROJEKCIE PROPONUJEMY WYKORZYSTANIE BAKTERII PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS JAKO MODELU DO ZROZUMIENIA OSOBLIWOŚCI, JAKIE PNAG MA W TWORZENIU BIOFILMU. W TYM CELU PROPONUJEMY ZBADANIE MECHANIZMÓW MOLEKULARNYCH, KTÓRE REGULUJĄ SYNTEZĘ I AKTYWACJĘ SYNTAZY PNAG, MECHANIZM TRANSDUKCJI SYGNAŁU ŁĄCZĄCY WARUNKI ŚRODOWISKOWE Z PRODUKCJĄ PNAG ORAZ LICZBĘ I LOKALIZACJĘ SYNTAZY PNAG W BŁONIE BAKTERII. PONADTO UŻYJEMY HETEROLOGICZNEJ EKSPRESJI PNAG W SALMONELLA ENTERITIDIS, BAKTERII, KTÓREJ JEJ BRAKUJE, DO ROZSZYFROWANIA WŁAŚCIWOŚCI, JAKIE OBECNOŚĆ PNAG NADAJE BAKTERIOM. NA KONIEC ZAPROJEKTUJEMY I WALIDUJEMY STOSOWANIE PNAG W CELU WYWOŁANIA TWORZENIA MIESZANEGO BIOFILMU DO ZASTOSOWAŃ BIOTECHNOLOGICZNYCH. (Polish)
17 August 2022
0 references
Pamplona/Iruña
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BIO2014-53530-R
0 references