Structural and biochemical studies of the mechanism of LINE-1 retrotransposition and hepadnaviral replication (Q84209)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q84209 in Poland
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Structural and biochemical studies of the mechanism of LINE-1 retrotransposition and hepadnaviral replication |
Project Q84209 in Poland |
Statements
6,442,834.0 zloty
0 references
6,442,834.0 zloty
0 references
100.0 percent
0 references
1 June 2017
0 references
28 August 2022
0 references
MIĘDZYNARODOWY INSTYTUT BIOLOGII MOLEKULARNEJ I KOMÓRKOWEJ W WARSZAWIE
0 references
Reverse transcription is the conversion of single-stranded RNA to double-stranded DNA. It is essential for the proliferation of transposable elements called retrotransposons, which constitute nearly 40% of the human genome. Their impact is often detrimental, so their activity must be controlled. In tetrapods, the dominant mechanism is transcriptional silencing by KRAB-KAP1 complexes. Some retroelements evolved into viruses, several of which are important human pathogens like human immunodeficiency virus (HIV) and hepatitis B virus (HBV). Retroviruses, just like retroelements, encode reverse transcriptases (RTs), catalyzing the multi-step reverse transcription reaction. The aim of this project is to determine the structure and mechanism of RTs from non-LTR retrotransposons and HBV. This will expand our understanding of RTs and will enable design of novel inhibitors of their activity. We also plan to elucidate the structural basis of retrotransposon silencing by the KRAB-KAP1 system. (Polish)
0 references
Reverse transcription is the conversion of single-stranded RNA to double-stranded DNA. It is essential for the proliferation of transposable elements called retrotransposons, which constitute nearly 40 % of the human genome. Their impact is often detrimental, so their activity must be controlled. In Tetrapods, the dominant mechanism is transcriptional silencing by KRAB-KAP1 complexes. Some retroelements Evolved into viruses, several of which are important human Pathogens like human immunodeficiency virus (HIV) and hepatitis B virus (HBV). Retroviruses, just like retroelements, encode reverse transcriptases (RTS), Catalysing the multi-step reverse transcription reaction. The aim of this project is to determine the structure and mechanism of RTS from non-LTR retrotransposons and HBV. This will expand our understanding of RTS and will enable design of novel inhibitors of their activity. We also plan to elucidate the structural basis of retrotransposon silencing by the KRAB-KAP1 system. (English)
14 October 2020
0 references
La transcription inverse est la conversion de l’ARN à brin unique en ADN à double brin. Il est essentiel pour la prolifération d’éléments transposables appelés rétrotransposons, qui constituent près de 40 % du génome humain. Leur impact est souvent préjudiciable, de sorte que leur activité doit être contrôlée. Dans les tétrapodes, le mécanisme dominant est le silence transcriptionnel par les complexes KRAB-KAP1. Certains rétroéléments ont évolué en virus, dont plusieurs sont des agents pathogènes humains importants comme le virus de l’immunodéficience humaine (VIH) et le virus de l’hépatite B (VHB). Les rétrovirus, tout comme les rétroéléments, codent des transcriptases inversées (RT), catalysant la réaction de transcription inversée en plusieurs étapes. L’objectif de ce projet est de déterminer la structure et le mécanisme des RT à partir de rétrotransposons non-LTR et de VHB. Cela élargira notre compréhension des RT et permettra la conception de nouveaux inhibiteurs de leur activité. Nous prévoyons également d’élucider la base structurelle du silence rétrotransposon par le système KRAB-KAP1. (French)
30 November 2021
0 references
Reverse Transkription ist die Umwandlung von einsträngiger RNA in doppelsträngige DNA. Es ist wichtig für die Verbreitung von transponierbaren Elementen, die Retrotransposons genannt werden, die fast 40 % des menschlichen Genoms ausmachen. Ihre Auswirkungen sind oft schädlich, daher muss ihre Aktivität kontrolliert werden. Bei Tetrapoden ist der dominante Mechanismus das transkriptionelle Schweigen durch KRAB-KAP1-Komplexe. Einige Retroelemente entwickelten sich zu Viren, von denen einige wichtige menschliche Krankheitserreger wie das humane Immundefizienzvirus (HIV) und das Hepatitis-B-Virus (HBV) sind. Retroviren, genau wie Retroelemente, kodieren Reverse Transkriptasen (RTs), wodurch die mehrstufige Reverse Transkriptionsreaktion katalysiert wird. Ziel dieses Projekts ist es, die Struktur und den Mechanismus von RTs aus Nicht-LTR-Retrotransposons und HBV zu bestimmen. Dies wird unser Verständnis von RTs erweitern und das Design neuartiger Inhibitoren ihrer Aktivität ermöglichen. Wir planen auch, die strukturelle Grundlage der Retrotransposon-Silencing durch das KRAB-KAP1-System aufzuklären. (German)
7 December 2021
0 references
Omgekeerde transcriptie is de omzetting van enkelstrengs RNA in dubbelstrengs DNA. Het is essentieel voor de verspreiding van transposeerbare elementen genaamd retrotransposons, die bijna 40 % van het menselijk genoom uitmaken. Hun impact is vaak schadelijk, dus hun activiteit moet worden gecontroleerd. In tetrapods is het dominante mechanisme transcriptionele geluiddemping door KRAB-KAP1-complexen. Sommige retro-elementen evolueerden tot virussen, waarvan er enkele belangrijke menselijke pathogenen zijn, zoals humaan immunodeficiëntievirus (HIV) en hepatitis B-virus (HBV). Retrovirussen, net als retro-elementen, coderen reverse transcriptases (RT’s), het katalyseren van de multi-step reverse transcription reactie. Het doel van dit project is om de structuur en het mechanisme van RT’s te bepalen van niet-LTR retrotransposons en HBV. Dit zal ons begrip van RT’s vergroten en het ontwerp van nieuwe remmers van hun activiteit mogelijk maken. We zijn ook van plan om de structurele basis van retrotransposon geluiddemping door het KRAB-KAP1 systeem op te helderen. (Dutch)
16 December 2021
0 references
La trascrizione inversa è la conversione di RNA a filamento singolo in DNA a doppio filamento. È essenziale per la proliferazione di elementi trasponibili chiamati retrotrasposoni, che costituiscono quasi il 40 % del genoma umano. Il loro impatto è spesso dannoso, quindi la loro attività deve essere controllata. Nei tetrapodi, il meccanismo dominante è il silenziamento trascrizionale dei complessi KRAB-KAP1. Alcuni retroelementi si sono evoluti in virus, molti dei quali sono importanti patogeni umani come virus dell'immunodeficienza umana (HIV) e virus dell'epatite B (HBV). I retrovirus, proprio come i retroelementi, codificano le trascrizioni inversa (RT), catalizzando la reazione di trascrizione inversa multi-step. L'obiettivo di questo progetto è quello di determinare la struttura e il meccanismo delle RT da retrotrasposoni non LTR e HBV. Questo amplierà la nostra comprensione delle RT e consentirà la progettazione di nuovi inibitori della loro attività. Abbiamo anche in programma di chiarire la base strutturale del silenziamento retrotransposon da parte del sistema KRAB-KAP1. (Italian)
16 January 2022
0 references
La transcripción inversa es la conversión del ARN de una sola cadena a ADN de doble cadena. Es esencial para la proliferación de elementos transponibles llamados retrotransposones, que constituyen casi el 40 % del genoma humano. Su impacto es a menudo perjudicial, por lo que su actividad debe ser controlada. En los tetrápodos, el mecanismo dominante es silenciamiento transcripcional por complejos KRAB-KAP1. Algunos retroelementos evolucionaron en virus, varios de los cuales son patógenos humanos importantes como el virus de inmunodeficiencia humana (VIH) y el virus de la hepatitis B (VHB). Los retrovirus, al igual que los retroelementos, codifican las transcriptasas inversas (RT), catalizando la reacción de transcripción inversa de varios pasos. El objetivo de este proyecto es determinar la estructura y el mecanismo de los RT a partir de retrotransposones no LTR y HBV. Esto ampliará nuestra comprensión de los RT y permitirá el diseño de nuevos inhibidores de su actividad. También planeamos dilucidar la base estructural del silenciamiento retrotransposon por el sistema KRAB-KAP1. (Spanish)
19 January 2022
0 references
Omvendt transskription er konverteringen af enstrenget RNA til dobbeltstrenget DNA. Det er afgørende for spredningen af transposible elementer kaldet retrotransposons, som udgør næsten 40 % af det menneskelige genom. Deres virkning er ofte skadelig, så deres aktivitet skal kontrolleres. I tetrapods er den dominerende mekanisme transkriptionel hæmning af KRAB-KAP1-komplekser. Nogle retroelementer udviklede sig til vira, hvoraf flere er vigtige menneskelige patogener som human immundefektvirus (HIV) og hepatitis B-virus (HBV). Retrovirusser, ligesom retroelementer, kode reverse transkriptases (RT'er), katalyserende multi-trin omvendt transkription reaktion. Formålet med dette projekt er at bestemme strukturen og mekanismen for RT'er fra ikke-LTR retrotransposons og HBV. Dette vil udvide vores forståelse af RT'er og vil gøre det muligt at designe nye hæmmere af deres aktivitet. Vi planlægger også at belyse det strukturelle grundlag for retrotransposonhæmning af KRAB-KAP1-systemet. (Danish)
5 November 2022
0 references
Käänteinen transkriptio on yksisäikeisen RNA:n muuntaminen kaksisäikeiseksi. Se on välttämätöntä sellaisten transposoituvien elementtien leviämisen kannalta, joita kutsutaan retrotransposoneiksi, jotka muodostavat lähes 40 % ihmisen genomista. Niiden vaikutus on usein haitallinen, joten niiden toimintaa on valvottava. Tetrapodeissa hallitseva mekanismi on KRAB-KAP1-kompleksien transkriptiovaimennus. Jotkut retroelementit kehittyivät viruksiksi, joista monet ovat tärkeitä ihmisen patogeenejä, kuten ihmisen immuunikatovirus (HIV) ja hepatiitti B -virus (HBV). Retrovirukset, kuten retroelementit, koodaavat käänteiskopioijat (RT) ja katalysoivat monivaiheisen käänteisen transkriptioreaktion. Tämän hankkeen tavoitteena on määrittää muiden kuin LTR-jälleensiirtojen ja HBV-jälkilähetysten rakenne ja mekanismi. Tämä laajentaa ymmärrystämme RT: istä ja mahdollistaa niiden toiminnan uusien estäjien suunnittelun. Aiomme myös selvittää KRAB-KAP1-järjestelmän jälkikääntämisen rakenteellisen perustan. (Finnish)
5 November 2022
0 references
Η αντίστροφη μεταγραφή είναι η μετατροπή του μονοκλώνου RNA σε δίκλων DNA. Είναι απαραίτητο για τον πολλαπλασιασμό των μεταφερόμενων στοιχείων που ονομάζονται retrotransposons, τα οποία αποτελούν σχεδόν το 40 % του ανθρώπινου γονιδιώματος. Ο αντίκτυπός τους είναι συχνά επιζήμιος, οπότε η δραστηριότητά τους πρέπει να ελέγχεται. Στα τετράποδα, ο κυρίαρχος μηχανισμός είναι η μεταγραφική σιγή από συμπλέγματα KRAB-KAP1. Ορισμένα αναδρομικά στοιχεία εξελίχθηκαν σε ιούς, αρκετά από τα οποία είναι σημαντικά ανθρώπινα παθογόνα, όπως ο ιός της ανθρώπινης ανοσοανεπάρκειας (HIV) και ο ιός της ηπατίτιδας Β (HBV). Οι ρετροϊοί, όπως και τα αναδρομικά στοιχεία, κωδικοποιούν τις αντίστροφες μεταγραφές (RTs), καταλύοντας την αντίδραση αντίστροφης μεταγραφής πολλαπλών βημάτων. Στόχος του έργου αυτού είναι ο προσδιορισμός της δομής και του μηχανισμού των RTs από μη LTR retrotransposons και HBV. Αυτό θα διευρύνει την κατανόησή μας για τα RTs και θα επιτρέψει το σχεδιασμό νέων αναστολέων της δραστηριότητάς τους. Σχεδιάζουμε επίσης να αποσαφηνίσουμε τη δομική βάση της σίγασης της ρετρομεταφοράς από το σύστημα KRAB-KAP1. (Greek)
5 November 2022
0 references
Is tras-scríobh droim ar ais an chomhshó RNA aon-snáithe DNA dúbailte-snáithe. Tá sé riachtanach le haghaidh iomadú na n-eilimintí in-aistrithe ar a dtugtar retrotransposons, arb ionann iad agus beagnach 40 % den ghéanóm daonna. Is minic a bhíonn tionchar díobhálach acu, mar sin ní mór a ngníomhaíocht a rialú. I dtetrapods, is é coimpléisc KRAB-KAP1 an mheicníocht cheannasach. Tháinig roinnt retroelements chun cinn i víris, agus tá roinnt acu pataiginí daonna tábhachtacha cosúil le víreas easpa imdhíonachta daonna (HIV) agus víreas heipitíteas B (HBV). Retroviruses, díreach cosúil le retroelements, ionchódaigh tras-scríbhinní droim ar ais (RTs), Catalysing an t-imoibriú tras-scríobh ilchéim droim ar ais. Is é aidhm an tionscadail seo struchtúr agus meicníocht RTanna a chinneadh ó retrotransposons neamh-LTR agus HBV. Leathnóidh sé seo ár dtuiscint ar RTanna agus cuirfidh sé ar chumas coscairí núíosacha ar a ngníomhaíocht a dhearadh. Tá sé beartaithe againn freisin chun elucidate an bonn struchtúrach de retrotransposon tosta ag an gcóras KRAB-KAP1. (Irish)
5 November 2022
0 references
Reverzna transkripcija je pretvorba enosmerne RNK v dvostransko DNK. To je bistvenega pomena za širjenje prenosljivih elementov, imenovanih retrotranspozoni, ki predstavljajo skoraj 40 % človeškega genoma. Njihov vpliv je pogosto škodljiv, zato je treba njihovo dejavnost nadzorovati. V tetrapodih je prevladujoči mehanizem transkripcijsko utišanje kompleksov KRAB-KAP1. Nekateri retroelementi so se razvili v viruse, od katerih so nekateri pomembni človeški patogeni, kot sta virus humane imunske pomanjkljivosti (HIV) in virus hepatitisa B (HBV). Retrovirusi, tako kot retroelementi, kodirajo reverzne transkriptaze (RT), ki katalizirajo večstopenjsko reverzno transkripcijsko reakcijo. Cilj tega projekta je določiti strukturo in mehanizem RT iz ne-LTR retrotranspozonov in HBV. To bo razširilo naše razumevanje RT-jev in omogočilo oblikovanje novih zaviralcev njihove dejavnosti. Prav tako nameravamo pojasniti strukturno osnovo retrotranspozonskega utišanja s strani sistema KRAB-KAP1. (Slovenian)
5 November 2022
0 references
Omvänd transkription är omvandlingen av enkelsträngat RNA till dubbelsträngat DNA. Det är viktigt för spridningen av överförbara element som kallas retrotransposons, som utgör nästan 40 % av det mänskliga genomet. Deras inverkan är ofta skadlig, så deras verksamhet måste kontrolleras. I tetrapods är den dominerande mekanismen transkriptionell ljuddämpning av KRAB-KAP1-komplex. Vissa retroelement utvecklades till virus, varav flera är viktiga mänskliga patogener som humant immunbristvirus (HIV) och hepatit B-virus (HBV). Retrovirus, precis som retroelement, kodar omvänd transkriptas (RTs), katalyserar den omvända transkriptionsreaktionen i flera steg. Syftet med detta projekt är att bestämma strukturen och mekanismen för RTs från icke-LTR retrotransposons och HBV. Detta kommer att öka vår förståelse av RTs och kommer att möjliggöra utformning av nya hämmare av deras verksamhet. Vi planerar också att belysa den strukturella grunden för retrotransposon ljuddämpning av KRAB-KAP1-systemet. (Swedish)
5 November 2022
0 references
Transcrierea inversă este conversia ARN-ului cu un singur strat în ADN dublu. Este esențial pentru proliferarea elementelor transmisibile numite retrotransposoni, care constituie aproape 40 % din genomul uman. Impactul lor este adesea dăunător, astfel încât activitatea lor trebuie să fie controlată. În tetrapode, mecanismul dominant este amortizarea transcripțională de către complexele KRAB-KAP1. Unele retroelemente au evoluat în virusuri, dintre care unele sunt agenți patogeni umani importanți, cum ar fi virusul imunodeficienței umane (HIV) și virusul hepatitei B (VHB). Retrovirusurile, la fel ca retroelementele, codifică revers transcriptaze (RTs), catalizând reacția multi-step reverse transcription. Scopul acestui proiect este de a determina structura și mecanismul de RT-uri din retrotransposoni non-LTR și HBV. Acest lucru va extinde înțelegerea noastră a RT-urilor și va permite proiectarea de noi inhibitori ai activității lor. De asemenea, intenționăm să elucidăm baza structurală a zgomotului retrotransposon prin sistemul KRAB-KAP1. (Romanian)
5 November 2022
0 references
Обратната транскрипция е преобразуването на едноверижна РНК в двуверижна ДНК. Той е от съществено значение за разпространението на преносими елементи, наречени ретротранспозони, които съставляват почти 40 % от човешкия геном. Тяхното въздействие често е вредно, така че тяхната дейност трябва да бъде контролирана. В тетраподите доминиращият механизъм е транскрипционно заглушаване от комплекси KRAB-KAP1. Някои ретроелементи еволюират във вируси, някои от които са важни човешки патогени като човешкия имунодефицитен вирус (HIV) и вируса на хепатит B (HBV). Ретровируси, точно като ретроелементи, кодират обратни транскриптази (RTs), Катализат на многостъпкова обратна транскрипция реакция. Целта на този проект е да се определи структурата и механизмът на РТ от ретротранспозони, различни от LTR, и HBV. Това ще разшири нашето разбиране за RTs и ще даде възможност за проектиране на нови инхибитори на тяхната дейност. Планираме също така да изясним конструктивната основа на ретротранспозонното заглушаване от системата KRAB-KAP1. (Bulgarian)
5 November 2022
0 references
Pöördtranskriptsioon on üheahelalise RNA teisendamine kaheahelaliseks DNA-ks. See on oluline transponeeritavate elementide, mida nimetatakse retrotransposoonideks, levikuks, mis moodustavad peaaegu 40 % inimese genoomist. Nende mõju on sageli kahjulik, seega tuleb nende tegevust kontrollida. Tetrapodide puhul on domineerivaks mehhanismiks KRAB-KAP1 komplekside transkriptsiooniline summutus. Mõned retroelemendid arenesid viirusteks, millest mitmed on olulised inimese patogeenid, nagu inimese immuunpuudulikkuse viirus (HIV) ja B-hepatiidi viirus (HBV). Retroviirused, nagu retroelemendid, kodeerivad pöördtranskriptaasid (RTs), katalüseerides mitmeastmelist pöördtranskriptsiooni reaktsiooni. Projekti eesmärk on määrata kindlaks mitte-LTR retrotransponoonidest ja HBV-st pärinevate RTde struktuur ja mehhanism. See laiendab meie arusaamist RT-dest ja võimaldab nende aktiivsuse uudsete inhibiitorite kavandamist. Samuti plaanime selgitada KRAB-KAP1 süsteemi retrotransposon summeerimise struktuurset alust. (Estonian)
5 November 2022
0 references
A fordított transzkripció az egyszálú RNS átalakítása kettős szálú DNS-ré. Elengedhetetlen a retrotranszpozonoknak nevezett transzpozibilis elemek elterjedéséhez, amelyek az emberi genom közel 40% -át teszik ki. Hatásuk gyakran káros, ezért tevékenységüket ellenőrizni kell. A tetrapodokban a domináns mechanizmus a KRAB-KAP1 komplexek transzkripciós elhallgatása. Néhány retroelem vírussá fejlődött, amelyek közül több fontos humán kórokozók, mint például a humán immunhiány vírus (HIV) és a hepatitis B vírus (HBV). Retrovírusok, csakúgy, mint a retroelemek, kódolják a fordított transzkriptázokat (RT), a többlépcsős reverz transzkripciós reakciót. A projekt célja a nem-LTR retrotranszpozonok és HBV-k RT szerkezetének és mechanizmusának meghatározása. Ez bővíti az RT-k megértését, és lehetővé teszi a tevékenységük új gátlóinak tervezését. Tervezzük továbbá a KRAB-KAP1 rendszer retrotranszpozon hangtompításának szerkezeti alapjainak tisztázását is. (Hungarian)
5 November 2022
0 references
Reverzná transkripcia je konverzia jednovláknovej RNA na dvojstrannú DNA. Je to nevyhnutné pre šírenie transponovateľných prvkov nazývaných retrotranspozóny, ktoré tvoria takmer 40 % ľudského genómu. Ich vplyv je často škodlivý, takže ich činnosť musí byť kontrolovaná. V tetrapodoch je dominantným mechanizmom transkripčné tlmenie hluku komplexmi KRAB-KAP1. Niektoré retroelementy sa vyvinuli do vírusov, z ktorých niektoré sú dôležité ľudské patogény, ako je vírus ľudskej imunodeficiencie (HIV) a vírus hepatitídy B (HBV). Retrovírusy, rovnako ako retroelementy, kódujú reverzné transkriptázy (RT), katalyzujú viacstupňovú reverznú transkripčnú reakciu. Cieľom tohto projektu je určiť štruktúru a mechanizmus RT z neLTR retrotranspozónov a HBV. To rozšíri naše chápanie RT a umožní navrhnúť nové inhibítory ich činnosti. Plánujeme tiež objasniť štrukturálnu základňu retrotransposonového tlmenia pomocou systému KRAB-KAP1. (Slovak)
5 November 2022
0 references
Atvirkštinė transkripcija yra vienos krypties RNR konversija į dvigrandę DNR. Tai labai svarbu, kad daugėtų perkeliamų elementų, vadinamų retrotranspozonais, kurie sudaro beveik 40 % žmogaus genomo. Jų poveikis dažnai yra žalingas, todėl jų veikla turi būti kontroliuojama. Tetrapoduose dominuojantis mechanizmas yra transkripcinis triukšmo slopinimas KRAB-KAP1 kompleksuose. Kai kurie retroelementai išsivystė į virusus, iš kurių keli yra svarbūs žmogaus patogenai, tokie kaip žmogaus imunodeficito virusas (ŽIV) ir hepatito B virusas (HBV). Retrovirusai, kaip ir retroelementai, koduoja atvirkštines transkriptazes (RT), katalizuoja kelių žingsnių atvirkštinės transkripcijos reakciją. Šio projekto tikslas – nustatyti RT struktūrą ir mechanizmą iš ne LTR retrotranspozonų ir HBV. Tai išplės mūsų supratimą apie RT ir leis kurti naujus jų veiklos inhibitorius. Taip pat planuojame išsiaiškinti KRAB-KAP1 sistemos retrotranspozoninio triukšmo struktūrinį pagrindą. (Lithuanian)
5 November 2022
0 references
A transcrição reversa é a conversão de RNA de cadeia única em DNA de dupla cadeia. É essencial para a proliferação de elementos transponíveis chamados retrotransposons, que constituem quase 40 % do genoma humano. O seu impacto é frequentemente prejudicial, pelo que a sua atividade deve ser controlada. Nos tetrápodes, o mecanismo dominante é o silenciamento transcricional por complexos KRAB-KAP1. Alguns retroelementos evoluíram para vírus, vários dos quais são importantes patógenos humanos, como o vírus da imunodeficiência humana (VIH) e o vírus da hepatite B (HBV). Retrovírus, assim como retroelementos, codificam transcriptases reversas (RTs), Catalisando a reação de transcrição reversa multietapas. O objetivo deste projeto é determinar a estrutura e o mecanismo das RT de retrotransposição não LTR e HBV. Isto irá expandir a nossa compreensão das RTs e permitirá a conceção de novos inibidores da sua atividade. Também pretendemos elucidar a base estrutural do silenciamento retrotransposon pelo sistema KRAB-KAP1. (Portuguese)
5 November 2022
0 references
Traskrizzjoni inversa hija l-konverżjoni ta’ RNA single-stranded għal DNA double-stranded. Huwa essenzjali għall-proliferazzjoni ta’ elementi trasponibbli msejħa retrotransposons, li jikkostitwixxu kważi 40 % tal-ġenoma umana. L-impatt tagħhom huwa ta’ spiss detrimentali, u għalhekk l-attività tagħhom trid tiġi kkontrollata. Fit-tetrapods, il-mekkaniżmu dominanti huwa s-sajlenser traskrizzjonali mill-kumplessi KRAB-KAP1. Xi retroelementi evolvew f’virusis, li bosta minnhom huma patoġeni umani importanti bħall-virus tal-immunodefiċjenza umana (HIV) u l-virus tal-epatite B (HBV). Retroviruses, bħal retroelements, jikkodifikaw reverse transcriptases (RTs), li jikkatalizzaw ir-reazzjoni multi-step reverse transcription. L-għan ta’ dan il-proġett huwa li jiddetermina l-istruttura u l-mekkaniżmu ta’ RTs minn retrotransposons mhux LTR u HBV. Dan se jespandi l-fehim tagħna dwar l-RTs u se jippermetti d-disinn ta’ inibituri ġodda tal-attività tagħhom. Aħna wkoll tippjana li tiċċara l-bażi strutturali ta ‘sajlenser retrotransposon mis-sistema KRAB-KAP1. (Maltese)
5 November 2022
0 references
Reversā transkripcija ir vienpavediena RNS pārvēršana par divpakāpju DNS. Tas ir būtiski, lai izplatītos transposējamie elementi, ko sauc par retrotransponiem, kas veido gandrīz 40 % no cilvēka genoma. To ietekme bieži vien ir kaitīga, tāpēc to darbība ir jākontrolē. Tetrapodos dominējošais mehānisms ir KRAB-KAP1 kompleksu transkripcijas klusināšana. Daži retroelementi attīstījās vīrusos, no kuriem vairāki ir svarīgi cilvēka patogēni, piemēram, cilvēka imūndeficīta vīruss (HIV) un B hepatīta vīruss (HBV). Retrovīrusi, tāpat kā retroelementi, kodēt reversās transkriptāzes (RTs), Catalysing daudzpakāpju reversās transkripcijas reakciju. Šā projekta mērķis ir noteikt RN struktūru un mehānismu no retrotransponiem, kas nav LTR, un HBV. Tas paplašinās mūsu izpratni par RT un ļaus izstrādāt jaunus to darbības inhibitorus. Mēs arī plānojam izskaidrot KRAB-KAP1 sistēmas retrotransponu trokšņa slāpēšanas strukturālo pamatu. (Latvian)
5 November 2022
0 references
Reverzna transkripcija je pretvorba jednostrane RNK u dvostranu DNK. Neophodan je za proliferaciju prenosivih elemenata nazvanih retrotranspozoni, koji čine gotovo 40 % ljudskog genoma. Njihov utjecaj često je štetan, pa se njihova aktivnost mora kontrolirati. U tetrapodima dominantan mehanizam je transkripcijsko prigušivanje kompleksa KRAB-KAP1. Neki retroelementi evoluirali su u viruse, od kojih su neki važni ljudski patogeni poput virusa humane imunodeficijencije (HIV) i virusa hepatitisa B (HBV). Retrovirusi, baš kao i retroelementi, kodiraju obratne transkriptaze (RT-ovi), Katalizirajući višestupanjsku reakciju obrnutog transkripcije. Cilj ovog projekta je odrediti strukturu i mehanizam RT-ova iz retrotranspozona izvan LTR-a i HBV-a. To će proširiti naše razumijevanje RTs i omogućiti dizajn novih inhibitora njihove aktivnosti. Također planiramo razjasniti strukturnu osnovu retrotransposon prigušivanja od strane KRAB-KAP1 sustava. (Croatian)
5 November 2022
0 references
Reverzní transkripce je konverze jednosvazkové RNA na dvouvláknovou DNA. Je zásadní pro šíření přenosných prvků nazývaných retrotransposony, které tvoří téměř 40 % lidského genomu. Jejich dopad je často škodlivý, takže jejich činnost musí být kontrolována. V tetrapodech je dominantním mechanismem transkripční tlumení komplexy KRAB-KAP1. Některé retroelementy se vyvinuly v viry, z nichž některé jsou důležitými lidskými patogeny, jako je virus lidské imunodeficience (HIV) a virus hepatitidy B (HBV). Retroviry, stejně jako retroelementy, kódují reverzní transkriptázy (RT), katalyzují vícestupňovou reverzní transkripci. Cílem tohoto projektu je určit strukturu a mechanismus RT z retrotransposonů jiných než LTR a HBV. To rozšíří naše chápání RT a umožní navrhnout nové inhibitory jejich činnosti. Plánujeme také objasnit strukturální základy retrotransposonového umlčování systémem KRAB-KAP1. (Czech)
5 November 2022
0 references
Cały Kraj
0 references
6 July 2023
0 references
Identifiers
POIR.04.04.00-00-20E7/16
0 references