EXPLOITATION OF ENVIRONMENTAL BACTERIA ADAPTED TO WATER SCARCITY FOR BIOPROCESS ENGINEERING IN SOLID PHASE (Q3179455)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3179455 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | EXPLOITATION OF ENVIRONMENTAL BACTERIA ADAPTED TO WATER SCARCITY FOR BIOPROCESS ENGINEERING IN SOLID PHASE |
Project Q3179455 in Spain |
Statements
54,450.0 Euro
0 references
108,900.0 Euro
0 references
50.0 percent
0 references
1 January 2019
0 references
31 December 2021
0 references
UNIVERSIDAD DE VALENCIA
0 references
46980
0 references
LAS BACTERIAS AMBIENTALES SE DESARROLLAN EN UNA AMPLIA GAMA DE AMBIENTES, INCLUYENDO EL AGUA DULCE Y DE MAR. PERO LA MAYORIA DE LOS NICHOS MICROBIANOS TIENEN UN SUMINISTRO RELATIVAMENTE LIMITADO DE AGUA. EL SUELO, UNO DE LOS PRINCIPALES RESERVORIOS DE DIVERSIDAD MICROBIANA, ASI COMO UNA DE LAS PRINCIPALES FUENTES DE MICROORGANISMOS CON APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS, ES UN EJEMPLO TIPICO DE SUSTRATO SOLIDO HETEROGENEO Y LIMITADO EN AGUA DONDE, SIN EMBARGO, LA BIODIVERSIDAD MICROBIANA MEDRA. EN CONTRASTE CON LA SITUACION DE LA NATURALEZA, LOS CULTIVOS MICROBIANOS SE REALIZAN EN EL LABORATORIO CON UN SUMINISTRO FIJO DE AGUA, COMO ES EL CASO DE LOS LLAMADOS MEDIOS "SOLIDOS" (PLACAS DE AGAR) O DE LOS MEDIOS LIQUIDOS UTILIZADOS DURANTE DECADAS PARA EL CULTIVO DE CEPAS BACTERIANAS Y FUNGICAS._x000D_ ESTE SUBPROYECTO 1 DE SETH BUSCA EL DESARROLLO Y PRUEBA DE CONCEPTO DE NUEVOS DISPOSITIVOS DE CULTIVO QUE PERMITAN UN MEJOR AISLAMIENTO DE LOS MICROORGANISMOS XEROFILOS Y SU CRECIMIENTO EN REACTORES SIMILARES A LOS DE LA FERMENTACION EN ESTADO SOLIDO (SSF). SE PLANTEO LA HIPOTESIS DE QUE, DADA LA ESCASEZ DE AGUA EN MUCHOS ENTORNOS NATURALES, SE PODRIA UTILIZAR UN CONTENIDO LIMITADO DE AGUA EN CULTIVOS MICROBIANOS OPTIMIZADOS. COMPROBAMOS ESTA IDEA EN UNA SERIE DE EXPERIMENTOS PRELIMINARES EN MEDIO LIQUIDO Y SOBRE UN SUSTRATO SOLIDO (PAÑO DE LIMPIEZA COMERCIAL CON R2A). COMO DESCRIBIMOS EN LA PROPUESTA, VARIOS AISLADOS EXTREMOFILOS CRECIERON DE HECHO MEJOR EN TELA EMPAPADA QUE EN CONDICIONES LIQUIDAS._x000D_ PROPONEMOS DOS ENFOQUES PRINCIPALES: (1) DESARROLLO DE UNA HERRAMIENTA DE CRIBADO EN FORMA DE DISPOSITIVO DE CULTIVO SOLIDO CON DISPONIBILIDAD CONTROLADA DE AGUA. ESTE DISPOSITIVO PERMITIRA AISLAR LAS CEPAS AMBIENTALES A UNA MAYOR VELOCIDAD QUE LOS CULTIVOS ACTUALES BASADOS EN PLACAS DE PETRI. SE PROBARA ESTE DISPOSITIVO Y SE COMPARARA CON LAS TECNICAS DE CULTIVO HABITUALES, EN TERMINOS DE NUMERO Y DIVERSIDAD DE MICROORGANISMOS CULTIVABLES. ESPERAMOS QUE ESTE DISPOSITIVO AYUDE A RESOLVER UN PROBLEMA BIEN CONOCIDO EN ECOLOGIA MICROBIANA, LA "ANOMALIA DEL RECUENTO EN PLACA" (EL HECHO DE QUE LAS BACTERIAS CULTIVABLES SON SOLO UNA FRACCION DEL TOTAL). (2) UN ENFOQUE REFERIDO A LA FERMENTACION INDUSTRIAL. PLANEAMOS DESARROLLAR SISTEMAS MEJORADOS DE SSF PARA EL CULTIVO MICROBIANO, UTILIZANDO NUEVOS MATERIALES CON POROSIDAD DEFINIDA, Y PROBANDO CEPAS SELECCIONADAS EN CULTIVO PURO Y CO-CULTIVO. ESTO PERMITIRA ESTANDARIZAR EL PROCESO MEDIANTE LA DEFINICION DE LOS PARAMETROS BIOLOGICOS Y FISICOQUIMICOS DEL PROCESO Y SUPERAR LAS LIMITACIONES ACTUALES EN RENDIMIENTO Y REPRODUCIBILIDAD._x000D_ LAS CEPAS UTILIZADAS EN SETH PROCEDERAN DE: (I) NUESTRA COLECCION DE XEROTOLERANTES PROCEDENTES DEL PROYECTO ANTERIOR HELIOS; (II) UNA NUEVA COLECCION SELECCIONADA UTILIZANDO EL DISPOSITIVO DE BIOPROSPECCION DESCRITO EN LA PRESENTE PROPUESTA; (III) EVOLUCION EXPERIMENTAL CON LA PLATAFORMA EVOLVER, APLICANDO PRESIONES DE SELECCION (SIMULACION DE DESECACION EN NUESTRO CASO) DURANTE GENERACIONES. SE UTILIZARAN ANALISIS OMICOS PARA ESTUDIAR LOS DETERMINANTES MOLECULARES IMPLICADOS EN LA ADAPTACION A LA DESECACION. FINALMENTE, EL SUBPROYECTO INCLUYE EL DESARROLLO DE UN PROTOTIPO A MEDIA ESCALA PARA PROBAR EL FUNCIONAMIENTO DE LOS SISTEMAS DISEÑADOS A PARTIR DE LOS RESULTADOS OBTENIDOS, QUE COMBINARA EL CONOCIMIENTO GENERADO EN TERMINOS DE FACTORES ASOCIADOS A LA RESISTENCIA A LA DESECACION, ELECCION DEL SUSTRATO, DISEÑO DEL REACTOR Y CONDICIONES DE CRECIMIENTO. (Spanish)
0 references
ENVIRONMENTAL BACTERIA CAN DEVELOP IN A WIDE RANGE OF ENVIRONMENTS, INCLUDING, BUT NOT RESTRICTED TO, SEA AND FRESHWATER. THAT SAID, THE VAST MAJORITY OF THE MICROBIAL NICHES HAVE A RELATIVELY LIMITED SUPPLY OF WATER AND/OR SUFFER FROM STATIONARY WATER DEPRIVATION. SOIL, ONE OF THE MAIN RESERVOIRS FOR MICROBIAL DIVERSITY AS WELL AS ONE OF THE MAIN SOURCES OF MICROORGANISMS WITH BIOTECHNOLOGICAL APPLICATIONS, IS A TYPICAL EXAMPLE OF A HETEROGENEOUS, WATER-LIMITED SOLID SUBSTRATE WHERE, YET, MICROBIAL BIODIVERSITY CAN FLOURISH. IN STRIKING CONTRAST WITH THE SITUATION IN NATURE, MICROBIAL CULTURES ARE CARRIED OUT IN THE LAB WITH A FIXED SUPPLY OF WATER, AS IT IS THE CASE IN THE SO-CALLED ¿SOLID¿ MEDIA (AGAR PLATES), LET ALONE THE LIQUID BROTHS USED FOR DECADES FOR CULTURING BACTERIAL AND FUNGAL STRAINS._x000D_ THIS SUBPROJECT FOCUSES ON THE DEVELOPMENT AND PROOF OF CONCEPT OF NEW CULTIVATION DEVICES THAT MAY ALLOW FOR AN IMPROVED ISOLATION OF XEROPHILIC MICROORGANISMS, AS WELL AS TO THE GROWTH IN SOLID STATE FERMENTATION (SSF)-LIKE REACTORS. WE HYPOTHESIZED THAT, GIVEN THE SCARCITY OF WATER IN MANY NATURAL ENVIRONMENTS, AND THE IRREGULAR DISTRIBUTION IN SPACE AND TIME OF WATER, A LIMITED WATER CONTENT COULD BE USED IN OPTIMIZED MICROBIAL CULTURES. IN ORDER TO CHECK THIS, WE PERFORMED A SET OF PRELIMINARY EXPERIMENTS IN LIQUID MEDIA AND ON A SOLID SUBSTRATE (COMMERCIAL CLEANING CLOTH SOAKED WITH R2A). AS WE DESCRIBE IN OUR PROPOSAL, SEVERAL EXTREMOPHILIC ISOLATES GREW IN FACT BETTER IN SOAKED CLOTH COMPARED TO LIQUID CONDITIONS._x000D_ SUBPROJECT 1 IS STRUCTURED IN TWO MAIN APPROACHES. THE FIRST ONE CONSISTS OF THE DEVELOPMENT OF A SCREENING TOOL IN THE SHAPE OF A CULTURING SOLID DEVICE WITH CONTROLLED WATER AVAILABILITY. THIS DEVICE WILL ALLOW TO ISOLATE ENVIRONMENTAL STRAINS AT A HIGHER RATE THAN CURRENT PETRI DISH-BASED CULTURING. THIS DEVICE WILL BE TESTED AND ITS YIELD COMPARED WITH THAT OF REGULAR CULTURE TECHNIQUES, IN TERMS OF NUMBER AND DIVERSITY OF CULTURABLE MICROORGANISMS. WE EXPECT THAT THIS DEVICE WILL CONTRIBUTE TO SOLVE A WELL-KNOWN ISSUE IN MICROBIAL ECOLOGY, THE ¿PLATE COUNT ANOMALY¿ (THE FACT THAT CULTURABLE BACTERIA ARE JUST A FRACTION OF THE TOTAL ONES). THE SECOND APPROACH REFERS TO INDUSTRIAL FERMENTATION. IN THIS SUB-OBJECTIVE, WE PLAN TO DEVELOP IMPROVED SSF SYSTEMS FOR MICROBIAL CULTURE, BY USING NEW MATERIALS WITH DEFINED POROSITY, AND BY TESTING SELECTED STRAINS IN PURE AND CO-CULTURE. THIS DEVELOPMENT AIMS AT STANDARDIZING THE PROCESS BY DEFINING ALL THE BIOLOGICAL AND PHYSICOCHEMICAL PARAMETERS OF THE PROCESS TO OVERCOME CURRENT LIMITATIONS IN TERMS OF YIELD AND REPRODUCIBILITY. THE STRAINS USED IN THIS PROJECT WILL ORIGINATE EITHER FROM (I) OUR COLLECTION OF XEROTOLERANTS ISSUED FROM THE PREVIOUS PROJECT HELIOS; (II) A NEW COLLECTION GATHERED BY USING THE SPECIFIC BIOPROSPECTING DEVICE DESCRIBED IN THE PRESENT PROPOSAL; (III) STRAINS EVOLVED IN THE LAB WITH THE EVOLVER PLATFORM, WHICH ALLOWS TO USE SELECTION PRESSURES (SIMULATION OF DESICCATION IN OUR CASE) FOR MANY GENERATIONS. TRANSCRIPTOMIC AND PROTEOMIC ANALYSIS WILL BE USED TO STUDY THE TRANSCRIPTION AND TRANSLATION DETERMINANTS OF DESICCATION ADAPTATION. FINALLY, THIS SUBPROJECT WILL INCLUDE THE DEVELOPMENT OF A MID-SCALE PROTOTYPE TO TEST THE PERFORMANCE OF THE SYSTEMS DESIGNED FROM THE RESULTS OBTAINED, WHICH WILL COMBINE THE KNOWLEDGE OBTAINED IN TERMS OF DESICCATION RESISTANCE-ASSOCIATED FACTORS, SUBSTRATE CHOICE, REACTOR DESIGN AND GROWTH CONDITIONS. (English)
0 references
LES BACTÉRIES DE L’ENVIRONNEMENT SE DÉVELOPPENT DANS UN LARGE ÉVENTAIL D’ENVIRONNEMENTS, Y COMPRIS L’EAU DOUCE ET L’EAU DE MER. MAIS LA PLUPART DES NICHES MICROBIENNES ONT UN APPROVISIONNEMENT EN EAU RELATIVEMENT LIMITÉ. LE SOL, L’UN DES PRINCIPAUX RÉSERVOIRS DE DIVERSITÉ MICROBIENNE, AINSI QUE L’UNE DES PRINCIPALES SOURCES DE MICRO-ORGANISMES AYANT DES APPLICATIONS BIOTECHNOLOGIQUES, EST UN EXEMPLE TYPIQUE DE SUBSTRAT SOLIDE HÉTÉROGÈNE ET LIMITÉ DANS L’EAU OÙ, CEPENDANT, LA BIODIVERSITÉ MICROBIENNE MEDRA. Dans CONTRACT AVEC LA SITUATION de naturalité, les CULTIVS microbiens sont réalisés dans le laboratoire avec un approvisionnement en eau fixe, comme c’est le cas des appels à médiation «SOLID» (AGAR PLACES) ou des MÉDIAS LIQUID LIQUID DURANT DURANTS POUR LE cultivo of BACTERIAAN ET FUNGICAS CEPAS._x000D_ ce sous-projet 1 de SETH est à la recherche du développement et de la mise à l’essai de nouveaux échecs culturels. cela permet un meilleur accommodement des MICROORGANISMES xérophiliques et leur croissance en REACTEURS SIMILAIRES à ceux de SOLID FERMENTATION (SSF). ON A ÉMIS L’HYPOTHÈSE QUE, COMPTE TENU DE LA RARETÉ DE L’EAU DANS DE NOMBREUX ENVIRONNEMENTS NATURELS, UNE TENEUR EN EAU LIMITÉE POURRAIT ÊTRE UTILISÉE DANS LES CULTURES MICROBIENNES OPTIMISÉES. NOUS AVONS VÉRIFIÉ CETTE IDÉE DANS UNE SÉRIE D’EXPÉRIENCES PRÉLIMINAIRES EN MILIEU LIQUIDE ET SUR UN SUBSTRAT SOLIDE (LINGETTE DE NETTOYAGE COMMERCIALE AVEC R2A). Comme nous l’avons décrit dans la PROPOSITION, varios ISLADOS a grandi extrêmement loin d’un meilleur FEATURE DANS LES CONDITIONS LIQUIDES._x000D_ PROPONE UTILISER DEUX APPLICATIONS PRINCIPALES: (1) MISE AU POINT D’UN OUTIL DE CRIBLAGE SOUS LA FORME D’UN DISPOSITIF DE CROISSANCE SOLIDE AVEC DISPONIBILITÉ CONTRÔLÉE DE L’EAU. CE DISPOSITIF PERMETTRA D’ISOLER LES SOUCHES ENVIRONNEMENTALES À UN RYTHME PLUS RAPIDE QUE LES CULTURES À BASE DE PLAQUES DE PETRI ACTUELLES. CE DISPOSITIF SERA TESTÉ ET COMPARÉ AUX TECHNIQUES DE CULTURE HABITUELLES, EN TERMES DE NOMBRE ET DE DIVERSITÉ DES MICRO-ORGANISMES CULTIVABLES. NOUS ESPÉRONS QUE CE DISPOSITIF AIDERA À RÉSOUDRE UN PROBLÈME BIEN CONNU DANS L’ÉCOLOGIE MICROBIENNE, L’ANOMALIE DU NOMBRE DE PLAQUES (LE FAIT QUE LES BACTÉRIES CULTIVABLES NE REPRÉSENTENT QU’UNE FRACTION DU TOTAL). (2) UNE APPROCHE DE LA FERMENTATION INDUSTRIELLE. NOUS PRÉVOYONS DE METTRE AU POINT DES SYSTÈMES AMÉLIORÉS POUR LA CULTURE MICROBIENNE, EN UTILISANT DE NOUVEAUX MATÉRIAUX À POROSITÉ DÉFINIE ET EN TESTANT CERTAINES SOUCHES EN CULTURE PURE ET EN CO-CULTURE. Cela permettra de STANDARD LE PROCÉDURE PROCESSANT LA DÉFINICATION DES Paramètres BIOLOGIQUES ET physico-chimiques du PROCESSE ET SUPER LES LIMITATIONS ACTUELLES EN REPRODUCIBILITÉ ET REPRODUCIBILITÉ._x000D_ Les ECA utilisés dans SETH proviendront: (I) NOTRE COLLECTION DE XEROTOLERANTS DU PROJET PRÉCÉDENT HELIOS; (II) UNE NOUVELLE COLLECTION SÉLECTIONNÉE À L’AIDE DU DISPOSITIF DE BIOPROSPECTION DÉCRIT DANS LA PRÉSENTE PROPOSITION; (III) ÉVOLUTION EXPÉRIMENTALE AVEC LA PLATE-FORME EVOLVER, EN APPLIQUANT DES PRESSIONS DE SÉLECTION (SIMULATION DE SÉCHAGE DANS NOTRE CAS) PENDANT DES GÉNÉRATIONS. L’ANALYSE OMIC SERA UTILISÉE POUR ÉTUDIER LES DÉTERMINANTS MOLÉCULAIRES IMPLIQUÉS DANS L’ADAPTATION AU SÉCHAGE. ENFIN, LE SOUS-PROJET COMPREND LA MISE AU POINT D’UN PROTOTYPE À MOYENNE ÉCHELLE POUR TESTER LE FONCTIONNEMENT DES SYSTÈMES CONÇUS À PARTIR DES RÉSULTATS OBTENUS, EN COMBINANT LES CONNAISSANCES GÉNÉRÉES EN TERMES DE FACTEURS LIÉS À LA RÉSISTANCE AU SÉCHAGE, AU CHOIX DU SUBSTRAT, À LA CONCEPTION DU RÉACTEUR ET AUX CONDITIONS DE CROISSANCE. (French)
4 December 2021
0 references
UMWELTBAKTERIEN ENTWICKELN SICH IN EINER VIELZAHL VON UMGEBUNGEN, EINSCHLIESSLICH SÜSS- UND MEERWASSER. ABER DIE MEISTEN MIKROBIELLEN NISCHEN HABEN EINE RELATIV BEGRENZTE VERSORGUNG MIT WASSER. EIN TYPISCHES BEISPIEL FÜR HETEROGENES FESTSUBSTRAT IST DER BODEN, EINER DER HAUPTQUELLEN MIKROBIELLER VIELFALT SOWIE EINE DER HAUPTQUELLEN VON MIKROORGANISMEN MIT BIOTECHNOLOGISCHEN ANWENDUNGEN. In CONTRACT MIT THE Naturality SITUATION werden die mikrobiellen CULTIVS im Labor mit einer festen Wasserversorgung durchgeführt, wie es bei den „SOLID“ vermittelten Anrufen (AGAR PLACES) oder der DURANT DURING LIQUID LIQUID MEDIAS für den Kultivo BACTERIAAN UND FUNGICAS CEPAS._x000D_ dieses Teilprojekt 1 von SETH ist auf der Suche nach der Entwicklung und Erprobung von neuem Kultiv Dispositiven, die eine bessere Unterbringung von xerophilen MICROORGANISMS und ihr Wachstum in SIMILAR REACTOREN zu denen der SOLID FERMENTATION (SSF) ermöglichen. DIE HYPOTHESE WURDE ANGEHOBEN, DASS ANGESICHTS DER WASSERKNAPPHEIT IN VIELEN NATÜRLICHEN UMGEBUNGEN EIN BEGRENZTER WASSERGEHALT IN OPTIMIERTEN MIKROBIELLEN KULTUREN VERWENDET WERDEN KÖNNTE. DIESE IDEE HABEN WIR IN EINER REIHE VON VORVERSUCHEN IM FLÜSSIGEN MEDIUM UND AUF EINEM FESTEN SUBSTRAT (KOMMERZIELLES REINIGUNGSTUCH MIT R2A) GEPRÜFT. Wie wir in der PROPOSAL beschrieben, varios ISLADOS Extrem aufgewachsen aus besserer FEATURE IN DEN EMPAPED DAS IN LIQUID CONDITIONS._x000D_ PROPONE USE TWO PRINCIPAL APPLICATIONEN: (1) ENTWICKLUNG EINES SCREENING-TOOLS IN FORM EINES FESTEN ANBAUGERÄTS MIT KONTROLLIERTER WASSERVERFÜGBARKEIT. DIESES GERÄT ERMÖGLICHT ES, UMWELTSTÄMME SCHNELLER ZU ISOLIEREN ALS DIE DERZEITIGEN PETRI-PLATTENKULTUREN. DIESES GERÄT WIRD IN BEZUG AUF DIE ANZAHL UND DIE VIELFALT DER KULTIVIERBAREN MIKROORGANISMEN MIT DEN ÜBLICHEN KULTURTECHNIKEN VERGLICHEN. WIR HOFFEN, DASS DIESES GERÄT DAZU BEITRAGEN WIRD, EIN BEKANNTES PROBLEM IN DER MIKROBIELLEN ÖKOLOGIE ZU LÖSEN, DIE „PLATTENZÄHLANOMALIE“ (DIE TATSACHE, DASS KULTIVIERBARE BAKTERIEN NUR EIN BRUCHTEIL DER SUMME SIND). (2) EINE HERANGEHENSWEISE AN DIE INDUSTRIELLE GÄRUNG. WIR PLANEN, VERBESSERTE SSF-SYSTEME FÜR DEN MIKROBIELLEN ANBAU ZU ENTWICKELN, NEUE MATERIALIEN MIT DEFINIERTER POROSITÄT ZU VERWENDEN UND AUSGEWÄHLTE STÄMME IN REINKULTUR UND KOKULTIVIERUNG ZU TESTEN. Dadurch wird es möglich sein, die PROCEDURE PROCESSIERUNG DER BIOLOGISCHEN und physikalisch-chemischen Parameter des PROCESSES zu STRANDARDEN UND AUF DIE AKTIONEN IN DER ERWÄGUNG UND REPRODUCIBILITÄT._x000D_ Die ECAs, die im SETH verwendet werden, stammen aus: (I) UNSERE SAMMLUNG VON XEROTOLERANTS AUS DEM VORHERIGEN PROJEKT HELIOS; II) EINE NEUE SAMMLUNG, DIE UNTER VERWENDUNG DES IN DIESEM VORSCHLAG BESCHRIEBENEN BIOPROSPECTING-GERÄTS AUSGEWÄHLT WURDE; (III) EXPERIMENTELLE EVOLUTION MIT DER EVOLVER-PLATTFORM, UNTER ANWENDUNG VON SELEKTIONSDRÜCKEN (SIMULATION DER TROCKNUNG IN UNSEREM FALL) FÜR GENERATIONEN. DIE OMIC ANALYSE WIRD VERWENDET, UM DIE MOLEKULAREN DETERMINANTEN ZU UNTERSUCHEN, DIE AN DER ANPASSUNG AN DIE TROCKNUNG BETEILIGT SIND. SCHLIESSLICH UMFASST DAS TEILPROJEKT DIE ENTWICKLUNG EINES MITTELGROSSEN PROTOTYPS ZUR ERPROBUNG DER FUNKTIONSWEISE DER SYSTEME, DIE AUS DEN GEWONNENEN ERGEBNISSEN ENTWICKELT WURDEN, WOBEI DAS WISSEN ÜBER FAKTOREN KOMBINIERT WIRD, DIE MIT TROCKNUNGSBESTÄNDIGKEIT, SUBSTRATUMWAHL, REAKTORDESIGN UND WACHSTUMSBEDINGUNGEN VERBUNDEN SIND. (German)
9 December 2021
0 references
MILIEUBACTERIËN ONTWIKKELEN ZICH IN EEN BREED SCALA AAN OMGEVINGEN, WAARONDER ZOET EN ZEEWATER. MAAR DE MEESTE MICROBIOLOGISCHE NICHES HEBBEN EEN RELATIEF BEPERKTE WATERVOORZIENING. DE BODEM, EEN VAN DE BELANGRIJKSTE RESERVOIRS VAN MICROBIËLE DIVERSITEIT EN EEN VAN DE BELANGRIJKSTE BRONNEN VAN MICRO-ORGANISMEN MET BIOTECHNOLOGISCHE TOEPASSINGEN, IS EEN TYPISCH VOORBEELD VAN HETEROGENE VASTE ONDERGROND EN BEPERKT IN WATER, WAAR DE MICROBIËLE BIODIVERSITEIT ECHTER MEDRA IS. In CONTRACT MET DE naturaliteit SITUATION worden de microbiële CULTIVS uitgevoerd in het laboratorium met een vaste watervoorziening, zoals het geval is bij de „SOLID” gemedieerde oproepen (AGAR PLACES) of van de DURANT DURING LIQUID LIQUID MEDIAS VOOR DE cultivo van BACTERIAAN EN FUNGICAS CEPAS._x000D_ dit subproject 1 van SETH is op zoek naar de ontwikkeling en het testen van nieuwe Cultive dispositives dat maakt een betere huisvesting van xerophilic MICROORGANISMS en hun groei in SIMILAR REACTORS naar die van SOLID FERMENTATION (SSF). DE HYPOTHESE WERD OPGEWORPEN DAT, GEZIEN DE WATERSCHAARSTE IN VEEL NATUURLIJKE OMGEVINGEN, EEN BEPERKT WATERGEHALTE KON WORDEN GEBRUIKT IN GEOPTIMALISEERDE MICROBIËLE GEWASSEN. WE CONTROLEERDEN DIT IDEE IN EEN REEKS VOORBEREIDENDE EXPERIMENTEN IN VLOEIBAAR MEDIUM EN OP EEN VAST SUBSTRAAT (COMMERCIËLE REINIGINGSDOEK MET R2A). Zoals we beschreven in het PROPOSAL, varios ISLADOS Uiterst opgegroeid van betere kenmerken IN DE EMPAPED DAT IN LIQUID CONDITIONS._x000D_ PROPONE GEBRUIKT TWEE PRINCIPAL APPLICATIONS: (1) ONTWIKKELING VAN EEN ZEEFINSTRUMENT IN DE VORM VAN EEN SOLIDE GROEIAPPARAAT MET GECONTROLEERDE BESCHIKBAARHEID VAN WATER. DIT APPARAAT ZAL HET MOGELIJK MAKEN OM MILIEUSTAMMEN SNELLER TE ISOLEREN DAN DE HUIDIGE PETRI-PLAATGEWASSEN. DIT APPARAAT ZAL WORDEN GETEST EN VERGELEKEN MET DE GEBRUIKELIJKE KWEEKTECHNIEKEN, IN TERMEN VAN HET AANTAL EN DE DIVERSITEIT VAN KWEEKBARE MICRO-ORGANISMEN. WE HOPEN DAT DIT APPARAAT ZAL HELPEN BIJ HET OPLOSSEN VAN EEN BEKEND PROBLEEM IN DE MICROBIËLE ECOLOGIE, DE „PLAATTELLING ANOMALIE” (HET FEIT DAT GEKWEEKTE BACTERIËN SLECHTS EEN FRACTIE VAN HET TOTAAL ZIJN). (2) EEN BENADERING VAN INDUSTRIËLE GISTING. WE ZIJN VAN PLAN OM VERBETERDE SSF-SYSTEMEN TE ONTWIKKELEN VOOR MICROBIËLE TEELT, MET BEHULP VAN NIEUWE MATERIALEN MET GEDEFINIEERDE POROSITEIT, EN HET TESTEN VAN GESELECTEERDE STAMMEN IN PURE CULTUUR EN CO-CULTIVATIE. Dit zal het mogelijk maken om de PROCEDURE PROCESSING VAN DE ONTWIKKELING VAN DE BIOLOGISCHE EN fysisch-chemische parametres VAN HET PROCESS EN SUPER DE ACTUALE LIMITATIONS IN REPRODUCIBILITEITHEID._x000D_ De ECA’s die in SETH worden gebruikt, komen uit: (I) ONZE COLLECTIE XEROTOLERANTS VAN HET VORIGE PROJECT HELIOS; (II) EEN NIEUWE COLLECTIE GESELECTEERD MET BEHULP VAN HET IN DIT VOORSTEL BESCHREVEN BIOPROSPECTINGSYSTEEM; (III) EXPERIMENTELE EVOLUTIE MET HET EVOLVER PLATFORM, HET TOEPASSEN VAN SELECTIEDRUK (SIMULATIE VAN DROGEN IN ONS GEVAL) VOOR GENERATIES. OMISCHE ANALYSE ZAL WORDEN GEBRUIKT OM DE MOLECULAIRE DETERMINANTEN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ DE AANPASSING AAN HET DROGEN TE BESTUDEREN. TEN SLOTTE OMVAT HET SUBPROJECT DE ONTWIKKELING VAN EEN PROTOTYPE OP MIDDELLANGE SCHAAL OM DE WERKING VAN DE OP BASIS VAN DE VERKREGEN RESULTATEN ONTWORPEN SYSTEMEN TE TESTEN, WAARBIJ DE KENNIS WORDT GECOMBINEERD DIE WORDT GEGENEREERD IN TERMEN VAN FACTOREN DIE VERBAND HOUDEN MET DROOGBESTENDIGHEID, SUBSTRATUMKEUZE, REACTORONTWERP EN GROEIOMSTANDIGHEDEN. (Dutch)
17 December 2021
0 references
I BATTERI AMBIENTALI SI SVILUPPANO IN UNA VASTA GAMMA DI AMBIENTI, TRA CUI L'ACQUA DOLCE E DI MARE. MA LA MAGGIOR PARTE DELLE NICCHIE MICROBICHE HANNO UN APPROVVIGIONAMENTO RELATIVAMENTE LIMITATO DI ACQUA. IL SUOLO, UNO DEI PRINCIPALI SERBATOI DI DIVERSITÀ MICROBICA, NONCHÉ UNA DELLE PRINCIPALI FONTI DI MICRORGANISMI CON APPLICAZIONI BIOTECNOLOGICHE, È UN TIPICO ESEMPIO DI SUBSTRATO SOLIDO ETEROGENEO E LIMITATO IN ACQUA DOVE, TUTTAVIA, LA BIODIVERSITÀ MICROBICA MEDRA. In CONTRATTO CON LA SITUAZIONE di naturalità, i CULTIVI microbici vengono effettuati in laboratorio con un approvvigionamento idrico fisso, come nel caso delle chiamate mediate "SOLID" (piatti AGAR) o dei MEDIA LIQUID LIQUID LIQUID DURANTE DURANTE PER IL cultivo DI CEPAS BACTERIAAN E FUNGICAS._x000D_ questo sottoprogetto 1 del SETH sta cercando lo sviluppo e la sperimentazione di nuove Cultive dispositivi che permettono una migliore sistemazione dei MICROORGANISMI xerofili e la loro crescita in REACTORS SIMILAR a quelli della FERMENTAZIONE SOLID (SSF). L'IPOTESI È STATA SOLLEVATA CHE, DATA LA SCARSITÀ DI ACQUA IN MOLTI AMBIENTI NATURALI, IL CONTENUTO D'ACQUA LIMITATO POTREBBE ESSERE UTILIZZATO NELLE COLTURE MICROBICHE OTTIMIZZATE. ABBIAMO CONTROLLATO QUESTA IDEA IN UNA SERIE DI ESPERIMENTI PRELIMINARI IN MEZZO LIQUIDO E SU UN SUBSTRATO SOLIDO (TESSUTO PER LA PULIZIA COMMERCIALE CON R2A). Come abbiamo descritto nel PROPOSALE, i varios ISLADOS sono cresciuti Estremamente da una migliore FEATURE NEL PROPOSTA CHE IN CONDIZIONI LIQUID._x000D_ PROPONE USO DUE APPLICAZIONE PRINCIPALI: (1) SVILUPPO DI UNO STRUMENTO DI SCREENING SOTTO FORMA DI UN DISPOSITIVO A CRESCITA SOLIDA CON DISPONIBILITÀ DI ACQUA CONTROLLATA. QUESTO DISPOSITIVO CONSENTIRÀ DI ISOLARE I CEPPI AMBIENTALI AD UN RITMO PIÙ RAPIDO RISPETTO ALLE ATTUALI COLTURE A BASE DI PIASTRA DI PETRI. QUESTO DISPOSITIVO SARÀ TESTATO E CONFRONTATO CON LE CONSUETE TECNICHE DI COLTURA, IN TERMINI DI NUMERO E DIVERSITÀ DEI MICRORGANISMI COLTIVABILI. SPERIAMO CHE QUESTO DISPOSITIVO AIUTERÀ A RISOLVERE UN PROBLEMA BEN NOTO NELL'ECOLOGIA MICROBICA, LA "ANOMALIA DEL CONTEGGIO DELLE PIASTRINE" (IL FATTO CHE I BATTERI COLTIVABILI SONO SOLO UNA FRAZIONE DEL TOTALE). (2) UN APPROCCIO ALLA FERMENTAZIONE INDUSTRIALE. PROGETTIAMO DI SVILUPPARE MIGLIORI SISTEMI SSF PER LA COLTIVAZIONE MICROBICA, UTILIZZANDO NUOVI MATERIALI CON POROSITÀ DEFINITA, E TESTANDO CEPPI SELEZIONATI IN COLTURA PURA E CO-COLTIVAZIONE. Ciò consentirà di STANDARD LA PROCEDURA PROCESSIONE DELLA DEFINICAZIONE DEI Parametri BIOLOGICI e fisico-chimici DEL PROCESSO E SUPER LE LIMITAZIONI ATTUALI IN REPRODUCIBILITÀ E REPRODUCIBILITÀ._x000D_ Le ECA utilizzate nel SETH proverranno da: I) LA NOSTRA COLLEZIONE DI XEROTOLERANTS DEL PRECEDENTE PROGETTO HELIOS; II) UNA NUOVA COLLEZIONE SELEZIONATA UTILIZZANDO IL DISPOSITIVO DI BIOPROSPEZIONE DESCRITTO NELLA PRESENTE PROPOSTA; (III) EVOLUZIONE SPERIMENTALE CON LA PIATTAFORMA EVOLVER, APPLICANDO PRESSIONI DI SELEZIONE (SIMULAZIONE DI ESSICCAZIONE NEL NOSTRO CASO) PER GENERAZIONI. L'ANALISI OMICA SARÀ UTILIZZATA PER STUDIARE I DETERMINANTI MOLECOLARI COINVOLTI NELL'ADATTAMENTO ALL'ESSICCAZIONE. INFINE, IL SOTTOPROGETTO PREVEDE LO SVILUPPO DI UN PROTOTIPO SU SCALA MEDIA PER TESTARE IL FUNZIONAMENTO DEI SISTEMI PROGETTATI SULLA BASE DEI RISULTATI OTTENUTI, COMBINANDO LE CONOSCENZE GENERATE IN TERMINI DI FATTORI ASSOCIATI ALLA RESISTENZA ALL'ESSICCAZIONE, ALLA SCELTA DEL SUBSTRATO, ALLA PROGETTAZIONE DEL REATTORE E ALLE CONDIZIONI DI CRESCITA. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΤΑ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΆ ΒΑΚΤΉΡΙΑ ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΑΝΑΠΤΥΧΘΟΎΝ ΣΕ ΈΝΑ ΕΥΡΎ ΦΆΣΜΑ ΠΕΡΙΒΑΛΛΌΝΤΩΝ, ΣΥΜΠΕΡΙΛΑΜΒΑΝΟΜΈΝΩΝ, ΜΕΤΑΞΎ ΆΛΛΩΝ, ΤΗΣ ΘΆΛΑΣΣΑΣ ΚΑΙ ΤΟΥ ΓΛΥΚΟΎ ΝΕΡΟΎ. ΤΟΎΤΟΥ ΛΕΧΘΈΝΤΟΣ, Η ΣΥΝΤΡΙΠΤΙΚΉ ΠΛΕΙΟΝΌΤΗΤΑ ΤΩΝ ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΏΝ ΚΌΓΧΩΝ ΈΧΟΥΝ ΣΧΕΤΙΚΆ ΠΕΡΙΟΡΙΣΜΈΝΗ ΠΑΡΟΧΉ ΝΕΡΟΎ ΚΑΙ/Ή ΥΠΟΦΈΡΟΥΝ ΑΠΌ ΣΤΑΤΙΚΉ ΣΤΈΡΗΣΗ ΝΕΡΟΎ. ΤΟ ΈΔΑΦΟΣ, ΈΝΑΣ ΑΠΌ ΤΟΥΣ ΚΎΡΙΟΥΣ ΤΑΜΙΕΥΤΉΡΕΣ ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΉΣ ΠΟΙΚΙΛΌΤΗΤΑΣ, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΜΊΑ ΑΠΌ ΤΙΣ ΚΎΡΙΕΣ ΠΗΓΈΣ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΏΝ ΜΕ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΈΣ ΕΦΑΡΜΟΓΈΣ, ΑΠΟΤΕΛΕΊ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΌ ΠΑΡΆΔΕΙΓΜΑ ΕΝΌΣ ΕΤΕΡΟΓΕΝΟΎΣ ΣΤΕΡΕΟΎ ΥΠΟΣΤΡΏΜΑΤΟΣ ΜΕ ΠΕΡΙΟΡΙΣΜΈΝΟ ΝΕΡΌ, ΌΠΟΥ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΑΝΘΊΣΕΙ Η ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΉ ΒΙΟΠΟΙΚΙΛΌΤΗΤΑ. Σε ΔΙΑΤΑΞΗ ΣΥΜΒΑΛΛΟΜΕΝΩΝ ΜΕ ΤΗΝ ΚΑΤΑΣΤΑΣΗ ΣΤΗ ΦΥΣΗ, οι ΜΙΚΡΟΒΙΩΤΙΚΟΙ ΠΟΛΙΤΙΣΜΟΙ ΕΦΑΡΜΟΖΟΝΤΑΙ ΣΤΟ ΤΟ ΤΟ ΦΥΤΟ ΜΕ ΤΗ ΦΥΣΗ ΜΕ ΤΗ ΦΥΣΙΚΗ, ΩΣ ΥΠΟΘΕΣΗ ΣΤΗ ΣΟΛΙΔΙΔΗ ΜΕΤΡΙΑ (AGAR PLATES), ΛΑΜΒΑΝΟΝΤΑΙ οι ΥΓΕΡΙΚΕΣ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΣΕΙΣ που ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΥΝΤΑΙ για ΑΠΟΚΛΕΙΣΤΙΚΑ ΒΑΚΤΗΡΙΑ και ΧΡΗΜΑΤΟΔΟΤΙΚΑ STRAINS._x000D_ Αυτό το υποέργο FOCUSES ΣΧΕΤΙΚΑ ΜΕ ΤΗΝ ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΚΑΙ ΤΟ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑ ΤΩΝ ΝΕΩΝ ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΩΝ ΠΟΛΙΤΙΣΜΟΥ ΤΩΝ ΝΕΩΝ ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΩΝ ΠΟΛΙΤΙΣΜΟΥ που μπορουν να ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΥΝΤΑΙ για μια ΒΕΛΤΙΩΜΕΝΗ ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗ ΞΕΡΟφιλικών ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΩΝ, Οσον αφορα την ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΣΤΑΘΕΡΟΠΟΙΗΣΕΩΝ (SSF)-LIKE REACTOR. ΥΠΟΘΈΣΑΜΕ ΌΤΙ, ΔΕΔΟΜΈΝΗΣ ΤΗΣ ΛΕΙΨΥΔΡΊΑΣ ΣΕ ΠΟΛΛΆ ΦΥΣΙΚΆ ΠΕΡΙΒΆΛΛΟΝΤΑ ΚΑΙ ΤΗΣ ΑΚΑΝΌΝΙΣΤΗΣ ΚΑΤΑΝΟΜΉΣ ΤΟΥ ΝΕΡΟΎ ΣΤΟ ΧΏΡΟ ΚΑΙ ΣΤΟ ΧΡΌΝΟ, ΜΙΑ ΠΕΡΙΟΡΙΣΜΈΝΗ ΠΕΡΙΕΚΤΙΚΌΤΗΤΑ ΣΕ ΝΕΡΌ ΘΑ ΜΠΟΡΟΎΣΕ ΝΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΕΊ ΣΕ ΒΕΛΤΙΣΤΟΠΟΙΗΜΈΝΕΣ ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΈΣ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΕΣ. ΓΙΑ ΝΑ ΤΟ ΕΛΈΓΞΟΥΜΕ ΑΥΤΌ, ΠΡΑΓΜΑΤΟΠΟΙΉΣΑΜΕ ΈΝΑ ΣΎΝΟΛΟ ΠΡΟΚΑΤΑΡΚΤΙΚΏΝ ΠΕΙΡΑΜΆΤΩΝ ΣΕ ΥΓΡΆ ΜΈΣΑ ΚΑΙ ΣΕ ΣΤΕΡΕΌ ΥΠΌΣΤΡΩΜΑ (ΕΜΠΟΡΙΚΌ ΎΦΑΣΜΑ ΚΑΘΑΡΙΣΜΟΎ ΕΜΠΟΤΙΣΜΈΝΟ ΜΕ R2A). ΩΣ ΠΕΡΙΓΡΑΦΗ ΣΤΗΝ ΠΡΟΤΑΣΗ ΜΑΣ, ΛΑΜΒΑΝΟΝΤΑΣ ΥΠΟΨΗ ΕΛΑΧΙΣΤΕΣ ΕΞΕΛΙΞΕΙΣ ΙΣΟΛΗΨΕΙΣ ΣΤΑ ΠΛΑΙΣΙΑ ΣΤΟ ΣΩΛΗΝΙΚΟ ΚΛΩΣΤΟ ΠΟΥ ΣΥΜΦΩΝΕΤΑΙ ΣΤΙΣ Υγρές Συνθήκες._x000D_ Υποέργο 1 ΔΙΑΡΡΥΘΜΙΖΕΤΑΙ σε ΔΙΚΤΥΕΣ ΚΥΡΙΕΣ ΕΦΑΡΜΟΓΕΣ. ΤΟ ΠΡΏΤΟ ΣΥΝΊΣΤΑΤΑΙ ΣΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΕΝΌΣ ΕΡΓΑΛΕΊΟΥ ΔΙΑΛΟΓΉΣ ΣΕ ΣΧΉΜΑ ΣΤΕΡΕΉΣ ΣΥΣΚΕΥΉΣ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑΣ ΜΕ ΕΛΕΓΧΌΜΕΝΗ ΔΙΑΘΕΣΙΜΌΤΗΤΑ ΝΕΡΟΎ. Η ΣΥΣΚΕΥΉ ΑΥΤΉ ΘΑ ΕΠΙΤΡΈΨΕΙ ΤΗΝ ΑΠΟΜΌΝΩΣΗ ΤΩΝ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΏΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ΜΕ ΥΨΗΛΌΤΕΡΟ ΡΥΘΜΌ ΑΠΌ ΤΗΝ ΤΡΈΧΟΥΣΑ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑ ΜΕ ΒΆΣΗ ΤΑ ΠΙΆΤΑ PETRI. Η ΣΥΣΚΕΥΉ ΑΥΤΉ ΘΑ ΔΟΚΙΜΑΣΤΕΊ ΚΑΙ Η ΑΠΌΔΟΣΉ ΤΗΣ ΘΑ ΣΥΓΚΡΙΘΕΊ ΜΕ ΕΚΕΊΝΗ ΤΩΝ ΤΑΚΤΙΚΏΝ ΤΕΧΝΙΚΏΝ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑΣ, ΌΣΟΝ ΑΦΟΡΆ ΤΟΝ ΑΡΙΘΜΌ ΚΑΙ ΤΗΝ ΠΟΙΚΙΛΊΑ ΤΩΝ ΚΑΛΛΙΕΡΓΉΣΙΜΩΝ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΏΝ. ΑΝΑΜΈΝΟΥΜΕ ΌΤΙ ΑΥΤΉ Η ΣΥΣΚΕΥΉ ΘΑ ΣΥΜΒΆΛΕΙ ΣΤΗΝ ΕΠΊΛΥΣΗ ΕΝΌΣ ΓΝΩΣΤΟΎ ΖΗΤΉΜΑΤΟΣ ΣΤΗ ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΉ ΟΙΚΟΛΟΓΊΑ, ΤΗΣ ΑΝΩΜΑΛΊΑΣ ΤΟΥ ΑΡΙΘΜΟΎ ΤΩΝ ΠΛΑΚΏΝ (ΤΟ ΓΕΓΟΝΌΣ ΌΤΙ ΤΑ ΚΑΛΛΙΕΡΓΟΎΜΕΝΑ ΒΑΚΤΉΡΙΑ ΕΊΝΑΙ ΜΌΝΟ ΈΝΑ ΚΛΆΣΜΑ ΤΩΝ ΣΥΝΟΛΙΚΏΝ). Η ΔΕΎΤΕΡΗ ΠΡΟΣΈΓΓΙΣΗ ΑΦΟΡΆ ΤΗ ΒΙΟΜΗΧΑΝΙΚΉ ΖΎΜΩΣΗ. ΣΕ ΑΥΤΌΝ ΤΟΝ ΕΠΙΜΈΡΟΥΣ ΣΤΌΧΟ, ΣΧΕΔΙΆΖΟΥΜΕ ΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΒΕΛΤΙΩΜΈΝΩΝ ΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ ΣΑΧ ΓΙΑ ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΉ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑ, ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΝΈΩΝ ΥΛΙΚΏΝ ΜΕ ΚΑΘΟΡΙΣΜΈΝΟ ΠΟΡΏΔΕΣ ΚΑΙ ΜΕ ΤΗ ΔΟΚΙΜΉ ΕΠΙΛΕΓΜΈΝΩΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ΣΕ ΚΑΘΑΡΉ ΚΑΙ ΣΥΝΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑ. Η ΕΞΈΛΙΞΗ ΑΥΤΉ ΑΠΟΣΚΟΠΕΊ ΣΤΗΝ ΤΥΠΟΠΟΊΗΣΗ ΤΗΣ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑΣ ΚΑΘΟΡΊΖΟΝΤΑΣ ΌΛΕΣ ΤΙΣ ΒΙΟΛΟΓΙΚΈΣ ΚΑΙ ΦΥΣΙΚΟΧΗΜΙΚΈΣ ΠΑΡΑΜΈΤΡΟΥΣ ΤΗΣ ΔΙΕΡΓΑΣΊΑΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΥΠΈΡΒΑΣΗ ΤΩΝ ΥΦΙΣΤΆΜΕΝΩΝ ΠΕΡΙΟΡΙΣΜΏΝ ΌΣΟΝ ΑΦΟΡΆ ΤΗΝ ΑΠΌΔΟΣΗ ΚΑΙ ΤΗΝ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΙΜΌΤΗΤΑ. ΤΑ ΣΤΕΛΈΧΗ ΠΟΥ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΎΝΤΑΙ ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΈΡΓΟ ΘΑ ΠΡΟΈΡΧΟΝΤΑΙ ΕΊΤΕ ΑΠΌ (I) ΣΥΛΛΟΓΉ XEROTOLERANTS ΠΟΥ ΕΚΔΌΘΗΚΕ ΑΠΌ ΤΟ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΟ ΈΡΓΟ HELIOS. II) ΜΙΑ ΝΈΑ ΣΥΛΛΟΓΉ ΠΟΥ ΣΥΛΛΈΓΕΤΑΙ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΤΗΣ ΕΙΔΙΚΉΣ ΣΥΣΚΕΥΉΣ ΒΙΟΠΡΟΒΟΛΉΣ ΠΟΥ ΠΕΡΙΓΡΆΦΕΤΑΙ ΣΤΗΝ ΠΑΡΟΎΣΑ ΠΡΌΤΑΣΗ· (III) ΣΤΕΛΈΧΗ ΕΞΕΛΊΧΘΗΚΑΝ ΣΤΟ ΕΡΓΑΣΤΉΡΙΟ ΜΕ ΤΗΝ ΠΛΑΤΦΌΡΜΑ EVOLVER, Η ΟΠΟΊΑ ΕΠΙΤΡΈΠΕΙ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΠΙΈΣΕΩΝ ΕΠΙΛΟΓΉΣ (ΠΡΟΣΟΜΟΊΩΣΗ ΤΗΣ ΑΠΟΞΉΡΑΝΣΗΣ ΣΤΗΝ ΠΕΡΊΠΤΩΣΉ ΜΑΣ) ΓΙΑ ΠΟΛΛΈΣ ΓΕΝΙΈΣ. Η ΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΉ ΚΑΙ ΠΡΩΤΕΩΜΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΕΊ ΓΙΑ ΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΩΝ ΚΑΘΟΡΙΣΤΙΚΏΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ ΜΕΤΑΓΡΑΦΉΣ ΚΑΙ ΜΕΤΆΦΡΑΣΗΣ ΤΗΣ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉΣ ΤΗΣ ΑΦΥΔΆΤΩΣΗΣ. ΤΈΛΟΣ, ΤΟ ΕΝ ΛΌΓΩ ΥΠΟΈΡΓΟ ΘΑ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΕΙ ΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΕΝΌΣ ΠΡΩΤΟΤΎΠΟΥ ΜΕΣΑΊΑΣ ΚΛΊΜΑΚΑΣ ΓΙΑ ΤΗ ΔΟΚΙΜΉ ΤΩΝ ΕΠΙΔΌΣΕΩΝ ΤΩΝ ΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ ΠΟΥ ΈΧΟΥΝ ΣΧΕΔΙΑΣΤΕΊ ΜΕ ΒΆΣΗ ΤΑ ΕΠΙΤΕΥΧΘΈΝΤΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΘΑ ΣΥΝΔΥΆΖΕΙ ΤΙΣ ΓΝΏΣΕΙΣ ΠΟΥ ΑΠΟΚΤΉΘΗΚΑΝ ΌΣΟΝ ΑΦΟΡΆ ΤΟΥΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ ΠΟΥ ΣΥΝΔΈΟΝΤΑΙ ΜΕ ΤΗΝ ΑΝΤΟΧΉ ΣΤΗΝ ΞΉΡΑΝΣΗ, ΤΗΝ ΕΠΙΛΟΓΉ ΥΠΟΣΤΡΏΜΑΤΟΣ, ΤΟΝ ΣΧΕΔΙΑΣΜΌ ΤΟΥ ΑΝΤΙΔΡΑΣΤΉΡΑ ΚΑΙ ΤΙΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΑΝΆΠΤΥΞΗΣ. (Greek)
18 August 2022
0 references
MILJØMÆSSIGE BAKTERIER KAN UDVIKLE SIG I EN LANG RÆKKE MILJØER, HERUNDER, MEN IKKE BEGRÆNSET TIL, HAV OG FERSKVAND. NÅR DET ER SAGT, HAR LANGT STØRSTEDELEN AF DE MIKROBIELLE NICHER EN RELATIVT BEGRÆNSET VANDFORSYNING OG/ELLER LIDER AF STATIONÆRE VANDMANGEL. JORD, SOM ER ET AF DE VIGTIGSTE RESERVOIRER FOR MIKROBIEL MANGFOLDIGHED, OG EN AF DE VIGTIGSTE KILDER TIL MIKROORGANISMER MED BIOTEKNOLOGISKE ANVENDELSER, ER ET TYPISK EKSEMPEL PÅ ET HETEROGENT, VANDBEGRÆNSET FAST SUBSTRAT, HVOR MIKROBIEL BIODIVERSITET KAN BLOMSTRE. I STRIKING KONTRAST MED SITUATION I NATUR, MICROBIAL CULTURES INDEN I LABET med en FIXED SUPPLY of WATER, da det er tilfældet i den så velkvalificerede MEDIA (AGAR PLATES), at det er muligt at anvende de flydende BROTHS til DECADES TIL KULTURING BACTERIAL OG FUNGAL STRAINS._x000D_ dette underprojekt FOCUSERER OM DEVELOPMENT OG PROOF af nye KULTIVATION UDVIKLINGER, der skal være i overensstemmelse med en IMPROVED ISOLATION af xerofile MICROORGANISMS, som vil blive brugt til at udvikle sig i SOLID STATE FERMENTATION (SSF)-LIKE REACTORS. VI ANTOG, AT I BETRAGTNING AF VANDKNAPHEDEN I MANGE NATURLIGE MILJØER OG DEN UREGELMÆSSIGE FORDELING I RUM OG TID AF VAND, KUNNE ET BEGRÆNSET VANDINDHOLD ANVENDES I OPTIMEREDE MIKROBIELLE KULTURER. FOR AT KONTROLLERE DETTE UDFØRTE VI ET SÆT FORELØBIGE FORSØG I FLYDENDE MEDIER OG PÅ ET FAST SUBSTRAT (KOMMERCIEL RENGØRINGSKLUD GENNEMBLØDT MED R2A). Som VEDTAGET i vores PROPOSAL, SEVERAL ekstremofile ISOLATES GREW I FACT BETTER I SOAKED CLOTH KOMPARET TIL LIQUID CONDITIONS._x000D_ delprojekt 1 er STRUCTURED I TWO MAIN APPROACHES. DEN FØRSTE BESTÅR I UDVIKLING AF ET SCREENINGVÆRKTØJ I FORM AF EN DYRKNING AF FAST ENHED MED KONTROLLERET VANDTILGÆNGELIGHED. DENNE ANORDNING VIL GØRE DET MULIGT AT ISOLERE MILJØMÆSSIGE STAMMER MED EN HØJERE HASTIGHED END NUVÆRENDE PETRISKÅL-BASERET DYRKNING. DETTE APPARAT VIL BLIVE TESTET OG DETS UDBYTTE SAMMENLIGNET MED UDBYTTET AF ALMINDELIGE DYRKNINGSTEKNIKKER MED HENSYN TIL ANTAL OG MANGFOLDIGHED AF DYRKELIGE MIKROORGANISMER. VI FORVENTER, AT DENNE ENHED VIL BIDRAGE TIL AT LØSE ET VELKENDT PROBLEM I MIKROBIEL ØKOLOGI, ¿PLATE COUNT ANOMALI^(DET FAKTUM, AT DYRKELIGE BAKTERIER ER BLOT EN BRØKDEL AF DE SAMLEDE DEM). DEN ANDEN TILGANG VEDRØRER INDUSTRIEL GÆRING. I DETTE DELMÅL PLANLÆGGER VI AT UDVIKLE FORBEDREDE SSF-SYSTEMER TIL MIKROBIEL KULTUR VED AT BRUGE NYE MATERIALER MED DEFINERET PORØSITET OG VED AT TESTE UDVALGTE STAMMER I REN OG CO-KULTUR. DENNE UDVIKLING HAR TIL FORMÅL AT STANDARDISERE PROCESSEN VED AT DEFINERE ALLE DE BIOLOGISKE OG FYSISK-KEMISKE PARAMETRE I PROCESSEN FOR AT OVERVINDE DE NUVÆRENDE BEGRÆNSNINGER MED HENSYN TIL UDBYTTE OG REPRODUCERBARHED. DE STAMMER, DER ANVENDES I DETTE PROJEKT, VIL STAMME FRA ENTEN (I) VORES SAMLING AF XEROTOLERANTS UDSTEDT FRA DET TIDLIGERE PROJEKT HELIOS; EN NY SAMLING, DER ER INDSAMLET VED HJÆLP AF DET SPECIFIKKE BIOPROSPEKTERINGSUDSTYR, DER ER BESKREVET I DETTE FORSLAG (III) STAMMER UDVIKLET I LABORATORIET MED EVOLVER-PLATFORMEN, SOM GØR DET MULIGT AT ANVENDE SELEKTIONSTRYK (SIMULERING AF UDTØRRING I VORES TILFÆLDE) I MANGE GENERATIONER. TRANSKRIPTOMISKE OG PROTEOMISKE ANALYSER VIL BLIVE ANVENDT TIL AT UNDERSØGE TRANSSKRIPTION OG OVERSÆTTELSESDETERMINANTER FOR UDTØRRINGSTILPASNING. ENDELIG VIL DETTE UNDERPROJEKT OMFATTE UDVIKLING AF EN MELLEMSTOR PROTOTYPE TIL AFPRØVNING AF YDEEVNEN AF DE SYSTEMER, DER ER UDFORMET UD FRA DE OPNÅEDE RESULTATER, OG SOM KOMBINERER DEN VIDEN, DER ER OPNÅET MED HENSYN TIL UDTØRRINGSMODSTANDSRELATEREDE FAKTORER, SUBSTRATVALG, REAKTORDESIGN OG VÆKSTBETINGELSER. (Danish)
18 August 2022
0 references
YMPÄRISTÖBAKTEERIT VOIVAT KEHITTYÄ MONENLAISISSA YMPÄRISTÖISSÄ, MUUN MUASSA MERISSÄ JA MAKEASSA VEDESSÄ. SUURIN OSA MIKROBIEN MARKKINARAOISTA ON KUITENKIN SUHTEELLISEN RAJALLINEN VEDENSAANTI JA/TAI KÄRSII KIINTEÄSTÄ VEDEN PUUTTEESTA. MAAPERÄ, JOKA ON YKSI MIKROBIEN MONIMUOTOISUUDEN TÄRKEIMMISTÄ ALTAISTA JA YKSI TÄRKEIMMISTÄ MIKRO-ORGANISMIEN LÄHTEISTÄ BIOTEKNOLOGISISSA SOVELLUKSISSA, ON TYYPILLINEN ESIMERKKI HETEROGEENISESTA, VETEEN RAJOITTUNEESTA KIINTEÄSTÄ SUBSTRAATISTA, JOSSA MIKROBIEN BIOLOGINEN MONIMUOTOISUUS KUITENKIN VOI KUKOISTAA. Vuonna STRIKING SOPIMUKSESSA, MICROBIAL CULTURES on merkitty LAB, jolla on FIXED SUPPLY OF WATER, koska se on CASE SO-SOLID-MEDIA (AGAR PLATES), LIQUID BROTHS Käytetty LIQUID BROTHS KÄYTETTÄVÄ TARJOITUKSET ja FUNGAL STRAINS._x000D_ TÄMÄN osahanke ON KEHITTÄMINEN JA KOSKEVA KOSKEVA KOSKEVA KOSKEVA KOSKEVA KOSKEVAT TUOTTEIDEN (SSF)-LIKE REACTORS (SSF)-LIKE REACTORS. OLETIMME, ETTÄ KUN OTETAAN HUOMIOON VEDEN NIUKKUUS MONISSA LUONNONYMPÄRISTÖISSÄ JA VEDEN EPÄSÄÄNNÖLLINEN JAKAUTUMINEN AVARUUDESSA JA AJASSA, MIKROBIVILJELMISSÄ VOITAISIIN KÄYTTÄÄ RAJOITETTUA VESIPITOISUUTTA. TÄMÄN TARKISTAMISEKSI SUORITIMME JOUKON ALUSTAVIA KOKEITA NESTEMÄISELLÄ VÄLIAINEELLA JA KIINTEÄLLÄ ALUSTALLA (KAUPALLINEN PUHDISTUSLIINA, JOKA ON LIOTETTU R2A: LLA). Kuten meidän PROPOSAL, SEVERAL äärimmäinen ISOLATES GREW vuonna FACT BETTER SOAKED CLOTH COMPARED to LIQUID CONDITIONS._x000D_ osahanke 1 on STRUCTURED TWO MAIN APPROACHES. ENSIMMÄINEN VAIHE ON SELLAISEN SEULONTATYÖKALUN KEHITTÄMINEN, JOKA ON MUODOLTAAN VILJELTÄVÄ KIINTEÄ LAITE, JONKA VEDENSAANTI ON VALVOTTU. TÄMÄ LAITE MAHDOLLISTAA YMPÄRISTÖKANTOJEN ERISTÄMISEN KORKEAMMALLA TAHDILLA KUIN NYKYINEN PETRI-MALJAPOHJAINEN VILJELY. TÄTÄ LAITETTA TESTATAAN JA SEN TUOTTOA VERRATAAN TAVANOMAISIIN VILJELYTEKNIIKOIHIN KULTUROITUVIEN MIKRO-ORGANISMIEN LUKUMÄÄRÄN JA MONIMUOTOISUUDEN OSALTA. ODOTAMME, ETTÄ TÄMÄ LAITE AUTTAA RATKAISEMAAN TUNNETTU ONGELMA MIKROBIEN EKOLOGIASSA, PLAE COUNT ANOMALY (SE, ETTÄ KULTUROITUVAT BAKTEERIT OVAT VAIN MURTO-OSA KAIKISTA BAKTEEREISTA). TOINEN LÄHESTYMISTAPA KOSKEE TEOLLISTA KÄYMISTÄ. TÄSSÄ ALATAVOITTEESSA AIOMME KEHITTÄÄ PAREMPIA SSF-JÄRJESTELMIÄ MIKROBIVILJELYÄ VARTEN KÄYTTÄMÄLLÄ UUSIA MATERIAALEJA, JOILLA ON MÄÄRITELTY HUOKOISUUS, JA TESTAAMALLA VALIKOITUJA KANTOJA PUHTAASSA JA YHTEISVILJELYSSÄ. TÄLLÄ KEHITTÄMISELLÄ PYRITÄÄN STANDARDOIMAAN PROSESSI MÄÄRITTELEMÄLLÄ KAIKKI PROSESSIN BIOLOGISET JA FYSIKAALIS-KEMIALLISET PARAMETRIT, JOTTA VOIDAAN POISTAA NYKYISET TUOTOKSEEN JA UUSITTAVUUTEEN LIITTYVÄT RAJOITUKSET. TÄSSÄ HANKKEESSA KÄYTETYT KANNAT OVAT PERÄISIN (I) EDELLISESTÄ HELIOS-HANKKEESTA MYÖNNETYSTÄ XEROTOLERANTS-KOKOELMASTA; II) UUSI KOKOELMA, JOKA ON KERÄTTY TÄSSÄ EHDOTUKSESSA KUVATTUA ERITYISTÄ BIOPROSPECTING-LAITETTA KÄYTTÄEN; (III) LABORATORIOSSA KEHITTYNEET KANNAT EVOLVER-ALUSTALLA, JONKA AVULLA VOIDAAN KÄYTTÄÄ VALINTAPAINEITA (KUIHTUMISEN SIMULOINTI MEIDÄN TAPAUKSESSAMME) MONIEN SUKUPOLVIEN AJAN. TRANSKRIPTION JA PROTEOMISEN ANALYYSIN AVULLA TUTKITAAN DESICCAATIOSOPEUTUKSEN TRANSKRIPTIOTA JA KÄÄNNÖKSIÄ. TÄHÄN OSAHANKKEESEEN SISÄLTYY MYÖS KESKISUUREN PROTOTYYPIN KEHITTÄMINEN SAATUJEN TULOSTEN PERUSTEELLA SUUNNITELTUJEN JÄRJESTELMIEN SUORITUSKYVYN TESTAAMISEKSI. PROTOTYYPIN AVULLA YHDISTETÄÄN KUIVUMISVASTUKSEEN LIITTYVISTÄ TEKIJÖISTÄ, SUBSTRAATIN VALINNASTA, REAKTORIN SUUNNITTELUSTA JA KASVUOLOSUHTEISTA SAATU TIETÄMYS. (Finnish)
18 August 2022
0 references
IL-BATTERJI AMBJENTALI JISTGĦU JIŻVILUPPAW F’FIRXA WIESGĦA TA’ AMBJENTI, INKLUŻI, IŻDA MHUX RISTRETTI GĦAL, IL-BAĦAR U L-ILMA ĦELU. MADANKOLLU, IL-MAĠĠORANZA L-KBIRA TAN-NIĊEĊ MIKROBIĊI GĦANDHOM PROVVISTA RELATTIVAMENT LIMITATA TA’ ILMA U/JEW IBATU MINN DEPRIVAZZJONI TA’ ILMA STAZZJONARJU. IL-ĦAMRIJA, WAĦDA MILL-ĠIBJUNI EWLENIN GĦAD-DIVERSITÀ MIKROBJALI KIF UKOLL WAĦDA MIS-SORSI EWLENIN TA’ MIKROORGANIŻMI B’APPLIKAZZJONIJIET BIJOTEKNOLOĠIĊI, HIJA EŻEMPJU TIPIKU TA’ SOTTOSTRAT SOLIDU ETEROĠENJU U LIMITAT BL-ILMA FEJN, MADANKOLLU, IL-BIJODIVERSITÀ MIKROBJALI TISTA’ TIFFJORIXXI. Fi STRIKING KONTRAST MA’ L-ISTITUZZJONI F’NATURA, KULTURI MICROBIAL ARE CARRIED OUT FIL-LAB ma’ SUPPLY FIXED ta’ WATER, KULTURI MICROBIJIET FIL-KAŻ SO-CALLED FIL-PAJJIŻI TA’ L-AGRIJA (PAJJIŻ TA’ GARATI), AĦĦAR IL-BROTÀ LIQUID UŻA GĦAL DECADES GĦAL KULTURAZZJONI BATTERIMENT U FUNGALL STRAINS._x000D_ Dak is-sottoproġett JIKKUNSIDRAW DWAR L-IŻVILUPP U l-Prova tal-KONĊETT TA’ DVIZZJONI EW KULTIVAZZJONI LI GĦANDHOM ALLOW GĦALL-ISOLAZZJONI IMPROVAZZJONI TAL-MICROORGANITI Kserofiliċi, KIF GĦANDHOM GĦANDHOM FERMENTAZZJONI SOLIDJA FERMENTAZZJONI (SSF)-LIKE. AĦNA IPOTIZZAJNA LI, MINĦABBA L-ISKARSEZZA TAL-ILMA F’ĦAFNA AMBJENTI NATURALI, U D-DISTRIBUZZJONI IRREGOLARI FL-ISPAZJU U L-ĦIN TAL-ILMA, KONTENUT LIMITAT TA’ ILMA JISTA’ JINTUŻA F’KULTURI MIKROBIĊI OTTIMIZZATI. SABIEX NIĊĊEKKJAW DAN, AĦNA WETTAQNA SETT TA ‘ESPERIMENTI PRELIMINARI FIL-MIDJA LIKWIDA U FUQ SUBSTRAT SOLIDU (DRAPP TAT-TINDIF KUMMERĊJALI MXARRBA B’R2A). Bħala DESCRIBE FIL-PROPOSTA OUR, SEVERAL Extremophilic ISOLATI GREW FIL-ITTAT FIL-KLIMA KOMUNITÀ GĦALL-KODIZZJONIJIET LIQUID._x000D_ subproġett 1 Huwa STRUCTURED F’APPROACHES MAIN DWO. L-EWWEL WAĦDA TIKKONSISTI FL-IŻVILUPP TA’ GĦODDA TA’ SKRINJAR FIL-FORMA TA’ APPARAT SOLIDU TAL-KULTURA B’DISPONIBBILTÀ KKONTROLLATA TAL-ILMA. DAN L-APPARAT SE JIPPERMETTI L-IŻOLAMENT TAR-RAZEZ AMBJENTALI B’RATA OGĦLA MILL-KULTURA ATTWALI BBAŻATA FUQ IL-PLATT PETRI. DAN L-APPARAT SE JIĠI TTESTJAT U R-RENDIMENT TIEGĦU META MQABBEL MA’ DAK TA’ TEKNIKI TA’ KULTURA REGOLARI, F’TERMINI TA’ NUMRU U DIVERSITÀ TA’ MIKROORGANIŻMI KULTURABBLI. NISTENNEW LI DAN L-APPARAT JIKKONTRIBWIXXI BIEX TISSOLVA KWISTJONI MAGĦRUFA SEW FL-EKOLOĠIJA MIKROBIKA, L-ANOMALIJA TAL-GĦADD TAL-PLATES (IL-FATT LI L-BATTERJI CULTURABLE HUMA BISS FRAZZJONI TA ‘DAWK TOTALI). IT-TIENI APPROĊĊ JIRREFERI GĦALL-FERMENTAZZJONI INDUSTRIJALI. F’DAN IS-SOTTOOBJETTIV, QED NIPPJANAW LI NIŻVILUPPAW SISTEMI MTEJBA TAL-SSF GĦALL-KULTURA MIKROBIKA, BL-UŻU TA’ MATERJALI ĠODDA B’POROŻITÀ DEFINITA, U BL-ITTESTJAR TA’ RAZEZ MAGĦŻULA F’PUR U KOKULTURA. DAN L-IŻVILUPP GĦANDU L-GĦAN LI JISTANDARDIZZA L-PROĊESS BILLI JIDDEFINIXXI L-PARAMETRI BIJOLOĠIĊI U FIŻIKOKIMIĊI KOLLHA TAL-PROĊESS BIEX JINGĦELBU L-LIMITAZZJONIJIET ATTWALI F’TERMINI TA’ RENDIMENT U RIPRODUĊIBBILTÀ. IR-RAZEZ UŻATI F’DAN IL-PROĠETT SE JORIĠINAW JEW MINN (I) IL-ĠBIR TAGĦNA TA’ XEROTOLERANTS MAĦRUĠ MILL-PROĠETT PREĊEDENTI HELIOS; (II) KOLLEZZJONI ĠDIDA MIĠBURA BL-UŻU TAL-APPARAT SPEĊIFIKU TA’ BIJOPROSPETTAR DESKRITT F’DIN IL-PROPOSTA; (III) RAZEZ EVOLVEW FIL-LABORATORJU MAL-PJATTAFORMA EVOLVER, LI TIPPERMETTI LI JUŻAW PRESSJONIJIET GĦAŻLA (SIMULAZZJONI TA ‘DESSIKAZZJONI FIL-KAŻ TAGĦNA) GĦAL ĦAFNA ĠENERAZZJONIJIET. L-ANALIŻI TRASKRITOMIKA U PROTEOMIKA SE TINTUŻA BIEX JIĠU STUDJATI D-DETERMINANTI TAT-TRASKRIZZJONI U T-TRADUZZJONI TAL-ADATTAMENT TAD-DESSIKAZZJONI. FL-AĦĦAR NETT, DAN IS-SUBPROĠETT SE JINKLUDI L-IŻVILUPP TA’ PROTOTIP FUQ SKALA MEDJA BIEX TIĠI TTESTJATA L-PRESTAZZJONI TAS-SISTEMI MFASSLA MIR-RIŻULTATI MIKSUBA, LI JIKKOMBINAW L-GĦARFIEN MIKSUB F’TERMINI TA’ FATTURI ASSOĊJATI MAR-REŻISTENZA GĦAD-DESSIKAZZJONI, L-GĦAŻLA TAS-SUBSTRAT, ID-DISINN TAR-REATTUR U L-KUNDIZZJONIJIET TAT-TKABBIR. (Maltese)
18 August 2022
0 references
VIDES BAKTĒRIJAS VAR ATTĪSTĪTIES DAŽĀDĀS VIDĒS, TOSTARP, BET NEAPROBEŽOJOTIES AR JŪRU UN SALDŪDENI. TOMĒR LIELĀKAJAI DAĻAI MIKROBU NIŠU IR SALĪDZINOŠI IEROBEŽOTA ŪDENS PIEGĀDE, UN/VAI TĀS CIEŠ NO STACIONĀRAS ŪDENS TRŪKUMA. AUGSNE, KAS IR VIENS NO GALVENAJIEM MIKROBU DAUDZVEIDĪBAS REZERVUĀRIEM, KĀ ARĪ VIENS NO GALVENAJIEM MIKROORGANISMU AVOTIEM AR BIOTEHNOLOĢISKU PIELIETOJUMU, IR TIPISKS PIEMĒRS NEVIENDABĪGAM CIETAJAM SUBSTRĀTAM AR IEROBEŽOTU ŪDENI, KUR TOMĒR VAR UZPLAUKT MIKROBU BIOLOĢISKĀ DAUDZVEIDĪBA. In STRIKING LĪGUMSLĒDZĒJUMS AR SITUĀCIJAS DABA, MICROBIĀLĀS KULTŪRAS PAR LAB ar FIXED SUPPLY OF WATER, tā kā tā ir lieta, kas saistīta ar to, ka tā ir īpaši svarīga (AGAR PLATES), LET ALONE THE LIQUID BROTHS LIQUID BROTHS izmantot DECADES CULTURING BACTERIAL AND FUNGAL STRAINS._x000D_ šis apakšprojekts PAR JAUNS KULTIVĀCIJAS DZĪVNIEKU ATTĪSTĪBAS AIZSARDZĪBAS AIZSARDZĪBAS PAR kserofilo MICROORGANISMS AIZSARDZĪBAS IZMANTOŠANAS IZMANTOŠANAS IZDEVUMU IZMANTOŠANAS IZDEVUMU IZMANTOŠANAS IZPILDĪŠANAS IZDEVUMU IZDEVUMIEM. MĒS PIEŅĒMĀM, KA, ŅEMOT VĒRĀ ŪDENS TRŪKUMU DAUDZĀS DABISKĀS VIDĒS UN NEREGULĀRU ŪDENS SADALĪJUMU TELPĀ UN LAIKĀ, OPTIMIZĒTĀS MIKROBU KULTŪRĀS VARĒTU IZMANTOT IEROBEŽOTU ŪDENS SATURU. LAI TO PĀRBAUDĪTU, MĒS VEICĀM VIRKNI IEPRIEKŠĒJU EKSPERIMENTU ŠĶIDRĀ VIDĒ UN AR CIETU SUBSTRĀTU (KOMERCIĀLS TĪRĪŠANAS AUDUMS, KAS IEMĒRC R2A). Kā WE DESCRIBE MŪSU PROPOSAL, SEVERAL ekstremofilo ISOLATES GREW FACT BETTER KOPĀ SALĪDZINĀJUMS LIQUID CONDITIONS._x000D_ apakšprojekts 1 IS STRUCTURED in TWO MAIN APPROACHES. PIRMAIS SASTĀV NO SKRĪNINGA INSTRUMENTA IZSTRĀDES, KAS IR CIETU KULTIVĒŠANAS IERĪCE AR KONTROLĒTU ŪDENS PIEEJAMĪBU. ŠĪ IERĪCE ĻAUS IZOLĒT VIDES CELMUS LIELĀKĀ ĀTRUMĀ NEKĀ PAŠREIZĒJĀ PETRI TRAUCIŅA KULTIVĒŠANA. ŠO IERĪCI TESTĒ UN TĀS RAŽU SALĪDZINA AR PARASTAJĀM KULTIVĒŠANAS METODĒM, ŅEMOT VĒRĀ KULTURĀLO MIKROORGANISMU SKAITU UN DAUDZVEIDĪBU. MĒS SAGAIDĀM, KA ŠĪ IERĪCE PALĪDZĒS ATRISINĀT PAZĪSTAMU PROBLĒMU MIKROBIĀLAJĀ EKOLOĢIJĀ, PLĀKŠŅU SKAITA ANOMĀLIJU(FAKTS, KA KULTURĀLĀS BAKTĒRIJAS IR TIKAI DAĻA NO KOPĒJĀ). OTRĀ PIEEJA ATTIECAS UZ RŪPNIECISKO FERMENTĀCIJU. ŠAJĀ APAKŠMĒRĶĪ MĒS PLĀNOJAM IZSTRĀDĀT UZLABOTAS NTSS SISTĒMAS MIKROBU KULTŪRAI, IZMANTOJOT JAUNUS MATERIĀLUS AR NOTEIKTU PORAINĪBU UN TESTĒJOT ATLASĪTOS CELMUS TĪRĀ UN KOKULTŪRĀ. ŠĪS ATTĪSTĪBAS MĒRĶIS IR STANDARTIZĒT PROCESU, DEFINĒJOT VISUS PROCESA BIOLOĢISKOS UN FIZIKĀLĶĪMISKOS PARAMETRUS, LAI PĀRVARĒTU PAŠREIZĒJOS RAŽAS UN REPRODUCĒJAMĪBAS IEROBEŽOJUMUS. ŠAJĀ PROJEKTĀ IZMANTOTO CELMU IZCELSME BŪS VAI NU (I) MŪSU XEROTOLERANTS KOLEKCIJA, KAS IZDOTA IEPRIEKŠĒJĀ PROJEKTĀ HELIOS; II) JAUNU KOLEKCIJU, KAS SAVĀKTA, IZMANTOJOT ŠAJĀ PRIEKŠLIKUMĀ APRAKSTĪTO KONKRĒTO BIOLOĢISKĀS IZPĒTES IERĪCI; (III) CELMI ATTĪSTĪJUŠIES LABORATORIJĀ AR EVOLVER PLATFORMU, KAS ĻAUJ IZMANTOT ATLASES SPIEDIENU (MŪSU GADĪJUMĀ IZŽŪŠANAS SIMULĀCIJA) DAUDZĀM PAAUDZĒM. TRANSKRIPTOMISKO UN PROTEOMISKO ANALĪZI IZMANTOS, LAI PĒTĪTU DESIKĀCIJAS ADAPTĀCIJAS TRANSKRIPCIJAS UN TULKOŠANAS NOTEICOŠOS FAKTORUS. VISBEIDZOT, ŠIS APAKŠPROJEKTS IETVERS VIDĒJA MĒROGA PROTOTIPA IZSTRĀDI, LAI PĀRBAUDĪTU NO IEGŪTAJIEM REZULTĀTIEM IZSTRĀDĀTO SISTĒMU VEIKTSPĒJU, KAS APVIENOS ZINĀŠANAS, KURAS IEGŪTAS ATTIECĪBĀ UZ AR DESIKĀCIJAS PRETESTĪBU SAISTĪTAJIEM FAKTORIEM, SUBSTRĀTA IZVĒLI, REAKTORA KONSTRUKCIJU UN AUGŠANAS APSTĀKĻIEM. (Latvian)
18 August 2022
0 references
ENVIRONMENTÁLNE BAKTÉRIE SA MÔŽU VYVINÚŤ V ŠIROKOM SPEKTRE PROSTREDÍ VRÁTANE, ALE NIE VÝLUČNE, MORA A SLADKEJ VODY. TO ZNAMENÁ, ŽE PREVAŽNÁ VÄČŠINA MIKROBIÁLNYCH VÝKLENKOV MÁ RELATÍVNE OBMEDZENÚ DODÁVKU VODY A/ALEBO TRPÍ NEDOSTATKOM STACIONÁRNEJ VODY. PÔDA, KTORÁ JE JEDNÝM Z HLAVNÝCH REZERVOÁROV MIKROBIÁLNEJ DIVERZITY, AKO AJ JEDNÝM Z HLAVNÝCH ZDROJOV MIKROORGANIZMOV S BIOTECHNOLOGICKÝMI APLIKÁCIAMI, JE TYPICKÝM PRÍKLADOM HETEROGÉNNEHO PEVNÉHO SUBSTRÁTU S OBMEDZENÝM OBSAHOM VODY, V KTOROM VŠAK MÔŽE PREKVITAŤ MIKROBIÁLNA BIODIVERZITA. V ŠTRIKOVANÍ S SITUÁCIOU v prírode sa MICROBIAL KULTURES UPRACOVANIA OBCHODNÝCH SPOLOČNOSTÍ SPOLOČNOSTI SPOLOČNOSTI SPOLOČNOSTI SPOLOČNOSTI SPOLOČNOSTI SPOLOČNOSTI SPOLOČNOSTI SPOLOČENSTVA V SPOLOČNOSTI SPOLOČNOSTI SPOLOČNOSTI SPOLOČNOSTI SPOLOČNOSTI V PRÍSTUPU, ako je to v prípade, že sa jedná o tak-CALLOVÝCH KULTALIZÁCIE V OBCHODNÝCH PLATIACH (AGAR PLATES), LET ALONE LIQUIDLÝCH BROTHSU, ktorý sa používa na pomôcky pre kultiváciu BACTERIALÝCH A FUNGALÝCH STRAINY._x000D__x000D_ tento podprojekt ZÁKLADY NA VÝVOJ A VÝROBKU NOVÝCH KULTIVÁROVÝCH PREDSEDNÝCH KULTIVÁCIÍ, KTORÉ MÔŽU NA VYHLÁSENIE OCHRANY xerofilných MICROORGANizmov, tak, ako by to mohlo byť v SOLIDNÝCH STÁTOCH FERMENTÁCIÁCH (SSF)-LIKE REACTORS. PREDPOKLADALI SME, ŽE VZHĽADOM NA NEDOSTATOK VODY V MNOHÝCH PRÍRODNÝCH PROSTREDIACH A NEPRAVIDELNÚ DISTRIBÚCIU VODY V PRIESTORE A ČASE BY SA V OPTIMALIZOVANÝCH MIKROBIÁLNYCH KULTÚRACH MOHOL POUŽIŤ OBMEDZENÝ OBSAH VODY. ABY SME TO SKONTROLOVALI, VYKONALI SME SÚBOR PREDBEŽNÝCH EXPERIMENTOV V TEKUTOM MÉDIU A NA PEVNOM SUBSTRÁTE (KOMERČNÉ ČISTIACE LÁTKY NAMOČENÉ R2A). Ako DESCRIBE in OUR PROPOSAL, SEVERAL Extremophilic ISOLATES GREW in FACT BETTER IN SOAKED CLOTH COMPAMENT TO LIQUID CONDITIONS._x000D_ podprojekt 1 JE VYKONÁVANÉ v TWO MAIN APPROACHES. PRVÝ POZOSTÁVA Z VÝVOJA SKRÍNINGOVÉHO NÁSTROJA V TVARE KULTIVAČNÉHO PEVNÉHO ZARIADENIA S RIADENOU DOSTUPNOSŤOU VODY. TOTO ZARIADENIE UMOŽNÍ IZOLOVAŤ ENVIRONMENTÁLNE KMENE VYŠŠOU RÝCHLOSŤOU AKO SÚČASNÉ KULTIVOVANIE NA BÁZE PETRIHO MISKY. TOTO ZARIADENIE SA BUDE TESTOVAŤ A JEHO VÝNOS SA BUDE POROVNÁVAŤ S VÝNOSMI BEŽNÝCH KULTIVAČNÝCH TECHNÍK, POKIAĽ IDE O POČET A ROZMANITOSŤ KULTIVOVATEĽNÝCH MIKROORGANIZMOV. OČAKÁVAME, ŽE TOTO ZARIADENIE PRISPEJE K VYRIEŠENIU DOBRE ZNÁMEHO PROBLÉMU V MIKROBIÁLNEJ EKOLÓGII, POČÍTA SA ANOMÁLIA (SKUTOČNOSŤ, ŽE KULTIVOVATEĽNÉ BAKTÉRIE SÚ LEN ZLOMKOM CELKOVÉHO POČTU BAKTÉRIÍ). DRUHÝ PRÍSTUP SA TÝKA PRIEMYSELNEJ FERMENTÁCIE. V TOMTO ČIASTKOVOM CIELI PLÁNUJEME VYVINÚŤ VYLEPŠENÉ SYSTÉMY SMO PRE MIKROBIÁLNU KULTÚRU POMOCOU NOVÝCH MATERIÁLOV S DEFINOVANOU PÓROVITOSŤOU A TESTOVANÍM VYBRANÝCH KMEŇOV V ČISTEJ A KOKULTÚRE. CIEĽOM TOHTO VÝVOJA JE ŠTANDARDIZÁCIA PROCESU DEFINOVANÍM VŠETKÝCH BIOLOGICKÝCH A FYZIKÁLNO-CHEMICKÝCH PARAMETROV PROCESU S CIEĽOM PREKONAŤ SÚČASNÉ OBMEDZENIA Z HĽADISKA VÝNOSU A REPRODUKOVATEĽNOSTI. KMENE POUŽITÉ V TOMTO PROJEKTE BUDÚ POCHÁDZAŤ BUĎ Z (I) NAŠEJ ZBIERKY XEROTOLERANTS VYDANEJ Z PREDCHÁDZAJÚCEHO PROJEKTU HELIOS; II) NOVÚ KOLEKCIU ZHROMAŽDENÚ S POUŽITÍM ŠPECIFICKÉHO BIOLOGICKÉHO ZARIADENIA OPÍSANÉHO V TOMTO NÁVRHU; (III) KMENE SA VYVINULI V LABORATÓRIU S PLATFORMOU EVOLVER, KTORÁ UMOŽŇUJE POUŽÍVAŤ SELEKTÍVNE TLAKY (SIMULÁCIA VYSUŠENIA V NAŠOM PRÍPADE) PRE MNOHO GENERÁCIÍ. TRANSKRIPTOMICKÁ A PROTEOMICKÁ ANALÝZA SA POUŽIJE NA ŠTÚDIUM TRANSKRIPCIE A DETERMINANTOV DETERMINANTOV VYSYCHANIA. NAPOKON, TENTO ČIASTKOVÝ PROJEKT BUDE ZAHŔŇAŤ VÝVOJ PROTOTYPU STREDNÉHO ROZSAHU NA TESTOVANIE VÝKONNOSTI SYSTÉMOV NAVRHNUTÝCH NA ZÁKLADE ZÍSKANÝCH VÝSLEDKOV, V KTOROM SA SPOJA POZNATKY ZÍSKANÉ Z HĽADISKA FAKTOROV SÚVISIACICH S ODOLNOSŤOU VOČI VYSUŠENIU, VÝBERU SUBSTRÁTU, KONŠTRUKCIE REAKTORA A PODMIENOK RASTU. (Slovak)
18 August 2022
0 references
IS FÉIDIR LE BAICTÉIR CHOMHSHAOIL FORBAIRT I RÉIMSE LEATHAN TIMPEALLACHTAÍ, LENA N-ÁIRÍTEAR AN FHARRAIGE AGUS FIONNUISCE, ACH GAN A BHEITH TEORANTA DÓIBH. É SIN RÁITE, TÁ SOLÁTHAR UISCE SÁCH TEORANTA AG FORMHÓR MÓR NA NIDEOIGE MIOCRÓBACH AGUS/NÓ TÁ DÍOTHACHT UISCE DO-AISTRITHE ORTHU. IS SAMPLA TIPICIÚIL DE SHUBSTRÁIT SHOLADACH ILCHINEÁLACH ATÁ TEORANTA LE HUISCE Í AN ITHIR, CEANN DE NA PRÍOMHFHOINSÍ MIOCRORGÁNACH A BHFUIL FEIDHMEANNA BITEICNEOLAÍOCHTA AG BAINT LÉI, CHOMH MAITH LE CEANN DE NA PRÍOMHFHOINSÍ MIOCRORGÁNACH A BHFUIL FEIDHMEANNA BITEICNEOLAÍOCHTA AG BAINT LÉI, ÁIT AR FÉIDIR LE BITHÉAGSÚLACHT MHIOCRÓBACH BLÁTHÚ. I gCOMHAIRLE STIÚRTHÓIREACHT LE DÉANAMH in NATÚR, tá CULTÚRanna MICROBIAL CARRIED MAIDIR LE SUPPED WATER, chomh maith leis an gcas atá ar fáil sna Stáit Aontaithe atá faoi stiúir (AGAR PLATES), LET ALONE na bratanna Leachtacha a úsáidtear le haghaidh DECADES lena saothrú le linn STRAINSACTERIAL AGUS FUNL._x000D_ [EN] (b) go bhfuil na buntáistí a bhaineann leis an bhforbairt agus leis an bhforbairt ar fheidhmiú agus ar fheidhmiú na gcoinníollacha nua-Chumarsáide seo a leanas á cheadú go hiomlán le haghaidh ISOARSCRÍBHINNÍ MAIDIR LE IARSCRÍBHINNÍ STIÚRTHÓIREACHT A DHÉANAMH AR AN RIALACHÁN SOLADH SOLID STÁIT (SSF)-go dleathach. HIPITÉISITHE AGAINN, MAR GHEALL AR AN GANNTANAS UISCE I DTIMPEALLACHTAÍ NÁDÚRTHA GO LEOR, AGUS AN DÁILEADH NEAMHRIALTA I SPÁS AGUS AM UISCE, D’FHÉADFAÍ ÁBHAR UISCE TEORANTA A ÚSÁID I SAOTHRÁIN MHIOCRÓBACHA OPTAMAITHE. D’FHONN É SEO A SHEICEÁIL, RINNEAMAR SRAITH DE RÉAMH-THURGNAIMH SNA MEÁIN LEACHTACHA AGUS AR FHOSHRAITH SHOLADACH (ÉADACH GLANTACHÁIN TRÁCHTÁLA SÁITHITHE LE R2A). Mar WE DESCRIBE i láthair na huaire, GNÍOMH SEVERAL ISOLATES extremophilic GRUAIRT I FACT BETTER I CÚLRA CÚRAM atá curtha i láthair chun coinníollacha._x000D_ SUBPROJECT 1 STRUCTURED IN IARRATAIS DO DHÉANAMH. IS ÉARD ATÁ SA CHÉAD CHEANN NÁ UIRLIS SCAGTHA A FHORBAIRT I GCRUTH GLÉAS SOLADACH SAOTHRAITHE LE HINFHAIGHTEACHT RIALAITHE UISCE. LIGFIDH AN GLÉAS SEO TRÉITHCHINEÁLACHA COMHSHAOIL A LEITHLISIÚ AR RÁTA NÍOS AIRDE NÁ COTHÚ MIAS PETRI ATÁ ANN FAOI LÁTHAIR. DÉANFAR AN GLÉAS SEO A THÁSTÁIL AGUS A THORADH I GCOMPARÁID LE TEICNÍCÍ CULTÚIR RIALTA, Ó THAOBH LÍON AGUS ÉAGSÚLACHT NA MIOCRORGÁNACH SAOTHRAITHE. TÁIMID AG SÚIL GO GCUIRFIDH AN GLÉAS SEO LE SAINCHEIST AITHEANTA A RÉITEACH IN ÉICEOLAÍOCHT MHIOCRÓBACH, AN AIMHRIALTACHT AIMHRIALTACHTAÍ A CHOMHAIREAMH (AR AN BHFÍRIC NACH BHFUIL ACH CODÁN DE NA BAICTÉIR IOMLÁNA AG BAICTÉIR SAOTHRAITHE). TAGRAÍONN AN DARA CUR CHUIGE DO CHOIPEADH TIONSCLAÍOCH. SAN FHO-AIDHM SEO, TÁ SÉ BEARTAITHE AGAINN CÓRAIS SSF FEABHSAITHE A FHORBAIRT DO CHULTÚR MIOCRÓBACH, TRÍ ÚSÁID A BHAINT AS ÁBHAIR NUA LE PÓIRIÚLACHT SHAINITHE, AGUS TRÍ THRÉITHCHINEÁLACHA ROGHNAITHE A THÁSTÁIL IN ÍON AGUS I GCOMHCHULTÚR. TÁ SÉ D’AIDHM AG AN BHFORBAIRT SEO AN PRÓISEAS A CHAIGHDEÁNÚ TRÍ PHARAIMÉADAIR BHITHEOLAÍOCHA AGUS FHISICEIMICEACHA UILE AN PHRÓISIS A SHAINIÚ CHUN NA TEORAINNEACHA REATHA MAIDIR LE TORADH AGUS IN-ATÁIRGTHEACHT A SHÁRÚ. TIOCFAIDH NA TRÉITHCHINEÁLACHA A ÚSÁIDTEAR SA TIONSCADAL SEO Ó (I) ÁR MBAILIÚCHÁN XEROTOLERANTS A EISÍODH ÓN TIONSCADAL HELIOS ROIMHE SEO; (II) BAILIÚCHÁN NUA A BAILÍODH TRÍ ÚSÁID A BHAINT AS AN BHFEISTE SHONRACH BHITH-CHIGIREACHTA A NDÉANTAR CUR SÍOS UIRTHI SA TOGRA SEO; (III) TRÉITHCHINEÁLACHA A FORBRAÍODH SA TSAOTHARLANN LEIS AN ARDÁN EVOLVER, A CHEADAÍONN BRÚNNA ROGHNÚCHÁIN A ÚSÁID (INSAMHLADH DÍSLITHE INÁR GCÁS) LE GO LEOR GLÚNTA. BAINFEAR ÚSÁID AS ANAILÍS TRAS-SCRÍBHINNE AGUS PRÓITÉAMAÍOCH CHUN STAIDÉAR A DHÉANAMH AR NA DEITÉARMANAINT TRAS-SCRÍOFA AGUS AISTRIÚCHÁIN A BHAINEANN LE HOIRIÚNÚ DESICCATION. AR DEIREADH, ÁIREOFAR LEIS AN BHFOTHIONSCADAL SEO FRÉAMHSHAMHAIL LÁR-SCÁLA A FHORBAIRT CHUN FEIDHMÍOCHT NA GCÓRAS ARNA NDEARADH Ó NA TORTHAÍ A FHAIGHTEAR A THÁSTÁIL, A CHOMHCHEANGLÓIDH AN T-EOLAS A FHAIGHTEAR I DTÉARMAÍ FACHTÓIRÍ A BHAINEANN LE FRIOTAÍOCHT DESICCATION, ROGHA FOSHRAITHE, DEARADH IMOIBREORA AGUS COINNÍOLLACHA FÁIS. (Irish)
18 August 2022
0 references
BAKTERIE V ŽIVOTNÍM PROSTŘEDÍ SE MOHOU VYVÍJET V ŠIROKÉ ŠKÁLE PROSTŘEDÍ, MIMO JINÉ VČETNĚ MOŘSKÉ A SLADKÉ VODY. PŘEVÁŽNÁ VĚTŠINA MIKROBIÁLNÍCH VÝKLENEK VŠAK MÁ RELATIVNĚ OMEZENÉ ZÁSOBOVÁNÍ VODOU A/NEBO TRPÍ STACIONÁRNÍ DEPRIVACÍ VODY. PŮDA, JEDNA Z HLAVNÍCH NÁDRŽÍ MIKROBIÁLNÍ ROZMANITOSTI, JAKOŽ I JEDEN Z HLAVNÍCH ZDROJŮ MIKROORGANISMŮ S BIOTECHNOLOGICKÝMI APLIKACEMI, JE TYPICKÝM PŘÍKLADEM HETEROGENNÍHO PEVNÉHO SUBSTRÁTU OMEZENÉHO NA VODU, KDE VŠAK MŮŽE MIKROBIÁLNÍ BIOLOGICKÁ ROZMANITOST VZKVÉTAT. In STRIKING CONTRAST with the SITUATION in NATURE, MICROBIAL CULTURES jsou vyčerpané v blízkosti s pevnou zásobou vody, stejně jako to je vaz v SO-CALLEDÁLNÍMEDIA (AGAR PLATES), LET ALONE LIQUID BROTHS, které jsou použity pro DECADES pro kulturování BACTERIAL and FUNGAL STRAINS._x000D_ tento podprojekt FOCUSES NA DEVELOPMENT A PROOF CONCEPT NOVÉ KULTIVACE DEVICES, že může být VŠECHNY pro IMPROVED ISOLATION Xerofilních MICROORGANISMS, jak se blíží k růstu v SOLID STATE FERMENTATION (SSF)-LIKE REACTORS. PŘEDPOKLÁDALI JSME, ŽE VZHLEDEM K NEDOSTATKU VODY V MNOHA PŘÍRODNÍCH PROSTŘEDÍCH A NEPRAVIDELNÉMU ROZLOŽENÍ VODY V PROSTORU A ČASE BY MOHL BÝT V OPTIMALIZOVANÝCH MIKROBIÁLNÍCH KULTURÁCH POUŽIT OMEZENÝ OBSAH VODY. ABYCHOM TO ZKONTROLOVALI, PROVEDLI JSME SOUBOR PŘEDBĚŽNÝCH EXPERIMENTŮ V KAPALNÝCH MÉDIÍCH A NA PEVNÉM SUBSTRÁTU (KOMERČNÍ ČISTICÍ HADŘÍK NAMOČENÝ R2A). Jako my V našem PROPOSALU, VŠECHNY extremofilní ISOLATES GREW IN FACT BETTER IN SOAKED CLOTH COMPARED to LIQUID CONDITIONS._x000D_ podprojekt 1 JE STRUCTURED V TWO MAIN APPROACHES. PRVNÍ SPOČÍVÁ VE VÝVOJI SCREENINGOVÉHO NÁSTROJE VE TVARU KULTIVAČNÍHO PEVNÉHO ZAŘÍZENÍ S KONTROLOVANOU DOSTUPNOSTÍ VODY. TOTO ZAŘÍZENÍ UMOŽNÍ IZOLOVAT ENVIRONMENTÁLNÍ KMENY VYŠŠÍ RYCHLOSTÍ NEŽ SOUČASNÉ PETRIHO KULTIVACE NA BÁZI MISKY. TOTO ZAŘÍZENÍ BUDE TESTOVÁNO A JEHO VÝTĚŽEK BUDE SROVNÁVÁN S BĚŽNÝMI KULTIVAČNÍMI TECHNIKAMI, POKUD JDE O POČET A ROZMANITOST KULTIVAČNÍCH MIKROORGANISMŮ. OČEKÁVÁME, ŽE TOTO ZAŘÍZENÍ PŘISPĚJE K ŘEŠENÍ ZNÁMÉHO PROBLÉMU V MIKROBIÁLNÍ EKOLOGII, ANOMÁLII POČTU DESTIČEK (SKUTEČNOST, ŽE KULTIVAČNÍ BAKTERIE JSOU JEN ZLOMKEM Z CELKOVÉHO POČTU). DRUHÝ PŘÍSTUP SE TÝKÁ PRŮMYSLOVÉ FERMENTACE. V TOMTO DÍLČÍM CÍLI PLÁNUJEME VYVINOUT VYLEPŠENÉ SYSTÉMY SSF PRO MIKROBIÁLNÍ KULTURU POMOCÍ NOVÝCH MATERIÁLŮ S DEFINOVANOU PÓROVITOSTÍ A TESTOVÁNÍM VYBRANÝCH KMENŮ V ČISTÉ A KOKULTURĚ. CÍLEM TOHOTO VÝVOJE JE STANDARDIZOVAT PROCES DEFINOVÁNÍM VŠECH BIOLOGICKÝCH A FYZIKÁLNĚ-CHEMICKÝCH PARAMETRŮ PROCESU K PŘEKONÁNÍ SOUČASNÝCH OMEZENÍ, POKUD JDE O VÝNOS A REPRODUKOVATELNOST. KMENY POUŽITÉ V TOMTO PROJEKTU BUDOU POCHÁZET BUĎ Z (I) NAŠÍ SBÍRKY XEROTOLERANTS VYDANÉ Z PŘEDCHOZÍHO PROJEKTU HELIOS; II) NOVOU SBÍRKU SHROMÁŽDĚNOU POMOCÍ SPECIFICKÉHO ZAŘÍZENÍ PRO BIOLOGICKÉ VYHLEDÁVÁNÍ POPSANÉHO V TOMTO NÁVRHU; (III) KMENY VYVINUTÉ V LABORATOŘI S PLATFORMOU EVOLVER, KTERÁ UMOŽŇUJE POUŽITÍ VÝBĚROVÝCH TLAKŮ (SIMULACE VYSYCHÁNÍ V NAŠEM PŘÍPADĚ) PO MNOHO GENERACÍ. TRANSKRIPTOMICKÁ A PROTEOMICKÁ ANALÝZA BUDE POUŽITA KE STUDIU TRANSKRIPČNÍCH A TRANSLAČNÍCH DETERMINANTŮ ADAPTACE NA VYSUŠOVÁNÍ. V NEPOSLEDNÍ ŘADĚ BUDE TENTO DÍLČÍ PROJEKT ZAHRNOVAT VÝVOJ PROTOTYPU STŘEDNÍHO STUPNICE PRO TESTOVÁNÍ VÝKONNOSTI SYSTÉMŮ NAVRŽENÝCH NA ZÁKLADĚ ZÍSKANÝCH VÝSLEDKŮ, KTERÝ BUDE KOMBINOVAT ZÍSKANÉ POZNATKY, POKUD JDE O FAKTORY SPOJENÉ S VYSOUŠECÍM ODPOREM, VÝBĚR SUBSTRÁTU, NÁVRH REAKTORU A RŮSTOVÉ PODMÍNKY. (Czech)
18 August 2022
0 references
AS BACTÉRIAS AMBIENTAIS PODEM DESENVOLVER-SE NUMA VASTA GAMA DE AMBIENTES, INCLUINDO, MAS NÃO RESTRITOS, AO MAR E À ÁGUA DOCE. DITO ISTO, A GRANDE MAIORIA DOS NICHOS MICROBIANOS TEM UM ABASTECIMENTO RELATIVAMENTE LIMITADO DE ÁGUA E/OU SOFRE DE PRIVAÇÃO DE ÁGUA ESTACIONÁRIA. O SOLO, UM DOS PRINCIPAIS RESERVATÓRIOS PARA A DIVERSIDADE MICROBIANA, BEM COMO UMA DAS PRINCIPAIS FONTES DE MICRORGANISMOS COM APLICAÇÕES BIOTECNOLÓGICAS, É UM EXEMPLO TÍPICO DE UM SUBSTRATO SÓLIDO HETEROGÊNEO, LIMITADO À ÁGUA, ONDE, NO ENTANTO, A BIODIVERSIDADE MICROBIANA PODE FLORESCER. Em CONTRATO DE ESTRIAÇÃO COM A SITUAÇÃO NA NATURA, os CULTUROS MICROBIAIS são reguilas a cabo no laboratório com uma oferta de água fictícia, tal como é o caso na ¿SOLID¿MEDIA (AGAR PLATES) SOBRE OUTROS LÍQUIDOS UTILIZADOS PARA DECADOS PARA CULTURAR ESTRAINOS BACTERIAIS E FUNGALOS._x000D_ este subprojeto FOCUSES SOBRE O DESENVOLVIMENTO E PROOFERÊNCIA DE CONCEITOS DE NOVA CULTIVAÇÃO DOS QUE POR UMA ISOLAÇÃO IMPROVEDA DE MICROORGANIZOS Xerofílicos, COMO GRANDE COMO CRESCIMENTO EM FERMENTAÇÃO SÓLIDA (SSF)-LIKE REACTORS. HIPOTETIZOU-SE QUE, DADA A ESCASSEZ DE ÁGUA EM MUITOS AMBIENTES NATURAIS, E A DISTRIBUIÇÃO IRREGULAR NO ESPAÇO E NO TEMPO DA ÁGUA, UM TEOR DE ÁGUA LIMITADO PODERIA SER UTILIZADO EM CULTURAS MICROBIANAS OTIMIZADAS. PARA VERIFICAR ISSO, REALIZAMOS UM CONJUNTO DE EXPERIMENTOS PRELIMINARES EM MEIOS LÍQUIDOS E EM SUBSTRATO SÓLIDO (PANO DE LIMPEZA COMERCIAL EMBEBIDO COM R2A). Como nos descrevimos na nossa proposta, os isolatos extremofílicos severos em FACT BETTER EM SOAKED CLOTH COMPARADO A CONDIÇÕES LÍQUIDOS._x000D_ subprojeto 1 são STRUCTURADOS EM DOIS PRIMEIROS APROVADOS. O PRIMEIRO CONSISTE NO DESENVOLVIMENTO DE UMA FERRAMENTA DE TRIAGEM NA FORMA DE UM DISPOSITIVO SÓLIDO DE CULTURA COM DISPONIBILIDADE DE ÁGUA CONTROLADA. ESTE DISPOSITIVO PERMITIRÁ ISOLAR ESTIRPES AMBIENTAIS A UMA TAXA MAIS ELEVADA DO QUE A ATUAL CULTURA À BASE DE PRATOS PETRI. ESTE DISPOSITIVO SERÁ TESTADO E SEU RENDIMENTO COMPARADO COM O DAS TÉCNICAS DE CULTURA REGULARES, EM TERMOS DE NÚMERO E DIVERSIDADE DE MICRORGANISMOS CULTIVÁVEIS. ESPERAMOS QUE ESTE DISPOSITIVO CONTRIBUA PARA RESOLVER UMA QUESTÃO BEM CONHECIDA EM ECOLOGIA MICROBIANA, A ANOMALIA DE CONTAGEM DE PLACAS¿(O FATO DE QUE AS BACTÉRIAS CULTIVÁVEIS SÃO APENAS UMA FRAÇÃO DAS TOTAIS). A SEGUNDA ABORDAGEM REFERE-SE À FERMENTAÇÃO INDUSTRIAL. NESTE SUBOBJETIVO, PLANEJAMOS DESENVOLVER SISTEMAS DE SSF MELHORADOS PARA CULTURA MICROBIANA, UTILIZANDO NOVOS MATERIAIS COM POROSIDADE DEFINIDA E TESTANDO CEPAS SELECIONADAS EM PURA E COCULTURA. ESTE DESENVOLVIMENTO VISA A PADRONIZAÇÃO DO PROCESSO, DEFININDO TODOS OS PARÂMETROS BIOLÓGICOS E FÍSICO-QUÍMICOS DO PROCESSO PARA SUPERAR AS LIMITAÇÕES ATUAIS EM TERMOS DE RENDIMENTO E REPRODUTIBILIDADE. AS CEPAS UTILIZADAS NESTE PROJETO SERÃO ORIUNDAS DE (I) NOSSA COLEÇÃO DE XEROTOLERANTS EMITIDOS A PARTIR DO PROJETO ANTERIOR HELIOS; II) UMA NOVA COLEÇÃO RECOLHIDA UTILIZANDO O DISPOSITIVO ESPECÍFICO DE BIOPROSPEÇÃO DESCRITO NA PRESENTE PROPOSTA; (III) CEPAS EVOLUÍRAM NO LABORATÓRIO COM A PLATAFORMA EVOLVER, QUE PERMITE USAR PRESSÕES DE SELEÇÃO (SIMULAÇÃO DE DESSECAÇÃO NO NOSSO CASO) POR MUITAS GERAÇÕES. A ANÁLISE TRANSCRIPTÔMICA E PROTEÔMICA SERÁ UTILIZADA PARA ESTUDAR OS DETERMINANTES DA TRANSCRIÇÃO E TRADUÇÃO DA ADAPTAÇÃO À DESSECAÇÃO. POR ÚLTIMO, ESTE SUBPROJETO INCLUIRÁ O DESENVOLVIMENTO DE UM PROTÓTIPO DE ESCALA MÉDIA PARA TESTAR O DESEMPENHO DOS SISTEMAS CONCEBIDOS A PARTIR DOS RESULTADOS OBTIDOS, QUE COMBINARÁ OS CONHECIMENTOS OBTIDOS EM TERMOS DE FATORES ASSOCIADOS À RESISTÊNCIA À DESSECAÇÃO, À ESCOLHA DO SUBSTRATO, À CONCEÇÃO DOS REATORES E ÀS CONDIÇÕES DE CRESCIMENTO. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
KESKKONNABAKTERID VÕIVAD ARENEDA PALJUDES KESKKONDADES, SEALHULGAS, KUID MITTE AINULT, MERES JA MAGEVEES. SAMAS ON ENAMIK MIKROOBSETEST NIŠŠIDEST SUHTELISELT PIIRATUD VEEVARUSTUSEGA JA/VÕI KANNATAVAD STATSIONAARSE VEEPUUDUSE ALL. PINNAS, MIS ON ÜKS PEAMISI MIKROOBIDE MITMEKESISUSE RESERVUAARISID JA ÜKS PEAMISI BIOTEHNOLOOGILISTE RAKENDUSTEGA MIKROORGANISMIDE ALLIKAID, ON TÜÜPILINE NÄIDE HETEROGEENSEST, VEEGA PIIRATUD TAHKEST SUBSTRAADIST, KUS MIKROOBIDE BIOLOOGILINE MITMEKESISUS VÕIB SIISKI ARENEDA. LEPINGU LEPINGU LEPINGU LEPINGU LIIKMESRIIKIDE KOHTUASI LIIKMESRIIKIDE KOHTUASI LIIKMESRIIKE LIIKMESRIIKE LIIKMESRIIKE KASUTATAVAD KOHUSTUSED KOHUSTUSED KOHTUASJAD KOHTUASI KOHUSTUSLIKES (AGAR PLATES), LIIKUID BROTHS USED CULTURINGRIAL-i ja FUNGALi jaoks STRAINS._x000D_THISe allprojekt, mis on seotud uue KULTIVTSIOONI DEVITSIOONIDE arengu ja töödega, mida on võimalik kasutada kserofiilsete MICROORGANISMSide ISOLTSIOONIDE JA KASUTAMINE SOLID STATE FERMENTATION (SSF)-LIKE REACTORSES. ME OLETASIME, ET ARVESTADES VEE NAPPUST PALJUDES LOODUSKESKKONDADES NING EBAREGULAARSET JAOTUMIST RUUMIS JA AJAS, VÕIKS OPTIMEERITUD MIKROOBIKULTUURIDES KASUTADA PIIRATUD VEESISALDUST. SELLE KONTROLLIMISEKS TEGIME EELKATSED VEDELAS KESKKONNAS JA TAHKEL SUBSTRAADIL (KAUBANDUSLIK PUHASTUSLAP, MIS ON LEOTATUD R2A-GA). Nagu WE DESCRIBE meie PROPOSAL, SEVERAL extremophilic ISOLATES GREW FACT BETTER IN SOAKED CLOTH COMPARED LIQUID CONDITIONS._x000D_ alamprojekt 1 IS STRUCTURED TWO MAIN APPROACHES. ESIMENE NEIST SEISNEB SÕELUMISVAHENDI VÄLJATÖÖTAMISES TAHKE KULTIVEERIMISVAHENDI KUJUL, MILLEL ON KONTROLLITUD VEE KÄTTESAADAVUS. SEE SEADE VÕIMALDAB ISOLEERIDA KESKKONNATÜVESID KIIREMINI KUI PRAEGUNE PETRI TASSIPÕHINE KULTIVEERIMINE. SEDA SEADET KATSETATAKSE JA SELLE SAAGIKUST VÕRRELDAKSE TAVALISE KULTIVEERIMISTEHNIKAGA, ARVESTADES KULTUREERITAVATE MIKROORGANISMIDE ARVU JA MITMEKESISUST. ME EELDAME, ET SEE SEADE AITAB LAHENDADA TUNTUD PROBLEEMI MIKROOBIDE ÖKOLOOGIAS, ÏPLATE COUNT ANOMALY (ASJAOLU, ET SÜÜSTAVAD BAKTERID ON VAID MURDOSA KÕIGIST NEIST). TEINE LÄHENEMISVIIS VIITAB TÖÖSTUSLIKULE KÄÄRITAMISELE. SELLE ALAEESMÄRGI RAAMES KAVATSEME ARENDADA MIKROOBSE KULTUURI JAOKS VÄLJA TÄIUSTATUD ROOSTEVABAST TERASEST KINNITUSDETAILIDE SÜSTEEMID, KASUTADES UUSI KINDLAKSMÄÄRATUD POORSUSEGA MATERJALE NING TESTIDES VALITUD TÜVESID PUHTAS JA KAASKULTUURIS. SELLE ARENGU EESMÄRK ON PROTSESSI STANDARDIMINE, MÄÄRATLEDES PROTSESSI KÕIK BIOLOOGILISED JA FÜÜSIKALIS-KEEMILISED PARAMEETRID, ET ÜLETADA PRAEGUSED SAAGIKUSE JA REPRODUTSEERITAVUSE PIIRANGUD. SELLES PROJEKTIS KASUTATAVAD TÜVED PÄRINEVAD KAS (I) MEIE XEROTOLERANTS KOLLEKTSIOONIST, MIS ON VÄLJA ANTUD EELMISEST PROJEKTIST HELIOS; II) UUS KOGUM, MIS ON KOGUTUD KÄESOLEVAS ETTEPANEKUS KIRJELDATUD KONKREETSE BIOPROSPEKTEERIMISSEADME ABIL; (III) TÜVED ARENESID LABORIS EVOLVERI PLATVORMI ABIL, MIS VÕIMALDAB KASUTADA VALIKUSURVEID (MEIE PUHUL KUIVAMISE IMULATSIOON) PALJUDE PÕLVKONDADE JAOKS. TRANSKRIPTSIOONI JA PROTEOOMILIST ANALÜÜSI KASUTATAKSE KUIVAMISE KOHANDAMISE TRANSKRIPTSIOONI JA TRANSLATSIOONI MÄÄRAVATE TEGURITE UURIMISEKS. LÕPUKS HÕLMAB SEE ALLPROJEKT KESKMISE ULATUSEGA PROTOTÜÜBI VÄLJATÖÖTAMIST, ET KATSETADA SAADUD TULEMUSTE PÕHJAL KAVANDATUD SÜSTEEMIDE TOIMIVUST, MILLES ÜHENDATAKSE TEADMISED KUIVAMISKINDLUSEGA SEOTUD TEGURITE, SUBSTRAADI VALIKU, REAKTORI KONSTRUKTSIOONI JA KASVUTINGIMUSTE KOHTA. (Estonian)
18 August 2022
0 references
A KÖRNYEZETI BAKTÉRIUMOK SOKFÉLE KÖRNYEZETBEN FEJLŐDHETNEK KI, BELEÉRTVE, DE NEM KIZÁRÓLAGOSAN A TENGERT ÉS AZ ÉDESVIZET. UGYANAKKOR A MIKROBIÁLIS FÜLKÉK TÚLNYOMÓ TÖBBSÉGE VISZONYLAG KORLÁTOZOTT VÍZELLÁTÁSSAL RENDELKEZIK ÉS/VAGY ÁLLANDÓ VÍZHIÁNYBAN SZENVED. A TALAJ, AMELY A MIKROBIÁLIS SOKFÉLESÉG EGYIK FŐ TÁROZÓJA, VALAMINT A BIOTECHNOLÓGIAI ALKALMAZÁSÚ MIKROORGANIZMUSOK EGYIK FŐ FORRÁSA, TIPIKUS PÉLDÁJA EGY HETEROGÉN, VÍZKORLÁTOZOTT SZILÁRD SZUBSZTRÁTUMNAK, AHOL AZONBAN A MIKROBIOLÓGIAI SOKFÉLESÉG VIRÁGOZHAT. A SZERZŐDÉS SZERZŐDÉSÉBEN, a MICROBIÁLIS KULTÚRA KULTÚRA, amelyet a LAB-ban egy FIXED SUPPLY-val végeztek el, az akkor már létező SOLID-MEDIA-ban (AGAR PLATES) is előfordul, hogy a LIQUID BROTHS-t, amelyet a Bakteriális és FUNGÁLLAMI STRAINS-hoz való felhasználás céljából használnak fel._x000D_ ez az alprojekt az új KULTIVÁCIÓK FEJEZETÉNEK FEJEZETÉNEK ÉS JEGYZÉKE, hogy a xerofil MICROORGANISMS-ek IMPROVED ISOLÁCIÓJÓKRA VONATKOZÓ MICROORGANISMÁCIÓKRA VONATKOZÓ SZABÁLYZATOKRA VONATKOZÓ SZABÁLYOZÁSOKRA VONATKOZÓ KÖVETKEZÉSI (SSF)-LIKE REACTOROKRA VONATKOZÓK. AZT FELTÉTELEZTÜK, HOGY TEKINTETTEL A SOK TERMÉSZETI KÖRNYEZETBEN TAPASZTALHATÓ VÍZHIÁNYRA, VALAMINT A VÍZ TÉRBEN ÉS IDŐBEN TÖRTÉNŐ SZABÁLYTALAN ELOSZLÁSÁRA, AZ OPTIMALIZÁLT MIKROBIÁLIS KULTÚRÁKBAN KORLÁTOZOTT VÍZTARTALOM HASZNÁLHATÓ FEL. ENNEK ELLENŐRZÉSE ÉRDEKÉBEN EGY SOR ELŐZETES KÍSÉRLETET VÉGEZTÜNK FOLYÉKONY KÖZEGBEN ÉS SZILÁRD SZUBSZTRÁTUMON (AZ R2A-VAL ÁZTATOTT KERESKEDELMI TISZTÍTÓRUHÁN). Mint ahogy a mi eljárásunkban, SEVERAL extremofil ISOLATES GREW A FACT BETTER A SOAKED CLOTH COMPARED A LIQUID CONDITIONS._x000D_ alprojekt 1 SZABÁLYZTATÁSA MAIN AJÁNLÁSOK. AZ ELSŐ EGY OLYAN SZŰRŐESZKÖZ KIFEJLESZTÉSÉBŐL ÁLL, AMELY SZABÁLYOZOTT VÍZELLÁTÁSSAL RENDELKEZŐ, SZILÁRD MŰVELÉSŰ ESZKÖZ FORMÁJÁT ÖLTI. EZ AZ ESZKÖZ LEHETŐVÉ TESZI A KÖRNYEZETI TÖRZSEK NAGYOBB MÉRTÉKŰ ELKÜLÖNÍTÉSÉT, MINT A JELENLEGI PETRI-CSÉSZE ALAPÚ TENYÉSZTÉS. EZT AZ ESZKÖZT TESZTELIK, ÉS HOZAMÁT ÖSSZEHASONLÍTJÁK A RENDSZERES TENYÉSZTÉSI TECHNIKÁKKAL, A TERMESZTETT MIKROORGANIZMUSOK SZÁMÁT ÉS SOKFÉLESÉGÉT ILLETŐEN. ARRA SZÁMÍTUNK, HOGY EZ AZ ESZKÖZ HOZZÁ FOG JÁRULNI EGY JÓL ISMERT PROBLÉMA MEGOLDÁSÁHOZ A MIKROBIÁLIS ÖKOLÓGIA, A LEMEZSZÁM ANOMÁLIA (AZ A TÉNY, HOGY A TERMESZTETT BAKTÉRIUMOK CSAK TÖREDÉKE A TELJES). A MÁSODIK MEGKÖZELÍTÉS AZ IPARI ERJESZTÉSRE VONATKOZIK. EBBEN AZ ALCÉLBAN A MIKROBIÁLIS KULTÚRA SZÁMÁRA TOVÁBBFEJLESZTETT SSF-RENDSZEREKET TERVEZÜNK KIFEJLESZTENI A MEGHATÁROZOTT POROZITÁSÚ ÚJ ANYAGOK FELHASZNÁLÁSÁVAL, VALAMINT A KIVÁLASZTOTT TÖRZSEK TISZTA ÉS KOKULTÚRÁBAN TÖRTÉNŐ TESZTELÉSÉVEL. E FEJLESZTÉS CÉLJA A FOLYAMAT SZABVÁNYOSÍTÁSA A FOLYAMAT VALAMENNYI BIOLÓGIAI ÉS FIZIKAI-KÉMIAI PARAMÉTERÉNEK MEGHATÁROZÁSÁVAL A HOZAM ÉS A REPRODUKÁLHATÓSÁG JELENLEGI KORLÁTAINAK LEKÜZDÉSE ÉRDEKÉBEN. AZ EBBEN A PROJEKTBEN HASZNÁLT TÖRZSEK VAGY (I) AZ ELŐZŐ HELIOS PROJEKTBŐL SZÁRMAZÓ XEROTOLERANTS GYŰJTEMÉNYÜNKBŐL SZÁRMAZNAK; II. AZ E JAVASLATBAN LEÍRT BIOKIJELZŐ ESZKÖZ FELHASZNÁLÁSÁVAL GYŰJTÖTT ÚJ GYŰJTEMÉNY; (III) TÖRZSEK ALAKULTAK KI A LABORBAN AZ EVOLVER PLATFORM, AMELY LEHETŐVÉ TESZI, HOGY A SZELEKCIÓS NYOMÁS (SZIMULÁCIÓ A MI ESETÜNKBEN) TÖBB GENERÁCIÓN KERESZTÜL. TRANSZKRIPTOMIKUS ÉS PROTEOMIKUS ELEMZÉST HASZNÁLNAK A KISZÁRADÁSI ADAPTÁCIÓ ÁTÍRÁSÁT ÉS FORDÍTÁSÁT MEGHATÁROZÓ TÉNYEZŐK TANULMÁNYOZÁSÁRA. VÉGÜL, EZ AZ ALPROJEKT MAGÁBAN FOGLALJA EGY KÖZEPES MÉRETŰ PROTOTÍPUS KIFEJLESZTÉSÉT A KAPOTT EREDMÉNYEK ALAPJÁN TERVEZETT RENDSZEREK TELJESÍTMÉNYÉNEK TESZTELÉSÉRE, AMELY ÖTVÖZI A KISZÁRADÁSI ELLENÁLLÁSHOZ KAPCSOLÓDÓ TÉNYEZŐK, A SZUBSZTRÁTVÁLASZTÁS, A REAKTORTERVEZÉS ÉS A NÖVEKEDÉSI FELTÉTELEK TEKINTETÉBEN SZERZETT ISMERETEKET. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
БАКТЕРИИТЕ ОТ ОКОЛНАТА СРЕДА МОГАТ ДА СЕ РАЗВИВАТ В ШИРОК СПЕКТЪР ОТ СРЕДИ, ВКЛЮЧИТЕЛНО, НО НЕ САМО, МОРСКИ И СЛАДКОВОДНИ. ВЪПРЕКИ ТОВА ПО-ГОЛЯМАТА ЧАСТ ОТ МИКРОБНИТЕ НИШИ ИМАТ ОТНОСИТЕЛНО ОГРАНИЧЕН ИЗТОЧНИК НА ВОДА И/ИЛИ СТРАДАТ ОТ СТАЦИОНАРНО ЛИШАВАНЕ ОТ ВОДА. ПОЧВАТА, КОЯТО Е ЕДИН ОТ ОСНОВНИТЕ РЕЗЕРВОАРИ ЗА МИКРОБНО РАЗНООБРАЗИЕ, КАКТО И ЕДИН ОТ ОСНОВНИТЕ ИЗТОЧНИЦИ НА МИКРООРГАНИЗМИ С БИОТЕХНОЛОГИЧНИ ПРИЛОЖЕНИЯ, Е ТИПИЧЕН ПРИМЕР ЗА ХЕТЕРОГЕНЕН ТВЪРД СУБСТРАТ, ОГРАНИЧЕН ВЪВ ВОДА, КЪДЕТО ВСЕ ОЩЕ МОЖЕ ДА ПРОЦЪФТЯВА МИКРОБНОТО БИОЛОГИЧНО РАЗНООБРАЗИЕ. Във връзка със ситуацията в природата, MICROBIAL CULTURES са се зараждали в сградата с фиксирана вода, тъй като това е случаят в така наречената „Солид Медия„(AGAR PLATES), като се има предвид, че това е дело на така наречената „Солид Медия“ (AGAR PLATES), като по този начин се използват за производство на хранителни продукти за култивиране на бактериални и финансови продукти STRAINS._x000D_Този подпроект ФОКУЗИ ЗА РАЗВИТИЕ И ПРОФОФ НА КОНСЕПТ НА НОВИ КУЛТИВАЦИИ, които могат да се превърнат в изобретени от ксерофилни микрокурганизми, които се случват в SOLID STATE FERMENTATION (SSF)-LIKE REACTORS. ПРЕДПОЛАГАХМЕ, ЧЕ ПРЕДВИД НЕДОСТИГА НА ВОДА В МНОГО ПРИРОДНИ СРЕДИ И НЕРАВНОМЕРНОТО РАЗПРЕДЕЛЕНИЕ В ПРОСТРАНСТВОТО И ВРЕМЕТО НА ВОДАТА, ОГРАНИЧЕНОТО ВОДНО СЪДЪРЖАНИЕ МОЖЕ ДА СЕ ИЗПОЛЗВА В ОПТИМИЗИРАНИ МИКРОБНИ КУЛТУРИ. ЗА ДА ПРОВЕРИМ ТОВА, ИЗВЪРШИХМЕ НАБОР ОТ ПРЕДВАРИТЕЛНИ ЕКСПЕРИМЕНТИ В ТЕЧНА СРЕДА И ВЪРХУ ТВЪРД СУБСТРАТ (ТЪРГОВСКА ПОЧИСТВАЩА КЪРПА, НАПОЕНА С R2A). Тъй като сме се развили в нашите ПРОПОЗАЛНИ, северофилни екстремофилни ISOLATES GREW в FACT BETTER в SOAKED CLOTH COMPARED да LIQUID CONDITIONS._x000D_ подпроект 1 е СТРУКТУРЕН В Два основни приложения. ПЪРВИЯТ СЕ СЪСТОИ В РАЗРАБОТВАНЕТО НА ИНСТРУМЕНТ ЗА СКРИНИНГ ПОД ФОРМАТА НА КУЛТИВИРАЩО ТВЪРДО УСТРОЙСТВО С КОНТРОЛИРАНА НАЛИЧНОСТ НА ВОДА. ИЗДЕЛИЕТО ПОЗВОЛЯВА ИЗОЛИРАНЕ НА ЩАМОВЕ НА ОКОЛНАТА СРЕДА С ПО-ВИСОКА СКОРОСТ ОТ ТЕКУЩАТА КУЛТИВАЦИЯ НА ПЕТРИ. ИЗДЕЛИЕТО ЩЕ БЪДЕ ТЕСТВАНО И ДОБИВА МУ В СРАВНЕНИЕ С ТОЗИ НА РЕДОВНИТЕ ТЕХНИКИ ЗА КУЛТИВИРАНЕ ПО ОТНОШЕНИЕ НА БРОЯ И РАЗНООБРАЗИЕТО НА КУЛТИВИРУЕМИТЕ МИКРООРГАНИЗМИ. ОЧАКВАМЕ, ЧЕ ТОВА УСТРОЙСТВО ЩЕ ДОПРИНЕСЕ ЗА РЕШАВАНЕ НА ДОБРЕ ПОЗНАТ ПРОБЛЕМ В МИКРОБНАТА ЕКОЛОГИЯ, АНОМАЛИЯТА НА БРОЯ НА ПЛОЧИТЕ (ФАКТЪТ, ЧЕ КУЛТИВИРУЕМИТЕ БАКТЕРИИ СА САМО ЧАСТ ОТ ОБЩИЯ БРОЙ). ВТОРИЯТ ПОДХОД СЕ ОТНАСЯ ДО ПРОМИШЛЕНАТА ФЕРМЕНТАЦИЯ. В ТАЗИ ПОДЦЕЛ ПЛАНИРАМЕ ДА РАЗРАБОТИМ ПОДОБРЕНИ SSF СИСТЕМИ ЗА МИКРОБНА КУЛТУРА, КАТО ИЗПОЛЗВАМЕ НОВИ МАТЕРИАЛИ С ОПРЕДЕЛЕНА ПОРЬОЗНОСТ И ТЕСТВАМЕ ИЗБРАНИ ЩАМОВЕ В ЧИСТА И КОКУЛТУРА. ТОВА РАЗВИТИЕ ИМА ЗА ЦЕЛ ДА СТАНДАРТИЗИРА ПРОЦЕСА ЧРЕЗ ОПРЕДЕЛЯНЕ НА ВСИЧКИ БИОЛОГИЧНИ И ФИЗИКОХИМИЧНИ ПАРАМЕТРИ НА ПРОЦЕСА, ЗА ДА СЕ ПРЕОДОЛЕЯТ НАСТОЯЩИТЕ ОГРАНИЧЕНИЯ ПО ОТНОШЕНИЕ НА ДОБИВА И ВЪЗПРОИЗВОДИМОСТТА. ИЗПОЛЗВАНИТЕ В ТОЗИ ПРОЕКТ ЩАМОВЕ ЩЕ ПРОИЗХОЖДАТ ИЛИ ОТ (I) НАШАТА КОЛЕКЦИЯ ОТ XEROTOLERANTS, ИЗДАДЕНА ОТ ПРЕДИШНИЯ ПРОЕКТ HELIOS; II) НОВА КОЛЕКЦИЯ, СЪБРАНА ЧРЕЗ ИЗПОЛЗВАНЕ НА СПЕЦИФИЧНОТО БИОПРОСПЕКТИРАЩО УСТРОЙСТВО, ОПИСАНО В НАСТОЯЩОТО ПРЕДЛОЖЕНИЕ; (III) ЩАМОВЕ ЕВОЛЮИРА В ЛАБОРАТОРИЯТА С ПЛАТФОРМАТА EVOLVER, КОЯТО ПОЗВОЛЯВА ДА СЕ ИЗПОЛЗВА СЕЛЕКТИВЕН НАТИСК (СИМУЛАЦИЯ НА ИЗСУШАВАНЕ В НАШИЯ СЛУЧАЙ) В ПРОДЪЛЖЕНИЕ НА МНОГО ПОКОЛЕНИЯ. ТРАНСКРИПТОМНИЯТ И ПРОТЕОМИЧНИЯТ АНАЛИЗ ЩЕ СЕ ИЗПОЛЗВАТ ЗА ИЗСЛЕДВАНЕ НА ТРАНСКРИПЦИОННИТЕ И ТРАНСЛАЦИОННИТЕ ДЕТЕРМИНАНТИ НА АДАПТАЦИЯТА НА ИЗСУШАВАНЕТО. И НАКРАЯ, ТОЗИ ПОДПРОЕКТ ЩЕ ВКЛЮЧВА РАЗРАБОТВАНЕТО НА ПРОТОТИП ОТ СРЕДЕН МАЩАБ ЗА ИЗПИТВАНЕ НА ЕКСПЛОАТАЦИОННИТЕ ПОКАЗАТЕЛИ НА СИСТЕМИТЕ, ПРОЕКТИРАНИ ВЪЗ ОСНОВА НА ПОЛУЧЕНИТЕ РЕЗУЛТАТИ, КОЙТО ЩЕ СЪЧЕТАЕ ЗНАНИЯТА, ПОЛУЧЕНИ ПО ОТНОШЕНИЕ НА ФАКТОРИТЕ, СВЪРЗАНИ С УСТОЙЧИВОСТТА НА ИЗСУШАВАНЕ, ИЗБОРА НА СУБСТРАТ, ПРОЕКТИРАНЕТО И УСЛОВИЯТА НА РАСТЕЖ НА РЕАКТОРА. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
APLINKOS BAKTERIJOS GALI IŠSIVYSTYTI ĮVAIRIOSE APLINKOSE, ĮSKAITANT, BET NEAPSIRIBOJANT JŪRA IR GĖLU VANDENIU. NEPAISANT TO, DIDŽIOJI DAUGUMA MIKROBŲ NIŠŲ TURI SANTYKINAI RIBOTĄ VANDENS TIEKIMĄ IR (ARBA) KENČIA NUO STACIONARIŲ VANDENS NEPRITEKLIAUS. DIRVOŽEMIS, VIENAS IŠ PAGRINDINIŲ MIKROBŲ ĮVAIROVĖS REZERVUARŲ, TAIP PAT VIENAS IŠ PAGRINDINIŲ BIOTECHNOLOGINIAIS TIKSLAIS NAUDOJAMŲ MIKROORGANIZMŲ ŠALTINIŲ, YRA TIPIŠKAS NEVIENALYČIO, VANDENS RIBOTUVO KIETO SUBSTRATO, KURIAME VIS DĖLTO GALI KLESTĖTI MIKROBŲ BIOLOGINĖ ĮVAIROVĖ, PAVYZDYS. Be STRIKING SU SITUACIJA NATURE, MICROBIAL CULTURES ARE CARRIED LAB su Fiksuoto vandens, nes ji yra BALTYTOS IR FUNGALINIO STRAINKOS (AGAR PLATES) atveju, LIETUVOS SUSITARIANČIOS BROTHIJOS, naudojamos DECADES BACTERIAL IR FUNGALINIAI STRAINTAI._x000D_ šis subprojektas "NAUJO KULTIVACIJOS VALSTYBĖS NAUJŲ KULTIVACIJOS VYRIAUSYBIŲ VYRIAUSYBĖS IR PATVIRTINIMO VALSTYBĖJE TAIKOMAS DĖL Kserofilinių MICROORGANIZAMŲ IŠLAIDŲ IŠLAIDŲ IŠLAIDŲ IŠLAIDŲ KONKRETŲ KONKURSŲ KONKURSO GYVENDINIMO (SSF) – LYKŲ REAKTORIŲ. HIPOTEZAVOME, KAD, ATSIŽVELGIANT Į VANDENS TRŪKUMĄ DAUGELYJE NATŪRALIOS APLINKOS IR NEREGULIARŲ VANDENS PASISKIRSTYMĄ ERDVĖJE IR LAIKU, OPTIMIZUOTOSE MIKROBŲ KULTŪROSE GALĖTŲ BŪTI NAUDOJAMAS RIBOTAS VANDENS KIEKIS. NORĖDAMI TAI PATIKRINTI, ATLIKOME PRELIMINARIUS EKSPERIMENTUS SKYSTOJE TERPĖJE IR ANT KIETO PAGRINDO (KOMERCINĖS VALYMO MEDŽIAGOS, MIRKYTOS R2A). Kaip mes DESCRIBE mūsų PROPOSAL, SEVEERAL ekstremofiliniai ISOLATES GREW į FACT GETTER į SOAKED CLOTH COMPARED TO LIQUID CONDITIONS._x000D_ subprojektas 1 yra STRUCTURED DWO MAIN APPROACHES. PIRMASIS SUSIDEDA IŠ ATRANKOS ĮRANKIO, KURIO FORMA YRA KIETAS KULTIVAVIMAS SU KONTROLIUOJAMU VANDENS PRIEINAMUMU, KŪRIMAS. ŠIS PRIETAISAS LEIS GERIAU IZOLIUOTI APLINKOS PADERMES NEI DABARTINIS PETRI INDŲ AUGINIMAS. ŠIS PRIETAISAS BUS IŠBANDYTAS IR JO DERLIUS LYGINAMAS SU ĮPRASTŲ KULTŪROS METODŲ DERLIUMI, ATSIŽVELGIANT Į KULTIVUOJAMŲ MIKROORGANIZMŲ SKAIČIŲ IR ĮVAIROVĘ. TIKIMĖS, KAD ŠIS PRIETAISAS PADĖS IŠSPRĘSTI GERAI ŽINOMĄ MIKROBŲ EKOLOGIJOS PROBLEMĄ, „PLATE COUNT ANOMALY“ (TAI, KAD KULTIVUOJAMOS BAKTERIJOS YRA TIK DALIS VISŲ). ANTRASIS METODAS SUSIJĘS SU PRAMONINE FERMENTACIJA. ŠIUO TIKSLU PLANUOJAME KURTI PATOBULINTAS MIKROBŲ KULTŪROS SSF SISTEMAS, NAUDODAMI NAUJAS MEDŽIAGAS SU NUSTATYTU PORINGUMU IR IŠBANDYDAMI PASIRINKTAS ŠTAMAS GRYNOJE IR KOKULTŪROJE. ŠIA RAIDA SIEKIAMA STANDARTIZUOTI PROCESĄ APIBRĖŽIANT VISUS BIOLOGINIUS IR FIZIKINIUS IR CHEMINIUS PROCESO PARAMETRUS, KAD BŪTŲ ĮVEIKTI DABARTINIAI DERLIAUS IR ATKURIAMUMO APRIBOJIMAI. ŠIAME PROJEKTE NAUDOJAMI ŠTAMAI BUS KILĘ IŠ (I) MŪSŲ XEROTOLERANTS KOLEKCIJOS, IŠLEISTOS IŠ ANKSTESNIO PROJEKTO HELIOS; II) NAUJAS RINKINYS, SURINKTAS NAUDOJANT ŠIAME PASIŪLYME APRAŠYTĄ SPECIALIĄ BIOLOGINIO TIKRINIMO PRIEMONĘ; (III) LABORATORIJOJE IŠSIVYSTĖ ŠTAMAI SU „EVOLVER“ PLATFORMA, KURI DAUGELIUI KARTŲ LEIDŽIA NAUDOTI ATRANKOS SLĖGIUS (MŪSŲ ATVEJU MODELIAVIMĄ). TRANSKRIPTOMINĖ IR PROTEOMINĖ ANALIZĖ BUS NAUDOJAMA TIRIANT DESICCATION ADAPTACIJOS TRANSKRIPCIJĄ IR VERTIMĄ LEMIANČIUS VEIKSNIUS. GALIAUSIAI Į ŠĮ PROJEKTĄ BUS ĮTRAUKTAS VIDUTINIO MASTO PROTOTIPO KŪRIMAS SIEKIANT IŠBANDYTI PAGAL GAUTUS REZULTATUS SUKURTŲ SISTEMŲ EKSPLOATACINES SAVYBES, KURIOS SUJUNGS ĮGYTAS ŽINIAS APIE ATSPARUMO IŠDŽIŪVIMUI VEIKSNIUS, SUBSTRATO PASIRINKIMĄ, REAKTORIŲ KONSTRUKCIJĄ IR AUGIMO SĄLYGAS. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
BAKTERIJE IZ OKOLIŠA MOGU SE RAZVITI U ŠIROKOM RASPONU OKOLIŠA, UKLJUČUJUĆI, ALI NE OGRANIČAVAJUĆI SE NA MORE I SLATKU VODU. MEĐUTIM, VELIKA VEĆINA MIKROBNIH NIŠA IMA RELATIVNO OGRANIČENU OPSKRBU VODOM I/ILI PATI OD NEPOKRETNE VODE. TLO, JEDAN OD GLAVNIH REZERVOARA ZA MIKROBNU RAZNOLIKOST, KAO I JEDAN OD GLAVNIH IZVORA MIKROORGANIZAMA S BIOTEHNOLOŠKIM PRIMJENAMA, TIPIČAN JE PRIMJER HETEROGENE KRUTE SUPSTRATE OGRANIČENE NA VODU GDJE IPAK MOŽE PROCVJETATI MIKROBNA BIOLOŠKA RAZNOLIKOST. U STRIKING CONTRAST sa SITUATION in NATURE, MICROBIAL CULTUREs su uređene u LAB-u s FIXED SUPPLY OF WATER, kao što je to slučaj u SO-CALLED-u, (AGAR PLATES), LET ALONE THE LIQUID BROTHS USED for CULTURING BACTERIAL I FUNGAL STRAINS._x000D_ to je potprojekt FOCUSES O DEVELOPMENT I PROIZVODNJA KONCEPT NEW CULTIVATION DEVICIJE JE POMOĆI ZA IMPROVEDENI IZLOŽIVANJE Xerophilic MICROORGANISMS, kao što je bilo u rastu u SOLID STATE FERMENTATION (SSF)-Like REACTORORI. PRETPOSTAVILI SMO DA BI SE, S OBZIROM NA NESTAŠICU VODE U MNOGIM PRIRODNIM SREDINAMA I NEPRAVILNU RASPODJELU U PROSTORU I VREMENU VODE, U OPTIMIZIRANIM MIKROBNIM KULTURAMA MOGAO KORISTITI OGRANIČENI SADRŽAJ VODE. DA BISMO TO PROVJERILI, OBAVILI SMO NIZ PRELIMINARNIH EKSPERIMENATA U TEKUĆIM MEDIJIMA I NA ČVRSTOJ PODLOZI (KOMERCIJALNA TKANINA ZA ČIŠĆENJE NATOPLJENA R2A). Kao što smo DESCRIBE u našem PROPOSAL, SEVERAL ekstremnophilic ISOLATES GREW u FACT BETTER u SOAKED CLOTH U ODNOSU na LIQUID CONDITIONS._x000D_ potprojekt 1 je STRUCTURED U TWO MAIN APPROACHES. PRVI SE SASTOJI OD RAZVOJA ALATA ZA PROBIR U OBLIKU KULTIVIRANOG KRUTOG UREĐAJA S KONTROLIRANOM DOSTUPNOŠĆU VODE. OVAJ UREĐAJ ĆE OMOGUĆITI IZOLACIJU SOJEVA OKOLIŠA VEĆOM BRZINOM OD TRENUTNOG UZGOJA NA BAZI PETRIJA. OVAJ UREĐAJ ĆE BITI TESTIRAN I NJEGOV PRINOS U USPOREDBI S ONIM REDOVNIH TEHNIKA KULTURE, U SMISLU BROJA I RAZNOLIKOSTI KULTIVIRANIH MIKROORGANIZAMA. OČEKUJEMO DA ĆE OVAJ UREĐAJ DOPRINIJETI RJEŠAVANJU POZNATOG PROBLEMA U MIKROBNOJ EKOLOGIJI, ANOMALIJA (ČINJENICA DA SU KULTIVIRANE BAKTERIJE SAMO DJELIĆ UKUPNOG BROJA BAKTERIJA). DRUGI PRISTUP ODNOSI SE NA INDUSTRIJSKU FERMENTACIJU. U OVOM PODCILJU PLANIRAMO RAZVITI POBOLJŠANE SSF SUSTAVE ZA MIKROBNU KULTURU, KORISTEĆI NOVE MATERIJALE S DEFINIRANOM POROZNOŠĆU, TE TESTIRANJEM ODABRANIH SOJEVA U ČISTOJ I KOKULTURI. TIM SE RAZVOJEM NASTOJI STANDARDIZIRATI PROCES DEFINIRANJEM SVIH BIOLOŠKIH I FIZIKALNO-KEMIJSKIH PARAMETARA PROCESA KAKO BI SE PREVLADALA POSTOJEĆA OGRANIČENJA U POGLEDU PRINOSA I OBNOVLJIVOSTI. SOJEVI KORIŠTENI U OVOM PROJEKTU POTJECAT ĆE ILI IZ (I) NAŠE ZBIRKE XEROTOLERANTS IZDANE IZ PRETHODNOG PROJEKTA HELIOS; II. NOVU ZBIRKU PRIKUPLJENU UPORABOM POSEBNOG UREĐAJA ZA BIOLOŠKO ISPITIVANJE OPISANOG U OVOM PRIJEDLOGU; (III) SOJEVI SU EVOLUIRALI U LABORATORIJU S EVOLVER PLATFORMOM, KOJA OMOGUĆUJE KORIŠTENJE SELEKCIJSKIH PRITISAKA (SIMULACIJA ISUŠIVANJA U NAŠEM SLUČAJU) ZA MNOGE GENERACIJE. TRANSKRIPTOMSKA I PROTEOMSKA ANALIZA KORISTIT ĆE SE ZA PROUČAVANJE TRANSKRIPCIJE I ODREDNICA PRIJEVODA PRILAGODBE ISUŠIVANJA. NAPOSLJETKU, OVAJ ĆE POTPROJEKT UKLJUČIVATI RAZVOJ PROTOTIPA SREDNJEG RAZMJERA ZA ISPITIVANJE UČINKOVITOSTI SUSTAVA OSMIŠLJENIH NA TEMELJU DOBIVENIH REZULTATA, KOJI ĆE KOMBINIRATI ZNANJE STEČENO U SMISLU ČIMBENIKA POVEZANIH S OTPOROM NA SUŠENJE, ODABIRA SUPSTRATA, PROJEKTIRANJA REAKTORA I UVJETA RASTA. (Croatian)
18 August 2022
0 references
MILJÖBAKTERIER KAN UTVECKLAS I EN MÄNGD OLIKA MILJÖER, INKLUSIVE, MEN INTE BEGRÄNSAT TILL, HAV OCH SÖTVATTEN. TROTS DETTA HAR DE ALLRA FLESTA MIKROBIELLA NISCHER EN RELATIVT BEGRÄNSAD VATTENFÖRSÖRJNING OCH/ELLER LIDER AV STILLASTÅENDE VATTENBRIST. JORD, EN AV DE VIKTIGASTE RESERVOARERNA FÖR MIKROBIELL MÅNGFALD SAMT EN AV DE VIKTIGASTE KÄLLORNA TILL MIKROORGANISMER MED BIOTEKNISKA TILLÄMPNINGAR, ÄR ETT TYPISKT EXEMPEL PÅ ETT HETEROGENT, VATTENBEGRÄNSAT FAST SUBSTRAT DÄR DEN MIKROBIELLA BIOLOGISKA MÅNGFALDEN KAN BLOMSTRA. I STRIKING CONTRAST MED SITUATIONEN I NATURE, MICROBIAL KULTURER ÄR KULTURER I LAB med en FIXED SUPPLY OF WATER, som det ÄR MÅLEN I SOLIDMEDIEN (AGAR PLATES), LÅN ENLIGA LIQUID BROTHS ANVÄNDAS FÖR DECADES FÖR KULTURING BAKERIAL OCH FUNGAL STRAINS._x000D_ det här delprojektet FOCUSES ON THE DEVELOPMENT OCH PROOF OF CONCEPT OF NEW CULTIVATION DEVICES ATT MAY ALLOW FOR EN IMPROVED ISOLATION OF xerofila MICROORGANISMS, ASELL AS TO THE GROWTH IN SOLID STATE FERMENTATION (SSF)-LIKE REACTORS. VI ANTOG ATT EN BEGRÄNSAD VATTENHALT SKULLE KUNNA ANVÄNDAS I OPTIMERADE MIKROBIELLA KULTURER MED TANKE PÅ VATTENBRISTEN I MÅNGA NATURLIGA MILJÖER OCH DEN OREGELBUNDNA FÖRDELNINGEN AV VATTEN I RUM OCH TID. FÖR ATT KONTROLLERA DETTA UTFÖRDE VI EN UPPSÄTTNING PRELIMINÄRA EXPERIMENT I FLYTANDE MEDIER OCH PÅ ETT FAST SUBSTRAT (KOMMERSIELL RENGÖRINGSDUK INDRÄNKT MED R2A). Som WE DESCRIBE IN OUR PROPOSAL, SEVERAL extremophilic ISOLATES GREW IN FACT BETTER I SOAKED CLOTH COMPARED to LIQUID CONDITIONS._x000D_ delprojekt 1 ÄR STRUCTURED I TWO MAIN APPROACHES. DEN FÖRSTA BESTÅR AV UTVECKLING AV ETT SCREENINGVERKTYG I FORM AV EN ODLINGSFAST ENHET MED KONTROLLERAD VATTENTILLGÅNG. DENNA ANORDNING KOMMER ATT GÖRA DET MÖJLIGT ATT ISOLERA MILJÖSTAMMAR I EN HÖGRE HASTIGHET ÄN NUVARANDE PETRI-RÄTTBASERAD ODLING. DENNA PRODUKT KOMMER ATT TESTAS OCH DESS AVKASTNING JÄMFÖRT MED REGELBUNDEN ODLINGSTEKNIK, I FRÅGA OM ANTAL OCH MÅNGFALD AV ODLADE MIKROORGANISMER. VI FÖRVÄNTAR OSS ATT DENNA ENHET KOMMER ATT BIDRA TILL ATT LÖSA ETT VÄLKÄNT PROBLEM I MIKROBIELL EKOLOGI, DEN PLATTA TAL ANOMALI (DET FAKTUM ATT ODLADE BAKTERIER ÄR BARA EN BRÅKDEL AV DE TOTALA). DET ANDRA TILLVÄGAGÅNGSSÄTTET AVSER INDUSTRIELL JÄSNING. I DETTA DELMÅL PLANERAR VI ATT UTVECKLA FÖRBÄTTRADE SSF-SYSTEM FÖR MIKROBIELL ODLING, GENOM ATT ANVÄNDA NYA MATERIAL MED DEFINIERAD POROSITET OCH GENOM ATT TESTA UTVALDA STAMMAR I REN OCH SAMKULTUR. DENNA UTVECKLING SYFTAR TILL ATT STANDARDISERA PROCESSEN GENOM ATT DEFINIERA ALLA BIOLOGISKA OCH FYSIKALISK-KEMISKA PARAMETRAR FÖR PROCESSEN FÖR ATT ÖVERVINNA NUVARANDE BEGRÄNSNINGAR I FRÅGA OM AVKASTNING OCH REPRODUCERBARHET. DE STAMMAR SOM ANVÄNDS I DETTA PROJEKT KOMMER ANTINGEN FRÅN (I) VÅR SAMLING AV XEROTOLERANTS SOM UTFÄRDATS FRÅN DET TIDIGARE PROJEKTET HELIOS. II) EN NY SAMLING SOM SAMLATS IN MED HJÄLP AV DEN SPECIFIKA PRODUKT FÖR BIOPROSPEKTERING SOM BESKRIVS I DETTA FÖRSLAG. (III) STAMMAR UTVECKLADES I LABBET MED EVOLVER PLATTFORM, SOM GÖR DET MÖJLIGT ATT ANVÄNDA URVALSTRYCK (SIMULERING AV UTTORKNING I VÅRT FALL) FÖR MÅNGA GENERATIONER. TRANSKRIPTOMISK OCH PROTEOMISK ANALYS KOMMER ATT ANVÄNDAS FÖR ATT STUDERA TRANSKRIPTION OCH ÖVERSÄTTNINGSDETERMINANTER FÖR TORKNINGSANPASSNING. SLUTLIGEN KOMMER DETTA DELPROJEKT ATT OMFATTA UTVECKLING AV EN MELLANSKALIG PROTOTYP FÖR ATT TESTA PRESTANDAN HOS DE SYSTEM SOM UTFORMATS UTIFRÅN DE ERHÅLLNA RESULTATEN, SOM KOMMER ATT KOMBINERA DEN KUNSKAP SOM ERHÅLLITS NÄR DET GÄLLER UTTORKNINGSRESISTENSASSOCIERADE FAKTORER, VAL AV SUBSTRAT, REAKTORDESIGN OCH TILLVÄXTFÖRHÅLLANDEN. (Swedish)
18 August 2022
0 references
BACTERIILE DE MEDIU SE POT DEZVOLTA ÎNTR-O GAMĂ LARGĂ DE MEDII, INCLUSIV, DAR FĂRĂ A SE LIMITA LA APĂ DULCE ȘI MARINĂ. ACESTEA FIIND SPUSE, MAREA MAJORITATE A NIȘELOR MICROBIENE AU O SURSĂ RELATIV LIMITATĂ DE APĂ ȘI/SAU SUFERĂ DE PRIVAREA DE APĂ STAȚIONARĂ. SOLUL, UNUL DINTRE PRINCIPALELE REZERVOARE PENTRU DIVERSITATEA MICROBIANĂ, PRECUM ȘI UNA DINTRE PRINCIPALELE SURSE DE MICROORGANISME CU APLICAȚII BIOTEHNOLOGICE, ESTE UN EXEMPLU TIPIC DE SUBSTRAT SOLID ETEROGEN, LIMITAT LA APĂ, ÎN CARE BIODIVERSITATEA MICROBIANĂ POATE ÎNFLORI. În CONTRATUL DE STRIKING CU SITUAȚIA ÎN NATURĂ, CULTURILE MICROBIALE sunt îngrădite în LAB, cu o combinație de apă, așa cum este cazul în MEDIA așa-numită (plăți AGAR), să se deplaseze în jurul BROTII LIQUID utilizate pentru DECADES PENTRU CULTURARE BACTERIAL ȘI FUNGAL STRAINS._x000D_ acest subproiect se încadrează în DEZVOLTAREA ȘI PROOFUL CONCEPTULUI NOU DE VICȚII CULTIVARE CĂ poate fi activată pentru o ISOLATION IMPROVATE de MICROORGANISme xerofile, la fel ca și la GROWTH în SOLID STATE FERMENTATION (SSF)-LIKE REACTORS. AM PRESUPUS CĂ, AVÂND ÎN VEDERE DEFICITUL DE APĂ DIN MULTE MEDII NATURALE ȘI DISTRIBUȚIA NEREGULATĂ ÎN SPAȚIU ȘI TIMP A APEI, UN CONȚINUT LIMITAT DE APĂ AR PUTEA FI UTILIZAT ÎN CULTURILE MICROBIENE OPTIMIZATE. PENTRU A VERIFICA ACEST LUCRU, AM EFECTUAT UN SET DE EXPERIMENTE PRELIMINARE ÎN MEDII LICHIDE ȘI PE UN SUBSTRAT SOLID (ȚESĂTURĂ DE CURĂȚARE COMERCIALĂ IMPREGNATĂ CU R2A). Ca DESCRIBE ÎN PROPOZIȚII NOASTRE, ISOLATELE SEVERALE extremofile GREW IN FACT BETTER ÎN COMPARATUL SOAKED CLOTH to LIQUID CONDITIONS._x000D_ subproiectul 1 este STRUCTURAT în două amenajări principale. PRIMUL CONSTĂ ÎN DEZVOLTAREA UNUI INSTRUMENT DE SCREENING SUB FORMA UNUI DISPOZITIV SOLID DE CULTURĂ CU DISPONIBILITATE CONTROLATĂ A APEI. ACEST DISPOZITIV VA PERMITE IZOLAREA TULPINILOR DE MEDIU LA O RATĂ MAI MARE DECÂT CULTURA CURENTĂ PE BAZĂ DE VASE PETRI. ACEST DISPOZITIV VA FI TESTAT ȘI RANDAMENTUL SĂU VA FI COMPARAT CU CEL AL TEHNICILOR DE CULTURĂ OBIȘNUITE, ÎN CEEA CE PRIVEȘTE NUMĂRUL ȘI DIVERSITATEA MICROORGANISMELOR CARE POT FI CULTIVATE. NE AȘTEPTĂM CA ACEST DISPOZITIV SĂ CONTRIBUIE LA REZOLVAREA UNEI PROBLEME BINE-CUNOSCUTE ÎN ECOLOGIA MICROBIANĂ, ANOMALIEA NUMĂRULUI DE PLĂCI (FAPTUL CĂ BACTERIILE CARE POT FI CULTIVATE SUNT DOAR O FRACȚIUNE DIN TOTALUL BACTERIILOR). A DOUA ABORDARE SE REFERĂ LA FERMENTAREA INDUSTRIALĂ. ÎN ACEST SUBOBIECTIV, INTENȚIONĂM SĂ DEZVOLTĂM SISTEME ÎMBUNĂTĂȚITE DE SSF PENTRU CULTURA MICROBIANĂ, PRIN UTILIZAREA DE NOI MATERIALE CU POROZITATE DEFINITĂ ȘI PRIN TESTAREA TULPINILOR SELECTATE ÎN PUR ȘI CO-CULTURĂ. ACEASTĂ EVOLUȚIE VIZEAZĂ STANDARDIZAREA PROCESULUI PRIN DEFINIREA TUTUROR PARAMETRILOR BIOLOGICI ȘI FIZICO-CHIMICI AI PROCESULUI PENTRU A DEPĂȘI LIMITĂRILE ACTUALE ÎN CEEA CE PRIVEȘTE RANDAMENTUL ȘI REPRODUCTIBILITATEA. TULPINILE UTILIZATE ÎN ACEST PROIECT VOR PROVENI FIE DIN (I) COLECȚIA NOASTRĂ DE XEROTOLERANTS EMISE DIN PROIECTUL ANTERIOR HELIOS; (II) O NOUĂ COLECȚIE CU AJUTORUL DISPOZITIVULUI SPECIFIC DE BIOPROSPECTARE DESCRIS ÎN PREZENTA PROPUNERE; (III) TULPINILE AU EVOLUAT ÎN LABORATOR CU PLATFORMA EVOLVER, CARE PERMITE UTILIZAREA PRESIUNILOR DE SELECȚIE (SIMULAREA DESHIDRATĂRII ÎN CAZUL NOSTRU) PENTRU MULTE GENERAȚII. ANALIZA TRANSCRIMINICĂ ȘI PROTEOMICĂ VA FI UTILIZATĂ PENTRU A STUDIA TRANSCRIEREA ȘI DETERMINANȚII DE TRADUCERE AI ADAPTĂRII DE DESHIDRATARE. ÎN CELE DIN URMĂ, ACEST SUBPROIECT VA INCLUDE DEZVOLTAREA UNUI PROTOTIP LA SCARĂ MEDIE PENTRU A TESTA PERFORMANȚA SISTEMELOR PROIECTATE PE BAZA REZULTATELOR OBȚINUTE, CARE VA COMBINA CUNOȘTINȚELE OBȚINUTE ÎN CEEA CE PRIVEȘTE FACTORII ASOCIAȚI REZISTENȚEI LA DESHIDRATARE, ALEGEREA SUBSTRATULUI, PROIECTAREA REACTORULUI ȘI CONDIȚIILE DE CREȘTERE. (Romanian)
18 August 2022
0 references
OKOLJSKE BAKTERIJE SE LAHKO RAZVIJEJO V NAJRAZLIČNEJŠIH OKOLJIH, MED DRUGIM TUDI V MORJU IN SLADKI VODI. KLJUB TEMU IMA VELIKA VEČINA MIKROBNIH NIŠ RAZMEROMA OMEJENO OSKRBO Z VODO IN/ALI TRPI ZARADI POMANJKANJA NEPREMIČNE VODE. TLA, KI SO EDEN OD GLAVNIH ZBIRALNIKOV MIKROBNE RAZNOVRSTNOSTI IN EDEN GLAVNIH VIROV MIKROORGANIZMOV Z BIOTEHNOLOŠKO UPORABO, SO TIPIČEN PRIMER HETEROGENEGA TRDNEGA SUBSTRATA, OMEJENEGA Z VODO, KJER LAHKO USPEVA MIKROBNA BIOTSKA RAZNOVRSTNOST. V STRIKING CONTRAST s SITUATION IN NATURE, MICROBIALNE KULTURES, ki so se znašli v LAB s FIXED SUPPLY of WATER, KI JI JE ZAKLENITI V SOLIDMEDIA (AGAR PLATES), LET ALONE LIQUID BROTHS UPORABO ZA DECADES ZA KULTURING BACTERIAL IN FUNGAL STRAINS._x000D_ Da je podprojekt FOCUSES NA RAZVOJ IN PROOGRAVANJE NOVE KULTIVACIJSKE DEVICIJE, ki lahko VSE ZA IMPROVED ISOLACIJO kserofilnih MICROORGANISMS, KI JE VELIKO NA PODROČJU PODJETJA (SSF)-LIKE REACTORI. DOMNEVALI SMO, DA BI LAHKO ZARADI POMANJKANJA VODE V MNOGIH NARAVNIH OKOLJIH IN NEPRAVILNE PORAZDELITVE V PROSTORU IN ČASU VODE V OPTIMIZIRANIH MIKROBNIH KULTURAH UPORABILI OMEJENO VSEBNOST VODE. DA BI TO PREVERILI, SMO IZVEDLI NIZ PREDHODNIH POSKUSOV V TEKOČEM MEDIJU IN NA TRDNEM SUBSTRATU (KOMERCIALNA ČISTILNA KRPA, NAMOČENA Z R2A). Kot JE DESCRIBE V našem PROPOSALU, SEVERALNE ekstremne ISOLATES GREW V FACT BETTER V NAJBOLJŠI CLOTH V PRIPRAVLJENIH POGOJIH._x000D_ Podprojekt 1 JE STRUCTURED V TWO MAIN APPROACHES. PRVI JE RAZVOJ ORODJA ZA PREGLEDOVANJE V OBLIKI KULTNE TRDNE NAPRAVE Z NADZOROVANO RAZPOLOŽLJIVOSTJO VODE. TA NAPRAVA BO OMOGOČILA IZOLACIJO OKOLJSKIH SEVOV S HITROSTJO, KI JE VIŠJA OD SEDANJE KULTIVIRANJA NA OSNOVI PETRIJEVKE. TA NAPRAVA BO PRESKUŠENA IN NJEN PRIDELEK V PRIMERJAVI Z OBIČAJNIMI TEHNIKAMI GOJENJA V SMISLU ŠTEVILA IN RAZNOLIKOSTI VRHUNSKIH MIKROORGANIZMOV. PRIČAKUJEMO, DA BO TA NAPRAVA PRISPEVALA K REŠEVANJU DOBRO ZNANEGA PROBLEMA V MIKROBNI EKOLOGIJI, ANOMALIJA ŠTETJA PLOŠČ (DEJSTVO, DA SO BAKTERIJE, KI JIH JE MOGOČE DOSEČI, LE DEL VSEH BAKTERIJ). DRUGI PRISTOP SE NANAŠA NA INDUSTRIJSKO FERMENTACIJO. V TEM PODCILJU NAČRTUJEMO RAZVOJ IZBOLJŠANIH SSF SISTEMOV ZA MIKROBNO KULTURO, Z UPORABO NOVIH MATERIALOV Z OPREDELJENO POROZNOSTJO IN S TESTIRANJEM IZBRANIH SEVOV V ČISTI IN SOKULTURI. CILJ TEGA RAZVOJA JE STANDARDIZACIJA PROCESA Z OPREDELITVIJO VSEH BIOLOŠKIH IN FIZIKALNO-KEMIJSKIH PARAMETROV PROCESA, DA SE PRESEŽEJO TRENUTNE OMEJITVE V SMISLU DONOSA IN OBNOVLJIVOSTI. SEVI, UPORABLJENI V TEM PROJEKTU, BODO IZHAJALI IZ (I) NAŠE ZBIRKE XEROTOLERANTS, IZDANE IZ PREJŠNJEGA PROJEKTA HELIOS; (II) NOVO ZBIRKO, ZBRANO Z UPORABO POSEBNEGA PRIPOMOČKA ZA BIOPROSPEKCIRANJE, OPISANEGA V TEM PREDLOGU; (III) SEVI SO SE RAZVILI V LABORATORIJU S PLATFORMO EVOLVER, KI OMOGOČA UPORABO IZBIRNIH TLAKOV (SIMULACIJA IZSUŠEVANJA V NAŠEM PRIMERU) ZA MNOGE GENERACIJE. TRANSKRIPTOMSKA IN PROTEOMSKA ANALIZA SE BO UPORABLJALA ZA PREUČEVANJE DETERMINANT TRANSKRIPCIJE IN PREVAJANJA PRI PRILAGAJANJU SUŠENJA. TA PODPROJEKT BO VKLJUČEVAL TUDI RAZVOJ SREDNJEGA PROTOTIPA ZA PRESKUŠANJE UČINKOVITOSTI SISTEMOV, ZASNOVANIH NA PODLAGI DOBLJENIH REZULTATOV, KI BO ZDRUŽEVAL PRIDOBLJENO ZNANJE V SMISLU DEJAVNIKOV, POVEZANIH Z ODPORNOSTJO NA SUŠENJE, IZBIRO SUBSTRATA, ZASNOVO REAKTORJA IN POGOJE RASTI. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
BAKTERIE EKOLOGICZNE MOGĄ SIĘ ROZWIJAĆ W WIELU ŚRODOWISKACH, W TYM, ALE NIE WYŁĄCZNIE, MORSKICH I SŁODKOWODNYCH. NIEMNIEJ JEDNAK ZDECYDOWANA WIĘKSZOŚĆ NISZ MIKROBIOLOGICZNYCH MA STOSUNKOWO OGRANICZONE ZAOPATRZENIE W WODĘ I/LUB CIERPI Z POWODU STACJONARNEGO NIEDOBORU WODY. GLEBA, JEDEN Z GŁÓWNYCH ZBIORNIKÓW RÓŻNORODNOŚCI DROBNOUSTROJÓW, A TAKŻE JEDNO Z GŁÓWNYCH ŹRÓDEŁ MIKROORGANIZMÓW O ZASTOSOWANIACH BIOTECHNOLOGICZNYCH, JEST TYPOWYM PRZYKŁADEM NIEJEDNORODNEGO, OGRANICZONEGO WODĄ STAŁEGO PODŁOŻA, W KTÓRYM MOŻE KWITNĄĆ BIORÓŻNORODNOŚĆ DROBNOUSTROJÓW. W STRIKING CONTRAST in the SITUATION IN NATURE, MICROBIAL CULTURES SA CARRIED IN THE LAB Z FIXED SUPPLY OF WATER, AS it is the CASE in the SO-Called ¿SOLIDŻMEDIA (AGAR PLATES), PODKREŚLAJĄCE BROTY LIQUIDUIDUDOWANE w DECADES NA CULTURING BACTERIAL I FUNGAL STRAINS._x000D_ ten podprojekt FOCUSES ON THE DEVELOPMENT AND PROOF OF CONCEPT OF NEW CULTIVATION DEVICES THAT MAY ALLOW FOR IMPROVEDED ISOLATION of xerophilic MICROORGANISMS, AS WELL AS TO THE GROWTH IN SOLID STATE FERMENTATION (SSF)-LIKE REACTORS. ZAKŁADALIŚMY, ŻE BIORĄC POD UWAGĘ NIEDOBÓR WODY W WIELU ŚRODOWISKACH NATURALNYCH ORAZ NIEREGULARNY ROZKŁAD W PRZESTRZENI I CZASIE WODY, W ZOPTYMALIZOWANYCH KULTURACH DROBNOUSTROJÓW MOŻNA WYKORZYSTAĆ OGRANICZONĄ ZAWARTOŚĆ WODY. ABY TO SPRAWDZIĆ, WYKONALIŚMY ZESTAW WSTĘPNYCH EKSPERYMENTÓW W ŚRODOWISKU CIEKŁYM ORAZ NA STAŁYM PODŁOŻU (KOMERCYJNA ŚCIERECZKA CZYSZCZĄCA NASĄCZONA R2A). Zgodnie z naszym projektem, SEVERAL extremophilic ISOLATES GREW IN FACT BETTER IN SOAKED CLOTH COMPARED TO LIQUID CONDITIONS._x000D_ podprojekt 1 STRUCTURED W Dwóch głównych APPROACHACH. PIERWSZY POLEGA NA OPRACOWANIU NARZĘDZIA PRZESIEWOWEGO W KSZTAŁCIE KULTYWUJĄCEGO STAŁEGO URZĄDZENIA O KONTROLOWANEJ DOSTĘPNOŚCI WODY. URZĄDZENIE TO POZWOLI NA ODIZOLOWANIE SZCZEPÓW ŚRODOWISKOWYCH W WIĘKSZYM TEMPIE NIŻ OBECNA HODOWLA NA BAZIE NACZYŃ PETRIEGO. WYRÓB TEN ZOSTANIE PRZETESTOWANY I JEGO WYDAJNOŚĆ W PORÓWNANIU Z REGULARNYMI TECHNIKAMI KULTUROWYMI POD WZGLĘDEM LICZBY I RÓŻNORODNOŚCI MIKROORGANIZMÓW UPRAWNYCH. OCZEKUJEMY, ŻE URZĄDZENIE TO PRZYCZYNI SIĘ DO ROZWIĄZANIA ZNANEGO PROBLEMU W EKOLOGII MIKROBIOLOGICZNEJ, ANOMALII LICZBY ŻPLATE¿(FAKT, ŻE BAKTERIE UPRAWNE TO TYLKO UŁAMEK WSZYSTKICH BAKTERII). DRUGIE PODEJŚCIE ODNOSI SIĘ DO FERMENTACJI PRZEMYSŁOWEJ. W TYM PODCELU PLANUJEMY OPRACOWAĆ ULEPSZONE SYSTEMY SSF DLA HODOWLI DROBNOUSTROJÓW, WYKORZYSTUJĄC NOWE MATERIAŁY O OKREŚLONEJ POROWATOŚCI ORAZ BADAJĄC WYBRANE SZCZEPY W CZYSTEJ I WSPÓŁKULTURZE. ROZWÓJ TEN MA NA CELU STANDARYZACJĘ PROCESU POPRZEZ OKREŚLENIE WSZYSTKICH PARAMETRÓW BIOLOGICZNYCH I FIZYKOCHEMICZNYCH PROCESU W CELU PRZEZWYCIĘŻENIA OBECNYCH OGRANICZEŃ W ZAKRESIE WYDAJNOŚCI I ODTWARZALNOŚCI. SZCZEPY UŻYTE W TYM PROJEKCIE BĘDĄ POCHODZIĆ Z (I) NASZEJ KOLEKCJI XEROTOLERANTS WYDANEJ Z POPRZEDNIEGO PROJEKTU HELIOS; (II) NOWĄ KOLEKCJĘ ZEBRANĄ PRZY UŻYCIU SPECJALNEGO URZĄDZENIA DO POSZUKIWANIA BIOLOGICZNEGO OPISANEGO W NINIEJSZYM WNIOSKU; (III) SZCZEPY EWOLUOWAŁY W LABORATORIUM Z PLATFORMĄ EVOLVER, KTÓRA POZWALA NA STOSOWANIE PRZEZ WIELE POKOLEŃ NACISKÓW SELEKCYJNYCH (SYMULACJA OSUSZANIA W NASZYM PRZYPADKU). ANALIZA TRANSKRYPTOMICZNA I PROTEOMICZNA ZOSTANIE WYKORZYSTANA DO BADANIA TRANSKRYPCJI I PRZEKŁADU DETERMINANTÓW ADAPTACJI OSUSZANIA. PONADTO TEN PODPROJEKT BĘDZIE OBEJMOWAŁ OPRACOWANIE PROTOTYPU ŚREDNIEJ SKALI W CELU PRZETESTOWANIA WYDAJNOŚCI SYSTEMÓW ZAPROJEKTOWANYCH NA PODSTAWIE UZYSKANYCH WYNIKÓW, KTÓRY POŁĄCZY ZDOBYTĄ WIEDZĘ W ZAKRESIE CZYNNIKÓW ZWIĄZANYCH Z ODPORNOŚCIĄ NA WYSYCHANIE, WYBORU PODŁOŻA, KONSTRUKCJI REAKTORA I WARUNKÓW WZROSTU. (Polish)
18 August 2022
0 references
12 June 2023
0 references
Paterna
0 references
Identifiers
RTI2018-095584-B-C41
0 references