GENOMIC AND SEXUAL DETERMINATION STUDIES IN SOLE (SOLEA SENEGALENSIS) BY INTEGRATING MAPS (Q3143517)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3143517 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | GENOMIC AND SEXUAL DETERMINATION STUDIES IN SOLE (SOLEA SENEGALENSIS) BY INTEGRATING MAPS |
Project Q3143517 in Spain |
Statements
121,000.0 Euro
0 references
151,250.0 Euro
0 references
80.0 percent
0 references
1 January 2019
0 references
31 December 2021
0 references
UNIVERSIDAD DE CADIZ
0 references
36°29'40.92"N, 6°16'2.50"W
0 references
11012
0 references
EL LENGUADO ES UNA DE LAS ESPECIES MAS VALORADAS ECONOMICAMENTE EN LA ACUICULTURA PORQUE TRIPLICA EL PRECIO DE OTRAS ESPECIES COMERCIALES Y ES UN BUEN CANDIDATO PARA LA DIVERSIFICACION DE LOS MERCADOS EUROPEOS, SATURADOS A CAUSA DE LA SUPERPRODUCCION DE DORADA Y LUBINA Y SU CULTIVO SE HA EXTENDIDO A VARIAS COMUNIDADES AUTONOMAS. PERO, EN COMPARACION CON LO QUE OCURRE EN OTRAS ESPECIES DE PECES PLANOS, LOS ESTUDIOS GENOMICOS LLEVADOS A CABO EN EL LENGUADO TODAVIA SON ESCASOS. ESTA ESPECIE SE CARACTERIZA POR PRESENTAR UN CARIOTIPO CON 42 CROMOSOMAS, Y 48 BRAZOS CROMOSOMICOS, DISTRIBUIDOS EN 3 PAREJAS METACENTRICAS, 2 PAREJAS SUBMETACENTRICAS, 4 PAREJAS SUBTELOCENTRICAS Y 12 PARES CROMOSOMICOS ACROCENTRICOS. DURANTE EL DESARROLLO DE DOS PROYECTOS CONSECUTIVOS, PARA LOS QUE AHORA SE PIDE RENOVACION, EL GRUPO DE LA UCA HA VENIDO DESARROLLANDO UN MAPA FISICO PARA SOLEA SENEGALENSIS COMPUESTO POR UNOS 100 BACS, PREVIAMENTE SECUENCIADOS Y LOCALIZADOS EN LOS CROMOSOMAS MEDIANTE FISH MULTIPLE. SE TIENEN, EN ESTE MOMENTO MARCADORES CROMOSOMICOS PARA LAS 21 PAREJAS EXISTENTES EN EL GENOMA DEL LENGUADO. SE PROPONE EN EL PROYECTO INTEGRAR ESTE MAPA CON EL DE LIGAMIENTO CONSTRUIDO CON 127 MICROSATELITES. PARA ELLO SE AISLARIAN Y CARACTERIZARIAN LOS BACS QUE LOS CONTUVIERAN, CON LO QUE SE AUMENTARIA ADEMAS LA DENSIDAD DEL MAPA EXISTENTE. EN EL PROYECTO PREVIO PARA EL QUE SE SOLICITA RENOVACION SE HA DESCUBIERTO UNA POSIBLE PARAJE DE PROTO-CROMOSOMAS SEXUALES EN EL LENGUADO, QUE SERIA EL PAR 1. LA DETERMINACION GENETICA DEL SEXO ESTA A MENUDO ASOCIADA CON LA FORMACION DE CROMOSOMAS SEXUALES QUE LLEVAN EL MASTER GEN RESPONSABLE DE LA DETERMINACION DEL SEXO. EN EL LENGUADO LA DETERMINACION DEL SEXO ES XX/XY PERO NO EXISTEN CROMOSOMAS SEXUALES HETEROMORFICOS. POR ELLO, SE PROPONE LA MICRODISECCION DEL PAR 1 QUE ES FACILMENTE IDENTIFICABLE AL MICROSCOPIO POR SER LA PAREJA METACENTRICA DE MAYOR TAMAÑO Y SU SECUENCIACION EN MACHOS Y HEMBRAS PARA COMPARAR LAS SECUENCIAS Y A PARTIR DE LAS DIFERENCIAS, INFERIR LA PRESENCIA DE LA REGION Y/O GENES DETERMINANTES DEL SEXO. EN ACUICULTURA ES ESENCIAL CONOCER LOS MECANISMOS DE DETERMINACION DEL SEXO CONSIDERANDO ADEMAS QUE EXISTEN CARACTERES COMO EL CRECIMIENTO QUE PRESENTAN DIMORFISMO SEXUAL. ADEMAS, EL CONOCIMIENTO DE ESE MECANISMO PERMITE GESTIONAR DE MANERA ADECUADA LOS LOTES DE REPRODUCTORES. TAMBIEN SE PRETENDE EN EL PROYECTO UN ESTUDIO DE RNAS NO CODIFICANTES DE GONADAS DE MACHOS Y HEMBRAS MADUROS BUSCANDO NCRNAS (LNCRNAS Y MIRNAS) QUE REGULEN LA ACTIVIDAD DE GENES ESPECIFICOS IMPLICADOS EN PROCESOS DE DETERMINACION/DIFERENCIACION DEL SEXO Y REPRODUCCION. LA PROFUNDIZACION EN EL CONOCIMIENTO DE ESTE MECANISMO PERMITIRA ESTABLECER ESTUDIOS DE SINTENIA CON OTRAS ESPECIES DE PECES Y EXTRAPOLAR LOS RESULTADOS A ESPECIES DE INTERES EN ACUICULTURA. (Spanish)
0 references
THE SENEGALESE SOLE IS ONE OF THE SPECIES MOST VALUED ECONOMICALLY IN AQUACULTURE BECAUSE IT TRIPLES THE PRICE OF OTHER COMMERCIAL SPECIES AND IS A GOOD CANDIDATE FOR THE DIVERSIFICATION OF THE EUROPEAN MARKETS, SATURATED BY THE OVERPRODUCTION OF SEA BREAM AND SEA BASS AND ITS CULTIVATION HAS SPREAD TO SEVERAL AUTONOMOUS COMMUNITIES. BUT, COMPARED TO WHAT HAPPENS IN OTHER FLATFISH SPECIES, GENOMIC STUDIES ON SOLE ARE STILL SCARCE. THIS SPECIES IS CHARACTERIZED BY A KARYOTYPE WITH 42 CHROMOSOMES AND 48 CHROMOSOMAL ARMS DISTRIBUTED IN 3 METACENTRIC PAIRS, 2 SUBMETACENTRIC PAIRS, 4 SUBTELOCENTRIC PAIRS AND 12 ACROCENTRIC CHROMOSOMAL PAIRS. DURING THE DEVELOPMENT OF TWO CONSECUTIVE PROJECTS, FOR WHICH RENOVATION IS NOW BEING REQUESTED, THE UCA GROUP HAS BEEN DEVELOPING A PHYSICAL MAP FOR SOLEA SENEGALENSIS, COMPOSED BY AROUND 100 BACS, PREVIOUSLY SEQUENCED AND LOCATED IN THE SOLE CHROMOSOMES BY MULTIPLE FISH. WE NOW HAVE CHROMOSOMAL MARKERS FOR THE 21 PAIRS IN THE SOLE GENOME. IT IS PROPOSED IN THE PROJECT TO INTEGRATE THIS GENETIC MAP WITH THE LINKAGE MAP COMPOSED OF 127 MICROSATELLITES. TO ACHIEVE THIS GOAL THE BACS HARBORING THE 127 MICROSTELLITS WILLBE LOCATED AND ISLATED FORM TEH LIBRARY, RESSULTING IN AN INCREAE OF THE DENSITY OF THE MAP , IN ADDITION TO THE INTEGRATION. IN THE PREVIOUS PROJECT FOR WHICH RENEWAL IS APLIED, A POSSIBLE SEX PROTO-CHROMOSOME IN SOLE, WHICH WOULD BE PAIR 1, HAS BEEN DISCOVERED. GENETIC DETERMINATION OF SEX IS OFTEN ASSOCIATED WITH THE FORMATION OF SEX CHROMOSOMES THAT CARRY THE MASTER GENE RESPONSIBLE FOR SEX DETERMINATION. IN THE SOLE THE SEX DETERMINATION IS XX / XY BUT THERE ARE NO HETEROMORPHIC SEX CHROMOSOMES. THEREFORE, IT IS PROPOSED THE MICRODISSECTION OF PAIR 1 THAT IS EASILY IDENTIFIABLE UNDER THE MICROSCOPE BECAUSE IT IS THE LARGEST METACENTRIC PAIR AND ITS SEQUENCING IN MALES AND FEMALES TO COMPARE THE SEQUENCES AND FROM THE DIFFERENCES, INFERRING THE PRESENCE OF THE REGION AND / OR SEX DETERMINING GENES. IN AQUACULTURE IT IS ESSENTIAL TO KNOW THE MECHANISMS OF SEX DETERMINATION, CONSIDERING ALSO THAT THERE ARE CHARACTERISTICS SUCH AS GROWTH THAT PRESENT SEXUAL DIMORPHISM. IN ADDITION, KNOWLEDGE OF THIS MECHANISM ALLOWS ADEQUATE MANAGEMENT OF BREEDERS STOCKS. MOREOVER, AN STUDY OF NCRNAS ISOLATED (LNCRNAS AND MIRNAS) FROM MATURE MALE AND FEMALE GONADS LOOKING FOR MIRNAS THAT REGULATE THE ACTIVITY OF SPECIFIC GENES INVOLVED IN THE DETERMINATION / DIFFERENTIATION OF SEX AND REPRODUCTION IS PROPOSED. THE DEEPENING OF THE KNOWLEDGE OF THIS MECHANISM WILL ALLOW TO ESTABLISH STUDIES OF SYNTENIA WITH OTHER SPECIES OF AND TO EXTEND THE RESULTS TO SPECIES WITH IMPORTANCE IN AQUACULTURE. (English)
0 references
LA SOLE EST L’UNE DES ESPÈCES AQUACOLES LES PLUS ÉCONOMIQUEMENT VALORISÉES PARCE QU’ELLE TRIPLE LE PRIX D’AUTRES ESPÈCES COMMERCIALES ET QU’ELLE EST UN BON CANDIDAT À LA DIVERSIFICATION DES MARCHÉS EUROPÉENS, SATURÉE PAR LA SURPRODUCTION DE BAR DORÉ ET DE BAR ET SA CULTURE S’EST ÉTENDUE À PLUSIEURS COMMUNAUTÉS AUTONOMES. CEPENDANT, PAR RAPPORT À CE QUI SE PASSE CHEZ D’AUTRES ESPÈCES DE POISSONS PLATS, LES ÉTUDES GÉNOMIQUES SUR LA SOLE SONT ENCORE RARES. CETTE ESPÈCE EST CARACTÉRISÉE PAR UN CARYOTYPE À 42 CHROMOSOMES, ET 48 BRAS CHROMOSOMIQUES, RÉPARTIS EN 3 PAIRES MÉTACENTRIQUES, 2 PAIRES SUBMÉTACENTRIQUES, 4 PAIRES SUBTÉLOCENTRIQUES ET 12 PAIRES CHROMOSOMIQUES ACROCENTRIQUES. AU COURS DE L’ÉLABORATION DE DEUX PROJETS CONSÉCUTIFS, POUR LESQUELS LE RENOUVELLEMENT EST MAINTENANT DEMANDÉ, LE GROUPE UCA A ÉLABORÉ UNE CARTE PHYSIQUE POUR SOLEA SENEGALENSIS COMPOSÉE D’ENVIRON 100 BACS, PRÉALABLEMENT SÉQUENCÉES ET LOCALISÉES SUR LES CHROMOSOMES À L’AIDE DE POISSONS MULTIPLES. DES MARQUEURS CHROMOSOMIQUES SONT ACTUELLEMENT DISPONIBLES POUR LES 21 PAIRES DU GÉNOME UNIQUE. IL EST PROPOSÉ DANS LE PROJET D’INTÉGRER CETTE CARTE À LA CARTE DE LIAISON CONSTRUITE AVEC 127 MICROSATELITES. À CETTE FIN, LES BACS QUI LES CONTIENNENT SONT AISLARIENS ET CARACTÉRISÉS, CE QUI AUGMENTE LA DENSITÉ DE LA CARTE EXISTANTE. DANS LE PROJET PRÉCÉDENT POUR LEQUEL LE RENOUVELLEMENT EST DEMANDÉ, UN EMPLACEMENT POSSIBLE DE PROTOCHROMOSOMES SEXUELS EN UNIQUE A ÉTÉ DÉCOUVERT, CE QUI SERAIT LE PARAGRAPHE 1. LA DÉTERMINATION GÉNÉTIQUE DU SEXE EST SOUVENT ASSOCIÉE À LA FORMATION DE CHROMOSOMES SEXUELS PORTEURS DU GÈNE MAÎTRE RESPONSABLE DE LA DÉTERMINATION DU SEXE. DANS LA SEULE DÉTERMINATION DU SEXE EST XX/XY MAIS IL N’Y A PAS DE CHROMOSOMES SEXUELS HETEROMORFICUS. PAR CONSÉQUENT, IL EST PROPOSÉ LA MICRODISECTION DU PARAGRAPHE 1 QUI EST FACILEMENT IDENTIFIABLE AU MICROSCOPE PARCE QU’IL S’AGIT DE LA PLUS GRANDE PAIRE METACENTRICA ET DE SON SÉQUENÇAGE CHEZ LES MÂLES ET LES FEMELLES POUR COMPARER LES SÉQUENCES ET À PARTIR DES DIFFÉRENCES, EN DÉDUIRE LA PRÉSENCE DE LA RÉGION ET/OU DES DÉTERMINANTS GÉNÉTIQUES DU SEXE. EN AQUACULTURE, IL EST ESSENTIEL DE CONNAÎTRE LES MÉCANISMES PERMETTANT DE DÉTERMINER LE SEXE ÉTANT DONNÉ QU’IL EXISTE DES CARACTÈRES COMME LA CROISSANCE QUI PRÉSENTENT UN DIMORPHISME SEXUEL. EN OUTRE, LA CONNAISSANCE DE CE MÉCANISME PERMET DE GÉRER CORRECTEMENT LES LOTS DE JOUEURS. LE PROJET VISE ÉGALEMENT À ÉTUDIER LES ARN NON CODANTS DES GONADAS DE MÂLES MATURES ET DE FEMELLES À LA RECHERCHE DE NCRNAS (LNCRNAS ET MIRNAS) QUI RÉGULENT L’ACTIVITÉ DE GÈNES SPÉCIFIQUES IMPLIQUÉS DANS LES PROCESSUS DE DÉTERMINATION/DIFFÉRENCIATION DU SEXE ET DE LA REPRODUCTION. L’APPROFONDISSEMENT DE LA CONNAISSANCE DE CE MÉCANISME PERMETTRA D’ÉTABLIR DES ÉTUDES SYNTHENIA AVEC D’AUTRES ESPÈCES DE POISSONS ET D’EXTRAPOLER LES RÉSULTATS AUX ESPÈCES PRÉSENTANT UN INTÉRÊT POUR L’AQUACULTURE. (French)
2 December 2021
0 references
SEEZUNGE IST EINE DER WIRTSCHAFTLICH AM MEISTEN GESCHÄTZTEN ARTEN IN DER AQUAKULTUR, WEIL SIE DEN PREIS ANDERER KOMMERZIELLER ARTEN VERDREIFACHT UND EIN GUTER KANDIDAT FÜR DIE DIVERSIFIZIERUNG DER EUROPÄISCHEN MÄRKTE IST, GESÄTTIGT DURCH DIE ÜBERPRODUKTION VON VERGOLDETEN UND WOLFSBARSCH, UND IHR ANBAU HAT SICH AUF MEHRERE AUTONOME GEMEINSCHAFTEN AUSGEBREITET. ABER IM VERGLEICH ZU ANDEREN PLATTFISCHARTEN SIND GENOMISCHE UNTERSUCHUNGEN AN DER SEEZUNGE NACH WIE VOR KNAPP. DIESE ART ZEICHNET SICH DURCH EINEN KARYOTYP MIT 42 CHROMOSOMEN UND 48 CHROMOSOMENARMEN AUS, VERTEILT IN 3 METAZENTRISCHEN PAAREN, 2 SUBMETAZENTRISCHEN PAAREN, 4 SUBTELOZENTRISCHEN PAAREN UND 12 AKROZENTRISCHEN CHROMOSOMENPAAREN. WÄHREND DER ENTWICKLUNG VON ZWEI AUFEINANDERFOLGENDEN PROJEKTEN, FÜR DIE NUN EINE ERNEUERUNG BEANTRAGT WIRD, HAT DIE UCA-GRUPPE EINE PHYSIKALISCHE KARTE FÜR SOLEA SENEGALENSIS ENTWICKELT, DIE AUS ETWA 100 BACS BESTEHT, DIE ZUVOR AUF DEN CHROMOSOMEN MIT MEHREREN FISCHEN SEQUENZIERT WURDEN. CHROMOSOMISCHE MARKER SIND DERZEIT FÜR DIE 21 PAARE IM ALLEINIGEN GENOM ERHÄLTLICH. IM PROJEKT WIRD VORGESCHLAGEN, DIESE KARTE MIT DER MIT 127 MICROSATELITES GEBAUTEN VERKNÜPFUNGSKARTE ZU INTEGRIEREN. ZU DIESEM ZWECK SIND DIE SIE ENTHALTENDEN BACS AISLARIAN UND KARAKTERISIERT, WODURCH DIE DICHTE DER VORHANDENEN KARTE ERHÖHT WIRD. IM VORHERIGEN PROJEKT, FÜR DAS EINE ERNEUERUNG BEANTRAGT WIRD, WURDE EIN MÖGLICHER STANDORT SEXUELLER PROTOCHROMOSOMES IN SOLE ENTDECKT, WAS PAR 1 SEIN WÜRDE. DIE GENETISCHE BESTIMMUNG DES GESCHLECHTS IST OFT MIT DER BILDUNG VON SEXUELLEN CHROMOSOMEN VERBUNDEN, DIE DAS MASTERGEN TRAGEN, DAS FÜR DIE BESTIMMUNG DES GESCHLECHTS VERANTWORTLICH IST. ALLEIN DIE BESTIMMUNG DES GESCHLECHTS IST XX/XY, ABER ES GIBT KEINE SEXUELLEN CHROMOSOMEN HETEROMORFICUS. DAHER WIRD DIE MICRODISECTION VON PAR 1 VORGESCHLAGEN, DIE UNTER DEM MIKROSKOP LEICHT ZU ERKENNEN IST, DA ES DAS GRÖSSTE METACENTRICA-PAAR UND SEINE SEQUENZIERUNG BEI MÄNNCHEN UND WEIBCHEN IST, UM DIE SEQUENZEN UND DIE UNTERSCHIEDE ZU VERGLEICHEN, WAS DAS VORHANDENSEIN DER REGION UND/ODER DER GENDETERMINANTEN DES GESCHLECHTS ABLEITET. IN DER AQUAKULTUR IST ES WICHTIG, DIE MECHANISMEN ZUR BESTIMMUNG DES GESCHLECHTS ZU KENNEN, DA ES CHARAKTERE WIE WACHSTUM GIBT, DIE SEXUELLEN DIMORPHISMUS DARSTELLEN. DARÜBER HINAUS ERMÖGLICHT DAS WISSEN ÜBER DIESEN MECHANISMUS, DIE CHARGEN VON SPIELERN RICHTIG ZU VERWALTEN. DAS PROJEKT ZIELT AUCH DARAUF AB, NICHTKODIERENDE RNAS VON GONADEN VON REIFEN MÄNNCHEN UND WEIBCHEN AUF DER SUCHE NACH NCRNAS (LNCRNAS UND MIRNAS), DIE DIE AKTIVITÄT BESTIMMTER GENE REGULIEREN, DIE AN PROZESSEN DER BESTIMMUNG/DIFFERENZIERUNG VON GESCHLECHT UND REPRODUKTION BETEILIGT SIND, ZU UNTERSUCHEN. DIE VERTIEFUNG DES WISSENS ÜBER DIESEN MECHANISMUS WIRD ES ERMÖGLICHEN, SYNTHENIA-STUDIEN MIT ANDEREN FISCHARTEN ZU ERSTELLEN UND DIE ERGEBNISSE AUF ARTEN VON INTERESSE AN DER AQUAKULTUR ZU EXTRAPOLIEREN. (German)
9 December 2021
0 references
TONG IS EEN VAN DE ECONOMISCH MEEST GEWAARDEERDE SOORTEN IN DE AQUACULTUUR OMDAT ZIJ DE PRIJS VAN ANDERE COMMERCIËLE SOORTEN VERDRIEVOUDIGT EN EEN GOEDE KANDIDAAT IS VOOR DE DIVERSIFICATIE VAN DE EUROPESE MARKTEN, VERZADIGD DOOR DE OVERPRODUCTIE VAN VERGULDE EN ZEEBAARS EN DE TEELT ERVAN HEEFT ZICH VERSPREID OVER VERSCHILLENDE AUTONOME GEMEENSCHAPPEN. MAAR IN VERGELIJKING MET WAT ER BIJ ANDERE PLATVISSOORTEN GEBEURT, ZIJN GENOMISCHE STUDIES OP TONG NOG STEEDS SCHAARS. DEZE SOORT WORDT GEKENMERKT DOOR EEN KARYOTYPE MET 42 CHROMOSOMEN EN 48 CHROMOSOMISCHE ARMEN, VERDEELD IN 3 METACENTRISCHE PAREN, 2 SUBMETACENTRISCHE PAREN, 4 SUBTELOCENTRISCHE PAREN EN 12 ACROCENTRISCHE CHROMOSOMISCHE PAREN. TIJDENS DE ONTWIKKELING VAN TWEE OPEENVOLGENDE PROJECTEN, WAARVOOR NU VERNIEUWING WORDT AANGEVRAAGD, HEEFT DE UCA-GROEP EEN FYSIEKE KAART VOOR SOLEA SENEGALENSIS ONTWIKKELD DIE BESTAAT UIT ONGEVEER 100 BACS, EERDER GESEQUENCEERD EN GELEGEN OP DE CHROMOSOMEN MET BEHULP VAN MEERDERE VISSEN. CHROMOSOMISCHE MARKERS ZIJN MOMENTEEL BESCHIKBAAR VOOR DE 21 PAREN IN HET ENIGE GENOOM. IN HET PROJECT WORDT VOORGESTELD DEZE KAART TE INTEGREREN MET DE LINKAGEKAART GEBOUWD MET 127 MICROSATELITES. DAARTOE ZIJN DE BACS DIE ZE BEVATTEN AISLARIAN EN GECARACTERISEERD, WAARDOOR DE DICHTHEID VAN DE BESTAANDE KAART TOENEEMT. IN HET VORIGE PROJECT WAARVOOR VERNIEUWING WORDT AANGEVRAAGD, IS EEN MOGELIJKE LOCATIE VAN SEKSUELE PROTOCHROMOSOMES IN TONG ONTDEKT, DIE LID 1 ZOU ZIJN. DE GENETISCHE BEPALING VAN GESLACHT WORDT VAAK GEASSOCIEERD MET DE VORMING VAN SEKSUELE CHROMOSOMEN DIE HET HOOFDGEN DRAGEN DAT VERANTWOORDELIJK IS VOOR DE BEPALING VAN GESLACHT. ALLEEN DE BEPALING VAN SEKS IS XX/XY, MAAR ER ZIJN GEEN SEKSUELE CHROMOSOMEN HETEROMORFICUS. DAAROM WORDT DE MICRODISECTIE VAN LID 1 VOORGESTELD, DIE GEMAKKELIJK ONDER DE MICROSCOOP KAN WORDEN GEÏDENTIFICEERD OMDAT HET HET GROOTSTE METACENTRICA-PAAR EN ZIJN SEQUENCING IN MANNETJES EN VROUWTJES IS OM DE SEQUENTIES EN DE VERSCHILLEN TE VERGELIJKEN, DE AANWEZIGHEID VAN DE REGIO EN/OF GENEN DETERMINANTEN VAN GESLACHT AF TE LEIDEN. IN DE AQUACULTUUR IS HET VAN ESSENTIEEL BELANG OM DE MECHANISMEN TE KENNEN OM SEKS TE BEPALEN, GEZIEN HET FEIT DAT ER TEKENS ZOALS GROEI ZIJN DIE SEKSUEEL DIMORFISME VERTONEN. BOVENDIEN MAAKT DE KENNIS VAN DIT MECHANISME HET MOGELIJK OM DE PARTIJEN SPELERS GOED TE BEHEREN. HET PROJECT IS OOK GERICHT OP HET BESTUDEREN VAN NIET-CODERENDE RNA’S VAN GONADAS VAN VOLWASSEN MANNETJES EN VROUWTJES DIE OP ZOEK ZIJN NAAR NCRNAS (LNCRNAS EN MIRNAS) DIE DE ACTIVITEIT VAN SPECIFIEKE GENEN REGULEREN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ PROCESSEN VAN BEPALING/DIFFERENTIATIE VAN GESLACHT EN VOORTPLANTING. DE VERDIEPING VAN DE KENNIS VAN DIT MECHANISME ZAL HET MOGELIJK MAKEN SYNTHENIA-STUDIES MET ANDERE VISSOORTEN UIT TE VOEREN EN DE RESULTATEN TE EXTRAPOLEREN NAAR SOORTEN DIE VAN BELANG ZIJN VOOR DE AQUACULTUUR. (Dutch)
17 December 2021
0 references
LA SOGLIOLA È UNA DELLE SPECIE PIÙ APPREZZATE DAL PUNTO DI VISTA ECONOMICO IN QUANTO TRIPLICA IL PREZZO DI ALTRE SPECIE COMMERCIALI ED È UN BUON CANDIDATO ALLA DIVERSIFICAZIONE DEI MERCATI EUROPEI, SATURATA DALLA SOVRAPPRODUZIONE DI SPIGOLA DORATA E DI SPIGOLA E LA SUA COLTIVAZIONE SI È DIFFUSA IN DIVERSE COMUNITÀ AUTONOME. MA, RISPETTO A QUANTO ACCADE IN ALTRE SPECIE DI PESCI PIATTI, GLI STUDI GENOMICI SULLA SOGLIOLA SONO ANCORA SCARSI. QUESTA SPECIE È CARATTERIZZATA DA UN CARIOTIPO CON 42 CROMOSOMI, E 48 BRACCI CROMOSOMICI, DISTRIBUITI IN 3 COPPIE METACENTRICHE, 2 COPPIE SUBMETACENTRICHE, 4 COPPIE SUBTELOCENTRICHE E 12 COPPIE CROMOSOMICHE ACROCENTRICHE. DURANTE LO SVILUPPO DI DUE PROGETTI CONSECUTIVI, PER I QUALI È ORA RICHIESTO IL RINNOVO, IL GRUPPO UCA HA MESSO A PUNTO UNA MAPPA FISICA PER SOLEA SENEGALENSIS COMPOSTA DA CIRCA 100 BACS, PRECEDENTEMENTE SEQUENZIATI E LOCALIZZATI SUI CROMOSOMI UTILIZZANDO MOLTEPLICI PESCI. I MARCATORI CROMOSOMICI SONO ATTUALMENTE DISPONIBILI PER LE 21 COPPIE NEL GENOMA UNICO. NEL PROGETTO SI PROPONE DI INTEGRARE QUESTA MAPPA CON LA MAPPA DI COLLEGAMENTO COSTRUITA CON 127 MICROSATELITES. A TAL FINE, I BACS CHE LI CONTENGONO SONO AISLARIAN E CARACTERIZZATI, AUMENTANDO COSÌ LA DENSITÀ DELLA MAPPA ESISTENTE. NEL PROGETTO PRECEDENTE PER IL QUALE È RICHIESTO IL RINNOVO, È STATO SCOPERTO UN POSSIBILE LUOGO DI PROTOCHROMOSOMES SESSUALI NELLA SOGLIOLA, CHE SAREBBE AL PARAGRAFO 1. LA DETERMINAZIONE GENETICA DEL SESSO È SPESSO ASSOCIATA ALLA FORMAZIONE DI CROMOSOMI SESSUALI CHE PORTANO IL GENE MAESTRO RESPONSABILE DELLA DETERMINAZIONE DEL SESSO. NELLA SOLA LA DETERMINAZIONE DEL SESSO È XX/XY MA NON CI SONO CROMOSOMI SESSUALI HETEROMORFICUS. PERTANTO, SI PROPONE LA MICRODISECZIONE DI PAR 1 CHE È FACILMENTE IDENTIFICABILE AL MICROSCOPIO PERCHÉ È LA PIÙ GRANDE COPPIA METACENTRICA E IL SUO SEQUENZIAMENTO IN MASCHI E FEMMINE PER CONFRONTARE LE SEQUENZE E DALLE DIFFERENZE, DEDURRE LA PRESENZA DELLA REGIONE E/O GENI DETERMINANTI DEL SESSO. IN ACQUACOLTURA È ESSENZIALE CONOSCERE I MECCANISMI PER DETERMINARE IL SESSO CONSIDERANDO CHE CI SONO PERSONAGGI COME LA CRESCITA CHE PRESENTANO DIMORFISMO SESSUALE. INOLTRE, LA CONOSCENZA DI QUESTO MECCANISMO CONSENTE DI GESTIRE CORRETTAMENTE I LOTTI DI GIOCATORI. IL PROGETTO MIRA INOLTRE A STUDIARE RNA NON CODIFICANTI DI GONADA DI MASCHI E FEMMINE MATURI ALLA RICERCA DI NCRNAS (LNCRNAS E MIRNAS) CHE REGOLANO L'ATTIVITÀ DI SPECIFICI GENI COINVOLTI NEI PROCESSI DI DETERMINAZIONE/DIFFERENZIAZIONE DEL SESSO E DELLA RIPRODUZIONE. L'APPROFONDIMENTO DELLA CONOSCENZA DI QUESTO MECCANISMO CONSENTIRÀ DI STABILIRE STUDI SYNTHENIA CON ALTRE SPECIE ITTICHE ED ESTRAPOLARE I RISULTATI ALLE SPECIE DI INTERESSE PER L'ACQUACOLTURA. (Italian)
16 January 2022
0 references
Η ΓΛΏΣΣΑ ΤΗΣ ΣΕΝΕΓΆΛΗΣ ΕΊΝΑΙ ΈΝΑ ΑΠΌ ΤΑ ΕΊΔΗ ΠΟΥ ΕΚΤΙΜΏΝΤΑΙ ΟΙΚΟΝΟΜΙΚΆ ΠΕΡΙΣΣΌΤΕΡΟ ΣΤΗΝ ΥΔΑΤΟΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑ, ΔΙΌΤΙ ΤΡΙΠΛΑΣΙΆΖΕΙ ΤΗΝ ΤΙΜΉ ΤΩΝ ΆΛΛΩΝ ΕΜΠΟΡΙΚΏΝ ΕΙΔΏΝ ΚΑΙ ΑΠΟΤΕΛΕΊ ΚΑΛΉ ΥΠΟΨΉΦΙΑ ΓΙΑ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΊΗΣΗ ΤΩΝ ΕΥΡΩΠΑΪΚΏΝ ΑΓΟΡΏΝ, ΚΟΡΕΣΜΈΝΗ ΑΠΌ ΤΗΝ ΥΠΕΡΠΑΡΑΓΩΓΉ ΛΑΒΡΑΚΙΟΎ ΚΑΙ ΛΑΒΡΑΚΙΟΎ ΚΑΙ Η ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΆ ΤΟΥ ΈΧΕΙ ΕΞΑΠΛΩΘΕΊ ΣΕ ΑΡΚΕΤΈΣ ΑΥΤΌΝΟΜΕΣ ΚΟΙΝΌΤΗΤΕΣ. ΑΛΛΆ, ΣΕ ΣΎΓΚΡΙΣΗ ΜΕ Ό, ΤΙ ΣΥΜΒΑΊΝΕΙ ΣΕ ΆΛΛΑ ΕΊΔΗ ΠΛΑΤΎΨΑΡΩΝ, ΟΙ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΈΣ ΜΕΛΈΤΕΣ ΣΤΗ ΓΛΏΣΣΑ ΕΞΑΚΟΛΟΥΘΟΎΝ ΝΑ ΕΊΝΑΙ ΣΠΆΝΙΕΣ. ΤΟ ΕΊΔΟΣ ΑΥΤΌ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΖΕΤΑΙ ΑΠΌ ΚΑΡΥΌΤΥΠΟ ΜΕ 42 ΧΡΩΜΟΣΏΜΑΤΑ ΚΑΙ 48 ΧΡΩΜΟΣΩΜΙΚΟΎΣ ΒΡΑΧΊΟΝΕΣ ΚΑΤΑΝΕΜΗΜΈΝΟΥΣ ΣΕ 3 ΜΕΤΑΚΕΝΤΡΙΚΆ ΖΕΎΓΗ, 2 ΥΠΟΜΕΤΑΚΕΝΤΡΙΚΆ ΖΕΎΓΗ, 4 ΥΠΟΤΕΛΟΚΕΝΤΡΙΚΆ ΖΕΎΓΗ ΚΑΙ 12 ΑΚΡΟΚΕΝΤΡΙΚΆ ΧΡΩΜΟΣΩΜΙΚΆ ΖΕΎΓΗ. ΚΑΤΆ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΗΣ ΑΝΆΠΤΥΞΗΣ ΔΎΟ ΔΙΑΔΟΧΙΚΏΝ ΈΡΓΩΝ, ΓΙΑ ΤΑ ΟΠΟΊΑ ΖΗΤΕΊΤΑΙ ΤΏΡΑ ΑΝΑΚΑΊΝΙΣΗ, Η ΟΜΆΔΑ UCA ΑΝΈΠΤΥΞΕ ΈΝΑ ΦΥΣΙΚΌ ΧΆΡΤΗ ΓΙΑ ΤΗ SOLEA SENEGALENSIS, Ο ΟΠΟΊΟΣ ΑΠΟΤΕΛΕΊΤΑΙ ΑΠΌ ΠΕΡΊΠΟΥ 100 BACS, ΤΑ ΟΠΟΊΑ ΕΊΧΑΝ ΠΡΟΗΓΟΥΜΈΝΩΣ ΑΚΟΛΟΥΘΗΘΕΊ ΚΑΙ ΒΡΊΣΚΟΝΤΑΝ ΣΤΑ ΜΌΝΑ ΧΡΩΜΟΣΏΜΑΤΑ ΑΠΌ ΠΟΛΛΆ ΨΆΡΙΑ. ΤΏΡΑ ΈΧΟΥΜΕ ΧΡΩΜΟΣΩΜΙΚΟΎΣ ΔΕΊΚΤΕΣ ΓΙΑ ΤΑ 21 ΖΕΎΓΗ ΣΤΟ ΜΟΝΑΔΙΚΌ ΓΟΝΙΔΊΩΜΑ. ΣΤΟ ΈΡΓΟ ΠΡΟΤΕΊΝΕΤΑΙ Η ΕΝΣΩΜΆΤΩΣΗ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΓΕΝΕΤΙΚΟΎ ΧΆΡΤΗ ΣΤΟΝ ΧΆΡΤΗ ΣΎΝΔΕΣΗΣ ΠΟΥ ΑΠΟΤΕΛΕΊΤΑΙ ΑΠΌ 127 ΜΙΚΡΟΔΟΡΥΦΌΡΟΥΣ. ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΠΊΤΕΥΞΗ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΣΤΌΧΟΥ ΤΟ BACS ΠΟΥ ΦΙΛΟΞΕΝΕΊ ΤΑ 127 MICROSTELLITS ΘΑ ΒΡΊΣΚΕΤΑΙ ΚΑΙ ΘΑ ISLATED ΜΟΡΦΉ TEH ΒΙΒΛΙΟΘΉΚΗ, ΑΠΟΤΈΛΕΣΜΑ ΣΕ ΜΙΑ ΑΎΞΗΣΗ ΤΗΣ ΠΥΚΝΌΤΗΤΑΣ ΤΟΥ ΧΆΡΤΗ, ΕΚΤΌΣ ΑΠΌ ΤΗΝ ΟΛΟΚΛΉΡΩΣΗ. ΣΤΟ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΟ ΈΡΓΟ ΓΙΑ ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΕΦΑΡΜΌΖΕΤΑΙ ΑΝΑΝΈΩΣΗ, ΈΧΕΙ ΑΝΑΚΑΛΥΦΘΕΊ ΈΝΑ ΠΙΘΑΝΌ ΣΕΞΟΥΑΛΙΚΌ ΠΡΩΤΟ-ΧΡΩΜΌΣΩΜΑ ΜΌΝΟ, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΘΑ ΉΤΑΝ ΖΕΎΓΟΣ 1. Ο ΓΕΝΕΤΙΚΌΣ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌΣ ΤΟΥ ΦΎΛΟΥ ΣΥΧΝΆ ΣΥΝΔΈΕΤΑΙ ΜΕ ΤΟ ΣΧΗΜΑΤΙΣΜΌ ΧΡΩΜΟΣΩΜΆΤΩΝ ΦΎΛΟΥ ΠΟΥ ΦΈΡΟΥΝ ΤΟ ΚΎΡΙΟ ΓΟΝΊΔΙΟ ΥΠΕΎΘΥΝΟ ΓΙΑ ΤΟΝ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌ ΤΟΥ ΦΎΛΟΥ. ΜΌΝΟ Ο ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌΣ ΤΟΥ ΦΎΛΟΥ ΕΊΝΑΙ XX/XY, ΑΛΛΆ ΔΕΝ ΥΠΆΡΧΟΥΝ ΕΤΕΡΟΜΟΡΦΙΚΆ ΧΡΩΜΟΣΏΜΑΤΑ ΦΎΛΟΥ. ΩΣ ΕΚ ΤΟΎΤΟΥ, ΠΡΟΤΕΊΝΕΤΑΙ Η ΜΙΚΡΟΔΙΑΤΟΜΉ ΤΟΥ ΖΕΎΓΟΥΣ 1 ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΕΎΚΟΛΑ ΑΝΑΓΝΩΡΊΣΙΜΗ ΚΆΤΩ ΑΠΌ ΤΟ ΜΙΚΡΟΣΚΌΠΙΟ ΕΠΕΙΔΉ ΕΊΝΑΙ ΤΟ ΜΕΓΑΛΎΤΕΡΟ ΜΕΤΑΚΕΝΤΡΙΚΌ ΖΕΎΓΟΣ ΚΑΙ Η ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΑ ΤΟΥ ΣΕ ΑΡΣΕΝΙΚΆ ΚΑΙ ΘΗΛΥΚΆ ΓΙΑ ΤΗ ΣΎΓΚΡΙΣΗ ΤΩΝ ΑΛΛΗΛΟΥΧΙΏΝ ΚΑΙ ΤΩΝ ΔΙΑΦΟΡΏΝ, ΣΥΝΆΓΟΝΤΑΣ ΤΗΝ ΠΑΡΟΥΣΊΑ ΤΗΣ ΠΕΡΙΟΧΉΣ Ή/ΚΑΙ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΠΟΥ ΚΑΘΟΡΊΖΟΥΝ ΤΟ ΦΎΛΟ. ΣΤΗΝ ΥΔΑΤΟΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑ ΕΊΝΑΙ ΑΠΑΡΑΊΤΗΤΟ ΝΑ ΓΝΩΡΊΖΟΥΜΕ ΤΟΥΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎΣ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΟΎ ΤΟΥ ΦΎΛΟΥ, ΛΑΜΒΆΝΟΝΤΑΣ ΕΠΊΣΗΣ ΥΠΌΨΗ ΌΤΙ ΥΠΆΡΧΟΥΝ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΆ ΌΠΩΣ Η ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΠΟΥ ΠΑΡΟΥΣΙΆΖΟΥΝ ΣΕΞΟΥΑΛΙΚΌ ΔΙΜΟΡΦΙΣΜΌ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, Η ΓΝΏΣΗ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎ ΕΠΙΤΡΈΠΕΙ ΤΗΝ ΚΑΤΆΛΛΗΛΗ ΔΙΑΧΕΊΡΙΣΗ ΤΩΝ ΑΠΟΘΕΜΆΤΩΝ ΚΤΗΝΟΤΡΌΦΩΝ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΠΡΟΤΕΊΝΕΤΑΙ ΜΙΑ ΜΕΛΈΤΗ ΤΩΝ NCRNAS ΑΠΟΜΟΝΩΜΈΝΩΝ (LNCRNAS ΚΑΙ MIRNAS) ΑΠΌ ΏΡΙΜΕΣ ΑΡΣΕΝΙΚΈΣ ΚΑΙ ΘΗΛΥΚΈΣ ΓΟΝΆΔΕΣ ΠΟΥ ΑΝΑΖΗΤΟΎΝ MIRNAS ΠΟΥ ΡΥΘΜΊΖΟΥΝ ΤΗ ΔΡΑΣΤΗΡΙΌΤΗΤΑ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΠΟΥ ΕΜΠΛΈΚΟΝΤΑΙ ΣΤΟΝ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌ/ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΊΗΣΗ ΤΟΥ ΦΎΛΟΥ ΚΑΙ ΤΗΣ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΉΣ. Η ΕΜΒΆΘΥΝΣΗ ΤΩΝ ΓΝΏΣΕΩΝ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎ ΘΑ ΕΠΙΤΡΈΨΕΙ ΤΗΝ ΕΚΠΌΝΗΣΗ ΜΕΛΕΤΏΝ ΓΙΑ ΤΗ SYNTENIA ΜΕ ΆΛΛΑ ΕΊΔΗ ΚΑΙ ΤΗΝ ΕΠΈΚΤΑΣΗ ΤΩΝ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΆΤΩΝ ΣΕ ΕΊΔΗ ΠΟΥ ΈΧΟΥΝ ΣΗΜΑΣΊΑ ΓΙΑ ΤΗΝ ΥΔΑΤΟΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑ. (Greek)
17 August 2022
0 references
SENEGALESISK TUNGE ER EN AF DE ARTER, DER ER MEST VÆRDSAT ØKONOMISK INDEN FOR AKVAKULTUR, FORDI DEN TREDOBLER PRISEN PÅ ANDRE KOMMERCIELLE ARTER OG ER EN GOD KANDIDAT TIL DIVERSIFICERING AF DE EUROPÆISKE MARKEDER, MÆTTET AF OVERPRODUKTION AF HAVBRASEN OG HAVBARS, OG DYRKNINGEN HERAF HAR SPREDT SIG TIL FLERE AUTONOME FÆLLESSKABER. MEN SAMMENLIGNET MED HVAD DER SKER I ANDRE FLADFISKARTER, ER GENOMISKE UNDERSØGELSER AF TUNGE STADIG KNAPPE. DENNE ART ER KENDETEGNET VED EN KARYOTYPE MED 42 KROMOSOMER OG 48 KROMOSOMALE ARME FORDELT I 3 METACENTRISKE PAR, 2 SUBMETAKENTRISKE PAR, 4 SUBTELOCENTRISKE PAR OG 12 AKROCENTRISKE KROMOSOMPAR. UNDER UDVIKLINGEN AF TO PÅ HINANDEN FØLGENDE PROJEKTER, FOR HVILKE DER NU ANMODES OM RENOVERING, HAR UCA-GRUPPEN UDVIKLET ET FYSISK KORT FOR SOLEA SENEGALENSIS, DER BESTÅR AF CA. 100 BACS, DER TIDLIGERE ER SEKVENSERET OG PLACERET I TUNGEKROMOSOMERNE AF FLERE FISK. VI HAR NU KROMOSOMALE MARKØRER TIL DE 21 PAR I ENEGENOMET. DET FORESLÅS I PROJEKTET AT INTEGRERE DETTE GENETISKE KORT MED SAMMENKOBLINGSKORTET BESTÅENDE AF 127 MIKROSATELLITTER. FOR AT NÅ DETTE MÅL VIL BACS, DER HUSER 127 MICROSTELLITER, BLIVE PLACERET OG ISLATED FORM TEH BIBLIOTEK, HVILKET RESULTERER I EN STIGNING I TÆTHEDEN AF KORTET, UD OVER INTEGRATIONEN. I DET TIDLIGERE PROJEKT, HVOR FORNYELSEN ER FORSTÆRKET, ER DER FUNDET ET MULIGT SEXPROTO-KROMOSOM I SÅL, SOM VILLE VÆRE PAR 1, ER BLEVET OPDAGET. GENETISK BESTEMMELSE AF KØN ER OFTE FORBUNDET MED DANNELSEN AF KØNSKROMOSOMER, DER BÆRER DET MESTERGEN, DER ER ANSVARLIG FOR KØNSBESTEMMELSE. I SÅLEN ER KØNSBESTEMMELSEN XX/XY, MEN DER ER INGEN HETEROMORFE KØNSKROMOSOMER. DERFOR FORESLÅS MIKRODISSEKTIONEN AF PAR 1, SOM LET KAN IDENTIFICERES UNDER MIKROSKOPET, FORDI DET ER DET STØRSTE METACENTRISKE PAR OG DETS SEKVENTERING HOS HANNER OG HUNNER FOR AT SAMMENLIGNE SEKVENSERNE OG FORSKELLENE, HVORVED TILSTEDEVÆRELSEN AF REGIONEN OG/ELLER KØNSBESTEMMENDE GENER UDLEDES. INDEN FOR AKVAKULTUR ER DET VIGTIGT AT KENDE MEKANISMERNE FOR KØNSBESTEMMELSE, OGSÅ I BETRAGTNING AF AT DER ER KARAKTERISTIKA SOM VÆKST, DER PRÆSENTERER SEKSUEL DIMORFISME. DESUDEN GIVER KENDSKAB TIL DENNE MEKANISME MULIGHED FOR EN PASSENDE FORVALTNING AF OPDRÆTTERNES BESTANDE. DESUDEN FORESLÅS EN UNDERSØGELSE AF NCRNAS ISOLEREDE (LNCRNAS OG MIRNAS) FRA MODNE MANDLIGE OG KVINDELIGE KØNSKIRTLER PÅ UDKIG EFTER MIRNA'ER, DER REGULERER AKTIVITETEN AF SPECIFIKKE GENER, DER ER INVOLVERET I BESTEMMELSE/DIFFERENTIERING AF KØN OG REPRODUKTION. EN UDDYBNING AF KENDSKABET TIL DENNE MEKANISME VIL GØRE DET MULIGT AT ETABLERE UNDERSØGELSER AF SYNTENIA MED ANDRE ARTER AF OG UDVIDE RESULTATERNE TIL ARTER AF BETYDNING INDEN FOR AKVAKULTUR. (Danish)
17 August 2022
0 references
SENEGALILAINEN KIELIKAMPELA ON YKSI VESIVILJELYSSÄ TALOUDELLISESTI ARVOSTETUIMMISTA LAJEISTA, KOSKA SE KOLMINKERTAISTAA MUIDEN KAUPALLISTEN LAJIEN HINNAN JA ON HYVÄ EHDOKAS EUROOPAN MARKKINOIDEN MONIPUOLISTAMISEEN, JOTA KYLLÄSTÄÄ MERIAHVENEN JA MERIBASSIN YLITUOTANTO, JA SEN VILJELY ON LEVINNYT USEISIIN AUTONOMISIIN YHTEISÖIHIN. MUTTA VERRATTUNA SIIHEN, MITÄ TAPAHTUU MUILLA KAMPELAKALALAJEILLA, GENOMITUTKIMUKSET KIELIKAMPELASTA OVAT EDELLEEN NIUKAT. TÄLLE LAJILLE ON OMINAISTA KARYOTYYPPI, JOSSA ON 42 KROMOSOMIA JA 48 KROMOSOMIHAARAA, JOTKA JAKAUTUVAT KOLMEEN METASENTRISEEN PARIIN, KAHTEEN SUBMETASENTRISEEN PARIIN, 4 SUBTELOSENTRISEEN PARIIN JA 12 AKROSENTRISEEN KROMOSOMIPARIIN. KEHITETTÄESSÄ KAHTA PERÄKKÄISTÄ HANKETTA, JOIDEN KUNNOSTAMISTA NYT PYYDETÄÄN, UCA-RYHMÄ ON KEHITTÄNYT SOLEA SENEGALENSIS -KARTAN, JOKA KOOSTUU NOIN 100 BACS:STÄ JA JOKA ON AIEMMIN SEKVENSOITU JA JOKA SIJAITSEE MERIANTURAKROMOSOMEISSA USEIDEN KALOJEN AVULLA. MEILLÄ ON NYT KROMOSOMIMARKKEREITA 21 PARILLE AINOASSA GENOMISSA. HANKKEESSA EHDOTETAAN TÄMÄN GENEETTISEN KARTAN YHDISTÄMISTÄ 127 MIKROSATELLIITIN MUODOSTAMAAN KARTTAAN. TÄMÄN TAVOITTEEN SAAVUTTAMISEKSI BACS VARTIOI 127 MICROSTELLITS SIJOITETAAN JA ISLATED MUOTO TEH KIRJASTO, RESSULTING INCREAE OF THE DENSITY OF THE MAP, LISÄKSI INTEGROINTI. EDELLISESSÄ HANKKEESSA, JOSSA UUSIMINEN ON APLIED, MAHDOLLINEN SUKUPUOLI PROTO-KROMOSOMI YKSIN, JOKA OLISI PARI 1, ON LÖYDETTY. SUKUPUOLEN GENEETTINEN MÄÄRITYS LIITTYY USEIN SUKUPUOLIKROMOSOMIEN MUODOSTUMISEEN, JOTKA KANTAVAT SUKUPUOLEN MÄÄRITTÄMISESTÄ VASTUUSSA OLEVAN PÄÄGEENIN. PELKÄSTÄÄN SUKUPUOLEN MÄÄRITYS ON XX/XY, MUTTA HETEROMORFISIA SUKUPUOLIKROMOSOMEJA EI OLE. SIKSI EHDOTETAAN PARIN 1 MIKRODISSEKTIOTA, JOKA ON HELPOSTI TUNNISTETTAVISSA MIKROSKOOPILLA, KOSKA SE ON SUURIN METASENTRINEN PARI JA SEN SEKVENSOINTI MIEHILLÄ JA NAISILLA VERRATA SEKVENSSEJÄ JA EROJA, PÄÄTELLEN ALUEEN JA/TAI SUKUPUOLEN MÄÄRITTÄVÄT GEENIT. VESIVILJELYSSÄ ON OLENNAISEN TÄRKEÄÄ TUNTEA SUKUPUOLEN MÄÄRITTÄMISEN MEKANISMIT, KUN OTETAAN HUOMIOON MYÖS SE, ETTÄ ON OLEMASSA SELLAISIA PIIRTEITÄ KUIN KASVU, JOKA AIHEUTTAA SEKSUAALISTA DIMORFISMIA. LISÄKSI TÄMÄN MEKANISMIN TUNTEMUS MAHDOLLISTAA JALOSTAJIEN KANTOJEN ASIANMUKAISEN HALLINNOINNIN. LISÄKSI EHDOTETAAN TUTKIMUSTA, JOSSA TUTKITAAN KYPSISTÄ UROS- JA NAARASPUOLISISTA SUKURAUHASISTA ERISTETTYJÄ NCRNA:ITA (LNCRNA:ITA JA MIRNA:ITA), JOTKA SÄÄTELEVÄT SUKUPUOLEN JA LISÄÄNTYMISEN MÄÄRITTÄMISEEN/ERIYTYKSEEN LIITTYVIEN TIETTYJEN GEENIEN AKTIIVISUUTTA. TÄTÄ MEKANISMIA KOSKEVAN TIETÄMYKSEN SYVENTÄMINEN MAHDOLLISTAA SYNTENIA-TUTKIMUSTEN TEKEMISEN MUIDEN LAJIEN KANSSA JA TULOSTEN ULOTTAMISEN VESIVILJELYSSÄ TÄRKEISIIN LAJEIHIN. (Finnish)
17 August 2022
0 references
IL-LINGWATA TAS-SENEGAL HIJA WAĦDA MILL-ISPEĊIJIET L-AKTAR EKONOMIKAMENT APPREZZATI FL-AKKWAKULTURA MINĦABBA LI TITTRIPLIKA L-PREZZ TA’ SPEĊIJIET KUMMERĊJALI OĦRA U HIJA KANDIDAT TAJJEB GĦAD-DIVERSIFIKAZZJONI TAS-SWIEQ EWROPEJ, SATURATA MILL-PRODUZZJONI ŻEJDA TAL-AWRAT U L-ISPNOTT U L-KULTIVAZZJONI TAGĦHA NFIRXET GĦAL DIVERSI KOMUNITAJIET AWTONOMI. IŻDA, META MQABBEL MA’ DAK LI JIĠRI FI SPEĊIJIET OĦRA TA’ PIXXIĊATT, L-ISTUDJI ĠENOMIĊI FUQ IL-LINGWATA GĦADHOM SKARSI. DIN L-ISPEĊI HIJA KKARATTERIZZATA MINN KARJOTIP BI 42 KROMOŻOMI U 48 DRIEGĦ KROMOŻOMALI DISTRIBWITI FI 3 PARI METAĊENTRIĊI, 2 PARI SUBMETAĊENTRIĊI, 4 PARI SUBTELOĊENTRIĊI U 12-IL PAR KROMOSOMALI AKROĊENTRIĊI. MATUL L-IŻVILUPP TA’ ŻEWĠ PROĠETTI KONSEKUTTIVI, LI GĦALIHOM ISSA QED TINTALAB RINNOVAZZJONI, IL-GRUPP UCA KIEN QED JIŻVILUPPA MAPPA FIŻIKA GĦAL SOLEA SENEGALENSIS, MAGĦMULA MINN MADWAR 100 BACS, LI QABEL KIENU SEKWENZJATI U LI JINSABU FIL-KROMOŻOMI UNIĊI MINN ĦUT MULTIPLU. ISSA GĦANDNA MARKATURI KROMOSOMALI GĦALL-21 PAR FIL-ĠENOMA UNIKA. FIL-PROĠETT QED JIĠI PROPOST LI DIN IL-MAPPA ĠENETIKA TIĠI INTEGRATA MAL-MAPPA TAR-RABTA MAGĦMULA MINN 127 MIKROSATELLITA. BIEX JINTLAĦAQ DAN L-GĦAN IL-BACS PORTORING L 127 MICROSTELLITS WILLBE JINSABU U ISLATED FORMA TEH LIBRERIJA, JIRRIŻULTAW FI INCREAE TAD-DENSITÀ TAL-MAPPA, MINBARRA L-INTEGRAZZJONI. FIL-PROĠETT PREĊEDENTI LI GĦALIH IT-TIĠDID HUWA APPLIKAT, ĠIE SKOPERT PROTOKROMOŻOMA SESSWALI POSSIBBLI FIL-LINGWATA, LI TKUN PAR 1. ID-DETERMINAZZJONI ĠENETIKA TAS-SESS TA’ SPISS HIJA ASSOĊJATA MAL-FORMAZZJONI TA’ KROMOŻOMI TAS-SESS LI JĠORRU L-ĠENE PRINĊIPALI RESPONSABBLI GĦAD-DETERMINAZZJONI TAS-SESS. FIL-LINGWATA, ID-DETERMINAZZJONI TAS-SESS HIJA XX/XY IŻDA MA HEMM L-EBDA KROMOŻOMI SESSWALI ETEROMORFIĊI. GĦALHEKK, HUWA PROPOST IL-MIKRODISSEZZJONI TAL-PAR 1 LI HIJA FAĊILMENT IDENTIFIKABBLI TAĦT IL-MIKROSKOPJU MINĦABBA LI HUWA L-AKBAR PAR METAĊENTRIKU U S-SEKWENZA TIEGĦU FL-IRĠIEL U N-NISA BIEX JITQABBLU S-SEKWENZI U MID-DIFFERENZI, U B’HEKK TIĠI DEDOTTA L-PREŻENZA TAR-REĠJUN U/JEW IL-ĠENI LI JIDDETERMINAW IS-SESS. FL-AKKWAKULTURA HUWA ESSENZJALI LI WIEĦED IKUN JAF IL-MEKKANIŻMI TA’ DETERMINAZZJONI TAS-SESS, META WIEĦED IQIS UKOLL LI HEMM KARATTERISTIĊI BĦAT-TKABBIR LI JIPPREŻENTAW ID-DIMORFIŻMU SESSWALI. BARRA MINN HEKK, L-GĦARFIEN TA’ DAN IL-MEKKANIŻMU JIPPERMETTI ĠESTJONI ADEGWATA TAL-ISTOKKIJIET TA’ DAWK LI JRABBU. BARRA MINN HEKK, QED JIĠI PROPOST STUDJU TA’ NCRNAS IŻOLATI (LNCRNAS U MIRNAS) MINN GONADI MASKILI U FEMMINILI MATURI LI QED IFITTXU L-MIRNAS LI JIRREGOLAW L-ATTIVITÀ TA’ ĠENI SPEĊIFIĊI INVOLUTI FID-DETERMINAZZJONI/DIFFERENZJAZZJONI TAS-SESS U R-RIPRODUZZJONI. L-APPROFONDIMENT TAL-GĦARFIEN TA’ DAN IL-MEKKANIŻMU SE JIPPERMETTI LI JIĠU STABBILITI STUDJI TAS-SYNTENIA MA’ SPEĊIJIET OĦRA TA’ U LI R-RIŻULTATI JIĠU ESTIŻI GĦAL SPEĊIJIET B’IMPORTANZA FL-AKKWAKULTURA. (Maltese)
17 August 2022
0 references
SENEGĀLAS JŪRASMĒLE IR VIENA NO SUGĀM, KO VISEKONOMISKĀK VĒRTĒ AKVAKULTŪRĀ, JO TĀ TRĪSKĀRŠO CITU KOMERCIĀLO SUGU CENU UN IR LABA IESPĒJA EIROPAS TIRGU DAŽĀDOŠANAI, KAS PIESĀTINĀTA AR JŪRASKARŪSU UN JŪRASASARU PĀRPRODUKCIJU, UN TĀS AUDZĒŠANA IR IZPLATĪJUSIES VAIRĀKĀS AUTONOMAJĀS KOPIENĀS. BET, SALĪDZINOT AR TO, KAS NOTIEK AR CITĀM PLEKSTVEIDĪGO ZIVJU SUGĀM, GENOMA PĒTĪJUMI PAR ZOLI JOPROJĀM IR IEROBEŽOTI. ŠAI SUGAI RAKSTURĪGS KARIOTIPS AR 42 HROMOSOMĀM UN 48 HROMOSOMU GRUPĀM, KAS IZPLATĪTAS 3 METACENTRISKOS PĀROS, 2 SUBMETACENTRISKOS PĀROS, 4 SUBTELOCENTRISKOS PĀROS UN 12 AKROCENTRISKOS HROMOSOMU PĀROS. IZSTRĀDĀJOT DIVUS SECĪGUS PROJEKTUS, KURU RENOVĀCIJA TAGAD TIEK PIEPRASĪTA, UCA GRUPA IR IZSTRĀDĀJUSI SOLEA SENEGALENSIS FIZISKO KARTI, KO VEIDO APTUVENI 100 BACS, KAS IEPRIEKŠ TIKA SEKVENCĒTA UN ATRODAS VIENĪGAJĀS HROMOSOMĀS AR VAIRĀKĀM ZIVĪM. TAGAD MUMS IR HROMOSOMU MARĶIERI 21 PĀRIEM VIENĪGAJĀ GENOMĀ. PROJEKTĀ IR IEROSINĀTS ŠO ĢENĒTISKO KARTI INTEGRĒT SASAISTES KARTĒ, KAS SASTĀV NO 127 MIKROSATELĪTIEM. LAI SASNIEGTU ŠO MĒRĶI, BACS IZVIETOS 127 MICROSTELLITS UN ISLATED VEIDO TEH BIBLIOTĒKU, KĀ REZULTĀTĀ PALIELINĀS KARTES BLĪVUMS PAPILDUS INTEGRĀCIJAI. IEPRIEKŠĒJĀ PROJEKTĀ, KURA ATJAUNOŠANA TIEK ATBALSTĪTA, TIKA ATKLĀTA IESPĒJAMĀ DZIMUMA PROTOHROMOSOMA, KAS BŪTU 1. PĀRIS. ĢENĒTISKĀ DZIMUMA NOTEIKŠANA BIEŽI VIEN IR SAISTĪTA AR DZIMUMA HROMOSOMU VEIDOŠANOS, KAS VEIC GALVENO GĒNU, KAS ATBILD PAR DZIMUMA NOTEIKŠANU. VIENĪGĀ DZIMUMA NOTEIKŠANA IR XX/XY, BET NAV HETEROMORFU DZIMUMA HROMOSOMU. TĀPĒC TIEK IEROSINĀTS MIKRODISZEKCIJA 1. PĀRIM, KAS IR VIEGLI IDENTIFICĒJAMS ZEM MIKROSKOPA, JO TAS IR LIELĀKAIS METACENTRISKAIS PĀRIS UN TĀ SEKVENCĒŠANA TĒVIŅIEM UN MĀTĪTĒM, LAI SALĪDZINĀTU SEKVENCES UN NO ATŠĶIRĪBĀM, KAS LIECINA PAR REĢIONA UN/VAI DZIMUMA NOTEICOŠO GĒNU KLĀTBŪTNI. AKVAKULTŪRĀ IR SVARĪGI ZINĀT DZIMUMA NOTEIKŠANAS MEHĀNISMUS, ŅEMOT VĒRĀ ARĪ TO, KA PASTĀV TĀDAS ĪPAŠĪBAS KĀ AUGŠANA, KAS RADA SEKSUĀLO DIMORFISMU. TURKLĀT ZINĀŠANAS PAR ŠO MEHĀNISMU ĻAUJ PIENĀCĪGI PĀRVALDĪT SELEKCIONĀRU KRĀJUMUS. TURKLĀT TIEK IEROSINĀTS PĒTĪJUMS PAR IZOLĒTĀM NCRNS (LNCRNS UN MIRNS) NO NOBRIEDUŠIEM VĪRIEŠU UN SIEVIEŠU DZIMUMDZIEDZERIEM, KUROS MEKLĒ MIRNS, KAS REGULĒ SPECIFISKU GĒNU AKTIVITĀTI, KURI IESAISTĪTI DZIMUMA UN REPRODUKCIJAS NOTEIKŠANĀ/DIFERENCĒŠANĀ. ZINĀŠANU PAR ŠO MEHĀNISMU PADZIĻINĀŠANA ĻAUS VEIKT PĒTĪJUMUS PAR SYNTENIA AR CITĀM SUGĀM UN ATTIECINĀT REZULTĀTUS ARĪ UZ SUGĀM, KAS IR NOZĪMĪGAS AKVAKULTŪRĀ. (Latvian)
17 August 2022
0 references
SENEGALSKÁ SOLEA JE JEDNÝM Z DRUHOV, KTORÉ SÚ EKONOMICKY NAJCENNEJŠIE V AKVAKULTÚRE, PRETOŽE STROJNÁSOBUJE CENY INÝCH KOMERČNÝCH DRUHOV A JE DOBRÝM KANDIDÁTOM NA DIVERZIFIKÁCIU EURÓPSKYCH TRHOV, KTORÝ JE NASÝTENÝ NADPRODUKCIOU PRASIAT A MORONY STRIEBRISTEJ A JEJ PESTOVANIE SA ROZŠÍRILO DO NIEKOĽKÝCH AUTONÓMNYCH SPOLOČENSTIEV. ALE V POROVNANÍ S TÝM, ČO SA DEJE U INÝCH DRUHOV PLATESOTVARÝCH RÝB, GENÓMOVÉ ŠTÚDIE NA SOLEU SÚ STÁLE ZRIEDKAVÉ. TENTO DRUH SA VYZNAČUJE KARYOTYPOM SO 42 CHROMOZÓMAMI A 48 CHROMOZÓMOVÝMI RAMENAMI DISTRIBUOVANÝMI V 3 METACENTRICKÝCH PÁROCH, 2 SUBMETACENTRICKÝCH PÁROCH, 4 SUBTELOCENTRICKÝCH PÁROCH A 12 AKROCENTRICKÝCH CHROMOZÓMOVÝCH PÁROCH. POČAS VÝVOJA DVOCH PO SEBE NASLEDUJÚCICH PROJEKTOV, PRE KTORÉ SA V SÚČASNOSTI POŽADUJE RENOVÁCIA, SKUPINA UCA VYVÍJA FYZICKÚ MAPU PRE SOLEA SENEGALENSIS, KTORÚ TVORÍ PRIBLIŽNE 100 SYSTÉMOV BACS, KTORÉ BOLI PREDTÝM ZOSKUPENÉ A UMIESTNENÉ V JEDINÝCH CHROMOZÓMOCH VIACERÝMI RYBAMI. TERAZ MÁME CHROMOZÓMOVÉ MARKERY PRE 21 PÁROV V JEDINOM GENÓME. V PROJEKTE SA NAVRHUJE INTEGROVAŤ TÚTO GENETICKÚ MAPU DO MAPY PREPOJENIA POZOSTÁVAJÚCEJ ZO 127 MIKROSATELITOV. NA DOSIAHNUTIE TOHTO CIEĽA BUDE BACS PRECHOVÁVAŤ 127 MICROSTELLITS SA NACHÁDZA A ISLATED FORMULÁR TEH KNIŽNICA, RESULTING V NÁRAST HUSTOTY MAPY, OKREM INTEGRÁCIE. V PREDCHÁDZAJÚCOM PROJEKTE, PRE KTORÝ SA OBNOVUJE, BOL OBJAVENÝ MOŽNÝ SEXUÁLNY PROTOCHROMOZÓM U SOLEY, KTORÝ BY BOL PÁR 1. GENETICKÉ URČENIE POHLAVIA JE ČASTO SPOJENÉ S TVORBOU POHLAVNÝCH CHROMOZÓMOV, KTORÉ NESÚ HLAVNÝ GÉN ZODPOVEDNÝ ZA URČENIE POHLAVIA. STANOVENIE POHLAVIA JE XX/XY, ALE NEEXISTUJÚ ŽIADNE HETEROMORFNÉ POHLAVNÉ CHROMOZÓMY. PRETO SA NAVRHUJE MIKRODISEKCIA PÁRU 1, KTORÁ JE ĽAHKO IDENTIFIKOVATEĽNÁ POD MIKROSKOPOM, PRETOŽE JE TO NAJVÄČŠÍ METACENTRICKÝ PÁR A JEHO SEKVENOVANIE U SAMCOV A SAMÍC NA POROVNANIE SEKVENCIÍ A ROZDIELOV, ČÍM SA ODVODZUJE PRÍTOMNOSŤ REGIÓNU A/ALEBO GÉNOV URČUJÚCICH POHLAVIE. V AKVAKULTÚRE JE NEVYHNUTNÉ POZNAŤ MECHANIZMY URČOVANIA POHLAVIA, BERÚC DO ÚVAHY AJ TO, ŽE EXISTUJÚ CHARAKTERISTIKY, AKO JE RAST, KTORÝ PREDSTAVUJE SEXUÁLNY DIMORFIZMUS. OKREM TOHO ZNALOSŤ TOHTO MECHANIZMU UMOŽŇUJE PRIMERANÉ HOSPODÁRENIE SO ZÁSOBAMI CHOVATEĽOV. OKREM TOHO SA NAVRHUJE ŠTÚDIA IZOLOVANÝCH NCRNA (LNCRNA A MIRNA) OD DOSPELÝCH SAMCOV A SAMÍC GONÁD HĽADAJÚCICH MIRNA, KTORÉ REGULUJÚ AKTIVITU ŠPECIFICKÝCH GÉNOV PODIEĽAJÚCICH SA NA URČOVANÍ/DIFERENCIÁCII POHLAVIA A REPRODUKCIE. PREHĹBENIE POZNATKOV O TOMTO MECHANIZME UMOŽNÍ VYPRACOVAŤ ŠTÚDIE SYNTENIA S INÝMI DRUHMI A ROZŠÍRIŤ VÝSLEDKY AJ NA DRUHY S VÝZNAMOM V AKVAKULTÚRE. (Slovak)
17 August 2022
0 references
IS É AN T-AON SENEGALESE AR CHEANN DE NA SPEICIS IS MÓ A LUACHÁIL GO HEACNAMAÍOCH I NDOBHARSHAOTHRÚ TOISC GO TRIPLES SÉ AN PRAGHAS AR SPEICIS TRÁCHTÁLA EILE AGUS IS IARRTHÓIR MAITH DO ÉAGSÚLÚ NA MARGAÍ EORPACHA, SÁITHITHE AG AN OVERPRODUCTION DE BREAM MARA AGUS BASS FARRAIGE AGUS TÁ A SAOTHRÚ LEATHADH GO DTÍ ROINNT POBAIL UATHRIALACHA. ACH, I GCOMPARÁID LEIS AN MÉID A THARLAÍONN I SPEICIS LEATHÓGACHA EILE, TÁ STAIDÉIR GHÉANÓMAÍOCHA AR AN SÓL FÓS GANN. TÁ AN SPEICEAS TRÉITHRITHE AG KARYOTYPE LE 42 CRÓMASÓIM AGUS 48 ARM CHROMOSOMAL DHÁILEADH I 3 PÉIRÍ MEITEALÁRNACHA, 2 PÉIRÍ SUBMETACENTRIC, 4 PÉIRÍ SUBTELOCENTRIC AGUS 12 PÉIRÍ CHROMOSOMAL ACROCENTRIC. LE LINN DHÁ THIONSCADAL AS A CHÉILE A FHORBAIRT, A BHFUIL ATHCHÓIRIÚ Á IARRAIDH INA LEITH ANOIS, TÁ LÉARSCÁIL FHISICIÚIL Á FHORBAIRT AG GRÚPA UCA DO SOLEA SENEGALENSIS, COMHDHÉANTA DE THART AR 100 BACS, A BHÍ SEICHEAMHAITHE ROIMHE SEO AGUS ATÁ SUITE SA CHRÓMASÓIM AONAIR AG IASC IOLRACH. NÍ MÓR DÚINN ANOIS MARCÓIRÍ CHROMOSOMAL DO NA PÉIRÍ 21 SA GENOME AMHÁIN. TÁ SÉ BEARTAITHE SA TIONSCADAL AN LÉARSCÁIL GHÉINITEACH SEO A CHOMHTHÁTHÚ LEIS AN LÉARSCÁIL NAISC COMHDHÉANTA DE 127 MICREASATAILÍT. CHUN AN SPRIOC SEO A BHAINT AMACH AN BACS CUAN AN 127 MICROSTELLITS WILLBE SUITE AGUS FOIRM ISLATED LEABHARLANN TEH, RESSULTING I INCREAE AN DLÚS AN LÉARSCÁIL, CHOMH MAITH LEIS AN COMHTHÁTHÚ. SA TIONSCADAL ROIMHE SEO A BHFUIL APLIED ATHNUACHAN, TÁ GNÉAS PROTO-CHROMOSOME FÉIDEARTHA I AMHÁIN, A BHEADH PÉIRE 1, FUAIR SÉ AMACH. IS MINIC A BHAINEANN CINNEADH GÉINITEACH GNÉIS LE FOIRMIÚ CRÓMASÓIM GNÉIS A IOMPRAÍONN AN MÁISTIR-GHÉINE ATÁ FREAGRACH AS CINNEADH GNÉIS. SA T-AON TÁ AN CINNEADH GNÉAS XX/XY ACH NÍL AON CRÓMASÓIM GNÉAS HETEROMORPHIC. DÁ BHRÍ SIN, MOLTAR MICRODISSECTION PÉIRE 1 ATÁ INAITHEANTA GO HÉASCA FAOIN MICREASCÓP TOISC GURB É AN PÉIRE MEITEALÁRNACH IS MÓ É AGUS A SHEICHEAMHÚ I BHFIREANNAIGH AGUS I MNÁ CHUN COMPARÁID A DHÉANAMH IDIR NA SEICHIMH AGUS Ó NA DIFRÍOCHTAÍ, RUD A LÉIRÍONN LÁITHREACHT AN RÉIGIÚIN AGUS/NÓ GÉINTE A CHINNEANN GNÉAS. I GCÁS AN DOBHARSHAOTHRAITHE, TÁ SÉ FÍOR-RIACHTANACH GO MBEADH MEICNÍOCHTAÍ AN CHINNIDH GNÉIS AR EOLAS ACU, AG CUR SAN ÁIREAMH FREISIN GO BHFUIL SAINTRÉITHE ANN AMHAIL FÁS A CHUIREANN DÍMHORFACHAS GNÉASACH I LÁTHAIR. INA THEANNTA SIN, CEADAÍONN EOLAS AR AN SÁSRA SEO BAINISTIÚ LEORDHÓTHANACH AR STOIC PÓRAITHEOIRÍ. THAIRIS SIN, MOLTAR STAIDÉAR A DHÉANAMH AR NCRNAS SCOITE (LNCRNAS AGUS MIRNAS) Ó GHÓNAID AIBÍ FIREANNA AGUS BAINEANNA AG LORG MIRNAS LENA RIALAÍTEAR GNÍOMHAÍOCHT GÉINTE SONRACHA A BHFUIL BAINT ACU LE GNÉAS AGUS ATÁIRGEADH A CHINNEADH/A DHIFREÁIL. LEIS AN EOLAS AR AN SÁSRA SIN A DHOIMHNIÚ, BEIFEAR IN ANN STAIDÉIR AR SYNTENIA A BHUNÚ LE SPEICIS EILE AGUS NA TORTHAÍ A LEATHNÚ CHUIG SPEICIS A BHFUIL TÁBHACHT LEO SA DOBHARSHAOTHRÚ. (Irish)
17 August 2022
0 references
JAZYK SENEGALSKÝ JE JEDNÍM Z DRUHŮ, KTERÉ JSOU EKONOMICKY NEJVÍCE CENĚNY V AKVAKULTUŘE, PROTOŽE ZTROJNÁSOBUJE CENU OSTATNÍCH KOMERČNÍCH DRUHŮ A JE DOBRÝM KANDIDÁTEM NA DIVERZIFIKACI EVROPSKÝCH TRHŮ, NASYCENÝCH NADPRODUKCÍ MOŘANŮ A MOŘČÁKA EVROPSKÉHO A JEHO PĚSTOVÁNÍ SE ROZŠÍŘILO DO NĚKOLIKA AUTONOMNÍCH SPOLEČENSTVÍ. ALE VE SROVNÁNÍ S TÍM, CO SE DĚJE U JINÝCH PLATÝSOVITÝCH DRUHŮ, JSOU GENOMICKÉ STUDIE NA JAZYKU STÁLE VZÁCNÉ. TENTO DRUH JE CHARAKTERIZOVÁN KARYOTYPEM SE 42 CHROMOZOMY A 48 CHROMOZOMOVÝMI RAMENY ROZDĚLENÝMI DO 3 METACENTRICKÝCH PÁRŮ, 2 SUBMETACENTRICKÝCH PÁRŮ, 4 SUBTELOCENTRICKÝCH PÁRŮ A 12 AKROCENTRICKÝCH CHROMOZOMÁLNÍCH PÁRŮ. BĚHEM VÝVOJE DVOU PO SOBĚ JDOUCÍCH PROJEKTŮ, U NICHŽ JE NYNÍ POŽADOVÁNA RENOVACE, VYVINULA SKUPINA UCA FYZICKOU MAPU PRO SOLEA SENEGALENSIS SLOŽENOU PŘIBLIŽNĚ ZE 100 BACS, KTERÁ BYLA DŘÍVE SEŘAZENA A UMÍSTĚNA V CHROMOZOMECH JAZYKA OBECNÉHO VÍCE RYBAMI. NYNÍ MÁME CHROMOZOMÁLNÍ MARKERY PRO 21 PÁRŮ V JEDINÉM GENOMU. V PROJEKTU SE NAVRHUJE INTEGROVAT TUTO GENETICKOU MAPU S MAPOU PROPOJENÍ SLOŽENOU ZE 127 MIKROSATELITŮ. K DOSAŽENÍ TOHOTO CÍLE BUDE BACS UKRÝVAT 127 MICROSTELLITS A ISLATED FORM TEH KNIHOVNA, VÝSLEDKEM JE ZVÝŠENÍ HUSTOTY MAPY, KROMĚ INTEGRACE. V PŘEDCHOZÍM PROJEKTU, PRO KTERÝ JE OBNOVA APLIKOVÁNA, BYL OBJEVEN MOŽNÝ SEX PROTO-CHROMOZOM V PODRÁŽCE, KTERÝ BY BYL PÁR 1, BYL OBJEVEN. GENETICKÉ URČENÍ POHLAVÍ JE ČASTO SPOJENO S TVORBOU SEXUÁLNÍCH CHROMOZOMŮ, KTERÉ NESOU HLAVNÍ GEN ZODPOVĚDNÝ ZA URČENÍ POHLAVÍ. V PODEŠVI JE STANOVENÍ POHLAVÍ XX/XY, ALE NEEXISTUJÍ ŽÁDNÉ HETEROMORFNÍ SEXUÁLNÍ CHROMOZOMY. PROTO SE NAVRHUJE MIKRODISEKCE PÁRU 1, KTERÝ JE SNADNO IDENTIFIKOVATELNÝ POD MIKROSKOPEM, PROTOŽE JE TO NEJVĚTŠÍ METACENTRICKÝ PÁR A JEHO SEKVENOVÁNÍ U SAMCŮ A SAMIC K POROVNÁNÍ SEKVENCÍ A Z ROZDÍLŮ, COŽ ODVOZUJE PŘÍTOMNOST GENŮ URČUJÍCÍCH OBLAST A/NEBO POHLAVÍ. V AKVAKULTUŘE JE NEZBYTNÉ ZNÁT MECHANISMY URČOVÁNÍ POHLAVÍ, A TO I VZHLEDEM K TOMU, ŽE EXISTUJÍ VLASTNOSTI, JAKO JE RŮST, KTERÝ PŘEDSTAVUJE SEXUÁLNÍ DIMORFISMUS. KROMĚ TOHO ZNALOST TOHOTO MECHANISMU UMOŽŇUJE ODPOVÍDAJÍCÍ ŘÍZENÍ CHOVATELSKÝCH POPULACÍ. KROMĚ TOHO SE NAVRHUJE STUDIE NCRNA IZOLOVANÝCH (LNCRNA A MIRNA) OD ZRALÝCH SAMCŮ A SAMIC GONÁD HLEDAJÍCÍCH MIRNA, KTERÉ REGULUJÍ AKTIVITU SPECIFICKÝCH GENŮ ZAPOJENÝCH DO STANOVENÍ/ROZLIŠENÍ POHLAVÍ A REPRODUKCE. PROHLOUBENÍ ZNALOSTÍ O TOMTO MECHANISMU UMOŽNÍ ZAVÉST STUDIE SYNTENIA S JINÝMI DRUHY DRUHŮ A ROZŠÍŘIT VÝSLEDKY NA DRUHY S VÝZNAMEM PRO AKVAKULTURU. (Czech)
17 August 2022
0 references
O LINGUADO SENEGALESO É UMA DAS ESPÉCIES ECONOMICAMENTE MAIS VALORIZADAS NA AQUICULTURA, UMA VEZ QUE TRIPLICA O PREÇO DE OUTRAS ESPÉCIES COMERCIAIS E É UM BOM CANDIDATO À DIVERSIFICAÇÃO DOS MERCADOS EUROPEUS, SATURADA PELA SOBREPRODUÇÃO DE GORAZ E ROBALO MARINHO E O SEU CULTIVO SE ESPALHOU POR VÁRIAS COMUNIDADES AUTÓNOMAS. MAS, EM COMPARAÇÃO COM O QUE ACONTECE EM OUTRAS ESPÉCIES DE PEIXES CHATOS, ESTUDOS GENÔMICOS SOBRE O LINGUADO AINDA SÃO ESCASSOS. ESTA ESPÉCIE É CARACTERIZADA POR UM CARIÓTIPO COM 42 CROMOSSOMAS E 48 BRAÇOS CROMOSSÔMICOS DISTRIBUÍDOS EM 3 PARES METACÊNTRICOS, 2 PARES SUBMETACÊNTRICOS, 4 PARES SUBTELOCÊNTRICOS E 12 PARES CROMOSSÔMICOS ACROCÊNTRICOS. DURANTE O DESENVOLVIMENTO DE DOIS PROJETOS CONSECUTIVOS, PARA OS QUAIS ESTÁ SENDO SOLICITADA RENOVAÇÃO, O GRUPO UCA VEM DESENVOLVENDO UM MAPA FÍSICO PARA SOLEA SENEGALENSIS, COMPOSTO POR CERCA DE 100 BACS, PREVIAMENTE SEQUENCIADOS E LOCALIZADOS NOS ÚNICOS CROMOSSOMAS POR MÚLTIPLOS PEIXES. AGORA TEMOS MARCADORES CROMOSSÔMICOS PARA OS 21 PARES NO ÚNICO GENOMA. PROPÕE-SE NO PROJETO INTEGRAR ESTE MAPA GENÉTICO COM O MAPA DE LIGAÇÃO COMPOSTO POR 127 MICROSSATÉLITES. PARA ATINGIR ESTE OBJETIVO, OS BACS QUE ABRIGAM OS 127 MICROSTELLITS SERÃO LOCALIZADOS E ISLATED FORMA TEH BIBLIOTECA, RESSULTANDO EM UM AUMENTO DA DENSIDADE DO MAPA, ALÉM DA INTEGRAÇÃO. NO PROJETO ANTERIOR, PARA O QUAL A RENOVAÇÃO É REALIZADA, FOI DESCOBERTO UM POSSÍVEL PROTOCROMOSSOMO SEXUAL EM LINGUADO, QUE SERIA O PAR 1, FOI DESCOBERTO. A DETERMINAÇÃO GENÉTICA DO SEXO É FREQUENTEMENTE ASSOCIADA À FORMAÇÃO DE CROMOSSOMAS SEXUAIS QUE CARREGAM O GENE MESTRE RESPONSÁVEL PELA DETERMINAÇÃO DO SEXO. NA ÚNICA DETERMINAÇÃO DO SEXO É XX/XY, MAS NÃO HÁ CROMOSSOMAS SEXUAIS HETEROMÓRFICOS. PORTANTO, PROPÕE-SE A MICRODISSECÇÃO DO PAR 1 QUE É FACILMENTE IDENTIFICÁVEL SOB O MICROSCÓPIO PORQUE É O MAIOR PAR METACÊNTRICO E SEU SEQUENCIAMENTO EM HOMENS E RAPARIGAS PARA COMPARAR AS SEQUÊNCIAS E DAS DIFERENÇAS, INFERINDO A PRESENÇA DA REGIÃO E/OU SEXO DETERMINANDO GENES. NA AQUICULTURA É ESSENCIAL CONHECER OS MECANISMOS DE DETERMINAÇÃO SEXUAL, CONSIDERANDO TAMBÉM QUE EXISTEM CARACTERÍSTICAS COMO O CRESCIMENTO QUE APRESENTAM DIMORFISMO SEXUAL. ALÉM DISSO, O CONHECIMENTO DESTE MECANISMO PERMITE UMA GESTÃO ADEQUADA DAS UNIDADES POPULACIONAIS DE CRIADORES. ALÉM DISSO, PROPÕE-SE UM ESTUDO DE NCRNAS ISOLADOS (LNCRNAS E MIRNAS) DE GÓNADAS MASCULINAS E FEMININAS MADURAS À PROCURA DE MIRNAS QUE REGULAM A ATIVIDADE DE GENES ESPECÍFICOS ENVOLVIDOS NA DETERMINAÇÃO/DIFERENCIAÇÃO DO SEXO E DA REPRODUÇÃO. O APROFUNDAMENTO DO CONHECIMENTO DESTE MECANISMO PERMITIRÁ ESTABELECER ESTUDOS DE SYNTENIA COM OUTRAS ESPÉCIES E ESTENDER OS RESULTADOS A ESPÉCIES COM IMPORTÂNCIA NA AQUICULTURA. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
SENEGALI MERIKEEL ON ÜKS VESIVILJELUSES MAJANDUSLIKULT KÕIGE ENAM HINNATUD LIIKE, SEST SEE KOLMEKORDISTAB TEISTE KAUBANDUSLIKE LIIKIDE HINDA NING ON HEA KANDIDAAT EUROOPA TURGUDE MITMEKESISTAMISEKS, MIS ON KÜLLASTUNUD BESUUGO JA HUNTAHVENA ÜLETOOTMISEST NING SELLE KASVATAMINE ON LEVINUD MITMESSE AUTONOOMSESSE PIIRKONDA. KUID VÕRRELDES TEISTE LESTALISTE LIIKIDEGA ON MERIKEELE GENOOMIUURINGUD ENDISELT NAPID. SEDA LIIKI ISELOOMUSTAB KARÜOTÜÜP, MILLEL ON 42 KROMOSOOMI JA 48 KROMOSOOMI, MIS JAGUNEVAD KOLMES METATSENTRILISES PAARIS, 2 SUBMETATSENTRILISES PAARIS, 4 SUBTELOTSENTRILISES PAARIS JA 12 AKROTSENTRILISES KROMOSOOMIPAARIS. KAHE JÄRJESTIKUSE PROJEKTI VÄLJATÖÖTAMISE AJAL, MILLE RENOVEERIMIST PRAEGU TAOTLETAKSE, ON UCA RÜHM TÖÖTANUD VÄLJA SOLEA SENEGALENSIS’E FÜÜSILISE KAARDI, MIS KOOSNEB UMBES 100-ST BACSIST, MIS ON VAREM JÄRJESTATUD JA ASUVAD MITME KALA MERIKEELE KROMOSOOMIDES. MEIL ON NÜÜD KROMOSOOMI MARKERID 21 PAARI KOHTA AINSAS GENOOMIS. PROJEKTIS TEHAKSE ETTEPANEK INTEGREERIDA SEE GENEETILINE KAART 127 MIKROSATELLIITIDEST KOOSNEVA ÜHENDUSKAARDIGA. SELLE EESMÄRGI SAAVUTAMISEKS ASUB 127 MICROSTELLITSI KINNITAV BACS JA ISLATED VORM TEH TEEK, MIS TAASTAB LISAKS INTEGRATSIOONILE KAARDI TIHEDUSE SUURENEMISE. EELMISES PROJEKTIS, MILLE UUENDAMIST TAOTLETAKSE, AVASTATI VÕIMALIK SOOST KROMOSOOMI PROTOKROMOSOOM TALLAS, MIS OLEKS 1. PAAR. SUGU GENEETILINE MÄÄRAMINE ON SAGELI SEOTUD SOO KROMOSOOMIDE MOODUSTUMISEGA, MIS KANNAVAD SOO MÄÄRAMISE EEST VASTUTAVAT PEAGEENI. AINSAL JUHUL ON SOO MÄÄRAMINE XX/XY, KUID HETEROMORFSEID SUGUKROMOSOOMI EI OLE. SEETÕTTU TEHAKSE ETTEPANEK, ET 1. PAARI MIKRODISSEKTSIOON ON MIKROSKOOBI ALL KERGESTI TUVASTATAV, SEST SEE ON SUURIM METATSENTRILINE PAAR JA SELLE JÄRJESTAMINE ISAS- JA EMASLOOMADEL, ET VÕRRELDA JÄRJESTUSI JA ERINEVUSI, JÄRELDADES PIIRKONNA JA/VÕI SUGU MÄÄRAVATE GEENIDE OLEMASOLU. VESIVILJELUSES ON OLULINE TEADA SOO MÄÄRAMISE MEHHANISME, VÕTTES ARVESSE KA SEDA, ET ON OLEMAS SELLISED OMADUSED NAGU KASV, MIS KUJUTAVAD ENDAST SEKSUAALSET DIMORFISMI. LISAKS VÕIMALDAVAD TEADMISED SELLEST MEHHANISMIST TÕUARETAJATE VARUSID ASJAKOHASELT MAJANDADA. LISAKS TEHAKSE ETTEPANEK UURIDA NCRNASID (LNCRNA-D JA MIRNA-D) TÄISKASVANUD ISASTEST JA EMASTEST SUGUNÄÄRMETEST, KES OTSIVAD MIRNASID, MIS REGULEERIVAD SOO JA PALJUNEMISE MÄÄRAMISES/DIFERENTSEERIMISES OSALEVATE KONKREETSETE GEENIDE AKTIIVSUST. SELLE MEHHANISMIGA SEOTUD TEADMISTE SÜVENDAMINE VÕIMALDAB TEHA SYNTENIA UURINGUID TEISTE LIIKIDEGA NING LAIENDADA TULEMUSI VESIVILJELUSES OLULISTELE LIIKIDELE. (Estonian)
17 August 2022
0 references
A SZENEGÁLI NYELVHAL AZ AKVAKULTÚRÁBAN GAZDASÁGILAG LEGÉRTÉKESEBB FAJOK EGYIKE, MIVEL MEGHÁROMSZOROZZA MÁS KERESKEDELMI FAJOK ÁRÁT, ÉS JÓ JELÖLT AZ EURÓPAI PIACOK DIVERZIFIKÁCIÓJÁRA, AMELYET A TENGERI DURBINCS ÉS A FARKASSÜGÉR TÚLTERMELÉSE TELÍTETT, ÉS TERMESZTÉSE TÖBB AUTONÓM KÖZÖSSÉGRE IS ÁTTERJEDT. A TÖBBI LEPÉNYHALFAJHOZ KÉPEST AZONBAN MÉG MINDIG KEVÉS A NYELVHAL GENOMIKUS VIZSGÁLATA. EZT A FAJT 42 KROMOSZÓMÁVAL ÉS 48 KROMOSZÓMA-KARRAL RENDELKEZŐ KAROTÍPUS JELLEMZI, AMELY 3 METACENTRIKUS PÁRBAN, 2 SZUBMETACENTRIKUS PÁRBAN, 4 SZUBTELOCENTRIKUS PÁRBAN ÉS 12 AKROCENTRIKUS KROMOSZÓMA PÁRBAN OSZLIK EL. KÉT EGYMÁST KÖVETŐ PROJEKT KIDOLGOZÁSA SORÁN, AMELYEK FELÚJÍTÁSÁT JELENLEG KÉRIK, AZ UCA-CSOPORT KIDOLGOZTA A SOLEA SENEGALENSIS FIZIKAI TÉRKÉPÉT, AMELY KÖRÜLBELÜL 100 BACS-BÓL ÁLL, AMELYET KORÁBBAN TÖBB HAL EGYETLEN KROMOSZÓMÁJÁBAN SZEKVENÁLTAK. MOST MÁR VANNAK KROMOSZÓMA MARKEREINK A 21 PÁRRA AZ EGYETLEN GENOMBAN. A PROJEKT AZT JAVASOLJA, HOGY EZT A GENETIKAI TÉRKÉPET INTEGRÁLJÁK A 127 MIKROSZATELLITBŐL ÁLLÓ ÖSSZEKAPCSOLÁSI TÉRKÉPBE. E CÉL ELÉRÉSE ÉRDEKÉBEN A 127 MICROSTELLITS-ET REJTŐ BACS ELHELYEZKEDIK ÉS ISLATED FORMÁTUMÚ TEH KÖNYVTÁR, AMELY AZ INTEGRÁCIÓ MELLETT NÖVELI A TÉRKÉP SŰRŰSÉGÉT. AZ ELŐZŐ PROJEKTBEN, AMELYNEK MEGÚJÍTÁSA MEGTÖRTÉNT, FELFEDEZTEK EGY LEHETSÉGES NEMI PROTO-KROMOSZÓMÁT A TALPBAN, AMELY 1-ES PÁR LENNE. A NEM GENETIKAI MEGHATÁROZÁSA GYAKRAN TÁRSUL A NEMI KROMOSZÓMÁK KIALAKULÁSÁHOZ, AMELYEK A NEMI MEGHATÁROZÁSÉRT FELELŐS MESTER GÉNT HORDOZZÁK. AZ EGYETLEN NEM MEGHATÁROZÁSA XX/XY, DE NINCSENEK HETEROMORF NEMI KROMOSZÓMÁK. EZÉRT JAVASOLT A MIKROSZKÓP ALATT KÖNNYEN AZONOSÍTHATÓ 1-ES PÁR MIKROFÁZISA, MIVEL EZ A LEGNAGYOBB METACENTRIKUS PÁR ÉS ANNAK SZEKVENÁLÁSA A HÍMEK ÉS NŐSTÉNYEK ESETÉBEN A SZEKVENCIÁK ÉS A KÜLÖNBSÉGEK ÖSSZEHASONLÍTÁSÁRA, AMI A RÉGIÓ ÉS/VAGY A NEMET MEGHATÁROZÓ GÉNEK JELENLÉTÉT VONJA LE. AZ AKVAKULTÚRÁBAN ALAPVETŐ FONTOSSÁGÚ A NEMI MEGHATÁROZÁS MECHANIZMUSAINAK ISMERETE, FIGYELEMBE VÉVE AZT IS, HOGY VANNAK OLYAN JELLEMZŐK, MINT A NÖVEKEDÉS, AMELY SZEXUÁLIS DIMORFIZMUST JELENT. EMELLETT E MECHANIZMUS ISMERETE LEHETŐVÉ TESZI A TENYÉSZTŐI ÁLLOMÁNYOK MEGFELELŐ KEZELÉSÉT. EZEN TÚLMENŐEN A NEM ÉS A REPRODUKCIÓ MEGHATÁROZÁSÁBAN/DIFFERENCIÁLÁSÁBAN RÉSZT VEVŐ SPECIFIKUS GÉNEK AKTIVITÁSÁT SZABÁLYOZÓ MIRNS-EKET KERESŐ, ÉRETT HÍM ÉS NŐSTÉNY IVARMIRIGYEKTŐL IZOLÁLT NCRNS-EK (LNCRNS-EK ÉS MIRNS-EK) VIZSGÁLATÁT JAVASOLJÁK. AZ E MECHANIZMUSSAL KAPCSOLATOS ISMERETEK ELMÉLYÍTÉSE LEHETŐVÉ TESZI, HOGY SYNTENIA-RA VONATKOZÓ TANULMÁNYOKAT KÉSZÍTSENEK MÁS FAJOKKAL, ÉS AZ EREDMÉNYEKET KITERJESSZÉK AZ AKVAKULTÚRÁBAN FONTOS FAJOKRA IS. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
СЕНЕГАЛСКИЯТ МОРСКИ ЕЗИК Е ЕДИН ОТ ВИДОВЕТЕ, КОИТО СА ИКОНОМИЧЕСКИ НАЙ-ЦЕНЕНИ В СЕКТОРА НА АКВАКУЛТУРИТЕ, ТЪЙ КАТО УТРОЯВА ЦЕНИТЕ НА ДРУГИТЕ ТЪРГОВСКИ ВИДОВЕ И Е ДОБЪР КАНДИДАТ ЗА ДИВЕРСИФИКАЦИЯ НА ЕВРОПЕЙСКИТЕ ПАЗАРИ, НАСИТЕН С СВРЪХПРОИЗВОДСТВОТО НА МОРСКА КАРАКУДА И ЛАВРАК И ОТГЛЕЖДАНЕТО МУ СЕ Е РАЗПРОСТРАНИЛО В НЯКОЛКО АВТОНОМНИ ОБЩНОСТИ. НО В СРАВНЕНИЕ С ТОВА, КОЕТО СЕ СЛУЧВА ПРИ ДРУГИ ВИДОВЕ КАЛКАНОПОДОБНИ, ГЕНОМНИТЕ ИЗСЛЕДВАНИЯ ВЪРХУ МОРСКИ ЕЗИК ВСЕ ОЩЕ СА ОСКЪДНИ. ТОЗИ ВИД СЕ ХАРАКТЕРИЗИРА С КАРИОТИП С 42 ХРОМОЗОМИ И 48 ХРОМОЗОМНИ РАМЕНА, РАЗПРЕДЕЛЕНИ В 3 МЕТАЦЕНТРИЧНИ ДВОЙКИ, 2 ПОДМЕТАЦЕНТРИЧНИ ДВОЙКИ, 4 СУБТЕЛОЦЕНТРИЧНИ ДВОЙКИ И 12 АКРОЦЕНТРИЧНИ ХРОМОЗОМНИ ДВОЙКИ. ПО ВРЕМЕ НА РАЗРАБОТВАНЕТО НА ДВА ПОСЛЕДОВАТЕЛНИ ПРОЕКТА, ЗА КОИТО ПОНАСТОЯЩЕМ СЕ ИСКА ОБНОВЯВАНЕ, ГРУПАТА UCA РАЗРАБОТВА ФИЗИЧЕСКА КАРТА ЗА SOLEA SENEGALENSIS, СЪСТАВЕНА ОТ ОКОЛО 100 ССАУ, ПРЕДВАРИТЕЛНО СЕКВЕНИРАНИ И РАЗПОЛОЖЕНИ В ЕДИНСТВЕНИ ХРОМОЗОМИ ОТ МНОЖЕСТВО РИБИ. СЕГА ИМАМЕ ХРОМОЗОМНИ МАРКЕРИ ЗА 21 ДВОЙКИ В ЕДИНСТВЕНИЯ ГЕНОМ. В ПРОЕКТА СЕ ПРЕДЛАГА ТАЗИ ГЕНЕТИЧНА КАРТА ДА СЕ ИНТЕГРИРА С КАРТАТА НА ВРЪЗКАТА, СЪСТАВЕНА ОТ 127 МИКРОСАТЕЛИТИ. ЗА ДА СЕ ПОСТИГНЕ ТАЗИ ЦЕЛ, ССАУ ПРИЮТЯВА 127 MICROSTELLITS ЩЕ СЕ НАМИРА И ISLATED ФОРМА TEH БИБЛИОТЕКА, В РЕЗУЛТАТ НА УВЕЛИЧАВАНЕ НА ПЛЪТНОСТТА НА КАРТАТА, В ДОПЪЛНЕНИЕ КЪМ ИНТЕГРАЦИЯТА. В ПРЕДИШНИЯ ПРОЕКТ, ЗА КОЙТО СЕ ИЗВЪРШВА ПОДНОВЯВАНЕ, Е ОТКРИТА ВЪЗМОЖНА ПОЛОВА ПРОТОХРОЗОМА В МОРСКИ ЕЗИК, КОЯТО БИ БИЛА ДВОЙКА 1. ГЕНЕТИЧНОТО ОПРЕДЕЛЯНЕ НА ПОЛА ЧЕСТО СЕ СВЪРЗВА С ОБРАЗУВАНЕТО НА ПОЛОВИ ХРОМОЗОМИ, КОИТО НОСЯТ ГЛАВНИЯ ГЕН, ОТГОВОРЕН ЗА ОПРЕДЕЛЯНЕТО НА ПОЛА. В ПОДМЕТКАТА ОПРЕДЕЛЯНЕТО НА ПОЛА Е XX/XY, НО НЯМА ХЕТЕРОМОРФНИ ПОЛОВИ ХРОМОЗОМИ. ПОРАДИ ТОВА СЕ ПРЕДЛАГА МИКРОДИСЕКЦИЯТА НА ДВОЙКА 1, КОЯТО Е ЛЕСНО РАЗПОЗНАВАЕМА ПОД МИКРОСКОПА, ТЪЙ КАТО ТЯ Е НАЙ-ГОЛЯМАТА МЕТАЦЕНТРИЧНА ДВОЙКА И СЕКВЕНИРАНЕТО Ѝ ПРИ МЪЖКИТЕ И ЖЕНСКИТЕ ЖИВОТНИ, ЗА ДА СЕ СРАВНЯТ ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТИТЕ И РАЗЛИКИТЕ, КАТО СЕ ПРАВИ ИЗВОД ЗА НАЛИЧИЕТО НА ГЕНИ, ОПРЕДЕЛЯЩИ РЕГИОНА И/ИЛИ ПОЛА. В АКВАКУЛТУРИТЕ Е ОТ СЪЩЕСТВЕНО ЗНАЧЕНИЕ ДА СЕ ПОЗНАВАТ МЕХАНИЗМИТЕ ЗА ОПРЕДЕЛЯНЕ НА ПОЛА, КАТО СЕ ИМА ПРЕДВИД СЪЩО ТАКА, ЧЕ СЪЩЕСТВУВАТ ХАРАКТЕРИСТИКИ КАТО РАСТЕЖ, КОИТО ПРЕДСТАВЛЯВАТ СЕКСУАЛЕН ДИМОРФИЗЪМ. ОСВЕН ТОВА ПОЗНАВАНЕТО НА ТОЗИ МЕХАНИЗЪМ ПОЗВОЛЯВА АДЕКВАТНО УПРАВЛЕНИЕ НА ЗАПАСИТЕ ОТ ЖИВОТНОВЪДИ. ОСВЕН ТОВА СЕ ПРЕДЛАГА ПРОУЧВАНЕ НА NCRNAS ИЗОЛИРАНИ (LNCRNAS И MIRNAS) ОТ ЗРЕЛИ МЪЖКИ И ЖЕНСКИ ГОНАДИ, КОИТО ТЪРСЯТ MIRNAS, КОИТО РЕГУЛИРАТ АКТИВНОСТТА НА СПЕЦИФИЧНИ ГЕНИ, УЧАСТВАЩИ В ОПРЕДЕЛЯНЕТО/ДИФЕРЕНЦИАЦИЯТА НА ПОЛА И РЕПРОДУКЦИЯТА. ЗАДЪЛБОЧАВАНЕТО НА ПОЗНАНИЯТА ЗА ТОЗИ МЕХАНИЗЪМ ЩЕ ПОЗВОЛИ ДА СЕ НАПРАВЯТ ПРОУЧВАНИЯ НА SYNTENIA С ДРУГИ ВИДОВЕ И ДА СЕ РАЗШИРЯТ РЕЗУЛТАТИТЕ, ТАКА ЧЕ ДА ОБХВАНАТ ВИДОВЕ, КОИТО СА ОТ ЗНАЧЕНИЕ ЗА АКВАКУЛТУРИТЕ. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
SENEGALO JŪRŲ LIEŽUVIS YRA VIENA IŠ EKONOMIŠKAI NAUDINGIAUSIŲ RŪŠIŲ AKVAKULTŪROJE, NES JI PATRIGUBINA KITŲ KOMERCINIŲ RŪŠIŲ KAINĄ IR YRA GERA KANDIDATĖ Į EUROPOS RINKAS ĮVAIRINTI, KURIĄ PRISOTINA PERTEKLINĖ JŪRINIŲ KAROSŲ IR PAPRASTŲJŲ VILKEŠERIŲ GAMYBA, O JŲ AUGINIMAS IŠPLITO Į KELETĄ AUTONOMINIŲ BENDRUOMENIŲ. TAČIAU, PALYGINTI SU TUO, KAS ATSITINKA SU KITOMIS PLEKŠNIAŽUVĖMIS, GENOMINIAI JŪRŲ LIEŽUVIŲ TYRIMAI VIS DAR YRA RIBOTI. ŠIAI RŪŠIAI BŪDINGAS KARIOTIPAS SU 42 CHROMOSOMOMIS IR 48 CHROMOSOMŲ GRUPĖMIS, PASKIRSTYTOMIS 3 METACENTRINĖMIS POROMIS, 2 SUBMETACENTRINĖMIS POROMIS, 4 SUBTELOCENTRINĖMIS POROMIS IR 12 AKROCENTRINIŲ CHROMOSOMŲ POROMIS. RENGIANT DU VIENAS PO KITO EINANČIUS PROJEKTUS, KURIUOS ŠIUO METU PRAŠOMA RENOVUOTI, UCA GRUPĖ PARENGĖ FIZINĮ SOLEA SENEGALENSIS ŽEMĖLAPĮ, SUDARYTĄ IŠ MAŽDAUG 100 BACS, ANKSČIAU SEKUSIŲ IR ESANČIŲ VIENINTELĖSE CHROMOSOMOSE KELIOMIS ŽUVIMIS. DABAR MES TURIME CHROMOSOMŲ ŽYMEKLIUS 21 PORAI VIENINTELIAME GENOME. PROJEKTE SIŪLOMA INTEGRUOTI ŠĮ GENETINĮ ŽEMĖLAPĮ SU RYŠIO ŽEMĖLAPIU, SUDARYTU IŠ 127 MIKROPALYDOVŲ. KAD PASIEKTŲ ŠĮ TIKSLĄ, BACS TURĖS 127 MICROSTELLITS BUS ĮSIKŪRĘS IR ISLATED FORMA TEH BIBLIOTEKA, TODĖL PADIDINTI ŽEMĖLAPIO TANKĮ, BE INTEGRACIJOS. ANKSTESNIAME PROJEKTE, KURIO ATNAUJINIMAS YRA IŠSKIRTAS, BUVO APTIKTA GALIMA SEKSO PROTO-CHROMOSOMA VIENINTELIS, KURIS BŪTŲ 1 PORA. GENETINIS LYTIES NUSTATYMAS DAŽNAI SIEJAMAS SU LYTINIŲ CHROMOSOMŲ, KURIOS ATLIEKA PAGRINDINĮ GENĄ, ATSAKINGĄ UŽ LYTIES NUSTATYMĄ, FORMAVIMU. VIENINTELIS LYTINIS NUSTATYMAS YRA XX/XY, TAČIAU HETEROMORFINIŲ LYTINIŲ CHROMOSOMŲ NĖRA. TODĖL SIŪLOMA 1 POROS MIKRODISEKCIJA, KURI YRA LENGVAI ATPAŽĮSTAMA MIKROSKOPU, NES JI YRA DIDŽIAUSIA METACENTRINĖ PORA IR JOS SEKOS NUSTATYMAS VYRAMS IR MOTERIMS, KAD BŪTŲ GALIMA PALYGINTI SEKAS IR IŠ SKIRTUMŲ, REMIANTIS REGIONO IR (ARBA) LYTIES NUSTATYMO GENŲ BUVIMU. AKVAKULTŪROS SRITYJE LABAI SVARBU ŽINOTI LYTIES NUSTATYMO MECHANIZMUS, TAIP PAT ATSIŽVELGIANT Į TAI, KAD YRA TOKIŲ SAVYBIŲ KAIP AUGIMAS, KURIS YRA SEKSUALINIS DIMORFIZMAS. BE TO, ŽINIOS APIE ŠĮ MECHANIZMĄ LEIDŽIA TINKAMAI VALDYTI SELEKCININKŲ ATSARGAS. BE TO, SIŪLOMA ATLIKTI NCRNR, IŠSKIRTŲ (LNCRNR IR MIRNR) IŠ BRANDŽIŲ PATINŲ IR PATELIŲ LYTINIŲ LIAUKŲ, IEŠKANČIŲ MIRNR, TYRIMĄ, KURIS REGULIUOJA SPECIFINIŲ GENŲ, SUSIJUSIŲ SU LYTIES IR REPRODUKCIJOS NUSTATYMU/DIFERENCIJAVIMU, AKTYVUMĄ. GILINUS ŽINIAS APIE ŠĮ MECHANIZMĄ BUS GALIMA ATLIKTI SYNTENIA TYRIMUS SU KITOMIS RŪŠIMIS IR IŠPLĖSTI JŲ REZULTATUS ĮTRAUKIANT AKVAKULTŪRAI SVARBIAS RŪŠIS. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
SENEGALSKI LIST JEDNA JE OD GOSPODARSKI NAJCJENJENIJIH VRSTA U AKVAKULTURI JER UTROSTRUČAVA CIJENU DRUGIH KOMERCIJALNIH VRSTA I DOBAR JE PREDUVJET ZA DIVERSIFIKACIJU EUROPSKIH TRŽIŠTA, ZASIĆEN PREKOMJERNOM PROIZVODNJOM KOMARČE I LUBINA, A UZGOJ SE PROŠIRIO NA NEKOLIKO AUTONOMNIH ZAJEDNICA. NO, U USPOREDBI S ONIM ŠTO SE DOGAĐA U DRUGIM VRSTAMA PLOSNATICA, GENOMSKA ISTRAŽIVANJA NA POTPLATU JOŠ UVIJEK SU OSKUDNA. OVU VRSTU KARAKTERIZIRA KARIOTIP S 42 KROMOSOMA I 48 KROMOSOMSKIH RUKU RASPOREĐENIH U 3 METACENTRIČNA PARA, 2 SUBMETACENTRIČNA PARA, 4 SUBTELOCENTRIC PARA I 12 AKROCENTRIČNIH KROMOSOMSKIH PAROVA. TIJEKOM RAZVOJA DVAJU UZASTOPNIH PROJEKATA, ZA KOJE SE SADA TRAŽI OBNOVA, SKUPINA UCA RAZVIJA FIZIČKU KARTU ZA SOLEA SENEGALENSIS, SASTAVLJENU OD OKO 100 BACS-A, PRETHODNO SEKVENCIRANE I SMJEŠTENE U JEDINIM KROMOSOMIMA VIŠE RIBA. SADA IMAMO KROMOSOMSKE MARKERE ZA 21 PAR U JEDINOM GENOMU. U PROJEKTU SE PREDLAŽE DA SE TA GENETSKA KARTA INTEGRIRA S KARTOM POVEZIVANJA KOJA SE SASTOJI OD 127 MIKROSATELITA. KAKO BI SE POSTIGAO TAJ CILJ BACS ĆE SE NALAZITI 127 MICROSTELLITS I ISLATED OBRAZAC TEH KNJIŽNICA, ŠTO JE REZULTAT INKREACIJE GUSTOĆE KARTE, OSIM INTEGRACIJE. U PRETHODNOM PROJEKTU ZA KOJI JE OBNOVLJENA, OTKRIVEN JE MOGUĆI SEKS PROTO KROMOSOM U POTPLATU, KOJI BI BIO PAR 1. GENETSKO ODREĐIVANJE SPOLA ČESTO JE POVEZANO SA STVARANJEM SEKSUALNIH KROMOSOMA KOJI NOSE GLAVNI GEN ODGOVORAN ZA ODREĐIVANJE SPOLA. U JEDINOM JE ODREĐIVANJU SPOLA XX/XY, ALI NEMA HETEROMORFNIH SEKSUALNIH KROMOSOMA. STOGA SE PREDLAŽE MIKRODISEKCIJA PARA 1 KOJI SE LAKO MOŽE IDENTIFICIRATI POD MIKROSKOPOM JER JE TO NAJVEĆI METACENTRIČNI PAR I NJEGOV SEKVENCIRANJE U MUŽJAKA I ŽENKI RADI USPOREDBE SEKVENCI I RAZLIKA, UZ ZAKLJUČAK O PRISUTNOSTI GENA KOJI ODREĐUJU REGIJU I/ILI SPOL. U AKVAKULTURI JE KLJUČNO POZNAVATI MEHANIZME ODREĐIVANJA SPOLA, UZIMAJUĆI U OBZIR I DA POSTOJE ZNAČAJKE POPUT RASTA KOJE PREDSTAVLJAJU SEKSUALNI DIMORFIZAM. OSIM TOGA, POZNAVANJE TOG MEHANIZMA OMOGUĆUJE ODGOVARAJUĆE UPRAVLJANJE STOKOVIMA UZGAJIVAČA. NADALJE, PREDLAŽE SE ISTRAŽIVANJE NRNA IZOLIRANIH (LNCRNA I MIRNA) IZ ZRELIH MUŽJAKA I ŽENSKIH GONADA U POTRAZI ZA MIRNA-IMA KOJI REGULIRAJU AKTIVNOST ODREĐENIH GENA UKLJUČENIH U ODREĐIVANJE/DIFERENCIRANJE SPOLA I REPRODUKCIJU. PRODUBLJIVANJE ZNANJA O TOM MEHANIZMU OMOGUĆIT ĆE USPOSTAVU STUDIJA SYNTENIA S DRUGIM VRSTAMA I PROŠIRENJE REZULTATA NA VRSTE KOJE SU VAŽNE U AKVAKULTURI. (Croatian)
17 August 2022
0 references
SENEGALS TUNGA ÄR EN AV DE ARTER SOM VÄRDERAS MEST EKONOMISKT INOM VATTENBRUKET EFTERSOM DEN TREDUBBLAR PRISET PÅ ANDRA KOMMERSIELLA ARTER OCH ÄR EN GOD KANDIDAT FÖR DIVERSIFIERING AV DE EUROPEISKA MARKNADERNA, MÄTTAD AV ÖVERPRODUKTION AV HAVSBRAXEN OCH HAVSABBORRE OCH ODLINGEN AV DEN HAR SPRIDIT SIG TILL FLERA AUTONOMA REGIONER. MEN JÄMFÖRT MED VAD SOM HÄNDER HOS ANDRA PLATTFISKARTER ÄR GENOMISKA STUDIER PÅ TUNGA FORTFARANDE KNAPPA. DENNA ART KÄNNETECKNAS AV EN KARYOTYP MED 42 KROMOSOMER OCH 48 KROMOSOMARMAR FÖRDELADE I 3 METACENTRISKA PAR, 2 SUBMETACENTRISKA PAR, 4 SUBTELOCENTRISKA PAR OCH 12 AKROCENTRISKA KROMOSOMPAR. UNDER UTVECKLINGEN AV TVÅ PÅ VARANDRA FÖLJANDE PROJEKT, FÖR VILKA RENOVERING NU BEGÄRS, HAR UCA-GRUPPEN TAGIT FRAM EN FYSISK KARTA FÖR SOLEA SENEGALENSIS, BESTÅENDE AV CIRKA 100 BACS, SOM TIDIGARE VAR ORDNADE OCH PLACERADE I DE ENDA KROMOSOMERNA AV FLERA FISKAR. VI HAR NU KROMOSOMMARKÖRER FÖR DE 21 PAREN I SULANS GENOM. I PROJEKTET FÖRESLÅS ATT DENNA GENETISKA KARTA SKA INTEGRERAS MED LÄNKKARTAN SOM BESTÅR AV 127 MIKROSATELLITER. FÖR ATT UPPNÅ DETTA MÅL KOMMER BACS ATT HYSA 127 MICROSTELLITS KOMMER ATT LOKALISERAS OCH ISLATED FORM TEH BIBLIOTEK, VILKET RESULTERAR I EN INCREAE AV DENSITETEN PÅ KARTAN, FÖRUTOM INTEGRATIONEN. I DET TIDIGARE PROJEKTET, FÖR VILKET FÖRNYELSE ÄR APLIED, HAR EN MÖJLIG KÖNSPROTOKROMOSOM I SULA, SOM SKULLE VARA PAR 1, UPPTÄCKTS. GENETISK BESTÄMNING AV KÖN ÄR OFTA FÖRKNIPPAD MED BILDANDET AV KÖNSKROMOSOMER SOM BÄR HUVUDGENEN SOM ANSVARAR FÖR KÖNSBESTÄMNING. I SULAN ÄR KÖNSBESTÄMNINGEN XX/XY MEN DET FINNS INGA HETEROMORFISKA KÖNSKROMOSOMER. DÄRFÖR FÖRESLÅS MIKRODISSEKTION AV PAR 1 SOM LÄTT KAN IDENTIFIERAS UNDER MIKROSKOPET EFTERSOM DET ÄR DET STÖRSTA METACENTRISKA PARET OCH DESS SEKVENSERING HOS HANAR OCH HONOR FÖR ATT JÄMFÖRA SEKVENSERNA OCH FRÅN SKILLNADERNA, VILKET LEDER TILL NÄRVARON AV REGIONEN OCH/ELLER KÖNSBESTÄMMA GENER. INOM VATTENBRUKET ÄR DET VIKTIGT ATT KÄNNA TILL MEKANISMERNA FÖR KÖNSBESTÄMNING, ÄVEN MED TANKE PÅ ATT DET FINNS EGENSKAPER SOM TILLVÄXT SOM MEDFÖR SEXUELL DIMORFISM. DESSUTOM MÖJLIGGÖR KUNSKAP OM DENNA MEKANISM EN LÄMPLIG FÖRVALTNING AV AVELSBESTÅNDEN. DESSUTOM FÖRESLÅS EN STUDIE AV NCRNAS ISOLERADE (LNCRNAS OCH MIRNAS) FRÅN MOGNA MANLIGA OCH KVINNLIGA GONADER SOM SÖKER MIRNAS SOM REGLERAR AKTIVITETEN HOS SPECIFIKA GENER SOM ÄR INVOLVERADE I BESTÄMNING/DIFFERENTIERING AV KÖN OCH REPRODUKTION. FÖRDJUPNINGEN AV KUNSKAPEN OM DENNA MEKANISM KOMMER ATT GÖRA DET MÖJLIGT ATT FASTSTÄLLA STUDIER AV SYNTENIA MED ANDRA ARTER AV OCH ATT UTVIDGA RESULTATEN TILL ARTER AV BETYDELSE FÖR VATTENBRUKET. (Swedish)
17 August 2022
0 references
LIMBA-DE-MARE SENEGALEZĂ ESTE UNA DINTRE SPECIILE CELE MAI APRECIATE DIN PUNCT DE VEDERE ECONOMIC ÎN ACVACULTURĂ, DEOARECE TRIPLEAZĂ PREȚUL ALTOR SPECII COMERCIALE ȘI ESTE UN BUN CANDIDAT PENTRU DIVERSIFICAREA PIEȚELOR EUROPENE, SATURATĂ DE SUPRAPRODUCȚIA DE DORADĂ ȘI BIBAN DE MARE, IAR CULTIVAREA SA S-A RĂSPÂNDIT ÎN MAI MULTE COMUNITĂȚI AUTONOME. DAR, ÎN COMPARAȚIE CU CEEA CE SE ÎNTÂMPLĂ LA ALTE SPECII DE PEȘTI PLAȚI, STUDIILE GENOMICE PE LIMBĂ-DE-MARE SUNT ÎNCĂ LIMITATE. ACEASTĂ SPECIE ESTE CARACTERIZATĂ PRINTR-UN CARIOTIP CU 42 DE CROMOZOMI ȘI 48 DE BRAȚE CROMOZOMIALE DISTRIBUITE ÎN 3 PERECHI METACENTRICE, 2 PERECHI SUBMETACENTRICE, 4 PERECHI SUBTELOCENTRICE ȘI 12 PERECHI CROMOZOMIALE ACROCENTRICE. ÎN TIMPUL ELABORĂRII A DOUĂ PROIECTE CONSECUTIVE, PENTRU CARE SE SOLICITĂ RENOVAREA, GRUPUL UCA A DEZVOLTAT O HARTĂ FIZICĂ PENTRU SOLEA SENEGALENSIS, COMPUSĂ DIN APROXIMATIV 100 BACS, SECVENȚIATĂ ANTERIOR ȘI LOCALIZATĂ ÎN CROMOZOMII-LICHIDI DE MAI MULȚI PEȘTI. ACUM AVEM MARKERI CROMOZOMIALI PENTRU CELE 21 DE PERECHI DIN SINGURUL GENOM. ÎN CADRUL PROIECTULUI SE PROPUNE INTEGRAREA ACESTEI HĂRȚI GENETICE CU HARTA DE LEGĂTURĂ COMPUSĂ DIN 127 MICROSATELIȚI. PENTRU A ATINGE ACEST OBIECTIV BACS ADĂPOSTIND 127 MICROSTELLITS VA FI LOCALIZAT ȘI ISLATED FORMA DE BIBLIOTECĂ TEH, REZULTATUL ÎNTR-O CREȘTERE A DENSITĂȚII HĂRȚII, ÎN PLUS FAȚĂ DE INTEGRARE. ÎN PROIECTUL ANTERIOR PENTRU CARE SE APLICĂ REÎNNOIREA, A FOST DESCOPERIT UN POSIBIL PROTOCROMOZOM SEXUAL ÎN LIMBĂ-DE-MARE, CARE AR FI PERECHEA 1. DETERMINAREA GENETICĂ A SEXULUI ESTE ADESEA ASOCIATĂ CU FORMAREA CROMOZOMILOR SEXUALI CARE POARTĂ GENA PRINCIPALĂ RESPONSABILĂ PENTRU DETERMINAREA SEXULUI. ÎN TALPĂ DETERMINAREA SEXULUI ESTE XX/XY, DAR NU EXISTĂ CROMOZOMI HETEROMORFICI SEXUALI. PRIN URMARE, SE PROPUNE MICRODISECȚIA PERECHII 1 CARE ESTE UȘOR DE IDENTIFICAT LA MICROSCOP, DEOARECE ESTE CEA MAI MARE PERECHE METACENTRICĂ ȘI SECVENȚIEREA SA LA MASCULI ȘI FEMELE PENTRU A COMPARA SECVENȚELE ȘI DIN DIFERENȚELE, DEDUCÂND PREZENȚA GENELOR CARE DETERMINĂ REGIUNEA ȘI/SAU SEXUL. ÎN ACVACULTURĂ, ESTE ESENȚIAL SĂ SE CUNOASCĂ MECANISMELE DE DETERMINARE A SEXULUI, AVÂND ÎN VEDERE, DE ASEMENEA, CĂ EXISTĂ CARACTERISTICI PRECUM CREȘTEREA CARE PREZINTĂ DIMORFISMUL SEXUAL. ÎN PLUS, CUNOAȘTEREA ACESTUI MECANISM PERMITE GESTIONAREA ADECVATĂ A STOCURILOR DE CRESCĂTORI. ÎN PLUS, SE PROPUNE UN STUDIU PRIVIND NCRNA IZOLATE (LNCRNA ȘI MIRNA) DIN GONADELE MATURE DE SEX MASCULIN ȘI FEMININ CARE CAUTĂ MIRNA-URI CARE REGLEMENTEAZĂ ACTIVITATEA GENELOR SPECIFICE IMPLICATE ÎN DETERMINAREA/DIFERENȚIEREA SEXULUI ȘI A REPRODUCERII. APROFUNDAREA CUNOȘTINȚELOR CU PRIVIRE LA ACEST MECANISM VA PERMITE STABILIREA DE STUDII PRIVIND SYNTENIA CU ALTE SPECII ȘI EXTINDEREA REZULTATELOR LA SPECIILE CU IMPORTANȚĂ ÎN ACVACULTURĂ. (Romanian)
17 August 2022
0 references
SENEGALSKI MORSKI LIST JE ENA OD GOSPODARSKO NAJBOLJ CENJENIH VRST V RIBOGOJSTVU, SAJ POTROJI CENE DRUGIH KOMERCIALNIH VRST IN JE DOBER KANDIDAT ZA DIVERZIFIKACIJO EVROPSKIH TRGOV, NASIČENA S PREKOMERNO PROIZVODNJO OKATEGA IN BRANCINA, NJEGOVA PRIDELAVA PA SE JE RAZŠIRILA NA VEČ AVTONOMNIH SKUPNOSTI. TODA V PRIMERJAVI S TEM, KAR SE DOGAJA PRI DRUGIH VRSTAH BOKOPLUT, SO GENOMSKE ŠTUDIJE MORSKEGA LISTA ŠE VEDNO REDKE. ZA TO VRSTO JE ZNAČILEN KARIOTIP Z 42 KROMOSOMI IN 48 KROMOSOMSKIMI KRAKI, RAZPOREJENIMI V 3 METACENTRIČNE PARE, 2 SUBMETACENTRIČNA PARA, 4 SUBTELCENTRIČNE PARE IN 12 AKROCENTRIČNIH KROMOSOMSKIH PAROV. MED RAZVOJEM DVEH ZAPOREDNIH PROJEKTOV, ZA KATERA SE ZDAJ ZAHTEVA PRENOVA, JE SKUPINA UCA RAZVIJALA FIZIČNI ZEMLJEVID ZA SOLEA SENEGALENSIS, SESTAVLJEN IZ PRIBLIŽNO 100 BACS, KI SO BILI PREJ ZAPOREDNI IN NAMEŠČENI V PODPLATIH KROMOSOMOV Z VEČ RIBAMI. ZDAJ IMAMO KROMOSOMSKE MARKERJE ZA 21 PAROV V EDINEM GENOMU. V PROJEKTU SE PREDLAGA VKLJUČITEV TE GENETSKE KARTE Z ZEMLJEVIDOM POVEZAVE, KI GA SESTAVLJA 127 MIKROSATELITOV. ZA DOSEGO TEGA CILJA BO BACS PRISTANE 127 MICROSTELLITS SE NAHAJA IN ISLATED OBLIKI TEH KNJIŽNICO, REZULTAT V POVEČANJE GOSTOTE ZEMLJEVIDA, POLEG INTEGRACIJE. V PREJŠNJEM PROJEKTU, ZA KATEREGA JE BILA IZVEDENA OBNOVA, JE BIL ODKRIT MOŽEN SPOLNI PROTO-KROMOSOM V PODPLATU, KI BI BIL PAR 1. GENETSKA DOLOČITEV SPOLA JE POGOSTO POVEZANA Z NASTAJANJEM SPOLNIH KROMOSOMOV, KI NOSIJO GLAVNI GEN, ODGOVOREN ZA DOLOČANJE SPOLA. V PODPLATU JE DOLOČANJE SPOLA XX/XY, VENDAR NI HETEROMORFNIH SPOLNIH KROMOSOMOV. ZATO SE PREDLAGA MIKRODISEKCIJA PARA 1, KI GA JE MOGOČE ZLAHKA PREPOZNATI POD MIKROSKOPOM, KER JE NAJVEČJI METACENTRIČNI PAR IN NJEGOVO SEKVENCIRANJE PRI SAMCIH IN SAMICAH ZA PRIMERJAVO ZAPOREDIJ IN IZ RAZLIK, KI KAŽEJO NA PRISOTNOST REGIJE IN/ALI SPOLA, KI DOLOČA GENE. V RIBOGOJSTVU JE BISTVENO POZNATI MEHANIZME DOLOČANJA SPOLA, PRI ČEMER JE TREBA UPOŠTEVATI TUDI, DA OBSTAJAJO ZNAČILNOSTI, KOT JE RAST, KI PREDSTAVLJAJO SPOLNI DIMORFIZEM. POLEG TEGA POZNAVANJE TEGA MEHANIZMA OMOGOČA USTREZNO UPRAVLJANJE REJSKIH ZALOG. POLEG TEGA SE PREDLAGA ŠTUDIJA IZOLIRANIH NCRNK (LNCRNA IN MIRNA) IZ ZRELIH MOŠKIH IN ŽENSKIH SPOLNIH ŽLEZ, KI IŠČEJO MIRNA, KI URAVNAVAJO AKTIVNOST SPECIFIČNIH GENOV, KI SODELUJEJO PRI DOLOČANJU/DIFERENCIACIJI SPOLA IN RAZMNOŽEVANJA. POGLOBITEV ZNANJA O TEM MEHANIZMU BO OMOGOČILA VZPOSTAVITEV ŠTUDIJ SYNTENIA Z DRUGIMI VRSTAMI IN RAZŠIRITEV REZULTATOV NA VRSTE, KI SO POMEMBNE V RIBOGOJSTVU. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
SOLA SENEGALU JEST JEDNYM Z GATUNKÓW NAJBARDZIEJ CENIONYCH GOSPODARCZO W AKWAKULTURZE, PONIEWAŻ POTROI CENĘ INNYCH GATUNKÓW HANDLOWYCH I JEST DOBRYM KANDYDATEM NA DYWERSYFIKACJĘ RYNKÓW EUROPEJSKICH, NASYCONĄ NADPRODUKCJĄ MORLESZA I LABRAKSA, A JEGO UPRAWA ROZPRZESTRZENIŁA SIĘ NA KILKA WSPÓLNOT AUTONOMICZNYCH. ALE W PORÓWNANIU Z TYM, CO DZIEJE SIĘ U INNYCH GATUNKÓW PŁASTUGOKSZTAŁTNYCH, BADANIA GENOMOWE SOLI SĄ NADAL OGRANICZONE. GATUNEK TEN CHARAKTERYZUJE SIĘ KARIOTYPEM Z 42 CHROMOSOMAMI I 48 RAMIONAMI CHROMOSOMOWYMI ROZMIESZCZONYMI W 3 PARACH METACENTRYCZNYCH, 2 PARACH SUBMETACENTRYCZNYCH, 4 PARACH SUBTELOCENTRYCZNYCH I 12 AKROCENTRYCZNYCH PARACH CHROMOSOMOWYCH. PODCZAS OPRACOWYWANIA DWÓCH KOLEJNYCH PROJEKTÓW, W ODNIESIENIU DO KTÓRYCH WNIOSKUJE SIĘ OBECNIE O RENOWACJĘ, GRUPA UCA OPRACOWAŁA FIZYCZNĄ MAPĘ SOLEA SENEGALENSIS, SKŁADAJĄCĄ SIĘ Z OKOŁO 100 BACS, WCZEŚNIEJ SEKWENCJONOWANYCH I ROZMIESZCZONYCH W CHROMOSOMACH SOLI PRZEZ WIELE RYB. TERAZ MAMY MARKERY CHROMOSOMALNE DLA 21 PAR W JEDYNYM GENOMIE. W PROJEKCIE PROPONUJE SIĘ ZINTEGROWANIE TEJ MAPY GENETYCZNEJ Z MAPĄ POWIĄZAŃ SKŁADAJĄCĄ SIĘ ZE 127 MIKROSATELITÓW. ABY OSIĄGNĄĆ TEN CEL, BACS PORTING 127 MICROSTELLITS BĘDZIE ZLOKALIZOWANY I ISLATED Z BIBLIOTEKI TEH, WYNIKAJĄC Z INKREMENTU GĘSTOŚCI MAPY, OPRÓCZ INTEGRACJI. W POPRZEDNIM PROJEKCIE, DLA KTÓREGO ODNOWIONO APLIED, ODKRYTO EWENTUALNY PROTOCHROMOSOM SEKSUALNY W PODESZWIE, KTÓRY BYŁBY PARĄ 1. GENETYCZNE OKREŚLENIE PŁCI JEST CZĘSTO ZWIĄZANE Z TWORZENIEM CHROMOSOMÓW PŁCIOWYCH, KTÓRE NIOSĄ GEN GŁÓWNY ODPOWIEDZIALNY ZA OKREŚLANIE PŁCI. W JEDYNEJ DETERMINACJI PŁCIOWEJ JEST XX/XY, ALE NIE MA CHROMOSOMÓW PŁCIOWYCH HETEROMORFICZNYCH. W ZWIĄZKU Z TYM PROPONUJE SIĘ MIKRODYSSEKCJĘ PARY 1, KTÓRĄ MOŻNA ŁATWO ZIDENTYFIKOWAĆ POD MIKROSKOPEM, PONIEWAŻ JEST TO NAJWIĘKSZA PARA METACENTRYCZNA I JEJ SEKWENCJONOWANIE U SAMCÓW I SAMIC W CELU PORÓWNANIA SEKWENCJI I RÓŻNIC, Z KTÓRYCH WYNIKA OBECNOŚĆ GENÓW OKREŚLAJĄCYCH REGION I/LUB PŁEĆ. W AKWAKULTURZE ISTOTNE JEST POZNANIE MECHANIZMÓW DETERMINACJI PŁCIOWEJ, BIORĄC RÓWNIEŻ POD UWAGĘ, ŻE ISTNIEJĄ CECHY TAKIE JAK WZROST, KTÓRY WYSTĘPUJE W ZWIĄZKU Z DYMORFIZMEM SEKSUALNYM. PONADTO ZNAJOMOŚĆ TEGO MECHANIZMU UMOŻLIWIA ODPOWIEDNIE ZARZĄDZANIE ZAPASAMI HODOWCÓW. PONADTO PROPONUJE SIĘ BADANIE NCRNAS WYIZOLOWANYCH (LNCRNA I MIRNA) OD DOJRZAŁYCH GONAD PŁCI MĘSKIEJ I ŻEŃSKIEJ POSZUKUJĄCYCH MIRNA, KTÓRE REGULUJĄ AKTYWNOŚĆ OKREŚLONYCH GENÓW ZAANGAŻOWANYCH W OKREŚLANIE/ZRÓŻNICOWANIE PŁCI I ROZRODCZOŚCI. POGŁĘBIENIE WIEDZY NA TEMAT TEGO MECHANIZMU POZWOLI NA USTANOWIENIE BADAŃ SYNTENII Z INNYMI GATUNKAMI I ROZSZERZENIE WYNIKÓW NA GATUNKI MAJĄCE ZNACZENIE W AKWAKULTURZE. (Polish)
17 August 2022
0 references
Cádiz
0 references
Identifiers
RTI2018-096847-B-C21
0 references