MECHANISMS OF ACTION OF THE HUMAN MICROBIOME: FROM GENETIC SEQUENCES TO IMMUNOMODULATORY PEPTIDES (Q3149933)
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Project Q3149933 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | MECHANISMS OF ACTION OF THE HUMAN MICROBIOME: FROM GENETIC SEQUENCES TO IMMUNOMODULATORY PEPTIDES |
Project Q3149933 in Spain |
Statements
116,160.0 Euro
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145,200.0 Euro
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80.0 percent
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1 January 2014
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31 December 2017
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AGENCIA CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
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43°28'52.79"N, 5°26'0.46"W
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33076
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ESTE PROYECTO CONTIENE LO QUE PRETENDE SER EL COMIENZO DE MI ANDADURA COMO INVESTIGADOR RAMON Y CAJAL EN LA UNIVERSIDAD DE VIGO. DURANTE MIS ULTIMOS CINCO AÑOS DE INVESTIGACION ME HE INTERESADO POR EL ESTUDIO Y CARACTERIZACION DE LAS PROTEINAS EXTRACELULARES DE BACTERIAS PROBIOTICAS COMO MEDIADORES DE LA COMUNICACION INTERCELULAR ENTRE ELLAS Y LAS CELULAS INMUNES Y EPITELIALES DE LA MUCOSA INTESTINAL. RECIENTEMENTE HEMOS DESCUBIERTO UNA NUEVA FAMILIA DE PEPTIDOS INMUNOMODULADORES ENCRIPTADOS DENTRO DE PROTEINAS EXTRACELULARES SECRETADAS POR PROBIOTICOS, SIN PUNTOS DE CORTE PARA LAS PRINCIPALES PROTEASAS INTESTINALES, Y QUE SERIAN LIBERADOS DEL MISMO MODO QUE LOS PEPTIDOS BIOACTIVOS DERIVADOS DE LAS PROTEINAS LACTEAS._x000D_ EN ESTE PROYECTO DE INVESTIGACION PLANTEO AHONDAR EN LA DESCRIPCION Y CARACTERIZACION DE ESTOS PEPTIDOS ENCRIPTADOS. QUEREMOS ESTUDIAR SU ABUNDANCIA EN EL EXOPROTEOMA DEL MICROBIOMA HUMANO (IN SILICO) UTILIZANDO SOLO LAS SECUENCIAS GENETICAS DISPONIBLES. POSTERIORMENTE SE CARACTERIZARAN LOS DISTINTOS TIPOS DE BIOACTIVIDAD DE LOS DISTINTOS PEPTIDOS ORIGINADOS POR DIGESTION INTESTINAL SIMULADA, DESDE UN PUNTO DE VISTA TEORICO, UTILIZANDO DISTINTAS HERRAMIENTAS INFORMATICAS. DE ENTRE LOS PEPTIDOS ENCONTRADOS, SELECCIONAREMOS LOS 20 QUE PRESENTEN UN MAYOR POTENCIAL ANTIINFLAMATORIO. POSTERIORMENTE ESTABLECEREMOS SU EFECTO SOBRE CELULAS DENDRITICAS MEDIANTE LAS TECNICAS OMICAS RNA-SEQ Y MBD O CHIP-SEQ. ESTAS TECNICAS NOS DARAN INFORMACION DE LA ACCION DE LOS PEPTIDOS DESDE UN PUNTO DE VISTA TRANSCRIPCIONAL, EPIGENETICO Y REGULADOR. HE DE RESALTAR QUE ADQUIRIRE EXPERIENCIA EN ESTAS TECNICAS GRACIAS A UN PROYECTO DE MOVILIDAD, CONCEDIDO A CARGO DEL FP7 EUROPEO, Y EN EL QUE ESTUDIARE LOS MECANISMOS DE INVASION DE LA BACTERIA RALSTONIA SOLANACEARUM DURANTE 2014._x000D_ LOS RESULTADOS DE ESTA LINEA DE INVESTIGACION PROPORCIONARAN LA BASE CIENTIFICA PARA ABORDAR EL DESARROLLO DE NUEVOS ALIMENTOS FUNCIONALES BASADOS EN PEPTIDOS BIOACTIVOS, DERIVADOS DE LAS SECUENCIAS GENETICAS DEL MICROBIOMA HUMANO. ESTOS ALIMENTOS ESTARIAN DIRIGIDOS TANTO A LA PREVENCION DE ENFERMEDADES GASTROINTESTINALES DE TIPO AUTOINMUNE E INFLAMATORIO COMO AL ALIVIO DE SUS SINTOMAS EN PACIENTES ENFERMOS. ESTO TENDRIA UNA REPERCUSION DIRECTA DISMINUYENDO LOS COSTES SANITARIOS DE LOS TRATAMIENTOS Y AUMENTANDO LA CALIDAD DE VIDA DE LOS ENFERMOS._x000D_ ESTE PROYECTO LO APOYA A TIEMPO COMPLETO LA DRA ANALIA LOURENÇO, PROFESORA ASOCIADA DEL DEPARTAMENTO DE INFORMATICA, Y A TIEMPO PARCIAL DEL DR. FLORENTINO RIVEROLA, PERTENECIENTES AL GRUPO DE SISTEMAS INFORMATICOS DE NUEVA GENERACION. AMBOS TIENEN AMPLIA EXPERIENCIA EN EL MANEJO DE BASES DE DATOS DE PEPTIDOS BIOACTIVOS Y DE BIOLOGIA DE SISTEMAS, ASI COMO EN EL DESARROLLO DE HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS, Y ADEMAS EL DR. RIVEROLA ES EL DIRECTOR DEL DEPARTAMENTO. CONSIDERO QUE SON PERFECTOS PARA COMENZAR ESTA NUEVA LINEA QUE INTEGRA BIOLOGIA MOLECULAR, BIOLOGIA CELULAR, OMICAS Y BIOINFORMATICA. LOS EXPERIMENTOS DE BIOLOGIA CELULAR SE REALIZARAN UTILIZANDO CELULAS DENDRITICAS (CDS) IN VITRO, EN EL LABORATORIO DE LINEAS CELULARES DEL IPLA-CSIC. FINALMENTE QUISIERA DESTACAR QUE ESTE PROYECTO CUENTA CON EL APOYO DE INVESTIGADORES DE RECONOCIDO PRESTIGIO EN INMUNOLOGIA (DRA. STELLA KNIGHT, IMPERIAL COLLEGE LONDON), EN MICROBIOLOGIA DE ALIMENTOS (DR. SIMON CARDING, INSTITUTE OF FOOD RESEARCH, NORWICH), EN ALIMENTACION FUNCIONAL (DR. HAIDONG TAN, GLYBOBIO LTD.) Y DE LA ASOCIACION ESPAÑOLA DE ENFERMEDAD DE CROHN Y COLITIS ULCEROSA. (Spanish)
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THIS PROJECT CONTAINS WHAT IS INTENDED TO BE THE BEGINNING OF MY CAREER AS A RESEARCHER RAMON Y CAJAL AT THE UNIVERSITY OF VIGO. DURING MY LAST FIVE YEARS OF RESEARCH I HAVE BEEN INTERESTED IN THE STUDY AND CHARACTERISATION OF THE EXTRACELLULAR PROTEINS OF PROBIOTIC BACTERIA AS MEDIATORS OF THE INTERCELLULAR COMMUNICATION BETWEEN THEM AND THE IMMUNE AND EPITHELIAL CELLS OF THE INTESTINAL MUCOSA. Recently we have uncovered a new FAMILY OF encrypted immunomodulatory PEPTIDs DENTER OF EXTRACULAR PROTEINS SECRETATED BY PROBIOTICS, WITHOUT COURT POINTS FOR PRINCIPLE INTESTINAL PROTEASES, AND WE WILL BE FREEED OF THE SAME MODE OF THE BIOACTIVE PEPTIDS DERIVED OF LACTE PROTEIN PROTEINS._x000D_ in this PLANT RESEARCH PROJECT to delve deeper into the description and CHARACTERISATION of these encrypted PEPTIDs. WE WANT TO STUDY ITS ABUNDANCE IN THE EXOPROTEOMA OF THE HUMAN MICROBIOME (IN SILICO) USING ONLY THE AVAILABLE GENETIC SEQUENCES. SUBSEQUENTLY, THE DIFFERENT TYPES OF BIOACTIVITY OF THE DIFFERENT PEPTIDES ORIGINATED BY SIMULATED INTESTINAL DIGESTION WILL BE CHARACTERISED, FROM A THEORETICAL POINT OF VIEW, USING DIFFERENT COMPUTER TOOLS. FROM AMONG THE PEPTIDES FOUND, WE WILL SELECT THE 20 WITH THE GREATEST ANTI-INFLAMMATORY POTENTIAL. LATER WE WILL ESTABLISH ITS EFFECT ON DENDRITIC CELLS USING THE OMIC TECHNIQUES RNA-SEQ AND MBD OR CHIP-SEQ. THESE TECHNIQUES WILL GIVE US INFORMATION ON THE ACTION OF PEPTIDES FROM A TRANSCRIPTIONAL, EPIGENETIC AND REGULATORY POINT OF VIEW. I must stress that I will acquire experience in these technical graces to a project of mobility, granted at the expense of the European FP7, and in which I will study the INVESTMENT MECHANISMS OF THE RALSTONIA solanacearum DURANTE BACTERIA 2014._x000D_ The results of this research line will provide the base SCIENTIFICATION FOR ABOUT THE DEVELOPMENT OF NEW FUNCIONAL FOODS BASED IN BIOACTIVE PEPTIDS, DERIVED OF THE GENETIC SECUTIONS OF THE HUMAN MICROBIOMA. THESE FOODS WOULD BE AIMED BOTH AT THE PREVENTION OF AUTOIMMUNE AND INFLAMMATORY GASTROINTESTINAL DISEASES AND AT THE RELIEF OF THEIR SYMPTOMS IN SICK PATIENTS. This would have a direct repercussion by reducing the health costs of the treatment and increasing the quality of life of children._x000D_ this project supports it in full time by DRA ANALIA LOURENÇO, associated PROFESSIONAL OF INFORMATION DEPARTAMENT, AND PARTIAL TIME OF DR. FLORENTINO Riverola, PERTENECENT TO THE GROUP OF NEW GENERATION INFORMATION SYSTEMS. BOTH HAVE EXTENSIVE EXPERIENCE IN THE MANAGEMENT OF BIOACTIVE PEPTIDES DATABASES AND SYSTEMS BIOLOGY, AS WELL AS IN THE DEVELOPMENT OF BIOINFORMATICS TOOLS, AND DR. RIVEROLA IS THE DIRECTOR OF THE DEPARTMENT. I THINK THEY ARE PERFECT TO START THIS NEW LINE THAT INTEGRATES MOLECULAR BIOLOGY, CELLULAR BIOLOGY, OMICAS AND BIOINFORMATICA. CELL BIOLOGY EXPERIMENTS WILL BE PERFORMED USING IN VITRO DENDRITIC CELLS (CDS) IN THE CELL LINES LABORATORY OF IPLA-CSIC. FINALLY, I WOULD LIKE TO EMPHASISE THAT THIS PROJECT HAS THE SUPPORT OF RENOWNED RESEARCHERS IN IMMUNOLOGY (DR. STELLA KNIGHT, IMPERIAL COLLEGE LONDON), IN FOOD MICROBIOLOGY (DR. SIMON CARDING, INSTITUTE OF FOOD RESEARCH, NORWICH), IN FUNCTIONAL FEEDING (DR. HAIDONG TAN, GLYBOBIO LTD.) AND THE SPANISH ASSOCIATION OF CROHN’S DISEASE AND ULCERATIVE COLITIS. (English)
12 October 2021
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CE PROJET CONTIENT CE QUI EST PRÉVU POUR ÊTRE LE DÉBUT DE MA CARRIÈRE DE CHERCHEUR RAMON Y CAJAL À L’UNIVERSITÉ DE VIGO. AU COURS DE MES CINQ DERNIÈRES ANNÉES DE RECHERCHE, J’AI ÉTÉ INTÉRESSÉ PAR L’ÉTUDE ET LA CARACTÉRISATION DES PROTÉINES EXTRACELLULAIRES DES BACTÉRIES PROBIOTIQUES EN TANT QUE MÉDIATEURS DE LA COMMUNICATION INTERCELLULAIRE ENTRE ELLES ET LES CELLULES IMMUNITAIRES ET ÉPITHÉLIALES DE LA MUQUEUSE INTESTINALE. Récemment, nous avons découvert une nouvelle FAMILLE DE peptidés immunomodulateurs cryptés Denter of EXTRACULAR PROTEINS SECRETATED PAR PROBIOTICS, SANS POINTS DU TRIBUNAL POUR LES protéases INTESTINALES PRINCIPLES, ET NOUS NOUS ÊTRE LIBRE DU MÊME MODE DES PEPTIDES BIOACTIVES DERIVES DES PROTEINS PROTEIN PROTEIN._x000D_ dans ce PROJET DE RECHERCHE PLANTE pour approfondir la description et la CHARACTERISATION de ces peptidés cryptés. NOUS VOULONS ÉTUDIER SON ABONDANCE DANS L’EXOPROTEOMA DU MICROBIOME HUMAIN (IN SILICO) EN UTILISANT UNIQUEMENT LES SÉQUENCES GÉNÉTIQUES DISPONIBLES. PAR LA SUITE, LES DIFFÉRENTS TYPES DE BIOACTIVITÉ DES DIFFÉRENTS PEPTIDES ISSUS DE LA DIGESTION INTESTINALE SIMULÉE SERONT CARACTÉRISÉS, D’UN POINT DE VUE THÉORIQUE, À L’AIDE DE DIFFÉRENTS OUTILS INFORMATIQUES. PARMI LES PEPTIDES TROUVÉS, NOUS SÉLECTIONNERONS LES 20 AVEC LE PLUS GRAND POTENTIEL ANTI-INFLAMMATOIRE. PLUS TARD, NOUS ÉTABLIRONS SON EFFET SUR LES CELLULES DENDRITIQUES EN UTILISANT LES TECHNIQUES ATOMIQUES RNA-SEQ ET MBD OU CHIP-SEQ. CES TECHNIQUES NOUS DONNERONT DES INFORMATIONS SUR L’ACTION DES PEPTIDES D’UN POINT DE VUE TRANSCRIPTIONNEL, ÉPIGÉNÉTIQUE ET RÉGLEMENTAIRE. Je tiens à souligner que j’acquérirai de l’expérience dans ces grâces techniques à un projet de mobilité, accordé aux dépens du 7e PC européen et dans lequel j’étudierai les MÉCÉNIS D’INVESTISSEMENT DE LA RALSTONIA solanacearum DURANTE BACTERIA 2014._x000D_ Les résultats de cette recherche fourniront la base scientifique pour le développement de nouveaux fOODS fongiques dans les peptids BIOACTIVES, DERIVED DES sécutions GENETIQUES DU microbiome humain. CES ALIMENTS SERAIENT DESTINÉS À LA FOIS À LA PRÉVENTION DES MALADIES GASTRO-INTESTINALES AUTO-IMMUNES ET INFLAMMATOIRES ET AU SOULAGEMENT DE LEURS SYMPTÔMES CHEZ LES PATIENTS MALADES. Cela aurait une répercussion directe en réduisant les coûts de santé du traitement et en améliorant la qualité de vie des enfants._x000D_ ce projet le soutient à temps plein par DRA ANALIA LOURENÇO, PROFESSIONNEL associé DU DÉPARTAMENT D’INFORMATION, ET TEMPS PARTIEL DU DR. Florentino Riverola, PERTENECENT AU GROUPE DES NOUVELLES SYSTÈMES D’INFORMATION GENÉRATION. TOUS DEUX POSSÈDENT UNE VASTE EXPÉRIENCE DE LA GESTION DES BASES DE DONNÉES SUR LES PEPTIDES BIOACTIFS ET DE LA BIOLOGIE DES SYSTÈMES, AINSI QUE DE LA MISE AU POINT D’OUTILS DE BIOINFORMATIQUE, ET DR. RIVEROLA EST LE DIRECTEUR DU DÉPARTEMENT. JE PENSE QU’ILS SONT PARFAITS POUR DÉMARRER CETTE NOUVELLE LIGNE QUI INTÈGRE LA BIOLOGIE MOLÉCULAIRE, LA BIOLOGIE CELLULAIRE, LES OMICAS ET BIOINFORMATICA. DES EXPÉRIENCES EN BIOLOGIE CELLULAIRE SERONT RÉALISÉES À L’AIDE DE CELLULES DENDRITIQUES IN VITRO (CD) DANS LE LABORATOIRE DES LIGNÉES CELLULAIRES DE L’IPLA-CSIC. ENFIN, JE TIENS À SOULIGNER QUE CE PROJET BÉNÉFICIE DU SOUTIEN DE CHERCHEURS RENOMMÉS EN IMMUNOLOGIE (DR. STELLA KNIGHT, IMPERIAL COLLEGE DE LONDRES), EN MICROBIOLOGIE ALIMENTAIRE (DR. SIMON CARDING, INSTITUT DE RECHERCHE ALIMENTAIRE, NORWICH), EN ALIMENTATION FONCTIONNELLE (DR. HAIDONG TAN, GLYBOBIO LTD.) ET L’ASSOCIATION ESPAGNOLE DE LA MALADIE DE CROHN ET DE LA COLITE ULCÉREUSE. (French)
2 December 2021
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DIESES PROJEKT BEINHALTET, WAS DER BEGINN MEINER KARRIERE ALS FORSCHER RAMON Y CAJAL AN DER UNIVERSITÄT VON VIGO SEIN SOLL. IN MEINEN LETZTEN FÜNF JAHREN DER FORSCHUNG WAR ICH AN DER UNTERSUCHUNG UND CHARAKTERISIERUNG DER EXTRAZELLULÄREN PROTEINE PROBIOTISCHER BAKTERIEN ALS VERMITTLER DER INTERZELLULÄREN KOMMUNIKATION ZWISCHEN IHNEN UND DEN IMMUN- UND EPITHELZELLEN DER DARMSCHLEIMHAUT INTERESSIERT. Vor kurzem haben wir eine neue FAMILIE der verschlüsselten immunmodulatorischen peptids Denter OF EXTRACULAR PROTEINS SECRETATED BY PROBIOTICS, OHNE COURT POINTS FÜR PRINCIPLE INTESTINAL Proteasen, und wir werden von der SAME MODE DER BIOACTIVE Peptids DER LEBEN PROTEINEN PROTEINS._x000D_ in diesem PLANT RESEARCH PROJECT tiefer in die Beschreibung und CHARACTERISIERUNG dieser verschlüsselten peptids eintauchen. WIR WOLLEN SEINE FÜLLE IM EXOPROTEOMA DES MENSCHLICHEN MIKROBIOMS (IN SILICO) NUR UNTER VERWENDUNG DER VERFÜGBAREN GENETISCHEN SEQUENZEN UNTERSUCHEN. ANSCHLIESSEND WERDEN DIE VERSCHIEDENEN ARTEN DER BIOAKTIVITÄT DER VERSCHIEDENEN PEPTIDE, DIE DURCH SIMULIERTE DARMVERDAUUNG ENTSTANDEN SIND, THEORETISCH MIT HILFE UNTERSCHIEDLICHER COMPUTERWERKZEUGE CHARAKTERISIERT. UNTER DEN GEFUNDENEN PEPTIDEN WERDEN WIR DIE 20 MIT DEM GRÖSSTEN ENTZÜNDUNGSHEMMENDEN POTENZIAL AUSWÄHLEN. SPÄTER WERDEN WIR IHRE WIRKUNG AUF DIE DENDRITISCHEN ZELLEN MITHILFE DER OMIC TECHNIKEN RNA-SEQ UND MBD ODER CHIP-SEQ ERMITTELN. DIESE TECHNIKEN GEBEN UNS INFORMATIONEN ÜBER DIE WIRKUNG VON PEPTIDEN AUS TRANSCRIPTIONALER, EPIGENETISCHER UND REGULATORISCHER SICHT. Ich muss betonen, dass ich Erfahrung in diesen technischen Gnaden zu einem Projekt der Mobilität erwerben werde, das auf Kosten des Europäischen RP7 gewährt wird, und in dem ich die INVESTMENT MECHANISMS OF THE RALSTONIA solanacearum DURANTE BACTERIA 2014 studieren werde._x000D_ Die Ergebnisse dieser Forschungslinie werden die Grundlagenforschung für die Entwicklung neuer Pilze liefern, die in BIOACTIVE Peptiden, DERIVED OF THE GENETIC Secutions OF THE HUMAN Microbioma, EINER GENETIC Secutions OF THE HUMAN Microbioma. DIESE LEBENSMITTEL WÜRDEN SOWOHL AUF DIE PRÄVENTION VON AUTOIMMUN- UND ENTZÜNDLICHEN MAGEN-DARM-ERKRANKUNGEN ALS AUCH AUF DIE LINDERUNG IHRER SYMPTOME BEI KRANKEN PATIENTEN ABZIELEN. Dies hätte direkte Auswirkungen auf die Senkung der Gesundheitskosten der Behandlung und die Verbesserung der Lebensqualität von Kindern._x000D_ dieses Projekt unterstützt es in Vollzeit durch DRA ANALIA LOURENÇO, assoziierte PROFESSIONAL OF INFORMATIONEN DEPARTAMENT, UND PARTIAL TIME von DR. Florentino Riverola, PERTENECENT IN DER GENERATION INFORMATIONEN SYSTEME. BEIDE VERFÜGEN ÜBER UMFANGREICHE ERFAHRUNG IM MANAGEMENT BIOAKTIVER PEPTIDE-DATENBANKEN UND SYSTEMBIOLOGIE SOWIE IN DER ENTWICKLUNG VON BIOINFORMATIK-TOOLS, UND DR. RIVEROLA IST DIREKTOR DER ABTEILUNG. ICH DENKE, SIE SIND PERFEKT, UM DIESE NEUE LINIE ZU STARTEN, DIE MOLEKULARBIOLOGIE, ZELLBIOLOGIE, OMICAS UND BIOINFORMATICA INTEGRIERT. ZELLBIOLOGIE-EXPERIMENTE WERDEN MIT IN-VITRO-DENDRITISCHEN ZELLEN (CDS) IM ZELLLINIENLABOR VON IPLA-CSIC DURCHGEFÜHRT. ABSCHLIESSEND MÖCHTE ICH BETONEN, DASS DIESES PROJEKT VON RENOMMIERTEN FORSCHERN IN DER IMMUNOLOGIE (DR) UNTERSTÜTZT WIRD. STELLA KNIGHT, IMPERIAL COLLEGE LONDON), IN LEBENSMITTELMIKROBIOLOGIE (DR. SIMON CARDING, INSTITUT FÜR LEBENSMITTELFORSCHUNG, NORWICH), IN DER FUNKTIONSFÜTTERUNG (DR. HAIDONG TAN, GLYBOBIO LTD.) UND DER SPANISCHEN VEREINIGUNG FÜR MORBUS CROHN UND COLITIS ULCEROSA. (German)
9 December 2021
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DIT PROJECT BEVAT HET BEGIN VAN MIJN CARRIÈRE ALS ONDERZOEKER RAMON Y CAJAL AAN DE UNIVERSITEIT VAN VIGO. GEDURENDE MIJN LAATSTE VIJF JAAR ONDERZOEK BEN IK GEÏNTERESSEERD GEWEEST IN DE STUDIE EN KARAKTERISERING VAN DE EXTRACELLULAIRE EIWITTEN VAN PROBIOTISCHE BACTERIËN ALS BEMIDDELAARS VAN DE INTERCELLULAIRE COMMUNICATIE TUSSEN HEN EN DE IMMUUN- EN EPITHELIALE CELLEN VAN HET DARMSLIJMVLIES. Onlangs hebben we een nieuwe FAMILY VAN gecodeerde immunomodulerende peptids Denter van EXTRACULAR PROTEINS SECRETATED BY PROBIOTICS, zonder COURT POINTS VOOR PRINCIPLE INTESTINAL proteases, en we zullen worden vrijgemaakt van de SAME MODE van de BIOACTIVE peptids DERIVED van lacte PROTEIN PROTEINS._x000D_ in deze PLANT RESEARCH PROJECT om dieper te verdiepen in de beschrijving en CHARACTERISATION van deze gecodeerde peptids. WE WILLEN DE OVERVLOED ERVAN BESTUDEREN IN DE EXOPROTEOMA VAN HET MENSELIJKE MICROBIOME (IN SILICO) MET BEHULP VAN ALLEEN DE BESCHIKBARE GENETISCHE SEQUENTIES. VERVOLGENS ZULLEN DE VERSCHILLENDE SOORTEN BIOACTIVITEIT VAN DE VERSCHILLENDE PEPTIDEN ONTSTAAN DOOR GESIMULEERDE DARMVERTERING, VANUIT EEN THEORETISCH OOGPUNT, MET BEHULP VAN VERSCHILLENDE COMPUTERHULPMIDDELEN. VAN ONDER DE GEVONDEN PEPTIDEN, ZULLEN WIJ DE 20 MET HET GROOTSTE ONTSTEKINGSREMMEND POTENTIEEL SELECTEREN. LATER ZULLEN WE HET EFFECT ERVAN OP DENDRITISCHE CELLEN VASTSTELLEN MET BEHULP VAN DE OMIC TECHNIEKEN RNA-SEQ EN MBD OF CHIP-SEQ. DEZE TECHNIEKEN GEVEN ONS INFORMATIE OVER DE WERKING VAN PEPTIDEN VANUIT EEN TRANSCRIPTIONEEL, EPIGENETISCH EN REGELGEVEND STANDPUNT. Ik moet benadrukken dat ik ervaring zal opdoen in deze technische genaden aan een mobiliteitsproject, toegekend ten koste van het Europese KP7, en waarin ik de INNVESTMENT MECHANISMS van de RALSTONIA solanacearum DURANTE BACTERIA 2014 zal bestuderen._x000D_ De resultaten van deze onderzoekslijn zullen de basis vormen voor de wetenschappelijk basis voor de ONTWIKKELING VAN NIEUWE funcional FOODS BASED IN BIOACTIVE peptids, DERIVED OF THE GENETIC secutions OF THE HUMAN microbioom. DEZE VOEDINGSMIDDELEN ZOUDEN ZOWEL GERICHT ZIJN OP DE PREVENTIE VAN AUTO-IMMUUN- EN ONTSTEKINGSGASTRO-INTESTINALE ZIEKTEN ALS OP DE VERLICHTING VAN HUN SYMPTOMEN BIJ ZIEKE PATIËNTEN. Dit zou een directe repercussie hebben door het verlagen van de gezondheidskosten van de behandeling en het verhogen van de kwaliteit van leven van kinderen._x000D_ dit project ondersteunt het in full time door DRA ANALIA LOURENÇO, geassocieerd PROFESSIONAL OF INFORMATION DEPARTAMENT, EN PARTIAL TIME OF DR. Florentino Riverola, PERTENECENT TO THE GROUP OF NEW GENERATION INFORMATION SYSTEMS. BEIDE HEBBEN RUIME ERVARING IN HET BEHEER VAN BIOACTIEVE PEPTIDES DATABASES EN SYSTEMEN BIOLOGIE, EVENALS IN DE ONTWIKKELING VAN BIO-INFORMATICA TOOLS, EN DR. RIVEROLA IS DE DIRECTEUR VAN DE AFDELING. IK DENK DAT ZE PERFECT ZIJN OM DEZE NIEUWE LIJN TE STARTEN DIE MOLECULAIRE BIOLOGIE, CELLULAIRE BIOLOGIE, OMICAS EN BIOINFORMATICA INTEGREERT. CELBIOLOGIEEXPERIMENTEN ZULLEN WORDEN UITGEVOERD MET BEHULP VAN IN VITRO DENDRITISCHE CELLEN (CD’S) IN HET CELLIJNENLABORATORIUM VAN IPLA-CSIC. TOT SLOT WIL IK BENADRUKKEN DAT DIT PROJECT DE STEUN KRIJGT VAN GERENOMMEERDE ONDERZOEKERS OP HET GEBIED VAN IMMUNOLOGIE (DR. STELLA KNIGHT, IMPERIAL COLLEGE LONDON), VOEDSELMICROBIOLOGIE (DR. SIMON CARDING, INSTITUUT VOOR VOEDSELONDERZOEK, NORWICH), FUNCTIONELE VOEDING (DR. HAIDONG TAN, GLYBOBIO LTD.) EN DE SPAANSE VERENIGING VAN CROHN’S ZIEKTE EN COLITIS ULCEROSA. (Dutch)
17 December 2021
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QUESTO PROGETTO CONTIENE QUELLO CHE È DESTINATO AD ESSERE L'INIZIO DELLA MIA CARRIERA COME RICERCATORE RAMON Y CAJAL PRESSO L'UNIVERSITÀ DI VIGO. DURANTE I MIEI ULTIMI CINQUE ANNI DI RICERCA MI SONO INTERESSATO ALLO STUDIO E ALLA CARATTERIZZAZIONE DELLE PROTEINE EXTRACELLULARI DEI BATTERI PROBIOTICI COME MEDIATORI DELLA COMUNICAZIONE INTERCELLULARE TRA LORO E LE CELLULE IMMUNI ED EPITELIALI DELLA MUCOSA INTESTINALE. Recentemente abbiamo scoperto una nuova FAMIGLIA DI Peptidi immunomodulatori crittografati Denter of EXTRACULAR PROTEINS SECRETATED DA PROBIOTICS, SENZA CORTI PER PROTEIE PRINCIPALI INTESTINALI, E saremo liberi dello stesso modello dei peptidi BIOACTIVE DERIVED DI PROTEINS PROTEINS._x000D_ in questo PROGETTO DI RICERCA PLANT per approfondire la descrizione e la CHARACTERISATION di questi peptidi crittografati. VOGLIAMO STUDIARE LA SUA ABBONDANZA NELL'EXOPROTEOMA DEL MICROBIOMA UMANO (IN SILICO) UTILIZZANDO SOLO LE SEQUENZE GENETICHE DISPONIBILI. SUCCESSIVAMENTE, I DIVERSI TIPI DI BIOATTIVITÀ DEI DIVERSI PEPTIDI ORIGINATI DALLA DIGESTIONE INTESTINALE SIMULATA SARANNO CARATTERIZZATI, DA UN PUNTO DI VISTA TEORICO, UTILIZZANDO DIVERSI STRUMENTI INFORMATICI. TRA I PEPTIDI TROVATI, SELEZIONEREMO I 20 CON IL PIÙ GRANDE POTENZIALE ANTINFIAMMATORIO. SUCCESSIVAMENTE STABILIREMO IL SUO EFFETTO SULLE CELLULE DENDRITICHE UTILIZZANDO LE TECNICHE OMICHE RNA-SEQ E MBD O CHIP-SEQ. QUESTE TECNICHE CI DARANNO INFORMAZIONI SULL'AZIONE DEI PEPTIDI DA UN PUNTO DI VISTA TRASCRIZIONALE, EPIGENETICO E NORMATIVO. Devo sottolineare che acquisirò esperienza in queste grazie tecniche ad un progetto di mobilità, concesso a spese del 7º PQ europeo e nel quale studierò i MECANISMI DI INVESTAZIONE DELLA RALSTONIA solanacearum DURANTE BACTERIA 2014._x000D_ I risultati di questa linea di ricerca forniranno la base scientifica PER SULLA SVILUPPO DI NUOVI ALIMENTI FOODS BASED IN Peptidi BIOATTIVI, DERIVED DELLE SEcuzioni GENETI DEL microbioma umano. QUESTI ALIMENTI SAREBBERO FINALIZZATI SIA ALLA PREVENZIONE DELLE MALATTIE GASTROINTESTINALI AUTOIMMUNI E INFIAMMATORIE SIA AL SOLLIEVO DEI LORO SINTOMI NEI PAZIENTI MALATI. Ciò avrebbe una ripercussione diretta riducendo i costi sanitari del trattamento e aumentando la qualità della vita dei bambini._x000D_ questo progetto lo sostiene a tempo pieno da DRA ANALIA LOURENÇO, associato PROFESSIONAL OF INFORMAMENTMENT, E TEMPO PARTIALE DI DR. Florentino Riverola, PERTENECENTE AL GRUPPO DI NUOVI SISTEMI DI INFORMAZIONI GENERALI. ENTRAMBI HANNO UNA VASTA ESPERIENZA NELLA GESTIONE DI DATABASE DI PEPTIDI BIOATTIVI E BIOLOGIA DEI SISTEMI, COSÌ COME NELLO SVILUPPO DI STRUMENTI DI BIOINFORMATICA, E DR. RIVEROLA È IL DIRETTORE DEL DIPARTIMENTO. PENSO CHE SIANO PERFETTI PER INIZIARE QUESTA NUOVA LINEA CHE INTEGRA BIOLOGIA MOLECOLARE, BIOLOGIA CELLULARE, OMICA E BIOINFORMATICA. GLI ESPERIMENTI DI BIOLOGIA CELLULARE SARANNO ESEGUITI UTILIZZANDO CELLULE DENDRITICHE IN VITRO (CD) NEL LABORATORIO DELLE LINEE CELLULARI DI IPLA-CSIC. INFINE, VORREI SOTTOLINEARE CHE QUESTO PROGETTO HA IL SOSTEGNO DI RICERCATORI RINOMATI IN IMMUNOLOGIA (DR. STELLA KNIGHT, IMPERIAL COLLEGE DI LONDRA), IN MICROBIOLOGIA ALIMENTARE (DR. CARDING SIMON, ISTITUTO DI RICERCA ALIMENTARE, NORWICH), NELL'ALIMENTAZIONE FUNZIONALE (DR. HAIDONG TAN, GLYBOBIO LTD.) E L'ASSOCIAZIONE SPAGNOLA DELLA MALATTIA DI CROHN E DELLA COLITE ULCEROSA. (Italian)
16 January 2022
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Villaviciosa
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Identifiers
AGL2013-44039-R
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