Extraction and characterisation of new RNA phage-like particles (Q3056349)

1.1.1.Projekta kopsavilkuma īss apraksts Vīrusveidīgās daļiņas (Virus-like particles, VLPs) ir tukšas, neinfekciozas, no vīrusa apvalka proteīna (CP) savāktas čaulas, kuras var izmantot dažādiem mērķiem fundamentālu un praktisku problēmu risināšanai. Vienpavediena RNS (ssRNS) fāgu VLP tiek plaši pielietotas jaunu vakcīnu radīšanai, ārstniecisku preparātu mērķētai piegādei un bioattēlošani, tomēr pašreiz pieejamais ssRNS fāgu VLP klāsts ir neliels un nepietiekošs minēto pielietojumu turpmākai attīstībai. Projektā mēs plānojam uzproducēt vairāk, kā 50 jaunas VLP no ssRNS fāgu CP, kuri ir nesen identificēti metagenomu datos. Pēc VLP kandidātu īpašību – produkcijas līmeņa, termiskās stabilitātes un sekvenču atšķirībām mēs plānojam atlasīt 5 perspektīvākos kandidātus padziļinātai izpētei. Atlasītajiem kandidātiem tiks izstrādāti efektīvi producēšanas un attīrīšanas protokoli, izpētīta VLP tolerance pret ģenētiskām un ķīmiskām modifikācijām, kā arī noteiktas trīsdimensionālās struktūras.Atslēgvārdi: vīrusveidīgās daļiņas, ssRNS fāgi, MS2, Qbeta, VLP vakcīnas1.1.2.Projekta kopsavilkuma pilns aprakstsProjekta galvenais mērķis ir izpētīt jaunu RNS fāgu vīrusveidīgo daļinu īpašības un pielietojumus. Pētījumu veids: rūpnieciskais pētījums.Projekts atbilst zinātnes nozarei: 1.6 – bioloģijas zinības; 3.4 – medicīniskā biotehnoloģija.Projekts nav saistīts ar saimniecisko darbību.Informācija par galvenajām projekta darbībām:•Balstoties uz datubāzēs pieejamajām 70 RNS fāgu apvalka proteīnu sekvencēm tiks izveidotas attiecīgās proteīnu ekspresijas plazmīdas un uzproducēti attiecīgie apvalka proteīni•Balstoties uz iegūto VLP produkcijas līmeni un stabilitāti tiks atlasīti 5 perspektīvākie kandidāti•Atlasītās VLP tiks raksturotas strukturāli un pēc to tolerances inkorporēt dažādus antigēnusProjekta plānotie rezultāti ir:•vismaz divas zinātniskas publikācijas SCOPUS datubāzē iekļautos žurnālos ar citēšanas indeksu >2•deponētas 5 struktūras Proteīnu Datu Bankā (PDB)•izstrādāta tehnoloģija 5 fāgu VLP iegūšanai un attīrīšanaiProjekta kopējās attiecināmās izmaksas ir 648514€.Plānotais projekta īstenošanas ilgums ir 3 gadi. Projekts tiks uzsākts 2017. gada 1. aprīlī un pabeigts 2020. gada 31. martā. (Latvian)

0 references

1.1.1.The virus-like particles (VLPs) are empty, non-infectious shells collected from the virus envelope protein (CP), which can be used for different purposes to solve fundamental and practical problems. Single-filter RNA (ssRNA) phase VLP is widely used for the creation of new vaccines, targeted supply of medicinal products and bioimage, however, the currently available range of SSRNA phases VLPs is small and insufficient for the further development of these applications. In the project we plan to produce more than 50 new VLPs from ssRNS phage CP, which have been recently identified in metagenome data. According to the differences in the characteristics of VLP candidates – production level, thermal stability and sequences – we plan to select the 5 most promising candidates for in-depth research. The selected candidates will develop effective production and purification protocols, explore VLP tolerance to genetic and chemical modifications, and define three dimensional structures. Virus-like particles, ssRNA phages, MS2, Qbeta, VLP vaccine1.1.2 Complete description of the project summary The main aim of the project is to explore the properties and applications of new particles of RNA phage-like viruses. Type of studies: Industrial research: The project is relevant to the scientific sector: 1.6 – biological knowledge; 3.4 – Medical biotechnology.The project is not related to economic activity.Information on the main project activities:•Based on the 70 RNA phase protein sequences available in the databases, the corresponding protein expression plasmamids will be created and relevant cascading proteins produced in the database•Based on the 70 RNA phage shell protein sequences will be selected the 5 prospective candidates•These Bankable VLP will be described in the overall cost of the project, and by the structure of the project, the duration of the project is based on a low level of output and stability of the VLP.The 5 prospective candidates will be selected.The Bank’s selected VLP will be described in the overall cost of the project, and by the structure of the project, the duration of the project is based on the two pro-denocol imputation to the GLP. The project will be launched on 1 April 2017 and completed on 31 March 2020. (English)

point in time

15 July 2021

0 references

1.1.1.Petite description du résumé du projet des particules de type virus (VLP) sont des coquilles vierges et non infectieuses prélevées à partir de protéines d’enveloppe virale (CP), qui peuvent être utilisées à diverses fins pour résoudre des problèmes fondamentaux et pratiques. Le phage VLP est largement utilisé pour la mise au point de nouveaux vaccins, la fourniture ciblée de médicaments et la bioimagerie, mais la gamme actuellement disponible de phage GLP est faible et insuffisante pour la poursuite du développement de ces applications. Dans le cadre du projet, nous prévoyons produire plus de 50 nouveaux VLP à partir de phage CP ssRNA, qui ont été récemment identifiés dans des données métagénomiques. Après des différences dans la qualité des candidats BPL — niveau de production, stabilité thermique et séquences, nous prévoyons de sélectionner les 5 candidats les plus prometteurs pour une recherche approfondie. Des protocoles de production et de purification efficaces seront élaborés pour les candidats sélectionnés, la tolérance du VLP aux modifications génétiques et chimiques sera étudiée, ainsi que les structures tridimensionnelles identifiées. particules ressemblant à des virus, phages d’ARNs ss, MS2, Qbêta, vaccins VLP1.1.2.Description complète du résumé du projetL’objectif principal du projet est d’étudier les propriétés et les applications des nouvelles particules de type virus de phage de l’ARN. Type d’études: recherche industrielle.Le projet correspond au domaine de la science: 1.6 — biologie; 3.4 — Biotechnologie médicale.Le projet n’est pas lié à l’activité économique.Informations sur les principales activités du projet:•Basé sur la base des 70 séquences de protéines de caissons d’ARN disponibles dans les bases de données, les plasmides d’expression protéique respectifs seront créés et les protéines de caissons correspondantes produites•En fonction du niveau et de la stabilité de la production de VLP obtenue, les 5 candidats les plus potentiels seront sélectionnés•Les VLP sélectionnés seront décrits structurellement et leur tolérance à l’intégration de différents antigènes.Les résultats prévus du projet sont:•au moins deux candidats scientifiques dans les revues SCOPUS avec un indice de citation >2•déposées 5 entités à la Banque de développement Le projet sera lancé le 1er avril 2017 et achevé le 31 mars 2020. (French)

point in time

25 November 2021

0 references

1.1.1.Kleine Beschreibung der Projektzusammenfassung von virusähnlichen Partikeln (VLPs) sind leere, nicht infektiöse Schalen, die aus Virushüllen (CP) gewonnen werden, die für verschiedene Zwecke verwendet werden können, um grundlegende und praktische Probleme zu lösen. Single-Strand RNA (ssRNA) phage VLP ist weit verbreitet für die Entwicklung neuer Impfstoffe, gezielte Versorgung mit Arzneimitteln und Bio-Bilder, jedoch ist die derzeit verfügbare Palette von ssRNA phage GLPs klein und unzureichend für die Weiterentwicklung dieser Anwendungen. Im Projekt planen wir, mehr als 50 neue VLPs aus ssRNA phage CPs herzustellen, die kürzlich in methagennomischen Daten identifiziert wurden. Nach Unterschieden in der Qualität der GLP-Kandidaten – Produktionsniveau, thermische Stabilität und Sequenzen – wollen wir die 5 vielversprechendsten Kandidaten für eine gründliche Forschung auswählen. Für die ausgewählten Kandidaten werden wirksame Herstellungs- und Reinigungsprotokolle entwickelt, die Toleranz von VLP gegenüber genetischen und chemischen Modifikationen sowie dreidimensionale Strukturen ermittelt. Virus-ähnliche Partikel, ssRNA-Phages, MS2, Qbeta, VLP-Impfstoffe1.1.2.Umfassende Beschreibung der ProjektzusammenfassungDas Hauptziel des Projekts ist es, die Eigenschaften und Anwendungen neuer RNA phage virusähnlicher Partikel zu untersuchen. Art der Studien: industrielle Forschung.Das Projekt entspricht dem Gebiet der Wissenschaft: 1.6 – Biologie; 3.4 – Medizinische Biotechnologie.Das Projekt bezieht sich nicht auf die Wirtschaftstätigkeit.Informationen zu den Hauptaktivitäten des Projekts:• Basierend auf der Grundlage der 70 RNA-Phage-Kaage-Proteinsequenzen, die in den Datenbanken verfügbar sind, werden die jeweiligen Proteinexpressionsplasmide erstellt und die entsprechenden Gehäuseproteine hergestellt•Auf der Grundlage des Niveaus und der Stabilität der gewonnenen VLP-Produktion werden die 5 prospektivsten Kandidaten ausgewählt•Die ausgewählten VLPs werden strukturell beschrieben und ihre Toleranz zur Einbeziehung verschiedener Antigene. Das Projekt wird am 1. April 2017 gestartet und am 31. März 2020 abgeschlossen. (German)

point in time

28 November 2021

0 references

1.1.1.Kleine beschrijving van de projectsamenvatting van virusachtige deeltjes (VLP’s) zijn blanco, niet-infectieuze schelpen die zijn verzameld uit virushulzeneiwit (CP), die voor verschillende doeleinden kunnen worden gebruikt om fundamentele en praktische problemen op te lossen. Single-strand RNA (ssRNA) phage VLP wordt veel gebruikt voor de ontwikkeling van nieuwe vaccins, gerichte levering van geneesmiddelen en bio-beelden, maar het momenteel beschikbare assortiment van ssRNA-phage GLP’s is klein en ontoereikend voor de verdere ontwikkeling van deze toepassingen. In het project zijn we van plan meer dan 50 nieuwe VLP’s van ssRNA phage CP’s te produceren, die onlangs zijn geïdentificeerd in methagennomische gegevens. Na verschillen in de kwaliteit van GLP-kandidaten — productieniveau, thermische stabiliteit en sequenties, zijn we van plan om de 5 meest veelbelovende kandidaten te selecteren voor diepgaand onderzoek. Voor de geselecteerde kandidaten zullen effectieve productie- en zuiveringsprotocollen worden ontwikkeld, de tolerantie van VLP voor genetische en chemische modificaties zal worden bestudeerd, evenals driedimensionale structuren. virus-achtige deeltjes, ssRNA phages, MS2, Qbeta, VLP vaccins1.1.2.Complete beschrijving van het project samenvattingHet belangrijkste doel van het project is het bestuderen van de eigenschappen en toepassingen van nieuwe RNA phage virus-achtige deeltjes. Soort studies: industrieel onderzoek.Het project komt overeen met het gebied van de wetenschap: 1.6 — biologie; 3.4 — Medische biotechnologie.Het project houdt geen verband met economische activiteit.Informatie over de belangrijkste activiteiten van het project:•Op basis van de 70 RNA-fage-eiwitsequenties die in de databanken beschikbaar zijn, zullen de respectieve eiwitexpressieplasmiden worden gecreëerd en de bijbehorende darmeiwitten worden geproduceerd•Op basis van het niveau en de stabiliteit van de verkregen VLP-productie, zullen de vijf meest potentiële kandidaten worden geselecteerd•De geselecteerde VLP’s zullen structureel worden beschreven en de tolerantie om verschillende antigenen te verwerken.De geplande resultaten van het project zijn:•ten minste twee wetenschappelijke kandidatenpublicaties in SCOPUS-tijdschriften met een citatie-index >2•gedeposited 5-technologie Protein De geplande GLP-projecten zijn de volgende:•ten minste twee wetenschappelijke kandidatenpublicaties in SCOPUS-tijdschriften met een citatie-index >2•Gedeposeerd 5 jaar durende technologie Prote-Prote. Het project zal op 1 april 2017 van start gaan en op 31 maart 2020 worden voltooid. (Dutch)

point in time

28 November 2021

0 references

1.1.1.Piccola descrizione della sintesi del progetto delle particelle simili a virus (VLP) sono conchiglie vuote e non infettive raccolte dalla proteina del budello virale (CP), che possono essere utilizzate per vari scopi per risolvere problemi fondamentali e pratici. L'RNA monofilare (ssRNA) fagi VLP è ampiamente utilizzato per lo sviluppo di nuovi vaccini, la fornitura mirata di medicinali e bioimmagini, tuttavia, la gamma attualmente disponibile di PPL per fagi ssRNA è piccola e insufficiente per l'ulteriore sviluppo di queste applicazioni. Nel progetto, abbiamo in programma di produrre più di 50 nuovi VLP da ssRNA phage CPs, che sono stati recentemente identificati nei dati metagennomici. Dopo le differenze nella qualità dei candidati GLP — livello di produzione, stabilità termica e sequenze, abbiamo intenzione di selezionare i 5 candidati più promettenti per la ricerca approfondita. Saranno sviluppati protocolli di produzione e purificazione efficaci per i candidati selezionati, saranno studiati la tolleranza del VLP alle modifiche genetiche e chimiche, nonché le strutture tridimensionali identificate. particelle virus-simile, fagi ssRNA, MS2, Qbeta, VLP Vaccini1.1.2.Descrizione completa della sintesi del progettoL'obiettivo principale del progetto è quello di studiare le proprietà e le applicazioni di nuove particelle virus-simile al fago RNA. Tipo di studi: ricerca industriale.Il progetto corrisponde al campo della scienza: 1.6 — biologia; 3.4 — Biotecnologie mediche.Il progetto non è legato all'attività economica.Informazioni sulle principali attività del progetto:•Basato sulla base delle 70 sequenze proteiche dei fagi disponibili nelle banche dati, verranno creati i rispettivi plasmidi di espressione proteica e le corrispondenti proteine dell'involucro prodotte•Basato sul livello e la stabilità della produzione VLP ottenuta, saranno selezionati i 5 più potenziali candidati•I VLP selezionati saranno descritti strutturalmente e la loro tolleranza ad incorporare diversi antigeniI risultati previsti del progetto sono:•almeno due pubblicazioni di candidati scientifici su riviste SCOPUS con un indice di citazione >2• il costo totale della tecnologia è di 5 anni. Il progetto sarà avviato il 1º aprile 2017 e completato il 31 marzo 2020. (Italian)

point in time

11 January 2022

0 references

1.1.1.Pequeña descripción del resumen del proyecto de partículas similares a virus (VLP) son cáscaras en blanco y no infecciosas recogidas de la proteína de la carcasa del virus (CP), que pueden utilizarse para diversos fines para resolver problemas fundamentales y prácticos. El fago VLP (ssRNA) de ARN de una sola cadena es ampliamente utilizado para el desarrollo de nuevas vacunas, el suministro dirigido de medicamentos y bioimágenes, sin embargo, la gama disponible actualmente de Fage GLP del ssRNA es pequeña e insuficiente para el desarrollo ulterior de estas aplicaciones. En el proyecto, planeamos producir más de 50 nuevos VLPs a partir de PC del fago del ssRNA, que han sido recientemente identificados en datos metagenómicos. Después de diferencias en la calidad de los candidatos a GLP — nivel de producción, estabilidad térmica y secuencias, planeamos seleccionar a los 5 candidatos más prometedores para una investigación en profundidad. Se desarrollarán protocolos de producción y purificación eficaces para los candidatos seleccionados, se estudiará la tolerancia del VLP a las modificaciones genéticas y químicas, así como se identificarán las estructuras tridimensionales. partículas similares a virus, fagos del ssRNA, vacunas MS2, Qbeta, VLP1.1.2.Descripción completa del resumen del proyectoEl objetivo principal del proyecto es estudiar las propiedades y aplicaciones de nuevas partículas similares al virus del ARN. Tipo de estudios: investigación industrial.El proyecto corresponde al campo de la ciencia: 1.6 — biología; 3.4 — Biotecnología médica.El proyecto no está relacionado con la actividad económica.Información sobre las principales actividades del proyecto:•Basado en las 70 secuencias de proteínas de envoltura de fágo de ARN disponibles en las bases de datos, se crearán los respectivos plásmidos de expresión proteica y se producirán las correspondientes proteínas de tripa•Basado en el nivel y la estabilidad de la producción de VLP obtenida, se seleccionarán los 5 candidatos más candidatos•Los VLP seleccionados se describirán estructuralmente y su tolerancia a incorporar diferentes antígenos.Los resultados previstos del proyecto son:•Al menos dos publicaciones de candidatos científicos en revistas SCOPUS con un índice de citación >2•Depositado 5 entidades del proyecto. El proyecto se pondrá en marcha el 1 de abril de 2017 y finalizará el 31 de marzo de 2020. (Spanish)

point in time

12 January 2022

0 references

location (string)

Rātsupītes iela 1 k-1, Rīga, LV-1067

0 references

Identifiers

Latvian Kohesio ID

1.1.1.1/16/A/104

0 references

Extraction and characterisation of new RNA phage-like particles (Q3056349)

Statements

Identifiers

Navigation menu

Search