New generation electron microscope: 3D ultra structure (Q3923196)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3923196 in Hungary
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | New generation electron microscope: 3D ultra structure |
Project Q3923196 in Hungary |
Statements
1 January 2017
0 references
20 April 2021
0 references
PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM
0 references
46°4'35.72"N, 18°13'40.94"E
0 references
A pályázatban két mérföldkövet határoztunk meg, mely közül az elsőt a 3D-TEM beszerzése, felállítása, beüzemelése jelenti, és ide tartozik még jelen pályázatban résztvevő kutatócsoportok felhasználóinak betanítása. Ezt követően kezdődhet a második mérföldkő elérését célzó munka a 3D-TEM-mel, amely egyszerre jelent kutatási, és oktatási tevékenységet. Ennek során kerül sor helyi kollaborációs és ipari partnerek bevonására, valamint nemzetközi kapcsolatok kiépítésére és kutatói hálózatokba való bekapcsolódásra. A projekt első fázisa a közbeszerzéssel egybekötött eszközbeszerzés lebonyolítását jelenti, melyet követően kerül sor a PTE ÁOK KEL területén a műszer összeszerelésére és beüzemelésére. A felállítandó 3D-TEM-nek helyet adó laboratóriumi helyiség melletti, korábban fotólaboratóriumként használt helyiség átalakítása történik meg annak érdekében, hogy a 3D-TEM vízzel való hűtését biztosító vízforgató berendezések beszerelése megtörténhessen. Mindezek az előmunkálatok építészeti jellegű munkát, ingatlan beruházást nem igényelnek, csupán a helyiségek berendezésének módosítását. átalakítását. Az átalakítással járó esetleg felmerülő költségeket projekten kívül, a PTE ÁOK saját költségvetésének terhére biztosítja. A közbeszerzés során az alábbi eszközök beszerzése valósul meg: Egy, a régióban egyedülálló új generációs 3D-TEM, amely a hagyományos fluoreszcens ernyőn megjelenő 2 dimenziós képalkotási funkció mellett, a 3D tomográffal való felszereltsége révén lehetővé válik a vizsgált struktúrák 3 dimenzióban történő megjelenítése. A 3D (TEM/STEM tomográf rendszer) leképezés mellett további alkalmazási lehetőségekkel rendelkezik, amelyek jelentősen megkönnyítik a műszert használó kutató munkáját. Ezek közé tartozik 1.) digitális montázs-készítő rendszer, 2.) komputer vezérelt tárgyasztal navigáció, 3.) az automata képkorrekció, 4.) az egyéni beállítási lehetőséget biztosító kontrol egység, ami lehetővé teszi a különböző igényű felhasználók számára a nekik megfelelő konfiguráció használatát. A műszer továbbá tartalmazni fog egy olyan egységet (EDS), amely alkalmas arra, hogy finom-fókuszú elektronsugárral pásztázva a mintát, ultra vékony metszeten meghatározza elemtartalmát (elemanalizátor). A fent részletezett funkciók és mikroszkópos egységek működését biztosító szoftverek mellett szükség van egy digitális kép alkotására alkalmas szoftverre, amely más képkezelő szoftverrel kompatibilis formában állítja elő a képet. Emellett szükség van egy, az elektronmikroszkópos képeken megjelenő objektumok gyors és automatizált módon történő elemzésre alkalmas szoftverre is. Az eszköz beszerzésével párhuzamosan, az infrastruktúra teljes rendelkezésre állása nélkül elkezdhető a pályázatban résztvevő kutatócsoportok által a tervezett kísérletek elvégzése és az elektronmikroszkópos vizsgálatra szánt minták előkészítése. Ebben a fázisban tervezzük olyan igény és szükséglet-felmérések elkészítését, melyek azt hivatottak vizsgálni, hogy hogyan kapcsolódhatunk be az Európai hálózatokba. A projekt második fázisában tervezzük a műszer kutatási, oktatási, valamint orvostudományi kar lévén diagnosztikus célra történő használatát. A kutatás során az alábbi célokat kívánjuk megvalósítani: 1) különböző patológia okozta degenerációk és normál öregedés során a retinában megfigyelhető morfológiai elváltozások, különös tekintettel a retinális szalag-szinapszis alaki elváltozásaira, ill. egyes szerkezeti elemeinek átrendeződéseire. 2) a tanulás során fontos szereppel bíró halánték lebenyben található kérgi hálózatok neuronális kapcsolati mintázatának feltérképezése, különös tekintettel az egyes sejtek közötti szinaptikus kapcsolatok vizsgálatára. 3) emberi temporális lebeny epilepsziában megfigyelhető kérgi ektopiás idegsejtek karakterizálása, ezek kapcsolatainak, különös tekintettel a szinaptikus kapcsolatok feltérképezésére. 4) krónikus stressz neurobiológiai hátterének kutatása során, a stressz hatására az agy limbikus rendszerében (pl. a hippocampus, prefrontális kéreg) létrejövő morfológiai elváltozások és szinapszisok szintjén megfigyelhető elváltozások vizsgálata a krónikus stressz okozta depresszió állatmodelljében. 5) az ösztrogén központi idegrendszeri gyors, nem klasszikus hatása során megfigyelhető ultrastruktúrális változások tanulmányozása 6) az idegszövet regenerációját befolyásoló vegyületek hatásainak tanulmányozása az axogenezis és szinaptogenezis folyamatára, valamint a sejtdifferenciálódás, a sejt-sejt interakciók elemzése. Az oktatási célok megvalósítása során a 3D-TEM, a KEL jelenlegi műszereihez hasonlóan, a korábbi éveknek megfelelően, az egyetemi tanrendben is dokumentált módon, oktatási célokat is szolgál majd a különböző karok (pl. ÁOK, GYTK, TTK) graduális képzésben tanuló hallgatói számára, a Molekuláris sejtbiológia (ÁOK), a Gyógyszerészeti Biológia (GYTK) és a Mikrotechnika (TTK) kötelező tantárgyak oktatásakor. Emellett az elmúlt 20 év gyakorlatának megfelelően, magyar és külföldi érdeklődő h (Hungarian)
0 references
Two milestones have been defined in the application, the first of which is the acquisition, setting up and installation of 3D-TEM, and this includes training the users of the research groups participating in this proposal. Work to achieve the second milestone can then start with 3D-TEM, which means both research and education. This will involve local collaboration and industrial partners, as well as the development of international relations and participation in research networks. The first phase of the project involves the implementation of the procurement of equipment, after which the instrument will be assembled and installed in the PTE ÁOK KEL. The room previously used as a photo laboratory next to the laboratory room hosting the 3D-TEM to be set up will be adapted to allow the installation of water rotating equipment for cooling 3D-TEM with water. All these pre-works do not require architectural work or real estate investment, but only the modification of the equipment of the premises. In addition to the project, the costs associated with the restructuring will be covered by the PTE ÁOK’s own budget. The procurement involves the purchase of the following means: A new generation of 3D-TEM, unique in the region, which, in addition to the 2-dimensional imaging function on the traditional fluorescent screen, is equipped with a 3D tomograph to show the examined structures in 3 dimensions. In addition to 3D (TEM/STEM tomograph system) it has additional application options that significantly facilitate the work of a researcher using the instrument. These include 1) digital montage creation system, 2) computer-controlled object table navigation, 3) automatic image correction, 4. control unit with custom setup, allowing users with different needs to use the appropriate configuration. The apparatus will also contain a unit (EDS) capable of scanning the sample with a fine-focused electron beam to determine its element content (element analyser) on an ultra thin section. In addition to the software to ensure the operation of the functions and microscopic units described above, a digital image creation software is required that produces the image in a form compatible with other image management software. In addition, there is also a need for software for quick and automated analysis of objects on electron microscopic images. In parallel with the purchase of the equipment, without the full availability of the infrastructure, it is possible to start carrying out planned experiments and preparing samples for electron microscopic examination by the research teams participating in the tender. At this stage, we plan to carry out needs and needs assessments to examine how to connect to the European networks. In the second phase of the project, we plan to use the instrument for diagnostic purposes as a faculty of research, education and medicine. In the course of the research, we aim to achieve the following objectives: 1) morphological lesions in the retina during degenerations caused by various pathology and normal aging, especially with regard to the formal lesions of the retinal ligament synapse and the rearrangement of certain structural elements. 2) mapping the neuronal connection pattern of cortical networks in the lobes of temples with an important role in learning, especially with regard to the investigation of synaptic connections between individual cells. 3) Characterisation of cortical ectopic nerve cells observed in human temporal lobe epilepsy, their connections, especially the mapping of synaptic connections. 4) In the course of researching the neurobiological background of chronic stress, examination of changes in the level of morphological lesions and synapses occurring in the limbic system of the brain (e.g. hippocampus, prefrontal cortex) due to stress in the animal model of chronic stress depression. 5) Study of ultra-structural changes observed during the rapid, non-classic effect of estrogen on the central nervous system 6) study of the effects of compounds that affect the regeneration of nerve tissue on the process of axogenesis and synaptogenesis, as well as cell differentiation, analysis of cell-cell interactions. During the realisation of educational goals, 3D-TEM, like the current instruments of the KEL, will serve educational purposes, as documented in the university curriculum, for students of various faculties (e.g. GTC, GYTK, TTK) for graduate studies, Molecular Cell Biology (ACs), Pharmaceutical Biology (GYTK) and Microtechnics (TTK) in compulsory subjects. In addition, according to the practice of the last 20 years, Hungarian and foreign interested h (English)
8 February 2022
0 references
Deux étapes ont été définies dans l’application, dont la première est l’acquisition, la mise en place et l’installation de 3D-TEM, ce qui inclut la formation des utilisateurs des groupes de recherche participant à la présente proposition. Les travaux visant à réaliser la deuxième étape peuvent ensuite commencer par le 3D-TEM, ce qui signifie à la fois la recherche et l’éducation. Cela impliquera la collaboration locale et des partenaires industriels, ainsi que le développement des relations internationales et la participation aux réseaux de recherche. La première phase du projet concerne la mise en œuvre de l’acquisition d’équipements, après quoi l’instrument sera assemblé et installé dans le PTE ÁOK KEL. La salle précédemment utilisée comme laboratoire photo à côté de la salle de laboratoire abritant le 3D-TEM à mettre en place sera adaptée pour permettre l’installation d’équipements de rotation de l’eau pour le refroidissement 3D-TEM avec de l’eau. Toutes ces pré-travaux ne nécessitent pas de travaux d’architecture ou d’investissement immobilier, mais seulement la modification de l’équipement des locaux. Outre le projet, les coûts liés à la restructuration seront couverts par le budget propre du PTE ÁOK. Le marché implique l’achat des moyens suivants: Une nouvelle génération de 3D-TEM, unique dans la région, qui, en plus de la fonction d’imagerie bidimensionnelle sur l’écran fluorescent traditionnel, est équipée d’un tomographie 3D pour montrer les structures examinées en 3 dimensions. En plus du système 3D (TEM/STEM tomograph system), il dispose d’autres options d’application qui facilitent considérablement le travail d’un chercheur utilisant l’instrument. Ceux-ci comprennent 1) le système de création de montage numérique, 2) la navigation de table d’objets commandée par ordinateur, 3) la correction automatique d’image, 4. l’unité de commande avec configuration personnalisée, permettant aux utilisateurs ayant des besoins différents d’utiliser la configuration appropriée. L’appareil contiendra également une unité (EDS) capable de scanner l’échantillon à l’aide d’un faisceau d’électrons finement focalisé pour déterminer sa teneur en éléments (analyseur d’éléments) sur une section ultra fine. Outre le logiciel pour assurer le fonctionnement des fonctions et des unités microscopiques décrites ci-dessus, un logiciel de création d’image numérique est nécessaire pour produire l’image sous une forme compatible avec d’autres logiciels de gestion d’images. En outre, il est également nécessaire de disposer de logiciels pour l’analyse rapide et automatisée d’objets sur des images microscopiques électroniques. Parallèlement à l’achat de l’équipement, sans la pleine disponibilité de l’infrastructure, il est possible de commencer à réaliser des expériences planifiées et à préparer des échantillons en vue d’un examen microscopique électronique par les équipes de recherche participant à l’appel d’offres. À ce stade, nous prévoyons de réaliser des évaluations des besoins et des besoins afin d’examiner comment se connecter aux réseaux européens. Dans la deuxième phase du projet, nous prévoyons utiliser l’instrument à des fins diagnostiques comme faculté de recherche, d’éducation et de médecine. Au cours de la recherche, nous visons à atteindre les objectifs suivants: 1) lésions morphologiques dans la rétine pendant les dégénérescences causées par diverses pathologies et le vieillissement normal, en particulier en ce qui concerne les lésions formelles du ligament rétinien synapse et le réarrangement de certains éléments structuraux. 2) cartographier le modèle de connexion neuronale des réseaux corticals dans les lobes des temples avec un rôle important dans l’apprentissage, en particulier en ce qui concerne l’étude des connexions synaptiques entre les cellules individuelles. 3) Caractérisation des cellules nerveuses ectopiques corticales observées dans l’épilepsie du lobe temporel humain, leurs connexions, en particulier la cartographie des connexions synaptiques. 4) Au cours de la recherche sur le contexte neurobiologique du stress chronique, l’examen des changements dans le niveau des lésions morphologiques et des synapses survenant dans le système limbique du cerveau (p. ex. hippocampe, cortex préfrontal) en raison du stress dans le modèle animal de dépression de stress chronique. 5) Étude des changements ultra-structuraux observés au cours de l’effet rapide et non classique de l’œstrogène sur le système nerveux central 6) étude des effets des composés qui affectent la régénération du tissu nerveux sur le processus d’axogenèse et de synaptogenèse, ainsi que la différenciation cellulaire, analyse des interactions cellules-cellules. Au cours de la réalisation des objectifs éducatifs, la 3D-TEM, comme les instruments actuels du KEL, servira à des fins éducatives, telles que documentées dans le programme d’études universitaires, pour les étudiants de diverses facultés (par exemple, GTC, GYTK, TTK) pour le... (French)
10 February 2022
0 references
Pécs, Baranya
0 references
Identifiers
GINOP-2.3.3-15-2016-00026
0 references