Development of a diagnostic system for patients with pancreatic adenocarcinoma based on previous clinical results of peripheral blood differential gene expression (Q3176398)
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Project Q3176398 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Development of a diagnostic system for patients with pancreatic adenocarcinoma based on previous clinical results of peripheral blood differential gene expression |
Project Q3176398 in Spain |
Statements
24,800.0 Euro
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31,000.0 Euro
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80.0 percent
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1 January 2016
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16 December 2017
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UNIVERSIDAD DE JAEN
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37°57'20.63"N, 3°29'31.42"W
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23050
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El adenocarcinoma ductal pancreático (PDAC), es la cuarta causa de muerte por cáncer. La falta de biomarcadores sensibles y específicos para su detección temprana constituye una de las principales limitaciones. En este contexto, la determinación del perfil de expresión génica en sangre periférica de pacientes ha demostrado ser útil como herramienta diagnóstica menos invasiva que la biopsia. Por otro lado, la tecnología de secuenciación masiva está permitiendo analizar simultáneamente miles de genes de manera rápida, reproducible y cada vez menos costosa. Nuestros resultados clínicos previos, que poseen patente internacional (WO 2014/076342), obtenidos mediante microarrays, nos han permitido identificar un perfil de expresión génica diferencial basado en cuatro genes que, hemos demostrado, son biomarcadores de diferenciales de pacientes con PDAC frente a sujetos sanos. Los objetivos del presente proyecto son: 1. Validar la sensibilidad y especificidad de la expresión diferencial de nuestros biomarcadores ya identificados en sangre periférica usando la novedosa tecnología de RNAseq; 2. Determinar la existencia de nuevos posibles biomarcadores tras el estudio de RNAseq; 3. Desarrollar un kit diagnóstico para el adenocarcinoma de páncreas basado en dicho panel de biomarcadores de sangre periférica, que pueda ser usado en la práctica clínica habitual. Para ello se usará la siguiente metodología: 1. Obtención del ARN total de sangre periférica de sujetos sanos y pacientes con PDAC previo tratamiento; 2. Determinación del perfil de expresión génica en muestras de sangre periférica mediante RNAseq; 3. Procesamiento de datos mediante software específico; 4. Validación de resultados obtenidos por PCR cuantitativa a tiempo real; 5. Desarrollo de kit diagnóstico para su comercialización y explotación a través de la empresa GENÓMICA S.A.U. (Spanish)
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Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is the fourth cause of death from cancer. The lack of sensitive and specific biomarkers for early detection is one of the main constraints. In this context, the determination of the peripheral blood gene expression profile of patients has been shown to be useful as a less invasive diagnostic tool than biopsy. On the other hand, mass sequencing technology is allowing thousands of genes to be analysed simultaneously in a fast, reproducible and less expensive way. Our previous clinical results, which have an international patent (WO 2014/076342), obtained by microarrays, have allowed us to identify a differential gene expression profile based on four genes that, we have shown, are biomarkers of differentials of patients with PDAC versus healthy subjects. The objectives of this project are to: 1. Validate the sensitivity and specificity of the differential expression of our biomarkers already identified in peripheral blood using the innovative RNAseq technology; 2. Determine the existence of new potential biomarkers following the RNAseq study; 3. Develop a diagnostic kit for pancreatic adenocarcinoma based on this panel of peripheral blood biomarkers, which can be used in normal clinical practice. The following methodology shall be used for this purpose: 1. Obtaining total peripheral blood RNA from healthy subjects and patients with PDAC after treatment; 2. Determination of gene expression profile in peripheral blood samples using RNAseq; 3. Data processing using specific software; 4. Validation of results obtained by quantitative PCR in real time; 5. Development of diagnostic kit for commercialisation and exploitation through the company GENÓMICA S.A.U. (English)
12 October 2021
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L’adénocarcinome ductal pancréatique (PDAC) est la quatrième cause de décès par cancer. L’absence de biomarqueurs sensibles et spécifiques pour la détection précoce est l’une des principales contraintes. Dans ce contexte, la détermination du profil d’expression du gène sanguin périphérique des patients s’est révélée utile comme outil de diagnostic moins invasif que la biopsie. D’autre part, la technologie de séquençage de masse permet d’analyser simultanément des milliers de gènes de manière rapide, reproductible et moins coûteuse. Nos résultats cliniques précédents, qui ont fait l’objet d’un brevet international (WO 2014/076342), obtenus par des microréseaux, nous ont permis d’identifier un profil d’expression génique différentiel basé sur quatre gènes qui, nous l’avons démontré, sont des biomarqueurs des différentiels de patients atteints de PDAC par rapport à des sujets sains. Les objectifs de ce projet sont les suivants: 1. Valider la sensibilité et la spécificité de l’expression différentielle de nos biomarqueurs déjà identifiés dans le sang périphérique à l’aide de la technologie innovante RNAseq; 2. Déterminer l’existence de nouveaux biomarqueurs potentiels à la suite de l’étude RNAseq; 3. Développer un kit de diagnostic pour l’adénocarcinome pancréatique basé sur ce panel de biomarqueurs sanguins périphériques, qui peut être utilisé dans la pratique clinique normale. La méthodologie suivante est utilisée à cette fin: 1. L’obtention de l’ARN sanguin périphérique total chez des sujets sains et des patients atteints de PDAC après le traitement; 2. Détermination du profil d’expression génique dans des échantillons sanguins périphériques à l’aide d’ARNseq; 3. Traitement des données à l’aide de logiciels spécifiques; 4. Validation des résultats obtenus par PCR quantitatif en temps réel; 5. Développement d’un kit de diagnostic pour la commercialisation et l’exploitation par l’intermédiaire de la société Genómica S.A.U. (French)
4 December 2021
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Pankreas-duktales Adenokarzinom (PDAC) ist die vierte Todesursache durch Krebs. Der Mangel an empfindlichen und spezifischen Biomarkern für die Früherkennung ist eine der Haupthindernisse. In diesem Zusammenhang hat sich die Bestimmung des peripheren Blutgenexpressionsprofils von Patienten als ein weniger invasives Diagnoseinstrument als Biopsie erwiesen. Andererseits ermöglicht die Massensequenzierungstechnologie, dass Tausende Gene gleichzeitig schnell, reproduzierbar und kostengünstiger analysiert werden können. Unsere bisherigen klinischen Ergebnisse, die ein internationales Patent (WO 2014/076342) von Microarrays haben, haben uns erlaubt, ein Differentialgenexpressionsprofil auf Basis von vier Genen zu identifizieren, die, wie wir gezeigt haben, Biomarker von Differentialen von Patienten mit PDAC gegenüber gesunden Probanden sind. Mit diesem Projekt sollen folgende Ziele verfolgt werden: 1. Validierung der Empfindlichkeit und Spezifität der Differentialausdruckung unserer bereits im peripheren Blut identifizierten Biomarker mit Hilfe der innovativen RNAseq-Technologie; 2. Ermittlung des Vorhandenseins neuer potenzieller Biomarker im Anschluss an die RNAseq-Studie; 3. Entwickeln Sie ein diagnostisches Kit für Pankreasadenokarzinom auf Basis dieses Panels peripherer Blutbiomarker, die in der normalen klinischen Praxis verwendet werden können. Zu diesem Zweck wird folgende Methode angewandt: 1. Erhalt des gesamten peripheren RNA von gesunden Probanden und Patienten mit PDAC nach der Behandlung; 2. Bestimmung des Genexpressionsprofils in peripheren Blutproben unter Verwendung von RNAseq; 3. Datenverarbeitung mit spezifischer Software; 4. Validierung der Ergebnisse, die durch quantitative PCR in Echtzeit erzielt wurden; 5. Entwicklung von Diagnose-Kit für Kommerzialisierung und Verwertung durch die Firma Genómica S.A.U. (German)
9 December 2021
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Alvleesklier adenocarcinoom (PDAC) is de vierde doodsoorzaak door kanker. Het gebrek aan gevoelige en specifieke biomarkers voor vroegtijdige opsporing is een van de belangrijkste beperkingen. In deze context is gebleken dat de bepaling van het perifere bloedgenexpressieprofiel van patiënten nuttig is als een minder invasief diagnostisch hulpmiddel dan biopsie. Aan de andere kant, massa sequencing technologie maakt het mogelijk duizenden genen gelijktijdig te analyseren op een snelle, reproduceerbare en minder dure manier. Onze eerdere klinische resultaten, die een internationaal octrooi hebben (WO 2014/076342), verkregen door microarrays, hebben ons in staat gesteld om een differentieel genexpressieprofiel te identificeren op basis van vier genen die, zoals we hebben aangetoond, biomarkers zijn van differentiëlen van patiënten met PDAC versus gezonde proefpersonen. De doelstellingen van dit project zijn: 1. Valideer de gevoeligheid en specificiteit van de differentiële expressie van onze biomarkers die al in perifeer bloed zijn geïdentificeerd met behulp van de innovatieve RNAseq-technologie; 2. Het bestaan van nieuwe potentiële biomarkers na het RNAseq-onderzoek te bepalen; 3. Ontwikkel een diagnostische kit voor alvleesklier adenocarcinoom gebaseerd op dit paneel van perifere bloed biomarkers, die kan worden gebruikt in normale klinische praktijk. Daartoe wordt de volgende methode gebruikt: 1. Het verkrijgen van totaal perifeer bloed RNA van gezonde proefpersonen en patiënten met PDAC na behandeling; 2. Bepaling van het genexpressieprofiel in perifere bloedmonsters met behulp van RNAseq; 3. Gegevensverwerking met behulp van specifieke software; 4. Validering van de resultaten die met kwantitatieve PCR in real time zijn verkregen; 5. Ontwikkeling van diagnostische kit voor commercialisering en exploitatie via het bedrijf Genómica S.A.U. (Dutch)
17 December 2021
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Jaén
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Identifiers
DTS15_00201
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