GENETIC, GENETIC AND GENETIC STUDY OF THE MAIN DETERMINANTS OF THE COMPACITY OF THE VINE CLUSTER (Q3165653)
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Project Q3165653 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | GENETIC, GENETIC AND GENETIC STUDY OF THE MAIN DETERMINANTS OF THE COMPACITY OF THE VINE CLUSTER |
Project Q3165653 in Spain |
Statements
78,650.0 Euro
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157,300.0 Euro
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50.0 percent
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1 January 2015
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30 September 2018
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AGENCIA CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
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42°27'58.03"N, 2°26'22.81"W
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26089
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LA COMPACIDAD DEL RACIMO ES UN RASGO FUNDAMENTAL DE LA VID (VITIS VINIFERA L.) QUE PUEDE AFECTAR TANTO A LA CALIDAD COMO AL RENDIMIENTO. LOS RACIMOS COMPACTOS MADURAN MENOS UNIFORMEMENTE, REDUCIENDO LA CALIDAD Y COMPLICANDO LA VENDIMIA. ADEMAS SON MAS SUSCEPTIBLES A PLAGAS Y ENFERMEDADES, PRINCIPALMENTE INFECCIONES POR HONGOS. POR TODO ELLO HAY UN GRAN INTERES EN EL SECTOR POR CONOCER LAS BASES GENETICAS Y FISIOLOGICAS QUE AFECTAN A ESTE CARACTER. EN EL PROYECTO ANTERIOR ESTABLECIMOS QUE LOS CARACTERES MAS DETERMINANTES DE ESE CARACTER SON LA LONGITUD DE LOS EJES PRINCIPALES DEL RACIMO Y EL NUMERO TOTAL DE BAYAS, MIENTRAS QUE EN SEGUNDO TERMINO APARECIA EL TAMAÑO DE LA BAYA. EN ALGUNOS GENES CANDIDATOS SE DETECTARON ASOCIACIONES PROMETEDORAS CON LA LONGITUD DE LOS EJES Y EL TAMAÑO DE BAYA, PERO NO CON EL NUMERO DE BAYAS. EL NUMERO FINAL DE BAYAS EN EL RACIMO ES CONSECUENCIA DEL NUMERO DE FLORES EN LA INFLORESCENCIA Y DE LA TASA DE CUAJADO DEL FRUTO, PRINCIPALES RESPONSABLES DEL COMPORTAMIENTO REPRODUCTIVO. EN ESTE PROYECTO SE VA A CONTINUAR EL ESTUDIO DE LA COMPACIDAD DEL RACIMO POR DOS VIAS PARALELAS: POR UN LADO, EVALUANDO LAS ASOCIACIONES PREVIAMENTE DETECTADAS, Y POR OTRO, LLEVANDO A CABO UN FENOTIPADO MAS FINO DEL COMPORTAMIENTO REPRODUCTIVO DE LA VID, RESPONSABLE DEL NUMERO FINAL DE BAYAS DEL RACIMO, Y UNA NUEVA SELECCION Y SECUENCIACION DE GENES CANDIDATOS QUE PERMITAN LOS CONSIGUIENTES ESTUDIOS DE ASOCIACION._x000D_ LOS OBJETIVOS CONCRETOS SON: 1) EVALUAR Y VALIDAR LAS ASOCIACIONES DETECTADAS EN GENES SELECCIONADOS PARA LA LONGITUD DE LOS EJES PRINCIPALES DEL RACIMO Y EL TAMAÑO DE LA BAYA. 2) CARACTERIZAR EL COMPORTAMIENTO REPRODUCTIVO DE LA COLECCION DE VARIEDADES DE VID EMPLEADA ANTERIORMENTE, CON ESPECIAL ENFASIS EN EL NUMERO DE FLORES Y LA TASA DE CUAJADO DEL FRUTO. 3) CARACTERIZAR LOS PROCESOS GENETICOS Y MOLECULARES RESPONSABLES DE LAS DIFERENCIAS FENOTIPICAS ENTRE MUTANTES QUE SE DIFERENCIAN EN EL COMPORTAMIENTO REPRODUCTIVO Y LA COMPACIDAD DEL RACIMO. PARA ELLO SE VAN A CARACTERIZAR A NIVEL HORMONAL, TRANSCRIPTOMICO Y GENOMICO, Y A REALIZAR ANALISIS DE SISTEMAS CON EL CONJUNTO DE DATOS. 4) IDENTIFICAR GENES INVOLUCRADOS EN LA DETERMINACION DEL NUMERO DE FLORES Y LA TASA DE CUAJADO EN RELACION CON LA COMPACIDAD DEL RACIMO, EN BASE A LA INFORMACION GENERADA EN EL ANTERIOR OBJETIVO. 5) IDENTIFICAR, EN GENES CANDIDATOS SELECCIONADOS, VARIANTES ALELICAS RESPONSABLES DE LA VARIACION NATURAL OBSERVADA. CON ESTE FIN SE REALIZARAN ANALISIS DE ASOCIACION GENETICA ENTRE FENOTIPOS Y POLIMORFISMOS DE SECUENCIA DE LAS VARIEDADES SELECCIONADAS._x000D_ CON LA CONSECUCION DEL PRIMER OBJETIVO SE VALIDARAN ALGUNAS DE LAS ASOCIACIONES ENCONTRADAS, Y EVENTUALMENTE SE PODRAN DEFINIR POSIBLES MARCADORES PARA MEJORA GENETICA. LA SEGUNDA VIA DEL PROYECTO PERMITIRA DEFINIR EL COMPORTAMIENTO REPRODUCTIVO DE LA VID, Y SU RELACION CON LA COMPACIDAD DEL RACIMO. LOS ANALISIS COMPARATIVO E INTEGRADO DE LOS DATOS "OMICS" OBTENIDOS EN MUTANTES PERMITIRAN LA IDENTIFICACION DE GENES INDIVIDUALES Y DE REDES DE GENES RELACIONADOS QUE TIENEN UN IMPACTO SOBRE EL COMPORTAMIENTO REPRODUCTIVO Y LA COMPACIDAD DEL RACIMO, Y TAMBIEN SELECCIONAR LOS GENES MAS RELEVANTES PARA EL ANALISIS DE ASOCIACION. FINALMENTE, SE ESPERA QUE LOS RESULTADOS DE ANALISIS DE ASOCIACION PUEDAN CONFIRMAR LA IMPLICACION DE ALGUNOS DE LOS GENES CANDIDATOS SELECCIONADOS EN LA DEFINICION DE LOS FACTORES QUE CAUSAN LAS DIFERENCIAS EN LA COMPACIDAD DEL RACIMO. (Spanish)
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THE COMPACTNESS OF THE CLUSTER IS A FUNDAMENTAL FEATURE OF THE VINE (VITIS VINIFERA L.) THAT CAN AFFECT BOTH QUALITY AND YIELD. COMPACT CLUSTERS RIPEN LESS EVENLY, REDUCING QUALITY AND COMPLICATING HARVESTING. IN ADDITION, THEY ARE MORE SUSCEPTIBLE TO PESTS AND DISEASES, MAINLY FUNGAL INFECTIONS. FOR ALL THIS THERE IS A GREAT INTEREST IN THE SECTOR TO KNOW THE GENETIC AND PHYSIOLOGICAL BASES THAT AFFECT THIS CHARACTER. IN THE PREVIOUS PROJECT WE ESTABLISHED THAT THE MOST DETERMINING CHARACTERS OF THIS CHARACTER ARE THE LENGTH OF THE MAIN AXES OF THE CLUSTER AND THE TOTAL NUMBER OF BERRIES, WHILE IN THE SECOND END THE SIZE OF THE BERRY APPEARED. SOME CANDIDATE GENES FOUND PROMISING ASSOCIATIONS WITH SHAFT LENGTH AND BERRY SIZE, BUT NOT WITH THE NUMBER OF BERRIES. THE FINAL NUMBER OF BERRIES IN THE CLUSTER IS DUE TO THE NUMBER OF FLOWERS IN THE INFLORESCENCE AND THE RATE OF CURD OF THE FRUIT, MAINLY RESPONSIBLE FOR REPRODUCTIVE BEHAVIOR. IN THIS PROJECT WE WILL CONTINUE THE STUDY OF THE COMPACTNESS OF THE CLUSTER BY TWO PARALLEL ROUTES: For one side, EVALUING THE PREVIOUS DETECTED ASSOCIATIONS, and for another, leading to a phenotyping more than affluent of the reproductive transport of life, RESPONSIBLE OF THE FINAL NUMERO OF RACIME BAYS, AND A NEW Selection and Sequence OF CANDIDATE GENES PERMITING CONSIGURES assocation STUDIES._x000D_ CONCRETING OBJECTIVES ARE: 1) EVALUATE AND VALIDATE THE ASSOCIATIONS DETECTED IN SELECTED GENES FOR THE LENGTH OF THE MAIN CLUSTER AXES AND THE SIZE OF THE BERRY. 2) CHARACTERISE THE REPRODUCTIVE BEHAVIOR OF THE COLLECTION OF VINE VARIETIES USED PREVIOUSLY, WITH SPECIAL EMPHASIS ON THE NUMBER OF FLOWERS AND THE RATE OF CURD OF THE FRUIT. 3) CHARACTERISE THE GENETIC AND MOLECULAR PROCESSES RESPONSIBLE FOR PHENOTYPIC DIFFERENCES BETWEEN MUTANTS THAT DIFFER IN THE REPRODUCTIVE BEHAVIOR AND COMPACTNESS OF THE CLUSTER. TO DO THIS, THEY WILL BE CHARACTERISED AT HORMONAL, TRANSCRIPTOMIC AND GENOMIC LEVEL, AND TO PERFORM ANALYSIS OF SYSTEMS WITH THE DATA SET. 4) IDENTIFY GENES INVOLVED IN THE DETERMINATION OF THE NUMBER OF FLOWERS AND THE RATE OF CURD IN RELATION TO THE COMPACTNESS OF THE CLUSTER, BASED ON THE INFORMATION GENERATED IN THE PREVIOUS OBJECTIVE. 5) IDENTIFY, IN SELECTED CANDIDATE GENES, VARIANTS ALELICAS RESPONSIBLE FOR THE OBSERVED NATURAL VARIATION. With this end, GENETIC ASSOCIATION ANALISIS will be carried out between PHENOTIPES AND POLYMORPHES OF SECUTIONS OF SELECTED VARIES._x000D_ WITH THE FIRST OBJECTIVE CONCERNING THE FIRST OBJECTIVES WITH THE FIRST OBJECTIVE OBJECTIVES AGAINST THE ASSOCIATIONS INCLUDED AND EVENTUALLY DEFERRANT POSIBLE MARCATORS FOR GENETICAL MEETING. THE SECOND VIA OF THE PROJECT WILL ALLOW TO DEFINE THE REPRODUCTIVE BEHAVIOR OF THE VINE, AND ITS RELATIONSHIP WITH THE COMPACTNESS OF THE CLUSTER. COMPARATIVE AND INTEGRATED ANALYSES OF “OMICS” DATA OBTAINED IN MUTANTS WILL ALLOW THE IDENTIFICATION OF INDIVIDUAL GENES AND NETWORKS OF RELATED GENES THAT HAVE AN IMPACT ON THE REPRODUCTIVE BEHAVIOR AND COMPACTNESS OF THE CLUSTER, AND ALSO SELECT THE GENES MOST RELEVANT FOR THE ASSOCIATION ANALYSIS. FINALLY, IT IS EXPECTED THAT THE RESULTS OF ASSOCIATION ANALYSIS CAN CONFIRM THE IMPLICATION OF SOME OF THE SELECTED CANDIDATE GENES IN THE DEFINITION OF THE FACTORS THAT CAUSE THE DIFFERENCES IN THE COMPACTNESS OF THE CLUSTER. (English)
12 October 2021
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LA COMPACITÉ DE LA GRAPPE EST UNE CARACTÉRISTIQUE FONDAMENTALE DE LA VIGNE (VITIS VINIFERA L.) QUI PEUT AFFECTER À LA FOIS LA QUALITÉ ET LE RENDEMENT. LES GRAPPES COMPACTES MÛRISSENT MOINS UNIFORMÉMENT, CE QUI RÉDUIT LA QUALITÉ ET COMPLIQUE LA RÉCOLTE. EN OUTRE, ILS SONT PLUS SENSIBLES AUX PARASITES ET AUX MALADIES, PRINCIPALEMENT LES INFECTIONS FONGIQUES. POUR TOUT CELA, IL Y A UN GRAND INTÉRÊT DANS LE SECTEUR À CONNAÎTRE LES BASES GÉNÉTIQUES ET PHYSIOLOGIQUES QUI AFFECTENT CE CARACTÈRE. DANS LE PROJET PRÉCÉDENT, NOUS AVONS ÉTABLI QUE LES CARACTÈRES LES PLUS DÉTERMINANTS DE CE CARACTÈRE SONT LA LONGUEUR DES AXES PRINCIPAUX DU CLUSTER ET LE NOMBRE TOTAL DE BAIES, TANDIS QU’À LA DEUXIÈME EXTRÉMITÉ, LA TAILLE DE LA BAIE EST APPARUE. CERTAINS GÈNES CANDIDATS ONT TROUVÉ DES ASSOCIATIONS PROMETTEUSES AVEC LA LONGUEUR DE L’ARBRE ET LA TAILLE DES BAIES, MAIS PAS AVEC LE NOMBRE DE BAIES. LE NOMBRE FINAL DE BAIES DANS LA GRAPPE EST DÛ AU NOMBRE DE FLEURS DANS L’INFLORESCENCE ET AU TAUX DE CAILLÉ DU FRUIT, PRINCIPALEMENT RESPONSABLE DU COMPORTEMENT REPRODUCTEUR. DANS CE PROJET, NOUS POURSUIVRONS L’ÉTUDE DE LA COMPACITÉ DU CLUSTER PAR DEUX VOIES PARALLÈLES: D’un côté, évaluer LES ASSOCIATIONS PRÉVUES DÉTÉES, et pour l’autre, conduire à un phénotypage plus que riche du transport reproductif de la vie, RESPONSABLE DES NUMÉROS FINALES DES BAYS RACIME, ET UNE NOUVELLE Sélection et séquence des GENES CANDIDATIQUES autorisant les CONSIGURES assocation STUDIES._x000D_ concrétisation OBJECTIVES SONT: 1) ÉVALUER ET VALIDER LES ASSOCIATIONS DÉTECTÉES DANS DES GÈNES SÉLECTIONNÉS POUR LA LONGUEUR DES AXES PRINCIPAUX DE GRAPPES ET LA TAILLE DE LA BAIE. 2) CARACTÉRISER LE COMPORTEMENT REPRODUCTEUR DE LA COLLECTE DES VARIÉTÉS DE VIGNE UTILISÉES PRÉCÉDEMMENT, EN METTANT PARTICULIÈREMENT L’ACCENT SUR LE NOMBRE DE FLEURS ET LE TAUX DE CAILLÉ DU FRUIT. 3) CARACTÉRISER LES PROCESSUS GÉNÉTIQUES ET MOLÉCULAIRES RESPONSABLES DES DIFFÉRENCES PHÉNOTYPIQUES ENTRE MUTANTS QUI DIFFÈRENT PAR LE COMPORTEMENT REPRODUCTEUR ET LA COMPACITÉ DE L’AMAS. POUR CE FAIRE, ILS SERONT CARACTÉRISÉS AU NIVEAU HORMONAL, TRANSCRIPTOMIQUE ET GÉNOMIQUE, ET POUR EFFECTUER L’ANALYSE DES SYSTÈMES AVEC L’ENSEMBLE DE DONNÉES. 4) IDENTIFIER LES GÈNES IMPLIQUÉS DANS LA DÉTERMINATION DU NOMBRE DE FLEURS ET DE LA VITESSE DE CAILLÉ PAR RAPPORT À LA COMPACITÉ DE L’AMAS, EN SE BASANT SUR LES INFORMATIONS GÉNÉRÉES DANS L’OBJECTIF PRÉCÉDENT. 5) IDENTIFIER, DANS LES GÈNES CANDIDATS SÉLECTIONNÉS, LES VARIANTES ALELICAS RESPONSABLES DE LA VARIATION NATURELLE OBSERVÉE. À cette fin, l’ANALISSE GÉNETIQUE D’ASSOCIATION sera effectuée entre PHÉNOTIPES ET POLYMORPHES DE SÉCURITÉ DES VARIES SÉLECTÉES._x000D_ AVEC LE PREMIER OBJECTIF CONCERNANT LES PREMIÈRES OBJECTIFS AVEC LES MARCATEURS POSIBLES PREMIÈRES OBJECTIVES CONCERNANT LES ASSOCIATIONS INCLUSES ET ÉVENTUALLIQUES POSIBLE MARCATEURS POUR LA REUNION GÉNÉRALE. LA DEUXIÈME VIA DU PROJET PERMETTRA DE DÉFINIR LE COMPORTEMENT REPRODUCTEUR DE LA VIGNE, ET SA RELATION AVEC LA COMPACITÉ DU CLUSTER. DES ANALYSES COMPARATIVES ET INTÉGRÉES DES DONNÉES «OMIQUES» OBTENUES CHEZ LES MUTANTS PERMETTRONT D’IDENTIFIER LES GÈNES INDIVIDUELS ET LES RÉSEAUX DE GÈNES APPARENTÉS QUI ONT UN IMPACT SUR LE COMPORTEMENT REPRODUCTEUR ET LA COMPACITÉ DU GROUPE, ET DE SÉLECTIONNER LES GÈNES LES PLUS PERTINENTS POUR L’ANALYSE DE L’ASSOCIATION. ENFIN, ON S’ATTEND À CE QUE LES RÉSULTATS DE L’ANALYSE D’ASSOCIATION PUISSENT CONFIRMER L’IMPLICATION DE CERTAINS DES GÈNES CANDIDATS SÉLECTIONNÉS DANS LA DÉFINITION DES FACTEURS QUI CAUSENT LES DIFFÉRENCES DANS LA COMPACITÉ DU GROUPE. (French)
4 December 2021
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DIE KOMPAKTHEIT DES CLUSTERS IST EIN GRUNDLEGENDES MERKMAL DER REBE (VITIS VINIFERA L.), DIE SOWOHL DIE QUALITÄT ALS AUCH DEN ERTRAG BEEINFLUSSEN KANN. KOMPAKTE CLUSTER REIFEN WENIGER GLEICHMÄSSIG UND REDUZIEREN DIE QUALITÄT UND ERSCHWEREN DIE ERNTE. DARÜBER HINAUS SIND SIE ANFÄLLIGER FÜR SCHÄDLINGE UND KRANKHEITEN, VOR ALLEM PILZINFEKTIONEN. FÜR ALL DIES BESTEHT EIN GROSSES INTERESSE AN DER BRANCHE, DIE GENETISCHEN UND PHYSIOLOGISCHEN GRUNDLAGEN ZU KENNEN, DIE DIESEN CHARAKTER BEEINFLUSSEN. IM VORHERIGEN PROJEKT HABEN WIR FESTGESTELLT, DASS DIE BESTIMMENDSTEN ZEICHEN DIESES CHARAKTERS DIE LÄNGE DER HAUPTACHSEN DES CLUSTERS UND DIE GESAMTZAHL DER BEEREN SIND, WÄHREND AM ZWEITEN ENDE DIE GRÖSSE DER BEEREN ERSCHIEN. EINIGE KANDIDATEN GENE FANDEN VIELVERSPRECHENDE ASSOZIATIONEN MIT WELLENLÄNGE UND BEERENGRÖSSE, ABER NICHT MIT DER ANZAHL DER BEEREN. DIE ENDGÜLTIGE ANZAHL DER BEEREN IM CLUSTER IST AUF DIE ANZAHL DER BLÜTEN IM BLÜTENSTAND UND DIE RATE DER QUARK DER FRUCHT ZURÜCKZUFÜHREN, DIE HAUPTSÄCHLICH FÜR DAS FORTPFLANZUNGSVERHALTEN VERANTWORTLICH IST. IN DIESEM PROJEKT WERDEN WIR DIE UNTERSUCHUNG DER KOMPAKTHEIT DES CLUSTERS DURCH ZWEI PARALLELE WEGE FORTSETZEN: Für eine Seite, evaluieren die PREVIOUS DETECTED ASSOCIATIONS, und für eine andere, die zu einer Phänotypisierung mehr als fließend des reproduktiven Transports des Lebens, RESPONSIBLE DER FINAL NUMERO der RACIME BAYS, und eine neue Auswahl und Reihenfolge der CANDIDATE-GENES, die CONSIGURES assocation STUDIES._x000D_ concreting OBJECTIVES ARE: 1) EVALUIEREN UND VALIDIEREN SIE DIE ASSOZIATIONEN, DIE IN AUSGEWÄHLTEN GENEN FÜR DIE LÄNGE DER HAUPTCLUSTERACHSEN UND DIE GRÖSSE DER BEERE NACHGEWIESEN WURDEN. 2) CHARAKTERISIEREN DAS REPRODUKTIONSVERHALTEN DER SAMMLUNG VON REBSORTEN, DIE ZUVOR VERWENDET WURDEN, MIT BESONDERER BETONUNG AUF DIE ANZAHL DER BLUMEN UND DIE RATE DER QUARK DER FRUCHT. 3) CHARAKTERISIEREN DIE GENETISCHEN UND MOLEKULAREN PROZESSE, DIE FÜR PHÄNOTYPISCHE UNTERSCHIEDE ZWISCHEN MUTANTEN VERANTWORTLICH SIND, DIE SICH IM FORTPFLANZUNGSVERHALTEN UND IN DER KOMPAKTHEIT DES CLUSTERS UNTERSCHEIDEN. UM DIES ZU TUN, WERDEN SIE AUF HORMONELLER, TRANSKRIPTOMISCHER UND GENOMISCHER EBENE CHARAKTERISIERT UND ZUR ANALYSE VON SYSTEMEN MIT DEM DATENSATZ DURCHGEFÜHRT. 4) IDENTIFIZIEREN SIE GENE, DIE AN DER BESTIMMUNG DER ANZAHL DER BLÜTEN UND DER QUARKRATE IN BEZUG AUF DIE KOMPAKTHEIT DES CLUSTERS BETEILIGT SIND, BASIEREND AUF DEN IM VORHERIGEN ZIEL GENERIERTEN INFORMATIONEN. 5) IN AUSGEWÄHLTEN KANDIDATENGENE DIE FÜR DIE BEOBACHTETE NATÜRLICHE VARIATION VERANTWORTLICHEN VARIANTEN ALELICAS IDENTIFIZIEREN. Mit diesem Zweck wird die GENETIC ASSOCIATION ANALISIS zwischen PHENOTIPES und POLYMORPHES von Secutions of SELECTED VARIES durchgeführt werden._x000D_MIT THE FIRST OBJECTIVE CONCERNING THE FIRST OBJECTIVEN MIT THE FIRST OBJECTIVEN AUF DIE ASSOCIATIONEN INCLUDED UND EVENTUALLY DEFERRANT POSIBLE MARCATOREN FÜR genetische MEETING. DIE ZWEITE ÜBER DAS PROJEKT ERMÖGLICHT ES, DAS FORTPFLANZUNGSVERHALTEN DER REBE UND IHRE BEZIEHUNG ZUR KOMPAKTHEIT DES CLUSTERS ZU DEFINIEREN. VERGLEICHENDE UND INTEGRIERTE ANALYSEN VON „OMICS“-DATEN, DIE IN MUTANTEN GEWONNEN WERDEN, ERMÖGLICHEN DIE IDENTIFIZIERUNG EINZELNER GENE UND NETZWERKE VERWANDTER GENE, DIE SICH AUF DAS FORTPFLANZUNGSVERHALTEN UND DIE KOMPAKTHEIT DES CLUSTERS AUSWIRKEN, SOWIE DIE FÜR DIE ASSOZIATIONSANALYSE RELEVANTESTEN GENE AUSWÄHLEN. SCHLIESSLICH WIRD ERWARTET, DASS DIE ERGEBNISSE DER ASSOZIATIONSANALYSE DIE IMPLIKATION EINIGER AUSGEWÄHLTER KANDIDATENGENE IN DER DEFINITION DER FAKTOREN, DIE DIE UNTERSCHIEDE IN DER KOMPAKTHEIT DES CLUSTERS VERURSACHEN, BESTÄTIGEN KÖNNEN. (German)
9 December 2021
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Logroño
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Identifiers
AGL2014-59171-R
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