Clinical relevance of human and microbiome transkiptoma included in extracellular vesicles (Q3056401)
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Project Q3056401 in Latvia
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Clinical relevance of human and microbiome transkiptoma included in extracellular vesicles |
Project Q3056401 in Latvia |
Statements
374,918.54 Euro
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648,648.0 Euro
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57.8 percent
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1 April 2019
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31 March 2022
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Atvasināta publiska persona "Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs"
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56°58'59.81"N, 24°1'53.44"E
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Cilvēka asinīs esošās ekstracelulārās vezikulas (EVs) var būt veidojušās gan no dažādām normālām šūnām, gan arī vēža šūnām. Ir pierādīts, ka EVs, kas izolētas no vēža pacientu asinīm satur dažādas vēža specifiskas molekulas, tādēļ ar to palīdzību var atklāt vēža klātbūtni, prognozēt tā agresivitāti un izsekot slimības progresijai. Šis projekts ir balstīts uz mūsu iepriekšējo pētījumu rezultātiem, kas parādīja, ka EVs satur ne tikai dažāda veida RNS molekulas, ko producē cilvēka šūnas, bet arī mikroorganismu RNS. Šī projekta galvenais mērķis ir iegūt jaunas zināšanas par vēža pacientu asinīs esošo EV RNS saturu un to izcelsmi, un izpētīt to potenciālo pielietojumu trīs dažādu vēža veidu – prostatas, krūts un kuņģa vēža diagnostikā, prognostikā un agrīnā recidīvu noteikšanā.Mēs plānojam paplašināt longitudinālu vēža biobanku, kas ietver detalizētu klīnisko informāciju, audzēja audu paraugus, kā arī vēža pacientu asins un fēču paraugus. EVs tiks izolētas no vēža pacientu un kontroles grupas plazmas un fēču paraugiem, un to RNS saturs tiks analizēts kopā ar katra pacienta audzēja un normālo audu RNS saturu. Tiks veikta virkne dažādu analīžu, lai novērtētu dažādu RNS klašu korelāciju ar klīniskiem un patoloģiskiem rādītājiem, un noteiktu to diagnostisko un prognostisko vērtību. Visbeidzot, tiks izstrādāti digitālā PCR testi izvēlēto RNS biomarķieru absolūtajai kvantificēšanai cilvēka plazmā un novērtēta to klīniskā lietderība.Mēs sagaidām, ka šī projekta īstenošanas rezultātā tiks identificēti RNS biomarķieri, kas spēj parādīt vēža klātbūtni un/vai korelē ar tā agresivitāti un slimības gaitu, un ir pielietojami asins analīžu izstrādei. Pašlaik šī tehnoloģija ir TRL2 līmenī un mēs sagaidām, ka projekta beigās tā sasniegs TRL4.Šis projekts atbilst RIS3 virzienam “Nākotnes izaugsmes tautsaimniecības nozares, kurās eksistē vai var rasties produkti un pakalpojumi ar augstu pievienoto vērtību” specializācijas jomā “biomedicīna, medicīnas tehnoloģija, biofarmācija un biotehnoloģija”, un atbilst NACE 72.11. Šis projekts atbilst rūpniecisko pētījumu kategorijai un nav saistīts ar saimniecisko darbību.Šis ir starpdisciplinārs pētījums, kurā, atbilstoši OECD klasifikācijai, iesaistītas bioloģijas (1.6.), datorzinātnes un informātikas (1.2.), bāzes medicīnas (3.1.) un klīniskās medicīnas (3.2.) zinātņu nozares.Šis projekts tiks īstenots sadarbībā starp Latvijas Biomedicīnas pētījumu un pētījumu centru un klīniskās diagnostikas laboratoriju SIA GenEra. Projekta īstenošanā tiks iesaisti studenti (>25% no kopējās noslodzes), kā arī tiks izveidota jauna zinātniskā darbinieka darba vieta. Projekts tiks īstenots, sākot ar 2019. gada 1.aprīli līdz 2022.gada 31.martam, un tā ilgums ir 36 mēneši. Projekta kopējais attiecināmais finansējums ir 648 648 EUR, no kā ERAF finansējums sastāda 374 918.54 EUR.Atslēgas vārdi: ekstracelulārās vezikulas, vēzis, šķidrā biopsija, nekodējošās RNS, audzēja mikrobioms. (Latvian)
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Extracellular vesicles (EVs) in human blood may be formed from a variety of normal cells as well as from cancer cells. EVs isolated from the blood of cancer patients have been shown to contain various cancer-specific molecules, so they can detect the presence of cancer, predict its aggressiveness and track the progression of the disease. This project is based on the results of our previous studies, which showed that EVs contains not only various types of RNA molecules produced by human cells, but also microorganism RNA. The main aim of this project is to gain new knowledge about the content and origin of EV RNA in the blood of cancer patients, and to explore their potential use in the diagnosis, prognosticity and early relapse of three different types of cancer – prognostic and early relapses.We plan to expand the longitudinal cancer biobank, which includes detailed clinical information, samples of tumour tissue, as well as samples of blood and faeces of cancer patients. EVS will be isolated from plasma and faeces samples from cancer patients and controls and their RNA content will be analysed with each patient’s tumour and normal tissue RNA content. A number of different analyses will be performed to evaluate correlations between different RNA classes and clinical and pathological parameters, and to determine their diagnostic and prognostic value. Finally, digital PCR tests for absolute quantification of selected RNA biomarkers in human plasma will be developed and their clinical usefulness assessed.We expect that this project will result in the identification of RNA biomarkers able to show the presence of cancer and/or correlate with its aggressiveness and disease course, and can be used for the development of blood tests. Currently, this technology is at the level of TRL2 and we expect it to reach TRL4 at the end of the project.This project follows the direction of RIS3 “Future growth economic sectors where high added value products and services exist or may arise” in the area of specialisation “biomedicine, medical technology, biopharmaceutical and biotechnology” and is in line with NACE 72.11. This project corresponds to the category of industrial research and is not related to economic activities.This is an interdisciplinary study in which according to the OECD classification involved fields of biology (1.6), computer science and informatics (1.2), basic medicine (3.1) and clinical medicine (3.2).This project will be implemented in cooperation between the Latvian Biomedical Research and Research Centre and clinical diagnostic laboratory SIA GenEra. The project will involve students (> 25 % of the total workload), as well as a new researcher’s workplace will be created. The project will be implemented from 1 April 2019 until 31 March 2022 and its duration is 36 months. The total eligible funding of the project is EUR 648648, from which ERDF funding is EUR 374918.54.The key words: Extracellular vesicles, cancer, liquid biopsy, non-corrosive RNA, tumour microbiome. (English)
15 July 2021
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Les vésicules extracellulaires (EV) dans le sang humain peuvent être formées à partir de différentes cellules normales ainsi que de cellules cancéreuses. Il a été démontré que les EVS isolés du sang des patients cancéreux contiennent diverses molécules spécifiques au cancer, de sorte qu’ils peuvent détecter la présence du cancer, prédire son agressivité et suivre la progression de la maladie. Ce projet est basé sur les résultats de nos recherches précédentes, qui ont montré que les VE contiennent non seulement différents types de molécules d’ARN produites par les cellules humaines, mais aussi l’ARN des microorganismes. L’objectif principal de ce projet est d’acquérir de nouvelles connaissances sur le contenu de l’ARN du VE dans le sang des patients cancéreux et leur origine, et d’explorer leur application potentielle dans trois types différents de cancer — cancer de la prostate, du sein et du cancer gastrique, pronostique et détection précoce des rechutes. L’EVS sera isolée à partir d’échantillons plasmatiques et fécaux de patients atteints de cancer et de groupes témoins et leur teneur en ARN sera analysée en même temps que la teneur en ARN de la tumeur et du tissu normal de chaque patient. Une série d’analyses différentes sera effectuée afin d’évaluer la corrélation entre les différentes classes d’ARN et les indicateurs cliniques et pathologiques et de déterminer leur valeur diagnostique et prédictive. Enfin, des tests numériques de PCR seront mis au point pour la quantification absolue de certains biomarqueurs d’ARN dans le plasma humain et leur utilité clinique sera évaluée. Nous nous attendons à ce que ce projet aboutisse à l’identification de biomarqueurs d’ARN capables de démontrer la présence d’un cancer et/ou en corrélation avec son agressivité et l’évolution de la maladie, et conviennent au développement de tests sanguins. Actuellement, cette technologie est au niveau TRL2 et nous prévoyons qu’elle atteindra TRL4 à la fin du projet. Ce projet est conforme à l’axe RIS3 des secteurs économiques de croissance future où des produits et services à forte valeur ajoutée existent ou peuvent se produire" dans le domaine de la spécialisation "biomédecine, technologie médicale, biopharmaceutique et biotechnologie" et correspond à la NACE 72.11. Ce projet correspond à la catégorie de la recherche industrielle et n’est pas lié à l’activité économique. Il s’agit d’une étude interdisciplinaire qui, selon la classification de l’OCDE, porte sur les domaines de la biologie (1.6), de l’informatique et de l’informatique (1.2), de la médecine fondamentale (3.1) et de la médecine clinique (3.2). Les étudiants seront impliqués dans la mise en œuvre du projet (>25 % de la charge de travail totale), ainsi qu’un nouveau lieu de travail d’un personnel scientifique sera créé. Le projet sera mis en œuvre du 1er avril 2019 au 31 mars 2022 pour une durée de 36 mois. Le financement total éligible pour le projet s’élève à 648 648 EUR, dont le financement du FEDER s’élève à 374 918,54 EUR. vésicules extracellulaires, cancer, biopsie liquide, ARN non cancéreux, microbiome tumoral. (French)
25 November 2021
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Rātsupītes iela 1 k-1, Rīga, LV-1067
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Rātsupītes iela 1 k-1, Rīga, LV-1067
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Identifiers
1.1.1.1/18/A/084
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