The role of the burial environment in biomolecular archeology and ancient tuberculosis research processes (Q3056348)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3056348 in Latvia
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | The role of the burial environment in biomolecular archeology and ancient tuberculosis research processes |
Project Q3056348 in Latvia |
Statements
550,823.15 Euro
0 references
648,027.24 Euro
0 references
85.0 percent
0 references
1 March 2017
0 references
29 February 2020
0 references
Atvasināta publiska persona "Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs"
0 references
56°58'59.81"N, 24°1'53.44"E
0 references
56°57'10.22"N, 24°6'48.53"E
0 references
56°58'32.05"N, 24°11'23.93"E
0 references
Biomolekulārai arheoloģijai ir milzīgs potenciāls seno patogēnu izpētē, kas var sniegt zināšanas par to evolūcijas un izpatīšanas procesiem. Šis zināšanas var tikt izmantotas mūsdienu infekciju slimību modeļos un dažādu patogēnu apkarošanas stratēģiju izveidē. Tuberkuloze ir vismaz 8000 gadus veca slimība, un tās izraisītāja Mycobacterium tuberculosis evolūcijas un izplatības izpēte var palīdzēt izveidot jaunas stratēģijas šīs infekcijas slimības veiksmīgai apkarošanai. Pētījumi liecina, ka M. tuberculosis DNS sekvenču detektēšana un analīze arheoloģiskos paraugos ir iespējama, tomēr tā ir apgrūtināta ar vides mikobaktēriju iespējamo klātbūtni apbedījumos.Projekta mērķis: Raksturot augsnes mikrobioma efektu senās DNS izpētes procesos un izpētīt tuberkulozes izraisītāja genoma klātbūtni 15.-18. gadsimta arheologiska materiāla paraugos.Mērķa sasniegšanai ir plānoti fundamentāli, starpdisciplināri pētījumi sadarbības projekta ietvaros. Projektā piedalīsies zinātnieki no Latvijas Biomedicīnas Pētījumu Centra un Latvijas Universitātes Latvijas Vēstures Institūta, kas pārstāv Molekulārās bioloģijas un biomedicīnas un Arheoloģijas sektorus. Projekts atbilst 3.5. “Cita medicīnas zinātne” un 6.1. “Vēsture un Arheoloģija” zinātnes nozarēm un nav saistīts ar saimniecisku darbību. Projekta izmaksas: 648 648 EUR (ERAF atbalsta apjoms: 551 351 EUR), projekta ilgums: 36 mēneši (01.03.2017 – 29.02.2020). Projekta ietvaros ir paredzētas trīs aktivitātes:1.Arheoloģiskajos izrakumos iegūtā 15.-18. gadsimta antropoģiska materiāla (kaulu un zobakmens paraugu) paleopatoloģiskā izpēte un biomolekulārā analīze.2.Apbedījuma vides bioarheoloģiskā raksturošana un vides mikrobioma izpēte.3.Vides mikroorganismu un M. tuberculosis DNS klātbūtnes raksturošana arheoloģiskos paraugos.Šī projekta izpilde sniegs jaunas zināšanas par arheoloģisko paraugu kontaminācijas pakāpi ar vides mikroorganismiem, kas šobrīd ir ļoti svarīgs jautājums paleopatoloģijas un seno patogēnu izpētes attīstībai. Turklāt projektā paredzētie pētījumi, kuru laikā tiks izmantotas nākošās pāaudzes sekvenēšanas tehnoloģijas, dos ieskatu par M. tuberculosis klātbūtni Latvijas antropoģiska materiālā. Projekta ietvaros publicēšanai tiks iesniegti vairāki oriģināli zinātniskie raksti, kā arī rezultāti tiks prezentēti starptautiskās konferencēs.Kopumā, projekta izpilde sniegs informāciju par vides mikroorganismu DNS klātbūtni Viduslaiku arheoloģiskos paraugos, kas palīdzēs izprast to ietekmi uz seno patogēnu pētījumiem. Projektā paredzētie mēģinājumi veikt M. tuberculosis DNS klātbūtnes noteikšanu un raksturošanu 15.-18. gadsimta arheologiska materiāla paraugos palīdzēs apstiprināt un uzlabot tuberkulozes paleopatoloģisku diagnozi un sniegs jaunas zināšanas par tuberkulozes izplatības procesiem Latvijā.Atslēgas vārdi: Mikrobioms, bioarheoloģija, senā DNS, tuberkuloze. (Latvian)
0 references
Biomolecular archaeology has enormous potential in researching ancient pathogens, which can provide knowledge of their evolution and spoiling processes. This knowledge can be used in modern models of infectious diseases and in developing strategies to combat various pathogens. Tuberculosis is at least 8000 years old and research into the evolution and spread of Mycobacterium tuberculosis may help to develop new strategies for the successful control of this infectious disease. Research has shown that detection and analysis of M. tuberculosis DNA sequences in archaeological samples is possible, but it is difficult with the possible presence of environmental mycobacteria in burials. To characterise the effect of soil microbiome in ancient DNA research processes and to investigate the presence of tuberculosis-causing genome in samples of 15th-18th century archaeology material. The project will be attended by scientists from Latvian Biomedical Research Centre and University of Latvia Institute of History, which represents Molecular Biology and Biomedical and Archaeology sectors. The project is in line with 3.5. “Other medical science” and 6.1. “History and Archaeology” in scientific fields and not related to economic activity. Project costs: EUR 648648 (the amount of the ERDF aid: EUR 551351), duration of the project: 36 months (01.03.2017-29.02.2020). Three activities are planned within the framework of the project: 1.Paleopathological research and biomolecular analysis of anthropogenic material (bone and tartar samples) obtained from archaeological excavations.2. Bioarcheological characterisation of burial environment and environmental microbiome.3. characterisation of environmental microorganisms and M. tuberculosis DNA in archaeological samples. Moreover, the studies envisaged in the project, during which the technologies for sequencing the next generation will be used, will provide an insight into the presence of M. tuberculosis in Latvian anthropological material. Within the framework of the project several original scientific articles will be submitted for publication, as well as the results will be presented at international conferences.In general, the implementation of the project will provide information on the presence of environmental micro-organism DNA in Medieval archaeological samples, which will help to understand their impact on the research of ancient pathogens. The project’s attempts to detect and characterise the presence of M. tuberculosis DNA in samples of 15th-18th century archaeological material will help confirm and improve the paleopathological diagnosis of tuberculosis and provide new knowledge about tuberculosis spread processes in Latvia. Microbiome, bioarcheology, ancient DNA, tuberculosis. (English)
15 July 2021
0 references
Rātsupītes iela 1 k-1, Rīga, LV-1067
0 references
Kalpaka bulvāris 4, Rīga, LV-1050
0 references
Lielvārdes iela 24, Rīga, LV-1006
0 references
Identifiers
1.1.1.1/16/A/101
0 references