Understanding Bacterial Nucleotide Excision Repair at the Level of the Single Molecule Inside Living Cells. (Q84178)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q84178 in Poland
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Understanding Bacterial Nucleotide Excision Repair at the Level of the Single Molecule Inside Living Cells. |
Project Q84178 in Poland |
Statements
2,949,970.0 zloty
0 references
2,949,970.0 zloty
0 references
100.0 percent
0 references
1 November 2016
0 references
29 July 2020
0 references
UNIWERSYTET IM. ADAMA MICKIEWICZA W POZNANIU
0 references
Malfunctioning DNA repair lead to an accumulation of mutations, which frequently results in cancer. The Nucleotide Excision Repair (NER) pathway removes a DNA lesions caused by UV light, cigarette smoke and chemical mutagens. NER is highly conserved, and studying the simpler NER in bacteria provides key insight into human NER. I propose an interdisciplinary approach to understand the mechanistic details of bacterial NER in living cells. I will use a combination of cutting-edge single-molecule methods to elucidate how DNA is repaired inside living cells. I will use super-resolution microscopy combined to study the behaviour of individual NER proteins. To complement this, conventional biochemistry, cell biology, genetics, smFRET assays, FCS and TIRF microscopy will be used. Together, this will provide a comprehensive understanding of the bacterial NER pathway, and constitute the first steps toward my ultimate goal, which is to understand how human cells repair DNA. (Polish)
0 references
Malfunctioning DNA repair lead to an accumulation of mutations, which frequently results in cancer. The Nucleotide Excision Repair (NER) pathway removes a DNA lesions caused by UV light, cigarette smoke and chemical mutagens. NER is highly conserved, and studying the simpler NER in bacteria provides key insight into human NER. I propose an interdisciplinary approach to understand the mechanistic details of bacterial NER in living cells. I will use a combination of cutting-edge single-molecule methods to elucidate how DNA is repaired inside living cells. I will use super-resolution microscopy combined to study the behaviour of individual NER proteins. To complement this, conventional Biochemistry, cell biology, genetics, SmFRET assays, FCS and tirf microscopy will be used. Together, this will provide a comprehensive understanding of the bacterial NER pathway, and constitute the first steps towards my ultimate goal, which is to understand how human cells repair DNA. (English)
14 October 2020
0 references
Un mauvais fonctionnement de la réparation de l’ADN conduit à une accumulation de mutations, ce qui entraîne fréquemment un cancer. La voie de réparation de l’excision du nucléotide (NER) élimine les lésions d’ADN causées par la lumière UV, la fumée de cigarette et les mutagènes chimiques. Ner est hautement conservé, et l’étude du NER plus simple dans les bactéries fournit un aperçu clé du NER humain. Je propose une approche interdisciplinaire pour comprendre les détails mécanistes du NER bactérien dans les cellules vivantes. J’utiliserai une combinaison de méthodes monomolécules de pointe pour élucider la façon dont l’ADN est réparé à l’intérieur des cellules vivantes. J’utiliserai la microscopie super-résolution combinée pour étudier le comportement des protéines NER individuelles. Pour compléter cela, la biochimie conventionnelle, la biologie cellulaire, la génétique, les essais smFRET, la microscopie FCS et TIRF seront utilisés. Ensemble, cela fournira une compréhension complète de la voie bactérienne NER, et constituera les premières étapes vers mon objectif ultime, qui est de comprendre comment les cellules humaines réparent l’ADN. (French)
30 November 2021
0 references
Eine fehlerhafte DNA-Reparatur führt zu einer Ansammlung von Mutationen, die häufig zu Krebs führt. Der Nucleotid Excision Repair (NER) Weg entfernt DNA-Läsionen, die durch UV-Licht, Zigarettenrauch und chemische Mutagene verursacht werden. Ner ist sehr konserviert, und das Studium des einfacheren NER in Bakterien bietet wichtige Einblicke in das menschliche NER. Ich schlage einen interdisziplinären Ansatz vor, um die mechanistischen Details von bakteriellen NER in lebenden Zellen zu verstehen. Ich werde eine Kombination von modernsten Single-Molekül-Methoden verwenden, um herauszufinden, wie DNA in lebenden Zellen repariert wird. Ich werde die Superauflösungsmikroskopie zusammen verwenden, um das Verhalten einzelner NER-Proteine zu untersuchen. Ergänzend dazu werden konventionelle Biochemie, Zellbiologie, Genetik, smFRET-Assays, FCS und TIRF-Mikroskopie eingesetzt. Gemeinsam wird dies ein umfassendes Verständnis des bakteriellen NER-Wegs vermitteln und die ersten Schritte in Richtung meines ultimativen Ziels darstellen, nämlich zu verstehen, wie menschliche Zellen DNA reparieren. (German)
7 December 2021
0 references
Defecte DNA-reparatie leidt tot een accumulatie van mutaties, wat vaak resulteert in kanker. De Nucleotide Excision Repair (NER) route verwijdert DNA-laesies veroorzaakt door UV-licht, sigarettenrook en chemische mutagene agentia. Ner is sterk geconserveerd, en het bestuderen van de eenvoudigere NER in bacteriën biedt een belangrijk inzicht in de menselijke NER. Ik stel een interdisciplinaire benadering voor om de mechanistische details van bacteriële NER in levende cellen te begrijpen. Ik zal een combinatie van geavanceerde single-molecule methoden gebruiken om te verduidelijken hoe DNA wordt gerepareerd in levende cellen. Ik zal superresolutie microscopie gecombineerd gebruiken om het gedrag van individuele NER-eiwitten te bestuderen. Om dit aan te vullen, zullen conventionele biochemie, celbiologie, genetica, smFRET-tests, FCS en TIRF-microscopie worden gebruikt. Samen zal dit een uitgebreid begrip bieden van de bacteriële NER-route en de eerste stappen vormen naar mijn uiteindelijke doel, dat is om te begrijpen hoe menselijke cellen DNA herstellen. (Dutch)
16 December 2021
0 references
Il malfunzionamento della riparazione del DNA porta ad un accumulo di mutazioni, che spesso si traduce in cancro. La via Nucleotide Excision Repair (NER) rimuove le lesioni del DNA causate dalla luce UV, dal fumo di sigaretta e dai mutageni chimici. Ner è altamente conservato, e studiare il più semplice NER in batteri fornisce informazioni chiave nel NER umano. Propongo un approccio interdisciplinare per comprendere i dettagli meccanicistici del NER batterico nelle cellule viventi. Userò una combinazione di metodi monomolecole all'avanguardia per chiarire come il DNA viene riparato all'interno delle cellule viventi. Userò microscopia super-risoluzione combinata per studiare il comportamento delle singole proteine NER. Per completare questo, saranno utilizzati biochimica convenzionale, biologia cellulare, genetica, test smFRET, FCS e microscopia TIRF. Insieme, questo fornirà una comprensione completa del percorso NER batterico e costituirà i primi passi verso il mio obiettivo finale, che è quello di capire come le cellule umane riparano il DNA. (Italian)
16 January 2022
0 references
El mal funcionamiento de la reparación del ADN conduce a una acumulación de mutaciones, lo que con frecuencia resulta en cáncer. La vía Nucleotide Excision Repair (NER) elimina las lesiones de ADN causadas por la luz UV, el humo del cigarrillo y los mutágenos químicos. NER está altamente conservado, y el estudio de la NER más simple en bacterias proporciona una visión clave de NER humano. Propongo un enfoque interdisciplinario para comprender los detalles mecánicos de la NER bacteriana en las células vivas. Usaré una combinación de métodos de molécula única de vanguardia para dilucidar cómo se repara el ADN dentro de las células vivas. Usaré microscopía de superresolución combinada para estudiar el comportamiento de las proteínas individuales de NER. Para complementar esto, se utilizará la bioquímica convencional, la biología celular, la genética, los ensayos smFRET, la microscopía FCS y TIRF. Juntos, esto proporcionará una comprensión completa de la vía bacteriana NER y constituirá los primeros pasos hacia mi objetivo final, que es comprender cómo las células humanas reparan el ADN. (Spanish)
19 January 2022
0 references
Funktionsfejl i DNA-reparation fører til en akkumulering af mutationer, hvilket ofte resulterer i kræft. Nucleotid Excision Repair (NER) vej fjerner DNA-læsioner forårsaget af UV-lys, cigaretrøg og kemiske mutagener. Ner er meget bevaret, og at studere den enklere NER i bakterier giver nøgleindsigt i human NER. Jeg foreslår en tværfaglig tilgang til at forstå de mekanistiske detaljer om bakteriel NER i levende celler. Jeg vil bruge en kombination af avancerede enkeltmolekylemetoder til at belyse, hvordan DNA repareres inde i levende celler. Jeg vil bruge superopløsningsmikroskopi kombineret til at studere adfærden af de enkelte NER-proteiner. Som supplement hertil vil der blive anvendt konventionel biokemi, cellebiologi, genetik, smFRET-assays, FCS og TIRF-mikroskopi. Sammen vil dette give en omfattende forståelse af den bakterielle NER-vej og udgøre de første skridt mod mit ultimative mål, som er at forstå, hvordan menneskelige celler reparerer DNA. (Danish)
26 July 2022
0 references
Η δυσλειτουργία της επιδιόρθωσης του DNA οδηγεί σε συσσώρευση μεταλλάξεων, η οποία συχνά οδηγεί σε καρκίνο. Η οδός επιδιόρθωσης Nucleotide Excision Repair (NER) αφαιρεί μια βλάβη DNA που προκαλείται από το υπεριώδες φως, τον καπνό του τσιγάρου και τους χημικούς μεταλλαξιογόνους παράγοντες. Το NER είναι εξαιρετικά διατηρημένο και η μελέτη του απλούστερου NER στα βακτήρια παρέχει βασικές πληροφορίες για το ανθρώπινο NER. Προτείνω μια διεπιστημονική προσέγγιση για την κατανόηση των μηχανιστικών λεπτομερειών του βακτηριακού NER στα ζωντανά κύτταρα. Θα χρησιμοποιήσω ένα συνδυασμό μονομοριακών μεθόδων αιχμής για να διευκρινίσω πώς το DNA επισκευάζεται μέσα στα ζωντανά κύτταρα. Θα χρησιμοποιήσω μικροσκόπιο υπερ-ανάλυσης σε συνδυασμό για να μελετήσω τη συμπεριφορά των μεμονωμένων πρωτεϊνών NER. Για να συμπληρωθεί αυτό, θα χρησιμοποιηθούν συμβατική βιοχημεία, κυτταρική βιολογία, γενετική, δοκιμές smFRET, μικροσκοπία FCS και TIRF. Μαζί, αυτό θα παράσχει μια ολοκληρωμένη κατανόηση της βακτηριακής οδού NER και θα αποτελέσει τα πρώτα βήματα προς τον τελικό στόχο μου, ο οποίος είναι να κατανοήσω τον τρόπο με τον οποίο τα ανθρώπινα κύτταρα επισκευάζουν το DNA. (Greek)
26 July 2022
0 references
Neispravan popravak DNK dovodi do nakupljanja mutacija, što često rezultira rakom. Put za popravak ekscizije nukleotida (NER) uklanja DNK lezije uzrokovane UV svjetlom, dimom cigareta i kemijskim mutagenim tvarima. NER je vrlo očuvan, a proučavanje jednostavnijeg NER-a u bakterijama pruža ključni uvid u ljudski NER. Predlažem interdisciplinarni pristup za razumijevanje mehanističkih detalja bakterijskog NER-a u živim stanicama. Upotrijebit ću kombinaciju najsuvremenijih jednomolekula metoda kako bih razjasnio kako se DNK popravlja unutar živih stanica. Koristit ću mikroskopiju superrazlučivosti kombiniranu za proučavanje ponašanja pojedinih NER proteina. Kako bi se to dopunilo, koristit će se konvencionalna biokemija, biologija stanica, genetika, smFRET testovi, FCS i TIRF mikroskopija. To će zajedno pružiti sveobuhvatno razumijevanje bakterijskog NER puta i predstavljati prve korake prema mom krajnjem cilju, a to je razumjeti kako ljudske stanice popravljaju DNK. (Croatian)
26 July 2022
0 references
Repararea defectuoasă a ADN-ului duce la o acumulare de mutații, ceea ce duce frecvent la cancer. Calea de reparare prin excizie a nucleotidelor (NER) elimină leziunile ADN cauzate de lumina UV, fumul de țigară și mutagenii chimici. Ner este foarte conservat, iar studierea NER mai simplu în bacterii oferă o perspectivă cheie în NER uman. Propun o abordare interdisciplinară pentru a înțelege detaliile mecanice ale NER bacterian în celulele vii. Voi folosi o combinație de metode de ultimă oră cu o singură moleculă pentru a elucida modul în care ADN-ul este reparat în interiorul celulelor vii. Voi folosi microscopia de super-rezoluție combinată pentru a studia comportamentul proteinelor NER individuale. Pentru a completa acest lucru, se vor utiliza biochimia convențională, biologia celulară, genetica, testele smFRET, microscopia FCS și TIRF. Împreună, acest lucru va oferi o înțelegere cuprinzătoare a căii bacteriene NER și va constitui primii pași către obiectivul meu final, care este de a înțelege modul în care celulele umane repară ADN-ul. (Romanian)
26 July 2022
0 references
Nesprávne fungovanie opravy DNA vedie k akumulácii mutácií, ktoré často vedú k rakovine. Nucleotide Excision Repair (NER) odstraňuje lézie DNA spôsobené UV svetlom, cigaretovým dymom a chemickými mutagénmi. NER je vysoko zachovaná a štúdium jednoduchšieho NER v baktériách poskytuje kľúčový pohľad na ľudský NER. Navrhujem interdisciplinárny prístup k pochopeniu mechanistických detailov bakteriálneho NER v živých bunkách. Použijem kombináciu špičkových jednomolekulových metód na objasnenie toho, ako je DNA opravená v živých bunkách. Budem používať super-rozlíšenie mikroskopie v kombinácii na štúdium správania jednotlivých NER proteínov. Na doplnenie sa použije konvenčná biochémia, bunková biológia, genetika, skúšky smFRET, mikroskopia FCS a TIRF. Spoločne to poskytne komplexné pochopenie bakteriálnej cesty NER a predstavuje prvé kroky smerom k môjmu konečnému cieľu, ktorým je pochopiť, ako ľudské bunky opravujú DNA. (Slovak)
26 July 2022
0 references
In-nuqqas ta’ funzjonament tat-tiswija tad-DNA jwassal għal akkumulazzjoni ta’ mutazzjonijiet, li spiss jirriżultaw f’kanċer. Il-passaġġ Nucleotide Excision Repair (NER) ineħħi leżjonijiet tad-DNA kkawżati minn dawl UV, duħħan tas-sigaretti u mutaġeni kimiċi. Ner hija kkonservata ħafna, u l-istudju tal-NER aktar sempliċi fil-batterji jipprovdi għarfien ewlieni dwar l-NER tal-bniedem. Nipproponi approċċ interdixxiplinarju biex nifhmu d-dettalji mekkanistiċi tal-NER batterjali fiċ-ċelloli ħajjin. I se tuża kombinazzjoni ta ‘metodi l-aktar avvanzata waħda-molekula biex tiċċara kif DNA hija msewwija ġewwa ċelloli ħajjin. Se nuża mikroskopija superriżoluzzjoni kkombinata biex nistudja l-imġiba tal-proteini NER individwali. Biex tikkumplimenta dan, se tintuża l-bijokimika konvenzjonali, il-bijoloġija taċ-ċelloli, il-ġenetika, l-assaġġi smFRET, il-mikroskopija FCS u TIRF. Flimkien, dan se jipprovdi fehim komprensiv tal-passaġġ tan-NER batterjali, u jikkostitwixxi l-ewwel passi lejn l-għan aħħari tiegħi, li huwa li nifhem kif iċ-ċelloli umani jsewwu d-DNA. (Maltese)
26 July 2022
0 references
O mau funcionamento do reparo do DNA leva a um acúmulo de mutações, o que frequentemente resulta em cancro. A via Nucleotide Excision Repair (NER) remove lesões de DNA causadas por luz UV, fumo de cigarro e mutagens químicas. NER é altamente conservado, e estudar o NER mais simples em bactérias fornece uma visão chave sobre NER humano. Proponho uma abordagem interdisciplinar para compreender os pormenores mecanicistas da NER bacteriana nas células vivas. Vou usar uma combinação de métodos de última geração para elucidar como o DNA é reparado dentro de células vivas. Utilizarei a microscopia de superresolução combinada para estudar o comportamento das proteínas NER individuais. Para complementar isso, utilizar-se-ão a bioquímica convencional, a biologia telemóvel, a genética, os ensaios de smFRET, a microscopia FCS e TIRF. Juntos, isso proporcionará uma compreensão abrangente da via NER bacteriana e constituirá os primeiros passos para o meu objetivo final, que é entender como as células humanas reparam o DNA. (Portuguese)
26 July 2022
0 references
Viallinen DNA-korjaus johtaa mutaatioiden kertymiseen, mikä johtaa usein syöpään. Nucleotide Excision Repair (NER) -reitti poistaa UV-valon, savukkeiden ja kemiallisten mutageenien aiheuttamat DNA-vauriot. Ner on erittäin säilynyt, ja yksinkertaisemman NER: n tutkiminen bakteereissa antaa keskeisen käsityksen ihmisen NER: stä. Ehdotan tieteidenvälistä lähestymistapaa ymmärtääkseni bakteerin NER: n mekanistisia yksityiskohtia elävissä soluissa. Käytän huippuluokan yhdenmolekyylin menetelmien yhdistelmää selvittääkseni, miten DNA korjataan elävien solujen sisällä. Käytän superresoluutiomikroskopiaa yhdessä tutkiakseni yksittäisten NER-proteiinien käyttäytymistä. Tämän täydentämiseksi käytetään perinteistä biokemiaa, solubiologiaa, genetiikkaa, smFRET-testejä, FCS:ää ja TIRF-mikroskopiaa. Yhdessä tämä antaa kattavan käsityksen bakteerien NER-reitistä ja muodostaa ensimmäiset askeleet kohti lopullista tavoitettani, joka on ymmärtää, miten ihmisen solut korjaavat DNA: n. (Finnish)
26 July 2022
0 references
Nepravilno popravilo DNK vodi do kopičenja mutacij, kar pogosto povzroči raka. Nukleotid Excision Repair (NER) odpravlja poškodbe DNK, ki jih povzročajo UV svetloba, cigaretni dim in kemične mutagene snovi. Ner je zelo ohranjen in preučevanje enostavnejšega NER v bakterijah zagotavlja ključni vpogled v človeški NER. Predlagam interdisciplinarni pristop k razumevanju mehanističnih podrobnosti bakterijskega NER v živih celicah. Uporabil bom kombinacijo najsodobnejših enomolekulskih metod, da pojasnim, kako se DNK popravlja v živih celicah. Uporabila bom superresolucijsko mikroskopijo v kombinaciji za preučevanje obnašanja posameznih proteinov NER. Za dopolnitev tega se bodo uporabljali konvencionalna biokemija, celična biologija, genetika, testi smFRET, FCS in TIRF mikroskopija. Skupaj bo to zagotovilo celovito razumevanje poti bakterijskega NER in predstavljalo prve korake k mojemu končnemu cilju, ki je razumeti, kako človeške celice popravljajo DNK. (Slovenian)
26 July 2022
0 references
Chybná oprava DNA vede k hromadění mutací, které často vedou k rakovině. Cesta Nucleotid Excision Repair (NER) odstraňuje DNA léze způsobené UV světlem, cigaretovým kouřem a chemickými mutageny. Ner je vysoce konzervovaný a studium jednoduššího NER v bakteriích poskytuje klíčový vhled do lidského NER. Navrhuji interdisciplinární přístup k pochopení mechanistických detailů bakteriálního NER v živých buňkách. Budu používat kombinaci nejmodernějších jednomolekulových metod, abych objasnil, jak se DNA opravuje uvnitř živých buněk. Pro studium chování jednotlivých NER proteinů budu používat mikroskopii superrozlišení. Jako doplněk bude použita konvenční biochemie, buněčná biologie, genetika, testy smFRET, mikroskopie FCS a TIRF. Společně to poskytne komplexní pochopení bakteriální dráhy NER a představuje první kroky k mému konečnému cíli, kterým je pochopit, jak lidské buňky obnovují DNA. (Czech)
26 July 2022
0 references
Netinkamas DNR remontas sukelia mutacijų kaupimąsi, o tai dažnai sukelia vėžį. Nucleotide Excision Repair (NER) kelias pašalina DNR pažeidimus, kuriuos sukelia UV šviesa, cigarečių dūmai ir cheminiai mutagenai. NER yra labai išsaugotas, o paprastesnio NER tyrimas bakterijomis suteikia pagrindinį supratimą apie žmogaus NER. Aš siūlau tarpdisciplininį požiūrį suprasti mechanistines bakterinių NER detales gyvose ląstelėse. Aš naudosiu pažangiausius vienos molekulės metodus, kad išsiaiškinčiau, kaip DNR atkuriama gyvų ląstelių viduje. Aš naudosiu super skiriamosios gebos mikroskopiją, kad ištirčiau atskirų NER baltymų elgesį. Šiam tikslui papildyti bus naudojama tradicinė biochemija, ląstelių biologija, genetika, smFRET tyrimai, FCS ir TIRF mikroskopija. Kartu tai suteiks išsamų supratimą apie bakterijų NER kelią ir bus pirmieji žingsniai siekiant mano galutinio tikslo, t. y. suprasti, kaip žmogaus ląstelės atstato DNR. (Lithuanian)
26 July 2022
0 references
Nepareiza DNS labošana izraisa mutāciju uzkrāšanos, kas bieži izraisa vēzi. Nukleotīda Excision Repair (NER) ceļš noņem DNS bojājumus, ko izraisa UV gaisma, cigarešu dūmi un ķīmiskie mutagēni. NIR ir ļoti saglabāts, un vienkāršāko NER izpēte baktērijās sniedz galveno ieskatu cilvēka NER. ES ierosinu starpdisciplināru pieeju, lai saprastu baktēriju NER mehānistiskās detaļas dzīvajās šūnās. ES izmantošu progresīvu vienas molekulas metožu kombināciju, lai noskaidrotu, kā DNS tiek remontēta dzīvo šūnu iekšienē. ES izmantošu superizšķirtspējas mikroskopiju kopā, lai pētītu atsevišķu NER proteīnu uzvedību. Lai to papildinātu, tiks izmantota tradicionālā bioķīmija, šūnu bioloģija, ģenētika, smFRET testi, FCS un TIRF mikroskopija. Kopā tas nodrošinās visaptverošu izpratni par baktēriju NER ceļu un būs pirmie soļi ceļā uz manu galīgo mērķi, proti, saprast, kā cilvēka šūnas labo DNS. (Latvian)
26 July 2022
0 references
Неправилното възстановяване на ДНК води до натрупване на мутации, което често води до рак. Пътят за възстановяване на нуклеотидните ексцизии (NER) премахва ДНК лезии, причинени от UV светлина, цигарен дим и химически мутагени. НЕР е силно запазена и изучаването на по-простия NER в бактериите осигурява ключово вникване в човешкия NER. Предлагам интердисциплинарен подход за разбиране на механичните детайли на бактериалния NER в живите клетки. Ще използвам комбинация от авангардни едномолекулни методи за изясняване на начина, по който ДНК се поправя вътре в живите клетки. Ще използвам микроскопия със суперрезолюция, комбинирана, за да изследвам поведението на отделните NER протеини. За да се допълни това, ще се използват конвенционална биохимия, клетъчна биология, генетика, smFRET тестове, FCS и TIRF микроскопия. Заедно това ще осигури цялостно разбиране на бактериалния NER път и ще представлява първите стъпки към крайната ми цел, а именно да разбера как човешките клетки възстановяват ДНК. (Bulgarian)
26 July 2022
0 references
A DNS-javítás hibás működése a mutációk felhalmozódásához vezet, ami gyakran rákot eredményez. A Nucleotide Excision Repair (NER) útvonal eltávolítja az UV fény, a cigarettafüst és a kémiai mutagének által okozott DNS-elváltozásokat. A NER nagyon megőrzött, és a baktériumokban az egyszerűbb NER tanulmányozása kulcsfontosságú betekintést nyújt az emberi NER-be. Interdiszciplináris megközelítést javasolok, hogy megértsük a bakteriális NER mechanisztikus részleteit az élő sejtekben. Az élvonalbeli egymolekula módszerek kombinációját fogom használni, hogy kiderítsem, hogyan javítják a DNS-t az élő sejtekben. Szuperfelbontású mikroszkópiát használok az egyes NER fehérjék viselkedésének tanulmányozására. Ennek kiegészítéseként a hagyományos biokémia, sejtbiológia, genetika, smFRET vizsgálatok, FCS és TIRF mikroszkópia kerül alkalmazásra. Együtt ez biztosítja a bakteriális NER útvonal átfogó megértését, és az első lépéseket jelenti a végső célom felé, amely annak megértése, hogy az emberi sejtek hogyan javítják a DNS-t. (Hungarian)
26 July 2022
0 references
Bíonn carnadh sóchán mar thoradh ar dheisiú DNA a mhífheidhmiú, rud a mbíonn ailse mar thoradh air go minic. Cuireann an cosán Deisiúchán Beachtais Nucleotide (NER) loit DNA de bharr solas UV, deatach toitíní agus só-ghineacha ceimiceacha. Tá Ner thar a bheith caomhnaithe, agus tugann staidéar ar an NER simplí i mbaictéir léargas lárnach ar NER daonna. Molaim cur chuige idirdhisciplíneach chun tuiscint a fháil ar shonraí meicníocha NER baictéarach i gcealla beo. Bainfidh mé úsáid as meascán de mhodhanna aonmhóilíneacha ceannródaíocha chun léiriú a thabhairt ar an gcaoi a ndéantar DNA a dheisiú taobh istigh de chealla maireachtála. Úsáidfidh mé micreascópacht sár-taifigh le chéile chun staidéar a dhéanamh ar iompar próitéiní aonair NER. Chun an méid sin a chomhlánú, úsáidfear gnáth-bhithcheimic, bitheolaíocht cille, géineolaíocht, measúnachtaí smFRET, micreascópacht FCS agus TIRF. Le chéile, soláthróidh sé seo tuiscint chuimsitheach ar an mbealach baictéarach NER, agus is ionann é agus na chéad chéimeanna i dtreo mo sprioc dheiridh, is é sin le tuiscint a fháil ar conas a dheisiú cealla daonna DNA. (Irish)
26 July 2022
0 references
Felaktig DNA reparation leder till en ackumulering av mutationer, vilket ofta resulterar i cancer. Nucleotide Excision Repair (NER) väg avlägsnar en DNA-lesioner som orsakas av UV-ljus, cigarettrök och kemiska mutagena ämnen. Nörd är mycket bevarad, och att studera den enklare NER i bakterier ger viktig inblick i människans NER. Jag föreslår ett tvärvetenskapligt tillvägagångssätt för att förstå de mekanistiska detaljerna i bakteriell NER i levande celler. Jag kommer att använda en kombination av banbrytande single-molekyle metoder för att belysa hur DNA repareras inuti levande celler. Jag kommer att använda superupplösningsmikroskopi kombinerat för att studera beteendet hos enskilda NER-proteiner. För att komplettera detta kommer konventionell biokemi, cellbiologi, genetik, smFRET-analyser, FCS och TIRF-mikroskopi att användas. Tillsammans kommer detta att ge en omfattande förståelse av den bakteriella NER-vägen och utgöra de första stegen mot mitt slutliga mål, vilket är att förstå hur mänskliga celler reparerar DNA. (Swedish)
26 July 2022
0 references
Ebaõnnestunud DNA parandamine põhjustab mutatsioonide kuhjumist, mis sageli põhjustab vähki. Nucleotide Excision Repair (NER) rada eemaldab UV-valguse, sigaretisuitsu ja keemiliste mutageenide põhjustatud DNA kahjustused. NER on väga konserveeritud ja bakterite lihtsamate NER-ide uurimine annab olulise ülevaate inimese NER-st. Pakun välja interdistsiplinaarse lähenemisviisi, et mõista elusrakkude bakteriaalse NERi mehhanistlikke üksikasju. Ma kasutan uusimate ühe molekuli meetodite kombinatsiooni, et selgitada, kuidas DNA-d elusrakkudes parandatakse. Ma kasutan superresolutsiooniga mikroskoopiat, et uurida üksikute NER-valkude käitumist. Selle täiendamiseks kasutatakse tavapärast biokeemiat, rakubioloogiat, geneetikat, smFRET-analüüse, FCS-i ja TIRF-mikroskoopiat. Koos annab see põhjaliku ülevaate bakteriaalsest NER-rajast ja on esimesed sammud minu lõppeesmärgi suunas, milleks on mõista, kuidas inimese rakud DNA-d parandavad. (Estonian)
26 July 2022
0 references
Cały Kraj
0 references
24 May 2023
0 references
Identifiers
POIR.04.04.00-00-1CA9/16
0 references