Clinical relevance of human and microbiome transkiptoma included in extracellular vesicles (Q3056401)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3056401 in Latvia
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Clinical relevance of human and microbiome transkiptoma included in extracellular vesicles |
Project Q3056401 in Latvia |
Statements
374,918.54 Euro
0 references
648,648.0 Euro
0 references
57.8 percent
0 references
1 April 2019
0 references
31 March 2022
0 references
Atvasināta publiska persona "Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs"
0 references
56°58'59.81"N, 24°1'53.44"E
0 references
Cilvēka asinīs esošās ekstracelulārās vezikulas (EVs) var būt veidojušās gan no dažādām normālām šūnām, gan arī vēža šūnām. Ir pierādīts, ka EVs, kas izolētas no vēža pacientu asinīm satur dažādas vēža specifiskas molekulas, tādēļ ar to palīdzību var atklāt vēža klātbūtni, prognozēt tā agresivitāti un izsekot slimības progresijai. Šis projekts ir balstīts uz mūsu iepriekšējo pētījumu rezultātiem, kas parādīja, ka EVs satur ne tikai dažāda veida RNS molekulas, ko producē cilvēka šūnas, bet arī mikroorganismu RNS. Šī projekta galvenais mērķis ir iegūt jaunas zināšanas par vēža pacientu asinīs esošo EV RNS saturu un to izcelsmi, un izpētīt to potenciālo pielietojumu trīs dažādu vēža veidu – prostatas, krūts un kuņģa vēža diagnostikā, prognostikā un agrīnā recidīvu noteikšanā.Mēs plānojam paplašināt longitudinālu vēža biobanku, kas ietver detalizētu klīnisko informāciju, audzēja audu paraugus, kā arī vēža pacientu asins un fēču paraugus. EVs tiks izolētas no vēža pacientu un kontroles grupas plazmas un fēču paraugiem, un to RNS saturs tiks analizēts kopā ar katra pacienta audzēja un normālo audu RNS saturu. Tiks veikta virkne dažādu analīžu, lai novērtētu dažādu RNS klašu korelāciju ar klīniskiem un patoloģiskiem rādītājiem, un noteiktu to diagnostisko un prognostisko vērtību. Visbeidzot, tiks izstrādāti digitālā PCR testi izvēlēto RNS biomarķieru absolūtajai kvantificēšanai cilvēka plazmā un novērtēta to klīniskā lietderība.Mēs sagaidām, ka šī projekta īstenošanas rezultātā tiks identificēti RNS biomarķieri, kas spēj parādīt vēža klātbūtni un/vai korelē ar tā agresivitāti un slimības gaitu, un ir pielietojami asins analīžu izstrādei. Pašlaik šī tehnoloģija ir TRL2 līmenī un mēs sagaidām, ka projekta beigās tā sasniegs TRL4.Šis projekts atbilst RIS3 virzienam “Nākotnes izaugsmes tautsaimniecības nozares, kurās eksistē vai var rasties produkti un pakalpojumi ar augstu pievienoto vērtību” specializācijas jomā “biomedicīna, medicīnas tehnoloģija, biofarmācija un biotehnoloģija”, un atbilst NACE 72.11. Šis projekts atbilst rūpniecisko pētījumu kategorijai un nav saistīts ar saimniecisko darbību.Šis ir starpdisciplinārs pētījums, kurā, atbilstoši OECD klasifikācijai, iesaistītas bioloģijas (1.6.), datorzinātnes un informātikas (1.2.), bāzes medicīnas (3.1.) un klīniskās medicīnas (3.2.) zinātņu nozares.Šis projekts tiks īstenots sadarbībā starp Latvijas Biomedicīnas pētījumu un pētījumu centru un klīniskās diagnostikas laboratoriju SIA GenEra. Projekta īstenošanā tiks iesaisti studenti (>25% no kopējās noslodzes), kā arī tiks izveidota jauna zinātniskā darbinieka darba vieta. Projekts tiks īstenots, sākot ar 2019. gada 1.aprīli līdz 2022.gada 31.martam, un tā ilgums ir 36 mēneši. Projekta kopējais attiecināmais finansējums ir 648 648 EUR, no kā ERAF finansējums sastāda 374 918.54 EUR.Atslēgas vārdi: ekstracelulārās vezikulas, vēzis, šķidrā biopsija, nekodējošās RNS, audzēja mikrobioms. (Latvian)
0 references
Extracellular vesicles (EVs) in human blood may be formed from a variety of normal cells as well as from cancer cells. EVs isolated from the blood of cancer patients have been shown to contain various cancer-specific molecules, so they can detect the presence of cancer, predict its aggressiveness and track the progression of the disease. This project is based on the results of our previous studies, which showed that EVs contains not only various types of RNA molecules produced by human cells, but also microorganism RNA. The main aim of this project is to gain new knowledge about the content and origin of EV RNA in the blood of cancer patients, and to explore their potential use in the diagnosis, prognosticity and early relapse of three different types of cancer – prognostic and early relapses.We plan to expand the longitudinal cancer biobank, which includes detailed clinical information, samples of tumour tissue, as well as samples of blood and faeces of cancer patients. EVS will be isolated from plasma and faeces samples from cancer patients and controls and their RNA content will be analysed with each patient’s tumour and normal tissue RNA content. A number of different analyses will be performed to evaluate correlations between different RNA classes and clinical and pathological parameters, and to determine their diagnostic and prognostic value. Finally, digital PCR tests for absolute quantification of selected RNA biomarkers in human plasma will be developed and their clinical usefulness assessed.We expect that this project will result in the identification of RNA biomarkers able to show the presence of cancer and/or correlate with its aggressiveness and disease course, and can be used for the development of blood tests. Currently, this technology is at the level of TRL2 and we expect it to reach TRL4 at the end of the project.This project follows the direction of RIS3 “Future growth economic sectors where high added value products and services exist or may arise” in the area of specialisation “biomedicine, medical technology, biopharmaceutical and biotechnology” and is in line with NACE 72.11. This project corresponds to the category of industrial research and is not related to economic activities.This is an interdisciplinary study in which according to the OECD classification involved fields of biology (1.6), computer science and informatics (1.2), basic medicine (3.1) and clinical medicine (3.2).This project will be implemented in cooperation between the Latvian Biomedical Research and Research Centre and clinical diagnostic laboratory SIA GenEra. The project will involve students (> 25 % of the total workload), as well as a new researcher’s workplace will be created. The project will be implemented from 1 April 2019 until 31 March 2022 and its duration is 36 months. The total eligible funding of the project is EUR 648648, from which ERDF funding is EUR 374918.54.The key words: Extracellular vesicles, cancer, liquid biopsy, non-corrosive RNA, tumour microbiome. (English)
15 July 2021
0 references
Les vésicules extracellulaires (EV) dans le sang humain peuvent être formées à partir de différentes cellules normales ainsi que de cellules cancéreuses. Il a été démontré que les EVS isolés du sang des patients cancéreux contiennent diverses molécules spécifiques au cancer, de sorte qu’ils peuvent détecter la présence du cancer, prédire son agressivité et suivre la progression de la maladie. Ce projet est basé sur les résultats de nos recherches précédentes, qui ont montré que les VE contiennent non seulement différents types de molécules d’ARN produites par les cellules humaines, mais aussi l’ARN des microorganismes. L’objectif principal de ce projet est d’acquérir de nouvelles connaissances sur le contenu de l’ARN du VE dans le sang des patients cancéreux et leur origine, et d’explorer leur application potentielle dans trois types différents de cancer — cancer de la prostate, du sein et du cancer gastrique, pronostique et détection précoce des rechutes. L’EVS sera isolée à partir d’échantillons plasmatiques et fécaux de patients atteints de cancer et de groupes témoins et leur teneur en ARN sera analysée en même temps que la teneur en ARN de la tumeur et du tissu normal de chaque patient. Une série d’analyses différentes sera effectuée afin d’évaluer la corrélation entre les différentes classes d’ARN et les indicateurs cliniques et pathologiques et de déterminer leur valeur diagnostique et prédictive. Enfin, des tests numériques de PCR seront mis au point pour la quantification absolue de certains biomarqueurs d’ARN dans le plasma humain et leur utilité clinique sera évaluée. Nous nous attendons à ce que ce projet aboutisse à l’identification de biomarqueurs d’ARN capables de démontrer la présence d’un cancer et/ou en corrélation avec son agressivité et l’évolution de la maladie, et conviennent au développement de tests sanguins. Actuellement, cette technologie est au niveau TRL2 et nous prévoyons qu’elle atteindra TRL4 à la fin du projet. Ce projet est conforme à l’axe RIS3 des secteurs économiques de croissance future où des produits et services à forte valeur ajoutée existent ou peuvent se produire" dans le domaine de la spécialisation "biomédecine, technologie médicale, biopharmaceutique et biotechnologie" et correspond à la NACE 72.11. Ce projet correspond à la catégorie de la recherche industrielle et n’est pas lié à l’activité économique. Il s’agit d’une étude interdisciplinaire qui, selon la classification de l’OCDE, porte sur les domaines de la biologie (1.6), de l’informatique et de l’informatique (1.2), de la médecine fondamentale (3.1) et de la médecine clinique (3.2). Les étudiants seront impliqués dans la mise en œuvre du projet (>25 % de la charge de travail totale), ainsi qu’un nouveau lieu de travail d’un personnel scientifique sera créé. Le projet sera mis en œuvre du 1er avril 2019 au 31 mars 2022 pour une durée de 36 mois. Le financement total éligible pour le projet s’élève à 648 648 EUR, dont le financement du FEDER s’élève à 374 918,54 EUR. vésicules extracellulaires, cancer, biopsie liquide, ARN non cancéreux, microbiome tumoral. (French)
25 November 2021
0 references
Extrazelluläre Vesikle (EVs) im menschlichen Blut können aus verschiedenen normalen Zellen sowie aus Krebszellen gebildet werden. Aus dem Blut von Krebspatienten isolierte EVS haben gezeigt, dass sie verschiedene krebsspezifische Moleküle enthalten, so dass sie das Vorhandensein von Krebs erkennen, ihre Aggressivität vorhersagen und den Verlauf der Krankheit verfolgen können. Dieses Projekt basiert auf den Ergebnissen unserer bisherigen Forschung, die gezeigt hat, dass EVs nicht nur verschiedene Arten von RNA-Molekülen enthalten, die von menschlichen Zellen produziert werden, sondern auch die RNA von Mikroorganismen. Hauptziel dieses Projekts ist es, neue Erkenntnisse über den Inhalt von EV RNA im Blut von Krebspatienten und deren Herkunft zu gewinnen und deren mögliche Anwendung bei drei verschiedenen Krebsarten – Prostata-, Brust- und Magenkrebskrebs, Prognose und Frührückfalldetektion – zu untersuchen. Wir planen, die Längsschnittkrebsbiobank zu erweitern, die detaillierte klinische Informationen, Tumorgewebeproben sowie Blut- und Stuhlproben von Krebspatienten umfasst. EFD wird aus Plasma- und Fäkalproben von Krebspatienten und Kontrollgruppen isoliert, und ihr RNA-Gehalt wird zusammen mit dem RNA-Gehalt des jeweiligen Patienten Tumors und des normalen Gewebes analysiert. Es wird eine Reihe verschiedener Analysen durchgeführt, um die Korrelation verschiedener RNA-Klassen mit klinischen und pathologischen Indikatoren zu bewerten und ihren diagnostischen und prädiktiven Wert zu bestimmen. Schließlich werden digitale PCR-Tests zur absoluten Quantifizierung ausgewählter RNA-Biomarker im menschlichen Plasma entwickelt und deren klinischer Nutzen bewertet. Wir gehen davon aus, dass dieses Projekt zur Identifizierung von RNA-Biomarkern führen wird, die das Vorhandensein von Krebs nachweisen und/oder mit seiner Aggressivität und dem Verlauf der Krankheit korrelieren und für die Entwicklung von Bluttests geeignet sind. Derzeit befindet sich diese Technologie auf TRL2-Ebene und wir erwarten, dass sie am Ende des Projekts TRL4 erreichen wird. Dieses Projekt steht im Einklang mit der RIS3-Achse der Wirtschaftssektoren des künftigen Wachstums, in denen Produkte und Dienstleistungen mit hohem Mehrwert bestehen oder auftreten können" im Bereich der Spezialisierung "Biomedizin, Medizintechnik, Biopharmazeutika und Biotechnologie" und entspricht der NACE 72.11. Dieses Projekt entspricht der Kategorie der industriellen Forschung und steht nicht im Zusammenhang mit der Wirtschaftstätigkeit. Dies ist eine interdisziplinäre Studie, die laut OECD-Klassifikation die Bereiche Biologie (1.6), Informatik und Informatik (1.2), Grundlagenmedizin (3.1) und klinische Medizin (3.2) umfasst. Dieses Projekt wird in Zusammenarbeit zwischen dem lettischen Biomedizinischen Forschungs- und Forschungszentrum und dem Clinical Diagnostic Laboratory genera Ltd. durchgeführt. Die Studierenden werden in die Durchführung des Projekts einbezogen (>25 % des Gesamtarbeitsaufwands), sowie ein neuer Arbeitsplatz eines wissenschaftlichen Personals geschaffen werden. Das Projekt wird vom 1. April 2019 bis zum 31. März 2022 mit einer Laufzeit von 36 Monaten durchgeführt. Förderfähig sind insgesamt 648 648 EUR, von denen sich die EFRE-Mittel auf 374 918,54 EUR belaufen. extrazelluläre Vesikle, Krebs, flüssige Biopsie, nicht Krebs RNA, Tumor-Mikrobiom. (German)
28 November 2021
0 references
Extracellulaire blaasjes (EVs) in menselijk bloed kunnen worden gevormd uit verschillende normale cellen en uit kankercellen. EVS geïsoleerd uit het bloed van kankerpatiënten is aangetoond dat ze verschillende kanker-specifieke moleculen bevatten, zodat ze de aanwezigheid van kanker kunnen detecteren, de agressiviteit ervan kunnen voorspellen en ziekteprogressie kunnen volgen. Dit project is gebaseerd op de resultaten van ons vorige onderzoek, waaruit bleek dat EV’s niet alleen verschillende soorten RNA-moleculen bevatten die door menselijke cellen worden geproduceerd, maar ook het RNA van micro-organismen. Het belangrijkste doel van dit project is om nieuwe kennis te verwerven over de inhoud van EV RNA in het bloed van kankerpatiënten en hun oorsprong, en om hun potentiële toepassing te onderzoeken in drie verschillende soorten kanker — prostaat-, borst- en maagkankerkanker, prognostiek en vroege recidiefdetectie. We zijn van plan om de longitudinale kankerbiobank uit te breiden, met gedetailleerde klinische informatie, tumorweefselmonsters, evenals bloed- en fecesmonsters van kankerpatiënten. EVS zal worden geïsoleerd uit plasma- en fecale monsters van kankerpatiënten en controlegroepen en hun RNA-gehalte zal worden geanalyseerd samen met het RNA-gehalte van de tumor en het normale weefsel van elke patiënt. Een reeks verschillende analyses zal worden uitgevoerd om de correlatie van verschillende RNA-klassen met klinische en pathologische indicatoren te beoordelen en hun diagnostische en voorspellende waarde te bepalen. Ten slotte zullen digitale PCR-tests worden ontwikkeld voor de absolute kwantificering van geselecteerde RNA-biomarkers in menselijk plasma en hun klinische nut zal worden beoordeeld. We verwachten dat dit project zal resulteren in de identificatie van RNA-biomarkers die de aanwezigheid van kanker kunnen aantonen en/of correleren met zijn agressiviteit en verloop van de ziekte, en geschikt zijn voor de ontwikkeling van bloedonderzoeken. Momenteel is deze technologie op TRL2-niveau en we verwachten dat deze aan het einde van het project TRL4 zal bereiken. Dit project is in overeenstemming met de RIS3-as van economische sectoren van toekomstige groei waar producten en diensten met een hoge toegevoegde waarde bestaan of kunnen voorkomen" op het gebied van specialisatie "biogeneeskunde, medische technologie, biofarmaceutica en biotechnologie" en komt overeen met NACE 72.11. Dit project komt overeen met de categorie industrieel onderzoek en houdt geen verband met economische activiteiten. Dit is een interdisciplinaire studie die volgens de OESO-classificatie betrekking heeft op de gebieden biologie (1.6), informatica en informatica (1.2), basisgeneeskunde (3.1) en klinische geneeskunde (3.2). Dit project zal worden uitgevoerd in samenwerking tussen het Letse Biomedisch Onderzoeks- en Onderzoekscentrum en het Clinical Diagnostic Laboratory genera Ltd. Studenten zullen worden betrokken bij de uitvoering van het project (>25 % van de totale werklast), evenals een nieuwe werkplek van een wetenschappelijk personeel. Het project wordt uitgevoerd van 1 april 2019 tot en met 31 maart 2022 met een looptijd van 36 maanden. De totale subsidiabele financiering voor het project bedraagt 648 648 EUR, waarvan de EFRO-financiering 374 918,54 EUR bedraagt. extracellulaire blaasjes, kanker, vloeibare biopsie, niet-kanker RNA, tumormicrobiome. (Dutch)
28 November 2021
0 references
Le vescicole extracellulari (EV) nel sangue umano possono essere formate da diverse cellule normali e da cellule tumorali. SVE isolato dal sangue dei pazienti oncologici ha dimostrato di contenere varie molecole tumorali specifiche, in modo da poter rilevare la presenza di cancro, prevedere la sua aggressività e tracciare la progressione della malattia. Questo progetto si basa sui risultati della nostra precedente ricerca, che ha dimostrato che i veicoli elettrici contengono non solo diversi tipi di molecole di RNA prodotte dalle cellule umane, ma anche l'RNA dei microrganismi. L'obiettivo principale di questo progetto è quello di acquisire nuove conoscenze sul contenuto di EV RNA nel sangue dei pazienti oncologici e sulla loro origine, e di esplorarne la potenziale applicazione in tre diversi tipi di cancro: cancro alla prostata, al seno e al cancro gastrico, prognostica e individuazione precoce della ricaduta. Abbiamo in programma di espandere la biobanca del cancro longitudinale, che include informazioni cliniche dettagliate, campioni di tessuti tumorali, nonché campioni di sangue e feci di pazienti oncologici. L'EVS sarà isolato da campioni plasmatici e fecali di pazienti oncologici e gruppi di controllo e il loro contenuto di RNA sarà analizzato insieme al contenuto di RNA del tumore di ciascun paziente e del tessuto normale. Saranno effettuate diverse analisi per valutare la correlazione delle diverse classi di RNA con indicatori clinici e patologici e per determinarne il valore diagnostico e predittivo. Infine, saranno sviluppati test PCR digitali per la quantificazione assoluta dei biomarcatori RNA selezionati nel plasma umano e la loro utilità clinica sarà valutata. Ci aspettiamo che questo progetto si traduca nell'identificazione di biomarcatori RNA in grado di dimostrare la presenza di tumori e/o correlarne l'aggressività e il decorso della malattia, e siano adatti allo sviluppo di esami del sangue. Attualmente, questa tecnologia è a livello TRL2 e ci aspettiamo che raggiunga il TRL4 alla fine del progetto. Questo progetto è in linea con l'asse RIS3 dei settori economici di crescita futura in cui esistono o possono verificarsi prodotti e servizi ad alto valore aggiunto" nel campo della specializzazione "biomedicina, tecnologia medica, biofarmaceutica e biotecnologia" e corrisponde alla NACE 72.11. Questo progetto corrisponde alla categoria della ricerca industriale e non è legato all'attività economica. Si tratta di uno studio interdisciplinare che, secondo la classificazione OCSE, coinvolge i settori della biologia (1.6), dell'informatica e dell'informatica (1.2), della medicina di base (3.1) e della medicina clinica (3.2). Questo progetto sarà attuato in collaborazione tra il Centro lettone di ricerca e ricerca biomedica e il Laboratorio diagnostico clinico genera Ltd. Gli studenti saranno coinvolti nella realizzazione del progetto (>25 % del carico di lavoro totale), così come un nuovo posto di lavoro di uno staff scientifico sarà creato. Il progetto sarà attuato dal 1º aprile 2019 al 31 marzo 2022 per una durata di 36 mesi. Il finanziamento totale ammissibile per il progetto è pari a 648 648 EUR, di cui il finanziamento FESR ammonta a 374 918,54 EUR. vescicole extracellulari, cancro, biopsia liquida, RNA non tumorale, microbioma tumorale. (Italian)
11 January 2022
0 references
Las vesículas extracelulares (VE) en la sangre humana se pueden formar a partir de diferentes células normales, así como de células cancerosas. El SVE aislado de la sangre de los pacientes de cáncer ha demostrado contener varias moléculas específicas del cáncer, por lo que pueden detectar la presencia de cáncer, predecir su agresividad y rastrear la progresión de la enfermedad. Este proyecto se basa en los resultados de nuestra investigación anterior, que mostró que los VE contienen no solo diferentes tipos de moléculas de ARN producidas por células humanas, sino también el ARN de microorganismos. El objetivo principal de este proyecto es adquirir nuevos conocimientos sobre el contenido del ARN del VE en la sangre de los pacientes de cáncer y su origen, y explorar su posible aplicación en tres tipos diferentes de cáncer: cáncer de próstata, cáncer de mama y gástrico, pronósticos y detección temprana de recaídas. El SVE se aislará de muestras plasmáticas y fecales de pacientes de cáncer y grupos de control y su contenido de ARN se analizará junto con el contenido de ARN del tumor y del tejido normal de cada paciente. Se realizará una serie de análisis diferentes para evaluar la correlación de diferentes clases de ARN con indicadores clínicos y patológicos y para determinar su valor diagnóstico y predictivo. Finalmente, se desarrollarán pruebas de PCR digitales para la cuantificación absoluta de biomarcadores de ARN seleccionados en plasma humano y su utilidad clínica será evaluada. Esperamos que este proyecto dé como resultado la identificación de biomarcadores de ARN capaces de demostrar la presencia de cáncer o correlacionar con su agresividad y curso de la enfermedad, y sean adecuados para el desarrollo de análisis de sangre. Actualmente, esta tecnología se encuentra en el nivel TRL2 y esperamos que llegue a TRL4 al final del proyecto. Este proyecto está en línea con el eje RIS3 de sectores económicos de crecimiento futuro en los que existen o pueden producirse productos y servicios de alto valor añadido" en el ámbito de la especialización "biomedicina, tecnología médica, biofarmacéutica y biotecnología" y corresponde a la NACE 72.11. Este proyecto corresponde a la categoría de investigación industrial y no está relacionado con la actividad económica. Se trata de un estudio interdisciplinario que, según la clasificación de la OCDE, incluye los campos de la biología (1.6), la informática y la informática (1.2), la medicina básica (3.1) y la medicina clínica (3.2). Este proyecto se ejecutará en cooperación entre el Centro de Investigación e Investigación Biomédica de Letonia y los géneros de Clinical Diagnostic Laboratory Ltd. Los estudiantes participarán en la ejecución del proyecto (>25 % de la carga de trabajo total), así como se creará un nuevo lugar de trabajo de un personal científico. El proyecto se ejecutará desde el 1 de abril de 2019 hasta el 31 de marzo de 2022, con una duración de 36 meses. La financiación total subvencionable para el proyecto asciende a 648 648 EUR, de los cuales la financiación del FEDER asciende a 374 918,54 EUR. vesículas extracelulares, cáncer, biopsia líquida, ARN no canceroso, microbioma tumoral. (Spanish)
12 January 2022
0 references
Rātsupītes iela 1 k-1, Rīga, LV-1067
0 references
Rātsupītes iela 1 k-1, Rīga, LV-1067
0 references
Identifiers
1.1.1.1/18/A/084
0 references