MIXED VIRUS INFECTIONS IN CULTIVATED PLANTS: DYNAMICS OF GUEST INTERACTIONS AND EFFECTS ON VECTOR DISSEMINATION (Q3200631)
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Project Q3200631 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | MIXED VIRUS INFECTIONS IN CULTIVATED PLANTS: DYNAMICS OF GUEST INTERACTIONS AND EFFECTS ON VECTOR DISSEMINATION |
Project Q3200631 in Spain |
Statements
130,075.0 Euro
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260,150.0 Euro
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50.0 percent
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30 December 2016
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31 December 2020
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CENTRO DE INVESTIGACION EN AGRIGENOMICA
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41°29'27.71"N, 2°8'15.00"E
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08266
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CONTINUANDO LA LINEA INICIADA EN EL PROYECTO ANTERIOR, SE BUSCA PROFUNDIZAR EN LA COMPRENSION DE LAS FRECUENTES INFECCIONES MIXTAS, CAUSADAS POR DOS O MAS VIRUS PRESENTES SIMULTANEAMENTE EN PLANTAS CULTIVADAS, Y QUE DAN LUGAR A ENFERMEDADES COMPLEJAS ESPECIFICAS. SE HA OBSERVADO QUE LAS INTERACCIONES ENTRE LOS VIRUS Y LA PLANTA HUESPED SIGUEN A MENUDO IMPORTANTES CAMBIOS A LO LARGO DEL TIEMPO, Y EL NIVEL DE DAÑO CAUSADO SE PUEDE MODULAR HASTA INCLUSO INVERTIRSE DESDE UN SINERGISMO INICIAL CON EXACERBACION DE SINTOMAS A UNA ATENUACION DEL EFECTO COMBINADO EN TIEMPOS TARDIOS. LOS PROCESOS RELEVANTES PARA ESTA RESPUESTA DINAMICA HAN SIDO POCO ESTUDIADOS, PERO PODRIAN AYUDAR A EXPLICAR LA PREVALENCIA DE LAS INFECCIONES MIXTAS SI COMO CONSECUENCIA FAVORECEN LA DISEMINACION DE LAS VIROSIS, POR LO QUE PROPONEMOS INCORPORARLOS AL TRABAJO EN CURSO. LA HIPOTESIS DE PARTIDA ES QUE ESTA RESPUESTA DINAMICA PREVISIBLEMENTE SEA LA RESULTANTE DE INTERACCIONES A DOS NIVELES: I) INTERNAMENTE, POR LA MODIFICACION DE LAS RESPUESTAS DEFENSIVAS EN LA PLANTA (INCLUYENDO SILENCIAMIENTO GENICO Y RESPUESTAS DEPENDIENTES DE SEÑALIZACION HORMONAL); Y II) EXTERNAMENTE, POR LA ALTERACION DEL METABOLISMO DE LA PLANTA Y SU EFECTO EN LA ACTIVIDAD DE LOS VECTORES COMO ELEMENTOS CLAVES EN LA DISEMINACION ESPACIAL Y PERVIVENCIA TEMPORAL DE LOS VIRUS PATOGENOS. LOS CAMBIOS MENCIONADOS EN LAS INFECCIONES MIXTAS PUEDEN COMPROMETER LA EFECTIVIDAD DE LAS MEDIDAS DE CONTROL APLICABLES CONTRA VIRUS INDIVIDUALES, POR LO QUE SU CONOCIMIENTO PODRIA TENER IMPLICACIONES PRACTICAS EN EL MANEJO DE ENFERMEDADES VIRALES. EL PROYECTO CONTEMPLA COMO OBJETIVOS GENERALES LA EXPLORACION DE LOS CAMBIOS A LO LARGO DEL TIEMPO EN DIFERENTES PATOSISTEMAS DE INFECCIONES VIRALES MIXTAS, VALORANDO COMO AFECTAN A LOS VIRUS (OBJETIVO 1), Y A LAS RESPUESTAS ASOCIADAS EN LAS PLANTAS HUESPEDES, INCLUYENDO LAS CONSECUENCIAS DERIVADAS DE DICHOS CAMBIOS EN LA DISEMINACION POR VECTORES (OBJETIVO 2). LAS COMPARACIONES SE REALIZARAN PARALELAMENTE EN LOS PATOSISTEMAS CUYO ESTUDIO YA SE HA INICIADO EN EL PROYECTO ANTERIOR, CENTRADO EN CUCURBITACEAS Y SOLANACEAS SUSCEPTIBLES A CRINIVIRUS, EN COMBINACION CON POTYVIRUS EN MELON Y CON BEGOMOVIRUS EN TOMATE, USANDO MOSCAS BLANCAS Y PULGONES COMO VECTORES. LA VALIDACION DE LAS HIPOTESIS SE EXTENDERA A UTILIZAR DIFERENTES VIRUS Y HUESPEDES EXPERIMENTALES, INCLUYENDO EL CASO DE LA ENFERMEDAD VIRAL DE LA BATATA (PLANTA HUESPED CONVOLVULACEA + CRINIVIRUS + POTYVIRUS), DONDE SE PROPONE PROFUNDIZAR EN LOS MECANISMOS DE REGULACION DE LA EXPRESION DE GENES MEDIANTE FENOMENOS RECIENTEMENTE CARACTERIZADOS DE DESLIZAMIENTO DE LA POLIMERASA, Y QUE GENERAN VARIANTES DE RNA EDITADAS Y CAPACES DE TRADUCIRSE EN PROTEINAS QUIMERICAS EN MAS DE UNA FASE DE LECTURA, Y QUE SE HA VISTO CAMBIAN EN SITUACION DE COINFECCION. TAMBIEN SE INCLUYEN SUBOBJETIVOS CON VIRUS MULTIPARTICULADOS COMO CRINIVIRUS, EXPLORANDO POSIBLES CAMBIOS DE EXPRESION GENICA (Y SUS FENOTIPOS VIRALES ASOCIADOS) POR ALTERACION DE LA FORMULA GENOMICA EN INFECCIONES MIXTAS. LOS PARTICIPANTES, PERTENECIENTES A DOS INSTITUCIONES, TIENEN EXPERIENCIA EN LOS PATOSISTEMAS MENCIONADOS, Y YA ESTAN COLABORANDO CON ENFOQUES Y METODOLOGIAS DIFERENTES QUE APORTAN COMPLEMENTARIEDAD AL TRABAJO CONJUNTO. LOS RESULTADOS ESPERABLES DEL PROYECTO SERVIRAN PARA COMPLETAR EL CONOCIMIENTO DE LAS INFECCIONES MIXTAS, Y SE ENFOCARAN A ACTUALIZAR LAS RECOMENDACIONES DE CONTROL Y MANEJO DE VIROSIS EN CULTIVOS. (Spanish)
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CONTINUING THE LINE INITIATED IN THE PREVIOUS PROJECT, WE SEEK TO DEEPEN THE UNDERSTANDING OF THE FREQUENT MIXED INFECTIONS, CAUSED BY TWO OR MORE VIRUSES PRESENT SIMULTANEOUSLY IN CULTIVATED PLANTS, AND WHICH GIVE RISE TO SPECIFIC COMPLEX DISEASES. IT HAS BEEN OBSERVED THAT THE INTERACTIONS BETWEEN THE VIRUS AND THE HOST PLANT OFTEN FOLLOW IMPORTANT CHANGES OVER TIME, AND THE LEVEL OF DAMAGE CAUSED CAN BE MODULATED TO EVEN REVERSE FROM AN INITIAL SYNERGISM WITH EXACERBATION OF SYMPTOMS TO AN ATTENUATION OF THE COMBINED EFFECT IN LATE TIMES. THE PROCESSES RELEVANT TO THIS DYNAMIC RESPONSE HAVE BEEN LITTLE STUDIED, BUT THEY COULD HELP EXPLAIN THE PREVALENCE OF MIXED INFECTIONS IF AS A CONSEQUENCE THEY FAVOR THE SPREAD OF VIROSIS, SO WE PROPOSE TO INCORPORATE THEM INTO THE ONGOING WORK. THE STARTING HYPOTHESIS IS THAT THIS DYNAMIC RESPONSE IS LIKELY TO RESULT FROM INTERACTIONS AT TWO LEVELS: INTERNALLY, BY MODIFYING DEFENSIVE RESPONSES IN THE PLANT (INCLUDING GENIC SILENCING AND HORMONAL SIGNALING-DEPENDENT RESPONSES); AND II) EXTERNALLY, DUE TO THE ALTERATION OF THE METABOLISM OF THE PLANT AND ITS EFFECT ON THE ACTIVITY OF THE VECTORS AS KEY ELEMENTS IN THE SPATIAL DISSEMINATION AND TEMPORAL SURVIVAL OF PATHOGEN VIRUSES. THE CHANGES MENTIONED IN MIXED INFECTIONS MAY COMPROMISE THE EFFECTIVENESS OF THE CONTROL MEASURES APPLICABLE AGAINST INDIVIDUAL VIRUSES, SO THEIR KNOWLEDGE COULD HAVE PRACTICAL IMPLICATIONS FOR THE MANAGEMENT OF VIRAL DISEASES. THE PROJECT ENVISAGES AS GENERAL OBJECTIVES THE EXPLORATION OF CHANGES OVER TIME IN DIFFERENT PATHOSYSTEMS OF MIXED VIRAL INFECTIONS, ASSESSING HOW THEY AFFECT VIRUSES (OBJECTIVE 1), AND THE ASSOCIATED RESPONSES IN HOST PLANTS, INCLUDING THE CONSEQUENCES OF SUCH CHANGES IN VECTOR DISSEMINATION (OBJECTIVE 2). THE COMPARISONS WERE MADE IN PARALLEL IN THE PATHOSYSTEMS WHOSE STUDY HAS ALREADY BEGUN IN THE PREVIOUS PROJECT, FOCUSING ON CUCURBITACEA AND SOLANACEA SUSCEPTIBLE TO CRINIVIRUS, IN COMBINATION WITH POTYVIRUS IN MELON AND WITH BEGOMOVIRUS IN TOMATO, USING WHITE FLIES AND APHIDS AS VECTORS. THE VALIDATION OF THE HYPOTHESES WILL EXTEND TO THE USE OF DIFFERENT VIRUSES AND EXPERIMENTAL HOSTS, INCLUDING THE CASE OF THE VIRAL DISEASE OF THE SWEET POTATO (HOST PLANT CONVOLVULACEA + CRINIVIRUS + POTYVIRUS), WHERE IT IS PROPOSED TO DEEPEN THE MECHANISMS OF REGULATING THE EXPRESSION OF GENES BY PHENOMENES RECENTLY CHARACTERISED BY SLIPPING OF POLYMERASE, AND WHICH GENERATE VARIANTS OF RNA EDITED AND CAPABLE OF TRANSLATING INTO QUIMERICAS PROTEINS IN MORE THAN ONE READING PHASE, AND WHICH HAS BEEN SEEN TO CHANGE IN SITUATION OF COINFECCION. SUB-OBJECTIVES WITH MULTIPARTICULATED VIRUSES SUCH AS CRINIVIRUS ARE ALSO INCLUDED, EXPLORING POSSIBLE CHANGES IN GENIC EXPRESSION (AND ITS ASSOCIATED VIRAL PHENOTYPES) DUE TO ALTERATION OF THE GENOMIC FORMULA IN MIXED INFECTIONS. THE PARTICIPANTS, BELONGING TO TWO INSTITUTIONS, HAVE EXPERIENCE IN THE AFOREMENTIONED PATHOSYSTEMS, AND ARE ALREADY COLLABORATING WITH DIFFERENT APPROACHES AND METHODOLOGIES THAT ADD COMPLEMENTARITY TO THE JOINT WORK. THE EXPECTED RESULTS OF THE PROJECT WILL SERVE TO COMPLETE THE KNOWLEDGE OF MIXED INFECTIONS, AND WILL FOCUS ON UPDATING THE RECOMMENDATIONS FOR CONTROL AND MANAGEMENT OF VIROSIS IN CROPS. (English)
13 October 2021
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POURSUIVANT LA LIGNE INITIÉE DANS LE PROJET PRÉCÉDENT, NOUS CHERCHONS À APPROFONDIR LA COMPRÉHENSION DES FRÉQUENTES INFECTIONS MIXTES, CAUSÉES PAR DEUX OU PLUSIEURS VIRUS PRÉSENTS SIMULTANÉMENT DANS LES PLANTES CULTIVÉES, ET QUI DONNENT LIEU À DES MALADIES COMPLEXES SPÉCIFIQUES. ON A OBSERVÉ QUE LES INTERACTIONS ENTRE LE VIRUS ET LA PLANTE HÔTE SUIVENT SOUVENT D’IMPORTANTS CHANGEMENTS AU FIL DU TEMPS, ET QUE LE NIVEAU DES DOMMAGES CAUSÉS PEUT ÊTRE MODULÉ POUR S’INVERSER MÊME D’UN SYNERGISME INITIAL AVEC EXACERBATION DES SYMPTÔMES À UNE ATTÉNUATION DE L’EFFET COMBINÉ DANS LES DERNIERS TEMPS. LES PROCESSUS PERTINENTS À CETTE RÉPONSE DYNAMIQUE ONT ÉTÉ PEU ÉTUDIÉS, MAIS ILS POURRAIENT AIDER À EXPLIQUER LA PRÉVALENCE DES INFECTIONS MIXTES SI, PAR CONSÉQUENT, ILS FAVORISENT LA PROPAGATION DE LA VIROSE, ALORS NOUS PROPOSONS DE LES INTÉGRER DANS LES TRAVAUX EN COURS. L’HYPOTHÈSE DE DÉPART EST QUE CETTE RÉPONSE DYNAMIQUE EST SUSCEPTIBLE DE RÉSULTER D’INTERACTIONS À DEUX NIVEAUX: EN INTERNE, EN MODIFIANT LES RÉPONSES DÉFENSIVES DE LA PLANTE (Y COMPRIS LES RÉPONSES GÉNIQUES AU SILENCE ET LES RÉPONSES DÉPENDANTES DE LA SIGNALISATION HORMONALE); ET II) À L’EXTÉRIEUR, EN RAISON DE L’ALTÉRATION DU MÉTABOLISME DE LA PLANTE ET DE SON EFFET SUR L’ACTIVITÉ DES VECTEURS EN TANT QU’ÉLÉMENTS CLÉS DE LA DISSÉMINATION SPATIALE ET DE LA SURVIE TEMPORELLE DES VIRUS PATHOGÈNES. LES CHANGEMENTS MENTIONNÉS DANS LES INFECTIONS MIXTES PEUVENT COMPROMETTRE L’EFFICACITÉ DES MESURES DE LUTTE CONTRE LES VIRUS INDIVIDUELS, DE SORTE QUE LEURS CONNAISSANCES POURRAIENT AVOIR DES IMPLICATIONS PRATIQUES POUR LA GESTION DES MALADIES VIRALES. LE PROJET ENVISAGE COMME OBJECTIFS GÉNÉRAUX L’EXPLORATION DES CHANGEMENTS AU FIL DU TEMPS DANS DIFFÉRENTS PATHOSYSTÈMES D’INFECTIONS VIRALES MIXTES, L’ÉVALUATION DE LEUR INCIDENCE SUR LES VIRUS (OBJECTIF 1) ET LES RÉACTIONS ASSOCIÉES CHEZ LES PLANTES HÔTES, Y COMPRIS LES CONSÉQUENCES DE CES CHANGEMENTS DANS LA DIFFUSION DES VECTEURS (OBJECTIF 2). LES COMPARAISONS ONT ÉTÉ FAITES EN PARALLÈLE DANS LES PATHOSYSTÈMES DONT L’ÉTUDE A DÉJÀ COMMENCÉ DANS LE PROJET PRÉCÉDENT, METTANT L’ACCENT SUR LES CUCURBITACÉES ET SOLANACEA SENSIBLES AU CRINIVIRUS, EN ASSOCIATION AVEC LE POTYVIRUS DANS LE MELON ET AVEC LE BÉGOMOVIRUS CHEZ LA TOMATE, EN UTILISANT DES MOUCHES BLANCHES ET DES PUCERONS COMME VECTEURS. LA VALIDATION DES HYPOTHÈSES S’ÉTENDRA À L’UTILISATION DE DIFFÉRENTS VIRUS ET HÔTES EXPÉRIMENTAUX, Y COMPRIS LE CAS DE LA MALADIE VIRALE DE LA POMME DE TERRE DOUCE (PLANTE HÔTE CONVOLVULACEA + CRINIVIRUS + POTYVIRUS), OÙ IL EST PROPOSÉ D’APPROFONDIR LES MÉCANISMES DE RÉGULATION DE L’EXPRESSION DES GÈNES PAR PHENOMENES RÉCEMMENT CARACTÉRISÉS PAR LE GLISSEMENT DE LA POLYMÉRASE, ET QUI GÉNÈRENT DES VARIANTES DE L’ARN ÉDITÉ ET CAPABLE DE TRADUIRE EN PROTÉINES QUIMERICAS EN PLUS D’UNE PHASE DE LECTURE, ET QUI A ÉTÉ VU CHANGER DANS LA SITUATION DE COINFECCION. DES SOUS-OBJECTIFS AVEC DES VIRUS MULTIPARTICULÉS TELS QUE LE CRINIVIRUS SONT ÉGALEMENT INCLUS, EXPLORANT LES CHANGEMENTS POSSIBLES DANS L’EXPRESSION GÉNIQUE (ET SES PHÉNOTYPES VIRALS ASSOCIÉS) EN RAISON DE L’ALTÉRATION DE LA FORMULE GÉNOMIQUE DANS LES INFECTIONS MIXTES. LES PARTICIPANTS, APPARTENANT À DEUX INSTITUTIONS, ONT UNE EXPÉRIENCE DANS LES PATHOSYSTÈMES SUSMENTIONNÉS ET COLLABORENT DÉJÀ AVEC DIFFÉRENTES APPROCHES ET MÉTHODOLOGIES QUI AJOUTENT UNE COMPLÉMENTARITÉ AUX TRAVAUX CONJOINTS. LES RÉSULTATS ATTENDUS DU PROJET SERVIRONT À COMPLÉTER LES CONNAISSANCES SUR LES INFECTIONS MIXTES ET METTRONT L’ACCENT SUR LA MISE À JOUR DES RECOMMANDATIONS RELATIVES AU CONTRÔLE ET À LA GESTION DE LA VIROSE DANS LES CULTURES. (French)
4 December 2021
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MIT DER FORTSETZUNG DER IM VORANGEGANGENEN PROJEKT INITIIERTEN LINIE BEMÜHEN WIR UNS, DAS VERSTÄNDNIS DER HÄUFIGEN GEMISCHTEN INFEKTIONEN ZU VERTIEFEN, DIE DURCH ZWEI ODER MEHR GLEICHZEITIG IN KULTURPFLANZEN VORKOMMENDE VIREN VERURSACHT WERDEN UND DIE ZU SPEZIFISCHEN KOMPLEXEN KRANKHEITEN FÜHREN. ES WURDE BEOBACHTET, DASS DIE WECHSELWIRKUNGEN ZWISCHEN DEM VIRUS UND DER WIRTSPFLANZE OFT WICHTIGE VERÄNDERUNGEN IM LAUFE DER ZEIT NACH SICH ZIEHEN UND DAS AUSMASS DER VERURSACHTEN SCHÄDEN MODULIERT WERDEN KANN, UM VON EINEM ANFÄNGLICHEN SYNERGISMUS MIT EINER VERSCHÄRFUNG DER SYMPTOME BIS HIN ZU EINER DÄMPFUNG DER KOMBINIERTEN WIRKUNG IN SPÄTEN ZEITEN SOGAR UMZUKEHREN. DIE PROZESSE, DIE FÜR DIESE DYNAMISCHE REAKTION RELEVANT SIND, WURDEN WENIG UNTERSUCHT, ABER SIE KÖNNTEN HELFEN, DIE PRÄVALENZ VON GEMISCHTEN INFEKTIONEN ZU ERKLÄREN, WENN SIE ALS FOLGE DIE AUSBREITUNG DER VIROSE BEGÜNSTIGEN, SO DASS WIR VORSCHLAGEN, SIE IN DIE LAUFENDE ARBEIT ZU INTEGRIEREN. DIE AUSGANGSHYPOTHESE IST, DASS DIESE DYNAMISCHE REAKTION WAHRSCHEINLICH AUS WECHSELWIRKUNGEN AUF ZWEI EBENEN RESULTIERT: INTERN DURCH ÄNDERUNG DER ABWEHRREAKTIONEN IN DER PFLANZE (EINSCHLIESSLICH GENOGENER SILENTIERUNG UND HORMONALE SIGNAL-ABHÄNGIGE REAKTIONEN); UND II) EXTERN, AUFGRUND DER VERÄNDERUNG DES STOFFWECHSELS DER PFLANZE UND IHRER WIRKUNG AUF DIE AKTIVITÄT DER VEKTOREN ALS SCHLÜSSELELEMENTE IN DER RÄUMLICHEN VERBREITUNG UND ZEITLICHEN ÜBERLEBEN VON KRANKHEITSVIREN. DIE BEI GEMISCHTEN INFEKTIONEN GENANNTEN ÄNDERUNGEN KÖNNEN DIE WIRKSAMKEIT DER GEGEN EINZELNE VIREN GELTENDEN BEKÄMPFUNGSMASSNAHMEN BEEINTRÄCHTIGEN, SO DASS IHR WISSEN PRAKTISCHE AUSWIRKUNGEN AUF DAS MANAGEMENT VON VIRUSKRANKHEITEN HABEN KÖNNTE. DAS PROJEKT SIEHT ALS ALLGEMEINE ZIELE DIE ERFORSCHUNG VON VERÄNDERUNGEN IM LAUFE DER ZEIT IN VERSCHIEDENEN PATHOSYSTEMEN GEMISCHTER VIRUSINFEKTIONEN VOR, DIE BEWERTUNG DER AUSWIRKUNGEN AUF VIREN (ZIEL 1) UND DIE DAMIT VERBUNDENEN REAKTIONEN IN WIRTSPFLANZEN, EINSCHLIESSLICH DER FOLGEN SOLCHER VERÄNDERUNGEN BEI DER VERBREITUNG VON VEKTOREN (ZIEL 2). DIE VERGLEICHE WURDEN PARALLEL IN DEN PATHOSYSTEMEN VORGENOMMEN, DEREN STUDIE BEREITS IM VORANGEGANGENEN PROJEKT BEGONNEN HAT, WOBEI DER SCHWERPUNKT AUF CUCURBITACEA UND SOLANACEA LIEGT, DIE FÜR CRINIVIRUS ANFÄLLIG SIND, IN KOMBINATION MIT DEM POTYVIRUS IN MELONE UND MIT BEGOMOVIRUS IN TOMATEN, WOBEI WEISSE FLIEGEN UND BLATTLÄUSE ALS VEKTOREN VERWENDET WERDEN. DIE VALIDIERUNG DER HYPOTHESEN ERSTRECKT SICH AUF DIE VERWENDUNG VERSCHIEDENER VIREN UND EXPERIMENTELLER WIRTE, EINSCHLIESSLICH DES FALLES DER VIRUSERKRANKUNG DER SÜSSKARTOFFEL (HOSTPFLANZE CONVOLVULACEA + CRINIVIRUS + POTYVIRUS), WO VORGESCHLAGEN WIRD, DIE MECHANISMEN ZUR REGULIERUNG DER EXPRESSION VON GENEN DURCH PHENOMENES, DIE VOR KURZEM DURCH DAS AUSRUTSCHEN DER POLYMERASE GEKENNZEICHNET SIND, ZU VERTIEFEN UND VARIANTEN VON RNA ZU ERZEUGEN, DIE IN MEHR ALS EINER LESEPHASE IN QUIMERICAS-PROTEINE ÜBERSETZT UND IN DER LAGE SIND, SICH IN DER SITUATION VON COINFECCION ZU ÄNDERN. AUCH UNTERZIELE MIT MULTIPARTIKULATED-VIREN WIE CRINIVIRUS WERDEN EINBEZOGEN, UM MÖGLICHE VERÄNDERUNGEN DER GENETISCHEN EXPRESSION (UND DER DAMIT VERBUNDENEN VIRALEN PHÄNOTYPEN) AUFGRUND EINER VERÄNDERUNG DER GENOMISCHEN FORMEL BEI GEMISCHTEN INFEKTIONEN ZU UNTERSUCHEN. DIE TEILNEHMER, DIE ZWEI INSTITUTIONEN ANGEHÖREN, VERFÜGEN ÜBER ERFAHRUNGEN MIT DEN GENANNTEN PATHOSYSTEMEN UND ARBEITEN BEREITS MIT VERSCHIEDENEN ANSÄTZEN UND METHODEN ZUSAMMEN, DIE DIE GEMEINSAME ARBEIT ERGÄNZEN. DIE ERWARTETEN ERGEBNISSE DES PROJEKTS WERDEN DAZU DIENEN, DAS WISSEN ÜBER GEMISCHTE INFEKTIONEN ZU VERVOLLSTÄNDIGEN, UND KONZENTRIEREN SICH AUF DIE AKTUALISIERUNG DER EMPFEHLUNGEN FÜR DIE KONTROLLE UND VERWALTUNG VON VIROSE IN KULTURPFLANZEN. (German)
9 December 2021
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DOOR DE LIJN VOORT TE ZETTEN DIE IN HET VORIGE PROJECT IS GEÏNITIEERD, PROBEREN WE HET BEGRIP VAN DE FREQUENTE GEMENGDE INFECTIES TE VERDIEPEN, VEROORZAAKT DOOR TWEE OF MEER VIRUSSEN DIE GELIJKTIJDIG IN GEKWEEKTE PLANTEN AANWEZIG ZIJN EN DIE AANLEIDING GEVEN TOT SPECIFIEKE COMPLEXE ZIEKTEN. ER IS WAARGENOMEN DAT DE INTERACTIES TUSSEN HET VIRUS EN DE WAARDPLANT VAAK BELANGRIJKE VERANDERINGEN IN DE TIJD VOLGEN, EN HET NIVEAU VAN DE VEROORZAAKTE SCHADE KAN WORDEN GEMODULEERD OM ZELFS OM TE KEREN VAN EEN AANVANKELIJK SYNERGISME MET EXACERBATIE VAN SYMPTOMEN TOT EEN VERZWAKKING VAN HET GECOMBINEERDE EFFECT IN LATE TIJDEN. DE PROCESSEN DIE RELEVANT ZIJN VOOR DEZE DYNAMISCHE RESPONS ZIJN WEINIG BESTUDEERD, MAAR ZE KUNNEN DE PREVALENTIE VAN GEMENGDE INFECTIES VERKLAREN ALS ZE ALS GEVOLG DAARVAN DE VERSPREIDING VAN VIROSE BEVORDEREN, DUS WE STELLEN VOOR OM ZE IN HET LOPENDE WERK OP TE NEMEN. DE UITGANGSHYPOTHESE IS DAT DEZE DYNAMISCHE RESPONS WAARSCHIJNLIJK HET GEVOLG IS VAN INTERACTIES OP TWEE NIVEAUS: INTERN, DOOR HET WIJZIGEN VAN DEFENSIEVE REACTIES IN DE PLANT (MET INBEGRIP VAN GELUIDDEMPING EN HORMONALE SIGNAALAFHANKELIJKE REACTIES); EN II) EXTERN, ALS GEVOLG VAN DE VERANDERING VAN HET METABOLISME VAN DE PLANT EN HET EFFECT ERVAN OP DE ACTIVITEIT VAN DE VECTOREN ALS BELANGRIJKE ELEMENTEN IN DE RUIMTELIJKE VERSPREIDING EN DE TIJDELIJKE OVERLEVING VAN PATHOGENE VIRUSSEN. DE BIJ GEMENGDE INFECTIES GENOEMDE VERANDERINGEN KUNNEN AFBREUK DOEN AAN DE DOELTREFFENDHEID VAN DE BESTRIJDINGSMAATREGELEN DIE VAN TOEPASSING ZIJN OP INDIVIDUELE VIRUSSEN, ZODAT HUN KENNIS PRAKTISCHE GEVOLGEN KAN HEBBEN VOOR DE BEHANDELING VAN VIRALE ZIEKTEN. HET PROJECT BEOOGT ALS ALGEMENE DOELSTELLINGEN DE EXPLORATIE VAN VERANDERINGEN IN DE LOOP DER TIJD IN VERSCHILLENDE PATHOSYSTEMEN VAN GEMENGDE VIRALE INFECTIES, WAARBIJ WORDT BEOORDEELD HOE ZIJ VIRUSSEN BEÏNVLOEDEN (DOELSTELLING 1), EN DE BIJBEHORENDE REACTIES IN WAARDPLANTEN, MET INBEGRIP VAN DE GEVOLGEN VAN DERGELIJKE VERANDERINGEN IN VECTORVERSPREIDING (DOELSTELLING 2). DE VERGELIJKINGEN WERDEN PARALLEL GEMAAKT IN DE PATHOSYSTEMS WAARVAN DE STUDIE AL IN HET VORIGE PROJECT IS BEGONNEN, WAARBIJ DE NADRUK LAG OP CUCURBITACEA EN SOLANACEA GEVOELIG VOOR CRINIVIRUS, IN COMBINATIE MET POTYVIRUS IN MELOEN EN MET BEGOMOVIRUS IN TOMAAT, WAARBIJ WITTE VLIEGEN EN BLADLUIZEN ALS VECTOREN WERDEN GEBRUIKT. DE VALIDATIE VAN DE HYPOTHESES ZAL ZICH UITSTREKKEN TOT HET GEBRUIK VAN VERSCHILLENDE VIRUSSEN EN EXPERIMENTELE GASTHEREN, WAARONDER HET GEVAL VAN DE VIRALE ZIEKTE VAN DE ZOETE AARDAPPEL (GASTPLANT CONVOLVULACEA + CRINIVIRUS + POTYVIRUS), WAAR WORDT VOORGESTELD OM DE MECHANISMEN VOOR HET REGULEREN VAN DE EXPRESSIE VAN GENEN DOOR PHENOMENES ONLANGS GEKENMERKT DOOR HET UITGLIJDEN VAN POLYMERASE TE VERDIEPEN, EN DIE VARIANTEN VAN RNA BEWERKT EN IN STAAT ZIJN OM TE VERTALEN IN QUIMERICAS-EIWITTEN IN MEER DAN ÉÉN LEZINGSFASE, EN DIE IS GEZIEN TE VERANDEREN IN DE SITUATIE VAN COINFECCION. SUBDOELSTELLINGEN MET MULTIPARTICULATED VIRUSSEN ZOALS CRINIVIRUS ZIJN OOK OPGENOMEN, WAARBIJ MOGELIJKE VERANDERINGEN IN DE GENIC EXPRESSIE (EN DE BIJBEHORENDE VIRALE FENOTYPES) WORDEN ONDERZOCHT ALS GEVOLG VAN WIJZIGING VAN DE GENOMISCHE FORMULE IN GEMENGDE INFECTIES. DE DEELNEMERS, DIE DEEL UITMAKEN VAN TWEE INSTELLINGEN, HEBBEN ERVARING IN DE BOVENGENOEMDE PATHOSYSTEMEN EN WERKEN REEDS SAMEN MET VERSCHILLENDE BENADERINGEN EN METHODOLOGIEËN DIE COMPLEMENTAIR ZIJN AAN DE GEZAMENLIJKE WERKZAAMHEDEN. DE VERWACHTE RESULTATEN VAN HET PROJECT ZULLEN DIENEN OM DE KENNIS VAN GEMENGDE INFECTIES TE VOLTOOIEN EN ZULLEN ZICH RICHTEN OP HET ACTUALISEREN VAN DE AANBEVELINGEN VOOR DE BESTRIJDING EN HET BEHEER VAN VIROSE IN GEWASSEN. (Dutch)
17 December 2021
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CONTINUANDO LA LINEA AVVIATA NEL PROGETTO PRECEDENTE, CERCHIAMO DI APPROFONDIRE LA COMPRENSIONE DELLE FREQUENTI INFEZIONI MISTE, CAUSATE DA DUE O PIÙ VIRUS PRESENTI CONTEMPORANEAMENTE NELLE PIANTE COLTIVATE, E CHE DANNO LUOGO A SPECIFICHE MALATTIE COMPLESSE. È STATO OSSERVATO CHE LE INTERAZIONI TRA IL VIRUS E LA PIANTA OSPITE SPESSO SEGUONO CAMBIAMENTI IMPORTANTI NEL TEMPO, E IL LIVELLO DEI DANNI CAUSATI PUÒ ESSERE MODULATO PER INVERTIRE PERSINO DA UN SINERGISMO INIZIALE CON ESACERBAZIONE DEI SINTOMI AD UN'ATTENUAZIONE DELL'EFFETTO COMBINATO IN TEMPI TARDIVI. I PROCESSI RILEVANTI PER QUESTA RISPOSTA DINAMICA SONO STATI POCO STUDIATI, MA POTREBBERO AIUTARE A SPIEGARE LA PREVALENZA DI INFEZIONI MISTE SE DI CONSEGUENZA FAVORISCONO LA DIFFUSIONE DELLA VIROSI, QUINDI PROPONIAMO DI INCORPORARLI NEL LAVORO IN CORSO. L'IPOTESI DI PARTENZA È CHE QUESTA RISPOSTA DINAMICA POSSA DERIVARE DA INTERAZIONI A DUE LIVELLI: INTERNAMENTE, MODIFICANDO LE RISPOSTE DIFENSIVE NELL'IMPIANTO (COMPRESI IL SILENZIAMENTO GENETICO E LE RISPOSTE DIPENDENTI DAL SEGNALAMENTO ORMONALE); E II) ESTERNAMENTE, A CAUSA DELL'ALTERAZIONE DEL METABOLISMO DELLA PIANTA E DEL SUO EFFETTO SULL'ATTIVITÀ DEI VETTORI COME ELEMENTI CHIAVE NELLA DIFFUSIONE SPAZIALE E NELLA SOPRAVVIVENZA TEMPORALE DEI VIRUS PATOGENI. I CAMBIAMENTI MENZIONATI NELLE INFEZIONI MISTE POSSONO COMPROMETTERE L'EFFICACIA DELLE MISURE DI CONTROLLO APPLICABILI CONTRO I SINGOLI VIRUS, IN MODO CHE LE LORO CONOSCENZE POSSANO AVERE IMPLICAZIONI PRATICHE PER LA GESTIONE DELLE MALATTIE VIRALI. IL PROGETTO PREVEDE COME OBIETTIVI GENERALI L'ESPLORAZIONE DI CAMBIAMENTI NEL TEMPO IN DIVERSI PATOSISTEMI DI INFEZIONI VIRALI MISTE, VALUTANDO COME INFLUENZANO I VIRUS (OBIETTIVO 1), E LE RISPOSTE ASSOCIATE NELLE PIANTE OSPITI, COMPRESE LE CONSEGUENZE DI TALI CAMBIAMENTI NELLA DIFFUSIONE DEI VETTORI (OBIETTIVO 2). I CONFRONTI SONO STATI EFFETTUATI IN PARALLELO NEI PATHOSYSTEMS IL CUI STUDIO È GIÀ INIZIATO NEL PROGETTO PRECEDENTE, CONCENTRANDOSI SU CUCURBITACEA E SOLANACEA SUSCETTIBILI DI CRINIVIRUS, IN COMBINAZIONE CON POTYVIRUS NEL MELONE E CON BEGOMOVIRUS NEL POMODORO, UTILIZZANDO MOSCHE BIANCHE E AFIDI COME VETTORI. LA CONVALIDA DELLE IPOTESI SI ESTENDERÀ ALL'USO DI DIVERSI VIRUS E HOST SPERIMENTALI, COMPRESO IL CASO DELLA MALATTIA VIRALE DELLA PATATA DOLCE (IMPIANTO OSPITE CONVOLVULACEA + CRINIVIRUS + POTYVIRUS), DOVE SI PROPONE DI APPROFONDIRE I MECCANISMI DI REGOLAZIONE DELL'ESPRESSIONE DEI GENI DA PARTE DI PHENOMENES RECENTEMENTE CARATTERIZZATI DA SCIVOLAMENTO DELLA POLIMERASI, E CHE GENERANO VARIANTI DI RNA MODIFICATE E IN GRADO DI TRADURRE IN PROTEINE QUIMERICAS IN PIÙ DI UNA FASE DI LETTURA, E CHE È STATO VISTO CAMBIARE NELLA SITUAZIONE DI COINFECCION. SONO INCLUSI ANCHE SOTTO-OBIETTIVI CON VIRUS MULTIPARTICULATED COME IL CRINIVIRUS, ESPLORANDO POSSIBILI CAMBIAMENTI NELL'ESPRESSIONE GENETICA (E I SUOI FENOTIPI VIRALI ASSOCIATI) DOVUTI ALL'ALTERAZIONE DELLA FORMULA GENOMICA NELLE INFEZIONI MISTE. I PARTECIPANTI, APPARTENENTI A DUE ISTITUZIONI, HANNO ESPERIENZA NEI SUDDETTI PATHOSYSTEM E STANNO GIÀ COLLABORANDO CON APPROCCI E METODOLOGIE DIVERSI CHE AGGIUNGONO COMPLEMENTARITÀ AL LAVORO CONGIUNTO. I RISULTATI ATTESI DEL PROGETTO SERVIRANNO A COMPLETARE LA CONOSCENZA DELLE INFEZIONI MISTE E SI CONCENTRERANNO SULL'AGGIORNAMENTO DELLE RACCOMANDAZIONI PER IL CONTROLLO E LA GESTIONE DELLA VIROSI NELLE COLTURE. (Italian)
16 January 2022
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Cerdanyola del Vallès
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Identifiers
AGL2016-75529-R
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