Marine metabolomic platform (Q3139754)
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Project Q3139754 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Marine metabolomic platform |
Project Q3139754 in Spain |
Statements
360,000.0 Euro
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450,000.0 Euro
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80.0 percent
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1 January 2018
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31 December 2020
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UNIVERSIDAD DE CADIZ
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36°31'43.28"N, 6°11'24.79"W
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11028
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Se trata de establecer una nueva plataforma, dentro del ámbito del INMAR (Instituto de Investigaciones Marinas), cuya principal función será llevar a cabo estudios de tipo metabolómico en todo tipo de organismos. Esta infraestructura, basada en espectrometría de masas de alta resolución (HRMS) acoplada a cromatografía, permitirá profundizar nuestro conocimiento acerca de los distintos procesos moleculares a distintos niveles (celular, tejido, etc.) mediante la caracterización de la gran diversidad de metabolitos involucrados. Incorporará además el último paquete de software disponible para la interpretación de los datos obtenidos. El equipamiento se complementará con la plataforma de proteómica ya existente en el INiBICA (Instituto de Investigación e Innovación en Ciencias Biomédicas) y el distinto equipamiento destinado a estudios transcriptómicos del propio INMAR. De esta forma la Universidad de Cádiz, así como el CEIMAR (Campus de Excelencia Internacional del Mar) en el que se integra, podrá ofrecer una solución completa a los investigadores y empresas interesadas en realizar estudios de tipo ómico. Como función secundaria, dicha plataforma permitirá también llevar a cabo la elucidación estructural de todo tipo de moléculas orgánicas de pequeño tamaño (<2000 Da), no solo metabolitos, así como su cuantificación a niveles traza, lo cual abrirá un amplio abanico de posibilidades tales como la caracterización de nuevos materiales o identificación de contaminantes desconocidos. (Spanish)
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The main goal of this proposal is to establish a new platform within the INMAR (Institute for Marine Research) aimed to perform metabolomic research in all kind of organisms. This infrastructure, based on high resolution mass spectrometry (HRMS) coupled to chromatography, will allow to improve our knowledge on the different molecular processes at several levels (e.g., cells, tissues, etc.) by characterizing the huge diversity of metabolites involved. It will also be equipped with the latest software package for data management and interpretation. The instrument will be complementary to those already existing that are dedicated to proteomic and transcriptomic analyses (such as the one in INiBICA, the Institute for Research and Innovation in Biomedical Sciences, and in INMAR, respectively). This way, the University of Cadiz, as well as the CEIMAR (International Campus of Excellence of the Sea), will be able to offer an integrated solution to those researchers and companies that are interested into carrying out comprehensive omic studies. As secondary goal, and apart from the aforementioned metabolites, the platform proposed here will also enable the structural elucidation and quantification at trace level of all kind of small size organic molecules (<2000 Da), opening a wide array of possibilities such as characterization of new materials or identification of unknown contaminants. (English)
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L’objectif est d’établir une nouvelle plateforme, dans le cadre de l’INMAR (Instituto de Investigaciones Marinas), dont la fonction principale sera de réaliser des études métabolomiques dans tous les types d’organismes. Cette infrastructure, basée sur la spectrométrie de masse à haute résolution (HRMS) couplée à la chromatographie, nous permettra d’approfondir notre connaissance des différents processus moléculaires à différents niveaux (cellulaires, tissus, etc.) en caractérisant la grande diversité des métabolites impliqués. Il intégrera également le dernier progiciel disponible pour l’interprétation des données obtenues. L’équipement sera complété par la plateforme protéomique déjà en place à l’INiBICA (Institut de recherche et d’innovation en sciences biomédicales) et les divers équipements destinés aux études transcriptomiques de l’INMAR lui-même. De cette façon, l’Université de Cadix, ainsi que le CEIMAR (Campus d’Excellence Internationale de la Mer) dans lequel il est intégré, seront en mesure d’offrir une solution complète aux chercheurs et aux entreprises intéressés à mener des études de type économique. Comme fonction secondaire, cette plate-forme permettra également l’élucidation structurelle de tous les types de petites molécules organiques (<2000 Da), non seulement les métabolites, ainsi que leur quantification à des niveaux de traces, ce qui ouvrira un large éventail de possibilités telles que la caractérisation de nouveaux matériaux ou l’identification de contaminants inconnus. (French)
2 December 2021
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Ziel ist die Schaffung einer neuen Plattform im Rahmen von INMAR (Instituto de Investigaciones Marinas), deren Hauptfunktion darin besteht, metabolomische Untersuchungen an allen Arten von Organismen durchzuführen. Diese Infrastruktur, basierend auf hochauflösender Massenspektrometrie (HRMS), gekoppelt mit der Chromatographie, ermöglicht es uns, unser Wissen über die verschiedenen molekularen Prozesse auf verschiedenen Ebenen (Zellular, Gewebe usw.) zu vertiefen, indem wir die große Vielfalt der beteiligten Metaboliten charakterisieren. Es wird auch das neueste Softwarepaket enthalten, das für die Interpretation der erhaltenen Daten zur Verfügung steht. Ergänzt wird die Ausrüstung durch die bereits am INiBICA (Institut für Forschung und Innovation in Biomedizinischen Wissenschaften) eingerichtete Proteomics-Plattform und die verschiedenen Geräte, die für transkriptomische Studien des INMAR selbst vorgesehen sind. Auf diese Weise können die Universität Cadiz sowie das CEIMAR (Campus der International Excellence of the Sea), in dem sie integriert ist, Forschern und Unternehmen, die sich für die Durchführung wirtschaftlicher Studien interessieren, eine Komplettlösung anbieten. Als sekundäre Funktion wird diese Plattform auch die strukturelle Aufklärung aller Arten von kleinen organischen Molekülen (<2000 Da), nicht nur Metaboliten, sowie deren Quantifizierung auf Spurenebenen ermöglichen, was eine Vielzahl von Möglichkeiten wie die Charakterisierung neuer Materialien oder die Identifizierung unbekannter Verunreinigungen eröffnet. (German)
9 December 2021
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Het doel is om een nieuw platform, binnen het bereik van INMAR (Instituto de Investigaciones Marinas), waarvan de belangrijkste functie zal zijn om metabolomic studies in alle soorten organismen uit te voeren. Deze infrastructuur, gebaseerd op hoge resolutie massaspectrometrie (HRMS) gekoppeld aan chromatografie, zal ons in staat stellen onze kennis van de verschillende moleculaire processen op verschillende niveaus (cellulair, weefsel, enz.) te verdiepen door de grote diversiteit van de betrokken metabolieten te karakteriseren. Het zal ook het meest recente softwarepakket bevatten dat beschikbaar is voor de interpretatie van de verkregen gegevens. De apparatuur zal worden aangevuld met het proteomics-platform dat reeds bij het INiBICA (Institute for Research and Innovation in Biomedische Wetenschappen) en de diverse apparatuur voor transcriptomische studies van INMAR zelf bestaat. Op deze manier zullen de Universiteit van Cadiz, evenals de CEIMAR (Campus van International Excellence of the Sea) waarin het is geïntegreerd, een complete oplossing bieden aan onderzoekers en bedrijven die geïnteresseerd zijn in het uitvoeren van economische studies. Als secundaire functie zal dit platform ook de structurele opheldering van alle soorten kleine organische moleculen (<2000 Da) mogelijk maken, niet alleen metabolieten, evenals hun kwantificering op sporenniveau, wat een breed scala aan mogelijkheden zal openen, zoals het karakteriseren van nieuwe materialen of de identificatie van onbekende verontreinigingen. (Dutch)
17 December 2021
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L'obiettivo è quello di creare una nuova piattaforma, nell'ambito dell'INMAR (Instituto de Investigaciones Marinas), la cui funzione principale sarà quella di effettuare studi metabolomici in tutti i tipi di organismi. Questa infrastruttura, basata sulla spettrometria di massa ad alta risoluzione (HRMS) accoppiata alla cromatografia, ci permetterà di approfondire la nostra conoscenza dei diversi processi molecolari a diversi livelli (cellulari, tessuti, ecc.) caratterizzando la grande diversità dei metaboliti coinvolti. Esso incorporerà anche l'ultimo pacchetto software disponibile per l'interpretazione dei dati ottenuti. L'attrezzatura sarà completata dalla piattaforma proteomica già in atto presso l'INiBICA (Institute for Research and Innovation in Biomedical Sciences) e dalle varie attrezzature destinate agli studi trascrittomici dello stesso INMAR. In questo modo l'Università di Cadice, così come il CEIMAR (Campus of International Excellence of the Sea) in cui è integrata, sarà in grado di offrire una soluzione completa ai ricercatori e alle aziende interessate a condurre studi di tipo economico. Come funzione secondaria, questa piattaforma consentirà anche l'illucidazione strutturale di tutti i tipi di piccole molecole organiche (<2000 Da), non solo metaboliti, così come la loro quantificazione a livelli di traccia, che aprirà una vasta gamma di possibilità come la caratterizzazione di nuovi materiali o l'identificazione di contaminanti sconosciuti. (Italian)
16 January 2022
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Puerto Real
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Identifiers
EQC2018-004150-P
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