Identification of quality indicators for the management of bacteriemias and bacterial determinants predictors of severe presentation in bacteriemia by Escherichia coli. (Q3141149)
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Project Q3141149 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Identification of quality indicators for the management of bacteriemias and bacterial determinants predictors of severe presentation in bacteriemia by Escherichia coli. |
Project Q3141149 in Spain |
Statements
102,000.0 Euro
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127,500.0 Euro
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80.0 percent
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1 January 2017
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31 March 2020
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FUNDACION PUBLICA ANDALUZA PARA LA GESTION DE LA INVESTIGACION EN SALUD DE SEVILLA
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37°23'19.07"N, 5°59'43.22"W
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41091
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Este proyecto incluye dos estudios relacionados cuyos objetivos son: (1) Identificar las variables relacionadas con el manejo clínico que tienen impacto en el pronóstico de los pacientes con bacteriemia, que sirvan para establecer recomendaciones y diseñar estudios de intervención específicos (estudio PRO-BAC), y (2) Identificar marcadores genéticos de Escherichia coli y sus niveles de expresión en pacientes con bacteriemia causada por este microorganismo que estén relacionados con la presentación en forma de sepsis grave y shock séptico que sirvan para el diseño de técnicas diagnósticas y/o terapéuticas (estudio PRO-BAC-Ec). Para el estudio PRO-BAC se realizará un estudio de cohortes prospectivo y multicéntrico en 28 hospitales españoles a lo largo de un año, con inclusión de pacientes con bacteriemia clínicamente significativa. La variable resultado principal será la mortalidad cruda hasta el día 30 y las variables de exposición principales, los aspectos específicos del manejo clínico. Para el estudio PRO-BAC-Ec se llevará a cabo un estudio de casos y controles apareados y anidados en la cohorte PRO-BAC, siendo elegibles todos los pacientes de esa cohorte con bacteriemia por E. coli; 101 casos (pacientes con sepsis grave o shock al inicio) y 101 controles (pacientes sin sepsis grave o shock) se elegirán de forma apareada en base a características basales de los pacientes, foco de la bacteriemia y tipo de adquisición. Se realizará una secuenciación completa del genoma de los aislados para identificar genes asociados a la presentación con sepsis grave o shock, y se realizará un análisis trascriptómico de los genes mas asociados a la presentación grave en cepas seleccionadas portadoras estos genes, unas causantes de shock y otras no. (Spanish)
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This project includes two related studies whose objectives are: (1) Identify the variables related to clinical management that have an impact on the prognosis of patients with bacteriemia, which serve to establish recommendations and design specific interventional studies (PRO-BAC study), and (2) Identify genetic markers of Escherichia coli and its expression levels in patients with bacteriemia caused by this microorganism that are related to presentation in the form of severe sepsis and septic shock that serve to design diagnostic or therapeutic techniques (PRO-BAC-Ec study). For the PRO-BAC study, a prospective and multicenter cohort study will be conducted in 28 Spanish hospitals over one year, including patients with clinically significant bacteriemia. The main outcome variable will be raw mortality up to day 30 and the main exposure variables, the specific aspects of clinical management. For the PRO-BAC-Ec study, a study of mated and nested cases and controls in the PRO-BAC cohort will be conducted, with all patients in this cohort with E. coli bacteriemia being eligible; 101 cases (patients with severe sepsis or shock at baseline) and 101 controls (patients without severe sepsis or shock) will be chosen in mating form based on baseline patient characteristics, focus of bacteremia and type of acquisition. A complete sequencing of the genome of the isolates will be performed to identify genes associated with the presentation with severe sepsis or shock, and a transcriptomic analysis of the genes most associated with severe presentation will be performed in selected strains carrying these genes, some causing shock and others not. (English)
12 October 2021
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Ce projet comprend deux études connexes dont les objectifs sont les suivants: (1) Déterminer les variables liées à la prise en charge clinique qui ont un impact sur le pronostic des patients atteints de bacteriemia, qui servent à établir des recommandations et à concevoir des études interventionnelles spécifiques (étude PRO-BAC), et (2) identifier les marqueurs génétiques d’Escherichia coli et ses niveaux d’expression chez les patients atteints de bacteriemie causées par ce micro-organisme qui sont liés à la présentation sous forme de septicémie sévère et de choc septique servant à concevoir des techniques diagnostiques ou thérapeutiques (étude PRO-BAC-Ec). Pour l’étude PRO-BAC, une étude de cohorte prospective et multicentrique sera menée dans 28 hôpitaux espagnols sur une période d’un an, y compris des patients atteints de bacteriemia cliniquement significative. La principale variable de résultat sera la mortalité brute jusqu’au jour 30 et les principales variables d’exposition, les aspects spécifiques de la prise en charge clinique. Pour l’étude PRO-BAC-Ec, une étude des cas et des témoins accouplés et imbriqués dans la cohorte PRO-BAC sera menée, tous les patients de cette cohorte ayant des bacteriemia d’E. coli étant admissibles; 101 cas (patients présentant une septicémie sévère ou un choc au début de l’étude) et 101 témoins (patients sans septicémie ou choc sévère) seront choisis sous forme d’accouplement en fonction des caractéristiques initiales du patient, de la concentration de la bactériémie et du type d’acquisition. Un séquençage complet du génome des isolats sera effectué afin d’identifier les gènes associés à la présentation avec une septicémie ou un choc sévère, et une analyse transcriptomique des gènes les plus associés à une présentation sévère sera effectuée dans des souches sélectionnées porteuses de ces gènes, certaines causant un choc et d’autres non. (French)
2 December 2021
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Dieses Projekt umfasst zwei verwandte Studien mit folgenden Zielen: (1) Identifizieren Sie die Variablen im Zusammenhang mit dem klinischen Management, die Auswirkungen auf die Prognose von Patienten mit Bakteriämie haben, die dazu dienen, Empfehlungen zu erarbeiten und spezifische interventionelle Studien zu entwerfen (PRO-BAC-Studie), und (2) genetische Marker von Escherichia coli und seine Expressionswerte bei Patienten mit Bakteriämie, die durch diesen Mikroorganismus verursacht werden, identifizieren, die mit der Darstellung in Form von schweren Sepsis und septischen Schocks zusammenhängen, die zur Entwicklung diagnostischer oder therapeutischer Techniken dienen (PRO-BAC-Ec-Studie). Für die PRO-BAC-Studie wird eine prospektive und multizentrische Kohortestudie in 28 spanischen Krankenhäusern über ein Jahr durchgeführt, darunter Patienten mit klinisch signifikanter Bakteriämie. Die wichtigste Ergebnisvariable ist die Rohsterblichkeit bis zum 30. Tag und die wichtigsten Expositionsvariablen, die spezifischen Aspekte des klinischen Managements. Für die PRO-BAC-Ec-Studie wird eine Studie über gepaarte und verschachtelte Fälle und Kontrollen in der PRO-BAC-Kohorte durchgeführt, wobei alle Patienten in dieser Kohorte mit E. coli-bakteriämie förderfähig sind; 101 Fälle (Patienten mit schwerer Sepsis oder Schock zu Beginn) und 101 Kontrollen (Patienten ohne schwere Sepsis oder Schock) werden in Paarungsform auf der Basis der Patientenmerkmale, des Schwerpunkts der Bakteriämie und der Art des Erwerbs ausgewählt. Eine vollständige Sequenzierung des Genoms der Isolate wird durchgeführt, um Gene zu identifizieren, die mit der Darstellung mit schweren Sepsis oder Schock verbunden sind, und eine transkriptomische Analyse der Gene, die am stärksten mit einer schweren Darstellung assoziiert sind, wird in ausgewählten Stämmen durchgeführt, die diese Gene tragen, einige verursachen Schock und andere nicht. (German)
9 December 2021
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Dit project omvat twee verwante studies met als doel: (1) Identificeer de variabelen met betrekking tot klinische behandeling die van invloed zijn op de prognose van patiënten met bacteriemie, die dienen om aanbevelingen vast te stellen en specifieke interventionele studies te ontwerpen (PRO-BAC-studie), en (2) genetische markers van Escherichia coli en de expressieniveaus daarvan identificeren bij patiënten met bacteriemie veroorzaakt door dit micro-organisme die gerelateerd zijn aan presentatie in de vorm van ernstige sepsis en septische shock die dienen voor het ontwerpen van diagnostische of therapeutische technieken (PRO-BAC-Ec-studie). Voor de PRO-BAC-studie zal een prospectief en multicenter cohortonderzoek worden uitgevoerd in 28 Spaanse ziekenhuizen gedurende een jaar, waaronder patiënten met klinisch significante bacteriemie. De belangrijkste uitkomstvariabele is de ruwe mortaliteit tot dag 30 en de belangrijkste blootstellingsvariabelen, de specifieke aspecten van klinisch beheer. Voor het PRO-BAC-Ec-onderzoek zal een onderzoek worden uitgevoerd naar gevallen van paren en geneste gevallen en controles in het PRO-BAC-cohort, waarbij alle patiënten in dit cohort met E. colibacteremie in aanmerking komen; 101 gevallen (patiënten met ernstige sepsis of shock bij aanvang) en 101 controles (patiënten zonder ernstige sepsis of shock) zullen in paringsvorm worden gekozen op basis van de kenmerken van de patiënt bij aanvang, de focus van bacteriemie en het type van verwerving. Een volledige sequencing van het genoom van de isolaten zal worden uitgevoerd om genen te identificeren geassocieerd met de presentatie met ernstige sepsis of shock, en een transcriptomische analyse van de genen die het meest geassocieerd zijn met ernstige presentatie zal worden uitgevoerd in geselecteerde stammen die deze genen dragen, sommige veroorzaken shock en anderen niet. (Dutch)
17 December 2021
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Questo progetto comprende due studi correlati i cui obiettivi sono: (1) Identificare le variabili relative alla gestione clinica che hanno un impatto sulla prognosi dei pazienti affetti da batteriemia, che servono a stabilire raccomandazioni e progettare studi interventistici specifici (studio PRO-BAC), e (2) Identificare i marcatori genetici di Escherichia coli e i suoi livelli di espressione in pazienti con batteriemia causata da questo microrganismo che sono correlati alla presentazione sotto forma di sepsi grave e shock settico che servono a progettare tecniche diagnostiche o terapeutiche (studio PRO-BAC-Ec). Per lo studio PRO-BAC, sarà condotto uno studio di coorte prospettica e multicentrica in 28 ospedali spagnoli nell'arco di un anno, compresi i pazienti con batteriemia clinicamente significativa. La principale variabile di risultato sarà la mortalità cruda fino al 30º giorno e le principali variabili di esposizione, gli aspetti specifici della gestione clinica. Per lo studio PRO-BAC-Ec, sarà condotto uno studio sui casi accoppiati e nidificati e sui controlli nella coorte PRO-BAC, con tutti i pazienti in questa coorte con batteriemia di E. coli idonei; 101 casi (pazienti con sepsi grave o shock al basale) e 101 controlli (pazienti senza sepsi grave o shock) saranno scelti in forma di accoppiamento in base alle caratteristiche basali del paziente, al focus della batteriemia e al tipo di acquisizione. Un sequenziamento completo del genoma degli isolati sarà eseguito per identificare i geni associati alla presentazione con sepsi grave o shock, e un'analisi trascrittamica dei geni più associati con presentazione grave sarà eseguita in ceppi selezionati che trasportano questi geni, alcuni causando shock e altri no. (Italian)
16 January 2022
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Sevilla
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Identifiers
PI16_01432
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