ANALYSIS AND CONTROL OF CONSANGUINITY AND GENOMIC KINSHIP IN THE MANAGEMENT OF GENETIC RESOURCES IN ANIMAL CONSERVATION AND IMPROVEMENT (Q3136385)
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Project Q3136385 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | ANALYSIS AND CONTROL OF CONSANGUINITY AND GENOMIC KINSHIP IN THE MANAGEMENT OF GENETIC RESOURCES IN ANIMAL CONSERVATION AND IMPROVEMENT |
Project Q3136385 in Spain |
Statements
126,808.0 Euro
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158,510.0 Euro
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80.0 percent
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30 December 2016
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31 December 2020
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UNIVERSIDAD DE VIGO
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42°14'15.58"N, 8°43'28.99"W
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36057
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EL AVANCE METODOLOGICO EN LA GENERACION DE DATOS GENOMICOS MEDIANTE LAS TECNICAS DE GENOTIPADO MASIVO Y SECUENCIACION SUPONE UN ANALISIS DETALLADO DE LA DIVERSIDAD CON MULTIPLES APLICACIONES EN LA CONSERVACION DE RECURSOS GENETICOS TANTO EN PROGRAMAS DE CONSERVACION COMO EN PROGRAMAS DE MEJORA GENETICA ANIMAL. LA DISPONIBILIDAD DE ESTOS DATOS PERMITE OBTENER ESTIMAS PRECISAS DE LA CONSANGUINIDAD Y EL PARENTESCO MOLECULARES, LAS CUALES REQUIEREN EL DESARROLLO Y REFINAMIENTO DE NUEVAS TECNICAS DE ANALISIS, SU INCORPORACION EN LA SIMULACION DE MODELOS BIOLOGICOS Y LA REEVALUACION DE LAS ESTRATEGIAS DE GESTION DE LOS RECURSOS GENETICOS. EL PRESENTE PROYECTO TIENE COMO OBJETIVO RESPONDER A DIFERENTES CUESTIONES GENERADAS POR LA OBTENCION DE ESTIMAS MOLECULARES DEL PARENTESCO Y LA CONSANGUINIDAD. EN EL PRIMER BLOQUE DE OBJETIVOS SE ANALIZARAN Y DESARROLLARAN APLICACIONES DEL PARENTESCO GENOMICO EN LA ESTIMACION Y CONTROL DE LA DIVERSIDAD GENETICA Y EN LA DETECCION DE LA HUELLA DE LA SELECCION, Y SE DESARROLLARAN ECUACIONES PREDICTIVAS DEL CENSO EFECTIVO DE POBLACION EN UN MODELO GENOMICO DE MUTACIONES DELETEREAS. EN EL SEGUNDO BLOQUE SE EVALUARAN LAS CONSECUENCIAS DE USAR INFORMACION GENOMICA EN LA GESTION DE POBLACIONES CONSERVADAS, EN ASPECTOS TALES COMO EL MANEJO DE POBLACIONES SUBDIVIDIDAS, LA CREACION DE POBLACIONES SINTETICAS (PARA PROGRAMAS EX-SITU O COMO BASE PARA UN PROGRAMA DE MEJORA GENETICA) O EN LA OPTIMIZACION DE PROGRAMAS DE REFUERZO POBLACIONAL (SUPPORTIVE BREEDING).TAMBIEN SE GENERARAN DATOS GENOMICOS EMPIRICOS SOBRE DEPRESION CONSANGUINEA Y PURGACION EN PROGRAMAS DE CONSERVACION. (Spanish)
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THE METHODOLOGICAL ADVANCE IN THE GENERATION OF GENOMIC DATA THROUGH MASS GENOTYPING AND SEQUENCING TECHNIQUES IMPLIES A DETAILED ANALYSIS OF DIVERSITY WITH MULTIPLE APPLICATIONS IN THE CONSERVATION OF GENETIC RESOURCES IN BOTH CONSERVATION PROGRAMS AND ANIMAL GENETIC IMPROVEMENT PROGRAMS. THE AVAILABILITY OF THESE DATA ALLOWS OBTAINING PRECISE ESTIMATES OF MOLECULAR CONSANGUINITY AND KINSHIP, WHICH REQUIRE THE DEVELOPMENT AND REFINEMENT OF NEW TECHNIQUES OF ANALYSIS, THEIR INCORPORATION IN THE SIMULATION OF BIOLOGICAL MODELS AND THE RE-EVALUATION OF THE STRATEGIES FOR THE MANAGEMENT OF GENETIC RESOURCES. THIS PROJECT AIMS TO ANSWER DIFFERENT QUESTIONS GENERATED BY THE OBTAINING OF MOLECULAR ESTIMATES OF KINSHIP AND CONSANGUINITY. IN THE FIRST BLOCK OF OBJECTIVES, APPLICATIONS OF THE GENOMIC KINSHIP WILL BE ANALYSED AND DEVELOPED IN THE ESTIMATION AND CONTROL OF GENETIC DIVERSITY AND IN THE DETECTION OF THE FOOTPRINT OF THE SELECTION, AND PREDICTIVE EQUATIONS OF THE EFFECTIVE POPULATION CENSUS WILL BE DEVELOPED IN A GENOMIC MODEL OF DELETERIOUS MUTATIONS. THE SECOND BLOCK WILL EVALUATE THE CONSEQUENCES OF USING GENOMIC INFORMATION IN THE MANAGEMENT OF CONSERVED POPULATIONS, IN ASPECTS SUCH AS THE MANAGEMENT OF SUBDIVIDED POPULATIONS, THE CREATION OF SYNTHETIC POPULATIONS (FOR EX-SITU PROGRAMS OR AS A BASIS FOR A GENETIC IMPROVEMENT PROGRAM) OR IN THE OPTIMISATION OF POPULATION REINFORCEMENT PROGRAMS (SUPPORTIVE BREEDING).TAMBIEN WILL GENERATE EMPIRICAL GENOMIC DATA ON BLOOD DEPRESSION AND PURGATION IN CONSERVATION PROGRAMS. (English)
12 October 2021
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L’AVANCÉE MÉTHODOLOGIQUE DANS LA PRODUCTION DE DONNÉES GÉNOMIQUES AU MOYEN DE TECHNIQUES DE GÉNOTYPAGE ET DE SÉQUENÇAGE DE MASSE IMPLIQUE UNE ANALYSE DÉTAILLÉE DE LA DIVERSITÉ AVEC DE MULTIPLES APPLICATIONS DANS LA CONSERVATION DES RESSOURCES GÉNÉTIQUES TANT DANS LES PROGRAMMES DE CONSERVATION QUE DANS LES PROGRAMMES D’AMÉLIORATION GÉNÉTIQUE ANIMALE. LA DISPONIBILITÉ DE CES DONNÉES PERMET D’OBTENIR DES ESTIMATIONS PRÉCISES DE LA CONSANGUINITÉ MOLÉCULAIRE ET DE LA PARENTÉ, CE QUI NÉCESSITE LE DÉVELOPPEMENT ET LE PERFECTIONNEMENT DE NOUVELLES TECHNIQUES D’ANALYSE, LEUR INTÉGRATION DANS LA SIMULATION DE MODÈLES BIOLOGIQUES ET LA RÉÉVALUATION DES STRATÉGIES DE GESTION DES RESSOURCES GÉNÉTIQUES. CE PROJET VISE À RÉPONDRE À DIFFÉRENTES QUESTIONS GÉNÉRÉES PAR L’OBTENTION D’ESTIMATIONS MOLÉCULAIRES DE LA PARENTÉ ET DE LA CONSANGUINITÉ. DANS LE PREMIER BLOC D’OBJECTIFS, LES APPLICATIONS DE LA PARENTÉ GÉNOMIQUE SERONT ANALYSÉES ET DÉVELOPPÉES DANS L’ESTIMATION ET LE CONTRÔLE DE LA DIVERSITÉ GÉNÉTIQUE ET DANS LA DÉTECTION DE L’EMPREINTE DE LA SÉLECTION, ET LES ÉQUATIONS PRÉDICTIVES DU RECENSEMENT EFFICACE DE LA POPULATION SERONT DÉVELOPPÉES DANS UN MODÈLE GÉNOMIQUE DE MUTATIONS DÉLÉTÈRES. LE DEUXIÈME BLOC ÉVALUERA LES CONSÉQUENCES DE L’UTILISATION DE L’INFORMATION GÉNOMIQUE DANS LA GESTION DES POPULATIONS CONSERVÉES, DANS DES ASPECTS TELS QUE LA GESTION DES POPULATIONS SUBDIVISÉES, LA CRÉATION DE POPULATIONS SYNTHÉTIQUES (POUR LES PROGRAMMES EX-SITU OU COMME BASE D’UN PROGRAMME D’AMÉLIORATION GÉNÉTIQUE) OU DANS L’OPTIMISATION DES PROGRAMMES DE RENFORCEMENT DES POPULATIONS (REPRODUCTION DE SOUTIEN).TAMBIEN GÉNÉRERA DES DONNÉES GÉNOMIQUES EMPIRIQUES SUR LA DÉPRESSION SANGUINE ET LA PURIFICATION DANS LES PROGRAMMES DE CONSERVATION. (French)
2 December 2021
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DER METHODISCHE FORTSCHRITT BEI DER GENERIERUNG GENOMISCHER DATEN DURCH MASSENGENOTYPISIERUNGS- UND SEQUENZIERUNGSTECHNIKEN IMPLIZIERT EINE DETAILLIERTE ANALYSE DER VIELFALT MIT VIELFÄLTIGEN ANWENDUNGEN IN DER ERHALTUNG GENETISCHER RESSOURCEN SOWOHL IN ERHALTUNGSPROGRAMMEN ALS AUCH IN TIERGENETISCHEN VERBESSERUNGSPROGRAMMEN. DIE VERFÜGBARKEIT DIESER DATEN ERMÖGLICHT GENAUE SCHÄTZUNGEN DER MOLEKULAREN KONANGUINITÄT UND VERWANDTSCHAFT, DIE DIE ENTWICKLUNG UND VERFEINERUNG NEUER ANALYSETECHNIKEN, IHRE EINBEZIEHUNG IN DIE SIMULATION BIOLOGISCHER MODELLE UND DIE NEUBEWERTUNG DER STRATEGIEN FÜR DAS MANAGEMENT GENETISCHER RESSOURCEN ERFORDERN. ZIEL DIESES PROJEKTS IST ES, VERSCHIEDENE FRAGEN ZU BEANTWORTEN, DIE DURCH DIE ERLANGUNG MOLEKULARER SCHÄTZUNGEN DER VERWANDTSCHAFT UND DER VERWANDTSCHAFT ENTSTEHEN. IM ERSTEN ZIELBLOCK WERDEN ANWENDUNGEN DER GENOMISCHEN VERWANDTSCHAFT BEI DER SCHÄTZUNG UND KONTROLLE DER GENETISCHEN VIELFALT UND BEIM NACHWEIS DES FUSSABDRUCKS DER SELEKTION ANALYSIERT UND ENTWICKELT, UND PRÄDIKTIVE GLEICHUNGEN DER EFFEKTIVEN VOLKSZÄHLUNG WERDEN IN EINEM GENOMISCHEN MODELL DER SCHÄDLICHEN MUTATIONEN ENTWICKELT. DER ZWEITE BLOCK WIRD DIE FOLGEN DER NUTZUNG GENOMISCHER INFORMATIONEN BEI DER VERWALTUNG KONSERVIERTER POPULATIONEN, IN ASPEKTEN WIE DEM MANAGEMENT VON UNTERGLIEDERTEN POPULATIONEN, DER BILDUNG SYNTHETISCHER POPULATIONEN (FÜR EX-SITU-PROGRAMME ODER ALS GRUNDLAGE FÜR EIN GENETISCHES VERBESSERUNGSPROGRAMM) ODER BEI DER OPTIMIERUNG VON BEVÖLKERUNGSVERSTÄRKUNGSPROGRAMMEN (UNTERSTÜTZENDE ZÜCHTUNG) BEWERTEN.TAMBIEN WIRD EMPIRISCHE GENOMISCHE DATEN ÜBER BLUTDEPRESSION UND REINIGUNG IN ERHALTUNGSPROGRAMMEN GENERIEREN. (German)
9 December 2021
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DE METHODOLOGISCHE VOORUITGANG IN HET GENEREREN VAN GENOMISCHE GEGEVENS DOOR MIDDEL VAN MASSA GENOTYPING EN SEQUENCING TECHNIEKEN IMPLICEERT EEN GEDETAILLEERDE ANALYSE VAN DIVERSITEIT MET MEERDERE TOEPASSINGEN IN HET BEHOUD VAN GENETISCHE HULPBRONNEN IN ZOWEL INSTANDHOUDINGSPROGRAMMA’S ALS DIERLIJKE GENETISCHE VERBETERINGSPROGRAMMA’S. DE BESCHIKBAARHEID VAN DEZE GEGEVENS MAAKT HET MOGELIJK NAUWKEURIGE SCHATTINGEN VAN MOLECULAIRE CONSANGUINITEIT EN VERWANTSCHAP TE VERKRIJGEN, DIE DE ONTWIKKELING EN VERFIJNING VAN NIEUWE ANALYSETECHNIEKEN, DE INTEGRATIE ERVAN IN DE SIMULATIE VAN BIOLOGISCHE MODELLEN EN DE HERBEOORDELING VAN DE STRATEGIEËN VOOR HET BEHEER VAN GENETISCHE HULPBRONNEN VEREISEN. DIT PROJECT HEEFT TOT DOEL VERSCHILLENDE VRAGEN TE BEANTWOORDEN DIE ONTSTAAN DOOR HET VERKRIJGEN VAN MOLECULAIRE SCHATTINGEN VAN VERWANTSCHAP EN CONSANGUINITEIT. IN HET EERSTE BLOK VAN DOELSTELLINGEN ZULLEN TOEPASSINGEN VAN DE GENOMISCHE VERWANTSCHAP WORDEN GEANALYSEERD EN ONTWIKKELD IN DE SCHATTING EN BEHEERSING VAN GENETISCHE DIVERSITEIT EN BIJ DE DETECTIE VAN DE VOETAFDRUK VAN DE SELECTIE, EN VOORSPELLENDE VERGELIJKINGEN VAN DE EFFECTIEVE POPULATIETELLING ZULLEN WORDEN ONTWIKKELD IN EEN GENOMISCH MODEL VAN SCHADELIJKE MUTATIES. HET TWEEDE BLOK ZAL DE GEVOLGEN EVALUEREN VAN HET GEBRUIK VAN GENOMISCHE INFORMATIE IN HET BEHEER VAN GECONSERVEERDE POPULATIES, IN ASPECTEN ZOALS HET BEHEER VAN ONDERVERDEELDE POPULATIES, DE CREATIE VAN SYNTHETISCHE POPULATIES (VOOR EX-SITU-PROGRAMMA’S OF ALS BASIS VOOR EEN GENETISCHE VERBETERINGSPROGRAMMA) OF IN DE OPTIMALISATIE VAN POPULATIEVERSTERKINGSPROGRAMMA’S (ONDERSTEUNENDE FOKKEN).TAMBIEN ZAL EMPIRISCHE GENOMISCHE GEGEVENS OVER BLOEDDEPRESSIE EN ZUIVERING IN CONSERVERINGSPROGRAMMA’S GENEREREN. (Dutch)
17 December 2021
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Vigo
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Identifiers
CGL2016-75904-C2-1-P
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