miRNAs: potential biomarkers in for the diagnosis of post-surgical septic shock (biomiR). (Q3149711)
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Project Q3149711 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | miRNAs: potential biomarkers in for the diagnosis of post-surgical septic shock (biomiR). |
Project Q3149711 in Spain |
Statements
29,500.0 Euro
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59,000.0 Euro
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50.0 percent
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1 January 2019
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31 March 2022
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HOSPITAL CLINICO UNIVERSITARIO DE VALLADOLID
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41°39'7.67"N, 4°43'42.82"W
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47186
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En España, la mortalidad en el caso de shock séptico es inaceptablemente elevada llegando a cifras 50-60% y aún no existe un “gold standard” para su diagnóstico. Los biomarcadores existentes pueden ayudan al diagnóstico clínico, pero en ningún caso ser recomendados como un test diagnóstico definitivo. Debido a sus características moleculares, se postula que el estudio de los miRNAs puede contribuir a solventar definitivamente este problema. El objetivo principal de este proyecto multicéntrico (3 centros) es: definir un algoritmo diferencial de miRNAs microvesiculares con capacidad diagnóstica y pronóstica de shock séptico. Correlacionar estos resultados con los del estudio del transcriptoma previo de nuestro grupo (PI15/01451) y por último, validar los algoritmos en una cohorte independiente. la metodología para los dos primeros objetivos analizaremos las 120 muestras (n=60 shock séptico y n=60 shock no séptico) incluidas en el trabajo previo (PI15/01451). Realizaremos el aislamiento de las microvesículas por precipitación y ultrafiltración; cuantificación de los miRNAs por cuantificación masiva y valoración de su rendimiento por bioanalyzer y PCR cuantitativa. El análisis bioinformático nos permitirá definir el algoritmo de miRNAs representativo de cada brazo y la validación la realizaremos en una cohorte independiente de 108 pacientes (n=36 shock séptico, n=36 shock no séptico y n=36 controles), siguiendo la misma aproximación experimental. Los resultados obtenidos aportarían herramientas definitivas para realizar diagnóstico preciso y precoz del shock séptico. También favorecería la implicación de empresas biotecnológicas con el sistema nacional de salud ya que existe la posibilidad de patentar kits diagnóstico, como avala el documento de interés empresarial. (Spanish)
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In Spain, mortality in the case of septic shock is unacceptably high reaching 50-60 % and there is still no “gold standard” for its diagnosis. Existing biomarkers can help clinical diagnosis, but in no case be recommended as a definitive diagnostic test. Due to their molecular characteristics, it is postulated that the study of miRNAs can contribute to definitively solve this problem. The main objective of this multicenter project (3 centers) is: define a differential algorithm of microvesicular miRNAs with diagnostic and prognostic capacity of septic shock. Correlate these results with those of our group’s previous transcriptome study (PI15/01451) and finally validate algorithms in an independent cohort. the methodology for the first two objectives will analyse the 120 samples (n=60 septic shock and n=60 non-septic shock) included in the previous work (PI15/01451). We will perform the isolation of the microvesicles by precipitation and ultrafiltration; quantification of miRNAs by mass quantification and performance assessment by Bioanalyser and quantitative PCR. The bioinformatics analysis will allow us to define the miRNAs algorithm representative of each arm and the validation will be performed in an independent cohort of 108 patients (n=36 septic shock, n=36 non-septic shock and n=36 controls), following the same experimental approach. The results obtained would provide definitive tools for accurate and early diagnosis of septic shock. It would also favor the involvement of biotechnology companies with the national health system since there is the possibility of patenting diagnostic kits, as endorsed by the document of business interest. (English)
12 October 2021
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En Espagne, la mortalité en cas de choc septique est inacceptablement élevée, atteignant 50-60 % et il n’y a toujours pas de «norme d’or» pour son diagnostic. Les biomarqueurs existants peuvent aider au diagnostic clinique, mais en aucun cas être recommandés comme test diagnostique définitif. En raison de leurs caractéristiques moléculaires, il est postulé que l’étude des miRNAs peut contribuer à résoudre définitivement ce problème. L’objectif principal de ce projet multicentrique (3 centres) est: définir un algorithme différentiel de miRNA microvésiculaires avec la capacité diagnostique et pronostique du choc septique. Corréler ces résultats avec ceux de la précédente étude transcriptome de notre groupe (PI15/01451) et valider enfin les algorithmes dans une cohorte indépendante. la méthodologie pour les deux premiers objectifs analysera les 120 échantillons (n=60 choc septique et n=60 choc non septique) inclus dans les travaux précédents (PI15/01451). Nous effectuerons l’isolement des microvésicules par précipitation et ultrafiltration; quantification des miRNA par quantification de masse et évaluation des performances par Bioanalyse et PCR quantitative. L’analyse bioinformatique nous permettra de définir l’algorithme miRNAs représentatif de chaque bras et la validation sera effectuée dans une cohorte indépendante de 108 patients (n=36 choc septique, n=36 choc non septique et n=36 témoins), suivant la même approche expérimentale. Les résultats obtenus fourniraient des outils définitifs pour un diagnostic précis et précoce du choc septique. Elle favoriserait également la participation des entreprises de biotechnologie au système national de santé, étant donné qu’il existe la possibilité de breveter des kits de diagnostic, comme en témoigne le document présentant un intérêt commercial. (French)
2 December 2021
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Valladolid
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Identifiers
PI18_01238
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