Antisense transcription requirement for plant external environment sensing. (Q84239)
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Project Q84239 in Poland
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Antisense transcription requirement for plant external environment sensing. |
Project Q84239 in Poland |
Statements
3,500,000.0 zloty
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3,500,000.0 zloty
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100.0 percent
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1 December 2017
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30 November 2020
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INSTYTUT BIOCHEMII I BIOFIZYKI POLSKIEJ AKADEMII NAUK
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Eukaryotic genomes including plants are pervasively transcribed producing a myriad of non-protein-coding RNA transcripts (ncRNA), including antisense transcripts. Although the prevalent nature of antisense transcription is now well accepted, its functional consequence is much less appreciated. In this application we propose existence of a novel, generic mechanism of Arabidopsis gene regulation by long, non-protein-coding antisense transcription in response to external environment. We will combine an in-depth analysis of antisense transcription absolute requirement for regulation by external signals, of a master regulator of seed dormancy - DOG1 with several, genome-wide approaches to test the proposed mechanism. Finally we will explore the mechanistic aspects of how DOG1 protein controls plant stress response. (Polish)
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Eukaryotic genomes including plants are pervasively transcribed producing a myriad of non-protein-coding RNA transcripts (ncRNA), including antisense transcripts. Although the prevalent nature of antisense transcription is now well accepted, its functional consequence is much less appreciated. In this application we propose existence of a novel, generic mechanism of Arabidopsis gene regulation by long, non-protein-coding antisense transcription in response to external environment. We will combine an in-depth analysis of antisense transcription absolute requirement for regulation by external signals, of a master regulator of seed dormancy – DOG1 with several, genome-wide approaches to test the proposed mechanism. Finally we will explore the mechanistic aspects of how DOG1 protein controls plant stress response. (English)
14 October 2020
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Les génomes eucaryotes, y compris les plantes, sont largement transcrits, produisant une myriade de transcriptions d’ARN non codés par des protéines (ARNnc), y compris des transcriptions antisens. Bien que la nature prédominante de la transcription antisens soit maintenant bien acceptée, sa conséquence fonctionnelle est beaucoup moins appréciée. Dans cette application, nous proposons l’existence d’un nouveau mécanisme générique de régulation des gènes d’Arabidopsis par transcription antisens longue et non protéique en réponse à un environnement externe. Nous allons combiner une analyse approfondie de l’exigence absolue de transcription antisens pour la régulation par des signaux externes, d’un régulateur maître de la dormance des semences — DOG1 avec plusieurs approches à l’échelle du génome pour tester le mécanisme proposé. Enfin, nous explorerons les aspects mécaniques de la façon dont la protéine DOG1 contrôle la réponse au stress des plantes. (French)
30 November 2021
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Eukaryotische Genome, einschließlich Pflanzen, werden durchdringend transkribiert und produzieren eine Vielzahl von RNA Transcripts (ncRNA), einschließlich Antisense Transcripts. Obwohl die vorherrschende Natur der Antisense-Transkription jetzt gut akzeptiert wird, wird ihre funktionelle Konsequenz viel weniger geschätzt. In dieser Anwendung schlagen wir die Existenz eines neuartigen, generischen Mechanismus der Arabidopsis Genregulierung durch lange, nicht-eiweiß-kodierende Antisense Transkription als Reaktion auf externe Umgebung vor. Wir werden eine eingehende Analyse der absoluten Antisense Transkriptionspflicht für die Regulierung durch externe Signale, eines Masterregulators für Saatgutruhe – DOG1 mit mehreren genomweiten Ansätzen zur Prüfung des vorgeschlagenen Mechanismus kombinieren. Abschließend werden wir die mechanischen Aspekte untersuchen, wie DOG1-Protein die Reaktion auf Pflanzenstress kontrolliert. (German)
7 December 2021
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Identifiers
POIR.04.04.00-00-3C97/16
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