NEW SEQUENCING TECHNOLOGIES (NGS) FOR THE STUDY OF MYCOVIRUSES IN FUSARIUM CIRCINATUM (Q3184827)
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Project Q3184827 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | NEW SEQUENCING TECHNOLOGIES (NGS) FOR THE STUDY OF MYCOVIRUSES IN FUSARIUM CIRCINATUM |
Project Q3184827 in Spain |
Statements
66,550.0 Euro
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133,100.0 Euro
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50.0 percent
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1 January 2016
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31 December 2019
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UNIVERSIDAD DE VALLADOLID
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42°24'34.67"N, 4°36'57.96"W
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34120
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FUSARIUM CIRCINATUM NIRENBERG & O'DONNELL (TELEOMORFO = GIBBERELLA CIRCINATA) ES UN HONGO ASCOMICETO CAUSANTE DEL CHANCRO RESINOSO DEL PINO (PPC, DE SUS INICIALES EN INGLES), UNA ENFERMEDAD QUE CAUSA IMPORTANTES DAÑOS Y PERDIDAS EN BOSQUES Y PLANTACIONES DE PINOS, SIENDO ADEMAS CONSIDERADO EL PATOGENO MAS IMPORTANTE DE VIVEROS EN VARIOS PAISES DE TODO EL MUNDO. LA ENFERMEDAD DEL PPC LLEGO A EUROPA EN EL AÑO 2004, CUANDO ESPAÑA NOTIFICO LA PRESENCIA DEL PATOGENO EN VARIOS VIVEROS DE PINOS EN ASTURIAS, Y EN PLANTACIONES DE CANTABRIA. DESDE ENTONCES, DIVERSOS ESTUDIOS CIENTIFICOS HAN EVALUADO LA DIVERSIDAD GENETICA DE LAS POBLACIONES DEL HONGO, SU PATOGENICIDAD, Y EL PAPEL DE ALGUNAS ESPECIES DE INSECTOS COMO POSIBLES VECTORES DE LA ENFERMEDAD. _x000D_ RECIENTEMENTE, ESTE GRUPO DE INVESTIGACION HA DETECTADO LA PRESENCIA DE DIFERENTES MOLECULAS DE DSRNA DE ORIGEN VIRICO EN ALGUNOS AISLAMIENTOS DE LA POBLACION ESPAÑOLA DE F. CIRCINATUM, TRES CEPAS QUE PERTENECEN A DOS NUEVAS ESPECIES DEL GENERO MITOVIRUS, FUSARIUM CIRCINATUM MITOVIRUS 1 (FCMV1), FCMV2- 1 Y FCMV2-2. LA DETECCION HA SIDO FRECUENTE EN LA POBLACION ESPAÑOLA DEL PATOGENO, DONDE UN 32% DE LOS AISLAMIENTOS ESTABAN INFECTADOS POR AL MENOS UNA DE LAS TRES CEPAS VIRICAS DETECTADAS. ESTAS MOLECULAS DE DSRNA PODRIAN DESENCADENAR PROCESOS HIPOVIRULENTOS EN EL HONGO HOSPEDANTE, COMO OCURRE EN CRYPHONECTRIA PARASITICA, EL AGENTE CAUSAL DEL CHANCRO DEL CASTAÑO, QUE ES CONTROLADO EFICAZMENTE CON ESTE METODO EN EL MONTE. SIN EMBARGO, LAS PRIMERAS PRUEBAS DE INOCULACION LLEVADAS A CABO PARECEN DESCARTAR ESTE EFECTO, LO QUE NOS OBLIGA A LA BUSQUEDA DE NUEVOS MICOVIRUS._x000D_ LAS TECNICAS DE DETECCION DE VIRUS RUTINARIAMENTE UTILIZADAS, COMO LA REACCION EN CADENA DE LA POLIMERASA CON TRANSCRIPTASA INVERSA (RT-PCR) REQUIEREN DE UN CONOCIMIENTO PREVIO DEL VIRUS PARA SER DETECTADO, Y POR TANTO NO SON ACONSEJABLES PARA LA DETECCION DE MICOVIRUS DESCONOCIDOS EN HONGOS. LA UTILIZACION DE LA METAGENOMICA, APOYADA EN LAS NUEVAS TECNOLOGIAS DE SECUENCIACION (NGS, DE SUS INICIALES EN INGLES), POSIBILITA DETERMINAR TODA LA COMUNIDAD VIRICA DE UN ORGANISMO, INCLUYENDO MICOVIRUS. _x000D_ EL OBJETIVO PRINCIPAL DEL PRESENTE PROYECTO ES UTILIZAR LAS NUEVAS TECNOLOGIAS DE SECUENCIACION PARA: (1) IDENTIFICAR LAS MOLECULAS VIRICAS EXISTENTES EN LOS AISLAMIENTOS DE F. CIRCINATUM, (2) ESTUDIAR EL EFECTO DE LOS MICOVIRUS SOBRE FUSARIUM CIRCINATUM, Y (3) ESTUDIAR EL EFECTO DE LA INOCULACION DE F. CIRCINATUM CON Y SIN MICOVIRUS SOBRE PLANTULAS DE PINO. LA CONSECUCION DE ESTOS OBJETIVOS CLARIFICARA LAS POSIBILIDADES DE ESTA ESTRATEGIA PARA EL CONTROL LA ENFERMEDAD DEL CHANCRO RESINOSO DEL PINO EN ESPAÑA. (Spanish)
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Fusarium circinatum NIRENBERG & O'DONNELL (teleomorph = GIBBERELLA CIRCINATA) is an ascomycete CAUSING HONGO of the resinous pine (PPC, OF YOUR INICAL IN ENGLISH), A DISEASE that causes IMPORTANT DAYS AND Lost IN BOSKS AND PINOSS PLANTATIONS, if ADEMAS CONSIDERED THE MASPORTANT pathogen OF VIVERAS IN VARIOS PAISES OF THE WORLD. CFP DISEASE REACHED EUROPE IN 2004, WHEN SPAIN REPORTED THE PRESENCE OF THE PATHOGEN IN SEVERAL PINE NURSERIES IN ASTURIAS, AND IN PLANTATIONS IN CANTABRIA. SINCE THEN, SEVERAL SCIENTIFIC STUDIES HAVE EVALUATED THE GENETIC DIVERSITY OF THE FUNGUS POPULATIONS, THEIR PATHOGENICITY, AND THE ROLE OF SOME INSECT SPECIES AS POTENTIAL VECTORS OF THE DISEASE. _x000D_ recently, THIS RESEARCH GROUP DETECTED THE PRESENCE OF DIFFERENT PROCEDURES OF ORIGEN virico dsRNA IN THE SPANISH PUBLICATION OF F. circinatum, THREE CEPAS that pertain to two new SPECIES OF GENERO MITOVIRUS, FUSARIUM circinatum MITOVIRUS 1 (FCMV1), FCMV2-1 and FCMV2-2. DETECTION HAS BEEN FREQUENT IN THE SPANISH POPULATION OF THE PATHOGEN, WHERE 32 % OF THE ISOLATES WERE INFECTED BY AT LEAST ONE OF THE THREE VIRIC STRAINS DETECTED. THESE DSRNA MOLECULES COULD TRIGGER HYPOVIRULENT PROCESSES IN THE HOST FUNGUS, AS IN CRYPHONECTRIA PARASITICA, THE CAUSAL AGENT OF CHESTNUT CHANCRO, WHICH IS EFFECTIVELY CONTROLLED BY THIS METHOD ON THE MOUNT. However, the FIRST INoculation TESTS BY CABO PARECATE THIS EFFECTION, THAT OFFER TO THE SEARCH OF NEW MICOVIRUS._x000D_ The routinely used VIRUS DETECTION TECHNICATIONS, as the CADENCE REACTION OF INVERSE TRANSCRIPTASE (RT-PCR) requires a preliminary knowledge of the VIRUS to be detected, and for so many are not advisable for the detection of MICOVIRUS unknowledged in hooks. THE USE OF METAGENOMICA, SUPPORTED BY THE NEW SEQUENCING TECHNOLOGIES (NGS, OF ITS INITIALS IN ENGLISH), MAKES IT POSSIBLE TO DETERMINE THE ENTIRE VIRIC COMMUNITY OF AN ORGANISM, INCLUDING MYCOVIRUS. _x000D_ the PRINCIPAL OBJECTIVE OF THE PRESENT PROJECT IS TO USE NEW Sequencing TECHNOLOGIES FOR: (1) IDENTIFY EXISTING VIRIC MOLECULES IN F. CIRCINATUM ISOLATIONS, (2) STUDY THE EFFECT OF MYCOVIRUSES ON FUSARIUM CIRCINATUM, AND (3) STUDY THE EFFECT OF F. CIRCINATUM INOCULATION WITH AND WITHOUT MYCOVIRUS ON PINE PLANTS. THE ACHIEVEMENT OF THESE OBJECTIVES WILL CLARIFY THE POSSIBILITIES OF THIS STRATEGY FOR THE CONTROL OF RESINOUS PINE CHANCRO DISEASE IN SPAIN. (English)
12 October 2021
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Fusarium circinatum NIRENBERG & O’DONNELL (teleomorphe = GIBBERELLA CIRCINATA) est un ascomycète CAUSING HONGO du pin résineux (PPC, DE VOTRE inical EN ANGLAIS), un DISEASE qui provoque des JOURS IMPORTANTES ET DANS LES PLANTATIONS PINOSSES, si Ademas a considéré le pathogène MASPORTANT DES VIVERAS DANS VARIOS PAISES DU MONDE. LA MALADIE DE LA PCP A ATTEINT L’EUROPE EN 2004, LORSQUE L’ESPAGNE A SIGNALÉ LA PRÉSENCE DE L’AGENT PATHOGÈNE DANS PLUSIEURS PÉPINIÈRES DE PINS DANS LES ASTURIES ET DANS LES PLANTATIONS DE CANTABRIE. DEPUIS, PLUSIEURS ÉTUDES SCIENTIFIQUES ONT ÉVALUÉ LA DIVERSITÉ GÉNÉTIQUE DES POPULATIONS DE CHAMPIGNONS, LEUR PATHOGÉNICITÉ ET LE RÔLE DE CERTAINES ESPÈCES D’INSECTES COMME VECTEURS POTENTIELS DE LA MALADIE. _x000D_ récemment, CE GROUPE DE RECHERCHE DÉTECTÉ LA PRÉSENCE DES PROCÉDURES DIFFÉRENTES DE VIrico dsRNA ORIGENNE DANS LA PUBLICATION ESPAGNE DE F. circinatum, TROIS CESPES qui concernent deux nouvelles SPECIES DE GENERO MITOVIRUS, Fusarium circinatum MITOVIRUS 1 (FCMV1), FCMV2-1 et FCMV2-2. LA DÉTECTION DE L’AGENT PATHOGÈNE A ÉTÉ FRÉQUENTE DANS LA POPULATION ESPAGNOLE, OÙ 32 % DES ISOLATS ONT ÉTÉ INFECTÉS PAR AU MOINS UNE DES TROIS SOUCHES VIRIQUES DÉTECTÉES. CES MOLÉCULES D’ARNS DS POURRAIENT DÉCLENCHER DES PROCESSUS HYPOVIRULENT DANS LE CHAMPIGNON HÔTE, COMME DANS CRYPHONECTRIA PARASITICA, L’AGENT CAUSAL DU CHÂTAIGNIER CHANCRO, QUI EST EFFICACEMENT CONTRÔLÉ PAR CETTE MÉTHODE SUR LE MONT. Cependant, la PREMIÈRE inoculation TESTS PARECATE DE CABO, QU’AFFAIRE À LA RECHERCHE DU NOUVEAU MICOVIRUS._x000D_ Les TECHNICATIONS DE DÉTECTION VIRUS couramment utilisées, comme la CADENCE REACTION OF INVERSE transcriptase (RT-PCR) nécessite une connaissance préliminaire du VIRUS pour être détecté, et pour beaucoup ne sont pas recommandés pour la détection de MICOVIRUS non connu dans les crochets. L’UTILISATION DE METAGENOMICA, SOUTENUE PAR LES NOUVELLES TECHNOLOGIES DE SÉQUENÇAGE (NGS, DE SES INITIALES EN ANGLAIS), PERMET DE DÉTERMINER L’ENSEMBLE DE LA COMMUNAUTÉ VIRIQUE D’UN ORGANISME, Y COMPRIS MYCOVIRUS. _x000D_ l’OBJECTIVE PRINCIPALE DU PROJET PRÉSENTE UTILISER DE NOUVELLES TECHNOLOGIES DE SÉCURAGE POUR: (1) IDENTIFIER LES MOLÉCULES VIRIQUES EXISTANTES DANS LES ISOLEMENTS DE F. CIRCINATUM, (2) ÉTUDIER L’EFFET DES MYCOVIRUS SUR FUSARIUM CIRCINATUM ET (3) ÉTUDIER L’EFFET DE L’INOCULATION DE F. CIRCINATUM AVEC ET SANS MYCOVIRUS SUR LES PINS. LA RÉALISATION DE CES OBJECTIFS CLARIFIERA LES POSSIBILITÉS DE CETTE STRATÉGIE DE LUTTE CONTRE LA MALADIE DU PIN RÉSINEUX CHANCRO EN ESPAGNE. (French)
4 December 2021
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Palencia
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Identifiers
AGL2015-69370-R
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