Development and validation of a hyperspectral system for analysis of solid tissue biopsies. QUASAR (Q4658098): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(Set a claim value: summary (P836): O projeto Quasar visa desenvolver um sistema completo de análise de tecidos sólidos. O sistema óptico Quasar baseia-se em um conceito inovador (atualmente sob pedido de patente) que permite reduzir drasticamente o número de FOV, mas por sua vez consegue obter informações a partir da amostra de tecido completa. A solução Quasar envolve a utilização de um sistema de imagem (histocitometro) de baixa ampliação que permite captar maior FOV em cada imagem...) |
(Changed label, description and/or aliases in pt) |
||
| label / pt | label / pt | ||
Desenvolvimento e validação de um sistema hiperespectral para análise de biópsias de | Desenvolvimento e validação de um sistema hiperespectral para análise de biópsias de tecidos sólidos. QUASAR | ||
Latest revision as of 12:55, 12 October 2024
Project Q4658098 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Development and validation of a hyperspectral system for analysis of solid tissue biopsies. QUASAR |
Project Q4658098 in Spain |
Statements
112,298.77 Euro
0 references
206,242.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 October 2018
0 references
30 September 2022
0 references
UNIVERSIDAD REY JUAN CARLOS
0 references
28933
0 references
El proyecto Quasar pretende desarrollar un sistema completo para análisis de téjido sólido. El sistema óptico Quasar se basa en un concepto innovador (actualmente bajo solicitud de patente) que permite reducir drásticamente el número de FOV, pero a su vez logra obtener información de la muestra completa de tejido. La solución Quasar implica el uso de un sistema de imagen (histocitómetro) de baja magnificación que permite capturar mayor FOV en cada imagen, mediante la utilización de lentes con gran apertura numérica para capturar el máximo de luz posible de la muestra. Esta aproximación permite la utilización de datos hiperespectrales aumentando la sensibilidad fenotípica de los análisis. El fin último del proyecto propuesto no es implementar un dispositivo para uso en investigación, sino desarrollar y validar un sistema completo estandarizado en una aplicación clínica específica, con gran incidencia y mortalidad como es el cáncer de pulmón. El sistema Quasar incluirá un preparador de muestras (tinción del tejido con los marcadores de fluorescencia) automatizado, un histo-citómetro hiperespectral de análisis de tejido con software de adquisición (que incluirá un módulo de calibración y control de calidad), software de análisis datos multiparamétricos con herramientas de visualización de imagen y análisis automático, y paneles de anticuerpos y fluorocromos para diagnóstico, pronóstico y evaluación de la adecuación de pacientes para ser tratados con inmunoterapias de cáncer de pulmón (companion diagnostic). La tecnología a ser implementada en el Quasar está basada en desarrollos llevados a cabo en el proyecto Platform-Cell (Proyecto financiado en la convocatoria Retos-Colaboración 2015), cuyo objetivo principal era desarrollar un citómetro de imagen para análisis de células aisladas (sangre periférica marcada con anticuerpos y fluorocromos) con alta sensibilidad, comparable a la de los citómetros de flujo convencionales. Los prometedores resultados obtenidos en el proyecto Platform-Cell en análisis de sangre, junto con las limitaciones actuales de las técnicas disponibles para análisis de tejidos sólidos, han impulsado el desarrollo del proyecto Quasar que utilizará el concepto Platform-Cell adaptado a los requisitos propios del análisis de biopsias de tejidos sólidos, más concretamente de pulmón. El consorcio Quasar estará formado por Cytognos como socio industrial, la Universidad Rey Juan Carlos de Madrid (URJC) a través del grupo de electromecánica y el grupo de desarrollo de algoritmos de análisis de imagen, y la Fundación para la Investigación Clínica Aplicada (FIMA) que participará con el grupo de aplicaciones ópticas y el grupo de validación clínica. Existen grandes sinergias y alto grado de complementariedad entre los distintos socios ya demostradas gracias al éxito en la implementación del proyecto Platform-Cell que contaba con los mismos participantes a los que se suma ahora el grupo de validación clínica del FIMA. (Spanish)
0 references
The Quasar project aims to develop a complete system for solid tissue analysis. The Quasar optical system is based on an innovative concept (currently under patent application) that allows to drastically reduce the number of FOV, but in turn manages to obtain information from the complete tissue sample. The Quasar solution involves the use of an image system (histocytometer) of low magnification that allows to capture greater FOV in each image, using lenses with large numerical aperture to capture the maximum possible light of the sample. This approach allows the use of hyperspectral data increasing the phenotypic sensitivity of the analyses. The ultimate purpose of the proposed project is not to implement a device for use in research, but to develop and validate a complete standardised system in a specific clinical application, with high incidence and mortality such as lung cancer. The Quasar system will include a sample preparer (tissue dye with fluorescence markers) automated, a hyperspectral tissue analysis histo-cytometer with acquisition software (including a calibration and quality control module), multiparametric data analysis software with imaging and automatic analysis tools, and antibody and fluorochrome panels for diagnosis, prognosis and evaluation of patient adequacy to be treated with lung cancer immunotherapies (companion diagnosis). The technology to be implemented in the Quasar is based on developments carried out in the Platform-Cell project (Project funded in the Challenges-Collaboration 2015 call), whose main objective was to develop an image cytometer for isolated cell analysis (peripheral blood marked with antibodies and fluorochromes) with high sensitivity, comparable to that of conventional flow cytometers. The promising results obtained in the Platform-Cell project in blood tests, together with the current limitations of the techniques available for solid tissue analysis, have led to the development of the Quasar project that will use the Platform-Cell concept adapted to the requirements of the analysis of solid tissue biopsies, more specifically lung. The Quasar consortium will be formed by Cytognos as an industrial partner, the Rey Juan Carlos University of Madrid (URJC) through the electromechanics group and the development group of image analysis algorithms, and the Foundation for Applied Clinical Research (FIMA) that will participate with the optical applications group and the clinical validation group. There are great synergies and a high degree of complementarity between the different partners already demonstrated thanks to the success in the implementation of the Platform-Cell project that had the same participants to whom the FIMA clinical validation group now joins. (English)
0.9760800358273908
0 references
Il-proġett Quasar għandu l-għan li jiżviluppa sistema kompluta għall-analiżi tat-tessuti solidi. Is-sistema ottika Quasar hija bbażata fuq kunċett innovattiv (bħalissa taħt l-applikazzjoni tal-privattiva) li jippermetti li jitnaqqas drastikament in-numru ta’ FOV, iżda min-naħa tiegħu jirnexxilu jikseb informazzjoni mill-kampjun sħiħ tat-tessut. Is-soluzzjoni Quasar tinvolvi l-użu ta’ sistema ta’ immaġni (istoċitometru) ta’ tkabbir baxx li jippermetti l-qbid ta’ FOV akbar f’kull immaġni, bl-użu ta’ lentijiet b’apertura numerika kbira biex jinqabad id-dawl massimu possibbli tal-kampjun. Dan l-approċċ jippermetti l-użu ta’ data iperspettrali li żżid is-sensittività fenotipika tal-analiżi. L-għan aħħari tal-proġett propost mhuwiex li jiġi implimentat apparat għall-użu fir-riċerka, iżda li tiġi żviluppata u vvalidata sistema standardizzata kompluta f’applikazzjoni klinika speċifika, b’inċidenza u mortalità għolja bħall-kanċer tal-pulmun. Is-sistema Quasar se tinkludi preparatur ta’ kampjuni (żebgħa tat-tessut b’markaturi tal-fluworexxenza) awtomatizzat, isto-ċitometru tal-analiżi tat-tessut iperspettrali b’softwer tal-akkwist (inkluż modulu ta’ kontroll tal-kalibrazzjoni u tal-kwalità), softwer ta’ analiżi tad-data multiparametrika b’għodod ta’ immaġni u analiżi awtomatika, u pannelli ta’ antikorpi u fluorochrome għad-dijanjożi, il-pronjożi u l-evalwazzjoni tal-adegwatezza tal-pazjent biex jiġi ttrattat b’immunoterapiji tal-kanċer tal-pulmun (dijanjosi ta’ kumpanjoni). It-teknoloġija li għandha tiġi implimentata fil-Quasar hija bbażata fuq żviluppi mwettqa fil-proġett Platform-Cell (Proġett iffinanzjat fis-sejħa tal-2015 tal-Kollaborazzjoni tal-Isfidi), li l-għan ewlieni tiegħu kien li jiżviluppa ċitometru tal-immaġni għal analiżi iżolata taċ-ċelloli (demm periferali mmarkat b’antikorpi u fluworokromi) b’sensittività għolja, komparabbli ma’ dik ta’ ċitometri bi fluss konvenzjonali. Ir-riżultati promettenti miksuba fil-proġett Platform-Cell fit-testijiet tad-demm, flimkien mal-limitazzjonijiet attwali tat-tekniki disponibbli għall-analiżi tat-tessuti solidi, wasslu għall-iżvilupp tal-proġett Quasar li se juża l-kunċett Platform-Cell adattat għar-rekwiżiti tal-analiżi ta’ bijopsiji ta’ tessuti solidi, b’mod aktar speċifiku l-pulmun. Il-konsorzju Quasar se jkun iffurmat minn Cytognos bħala sieħeb industrijali, l-Università Rey Juan Carlos ta’ Madrid (URJC) permezz tal-grupp elettromekkaniku u l-grupp ta’ żvilupp tal-algoritmi tal-analiżi tal-immaġni, u l-Fondazzjoni għar-Riċerka Klinika Applikata (FIMA) li se tipparteċipa mal-grupp tal-applikazzjonijiet ottiċi u l-grupp ta’ validazzjoni klinika. Hemm sinerġiji kbar u grad għoli ta’ komplementarjetà bejn l-imsieħba differenti li diġà ntwera bis-saħħa tas-suċċess fl-implimentazzjoni tal-proġett Platform-Cell li kellu l-istess parteċipanti li magħhom issa jingħaqad il-grupp ta’ validazzjoni klinika FIMA. (Maltese)
0 references
Cilj projekta Quasar je razviti cjelovit sustav za analizu čvrstog tkiva. Quasar optički sustav temelji se na inovativnom konceptu (trenutačno pod patentnom prijavom) koji omogućuje drastično smanjenje broja FOV-a, ali zauzvrat uspijeva dobiti informacije iz cijelog uzorka tkiva. Quasar rješenje uključuje korištenje slikovnog sustava (histocitometar) niskog povećanja koji omogućuje snimanje većeg FOV-a na svakoj slici, koristeći leće s velikim numeričkim otvorom blende za snimanje maksimalnog mogućeg svjetla uzorka. Ovaj pristup omogućuje korištenje hiperspektralnih podataka povećavajući fenotipsku osjetljivost analiza. Krajnja svrha predloženog projekta nije uvođenje uređaja za uporabu u istraživanju, već razvoj i potvrđivanje cjelovitog standardiziranog sustava u određenoj kliničkoj primjeni, s visokom incidencijom i smrtnošću kao što je rak pluća. Sustav Quasar uključivat će automatski uređaj za pripremu uzoraka (boja tkiva s fluorescencijskim markerima), histocitometar za analizu hiperspektralnog tkiva s softverom za akviziciju (uključujući modul za kalibraciju i kontrolu kvalitete), multiparametrijski softver za analizu podataka s alatima za snimanje i automatsku analizu te antitijela i fluorokromne ploče za dijagnozu, prognozu i procjenu primjerenosti pacijenata za liječenje imunoterapija raka pluća (dijagnoza pratitelja). Tehnologija koja će se implementirati u Quasar temelji se na razvoju projekta Platform-Cell (Projekt financiran u okviru poziva na podnošenje prijedloga za 2015. godinu), čiji je glavni cilj bio razviti citometar slike za analizu izoliranih stanica (periferna krv označena antitijelima i fluorokromima) s visokom osjetljivošću, usporedivom s onima konvencionalnih citometara protoka. Obećavajući rezultati dobiveni u projektu Platform-Cell u testovima krvi, zajedno s trenutnim ograničenjima tehnika dostupnih za analizu krutih tkiva, doveli su do razvoja projekta Quasar koji će koristiti koncept Platform-Cell prilagođen zahtjevima analize biopsija krutih tkiva, točnije pluća. Konzorcij Quasar formirat će Cytognos kao industrijski partner, Sveučilište Rey Juan Carlos u Madridu (URJC) kroz elektromehaničku grupu i razvojnu skupinu algoritama za analizu slika te Zakladu za primijenjena klinička istraživanja (FIMA) koja će sudjelovati u grupi optičkih aplikacija i kliničkoj validacijskoj skupini. Postoje velike sinergije i visok stupanj komplementarnosti među različitim partnerima koji su već dokazani zahvaljujući uspjehu u provedbi projekta Platform-Cell koji je imao iste sudionike kojima se sada pridružila FIMA-ina skupina za kliničku validaciju. (Croatian)
0 references
Quasar-projektet har til formål at udvikle et komplet system til solid vævsanalyse. Quasar optiske system er baseret på et innovativt koncept (i øjeblikket under patentansøgning), der giver mulighed for drastisk at reducere antallet af FOV, men til gengæld formår at indhente oplysninger fra den komplette vævsprøve. Quasar-opløsningen indebærer brug af et billedsystem (histocytometer) med lav forstørrelse, der gør det muligt at indfange større FOV i hvert billede ved hjælp af linser med stor numerisk blænde for at indfange det størst mulige lys i prøven. Denne tilgang gør det muligt at bruge hyperspektrale data, der øger analysernes fænotypiske følsomhed. Det endelige formål med det foreslåede projekt er ikke at indføre en anordning til brug i forskning, men at udvikle og validere et komplet standardiseret system i en specifik klinisk applikation med høj forekomst og dødelighed som f.eks. lungekræft. Quasar-systemet vil omfatte en prøveforberedelse (vævsfarve med fluorescensmarkører) automatiseret, en hyperspektral vævsanalyse histo-cytometer med opkøbssoftware (herunder et kalibrerings- og kvalitetskontrolmodul), multiparametrisk dataanalysesoftware med billeddannelse og automatiske analyseværktøjer samt antistof- og fluorochrompaneler til diagnosticering, prognose og evaluering af patientens tilstrækkelighed til at blive behandlet med lungekræft immunopatier (ledsagsdiagnose). Den teknologi, der skal implementeres i Quasar, er baseret på udviklingen i Platform-Cell-projektet (Projekt finansieret i Challenges-Collaboration 2015 call), hvis hovedformål var at udvikle et billede cytometer til isoleret celleanalyse (perifert blod mærket med antistoffer og fluorochromer) med høj følsomhed, der kan sammenlignes med konventionelle flowcytometre. De lovende resultater, der er opnået i Platform-Cell-projektet i blodprøver, sammen med de nuværende begrænsninger af de teknikker, der er tilgængelige for solid vævsanalyse, har ført til udviklingen af Quasar-projektet, der vil anvende Platform-Cell-konceptet, der er tilpasset kravene i analysen af fastvævsbiopsier, mere specifikt lunge. Quasar-konsortiet vil blive dannet af Cytognos som industriel partner, Rey Juan Carlos University of Madrid (URJC) gennem elektromekanikgruppen og udviklingsgruppen for billedanalysealgoritmer og Foundation for Applied Clinical Research (FIMA), der vil deltage i gruppen for optiske applikationer og den kliniske valideringsgruppe. Der er store synergier og en høj grad af komplementaritet mellem de forskellige partnere, der allerede er demonstreret takket være succesen med gennemførelsen af Platform-Cell-projektet, der havde de samme deltagere, som FIMA's kliniske valideringsgruppe nu deltager i. (Danish)
0 references
O projeto Quasar visa desenvolver um sistema completo de análise de tecidos sólidos. O sistema óptico Quasar baseia-se em um conceito inovador (atualmente sob pedido de patente) que permite reduzir drasticamente o número de FOV, mas por sua vez consegue obter informações a partir da amostra de tecido completa. A solução Quasar envolve a utilização de um sistema de imagem (histocitometro) de baixa ampliação que permite captar maior FOV em cada imagem, utilizando lentes com grande abertura numérica para captar a máxima luz possível da amostra. Esta abordagem permite a utilização de dados hiperespectrais que aumentam a sensibilidade fenotípica das análises. O objetivo final do projeto proposto não é implementar um dispositivo para utilização em investigação, mas sim desenvolver e validar um sistema normalizado completo numa aplicação clínica específica, com elevada incidência e mortalidade, como o cancro do pulmão. O sistema Quasar incluirá um preparador de amostras (corante de tecidos com marcadores de fluorescência) automatizado, um histocitometro de análise de tecidos hiperespetral com software de aquisição (incluindo um módulo de calibração e controlo de qualidade), software de análise de dados multiparamétricos com ferramentas de imagem e de análise automática e painéis de anticorpos e fluorocromos para diagnóstico, prognóstico e avaliação da adequação dos doentes a serem tratados com imunoterapias de cancro do pulmão (diagnóstico de acompanhamento). A tecnologia a implementar no Quasar baseia-se nos desenvolvimentos realizados no projeto Plataforma-Célula (Projeto financiado no concurso Challenges-Collaboration 2015), cujo principal objetivo foi desenvolver um citómetro de imagem para análise de células isoladas (sangue periférico marcado com anticorpos e fluorocromos) com elevada sensibilidade, comparável à dos citómetros de fluxo convencionais. Os resultados promissores obtidos no projeto Plataforma-Célula em análises ao sangue, juntamente com as atuais limitações das técnicas disponíveis para análise de tecidos sólidos, levaram ao desenvolvimento do projeto Quasar que utilizará o conceito Plataforma-Célula adaptado às exigências da análise de biópsias de tecidos sólidos, mais especificamente pulmonares. O consórcio Quasar será formado pela Cytognos como parceiro industrial, a Universidade Rey Juan Carlos de Madrid (URJC) através do grupo de eletromecânica e do grupo de desenvolvimento de algoritmos de análise de imagem, e a Fundação para a Investigação Clínica Aplicada (FIMA) que participará com o grupo de aplicações ópticas e o grupo de validação clínica. Há grandes sinergias e um alto grau de complementaridade entre os diferentes parceiros já demonstrados graças ao sucesso na implementação do projeto Plataforma-Célula que teve os mesmos participantes a quem o grupo de validação clínica FIMA agora se junta. (Portuguese)
0 references
Проектът Quasar има за цел да разработи цялостна система за анализ на твърди тъкани. Оптичната система Quasar се основава на иновативна концепция (понастоящем под патентна заявка), която позволява драстично намаляване на броя на FOV, но от своя страна успява да получи информация от пълната тъканна проба. Решението Quasar включва използването на система от изображения (хистоцитометър) с ниско увеличение, която позволява да се улови по-голям FOV във всяко изображение, като се използват лещи с голям цифров отвор, за да се улови максималната възможна светлина на пробата. Този подход позволява използването на хиперспектрални данни, увеличаващи фенотипната чувствителност на анализите. Крайната цел на предложения проект не е да се въведе изделие за използване в научните изследвания, а да се разработи и валидира цялостна стандартизирана система в специфично клинично приложение, с висока честота и смъртност като рак на белия дроб. Системата Quasar ще включва автоматизиран препарат за подготовка на тъкани с флуоресцентни маркери, хистоцитометър за хиперспектрален анализ на тъканите със софтуер за придобиване (включително модул за калибриране и контрол на качеството), многопараметричен софтуер за анализ на данни с инструменти за изобразяване и автоматичен анализ, както и панели за антитела и флуорохром за диагностика, прогноза и оценка на адекватността на пациентите, които да бъдат лекувани с имунотерапевтии на белодробния рак (диагностика на придружаването). Технологията, която ще бъде внедрена в Quasar, се основава на разработки, осъществени в рамките на проекта Platform-Cell (проект, финансиран по поканата Challenges-Collaboration 2015), чиято основна цел е разработването на образен цитометър за анализ на изолирани клетки (периферна кръв, маркирана с антитела и флуорохроми) с висока чувствителност, сравнима с тази на конвенционалните поточни цитометри. Обещаващите резултати, получени в проекта Platform-Cell в кръвните тестове, заедно с настоящите ограничения на наличните техники за анализ на твърди тъкани, доведоха до разработването на проекта Quasar, който ще използва концепцията Platform-Cell, адаптирана към изискванията на анализа на биопсии на твърди тъкани, по-специално белите дробове. Консорциумът Quasar ще бъде сформиран от Cytognos като индустриален партньор, Университета Рей Хуан Карлос в Мадрид (URJC) чрез групата за електромеханика и групата за разработване на алгоритми за анализ на изображения и Фондацията за приложни клинични изследвания (FIMA), която ще участва с групата за оптични приложения и групата за клинично валидиране. Налице са големи синергии и висока степен на взаимно допълване между различните партньори, вече демонстрирана благодарение на успеха в изпълнението на проекта Platform-Cell, който имаше същите участници, към които се присъедини групата за клинично валидиране FIMA. (Bulgarian)
0 references
Quasari projekti eesmärk on töötada välja terviklik süsteem tahkete kudede analüüsiks. Quasari optiline süsteem põhineb uuenduslikul kontseptsioonil (praegu patenditaotlusel), mis võimaldab oluliselt vähendada FOV-i arvu, kuid suudab omakorda saada teavet kogu koeproovist. Quasari lahendus hõlmab madala suurendusega pildisüsteemi (histotsütomeetrit), mis võimaldab jäädvustada igal pildil suuremat FOV-i, kasutades suure numbrilise avaga läätsi, et jäädvustada proovi maksimaalset võimalikku valgust. Selline lähenemine võimaldab kasutada hüperspektraalseid andmeid, mis suurendavad analüüside fenotüübilist tundlikkust. Kavandatava projekti lõppeesmärk ei ole rakendada teadusuuringutes kasutatavat seadet, vaid töötada välja ja kinnitada konkreetses kliinilises rakenduses täielik standardiseeritud süsteem, mille esinemissagedus ja suremus on suur, näiteks kopsuvähk. Quasari süsteem hõlmab proovi ettevalmistajat (koevärv koos fluorestsentsmarkeritega) automatiseeritud, hüperspektraalset koeanalüüsi histo-tsütomeetrilist histotomeetrit koos soetamistarkvaraga (sh kalibreerimis- ja kvaliteedikontrollimoodul), multiparameetrilist andmeanalüüsi tarkvara pilditöötlus- ja automaatsete analüüsivahenditega ning antikehade ja fluorokroompaneelide diagnoosimiseks, prognoosimiseks ja patsiendi piisavuse hindamiseks kopsuvähi immunoteraapiate raviks (kompansioonidiagnoos). Quasaris rakendatav tehnoloogia põhineb projekti Platform-Cell (Projekt, mida rahastati 2015. aasta väljakutsete koostöö raames) raames tehtud arengutel, mille peamine eesmärk oli töötada välja fototsütomeeter isoleeritud rakkude analüüsiks (antikehade ja fluorokroomidega tähistatud perifeerne veri), millel on kõrge tundlikkus, mis on võrreldav tavapäraste voolutsütomeetrite omaga. Platvormi-Cell’i vereanalüüside projektis saadud paljulubavad tulemused koos praeguste piirangutega tahkete kudede analüüsiks kasutatavate meetodite puhul on viinud Quasari projekti väljatöötamiseni, mis kasutab platvormi-Cell kontseptsiooni, mis on kohandatud tahkete kudede biopsia, täpsemalt kopsude analüüsi nõuetele. Quasari konsortsiumi moodustavad Cytognos tööstuspartnerina, Madridi Rey Juan Carlose ülikool (URJC) elektromehaanikagrupi ja pildianalüüsi algoritmide arendusrühma kaudu ning rakenduslike kliiniliste uuringute sihtasutus (FIMA), mis osaleb optiliste rakenduste rühmas ja kliinilise valideerimise rühmas. Erinevate partnerite vahel on suur koostoime ja suur vastastikune täiendavus tänu platvormi-Cell projekti edukale rakendamisele, kus osalesid samad osalejad, kellega nüüd liitub FIMA kliinilise valideerimise rühm. (Estonian)
0 references
Το έργο Quasar στοχεύει στην ανάπτυξη ενός ολοκληρωμένου συστήματος ανάλυσης στερεών ιστών. Το οπτικό σύστημα Quasar βασίζεται σε μια καινοτόμο ιδέα (επί του παρόντος υπό αίτηση ευρεσιτεχνίας) που επιτρέπει τη δραστική μείωση του αριθμού των FOV, αλλά με τη σειρά του καταφέρνει να λάβει πληροφορίες από το πλήρες δείγμα ιστού. Η λύση Quasar περιλαμβάνει τη χρήση ενός συστήματος εικόνας (ιστοκυτταρόμετρο) χαμηλής μεγέθυνσης που επιτρέπει τη λήψη μεγαλύτερου FOV σε κάθε εικόνα, χρησιμοποιώντας φακούς με μεγάλο αριθμητικό διάφραγμα για να συλλάβει το μέγιστο δυνατό φως του δείγματος. Αυτή η προσέγγιση επιτρέπει τη χρήση υπερφασματικών δεδομένων που αυξάνουν τη φαινοτυπική ευαισθησία των αναλύσεων. Απώτερος σκοπός του προτεινόμενου έργου δεν είναι η εφαρμογή μιας συσκευής για χρήση στην έρευνα, αλλά η ανάπτυξη και επικύρωση ενός πλήρους τυποποιημένου συστήματος σε μια συγκεκριμένη κλινική εφαρμογή, με υψηλή συχνότητα εμφάνισης και θνησιμότητα, όπως ο καρκίνος του πνεύμονα. Το σύστημα Quasar θα περιλαμβάνει αυτοματοποιημένο παρασκευαστή δειγμάτων (βαφή ιστού με δείκτες φθορισμού), ιστο-κυτταρόμετρο ανάλυσης υπερφασματικών ιστών με λογισμικό απόκτησης (συμπεριλαμβανομένης μονάδας βαθμονόμησης και ποιοτικού ελέγχου), πολυπαραμετρικό λογισμικό ανάλυσης δεδομένων με εργαλεία απεικόνισης και αυτόματης ανάλυσης, και πάνελ αντισωμάτων και φθορίου για τη διάγνωση, την πρόγνωση και την αξιολόγηση της επάρκειας των ασθενών που πρέπει να αντιμετωπίζονται με ανοσοθεραπείες του καρκίνου του πνεύμονα (διάγνωση συνοδείας). Η τεχνολογία που θα εφαρμοστεί στο Quasar βασίζεται στις εξελίξεις που πραγματοποιήθηκαν στο έργο Platform-Cell (έργο χρηματοδοτούμενο στο πλαίσιο της πρόσκλησης Challenges-Collaboration 2015), του οποίου ο κύριος στόχος ήταν η ανάπτυξη ενός κυτταρομέτρου εικόνας για απομονωμένη ανάλυση κυττάρων (περιφερικό αίμα με αντισώματα και φθοριώματα) με υψηλή ευαισθησία, συγκρίσιμη με εκείνη των συμβατικών κυτταρομέτρων ροής. Τα ελπιδοφόρα αποτελέσματα του έργου Platform-Cell στις εξετάσεις αίματος, σε συνδυασμό με τους τρέχοντες περιορισμούς των τεχνικών που είναι διαθέσιμες για την ανάλυση στερεών ιστών, οδήγησαν στην ανάπτυξη του έργου Quasar που θα χρησιμοποιήσει την έννοια Platform-Cell προσαρμοσμένη στις απαιτήσεις της ανάλυσης των βιοψιών στερεών ιστών, ειδικότερα των πνευμόνων. Η κοινοπραξία Quasar θα σχηματιστεί από την Cytognos ως βιομηχανικό εταίρο, το Πανεπιστήμιο Rey Juan Carlos της Μαδρίτης (URJC) μέσω της ομάδας ηλεκτρομηχανικής και της ομάδας ανάπτυξης αλγορίθμων ανάλυσης εικόνας, και το Ίδρυμα Εφαρμοσμένων Κλινικών Ερευνών (FIMA) που θα συμμετάσχει με την ομάδα οπτικών εφαρμογών και την ομάδα κλινικής επικύρωσης. Υπάρχουν μεγάλες συνέργειες και υψηλός βαθμός συμπληρωματικότητας μεταξύ των διαφόρων εταίρων που έχουν ήδη καταδειχθεί χάρη στην επιτυχία στην υλοποίηση του έργου Platform-Cell, το οποίο είχε τους ίδιους συμμετέχοντες στους οποίους συμμετέχει τώρα η ομάδα κλινικής επικύρωσης της FIMA. (Greek)
0 references
Das Quasar-Projekt zielt darauf ab, ein komplettes System für die Feststoffanalyse zu entwickeln. Das optische Quasar-System basiert auf einem innovativen Konzept (derzeit unter Patentanmeldung), das es ermöglicht, die Anzahl der FOV drastisch zu reduzieren, aber wiederum Informationen aus der gesamten Gewebeprobe zu erhalten. Die Quasar-Lösung beinhaltet die Verwendung eines Bildsystems (Histozytometer) mit geringer Vergrößerung, das es ermöglicht, größere FOV in jedem Bild zu erfassen, indem Linsen mit großer numerischer Blende verwendet werden, um das maximal mögliche Licht der Probe zu erfassen. Dieser Ansatz ermöglicht die Verwendung von hyperspektralen Daten, die die phänotypische Empfindlichkeit der Analysen erhöhen. Der letztendliche Zweck des vorgeschlagenen Projekts besteht nicht darin, ein Gerät für die Forschung zu implementieren, sondern ein vollständiges standardisiertes System in einer spezifischen klinischen Anwendung mit hoher Inzidenz und Mortalität wie Lungenkrebs zu entwickeln und zu validieren. Das Quasar-System wird einen Probenpräparator (Gewebefarbstoff mit Fluoreszenzmarkern) umfassen, ein hyperspektrales Gewebeanalyse-Histozytometer mit Erfassungssoftware (einschließlich eines Kalibrier- und Qualitätskontrollmoduls), eine multiparametrische Datenanalysesoftware mit Bildgebungs- und automatischen Analysewerkzeugen sowie Antikörper- und Fluorchrom-Panels für Diagnose, Prognose und Bewertung der Angemessenheit von Patienten, die mit Lungenkrebs-Immuntherapien behandelt werden (Kompanionsdiagnose). Die im Quasar zu implementierende Technologie basiert auf den Entwicklungen des Platform-Cell-Projekts (Projekt, das in der Challenges-Collaboration 2015 gefördert wurde), dessen Hauptziel es war, ein Bildzytometer für die isolierte Zellanalyse (peripheres Blut mit Antikörpern und Fluorchromen markiert) mit hoher Empfindlichkeit zu entwickeln, vergleichbar mit herkömmlichen Durchflusszytometern. Die vielversprechenden Ergebnisse, die im Rahmen des Platform-Cell-Projekts bei Bluttests erzielt wurden, haben zusammen mit den derzeitigen Einschränkungen der verfügbaren Techniken für die Festgewebeanalyse zur Entwicklung des Quasar-Projekts geführt, bei dem das Platform-Cell-Konzept verwendet wird, das an die Anforderungen der Analyse von Festgewebebiopsien, insbesondere der Lunge, angepasst ist. Das Quasar-Konsortium wird von Cytognos als Industriepartner, der Rey Juan Carlos University of Madrid (URJC) durch die Elektromechanik-Gruppe und der Entwicklungsgruppe von Bildanalysealgorithmen und der Foundation for Applied Clinical Research (FIMA) gebildet, die sich mit der Gruppe für optische Anwendungen und der klinischen Validierungsgruppe beteiligen wird. Es gibt große Synergien und eine hohe Komplementarität zwischen den verschiedenen Partnern dank des Erfolgs bei der Umsetzung des Platform-Cell-Projekts, das dieselben Teilnehmer hatte, denen die klinische Validierungsgruppe FIMA beigetreten ist. (German)
0 references
Cílem projektu Quasar je vyvinout kompletní systém pro analýzu pevných tkání. Optický systém Quasar je založen na inovativním konceptu (v současné době pod patentovou přihláškou), který umožňuje drasticky snížit počet FOV, ale naopak dokáže získat informace z kompletního vzorku tkáně. Řešení Quasar zahrnuje použití obrazového systému (histocytometr) s nízkým zvětšením, který umožňuje zachytit větší FOV na každém snímku pomocí čoček s velkou numerickou clonou pro zachycení maximálního možného světla vzorku. Tento přístup umožňuje použití hyperspektrálních dat, které zvyšují fenotypovou citlivost analýz. Konečným účelem navrhovaného projektu není implementace prostředku pro použití ve výzkumu, ale vytvoření a validace kompletního standardizovaného systému v konkrétní klinické aplikaci s vysokou incidencí a úmrtností, jako je rakovina plic. Systém Quasar bude zahrnovat automatizovaný preparátor vzorku (tkáňové barvivo s fluorescenčními markery), histocytometr hyperspektrální tkáňové analýzy s akvizičním softwarem (včetně kalibračního a kontrolního modulu), multiparametrický software pro analýzu dat s zobrazovacími a automatickými analytickými nástroji a protilátkové a fluorochromové panely pro diagnostiku, prognózu a hodnocení adekvátnosti pacientů léčených imunoterapií rakoviny plic (společenská diagnóza). Technologie, která má být implementována v Quasaru, je založena na vývoji projektu Platform-Cell (projekt financovaný ve výzvě Challenges-Collaboration 2015), jehož hlavním cílem bylo vyvinout obrazový cytometr pro analýzu izolovaných buněk (periferní krev označená protilátkami a fluorochromy) s vysokou citlivostí, srovnatelnou s konvenčními průtokovými cytometry. Slibné výsledky projektu Platform-Cell v oblasti krevních testů spolu se současnými omezeními dostupných technik pro analýzu pevných tkání vedly k rozvoji projektu Quasar, který bude využívat koncept Platform-Cell přizpůsobený požadavkům analýzy biopsií pevných tkání, konkrétně plic. Konsorcium Quasar vytvoří společnost Cytognos jako průmyslový partner, Univerzita Rey Juan Carlos v Madridu (URJC) prostřednictvím skupiny elektromechaniky a vývojové skupiny algoritmů analýzy obrazu a Nadace pro aplikovaný klinický výzkum (FIMA), která se bude podílet na skupině optických aplikací a klinické validační skupině. Existují velké synergie a vysoká míra doplňkovosti mezi různými partnery, která již prokázala úspěch při provádění projektu Platform-Cell, který měl stejné účastníky, ke kterým se nyní připojila skupina pro klinickou validaci FIMA. (Czech)
0 references
Tá sé mar aidhm ag an tionscadal Quasar córas iomlán a fhorbairt chun anailís a dhéanamh ar fhíochán soladach. Tá an córas optúil Quasar bunaithe ar choincheap nuálach (faoi láthair faoi iarratas ar phaitinn) a ligeann líon na FOV a laghdú go suntasach, ach bainistíonn sé faisnéis a fháil ón sampla fíocháin iomlán. Is éard atá i gceist leis an tuaslagán Quasar córas íomhánna (histocytometer) d’fhormhéadú íseal a úsáid a fhágann gur féidir FOV níos mó a ghabháil i ngach íomhá, ag úsáid lionsaí a bhfuil cró uimhriúil mór acu chun an tsolas is mó is féidir a fháil ón sampla. Leis an gcur chuige seo is féidir úsáid a bhaint as sonraí hipearspeictreacha a mhéadaíonn íogaireacht fheinitíopach na n-anailísí. Is é cuspóir deiridh an tionscadail atá beartaithe gléas a chur chun feidhme lena úsáid i dtaighde, ach córas caighdeánaithe iomlán a fhorbairt agus a bhailíochtú i bhfeidhmchlár cliniciúil sonrach, ina bhfuil ardmhinicíocht agus básmhaireacht amhail ailse scamhóg. Áireofar leis an gcóras Quasar ullmhóir samplach (lí fíocháin le marcóirí fluaraiseachta) uathoibrithe, anailís fíochán hipearspeictreach histo-cytometer le bogearraí fála (lena n-áirítear modúl calabrúcháin agus rialaithe cáilíochta), bogearraí anailíse sonraí multiparametric le huirlisí íomháithe agus anailíse uathoibríocha, agus painéil antasubstainte agus fluarascópacha chun diagnóis, prognóis agus meastóireacht ar leordhóthanacht othar a chóireáil le himdhíonacht ailse scamhóg (dhiagnóis choimhdeach). Tá an teicneolaíocht atá le cur chun feidhme sa Quasar bunaithe ar fhorbairtí a rinneadh sa tionscadal Platform-Cell (Tionscadal arna mhaoiniú sa ghlao ar Dhúshláin-Comhoibriú 2015), a raibh sé mar phríomhchuspóir aige cítiméadar íomhá a fhorbairt le haghaidh anailíse cille scoite (fuil fhorimeallach marcáilte le hantasubstaintí agus fluaracróim) le híogaireacht ard, atá inchomparáide leis an íogaireacht a bhaineann le cítiméadair gnáthshreabhadh. Mar thoradh ar na torthaí a bhfuil gealladh fúthu a fuarthas sa tionscadal Ardán-Cell i dtástálacha fola, mar aon le teorainneacha reatha na dteicnící atá ar fáil le haghaidh anailíse fíocháin soladacha, tá forbairt an tionscadail Quasar ina chúis le forbairt an tionscadail Quasar a úsáidfidh coincheap an Ardáin-Cell atá curtha in oiriúint do riachtanais na hanailíse ar bhithphíosaí fíochán soladacha, scamhóg go sonrach. Cruthóidh Cytognos cuibhreannas Quasar mar chomhpháirtí tionsclaíoch, Ollscoil Rey Juan Carlos Maidrid (URJC) tríd an ngrúpa leictrimheicniúla agus an grúpa forbartha algartam anailíse íomhá, agus an Fhondúireacht um Thaighde Cliniciúil Feidhmeach (FIMA) a ghlacfaidh páirt leis an ngrúpa iarratas optúil agus leis an ngrúpa bailíochtaithe cliniciúil. Tá sineirgí móra agus leibhéal ard comhlántachta idir na comhpháirtithe éagsúla atá léirithe cheana féin a bhuí leis an rath a bhí ar chur chun feidhme an tionscadail Ardán-Cell a raibh na rannpháirtithe céanna acu agus a bhfuil grúpa bailíochtaithe cliniciúil FIMA páirteach ann anois. (Irish)
0 references
A Quasar projekt célja a szilárd szövetek elemzésére szolgáló teljes rendszer kifejlesztése. A Quasar optikai rendszer egy (jelenleg szabadalmi bejelentés alatt álló) innovatív koncepción alapul, amely lehetővé teszi a FOV számának drasztikus csökkentését, de a teljes szövetmintából is képes információkat szerezni. A Quasar megoldás magában foglalja egy kis nagyítású képrendszer (histocytometer) használatát, amely lehetővé teszi, hogy nagyobb FOV-ot rögzítsen minden képben, nagy numerikus rekesznyílású objektívekkel a minta lehető legnagyobb fényének rögzítésére. Ez a megközelítés lehetővé teszi az elemzések fenotípusos érzékenységét fokozó hiperspektrális adatok használatát. A javasolt projekt végső célja nem egy kutatási célú eszköz bevezetése, hanem egy teljes, szabványosított rendszer kifejlesztése és validálása egy adott klinikai alkalmazásban, magas előfordulási gyakorisággal és mortalitással, mint például a tüdőrák. A Quasar rendszer magában foglal egy automatizált mintaelőkészítőt (fluoreszcenciás markerekű szövetfesték), egy hiperspektrális szövetelemzést akvizíciós szoftverrel (beleértve a kalibrációs és minőségellenőrző modult), többparametrikus adatelemző szoftvert képalkotó és automatikus elemző eszközökkel, valamint antitesteket és fluorokróm paneleket a tüdőrák immunterápiáival kezelendő betegek megfelelőségének diagnosztizálására, prognózisára és értékelésére (kísérleti diagnózis). A Quasarban megvalósítandó technológia a Platform-Cell projekt (a Challenges-Collaboration 2015 felhívás keretében finanszírozott projekt) fejlesztésein alapul, amelynek fő célja az volt, hogy a hagyományos áramlási citométerekhez hasonló, nagy érzékenységű, izolált sejtanalízishez (ellenanyagokkal és fluorkrómokkal jelölt perifériás vér) készítsen citométert. A Platform-Cell projekt vérvizsgálatok során elért ígéretes eredményei, valamint a szilárd szövetek elemzésére rendelkezésre álló technikák jelenlegi korlátai a Quasar projekt kifejlesztéséhez vezettek, amely a Platform-Cell koncepciót fogja alkalmazni a szilárd szöveti biopsziák, pontosabban a tüdő elemzésének követelményeihez igazítva. A Quasar konzorciumot a Cytognos mint ipari partner, a madridi Rey Juan Carlos Egyetem (URJC) az elektromechanikai csoporton és a képelemző algoritmusok fejlesztési csoportján keresztül, valamint az Alkalmazott Klinikai Kutatásért Alapítvány (FIMA) alkotja, amely részt vesz az optikai alkalmazások csoportjában és a klinikai validálási csoportban. A különböző partnerek között jelentős szinergiák és magas fokú komplementaritás tapasztalható, köszönhetően a Platform-Cell projekt sikeres megvalósításának, amelyhez ugyanazok a résztvevők tartoztak, akikhez a FIMA klinikai validáló csoportja csatlakozik. (Hungarian)
0 references
Cieľom projektu Quasar je vyvinúť kompletný systém pre analýzu pevných tkanív. Optický systém Quasar je založený na inovatívnej koncepcii (v súčasnosti pod patentovou aplikáciou), ktorá umožňuje drasticky znížiť počet FOV, ale na druhej strane dokáže získať informácie z kompletnej vzorky tkaniva. Riešenie Quasar zahŕňa použitie obrazového systému (histocytometer) s nízkym zväčšením, ktorý umožňuje zachytiť väčšie FOV na každom obrázku pomocou šošoviek s veľkou číselnou clonou na zachytenie maximálneho možného svetla vzorky. Tento prístup umožňuje použitie hyperspektrálnych údajov zvyšujúcich fenotypovú citlivosť analýz. Konečným účelom navrhovaného projektu nie je implementovať zariadenie na použitie vo výskume, ale vyvinúť a validovať kompletný štandardizovaný systém v konkrétnej klinickej aplikácii s vysokou incidenciou a úmrtnosťou, ako je rakovina pľúc. Systém Quasar bude zahŕňať prípravu vzoriek (farbivo tkaniva s fluorescenčnými markermi) automatizovaný, hyperspektrálny tkanivový histocytometometer s akvizičným softvérom (vrátane modulu kalibrácie a kontroly kvality), multiparametrický softvér na analýzu údajov s zobrazovacími a automatickými analytickými nástrojmi a panely protilátok a fluorochrómu na diagnostiku, prognózu a hodnotenie primeranosti pacientov, ktoré sa majú liečiť imunoterapiami rakoviny pľúc (diagnostika spoločnosti). Technológia, ktorá sa má zaviesť v Quasar, je založená na vývoji projektu Platform-Cell (projekt financovaný vo výzve Challenges-Collaboration 2015), ktorého hlavným cieľom bolo vyvinúť obrazový cytometer pre izolovanú bunkovú analýzu (periférna krv označená protilátkami a fluorochrómmi) s vysokou citlivosťou porovnateľnou s bežnými prietokovými cytometrami. Sľubné výsledky získané v rámci projektu Platform-Cell v krvných testoch spolu so súčasnými obmedzeniami dostupných techník na analýzu pevných tkanív viedli k vývoju projektu Quasar, ktorý bude využívať koncepciu Platform-Cell prispôsobenú požiadavkám analýzy biopsií pevných tkanív, konkrétne pľúc. Konzorcium Quasar bude tvoriť Cytognos ako priemyselný partner, Univerzita Rey Juan Carlos v Madride (URJC) prostredníctvom skupiny elektromechaniky a vývojovej skupiny algoritmov obrazovej analýzy a Nadácie pre aplikovaný klinický výskum (FIMA), ktorá sa zúčastní skupiny optických aplikácií a skupiny klinickej validácie. Existujú veľké synergie a vysoká miera komplementárnosti medzi rôznymi partnermi už preukázaná vďaka úspechu pri realizácii projektu Platform-Cell, ktorý mal tých istých účastníkov, ku ktorým sa v súčasnosti pripája skupina pre klinickú validáciu FIMA. (Slovak)
0 references
Quasar projekta mērķis ir izstrādāt pilnīgu sistēmu cieto audu analīzei. Quasar optiskā sistēma ir balstīta uz inovatīvu koncepciju (pašlaik saskaņā ar patenta pieteikumu), kas ļauj krasi samazināt FOV skaitu, bet savukārt izdodas iegūt informāciju no visa audu parauga. Quasar risinājums ietver zema palielinājuma attēla sistēmas (histocitometra) izmantošanu, kas ļauj katrā attēlā uzņemt lielāku FOV, izmantojot objektīvus ar lielu skaitlisku atvērumu, lai uztvertu parauga maksimālo iespējamo gaismu. Šī pieeja ļauj izmantot hiperspektrālos datus, kas palielina analīžu fenotipisko jutību. Ierosinātā projekta galīgais mērķis nav ieviest ierīci, kas izmantojama pētniecībā, bet gan izstrādāt un apstiprināt pilnīgu standartizētu sistēmu konkrētā klīniskā pielietojumā ar augstu saslimstību un mirstību, piemēram, plaušu vēzi. Quasar sistēmā būs automatizēts paraugu sagatavotājs (audu krāsviela ar fluorescences marķieriem), hiperspektrālās audu analīzes histocitometrs ar iegādes programmatūru (tostarp kalibrēšanas un kvalitātes kontroles modulis), multiparametrisko datu analīzes programmatūra ar attēlveidošanas un automātiskās analīzes rīkiem, kā arī antivielu un fluorohroma paneļi diagnostikai, prognozei un pacientu piemērotības novērtēšanai, lai ārstētu ar plaušu vēža imūnterapiju (komponentu diagnostika). Quasar īstenojamās tehnoloģijas pamatā ir attīstība, kas veikta Platforma-Cell projektā (Projekts, ko finansē 2015. gada konkursa “Izaicinājumi-Sadarbība”) ietvaros, kura galvenais mērķis bija izstrādāt attēlu citometru izolētu šūnu analīzei (perifērās asinis, kas apzīmētas ar antivielām un fluorohromiem) ar augstu jutību, kas pielīdzināma parastajiem plūsmas citometriem. Daudzsološie rezultāti, kas iegūti projektā Platform-Cell asins analīzē, kā arī pašreizējie ierobežojumi metodēm, kas pieejamas cieto audu analīzei, ir ļāvuši izstrādāt Quasar projektu, kurā tiks izmantota Platform-Cell koncepcija, kas pielāgota cieto audu biopsiju, konkrētāk, plaušu, analīzes prasībām. Quasar konsorciju veidos Cytognos kā rūpniecības partneris, Rey Juan Carlos University of Madrid (URJC), izmantojot elektromehānikas grupu un attēlu analīzes algoritmu izstrādes grupu, un Lietišķās klīniskās pētniecības fonds (FIMA), kas piedalīsies optisko lietojumprogrammu grupā un klīniskās validācijas grupā. Pastāv liela sinerģija un augsta līmeņa papildināmība starp dažādiem partneriem, kas jau ir pierādīti, pateicoties panākumiem platformas-Cell projekta īstenošanā, kurā piedalījās tie paši dalībnieki, kuriem tagad pievienojas FIMA klīniskās validācijas grupa. (Latvian)
0 references
Quasar-projektet syftar till att utveckla ett komplett system för solid vävnadsanalys. Quasars optiska system bygger på ett innovativt koncept (för närvarande under patentansökan) som gör det möjligt att drastiskt minska antalet FOV, men i sin tur lyckas få information från hela vävnadsprovet. Quasar-lösningen innebär användning av ett bildsystem (histocytometer) med låg förstoring som gör det möjligt att fånga större FOV i varje bild, med hjälp av linser med stor numerisk bländare för att fånga det maximala möjliga ljuset av provet. Detta tillvägagångssätt möjliggör användning av hyperspektral data som ökar den fenotypiska känsligheten hos analyserna. Det slutliga syftet med det föreslagna projektet är inte att implementera en produkt för användning i forskning, utan att utveckla och validera ett komplett standardiserat system i en specifik klinisk tillämpning, med hög incidens och dödlighet såsom lungcancer. Quasar-systemet kommer att omfatta en provberedare (vävnadsfärg med fluorescensmarkörer) automatiserad, en hyperspektral vävnadsanalys histo-cytometer med förvärvsprogram (inklusive en kalibrerings- och kvalitetskontrollmodul), multiparametrisk dataanalysprogramvara med avbildning och automatiska analysverktyg samt antikropps- och fluorokrompaneler för diagnos, prognos och utvärdering av patientens tillräcklighet som ska behandlas med immunterapi med lungcancer (kompaniondiagnos). Tekniken som ska implementeras i Quasar bygger på utvecklingen i Platform-Cell-projektet (projekt finansierat i utlysningen Challenges-Collaboration 2015), vars huvudsyfte var att utveckla en bildcytometer för isolerad cellanalys (perifert blod märkt med antikroppar och fluorokromer) med hög känslighet, jämförbar med den hos konventionella flödescytmetrar. De lovande resultat som erhållits i Platform-Cell-projektet i blodprover, tillsammans med de nuvarande begränsningarna av de tekniker som finns tillgängliga för analys av fast vävnad, har lett till utvecklingen av Quasar-projektet som kommer att använda Platform-Cell-konceptet anpassat till kraven för analys av solid vävnadsbiopsier, mer specifikt lunga. Quasar-konsortiet kommer att bildas av Cytognos som en industriell partner, Rey Juan Carlos University of Madrid (URJC) genom elektromekanikgruppen och utvecklingsgruppen för bildanalysalgoritmer, och Foundation for Applied Clinical Research (FIMA) som kommer att delta med den optiska applikationsgruppen och den kliniska valideringsgruppen. Det finns stora synergier och en hög grad av komplementaritet mellan de olika partnerna redan visat tack vare framgången i genomförandet av Platform-Cell-projektet som hade samma deltagare som FIMA:s kliniska valideringsgrupp nu ansluter sig till. (Swedish)
0 references
„Quasar“ projektu siekiama sukurti išsamią kietųjų audinių analizės sistemą. „Quasar“ optinė sistema yra pagrįsta naujoviška koncepcija (šiuo metu patentinė paraiška), kuri leidžia drastiškai sumažinti FOV skaičių, tačiau savo ruožtu sugeba gauti informaciją iš viso audinių mėginio. „Quasar“ sprendimas apima mažo padidinimo vaizdo sistemą (histocitometrą), kuri leidžia užfiksuoti didesnį FOV kiekviename atvaizde, naudojant lęšius su didele skaitine diafragma, kad būtų užfiksuota didžiausia įmanoma mėginio šviesa. Šis metodas leidžia naudoti hiperspektrinius duomenis, didinančius analizės fenotipinį jautrumą. Galutinis siūlomo projekto tikslas yra ne įdiegti priemonę, skirtą naudoti moksliniams tyrimams, o sukurti ir patvirtinti išsamią standartizuotą sistemą konkrečioje klinikinėje praktikoje, kurioje didelis paplitimas ir mirtingumas, pvz., plaučių vėžys. Quasar sistemą sudarys mėginių ruošėjas (audinių dažai su fluorescencijos žymenimis) automatizuotas, hiperspektrinės audinių analizės histocitometro su įsigijimo programine įranga (įskaitant kalibravimo ir kokybės kontrolės modulį), multiparametrinės duomenų analizės programinė įranga su vizualizavimo ir automatinės analizės įrankiais ir antikūnų bei fluorochromo plokštės, skirtos diagnozuoti, prognozuoti ir įvertinti paciento tinkamumą gydyti plaučių vėžio imunoterapija (kompanijos diagnozė). Technologija, kuri turi būti įdiegta Quasar, yra pagrįsta pokyčiais, atliktais vykdant Platform-Cell projektą (projektas, finansuotas pagal 2015 m. kvietimą teikti pasiūlymus „Iššūkiai-Collaboration“), kurio pagrindinis tikslas buvo sukurti vaizdo citometrą izoliuotų ląstelių analizei (periferinis kraujas pažymėtas antikūnais ir fluorochromais) su dideliu jautrumu, panašiu į įprastų srauto citometrų. Dėl perspektyvių rezultatų, gautų vykdant projektą „Plat-Cell“ atliekant kraujo tyrimus, kartu su dabartiniais kietojo audinio analizės metodų apribojimais, buvo sukurtas Quasar projektas, kuriame bus naudojama platformos-Cell koncepcija, pritaikyta prie kietojo audinio biopsijos, tiksliau plaučių, analizės reikalavimų. Konsorciumą „Quasar“ sudarys „Cytognos“ kaip pramonės partneris, Madrido Rey Juan Carloso universitetas (URJC) per elektromechanikos grupę ir vaizdo analizės algoritmų kūrimo grupę, ir Taikomųjų klinikinių tyrimų fondas (FIMA), kuris dalyvaus optinių programų grupėje ir klinikinio patvirtinimo grupėje. Dėl sėkmingo projekto „Plat-Cell“, kuriame dalyvavo tie patys dalyviai, prie kurių prisijungė FIMA klinikinio patvirtinimo grupė, įgyvendinimo sėkmė jau parodė didelę įvairių partnerių sinergiją ir didelį papildomumą. (Lithuanian)
0 references
Quasar-hankkeen tavoitteena on kehittää täydellinen järjestelmä kiinteiden kudosten analysointia varten. Quasar optinen järjestelmä perustuu innovatiiviseen konseptiin (tällä hetkellä patenttihakemuksessa), jonka avulla voidaan vähentää merkittävästi FOV: n määrää, mutta onnistuu puolestaan saamaan tietoja koko kudosnäytteestä. Quasar-ratkaisussa käytetään pienikokoista kuvajärjestelmää (histosytometriä), joka mahdollistaa suuremman FOV:n tallentamisen jokaiseen kuvaan käyttäen suurilla numeerisilla aukoilla varustettuja linssejä näytteen suurimman mahdollisen valon taltioimiseksi. Tämä lähestymistapa mahdollistaa hyperspektritietojen käytön, mikä lisää analyysien fenotyyppistä herkkyyttä. Ehdotetun hankkeen perimmäisenä tarkoituksena ei ole ottaa käyttöön tutkimuskäyttöön tarkoitettua laitetta vaan kehittää ja validoida täydellinen standardoitu järjestelmä tietyssä kliinisessä sovelluksessa, jossa esiintyvyys ja kuolleisuus ovat korkeat, kuten keuhkosyöpä. Quasar-järjestelmään kuuluu automatisoitu näytteenvalmistaja (kudosväriaine fluoresenssimarkkereilla), hyperspektrinen kudosanalyysi histosytometri, jossa on hankintaohjelmisto (mukaan lukien kalibrointi- ja laadunvalvontamoduuli), moniparametrinen data-analyysiohjelmisto kuvantamis- ja automaattisen analyysityökalun avulla sekä vasta-aine- ja fluorokromipaneelit, joiden avulla voidaan diagnosoida, ennustaa ja arvioida potilaiden riittävyyttä keuhkosyöpäimmunoterapeuttisilla hoidoilla (lisädiagnoosi). Quasarissa toteutettava teknologia perustuu Platform-Cell-projektiin (Challenges-Collaboration 2015 -haussa rahoitettu hanke), jonka päätavoitteena oli kehittää kuvasytometri eristettyä soluanalyysiä varten (perifeerinen veri, joka on merkitty vasta-aineilla ja fluorochromeilla) ja jonka herkkyys on verrattavissa tavanomaisiin virtaussytometreihin. Platform-Cell-hankkeessa verikokeissa saadut lupaavat tulokset sekä kiinteiden kudosten analysointiin käytettävissä olevien tekniikoiden nykyiset rajoitukset ovat johtaneet Quasar-hankkeen kehittämiseen, jossa käytetään Platform-Cell-konseptia, joka on mukautettu kiinteiden kudosbiopsioiden, erityisesti keuhkojen, analyysin vaatimuksiin. Quasar-konsortion muodostaa Cytognos teolliseksi yhteistyökumppaniksi, Rey Juan Carlos University of Madrid (URJC) sähkömekaniikkaryhmän ja kuva-analyysialgoritmien kehitysryhmän sekä soveltavan kliinisen tutkimuksen säätiön (FIMA) kautta, joka osallistuu optisten sovellusten ryhmään ja kliiniseen validointiryhmään. Eri kumppanien välillä on suuria synergioita ja suurta täydentävyyttä, mikä on jo osoittanut, että Platform-Cell-projektissa on onnistuttu toteuttamaan samoja osallistujia, joihin FIMA:n kliininen validointiryhmä on nyt liittynyt. (Finnish)
0 references
Le projet Quasar vise à développer un système complet d’analyse des tissus solides. Le système optique Quasar est basé sur un concept innovant (actuellement soumis à une demande de brevet) qui permet de réduire drastiquement le nombre de FOV, mais parvient à son tour à obtenir des informations à partir de l’échantillon tissulaire complet. La solution Quasar implique l’utilisation d’un système d’image (histocytomètre) de faible grossissement qui permet de capturer plus de FOV dans chaque image, en utilisant des lentilles à grande ouverture numérique pour capturer le maximum de lumière possible de l’échantillon. Cette approche permet l’utilisation de données hyperspectrales augmentant la sensibilité phénotypique des analyses. Le but ultime du projet proposé n’est pas de mettre en œuvre un dispositif pour la recherche, mais de développer et de valider un système normalisé complet dans une application clinique spécifique, avec une incidence et une mortalité élevées telles que le cancer du poumon. Le système Quasar comprendra un préparateur d’échantillons (tissue colorant avec marqueurs de fluorescence) automatisé, un histocytomètre d’analyse des tissus hyperspectral avec un logiciel d’acquisition (y compris un module d’étalonnage et de contrôle de la qualité), un logiciel d’analyse de données multiparamétriques avec des outils d’imagerie et d’analyse automatique, ainsi que des panneaux d’anticorps et de fluorochromes pour le diagnostic, le pronostic et l’évaluation de l’adéquation du patient à traiter avec des immunothérapies du cancer du poumon (diagnostic compagnon). La technologie à mettre en œuvre dans le Quasar est basée sur les développements réalisés dans le cadre du projet Platform-Cell (Projet financé dans l’appel Challenges-Collaboration 2015), dont l’objectif principal était de développer un cytomètre d’image pour l’analyse cellulaire isolée (sang périphérique marqué d’anticorps et de fluorochromes) à haute sensibilité, comparable à celle des cytomètres à flux conventionnels. Les résultats prometteurs obtenus dans le cadre du projet Platform-Cell dans les tests sanguins, ainsi que les limites actuelles des techniques disponibles pour l’analyse des tissus solides, ont conduit au développement du projet Quasar qui utilisera le concept Platform-Cell adapté aux exigences de l’analyse des biopsies des tissus solides, plus particulièrement des poumons. Le consortium Quasar sera formé par Cytognos en tant que partenaire industriel, l’Université Rey Juan Carlos de Madrid (URJC) à travers le groupe électromécanique et le groupe de développement des algorithmes d’analyse d’images, et la Fondation pour la recherche clinique appliquée (FIMA) qui participera avec le groupe d’applications optiques et le groupe de validation clinique. Il existe de grandes synergies et un haut degré de complémentarité entre les différents partenaires déjà démontrés grâce au succès de la mise en œuvre du projet Platform-Cell qui a eu les mêmes participants que le groupe de validation clinique FIMA. (French)
0 references
Il progetto Quasar mira a sviluppare un sistema completo per l'analisi dei tessuti solidi. Il sistema ottico Quasar si basa su un concetto innovativo (attualmente sotto domanda di brevetto) che permette di ridurre drasticamente il numero di FOV, ma a sua volta riesce ad ottenere informazioni dal campione di tessuto completo. La soluzione Quasar prevede l'utilizzo di un sistema di immagini (istocitometro) di basso ingrandimento che permette di catturare un maggiore FOV in ogni immagine, utilizzando lenti con grande apertura numerica per catturare la massima luce possibile del campione. Questo approccio consente l'uso di dati iperspettrali aumentando la sensibilità fenotipica delle analisi. Lo scopo finale del progetto proposto non è quello di implementare un dispositivo per l'uso nella ricerca, ma di sviluppare e convalidare un sistema standardizzato completo in una specifica applicazione clinica, con alta incidenza e mortalità come il cancro ai polmoni. Il sistema Quasar includerà un preparatore di campioni (colorante tessutale con marcatori di fluorescenza) automatizzato, un istocito-citometro di analisi del tessuto iperspettrale con software di acquisizione (compreso un modulo di calibrazione e controllo della qualità), software di analisi dei dati multiparametrico con strumenti di imaging e analisi automatica, e pannelli anticorpali e fluorocromatici per la diagnosi, la prognosi e la valutazione dell'adeguatezza del paziente da trattare con immunoterapie tumorali polmonari (diagnosi del gruppo). La tecnologia da implementare nel Quasar si basa sugli sviluppi realizzati nel progetto Platform-Cell (Progetto finanziato nel bando Challenges-Collaboration 2015), il cui obiettivo principale era quello di sviluppare un citometro immagine per l'analisi cellulare isolata (sangue periferico contrassegnato con anticorpi e fluorocromi) ad alta sensibilità, paragonabile a quella dei citometri a flusso convenzionali. I promettenti risultati ottenuti nel progetto Platform-Cell negli esami del sangue, insieme alle attuali limitazioni delle tecniche disponibili per l'analisi dei tessuti solidi, hanno portato allo sviluppo del progetto Quasar che utilizzerà il concetto Platform-Cell adattato alle esigenze dell'analisi delle biopsie dei tessuti solidi, in particolare del polmone. Il consorzio Quasar sarà formato da Cytognos come partner industriale, l'Università Rey Juan Carlos di Madrid (URJC) attraverso il gruppo elettromeccanico e il gruppo di sviluppo di algoritmi di analisi delle immagini, e la Fondazione per la Ricerca Clinica Applicata (FIMA) che parteciperà con il gruppo di applicazioni ottiche e il gruppo di validazione clinica clinica. Ci sono grandi sinergie e un alto grado di complementarità tra i diversi partner già dimostrati grazie al successo nell'attuazione del progetto Platform-Cell che ha avuto gli stessi partecipanti a cui il gruppo di validazione clinica FIMA ora si unisce. (Italian)
0 references
Het Quasar-project heeft tot doel een compleet systeem voor analyse van vaste weefsels te ontwikkelen. Het Quasar optische systeem is gebaseerd op een innovatief concept (momenteel onder octrooiaanvraag) dat het mogelijk maakt om het aantal FOV drastisch te verminderen, maar op zijn beurt erin slaagt informatie uit het volledige weefselmonster te verkrijgen. De Quasar-oplossing omvat het gebruik van een beeldsysteem (histocytometer) van lage vergroting waarmee een grotere FOV in elk beeld kan worden vastgelegd, met behulp van lenzen met een groot numeriek diafragma om het maximaal mogelijke licht van het monster vast te leggen. Deze aanpak maakt het gebruik van hyperspectrale gegevens mogelijk waardoor de fenotypische gevoeligheid van de analyses toeneemt. Het uiteindelijke doel van het voorgestelde project is niet om een hulpmiddel voor gebruik in onderzoek te implementeren, maar om een volledig gestandaardiseerd systeem te ontwikkelen en te valideren in een specifieke klinische toepassing, met hoge incidentie en sterfte zoals longkanker. Het Quasar-systeem zal een geautomatiseerde monstervoorbereider (weefselkleurstof met fluorescentiemarkers) omvatten, een histo-cytometer voor hyperspectrale weefselanalyse met acquisitiesoftware (met inbegrip van een kalibratie- en kwaliteitscontrolemodule), multiparametrische gegevensanalysesoftware met beeldvorming en automatische analysetools, en antilichamen en fluorochroompanelen voor diagnose, prognose en evaluatie van patiëntgeschiktheid om te worden behandeld met immunotherapieën voor longkanker (companiondiagnose). De technologie die in de Quasar moet worden geïmplementeerd, is gebaseerd op ontwikkelingen in het Platform-Cell-project (project gefinancierd in de oproep Challenges-Collaboration 2015), waarvan de belangrijkste doelstelling was om een beeldcytometer te ontwikkelen voor geïsoleerde celanalyse (perifeer bloed gemarkeerd met antilichamen en fluorochromen) met een hoge gevoeligheid, vergelijkbaar met die van conventionele flowcytometers. De veelbelovende resultaten in het Platform-Cell-project in bloedonderzoek, samen met de huidige beperkingen van de technieken die beschikbaar zijn voor de analyse van vaste weefsels, hebben geleid tot de ontwikkeling van het Quasar-project dat gebruik zal maken van het Platform-Cell-concept dat is aangepast aan de vereisten van de analyse van vaste weefselbiopieën, meer bepaald longen. Het Quasar-consortium wordt gevormd door Cytognos als industriële partner, de Rey Juan Carlos University of Madrid (URJC) via de elektromechanicagroep en de ontwikkelingsgroep van beeldanalyse-algoritmen, en de Foundation for Applied Clinical Research (FIMA) die zal deelnemen met de groep optische toepassingen en de klinische validatiegroep. Er zijn grote synergieën en een hoge mate van complementariteit tussen de verschillende partners is al aangetoond dankzij het succes in de uitvoering van het Platform-Cell-project dat dezelfde deelnemers had waartoe de FIMA klinische validatiegroep zich nu aansluit. (Dutch)
0 references
Projekt Quasar je namenjen razvoju celovitega sistema za analizo trdnih tkiv. Optični sistem Quasar temelji na inovativnem konceptu (trenutno v patentni prijavi), ki omogoča drastično zmanjšanje števila FOV, vendar pa lahko pridobi informacije iz celotnega vzorca tkiva. Quasarjeva rešitev vključuje uporabo slikovnega sistema (histocitometra) nizke povečave, ki omogoča zajemanje večjega FOV na vsaki sliki, z uporabo objektivov z veliko številčno zaslonko za zajemanje največje možne svetlobe vzorca. Ta pristop omogoča uporabo hiperspektralnih podatkov, ki povečujejo fenotipsko občutljivost analiz. Končni namen predlaganega projekta ni uvedba pripomočka za uporabo v raziskavah, temveč razvoj in potrditev celovitega standardiziranega sistema v posebni klinični aplikaciji z visoko incidenco in umrljivostjo, kot je pljučni rak. Sistem Quasar bo vključeval avtomat za pripravo vzorcev (barvanje tkiv s fluorescenčnimi označevalci), histocitometer hiperspektralnega tkiva s programsko opremo za pridobivanje (vključno z modulom za kalibracijo in nadzor kakovosti), multiparametrično programsko opremo za analizo podatkov s slikovnimi in avtomatskimi orodji za analizo ter antitelo in fluorokromske plošče za diagnozo, prognozo in oceno ustreznosti bolnikov za zdravljenje imunoterapije pljučnega raka (diagnostika spremljevalca). Tehnologija, ki se bo izvajala v Quasarju, temelji na razvoju projekta Platform-Cell (projekt, financiran v razpisu Challenges-Collaboration 2015), katerega glavni cilj je bil razviti slikovni citometer za izolirano celično analizo (periferna kri, označena s protitelesi in fluorokromi) z visoko občutljivostjo, primerljivo z občutljivostjo konvencionalnih citometrov pretoka. Obetavni rezultati projekta Platform-Cell na področju krvnih preiskav so skupaj s trenutnimi omejitvami tehnik, ki so na voljo za analizo trdnih tkiv, privedli do razvoja projekta Quasar, ki bo uporabljal koncept Platform-Cell, prilagojen zahtevam analize biopsij trdnega tkiva, natančneje pljuč. Konzorcij Quasar bodo ustanovili Cytognos kot industrijski partner, Univerza Rey Juan Carlos v Madridu (URJC) prek skupine elektromehanike in razvojne skupine algoritmov za analizo slik ter Fundacija za uporabne klinične raziskave (FIMA), ki bo sodelovala s skupino optičnih aplikacij in skupino za klinično validacijo. Obstajajo velike sinergije in visoka stopnja komplementarnosti med različnimi partnerji, ki so se že izkazali zaradi uspeha pri izvajanju projekta Platform-Cell, ki je imel iste udeležence, katerim se zdaj pridruži skupina za klinično validacijo FIMA. (Slovenian)
0 references
Proiectul Quasar își propune să dezvolte un sistem complet de analiză a țesuturilor solide. Sistemul optic Quasar se bazează pe un concept inovator (în prezent sub cerere de brevet) care permite reducerea drastică a numărului de FOV, dar, la rândul său, reușește să obțină informații din proba completă de țesut. Soluția Quasar implică utilizarea unui sistem de imagine (histocytometru) de mărire scăzută, care permite capturarea unui FOV mai mare în fiecare imagine, folosind obiective cu diafragmă numerică mare pentru a capta lumina maximă posibilă a eșantionului. Această abordare permite utilizarea datelor hiperspectrale crescând sensibilitatea fenotipică a analizelor. Scopul final al proiectului propus nu este de a implementa un dispozitiv destinat cercetării, ci de a dezvolta și valida un sistem complet standardizat într-o aplicație clinică specifică, cu o incidență și mortalitate ridicată, cum ar fi cancerul pulmonar. Sistemul Quasar va include un preparator de probe (colorant tisular cu markeri de fluorescență) automatizat, un histocitometru hiperspectral de analiză a țesuturilor cu software de achiziție (inclusiv un modul de calibrare și control al calității), software de analiză multiparametrică a datelor cu instrumente imagistice și de analiză automată și panouri de anticorpi și fluorocrom pentru diagnosticarea, prognosticul și evaluarea adecvării pacientului pentru a fi tratați cu imunoterapii împotriva cancerului pulmonar (diagnosticul însoțitor). Tehnologia care urmează să fie implementată în cadrul Quasar se bazează pe evoluțiile realizate în cadrul proiectului Platform-Cell (Proiect finanțat în cadrul apelului Challenges-Collaboration 2015), al cărui obiectiv principal a fost de a dezvolta un citometru de imagine pentru analiza celulară izolată (sânge periferic marcat cu anticorpi și fluorocromi) cu sensibilitate ridicată, comparabil cu cel al citometrelor de debit convenționale. Rezultatele promițătoare obținute în cadrul proiectului Platform-Cell în testele de sânge, împreună cu limitările actuale ale tehnicilor disponibile pentru analiza țesuturilor solide, au condus la dezvoltarea proiectului Quasar care va utiliza conceptul Platform-Cell adaptat cerințelor de analiză a biopsiilor țesutului solid, mai precis a plămânilor. Consorțiul Quasar va fi format de Cytognos ca partener industrial, Universitatea Rey Juan Carlos din Madrid (URJC) prin grupul electromecanic și grupul de dezvoltare a algoritmilor de analiză a imaginii și Fundația pentru Cercetare Clinică Aplicată (FIMA) care va participa cu grupul de aplicații optice și cu grupul de validare clinică. Există sinergii mari și un grad ridicat de complementaritate între diferiții parteneri deja demonstrat datorită succesului în punerea în aplicare a proiectului Platform-Cell, care a avut aceiași participanți cărora li se alătură acum grupul de validare clinică FIMA. (Romanian)
0 references
Móstoles
0 references
21 December 2023
0 references
Identifiers
RTC-2017-6218-1-P01
0 references