DESIGN OF INNOVATIVE BIOCIDES FROM THE ELUCIDATION OF THE MECHANISM OF OLIGOMERS WITH ANTIMICROBIAL PROPERTIES (Q3170046): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(Set a claim value: summary (P836): Neste projeto, propomos desenvolver uma estratégia para a conceção racional de oligómeros antimicrobianos, com base no entendimento do seu mecanismo de ação a nível de memória, a partir de uma abordagem sinergética in-sílica/in-vitro. A CHAVE PARA SUCEDER A ESTA ABORDAGEM É A APLICAÇÃO DE METODOLOGIAS DE EMERGÊNCIA: DINÂMICA MOLECULAR grosseira (CG-MD) e DM ligada com GPUS ao nexo que permitiria uma expansão sem precisões dos fenómenos mesoescalares...) |
(Changed label, description and/or aliases in pt) |
||
| label / pt | label / pt | ||
CONCEPÇÃO DE BIOCIDAS INOVADORAS PROVENIENTES DA ELUCIDAÇÃO DO MECANISMO DE OLIGÓMEROS COM PROPRIEDADES ANTIMICROBIANAS | |||
Latest revision as of 21:30, 10 October 2024
Project Q3170046 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | DESIGN OF INNOVATIVE BIOCIDES FROM THE ELUCIDATION OF THE MECHANISM OF OLIGOMERS WITH ANTIMICROBIAL PROPERTIES |
Project Q3170046 in Spain |
Statements
14,831.13 Euro
0 references
27,238.07 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
5 December 2016
0 references
31 December 2016
0 references
UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA
0 references
15872
0 references
EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS DESARROLLAR UNA ESTRATEGIA PARA EL DISEÑO RACIONAL DE OLIGOMEROS ANTIMICROBIANOS BASADO EN LA COMPRENSION DE SU MECANISMO DE ACCION A NIVEL DE LA MEMBRANA, DESDE UN ENFOQUE SINERGICO IN-SILICO/IN-VITRO. LA CLAVE PARA QUE ESTE ENFOQUE TENGA EXITO ES LA APLICACION DE METODOLOGIAS EMERGENTES: COARSE GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) Y MD ACELERADA CON GPUS AL NEXO QUE UNE AMBAS APROXIMACIONES, QUE PERMITIRA UNA EXPLORACION SIN PRECEDENTES DE LOS FENOMENOS A NIVEL DE MESO-ESCALA DE LAS MOLECULAS ANTIMICROBIANAS Y DE SU INTERACCION CON LAS MEMBRANAS._x000D_ UTILIZANDO ESTE ENFOQUE SE ESTUDIARAN LOS MECANISMOS DE ACCION DE PEPTIDOS ANTIMICROBIANOS (AMPS) Y MOLECULAS AUTO-ENSAMBLADAS "INTELIGENTES" (CICLOPEPTIDOS, MOLECULAS ORGANICAS, CICLODEXTRINAS, POLIMEROS, CLUSTERES ATOMICOS-AQCS, ETC) CON EL OBJETIVO FINAL DE OBTENER INFORMACION QUE PUEDA SER USADA PARA EL DISEÑO DE NUEVOS AGENTES ANTIBACTERIANOS MEJORADOS QUE REDUZCAN TANTO LA TOXICIDAD COMO LA APARICION DE RESISTENCIAS. SE INVESTIGARAN TRES GRANDES BLOQUES DE DIFERENTES MOLECULAS ANTIMICROBIANAS:_x000D_ EN EL PRIMER BLOQUE NOS CENTRAREMOS EN ENTIDADES FORMADORAS DE POROS TRANSMEMBRANA, COMO NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUESTOS POR CICLOPEPTIDOS. ESTUDIAREMOS SU MECANISMO DE INTERACCION CON LA MEMBRANA Y EL TRANSPORTE A TRAVES DE SUS CAVIDADES. SE DESARROLLARAN PARAMETROS CG DE ESTOS PEPTIDOS Y SE UTILIZARAN COMO NANOPOROS BIOMIMETICOS, MODELOS DE CANALES BIOLOGICOS, LO QUE AYUDARA AL DISEÑO DE NUEVAS TERAPIAS PARA CANALOPATIAS, ENFERMEDADES PROVOCADAS POR UN FUNCIONAMIENTO INCORRECTO DE DETERMINADO TIPO DE PROTEINAS. LLEVAREMOS A CABO UNA COMPARATIVA DE METODOS COMPUTACIONALES PARA LA OBTENCION DE CONSTANTES CINETICAS EN EL TRANSPORTE TRANSMEMBRANA DE IONES (BXD Y ABAD-SANSOM)._x000D_ EL SEGUNDO BLOQUE SE ENFOCA EN MOLECULAS ANTIMICROBIANAS CON MECANISMOS DISRUPTIVOS DE LA MEMBRANA, COMO LOS NANOTUBOS PEPTIDICOS, CICLODEXTRINAS O ENTIDADES POLIMERICAS. DESARROLLAREMOS UNA BASE DE DATOS A PARTIR DE SIMULACIONES SISTEMATICAS DE MD DE PEPTIDOS ANTIMICROBIANOS, ANALIZANDO DISTINTOS CAMPOS DE FUERZA Y CONDICIONES DE MEMBRANA: UNA VERSION BASICA Y GRATUITA, PARA UN USUARIO ESTANDAR Y OTRA VERSION PROFESIONAL PARA UN USUARIO MAS ESPECIALIZADO QUE BUSQUE ANALISIS O SISTEMAS CONCRETOS._x000D_ EN EL ULTIMO BLOQUE CONSIDERAREMOS OTRAS MOLECULAS ANTIMICROBIANAS CON MECANISMOS DIFERENTES O DESCONOCIDOS, COMO LOS AQCS O HIDROFOBINAS, ACEITES ESENCIALES, COMPUESTOS NATURALES Y MOLECULAS SINTETICAS, EN EL MARCO DE INTERES INDUSTRIAL O UNA ETN EUROPEA, RESPECTIVAMENTE._x000D_ EL PRESENTE PROYECTO ESTA CONCEBIDO EN UN ESCENARIO TOTALMENTE INTERDISCIPLINAR EN DONDE SE TRATARA DE COMBINAR UN SOLIDO ENFOQUE COMPUTACIONAL, INNOVADOR EN EL CAMPO DE LOS AGENTES ANTIMICROBIANOS, CON DIFERENTES COLABORACIONES EXPERIMENTALES DE GRUPOS ESPECIALIZADOS EN EL DESARROLLO DE MOLECULAS ANTIMICROBIANAS A NIVEL NACIONAL E INTERNACIONAL. EL ENFOQUE PROPUESTO BASADO EN LA SINERGIA ENTRE METODOS IN-SILICO/IN-VITRO SE BENEFICIARA ENORMEMENTE DE UN ESCENARIO TAN INTERDISCIPLINAR POSIBILITANDO UN AVANCE SIGNIFICATIVO EN LA VALIDACION DE METODOS COMPUTACIONALES PARA PROBAR/VERIFICAR LAS PREDICCIONES IN-SILICO. ADEMAS, COMO PARTE DEL COMITE DE GESTION EN LA ACCION EUROPEA COST CM1306,SERA POSIBLE UN INTERCAMBIO DE INFORMACION EXCEPCIONAL Y COLABORATIVO ENTRE GRUPOS EXPERIMENTALES Y TEORICOS, MAXIMIZANDO ASI EL IMPACTO DE LAS ACTIVIDADES DE INVESTIGACION DE ESTA PROPUESTA. (Spanish)
0 references
IN THIS PROJECT WE PROPOSE TO DEVELOP A STRATEGY FOR THE RATIONAL DESIGN OF ANTIMICROBIAL OLIGOMERS BASED ON THE UNDERSTANDING OF THEIR MECHANISM OF ACTION AT MEMBRANE LEVEL, FROM AN IN-SILIC/IN-VITRO SYNERGISTIC APPROACH. THE KEY FOR THIS APPROACH TO SUCCEED IS THE APPLICATION OF EMERGING METHODOLOGIES: Coarse GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) and MD linked with GPUS to the nexus that would allow for an expansion without precisions of the meso-escalal phenomena of the ANTIMICROBIAN molecules and their interaction with the MEMBRANAS._x000D_ UTILIZANDO this focus will be studied ANTIMYROBIAN PEPTID MECHANISMES (AMPS) AND “INTELIGENTS” AUTO-ENSAMBLATE molecules (CYCLOPEPTIDs, ORGANIC molecules, CYCLODEXTRINES, polymers, atomic clusters-AQCS, (ETC) WITH THE FINAL OBJECTIVE OF OBJECTIVE INFORMATION THAT CAN BE USED FOR THE DESIGN OF NEW ANTIBACTERIAL AGENTS that reduce TOXICITY AS APARICTION OF RESISTANCE. Three GREAT BLOCKS OF DIFFERENT PRODUCTS ANTIMICROBIANs:_x000D_ will be investigated at the first block we will focus on TRANSMEMBRANE FORING ENTITIES, as NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOSED BY CYCLOPEPTID. WE WILL STUDY ITS MECHANISM OF INTERACTION WITH THE MEMBRANE AND TRANSPORT THROUGH ITS CAVITIES. CG PARAMETERS OF THESE PEPTIDES WILL BE DEVELOPED AND USED AS BIOMIMETIC NANOPORES, MODELS OF BIOLOGICAL CHANNELS, WHICH WILL HELP THE DESIGN OF NEW THERAPIES FOR CANALOPATIAS, DISEASES CAUSED BY THE INCORRECT FUNCTIONING OF CERTAIN TYPES OF PROTEINS. We will bring a COMPARATIVE COMPARATIVE OF COMPUTATIONAL METHODS FOR THE OBTENTION OF CINETIC CONSTANTS IN THE TRANSMEMBRANE TRANSPORT OF IONES (BXD and ABAD-Sansom)._x000D_ The second BLOCKING BLOCLE focuses on ANTIMICROBIAN molecules with disruptive mechanisms, like peptic NANOTUBOS, CICLODEXTRINES or polymerica ENTITIES. WE WILL DEVELOP A DATABASE BASED ON MD SIMULATIONS OF ANTIMICROBIAL PEPTIDES, ANALYSING DIFFERENT FORCE FIELDS AND MEMBRANE CONDITIONS: A basic and free version, for a USER to stand and another professional version for a user more specific than searching Analyses or concret systems._x000D_ in the ULTIME BLOKING WITH OTHER ANTIMICROBIAN MORE MORE WITH DIFFERENT MECHANISHES or DISCOUNTS, as AQCS or HYDROPHOBINS, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL COMPOSES AND SYINTETICAL PROCEDURES, IN THE FRAMEWORK OF INDUSTRIAL INTEREST OR A EUROPEAN ETN, RESPECTIVELY._x000D_ The present project is agreed upon in a fully interdisciplined ESCENARY IN WHERE WHERE will be an attempt to combine a COMPUTATIONAL focus, INNOVATOR IN THE CAMPO OF ANTIMICROBIAN AGENTS, WITH DIFFERENT EXPERIMENTAL COLABORATIONS OF SPECIALISED GROUPS IN THE DEVELOPMENT OF ANTIMICROBIAN molecules to NATIONAL and INTERNATIONAL LEVEL. THE PROPOSED APPROACH BASED ON SYNERGY BETWEEN IN-SILICO/IN-VITRO METHODS WILL GREATLY BENEFIT FROM SUCH AN INTERDISCIPLINARY SCENARIO ENABLING SIGNIFICANT PROGRESS IN THE VALIDATION OF COMPUTATIONAL METHODS TO TEST/VERIFY IN-SILIC PREDICTIONS. IN ADDITION, AS PART OF THE MANAGEMENT COMMITTEE ON THE EUROPEAN ACTION COST CM1306, IT WAS POSSIBLE TO EXCHANGE EXCEPTIONAL AND COLLABORATIVE INFORMATION BETWEEN EXPERIMENTAL AND THEORETICAL GROUPS, THUS MAXIMISING THE IMPACT OF THE RESEARCH ACTIVITIES OF THIS PROPOSAL. (English)
12 October 2021
0.5814953002466929
0 references
DANS CE PROJET, NOUS PROPOSONS DE DÉVELOPPER UNE STRATÉGIE DE CONCEPTION RATIONNELLE DES OLIGOMÈRES ANTIMICROBIENS BASÉE SUR LA COMPRÉHENSION DE LEUR MÉCANISME D’ACTION AU NIVEAU DE LA MEMBRANE, À PARTIR D’UNE APPROCHE SYNERGIQUE IN-SILIC/IN-VITRO. LA CLÉ DE LA RÉUSSITE DE CETTE APPROCHE EST L’APPLICATION DE MÉTHODOLOGIES ÉMERGENTES: DYNAMIQUE MOLECULAIRE GRAINES GRAINES (CG-MD) et MD liées à GPUS au lien qui permettrait une expansion sans précision des phénomènes méso-escalaux des molécules ANTIMICROBIAN et de leur interaction avec les MEMBRANAS._x000D_ utilizando ce point sera étudié dans les mécanismes peptidiques ANTIMYROBIAN (AMPS) ET «INTELIGENTS» AUTO-ENSAMBLATE (CYCLOPEPTIDS, molécules ORGANIQUES, cyclodextrines, polymères, amas atomiques-AQCS, (ETC) AVEC L’OBJECTIF FINAL DE L’INFORMATION OBJECTIVE QU’IL EST UTILISÉ POUR LE DESIGN DE NOUVELLES AGENTES ANTIBACTERIELLES qui réduisent la TOXICITÉ EN APARICTION DE RÉSISTANCE. Trois GRANDS BLOCKS DE PRODUITS DIFFÉRENTS ANTIMICROBIANS:_x000D_ seront étudiés au premier bloc, nous nous concentrerons sur les ENTITÉS DE FORING transmembranaire, comme NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOS PAR CYCLOPEPTID. NOUS ÉTUDIERONS SON MÉCANISME D’INTERACTION AVEC LA MEMBRANE ET DE TRANSPORT À TRAVERS SES CAVITÉS. LES PARAMÈTRES CG DE CES PEPTIDES SERONT DÉVELOPPÉS ET UTILISÉS COMME NANOPORES BIOMIMÉTIQUES, MODÈLES DE CANAUX BIOLOGIQUES, QUI AIDERONT À CONCEVOIR DE NOUVELLES THÉRAPIES POUR CANALOPATIAS, MALADIES CAUSÉES PAR LE MAUVAIS FONCTIONNEMENT DE CERTAINS TYPES DE PROTÉINES. Nous apporterons une COMPARATIVE COMPARATIVE DES MÉTHODES COMPUTATIONNELLES POUR L’obtention de CONSTANTS CINÉTIQUES DANS LE TRANSPORT transmembranaire d’ions (BXD et ABAD-Sansom)._x000D_ Le deuxième BLOCLE BLOCKING se concentre sur les molécules ANTIMICROBIAN avec des mécanismes perturbateurs, comme les NANOTUBOS péptiques, les CICLODEXTRINES ou les ENTITÉS polymériques. NOUS DÉVELOPPERONS UNE BASE DE DONNÉES BASÉE SUR DES SIMULATIONS MD DE PEPTIDES ANTIMICROBIENS, ANALYSANT DIFFÉRENTS CHAMPS DE FORCE ET CONDITIONS MEMBRANAIRES: Une version basique et gratuite, pour un UTILISATEUR, et une autre version professionnelle pour un utilisateur plus spécifique que la recherche d’Analyses ou de systèmes concrets._x000D_ dans le bloking ULTIME AVEC AUTRES ANTIMICROBIANES PLUS PLUS AVEC LES MÉCANISES DIFFÉRENTES ou DISCOUNTS, comme AQCS ou hydrophobines, ACEITES ESSENTIELS, NATURAL compose ET PROCÉDURES SYINTÉTIQUES, DANS LE CADRE D’INTÉRÊT INDUSTRIEL OU UN ETN EUROPEEN, RESPECTIVELY._x000D_ Le présent projet est convenu au sein d’un CESÉNAIRE pleinement interdiscipliné DANS WHERE WHERE sera une tentative de combiner une approche COMPUTATIONALE, INNOVATOR DANS LE CAMPO DES AGENTS ANTIMICROBIAN, avec des collaborations expérimentales DIFFÉRENTES DE GROUPES SPÉCIALISÉS DANS LE DÉVELOPPEMENT DES molécules ANTIMICROBIANES à NIVEAU NATIONAL et INTERNATIONAL. L’APPROCHE PROPOSÉE FONDÉE SUR LA SYNERGIE ENTRE LES MÉTHODES IN-SILICO/IN-VITRO BÉNÉFICIERA GRANDEMENT D’UN TEL SCÉNARIO INTERDISCIPLINAIRE PERMETTANT DE RÉALISER DES PROGRÈS SIGNIFICATIFS DANS LA VALIDATION DES MÉTHODES DE CALCUL POUR TESTER/VÉRIFIER LES PRÉDICTIONS IN-SILIC. EN OUTRE, DANS LE CADRE DU COMITÉ DE GESTION DE L’ACTION EUROPÉENNE COÛT CM1306, IL A ÉTÉ POSSIBLE D’ÉCHANGER DES INFORMATIONS EXCEPTIONNELLES ET COLLABORATIVES ENTRE GROUPES EXPÉRIMENTAUX ET THÉORIQUES, MAXIMISANT AINSI L’IMPACT DES ACTIVITÉS DE RECHERCHE DE CETTE PROPOSITION. (French)
4 December 2021
0 references
IN DIESEM PROJEKT SCHLAGEN WIR VOR, EINE STRATEGIE FÜR DIE RATIONELLE GESTALTUNG ANTIMIKROBIELLER OLIGOMERE ZU ENTWICKELN, DIE AUF DEM VERSTÄNDNIS IHRES WIRKMECHANISMUS AUF MEMBRANEBENE BASIERT, AUS EINEM IN-SILIC/IN-VITRO SYNERGISTISCHEN ANSATZ. DER SCHLÜSSEL FÜR DIESEN ERFOLGSANSATZ IST DIE ANWENDUNG NEUER METHODEN: Grobe GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) und MD, die mit GPUS verbunden sind, mit dem Nexus verbunden, der eine Erweiterung ohne Präzision der meso-eskalischen Phänomene der ANTIMICROBIAN-Moleküle und deren Interaktion mit den MEMBRANAS ermöglichen würde._x000D_ utilizando dieser Fokus wird untersucht werden ANTIMYROBIAN peptid Mechanismen (AMPS) UND „INTELIGENTS“ AUTO-ENSAMBLATE Moleküle (CYCLOPEPTIDs, ORGANIC-Moleküle, Cyclodextrine, Polymere, Atomcluster-AQCS, (ETC) MIT DEN FINANZEN OBJEKTIVEN INFORMATIONEN, die für das Design von neuen ANTIBACTERIAL AGENTEN verwendet werden können, die TOXICITY als APARICTION OF RESISTANCE reduzieren. Drei GREAT BLOCKS OF DIFFERENT PRODUKTE ANTIMICROBIANs:_x000D_ werden am ersten Block untersucht, den wir auf Transmembrane FORING ENTITIES konzentrieren werden, als NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOS BYCLOPEPTID. WIR WERDEN DEN MECHANISMUS DER WECHSELWIRKUNG MIT DER MEMBRAN UND DEN TRANSPORT DURCH IHRE HOHLRÄUME UNTERSUCHEN. CG-PARAMETER DIESER PEPTIDE WERDEN ALS BIOMIMETISCHE NANOPOREN, MODELLE BIOLOGISCHER KANÄLE, ENTWICKELT UND VERWENDET, DIE DIE ENTWICKLUNG NEUER THERAPIEN FÜR CANALOPATIAS, KRANKHEITEN, DIE DURCH DAS FEHLERHAFTE FUNKTIONIEREN BESTIMMTER ARTEN VON PROTEINEN VERURSACHT WERDEN, UNTERSTÜTZEN. Die zweite BLOCKING BLOCLE konzentriert sich auf ANTIMICROBIAN-Moleküle mit disruptiven Mechanismen wie peptischen NANOTUBOS, CICLODEXTRINES oder Polymerica-ENTITIEN. WIR WERDEN EINE DATENBANK ENTWICKELN, DIE AUF MD-SIMULATIONEN VON ANTIMIKROBIELLEN PEPTIDEN BASIERT UND VERSCHIEDENE KRAFTFELDER UND MEMBRANBEDINGUNGEN ANALYSIERT: Eine einfache und kostenlose Version, damit ein USER steht und eine andere professionelle Version für einen Benutzer spezifischer als auf der Suche nach Analyses- oder Konkretsystemen._x000D_ in der ULTIME Blowking MIT ANDEREN ANTIMICROBIAN MEHR MEHR MIT DIFFERENTEN MEHR MIT DIFFERENTEN MEHR MEHR MIT DIFFERENTEN MEHR MEHR MIT DEN DIFFERENT MEHR MEHR MEHR MIT DIFFERENT MEHR MEHR MIT DIFFERENT MECHANISHES oder DISCOUNTS, als AQCS oder Hydrophobine, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL composes AND SYINTETICAL PROCEDURES, IN THE FRAMEWORK OF INDUSTRIAL INTEREST oder ein EUROPÄISCHEN ETN, RESPECTIVELY._x000D_ Das vorliegende Projekt wird in einem vollständig interdisziplinären Weniger vereinbart, um einen COMPUTATIONALen Schwerpunkt zu kombinieren. INNOVATOR IN DER CAMPO ANTIMICROBIAN AGENTEN, MIT DIFFERENTE EXPERIMENTAL Kollaborationen von SPEZIALISED GROUPS IN DER ANTIMICROBIAN-Moleküle zu NATIONAL und INTERNATIONALer LEVEL. DER VORGESCHLAGENE ANSATZ, DER AUF SYNERGIEN ZWISCHEN IN-SILICO/IN-VITRO-METHODEN BASIERT, WIRD VON EINEM SOLCHEN INTERDISZIPLINÄREN SZENARIO SEHR PROFITIEREN, DAS ERHEBLICHE FORTSCHRITTE BEI DER VALIDIERUNG VON BERECHNUNGSMETHODEN ZUR ERPROBUNG/ÜBERPRÜFUNG VON IN-SILIC-VORHERSAGEN ERMÖGLICHT. DARÜBER HINAUS WAR ES IM RAHMEN DES VERWALTUNGSAUSSCHUSSES FÜR DIE EUROPÄISCHEN MASSNAHMEN CM1306 MÖGLICH, AUSSERGEWÖHNLICHE UND KOLLABORATIVE INFORMATIONEN ZWISCHEN EXPERIMENTELLEN UND THEORETISCHEN GRUPPEN AUSZUTAUSCHEN UND SO DIE WIRKUNG DER FORSCHUNGSTÄTIGKEITEN DIESES VORSCHLAGS ZU MAXIMIEREN. (German)
9 December 2021
0 references
IN DIT PROJECT STELLEN WE VOOR OM EEN STRATEGIE TE ONTWIKKELEN VOOR HET RATIONELE ONTWERP VAN ANTIMICROBIËLE OLIGOMEREN OP BASIS VAN HET BEGRIP VAN HUN WERKINGSMECHANISME OP MEMBRAANNIVEAU, VANUIT EEN IN-SILIC/IN-VITRO SYNERGISTISCHE BENADERING. DE SLEUTEL TOT HET SLAGEN VAN DEZE AANPAK IS DE TOEPASSING VAN NIEUWE METHODEN: Grove GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) en MD verbonden met GPUS aan de nexus die zou zorgen voor een uitbreiding zonder precisie van de meso-escale fenomenen van de ANTIMICROBIAN moleculen en hun interactie met de MEMBRANAS._x000D_ utilizando deze focus zal worden bestudeerd ANTIMYROBIAN peptid mechanismes (AMPS) EN „INTELIGENTS” AUTO-ENSAMBLATE molecules (CYCLOPEPTIDs, ORGANISCHE moleculen, cyclodextrines, polymeren, atomaire clusters-AQCS, (ETC) MET DE FINAL OBJECTIVE INFORMATIE DAT kan worden gebruikt voor het ontwerp van nieuwe ANTIBACTERIËLE AGENTEN die TOXICITY verminderen als toepassing van RESISTANCE. Drie GROTE BLOCKS VAN DIFFERENT PRODUCTEN ANTIMICROBIANs:_x000D_ zullen worden onderzocht in het eerste blok zullen we ons richten op transmembraan FORING ENTITIES, als NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOS door CYCLOPEPTID. WE ZULLEN HET MECHANISME VAN INTERACTIE MET HET MEMBRAAN EN HET TRANSPORT DOOR ZIJN HOLTES BESTUDEREN. CG-PARAMETERS VAN DEZE PEPTIDEN ZULLEN WORDEN ONTWIKKELD EN GEBRUIKT ALS BIOMIMETISCHE NANOPORES, MODELLEN VAN BIOLOGISCHE KANALEN, DIE HET ONTWERP VAN NIEUWE THERAPIEËN VOOR CANALOPATIAS ZULLEN HELPEN, ZIEKTEN VEROORZAAKT DOOR DE ONJUISTE WERKING VAN BEPAALDE SOORTEN EIWITTEN. We brengen een COMPARATIVE COMPARATIVE VAN COMPUTATIONALE METHODS VOOR HET obtention VAN CINETIC CONSTANTS IN DE transmembraan TRANSPORT VAN ionen (BXD en ABAD-Sansom)._x000D_ De tweede BLOCKING BLOCLE richt zich op ANTIMICROBIAN moleculen met disruptieve mechanismen, zoals peptic NANOTUBOS, CICLODEXTRINES of polymerica ENTITIES. WE ZULLEN EEN DATABASE ONTWIKKELEN OP BASIS VAN MD-SIMULATIES VAN ANTIMICROBIËLE PEPTIDEN, WAARBIJ VERSCHILLENDE KRACHTVELDEN EN MEMBRAANCONDITIES WORDEN GEANALYSEERD: Een eenvoudige en gratis versie, voor een gebruiker te staan en een andere professionele versie voor een gebruiker specifieker dan het zoeken Analyses of beton systemen._x000D_ in de ULTIME bloking MET ANDERE ANTIMICROBIAN MORE MORE MET DIFFERENT MECHANISHES of DISCOUNTS, als AQCS of hydrophobins, ESSENTIALE ACEITES, NATURAL componeert EN SYINTETICAL PROCEDURES, IN HET FRAME WERK VAN INDUSTRIAL INTEREST OF A EUROPESE ETN, RESPECTIVELY._x000D_Het huidige project wordt overeengekomen in een volledig interdisciplineerde ESCENARY IN WHERE zal een poging zijn om een COMPUTATIONAL focus te combineren, INNOVATOR IN DE CAMPO VAN ANTIMICROBIAN AGENTS, MET DIFFERENTE EXPERIMENTALE samenwerking van SPECIALISED GROUPS IN DE ONTWIKKELING VAN ANTIMICROBIAN moleculen aan NATIONALE en INTERNATIONAL LEVEL. DE VOORGESTELDE AANPAK OP BASIS VAN SYNERGIE TUSSEN IN-SILICO-/IN-VITROMETHODEN ZAL VEEL BAAT HEBBEN BIJ EEN DERGELIJK INTERDISCIPLINAIR SCENARIO, WAARDOOR AANZIENLIJKE VOORUITGANG KAN WORDEN GEBOEKT BIJ DE VALIDATIE VAN REKENMETHODEN VOOR HET TESTEN/VERIFICATIE VAN IN-SILIC-VOORSPELLINGEN. DAARNAAST WAS HET IN HET KADER VAN HET BEHEERSCOMITÉ VOOR DE EUROPESE ACTIEKOSTEN CM1306 MOGELIJK OM UITZONDERLIJKE EN GEZAMENLIJKE INFORMATIE UIT TE WISSELEN TUSSEN EXPERIMENTELE EN THEORETISCHE GROEPEN, WAARDOOR HET EFFECT VAN DE ONDERZOEKSACTIVITEITEN VAN DIT VOORSTEL WERD GEMAXIMALISEERD. (Dutch)
17 December 2021
0 references
IN QUESTO PROGETTO PROPONIAMO DI SVILUPPARE UNA STRATEGIA PER LA PROGETTAZIONE RAZIONALE DEGLI OLIGOMERI ANTIMICROBICI BASATA SULLA COMPRENSIONE DEL LORO MECCANISMO D'AZIONE A LIVELLO DI MEMBRANA, DA UN APPROCCIO SINERGICO IN-SILICO/IN-VITRO. LA CHIAVE PER IL SUCCESSO DI QUESTO APPROCCIO È L'APPLICAZIONE DI METODOLOGIE EMERGENTI: MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) e MD legati con GPUS al nesso che permetterebbe un'espansione senza precisione dei fenomeni meso-escalali delle molecole ANTIMICROBIAN e della loro interazione con i MEMBRANAS._x000D_ utilizando questo focus sarà studiato Meccanismi peptidi ANTIMYROBIAN (AMPS) E "INTELIGENTS" molecole AUTO-ENSAMBLATE (CYCLOPEPTIDs, molecole ORGANICHE, ciclodestrine, polimeri, ammassi atomici-AQCS, (ETC) CON L'OBIETTIVO FINALE DI INFORMAZIONI OBIETTIVE che possono essere utilizzati per la progettazione di nuovi AGENTI ANTIBACTERIALI che riducono la TOXICITÀ come APARICAZIONE DI RESISTENZA. Tre GRANDI BLOCKS DI PRODOTTI DIFFERENTI ANTIMICROBIAN:_x000D_ saranno indagati al primo blocco che ci concentreremo su ENTITIESE FORING transmembrane, come NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOSED DA CYCLOPEPTID. STUDIEREMO IL SUO MECCANISMO DI INTERAZIONE CON LA MEMBRANA E IL TRASPORTO ATTRAVERSO LE SUE CAVITÀ. I PARAMETRI CG DI QUESTI PEPTIDI SARANNO SVILUPPATI E UTILIZZATI COME NANOPORI BIOMIMETICI, MODELLI DI CANALI BIOLOGICI, CHE AIUTERANNO LA PROGETTAZIONE DI NUOVE TERAPIE PER CANALOPATIAS, MALATTIE CAUSATE DAL FUNZIONAMENTO SCORRETTO DI ALCUNI TIPI DI PROTEINE. Porteremo un COMPARATIVE COMPARATIVE DI METODI COMPUTAZIONALI PER L'ostensione dei CONSTANTS CINETICI NEL TRASPORTO transmembrano degli ioni (BXD e ABAD-Sansom)._x000D_ Il secondo BLOCLE BLOCKING si concentra sulle molecole ANTIMICROBIAN con meccanismi dirompenti, come NANOTUBOS peptici, CICLODEXTRINES o ENTITIES Polyica. SVILUPPEREMO UN DATABASE BASATO SU SIMULAZIONI MD DI PEPTIDI ANTIMICROBICI, ANALIZZANDO DIVERSI CAMPI DI FORZA E CONDIZIONI DI MEMBRANA: Una versione semplice e gratuita, per un UTENTE di stand e un'altra versione professionale per un utente più specifico della ricerca di sistemi di analisi o concret._x000D_ nel bloking ULTIME CON ALTRI ANTIMICROBICI PIÙ CON MECHANISHES DIFFERENTI o DISCOUNTI, come AQCS o idrofobina, gli ACETI ESSENTIALI, i Composti NATURALI E I PROCEDURI SINTETICI, NEL QUADRO DI INTEREST INDUSTRIALE O UN'ETN EUROPEA, RESPECTIVELY._x000D_ Il presente progetto è concordato in un CESENARIA pienamente interdisciplinato in cui si cercherà di combinare un focus COMPUTATIVO, INNOVATORE NEL CAMPO DI AGENTI ANTIMICROBICI, CON DIFFERENTI EXPERIMENTALI DI GRUPPI SPECIALIZZATI NEL SVILUPPO delle molecole ANTIMICROBiane al LIVELLO NAZIONALE ed INTERNAZIONALE. L'APPROCCIO PROPOSTO BASATO SULLA SINERGIA TRA I METODI IN-SILICO/IN-VITRO TRARRÀ GRANDE BENEFICIO DA UN TALE SCENARIO INTERDISCIPLINARE CHE CONSENTIRÀ PROGRESSI SIGNIFICATIVI NELLA CONVALIDA DEI METODI DI CALCOLO PER TESTARE/VERIFICARE LE PREVISIONI IN SILICO. INOLTRE, NELL'AMBITO DEL COMITATO DI GESTIONE SUL COSTO DELL'AZIONE EUROPEA CM1306, È STATO POSSIBILE SCAMBIARE INFORMAZIONI ECCEZIONALI E COLLABORATIVE TRA GRUPPI SPERIMENTALI E TEORICI, MASSIMIZZANDO COSÌ L'IMPATTO DELLE ATTIVITÀ DI RICERCA DELLA PRESENTE PROPOSTA. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΈΡΓΟ ΠΡΟΤΕΊΝΟΥΜΕ ΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΜΙΑΣ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΉΣ ΓΙΑ ΤΟΝ ΟΡΘΟΛΟΓΙΚΌ ΣΧΕΔΙΑΣΜΌ ΤΩΝ ΑΝΤΙΜΙΚΡΟΒΙΑΚΏΝ ΟΛΙΓΟΜΕΡΏΝ ΜΕ ΒΆΣΗ ΤΗΝ ΚΑΤΑΝΌΗΣΗ ΤΟΥ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎ ΔΡΆΣΗΣ ΤΟΥΣ ΣΕ ΕΠΊΠΕΔΟ ΜΕΜΒΡΆΝΗΣ, ΑΠΌ ΜΙΑ IN-SILIC/IN-VITRO ΣΥΝΕΡΓΙΣΤΙΚΉ ΠΡΟΣΈΓΓΙΣΗ. ΤΟ ΚΛΕΙΔΊ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΠΙΤΥΧΊΑ ΑΥΤΉΣ ΤΗΣ ΠΡΟΣΈΓΓΙΣΗΣ ΕΊΝΑΙ Η ΕΦΑΡΜΟΓΉ ΑΝΑΔΥΌΜΕΝΩΝ ΜΕΘΟΔΟΛΟΓΙΏΝ: Χονδροειδή ΜΗΧΑΝΙΚΗ ΔΥΝΑΜΙΚΗ (CG-MD) και MD που συνδέονται με το GPUS με το σύνδεσμο που θα επέτρεπε μια επέκταση χωρίς ακρίβεια των μεσο-αποκλαδικών φαινομένων των μορίων ANTIMICROBIAN και την αλληλεπίδρασή τους με το MEMBRANAS._x000D_ utilizando αυτό το επίκεντρο θα μελετηθεί ANTIMYROBIAN πεπτιδικοί μηχανισμοί (AMPS) και «INTELIGENTS» AUTO-ENSAMBLATE μόρια (CYCLOPEPTIDs, ΟΡΓΑΝΙΚΑ μόρια, κυκλοδεξτρίνες, πολυμερή, ατομικές συστάδες-AQCS, (ETC) ΜΕ ΤΟ ΤΕΛΙΚΟ ΣΤΟΧΟ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΩΝ που ΜΠΟΡΟΥΝ να ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΥΝΤΑΙ ΓΙΑ ΤΟ ΣΧΕΔΙΟ ΝΕΩΝ ΑΝΤΙΒΑΚΤΕΡΙΚΩΝ ΣΥΜΦΩΝΙΩΝ που μειώνουν την ΤΟΞΙΚΟΤΗΤΑ ΩΣ ΑΠΟΖΗΜΙΩΣΗ ΤΗΣ ΔΙΑΤΑΞΗΣ. Στο πρώτο μπλοκ θα διερευνηθούν τρία ΑΝΤΙΜΙΚΡΟΒΙΑ:_x000D_ στο πρώτο μπλοκ θα επικεντρωθούμε στους διαμεμβρανικούς ΦΟΡΕΙΣ, όπως NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPOSED ΑΠΟ CYCLOPEPTID. ΘΑ ΜΕΛΕΤΉΣΟΥΜΕ ΤΟΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΌ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗΣ ΜΕ ΤΗ ΜΕΜΒΡΆΝΗ ΚΑΙ ΤΗ ΜΕΤΑΦΟΡΆ ΜΈΣΩ ΤΩΝ ΚΟΙΛΟΤΉΤΩΝ ΤΗΣ. ΟΙ ΠΑΡΆΜΕΤΡΟΙ CG ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΠΕΠΤΙΔΊΩΝ ΘΑ ΑΝΑΠΤΥΧΘΟΎΝ ΚΑΙ ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΩΣ ΒΙΟΜΙΕΤΙΚΟΊ ΝΑΝΟΠΟΡΕΊΣ, ΜΟΝΤΈΛΑ ΒΙΟΛΟΓΙΚΏΝ ΔΙΑΎΛΩΝ, ΤΑ ΟΠΟΊΑ ΘΑ ΒΟΗΘΉΣΟΥΝ ΣΤΟ ΣΧΕΔΙΑΣΜΌ ΝΈΩΝ ΘΕΡΑΠΕΙΏΝ ΓΙΑ ΤΟ CANALOPATIAS, ΑΣΘΈΝΕΙΕΣ ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΟΎΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΗΝ ΚΑΚΉ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑ ΟΡΙΣΜΈΝΩΝ ΤΎΠΩΝ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ. Θα φέρουμε ένα COMPARATIVE COMPARATIVE OF COMPUTATIONAL METHODS FOR THE obtention of CINETIC CONSTANTS IN THE transmembrane TRANSPORT OF iones (BXD and ABAD-Sansom)._x000D_ Το δεύτερο BLOCLE επικεντρώνεται σε μόρια ΑΝΤΙΜΙΚΡΟΒΙΩΝ με ανατρεπτικούς μηχανισμούς, όπως πεπτικές ΝΑΝΟΤΟΜΠΕΣ, CICLODEXTRINES ή ENTITIES Polymerica. ΘΑ ΑΝΑΠΤΎΞΟΥΜΕ ΜΙΑ ΒΆΣΗ ΔΕΔΟΜΈΝΩΝ ΒΑΣΙΣΜΈΝΗ ΣΕ ΠΡΟΣΟΜΟΙΏΣΕΙΣ MD ΤΩΝ ΑΝΤΙΜΙΚΡΟΒΙΑΚΏΝ ΠΕΠΤΙΔΊΩΝ, ΑΝΑΛΎΟΝΤΑΣ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΆ ΠΕΔΊΑ ΔΎΝΑΜΗΣ ΚΑΙ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΜΕΜΒΡΆΝΗΣ: Μια βασική και δωρεάν έκδοση, για να σταθεί ένας ΧΡΗΣΤΗΣ και μια άλλη επαγγελματική έκδοση για έναν χρήστη πιο συγκεκριμένη από την αναζήτηση συστημάτων ανάλυσης ή concret._x000D_ στο ULTIME bloking ΜΕ ΑΛΛΕΣ ANTIMICROBIAN MORE ΠΕΡΙΣΣΟΤΕΡΑ ΜΕ ΔΙΑΦΟΡΕΣ ΜΗΧΑΝΕΣ ή ΕΚΠΤΩΣΕΙΣ, ως AQCS ή υδροφοβίνες, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL composes AND SYINTETICAL PROCEDURES, ΣΤΟ ΠΛΑΙΣΙΟ ΒΙΟΜΗΧΑΝΙΚΟΥ ΕΝΔΙΑΦΕΡΟΝΤΟΣ Ή ΕΝΟΣ ΕΥΡΩΠΑΙΚΟΥ ETN, RESPECTIVELY._x000D_ Το παρόν έργο συμφωνείται σε μια πλήρως διεπιστημονική ΟΙΚΟΝΟΜΙΚΗ ΟΙΚΟΝΟΜΙΚΗ, όπου θα είναι μια προσπάθεια να συνδυάσει μια COMPUTATIONAL εστίαση, INNOVATOR IN THE CAMPO OF ANTIMICROBIAN AGENTS, ΜΕ ΔΙΑΦΟΡΕΣ ΕΚΤΕΛΕΣΤΙΚΕΣ ΣΥΝΕΡΓΑΣΙΕΣ ΕΙΔΙΚΩΝ ΟΜΑΔΩΝ ΣΤΗΝ ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΑΝΤΙΜΙΚΡΟΒΙΩΝ σε ΕΘΝΙΚΟ και ΔΙΕΘΝΕΣ ΕΠΙΠΕΔΟ. Η ΠΡΟΤΕΙΝΌΜΕΝΗ ΠΡΟΣΈΓΓΙΣΗ ΠΟΥ ΒΑΣΊΖΕΤΑΙ ΣΤΗ ΣΥΝΈΡΓΕΙΑ ΜΕΤΑΞΎ IN-SILICO/IN-VITRO ΜΕΘΌΔΩΝ ΘΑ ΩΦΕΛΗΘΕΊ ΣΕ ΜΕΓΆΛΟ ΒΑΘΜΌ ΑΠΌ ΈΝΑ ΤΈΤΟΙΟ ΔΙΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΌ ΣΕΝΆΡΙΟ ΠΟΥ ΕΠΙΤΡΈΠΕΙ ΣΗΜΑΝΤΙΚΉ ΠΡΌΟΔΟ ΣΤΗΝ ΕΠΙΚΎΡΩΣΗ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΙΚΏΝ ΜΕΘΌΔΩΝ ΓΙΑ ΤΗ ΔΟΚΙΜΉ/ΕΠΑΛΉΘΕΥΣΗ IN-SILIC ΠΡΟΒΛΈΨΕΩΝ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΣΤΟ ΠΛΑΊΣΙΟ ΤΗΣ ΕΠΙΤΡΟΠΉΣ ΔΙΑΧΕΊΡΙΣΗΣ ΤΗΣ ΕΥΡΩΠΑΪΚΉΣ ΔΡΆΣΗΣ CM1306, ΚΑΤΈΣΤΗ ΔΥΝΑΤΉ Η ΑΝΤΑΛΛΑΓΉ ΈΚΤΑΚΤΩΝ ΚΑΙ ΣΥΝΕΡΓΑΤΙΚΏΝ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΏΝ ΜΕΤΑΞΎ ΠΕΙΡΑΜΑΤΙΚΏΝ ΚΑΙ ΘΕΩΡΗΤΙΚΏΝ ΟΜΆΔΩΝ, ΜΕΓΙΣΤΟΠΟΙΏΝΤΑΣ ΈΤΣΙ ΤΟΝ ΑΝΤΊΚΤΥΠΟ ΤΩΝ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΏΝ ΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΉΤΩΝ ΤΗΣ ΠΑΡΟΎΣΑΣ ΠΡΌΤΑΣΗΣ. (Greek)
18 August 2022
0 references
I DETTE PROJEKT FORESLÅR VI AT UDVIKLE EN STRATEGI FOR RATIONELT DESIGN AF ANTIMIKROBIELLE OLIGOMERER BASERET PÅ FORSTÅELSEN AF DERES VIRKNINGSMEKANISME PÅ MEMBRANNIVEAU FRA EN IN-SILIC/IN-VITRO SYNERGISTISK TILGANG. NØGLEN TIL EN VELLYKKET TILGANG ER ANVENDELSEN AF NYE METODER: Grov GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) og MD forbundet med GPUS til sammenhængen, der ville give mulighed for en udvidelse uden præcisioner af meso-escalale fænomener i ANTIMICROBIAN molekyler og deres interaktion med MEMBRANAS._x000D_ utilizando dette fokus vil blive undersøgt ANTIMYROBIAN peptid mekanismer (AMPS) OG "INTELIGENTS" AUTO-ENSAMBLATE molekyler (CYCLOPEPTID, ORGANISKE molekyler, cyclodextriner, polymerer, atomklynger-AQCS, (ETC) med den endelige OBJECTIVE INFORMATION, der skal bruges til DESIGN AF NYE ANTIBACTERIAL AGENTS, der reducerer TOXICITY som APARICTION AF RESISTANCE. Tre store BLOKKS AF DIFFERENT PRODUKTER ANTIMICROBIANs:_x000D_ vil blive undersøgt på den første blok, vi vil fokusere på transmembrane FORING ENTITIES, som NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOS BY CYCLOPEPTID. VI VIL STUDERE DENS MEKANISME FOR INTERAKTION MED MEMBRANEN OG TRANSPORT GENNEM DENS HULRUM. CG-PARAMETRE FOR DISSE PEPTIDER VIL BLIVE UDVIKLET OG BRUGT SOM BIOMIMETISKE NANOPORER, MODELLER AF BIOLOGISKE KANALER, SOM VIL HJÆLPE DESIGN AF NYE TERAPIER FOR CANALOPATIAS, SYGDOMME FORÅRSAGET AF DEN UKORREKTE FUNKTION AF VISSE TYPER AF PROTEINER. Vi vil medbringe en KOMPARATIVE KOMPARATIVE af COMPUTATIONAL METHODS TIL obtention af CINETISKE CONSTANTER I transmembran TRANSPORT af ioner (BXD og ABAD-Sansom)._x000D_ Den anden BLOKING BLOCLE fokuserer på ANTIMICROBIAN molekyler med forstyrrende mekanismer, som peptiske NANOTUBOS, CICLODEXTRINES eller polymerica ENTIES. VI VIL UDVIKLE EN DATABASE BASERET PÅ MD-SIMULERINGER AF ANTIMIKROBIELLE PEPTIDER, DER ANALYSERER FORSKELLIGE KRAFTFELTER OG MEMBRANBETINGELSER: En grundlæggende og gratis version, så en USER kan stå, og en anden professionel version til en bruger, der er mere specifik end at søge Analyser eller betonsystemer._x000D_ i ULTIME bloking MED ANDRE ANTIMICROBIAN MORE MED DIFFERENT MECHANISHES eller DISCOUNTS, som AQCS eller hydrofobiner ESSENTIAL ACEITES, NATURAL komponerer OG SYINTETISKE PROCEDURES, I FRAMEWORK OF INDUSTRIAL INTEREST ELLER et EUROPÆISKE ETN, RESPECTIVELY._x000D_ Dette projekt er aftalt i et fuldt interdisciplineret ESCENARY I HVORERE, vil være et forsøg på at kombinere et COMPUTATIONAL fokus, INNOVATOR I KAMPO af ANTIMICROBIAN AGENTS, med DIFFERENT EXPERIMENTAL samarbejde af SPECIALISED GROUPS I DEVELOPMENT AF ANTIMICROBIAN molekyler til NATIONAL og INTERNATIONAL LEVEL. DEN FORESLÅEDE TILGANG BASERET PÅ SYNERGI MELLEM IN-SILICO-/IN-VITRO-METODER VIL I HØJ GRAD DRAGE FORDEL AF ET SÅDANT TVÆRFAGLIGT SCENARIO, DER MULIGGØR BETYDELIGE FREMSKRIDT MED VALIDERINGEN AF BEREGNINGSMETODER TIL TEST/VERIFICERING AF IN-SILIC FORUDSIGELSER. DESUDEN VAR DET SOM LED I FORVALTNINGSUDVALGET FOR EU-AKTIONSOMKOSTNINGERNE CM1306 MULIGT AT UDVEKSLE EXCEPTIONELLE OG SAMARBEJDSBASEREDE OPLYSNINGER MELLEM EKSPERIMENTELLE OG TEORETISKE GRUPPER OG DERMED MAKSIMERE VIRKNINGEN AF DETTE FORSLAGS FORSKNINGSAKTIVITETER. (Danish)
18 August 2022
0 references
TÄSSÄ HANKKEESSA EHDOTAMME, ETTÄ KEHITETÄÄN STRATEGIA MIKROBILÄÄKKEIDEN OLIGOMEERIEN JÄRKIPERÄISTÄ SUUNNITTELUA VARTEN, JOKA PERUSTUU NIIDEN TOIMINTAMEKANISMIN YMMÄRTÄMISEEN KALVOTASOLLA IN-SILIC/IN- VITRO -SYNERGISTISEN LÄHESTYMISTAVAN POHJALTA. TÄMÄN LÄHESTYMISTAVAN ONNISTUMISEN KANNALTA KESKEISTÄ ON UUSIEN MENETELMIEN SOVELTAMINEN: Karkeat GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) ja MD liittyvät GPUS nexus joka mahdollistaisi laajenemisen ilman tarkkuutta meso-escalal ilmiöitä ANTIMICROBIAN molekyylejä ja niiden vuorovaikutus MEMBRANAS._x000D_ utilizando tämä painopiste tutkitaan ANTIMYROBIAN peptidimekanismit (AMPS) JA ”INTELIGENTS” AUTO-ENSAMBLATE molekyylejä (CYCLOPEPTIDs, ORGANIC-molekyylit, syklodekstriinit, polymeerit, atomiklusterit-AQCS, (ETC), joilla on RAHOITUS OBJECTIVE TIETOJEN TIEDOT, joita voidaan käyttää uusien ANTIBACTERIAL-Agenttien DESIGN: iin, jotka vähentävät TOXICITIA AS APARICTION OF RESISTANCE. Kolme GREAT BLOCKKS DIFFERENT PRODUCTS ANTIMICROBIANs:_x000D_ tutkitaan ensimmäisessä lohkossa keskitymme transmembraani FORING ENTITIES, kuten NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOS BYCLOPEPTID. TUTKIMME SEN VUOROVAIKUTUSMEKANISMIA KALVON KANSSA JA KULJETAMME SEN ONTELOIDEN LÄPI. NÄIDEN PEPTIDIEN CG-PARAMETREJA KEHITETÄÄN JA KÄYTETÄÄN BIOMIMEETTISINÄ NANOHUOKOSMALLEINA, BIOLOGISTEN KANAVIEN MALLEINA, JOTKA AUTTAVAT SUUNNITTELEMAAN UUSIA HOITOJA CANALOPATIASILLE, TIETYNTYYPPISTEN PROTEIINIEN VIRHEELLISESTÄ TOIMINNASTA JOHTUVIIN SAIRAUKSIIN. Tuomme ionien (BXD ja ABAD-Sansom) Transmembrane TRANSPORTS (BXD ja ABAD-Sansom) KILPAILUKSEN KILPAILUKUKSEN KILPAILUKSEEN._x000D_ Toinen BLOCKING BLOCLE keskittyy ANTIMICROBIAN molekyyleihin, joissa on häiritseviä mekanismeja, kuten peptiset NANOTUBOS, CICLODEXTRINES tai polymerica ENTITIES. KEHITÄMME TIETOKANTAA, JOKA PERUSTUU ANTIMIKROBISTEN PEPTIDIEN MD-SIMULAATIOIHIN JA ANALYSOIMME ERILAISIA VOIMAKENTTIÄ JA KALVO-OLOSUHTEITA: Perus- ja ilmainen versio, jonka avulla käyttäjä voi seistä, ja toinen ammattimainen versio käyttäjälle tarkemmin kuin Analyses- tai konkreettisten järjestelmien etsiminen._x000D_ ULTIME-blokingissa MUIDEN ANTIMICROBIAN ON ANTIMICROBIAN MORE MORE MORE MORE MORE WITHENT MECHANISHES tai DISCOUNTS, kuten AQCS tai hydrofobiinit, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL säveltää JA SYINTETICAL PROCEDURES, IN RAMEWORK OF INDUSTRIAL INTEREST OR A EUROOPAN ETN, RESPECTIVELY._x000D_ Nykyinen hanke sovitaan täysin poikkitieteellisessä ESCENARIAssa, jossa pyritään yhdistämään kilpailukykyinen painopiste, INNOVATOR ANTIMICROBIAN AGENTSIN TUOMIOISTUIMEN TUOMIOISTUIN ANTIMICROBIAN-molekyylien ANTIMICROBIAN-molekyylien kanssa NATIONAL- ja INTERNATIONAL LEVEL -molekyylien kanssa. EHDOTETTU LÄHESTYMISTAPA, JOKA PERUSTUU IN-SILICO/IN VITRO -MENETELMIEN VÄLISEEN SYNERGIAAN, HYÖTYY SUURESTI TÄLLAISESTA MONITIETEELLISESTÄ SKENAARIOSTA, JOKA MAHDOLLISTAA MERKITTÄVÄN EDISTYMISEN LASKENNALLISTEN MENETELMIEN VALIDOINNISSA PII-ENNUSTEIDEN TESTAAMISEKSI/VARMENTAMISEKSI. LISÄKSI EUROOPPALAISEN TOIMEN KUSTANNUKSIA KÄSITTELEVÄN HALLINTOKOMITEAN CM1306 YHTEYDESSÄ OLI MAHDOLLISTA VAIHTAA POIKKEUKSELLISIA JA YHTEISTYÖHÖN PERUSTUVIA TIETOJA KOKEELLISTEN JA TEOREETTISTEN RYHMIEN VÄLILLÄ JA MAKSIMOIDA TÄMÄN EHDOTUKSEN TUTKIMUSTOIMIEN VAIKUTUS. (Finnish)
18 August 2022
0 references
F’DAN IL-PROĠETT NIPPROPONU LI TIĠI ŻVILUPPATA STRATEĠIJA GĦAT-TFASSIL RAZZJONALI TA’ OLIGOMERI ANTIMIKROBIĊI BBAŻATA FUQ IL-FEHIM TAL-MEKKANIŻMU TA’ AZZJONI TAGĦHOM FIL-LIVELL TAL-MEMBRANA, MINN APPROĊĊ SINERĠISTIKU IN-SILIKU/IN-VITRO. IL-MUFTIEĦ BIEX DAN L-APPROĊĊ JIRNEXXI HUWA L-APPLIKAZZJONI TA’ METODOLOĠIJI EMERĠENTI: Molekuli Aħrax MOLECULAR MOLECULAR (CG-MD) u MD marbuta ma’ GPUS għar-rabta li tippermetti espansjoni mingħajr preċiżjonijiet tal-fenomeni meso-eskali tal-molekuli ANTIMICROBIAN u l-interazzjoni tagħhom mal-MEMBRANAS._x000D_ utilizando dan il-fokus se jiġi studjat ANTIMYROBIAN peptid mechanismes (AMPS) U “INTELIGENTS” AUTO-ENSAMBLATE molekuli (CYCLOPEIDs, CYCLOPEIDs, molekuli ORGANIC, ċiklodestrini, polimeri, raggruppamenti atomiċi-AQCS, (ETC) BIL-OBJETTIVA FINALI TA’ INFORMAZZJONI OBJETTIVA LI KIF GĦANDHOM GĦANDHOM GĦANDHOM GĦANDHOM GĦANDHOM GĦANDHOM GĦANDHOM GĦANDHOM GĦANDHOM inaqqsu t-TAXXIJA AS APARICTION TA’ RESISTANCE. Tliet BLOCKS GREAT TA ‘PRODOTT DIFFERENT ANTIMICROBIANs:_x000D_ se jiġu investigati fl-ewwel blokk aħna se tiffoka fuq l-ENTITAJIET transmembrane FORING, kif NANOTUBOS/NANOEMBUDOS KOMUOS BY CYCLOPEPTID. AĦNA SE TISTUDJA L-MEKKANIŻMU TAGĦHA TA ‘INTERAZZJONI MAL-MEMBRANA U T-TRASPORT PERMEZZ KAVITAJIET TAGĦHA. IL-PARAMETRI CG TA’ DAWN IL-PEPTIDI SE JIĠU ŻVILUPPATI U UŻATI BĦALA NANOPORI BIJOMETIĊI, MUDELLI TA’ KANALI BIJOLOĠIĊI, LI SE JGĦINU FIT-TFASSIL TA’ TERAPIJI ĠODDA GĦAL CANALOPATIAS, MARD IKKAWŻAT MILL-FUNZJONAMENT ĦAŻIN TA’ ĊERTI TIPI TA’ PROTEINI. Aħna ser iġġib KOMPARATTIV KOMPARATTIV TA ‘METHODS KOMPUTAZZJONI GĦALL-obtenzjoni ta’ KONSTANTS CINETIC FL-TRASPORT transmembran tal-jonji (BXD u ABAD-Sansom)._x000D_ It-tieni BLOCLE BLOCKING tiffoka fuq molekuli ANTIMICROBIAN b’mekkaniżmi ta ‘sfrattu, bħal peptiċi NANOTUBOS, CICLODEXTRINES jew ENTITAJIET polimerika. AĦNA SE TIŻVILUPPA DATABASE BBAŻATA FUQ SIMULAZZJONIJIET MD TA ‘PEPTIDI ANTIMIKROBIĊI, ANALIŻI OQSMA FORZA DIFFERENTI U L-KONDIZZJONIJIET TAL-MEMBRANA: Verżjoni bażika u ħielsa, għal USER biex toqgħod u verżjoni professjonali oħra għal utent aktar speċifiku minn tiftix ta ‘Analyses jew concret systems._x000D_ fil-bloking ULTIME B’MORE MORE OTHER ANTIMICROBIAN ma DIFFERENT MECHANISHES jew DISCOUNTS, bħala AQCS jew hydrophobins, ACEITES EŻENZJALI, Komposti NATURALI U PROĊEDURI SYINTETICAL, FIL-QAFAS TA’ INTEREST INDUSTRIJALI JEW A ETN EWROPEA, RISPECTIVELY._x000D_ Il-proġett preżenti huwa maqbul f’ESCENARJU interdixxiplinari bis-sħiħ B’XAHAR ser ikun tentattiv biex jiġi kkombinat fokus KOMUTAZZJONI, INNOVATOR FIL-KAMPO TA’ AĠENTI TA’ ANTIMICROBIAN, BIL-Kollaborazzjonijiet ESPERJONALI DIFFERENTI TAL-GROUPS SPEĊJALI F’DEVELOPMENT TA’ molekuli ANTIMICROBIAN għal-LIVELL NAZZJONALI u INTERNAZZJONALI. L-APPROĊĊ PROPOST IBBAŻAT FUQ IS-SINERĠIJA BEJN IL-METODI IN-SILICO/IN-VITRO SE JIBBENEFIKA BIL-KBIR MINN XENARJU INTERDIXXIPLINARI BĦAL DAN LI JIPPERMETTI PROGRESS SINIFIKANTI FIL-VALIDAZZJONI TAL-METODI KOMPUTAZZJONALI BIEX JIĠU TTESTJATI/IVVERIFIKATI T-TBASSIR IN-SILIKU. BARRA MINN HEKK, BĦALA PARTI MILL-KUMITAT TA’ ĠESTJONI DWAR L-ISPIŻA TAL-AZZJONI EWROPEA CM1306, KIEN POSSIBBLI LI TIĠI SKAMBJATA INFORMAZZJONI EĊĊEZZJONALI U KOLLABORATTIVA BEJN IL-GRUPPI SPERIMENTALI U TEORETIĊI, BIEX B’HEKK JIĠI MMASSIMIZZAT L-IMPATT TAL-ATTIVITAJIET TA’ RIĊERKA TA’ DIN IL-PROPOSTA. (Maltese)
18 August 2022
0 references
ŠAJĀ PROJEKTĀ MĒS IEROSINĀM IZSTRĀDĀT STRATĒĢIJU ANTIMIKROBIĀLO OLIGOMĒRU RACIONĀLAI IZSTRĀDEI, PAMATOJOTIES UZ IZPRATNI PAR TO DARBĪBAS MEHĀNISMU MEMBRĀNU LĪMENĪ, IZMANTOJOT IN-SILIC/IN-VITRO SINERĢISKU PIEEJU. LAI ŠĪ PIEEJA BŪTU SEKMĪGA, IR JĀIZMANTO JAUNAS METODES: Ar GPUS saistīts rupjš MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) un MD, kas saistīts ar GPUS ar saikni, kas ļautu paplašināt ANTIMICROBIAN molekulu mezoekalālās parādības un to mijiedarbību ar MEMBRANAS._x000D_ utilizando šo fokusu pētīs ANTIMYROBIAN peptīdu mehānismi (AMPS) UN “INTELIGENTS” AUTO-ENSAMBLATE molekulas (CYCLOPEPTID, ORGANIC molekulas, ciklodekstrīni, polimēri, atomu kopas-AQCS, (ETC) ar FINĀLĀ OBJEKTĪVA INFORMĀCIJAS INFORMĀCIJAS, kas var izmantot jaunu ANTIBACTERIAL AGENTU, kas samazina toksicitāti kā RESISTANCE APARICTION. Trīs GREAT BLOCKS DIFFERENT PRODUCTS ANTIMICROBIANs:_x000D_ tiks pētīta pirmajā blokā mēs koncentrēsimies uz transmembrānu FORING ENTITIES, kā NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOS BY CYCLOPEPTID. MĒS PĒTĪSIM TĀ MIJIEDARBĪBAS MEHĀNISMU AR MEMBRĀNU UN TRANSPORTU CAUR TĀS DOBUMIEM. ŠO PEPTĪDU CG PARAMETRI TIKS IZSTRĀDĀTI UN IZMANTOTI KĀ BIOMIMĒTISKI NANOPORAS, BIOLOĢISKO KANĀLU MODEĻI, KAS PALĪDZĒS IZSTRĀDĀT JAUNAS TERAPIJAS CANALOPATIAS — SLIMĪBAS, KO IZRAISA DAŽU PROTEĪNU VEIDU NEPAREIZA DARBĪBA. Mēs atvedīsim COMPARATIVE COMPARATIVE COMPARATIVE KOMPUTĀCIJAS METODES CINETIC CONSTANTS uz jonu transmembrānu TRANSPORTS (BXD un ABAD-Sansom)._x000D_ Otrais BLOCKING BLOCLE koncentrējas uz ANTIMICROBIAN molekulām ar graujošiem mehānismiem, piemēram, peptisko NANOTUBOS, CICLODEXTRINES vai polimerika ENTITIES. MĒS IZSTRĀDĀSIM DATUBĀZI, KURAS PAMATĀ IR PRETMIKROBU PEPTĪDU MD SIMULĀCIJAS, ANALIZĒJOT DAŽĀDUS SPĒKA LAUKUS UN MEMBRĀNAS APSTĀKĻUS: Pamata un bezmaksas versija, lai LIETOTĀJS stāvētu, un vēl viena profesionāla versija lietotājam, kas ir specifiskāka nekā analītisko vai concret sistēmu meklēšana._x000D_ ULTIME bloking ar citu ANTIMICROBIAN VAIRĀK ar DIFFERENT MECHANISHES vai DISCOUNTS, kā AQCS vai hidrofobīni, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL composes AND SYINTETICAL PROCEDURES, in the FRAMEWORK OF INDUSTRIAL INTEREST OR A EUROPEAN ETN, RESPECTIVELY._x000D_ Šis projekts ir saskaņots pilnībā starpdisciplinārā ESKĀ, kur būs mēģinājums apvienot Konkurētspējas fokusu, ANTIMICROBIAN Aģentu KAMPO, AR DIFFERENT EXPERIMENTAL colaboration of SPECIALISED GROUPS in the DEVELOPMENT of ANTIMICROBIAN molekulas uz NATIONAL un INTERNATIONAL LEVEL. IEROSINĀTĀ PIEEJA, KURAS PAMATĀ IR SINERĢIJĀ STARP IN-SILICO/IN-VITRO METODĒM, LIELĀ MĒRĀ GŪS LABUMU NO ŠĀDA STARPDISCIPLINĀRA SCENĀRIJA, KAS ĻAUS IEVĒROJAMI UZLABOT SKAITĻOŠANAS METOŽU VALIDĀCIJU, LAI PĀRBAUDĪTU/PĀRBAUDĪTU SILIKISKĀS PROGNOZES. TURKLĀT EIROPAS RĪCĪBAS IZMAKSU PĀRVALDĪBAS KOMITEJAS SASTĀVĀ CM1306 BIJA IESPĒJAMS APMAINĪTIES AR ĀRKĀRTAS UN SADARBĪBAS INFORMĀCIJU STARP EKSPERIMENTĀLAJĀM UN TEORĒTISKAJĀM GRUPĀM, TĀDĒJĀDI MAKSIMĀLI PALIELINOT ŠĀ PRIEKŠLIKUMA PĒTNIECĪBAS PASĀKUMU IETEKMI. (Latvian)
18 August 2022
0 references
V TOMTO PROJEKTE NAVRHUJEME VYPRACOVAŤ STRATÉGIU RACIONÁLNEHO NAVRHOVANIA ANTIMIKROBIÁLNYCH OLIGOMÉROV ZALOŽENÚ NA POCHOPENÍ ICH MECHANIZMU ÚČINKU NA ÚROVNI MEMBRÁNY, Z SYNERGICKÉHO PRÍSTUPU IN-SILIC/IN-VITRO. KĽÚČOM K ÚSPECHU TOHTO PRÍSTUPU JE UPLATŇOVANIE NOVÝCH METODÍK: Hrubé GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) a MD spojené s GPUS s prepojením, ktoré by umožnilo rozšírenie bez presnosti mezoeskalálnych javov molekúl ANTIMICROBIAN a ich interakciu s MEMBRANAS._x000D_ utilizando toto zameranie sa bude študovať ANTIMYROBIAN peptidové mechanizmy (AMPS) A „INTELIGENTS“ AUTO-ENSAMBLATE molekuly (CYCLOPEPTIDs, ORGANICKÉ molekuly, cyklodextríny, polyméry, atómové zhluky-AQCS, (ETC) s konečným OBJEKTÍVnym INFORMÁCIEm, ktoré môžu byť použité na označenie nových ANTIBACTERIAL AGENTS, ktoré znižujú TOXIKITU ako APARICIA RESISTANCE. V prvom bloku sa zameriame na transmembránové technológie ako NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOSED BYCLOPEPTID. BUDEME SKÚMAŤ JEHO MECHANIZMUS INTERAKCIE S MEMBRÁNOU A TRANSPORT CEZ JEJ DUTINY. CG PARAMETRE TÝCHTO PEPTIDOV BUDÚ VYVINUTÉ A POUŽITÉ AKO BIOMIMETICKÉ NANOPÓRY, MODELY BIOLOGICKÝCH KANÁLOV, KTORÉ POMÔŽU NAVRHNÚŤ NOVÉ TERAPIE PRE CANALOPATIAS, CHOROBY SPÔSOBENÉ NESPRÁVNYM FUNGOVANÍM URČITÝCH TYPOV BIELKOVÍN. Prinesieme COMPARATIVE COMPARATIVE COMPUTATIONAL METHODS pre potenciu CINETICKÝCH CONSTANTov v transmembránovej preprave iónov (BXD a ABAD-Sansom)._x000D_ Druhý BLOCKING BLOCLE sa zameriava na molekuly ANTIMICROBIAN s rušivými mechanizmami, ako sú peptické NANOTUBOS, CICLODEXTRINES alebo polymerické ENTITIES. VYTVORÍME DATABÁZU ZALOŽENÚ NA MD SIMULÁCIÁCH ANTIMIKROBIÁLNYCH PEPTIDOV, ANALYZUJEME RÔZNE SILOVÉ POLIA A MEMBRÁNOVÉ PODMIENKY: Základná a bezplatná verzia pre používateľa a ďalšia profesionálna verzia pre používateľa, ktorá je špecifickejšia ako vyhľadávanie analytických systémov alebo konkrétnych systémov._x000D_ v ULTIME blokingu s ĎALším ANTIMICROBÍNOM viacej s DIFFERENTÝmi MECHANISHES alebo DISCOUNTS, ako AQCS alebo hydrofóby, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL composes and SYINTETICKAL PROCEDURES, V RÁMCI INDUSTRIÁLNEHO INTERESTU alebo EURÓPSKYCH ETN, RESPECTIVELY._x000D_ Súčasný projekt sa dohodne v plne interdisciplinovanom ESCENARIÁCIU, kde sa bude snažiť spojiť komplexné zameranie, INNOVATOR V CAMPO ANIMIKROBIANOVÝCH AGENTOV, S DIFFERENTnou exERIMENTÁLnou spoluprácou SPECIALIZEDÝCH GROUPS vo vývoji ANTIMIKROBIANových molekúl na NÁRODnú a medzinárodnú LEVEL. NAVRHOVANÝ PRÍSTUP ZALOŽENÝ NA SYNERGII MEDZI METÓDAMI IN-SILICO/IN-VITRO BUDE VO VEĽKEJ MIERE PROFITOVAŤ Z TAKÉHOTO INTERDISCIPLINÁRNEHO SCENÁRA, KTORÝ UMOŽNÍ VÝZNAMNÝ POKROK PRI VALIDÁCII VÝPOČTOVÝCH METÓD NA TESTOVANIE/OVERENIE PREDPOVEDÍ IN-SILIC. OKREM TOHO V RÁMCI RIADIACEHO VÝBORU PRE EURÓPSKE AKČNÉ NÁKLADY CM1306 BOLO MOŽNÉ VYMIEŇAŤ SI VÝNIMOČNÉ A KOLABORATÍVNE INFORMÁCIE MEDZI EXPERIMENTÁLNYMI A TEORETICKÝMI SKUPINAMI, ČÍM SA MAXIMALIZOVAL VPLYV VÝSKUMNÝCH ČINNOSTÍ TOHTO NÁVRHU. (Slovak)
18 August 2022
0 references
SA TIONSCADAL SEO, MOLAIMID STRAITÉIS A FHORBAIRT LE HAGHAIDH DEARADH RÉASÚNACH OLAGAIMÉIRÍ FRITHMHIOCRÓBACHA BUNAITHE AR AN TUISCINT AR A MEICNÍOCHT GNÍOMHAÍOCHTA AG LEIBHÉAL MEMBRANE, Ó CHUR CHUIGE SINEIRGISTEACH IN-SILIC/IN-VITRO. IS É AN RUD IS TÁBHACHTAÍ CHUN GO N-ÉIREOIDH LEIS AN GCUR CHUIGE SEO NÁ MODHEOLAÍOCHTAÍ ATÁ AG TEACHT CHUN CINN A CHUR I BHFEIDHM: Garbh grained DYNAMICS MOLECULAR (CG-MD) agus MD nasctha le GPUs leis an nasc a cheadódh do leathnú gan cruinneas feiniméin mheso-escalal na móilíní ANTIMICROBIAN agus a n-idirghníomhaíocht leis an MEMBRANAS._x000D_ utilizando déanfar staidéar ar an fócas seo meicníochtaí ANTIMYROBIAN Peptid (AMPS) AGUS “INTELIGENTS” móilíní AUTO-ENSAMBLATE (CYCLOPEPTIDs, móilíní ORGANIC, cyclodextrines, polaiméirí, braislí adamhach-AQCS, (ETC) leis an eolas FINAL INMHEÁNACH OBJECTIVE GO bhfuil an CAN a úsáidtear le haghaidh DEARADH GNÍOMHAÍOCHTA NUA a laghdaíonn TOXICITY mar a bhaineann le hathnuachan. Trí BLOCKS GREAT NA TÁIRGÍ DIFFERENT ANTIMICROBIANs: _x000D_ Déanfar imscrúdú ar an gcéad bhloc beimid ag díriú ar ENTITIES FORING TRANSMEMBRANE, mar NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOSED BY CYCLOPEPTID. DÉANFAIMID STAIDÉAR AR A MHEICNÍOCHT IDIRGHNÍOMHAÍOCHTA LEIS AN MEMBRANE AGUS IOMPAR TRÍNA CAVITIES. FORBRÓFAR AGUS ÚSÁIDFEAR PARAIMÉADAIR CG DE NA PEPTIDES SEO MAR NANAPORES BITHEOLAÍOCHTA, SAMHLACHA DE CHAINÉIL BHITHEOLAÍOCHA, RUD A CHABHRÓIDH LE TEIRIPÍ NUA A DHEARADH DO CANALOPATIAS, GALAIR DE BHARR FEIDHMIÚ MÍCHEART CINEÁLACHA ÁIRITHE PRÓITÉINÍ. Tabharfaimid COMPARATIVE AR METHODS COMPUTATIONAL DÉANAMH Díríonn an dara BLOCLE BLOCING ar mhóilíní ANTIMICROBIAN le meicníochtaí suaiteacha, cosúil le NANOTUBOS peptic, CICLODEXTRINES nó ENTITIES Polyica. FORBRÓIMID BUNACHAR SONRAÍ BUNAITHE AR IONSAMHLÚCHÁIN MD DE PHEIPTÍDÍ FRITHMHIOCRÓBACHA, INA NDÉANFAR ANAILÍS AR RÉIMSÍ FÓRSA AGUS COINNÍOLLACHA SCANNÁIN ÉAGSÚLA: Leagan bunúsach agus saor in aisce, le haghaidh USER chun seasamh agus leagan gairmiúil eile d’úsáideoir atá níos sainiúla ná Anailísí nó concret systems a chuardach._x000D_ sa ULTIME BLOKING LE MÓRTHÓIRÍ EILE LE DIFFERENT MECHANISHES nó DISCOUNTS, mar AQCS nó HYDROPHOBINS, comhlachtaí ESSENTIAL, cumadóirí NÁDÚRTHA AGUS NÓ COINNÍOLLACHA, I BHRÍ go mbeidh an tionscadal atá ann faoi láthair ina iarracht fócas COMPUTATIONAL a chur le chéile in ESCENARAÍ idirdhisciplíneach go hiomlán idirdhisciplíneach I EILE SEO A BHAINEANN LE hAGHAIDH EORPACH, neamhaire I nGNÍOMHAÍOCHTAÍ ANTIMICROBIAN, agus le colborations EXPERIMENTAL DIFFERMENTAL GROUPS SPEISIALTA I bhforbairt móilíní ANTIMICROBIAN go LEVEL NÁISIÚNTA agus IDIRNÁISIÚNTA. BAINFIDH AN CUR CHUIGE ATÁ BEARTAITHE, BUNAITHE AR SHINEIRGÍOCHT IDIR MODHANNA INSILICO/IN-VITRO, TAIRBHE MHÓR AS CÁS IDIRDHISCIPLÍNEACH DEN SÓRT SIN A CHUMASÓIDH DUL CHUN CINN SUNTASACH I MBAILÍOCHTÚ MODHANNA RÍOMHAIREACHTÚLA CHUN RÉAMH-MHEASTACHÁIN I-SILIC A THÁSTÁIL/A FHÍORÚ. INA THEANNTA SIN, MAR CHUID DEN CHOISTE BAINISTÍOCHTA AR AN GCOSTAS GNÍOMHAÍOCHTA EORPAÍ CM1306, BHÍOTHAS IN ANN FAISNÉIS EISCEACHTÚIL CHOMHOIBRÍOCH A MHALARTÚ IDIR GRÚPAÍ TURGNAMHACHA AGUS TEOIRICIÚLA, AGUS AR AN GCAOI SIN TIONCHAR GHNÍOMHAÍOCHTAÍ TAIGHDE AN TOGRA SEO A UASMHÉADÚ. (Irish)
18 August 2022
0 references
V TOMTO PROJEKTU NAVRHUJEME VYPRACOVAT STRATEGII RACIONÁLNÍHO NÁVRHU ANTIMIKROBIÁLNÍCH OLIGOMERŮ ZALOŽENOU NA POCHOPENÍ JEJICH MECHANISMU ÚČINKU NA MEMBRÁNOVÉ ÚROVNI, A TO ZE SYNERGICKÉHO PŘÍSTUPU IN-SILIC/IN-VITRO. KLÍČEM K ÚSPĚCHU TOHOTO PŘÍSTUPU JE POUŽITÍ NOVĚ VZNIKAJÍCÍCH METODIK: Hrubé GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) a MD spojené s GPUS na spojitost, která by umožnila expanzi bez přesnosti mezoeskalálních jevů ANTIMICROBIAN molekul a jejich interakce s MEMBRANAS._x000D_ utilizando toto zaměření bude studováno ANTIMYROBIAN peptid mechanismy (AMPS) A „INTELIGENTS“ AUTO-ENSAMBLATE molekuly (CYCLOPEPTID, ORGANICKÉ molekuly, cyklodextriny, polymery, atomové klastry-AQCS, (ETC) S FINÁLNÍM OBCHODNÍM OBCHODNÍM OBCHODNÍM OBCHODNÍM OBCHODNÍM OBCHODNÍM OBCHODNÍM OBCHODNÍM OBCHODU, které mohou být použity pro DESIGN NOVÉ ANTIBACTERIÁLNÍ AGENTY, které snižují TOXICITY as APARICTION OF RESISTANCE. Tři VELKÉ BLOKY DIFFERENT PRODUKTY ANTIMICROBIANs:_x000D_ budou zkoumány v prvním bloku, který se zaměříme na transmembranové FORING ENTITIES, jako NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOSED BYCLOPEPTID. BUDEME ZKOUMAT JEHO MECHANISMUS INTERAKCE S MEMBRÁNOU A TRANSPORT PŘES JEJÍ DUTINY. CG PARAMETRY TĚCHTO PEPTIDŮ BUDOU VYVINUTY A POUŽÍVÁNY JAKO BIOMIMETICKÉ NANOPORY, MODELY BIOLOGICKÝCH KANÁLŮ, KTERÉ POMOHOU NAVRHNOUT NOVÉ TERAPIE PRO CANALOPATIAS, NEMOCI ZPŮSOBENÉ NESPRÁVNÝM FUNGOVÁNÍM URČITÝCH TYPŮ PROTEINŮ. Přineseme COMPARATIVE COMPARATIVE COMPUTATIONAL METHODS for the obtention of CINETIC CONSTANTS IN THE transmembrane TRANSPORT of iones (BXD a ABAD-Sansom)._x000D_ Druhý BLOCKING BLOCLE se zaměřuje na ANTIMICROBIAN molekuly s rušivými mechanismy, jako jsou peptické NANOTUBOS, CICLODEXTRINES nebo polymerika ENTITIES. VYTVOŘÍME DATABÁZI ZALOŽENOU NA MD SIMULACI ANTIMIKROBIÁLNÍCH PEPTIDŮ, KTERÁ ANALYZUJE RŮZNÁ SILOVÁ POLE A MEMBRÁNOVÉ PODMÍNKY: Základní a bezplatná verze, pro USER stát a další profesionální verze pro uživatele specifičtější než vyhledávání Analýzy nebo konkretizační systémy._x000D_ v ULTIME bloking s dalším ANTIMICROBIAN VÍCE s DIFFERENT MECHANISHES nebo DISCOUNTS, jako AQCS nebo hydrofobiny, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL composes and SYINTETICAL PROCEDURES, IN THE FRAMEWORK OF INDUSTRIAL INTEREST NEBO A EVROPSKÝ ETN, RESPECTIVELY._x000D_ Současný projekt je dohodnut v plně interdisciplinovaném ESCENARY, kde se bude snažit spojit COMPUTATIONAL focus, INNOVATOR V CAMPO ANTIMICROBIAN AGENTS, s DIFFERENT EXPERIMENTAL SPOLEČNOSTI SPECIÁLNÍ GROUPS V DEVELOPCI ANTIMICROBIAN molekul na NATIONAL a INTERNATIONAL LEVEL. NAVRHOVANÝ PŘÍSTUP ZALOŽENÝ NA SOUČINNOSTI MEZI METODAMI IN-SILICO/IN-VITRO BUDE VELMI TĚŽIT Z TAKOVÉHO INTERDISCIPLINÁRNÍHO SCÉNÁŘE, KTERÝ UMOŽNÍ VÝZNAMNÝ POKROK PŘI VALIDACI VÝPOČETNÍCH METOD PRO TESTOVÁNÍ/OVĚŘOVÁNÍ IN-SILIICKÝCH PREDIKCÍ. KROMĚ TOHO BYLO MOŽNÉ V RÁMCI ŘÍDÍCÍHO VÝBORU PRO EVROPSKÉ NÁKLADY NA AKCI CM1306 VYMĚŇOVAT VÝJIMEČNÉ A KOOPERATIVNÍ INFORMACE MEZI EXPERIMENTÁLNÍMI A TEORETICKÝMI SKUPINAMI, ČÍMŽ SE MAXIMALIZOVAL DOPAD VÝZKUMNÝCH ČINNOSTÍ TOHOTO NÁVRHU. (Czech)
18 August 2022
0 references
Neste projeto, propomos desenvolver uma estratégia para a conceção racional de oligómeros antimicrobianos, com base no entendimento do seu mecanismo de ação a nível de memória, a partir de uma abordagem sinergética in-sílica/in-vitro. A CHAVE PARA SUCEDER A ESTA ABORDAGEM É A APLICAÇÃO DE METODOLOGIAS DE EMERGÊNCIA: DINÂMICA MOLECULAR grosseira (CG-MD) e DM ligada com GPUS ao nexo que permitiria uma expansão sem precisões dos fenómenos mesoescalares das moléculas ANTIMICROBIANAS e a sua interacção com as MEMBRANAS._x000D_ UTILIZANDO este enfoque será estudado MECANISMOS PÉPTIDOS ANTIMIGROBIANOS (AMPS) E MECANISMOS AUTOENSAMBLADOS "INTELIGENTES" (CICLOPEPTIDS, moléculas ORGANICAS, CICLODEXTRINAS, polímeros, clusters atómicos-AQCS, (ETC) COM O OBJETIVO FINAL DA INFORMAÇÃO OBJECTIVA QUE PODE SER UTILIZADA PARA A DESIGNAÇÃO DE NOVOS AGENTES ANTIBACTERIAIS QUE REDUZEM A TOXICIDADE À APARICAÇÃO DA RESISTÊNCIA. Três GRANDES BLOCOS DE DIFERENTES PRODUTOS ANTIMICROBIANOS:_x000D_ serão investigados no primeiro bloco vamos nos concentrar nas ENTIDADES FORING TRANSMEMBRANA, como NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUÍDOS PELO CICLOPEPTIDO. Estudaremos o seu mecanismo de interacção com a MEMBRANA e o transporte através das suas naves. Os PARÂMETROS CG destes péptidos serão desenvolvidos e utilizados como NANOPORES BIOMIMÉTICOS, MODELOS DE CANAIS BIOLÓGICOS, que AJUDARÃO A CONCEPÇÃO DE NOVAS TERÁPIAS PARA CANALOPATIAS, DOENÇAS CAUSADAS PELO FUNCIONAMENTO INCORRETO DE DETERMINADOS TIPOS DE PROTEÍNAS. Traremos uma COMPARATIVA DOS MÉTODOS COMPUTACIONAIS PARA A OBTENÇÃO DE CONSTANTES CINETICOS NO TRANSPORTE TRANSMEMBRANO DE IONES (BXD e ABAD-Sansom)._x000D_ O segundo BLOCO DE BLOQUEAMENTO centra-se nas moléculas ANTIMICROBIANAS com mecanismos disruptivos, como NANOTUBOS pépticos, CICLODEXTRINES ou ENTIDADES poliméricas. Iremos desenvolver uma base de dados baseada em simulações médicas de péptidos antimicrobianos, analisando diferentes campos de força e condições de memória: A basic and free version, for a USER to stand and another professional version for a user more specific than searching Analyses or concret systems._x000D_ in the ULTIME BLOKING WITH OTHER ANTIMICROBIAN MORE MORE WITH DIFFERENT MECHANISHES or DISCOUNTS, as AQCS or HYDROPHOBINS, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL COMPOSES AND SYINTETICAL PROCEDURES, IN THE FRAMEWORK OF INDUSTRIAL INTEREST OR A EUROPEAN ETN, RESPECTIVELY._x000D_ The present project is agreed upon in a fully interdisciplined ESCENARY IN WHERE WHERE will be an attempt to combine a COMPUTATIONAL focus, INNOVATOR IN THE CAMPO OF ANTIMICROBIAN AGENTS, WITH DIFFERENT EXPERIMENTAL COLABORATIONS OF SPECIALISED GROUPS IN THE DEVELOPMENT OF ANTIMICROBIAN molecules to NATIONAL and INTERNATIONAL LEVEL. A ABORDAGEM PROPOSTA, BASEADA NA SINERGIA ENTRE OS MÉTODOS IN-SILICO/IN-VITRO, BENEFÍCIARÁ MUITO DESTAS CENÁRIAS INTERDISCIPLINARES QUE PERMITEM PROGRESSOS SIGNIFICATIVOS NA VALIDAÇÃO DOS MÉTODOS COMPUTACIONAIS DE ENSAIO/VERIFICAÇÃO DAS PREDIÇÕES IN-SILIC. Além disso, no âmbito do Comité de Gestão do CUSTO DA AÇÃO EUROPEIA CM1306, era possível trocar informações excecionais e colaborativas entre grupos de peritos e grupos teóricos, maximizando assim o impacto das atividades de investigação da presente proposta. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
SELLES PROJEKTIS TEEME ETTEPANEKU TÖÖTADA VÄLJA STRATEEGIA ANTIMIKROOBSETE OLIGOMEERIDE RATSIONAALSEKS KUJUNDAMISEKS, MIS PÕHINEB NENDE TOIMEMEHHANISMI MÕISTMISEL MEMBRAANI TASANDIL IN-SILIK/IN-VITRO SÜNERGISTLIKUST LÄHENEMISVIISIST. SELLE LÄHENEMISVIISI EDU VÕTI ON KUJUNEMISJÄRGUS MEETODITE RAKENDAMINE: Jäme GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) ja MD, mis on seotud GPUS-iga seosega, mis võimaldaks ANTIMICROBIAN molekulide meso-ekaalsete nähtuste ja nende koostoime MEMBRANAS._x000D_ utilizandoga laiendada ilma ANTIMYROBIANi peptiidimehhanismide (AMPS) ja „INTELIGENTS“ AUTO-ENSAMBLATE molekulide (CYCLOPEPTIDid), ORGANIC molekulid, tsüklodekstriinid, polümeerid, aatomiklastrid-AQCS, (ETC) Lõplik OBJEKTIIV OBJECTIVE INFORMISE TEADMISEKS, et mitte kasutada UUUUDE ANTIBACTERIALsete AGENTide jaoks, mis vähendavad RESISTANCE TOXICITY AS APARICTION. Kolme GREAT BLOCKS DIFFERENT PRODUCTS ANTIMICROBIANs:_x000D_ uuritakse esimeses plokis me keskendume transmembraani FORING ENTITIES, nagu NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOSED BYCLOPEPTID. ME UURIME SELLE INTERAKTSIOONIMEHHANISMI MEMBRAANIGA JA TRANSPORTI LÄBI SELLE ÕÕNSUSTE. NENDE PEPTIIDIDE CG PARAMEETRID TÖÖTATAKSE VÄLJA JA NEID KASUTATAKSE BIOMIMEETILISTE NANOPOORIDENA, BIOLOOGILISTE KANALITE MUDELITENA, MIS AITAVAD KAVANDADA UUSI RAVIMEETODEID CANALOPATIASE JAOKS, HAIGUSI, MIS ON PÕHJUSTATUD TEATUD TÜÜPI VALKUDE EBAÕIGEST TOIMIMISEST. Me esitame ioonide transmembraani TRANSPORTis (BXD ja ABAD-Sansom) (BXD ja ABAD-Sansom)._x000D_2.x000D_ Teine BLOCKING BLOCLE keskendub ANTIMICROBIAN molekulidele, millel on häirivad mehhanismid, nagu peptiline NANOTUBOS, CICLODEXTRINES või polyica ENTITIES. ME TÖÖTAME VÄLJA ANDMEBAASI, MIS PÕHINEB MIKROOBIVASTASTE PEPTIIDIDE MD SIMULATSIOONIDEL, ANALÜÜSIDES ERINEVAID JÕUVÄLJASID JA MEMBRAANITINGIMUSI: Lihtne ja tasuta versioon, et kasutaja saaks seista ja teine professionaalne versioon kasutajale spetsiifilisem kui otsingu Analüüsid või concret systems._x000D_ in the ULTIME bloking WITH OTHER ANTIMICROBIAN MORE MORE WITH DIFFERENT MECHANISHES või DISCOUNTS, nagu AQCS või hüdrofoobiad, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL Koostis JA SÜINTETIKALISED, INNDUSTRIAL INTEREST VÕI EUROOPA ETN, RESPECTIVELY._x000D_Käesolevas projektis lepitakse kokku täielikult interdistsiplinaarses ESCENARIS, mille eesmärk on ühendada konkurentsivõimeline fookus, INNOVATOR ANTIMICROBIAN AGENTSIOONIDE CAMPO, WITH DIFFERENT EXPERIMENTAL colaborations of SPECIALISED GROUPS ANTIMICROBIAN molekulide arengus NATIONAL ja INTERNATIONAL LEVEL. KAVANDATUD LÄHENEMISVIIS, MIS PÕHINEB IN-SILICO/IN-VITRO MEETODITE VAHELISEL KOOSTOIMEL, SAAB PALJU KASU SELLISEST INTERDISTSIPLINAARSEST STSENAARIUMIST, MIS VÕIMALDAB TEHA MÄRKIMISVÄÄRSEID EDUSAMME ARVUTUSMEETODITE VALIDEERIMISEL, ET TESTIDA/KONTROLLIDA IN-SILIC PROGNOOSE. LISAKS OLI EUROOPA MEETMETE KORRALDUSKOMITEE CM1306 RAAMES VÕIMALIK VAHETADA ERAKORRALIST JA KOOSTÖÖPÕHIST TEAVET KATSE- JA TEOREETILISTE RÜHMADE VAHEL, MAKSIMEERIDES SEEGA KÄESOLEVA ETTEPANEKU TEADUSTEGEVUSE MÕJU. (Estonian)
18 August 2022
0 references
EBBEN A PROJEKTBEN AZ ANTIMIKROBIÁLIS OLIGOMEREK RACIONÁLIS TERVEZÉSÉRE VONATKOZÓ STRATÉGIA KIDOLGOZÁSÁT JAVASOLJUK A MEMBRÁNSZINTŰ HATÁSMECHANIZMUSUK MEGÉRTÉSE ALAPJÁN, EGY IN-SZILIC/IN-VITRO SZINERGIKUS MEGKÖZELÍTÉS ALAPJÁN. E MEGKÖZELÍTÉS SIKERÉNEK KULCSA A KIALAKULÓBAN LÉVŐ MÓDSZEREK ALKALMAZÁSA: Az ANTIMICROBIAN molekulák mezoeszkalális jelenségeinek és a MEMBRANAS-szel való kölcsönhatásuknak a GPUS-szal összekapcsolt, a GPUS-hoz kapcsolódó MOLECULAR MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) és MD MD-t kell vizsgálni._x000D_ utilizando ezt a fókuszt ANTIMYROBIAN peptidmechanizmusok (AMPS) és „INTELIGENTS” AUTO-ENSAMBLATE molekulák (CYCLOPEPTIDs, ORGANIC molekulák, ciklodextrinek, polimerek, atomklaszterek-AQCS, (ETC) a CÉLKITŰZÉSI INFORMÁCIÓK VÉGREHAJTÁSA, hogy a TOXICITY-t csökkentő új ANTIBACTERIÁLIS AGENTEKCIÓK DESIGNÁLJÁBAN felhasználhatók. Az első blokkban az ANTIMICROBIANs:_x000D_ három nagy BLOCK-ját vizsgáljuk meg a transzmembrán foring ENTITITIES-re, mint NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOSED BYCLOPEPTID. TANULMÁNYOZNI FOGJUK A MEMBRÁNNAL VALÓ KÖLCSÖNHATÁS MECHANIZMUSÁT ÉS AZ ÜREGEIN KERESZTÜL TÖRTÉNŐ SZÁLLÍTÁST. EZEKNEK A PEPTIDEKNEK A CG PARAMÉTEREIT BIOMIMETIKUS NANOPÓRUSKÉNT, BIOLÓGIAI CSATORNÁK MODELLJEKÉNT DOLGOZZÁK KI ÉS HASZNÁLJÁK, AMELYEK SEGÍTENEK A CANALOPATIAS ÚJ TERÁPIÁINAK KIALAKÍTÁSÁBAN, AMELYEK BIZONYOS FEHÉRJÉK HELYTELEN MŰKÖDÉSE ÁLTAL OKOZOTT BETEGSÉGEK. Az ionok (BXD és ABAD-Sansom) transzmembrán transzportjában lévő CINETIC CONSTANTS-ok kontúrjának összefoglalását hozjuk._x000D_ A második BLOCKING BLOCLE a diszruptív mechanizmusú ANTIMICROBIAN molekulákra összpontosít, mint például a peptikus NANOTUBOS, a CICLODEXTRINES vagy a Polyica ENTITIES. LÉTREHOZUNK EGY ADATBÁZIST AZ ANTIMIKROBIÁLIS PEPTIDEK MD SZIMULÁCIÓI ALAPJÁN, ELEMEZVE A KÜLÖNBÖZŐ ERŐMEZŐKET ÉS MEMBRÁNVISZONYOKAT: Egy egyszerű és ingyenes verzió, amely egy felhasználó számára áll, és egy másik professzionális verzió a felhasználó számára, mint elemzők vagy concret rendszerek keresése._x000D_ az ULTIME bloking más ANTIMICROBIAN MORE MORE MORE WITH DIFFERENT MECHANISHES vagy DISCOUNTS, mint AQCS vagy hidrofobinok, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL Composes AND SYINTETICAL PROCEDURES, IN the FRAMEWORK of INDUSTRIAL INTEREST OR A EURÓPAI ETN, RESPECTIVELY._x000D_ A jelen projektről egy teljesen interdiszciplinált EGYESÜLT EGYESÜLT ÖSSZEFOGLALÓ kísérletet teszünk, INNOVATOR az ANTIMIKROBIAN AGENTEK KAMPO-jában, az ANTIMIKROBIAN molekulák NEMZETKÖZI és NEMZETKÖZI FELÜGYELETI KIADÁSI KIADÁSÁBAN. AZ IN-SZILÍCIUM/IN-VITRO MÓDSZEREK KÖZÖTTI SZINERGIÁN ALAPULÓ JAVASOLT MEGKÖZELÍTÉS NAGYBAN KEDVEZ EGY ILYEN INTERDISZCIPLINÁRIS FORGATÓKÖNYVNEK, AMELY JELENTŐS ELŐRELÉPÉST TESZ LEHETŐVÉ A SZILIKUS ELŐREJELZÉSEK TESZTELÉSÉRE/ELLENŐRZÉSÉRE SZOLGÁLÓ SZÁMÍTÁSI MÓDSZEREK VALIDÁLÁSA TERÉN. EZEN TÚLMENŐEN A CM1306 EURÓPAI FELLÉPÉSI KÖLTSÉG IRÁNYÍTÓBIZOTTSÁGÁNAK RÉSZEKÉNT LEHETŐSÉG VOLT A KÍSÉRLETI ÉS ELMÉLETI CSOPORTOK KÖZÖTTI KIVÉTELES ÉS EGYÜTTMŰKÖDÉSEN ALAPULÓ INFORMÁCIÓK CSERÉJÉRE, EZÁLTAL MAXIMALIZÁLVA A JAVASLAT KUTATÁSI TEVÉKENYSÉGEINEK HATÁSÁT. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
В ТОЗИ ПРОЕКТ ПРЕДЛАГАМЕ ДА СЕ РАЗРАБОТИ СТРАТЕГИЯ ЗА РАЦИОНАЛНО ПРОЕКТИРАНЕ НА АНТИМИКРОБНИ ОЛИГОМЕРИ ВЪЗ ОСНОВА НА РАЗБИРАНЕТО НА ТЕХНИЯ МЕХАНИЗЪМ НА ДЕЙСТВИЕ НА МЕМБРАННО НИВО, ОТ СИНЕРГИЧЕН ПОДХОД IN-SILIC/IN-VITRO. КЛЮЧЪТ КЪМ УСПЕХА НА ТОЗИ ПОДХОД Е ПРИЛАГАНЕТО НА НОВОВЪЗНИКВАЩИ МЕТОДОЛОГИИ: Груби GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) и MD, свързани с GPUS към връзката, които биха позволили разширяване без прецизност на мезо-ескалните феномени на молекулите ANTIMICROBIAN и тяхното взаимодействие с MEMBRANAS._x000D_ utilizando, този фокус ще бъде изследван ANTIMYROBIAN пептидни механизми (AMPS) И „INTELIGENTS“ AUTO-ENSAMBLATE молекули (CYCLOPEPTIDs, ORGANIC молекули, циклодекстрини, полимери, атомни клъстери-AQCS, (ETC) С ОФИНАЛНА ЦЕЛЕТИВА НА ЦЕЛТИВНА ИНФОРМАЦИЯ, която може да се използва за модела на новите антибактериални аГЕНТИ, които намаляват токсикологичния ефект като апликация за възстановяване. В първия блок ще бъдат изследвани три големи блока на диференциални продукти ANTIMICROBIANs:_x000D_, като NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOSED BY CYCLOPEPTID. ЩЕ ПРОУЧИМ МЕХАНИЗМА Ѝ НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ С МЕМБРАНАТА И ТРАНСПОРТИРАНЕТО ПРЕЗ НЕЙНИТЕ КУХИНИ. CG ПАРАМЕТРИТЕ НА ТЕЗИ ПЕПТИДИ ЩЕ БЪДАТ РАЗРАБОТЕНИ И ИЗПОЛЗВАНИ КАТО БИОМИМЕТИЧНИ НАНОПОРИ, МОДЕЛИ НА БИОЛОГИЧНИ КАНАЛИ, КОИТО ЩЕ ПОМОГНАТ ЗА РАЗРАБОТВАНЕТО НА НОВИ ТЕРАПИИ ЗА CANALOPATIAS, ЗАБОЛЯВАНИЯ, ПРИЧИНЕНИ ОТ НЕПРАВИЛНОТО ФУНКЦИОНИРАНЕ НА ОПРЕДЕЛЕНИ ВИДОВЕ ПРОТЕИНИ. Ние ще представим КОНКРАТИВНА КОМПАРАТИВА НА КОМПУТАЦИОННИ МЕТОСИ ЗА НАУЧНИТЕ КОНСТАНТИ В трансмембранния ТРАНСПОРТ на йоните (BXD и ABAD-Sansom)._x000D_ Вторият БЛОКИНГ БЛОКЕН се фокусира върху АНТИМИКРОБИАНските молекули с разрушителни механизми, като пептични NANOTUBOS, CICLODEXTRINES или полимерни ENTITIES. ЩЕ РАЗРАБОТИМ БАЗА ДАННИ, БАЗИРАНА НА СИМУЛАЦИИ НА MD НА АНТИМИКРОБНИ ПЕПТИДИ, АНАЛИЗИРАЩА РАЗЛИЧНИ СИЛОВИ ПОЛЕТА И МЕМБРАННИ УСЛОВИЯ: Основна и безплатна версия, за да може ПОТРЕБИТЕЛЯ да стои и друга професионална версия за потребителя, която е по-специфична от търсенето на анализатори или бетонни системи._x000D_ в ULTIME bloking С ДРУГИ АНТИМИКРОБИРАНИ ПОВЕЧЕ ПОВЕЧЕ ПОВЕЧЕ ПОВЕЧЕ с диференциални механиши или DISCOUNTS, като AQCS или хидрофобини, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL composes and SYINTETICAL PROCEDURES, В РАМКОВАТА НА INDUSTRIAL INTEREST OR A EUROPEAN ETN, RESPECTIVELY._x000D_ Настоящият проект е договорен в напълно интердисциплинарна програма, в която ще бъде опит за комбиниране на КОМПУТАЦИОНЕН фокус, INNOVATOR В CAMPO OF ANTIMICROBIAN AGENTS, с диференциални EXPERIMENTAL colaborations OF SPECIALISED GROUPS in THE DEVELOPMENT OF ANTIMICROBIAN молекули към NATIONAL и INTERNATIONAL LEVEL. ПРЕДЛОЖЕНИЯТ ПОДХОД, ОСНОВАН НА СИНЕРГИЯ МЕЖДУ МЕТОДИТЕ IN-SILICO/IN-VITRO, ЩЕ ИМА ГОЛЯМА ПОЛЗА ОТ ТАКЪВ ИНТЕРДИСЦИПЛИНАРЕН СЦЕНАРИЙ, ПОЗВОЛЯВАЩ ЗНАЧИТЕЛЕН НАПРЕДЪК В ВАЛИДИРАНЕТО НА ИЗЧИСЛИТЕЛНИТЕ МЕТОДИ ЗА ИЗПИТВАНЕ/ПРОВЕРКА НА IN-SILIC ПРОГНОЗИ. ОСВЕН ТОВА, КАТО ЧАСТ ОТ УПРАВИТЕЛНИЯ КОМИТЕТ ПО РАЗХОДИТЕ ЗА ЕВРОПЕЙСКИ ДЕЙСТВИЯ CM1306, БЕШЕ ВЪЗМОЖНО ДА СЕ ОБМЕНЯ ИЗКЛЮЧИТЕЛНА И СЪВМЕСТНА ИНФОРМАЦИЯ МЕЖДУ ЕКСПЕРИМЕНТАЛНИ И ТЕОРЕТИЧНИ ГРУПИ, КАТО ПО ТОЗИ НАЧИН СЕ УВЕЛИЧИ МАКСИМАЛНО ВЪЗДЕЙСТВИЕТО НА НАУЧНОИЗСЛЕДОВАТЕЛСКИТЕ ДЕЙНОСТИ НА НАСТОЯЩОТО ПРЕДЛОЖЕНИЕ. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
ŠIAME PROJEKTE SIŪLOME PARENGTI RACIONALAUS ANTIMIKROBINIŲ OLIGOMERŲ PROJEKTAVIMO STRATEGIJĄ, PAGRĮSTĄ JŲ VEIKIMO MEMBRANINIU LYGMENIU MECHANIZMO SUPRATIMU, TAIKANT SINERGETINĮ POŽIŪRĮ Į SILIKĄ IR IN-VITRO. KAD ŠIS POŽIŪRIS BŪTŲ SĖKMINGAS, LABAI SVARBU TAIKYTI NAUJAS METODIKAS: Šiurkštus GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) ir MD, susietas su GPUS į ryšį, kuris leistų plėstis be ANTIMICROBIAN molekulių mezoesalinių reiškinių tikslumo ir jų sąveikos su MEMBRANAS._x000D_ utilizando šis dėmesys bus tiriamas ANTIMYROBIAN peptidų mechanizmų (AMPS) IR „INTELIGENTS“ AUTO-ENSAMBLATE molekulių (CYCLOPEPTIDs, ORGANIC molekulės, ciklodekstrinai, polimerai, atominiai klasteriai-AQCS, (ETC) su GALIOJO INFORMACIJA, KAD NAUJŲ ANTIBAKTŲ NAUJŲ ANTIBACTORIJŲ, mažinančių TOXICITYJĄ, kaip APSAUGOS APSAUGOS, DESIGN. Trys GREAT BLOCKS DIFFERENT PRODUCTS ANTIMICROBIANs:_x000D_ bus tiriamas pirmajame bloke mes sutelkti dėmesį į transmembrane FORING ENTITIES, kaip NANOTUBOS/NANOEMBUDOS KOMPOZITAS BY CYCLOPEPTID. MES IŠTIRSIME JO SĄVEIKOS SU MEMBRANA IR TRANSPORTAVIMO PER ERTMES MECHANIZMĄ. ŠIŲ PEPTIDŲ CG PARAMETRAI BUS SUKURTI IR NAUDOJAMI KAIP BIOMIMETINIAI NANOPORAI, BIOLOGINIŲ KANALŲ MODELIAI, KURIE PADĖS KURTI NAUJUS CANALOPATIAS GYDYMO BŪDUS, LIGAS, KURIAS SUKELIA NETINKAMAS TAM TIKRŲ TIPŲ BALTYMŲ VEIKIMAS. Mes pateiksime COMPARATIVE COMPARATIVE COMPUTATIONAL METHODS, skirtą CINETICROBIAN molekulėms, turinčioms jonų transmembraninį TRANSPORTą (BXD ir ABAD-Sansom)._x000D_ Antrasis „BLOCKING BLOCLE“ dėmesys sutelkiamas į ANTIMICROBIAN molekules su ardomaisiais mechanizmais, pvz., Peptikų NANOTUBOS, CICLODEXTRINES ar polimerikos ENTITIES. MES SUKURSIME DUOMENŲ BAZĘ, PAGRĮSTĄ ANTIMIKROBINIŲ PEPTIDŲ MD MODELIAVIMU, ANALIZUODAMI SKIRTINGAS JĖGOS SRITIS IR MEMBRANOS SĄLYGAS: Pagrindinė ir nemokama versija, kad vartotojas stovėtų ir kita profesionali versija vartotojui būtų konkretesnė nei ieškoti analizių ar betoninių sistemų._x000D_ ULTIME blokuodamas SU KITA ANTIMICROBIAN DAUGIAU SU PATVIRTINTA MECHANISHES ar DISCOUNTS, kaip AQCS arba hidrofobinai, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL composes and SYINTETICAL PROCEDURES, INNDUSTRIAL INTEREST ARBA EUROPOS ETN, RESPECTIVELY, RESPECTIVELY._x000D_ Dėl šio projekto susitarta visapusiškai disciplinuotame ESCENARYJE, kuriame bus bandoma sujungti bendrą dėmesį, ANTIMICROBIAN AGENTŲ KAMPO INNOVATORAS, SU PATVIRTINTA IŠLAIDŲ IŠLAIDŲ bendralaboratorija ANTIMICROBIAN molekulių vystymui į NATIONAL ir INTERNATIONAL LEVEL. SIŪLOMAS METODAS, GRINDŽIAMAS IN-SILICIO/IN-VITRO METODŲ SINERGIJA, BUS LABAI NAUDINGAS IŠ TOKIO TARPDISCIPLININIO SCENARIJAUS, KURIS LEIS PADARYTI DIDELĘ PAŽANGĄ PATVIRTINANT SKAIČIAVIMO METODUS, KAD BŪTŲ GALIMA IŠBANDYTI IR (ARBA) PATIKRINTI IN-SILIC PROGNOZES. BE TO, EUROPOS VEIKSMŲ VALDYMO KOMITETE CM1306 BUVO GALIMA KEISTIS IŠSKIRTINE IR BENDRADARBIAVIMO INFORMACIJA TARP EKSPERIMENTINIŲ IR TEORINIŲ GRUPIŲ, TAIP MAKSIMALIAI PADIDINANT ŠIO PASIŪLYMO MOKSLINIŲ TYRIMŲ VEIKLOS POVEIKĮ. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
U OVOM PROJEKTU PREDLAŽEMO RAZVOJ STRATEGIJE ZA RACIONALNO OBLIKOVANJE ANTIMIKROBNIH OLIGOMERA NA TEMELJU RAZUMIJEVANJA NJIHOVA MEHANIZMA DJELOVANJA NA RAZINI MEMBRANE, S POMOĆU IN-SILIC/IN-VITRO SINERGISTIČKOG PRISTUPA. ZA USPJEH TOG PRISTUPA KLJUČNA JE PRIMJENA NOVIH METODOLOGIJA: Grubi GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) i MD povezani s GPUS-om na nexus koji bi omogućio proširenje bez preciznosti mezo-eskalnih fenomena ANTIMICROBIAN molekula i njihovu interakciju s MEMBRANAS._x000D_ utilizando ovaj fokus će se proučavati ANTIMYROBIAN peptidni mehanizmi (AMPS) i „INTELIGENTS” AUTO-ENSAMBLATE molekule (CYCLOPEPTIDs, ORGANIC molekule, ciklodekstrini, polimeri, atomski klasteri-AQCS, (ETC) S FINALnim OBJEKTIVNIM INFORMACIJAMA da se mogu koristiti za dizajn novih ANTIBACTERIAL AGENTS koji smanjuju TOXICITY kao APARICTION RESISTANCE. Tri VELIKI BLOKOVI DIFFERENTNI PROIZVODI ANTIMICROBIANs:_x000D_ će biti istraženi na prvom bloku koji ćemo se fokusirati na transmembranske ZAJEDNICE, kao NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOSED BY CYCLOPEPTID. PROUČIT ĆEMO NJEGOV MEHANIZAM INTERAKCIJE S MEMBRANOM I TRANSPORTOM KROZ ŠUPLJINE. CG PARAMETRI TIH PEPTIDA BIT ĆE RAZVIJENI I KORIŠTENI KAO BIOMIMETIČKI NANOPORI, MODELI BIOLOŠKIH KANALA, KOJI ĆE POMOĆI U DIZAJNIRANJU NOVIH TERAPIJA ZA CANALOPATIAS, BOLESTI UZROKOVANE POGREŠNIM FUNKCIONIRANJEM ODREĐENIH VRSTA PROTEINA. U transmembranski prijevoz iona (BXD i ABAD-Sansom)._x000D_ Drugi BLOCKING BLOCLE usredotočuje se na ANTIMICROBIAN molekule s disruptivnim mehanizmima, kao što su peptički NANOTUBOS, CICLODEXTRINES ili polimerni ENTITI. RAZVIT ĆEMO BAZU PODATAKA NA TEMELJU MD SIMULACIJA ANTIMIKROBNIH PEPTIDA, ANALIZIRAJUĆI RAZLIČITA POLJA SILE I MEMBRANSKE UVJETE: Osnovna i besplatna verzija, za USER stajati i drugu profesionalnu verziju za korisnika specifičniji od pretraživanja Analyses ili concret sustava._x000D_ u ULTIME bloking S OTHER ANTIMICROBIAN VIŠE S DIFFERENT MECHANISHES ili DISCOUNTS, kao AQCS ili hydrophobins, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL sastavi I SYINTETICAL PROCEDURES, U FRAMEWORK INDUSTRIJSKI INTEREST ILI EUROPSKI ETN, RESPECTIVELY._x000D_Ovaj projekt je dogovoren u potpuno interdiscipliniranom ESCENARY U GDJE gdje će biti pokušaj kombiniranja komputencijskog fokusa, INNOVATOR U CAMPO ANTIMICROBIAN AGENTS, sa DIFFERENTNIm IZVJEŠĆAMA SPECIJALNIH GROUPS-a u DEVELOPMENT of ANTIMICROBIAN molekule na NATIONAL i INTERNATIONAL LEVEL. PREDLOŽENI PRISTUP KOJI SE TEMELJI NA SINERGIJI IZMEĐU IN-SILICO/IN-VITRO METODA UVELIKE ĆE IMATI KORISTI OD TAKVOG INTERDISCIPLINARNOG SCENARIJA KOJI ĆE OMOGUĆITI ZNATAN NAPREDAK U VALIDACIJI RAČUNALNIH METODA ZA ISPITIVANJE/PROVJERU IN-SILIC PREDVIĐANJA. OSIM TOGA, U OKVIRU UPRAVNOG ODBORA ZA TROŠKOVE EUROPSKOG DJELOVANJA CM1306, BILO JE MOGUĆE RAZMJENJIVATI IZNIMNE I SURADNIČKE INFORMACIJE IZMEĐU EKSPERIMENTALNIH I TEORIJSKIH SKUPINA, ČIME SE MAKSIMALNO POVEĆAO UČINAK ISTRAŽIVAČKIH AKTIVNOSTI OVOG PRIJEDLOGA. (Croatian)
18 August 2022
0 references
I DETTA PROJEKT FÖRESLÅR VI ATT UTVECKLA EN STRATEGI FÖR RATIONELL UTFORMNING AV ANTIMIKROBIELLA OLIGOMERER BASERAT PÅ FÖRSTÅELSEN AV DERAS VERKNINGSMEKANISM PÅ MEMBRANNIVÅ, FRÅN EN IN-SILIC/IN-VITRO SYNERGISTISK STRATEGI. EN FÖRUTSÄTTNING FÖR ATT DENNA STRATEGI SKA LYCKAS ÄR ATT NYA METODER TILLÄMPAS: Grova GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) och MD kopplade till GPUS till kopplingen som skulle möjliggöra en expansion utan precisioner av meso-escalal fenomen i ANTIMICROBIAN molekyler och deras interaktion med MEMBRANAS._x000D_ utilizando detta fokus kommer att studeras ANTIMYROBIAN peptidmekanismer (AMPS) OCH ”INTELIGENTS” AUTO-ENSAMBLATE molekyler (CYCLOPEPTID, ORGANIC molekyler, cyklodextriner, polymerer, atomkluster-AQCS, (ETC) MED FINAL OBJEKTIV AV OBJEKTIV INFORMATION som kan användas för de nya ANTIBACTERIAL AGENTS som minskar TOXICITY som APARICTION AV RESISTANCE. Tre stora BLOCKS OF DIFFERENT PRODUKTER ANTIMICROBIANs:_x000D_ kommer att undersökas vid det första blocket vi kommer att fokusera på transmembrane FORING ENTITIES, som NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOS AV CYCLOPEPTID. VI KOMMER ATT STUDERA DESS MEKANISM FÖR INTERAKTION MED MEMBRANET OCH TRANSPORT GENOM DESS HÅLRUM. CG-PARAMETRAR FÖR DESSA PEPTIDER KOMMER ATT UTVECKLAS OCH ANVÄNDAS SOM BIOMIMETISKA NANOPORER, MODELLER AV BIOLOGISKA KANALER, VILKET KOMMER ATT HJÄLPA UTFORMNINGEN AV NYA TERAPIER FÖR CANALOPATIAS, SJUKDOMAR ORSAKADE AV FELAKTIG FUNKTION AV VISSA TYPER AV PROTEINER. Vi kommer att ta med en COMPARATIVE COMPARATIVE OF COMPUTATIONAL METHODS FOR THE Obtention of CINETIC CONSTANTS I THE Transmembrane TRANSPORT of Iones (BXD och ABAD-Sansom)._x000D_ Den andra BLOCKING BLOCLE fokuserar på ANTIMICROBIAN molekyler med störande mekanismer, som peptiska NANOTUBOS, CICLODEXTRINES eller polymerica ENTITIES. VI KOMMER ATT UTVECKLA EN DATABAS BASERAD PÅ MD-SIMULERINGAR AV ANTIMIKROBIELLA PEPTIDER, SOM ANALYSERAR OLIKA KRAFTFÄLT OCH MEMBRANFÖRHÅLLANDEN: En grundläggande och fri version, för en USER att stå och en annan professionell version för en användare mer specifikt än att söka Analyser eller konkret system._x000D_ i ULTIME bloking med andra ANTIMICROBIAN MER MER MED DIFFERENT MECHANISHES eller DISCOUNTS, som AQCS eller hydrofobiner, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL komponerar och SYINTETICAL PROCEDURES, I RAMEWORK OF INDUSTRIAL INTEREST ELLER EUROPEISKA ETN, RESPECTIVELY._x000D_ Det aktuella projektet är överenskommet i en helt tvärvetenskaplig ESCENARY I där kommer att vara ett försök att kombinera ett konkurrenskraftigt fokus, INNOVATOR I KAMPOEN AV ANTIMICROBIAN AGENTS, MED DIFFERENT EXPERIMENTAL coaborations of SPECIALISED GROUPS IN THE DEVELOPMENT OF ANTIMICROBIAN molekyler to NATIONAL and INTERNATIONAL LEVEL. DET FÖRESLAGNA TILLVÄGAGÅNGSSÄTTET SOM BYGGER PÅ SYNERGI MELLAN IN-SILICO/IN-VITRO-METODER KOMMER ATT DRA STOR NYTTA AV ETT SÅDANT TVÄRVETENSKAPLIGT SCENARIO SOM MÖJLIGGÖR BETYDANDE FRAMSTEG I VALIDERINGEN AV BERÄKNINGSMETODER FÖR ATT TESTA/VERIFIERA IN-SILIC FÖRUTSÄGELSER. SOM EN DEL AV FÖRVALTNINGSKOMMITTÉN FÖR DEN EUROPEISKA ÅTGÄRDSKOSTNADEN CM1306 VAR DET DESSUTOM MÖJLIGT ATT UTBYTA EXCEPTIONELL OCH SAMARBETSINRIKTAD INFORMATION MELLAN EXPERIMENTELLA OCH TEORETISKA GRUPPER OCH PÅ SÅ SÄTT MAXIMERA EFFEKTERNA AV DETTA FÖRSLAGS FORSKNINGSVERKSAMHET. (Swedish)
18 August 2022
0 references
ÎN ACEST PROIECT PROPUNEM DEZVOLTAREA UNEI STRATEGII PENTRU PROIECTAREA RAȚIONALĂ A OLIGOMERILOR ANTIMICROBIENI, BAZATĂ PE ÎNȚELEGEREA MECANISMULUI LOR DE ACȚIUNE LA NIVEL DE MEMBRANĂ, PORNIND DE LA O ABORDARE SINERGICĂ IN-SILIC/IN-VITRO. CHEIA SUCCESULUI ACESTEI ABORDĂRI ESTE APLICAREA METODOLOGIILOR EMERGENTE: Grosiere GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) și MD legate cu GPUS la legătura care ar permite o expansiune fără precizie a fenomenelor mezo-escalale ale moleculelor ANTIMICROBIAN și interacțiunea lor cu MEMBRANAS._x000D_ utilizando acest accent va fi studiat ANTIMYROBIAN peptid mechanismes (AMPS) ȘI „INTELIGENTS” molecule AUTO-ENSAMBLATE (CYCLOPEPTID, molecule ORGANICE, ciclodextrine, polimeri, clustere atomice-AQCS, (ETC) CU OBJECTIVUL FINAL DE INFORMAȚII OBJECTIVE care pot fi utilizate pentru desfacerea unor noi AGENTI ANTIBACTERIALE care reduc TOXICITATEA CA APARICȚIA RESISTANȚEI. Trei mari BLOCKURI DE PRODUSE DIFERENTE ANTIMICROBIANS:_x000D_ vor fi investigate la primul bloc ne vom concentra pe transmembrana FORING ENTITIES, ca NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUZATE DE CYCLOPEPTID. VOM STUDIA MECANISMUL SĂU DE INTERACȚIUNE CU MEMBRANA ȘI DE TRANSPORT PRIN CAVITĂȚILE SALE. PARAMETRII CG AI ACESTOR PEPTIDE VOR FI DEZVOLTAȚI ȘI UTILIZAȚI CA NANOPORI BIOMIMETICI, MODELE DE CANALE BIOLOGICE, CARE VOR AJUTA LA PROIECTAREA DE NOI TERAPII PENTRU CANALOPATIAS, BOLI CAUZATE DE FUNCȚIONAREA INCORECTĂ A ANUMITOR TIPURI DE PROTEINE. Vom aduce un COMPARATIV COMPARATIV DE METOZIȚII COMPUTAȚIONALE PENTRU Obținerea CONSTANTELOR CINETICE ÎN TRANSPORTUL Transmembran de ioni (BXD și ABAD-Sansom)._x000D_ Al doilea BLOCKING BLOCLE se concentrează pe molecule ANTIMICROBIAN cu mecanisme disruptive, cum ar fi NANOTUBOS Peptic, CICLODEXTRINES sau polimerica ENTITIES. VOM DEZVOLTA O BAZĂ DE DATE BAZATĂ PE SIMULĂRI MD ALE PEPTIDELOR ANTIMICROBIENE, ANALIZÂND DIFERITE CÂMPURI DE FORȚĂ ȘI CONDIȚII DE MEMBRANĂ: O versiune de bază și gratuită, pentru un UTIME pentru a sta și o altă versiune profesională pentru un utilizator mai specific decât căutarea Analize sau sisteme concrete._x000D_ în bloking ULTIME CU ALTE ANTIMICROBIAN MAI MULTE MAI MULT CU MECHANISHES DIFERENT sau DISCOUNTE, ca AQCS sau hidrofobine, premii ESSENTIALE, componențe NATURALE ȘI PROCEDUSE SYINTETICE, ÎN CADRUUL INTERESTIULUI INDUSTRIAL SAU O ETN EUROPEANĂ, RESPECTIVITATE._x000D_ Prezentul proiect este convenit într-o ESCENARIE complet interdisciplinară în care aici va fi o încercare de a combina un accent COMPUTATIONAL, INNOVATOR ÎN CAMPOUL AGENȚILOR ANTIMICROBIALE, cu colaborarea EXPERIMENTALĂ DIFERENTă a GROUPSLOR SPECIALIZATE în dezvoltarea moleculelor ANTIMICROBIAN către LEVEL NATIONAL și INTERNATIONAL. ABORDAREA PROPUSĂ, BAZATĂ PE SINERGIA DINTRE METODELE IN-SILICO/IN-VITRO, VA BENEFICIA ÎN MARE MĂSURĂ DE UN ASTFEL DE SCENARIU INTERDISCIPLINAR CARE VA PERMITE REALIZAREA DE PROGRESE SEMNIFICATIVE ÎN VALIDAREA METODELOR DE CALCUL ÎN VEDEREA TESTĂRII/VERIFICĂRII PREVIZIUNILOR INSILICE. ÎN PLUS, ÎN CADRUL COMITETULUI DE GESTIONARE A COSTURILOR ACȚIUNII EUROPENE CM1306, A FOST POSIBIL SCHIMBUL DE INFORMAȚII EXCEPȚIONALE ȘI COLABORATIVE ÎNTRE GRUPURILE EXPERIMENTALE ȘI TEORETICE, MAXIMIZÂND ASTFEL IMPACTUL ACTIVITĂȚILOR DE CERCETARE ALE PREZENTEI PROPUNERI. (Romanian)
18 August 2022
0 references
V TEM PROJEKTU PREDLAGAMO RAZVOJ STRATEGIJE ZA RACIONALNO ZASNOVO PROTIMIKROBNIH OLIGOMEROV, KI TEMELJI NA RAZUMEVANJU NJIHOVEGA MEHANIZMA DELOVANJA NA MEMBRANSKI RAVNI, NA PODLAGI IN-SILICNEGA/IN-VITRO SINERGISTIČNEGA PRISTOPA. ZA USPEH TEGA PRISTOPA JE KLJUČNA UPORABA NOVIH METODOLOGIJ: Grobi GRAINED MOLECULAR DYNAMICS (CG-MD) in MD, povezani z GPUS, s povezavo, ki bi omogočila razširitev mezoeskalnih pojavov molekul ANTIMICROBIAN in njihove interakcije z MEMBRANAS._x000D_ utilizando brez natančnosti mezo-eskalnih pojavov ANTIMYROBIAN peptidnih mehanizmov (AMPS) in „INTELIGENTS“ AUTO-ENSAMBLATE molekul (CYCLOPEPTIDs, ORGANIC molekule, ciklodekstrini, polimeri, atomske grozde-AQCS, (ETC) S KONČNI OBJEKTIVE INFORMACIJE OBJEKTIVE INFORMACIJE, ki jih lahko uporabimo za razvoj novih anTIbakterskih AGENTOV, ki zmanjšujejo TOXICITY AS APARICTION RESISTANCE. V prvem bloku se bomo osredotočili na transmembranske FORING ENTITIVE, kot NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOS CYCLOPEPTID. PREUČILI BOMO NJEGOV MEHANIZEM INTERAKCIJE Z MEMBRANO IN TRANSPORT SKOZI NJENE VOTLINE. CG PARAMETRI TEH PEPTIDOV BODO RAZVITI IN UPORABLJENI KOT BIOMIMETIČNE NANOPORE, MODELI BIOLOŠKIH KANALOV, KI BODO POMAGALI PRI OBLIKOVANJU NOVIH TERAPIJ ZA CANALOPATIAS, BOLEZNI, KI JIH POVZROČA NEPRAVILNO DELOVANJE NEKATERIH VRST BELJAKOVIN. Prinesli bomo COMPARATIVE COMPARATIVE OF COMPUTATIONAL METHODS for the Obtention OF CINETIC CONSTANTS IN THE Transmembrane TRANSPORT OF ionov (BXD in ABAD-Sansom)._x000D_ Drugi BLOCKING BLOCLE se osredotoča na ANTIMIKROBIAN molekule z motečimi mehanizmi, kot so peptični NANOTUBOS, CICLODEXTRINES ali polimerične ENTITIES. RAZVILI BOMO BAZO PODATKOV, KI BO TEMELJILA NA SIMULACIJAH PROTIMIKROBNIH PEPTIDOV Z ANALIZO RAZLIČNIH SILNIH POLJ IN MEMBRANSKIH POGOJEV: Osnovna in brezplačna različica, ki omogoča, da uporabnik stoji in še ena strokovna različica za uporabnika, ki je bolj specifična od iskanja analitičnih ali konkretnih sistemov._x000D_ v ULTIME bloking Z DRUGIm ANTIMICROBIANOM VEČ VEČ Z DRUŽNIH MECHANIŠČIH ali DOVARNIH, kot AQCS ali hidrofobini, ESSENTIALNE ACEITES, NATURAL sestavlja in siINTETICAL PROCEDES, V FRAMEWORK INDUSTRIALNI INTEREST ALI EVROPSKI ETN, RESPECTIVELY._x000D_ Ta projekt je dogovorjen v popolnoma interdisciplinirani ESCENARIJA V KER bo poskus združitve COMPUTATIONAL fokus, INNOVATOR V CAMPOU ANTIMIKROBIANOV AGENTOV, Z NADZORNIH eksperimentalnimi sodelovanji SPECIALNIH GROUPS v razvoju ANTIMIKROBIANskih molekul v NATIONAL in INTERNATIONAL LEVEL. PREDLAGANI PRISTOP, KI TEMELJI NA SINERGIJI MED METODAMI IN-SILICO/IN-VITRO, BO IMEL VELIKE KORISTI OD TAKEGA INTERDISCIPLINARNEGA SCENARIJA, KI BO OMOGOČIL ZNATEN NAPREDEK PRI POTRJEVANJU RAČUNSKIH METOD ZA PRESKUŠANJE/PREVERJANJE NAPOVEDI V SILICIJU. POLEG TEGA JE BILO V OKVIRU UPRAVLJALNEGA ODBORA ZA STROŠKE EVROPSKIH UKREPOV CM1306 MOGOČE IZMENJATI IZJEMNE IN SODELOVALNE INFORMACIJE MED EKSPERIMENTALNIMI IN TEORETIČNIMI SKUPINAMI, S ČIMER JE BIL ČIM VEČJI UČINEK RAZISKOVALNIH DEJAVNOSTI TEGA PREDLOGA. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
W RAMACH TEGO PROJEKTU PROPONUJEMY OPRACOWANIE STRATEGII RACJONALNEGO PROJEKTOWANIA OLIGOMERÓW PRZECIWDROBNOUSTROJOWYCH W OPARCIU O ZROZUMIENIE ICH MECHANIZMU DZIAŁANIA NA POZIOMIE MEMBRANY, Z PODEJŚCIA SYNERGICZNEGO IN-SILIC/IN-VITRO. KLUCZEM DO SUKCESU TEGO PODEJŚCIA JEST ZASTOSOWANIE NOWYCH METOD: Grube GRAINED DYNAMICS MOLECULAR (CG-MD) i MD związane z GPUS do związku, który pozwoli na rozszerzenie bez precyzji zjawisk mezo-eskalalnych ANTIMICROBIAN molekuły i ich interakcji z MEMBRANAS._x000D_ utilizando ten nacisk zostanie zbadany ANTIMYROBIAN peptydowe mechanizmy (AMPS) I „INTELIGENTS” AUTO-ENSAMBLATE molekuły (CYCLOPEPTIDs, cząsteczki ORGANICZNE, cyklodekstryny, polimery, klastry atomowe – AQCS, (ETC) Z FINALNYM INFORMACJĄ INFORMACYJNYCH, Które mogą być wykorzystywane do projektowania nowych agentów ANTIBACTERIALNYCH, które zmniejszają TOXICITY AS APARICTION OF RESISTANCE. Trzy GREAT BLOCKI PRODUKTÓW ANTIMICROBIAN:_x000D_ zostaną zbadane w pierwszym bloku skupimy się na transmembrany FORING ENTITIES, jak NANOTUBOS/NANOEMBUDOS COMPUOS CYCLOPEPTID. ZBADAMY JEGO MECHANIZM INTERAKCJI Z MEMBRANĄ I PRZENIESIEMY SIĘ PRZEZ JEJ UBYTKI. PARAMETRY CG TYCH PEPTYDÓW ZOSTANĄ OPRACOWANE I WYKORZYSTANE JAKO NANOPORY BIOMIMETYCZNE, MODELE KANAŁÓW BIOLOGICZNYCH, KTÓRE POMOGĄ W PROJEKTOWANIU NOWYCH TERAPII DLA CANALOPATIAS, CHORÓB SPOWODOWANYCH NIEPRAWIDŁOWYM FUNKCJONOWANIEM NIEKTÓRYCH RODZAJÓW BIAŁEK. Wprowadzimy COMPARATIVE COMPARATIVE OF COMPUTATIONAL METHODS for the obtention of CINETIC CONSTANTS IN THE Transmembrane TRANSPORT OF Iones (BXD i ABAD-Sansom)._x000D_ Drugi BLOCKING BLOCLE skupia się na cząsteczkach ANTIMICROBIAN z mechanizmami zakłócającymi, takimi jak peptyczne NANOTUBOS, CICLODEXTRINES czy polimerica ENTITIES. OPRACUJEMY BAZĘ DANYCH OPARTĄ NA SYMULACJI MD PEPTYDÓW PRZECIWDROBNOUSTROJOWYCH, ANALIZUJĄC RÓŻNE POLA SIŁOWE I WARUNKI MEMBRANOWE: Wersja podstawowa i darmowa, dla UŻYTKOWNIKA do stania i inna profesjonalna wersja dla użytkownika bardziej specyficzna niż wyszukiwanie analiz lub systemów betonowych._x000D_ w ULTIME bloking Z INNYm ANTIMICROBIAN WIĘCEJ Z WIĘCEJ MECHANISHES lub DISCOUNTS, jako AQCS lub hydrofobiny, ESSENTIAL ACEITES, NATURAL Skład I PROCEDURY SYINTETICALNE, W ORAZ W FRAMACH INTERESTU PRZEMYSŁOWEGO LUB EUROPEJSKIEJ ETN, RESPECTIVELY._x000D_ Obecny projekt jest uzgodniony w pełni interdyscyplinarnej ESCENARY, gdzie będzie to próba połączenia koncentracji COMPUTATIONAL, INNOVATOR W KAMPO ANTIMICROBIAN AGENTS, Z DIFFERENT EXPERIMENTAL WSPÓŁPRACY SPECJALIZACJI GRUPÓW W Rozbudowie ANTIMICROBIAN molekuły do NATIONAL i INTERNATIONAL LEVEL. PROPONOWANE PODEJŚCIE OPARTE NA SYNERGII MIĘDZY METODAMI IN-SILICO/IN-VITRO PRZYNIESIE ZNACZNE KORZYŚCI Z TAKIEGO INTERDYSCYPLINARNEGO SCENARIUSZA UMOŻLIWIAJĄCEGO ZNACZNE POSTĘPY W ZATWIERDZANIU METOD OBLICZENIOWYCH W CELU TESTOWANIA/WERYFIKACJI PROGNOZ IN-SILIC. PONADTO W RAMACH KOMITETU ZARZĄDZAJĄCEGO DS. EUROPEJSKIEGO KOSZTU DZIAŁANIA CM1306 MOŻLIWA BYŁA WYMIANA INFORMACJI WYJĄTKOWYCH I OPARTYCH NA WSPÓŁPRACY MIĘDZY GRUPAMI DOŚWIADCZALNYMI I TEORETYCZNYMI, CO ZMAKSYMALIZOWAŁO WPŁYW DZIAŁAŃ BADAWCZYCH W RAMACH NINIEJSZEGO WNIOSKU. (Polish)
18 August 2022
0 references
Santiago de Compostela
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
CTQ2015-74621-JIN
0 references