Multicentric study of the population structure of Staphylococcus aureus, its relationship with the microbiome, pathogenic cocoonisation by P. aeruginosa and clinical situation in cystic fibrosis (Q3202696): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(Changed label, description and/or aliases in el, da, fi, mt, lv, sk, ga, cs, pt, et, hu, bg, lt, hr, sv, ro, sl, pl, nl, fr, de, it, es, and other parts: Adding translations: el, da, fi, mt, lv, sk, ga, cs, pt, et, hu, bg, lt, hr, sv, ro, sl, pl,) |
(BatchIngestion) |
||
| Property / contained in Local Administrative Unit | |||
| Property / contained in Local Administrative Unit: Madrid / rank | |||
Normal rank | |||
Revision as of 07:18, 10 June 2023
Project Q3202696 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Multicentric study of the population structure of Staphylococcus aureus, its relationship with the microbiome, pathogenic cocoonisation by P. aeruginosa and clinical situation in cystic fibrosis |
Project Q3202696 in Spain |
Statements
81,375.0 Euro
0 references
162,750.0 Euro
0 references
50.0 percent
0 references
1 January 2016
0 references
31 March 2020
0 references
FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL RAMON Y CAJAL
0 references
40°25'0.12"N, 3°42'12.89"W
0 references
28079
0 references
La colonización broncopulmonar por Pseudomonas aeruginosa condiciona el manejo del paciente con fibrosis quística (FQ). Suele estar precedida por Staphylocccus aureus que persiste (co-colonización) o es desplazado por P. aeruginosa. La colonización por S. aureus podría tener importancia en estos estadios y en la evolución posterior según el estudio multicéntrico previo PI12/00734 El proyecto actual ampliará los conocimientos de este patógeno en FQ. No se conoce la estructura poblacional de S. aureus en FQ en España, su relación con la resistencia y factores de virulencia, disfunción del operon agr (implicado en heterorresistencia y virulencia) y no hay estudios que analicen la dinámica del microbioma en las secreciones respiratorias y su implicación en diferentes estadíos (primocolonización, colonización crónica y exacerbación). En este proyecto abordará estos aspectos como objetivos. Cada Unidad de FQ (7 pediátricas y 9 de adultos), distribuidas por toda España, incluirá 12 pacientes, diferenciando el estado de colonización y características clínicas, con un seguimiento de un año. Se recogerán secreciones respiratorias y sueros de cada paciente y enviarán al centro coordinador (Hosp. Ramón y Cajal) para cultivo microbiológico, detección de patógenos, PCR-tiempo real, estudio poblacional (PFGE, MLST), caracterización de mecanismos de resistencia a antibióticos de elección en FQ y genes de virulencia y marcadores de inflamación. En 15 pacientes seleccionados, con (n=9) y sin (n=6) colonización por S. aureus, se estudiará por metagenómica (MiSeq) y bioinformática el microbioma y su dinámica de colonización de la mucosa respiratoria. Los resultados se compararán con los obtenidos en el proyecto PI12/00734 en pacientes colonizados por P. aeruginosa. Estos resultados servirán para nuevas herramientas de diagnóstico y recomendaciones clínicas en pacientes colonizados por S. aureus en FQ. (Spanish)
0 references
Bronchopulmonary colonisation by Pseudomonas aeruginosa conditions the management of the patient with cystic fibrosis (CF). It is usually preceded by Staphylocccus aureus which persists (co-colonisation) or is displaced by P. aeruginosa. Colonisation by S. aureus could be of importance in these stages and in subsequent evolution according to the previous multicenter study PI12/00734 The current project will expand the knowledge of this pathogen in CF. The population structure of S. aureus in CF in Spain is not known, its relationship with resistance and virulence factors, operon agr dysfunction (involved in hetero-resistance and virulence) and there are no studies that analyse the dynamics of the microbiome in respiratory secretions and its involvement in different stages (primocolonisation, chronic colonisation and exacerbation). In this project it will address these aspects as objectives. Each CF Unit (7 pediatrics and 9 adults), distributed throughout Spain, will include 12 patients, differentiating colonisation status and clinical characteristics, with a one-year follow-up. Respiratory secretions and serums will be collected from each patient and sent to the coordinating centre (Hosp. Ramón y Cajal) for microbiological cultivation, detection of pathogens, PCR-real time, population study (PFGE, MLST), characterisation of mechanisms of resistance to antibiotics of choice in CF and virulence genes and markers of inflammation. In 15 selected patients, with (n=9) and without (n=6) colonisation by S. aureus, the microbiome and its colonisation dynamics of the respiratory mucosa will be studied by metagenomics (MiSeq) and bioinformatics. The results will be compared with those obtained in project PI12/00734 in patients colonised by P. aeruginosa. These results will serve for new diagnostic tools and clinical recommendations in patients colonised by S. aureus in CF. (English)
13 October 2021
0 references
La colonisation bronchopulmonaire par Pseudomonas aeruginosa conditionne la prise en charge du patient atteint de fibrose kystique (CF). Elle est habituellement précédée de Staphylocccus aureus qui persiste (cocolonisation) ou est déplacée par P. aeruginosa. La colonisation par S. aureus pourrait être importante à ces stades et dans l’évolution subséquente selon l’étude multicentrique précédente PI12/00734 Le projet actuel élargira les connaissances de cet agent pathogène dans les FC. La structure de la population de S. aureus chez les CF en Espagne n’est pas connue, sa relation avec les facteurs de résistance et de virulence, la dysfonction opéron agr (impliquée dans l’hétérorésistance et la virulence) et il n’y a pas d’études qui analysent la dynamique du microbiome dans les sécrétions respiratoires et son implication à différents stades (primocolonisation, colonisation chronique et exacerbation). Dans le cadre de ce projet, il abordera ces aspects en tant qu’objectifs. Chaque unité des FC (7 enfants et 9 adultes), distribuée dans toute l’Espagne, comprendra 12 patients, différenciant l’état de colonisation et les caractéristiques cliniques, avec un suivi d’un an. Les sécrétions respiratoires et les sérums seront prélevés sur chaque patient et envoyés au centre de coordination (Hosp. Ramón y Cajal) pour la culture microbiologique, la détection d’agents pathogènes, la PCR-temps réel, l’étude des populations (PFGE, MLST), la caractérisation des mécanismes de résistance aux antibiotiques de choix dans les gènes CF et virulence et les marqueurs de l’inflammation. Chez 15 patients sélectionnés, avec (n=9) et sans colonisation (n=6) par S. aureus, le microbiome et sa dynamique de colonisation de la muqueuse respiratoire seront étudiés par la métagénomique (MiSeq) et la bioinformatique. Les résultats seront comparés à ceux obtenus dans le cadre du projet PI12/00734 chez les patients colonisés par P. aeruginosa. Ces résultats serviront à l’élaboration de nouveaux outils de diagnostic et de recommandations cliniques chez les patients colonisés par S. aureus dans les FC. (French)
5 December 2021
0 references
Bronchopulmonale Kolonisation durch Pseudomonas aeruginosa bedingt die Behandlung des Patienten mit zystischer Fibrose (CF). Es wird in der Regel von Staphylocccus aureus, der fortbesteht (Kokolonisierung) oder wird durch P. aeruginosa vertrieben. Kolonisation durch S. aureus könnte in diesen Stadien und in der anschließenden Entwicklung gemäß der vorherigen multizentrischen Studie PI12/00734 von Bedeutung sein. Das aktuelle Projekt wird das Wissen über diesen Krankheitserreger im CF erweitern. Die Populationsstruktur von S. aureus im CF in Spanien ist nicht bekannt, seine Beziehung zu Resistenz- und Virulenzfaktoren, Operaon-Agr-Dysfunktion (beteiligt an Hetero-Widerstand und Virulenz) und es gibt keine Studien, die die Dynamik des Mikrobioms in Atemsekretionen und seine Beteiligung in verschiedenen Stadien (primocolonisation, chronische Kolonisierung und Exazerbation) analysieren. In diesem Projekt wird sie diese Aspekte als Ziele behandeln. Jede CF-Einheit (7 pädiatrische und 9 Erwachsene), die in ganz Spanien verteilt wird, umfasst 12 Patienten, die den Kolonisationsstatus unterscheiden und klinische Merkmale mit einem einjährigen Follow-up. Atemsekrete und Serume werden von jedem Patienten gesammelt und in die Koordinierungsstelle (Hosp. Ramón y Cajal) für den mikrobiologischen Anbau, Nachweis von Krankheitserregern, PCR-Echtzeit, Populationsstudie (PFGE, MLST), Charakterisierung von Mechanismen der Resistenz gegen Antibiotika der Wahl in CF- und Virulenzgenen und Entzündungsmarkern. Bei 15 ausgewählten Patienten mit (n=9) und ohne (n=6) Kolonisation durch S. aureus werden das Mikrobiom und seine Kolonisationsdynamik der Atemschleimhaut durch Metagenomics (MiSeq) und Bioinformatik untersucht. Die Ergebnisse werden mit denen des Projekts PI12/00734 bei Patienten verglichen, die von P. aeruginosa kolonisiert wurden. Diese Ergebnisse dienen für neue Diagnoseinstrumente und klinische Empfehlungen bei Patienten, die von S. aureus im CF kolonisiert werden. (German)
9 December 2021
0 references
Bronchopulmonale kolonisatie door Pseudomonas aeruginosa beïnvloedt de behandeling van de patiënt met cystische fibrose (CF). Het wordt meestal voorafgegaan door Staphylocccus aureus die aanhoudt (co-kolonisatie) of wordt verplaatst door P. aeruginosa. Kolonisatie door S. aureus zou van belang kunnen zijn in deze stadia en in de daaropvolgende evolutie volgens de vorige multicenter studie PI12/00734 Het huidige project zal de kennis van dit pathogeen in CF uitbreiden. De populatiestructuur van S. aureus in CF in Spanje is niet bekend, de relatie met resistentie en virulentiefactoren, operon agr disfunctie (betrokken bij hetero-resistentie en virulentie) en er zijn geen studies die de dynamiek van het microbiome in respiratoire secreties analyseren en de betrokkenheid ervan in verschillende stadia (primocolonisatie, chronische kolonisatie en exacerbatie). In dit project zullen deze aspecten als doelstellingen worden behandeld. Elke CF-eenheid (7 kinderen en 9 volwassenen), verspreid over Spanje, omvat 12 patiënten, onderscheidende kolonisatiestatus en klinische kenmerken, met een follow-up van één jaar. Ademhalingssecreties en serums worden bij elke patiënt verzameld en naar het coördinatiecentrum gestuurd (Hosp. Ramón y Cajal) voor microbiologische teelt, detectie van pathogenen, PCR-real time, populatiestudie (PFGE, MLST), karakterisering van mechanismen van resistentie tegen antibiotica van keuze in CF en virulentiegenen en merkers van ontsteking. Bij 15 geselecteerde patiënten, met (n=9) en zonder (n=6) kolonisatie door S. aureus, zal het microbiome en de kolonisatiedynamiek van het ademhalingsslijmvlies worden onderzocht door middel van metagenomica (MiSeq) en bio-informatica. De resultaten worden vergeleken met die verkregen in project PI12/00734 bij patiënten die gekoloniseerd worden door P. aeruginosa. Deze resultaten zullen dienen voor nieuwe diagnostische hulpmiddelen en klinische aanbevelingen bij patiënten gekoloniseerd door S. aureus in CF. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Colonizzazione broncopolmonare da Pseudomonas aeruginosa condizioni di gestione del paziente con fibrosi cistica (CF). Di solito è preceduta da Staphylocccus aureus che persiste (co-colonizzazione) o viene spostata da P. aeruginosa. La colonizzazione da parte di S. aureus potrebbe essere importante in queste fasi e nella successiva evoluzione secondo il precedente studio multicentrico PI12/00734 L'attuale progetto amplierà la conoscenza di questo patogeno in CF. La struttura della popolazione di S. aureus in CF in Spagna non è nota, il suo rapporto con i fattori di resistenza e virulenza, la disfunzione operon agr (coinvolto in etero-resistenza e virulenza) e non ci sono studi che analizzano la dinamica del microbioma nelle secrezioni respiratorie e il suo coinvolgimento in diversi stadi (primocolonizzazione, colonizzazione cronica ed esacerbazione). In questo progetto affronterà questi aspetti come obiettivi. Ogni unità CF (7 pediatrica e 9 adulti), distribuita in tutta la Spagna, comprenderà 12 pazienti, differenziando lo stato di colonizzazione e le caratteristiche cliniche, con un follow-up di un anno. Le secrezioni respiratorie e i sieri saranno raccolti da ogni paziente e inviati al centro di coordinamento (Hosp. Ramón y Cajal) per la coltivazione microbiologica, individuazione di agenti patogeni, PCR-tempo reale, studio della popolazione (PFGE, MLST), caratterizzazione dei meccanismi di resistenza agli antibiotici di scelta nei geni CF e virulenza e marcatori di infiammazione. In 15 pazienti selezionati, con colonizzazione (n=9) e senza (n=6) da parte di S. aureus, il microbioma e la sua dinamica di colonizzazione della mucosa respiratoria saranno studiati da metagenomics (MiSeq) e bioinformatica. I risultati saranno confrontati con quelli ottenuti nel progetto PI12/00734 in pazienti colonizzati da P. aeruginosa. Questi risultati serviranno per nuovi strumenti diagnostici e raccomandazioni cliniche nei pazienti colonizzati da S. aureus in CF. (Italian)
16 January 2022
0 references
Βρογχοπνευμονικός αποικισμός από Pseudomonas aeruginosa παθαίνει τη διαχείριση του ασθενούς με κυστική ίνωση (CF). Προηγείται συνήθως ο Staphylocccus aureus ο οποίος παραμένει (συναποικισμός) ή εκτοπίζεται από την P. aeruginosa. Ο αποικισμός του S. aureus θα μπορούσε να είναι σημαντικός σε αυτά τα στάδια και στην επακόλουθη εξέλιξη σύμφωνα με την προηγούμενη πολυκεντρική μελέτη PI12/00734 Το τρέχον έργο θα επεκτείνει τη γνώση αυτού του παθογόνου στο CF. Η πληθυσμιακή δομή του S. aureus στο CF στην Ισπανία δεν είναι γνωστή, η σχέση του με παράγοντες αντίστασης και λοιμογόνου δύναμης, η δυσλειτουργία operon agr (που εμπλέκεται σε ετερο-αντίσταση και λοιμογόνος δράση) και δεν υπάρχουν μελέτες που να αναλύουν τη δυναμική του μικροβιώματος στις αναπνευστικές εκκρίσεις και τη συμμετοχή του σε διάφορα στάδια (primocolonization, χρόνιο αποικισμό και εκτομή). Σε αυτό το έργο θα αντιμετωπίσει αυτές τις πτυχές ως στόχους. Κάθε μονάδα CF (7 παιδιατρική και 9 ενήλικες), κατανεμημένη σε όλη την Ισπανία, θα περιλαμβάνει 12 ασθενείς, διαφοροποιώντας την κατάσταση αποικισμού και τα κλινικά χαρακτηριστικά, με παρακολούθηση ενός έτους. Οι αναπνευστικές εκκρίσεις και οι οροί θα συλλέγονται από κάθε ασθενή και θα αποστέλλονται στο συντονιστικό κέντρο (Hosp. Ramón y Cajal) για μικροβιολογική καλλιέργεια, ανίχνευση παθογόνων παραγόντων, PCR-πραγματικό χρόνο, μελέτη πληθυσμού (PFGE, MLST), χαρακτηρισμός μηχανισμών αντοχής στα αντιβιοτικά επιλογής σε CF και λοιμογόνου γονιδίων και δεικτών φλεγμονής. Σε 15 επιλεγμένους ασθενείς, με (n=9) και χωρίς (n=6) αποικισμό από τον S. aureus, το μικροβιομέτρο και η δυναμική αποικισμού του αναπνευστικού βλεννογόνου θα μελετηθούν με τη μεταγεωμική (MiSeq) και τη βιοπληροφορική. Τα αποτελέσματα θα συγκριθούν με τα αποτελέσματα του έργου PI12/00734 σε ασθενείς που αποικίστηκαν από την P. aeruginosa. Τα αποτελέσματα αυτά θα χρησιμεύσουν για νέα διαγνωστικά εργαλεία και κλινικές συστάσεις σε ασθενείς που αποικίζονται από το S. aureus σε CF. (Greek)
18 August 2022
0 references
Bronchopulmonal kolonisering af Pseudomonas aeruginosa betingelser behandlingen af patienten med cystisk fibrose (CF). Det indledes normalt med Staphylocccus aureus, som fortsætter (kolonisering) eller forskydes af P. aeruginosa. Kolonisering af S. aureus kan være af betydning i disse faser og i efterfølgende evolution i henhold til den tidligere multicenter undersøgelse PI12/00734 Det nuværende projekt vil udvide kendskabet til dette patogen i CF. Befolkningsstrukturen af S. aureus i CF i Spanien er ikke kendt, dets forhold til resistens og virulens faktorer, operon agr dysfunktion (involveret i hetero-resistens og virulens), og der er ingen undersøgelser, der analyserer dynamikken i mikrobiomet i respiratoriske sekreter og dets involvering i forskellige stadier (primokolonisering, kronisk kolonisering og forværring). I dette projekt vil det behandle disse aspekter som mål. Hver CF Unit (7 pædiatri og 9 voksne), fordelt over hele Spanien, vil omfatte 12 patienter, differentierende kolonisering status og kliniske karakteristika, med en et-årig opfølgning. Åndedrætssekreter og serum indsamles fra hver patient og sendes til koordinationscentret (Hosp. Ramón y Cajal) til mikrobiologisk dyrkning, påvisning af patogener, PCR-realtid, populationsundersøgelse (PFGE, MLST), karakterisering af mekanismer for resistens over for foretrukne antibiotika i CF- og virulensgener og markører for inflammation. Hos 15 udvalgte patienter med (n=9) og uden (n=6) kolonisering af S. aureus vil mikrobiomet og dets koloniseringsdynamik i åndedrætsslimhinden blive undersøgt ved metagenomik (MiSeq) og bioinformatik. Resultaterne vil blive sammenlignet med resultaterne i projekt PI12/00734 hos patienter, der er koloniseret af P. aeruginosa. Disse resultater vil tjene til nye diagnostiske værktøjer og kliniske anbefalinger hos patienter, der er koloniseret af S. aureus i CF. (Danish)
18 August 2022
0 references
Pseudomonas aeruginosa -bakteerin aiheuttama bronkopulmonaalinen kolonisaatio aiheuttaa kystistä fibroosia (CF) sairastavan potilaan hoidon. Sitä edeltää yleensä Staphylocccus aureus, joka jatkuu (kolonisaatio) tai P. aeruginosa syrjäyttää sen. S. aureuksen kolonisaatio voisi olla tärkeää näissä vaiheissa ja sen jälkeisessä kehityksessä edellisen monikeskustutkimuksen PI12/00734 mukaan. Nykyinen hanke laajentaa tämän taudinaiheuttajan tuntemusta CF: ssä. S. aureuksen väestörakennetta CF: ssä Espanjassa ei tunneta, sen suhdetta resistenssi- ja virulenssitekijöihin, operon agr – toimintahäiriöitä (jotka liittyvät heteroresistenssiin ja virulenssiin) eikä ole olemassa tutkimuksia, joissa analysoidaan mikrobiomin dynamiikkaa hengitystieerityksissä ja sen osallistumista eri vaiheisiin (primokolonisaatio, krooninen kolonisaatio ja paheneminen). Tässä hankkeessa komissio käsittelee näitä näkökohtia tavoitteina. Kuhunkin CF-yksikköön (7 pediatrista ja 9 aikuista), jotka jakautuvat eri puolilla Espanjaa, kuuluu 12 potilasta, jotka eriyttävät kolonisaation tilan ja kliiniset ominaisuudet ja joiden seuranta on yksi vuosi. Hengityseritteet ja seerumit kerätään jokaiselta potilaalta ja lähetetään koordinointikeskukseen (Hosp. Ramón y Cajal) mikrobiologiseen viljelyyn, patogeenien havaitsemiseen, PCR-reaaliaikaan, populaatiotutkimukseen (PFGE, MLST), valikoitujen antibioottiresistenssimekanismien karakterisointi CF:ssä ja virulenssigeeneissä ja tulehduksen merkkiaineissa. 15:llä valitulla potilaalla (n=9) ja ilman (n=6) S. aureuksen kolonisaatiota mikrobiomia ja sen hengityslimakalvon kolonisaatiodynamiikkaa tutkitaan metagenomiikalla (MiSeq) ja bioinformatiikalla. Tuloksia verrataan P. aeruginosan kolonisoimilla potilailla saatuihin tuloksiin PI12/00734-hankkeessa. Nämä tulokset palvelevat uusia diagnostisia työkaluja ja kliinisiä suosituksia potilailla, jotka S. aureus kolonisoi CF: ssä. (Finnish)
18 August 2022
0 references
Il-kolonizzazzjoni bronkopulmonari minn Pseudomonas aeruginosa tikkundizzjona l-ġestjoni tal-pazjent b’fibrożi ċistika (CF). Normalment jiġi preċedut minn Staphylocccus aureus li jippersisti (kokolonizzazzjoni) jew jiġi spostat minn P. aeruginosa. Il-kolonizzazzjoni minn S. aureus tista’ tkun ta’ importanza f’dawn l-istadji u fl-evoluzzjoni sussegwenti skont l-istudju preċedenti multiċentriku PI12/00734 Il-proġett attwali se jespandi l-għarfien ta’ dan il-patoġenu fis-CF. L-istruttura tal-popolazzjoni ta’ S. aureus f’CF fi Spanja mhijiex magħrufa, ir-relazzjoni tagħha ma’ fatturi ta’ reżistenza u virulenza, disfunzjoni tal-operona agr (involuta f’etero-reżistenza u virulenza) u ma hemm l-ebda studji li janalizzaw id-dinamika tal-mikrobijoma fit-tnixxijiet respiratorji u l-involviment tiegħu fi stadji differenti (primokononizzazzjoni, kolonizzazzjoni kronika u taħrix). F’dan il-proġett se tindirizza dawn l-aspetti bħala objettivi. Kull unità CF (7 pedjatriċi u 9 adulti), imqassma fi Spanja, se tinkludi 12-il pazjent, li jiddifferenzjaw l-istat ta’ kolonizzazzjoni u l-karatteristiċi kliniċi, b’segwitu ta’ sena. Sekrezzjonijiet respiratorji u serums jinġabru minn kull pazjent u jintbagħtu liċ-ċentru ta’ koordinazzjoni (Hosp. Ramón y Cajal) għall-kultivazzjoni mikrobijoloġika, id-detezzjoni ta’ patoġeni, il-PCR-time real time, l-istudju dwar il-popolazzjoni (PFGE, MLST), il-karatterizzazzjoni tal-mekkaniżmi ta’ reżistenza għall-antibijotiċi tal-għażla fis-CF u l-ġeni ta’ virulenza u l-markaturi tal-infjammazzjoni. Fi 15-il pazjent magħżul, bi (n=9) u mingħajr (n=6) kolonizzazzjoni minn S. aureus, il-mikrobijoma u d-dinamika tal-kolonizzazzjoni tal-mukoża respiratorja se jiġu studjati permezz ta’ metaġenomiċi (MiSeq) u bijoinformatika. Ir-riżultati se jitqabblu ma’ dawk miksuba fil-proġett PI12/00734 f’pazjenti kolonizzati minn P. aeruginosa. Dawn ir-riżultati se jservu għal għodod dijanjostiċi ġodda u rakkomandazzjonijiet kliniċi f’pazjenti kolonizzati minn S. aureus f’CF. (Maltese)
18 August 2022
0 references
Bronhopulmonāra kolonizācija Pseudomonas aeruginosa dēļ, ārstējot pacientu ar cistisko fibrozi (CF). Pirms tā parasti ir Staphylocccus aureus, kas saglabājas (kolonizācija) vai ir pārvietots ar P. aeruginosa. S. aureus kolonizācija varētu būt svarīga šajos posmos un turpmākajā attīstībā saskaņā ar iepriekšējo daudzcentru pētījumu PI12/00734 Pašreizējais projekts paplašinās zināšanas par šo patogēnu CF. S. aureus populācijas struktūra CF Spānijā nav zināma, tās saistība ar rezistences un virulences faktoriem, operona agr disfunkcija (saistīta ar heterorezistenci un virulenci) un nav pētījumu, kas analizētu mikrobioma dinamiku elpošanas izdalījumos un tā iesaisti dažādos posmos (primokolonizācija, hroniska kolonizācija un paasinājums). Šajā projektā šie aspekti tiks aplūkoti kā mērķi. Katrā KF vienībā (7 pediatrijā un 9 pieaugušajiem), kas izplatīta visā Spānijā, būs 12 pacienti, kas atšķir kolonizācijas statusu un klīniskos raksturlielumus, ar viena gada novērošanas periodu. Elpošanas sekrēcijas un serumi tiks savākti no katra pacienta un nosūtīti uz koordinācijas centru (Hosp. Ramón y Cajal) mikrobioloģiskai audzēšanai, patogēnu noteikšanai, PCR reāllaikam, populācijas pētījumam (PFGE, MLST), rezistences pret antibiotikām mehānismu raksturošanai CF un virulences gēnos un iekaisuma marķieros. 15 izvēlētiem pacientiem ar (n=9) un bez (n=6) kolonizācijas ar S. aureus mikrobiomu un tā kolonizācijas dinamiku elpošanas gļotādā pētīs metagenomika (MiSeq) un bioinformātika. Rezultāti tiks salīdzināti ar rezultātiem, kas iegūti projektā PI12/00734 pacientiem, kurus kolonizēja P. aeruginosa. Šie rezultāti kalpos jauniem diagnostikas instrumentiem un klīniskiem ieteikumiem pacientiem, kurus kolonizē S. aureus CF. (Latvian)
18 August 2022
0 references
Bronchopulmonárna kolonizácia liekom Pseudomonas aeruginosa podmieňuje liečbu pacienta s cystickou fibrózou (CF). Zvyčajne predchádza Staphyloccus aureus, ktorý pretrváva (kokolonizácia) alebo je premiestnený P. aeruginosa. Kolonizácia S. aureus by mohla byť dôležitá v týchto štádiách a následnej evolúcii podľa predchádzajúcej multicentrickej štúdie PI12/00734 Súčasný projekt rozšíri vedomosti o tomto patogéne v CF. Štruktúra populácie S. aureus v CF v Španielsku nie je známa, jeho vzťah s rezistenciou a virulenciou, dysfunkcia operónu agr (zapojená do heterorezistencie a virulencie) a neexistujú žiadne štúdie, ktoré analyzujú dynamiku mikrobiómu v respiračných sekrétoch a jeho zapojenie do rôznych štádií (primocolonizácia, chronická kolonizácia a exacerbácia). V tomto projekte sa bude zaoberať týmito aspektmi ako cieľmi. Každá jednotka CF (7 pediatrie a 9 dospelých), distribuovaná v celom Španielsku, bude zahŕňať 12 pacientov, rozlišujúci stav kolonizácie a klinické charakteristiky, s jednoročným sledovaním. Respiračné sekréty a séra sa odoberajú od každého pacienta a posielajú sa do koordinačného centra (Hosp. Ramón y Cajal) na mikrobiologické pestovanie, zisťovanie patogénov, PCR v reálnom čase, populačná štúdia (PFGE, MLST), charakterizácia mechanizmov rezistencie na antibiotiká výberu v génoch CF a virulencii a markery zápalu. U 15 vybraných pacientov s (n=9) a bez (n=6) kolonizácie S. aureus sa mikrobióm a jeho kolonizačná dynamika respiračnej sliznice budú skúmať metagenomikami (MiSeq) a bioinformatikami. Výsledky sa porovnajú s výsledkami získanými v projekte PI12/00734 u pacientov kolonizovaných P. aeruginosa. Tieto výsledky budú slúžiť pre nové diagnostické nástroje a klinické odporúčania u pacientov kolonizovaných S. aureus v CF. (Slovak)
18 August 2022
0 references
Coilíneacht bhronchopulmonary ag coinníollacha Pseudomonas aeruginosa chun an t-othar a bhainistiú le fiobróis chisteach (CF). De ghnáth, bíonn Staphylocccus aureus ann a mhaireann (comhchoilíniú) nó a easáitítear P. aeruginosa. D’fhéadfadh Coilíniú ag S. aureus a bheith tábhachtach sna céimeanna seo agus in éabhlóid ina dhiaidh sin de réir an staidéir multicenter roimhe seo PI12/00734 Cuirfidh an tionscadal reatha eolas ar an bpataigin seo i CF. Ní fios struchtúr daonra S. aureus sa CF sa Spáinn, a ghaol le fachtóirí friotaíochta agus nimhneachta, mífheidhmiú agr operon (a bhí páirteach i hetero-fhriotaíocht agus nimhneacht) agus níl aon staidéir ann a dhéanann anailís ar dhinimic an mhicreabhithóm i secretions riospráide agus a rannpháirtíocht i gcéimeanna éagsúla (primocolonization, coilíniú ainsealach agus géarú). Sa tionscadal seo, tabharfaidh sé aghaidh ar na gnéithe sin mar chuspóirí. Áireofar ar gach Aonad CC (7 bpéidiatraic agus 9 nduine fásta), a dháilfear ar fud na Spáinne, 12 othar, lena ndéanfar idirdhealú idir stádas coilínithe agus tréithe cliniciúla, agus déanfar obair leantach bliana ina dhiaidh sin. Baileofar táil riospráide agus séirim ó gach othar agus seolfar chuig an ionad comhordaithe iad (Hosp. Ramón y Cajal) le haghaidh saothrú micribhitheolaíoch, brath pataiginí, PCR-fíor-am, staidéar daonra (PFGE, MLST), tréithriú meicníochtaí friotaíochta in aghaidh antaibheathaigh rogha i CF agus géine virulence agus marcóirí athlasadh. I 15 othair roghnaithe, le (n = 9) agus gan (n = 6) coilíniú ag S. aureus, beidh an microbiome agus a dinimic coilíniú an mhúcóis riospráide a staidéar ag metagenomics (MiSeq) agus bioinformatics. Cuirfear na torthaí i gcomparáid leis na torthaí a fuarthas i dtionscadal PI12/00734 in othair atá coilínithe ag P. aeruginosa. Fónfaidh na torthaí seo d’uirlisí diagnóiseacha nua agus do mholtaí cliniciúla in othair atá coilínithe ag S. aureus in CF. (Irish)
18 August 2022
0 references
Bronchopulmonální kolonizace Pseudomonas aeruginosa stavuje léčbu pacienta s cystickou fibrózou (CF). Obvykle mu předchází Staphylocccus aureus, který přetrvává (spolukolonizace) nebo je vysídlen P. aeruginosa. Kolonizace S. aureus by mohla být důležitá v těchto fázích a v následném vývoji podle předchozí multicentrické studie PI12/00734 Současný projekt rozšíří znalosti tohoto patogenu v CF. Populační struktura S. aureus v CF ve Španělsku není známa, jeho vztah k rezistenci a virulence faktory, operon agr dysfunkce (zapojený do hetero rezistence a virulence) a neexistují studie, které by analyzovaly dynamiku mikrobiomu v respiračních sekrecích a jeho zapojení do různých stádií (primocolonizace, chronická kolonizace a exacerbace). V rámci tohoto projektu bude tyto aspekty řešit jako cíle. Každá jednotka CF (7 pediatrů a 9 dospělých), která je distribuována po celém Španělsku, bude zahrnovat 12 pacientů, kteří rozlišují stav kolonizace a klinické charakteristiky, s ročním sledováním. Respirační sekrece a séra budou shromážděny od každého pacienta a odeslány do koordinačního centra (Hosp. Ramón y Cajal) pro mikrobiologické kultivace, detekce patogenů, PCR-reálný čas, populační studie (PFGE, MLST), charakterizace mechanismů rezistence na antibiotika zvolená v CF a virulence genů a markerů zánětu. U 15 vybraných pacientů s (n=9) a bez (n=6) kolonizace S. aureus bude mikrobiom a jeho kolonizační dynamika respirační sliznice zkoumána pomocí metagenomiky (MiSeq) a bioinformatiky. Výsledky budou porovnány s výsledky získanými v rámci projektu PI12/00734 u pacientů kolonizovaných P. aeruginosa. Tyto výsledky budou sloužit pro nové diagnostické nástroje a klinická doporučení u pacientů kolonizovaných S. aureus v CF. (Czech)
18 August 2022
0 references
A colonização broncopulmonar por Pseudomonas aeruginosa condiciona o manejo do paciente com fibrose cística (CF). Geralmente é precedida por Staphylocccus aureus que persiste (colonização) ou é deslocado por P. aeruginosa. A colonização por S. aureus poderia ser importante nessas etapas e na evolução subsequente de acordo com o estudo multicêntrico anterior PI12/00734 O projeto atual ampliará o conhecimento desse patógeno na FC. A estrutura populacional de S. aureus na FC na Espanha não é conhecida, sua relação com fatores de resistência e virulência, disfunção operon agr (envolvida em heterorresistência e virulência) e não há estudos que analisem a dinâmica do microbioma nas secreções respiratórias e seu envolvimento em diferentes estágios (primocolonização, colonização crônica e exacerbação). Neste projeto, abordará estes aspetos como objetivos. Cada unidade de FC (7 pediatria e 9 adultos), distribuída em toda a Espanha, incluirá 12 pacientes, diferenciando o estado de colonização e características clínicas, com um seguimento de um ano. As secreções respiratórias e os soros serão recolhidos de cada doente e enviados para o centro de coordenação (Hosp. Ramón y Cajal) para cultivo microbiológico, deteção de patógenos, PCR-tempo real, estudo populacional (PFGE, MLST), caracterização de mecanismos de resistência a antibióticos de escolha em genes de FC e virulência e marcadores de inflamação. Em 15 pacientes selecionados, com (n=9) e sem (n=6) colonização por S. aureus, o microbiome e sua dinâmica de colonização da mucosa respiratória serão estudados por metagenômica (MiSeq) e bioinformática. Os resultados serão comparados com os obtidos no projeto PI12/00734 em pacientes colonizados por P. aeruginosa. Esses resultados servirão para novas ferramentas diagnósticas e recomendações clínicas em pacientes colonizados por S. aureus em FC. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
Bronhopulmonaalne koloniseerimine Pseudomonas aeruginosa poolt takistab tsüstilise fibroosiga (CF) patsiendi ravi. Tavaliselt eelneb sellele Staphylocccus aureus, mis püsib (kaaskolonisatsioon) või on P. aeruginosa poolt nihkunud. S. aureuse kolonisatsioon võib olla oluline nendes etappides ja hilisemas arengus vastavalt eelmisele mitmekeskuselisele uuringule PI12/00734 Käesolev projekt laiendab teadmisi selle patogeeni kohta CFis. S. aureuse populatsiooni struktuur CFis Hispaanias ei ole teada, selle seos resistentsuse ja virulentsuse teguritega, operooni agr düsfunktsioon (hõlmab heteroresistentsust ja virulentsust) ning puuduvad uuringud, mis analüüsiksid mikrobioomi dünaamikat hingamisteede sekreedides ja selle kaasatust erinevates staadiumides (primmokolonisatsioon, krooniline kolonisatsioon ja ägenemine). Käesolevas projektis käsitletakse neid aspekte eesmärkidena. Igas CFi üksuses (7 pediaatriat ja 9 täiskasvanut), mis paiknevad kogu Hispaanias, kuulub 12 patsienti, eristades kolonisatsioonistaatust ja kliinilisi omadusi üheaastase järelkontrolliga. Respiratoorsed sekreedid ja seerumid kogutakse igalt patsiendilt ja saadetakse koordineerimiskeskusesse (Hosp. Ramón y Cajal) mikrobioloogilise kasvatamise, patogeenide tuvastamise, PCR-reaalse aja, populatsiooni uuringu (PFGE, MLST), CF- resistentsuse mehhanismide iseloomustamise ning virulentsuse geenide ja põletikumarkerite puhul. 15 valitud patsiendil, kellel (n=9) ja ilma (n=6) koloniseerimiseta S. aureus, uuritakse mikrobioomi ja selle kolonisatsioonidünaamikat hingamisteede limaskestas metagenoomika (MiSeq) ja bioinformaatika abil. Tulemusi võrreldakse P. aeruginosa koloniseeritud patsientidel projekti PI12/00734 tulemustega. Neid tulemusi kasutatakse uute diagnostikavahendite ja kliiniliste soovituste jaoks S. aureus’e koloniseeritud patsientidel CFis. (Estonian)
18 August 2022
0 references
A Pseudomonas aeruginosa bronchopulmonalis kolonizációja a cisztás fibrózisban (CF) szenvedő beteg kezelését feltételezi. Általában Staphylocccus aureus előzi meg, amely megmarad (társkolonizáció) vagy a P. aeruginosa váltja ki. Az S. aureus által végzett kolonizáció fontos lehet ezekben a szakaszokban és az azt követő evolúcióban a PI12/00734 előző multicentrikus tanulmány szerint. A jelenlegi projekt bővíti a kórokozó tudását a CF-ben. A spanyolországi S. aureus populációszerkezete nem ismert, a rezisztencia és a virulencia tényezőivel való kapcsolata, az operon agr diszfunkció (amely a heterorezisztenciában és a virulenciában nyilvánul meg), és nincsenek olyan tanulmányok, amelyek a mikrobióm dinamikáját elemzik a légzőszervi szekréciókban és annak különböző szakaszaiban való részvételét (primokolizáció, krónikus kolonizáció és súlyosbodás). Ebben a projektben ezeket a szempontokat célként fogja kezelni. Minden Spanyolországban elosztott CF egység (7 gyermekgyógyászati és 9 felnőtt) 12 betegből áll, megkülönböztetve a kolonizációs státuszt és a klinikai jellemzőket, egyéves követéssel. A légzőszervi váladékokat és szérumokat minden betegtől összegyűjtik és elküldik a koordinációs központba (Hosp. Ramón y Cajal) mikrobiológiai termesztéshez, kórokozók kimutatásához, PCR-valós időhöz, populációs vizsgálathoz (PFGE, MLST), az antibiotikumokkal szembeni rezisztencia mechanizmusainak jellemzéséhez a CF-ben és a virulenciagénekben és a gyulladás markereiben. 15 kiválasztott betegnél (n=9) és anélkül (n=6) az S. aureus kolonizációja mellett a mikrobiómot és a légző nyálkahártya kolonizációs dinamikáját metagenomikával (MiSeq) és bioinformatikával fogják vizsgálni. Az eredményeket összehasonlítják a P. aeruginosa által kolonizált PI12/00734 projekt eredményeivel. Ezek az eredmények új diagnosztikai eszközökre és klinikai ajánlásokra szolgálnak az S. aureus által CF-ben kolonizált betegek esetében. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
Бронхопулмоналната колонизация чрез Pseudomonas aeruginosa повлиява лечението на пациента с кистозна фиброза (КФ). Обикновено се предхожда от Staphylocccus aureus, който продължава (коколонизация) или се измества от P. aeruginosa. Колонизацията от S. aureus може да бъде от значение в тези етапи и в последващата еволюция според предишното многоцентрово проучване PI12/00734 Настоящият проект ще разшири познанията за този патоген в КФ. Популационната структура на S. aureus в CF в Испания не е известна, връзката му с факторите на резистентност и вирулентност, operon agr дисфункция (включваща хетероустойчивост и вирулентност) и няма проучвания, които да анализират динамиката на микробиома в респираторните секрети и неговото участие в различни етапи (примоколонизация, хронична колонизация и обостряне). В рамките на този проект тези аспекти ще бъдат разгледани като цели. Всяко отделение по КФ (7 педиатрия и 9 възрастни), разпределени в Испания, ще включва 12 пациенти, различаващи се колонизационния статус и клиничните характеристики, с едногодишно проследяване. Респираторните секрети и серуми се събират от всеки пациент и се изпращат в координационния център (Hosp. Ramón y Cajal) за микробиологично култивиране, откриване на патогени, PCR-реално време, проучване на популацията (PFGE, MLST), характеризиране на механизмите на резистентност към антибиотици по избор в CF и вирулентните гени и маркери на възпалението. При 15 избрани пациенти с (n=9) и без (n=6) колонизация от S. aureus микробиомът и неговата колонизация на дихателната лигавица ще бъдат проучени чрез метагеномия (MiSeq) и биоинформатика. Резултатите ще бъдат сравнени с тези, получени по проект PI12/00734 при пациенти, колонизирани от P. aeruginosa. Тези резултати ще послужат за нови диагностични инструменти и клинични препоръки при пациенти, колонизирани от S. aureus при КФ. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
Pseudomonas aeruginosa atliekama bronchopulmoninė kolonizacija sutrikdo cistine fibroze (CF) sergančių pacientų gydymą. Prieš jį paprastai būna Staphylocccus aureus, kuris išlieka (kolonizacija) arba yra perkeltas P. aeruginosa. S. aureus kolonizacija gali būti svarbi šiose stadijose ir vėlesnėje evoliucijoje pagal ankstesnį daugiacentrį tyrimą PI12/00734 Dabartinis projektas išplės žinias apie šį patogeną CF. S. aureus populiacijos struktūra CF Ispanijoje nežinoma, jo ryšys su atsparumo ir virulentiškumo faktoriais, operono agr disfunkcija (susijusi su heteroatsparumu ir virulentiškumu) ir nėra tyrimų, kurie analizuotų mikrobiomo dinamiką kvėpavimo sekrecijose ir jos dalyvavimą skirtinguose etapuose (primokolonizacija, lėtinė kolonizacija ir paūmėjimas). Šiame projekte šie aspektai bus nagrinėjami kaip tikslai. Kiekvienas CF vienetas (7 pediatrai ir 9 suaugusieji), platinamas visoje Ispanijoje, apima 12 pacientų, diferencijuojant kolonizacijos būklę ir klinikinius požymius, po vienerių metų stebėjimo. Kvėpavimo išskyros ir serumai bus renkami iš kiekvieno paciento ir siunčiami į koordinavimo centrą (Hosp. Ramón y Cajal) mikrobiologiniam auginimui, patogenų nustatymui, PGR realiuoju laiku, populiacijos tyrimui (PFGE, MLST), pasirinkto atsparumo antibiotikams mechanizmų apibūdinimui CF ir virulentiškumo genams bei uždegimo žymenims. 15 atrinktų pacientų, kuriems (n=9) ir be (n=6) kolonizacijos S. aureus atliekama kolonizacija, kvėpavimo takų gleivinės mikrobiomas ir jos kolonizacijos dinamika bus tiriami atliekant metagenomiką (MiSeq) ir bioinformatiką. Rezultatai bus lyginami su projekto PI12/00734 rezultatais pacientams, kuriuos kolonizavo P. aeruginosa. Šie rezultatai bus naudojami naujoms diagnostikos priemonėms ir klinikinėms rekomendacijoms pacientams, kolonizuotiems S. aureus CF. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
Bronhopulmonarna kolonizacija Pseudomonas aeruginosa uvjetuje liječenje bolesnika s cističnom fibrozom (CF). Njemu obično prethodi Staphylocccus aureus koji i dalje traje (kolonizacija) ili ga je P. aeruginosa premjestio. Kolonizacija S. aureusa mogla bi biti važna u tim fazama i u kasnijoj evoluciji prema prethodnom multicentričnom istraživanju PI12/00734 Trenutni projekt proširit će znanje o ovom patogenu u CF-u. Populacijska struktura S. aureusa u CF-u u Španjolskoj nije poznata, njegov odnos s čimbenicima otpornosti i virulencije, disfunkcija operon agr (uključena u hetero-otpornost i virulencije) i ne postoje studije koje analiziraju dinamiku mikrobioma u respiratornim izlučevinama i njegovu uključenost u različitim fazama (primokolonizacija, kronična kolonizacija i pogoršanje). U okviru ovog projekta razmotrit će se ti aspekti kao ciljevi. Svaka jedinica CF (7 pedijatrija i 9 odraslih osoba), raspoređena u cijeloj Španjolskoj, uključivat će 12 bolesnika, razlikujući status kolonizacije i kliničke karakteristike, uz jednogodišnje praćenje. Izlučevine dišnih putova i serumi bit će prikupljeni od svakog bolesnika i poslani u koordinacijski centar (Hosp. Ramón y Cajal) za mikrobiološki uzgoj, otkrivanje patogena, PCR-stvarno vrijeme, populacijsko ispitivanje (PFGE, MLST), karakterizaciju mehanizama rezistencije na antibiotike izbora u CF-u i genima virulencije te markere upale. U 15 odabranih bolesnika, s (n=9) i bez (n=6) kolonizacije pomoću S. aureusa, mikrobiom i njegova dinamika kolonizacije respiratorne sluznice proučavat će se metagenomijom (MiSeq) i bioinformatikom. Rezultati će se usporediti s onima dobivenima u projektu PI12/00734 u bolesnika koloniziranih P. aeruginosa. Ovi rezultati poslužit će za nove dijagnostičke alate i kliničke preporuke u bolesnika koje je S. aureus kolonizirao u CF-u. (Croatian)
18 August 2022
0 references
Bronkopulmonell kolonisering av Pseudomonas aeruginosa villkorar behandlingen av patienten med cystisk fibros (CF). Det föregås vanligtvis av Staphylocccus aureus som kvarstår (kolonisering) eller förskjuts av P. aeruginosa. Kolonisering av S. aureus kan vara av betydelse i dessa skeden och i efterföljande evolution enligt den tidigare multicenterstudien PI12/00734 Det nuvarande projektet kommer att utöka kunskapen om denna patogen i CF. Befolkningsstrukturen hos S. aureus i CF i Spanien är inte känd, dess förhållande till resistens och virulensfaktorer, operon agr dysfunktion (inblandat i hetero-resistens och virulens) och det finns inga studier som analyserar dynamiken hos mikrobiomet i andningssekretioner och dess engagemang i olika stadier (primokolonisering, kronisk kolonisering och exacerbation). I detta projekt kommer dessa aspekter att behandlas som mål. Varje CF-enhet (7 barn och 9 vuxna), fördelade över hela Spanien, kommer att omfatta 12 patienter, som differentierar koloniseringsstatus och kliniska egenskaper, med en ettårig uppföljning. Respiratoriska sekret och serum kommer att samlas in från varje patient och skickas till samordningscentralen (Hosp. Ramón y Cajal) för mikrobiologisk odling, påvisande av patogener, PCR-realtid, populationsstudie (PFGE, MLST), karakterisering av valfria antibiotikaresistensmekanismer i CF och virulensgener och inflammationsmarkörer. Hos 15 utvalda patienter, med (n=9) och utan (n=6) kolonisering av S. aureus, kommer mikrobiomet och dess koloniseringsdynamik i andningsslemhinnan att studeras med metagenomik (MiSeq) och bioinformatik. Resultaten kommer att jämföras med resultaten från projekt PI12/00734 hos patienter som koloniserats av P. aeruginosa. Dessa resultat kommer att tjäna för nya diagnosverktyg och kliniska rekommendationer hos patienter som koloniserats av S. aureus i CF. (Swedish)
18 August 2022
0 references
Colonizarea bronhopulmonară de către Pseudomonas aeruginosa condițiile de gestionare a pacientului cu fibroză chistică (FC). De obicei, este precedat de Staphylocccus aureus care persistă (cocolonizare) sau este deplasat de P. aeruginosa. Colonizarea de către S. aureus ar putea fi importantă în aceste etape și în evoluția ulterioară conform studiului multicentric anterior PI12/00734 Proiectul actual va extinde cunoștințele acestui agent patogen în FC. Structura populației S. aureus în CF în Spania nu este cunoscută, relația sa cu factorii de rezistență și virulență, disfuncția operon agr (implicată în hetero-rezistență și virulență) și nu există studii care să analizeze dinamica microbiomului în secrețiile respiratorii și implicarea sa în diferite etape (primocolonizare, colonizare cronică și exacerbare). În cadrul acestui proiect, acesta va aborda aceste aspecte ca obiective. Fiecare unitate FC (7 pediatrii și 9 adulți), distribuită pe întreg teritoriul Spaniei, va include 12 pacienți, diferențiind statusul de colonizare și caracteristicile clinice, cu o urmărire de un an. Secrețiile respiratorii și serurile vor fi colectate de la fiecare pacient și trimise la centrul de coordonare (Hosp. Ramón y Cajal) pentru cultivarea microbiologică, detectarea agenților patogeni, timpul real PCR, studiul populațional (PFGE, MLST), caracterizarea mecanismelor de rezistență la antibiotice alese în genele CF și virulența și markerii inflamației. La 15 pacienți selectați, cu colonizare (n=9) și fără (n=6) de către S. aureus, microbiomul și dinamica sa de colonizare a mucoasei respiratorii vor fi studiate prin metagenomică (MiSeq) și bioinformatică. Rezultatele vor fi comparate cu cele obținute în cadrul proiectului PI12/00734 la pacienții colonizați de P. aeruginosa. Aceste rezultate vor servi la noi instrumente de diagnostic și recomandări clinice la pacienții colonizați de S. aureus în CF. (Romanian)
18 August 2022
0 references
Bronhopulmonalna kolonizacija s Pseudomonas aeruginosa pogojuje zdravljenje bolnika s cistično fibrozo (CF). Običajno je pred njim Staphylocccus aureus, ki vztraja (kolonizacija) ali se premakne s P. aeruginosa. Kolonizacija S. aureusa bi lahko bila pomembna v teh fazah in v poznejši evoluciji v skladu s prejšnjo multicentrično študijo PI12/00734 Trenutni projekt bo razširil znanje o tem patogenu v CF. Prebivalska struktura S. aureus v CF v Španiji ni znana, njegovo razmerje z odpornostjo in dejavniki virulence, disfunkcijo operon agr (vključeno v hetero-odpornost in virulenco) in ni študij, ki bi analizirale dinamiko mikrobioma pri izločkih dihal in njegovo vključenost v različne faze (primokolonizacija, kronična kolonizacija in poslabšanje). V tem projektu bodo ti vidiki obravnavani kot cilji. Vsaka enota CF (7 pediatričnih bolnikov in 9 odraslih), razdeljena po vsej Španiji, bo vključevala 12 bolnikov, ki bodo razlikovali stanje kolonizacije in klinične značilnosti, z enoletnim spremljanjem. Izločki iz dihal in serumi bodo zbrani od vsakega bolnika in poslani v koordinacijski center (Hosp. Ramón y Cajal) za mikrobiološko gojenje, odkrivanje patogenov, PCR realni čas, populacijska študija (PFGE, MLST), karakterizacija mehanizmov odpornosti na antibiotike po izbiri pri CF in virusnih genih ter označevalcih vnetja. Pri 15 izbranih bolnikih z (n = 9) in brez (n = 6) kolonizacije S. aureus bodo mikrobiom in njegovo kolonizacijo sluznice dihal proučevali z metagenomiko (MiSeq) in bioinformatiko. Rezultati bodo primerjani s tistimi, pridobljenimi pri projektu PI12/00734 pri bolnikih, ki so bili kolonizirani s P. aeruginosa. Ti rezultati bodo služili za nova diagnostična orodja in klinična priporočila pri bolnikih, ki jih je koloniziral S. aureus v CF. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
Kolonizacja oskrzeli przez Pseudomonas aeruginosa powoduje leczenie pacjenta z mukowiscydozą (CF). Zwykle poprzedza ją Staphylocccus aureus, który utrzymuje się (ko-kolonizacja) lub jest przenoszony przez P. aeruginosa. Kolonizacja S. aureus może mieć znaczenie w tych stadiach i w dalszej ewolucji zgodnie z poprzednim wieloośrodkowym badaniem PI12/00734 Obecny projekt poszerzy wiedzę na temat tego patogenu w CF. Struktura populacji S. aureus w CF w Hiszpanii nie jest znana, jego związek z czynnikami oporności i zjadliwości, zaburzenia funkcjonowania oper agr (zaangażowane w heteroodporność i zjadliwość) i nie ma badań, które analizują dynamikę mikrobiomu w wydzielinach oddechowych i jego udział w różnych stadiach (primokolonizacja, chroniczna kolonizacja i zaostrzenie). W ramach tego projektu uwzględnione zostaną te aspekty jako cele. Każda jednostka CF (7 pediatrów i 9 dorosłych), rozprowadzana w całej Hiszpanii, obejmie 12 pacjentów, różnicując stan kolonizacji i charakterystykę kliniczną, z roczną obserwacją. Wydzieliny z dróg oddechowych i surowice będą pobierane od każdego pacjenta i wysyłane do ośrodka koordynującego (Hosp. Ramón y Cajal) do uprawy mikrobiologicznej, wykrywania patogenów, czasu rzeczywistego PCR, badania populacji (PFGE, MLST), charakterystyki mechanizmów oporności na wybrane antybiotyki w genach CF i zjadliwości oraz markerów zapalenia. U 15 wybranych pacjentów z (n=9) i bez (n=6) kolonizacji przez S. aureus mikrobiom i jego dynamika kolonizacji błony śluzowej dróg oddechowych będą badane za pomocą metagenomiki (MiSeq) i bioinformatyki. Wyniki zostaną porównane z wynikami uzyskanymi w projekcie PI12/00734 u pacjentów skolonizowanych przez P. aeruginosa. Wyniki te będą służyć do nowych narzędzi diagnostycznych i zaleceń klinicznych u pacjentów skolonizowanych przez S. aureus w CF. (Polish)
18 August 2022
0 references
Madrid
0 references
Identifiers
PI15_00466
0 references