Understanding Bacterial Nucleotide Excision Repair at the Level of the Single Molecule Inside Living Cells. (Q84178): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(Changed an Item: Change because item Q2513981 was merged with Q2517977) |
(Removed claim: co-financing rate (P837): 100.0 percentage) |
||||||
| Property / co-financing rate | |||||||
| |||||||
| Property / co-financing rate: 100.0 percent / rank | |||||||
Revision as of 23:34, 20 October 2022
Project Q84178 in Poland
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Understanding Bacterial Nucleotide Excision Repair at the Level of the Single Molecule Inside Living Cells. |
Project Q84178 in Poland |
Statements
2,949,970.0 zloty
0 references
2,949,970.0 zloty
0 references
1 November 2016
0 references
30 April 2020
0 references
UNIWERSYTET IM. ADAMA MICKIEWICZA W POZNANIU
0 references
Malfunctioning DNA repair lead to an accumulation of mutations, which frequently results in cancer. The Nucleotide Excision Repair (NER) pathway removes a DNA lesions caused by UV light, cigarette smoke and chemical mutagens. NER is highly conserved, and studying the simpler NER in bacteria provides key insight into human NER. I propose an interdisciplinary approach to understand the mechanistic details of bacterial NER in living cells. I will use a combination of cutting-edge single-molecule methods to elucidate how DNA is repaired inside living cells. I will use super-resolution microscopy combined to study the behaviour of individual NER proteins. To complement this, conventional biochemistry, cell biology, genetics, smFRET assays, FCS and TIRF microscopy will be used. Together, this will provide a comprehensive understanding of the bacterial NER pathway, and constitute the first steps toward my ultimate goal, which is to understand how human cells repair DNA. (Polish)
0 references
Malfunctioning DNA repair lead to an accumulation of mutations, which frequently results in cancer. The Nucleotide Excision Repair (NER) pathway removes a DNA lesions caused by UV light, cigarette smoke and chemical mutagens. NER is highly conserved, and studying the simpler NER in bacteria provides key insight into human NER. I propose an interdisciplinary approach to understand the mechanistic details of bacterial NER in living cells. I will use a combination of cutting-edge single-molecule methods to elucidate how DNA is repaired inside living cells. I will use super-resolution microscopy combined to study the behaviour of individual NER proteins. To complement this, conventional Biochemistry, cell biology, genetics, SmFRET assays, FCS and tirf microscopy will be used. Together, this will provide a comprehensive understanding of the bacterial NER pathway, and constitute the first steps towards my ultimate goal, which is to understand how human cells repair DNA. (English)
14 October 2020
0 references
Le dysfonctionnement de la réparation de l’ADN entraîne une accumulation de mutations, ce qui entraîne souvent un cancer. La voie de réparation de l’excision nucléotide (NER) élimine une lésion de l’ADN causée par la lumière UV, la fumée de cigarette et les mutagènes chimiques. Le NER est très conservé, et l’étude du NER plus simple dans les bactéries fournit un aperçu clé du NER humain. Je propose une approche interdisciplinaire pour comprendre les détails mécaniques du NER bactérien dans les cellules vivantes. J’utiliserai une combinaison de méthodes monomoléculaires de pointe pour élucider la façon dont l’ADN est réparé à l’intérieur des cellules vivantes. J’utiliserai la microscopie super-résolution combinée pour étudier le comportement des protéines NER individuelles. Pour compléter cela, on utilisera la biochimie classique, la biologie cellulaire, la génétique, les tests smFRET, la microscopie FCS et la microscopie TIRF. Ensemble, cela fournira une compréhension complète de la voie bactérienne NER, et constituera les premières étapes vers mon objectif ultime, qui est de comprendre comment les cellules humaines réparent l’ADN. (French)
30 November 2021
0 references
Eine Fehlfunktion der DNA-Reparatur führt zu einer Ansammlung von Mutationen, die häufig zu Krebs führen. Der Nucleotide Excision Repair (NER) Pfad entfernt DNA-Läsionen, die durch UV-Licht, Zigarettenrauch und chemische Mutagene verursacht werden. NER ist hoch erhalten, und das Studium der einfacheren NER in Bakterien bietet einen wichtigen Einblick in menschliche NER. Ich schlage einen interdisziplinären Ansatz vor, um die mechanischen Details von bakteriellen NER in lebenden Zellen zu verstehen. Ich werde eine Kombination aus modernsten Single-Molekül-Methoden verwenden, um zu klären, wie DNA in lebenden Zellen repariert wird. Ich werde eine hochauflösende Mikroskopie verwenden, um das Verhalten einzelner NER-Proteine zu untersuchen. Dazu werden konventionelle Biochemie, Zellbiologie, Genetik, smFRET-Assays, FCS- und TIRF-Mikroskopie verwendet. Gemeinsam wird dies ein umfassendes Verständnis des bakteriellen NER-Wegs liefern und die ersten Schritte in Richtung meines letzten Ziels darstellen, nämlich zu verstehen, wie menschliche Zellen DNA reparieren. (German)
7 December 2021
0 references
Defecte DNA-reparatie leidt tot een accumulatie van mutaties, wat vaak resulteert in kanker. De Nucleotide Excision Repair (NER) route verwijdert een DNA laesies veroorzaakt door UV-licht, sigarettenrook en chemische mutagene stoffen. NER is zeer geconserveerd, en het bestuderen van de eenvoudigere NER in bacteriën geeft een belangrijk inzicht in menselijke NER. Ik stel een interdisciplinaire aanpak voor om de Mechanistische details van bacteriële NER in levende cellen te begrijpen. Ik zal een combinatie van geavanceerde single-molecule methoden gebruiken om te verduidelijken hoe DNA wordt gerepareerd in levende cellen. Ik zal super-resolutie microscopie gecombineerd gebruiken om het gedrag van individuele NER-eiwitten te bestuderen. Om dit aan te vullen, zullen conventionele biochemie, celbiologie, genetica, smFRET assays, FCS en TIRF microscopie worden gebruikt. Samen zal dit een uitgebreid begrip bieden van de bacteriële NER-route en de eerste stappen vormen naar mijn uiteindelijke doel, namelijk begrijpen hoe menselijke cellen DNA repareren. (Dutch)
16 December 2021
0 references
Il malfunzionamento della riparazione del DNA porta ad un accumulo di mutazioni, che spesso provoca il cancro. La via Nucleotide Excision Repair (NER) rimuove una lesione del DNA causata dalla luce UV, dal fumo di sigaretta e dai mutageni chimici. NER è altamente conservato, e lo studio del NER più semplice nei batteri fornisce informazioni chiave sul NER umano. Propongo un approccio interdisciplinare per comprendere i dettagli meccanici del NER batterico nelle cellule viventi. Userò una combinazione di metodi di monomolecola all'avanguardia per chiarire come il DNA viene riparato all'interno delle cellule viventi. Userò microscopia a super-risoluzione combinata per studiare il comportamento delle singole proteine NER. A complemento di questo, saranno utilizzati biochimica convenzionale, biologia cellulare, genetica, test smFRET, FCS e microscopia TIRF. Insieme, questo fornirà una comprensione completa del percorso NER batterico e costituirà i primi passi verso il mio obiettivo finale, che è quello di capire come le cellule umane riparano il DNA. (Italian)
16 January 2022
0 references
El mal funcionamiento de la reparación del ADN lleva a una acumulación de mutaciones, que con frecuencia resulta en cáncer. La vía de reparación de la escisión del nucleótido (NER) elimina las lesiones del ADN causadas por la luz UV, el humo del cigarrillo y los mutágenos químicos. NER es altamente conservado, y el estudio de la NER más simple en bacterias proporciona una visión clave del NER humano. Propongo un enfoque interdisciplinario para entender los detalles mecánicos de la NER bacteriana en las células vivas. Usaré una combinación de métodos de una sola molécula de vanguardia para dilucidar cómo se repara el ADN dentro de las células vivas. Usaré microscopía de superresolución combinada para estudiar el comportamiento de las proteínas NER individuales. Para complementar esto, se utilizarán bioquímicas convencionales, biología celular, genética, ensayos smFRET, microscopía FCS y TIRF. Juntos, esto proporcionará una comprensión integral de la vía bacteriana NER, y constituirá los primeros pasos hacia mi objetivo final, que es entender cómo las células humanas reparan el ADN. (Spanish)
19 January 2022
0 references
Svigtende DNA-reparation fører til en akkumulering af mutationer, hvilket ofte resulterer i kræft. Nucleotide Excision Repair (NER)-vejen fjerner DNA-læsioner forårsaget af UV-lys, cigaretrøg og kemiske mutagener. NER er meget bevaret, og at studere den enklere NER i bakterier giver nøgleindsigt i human NER. Jeg foreslår en tværfaglig tilgang til at forstå de mekanistiske detaljer om bakteriel NER i levende celler. Jeg vil bruge en kombination af banebrydende enkeltmolekylære metoder til at belyse, hvordan DNA repareres inde i levende celler. Jeg vil bruge superopløsningsmikroskopi kombineret til at studere adfærden af individuelle NER-proteiner. Som supplement hertil vil der blive anvendt konventionel biokemi, cellebiologi, genetik, smFRET-assays, FCS- og TIRF-mikroskopi. Sammen vil dette give en omfattende forståelse af den bakterielle NER-vej og udgøre de første skridt i retning af mit ultimative mål, som er at forstå, hvordan menneskelige celler reparerer DNA. (Danish)
26 July 2022
0 references
Η δυσλειτουργία της επιδιόρθωσης του DNA οδηγεί σε συσσώρευση μεταλλάξεων, η οποία συχνά οδηγεί σε καρκίνο. Η οδός επισκευής εκτομής νουκλεοτιδίων (NER) απομακρύνει τις βλάβες του DNA που προκαλούνται από το υπεριώδες φως, τον καπνό του τσιγάρου και τους χημικούς μεταλλαξιογόνους παράγοντες. Το NER διατηρείται σε μεγάλο βαθμό και η μελέτη του απλούστερου NER στα βακτήρια παρέχει βασικές γνώσεις για το ανθρώπινο NER. Προτείνω μια διεπιστημονική προσέγγιση για να κατανοήσουμε τις μηχανιστικές λεπτομέρειες του βακτηριακού NER στα ζωντανά κύτταρα. Θα χρησιμοποιήσω έναν συνδυασμό πρωτοποριακών μεθόδων μονού μορίου για να διευκρινίσω πώς επισκευάζεται το DNA μέσα στα ζωντανά κύτταρα. Θα χρησιμοποιήσω μικροσκοπία υπερ-ανάλυσης σε συνδυασμό για να μελετήσω τη συμπεριφορά μεμονωμένων πρωτεϊνών NER. Για να συμπληρωθεί αυτό, θα χρησιμοποιηθούν η συμβατική βιοχημεία, η κυτταρική βιολογία, η γενετική, οι δοκιμασίες smFRET, η μικροσκοπία FCS και TIRF. Μαζί, αυτό θα προσφέρει μια ολοκληρωμένη κατανόηση της βακτηριακής οδού NER, και θα αποτελέσει τα πρώτα βήματα προς τον απώτερο στόχο μου, ο οποίος είναι να κατανοήσω πώς τα ανθρώπινα κύτταρα επισκευάζουν το DNA. (Greek)
26 July 2022
0 references
Neispravan popravak DNK dovodi do nakupljanja mutacija, što često rezultira rakom. Nukleotidni put za popravak ekscizije (NER) uklanja lezije DNK uzrokovane UV svjetlom, dimom cigareta i kemijskim mutagenim tvarima. NER je vrlo očuvan, a proučavanje jednostavnijeg NER-a u bakterijama pruža ključni uvid u ljudski NER. Predlažem interdisciplinarni pristup razumjeti mehanističke detalje bakterijske NER u živim stanicama. Koristit ću kombinaciju najsuvremenijih jednomolekulanih metoda da pojasnim kako se DNK popravlja unutar živih stanica. Koristit ću super-rezolucijsku mikroskopiju kombiniranu za proučavanje ponašanja pojedinih proteina NER-a. Kako bi se to nadopunilo, koristit će se konvencionalna biokemija, stanična biologija, genetika, smFRET testovi, FCS i TIRF mikroskopija. Zajedno, to će pružiti sveobuhvatno razumijevanje bakterijskog NER puta, i predstavljati prve korake prema mom krajnjem cilju, a to je razumjeti kako ljudske stanice popravljaju DNK. (Croatian)
26 July 2022
0 references
Repararea defectuoasă a ADN-ului duce la o acumulare de mutații, ceea ce duce frecvent la cancer. Calea de reparare a exciziei nucleotidelor (NER) elimină leziunile ADN cauzate de lumina UV, fumul de țigară și mutagenii chimici. NER este foarte conservat, iar studiul NER mai simplu în bacterii oferă o perspectivă cheie asupra NER uman. Propun o abordare interdisciplinară pentru a înțelege detaliile mecaniciste ale NER bacteriene în celulele vii. Voi folosi o combinație de metode monomolecule de ultimă oră pentru a elucida modul în care ADN-ul este reparat în interiorul celulelor vii. Voi folosi microscopie super-rezoluție combinată pentru a studia comportamentul proteinelor NER individuale. Pentru a completa acest lucru, vor fi utilizate biochimie convențională, biologie celulară, genetică, teste smFRET, FCS și microscopie TIRF. Împreună, acest lucru va oferi o înțelegere cuprinzătoare a căii bacteriene NER și va constitui primii pași către obiectivul meu final, care este de a înțelege modul în care celulele umane repară ADN-ul. (Romanian)
26 July 2022
0 references
Porucha opravy DNA vedie k nahromadeniu mutácií, čo často vedie k rakovine. Cesta opravy nukleotidu Excision (NER) odstraňuje lézie DNA spôsobené UV svetlom, cigaretovým dymom a chemickými mutagénmi. NER je vysoko zachovaná a štúdium jednoduchšieho NER v baktériách poskytuje kľúčový pohľad na ľudské NER. Navrhujem interdisciplinárny prístup k pochopeniu mechanistických detailov bakteriálneho NER v živých bunkách. Použijem kombináciu najmodernejších jednomolekulových metód na objasnenie toho, ako sa DNA opravuje vo vnútri živých buniek. Na štúdium správania jednotlivých proteínov NER použijem kombinovanú mikroskopiu so superrozlíšením. Na doplnenie sa použije konvenčná biochémia, bunková biológia, genetika, smFRET testy, FCS a TIRF mikroskopia. Spoločne to poskytne komplexné pochopenie bakteriálnej dráhy NER a bude predstavovať prvé kroky k môjmu konečnému cieľu, ktorým je pochopiť, ako ľudské bunky opravia DNA. (Slovak)
26 July 2022
0 references
Tiswija ħażina tad-DNA twassal għal akkumulazzjoni ta’ mutazzjonijiet, li spiss tirriżulta fil-kanċer. Il-passaġġ ta’ Tiswija ta’ Eċiżjoni ta’ Nucleotide (NER) ineħħi leżjonijiet tad-DNA ikkawżati minn dawl UV, duħħan tas-sigaretti u mutaġeni kimiċi. In-NER huwa kkonservat ħafna, u l-istudju tan-NER aktar sempliċi fil-batterji jipprovdi ħarsa ewlenija lejn in-NER tal-bniedem. Nipproponi approċċ interdixxiplinari biex nifhem id-dettalji mekkanistiċi ta’ NER batteriku fiċ-ċelloli ħajjin. I se tuża kombinazzjoni ta ‘metodi l-aktar avvanzati ta’ molekula waħda biex tiċċara kif DNA hija msewwija ġewwa ċelluli ħajjin. Se nuża mikroskopija b’riżoluzzjoni għolja flimkien biex nistudja l-imġiba tal-proteini NER individwali. Biex tikkumplimenta din il-bijokimika konvenzjonali, il-bijoloġija taċ-ċelloli, il-ġenetika, l-assaġġi smFRET, il-mikroskopija FCS u TIRF se jintużaw. Flimkien, dan se jipprovdi fehim komprensiv tal-passaġġ NER batteriku, u jikkostitwixxi l-ewwel passi lejn l-għan aħħari tiegħi, li huwa li nifhem kif iċ-ċelloli umani jissewwew id-DNA. (Maltese)
26 July 2022
0 references
O mau funcionamento do reparo do DNA leva a um acúmulo de mutações, o que frequentemente resulta em cancro. A via Nucleotide Excision Repair (NER) remove lesões de DNA causadas por luz UV, fumo de cigarro e mutagens químicas. NER é altamente conservado, e estudar o NER mais simples em bactérias fornece uma visão chave sobre NER humano. Proponho uma abordagem interdisciplinar para compreender os pormenores mecanicistas da NER bacteriana nas células vivas. Vou usar uma combinação de métodos de última geração para elucidar como o DNA é reparado dentro de células vivas. Utilizarei a microscopia de superresolução combinada para estudar o comportamento das proteínas NER individuais. Para complementar isso, utilizar-se-ão a Bioquímica convencional, a biologia telemóvel, a genética, os ensaios de smFRET, a microscopia FCS e TIRF. Juntos, isso proporcionará uma compreensão abrangente da via NER bacteriana e constituirá os primeiros passos para o meu objetivo final, que é entender como as células humanas reparam o DNA. (Portuguese)
26 July 2022
0 references
Viallinen DNA-korjaus johtaa mutaatioiden kertymiseen, mikä johtaa usein syöpään. Nucleotide Excision Repair (NER) -reitti poistaa UV-valon, tupakansavun ja kemiallisten mutageenien aiheuttamat DNA-vauriot. NER on erittäin säilynyt, ja yksinkertaisemman NER: n tutkiminen bakteereissa antaa keskeisen käsityksen ihmisen NER: stä. Ehdotan tieteidenvälistä lähestymistapaa, jolla ymmärretään bakteerien NER: n mekanistiset yksityiskohdat elävissä soluissa. Käytän yhdistelmää huippuluokan yksimolekyylimenetelmistä selvittääkseni, miten DNA korjataan elävien solujen sisällä. Käytän superresoluution mikroskopiaa yhdessä yksittäisten NER-proteiinien käyttäytymisen tutkimiseen. Tämän lisäksi käytetään perinteistä biokemiaa, solubiologiaa, genetiikkaa, smFRET-testejä, FCS- ja TIRF-mikroskopiaa. Yhdessä tämä antaa kattavan käsityksen bakteerien NER-reitistä ja on ensimmäinen askel kohti lopullista tavoitettani, joka on ymmärtää, miten ihmissolut korjaavat DNA:ta. (Finnish)
26 July 2022
0 references
Nepravilno popravilo DNK povzroči kopičenje mutacij, kar pogosto povzroči raka. Pot Nukleotid Excision Repair (NER) odstrani poškodbe DNK, ki jih povzročajo UV svetloba, cigaretni dim in kemični mutageni. NER je zelo ohranjen in preučevanje enostavnejšega NER v bakterijah zagotavlja ključni vpogled v človeški NER. Predlagam interdisciplinarni pristop k razumevanju mehanističnih detajlov bakterijskega NER v živih celicah. Uporabil bom kombinacijo najsodobnejših enomolekularnih metod, da pojasnim, kako se DNK popravlja v živih celicah. Za preučevanje obnašanja posameznih proteinov NER bom uporabil mikroskopijo s superresolucijo. Za dopolnitev tega se bodo uporabljali konvencionalni biokemija, celična biologija, genetika, preskusi smFRET, FCS in TIRF mikroskopija. Skupaj bo to zagotovilo celovito razumevanje bakterijske poti NER in predstavljalo prve korake k mojemu končnemu cilju, ki je razumeti, kako človeške celice popravljajo DNK. (Slovenian)
26 July 2022
0 references
Nefunkční oprava DNA vede k hromadění mutací, což často vede k rakovině. Cesta k opravě nukleotidu (NER) odstraňuje DNA léze způsobené UV světlem, cigaretovým kouřem a chemickými mutageny. NER je vysoce konzervovaný a studium jednoduššího NER v bakteriích poskytuje klíčový vhled do lidského NER. Navrhuji interdisciplinární přístup k pochopení mechanistických detailů bakteriálního NER v živých buňkách. Použiji kombinaci špičkových jednomolekulových metod k objasnění toho, jak je DNA opravena uvnitř živých buněk. Pro studium chování jednotlivých NER proteinů budu používat mikroskopii se superrozlišením. K doplnění se použije konvenční biochemie, buněčná biologie, genetika, smFRET testy, mikroskopie FCS a TIRF. Společně to poskytne komplexní pochopení bakteriální NER cesty a představuje první krok k mému konečnému cíli, kterým je pochopit, jak lidské buňky opravují DNA. (Czech)
26 July 2022
0 references
Sugedus DNR remontui, susikaupia mutacijos, kurios dažnai sukelia vėžį. Nukleotidų ekscizijos taisymo (NER) kelias pašalina DNR pažeidimus, kuriuos sukelia UV šviesa, cigarečių dūmai ir cheminiai mutagenai. NER yra labai išsaugotas, o paprastesnio NER tyrimas bakterijose suteikia pagrindinių įžvalgų apie žmogaus NER. Siūlau tarpdisciplininį požiūrį, kad būtų galima suprasti bakterijų NER mechanistines detales gyvose ląstelėse. Aš naudosiu pažangiausių vienos molekulių metodų derinį, kad išsiaiškinčiau, kaip DNR remontuojama gyvų ląstelių viduje. Aš naudoju super skiriamosios gebos mikroskopiją kartu tiriant atskirų NER baltymų elgseną. Siekiant tai papildyti, bus naudojami įprasti biochemija, ląstelių biologija, genetika, smFRET tyrimai, FCS ir TIRF mikroskopija. Kartu tai suteiks išsamų supratimą apie bakterijų NER kelią, ir bus pirmieji žingsniai link mano galutinio tikslo, t. y. suprasti, kaip žmogaus ląstelės atkuria DNR. (Lithuanian)
26 July 2022
0 references
Nepareiza DNS labošana noved pie mutāciju uzkrāšanās, kas bieži izraisa vēzi. Nukleotīdu ekscīzijas atjaunošanas (NER) ceļš novērš DNS bojājumus, ko izraisa UV gaisma, cigarešu dūmi un ķīmiskie mutagēni. NER ir ļoti saglabāts, un vienkāršāka NER izpēte baktērijās sniedz galveno ieskatu cilvēka NER. ES ierosinu starpdisciplināru pieeju, lai izprastu baktēriju NER mehānistiskās detaļas dzīvajās šūnās. ES izmantošu visprogresīvāko vienas molekulas metožu kombināciju, lai noskaidrotu, kā DNS tiek remontēta dzīvās šūnās. ES izmantošu super-izšķīduma mikroskopiju kopā, lai pētītu atsevišķu NER proteīnu uzvedību. Lai to papildinātu, tiks izmantota tradicionālā bioķīmija, šūnu bioloģija, ģenētika, smFRET testi, FCS un TIRF mikroskopija. Kopā tas nodrošinās visaptverošu izpratni par baktēriju NER ceļu un būs pirmie soļi ceļā uz manu galīgo mērķi, proti, saprast, kā cilvēka šūnas atjauno DNS. (Latvian)
26 July 2022
0 references
Неправилното възстановяване на ДНК води до натрупване на мутации, което често води до рак. Пътят за възстановяване на нуклеотидни ексцизии (NER) премахва ДНК лезии, причинени от ултравиолетова светлина, цигарен дим и химични мутагени. NER е силно запазен и изучаването на по-простата NER в бактериите осигурява ключова представа за човека NER. Предлагам интердисциплинарен подход за разбиране на механистичните детайли на бактериалните NER в живите клетки. Ще използвам комбинация от авангардни едномолекулни методи, за да изясня как ДНК се възстановява вътре в живите клетки. Ще използвам микроскопия със супер резолюция, за да изследвам поведението на отделните NER протеини. В допълнение към това ще се използват конвенционална биохимия, клетъчна биология, генетика, smFRET тестове, FCS и TIRF микроскопия. Заедно това ще осигури цялостно разбиране на бактериалния път NER и ще представлява първата стъпка към крайната ми цел, която е да разбера как човешките клетки възстановяват ДНК. (Bulgarian)
26 July 2022
0 references
A hibás DNS-javítás mutációk felhalmozódásához vezet, ami gyakran rákot okoz. A Nucleotide Excision Repair (NER) útvonal eltávolítja az UV fény, a cigarettafüst és a kémiai mutagének által okozott DNS-elváltozásokat. A NER erősen konzervált, és az egyszerűbb NER baktériumban való tanulmányozása kulcsfontosságú betekintést nyújt az emberi NER-be. Interdiszciplináris megközelítést javasolok, hogy megértsük az élő sejtekben lévő bakteriális NER mechanisztikus részleteit. A legmodernebb egymolekulás módszerek kombinációját fogom használni, hogy tisztázzuk, hogyan javítjuk a DNS-t az élő sejtekben. Szuperfelbontó mikroszkópiával fogom tanulmányozni az egyes NER fehérjék viselkedését. Ennek kiegészítéseként hagyományos biokémia, sejtbiológia, genetika, smFRET vizsgálatok, FCS és TIRF mikroszkópia kerül alkalmazásra. Ez együttesen biztosítja a bakteriális NER útvonal átfogó megértését, és az első lépést jelenti a végső célom felé, amely az, hogy megértsük, hogyan javítja az emberi sejtek a DNS-t. (Hungarian)
26 July 2022
0 references
Bíonn carnadh sóchán mar thoradh ar dheisiú DNA a mhífheidhmiú, rud a mbíonn ailse mar thoradh air go minic. Cuireann an cosán Deisiúchán Beachtais Nucleotide (NER) loit DNA de bharr solas UV, deatach toitíní agus só-ghineacha ceimiceacha. Tá Ner thar a bheith caomhnaithe, agus tugann staidéar ar an NER simplí i mbaictéir léargas lárnach ar NER daonna. Molaim cur chuige idirdhisciplíneach chun tuiscint a fháil ar shonraí meicníocha NER baictéarach i gcealla beo. Bainfidh mé úsáid as meascán de mhodhanna aonmhóilíneacha ceannródaíocha chun léiriú a thabhairt ar an gcaoi a ndéantar DNA a dheisiú taobh istigh de chealla maireachtála. Úsáidfidh mé micreascópacht sár-taifigh le chéile chun staidéar a dhéanamh ar iompar próitéiní aonair NER. Chun é seo a chomhlánú, úsáidfear gnáth-bhithcheimic, bitheolaíocht cille, géineolaíocht, measúnachtaí SmFRET, micreascópacht FCS agus TIRF. Le chéile, soláthróidh sé seo tuiscint chuimsitheach ar an mbealach baictéarach NER, agus is ionann é agus na chéad chéimeanna i dtreo mo sprioc dheiridh, is é sin le tuiscint a fháil ar conas a dheisiú cealla daonna DNA. (Irish)
26 July 2022
0 references
Felaktig DNA-reparation leder till en ackumulering av mutationer, vilket ofta resulterar i cancer. Nucleotide Excision Repair (NER) väg avlägsnar DNA-skador orsakade av UV-ljus, cigarettrök och kemiska mutagener. NER är starkt bevarad, och att studera den enklare NER i bakterier ger viktig insikt i mänsklig NER. Jag föreslår ett tvärvetenskapligt tillvägagångssätt för att förstå de mekanistiska detaljerna i bakteriell NER i levande celler. Jag kommer att använda en kombination av banbrytande enkelmolekylära metoder för att klargöra hur DNA repareras inuti levande celler. Jag kommer att använda superupplösning mikroskopi kombinerad för att studera beteendet hos enskilda NER-proteiner. För att komplettera detta kommer konventionell biokemi, cellbiologi, genetik, smFRET-tester, FCS och TIRF-mikroskopi att användas. Tillsammans kommer detta att ge en omfattande förståelse av den bakteriella NER-vägen, och utgöra de första stegen mot mitt slutliga mål, vilket är att förstå hur mänskliga celler reparerar DNA. (Swedish)
26 July 2022
0 references
Nurjunud DNA remont põhjustab mutatsioonide kuhjumist, mis sageli põhjustab vähki. Nucleotide Excision Repair (NER) rada eemaldab UV-valguse, sigaretisuitsu ja keemiliste mutageenide põhjustatud DNA-kahjustused. NER on väga konserveeritud ja lihtsamate bakterite NERide uurimine annab olulise ülevaate inimese NERist. Ma pakun välja interdistsiplinaarse lähenemisviisi, et mõista elusrakkudes leiduvate bakteriaalsete NERide mehhaanilisi üksikasju. Ma kasutan kombinatsiooni tipptasemel ühe molekuli meetoditest, et selgitada, kuidas DNA elusrakkudes parandatakse. Kasutan superresolutsiooniga mikroskoopiat, et uurida üksikute NER-valkude käitumist. Selle täiendamiseks kasutatakse tavapärast biokeemiat, rakubioloogiat, geneetikat, smFRET-teste, FCSi ja TIRF-mikroskoopiat. Koos annab see põhjaliku ülevaate bakteriaalsest NER-teest ja kujutab endast esimest sammu minu lõppeesmärgi suunas, milleks on mõista, kuidas inimese rakud DNA-d parandavad. (Estonian)
26 July 2022
0 references
Identifiers
POIR.04.04.00-00-1CA9/16
0 references