METHYLATION PATTERNS OF PLACENTA IMPRINTED GENES, EXPOSURE TO NON-PERSISTENT PESTICIDES, AND GROWTH AND FETAL AND INFANTILE DEVELOPMENT (Q3179851): Difference between revisions
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MODELLI DI METILAZIONE DEI GENI IMPRESSI DALLA PLACENTA, ESPOSIZIONE A PESTICIDI NON PERSISTENTI, CRESCITA E SVILUPPO FETALE E INFANTILE | |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Obiettivi: Identificare un gruppo di biomarcatori genici il cui modello coordinato di metilazione o metilazione di specifiche regioni regolatorie di espressione genica (GRI) è associato a alterazioni avverse nello sviluppo, nella crescita fetale e nello sviluppo neurologico a 12 mesi di età. Oltre a valutare l'associazione tra l'esposizione prenatale ai pesticidi organofosforici e neonicotinoidi e il modello di metilazione. Metodologia: Coorte di nascita prospettica di 344 binomie madre-bambino. Le donne saranno catturate durante il primo trimestre di gravidanza e monitorate durante il secondo e terzo trimestre di gravidanza, parto e l'anno di nascita del bambino. I campioni di urina saranno prelevati durante la gravidanza e il bambino all'anno, i campioni di placenta saranno prelevati anche alla nascita. Saranno raccolte informazioni sulle variabili relative alla crescita e allo sviluppo fetale e il test di neurosviluppo Bayley-II sarà applicato ai bambini a 12 mesi. Il DNA verrà estratto e purificato dai campioni di placenta utilizzando il Mini Kit QIAamp DNA. L'analisi di metilazione del genoma completo delle cellule placenta sarà eseguita con Infinium® HumanMethylation450 BeadChip di Illumina e geni specifici mediante pirossequenziamento. Essi determineranno i livelli di pesticidi organofosforici e neonicotinoidi nei campioni di urina. Utilizzando modelli semi-supervisti di miscela partizionata ricorsivamente (SS-RPMM) identificherà il gruppo di geni i cui modelli di metilazione sono più associati alle variabili di effetto. I modelli di regressione logistica e lineare multivariati devono essere costruiti, se del caso, sulle variabili degli effetti in relazione al cluster dei modelli di metilazione. (Italian) | |||||||||||||||
| Property / summary: Obiettivi: Identificare un gruppo di biomarcatori genici il cui modello coordinato di metilazione o metilazione di specifiche regioni regolatorie di espressione genica (GRI) è associato a alterazioni avverse nello sviluppo, nella crescita fetale e nello sviluppo neurologico a 12 mesi di età. Oltre a valutare l'associazione tra l'esposizione prenatale ai pesticidi organofosforici e neonicotinoidi e il modello di metilazione. Metodologia: Coorte di nascita prospettica di 344 binomie madre-bambino. Le donne saranno catturate durante il primo trimestre di gravidanza e monitorate durante il secondo e terzo trimestre di gravidanza, parto e l'anno di nascita del bambino. I campioni di urina saranno prelevati durante la gravidanza e il bambino all'anno, i campioni di placenta saranno prelevati anche alla nascita. Saranno raccolte informazioni sulle variabili relative alla crescita e allo sviluppo fetale e il test di neurosviluppo Bayley-II sarà applicato ai bambini a 12 mesi. Il DNA verrà estratto e purificato dai campioni di placenta utilizzando il Mini Kit QIAamp DNA. L'analisi di metilazione del genoma completo delle cellule placenta sarà eseguita con Infinium® HumanMethylation450 BeadChip di Illumina e geni specifici mediante pirossequenziamento. Essi determineranno i livelli di pesticidi organofosforici e neonicotinoidi nei campioni di urina. Utilizzando modelli semi-supervisti di miscela partizionata ricorsivamente (SS-RPMM) identificherà il gruppo di geni i cui modelli di metilazione sono più associati alle variabili di effetto. I modelli di regressione logistica e lineare multivariati devono essere costruiti, se del caso, sulle variabili degli effetti in relazione al cluster dei modelli di metilazione. (Italian) / rank | |||||||||||||||
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| Property / summary: Obiettivi: Identificare un gruppo di biomarcatori genici il cui modello coordinato di metilazione o metilazione di specifiche regioni regolatorie di espressione genica (GRI) è associato a alterazioni avverse nello sviluppo, nella crescita fetale e nello sviluppo neurologico a 12 mesi di età. Oltre a valutare l'associazione tra l'esposizione prenatale ai pesticidi organofosforici e neonicotinoidi e il modello di metilazione. Metodologia: Coorte di nascita prospettica di 344 binomie madre-bambino. Le donne saranno catturate durante il primo trimestre di gravidanza e monitorate durante il secondo e terzo trimestre di gravidanza, parto e l'anno di nascita del bambino. I campioni di urina saranno prelevati durante la gravidanza e il bambino all'anno, i campioni di placenta saranno prelevati anche alla nascita. Saranno raccolte informazioni sulle variabili relative alla crescita e allo sviluppo fetale e il test di neurosviluppo Bayley-II sarà applicato ai bambini a 12 mesi. Il DNA verrà estratto e purificato dai campioni di placenta utilizzando il Mini Kit QIAamp DNA. L'analisi di metilazione del genoma completo delle cellule placenta sarà eseguita con Infinium® HumanMethylation450 BeadChip di Illumina e geni specifici mediante pirossequenziamento. Essi determineranno i livelli di pesticidi organofosforici e neonicotinoidi nei campioni di urina. Utilizzando modelli semi-supervisti di miscela partizionata ricorsivamente (SS-RPMM) identificherà il gruppo di geni i cui modelli di metilazione sono più associati alle variabili di effetto. I modelli di regressione logistica e lineare multivariati devono essere costruiti, se del caso, sulle variabili degli effetti in relazione al cluster dei modelli di metilazione. (Italian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 16 January 2022
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Revision as of 14:55, 16 January 2022
Project Q3179851 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | METHYLATION PATTERNS OF PLACENTA IMPRINTED GENES, EXPOSURE TO NON-PERSISTENT PESTICIDES, AND GROWTH AND FETAL AND INFANTILE DEVELOPMENT |
Project Q3179851 in Spain |
Statements
105,640.0 Euro
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132,050.0 Euro
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80.0 percent
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1 January 2014
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31 March 2017
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ESCUELA ANDALUZA DE SALUD PUBLICA
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37°10'24.60"N, 3°35'58.31"W
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18087
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Objetivos: Identificar un panel de biomarcadores de genes cuyo patrón coordinado de metilación y/o la metilación de las regiones reguladoras de la expresión de genes específicos (ICR) se asocie con el alteraciones adversas en desarrollo, crecimiento fetal y neurodesarrollo a los 12 meses edad. Así como evaluar la asociación entre la exposición prenatal a plaguicidas organofosforados y neonicotinoides y el patrón de metilación. Metodología: Cohorte de nacimiento prospectiva de 344 binomios madre-hijo/a. Las mujeres se captarán durante el primer trimestre de embarazo y se les efectuará un seguimiento durante el segundo y tercer trimestre de embarazo, el parto y al año del nacimiento del/a hijo/a. Se tomarán muestras de orina durante el embarazo y al niño al año, asimismo se tomaránmuestras de placenta en el parto. Se recogerá información sobre variables relacionadas con desarrollo y crecimiento fetal y se aplicará a los niños/as la prueba Bayley-II de neurodesarrollo a los 12 meses. El ADN será extraído y purificado a partir de lasmuestras de placenta utilizando el QIAamp DNA Mini Kit. El análisis de metilación del genoma completo de células de placenta se realizarán con Infinium® HumanMethylation450 BeadChip de Illumina y de genes específicos por pirosecuenciación. Sedeterminarán los niveles de plaguicidas organofosforados y neonicotinoides en las muestras de orina. Utilizando semisupervised recursively partitioned mixture models (SS-RPMM) se identificará el grupo de genes cuyos patrones de metilación resultan más asociados a las variables de efecto. Se construirán modelos de regresión logística y lineal multivariantes según corresponda, sobre las variables de efectos en relación a los cluster de los patrones de metilación. (Spanish)
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Objectives: Identify a panel of gene biomarkers whose coordinated methylation pattern or methylation of specific gene expression regulatory regions (GRIs) is associated with adverse alterations in development, foetal growth and neurodevelopment at 12 months of age. As well as evaluating the association between prenatal exposure to organophosphorus and neonicotinoid pesticides and the methylation pattern. Methodology: Prospective birth cohort of 344 mother-child binomies. Women will be captured during the first trimester of pregnancy and monitored during the second and third trimesters of pregnancy, delivery and the year of birth of the child. Urine samples will be taken during pregnancy and the child per year, placenta samples will also be taken at birth. Information on variables related to foetal growth and development will be collected and the Bayley-II neurodevelopment test will be applied to children at 12 months. DNA will be extracted and purified from placenta samples using the QIAamp DNA Mini Kit. The methylation analysis of the complete genome of placenta cells will be performed with Illumina’s Infinium® HumanMethylation450 BeadChip and specific genes by pyrossequencing. They will determine the levels of organophosphorus and neonicotinoid pesticides in urine samples. Using semi-supervised Recursively partitioned mixture models (SS-RPMM) will identify the group of genes whose methylation patterns are most associated with effect variables. Multivariate logistic and linear regression models shall be constructed, as appropriate, on the effects variables in relation to the cluster of methylation patterns. (English)
12 October 2021
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Objectifs: Identifier un groupe de biomarqueurs géniques dont le patron de méthylation coordonnée ou la méthylation de régions régulatrices spécifiques de l’expression génique (SRG) est associé à des altérations défavorables du développement, de la croissance fœtale et du neurodéveloppement à l’âge de 12 mois. En plus d’évaluer l’association entre l’exposition prénatale aux pesticides organophosphorés et néonicotinoïdes et le profil de méthylation. Méthodologie: Cohorte de naissance prospective de 344 binomies mère-enfant. Les femmes seront capturées au cours du premier trimestre de la grossesse et surveillées pendant les deuxième et troisième trimestres de la grossesse, de l’accouchement et de l’année de naissance de l’enfant. Des échantillons d’urine seront prélevés pendant la grossesse et l’enfant par an, des échantillons placenta seront également prélevés à la naissance. Des renseignements sur les variables liées à la croissance et au développement du fœtus seront recueillis et le test de neurodéveloppement Bayley-II sera appliqué aux enfants à 12 mois. L’ADN sera extrait et purifié à partir d’échantillons placenta à l’aide du kit ADN QIAamp. L’analyse de la méthylation du génome complet des cellules placentaires sera réalisée avec Infinium® HumanMethylation450 BeadChip d’Illumina et des gènes spécifiques par pyrosséquençage. Ils détermineront les concentrations de pesticides organophosphorés et néonicotinoïdes dans les échantillons d’urine. L’utilisation de modèles de mélanges récursivement partagés semi-supervisés (SS-RPMM) permettra d’identifier le groupe de gènes dont les patrons de méthylation sont les plus associés aux variables d’effet. Des modèles de régression logistique et linéaire multivariées doivent être construits, le cas échéant, sur les variables d’effets par rapport au groupe de modèles de méthylation. (French)
4 December 2021
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Ziele: Identifizieren Sie ein Panel von Gen-Biomarkern, deren koordiniertes Methylierungsmuster oder Methylierung spezifischer Genexpressions-Regulierungsregionen (GRIs) mit nachteiligen Veränderungen in der Entwicklung, dem fetalen Wachstum und der Neuroentwicklung im Alter von 12 Monaten assoziiert ist. Sowie die Bewertung des Zusammenhangs zwischen pränataler Exposition gegenüber Organophosphor und Neonicotinoid-Pestiziden und dem Methylierungsmuster. Methodik: Voraussichtliche Geburtskohorte von 344 Mutter-Kind-Binomien. Frauen werden während des ersten Trimesters der Schwangerschaft gefangen und während des zweiten und dritten Trimesters der Schwangerschaft, der Geburt und des Geburtsjahres überwacht. Urinproben werden während der Schwangerschaft und das Kind pro Jahr genommen, Plazentaproben werden auch bei der Geburt genommen. Es werden Informationen über Variablen im Zusammenhang mit fetalem Wachstum und Entwicklung gesammelt und der Bayley-II Neuroentwicklungstest für Kinder ab 12 Monaten angewendet. Die DNA wird mit dem QIAamp DNA Mini Kit aus Plazentaproben extrahiert und gereinigt. Die Methylierungsanalyse des vollständigen Genoms von Plazentazellen wird mit Illuminas Infinium® HumanMethylation450 BeadChip und spezifischen Genen durch Pyrossequenzierung durchgeführt. Sie bestimmen die Gehalte an Organophosphor und Neonicotinoid-Pestiziden in Urinproben. Die Verwendung von semi-supervised Recursively partitioned Mix Models (SS-RPMM) identifiziert die Gruppe von Genen, deren Methylierungsmuster am meisten mit Effektvariablen assoziiert sind. Multivariate logistische und lineare Regressionsmodelle sind gegebenenfalls anhand der Wirkungsvariablen in Bezug auf den Cluster von Methylierungsmustern zu erstellen. (German)
9 December 2021
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Doelstellingen: Identificeer een panel van genbiomarkers waarvan het gecoördineerde methylatiepatroon of methylatie van specifieke gebieden van genexpressie (GRI’s) in verband wordt gebracht met ongunstige veranderingen in ontwikkeling, foetale groei en neuroontwikkeling op de leeftijd van 12 maanden. Naast de evaluatie van het verband tussen prenatale blootstelling aan organische fosfor en neonicotinoïde bestrijdingsmiddelen en het methylatiepatroon. Methodologie: Prospectieve geboortecohort van 344 moeder-kind binomies. Vrouwen worden gevangen tijdens het eerste trimester van de zwangerschap en gecontroleerd tijdens het tweede en derde trimester van de zwangerschap, bevalling en het geboortejaar van het kind. Urine monsters worden genomen tijdens de zwangerschap en het kind per jaar, placenta monsters worden ook genomen bij de geboorte. Informatie over variabelen in verband met foetale groei en ontwikkeling zal worden verzameld en de Bayley-II neuroontwikkelingstest zal worden toegepast op kinderen na 12 maanden. DNA zal worden geëxtraheerd en gezuiverd uit placenta monsters met behulp van de QIAamp DNA Mini Kit. De methylation analyse van het volledige genoom van placenta cellen zal worden uitgevoerd met Illumina’s Infinium® HumanMethylation450 BeadChip en specifieke genen door pyrossequencing. Zij zullen de niveaus van organische fosfor en neonicotinoïde pesticiden in urinemonsters bepalen. Met behulp van semi-gecontroleerde Recursively partitioned mengselmodellen (SS-RPMM) zal de groep genen waarvan de methylatiepatronen het meest geassocieerd zijn met effectvariabelen, identificeren. Multivariate logistieke en lineaire regressiemodellen moeten in voorkomend geval worden geconstrueerd op de effectenvariabelen ten opzichte van de cluster van methylatiepatronen. (Dutch)
17 December 2021
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Obiettivi: Identificare un gruppo di biomarcatori genici il cui modello coordinato di metilazione o metilazione di specifiche regioni regolatorie di espressione genica (GRI) è associato a alterazioni avverse nello sviluppo, nella crescita fetale e nello sviluppo neurologico a 12 mesi di età. Oltre a valutare l'associazione tra l'esposizione prenatale ai pesticidi organofosforici e neonicotinoidi e il modello di metilazione. Metodologia: Coorte di nascita prospettica di 344 binomie madre-bambino. Le donne saranno catturate durante il primo trimestre di gravidanza e monitorate durante il secondo e terzo trimestre di gravidanza, parto e l'anno di nascita del bambino. I campioni di urina saranno prelevati durante la gravidanza e il bambino all'anno, i campioni di placenta saranno prelevati anche alla nascita. Saranno raccolte informazioni sulle variabili relative alla crescita e allo sviluppo fetale e il test di neurosviluppo Bayley-II sarà applicato ai bambini a 12 mesi. Il DNA verrà estratto e purificato dai campioni di placenta utilizzando il Mini Kit QIAamp DNA. L'analisi di metilazione del genoma completo delle cellule placenta sarà eseguita con Infinium® HumanMethylation450 BeadChip di Illumina e geni specifici mediante pirossequenziamento. Essi determineranno i livelli di pesticidi organofosforici e neonicotinoidi nei campioni di urina. Utilizzando modelli semi-supervisti di miscela partizionata ricorsivamente (SS-RPMM) identificherà il gruppo di geni i cui modelli di metilazione sono più associati alle variabili di effetto. I modelli di regressione logistica e lineare multivariati devono essere costruiti, se del caso, sulle variabili degli effetti in relazione al cluster dei modelli di metilazione. (Italian)
16 January 2022
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Granada
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Identifiers
PI13_01559
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