ANALYSIS OF VIRULENCE AND PATHOGENICITY MECHANISMS IN MYCOPLASMAS: DESIGN OF VACCINES AGAINST SOME SPECIES OF CLINICAL INTEREST (Q3160298): Difference between revisions
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ANALISI DEI MECCANISMI DI VIRULENZA E PATOGENICITÀ NEI MICOPLASMI: PROGETTAZIONE DI VACCINI CONTRO ALCUNE SPECIE DI INTERESSE CLINICO | |||||||||||||||
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I MICOPLASMI RAPPRESENTANO UNO DEI SISTEMI BIOLOGICI PIÙ SEMPLICI E SONO UN BUON MODELLO DI MINIMO GENE E CELLULE MINIMA-REPLICATIVE. NONOSTANTE LA SUA SEMPLICITÀ, LA SUA BIOLOGIA DI BASE È MOLTO SCONOSCIUTA E HA UN GRAN NUMERO DI GENI SENZA ANNOTAZIONI FUNZIONALI. LA MAGGIOR PARTE DEI MICOPLASMI SONO PARASSITI E PATOGENI DI VARIE SPECIE ANIMALI, COMPRESE LE SPECIE UMANE. L'OBIETTIVO FONDAMENTALE DI QUESTO PROGETTO È QUELLO DI PROGETTARE STRATEGIE PER LA LORO PROFILASSI O TERAPIA, SOPRATTUTTO CERCANDO DI OTTENERE VACCINI CONTRO ALCUNI MICOPLASMI. NELLO SPECIFICO, CI CONCENTREREMO SULLE SEGUENTI SPECIE: MYCOPLASMA GENITALIUM, PATOGENO DEL SISTEMA UROGENITALE UMANO; MYCOPLASMA HYOPNEUMONIAE, IMPORTANTE PATOGENO RESPIRATORIO NEI SUINI; MYCOPLASMA BOVIS, UN IMPORTANTE AGENTE RESPIRATORIO NEI BOVINI; MYCOPLASMA HYORHINIS, PATOGENO DEI SUINI E COLPISCE ANCHE L'UOMO (RELATIVO AL CANCRO ALLA PROSTATA). M. GENITALIUM È LA SPECIE CHE ABBIAMO STUDIATO IN PRECEDENZA, IN GRAN PARTE PER LA SUA MAGGIORE FACILITÀ DI TRASFORMAZIONE E MANIPOLAZIONE GENETICA IN GENERALE E PERCHÉ È UN MODELLO DI GENOMA MINIMO. CI HA PERMESSO DI ACQUISIRE ESPERIENZA NELLA GESTIONE GENETICA E NELLA MANIPOLAZIONE DI QUESTI DIFFICILI MICRORGANISMI, NONCHÉ NELL'ANALISI DEI MECCANISMI DI PATOGENICITÀ DEI MICOPLASMI E NELL'IDENTIFICAZIONE E CARATTERIZZAZIONE (IN ALCUNI CASI A LIVELLO DI STRUTTURA CRYSTALOGRAMICA) DELLE PROTEINE COINVOLTE IN ESSI. IN QUESTO CASO, PIUTTOSTO CHE UN VACCINO, RITENIAMO INTERESSANTE TRACCIARE L'ATTIVITÀ INIBITORIA DI UNA LIBRERIA DI COMPOSTI SVILUPPATA NEL PRECEDENTE PROGETTO COORDINATO E VOLTA A INATTIVARE LA GLICOSILTRANSFERASI DEL MICRORGANISMO. ALCUNI DI QUESTI ENZIMI SONO TOTALMENTE INDISPENSABILI PER MYCOPLASMA E MOSTRANO ATTIVITÀ MOLTO SPECIFICHE, QUINDI SONO BUONI CANDIDATI PER GLI OBIETTIVI TERAPEUTICI. INOLTRE, CONTINUEREMO A STUDIARE LE BASI MOLECOLARI DELLA SUA PATOGENICITÀ, IDENTIFICANDO I GENI DELLA VIRULENZA IN PARTICOLARE QUELLI LEGATI AL MECCANISMO DI ADESIONE E ALLE COMPLESSE RETI DI REGOLAZIONE GENICA. IL VOSTRO GENOMA SARÀ ANCHE RIANOTATO SULLA BASE DI UN'ANALISI PROTEOGENOMICA E BIOINFORMATICA, REANOTATION CHE SARÀ ESTESA AI GENI ORTOLOGHI DI ALTRE SPECIE DI MYCOPLASMA. NEL CASO DI M. HYOPNEUMONIAE E M. BOVIS CERCHEREMO DI PROGETTARE UN VACCINO VIVO CANCELLANDO I GENI DELLA VIRULENZA E DI UTILIZZARE LA CELLULA VIVA COME OSPITE PER UN EVENTUALE VACCINO COMBI, PER ESPRESSIONE QUIROLOGIA DELLE PROTEINE ANTIGENICAS DI ALTRI PATOGENI SUINI (P.E., CIRCOVIRUS) E BOVINI (P.E., BHV-1, BRSV, ECC.). QUESTO RICHIEDE METODI DI TRASFORMAZIONE, CHE ABBIAMO GIÀ RAGGIUNTO IN M. HYOPNEUMONIAE E CHE SARANNO ESTESI A M. BOVIS, CON UNA STORIA CHE INDICA CHE POTREBBE ESSERE TRASFORMATO PER TRANSIZIONE E OMOLOGAZIONE. INFINE, NEL CASO DI M. HYORHINIS, ANCHE SE IL SUO RUOLO DI AGENTE PATOGENO È GIÀ STATO MENZIONATO, IN QUESTO PROGETTO NE ESPLOREREMO UN ALTRO ASPETTO. RECENTEMENTE, È STATO APPENA DESCRITTO CHE ALCUNE DELLE SUE PROTEINE DELLA MEMBRANA HANNO ATTIVITÀ ANTIAGREGACION DELLE BETAPEPTIDS DI ALZHEIMER. QUESTO EFFETTO È MEDIATO DA UN'ECCESSIVA ESPRESSIONE DEL GENE DELLA CALPASTATINA (INIBITORE DELLA CALPATINA) NELLE CELLULE UMANE. CERCHEREMO DI PURIFICARE, IDENTIFICARE E CARATTERIZZARE QUESTO O QUESTI COMPONENTI ED EFFETTUARE PROVE SU UN MODELLO RATON, DISPONIBILE IN UN ALTRO GRUPPO DELLA NOSTRA UNIVERSITÀ, AL FINE DI IDENTIFICARE IL MECCANISMO SOTTOSTANTE. (Italian) | |||||||||||||||
| Property / summary: I MICOPLASMI RAPPRESENTANO UNO DEI SISTEMI BIOLOGICI PIÙ SEMPLICI E SONO UN BUON MODELLO DI MINIMO GENE E CELLULE MINIMA-REPLICATIVE. NONOSTANTE LA SUA SEMPLICITÀ, LA SUA BIOLOGIA DI BASE È MOLTO SCONOSCIUTA E HA UN GRAN NUMERO DI GENI SENZA ANNOTAZIONI FUNZIONALI. LA MAGGIOR PARTE DEI MICOPLASMI SONO PARASSITI E PATOGENI DI VARIE SPECIE ANIMALI, COMPRESE LE SPECIE UMANE. L'OBIETTIVO FONDAMENTALE DI QUESTO PROGETTO È QUELLO DI PROGETTARE STRATEGIE PER LA LORO PROFILASSI O TERAPIA, SOPRATTUTTO CERCANDO DI OTTENERE VACCINI CONTRO ALCUNI MICOPLASMI. NELLO SPECIFICO, CI CONCENTREREMO SULLE SEGUENTI SPECIE: MYCOPLASMA GENITALIUM, PATOGENO DEL SISTEMA UROGENITALE UMANO; MYCOPLASMA HYOPNEUMONIAE, IMPORTANTE PATOGENO RESPIRATORIO NEI SUINI; MYCOPLASMA BOVIS, UN IMPORTANTE AGENTE RESPIRATORIO NEI BOVINI; MYCOPLASMA HYORHINIS, PATOGENO DEI SUINI E COLPISCE ANCHE L'UOMO (RELATIVO AL CANCRO ALLA PROSTATA). M. GENITALIUM È LA SPECIE CHE ABBIAMO STUDIATO IN PRECEDENZA, IN GRAN PARTE PER LA SUA MAGGIORE FACILITÀ DI TRASFORMAZIONE E MANIPOLAZIONE GENETICA IN GENERALE E PERCHÉ È UN MODELLO DI GENOMA MINIMO. CI HA PERMESSO DI ACQUISIRE ESPERIENZA NELLA GESTIONE GENETICA E NELLA MANIPOLAZIONE DI QUESTI DIFFICILI MICRORGANISMI, NONCHÉ NELL'ANALISI DEI MECCANISMI DI PATOGENICITÀ DEI MICOPLASMI E NELL'IDENTIFICAZIONE E CARATTERIZZAZIONE (IN ALCUNI CASI A LIVELLO DI STRUTTURA CRYSTALOGRAMICA) DELLE PROTEINE COINVOLTE IN ESSI. IN QUESTO CASO, PIUTTOSTO CHE UN VACCINO, RITENIAMO INTERESSANTE TRACCIARE L'ATTIVITÀ INIBITORIA DI UNA LIBRERIA DI COMPOSTI SVILUPPATA NEL PRECEDENTE PROGETTO COORDINATO E VOLTA A INATTIVARE LA GLICOSILTRANSFERASI DEL MICRORGANISMO. ALCUNI DI QUESTI ENZIMI SONO TOTALMENTE INDISPENSABILI PER MYCOPLASMA E MOSTRANO ATTIVITÀ MOLTO SPECIFICHE, QUINDI SONO BUONI CANDIDATI PER GLI OBIETTIVI TERAPEUTICI. INOLTRE, CONTINUEREMO A STUDIARE LE BASI MOLECOLARI DELLA SUA PATOGENICITÀ, IDENTIFICANDO I GENI DELLA VIRULENZA IN PARTICOLARE QUELLI LEGATI AL MECCANISMO DI ADESIONE E ALLE COMPLESSE RETI DI REGOLAZIONE GENICA. IL VOSTRO GENOMA SARÀ ANCHE RIANOTATO SULLA BASE DI UN'ANALISI PROTEOGENOMICA E BIOINFORMATICA, REANOTATION CHE SARÀ ESTESA AI GENI ORTOLOGHI DI ALTRE SPECIE DI MYCOPLASMA. NEL CASO DI M. HYOPNEUMONIAE E M. BOVIS CERCHEREMO DI PROGETTARE UN VACCINO VIVO CANCELLANDO I GENI DELLA VIRULENZA E DI UTILIZZARE LA CELLULA VIVA COME OSPITE PER UN EVENTUALE VACCINO COMBI, PER ESPRESSIONE QUIROLOGIA DELLE PROTEINE ANTIGENICAS DI ALTRI PATOGENI SUINI (P.E., CIRCOVIRUS) E BOVINI (P.E., BHV-1, BRSV, ECC.). QUESTO RICHIEDE METODI DI TRASFORMAZIONE, CHE ABBIAMO GIÀ RAGGIUNTO IN M. HYOPNEUMONIAE E CHE SARANNO ESTESI A M. BOVIS, CON UNA STORIA CHE INDICA CHE POTREBBE ESSERE TRASFORMATO PER TRANSIZIONE E OMOLOGAZIONE. INFINE, NEL CASO DI M. HYORHINIS, ANCHE SE IL SUO RUOLO DI AGENTE PATOGENO È GIÀ STATO MENZIONATO, IN QUESTO PROGETTO NE ESPLOREREMO UN ALTRO ASPETTO. RECENTEMENTE, È STATO APPENA DESCRITTO CHE ALCUNE DELLE SUE PROTEINE DELLA MEMBRANA HANNO ATTIVITÀ ANTIAGREGACION DELLE BETAPEPTIDS DI ALZHEIMER. QUESTO EFFETTO È MEDIATO DA UN'ECCESSIVA ESPRESSIONE DEL GENE DELLA CALPASTATINA (INIBITORE DELLA CALPATINA) NELLE CELLULE UMANE. CERCHEREMO DI PURIFICARE, IDENTIFICARE E CARATTERIZZARE QUESTO O QUESTI COMPONENTI ED EFFETTUARE PROVE SU UN MODELLO RATON, DISPONIBILE IN UN ALTRO GRUPPO DELLA NOSTRA UNIVERSITÀ, AL FINE DI IDENTIFICARE IL MECCANISMO SOTTOSTANTE. (Italian) / rank | |||||||||||||||
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| Property / summary: I MICOPLASMI RAPPRESENTANO UNO DEI SISTEMI BIOLOGICI PIÙ SEMPLICI E SONO UN BUON MODELLO DI MINIMO GENE E CELLULE MINIMA-REPLICATIVE. NONOSTANTE LA SUA SEMPLICITÀ, LA SUA BIOLOGIA DI BASE È MOLTO SCONOSCIUTA E HA UN GRAN NUMERO DI GENI SENZA ANNOTAZIONI FUNZIONALI. LA MAGGIOR PARTE DEI MICOPLASMI SONO PARASSITI E PATOGENI DI VARIE SPECIE ANIMALI, COMPRESE LE SPECIE UMANE. L'OBIETTIVO FONDAMENTALE DI QUESTO PROGETTO È QUELLO DI PROGETTARE STRATEGIE PER LA LORO PROFILASSI O TERAPIA, SOPRATTUTTO CERCANDO DI OTTENERE VACCINI CONTRO ALCUNI MICOPLASMI. NELLO SPECIFICO, CI CONCENTREREMO SULLE SEGUENTI SPECIE: MYCOPLASMA GENITALIUM, PATOGENO DEL SISTEMA UROGENITALE UMANO; MYCOPLASMA HYOPNEUMONIAE, IMPORTANTE PATOGENO RESPIRATORIO NEI SUINI; MYCOPLASMA BOVIS, UN IMPORTANTE AGENTE RESPIRATORIO NEI BOVINI; MYCOPLASMA HYORHINIS, PATOGENO DEI SUINI E COLPISCE ANCHE L'UOMO (RELATIVO AL CANCRO ALLA PROSTATA). M. GENITALIUM È LA SPECIE CHE ABBIAMO STUDIATO IN PRECEDENZA, IN GRAN PARTE PER LA SUA MAGGIORE FACILITÀ DI TRASFORMAZIONE E MANIPOLAZIONE GENETICA IN GENERALE E PERCHÉ È UN MODELLO DI GENOMA MINIMO. CI HA PERMESSO DI ACQUISIRE ESPERIENZA NELLA GESTIONE GENETICA E NELLA MANIPOLAZIONE DI QUESTI DIFFICILI MICRORGANISMI, NONCHÉ NELL'ANALISI DEI MECCANISMI DI PATOGENICITÀ DEI MICOPLASMI E NELL'IDENTIFICAZIONE E CARATTERIZZAZIONE (IN ALCUNI CASI A LIVELLO DI STRUTTURA CRYSTALOGRAMICA) DELLE PROTEINE COINVOLTE IN ESSI. IN QUESTO CASO, PIUTTOSTO CHE UN VACCINO, RITENIAMO INTERESSANTE TRACCIARE L'ATTIVITÀ INIBITORIA DI UNA LIBRERIA DI COMPOSTI SVILUPPATA NEL PRECEDENTE PROGETTO COORDINATO E VOLTA A INATTIVARE LA GLICOSILTRANSFERASI DEL MICRORGANISMO. ALCUNI DI QUESTI ENZIMI SONO TOTALMENTE INDISPENSABILI PER MYCOPLASMA E MOSTRANO ATTIVITÀ MOLTO SPECIFICHE, QUINDI SONO BUONI CANDIDATI PER GLI OBIETTIVI TERAPEUTICI. INOLTRE, CONTINUEREMO A STUDIARE LE BASI MOLECOLARI DELLA SUA PATOGENICITÀ, IDENTIFICANDO I GENI DELLA VIRULENZA IN PARTICOLARE QUELLI LEGATI AL MECCANISMO DI ADESIONE E ALLE COMPLESSE RETI DI REGOLAZIONE GENICA. IL VOSTRO GENOMA SARÀ ANCHE RIANOTATO SULLA BASE DI UN'ANALISI PROTEOGENOMICA E BIOINFORMATICA, REANOTATION CHE SARÀ ESTESA AI GENI ORTOLOGHI DI ALTRE SPECIE DI MYCOPLASMA. NEL CASO DI M. HYOPNEUMONIAE E M. BOVIS CERCHEREMO DI PROGETTARE UN VACCINO VIVO CANCELLANDO I GENI DELLA VIRULENZA E DI UTILIZZARE LA CELLULA VIVA COME OSPITE PER UN EVENTUALE VACCINO COMBI, PER ESPRESSIONE QUIROLOGIA DELLE PROTEINE ANTIGENICAS DI ALTRI PATOGENI SUINI (P.E., CIRCOVIRUS) E BOVINI (P.E., BHV-1, BRSV, ECC.). QUESTO RICHIEDE METODI DI TRASFORMAZIONE, CHE ABBIAMO GIÀ RAGGIUNTO IN M. HYOPNEUMONIAE E CHE SARANNO ESTESI A M. BOVIS, CON UNA STORIA CHE INDICA CHE POTREBBE ESSERE TRASFORMATO PER TRANSIZIONE E OMOLOGAZIONE. INFINE, NEL CASO DI M. HYORHINIS, ANCHE SE IL SUO RUOLO DI AGENTE PATOGENO È GIÀ STATO MENZIONATO, IN QUESTO PROGETTO NE ESPLOREREMO UN ALTRO ASPETTO. RECENTEMENTE, È STATO APPENA DESCRITTO CHE ALCUNE DELLE SUE PROTEINE DELLA MEMBRANA HANNO ATTIVITÀ ANTIAGREGACION DELLE BETAPEPTIDS DI ALZHEIMER. QUESTO EFFETTO È MEDIATO DA UN'ECCESSIVA ESPRESSIONE DEL GENE DELLA CALPASTATINA (INIBITORE DELLA CALPATINA) NELLE CELLULE UMANE. CERCHEREMO DI PURIFICARE, IDENTIFICARE E CARATTERIZZARE QUESTO O QUESTI COMPONENTI ED EFFETTUARE PROVE SU UN MODELLO RATON, DISPONIBILE IN UN ALTRO GRUPPO DELLA NOSTRA UNIVERSITÀ, AL FINE DI IDENTIFICARE IL MECCANISMO SOTTOSTANTE. (Italian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 16 January 2022
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Revision as of 13:06, 16 January 2022
Project Q3160298 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | ANALYSIS OF VIRULENCE AND PATHOGENICITY MECHANISMS IN MYCOPLASMAS: DESIGN OF VACCINES AGAINST SOME SPECIES OF CLINICAL INTEREST |
Project Q3160298 in Spain |
Statements
105,875.0 Euro
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211,750.0 Euro
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50.0 percent
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1 January 2014
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31 December 2017
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UNIVERSIDAD AUTONOMA DE BARCELONA
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41°29'27.71"N, 2°8'15.00"E
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08266
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LOS MICOPLASMAS REPRESENTAN UNO DE LOS SISTEMAS BIOLOGICOS MAS SIMPLES CONOCIDOS Y SON UN BUEN MODELO DE ¿GENOMA MINIMO¿ Y ¿CELULA MINIMA¿ AUTORREPLICATIVA. PESE A SU SIMPLICIDAD, SU BIOLOGIA BASICA ES MUY DESCONOCIDA Y PRESENTAN UN GRAN NUMERO DE GENES SIN ANOTACION FUNCIONAL. LA MAYORIA DE LOS MICOPLASMAS SON PARASITOS Y PATOGENOS DE DIVERSAS ESPECIES ANIMALES, INCLUYENDO LA ESPECIE HUMANA. EL OBJETIVO FUNDAMENTAL DEL PRESENTE PROYECTO ES DISEÑAR ESTRATEGIAS PARA SU PROFILAXIS O TERAPIA, ESPECIALMENTE TRATANDO DE OBTENER VACUNAS CONTRA ALGUNOS MICOPLASMAS. CONCRETAMENTE NOS CENTRAREMOS EN LAS SIGUIENTES ESPECIES: MYCOPLASMA GENITALIUM, PATOGENO DEL SISTEMA UROGENITAL HUMANO; MYCOPLASMA HYOPNEUMONIAE, IMPORTANTE PATOGENO RESPIRATORIO DEL GANADO PORCINO; MYCOPLASMA BOVIS, IMPORTANTE PATOGENO RESPIRATORIO DEL GANADO BOVINO; MYCOPLASMA HYORHINIS, PATOGENO DEL GANADO PORCINO Y TAMBIEN AFECTA A HUMANOS (RELACIONADO CON EL CANCER DE PROSTATA). M. GENITALIUM ES LA ESPECIE QUE PREVIAMENTE MAS HEMOS ESTUDIADO, EN GRAN PARTE POR SU MAYOR FACILIDAD DE TRANSFORMACION Y MANIPULACION GENETICA EN GENERAL Y POR TRATARSE DE UN MODELO DE GENOMA MINIMO. NOS HA PERMITIDO ADQUIRIR EXPERIENCIA EN EL MANEJO Y MANIPULACION GENETICA DE ESTOS DIFICILES MICROORGANISMOS ASI COMO EN ANALIZAR LOS MECANISMOS DE PATOGENICIDAD DE LOS MICOPLASMAS E IDENTIFICAR Y CARACTERIZAR (EN ALGUNOS CASOS A NIVEL DE ESTRUCTURA CRISTALOGRAFICA) LAS PROTEINAS INVOLUCRADAS EN LOS MISMOS. EN ESTE CASO, MAS QUE UNA VACUNA CREEMOS INTERESANTE RASTREAR LA ACTIVIDAD INHIBIDORA DE UNA LIBRERIA DE COMPUESTOS DESARROLLADOS EN EL ANTERIOR PROYECTO COORDINADO Y DIRIGIDOS A INACTIVAR LAS GLICOSIL-TRANSFERASAS DEL MICROORGANISMO. ALGUNAS DE ESTAS ENZIMAS SON TOTALMENTE INDISPENSABLES PARA MICOPLASMA Y EXHIBEN ACTIVIDADES MUY ESPECIFICAS, POR LO QUE SON BUENAS CANDIDATAS A DIANAS TERAPEUTICAS. ADEMAS, SEGUIREMOS ESTUDIANDO LAS BASES MOLECULARES DE SU PATOGENICIDAD, IDENTIFICANDO GENES DE VIRULENCIA ESPECIALMENTE AQUELLOS RELACIONADOS CON EL MECANISMO DE ADHESION Y REDES COMPLEJAS DE REGULACION GENICA. TAMBIEN SE REANOTARA SU GENOMA EN BASE A UN ANALISIS PROTEOGENOMICO Y BIOINFORMATICO, REANOTACION QUE SERA EXTENSIBLE A LOS GENES ORTOLOGOS DE OTRAS ESPECIES DE MICOPLASMAS. EN EL CASO DE M. HYOPNEUMONIAE Y M. BOVIS TRATAREMOS DE DISEÑAR UNA VACUNA VIVA POR DELECION DE GENES DE VIRULENCIA ASI COMO UTILIZAR LA CELULA VIVA VACUNAL COMO HUESPED PARA UNA POSIBLE VACUNA COMBI, POR EXPRESION HEREROLOGA DE PROTEINAS ANTIGENICAS DE OTROS PATOGENOS PORCINOS (P.E., CIRCOVIRUS) Y BOVINOS (P.E., BHV-1, BRSV, ETC) RESPECTIVAMENTE. ESTO REQUIERE DISPONER DE METODOS DE TRANSFORMACION, COSA QUE YA HEMOS CONSEGUIDO EN M. HYOPNEUMONIAE Y QUE SE VA A EXTENDER A M. BOVIS, CON ANTECEDENTES QUE INDICAN QUE PODRIA SER TRANSFORMADO MEDIANTE TRANSPOSICION Y RECOMBINACION HOMOLOGA. FINALMENTE, EN EL CASO DE M. HYORHINIS, AUNQUE YA SE HA MENCIONADO SU PAPEL COMO PATOGENO, EN EL PRESENTE PROYECTO VAMOS A EXPLORAR OTRA FACETA DEL MISMO. RECIENTEMENTE SE ACABA DE DESCRIBIR QUE ALGUNA/S DE SUS PROTEINAS DE MEMBRANA PRESENTA ACTIVIDAD ANTIAGREGACION DE LOS BETAPEPTIDOS DEL ALZHEIMER. ESTE EFECTO VENDRIA MEDIADO POR UNA SOBREEXPRESION DEL GEN DE LA CALPASTATINA (INHIBIDOR DE LA CALPAINA) EN LAS CELULAS HUMANAS. TRATAREMOS DE PURIFICAR, IDENTIFICAR Y CARACTERIZAR ESTE O ESTOS COMPONENTES Y DE REALIZAR ENSAYOS EN UN MODELO DE RATON, DISPONIBLE EN OTRO GRUPO DE NUESTRA UNIVERSIDAD, CON OBJETO DE IDENTIFICAR EL MECANISMO SUBYACENTE. (Spanish)
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MYCOPLASMAS REPRESENT ONE OF THE SIMPLEST KNOWN BIOLOGICAL SYSTEMS AND ARE A GOOD MODEL OF MINIMO GENE AND MINIMA-REPLICATIVE CELL. DESPITE ITS SIMPLICITY, ITS BASIC BIOLOGY IS VERY UNKNOWN AND HAS A LARGE NUMBER OF GENES WITHOUT FUNCTIONAL ANNOTATION. MOST MYCOPLASMAS ARE PARASITES AND PATHOGENS OF VARIOUS ANIMAL SPECIES, INCLUDING THE HUMAN SPECIES. THE FUNDAMENTAL OBJECTIVE OF THIS PROJECT IS TO DESIGN STRATEGIES FOR THEIR PROPHYLAXIS OR THERAPY, ESPECIALLY BY TRYING TO OBTAIN VACCINES AGAINST SOME MYCOPLASMAS. SPECIFICALLY, WE WILL FOCUS ON THE FOLLOWING SPECIES: MYCOPLASMA GENITALIUM, PATHOGEN OF THE HUMAN UROGENITAL SYSTEM; MYCOPLASMA HYOPNEUMONIAE, IMPORTANT RESPIRATORY PATHOGEN IN PIGS; MYCOPLASMA BOVIS, AN IMPORTANT RESPIRATORY PATHOGEN IN CATTLE; MYCOPLASMA HYORHINIS, PATHOGEN OF PIGS AND ALSO AFFECTS HUMANS (RELATED TO PROSTATE CANCER). M. GENITALIUM IS THE SPECIES THAT WE HAVE PREVIOUSLY STUDIED MOST, LARGELY FOR ITS GREATER EASE OF TRANSFORMATION AND GENETIC MANIPULATION IN GENERAL AND BECAUSE IT IS A MODEL OF A MINIMAL GENOME. IT HAS ALLOWED US TO GAIN EXPERIENCE IN THE GENETIC MANAGEMENT AND MANIPULATION OF THESE DIFFICULT MICROORGANISMS AS WELL AS IN ANALYSING THE PATHOGENICITY MECHANISMS OF MYCOPLASMAS AND IDENTIFYING AND CHARACTERISING (IN SOME CASES AT THE LEVEL OF CRYSTALOGRAMIC STRUCTURE) THE PROTEINS INVOLVED IN THEM. IN THIS CASE, RATHER THAN A VACCINE, WE THINK IT INTERESTING TO TRACK THE INHIBITORY ACTIVITY OF A LIBRARY OF COMPOUNDS DEVELOPED IN THE PREVIOUS COORDINATED PROJECT AND AIMED AT INACTIVATING THE GLYCOSYLTRANSFERASE OF THE MICROORGANISM. SOME OF THESE ENZYMES ARE TOTALLY INDISPENSABLE FOR MYCOPLASMA AND EXHIBIT VERY SPECIFIC ACTIVITIES, SO THEY ARE GOOD CANDIDATES FOR THERAPEUTIC TARGETS. IN ADDITION, WE WILL CONTINUE TO STUDY THE MOLECULAR BASES OF ITS PATHOGENICITY, IDENTIFYING VIRULENCE GENES ESPECIALLY THOSE RELATED TO THE ADHESION MECHANISM AND COMPLEX NETWORKS OF GENIC REGULATION. YOUR GENOME WILL ALSO BE REANOTATED BASED ON A PROTEOGENOMIC AND BIOINFORMATIC ANALYSIS, REANOTATION THAT WILL BE EXTENDED TO THE ORTHOLOGOUS GENES OF OTHER MYCOPLASMA SPECIES. IN THE CASE OF M. HYOPNEUMONIAE AND M. BOVIS WE WILL TRY TO DESIGN A LIVE VACCINE BY DELETION OF VIRULENCE GENES AS WELL AS USE THE LIVE CELL AS A HOST FOR A POSSIBLE COMBI VACCINE, BY EXPRESSION HEREROLOGY OF PROTEINS ANTIGENICAS OF OTHER PORCINE PATHOGENS (P.E., CIRCOVIRUS) AND CATTLE (P.E., BHV-1, BRSV, ETC.) RESPECTIVELY. THIS REQUIRES HAVING METHODS OF TRANSFORMATION, WHICH WE HAVE ALREADY ACHIEVED IN M. HYOPNEUMONIAE AND THAT WILL BE EXTENDED TO M. BOVIS, WITH A HISTORY THAT INDICATES THAT IT COULD BE TRANSFORMED BY TRANSITION AND HOMOLOGATION. FINALLY, IN THE CASE OF M. HYORHINIS, ALTHOUGH HIS ROLE AS A PATHOGEN HAS ALREADY BEEN MENTIONED, IN THIS PROJECT WE WILL EXPLORE ANOTHER FACET OF IT. RECENTLY, IT HAS JUST BEEN DESCRIBED THAT SOME OF ITS MEMBRANE PROTEINS HAVE ACTIVITY ANTIAGREGACION OF ALZHEIMER’S BETAPEPTIDS. THIS EFFECT IS MEDIATED BY AN OVEREXPRESSION OF THE CALPASTATIN GENE (CALPAIN INHIBITOR) IN HUMAN CELLS. WE WILL TRY TO PURIFY, IDENTIFY AND CHARACTERISE THIS OR THESE COMPONENTS AND CARRY OUT TRIALS ON A RATON MODEL, AVAILABLE IN ANOTHER GROUP OF OUR UNIVERSITY, IN ORDER TO IDENTIFY THE UNDERLYING MECHANISM. (English)
12 October 2021
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LES MYCOPLASMES REPRÉSENTENT L’UN DES SYSTÈMES BIOLOGIQUES LES PLUS SIMPLES CONNUS ET SONT UN BON MODÈLE DE GÈNE MINIMO ET DE CELLULES REPRODUCTRICES MINIMA. MALGRÉ SA SIMPLICITÉ, SA BIOLOGIE DE BASE EST TRÈS INCONNUE ET POSSÈDE UN GRAND NOMBRE DE GÈNES SANS ANNOTATION FONCTIONNELLE. LA PLUPART DES MYCOPLASMES SONT DES PARASITES ET DES AGENTS PATHOGÈNES DE DIVERSES ESPÈCES ANIMALES, Y COMPRIS LES ESPÈCES HUMAINES. L’OBJECTIF FONDAMENTAL DE CE PROJET EST DE CONCEVOIR DES STRATÉGIES DE PROPHYLAXIE OU DE THÉRAPIE, NOTAMMENT EN ESSAYANT D’OBTENIR DES VACCINS CONTRE CERTAINS MYCOPLASMES. PLUS PRÉCISÉMENT, NOUS NOUS CONCENTRERONS SUR LES ESPÈCES SUIVANTES: MYCOPLASMA GENITALIUM, PATHOGÈNE DU SYSTÈME UROGENITAL HUMAIN; MYCOPLASMA HYOPNEUMONIAE, IMPORTANT PATHOGÈNE RESPIRATOIRE CHEZ LES PORCS; MYCOPLASMA BOVIS, UN IMPORTANT AGENT PATHOGÈNE RESPIRATOIRE CHEZ LES BOVINS; MYCOPLASMA HYORHINIS, AGENT PATHOGÈNE DES PORCS ET AFFECTE ÉGALEMENT LES HUMAINS (LIÉS AU CANCER DE LA PROSTATE). M. GENITALIUM EST L’ESPÈCE QUE NOUS AVONS LE PLUS ÉTUDIÉE PRÉCÉDEMMENT, EN GRANDE PARTIE POUR SA PLUS GRANDE FACILITÉ DE TRANSFORMATION ET DE MANIPULATION GÉNÉTIQUE EN GÉNÉRAL ET PARCE QU’IL S’AGIT D’UN MODÈLE D’UN GÉNOME MINIMAL. ELLE NOUS A PERMIS D’ACQUÉRIR DE L’EXPÉRIENCE DANS LA GESTION GÉNÉTIQUE ET LA MANIPULATION DE CES MICRO-ORGANISMES DIFFICILES AINSI QUE DANS L’ANALYSE DES MÉCANISMES PATHOGÈNES DES MYCOPLASMES ET L’IDENTIFICATION ET LA CARACTÉRISATION (DANS CERTAINS CAS AU NIVEAU DE LA STRUCTURE CRYSTALOGRAMIQUE) DES PROTÉINES QUI Y SONT IMPLIQUÉES. DANS CE CAS, PLUTÔT QU’UN VACCIN, NOUS PENSONS QU’IL EST INTÉRESSANT DE SUIVRE L’ACTIVITÉ INHIBITRICE D’UNE BIBLIOTHÈQUE DE COMPOSÉS DÉVELOPPÉE DANS LE PROJET COORDONNÉ PRÉCÉDENT ET VISANT À INACTIVER LA GLYCOSYLTRANSFÉRASE DU MICRO-ORGANISME. CERTAINES DE CES ENZYMES SONT TOTALEMENT INDISPENSABLES POUR MYCOPLASMA ET PRÉSENTENT DES ACTIVITÉS TRÈS SPÉCIFIQUES, DE SORTE QU’ELLES SONT DE BONS CANDIDATS POUR DES CIBLES THÉRAPEUTIQUES. EN OUTRE, NOUS CONTINUERONS À ÉTUDIER LES BASES MOLÉCULAIRES DE SA PATHOGÉNICITÉ, EN IDENTIFIANT LES GÈNES DE VIRULENCE, EN PARTICULIER CEUX LIÉS AU MÉCANISME D’ADHÉSION ET AUX RÉSEAUX COMPLEXES DE RÉGULATION GÉNIQUE. VOTRE GÉNOME SERA ÉGALEMENT REANOTATED BASÉ SUR UNE ANALYSE PROTEOGENOMIC ET BIOINFORMATIQUE, REANOTATION QUI SERA ÉTENDUE AUX GÈNES ORTHOLOGUES D’AUTRES ESPÈCES DE MYCOPLASMA. DANS LE CAS DE M. HYOPNEUMONIAE ET DE M. BOVIS, NOUS TENTERONS DE CONCEVOIR UN VACCIN VIVANT PAR SUPPRESSION DES GÈNES DE VIRULENCE AINSI QUE D’UTILISER LA CELLULE VIVANTE COMME HÔTE D’UN POSSIBLE VACCIN COMBI, PAR L’EXPRESSION HEREROLOGIE DES PROTÉINES ANTIGENICAS D’AUTRES PATHOGÈNES PORCINS (P.E., CIRCOVIRUS) ET DES BOVINS (P.E., BHV-1, BRSV, ETC.) RESPECTIVEMENT. CELA NÉCESSITE DES MÉTHODES DE TRANSFORMATION, QUE NOUS AVONS DÉJÀ RÉALISÉES CHEZ M. HYOPNEUMONIAE ET QUI SERONT ÉTENDUES À M. BOVIS, AVEC UNE HISTOIRE QUI INDIQUE QU’IL POURRAIT ÊTRE TRANSFORMÉ PAR LA TRANSITION ET L’HOMOLOGATION. ENFIN, DANS LE CAS DE M. HYORHINIS, BIEN QUE SON RÔLE D’AGENT PATHOGÈNE AIT DÉJÀ ÉTÉ MENTIONNÉ, DANS CE PROJET, NOUS EXPLORERONS UNE AUTRE FACETTE DE CELUI-CI. RÉCEMMENT, IL VIENT D’ÊTRE DÉCRIT QUE CERTAINES DE SES PROTÉINES MEMBRANAIRES ONT UNE ACTIVITÉ ANTIAGREGACION DES BETAPEPTIDS ALZHEIMER. CET EFFET EST MÉDIÉ PAR UNE SUREXPRESSION DU GÈNE DE LA CALPASTATINE (INHIBITEUR DE LA CALPASTATINE) DANS LES CELLULES HUMAINES. NOUS TENTERONS DE PURIFIER, D’IDENTIFIER ET DE CARACTÉRISER CE OU CES COMPOSANTS ET DE RÉALISER DES ESSAIS SUR UN MODÈLE RATON, DISPONIBLE DANS UN AUTRE GROUPE DE NOTRE UNIVERSITÉ, AFIN D’IDENTIFIER LE MÉCANISME SOUS-JACENT. (French)
4 December 2021
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MYKOPLASMEN STELLEN EINES DER EINFACHSTEN BEKANNTEN BIOLOGISCHEN SYSTEME DAR UND SIND EIN GUTES MODELL VON MINIMO-GEN UND MINIMA-REPLIKATIONSZELLE. TROTZ SEINER EINFACHHEIT IST SEINE GRUNDLEGENDE BIOLOGIE SEHR UNBEKANNT UND HAT EINE GROSSE ANZAHL VON GENEN OHNE FUNKTIONELLE ANNOTATION. DIE MEISTEN MYKOPLASMEN SIND PARASITEN UND KRANKHEITSERREGER VERSCHIEDENER TIERARTEN, EINSCHLIESSLICH DER MENSCHLICHEN SPEZIES. DAS GRUNDLEGENDE ZIEL DIESES PROJEKTS IST ES, STRATEGIEN FÜR IHRE PROPHYLAXE ODER THERAPIE ZU ENTWERFEN, INSBESONDERE DURCH DEN VERSUCH, IMPFSTOFFE GEGEN EINIGE MYKOPLASMEN ZU ERHALTEN. INSBESONDERE WERDEN WIR UNS AUF FOLGENDE ARTEN KONZENTRIEREN: MYCOPLASMA GENITALIUM, ERREGER DES MENSCHLICHEN UROGENITALSYSTEMS; MYCOPLASMA HYOPNEUMONIAE, WICHTIGER ATEMWEGSERREGER BEI SCHWEINEN; MYCOPLASMA BOVIS, EIN WICHTIGER ATEMWEGSERREGER BEI RINDERN; MYCOPLASMA HYORHINIS, ERREGER VON SCHWEINEN UND BETRIFFT AUCH DEN MENSCHEN (BEZOGEN AUF PROSTATAKREBS). M. GENITALIUM IST DIE ART, DIE WIR BISHER AM MEISTEN UNTERSUCHT HABEN, VOR ALLEM WEGEN IHRER GRÖSSEREN ERLEICHTERUNG DER TRANSFORMATION UND GENETISCHEN MANIPULATION IM ALLGEMEINEN UND WEIL ES EIN MODELL EINES MINIMALEN GENOMS IST. ES HAT UNS ERMÖGLICHT, ERFAHRUNGEN IN DER GENETISCHEN VERWALTUNG UND MANIPULATION DIESER SCHWIERIGEN MIKROORGANISMEN ZU SAMMELN SOWIE DIE PATHOGENITÄTSMECHANISMEN VON MYKOPLASMEN ZU ANALYSIEREN UND DIE AN IHNEN BETEILIGTEN PROTEINE ZU IDENTIFIZIEREN UND ZU CHARAKTERISIEREN (IN EINIGEN FÄLLEN AUF DER EBENE DER CRYSTALOGRAMIC-STRUKTUR). IN DIESEM FALL HALTEN WIR ES FÜR INTERESSANT, DIE HEMMUNGSAKTIVITÄT EINER IM VORANGEGANGENEN KOORDINIERTEN PROJEKT ENTWICKELTEN BIBLIOTHEK VON VERBINDUNGEN ZU VERFOLGEN, DIE DARAUF ABZIELTE, DIE GLYKOSYLTRANSFERASE DES MIKROORGANISMUS ZU INAKTIVIEREN. EINIGE DIESER ENZYME SIND FÜR MYCOPLASMA ABSOLUT UNVERZICHTBAR UND ZEIGEN SEHR SPEZIFISCHE AKTIVITÄTEN, SO DASS SIE GUTE KANDIDATEN FÜR THERAPEUTISCHE ZIELE SIND. DARÜBER HINAUS WERDEN WIR WEITERHIN DIE MOLEKULAREN GRUNDLAGEN SEINER PATHOGENITÄT UNTERSUCHEN UND VIRULENZGENE IDENTIFIZIEREN, INSBESONDERE JENE, DIE MIT DEM ADHÄSIONSMECHANISMUS UND KOMPLEXEN NETZEN DER GENREGULIERUNG ZUSAMMENHÄNGEN. IHR GENOM WIRD AUCH AUF DER GRUNDLAGE EINER PROTEOGENOMIC UND BIOINFORMATISCHEN ANALYSE, REANOTATION, DIE AUF DIE ORTHOLOGEN GENE ANDERER MYCOPLASMA-ARTEN ERWEITERT WERDEN. IM FALLE VON M. HYOPNEUMONIAE UND M. BOVIS WERDEN WIR VERSUCHEN, EINEN LEBENDIMPFSTOFF DURCH STREICHUNG VON VIRULENZGENEN ZU ENTWERFEN UND DIE LEBENDE ZELLE ALS WIRT FÜR EINEN MÖGLICHEN COMBI-IMPFSTOFF ZU VERWENDEN, INDEM WIR HIERROLOGIE VON PROTEINEN ANTIGENICAS ANDERER SCHWEINEERREGER (P.E., ZIRKOVIRUS) BZW. RINDERN (P.E., BHV-1, BRSV USW.) ENTWICKELN. DIES ERFORDERT METHODEN DER TRANSFORMATION, DIE WIR BEREITS IN M. HYOPNEUMONIAE ERREICHT HABEN UND DIE AUF M. BOVIS AUSGEDEHNT WERDEN, MIT EINER GESCHICHTE, DIE DARAUF HINDEUTET, DASS SIE DURCH ÜBERGANG UND HOMOLOGATION VERÄNDERT WERDEN KÖNNTE. SCHLIESSLICH, IM FALL VON M. HYORHINIS, OBWOHL SEINE ROLLE ALS KRANKHEITSERREGER BEREITS ERWÄHNT WURDE, WERDEN WIR IN DIESEM PROJEKT EINE WEITERE FACETTE DAVON ERFORSCHEN. VOR KURZEM WURDE GERADE BESCHRIEBEN, DASS EINIGE SEINER MEMBRANPROTEINE AKTIVITÄT ANTIAGREGACION VON ALZHEIMER-BETAPEPTIDS HABEN. DIESER EFFEKT WIRD DURCH EINE ÜBEREXPRESSION DES CALPASTATIN-GENS (CALPAIN-INHIBITOR) IN MENSCHLICHEN ZELLEN VERMITTELT. WIR WERDEN VERSUCHEN, DIESE ODER DIESE KOMPONENTEN ZU REINIGEN, ZU IDENTIFIZIEREN UND ZU CHARAKTERISIEREN UND VERSUCHE AN EINEM RATON-MODELL DURCHZUFÜHREN, DAS IN EINER ANDEREN GRUPPE UNSERER UNIVERSITÄT VERFÜGBAR IST, UM DEN ZUGRUNDE LIEGENDEN MECHANISMUS ZU IDENTIFIZIEREN. (German)
9 December 2021
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MYCOPLASMA’S VERTEGENWOORDIGEN EEN VAN DE EENVOUDIGST BEKENDE BIOLOGISCHE SYSTEMEN EN ZIJN EEN GOED MODEL VAN MINIMO-GEN EN MINIMA-REPLICATIEVE CEL. ONDANKS ZIJN EENVOUD, IS DE BASISBIOLOGIE ZEER ONBEKEND EN HEEFT EEN GROOT AANTAL GENEN ZONDER FUNCTIONELE ANNOTATIE. DE MEESTE MYCOPLASMA’S ZIJN PARASIETEN EN ZIEKTEVERWEKKERS VAN VERSCHILLENDE DIERSOORTEN, WAARONDER DE MENSELIJKE SOORTEN. HET FUNDAMENTELE DOEL VAN DIT PROJECT IS HET ONTWERPEN VAN STRATEGIEËN VOOR HUN PROFYLAXE OF THERAPIE, VOORAL DOOR TE PROBEREN VACCINS TE VERKRIJGEN TEGEN SOMMIGE MYCOPLASMA’S. SPECIFIEK ZULLEN WE ONS RICHTEN OP DE VOLGENDE SOORTEN: MYCOPLASMA GENITALIUM, PATHOGEEN VAN HET MENSELIJKE UROGENITALE SYSTEEM; MYCOPLASMA HYOPNEUMONIAE, BELANGRIJKE RESPIRATOIRE ZIEKTEVERWEKKER BIJ VARKENS; MYCOPLASMA BOVIS, EEN BELANGRIJKE RESPIRATOIRE ZIEKTEVERWEKKER BIJ RUNDEREN; MYCOPLASMA HYORHINIS, ZIEKTEVERWEKKER VAN VARKENS EN TREFT OOK MENSEN (VERWANT AAN PROSTAATKANKER). M. GENITALIUM IS DE SOORT DIE WE EERDER HET MEEST HEBBEN BESTUDEERD, GROTENDEELS VANWEGE ZIJN GROTERE GEMAK VAN TRANSFORMATIE EN GENETISCHE MANIPULATIE IN HET ALGEMEEN EN OMDAT HET EEN MODEL IS VAN EEN MINIMAAL GENOOM. HET HEEFT ONS IN STAAT GESTELD OM ERVARING OP TE DOEN MET HET GENETISCHE BEHEER EN DE MANIPULATIE VAN DEZE MOEILIJKE MICRO-ORGANISMEN EN MET HET ANALYSEREN VAN DE PATHOGENITEITSMECHANISMEN VAN MYCOPLASMA’S EN HET IDENTIFICEREN EN KARAKTERISEREN (IN SOMMIGE GEVALLEN OP HET NIVEAU VAN DE CRYSTALOGRAMIC-STRUCTUUR) VAN DE EIWITTEN DIE ERBIJ BETROKKEN ZIJN. IN DIT GEVAL, IN PLAATS VAN EEN VACCIN, VINDEN WE HET INTERESSANT OM DE REMMENDE ACTIVITEIT TE VOLGEN VAN EEN BIBLIOTHEEK VAN VERBINDINGEN DIE IN HET VORIGE GECOÖRDINEERDE PROJECT IS ONTWIKKELD EN GERICHT IS OP HET INACTIVEREN VAN DE GLYCOSYLTRANSFERASE VAN HET MICRO-ORGANISME. SOMMIGE VAN DEZE ENZYMEN ZIJN ABSOLUUT ONMISBAAR VOOR MYCOPLASMA EN VERTONEN ZEER SPECIFIEKE ACTIVITEITEN, DUS ZE ZIJN GOEDE KANDIDATEN VOOR THERAPEUTISCHE DOELEN. DAARNAAST ZULLEN WE DOORGAAN MET HET BESTUDEREN VAN DE MOLECULAIRE BASEN VAN ZIJN PATHOGENITEIT, WAARBIJ VIRULENTIEGENEN WORDEN GEÏDENTIFICEERD, VOORAL DIE GERELATEERD AAN HET ADHESIEMECHANISME EN COMPLEXE NETWERKEN VAN GENIC VERORDENING. UW GENOOM ZAL OOK REANOTATED WORDEN GEBASEERD OP EEN PROTEOGENOMISCHE EN BIO-INFORMATISCHE ANALYSE, REANOTATION DIE ZAL WORDEN UITGEBREID TOT DE ORTHOLOGE GENEN VAN ANDERE MYCOPLASMA-SOORTEN. IN HET GEVAL VAN M. HYOPNEUMONIAE EN M. BOVIS ZULLEN WE PROBEREN EEN LEVEND VACCIN TE ONTWERPEN DOOR VIRULENTIEGENEN TE VERWIJDEREN EN DE LEVENDE CEL TE GEBRUIKEN ALS GASTHEER VOOR EEN MOGELIJK COMBIVACCIN, DOOR DE EXPRESSIE HIERROLOGIE VAN EIWITTEN ANTIGENICAS VAN ANDERE VARKENSPATHOGENEN (P.E., CIRCOVIRUS) EN RUNDEREN (P.E., BHV-1, BRSV, ENZ.). DIT VEREIST TRANSFORMATIEMETHODEN, DIE WE AL HEBBEN BEREIKT IN M. HYOPNEUMONIAE EN DAT ZAL WORDEN UITGEBREID TOT M. BOVIS, MET EEN GESCHIEDENIS DIE AANGEEFT DAT HET KAN WORDEN GETRANSFORMEERD DOOR OVERGANG EN HOMOLOGATIE. TOT SLOT, IN HET GEVAL VAN M. HYORHINIS, HOEWEL ZIJN ROL ALS ZIEKTEVERWEKKER AL IS GENOEMD, ZULLEN WE IN DIT PROJECT EEN ANDER FACET ERVAN ONDERZOEKEN. ONLANGS IS HET ZOJUIST BESCHREVEN DAT SOMMIGE VAN ZIJN MEMBRAANEIWITTEN ACTIVITEIT ANTIAGREGACION VAN ALZHEIMER BETAPEPTIDS HEBBEN. DIT EFFECT WORDT GEMEDIEERD DOOR EEN OVEREXPRESSIE VAN HET CALPASTATINE-GEN (CALPAINREMMER) IN MENSELIJKE CELLEN. WE ZULLEN PROBEREN DIT OF DEZE COMPONENTEN TE ZUIVEREN, TE IDENTIFICEREN EN TE KARAKTERISEREN EN TESTEN UIT TE VOEREN OP EEN RATON-MODEL, BESCHIKBAAR IN EEN ANDERE GROEP VAN ONZE UNIVERSITEIT, OM HET ONDERLIGGENDE MECHANISME TE IDENTIFICEREN. (Dutch)
17 December 2021
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I MICOPLASMI RAPPRESENTANO UNO DEI SISTEMI BIOLOGICI PIÙ SEMPLICI E SONO UN BUON MODELLO DI MINIMO GENE E CELLULE MINIMA-REPLICATIVE. NONOSTANTE LA SUA SEMPLICITÀ, LA SUA BIOLOGIA DI BASE È MOLTO SCONOSCIUTA E HA UN GRAN NUMERO DI GENI SENZA ANNOTAZIONI FUNZIONALI. LA MAGGIOR PARTE DEI MICOPLASMI SONO PARASSITI E PATOGENI DI VARIE SPECIE ANIMALI, COMPRESE LE SPECIE UMANE. L'OBIETTIVO FONDAMENTALE DI QUESTO PROGETTO È QUELLO DI PROGETTARE STRATEGIE PER LA LORO PROFILASSI O TERAPIA, SOPRATTUTTO CERCANDO DI OTTENERE VACCINI CONTRO ALCUNI MICOPLASMI. NELLO SPECIFICO, CI CONCENTREREMO SULLE SEGUENTI SPECIE: MYCOPLASMA GENITALIUM, PATOGENO DEL SISTEMA UROGENITALE UMANO; MYCOPLASMA HYOPNEUMONIAE, IMPORTANTE PATOGENO RESPIRATORIO NEI SUINI; MYCOPLASMA BOVIS, UN IMPORTANTE AGENTE RESPIRATORIO NEI BOVINI; MYCOPLASMA HYORHINIS, PATOGENO DEI SUINI E COLPISCE ANCHE L'UOMO (RELATIVO AL CANCRO ALLA PROSTATA). M. GENITALIUM È LA SPECIE CHE ABBIAMO STUDIATO IN PRECEDENZA, IN GRAN PARTE PER LA SUA MAGGIORE FACILITÀ DI TRASFORMAZIONE E MANIPOLAZIONE GENETICA IN GENERALE E PERCHÉ È UN MODELLO DI GENOMA MINIMO. CI HA PERMESSO DI ACQUISIRE ESPERIENZA NELLA GESTIONE GENETICA E NELLA MANIPOLAZIONE DI QUESTI DIFFICILI MICRORGANISMI, NONCHÉ NELL'ANALISI DEI MECCANISMI DI PATOGENICITÀ DEI MICOPLASMI E NELL'IDENTIFICAZIONE E CARATTERIZZAZIONE (IN ALCUNI CASI A LIVELLO DI STRUTTURA CRYSTALOGRAMICA) DELLE PROTEINE COINVOLTE IN ESSI. IN QUESTO CASO, PIUTTOSTO CHE UN VACCINO, RITENIAMO INTERESSANTE TRACCIARE L'ATTIVITÀ INIBITORIA DI UNA LIBRERIA DI COMPOSTI SVILUPPATA NEL PRECEDENTE PROGETTO COORDINATO E VOLTA A INATTIVARE LA GLICOSILTRANSFERASI DEL MICRORGANISMO. ALCUNI DI QUESTI ENZIMI SONO TOTALMENTE INDISPENSABILI PER MYCOPLASMA E MOSTRANO ATTIVITÀ MOLTO SPECIFICHE, QUINDI SONO BUONI CANDIDATI PER GLI OBIETTIVI TERAPEUTICI. INOLTRE, CONTINUEREMO A STUDIARE LE BASI MOLECOLARI DELLA SUA PATOGENICITÀ, IDENTIFICANDO I GENI DELLA VIRULENZA IN PARTICOLARE QUELLI LEGATI AL MECCANISMO DI ADESIONE E ALLE COMPLESSE RETI DI REGOLAZIONE GENICA. IL VOSTRO GENOMA SARÀ ANCHE RIANOTATO SULLA BASE DI UN'ANALISI PROTEOGENOMICA E BIOINFORMATICA, REANOTATION CHE SARÀ ESTESA AI GENI ORTOLOGHI DI ALTRE SPECIE DI MYCOPLASMA. NEL CASO DI M. HYOPNEUMONIAE E M. BOVIS CERCHEREMO DI PROGETTARE UN VACCINO VIVO CANCELLANDO I GENI DELLA VIRULENZA E DI UTILIZZARE LA CELLULA VIVA COME OSPITE PER UN EVENTUALE VACCINO COMBI, PER ESPRESSIONE QUIROLOGIA DELLE PROTEINE ANTIGENICAS DI ALTRI PATOGENI SUINI (P.E., CIRCOVIRUS) E BOVINI (P.E., BHV-1, BRSV, ECC.). QUESTO RICHIEDE METODI DI TRASFORMAZIONE, CHE ABBIAMO GIÀ RAGGIUNTO IN M. HYOPNEUMONIAE E CHE SARANNO ESTESI A M. BOVIS, CON UNA STORIA CHE INDICA CHE POTREBBE ESSERE TRASFORMATO PER TRANSIZIONE E OMOLOGAZIONE. INFINE, NEL CASO DI M. HYORHINIS, ANCHE SE IL SUO RUOLO DI AGENTE PATOGENO È GIÀ STATO MENZIONATO, IN QUESTO PROGETTO NE ESPLOREREMO UN ALTRO ASPETTO. RECENTEMENTE, È STATO APPENA DESCRITTO CHE ALCUNE DELLE SUE PROTEINE DELLA MEMBRANA HANNO ATTIVITÀ ANTIAGREGACION DELLE BETAPEPTIDS DI ALZHEIMER. QUESTO EFFETTO È MEDIATO DA UN'ECCESSIVA ESPRESSIONE DEL GENE DELLA CALPASTATINA (INIBITORE DELLA CALPATINA) NELLE CELLULE UMANE. CERCHEREMO DI PURIFICARE, IDENTIFICARE E CARATTERIZZARE QUESTO O QUESTI COMPONENTI ED EFFETTUARE PROVE SU UN MODELLO RATON, DISPONIBILE IN UN ALTRO GRUPPO DELLA NOSTRA UNIVERSITÀ, AL FINE DI IDENTIFICARE IL MECCANISMO SOTTOSTANTE. (Italian)
16 January 2022
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Cerdanyola del Vallès
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Identifiers
BIO2013-48704-R
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