GENOMIC AND SEXUAL DETERMINATION STUDIES IN SOLE (SOLEA SENEGALENSIS) BY INTEGRATING MAPS (Q3143517): Difference between revisions
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STUDI DI DETERMINAZIONE GENOMICA E SESSUALE NELLA SOGLIOLA (SOLEA SENEGALENSIS) INTEGRANDO LE MAPPE | |||||||||||||||
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LA SOGLIOLA È UNA DELLE SPECIE PIÙ APPREZZATE DAL PUNTO DI VISTA ECONOMICO IN QUANTO TRIPLICA IL PREZZO DI ALTRE SPECIE COMMERCIALI ED È UN BUON CANDIDATO ALLA DIVERSIFICAZIONE DEI MERCATI EUROPEI, SATURATA DALLA SOVRAPPRODUZIONE DI SPIGOLA DORATA E DI SPIGOLA E LA SUA COLTIVAZIONE SI È DIFFUSA IN DIVERSE COMUNITÀ AUTONOME. MA, RISPETTO A QUANTO ACCADE IN ALTRE SPECIE DI PESCI PIATTI, GLI STUDI GENOMICI SULLA SOGLIOLA SONO ANCORA SCARSI. QUESTA SPECIE È CARATTERIZZATA DA UN CARIOTIPO CON 42 CROMOSOMI, E 48 BRACCI CROMOSOMICI, DISTRIBUITI IN 3 COPPIE METACENTRICHE, 2 COPPIE SUBMETACENTRICHE, 4 COPPIE SUBTELOCENTRICHE E 12 COPPIE CROMOSOMICHE ACROCENTRICHE. DURANTE LO SVILUPPO DI DUE PROGETTI CONSECUTIVI, PER I QUALI È ORA RICHIESTO IL RINNOVO, IL GRUPPO UCA HA MESSO A PUNTO UNA MAPPA FISICA PER SOLEA SENEGALENSIS COMPOSTA DA CIRCA 100 BACS, PRECEDENTEMENTE SEQUENZIATI E LOCALIZZATI SUI CROMOSOMI UTILIZZANDO MOLTEPLICI PESCI. I MARCATORI CROMOSOMICI SONO ATTUALMENTE DISPONIBILI PER LE 21 COPPIE NEL GENOMA UNICO. NEL PROGETTO SI PROPONE DI INTEGRARE QUESTA MAPPA CON LA MAPPA DI COLLEGAMENTO COSTRUITA CON 127 MICROSATELITES. A TAL FINE, I BACS CHE LI CONTENGONO SONO AISLARIAN E CARACTERIZZATI, AUMENTANDO COSÌ LA DENSITÀ DELLA MAPPA ESISTENTE. NEL PROGETTO PRECEDENTE PER IL QUALE È RICHIESTO IL RINNOVO, È STATO SCOPERTO UN POSSIBILE LUOGO DI PROTOCHROMOSOMES SESSUALI NELLA SOGLIOLA, CHE SAREBBE AL PARAGRAFO 1. LA DETERMINAZIONE GENETICA DEL SESSO È SPESSO ASSOCIATA ALLA FORMAZIONE DI CROMOSOMI SESSUALI CHE PORTANO IL GENE MAESTRO RESPONSABILE DELLA DETERMINAZIONE DEL SESSO. NELLA SOLA LA DETERMINAZIONE DEL SESSO È XX/XY MA NON CI SONO CROMOSOMI SESSUALI HETEROMORFICUS. PERTANTO, SI PROPONE LA MICRODISECZIONE DI PAR 1 CHE È FACILMENTE IDENTIFICABILE AL MICROSCOPIO PERCHÉ È LA PIÙ GRANDE COPPIA METACENTRICA E IL SUO SEQUENZIAMENTO IN MASCHI E FEMMINE PER CONFRONTARE LE SEQUENZE E DALLE DIFFERENZE, DEDURRE LA PRESENZA DELLA REGIONE E/O GENI DETERMINANTI DEL SESSO. IN ACQUACOLTURA È ESSENZIALE CONOSCERE I MECCANISMI PER DETERMINARE IL SESSO CONSIDERANDO CHE CI SONO PERSONAGGI COME LA CRESCITA CHE PRESENTANO DIMORFISMO SESSUALE. INOLTRE, LA CONOSCENZA DI QUESTO MECCANISMO CONSENTE DI GESTIRE CORRETTAMENTE I LOTTI DI GIOCATORI. IL PROGETTO MIRA INOLTRE A STUDIARE RNA NON CODIFICANTI DI GONADA DI MASCHI E FEMMINE MATURI ALLA RICERCA DI NCRNAS (LNCRNAS E MIRNAS) CHE REGOLANO L'ATTIVITÀ DI SPECIFICI GENI COINVOLTI NEI PROCESSI DI DETERMINAZIONE/DIFFERENZIAZIONE DEL SESSO E DELLA RIPRODUZIONE. L'APPROFONDIMENTO DELLA CONOSCENZA DI QUESTO MECCANISMO CONSENTIRÀ DI STABILIRE STUDI SYNTHENIA CON ALTRE SPECIE ITTICHE ED ESTRAPOLARE I RISULTATI ALLE SPECIE DI INTERESSE PER L'ACQUACOLTURA. (Italian) | |||||||||||||||
| Property / summary: LA SOGLIOLA È UNA DELLE SPECIE PIÙ APPREZZATE DAL PUNTO DI VISTA ECONOMICO IN QUANTO TRIPLICA IL PREZZO DI ALTRE SPECIE COMMERCIALI ED È UN BUON CANDIDATO ALLA DIVERSIFICAZIONE DEI MERCATI EUROPEI, SATURATA DALLA SOVRAPPRODUZIONE DI SPIGOLA DORATA E DI SPIGOLA E LA SUA COLTIVAZIONE SI È DIFFUSA IN DIVERSE COMUNITÀ AUTONOME. MA, RISPETTO A QUANTO ACCADE IN ALTRE SPECIE DI PESCI PIATTI, GLI STUDI GENOMICI SULLA SOGLIOLA SONO ANCORA SCARSI. QUESTA SPECIE È CARATTERIZZATA DA UN CARIOTIPO CON 42 CROMOSOMI, E 48 BRACCI CROMOSOMICI, DISTRIBUITI IN 3 COPPIE METACENTRICHE, 2 COPPIE SUBMETACENTRICHE, 4 COPPIE SUBTELOCENTRICHE E 12 COPPIE CROMOSOMICHE ACROCENTRICHE. DURANTE LO SVILUPPO DI DUE PROGETTI CONSECUTIVI, PER I QUALI È ORA RICHIESTO IL RINNOVO, IL GRUPPO UCA HA MESSO A PUNTO UNA MAPPA FISICA PER SOLEA SENEGALENSIS COMPOSTA DA CIRCA 100 BACS, PRECEDENTEMENTE SEQUENZIATI E LOCALIZZATI SUI CROMOSOMI UTILIZZANDO MOLTEPLICI PESCI. I MARCATORI CROMOSOMICI SONO ATTUALMENTE DISPONIBILI PER LE 21 COPPIE NEL GENOMA UNICO. NEL PROGETTO SI PROPONE DI INTEGRARE QUESTA MAPPA CON LA MAPPA DI COLLEGAMENTO COSTRUITA CON 127 MICROSATELITES. A TAL FINE, I BACS CHE LI CONTENGONO SONO AISLARIAN E CARACTERIZZATI, AUMENTANDO COSÌ LA DENSITÀ DELLA MAPPA ESISTENTE. NEL PROGETTO PRECEDENTE PER IL QUALE È RICHIESTO IL RINNOVO, È STATO SCOPERTO UN POSSIBILE LUOGO DI PROTOCHROMOSOMES SESSUALI NELLA SOGLIOLA, CHE SAREBBE AL PARAGRAFO 1. LA DETERMINAZIONE GENETICA DEL SESSO È SPESSO ASSOCIATA ALLA FORMAZIONE DI CROMOSOMI SESSUALI CHE PORTANO IL GENE MAESTRO RESPONSABILE DELLA DETERMINAZIONE DEL SESSO. NELLA SOLA LA DETERMINAZIONE DEL SESSO È XX/XY MA NON CI SONO CROMOSOMI SESSUALI HETEROMORFICUS. PERTANTO, SI PROPONE LA MICRODISECZIONE DI PAR 1 CHE È FACILMENTE IDENTIFICABILE AL MICROSCOPIO PERCHÉ È LA PIÙ GRANDE COPPIA METACENTRICA E IL SUO SEQUENZIAMENTO IN MASCHI E FEMMINE PER CONFRONTARE LE SEQUENZE E DALLE DIFFERENZE, DEDURRE LA PRESENZA DELLA REGIONE E/O GENI DETERMINANTI DEL SESSO. IN ACQUACOLTURA È ESSENZIALE CONOSCERE I MECCANISMI PER DETERMINARE IL SESSO CONSIDERANDO CHE CI SONO PERSONAGGI COME LA CRESCITA CHE PRESENTANO DIMORFISMO SESSUALE. INOLTRE, LA CONOSCENZA DI QUESTO MECCANISMO CONSENTE DI GESTIRE CORRETTAMENTE I LOTTI DI GIOCATORI. IL PROGETTO MIRA INOLTRE A STUDIARE RNA NON CODIFICANTI DI GONADA DI MASCHI E FEMMINE MATURI ALLA RICERCA DI NCRNAS (LNCRNAS E MIRNAS) CHE REGOLANO L'ATTIVITÀ DI SPECIFICI GENI COINVOLTI NEI PROCESSI DI DETERMINAZIONE/DIFFERENZIAZIONE DEL SESSO E DELLA RIPRODUZIONE. L'APPROFONDIMENTO DELLA CONOSCENZA DI QUESTO MECCANISMO CONSENTIRÀ DI STABILIRE STUDI SYNTHENIA CON ALTRE SPECIE ITTICHE ED ESTRAPOLARE I RISULTATI ALLE SPECIE DI INTERESSE PER L'ACQUACOLTURA. (Italian) / rank | |||||||||||||||
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| Property / summary: LA SOGLIOLA È UNA DELLE SPECIE PIÙ APPREZZATE DAL PUNTO DI VISTA ECONOMICO IN QUANTO TRIPLICA IL PREZZO DI ALTRE SPECIE COMMERCIALI ED È UN BUON CANDIDATO ALLA DIVERSIFICAZIONE DEI MERCATI EUROPEI, SATURATA DALLA SOVRAPPRODUZIONE DI SPIGOLA DORATA E DI SPIGOLA E LA SUA COLTIVAZIONE SI È DIFFUSA IN DIVERSE COMUNITÀ AUTONOME. MA, RISPETTO A QUANTO ACCADE IN ALTRE SPECIE DI PESCI PIATTI, GLI STUDI GENOMICI SULLA SOGLIOLA SONO ANCORA SCARSI. QUESTA SPECIE È CARATTERIZZATA DA UN CARIOTIPO CON 42 CROMOSOMI, E 48 BRACCI CROMOSOMICI, DISTRIBUITI IN 3 COPPIE METACENTRICHE, 2 COPPIE SUBMETACENTRICHE, 4 COPPIE SUBTELOCENTRICHE E 12 COPPIE CROMOSOMICHE ACROCENTRICHE. DURANTE LO SVILUPPO DI DUE PROGETTI CONSECUTIVI, PER I QUALI È ORA RICHIESTO IL RINNOVO, IL GRUPPO UCA HA MESSO A PUNTO UNA MAPPA FISICA PER SOLEA SENEGALENSIS COMPOSTA DA CIRCA 100 BACS, PRECEDENTEMENTE SEQUENZIATI E LOCALIZZATI SUI CROMOSOMI UTILIZZANDO MOLTEPLICI PESCI. I MARCATORI CROMOSOMICI SONO ATTUALMENTE DISPONIBILI PER LE 21 COPPIE NEL GENOMA UNICO. NEL PROGETTO SI PROPONE DI INTEGRARE QUESTA MAPPA CON LA MAPPA DI COLLEGAMENTO COSTRUITA CON 127 MICROSATELITES. A TAL FINE, I BACS CHE LI CONTENGONO SONO AISLARIAN E CARACTERIZZATI, AUMENTANDO COSÌ LA DENSITÀ DELLA MAPPA ESISTENTE. NEL PROGETTO PRECEDENTE PER IL QUALE È RICHIESTO IL RINNOVO, È STATO SCOPERTO UN POSSIBILE LUOGO DI PROTOCHROMOSOMES SESSUALI NELLA SOGLIOLA, CHE SAREBBE AL PARAGRAFO 1. LA DETERMINAZIONE GENETICA DEL SESSO È SPESSO ASSOCIATA ALLA FORMAZIONE DI CROMOSOMI SESSUALI CHE PORTANO IL GENE MAESTRO RESPONSABILE DELLA DETERMINAZIONE DEL SESSO. NELLA SOLA LA DETERMINAZIONE DEL SESSO È XX/XY MA NON CI SONO CROMOSOMI SESSUALI HETEROMORFICUS. PERTANTO, SI PROPONE LA MICRODISECZIONE DI PAR 1 CHE È FACILMENTE IDENTIFICABILE AL MICROSCOPIO PERCHÉ È LA PIÙ GRANDE COPPIA METACENTRICA E IL SUO SEQUENZIAMENTO IN MASCHI E FEMMINE PER CONFRONTARE LE SEQUENZE E DALLE DIFFERENZE, DEDURRE LA PRESENZA DELLA REGIONE E/O GENI DETERMINANTI DEL SESSO. IN ACQUACOLTURA È ESSENZIALE CONOSCERE I MECCANISMI PER DETERMINARE IL SESSO CONSIDERANDO CHE CI SONO PERSONAGGI COME LA CRESCITA CHE PRESENTANO DIMORFISMO SESSUALE. INOLTRE, LA CONOSCENZA DI QUESTO MECCANISMO CONSENTE DI GESTIRE CORRETTAMENTE I LOTTI DI GIOCATORI. IL PROGETTO MIRA INOLTRE A STUDIARE RNA NON CODIFICANTI DI GONADA DI MASCHI E FEMMINE MATURI ALLA RICERCA DI NCRNAS (LNCRNAS E MIRNAS) CHE REGOLANO L'ATTIVITÀ DI SPECIFICI GENI COINVOLTI NEI PROCESSI DI DETERMINAZIONE/DIFFERENZIAZIONE DEL SESSO E DELLA RIPRODUZIONE. L'APPROFONDIMENTO DELLA CONOSCENZA DI QUESTO MECCANISMO CONSENTIRÀ DI STABILIRE STUDI SYNTHENIA CON ALTRE SPECIE ITTICHE ED ESTRAPOLARE I RISULTATI ALLE SPECIE DI INTERESSE PER L'ACQUACOLTURA. (Italian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 16 January 2022
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Revision as of 11:24, 16 January 2022
Project Q3143517 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | GENOMIC AND SEXUAL DETERMINATION STUDIES IN SOLE (SOLEA SENEGALENSIS) BY INTEGRATING MAPS |
Project Q3143517 in Spain |
Statements
121,000.0 Euro
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151,250.0 Euro
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80.0 percent
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1 January 2019
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31 December 2021
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UNIVERSIDAD DE CADIZ
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36°29'40.92"N, 6°16'2.50"W
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11012
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EL LENGUADO ES UNA DE LAS ESPECIES MAS VALORADAS ECONOMICAMENTE EN LA ACUICULTURA PORQUE TRIPLICA EL PRECIO DE OTRAS ESPECIES COMERCIALES Y ES UN BUEN CANDIDATO PARA LA DIVERSIFICACION DE LOS MERCADOS EUROPEOS, SATURADOS A CAUSA DE LA SUPERPRODUCCION DE DORADA Y LUBINA Y SU CULTIVO SE HA EXTENDIDO A VARIAS COMUNIDADES AUTONOMAS. PERO, EN COMPARACION CON LO QUE OCURRE EN OTRAS ESPECIES DE PECES PLANOS, LOS ESTUDIOS GENOMICOS LLEVADOS A CABO EN EL LENGUADO TODAVIA SON ESCASOS. ESTA ESPECIE SE CARACTERIZA POR PRESENTAR UN CARIOTIPO CON 42 CROMOSOMAS, Y 48 BRAZOS CROMOSOMICOS, DISTRIBUIDOS EN 3 PAREJAS METACENTRICAS, 2 PAREJAS SUBMETACENTRICAS, 4 PAREJAS SUBTELOCENTRICAS Y 12 PARES CROMOSOMICOS ACROCENTRICOS. DURANTE EL DESARROLLO DE DOS PROYECTOS CONSECUTIVOS, PARA LOS QUE AHORA SE PIDE RENOVACION, EL GRUPO DE LA UCA HA VENIDO DESARROLLANDO UN MAPA FISICO PARA SOLEA SENEGALENSIS COMPUESTO POR UNOS 100 BACS, PREVIAMENTE SECUENCIADOS Y LOCALIZADOS EN LOS CROMOSOMAS MEDIANTE FISH MULTIPLE. SE TIENEN, EN ESTE MOMENTO MARCADORES CROMOSOMICOS PARA LAS 21 PAREJAS EXISTENTES EN EL GENOMA DEL LENGUADO. SE PROPONE EN EL PROYECTO INTEGRAR ESTE MAPA CON EL DE LIGAMIENTO CONSTRUIDO CON 127 MICROSATELITES. PARA ELLO SE AISLARIAN Y CARACTERIZARIAN LOS BACS QUE LOS CONTUVIERAN, CON LO QUE SE AUMENTARIA ADEMAS LA DENSIDAD DEL MAPA EXISTENTE. EN EL PROYECTO PREVIO PARA EL QUE SE SOLICITA RENOVACION SE HA DESCUBIERTO UNA POSIBLE PARAJE DE PROTO-CROMOSOMAS SEXUALES EN EL LENGUADO, QUE SERIA EL PAR 1. LA DETERMINACION GENETICA DEL SEXO ESTA A MENUDO ASOCIADA CON LA FORMACION DE CROMOSOMAS SEXUALES QUE LLEVAN EL MASTER GEN RESPONSABLE DE LA DETERMINACION DEL SEXO. EN EL LENGUADO LA DETERMINACION DEL SEXO ES XX/XY PERO NO EXISTEN CROMOSOMAS SEXUALES HETEROMORFICOS. POR ELLO, SE PROPONE LA MICRODISECCION DEL PAR 1 QUE ES FACILMENTE IDENTIFICABLE AL MICROSCOPIO POR SER LA PAREJA METACENTRICA DE MAYOR TAMAÑO Y SU SECUENCIACION EN MACHOS Y HEMBRAS PARA COMPARAR LAS SECUENCIAS Y A PARTIR DE LAS DIFERENCIAS, INFERIR LA PRESENCIA DE LA REGION Y/O GENES DETERMINANTES DEL SEXO. EN ACUICULTURA ES ESENCIAL CONOCER LOS MECANISMOS DE DETERMINACION DEL SEXO CONSIDERANDO ADEMAS QUE EXISTEN CARACTERES COMO EL CRECIMIENTO QUE PRESENTAN DIMORFISMO SEXUAL. ADEMAS, EL CONOCIMIENTO DE ESE MECANISMO PERMITE GESTIONAR DE MANERA ADECUADA LOS LOTES DE REPRODUCTORES. TAMBIEN SE PRETENDE EN EL PROYECTO UN ESTUDIO DE RNAS NO CODIFICANTES DE GONADAS DE MACHOS Y HEMBRAS MADUROS BUSCANDO NCRNAS (LNCRNAS Y MIRNAS) QUE REGULEN LA ACTIVIDAD DE GENES ESPECIFICOS IMPLICADOS EN PROCESOS DE DETERMINACION/DIFERENCIACION DEL SEXO Y REPRODUCCION. LA PROFUNDIZACION EN EL CONOCIMIENTO DE ESTE MECANISMO PERMITIRA ESTABLECER ESTUDIOS DE SINTENIA CON OTRAS ESPECIES DE PECES Y EXTRAPOLAR LOS RESULTADOS A ESPECIES DE INTERES EN ACUICULTURA. (Spanish)
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THE SENEGALESE SOLE IS ONE OF THE SPECIES MOST VALUED ECONOMICALLY IN AQUACULTURE BECAUSE IT TRIPLES THE PRICE OF OTHER COMMERCIAL SPECIES AND IS A GOOD CANDIDATE FOR THE DIVERSIFICATION OF THE EUROPEAN MARKETS, SATURATED BY THE OVERPRODUCTION OF SEA BREAM AND SEA BASS AND ITS CULTIVATION HAS SPREAD TO SEVERAL AUTONOMOUS COMMUNITIES. BUT, COMPARED TO WHAT HAPPENS IN OTHER FLATFISH SPECIES, GENOMIC STUDIES ON SOLE ARE STILL SCARCE. THIS SPECIES IS CHARACTERIZED BY A KARYOTYPE WITH 42 CHROMOSOMES AND 48 CHROMOSOMAL ARMS DISTRIBUTED IN 3 METACENTRIC PAIRS, 2 SUBMETACENTRIC PAIRS, 4 SUBTELOCENTRIC PAIRS AND 12 ACROCENTRIC CHROMOSOMAL PAIRS. DURING THE DEVELOPMENT OF TWO CONSECUTIVE PROJECTS, FOR WHICH RENOVATION IS NOW BEING REQUESTED, THE UCA GROUP HAS BEEN DEVELOPING A PHYSICAL MAP FOR SOLEA SENEGALENSIS, COMPOSED BY AROUND 100 BACS, PREVIOUSLY SEQUENCED AND LOCATED IN THE SOLE CHROMOSOMES BY MULTIPLE FISH. WE NOW HAVE CHROMOSOMAL MARKERS FOR THE 21 PAIRS IN THE SOLE GENOME. IT IS PROPOSED IN THE PROJECT TO INTEGRATE THIS GENETIC MAP WITH THE LINKAGE MAP COMPOSED OF 127 MICROSATELLITES. TO ACHIEVE THIS GOAL THE BACS HARBORING THE 127 MICROSTELLITS WILLBE LOCATED AND ISLATED FORM TEH LIBRARY, RESSULTING IN AN INCREAE OF THE DENSITY OF THE MAP , IN ADDITION TO THE INTEGRATION. IN THE PREVIOUS PROJECT FOR WHICH RENEWAL IS APLIED, A POSSIBLE SEX PROTO-CHROMOSOME IN SOLE, WHICH WOULD BE PAIR 1, HAS BEEN DISCOVERED. GENETIC DETERMINATION OF SEX IS OFTEN ASSOCIATED WITH THE FORMATION OF SEX CHROMOSOMES THAT CARRY THE MASTER GENE RESPONSIBLE FOR SEX DETERMINATION. IN THE SOLE THE SEX DETERMINATION IS XX / XY BUT THERE ARE NO HETEROMORPHIC SEX CHROMOSOMES. THEREFORE, IT IS PROPOSED THE MICRODISSECTION OF PAIR 1 THAT IS EASILY IDENTIFIABLE UNDER THE MICROSCOPE BECAUSE IT IS THE LARGEST METACENTRIC PAIR AND ITS SEQUENCING IN MALES AND FEMALES TO COMPARE THE SEQUENCES AND FROM THE DIFFERENCES, INFERRING THE PRESENCE OF THE REGION AND / OR SEX DETERMINING GENES. IN AQUACULTURE IT IS ESSENTIAL TO KNOW THE MECHANISMS OF SEX DETERMINATION, CONSIDERING ALSO THAT THERE ARE CHARACTERISTICS SUCH AS GROWTH THAT PRESENT SEXUAL DIMORPHISM. IN ADDITION, KNOWLEDGE OF THIS MECHANISM ALLOWS ADEQUATE MANAGEMENT OF BREEDERS STOCKS. MOREOVER, AN STUDY OF NCRNAS ISOLATED (LNCRNAS AND MIRNAS) FROM MATURE MALE AND FEMALE GONADS LOOKING FOR MIRNAS THAT REGULATE THE ACTIVITY OF SPECIFIC GENES INVOLVED IN THE DETERMINATION / DIFFERENTIATION OF SEX AND REPRODUCTION IS PROPOSED. THE DEEPENING OF THE KNOWLEDGE OF THIS MECHANISM WILL ALLOW TO ESTABLISH STUDIES OF SYNTENIA WITH OTHER SPECIES OF AND TO EXTEND THE RESULTS TO SPECIES WITH IMPORTANCE IN AQUACULTURE. (English)
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LA SOLE EST L’UNE DES ESPÈCES AQUACOLES LES PLUS ÉCONOMIQUEMENT VALORISÉES PARCE QU’ELLE TRIPLE LE PRIX D’AUTRES ESPÈCES COMMERCIALES ET QU’ELLE EST UN BON CANDIDAT À LA DIVERSIFICATION DES MARCHÉS EUROPÉENS, SATURÉE PAR LA SURPRODUCTION DE BAR DORÉ ET DE BAR ET SA CULTURE S’EST ÉTENDUE À PLUSIEURS COMMUNAUTÉS AUTONOMES. CEPENDANT, PAR RAPPORT À CE QUI SE PASSE CHEZ D’AUTRES ESPÈCES DE POISSONS PLATS, LES ÉTUDES GÉNOMIQUES SUR LA SOLE SONT ENCORE RARES. CETTE ESPÈCE EST CARACTÉRISÉE PAR UN CARYOTYPE À 42 CHROMOSOMES, ET 48 BRAS CHROMOSOMIQUES, RÉPARTIS EN 3 PAIRES MÉTACENTRIQUES, 2 PAIRES SUBMÉTACENTRIQUES, 4 PAIRES SUBTÉLOCENTRIQUES ET 12 PAIRES CHROMOSOMIQUES ACROCENTRIQUES. AU COURS DE L’ÉLABORATION DE DEUX PROJETS CONSÉCUTIFS, POUR LESQUELS LE RENOUVELLEMENT EST MAINTENANT DEMANDÉ, LE GROUPE UCA A ÉLABORÉ UNE CARTE PHYSIQUE POUR SOLEA SENEGALENSIS COMPOSÉE D’ENVIRON 100 BACS, PRÉALABLEMENT SÉQUENCÉES ET LOCALISÉES SUR LES CHROMOSOMES À L’AIDE DE POISSONS MULTIPLES. DES MARQUEURS CHROMOSOMIQUES SONT ACTUELLEMENT DISPONIBLES POUR LES 21 PAIRES DU GÉNOME UNIQUE. IL EST PROPOSÉ DANS LE PROJET D’INTÉGRER CETTE CARTE À LA CARTE DE LIAISON CONSTRUITE AVEC 127 MICROSATELITES. À CETTE FIN, LES BACS QUI LES CONTIENNENT SONT AISLARIENS ET CARACTÉRISÉS, CE QUI AUGMENTE LA DENSITÉ DE LA CARTE EXISTANTE. DANS LE PROJET PRÉCÉDENT POUR LEQUEL LE RENOUVELLEMENT EST DEMANDÉ, UN EMPLACEMENT POSSIBLE DE PROTOCHROMOSOMES SEXUELS EN UNIQUE A ÉTÉ DÉCOUVERT, CE QUI SERAIT LE PARAGRAPHE 1. LA DÉTERMINATION GÉNÉTIQUE DU SEXE EST SOUVENT ASSOCIÉE À LA FORMATION DE CHROMOSOMES SEXUELS PORTEURS DU GÈNE MAÎTRE RESPONSABLE DE LA DÉTERMINATION DU SEXE. DANS LA SEULE DÉTERMINATION DU SEXE EST XX/XY MAIS IL N’Y A PAS DE CHROMOSOMES SEXUELS HETEROMORFICUS. PAR CONSÉQUENT, IL EST PROPOSÉ LA MICRODISECTION DU PARAGRAPHE 1 QUI EST FACILEMENT IDENTIFIABLE AU MICROSCOPE PARCE QU’IL S’AGIT DE LA PLUS GRANDE PAIRE METACENTRICA ET DE SON SÉQUENÇAGE CHEZ LES MÂLES ET LES FEMELLES POUR COMPARER LES SÉQUENCES ET À PARTIR DES DIFFÉRENCES, EN DÉDUIRE LA PRÉSENCE DE LA RÉGION ET/OU DES DÉTERMINANTS GÉNÉTIQUES DU SEXE. EN AQUACULTURE, IL EST ESSENTIEL DE CONNAÎTRE LES MÉCANISMES PERMETTANT DE DÉTERMINER LE SEXE ÉTANT DONNÉ QU’IL EXISTE DES CARACTÈRES COMME LA CROISSANCE QUI PRÉSENTENT UN DIMORPHISME SEXUEL. EN OUTRE, LA CONNAISSANCE DE CE MÉCANISME PERMET DE GÉRER CORRECTEMENT LES LOTS DE JOUEURS. LE PROJET VISE ÉGALEMENT À ÉTUDIER LES ARN NON CODANTS DES GONADAS DE MÂLES MATURES ET DE FEMELLES À LA RECHERCHE DE NCRNAS (LNCRNAS ET MIRNAS) QUI RÉGULENT L’ACTIVITÉ DE GÈNES SPÉCIFIQUES IMPLIQUÉS DANS LES PROCESSUS DE DÉTERMINATION/DIFFÉRENCIATION DU SEXE ET DE LA REPRODUCTION. L’APPROFONDISSEMENT DE LA CONNAISSANCE DE CE MÉCANISME PERMETTRA D’ÉTABLIR DES ÉTUDES SYNTHENIA AVEC D’AUTRES ESPÈCES DE POISSONS ET D’EXTRAPOLER LES RÉSULTATS AUX ESPÈCES PRÉSENTANT UN INTÉRÊT POUR L’AQUACULTURE. (French)
2 December 2021
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SEEZUNGE IST EINE DER WIRTSCHAFTLICH AM MEISTEN GESCHÄTZTEN ARTEN IN DER AQUAKULTUR, WEIL SIE DEN PREIS ANDERER KOMMERZIELLER ARTEN VERDREIFACHT UND EIN GUTER KANDIDAT FÜR DIE DIVERSIFIZIERUNG DER EUROPÄISCHEN MÄRKTE IST, GESÄTTIGT DURCH DIE ÜBERPRODUKTION VON VERGOLDETEN UND WOLFSBARSCH, UND IHR ANBAU HAT SICH AUF MEHRERE AUTONOME GEMEINSCHAFTEN AUSGEBREITET. ABER IM VERGLEICH ZU ANDEREN PLATTFISCHARTEN SIND GENOMISCHE UNTERSUCHUNGEN AN DER SEEZUNGE NACH WIE VOR KNAPP. DIESE ART ZEICHNET SICH DURCH EINEN KARYOTYP MIT 42 CHROMOSOMEN UND 48 CHROMOSOMENARMEN AUS, VERTEILT IN 3 METAZENTRISCHEN PAAREN, 2 SUBMETAZENTRISCHEN PAAREN, 4 SUBTELOZENTRISCHEN PAAREN UND 12 AKROZENTRISCHEN CHROMOSOMENPAAREN. WÄHREND DER ENTWICKLUNG VON ZWEI AUFEINANDERFOLGENDEN PROJEKTEN, FÜR DIE NUN EINE ERNEUERUNG BEANTRAGT WIRD, HAT DIE UCA-GRUPPE EINE PHYSIKALISCHE KARTE FÜR SOLEA SENEGALENSIS ENTWICKELT, DIE AUS ETWA 100 BACS BESTEHT, DIE ZUVOR AUF DEN CHROMOSOMEN MIT MEHREREN FISCHEN SEQUENZIERT WURDEN. CHROMOSOMISCHE MARKER SIND DERZEIT FÜR DIE 21 PAARE IM ALLEINIGEN GENOM ERHÄLTLICH. IM PROJEKT WIRD VORGESCHLAGEN, DIESE KARTE MIT DER MIT 127 MICROSATELITES GEBAUTEN VERKNÜPFUNGSKARTE ZU INTEGRIEREN. ZU DIESEM ZWECK SIND DIE SIE ENTHALTENDEN BACS AISLARIAN UND KARAKTERISIERT, WODURCH DIE DICHTE DER VORHANDENEN KARTE ERHÖHT WIRD. IM VORHERIGEN PROJEKT, FÜR DAS EINE ERNEUERUNG BEANTRAGT WIRD, WURDE EIN MÖGLICHER STANDORT SEXUELLER PROTOCHROMOSOMES IN SOLE ENTDECKT, WAS PAR 1 SEIN WÜRDE. DIE GENETISCHE BESTIMMUNG DES GESCHLECHTS IST OFT MIT DER BILDUNG VON SEXUELLEN CHROMOSOMEN VERBUNDEN, DIE DAS MASTERGEN TRAGEN, DAS FÜR DIE BESTIMMUNG DES GESCHLECHTS VERANTWORTLICH IST. ALLEIN DIE BESTIMMUNG DES GESCHLECHTS IST XX/XY, ABER ES GIBT KEINE SEXUELLEN CHROMOSOMEN HETEROMORFICUS. DAHER WIRD DIE MICRODISECTION VON PAR 1 VORGESCHLAGEN, DIE UNTER DEM MIKROSKOP LEICHT ZU ERKENNEN IST, DA ES DAS GRÖSSTE METACENTRICA-PAAR UND SEINE SEQUENZIERUNG BEI MÄNNCHEN UND WEIBCHEN IST, UM DIE SEQUENZEN UND DIE UNTERSCHIEDE ZU VERGLEICHEN, WAS DAS VORHANDENSEIN DER REGION UND/ODER DER GENDETERMINANTEN DES GESCHLECHTS ABLEITET. IN DER AQUAKULTUR IST ES WICHTIG, DIE MECHANISMEN ZUR BESTIMMUNG DES GESCHLECHTS ZU KENNEN, DA ES CHARAKTERE WIE WACHSTUM GIBT, DIE SEXUELLEN DIMORPHISMUS DARSTELLEN. DARÜBER HINAUS ERMÖGLICHT DAS WISSEN ÜBER DIESEN MECHANISMUS, DIE CHARGEN VON SPIELERN RICHTIG ZU VERWALTEN. DAS PROJEKT ZIELT AUCH DARAUF AB, NICHTKODIERENDE RNAS VON GONADEN VON REIFEN MÄNNCHEN UND WEIBCHEN AUF DER SUCHE NACH NCRNAS (LNCRNAS UND MIRNAS), DIE DIE AKTIVITÄT BESTIMMTER GENE REGULIEREN, DIE AN PROZESSEN DER BESTIMMUNG/DIFFERENZIERUNG VON GESCHLECHT UND REPRODUKTION BETEILIGT SIND, ZU UNTERSUCHEN. DIE VERTIEFUNG DES WISSENS ÜBER DIESEN MECHANISMUS WIRD ES ERMÖGLICHEN, SYNTHENIA-STUDIEN MIT ANDEREN FISCHARTEN ZU ERSTELLEN UND DIE ERGEBNISSE AUF ARTEN VON INTERESSE AN DER AQUAKULTUR ZU EXTRAPOLIEREN. (German)
9 December 2021
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TONG IS EEN VAN DE ECONOMISCH MEEST GEWAARDEERDE SOORTEN IN DE AQUACULTUUR OMDAT ZIJ DE PRIJS VAN ANDERE COMMERCIËLE SOORTEN VERDRIEVOUDIGT EN EEN GOEDE KANDIDAAT IS VOOR DE DIVERSIFICATIE VAN DE EUROPESE MARKTEN, VERZADIGD DOOR DE OVERPRODUCTIE VAN VERGULDE EN ZEEBAARS EN DE TEELT ERVAN HEEFT ZICH VERSPREID OVER VERSCHILLENDE AUTONOME GEMEENSCHAPPEN. MAAR IN VERGELIJKING MET WAT ER BIJ ANDERE PLATVISSOORTEN GEBEURT, ZIJN GENOMISCHE STUDIES OP TONG NOG STEEDS SCHAARS. DEZE SOORT WORDT GEKENMERKT DOOR EEN KARYOTYPE MET 42 CHROMOSOMEN EN 48 CHROMOSOMISCHE ARMEN, VERDEELD IN 3 METACENTRISCHE PAREN, 2 SUBMETACENTRISCHE PAREN, 4 SUBTELOCENTRISCHE PAREN EN 12 ACROCENTRISCHE CHROMOSOMISCHE PAREN. TIJDENS DE ONTWIKKELING VAN TWEE OPEENVOLGENDE PROJECTEN, WAARVOOR NU VERNIEUWING WORDT AANGEVRAAGD, HEEFT DE UCA-GROEP EEN FYSIEKE KAART VOOR SOLEA SENEGALENSIS ONTWIKKELD DIE BESTAAT UIT ONGEVEER 100 BACS, EERDER GESEQUENCEERD EN GELEGEN OP DE CHROMOSOMEN MET BEHULP VAN MEERDERE VISSEN. CHROMOSOMISCHE MARKERS ZIJN MOMENTEEL BESCHIKBAAR VOOR DE 21 PAREN IN HET ENIGE GENOOM. IN HET PROJECT WORDT VOORGESTELD DEZE KAART TE INTEGREREN MET DE LINKAGEKAART GEBOUWD MET 127 MICROSATELITES. DAARTOE ZIJN DE BACS DIE ZE BEVATTEN AISLARIAN EN GECARACTERISEERD, WAARDOOR DE DICHTHEID VAN DE BESTAANDE KAART TOENEEMT. IN HET VORIGE PROJECT WAARVOOR VERNIEUWING WORDT AANGEVRAAGD, IS EEN MOGELIJKE LOCATIE VAN SEKSUELE PROTOCHROMOSOMES IN TONG ONTDEKT, DIE LID 1 ZOU ZIJN. DE GENETISCHE BEPALING VAN GESLACHT WORDT VAAK GEASSOCIEERD MET DE VORMING VAN SEKSUELE CHROMOSOMEN DIE HET HOOFDGEN DRAGEN DAT VERANTWOORDELIJK IS VOOR DE BEPALING VAN GESLACHT. ALLEEN DE BEPALING VAN SEKS IS XX/XY, MAAR ER ZIJN GEEN SEKSUELE CHROMOSOMEN HETEROMORFICUS. DAAROM WORDT DE MICRODISECTIE VAN LID 1 VOORGESTELD, DIE GEMAKKELIJK ONDER DE MICROSCOOP KAN WORDEN GEÏDENTIFICEERD OMDAT HET HET GROOTSTE METACENTRICA-PAAR EN ZIJN SEQUENCING IN MANNETJES EN VROUWTJES IS OM DE SEQUENTIES EN DE VERSCHILLEN TE VERGELIJKEN, DE AANWEZIGHEID VAN DE REGIO EN/OF GENEN DETERMINANTEN VAN GESLACHT AF TE LEIDEN. IN DE AQUACULTUUR IS HET VAN ESSENTIEEL BELANG OM DE MECHANISMEN TE KENNEN OM SEKS TE BEPALEN, GEZIEN HET FEIT DAT ER TEKENS ZOALS GROEI ZIJN DIE SEKSUEEL DIMORFISME VERTONEN. BOVENDIEN MAAKT DE KENNIS VAN DIT MECHANISME HET MOGELIJK OM DE PARTIJEN SPELERS GOED TE BEHEREN. HET PROJECT IS OOK GERICHT OP HET BESTUDEREN VAN NIET-CODERENDE RNA’S VAN GONADAS VAN VOLWASSEN MANNETJES EN VROUWTJES DIE OP ZOEK ZIJN NAAR NCRNAS (LNCRNAS EN MIRNAS) DIE DE ACTIVITEIT VAN SPECIFIEKE GENEN REGULEREN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ PROCESSEN VAN BEPALING/DIFFERENTIATIE VAN GESLACHT EN VOORTPLANTING. DE VERDIEPING VAN DE KENNIS VAN DIT MECHANISME ZAL HET MOGELIJK MAKEN SYNTHENIA-STUDIES MET ANDERE VISSOORTEN UIT TE VOEREN EN DE RESULTATEN TE EXTRAPOLEREN NAAR SOORTEN DIE VAN BELANG ZIJN VOOR DE AQUACULTUUR. (Dutch)
17 December 2021
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LA SOGLIOLA È UNA DELLE SPECIE PIÙ APPREZZATE DAL PUNTO DI VISTA ECONOMICO IN QUANTO TRIPLICA IL PREZZO DI ALTRE SPECIE COMMERCIALI ED È UN BUON CANDIDATO ALLA DIVERSIFICAZIONE DEI MERCATI EUROPEI, SATURATA DALLA SOVRAPPRODUZIONE DI SPIGOLA DORATA E DI SPIGOLA E LA SUA COLTIVAZIONE SI È DIFFUSA IN DIVERSE COMUNITÀ AUTONOME. MA, RISPETTO A QUANTO ACCADE IN ALTRE SPECIE DI PESCI PIATTI, GLI STUDI GENOMICI SULLA SOGLIOLA SONO ANCORA SCARSI. QUESTA SPECIE È CARATTERIZZATA DA UN CARIOTIPO CON 42 CROMOSOMI, E 48 BRACCI CROMOSOMICI, DISTRIBUITI IN 3 COPPIE METACENTRICHE, 2 COPPIE SUBMETACENTRICHE, 4 COPPIE SUBTELOCENTRICHE E 12 COPPIE CROMOSOMICHE ACROCENTRICHE. DURANTE LO SVILUPPO DI DUE PROGETTI CONSECUTIVI, PER I QUALI È ORA RICHIESTO IL RINNOVO, IL GRUPPO UCA HA MESSO A PUNTO UNA MAPPA FISICA PER SOLEA SENEGALENSIS COMPOSTA DA CIRCA 100 BACS, PRECEDENTEMENTE SEQUENZIATI E LOCALIZZATI SUI CROMOSOMI UTILIZZANDO MOLTEPLICI PESCI. I MARCATORI CROMOSOMICI SONO ATTUALMENTE DISPONIBILI PER LE 21 COPPIE NEL GENOMA UNICO. NEL PROGETTO SI PROPONE DI INTEGRARE QUESTA MAPPA CON LA MAPPA DI COLLEGAMENTO COSTRUITA CON 127 MICROSATELITES. A TAL FINE, I BACS CHE LI CONTENGONO SONO AISLARIAN E CARACTERIZZATI, AUMENTANDO COSÌ LA DENSITÀ DELLA MAPPA ESISTENTE. NEL PROGETTO PRECEDENTE PER IL QUALE È RICHIESTO IL RINNOVO, È STATO SCOPERTO UN POSSIBILE LUOGO DI PROTOCHROMOSOMES SESSUALI NELLA SOGLIOLA, CHE SAREBBE AL PARAGRAFO 1. LA DETERMINAZIONE GENETICA DEL SESSO È SPESSO ASSOCIATA ALLA FORMAZIONE DI CROMOSOMI SESSUALI CHE PORTANO IL GENE MAESTRO RESPONSABILE DELLA DETERMINAZIONE DEL SESSO. NELLA SOLA LA DETERMINAZIONE DEL SESSO È XX/XY MA NON CI SONO CROMOSOMI SESSUALI HETEROMORFICUS. PERTANTO, SI PROPONE LA MICRODISECZIONE DI PAR 1 CHE È FACILMENTE IDENTIFICABILE AL MICROSCOPIO PERCHÉ È LA PIÙ GRANDE COPPIA METACENTRICA E IL SUO SEQUENZIAMENTO IN MASCHI E FEMMINE PER CONFRONTARE LE SEQUENZE E DALLE DIFFERENZE, DEDURRE LA PRESENZA DELLA REGIONE E/O GENI DETERMINANTI DEL SESSO. IN ACQUACOLTURA È ESSENZIALE CONOSCERE I MECCANISMI PER DETERMINARE IL SESSO CONSIDERANDO CHE CI SONO PERSONAGGI COME LA CRESCITA CHE PRESENTANO DIMORFISMO SESSUALE. INOLTRE, LA CONOSCENZA DI QUESTO MECCANISMO CONSENTE DI GESTIRE CORRETTAMENTE I LOTTI DI GIOCATORI. IL PROGETTO MIRA INOLTRE A STUDIARE RNA NON CODIFICANTI DI GONADA DI MASCHI E FEMMINE MATURI ALLA RICERCA DI NCRNAS (LNCRNAS E MIRNAS) CHE REGOLANO L'ATTIVITÀ DI SPECIFICI GENI COINVOLTI NEI PROCESSI DI DETERMINAZIONE/DIFFERENZIAZIONE DEL SESSO E DELLA RIPRODUZIONE. L'APPROFONDIMENTO DELLA CONOSCENZA DI QUESTO MECCANISMO CONSENTIRÀ DI STABILIRE STUDI SYNTHENIA CON ALTRE SPECIE ITTICHE ED ESTRAPOLARE I RISULTATI ALLE SPECIE DI INTERESSE PER L'ACQUACOLTURA. (Italian)
16 January 2022
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Cádiz
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Identifiers
RTI2018-096847-B-C21
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