OPTICAL ANALYSIS OF REPRODUCTIVE CHARACTERS IN A DIAELICO CROSSING BETWEEN THREE IBERICO PORK STRAINS (Q3146621): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(Changed label, description and/or aliases in de, and other parts: Adding German translations) |
(Changed label, description and/or aliases in nl, and other parts: Adding Dutch translations) |
||||||||||||||
| label / nl | label / nl | ||||||||||||||
OPTISCHE ANALYSE VAN REPRODUCTIEVE TEKENS IN EEN DIAELICO KRUISING TUSSEN DRIE IBERICO-VARKENSSTAMMEN | |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
DIT PROJECT RICHT ZICH OP DE STUDIE VAN DE REPRODUCTIEVE EFFICIËNTIE VAN IBERISCHE BORSTELHAREN, GEBASEERD OP EEN EXPERIMENTEEL ONTWERP DAT DRIE VERSCHILLENDE STAMMEN (RETINTAS, ENTREPELADA EN TORBISCAL) INTEGREERT, EVENALS HUN F1 KRUISEN, BINNEN EEN COMMERCIËLE POPULATIE BEHEERD DOOR INGA FOOD SA. HET PROJECT IS VAN PLAN OM ZOWEL GENEALOGISCHE ALS PRODUCTIEVE/REPRODUCTIEVE INFORMATIE VAN DIEREN UIT DE POPULATIESTICHTING (JAAR 2010) TE GEBRUIKEN EN AANVULLENDE INFORMATIE TE GENEREREN VAN GENOMISCH TYPE (GENOTYPERING VAN 1.200 INDIVIDUEN MET DE COMMERCIËLE CHIP VAN 60.000 SNP-MARKERS), METABOLOMICO (BIJNA INFRAROODSPECTROSCOPIE VOOR 1.500 BLOEDSERUMMONSTERS DIE ZIJN GENOMEN ROND DE INSEMINATIE/IMPLANTATIE), EN MICROBIOMICO (MASSAGE SEQUENCING VOOR HET 16S RRNA-GEN VAN 300 MONSTERS VAGINALE MICROBIOME GENOMEN OP HET MOMENT VAN INSEMINATIE VAN DE ZEUGEN). ZODRA ALLE INFORMATIE IS VERKREGEN, ZAL EEN EERSTE STAP WORDEN GEZET GERICHT OP HET ANALYSEREN EN KARAKTERISEREN VAN DE GENETISCHE DIVERSITEIT VAN DE GEBRUIKTE STAMMEN, EVENALS HET BEPALEN VAN DE AANWEZIGHEID VAN EEN SELECTIEVOETAFDRUK ERIN. TEN TWEEDE, ZAL WORDEN UITGEVOERD ANOMALIE VAN ASSOCIATIE OP REPRODUCTIEVE TEKENS ZOALS LEEFTIJD BIJ EERSTE INSEMINATIE OF EERSTE BEVALLING, VRUCHTBAARHEID VAN ZEUGEN (GESTANT OF NIET-ZWANGER), OF PROLIFICITEIT IN TERMEN VAN BIGGEN GEBOREN LEVEND, DOOD OF GESPEENDE BIGGEN. IN DIT GEVAL ZULLEN DE MOGELIJKE ASSOCIATIES TUSSEN DEZE VOORTPLANTINGSKARAKTERS EN DE VERSCHILLENDE INFORMATIEBRONNEN AFZONDERLIJK WORDEN ONDERZOCHT (GENOOM, METABOLOMA EN MICROBIOME), WAARBIJ OOK WORDT VOORGESTELD DE MOGELIJKE IMPACT VAN BLOEDVERWANTSCHAP OP HEN TE ONDERZOEKEN. IN EEN VOLGENDE STAP ZAL HET DE MODELLEN VAN GENOMIC EVALUATIE VERDIEPEN, WAARBIJ EEN SPECIALE NADRUK WORDT GELEGD OP DE WEGING VAN ZOWEL GENOMIC ALS FENOTYPISCHE INFORMATIE, EVENALS DE MEER DAN MOGELIJKE INTERACTIE TUSSEN HET GENOOM EN HET METABOLOMA. ALS EEN VAN DE MEEST RELEVANTE MIJLPALEN VAN HET PROJECT IS HET DOEL TEN SLOTTE OM OP GEÏNTEGREERDE WIJZE ALLE BESCHIKBARE INFORMATIEBRONNEN TE ANALYSEREN, MET ALS DOEL BIOLOGISCHE NETWERKEN TOT STAND TE BRENGEN DIE DE VERSCHILLENDE LAGEN VAN INFORMATIE INTEGREREN EN EEN VOLLEDIGER EN REALISTISCHER KARAKTERISERING VAN DE BIOLOGISCHE MECHANISMEN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ DE VERORDENING INZAKE DE VOORTPLANTING (EN HUN EFFICIËNTIE) IN DE VARKENS IN HET ALGEMEEN, EN IBERISCHE ZEUGEN IN HET BIJZONDER. OVER HET GEHEEL GENOMEN WORDT EEN NIEUW EN AMBITIEUS INITIATIEF VOORGESTELD, DAT ZOWEL VOOR DE VARKENSINDUSTRIE ALS VOOR DE WETENSCHAPPELIJKE GEMEENSCHAP VAN BELANG IS, WAARBIJ EEN TEAM VAN ERKENDE INTERNATIONALE ONDERZOEKERS WORDT BETROKKEN DAT DE LEVENSVATBAARHEID VAN HET PROJECT EN DE VERWEZENLIJKING VAN DE GESTELDE DOELSTELLINGEN WAARBORGT. (Dutch) | |||||||||||||||
| Property / summary: DIT PROJECT RICHT ZICH OP DE STUDIE VAN DE REPRODUCTIEVE EFFICIËNTIE VAN IBERISCHE BORSTELHAREN, GEBASEERD OP EEN EXPERIMENTEEL ONTWERP DAT DRIE VERSCHILLENDE STAMMEN (RETINTAS, ENTREPELADA EN TORBISCAL) INTEGREERT, EVENALS HUN F1 KRUISEN, BINNEN EEN COMMERCIËLE POPULATIE BEHEERD DOOR INGA FOOD SA. HET PROJECT IS VAN PLAN OM ZOWEL GENEALOGISCHE ALS PRODUCTIEVE/REPRODUCTIEVE INFORMATIE VAN DIEREN UIT DE POPULATIESTICHTING (JAAR 2010) TE GEBRUIKEN EN AANVULLENDE INFORMATIE TE GENEREREN VAN GENOMISCH TYPE (GENOTYPERING VAN 1.200 INDIVIDUEN MET DE COMMERCIËLE CHIP VAN 60.000 SNP-MARKERS), METABOLOMICO (BIJNA INFRAROODSPECTROSCOPIE VOOR 1.500 BLOEDSERUMMONSTERS DIE ZIJN GENOMEN ROND DE INSEMINATIE/IMPLANTATIE), EN MICROBIOMICO (MASSAGE SEQUENCING VOOR HET 16S RRNA-GEN VAN 300 MONSTERS VAGINALE MICROBIOME GENOMEN OP HET MOMENT VAN INSEMINATIE VAN DE ZEUGEN). ZODRA ALLE INFORMATIE IS VERKREGEN, ZAL EEN EERSTE STAP WORDEN GEZET GERICHT OP HET ANALYSEREN EN KARAKTERISEREN VAN DE GENETISCHE DIVERSITEIT VAN DE GEBRUIKTE STAMMEN, EVENALS HET BEPALEN VAN DE AANWEZIGHEID VAN EEN SELECTIEVOETAFDRUK ERIN. TEN TWEEDE, ZAL WORDEN UITGEVOERD ANOMALIE VAN ASSOCIATIE OP REPRODUCTIEVE TEKENS ZOALS LEEFTIJD BIJ EERSTE INSEMINATIE OF EERSTE BEVALLING, VRUCHTBAARHEID VAN ZEUGEN (GESTANT OF NIET-ZWANGER), OF PROLIFICITEIT IN TERMEN VAN BIGGEN GEBOREN LEVEND, DOOD OF GESPEENDE BIGGEN. IN DIT GEVAL ZULLEN DE MOGELIJKE ASSOCIATIES TUSSEN DEZE VOORTPLANTINGSKARAKTERS EN DE VERSCHILLENDE INFORMATIEBRONNEN AFZONDERLIJK WORDEN ONDERZOCHT (GENOOM, METABOLOMA EN MICROBIOME), WAARBIJ OOK WORDT VOORGESTELD DE MOGELIJKE IMPACT VAN BLOEDVERWANTSCHAP OP HEN TE ONDERZOEKEN. IN EEN VOLGENDE STAP ZAL HET DE MODELLEN VAN GENOMIC EVALUATIE VERDIEPEN, WAARBIJ EEN SPECIALE NADRUK WORDT GELEGD OP DE WEGING VAN ZOWEL GENOMIC ALS FENOTYPISCHE INFORMATIE, EVENALS DE MEER DAN MOGELIJKE INTERACTIE TUSSEN HET GENOOM EN HET METABOLOMA. ALS EEN VAN DE MEEST RELEVANTE MIJLPALEN VAN HET PROJECT IS HET DOEL TEN SLOTTE OM OP GEÏNTEGREERDE WIJZE ALLE BESCHIKBARE INFORMATIEBRONNEN TE ANALYSEREN, MET ALS DOEL BIOLOGISCHE NETWERKEN TOT STAND TE BRENGEN DIE DE VERSCHILLENDE LAGEN VAN INFORMATIE INTEGREREN EN EEN VOLLEDIGER EN REALISTISCHER KARAKTERISERING VAN DE BIOLOGISCHE MECHANISMEN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ DE VERORDENING INZAKE DE VOORTPLANTING (EN HUN EFFICIËNTIE) IN DE VARKENS IN HET ALGEMEEN, EN IBERISCHE ZEUGEN IN HET BIJZONDER. OVER HET GEHEEL GENOMEN WORDT EEN NIEUW EN AMBITIEUS INITIATIEF VOORGESTELD, DAT ZOWEL VOOR DE VARKENSINDUSTRIE ALS VOOR DE WETENSCHAPPELIJKE GEMEENSCHAP VAN BELANG IS, WAARBIJ EEN TEAM VAN ERKENDE INTERNATIONALE ONDERZOEKERS WORDT BETROKKEN DAT DE LEVENSVATBAARHEID VAN HET PROJECT EN DE VERWEZENLIJKING VAN DE GESTELDE DOELSTELLINGEN WAARBORGT. (Dutch) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: DIT PROJECT RICHT ZICH OP DE STUDIE VAN DE REPRODUCTIEVE EFFICIËNTIE VAN IBERISCHE BORSTELHAREN, GEBASEERD OP EEN EXPERIMENTEEL ONTWERP DAT DRIE VERSCHILLENDE STAMMEN (RETINTAS, ENTREPELADA EN TORBISCAL) INTEGREERT, EVENALS HUN F1 KRUISEN, BINNEN EEN COMMERCIËLE POPULATIE BEHEERD DOOR INGA FOOD SA. HET PROJECT IS VAN PLAN OM ZOWEL GENEALOGISCHE ALS PRODUCTIEVE/REPRODUCTIEVE INFORMATIE VAN DIEREN UIT DE POPULATIESTICHTING (JAAR 2010) TE GEBRUIKEN EN AANVULLENDE INFORMATIE TE GENEREREN VAN GENOMISCH TYPE (GENOTYPERING VAN 1.200 INDIVIDUEN MET DE COMMERCIËLE CHIP VAN 60.000 SNP-MARKERS), METABOLOMICO (BIJNA INFRAROODSPECTROSCOPIE VOOR 1.500 BLOEDSERUMMONSTERS DIE ZIJN GENOMEN ROND DE INSEMINATIE/IMPLANTATIE), EN MICROBIOMICO (MASSAGE SEQUENCING VOOR HET 16S RRNA-GEN VAN 300 MONSTERS VAGINALE MICROBIOME GENOMEN OP HET MOMENT VAN INSEMINATIE VAN DE ZEUGEN). ZODRA ALLE INFORMATIE IS VERKREGEN, ZAL EEN EERSTE STAP WORDEN GEZET GERICHT OP HET ANALYSEREN EN KARAKTERISEREN VAN DE GENETISCHE DIVERSITEIT VAN DE GEBRUIKTE STAMMEN, EVENALS HET BEPALEN VAN DE AANWEZIGHEID VAN EEN SELECTIEVOETAFDRUK ERIN. TEN TWEEDE, ZAL WORDEN UITGEVOERD ANOMALIE VAN ASSOCIATIE OP REPRODUCTIEVE TEKENS ZOALS LEEFTIJD BIJ EERSTE INSEMINATIE OF EERSTE BEVALLING, VRUCHTBAARHEID VAN ZEUGEN (GESTANT OF NIET-ZWANGER), OF PROLIFICITEIT IN TERMEN VAN BIGGEN GEBOREN LEVEND, DOOD OF GESPEENDE BIGGEN. IN DIT GEVAL ZULLEN DE MOGELIJKE ASSOCIATIES TUSSEN DEZE VOORTPLANTINGSKARAKTERS EN DE VERSCHILLENDE INFORMATIEBRONNEN AFZONDERLIJK WORDEN ONDERZOCHT (GENOOM, METABOLOMA EN MICROBIOME), WAARBIJ OOK WORDT VOORGESTELD DE MOGELIJKE IMPACT VAN BLOEDVERWANTSCHAP OP HEN TE ONDERZOEKEN. IN EEN VOLGENDE STAP ZAL HET DE MODELLEN VAN GENOMIC EVALUATIE VERDIEPEN, WAARBIJ EEN SPECIALE NADRUK WORDT GELEGD OP DE WEGING VAN ZOWEL GENOMIC ALS FENOTYPISCHE INFORMATIE, EVENALS DE MEER DAN MOGELIJKE INTERACTIE TUSSEN HET GENOOM EN HET METABOLOMA. ALS EEN VAN DE MEEST RELEVANTE MIJLPALEN VAN HET PROJECT IS HET DOEL TEN SLOTTE OM OP GEÏNTEGREERDE WIJZE ALLE BESCHIKBARE INFORMATIEBRONNEN TE ANALYSEREN, MET ALS DOEL BIOLOGISCHE NETWERKEN TOT STAND TE BRENGEN DIE DE VERSCHILLENDE LAGEN VAN INFORMATIE INTEGREREN EN EEN VOLLEDIGER EN REALISTISCHER KARAKTERISERING VAN DE BIOLOGISCHE MECHANISMEN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ DE VERORDENING INZAKE DE VOORTPLANTING (EN HUN EFFICIËNTIE) IN DE VARKENS IN HET ALGEMEEN, EN IBERISCHE ZEUGEN IN HET BIJZONDER. OVER HET GEHEEL GENOMEN WORDT EEN NIEUW EN AMBITIEUS INITIATIEF VOORGESTELD, DAT ZOWEL VOOR DE VARKENSINDUSTRIE ALS VOOR DE WETENSCHAPPELIJKE GEMEENSCHAP VAN BELANG IS, WAARBIJ EEN TEAM VAN ERKENDE INTERNATIONALE ONDERZOEKERS WORDT BETROKKEN DAT DE LEVENSVATBAARHEID VAN HET PROJECT EN DE VERWEZENLIJKING VAN DE GESTELDE DOELSTELLINGEN WAARBORGT. (Dutch) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 17 December 2021
| |||||||||||||||
Revision as of 10:51, 17 December 2021
Project Q3146621 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | OPTICAL ANALYSIS OF REPRODUCTIVE CHARACTERS IN A DIAELICO CROSSING BETWEEN THREE IBERICO PORK STRAINS |
Project Q3146621 in Spain |
Statements
96,800.0 Euro
0 references
193,600.0 Euro
0 references
50.0 percent
0 references
30 December 2016
0 references
29 December 2020
0 references
UNIVERSIDAD AUTONOMA DE BARCELONA
0 references
41°29'27.71"N, 2°8'15.00"E
0 references
08266
0 references
EL PRESENTE PROYECTO SE CENTRA EN EL ESTUDIO DE LA EFICIENCIA REPRODUCTIVA DE LAS CERDAS IBERICAS, PARTIENDO DE UN DISEÑO EXPERIMENTAL QUE INTEGRA TRES ESTIRPES DISTINTAS (RETINTAS, ENTREPELADA Y TORBISCAL), ASI COMO SUS CRUCES F1, DENTRO DE UNA POBLACION COMERCIAL GESTIONADA POR LA EMPRESA INGA FOOD SA. EL PROYECTO PREVE USAR LA INFORMACION TANTO GENEALOGICA COMO PRODUCTIVA/REPRODUCTIVA DE LOS ANIMALES DESDE LA FUNDACION DE LA POBLACION (AÑO 2010), E GENERAR INFORMACION ADICIONAL DE TIPO GENOMICO (GENOTIPADO DE 1.200 INDIVIDUOS CON EL CHIP COMERCIAL DE 60.000 MARCADORES SNP), METABOLOMICO (ESPECTROSCOPIA DE INFRARROJO CERCANO PARA 1.500 MUESTRAS DE SUERO SANGUINEO TOMADAS ALREDEDOR DE LA INSEMINACION/IMPLANTACION), Y MICROBIOMICO (SECUENCIACION MASIVA PARA EL GEN 16S RRNA DE 300 MUESTRAS DE MICROBIOMA VAGINAL TOMADAS EN EL MOMENTO DE LA INSEMINACION DE LAS CERDAS). UNA VEZ OBTENIDA TODA LA INFORMACION, SE REALIZARA UN PRIMER PASO ENFOCADO A ANALIZAR Y CARACTERIZAR LA DIVERSIDAD GENETICA DE LAS ESTIRPES UTILIZADAS, ASI COMO DETERMINAR LA PRESENCIA DE HUELLA DE SELECCION EN LAS MISMAS. EN SEGUNDO LUGAR SE REALIZARAN ANALISIS ¿OMICOS¿ DE ASOCIACION SOBRE CARACTERES REPRODUCTIVOS COMO LA EDAD A LA PRIMERA INSEMINACION O AL PRIMER PARTO, LA FERTILIDAD DE LAS CERDAS (GESTANTE O NO GESTANTE), O LA PROLIFICIDAD EN TERMINOS DE LECHONES NACIDOS VIVOS, MUERTOS O LECHONES DESTETADOS. EN ESTE CASO SE ESTUDIARAN LAS POSIBLES ASOCIACIONES ENTRE ESTOS CARACTERES REPRODUCTIVOS Y LOS DISTINTAS FUENTES DE INFORMACION ¿OMICA¿ POR SEPARADO (GENOMA, METABOLOMA Y MICROBIOMA), PLANTEANDO TAMBIEN EL ESTUDIO DEL POSIBLE IMPACTO DE LA CONSANGUINIDAD SOBRE LOS MISMOS. EN UN SIGUIENTE PASO, SE PROFUNDIZARA EN LOS MODELOS DE EVALUACION GENOMICA, PONIENDO UN ENFASIS ESPECIAL EN LA PONDERACION DE LA INFORMACION TANTO GENOMICA COMO FENOTIPICA, ASI COMO LA MAS QUE POSIBLE INTERACCION ENTRE EL GENOMA Y EL METABOLOMA. FINALMENTE, Y SIENDO ESTE UNO DE LOS HITOS MAS RELEVANTES DEL PROYECTO, SE PRETENDE ANALIZAR DE MANERA INTEGRADA TODAS LAS FUENTES DE INFORMACION DISPONIBLES, CON EL OBJETIVO DE CREAR REDES BIOLOGICAS QUE INTEGREN LAS DISTINTAS CAPAS DE INFORMACION Y APORTEN UNA CARACTERIZACION MAS COMPLETA Y REALISTA DE LOS MECANISMOS BIOLOGICOS IMPLICADOS EN LA REGULACION DE LA REPRODUCCION (Y SU EFICIENCIA) EN EL PORCINO EN GENERAL, Y EN LAS CERDAS IBERICAS EN PARTICULAR. EN CONJUNTO, SE PLANTEA UNA INICIATIVA NOVEDOSA Y AMBICIOSA, RELEVANTE TANTO PARA LA INDUSTRIA PORCINA COMO PARA LA COMUNIDAD CIENTIFICA, E IMPLICANDO UN EQUIPO DE INVESTIGADORES DE RECONOCIDO PRESTIGIO INTERNACIONAL QUE GARANTIZA LA VIABILIDAD DE PROYECTO Y LA CONSECUCION DE LOS OBJETIVOS MARCADOS. (Spanish)
0 references
THIS PROJECT FOCUSES ON THE STUDY OF THE REPRODUCTIVE EFFICIENCY OF IBERIAN BRISTLES, BASED ON AN EXPERIMENTAL DESIGN THAT INTEGRATES THREE DIFFERENT STRAINS (RETINTAS, ENTREPELADA AND TORBISCAL), AS WELL AS THEIR F1 CROSSES, WITHIN A COMMERCIAL POPULATION MANAGED BY INGA FOOD SA. THE PROJECT PLANS TO USE BOTH GENEALOGIC AND PRODUCTIVE/REPRODUCTIVE INFORMATION OF ANIMALS FROM THE POPULATION FOUNDATION (YEAR 2010), AND GENERATE ADDITIONAL INFORMATION OF GENOMIC TYPE (GENOTYPING OF 1,200 INDIVIDUALS WITH THE COMMERCIAL CHIP OF 60,000 SNP MARKERS), METABOLOMICO (NEAR INFRARED SPECTROSCOPY FOR 1,500 BLOOD SERUM SAMPLES TAKEN AROUND THE INSEMINATION/IMPLANTATION), AND MICROBIOMICO (MASSIVE SEQUENCING FOR THE 16S RRNA GENE OF 300 SAMPLES OF VAGINAL MICROBIOME TAKEN AT THE TIME OF THE INSEMINATION OF THE SOWS). ONCE ALL THE INFORMATION IS OBTAINED, A FIRST STEP WILL BE MADE FOCUSED ON ANALYSING AND CHARACTERISING THE GENETIC DIVERSITY OF THE STRAINS USED, AS WELL AS DETERMINING THE PRESENCE OF A SELECTION FOOTPRINT IN THEM. SECOND, WILL BE PERFORMED ANOMALY OF ASSOCIATION ON REPRODUCTIVE CHARACTERS SUCH AS AGE AT FIRST INSEMINATION OR FIRST DELIVERY, FERTILITY OF SOWS (GESTANT OR NON-PREGNANT), OR PROLIFICITY IN TERMS OF PIGLETS BORN ALIVE, DEAD OR WEANED PIGLETS. IN THIS CASE THE POSSIBLE ASSOCIATIONS BETWEEN THESE REPRODUCTIVE CHARACTERS AND THE DIFFERENT SOURCES OF INFORMATION WILL BE STUDIED SEPARATELY (GENOME, METABOLOMA AND MICROBIOME), ALSO PROPOSING THE STUDY OF THE POSSIBLE IMPACT OF CONSANGUINITY ON THEM. IN A NEXT STEP, IT WILL DEEPEN THE MODELS OF GENOMIC EVALUATION, PUTTING A SPECIAL EMPHASIS ON THE WEIGHTING OF BOTH GENOMIC AND PHENOTYPIC INFORMATION, AS WELL AS THE MORE THAN POSSIBLE INTERACTION BETWEEN THE GENOME AND THE METABOLOMA. FINALLY, BEING ONE OF THE MOST RELEVANT MILESTONES OF THE PROJECT, THE AIM IS TO ANALYSE IN AN INTEGRATED WAY ALL AVAILABLE SOURCES OF INFORMATION, WITH THE AIM OF CREATING BIOLOGICAL NETWORKS THAT INTEGRATE THE DIFFERENT LAYERS OF INFORMATION AND PROVIDE A MORE COMPLETE AND REALISTIC CHARACTERISATION OF THE BIOLOGICAL MECHANISMS INVOLVED IN THE REGULATION OF REPRODUCTION (AND THEIR EFFICIENCY) IN THE PIGS IN GENERAL, AND IBERIAN SOWS IN PARTICULAR. ON THE WHOLE, A NEW AND AMBITIOUS INITIATIVE IS PROPOSED, RELEVANT TO BOTH THE PIG INDUSTRY AND THE SCIENTIFIC COMMUNITY, AND INVOLVING A TEAM OF RESEARCHERS OF RECOGNISED INTERNATIONAL STANDING THAT GUARANTEES THE VIABILITY OF THE PROJECT AND THE ACHIEVEMENT OF THE OBJECTIVES SET. (English)
12 October 2021
0 references
CE PROJET SE CONCENTRE SUR L’ÉTUDE DE L’EFFICACITÉ REPRODUCTRICE DES SOIES IBÉRIQUES, BASÉE SUR UNE CONCEPTION EXPÉRIMENTALE QUI INTÈGRE TROIS SOUCHES DIFFÉRENTES (RETINTAS, ENTREPELADA ET TORBISCAL), AINSI QUE LEURS CROISEMENTS F1, AU SEIN D’UNE POPULATION COMMERCIALE GÉRÉE PAR INGA FOOD SA. LE PROJET PRÉVOIT D’UTILISER DES INFORMATIONS GÉNÉALOGIQUES ET PRODUCTIVES/REPRODUCTRICES SUR LES ANIMAUX DE LA FONDATION DE LA POPULATION (ANNÉE 2010), ET DE GÉNÉRER DES INFORMATIONS SUPPLÉMENTAIRES DE TYPE GÉNOMIQUE (GÉNOTAGE DE 1 200 INDIVIDUS AVEC LA PUCE COMMERCIALE DE 60 000 MARQUEURS SNP), METABOLOMICO (SPECTROSCOPIE INFRAROUGE PROCHE DE 1500 ÉCHANTILLONS DE SÉRUM SANGUIN PRÉLEVÉS AUTOUR DE L’INSÉMINATION/IMPLANTATION) ET MICROBIOMICO (SÉQUENÇAGE MASSIF DU GÈNE 16S DE L’ARNR 16S DE 300 ÉCHANTILLONS DE MICROBIOME VAGINAL PRÉLEVÉS AU MOMENT DE L’INSÉMINATION DES TRUIES). UNE FOIS TOUTES LES INFORMATIONS OBTENUES, UNE PREMIÈRE ÉTAPE SERA FAITE POUR ANALYSER ET CARACTÉRISER LA DIVERSITÉ GÉNÉTIQUE DES SOUCHES UTILISÉES, AINSI QUE POUR DÉTERMINER LA PRÉSENCE D’UNE EMPREINTE DE SÉLECTION DANS CELLES-CI. DEUXIÈMEMENT, UNE ANOMALIE D’ASSOCIATION SERA RÉALISÉE SUR DES CARACTÈRES REPRODUCTIFS TELS QUE L’ÂGE AU DÉBUT DE L’INSÉMINATION OU DE LA PREMIÈRE ACCOUCHEMENT, LA FERTILITÉ DES TRUIES (GESTANT OU NON ENCEINTE) OU LA PROLIFICITÉ EN TERMES DE PORCELETS NÉS VIVANTS, MORTS OU SEVRÉS. DANS CE CAS, LES ASSOCIATIONS POSSIBLES ENTRE CES CARACTÈRES REPRODUCTEURS ET LES DIFFÉRENTES SOURCES D’INFORMATION SERONT ÉTUDIÉES SÉPARÉMENT (GÉNOME, METABOLOMA ET MICROBIOME), EN PROPOSANT ÉGALEMENT L’ÉTUDE DE L’IMPACT POSSIBLE DE LA CONSANGUINITÉ SUR EUX. DANS UNE PROCHAINE ÉTAPE, IL APPROFONDIRA LES MODÈLES D’ÉVALUATION GÉNOMIQUE, EN METTANT PARTICULIÈREMENT L’ACCENT SUR LA PONDÉRATION DE L’INFORMATION GÉNOMIQUE ET PHÉNOTYPIQUE, AINSI QUE SUR L’INTERACTION PLUS QUE POSSIBLE ENTRE LE GÉNOME ET LE METABOLOMA. ENFIN, ÉTANT L’UNE DES ÉTAPES LES PLUS IMPORTANTES DU PROJET, L’OBJECTIF EST D’ANALYSER DE MANIÈRE INTÉGRÉE TOUTES LES SOURCES D’INFORMATION DISPONIBLES, DANS LE BUT DE CRÉER DES RÉSEAUX BIOLOGIQUES QUI INTÈGRENT LES DIFFÉRENTES COUCHES D’INFORMATION ET FOURNISSENT UNE CARACTÉRISATION PLUS COMPLÈTE ET PLUS RÉALISTE DES MÉCANISMES BIOLOGIQUES IMPLIQUÉS DANS LE RÈGLEMENT DE LA REPRODUCTION (ET DE LEUR EFFICACITÉ) CHEZ LES PORCS EN GÉNÉRAL, ET LES TRUIES IBÉRIQUES EN PARTICULIER. DANS L’ENSEMBLE, UNE INITIATIVE NOUVELLE ET AMBITIEUSE EST PROPOSÉE, QUI CONCERNE À LA FOIS L’INDUSTRIE PORCINE ET LA COMMUNAUTÉ SCIENTIFIQUE, ET QUI ASSOCIE UNE ÉQUIPE DE CHERCHEURS AYANT UNE RÉPUTATION INTERNATIONALE RECONNUE QUI GARANTIT LA VIABILITÉ DU PROJET ET LA RÉALISATION DES OBJECTIFS FIXÉS. (French)
2 December 2021
0 references
DAS PROJEKT KONZENTRIERT SICH AUF DIE UNTERSUCHUNG DER REPRODUKTIONSEFFIZIENZ VON IBERISCHEN BORSTEN, BASIEREND AUF EINEM EXPERIMENTELLEN DESIGN, DAS DREI VERSCHIEDENE STÄMME (RETINTAS, ENTREPELADA UND TORBISCAL) SOWIE DEREN F1-KREUZE IN EINE VON INGA FOOD SA VERWALTETE KOMMERZIELLE BEVÖLKERUNG INTEGRIERT. DAS PROJEKT PLANT, SOWOHL GENEALOGISCHE ALS AUCH PRODUKTIVE/REPRODUKTIVE INFORMATIONEN VON TIEREN DER POPULATIONSSTIFTUNG (JAHR 2010) ZU NUTZEN UND ZUSÄTZLICHE INFORMATIONEN ÜBER DEN GENOMISCHEN TYP ZU GENERIEREN (GENOTYPISIERUNG VON 1.200 PERSONEN MIT DEM KOMMERZIELLEN CHIP VON 60.000 SNP-MARKERN), METABOLOMICO (NAHE INFRAROTSPEKTROSKOPIE FÜR 1.500 BLUTSERUMPROBEN, DIE UM DIE INSEMINATION/IMPLANTATION ENTNOMMEN WURDEN) UND MICROBIOMICO (MASSIVE SEQUENZIERUNG FÜR DAS 16S RRNA-GEN VON 300 PROBEN VAGINALEM MIKROBIOM, DIE ZUM ZEITPUNKT DER INSEMINATION DER SAUEN ENTNOMMEN WURDEN). SOBALD ALLE INFORMATIONEN VORLIEGEN, WIRD EIN ERSTER SCHRITT AUF DIE ANALYSE UND CHARAKTERISIERUNG DER GENETISCHEN VIELFALT DER VERWENDETEN STÄMME SOWIE AUF DIE BESTIMMUNG DES VORHANDENSEINS EINES AUSWAHLFUSSABDRUCKS IN IHNEN AUSGERICHTET. ZWEITENS WIRD EINE ANOMALIE DER VEREINIGUNG ÜBER FORTPFLANZUNGSCHARAKTERE WIE ALTER BEI DER ERSTEN BESAMUNG ODER ERSTLIEFERUNG, FRUCHTBARKEIT VON SAUEN (GESTANT ODER NICHT-SCHWANGER) ODER FRUCHTBARKEIT IN BEZUG AUF LEBENDE FERKEL, TOTE ODER ENTWÖHNTE FERKEL DURCHGEFÜHRT. IN DIESEM FALL WERDEN DIE MÖGLICHEN ASSOZIATIONEN ZWISCHEN DIESEN REPRODUKTIONSCHARAKTEREN UND DEN VERSCHIEDENEN INFORMATIONSQUELLEN GETRENNT UNTERSUCHT (GENOM, METABOLOMA UND MIKROBIOM), UND SCHLÄGT AUCH VOR, DIE MÖGLICHEN AUSWIRKUNGEN VON KONANGUINITÄT AUF SIE ZU UNTERSUCHEN. IN EINEM NÄCHSTEN SCHRITT WIRD ES DIE MODELLE DER GENOMISCHEN BEWERTUNG VERTIEFEN, WOBEI EIN BESONDERER SCHWERPUNKT AUF DER GEWICHTUNG SOWOHL GENOMISCHER ALS AUCH PHÄNOTYPISCHER INFORMATIONEN SOWIE DIE MEHR ALS MÖGLICHE WECHSELWIRKUNG ZWISCHEN GENOM UND METABOLOMA GELEGT WIRD. ALS EINER DER WICHTIGSTEN MEILENSTEINE DES PROJEKTS SCHLIESSLICH SOLLEN ALLE VERFÜGBAREN INFORMATIONSQUELLEN IN INTEGRIERTER WEISE ANALYSIERT WERDEN, UM BIOLOGISCHE NETZWERKE ZU SCHAFFEN, DIE DIE VERSCHIEDENEN INFORMATIONSSCHICHTEN INTEGRIEREN UND EINE UMFASSENDERE UND REALISTISCHERE CHARAKTERISIERUNG DER BIOLOGISCHEN MECHANISMEN ERMÖGLICHEN, DIE AN DER VERORDNUNG ÜBER DIE FORTPFLANZUNG (UND DEREN EFFIZIENZ) AN SCHWEINEN IM ALLGEMEINEN UND IM BESONDEREN IBERISCHEN SAUEN BETEILIGT SIND. INSGESAMT WIRD EINE NEUE UND EHRGEIZIGE INITIATIVE VORGESCHLAGEN, DIE SOWOHL FÜR DIE SCHWEINEINDUSTRIE ALS AUCH FÜR DIE WISSENSCHAFTLICHE GEMEINSCHAFT RELEVANT IST UND EIN TEAM VON FORSCHERN MIT ANERKANNTER INTERNATIONALER STELLUNG EINBEZIEHT, DIE DIE LEBENSFÄHIGKEIT DES PROJEKTS UND DIE ERREICHUNG DER GESETZTEN ZIELE GEWÄHRLEISTEN. (German)
9 December 2021
0 references
DIT PROJECT RICHT ZICH OP DE STUDIE VAN DE REPRODUCTIEVE EFFICIËNTIE VAN IBERISCHE BORSTELHAREN, GEBASEERD OP EEN EXPERIMENTEEL ONTWERP DAT DRIE VERSCHILLENDE STAMMEN (RETINTAS, ENTREPELADA EN TORBISCAL) INTEGREERT, EVENALS HUN F1 KRUISEN, BINNEN EEN COMMERCIËLE POPULATIE BEHEERD DOOR INGA FOOD SA. HET PROJECT IS VAN PLAN OM ZOWEL GENEALOGISCHE ALS PRODUCTIEVE/REPRODUCTIEVE INFORMATIE VAN DIEREN UIT DE POPULATIESTICHTING (JAAR 2010) TE GEBRUIKEN EN AANVULLENDE INFORMATIE TE GENEREREN VAN GENOMISCH TYPE (GENOTYPERING VAN 1.200 INDIVIDUEN MET DE COMMERCIËLE CHIP VAN 60.000 SNP-MARKERS), METABOLOMICO (BIJNA INFRAROODSPECTROSCOPIE VOOR 1.500 BLOEDSERUMMONSTERS DIE ZIJN GENOMEN ROND DE INSEMINATIE/IMPLANTATIE), EN MICROBIOMICO (MASSAGE SEQUENCING VOOR HET 16S RRNA-GEN VAN 300 MONSTERS VAGINALE MICROBIOME GENOMEN OP HET MOMENT VAN INSEMINATIE VAN DE ZEUGEN). ZODRA ALLE INFORMATIE IS VERKREGEN, ZAL EEN EERSTE STAP WORDEN GEZET GERICHT OP HET ANALYSEREN EN KARAKTERISEREN VAN DE GENETISCHE DIVERSITEIT VAN DE GEBRUIKTE STAMMEN, EVENALS HET BEPALEN VAN DE AANWEZIGHEID VAN EEN SELECTIEVOETAFDRUK ERIN. TEN TWEEDE, ZAL WORDEN UITGEVOERD ANOMALIE VAN ASSOCIATIE OP REPRODUCTIEVE TEKENS ZOALS LEEFTIJD BIJ EERSTE INSEMINATIE OF EERSTE BEVALLING, VRUCHTBAARHEID VAN ZEUGEN (GESTANT OF NIET-ZWANGER), OF PROLIFICITEIT IN TERMEN VAN BIGGEN GEBOREN LEVEND, DOOD OF GESPEENDE BIGGEN. IN DIT GEVAL ZULLEN DE MOGELIJKE ASSOCIATIES TUSSEN DEZE VOORTPLANTINGSKARAKTERS EN DE VERSCHILLENDE INFORMATIEBRONNEN AFZONDERLIJK WORDEN ONDERZOCHT (GENOOM, METABOLOMA EN MICROBIOME), WAARBIJ OOK WORDT VOORGESTELD DE MOGELIJKE IMPACT VAN BLOEDVERWANTSCHAP OP HEN TE ONDERZOEKEN. IN EEN VOLGENDE STAP ZAL HET DE MODELLEN VAN GENOMIC EVALUATIE VERDIEPEN, WAARBIJ EEN SPECIALE NADRUK WORDT GELEGD OP DE WEGING VAN ZOWEL GENOMIC ALS FENOTYPISCHE INFORMATIE, EVENALS DE MEER DAN MOGELIJKE INTERACTIE TUSSEN HET GENOOM EN HET METABOLOMA. ALS EEN VAN DE MEEST RELEVANTE MIJLPALEN VAN HET PROJECT IS HET DOEL TEN SLOTTE OM OP GEÏNTEGREERDE WIJZE ALLE BESCHIKBARE INFORMATIEBRONNEN TE ANALYSEREN, MET ALS DOEL BIOLOGISCHE NETWERKEN TOT STAND TE BRENGEN DIE DE VERSCHILLENDE LAGEN VAN INFORMATIE INTEGREREN EN EEN VOLLEDIGER EN REALISTISCHER KARAKTERISERING VAN DE BIOLOGISCHE MECHANISMEN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ DE VERORDENING INZAKE DE VOORTPLANTING (EN HUN EFFICIËNTIE) IN DE VARKENS IN HET ALGEMEEN, EN IBERISCHE ZEUGEN IN HET BIJZONDER. OVER HET GEHEEL GENOMEN WORDT EEN NIEUW EN AMBITIEUS INITIATIEF VOORGESTELD, DAT ZOWEL VOOR DE VARKENSINDUSTRIE ALS VOOR DE WETENSCHAPPELIJKE GEMEENSCHAP VAN BELANG IS, WAARBIJ EEN TEAM VAN ERKENDE INTERNATIONALE ONDERZOEKERS WORDT BETROKKEN DAT DE LEVENSVATBAARHEID VAN HET PROJECT EN DE VERWEZENLIJKING VAN DE GESTELDE DOELSTELLINGEN WAARBORGT. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Cerdanyola del Vallès
0 references
Identifiers
CGL2016-80155-R
0 references