METHYLATION PATTERNS OF PLACENTA IMPRINTED GENES, EXPOSURE TO NON-PERSISTENT PESTICIDES, AND GROWTH AND FETAL AND INFANTILE DEVELOPMENT (Q3179851): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(Changed an Item) |
(Added qualifier: readability score (P590521): 0.3034987968953353) |
||||||
| Property / summary: Objectives: Identify a panel of gene biomarkers whose coordinated methylation pattern or methylation of specific gene expression regulatory regions (GRIs) is associated with adverse alterations in development, foetal growth and neurodevelopment at 12 months of age. As well as evaluating the association between prenatal exposure to organophosphorus and neonicotinoid pesticides and the methylation pattern. Methodology: Prospective birth cohort of 344 mother-child binomies. Women will be captured during the first trimester of pregnancy and monitored during the second and third trimesters of pregnancy, delivery and the year of birth of the child. Urine samples will be taken during pregnancy and the child per year, placenta samples will also be taken at birth. Information on variables related to foetal growth and development will be collected and the Bayley-II neurodevelopment test will be applied to children at 12 months. DNA will be extracted and purified from placenta samples using the QIAamp DNA Mini Kit. The methylation analysis of the complete genome of placenta cells will be performed with Illumina’s Infinium® HumanMethylation450 BeadChip and specific genes by pyrossequencing. They will determine the levels of organophosphorus and neonicotinoid pesticides in urine samples. Using semi-supervised Recursively partitioned mixture models (SS-RPMM) will identify the group of genes whose methylation patterns are most associated with effect variables. Multivariate logistic and linear regression models shall be constructed, as appropriate, on the effects variables in relation to the cluster of methylation patterns. (English) / qualifier | |||||||
readability score: 0.3034987968953353
| |||||||
Revision as of 14:08, 20 March 2024
Project Q3179851 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | METHYLATION PATTERNS OF PLACENTA IMPRINTED GENES, EXPOSURE TO NON-PERSISTENT PESTICIDES, AND GROWTH AND FETAL AND INFANTILE DEVELOPMENT |
Project Q3179851 in Spain |
Statements
106,379.48 Euro
0 references
132,050.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
1 January 2014
0 references
31 March 2017
0 references
ESCUELA ANDALUZA DE SALUD PUBLICA
0 references
Objetivos: Identificar un panel de biomarcadores de genes cuyo patrón coordinado de metilación y/o la metilación de las regiones reguladoras de la expresión de genes específicos (ICR) se asocie con el alteraciones adversas en desarrollo, crecimiento fetal y neurodesarrollo a los 12 meses edad. Así como evaluar la asociación entre la exposición prenatal a plaguicidas organofosforados y neonicotinoides y el patrón de metilación. Metodología: Cohorte de nacimiento prospectiva de 344 binomios madre-hijo/a. Las mujeres se captarán durante el primer trimestre de embarazo y se les efectuará un seguimiento durante el segundo y tercer trimestre de embarazo, el parto y al año del nacimiento del/a hijo/a. Se tomarán muestras de orina durante el embarazo y al niño al año, asimismo se tomaránmuestras de placenta en el parto. Se recogerá información sobre variables relacionadas con desarrollo y crecimiento fetal y se aplicará a los niños/as la prueba Bayley-II de neurodesarrollo a los 12 meses. El ADN será extraído y purificado a partir de lasmuestras de placenta utilizando el QIAamp DNA Mini Kit. El análisis de metilación del genoma completo de células de placenta se realizarán con Infinium® HumanMethylation450 BeadChip de Illumina y de genes específicos por pirosecuenciación. Sedeterminarán los niveles de plaguicidas organofosforados y neonicotinoides en las muestras de orina. Utilizando semisupervised recursively partitioned mixture models (SS-RPMM) se identificará el grupo de genes cuyos patrones de metilación resultan más asociados a las variables de efecto. Se construirán modelos de regresión logística y lineal multivariantes según corresponda, sobre las variables de efectos en relación a los cluster de los patrones de metilación. (Spanish)
0 references
Objectives: Identify a panel of gene biomarkers whose coordinated methylation pattern or methylation of specific gene expression regulatory regions (GRIs) is associated with adverse alterations in development, foetal growth and neurodevelopment at 12 months of age. As well as evaluating the association between prenatal exposure to organophosphorus and neonicotinoid pesticides and the methylation pattern. Methodology: Prospective birth cohort of 344 mother-child binomies. Women will be captured during the first trimester of pregnancy and monitored during the second and third trimesters of pregnancy, delivery and the year of birth of the child. Urine samples will be taken during pregnancy and the child per year, placenta samples will also be taken at birth. Information on variables related to foetal growth and development will be collected and the Bayley-II neurodevelopment test will be applied to children at 12 months. DNA will be extracted and purified from placenta samples using the QIAamp DNA Mini Kit. The methylation analysis of the complete genome of placenta cells will be performed with Illumina’s Infinium® HumanMethylation450 BeadChip and specific genes by pyrossequencing. They will determine the levels of organophosphorus and neonicotinoid pesticides in urine samples. Using semi-supervised Recursively partitioned mixture models (SS-RPMM) will identify the group of genes whose methylation patterns are most associated with effect variables. Multivariate logistic and linear regression models shall be constructed, as appropriate, on the effects variables in relation to the cluster of methylation patterns. (English)
12 October 2021
0.3034987968953353
0 references
Objectifs: Identifier un groupe de biomarqueurs géniques dont le patron de méthylation coordonnée ou la méthylation de régions régulatrices spécifiques de l’expression génique (SRG) est associé à des altérations défavorables du développement, de la croissance fœtale et du neurodéveloppement à l’âge de 12 mois. En plus d’évaluer l’association entre l’exposition prénatale aux pesticides organophosphorés et néonicotinoïdes et le profil de méthylation. Méthodologie: Cohorte de naissance prospective de 344 binomies mère-enfant. Les femmes seront capturées au cours du premier trimestre de la grossesse et surveillées pendant les deuxième et troisième trimestres de la grossesse, de l’accouchement et de l’année de naissance de l’enfant. Des échantillons d’urine seront prélevés pendant la grossesse et l’enfant par an, des échantillons placenta seront également prélevés à la naissance. Des renseignements sur les variables liées à la croissance et au développement du fœtus seront recueillis et le test de neurodéveloppement Bayley-II sera appliqué aux enfants à 12 mois. L’ADN sera extrait et purifié à partir d’échantillons placenta à l’aide du kit ADN QIAamp. L’analyse de la méthylation du génome complet des cellules placentaires sera réalisée avec Infinium® HumanMethylation450 BeadChip d’Illumina et des gènes spécifiques par pyrosséquençage. Ils détermineront les concentrations de pesticides organophosphorés et néonicotinoïdes dans les échantillons d’urine. L’utilisation de modèles de mélanges récursivement partagés semi-supervisés (SS-RPMM) permettra d’identifier le groupe de gènes dont les patrons de méthylation sont les plus associés aux variables d’effet. Des modèles de régression logistique et linéaire multivariées doivent être construits, le cas échéant, sur les variables d’effets par rapport au groupe de modèles de méthylation. (French)
4 December 2021
0 references
Ziele: Identifizieren Sie ein Panel von Gen-Biomarkern, deren koordiniertes Methylierungsmuster oder Methylierung spezifischer Genexpressions-Regulierungsregionen (GRIs) mit nachteiligen Veränderungen in der Entwicklung, dem fetalen Wachstum und der Neuroentwicklung im Alter von 12 Monaten assoziiert ist. Sowie die Bewertung des Zusammenhangs zwischen pränataler Exposition gegenüber Organophosphor und Neonicotinoid-Pestiziden und dem Methylierungsmuster. Methodik: Voraussichtliche Geburtskohorte von 344 Mutter-Kind-Binomien. Frauen werden während des ersten Trimesters der Schwangerschaft gefangen und während des zweiten und dritten Trimesters der Schwangerschaft, der Geburt und des Geburtsjahres überwacht. Urinproben werden während der Schwangerschaft und das Kind pro Jahr genommen, Plazentaproben werden auch bei der Geburt genommen. Es werden Informationen über Variablen im Zusammenhang mit fetalem Wachstum und Entwicklung gesammelt und der Bayley-II Neuroentwicklungstest für Kinder ab 12 Monaten angewendet. Die DNA wird mit dem QIAamp DNA Mini Kit aus Plazentaproben extrahiert und gereinigt. Die Methylierungsanalyse des vollständigen Genoms von Plazentazellen wird mit Illuminas Infinium® HumanMethylation450 BeadChip und spezifischen Genen durch Pyrossequenzierung durchgeführt. Sie bestimmen die Gehalte an Organophosphor und Neonicotinoid-Pestiziden in Urinproben. Die Verwendung von semi-supervised Recursively partitioned Mix Models (SS-RPMM) identifiziert die Gruppe von Genen, deren Methylierungsmuster am meisten mit Effektvariablen assoziiert sind. Multivariate logistische und lineare Regressionsmodelle sind gegebenenfalls anhand der Wirkungsvariablen in Bezug auf den Cluster von Methylierungsmustern zu erstellen. (German)
9 December 2021
0 references
Doelstellingen: Identificeer een panel van genbiomarkers waarvan het gecoördineerde methylatiepatroon of methylatie van specifieke gebieden van genexpressie (GRI’s) in verband wordt gebracht met ongunstige veranderingen in ontwikkeling, foetale groei en neuroontwikkeling op de leeftijd van 12 maanden. Naast de evaluatie van het verband tussen prenatale blootstelling aan organische fosfor en neonicotinoïde bestrijdingsmiddelen en het methylatiepatroon. Methodologie: Prospectieve geboortecohort van 344 moeder-kind binomies. Vrouwen worden gevangen tijdens het eerste trimester van de zwangerschap en gecontroleerd tijdens het tweede en derde trimester van de zwangerschap, bevalling en het geboortejaar van het kind. Urine monsters worden genomen tijdens de zwangerschap en het kind per jaar, placenta monsters worden ook genomen bij de geboorte. Informatie over variabelen in verband met foetale groei en ontwikkeling zal worden verzameld en de Bayley-II neuroontwikkelingstest zal worden toegepast op kinderen na 12 maanden. DNA zal worden geëxtraheerd en gezuiverd uit placenta monsters met behulp van de QIAamp DNA Mini Kit. De methylation analyse van het volledige genoom van placenta cellen zal worden uitgevoerd met Illumina’s Infinium® HumanMethylation450 BeadChip en specifieke genen door pyrossequencing. Zij zullen de niveaus van organische fosfor en neonicotinoïde pesticiden in urinemonsters bepalen. Met behulp van semi-gecontroleerde Recursively partitioned mengselmodellen (SS-RPMM) zal de groep genen waarvan de methylatiepatronen het meest geassocieerd zijn met effectvariabelen, identificeren. Multivariate logistieke en lineaire regressiemodellen moeten in voorkomend geval worden geconstrueerd op de effectenvariabelen ten opzichte van de cluster van methylatiepatronen. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Obiettivi: Identificare un gruppo di biomarcatori genici il cui modello coordinato di metilazione o metilazione di specifiche regioni regolatorie di espressione genica (GRI) è associato a alterazioni avverse nello sviluppo, nella crescita fetale e nello sviluppo neurologico a 12 mesi di età. Oltre a valutare l'associazione tra l'esposizione prenatale ai pesticidi organofosforici e neonicotinoidi e il modello di metilazione. Metodologia: Coorte di nascita prospettica di 344 binomie madre-bambino. Le donne saranno catturate durante il primo trimestre di gravidanza e monitorate durante il secondo e terzo trimestre di gravidanza, parto e l'anno di nascita del bambino. I campioni di urina saranno prelevati durante la gravidanza e il bambino all'anno, i campioni di placenta saranno prelevati anche alla nascita. Saranno raccolte informazioni sulle variabili relative alla crescita e allo sviluppo fetale e il test di neurosviluppo Bayley-II sarà applicato ai bambini a 12 mesi. Il DNA verrà estratto e purificato dai campioni di placenta utilizzando il Mini Kit QIAamp DNA. L'analisi di metilazione del genoma completo delle cellule placenta sarà eseguita con Infinium® HumanMethylation450 BeadChip di Illumina e geni specifici mediante pirossequenziamento. Essi determineranno i livelli di pesticidi organofosforici e neonicotinoidi nei campioni di urina. Utilizzando modelli semi-supervisti di miscela partizionata ricorsivamente (SS-RPMM) identificherà il gruppo di geni i cui modelli di metilazione sono più associati alle variabili di effetto. I modelli di regressione logistica e lineare multivariati devono essere costruiti, se del caso, sulle variabili degli effetti in relazione al cluster dei modelli di metilazione. (Italian)
16 January 2022
0 references
Eesmärgid: Määrata geenide biomarkerite paneel, mille koordineeritud metüleerimismuster või metülatsioon konkreetsete geeniekspressiooni reguleerivate piirkondade (GRI) puhul on seotud negatiivsete muutustega arengus, loote kasvus ja neuroarengus 12 kuu vanuses. Samuti hinnatakse seoseid prenataalse kokkupuute vahel fosfororgaaniliste ja neonikotinoidsete pestitsiididega ning metüülimise vahel. Metoodika: 344 ema-lapse binoomi tulevane sünnikohort. Naised võetakse kinni raseduse esimesel trimestril ning jälgitakse raseduse teisel ja kolmandal trimestril, sünnitusel ja lapse sünniaastal. Uriiniproovid võetakse raseduse ajal ja laps aastas, platsenta proovid võetakse ka sünnil. Kogutakse teavet loote kasvu ja arenguga seotud muutujate kohta ning 12 kuu pärast tehakse lastele Bayley-II neuroarengu test. DNA ekstraheeritakse ja puhastatakse platsentaproovidest, kasutades QIAamp DNA Mini Kit’i. Illumina’s Infinium® HumanMethylation450 BeadChip’i ja konkreetsete geenide metülatsioonianalüüs platsentarakkude täieliku genoomi kohta tehakse pürossequencing’i abil. Nad määravad fosfororgaaniliste ja neonikotinoidide pestitsiidide sisalduse uriiniproovides. Kasutades pooljärelevalvega rekursiivselt jaotatud segumudeleid (SS-RPMM), määratakse kindlaks geenide rühm, mille metüülimise mustrid on kõige enam seotud mõjumuutujatega. Vajaduse korral koostatakse mitme muutujaga logistilised ja lineaarsed regressioonimudelid mõjumuutujatele, mis on seotud metüleerimismustrite klastriga. (Estonian)
4 August 2022
0 references
Tikslai: Nustatyti genų biologinių žymenų grupę, kurios suderintas metilinimo modelis arba specifinių genų raiškos reguliavimo regionų metilinimas (GRI) yra susijęs su nepageidaujamais vystymosi, vaisiaus augimo ir nervų vystymosi pokyčiais 12 mėnesių amžiaus. Taip pat įvertinti ryšį tarp fosforo organo ir neonikotinoidinių pesticidų prenatalinio poveikio ir metilinimo modelio. Metodika: Perspektyvi 344 motinos-vaikų binomių gimimo kohorta. Moterys bus užfiksuotos per pirmąjį nėštumo trimestrą ir stebimos antruoju ir trečiuoju nėštumo trimestrais, gimdymo ir vaiko gimimo metais. Šlapimo mėginiai bus imami nėštumo metu ir vaikas per metus, placentos mėginiai taip pat bus paimti gimimo metu. Bus renkama informacija apie kintamuosius, susijusius su vaisiaus augimu ir vystymusi, o Bayley-II neurokūros testas bus taikomas vaikams po 12 mėnesių. DNR ekstrahuojama ir išgryninama iš placentos mėginių naudojant QIAamp DNA Mini Kit. Viso placentos ląstelių genomo metilinimo analizė bus atliekama naudojant Illumina’s Infinium® HumanMethylation450 BeadChip ir specifinius genus, naudojant pirosseką. Jie nustatys fosforo ir neonikotinoidų organinių pesticidų kiekį šlapimo mėginiuose. Naudojant pusiau prižiūrimus Recursively splited mišinio modelius (SS-RPMM) bus nustatyta genų, kurių metilinimo modeliai yra labiausiai susiję su poveikio kintamaisiais, grupė. Daugiamačiai logistikos ir tiesinės regresijos modeliai prireikus turi būti sukonstruoti pagal poveikio kintamuosius, susijusius su metilinimo modelių grupe. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
Ciljevi: Identificirajte skupinu biomarkera gena čiji je usklađeni obrazac metilacije ili metilacija određenih regulatornih područja ekspresije gena (GRI) povezan s nepovoljnim promjenama u razvoju, rastu fetusa i neurorazvoju u dobi od 12 mjeseci. Kao i procjenu povezanosti prenatalne izloženosti organofosforu i neonikotinoidnim pesticidima i metilacijskim obrascima. Metodologija: Prospektivna rodna kohorta od 344 binoma majke i djeteta. Žene će biti zarobljene tijekom prvog tromjesečja trudnoće i praćene tijekom drugog i trećeg tromjesečja trudnoće, poroda i godine rođenja djeteta. Uzorci urina uzimat će se tijekom trudnoće, a dijete godišnje, uzorci posteljice također će se uzimati pri rođenju. Prikupljat će se informacije o varijablama koje se odnose na rast i razvoj fetusa, a test neurorazvoja Bayley-II primjenjivat će se na djecu nakon 12 mjeseci. DNK će biti izvađen i pročišćen iz uzoraka posteljice pomoću QIAamp DNA Mini Kit. Metilacijska analiza kompletnog genoma posteljice provest će se pomoću Illumina’s Infinium® HumanMethylation450 BeadChip i specifičnih gena pirossequencingom. Oni će odrediti razine organofosfora i neonikotinoida pesticida u uzorcima urina. Korištenjem polunadziranih modela rekurzivno podijeljenih smjesa (SS-RPMM) identificirat će se skupina gena čiji su metilacijski obrasci najviše povezani s varijablama učinka. Multivarijatni logistički i linearni regresijski modeli izrađuju se, prema potrebi, na varijablama učinaka u odnosu na skup metilacijskih uzoraka. (Croatian)
4 August 2022
0 references
Στόχοι: Προσδιορίζεται μια ομάδα γονιδιακών βιοδεικτών των οποίων το συντονισμένο πρότυπο μεθυλίωσης ή μεθυλίωσης συγκεκριμένων περιοχών ρύθμισης γονιδιακής έκφρασης (GRIs) συνδέεται με δυσμενείς μεταβολές στην ανάπτυξη, την ανάπτυξη του εμβρύου και τη νευροανάπτυξη σε ηλικία 12 μηνών. Εκτός από την αξιολόγηση της συσχέτισης μεταξύ της προγεννητικής έκθεσης σε οργανοφωσφόρους και νεονικοτινοειδών φυτοφαρμάκων και της μεθυλίωσης. Μεθοδολογία: Πιθανή γενετήσια κοόρτη 344 βινομιών μητέρας-παιδιού. Οι γυναίκες θα συλλαμβάνονται κατά τη διάρκεια του πρώτου τριμήνου της εγκυμοσύνης και θα παρακολουθούνται κατά τη διάρκεια του δεύτερου και του τρίτου τριμήνου της εγκυμοσύνης, της τοκετού και του έτους γέννησης του παιδιού. Δείγματα ούρων θα λαμβάνονται κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης και το παιδί ανά έτος, δείγματα πλακούντα θα λαμβάνονται επίσης κατά τη γέννηση. Θα συλλεχθούν πληροφορίες σχετικά με τις μεταβλητές που σχετίζονται με την ανάπτυξη και την ανάπτυξη του εμβρύου και η δοκιμή νευροανάπτυξης Bayley-II θα εφαρμοστεί στα παιδιά σε 12 μήνες. Το DNA θα εξαχθεί και θα καθαριστεί από δείγματα πλακούντα χρησιμοποιώντας το QIAamp DNA Mini Kit. Η ανάλυση μεθυλίωσης του πλήρους γονιδιώματος των κυττάρων του πλακούντα θα πραγματοποιηθεί με το Infinium® HumanMethylation450 BeadChip της Illumina και ειδικά γονίδια με πυρόσβεσης. Θα καθορίσουν τα επίπεδα οργανοφωσφόρου και νεονικοτινοειδών φυτοφαρμάκων σε δείγματα ούρων. Χρησιμοποιώντας ημι-εποπτευόμενα αναδρομικά χωρισμένα μοντέλα μείγματος (SS-RPMM) θα προσδιορίσει την ομάδα των γονιδίων των οποίων τα μοτίβα μεθυλίωσης συνδέονται περισσότερο με μεταβλητές επίδρασης. Τα μοντέλα υλικοτεχνικής και γραμμικής παλινδρόμησης πολλαπλών μεταβλητών κατασκευάζονται, ανάλογα με την περίπτωση, στις μεταβλητές επιπτώσεις σε σχέση με το σύμπλεγμα προτύπων μεθυλίωσης. (Greek)
4 August 2022
0 references
Ciele: Identifikujte skupinu génových biomarkerov, ktorých koordinovaný model metylácie alebo metylácia špecifických regulačných oblastí génovej expresie (GRIs) je spojený s nežiaducimi zmenami vo vývoji, raste plodu a neurovývoje vo veku 12 mesiacov. Ako aj hodnotenie súvislosti medzi prenatálnou expozíciou organofosforu a neonikotinoidným pesticídom a modelom metylácie. Metodika: Perspektívna pôrodná kohorta 344 dvojíc matiek a detí. Ženy budú zachytené počas prvého trimestra tehotenstva a monitorované počas druhého a tretieho trimestra tehotenstva, pôrodu a roku narodenia dieťaťa. Vzorky moču sa odoberajú počas tehotenstva a dieťaťa za rok, vzorky placenty sa tiež odoberajú pri narodení. Zozbierajú sa informácie o premenných súvisiacich s rastom a vývojom plodu a Bayleyho-II test neurovývoja sa bude aplikovať na deti po 12 mesiacoch. DNA sa extrahuje a čistí zo vzoriek placenty pomocou QIAamp DNA Mini Kit. Analýza metylácie kompletného genómu buniek placenty sa vykoná pomocou Illuminy Infinium® HumanMethylation450 BeadChip a špecifických génov pyrosekvenovaním. Určia hladiny organofosforu a neonikotinoidných pesticídov vo vzorkách moču. Použitím polokontrolovaných modelov rekurzívne rozdelených zmesí (SS-RPMM) sa identifikuje skupina génov, ktorých modely metylácie sú najviac spojené s účinnými premennými. Multivariabilné logistické a lineárne regresné modely sa podľa potreby zostavujú z premenných účinkov vo vzťahu k zhluku metylačných modelov. (Slovak)
4 August 2022
0 references
Tavoitteet: Tunnistettava geenibiomarkkereista koostuva paneeli, jonka yhteensovitettu metylaatiomalli tai tiettyjen geenien ilmentymisalueiden metylaatio on yhteydessä kehityksen, sikiön kasvun ja neurokehityksen haitallisiin muutoksiin 12 kuukauden iässä. Sen lisäksi, että arvioidaan orgaaniselle fosforille altistumisen ja neonikotinoidien torjunta-aineille altistumisen ja metylaatiomallin välistä yhteyttä. Menetelmät: Mahdollinen syntymäkohortti 344 äiti-lapsi binomies. Naiset otetaan kiinni raskauden ensimmäisen kolmanneksen aikana, ja heitä seurataan raskauden, synnytyksen ja lapsen syntymävuoden toisen ja kolmannen kolmanneksen aikana. Virtsanäytteitä otetaan raskauden aikana ja lapsi vuodessa, istukkanäytteitä otetaan myös syntymän yhteydessä. Sikiön kasvuun ja kehitykseen liittyviä muuttujia koskevat tiedot kerätään ja Bayley II:n neurokehitystesti tehdään lapsille 12 kuukauden kuluttua. DNA uutetaan ja puhdistetaan istukkanäytteistä käyttäen QIAamp DNA Mini Kit. Istukan solujen täydellisen genomin metylaatioanalyysi suoritetaan Illuminan Infinium® HumanMethylation450 BeadChipillä ja tietyillä geeneillä pyrossekvensoinnin avulla. Ne määrittävät orgaanisen fosforin ja neonikotinoidien torjunta-aineiden pitoisuudet virtsanäytteissä. Osittain valvottujen rekursiivisesti jaettujen seosmallien (SS-RPMM) avulla voidaan tunnistaa geeniryhmä, jonka metylaatiomallit liittyvät eniten vaikutusmuuttujiin. Monimuuttujaiset logistiset ja lineaariset regressiomallit on tarvittaessa laadittava muuttujien vaikutuksesta metylaatiomallien klustereihin nähden. (Finnish)
4 August 2022
0 references
Cele: Zidentyfikuj panel biomarkerów genowych, których skoordynowany wzór metylacji lub metylacja określonych regionów regulacyjnych ekspresji genów (GRI) wiąże się z niekorzystnymi zmianami w rozwoju, wzroście płodu i neurorozwoju w wieku 12 miesięcy. A także ocenę związku między narażeniem prenatalnym na pestycydy fosforoorganiczne i neonikotynoidy a wzorzec metylacji. Metodyka: Prospektywna kohorta urodzeń 344 binomii matka-dziecko. Kobiety zostaną schwytane w pierwszym trymestrze ciąży i monitorowane w drugim i trzecim trymestrze ciąży, porodu i roku urodzenia dziecka. Próbki moczu będą pobierane w czasie ciąży, a dziecko rocznie, próbki łożyska będą również pobierane po urodzeniu. Zebrane zostaną informacje na temat zmiennych związanych ze wzrostem i rozwojem płodu, a test neurorozwojowy Bayley-II zostanie zastosowany u dzieci w wieku 12 miesięcy. DNA będzie ekstrahowane i oczyszczane z próbek łożyska za pomocą QIAamp DNA Mini Kit. Analiza metylacji pełnego genomu komórek łożyska zostanie przeprowadzona za pomocą Illumina Infinium® HumanMethylation450 BeadChip i specyficznych genów za pomocą sekwencjonowania pyrossequencingu. Określą poziomy pestycydów fosforoorganicznych i neonikotynoidowych w próbkach moczu. Zastosowanie półnadzorowanych modeli mieszanek rekursywnie podzielonych (SS-RPMM) pozwoli zidentyfikować grupę genów, których wzorce metylacji są najbardziej związane ze zmiennymi efektami. Wielowymiarowe modele logistyczne i regresji liniowej są konstruowane, w stosownych przypadkach, na zmiennych skutków w odniesieniu do klastra wzorców metylacji. (Polish)
4 August 2022
0 references
Célkitűzések: Olyan gén-biomarkerek panelének azonosítása, amelyek összehangolt metilációs mintázata vagy meghatározott génexpressziós szabályozási régiók (GRI-k) metilációja a fejlődés, a magzati növekedés és a neurofejlesztés káros változásaival jár 12 hónapos korban. Valamint a szerves foszfor és a neonikotinoid növényvédő szerek prenatális expozíciója és a metilációs minta közötti összefüggés értékelése. Módszertan: 344 anya-gyermek binom leendő születési kohorsza. A nőket a terhesség első trimeszterében fogják el, és a terhesség, a szülés és a gyermek születésének második és harmadik trimeszterében ellenőrzik. Vizeletmintákat kell venni a terhesség alatt, és a gyermek évente, placenta mintákat is kell venni a születéskor. A magzati növekedéssel és fejlődéssel kapcsolatos változókra vonatkozó információkat összegyűjtik, és a Bayley-II neurofejlesztési tesztet 12 hónapos gyermekeknél alkalmazzák. DNS-t extrahálnak és tisztítanak a placentamintákból a QIAamp DNS Mini Kit segítségével. A placentasejtek teljes genomjának metilációs analízisét az Illumina Infinium® HumanMethylation450 BeadChip-jével és specifikus génjeivel, piroszszekvenálással kell elvégezni. Meghatározzák a szerves foszfor és a neonikotinoid peszticidek szintjét a vizeletmintákban. A félig felügyelt Rekurzívan particionált keverékmodellek (SS-RPMM) segítségével azonosítják azokat a géncsoportokat, amelyek metilációs mintái leginkább a hatásváltozókhoz kapcsolódnak. Adott esetben többváltozós logisztikai és lineáris regressziós modelleket kell kialakítani a metilációs minták klaszterével kapcsolatos hatásváltozókra. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
Cíle: Identifikovat panel genových biomarkerů, jejichž koordinovaný methylační vzor nebo methylace specifických oblastí regulace genové exprese (GRI) je spojena s nepříznivými změnami ve vývoji, růstu plodu a neurovývoji ve věku 12 měsíců. Jakož i hodnocení vztahu mezi prenatální expozicí organofosforům a neonikotinoidním pesticidům a methylačním vzorem. Metodika: Potenciální porodní kohorta 344 binomií matek a dětí. Ženy budou zachyceny během prvního trimestru těhotenství a sledovány během druhého a třetího trimestru těhotenství, porodu a roku narození dítěte. Vzorky moči budou odebrány během těhotenství a dítě za rok, vzorky placenty budou také odebrány při narození. Budou shromážděny informace o proměnných týkajících se růstu plodu a vývoje plodu a test neurovývoje Bayley-II se bude vztahovat na děti ve 12 měsících. DNA bude extrahována a čištěna ze vzorků placenty pomocí QIAamp DNA Mini Kit. Methylační analýza kompletního genomu placentových buněk bude provedena pomocí přípravku Illumina Infinium® HumanMethylation450 BeadChip a specifických genů pyrossekvencováním. Určí hladiny organofosforu a neonikotinoidních pesticidů ve vzorcích moči. Pomocí semi-suovervised Rekursively dělené směsi modely (SS-RPMM) identifikuje skupinu genů, jejichž methylace vzory jsou nejvíce spojeny s proměnnými účinku. Multivariační logistické a lineární regresní modely se sestaví podle potřeby na proměnných účinků ve vztahu ke klastru methylačních vzorců. (Czech)
4 August 2022
0 references
Mērķi: Identificēt gēnu biomarķieru grupu, kuru koordinētais metilēšanas modelis vai specifisku gēnu ekspresijas regulējošo reģionu (GRI) metilēšana ir saistīta ar nevēlamām attīstības, augļa augšanas un neiroloģiskās attīstības izmaiņām 12 mēnešu vecumā. Kā arī novērtēt saistību starp fosfororganisko un neonikotinoīdu pesticīdu prenatālo iedarbību un metilēšanas modeli. Metodika: Topošā dzimšanas kohorta no 344 mātes un bērna binomijām. Sievietes tiks notvertas grūtniecības pirmajā trimestrī un tiks uzraudzītas otrajā un trešajā grūtniecības trimestrī, dzemdībām un bērna piedzimšanas gadā. Urīna paraugi tiks ņemti grūtniecības laikā un bērns gadā, placentas paraugi tiks ņemti arī dzimšanas brīdī. Tiks apkopota informācija par mainīgajiem lielumiem, kas saistīti ar augļa augšanu un attīstību, un pēc 12 mēnešiem bērniem tiks piemērots Bayley-II neiroattīstības tests. DNS tiks ekstrahēta un attīrīta no placentas paraugiem, izmantojot QIAamp DNS Mini Kit. Placentas šūnu pilnīga genoma metilācijas analīze tiks veikta ar Illumina Infinium® HumanMethylation450 BeadChip un specifiskiem gēniem pirossekvencē. Tie noteiks fosfororganisko un neonikotinoīdu pesticīdu līmeni urīna paraugos. Izmantojot daļēji uzraudzītus atkārtoti sadalītus maisījumu modeļus (SS-RPMM), identificēs gēnu grupu, kuras metilēšanas modeļi ir visvairāk saistīti ar ietekmes mainīgajiem lielumiem. Multivariātu loģistikas un lineārās regresijas modeļus pēc vajadzības izstrādā, ņemot vērā ietekmes mainīgos lielumus attiecībā pret metilēšanas modeļu kopu. (Latvian)
4 August 2022
0 references
Cuspóirí: Painéal bithmharcóirí géine a shainaithint a mbaineann a bpatrún meitile comhordaithe nó a meitil réigiúin rialála géine (GRInna) le hathruithe díobhálacha ar fhorbairt, fás féatais agus néarfhorbairt ag 12 mhí d’aois. Chomh maith leis an gceangal idir nochtadh réamhbhreithe do lotnaidicídí orgánafosfair agus lotnaidicídí neoinicitínóideacha agus an patrún meitile a mheas. Modheolaíocht: Cohórt breithe de 344 binomies mháthair-leanbh. Déanfar mná a ghabháil le linn an chéad ráithe de thoircheas agus déanfar monatóireacht orthu le linn an dara agus an tríú ráithe de thoircheas, seachadadh agus bliain bhreithe an linbh. Tógfar samplaí fuail le linn toirchis agus an leanbh in aghaidh na bliana, tógfar samplaí broghais freisin ag breith. Baileofar faisnéis faoi athróga a bhaineann le fás agus forbairt féatais agus cuirfear an tástáil néarfhorbartha Bayley-II i bhfeidhm ar leanaí ag 12 mhí. Déanfar DNA a bhaint agus a íonú ó shamplaí placenta ag baint úsáide as an QIAamp DNA Mini Kit. Beidh an anailís meitile ar an genome iomlán na cealla placenta a dhéanamh le Infinium Illumina ar ® HumanMethylation450 BeadChip agus géinte ar leith ag pyrossequencing. Cinnfidh siad na leibhéil lotnaidicídí orgánafosfair agus neonicotinoid i samplaí fuail. Trí úsáid a bhaint as samhlacha meascáin athdhéanta leath-mhaoirsithe (SS-RPMM) sainaithneofar an grúpa géinte a bhfuil a bpatrúin mheitile is mó a bhaineann le hathróga éifeachta. Déanfar samhlacha lóistíochta ilathraitheacha agus samhlacha cúlchéimnithe líneacha a thógáil, de réir mar is iomchuí, ar na hathróga éifeachtaí i ndáil leis an mbraisle de phatrúin mheitile. (Irish)
4 August 2022
0 references
Cilji: Določite ploščo genskih biomarkerjev, katerih usklajen metilacijski vzorec ali metilacija določenih regij izražanja genov je povezana s škodljivimi spremembami v razvoju, rasti ploda in nevrorazvoju pri starosti 12 mesecev. Ter oceno povezave med prenatalno izpostavljenostjo organofosforjevim in neonikotinoidnim pesticidom ter metilacijskim vzorcem. Metodologija: Predvidena rodna kohorta 344 binomov mater in otrok. Ženske bodo ujete v prvem trimesečju nosečnosti in nadzorovane v drugem in tretjem trimesečju nosečnosti, poroda in leta rojstva otroka. Vzorci urina bodo odvzeti med nosečnostjo in otrok na leto, vzorci placente bodo odvzeti tudi ob rojstvu. Zbirali se bodo podatki o spremenljivkah, povezanih z rastjo in razvojem ploda, test nevrorazvoja Bayley-II pa se bo izvajal pri otrocih po 12 mesecih. DNK se ekstrahira in očisti iz vzorcev placente z uporabo QIAamp DNA Mini Kit. Analiza metilacije celotnega genoma celic placente se izvede s pomočjo Illuminovega Infinium® HumanMethylation450 BeadChip in specifičnih genov s pirosekvenciranjem. Določili bodo ravni organofosforjevih in neonikotinoidnih pesticidov v vzorcih urina. Uporaba polnadzorovanih rekurzivno razdeljenih modelov zmesi (SS-RPMM) bo opredelila skupino genov, katerih vzorci metilacije so najbolj povezani s spremenljivkami učinka. Multivariatni logistični in linearni regresijski modeli se po potrebi izdelajo na spremenljivkah učinkov v zvezi s skupino vzorcev metilacije. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
Цели: Идентифицирайте група от генни биомаркери, чийто координиран модел на метилиране или метилиране на специфични региони на генна експресия (ГРИ) е свързан с неблагоприятни промени в развитието, растежа на плода и неврологичното развитие на 12-месечна възраст. Както и оценка на връзката между пренаталната експозиция на органофосфор и неоникотиноидни пестициди и модела на метилиране. Методология: Потенциална родилна кохорта от 344 биноми майка-дете. Жените ще бъдат уловени по време на първия триместър на бременността и ще бъдат наблюдавани по време на втория и третия триместър на бременността, раждането и годината на раждане на детето. Проби от урина се вземат по време на бременност и детето годишно, проби от плацентата също ще се вземат при раждането. Ще бъде събрана информация за променливите, свързани с растежа и развитието на плода, а тестът за невроразвитие на Bayley-II ще се прилага за деца на 12 месеца. ДНК ще бъде извлечена и пречистена от плацента проби с помощта на QIAamp DNA Mini Kit. Метилационният анализ на пълния геном на плацентаните клетки ще се извършва с Infinium® HumanMethylation450 на Illumina и специфични гени чрез пиросеквениране. Те ще определят нивата на органофосфор и неоникотиноидни пестициди в пробите урина. Използването на полу-контролирани рекурсивно разделени модели на смес (SS-RPMM) ще идентифицира групата гени, чиито модели на метилиране са най-свързани с променливите на ефекта. По целесъобразност се изграждат многовариантни логистични и линейни регресионни модели върху променливите влияния във връзка с клъстера от модели на метилиране. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
Għanijiet: Identifika bord ta’ bijomarkaturi tal-ġeni li l-mudell koordinat tal-metilazzjoni jew il-metilazzjoni ta’ reġjuni regolatorji speċifiċi tal-espressjoni tal-ġeni (GRIs) huma assoċjati ma’ bidliet avversi fl-iżvilupp, it-tkabbir tal-fetu u n-newrożvilupp fl-età ta’ 12-il xahar. Kif ukoll l-evalwazzjoni tal-assoċjazzjoni bejn l-esponiment ta’ qabel it-twelid għall-pestiċidi organofosforiċi u n-neonikotinojdi u x-xejra tal-metilazzjoni. Metodoloġija: Koorti prospettiv tat-twelid ta’ 344 binomija tal-omm u t-tarbija. In-nisa jinqabdu matul l-ewwel trimestru tat-tqala u jiġu mmonitorjati matul it-tieni u t-tielet trimestri tat-tqala, il-ħlas u s-sena tat-twelid tat-tarbija. Kampjuni tal-awrina se jittieħdu waqt it-tqala u t-tarbija fis-sena, kampjuni tal-plaċenta se jittieħdu wkoll fit-twelid. Se tinġabar informazzjoni dwar fatturi varjabbli relatati mat-tkabbir u l-iżvilupp tal-fetu u t-test ta’ żvilupp newroloġiku Bayley-II se jiġi applikat fuq it-tfal wara 12-il xahar. DNA se jiġu estratti u ppurifikati minn kampjuni tal-plaċenta bl-użu tal-QIAamp DNA Mini Kit. L-analiżi tal-metilazzjoni tal-ġenoma sħiħa taċ-ċelloli tal-plaċenta se ssir bl-Infinium® HumanMethylation450 BeadChip ta’ Illumina u ġeni speċifiċi permezz ta’ pyrossequencing. Dawn se jiddeterminaw il-livelli ta’ pestiċidi organofosforiċi u neonikotinojdi fil-kampjuni tal-awrina. L-użu ta’ mudelli ta’ taħlita semi-supervizzati Recursively partitioned (SS-RPMM) għandu jidentifika l-grupp ta’ ġeni li l-mudelli tal-metilazzjoni tagħhom huma l-aktar assoċjati ma’ varjabbli ta’ effett. Mudelli loġistiċi u lineari ta’ rigressjoni multivarjati għandhom jinbnew, kif xieraq, fuq l-effetti varjabbli fir-rigward tar-raggruppament ta’ mudelli ta’ metilazzjoni. (Maltese)
4 August 2022
0 references
Objetivos: Identificar um painel de biomarcadores genéticos cujo padrão coordenado de metilação ou metilação de regiões reguladoras específicas de expressão gênica (GRIs) está associado a alterações adversas no desenvolvimento, crescimento fetal e neurodesenvolvimento aos 12 meses de idade. Além de avaliar a associação entre exposição pré-natal a organofosforados e agrotóxicos neonicotinóides e o padrão de metilação. Metodologia: Coorte de nascimentos prospetiva de 344 biografias mãe-filho. As raparigas serão capturadas durante o primeiro trimestre da gravidez e monitoradas durante o segundo e terceiro trimestres de gravidez, parto e ano de nascimento da criança. As amostras de urina serão colhidas durante a gravidez e a criança por ano, amostras de placenta também serão colhidas no nascimento. Serão recolhidas informações sobre as variáveis relacionadas com o crescimento e o desenvolvimento fetal e o teste de neurodesenvolvimento de Bayley-II será aplicado às crianças aos 12 meses. O DNA será extraído e purificado a partir de amostras de placenta usando o QIAamp DNA Mini Kit. A análise de metilação do genoma completo das células placenta será realizada com o Infinium® HumanMethylation450 BeadChip de Illumina e genes específicos por pirossequenciamento. Eles determinarão os níveis de organofosforo e pesticidas neonicotinóides em amostras de urina. Usando modelos de mistura recursivamente particionados semisupervisionados (SS-RPMM) identificará o grupo de genes cujos padrões de metilação estão mais associados a variáveis de efeito. Devem ser construídos modelos logísticos e de regressão linear multivariados, conforme adequado, sobre as variáveis de efeitos em relação ao conjunto de padrões de metilação. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
Målsætninger: Identificere et panel af genbiomarkører, hvis koordinerede methyleringsmønster eller methylering af specifikke genekspressionsregulerende regioner (GRI'er) er forbundet med negative ændringer i udvikling, fostervækst og neuroudvikling ved 12 måneders alderen. Samt en vurdering af sammenhængen mellem prænatal eksponering for organofosphorus og neonicotinoidpesticider og methyleringsmønsteret. Metode: Potentiel fødselskohorte af 344 moder-barn binomier. Kvinder vil blive fanget i første trimester af graviditeten og overvåges i andet og tredje trimester af graviditeten, fødslen og barnets fødselsår. Urinprøver vil blive taget under graviditeten og barnet om året, placenta prøver vil også blive taget ved fødslen. Der vil blive indsamlet oplysninger om variabler vedrørende fostervækst og -udvikling, og Bayley-II-neuroudviklingstesten vil blive anvendt på børn efter 12 måneder. DNA ekstraheres og renses fra placentaprøver ved hjælp af QIAamp DNA Mini Kit. Methyleringsanalysen af hele moderkagecellernes genom vil blive udført med Illuminas Infinium® HumanMethylation450 BeadChip og specifikke gener ved pyrossekvensering. De vil bestemme niveauet af organofosphorus og neonicotinoide pesticider i urinprøver. Ved hjælp af semi-overvågede Recursively partitioned blandingsmodeller (SS-RPMM) identificerer gruppen af gener, hvis methyleringsmønstre er mest forbundet med effektvariabler. Multivariate logistiske og lineære regressionsmodeller skal, hvor det er relevant, konstrueres på grundlag af effektvariablerne i forhold til klyngen af methyleringsmønstre. (Danish)
4 August 2022
0 references
Obiective: Identificați un grup de biomarkeri genetici al căror model coordonat de metilare sau metilare a regiunilor de reglementare a expresiei genelor specifice (GRI) este asociat cu modificări adverse ale dezvoltării, creșterii fetale și dezvoltării neurodezvoltării la vârsta de 12 luni. Precum și evaluarea asocierii dintre expunerea prenatală la pesticide organofosforice și neonicotinoide și modelul de metilare. Metodologie: Cohortă prospectivă de 344 de binomii mamă-copil. Femeile vor fi capturate în primul trimestru de sarcină și monitorizate în al doilea și al treilea trimestru de sarcină, naștere și anul nașterii copilului. Probele de urină vor fi prelevate în timpul sarcinii și copilul pe an, probele placentare vor fi, de asemenea, prelevate la naștere. Informațiile privind variabilele legate de creșterea și dezvoltarea fătului vor fi colectate, iar testul de neurodezvoltare Bayley-II va fi aplicat copiilor la 12 luni. ADN-ul va fi extras și purificat din probele de placentă folosind kit-ul Mini Kit ADN QIAamp. Analiza metilării genomului complet al celulelor placente se va efectua cu ajutorul Illuminei Infinium® HumanMethylation450 BeadChip și a genelor specifice prin pirossequencing. Acestea vor determina nivelurile de pesticide organofosforice și neonicotinoide din probele de urină. Utilizarea modelelor semi-supravegheate de amestec recursiv partiționat (SS-RPMM) va identifica grupul de gene ale căror modele de metilare sunt cele mai asociate cu variabilele de efect. Modelele de regresie logistică și liniară multivariate se construiesc, după caz, pe variabilele de efecte în raport cu gruparea modelelor de metilare. (Romanian)
4 August 2022
0 references
Mål: Identifiera en panel av genbiomarkörer vars samordnade metyleringsmönster eller metylering av specifika genuttryck regulatoriska regioner (GRI) är förknippade med negativa förändringar i utveckling, fostertillväxt och neuroutveckling vid 12 månaders ålder. Förutom att utvärdera sambandet mellan prenatal exponering för organisk fosfor och neonikotinoida bekämpningsmedel och metyleringsmönstret. Metod: Blivande födelsekohort på 344 barnbinomier. Kvinnor kommer att fångas under graviditetens första trimester och övervakas under andra och tredje trimestern av graviditet, förlossning och barnets födelseår. Urinprover kommer att tas under graviditeten och barnet per år, moderkakaprover kommer också att tas vid födseln. Information om variabler relaterade till fostertillväxt och fosterutveckling kommer att samlas in och Bayley-II neuroutvecklingstestet kommer att tillämpas på barn vid 12 månader. DNA extraheras och renas från placentaprover med hjälp av QIAamp DNA Mini Kit. Metyleringsanalysen av hela genomet av placentaceller kommer att utföras med Illuminas Infinium® HumanMethylation450 BeadChip och specifika gener genom pyrosssekvensering. De kommer att bestämma nivåerna av organisk fosfor och neonikotinoida bekämpningsmedel i urinprover. Med hjälp av halvövervakade Recursively partitionerade blandningsmodeller (SS-RPMM) kommer att identifiera den grupp av gener vars metyleringsmönster är mest förknippade med effektvariabler. Multivariata logistiska och linjära regressionsmodeller ska, beroende på vad som är lämpligt, konstrueras på effektvariablerna i förhållande till metyleringsmönstren. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Granada
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI13_01559
0 references