Evolution of resistors and Resistotypes in ICU: towards a Particularly Risk Analysis of Emergency Risk and Infection with Antibiotic Resistant Bacteria (Q3145312): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(BatchIngestion) |
(Changed an Item) |
||||||||||||||
| Property / postal code | |||||||||||||||
| Property / postal code: 28079 / rank | |||||||||||||||
| Property / location (string) | |||||||||||||||
| Property / location (string): Madrid / rank | |||||||||||||||
| Property / coordinate location | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / coordinate location: 40°25'0.12"N, 3°42'12.89"W / rank | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS: Madrid / rank | |||||||||||||||
| Property / date of last update | |||||||||||||||
12 June 2023
| |||||||||||||||
| Property / date of last update: 12 June 2023 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / location (string) | |||||||||||||||
Madrid | |||||||||||||||
| Property / location (string): Madrid / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / coordinate location | |||||||||||||||
40°25'0.12"N, 3°42'12.89"W
| |||||||||||||||
| Property / coordinate location: 40°25'0.12"N, 3°42'12.89"W / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / coordinate location: 40°25'0.12"N, 3°42'12.89"W / qualifier | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS: Madrid / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Revision as of 14:20, 12 June 2023
Project Q3145312 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Evolution of resistors and Resistotypes in ICU: towards a Particularly Risk Analysis of Emergency Risk and Infection with Antibiotic Resistant Bacteria |
Project Q3145312 in Spain |
Statements
82,875.0 Euro
0 references
165,750.0 Euro
0 references
50.0 percent
0 references
1 January 2019
0 references
31 March 2022
0 references
FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL RAMON Y CAJAL
0 references
La resistencia a antibióticos (RAM) es uno de los Retos de Salud Global del siglo XXI. En Europa, la agenda de investigación 2020-25 de RAM va dirigida a la compresión de los procesos adquisición (emergencia), transmisión y persistencia de bacterias RAM que permitan la implementación de estrategias de intervención eficaces. El riesgo de adquisición y transmisión de patógenos oportunistas RAM en el ámbito hospitalario se produce mayoritariamente en las UCIs y está asociado a las características individuales del hospedador y a los factores externos locales (consumo de antibióticos y otros fármacos, factores demográficos,..I) que determinan la estructura y la función de la microbiota intestinal a nivel individual (“resistencia/sensibilidad a la colonización”) y a nivel colectivo (“presión de colonización”). La falta de herramientas de alta sensibilidad y especificidad para determinar poblaciones bacterianas minoritarias y a nivel de subespecie; y la aplicación de sistemas de vigilancia y control de la infección hospitalaria mayoritariamente retrospectivos ha demorado la comprensión de dichos procesos. Este proyecto plantea un Análisis de los riesgos de adquisición y transmisión de microorganismos RAM, partiendo de la observación multidepartamental de la ecología y evolución de resistomas en una UCI durante 6 meses (pooling strategies, sistemas de alerta) y el estudio clínico de pacientes (metadatos h. clínica digital y-prot Resistencia Cero). El Resistoma de grupo permitirá seleccionar diferentes “escenarios RAM de riesgo” que serán analizados por técnicas “ómicas” de alto rendimiento generadas por este consorcio para i) la estratificación de pacientes en resistotipos (ResCap-SeqCapEZ), y enterotipos (kin-genomics, 16SRNA) ii) el análisis de los efectos de las intervenciones (genome-resolved metagenomics y metaproteómica), y iii) la identificación de biomarcadores. Las variables generadas allimentarán un sistema computacional de predicción i. Proyecto I+D+i multi (Spanish)
0 references
Antibiotic Resistance (RAM) is one of the 21st century Global Health Challenges. In Europe, the 2020-25 research agenda of RAM is aimed at the compression of acquisition processes (emergency), transmission and persistence of RAM bacteria that allow the implementation of effective intervention strategies. The risk of acquisition and transmission of opportunistic ADR pathogens in hospitals occurs mostly in ICUs and is associated with individual host characteristics and local external factors (antibiotic and other drug consumption, demographic factors,..I) that determine the structure and function of the intestinal microbiota at the individual level (“resistance/sensitivity to colonisation”) and at the collective level (“colonisation pressure”). The lack of high sensitivity and specificity tools to identify minority and subspecies-level bacterial populations; and the implementation of mostly retrospective hospital infection surveillance and control systems has delayed understanding of these processes. This project proposes an Analysis of the risks of acquisition and transmission of AMR microorganisms, based on the multidepartmental observation of the ecology and evolution of resistomas in a ICU for 6 months (pooling strategies, warning systems) and the clinical study of patients (digital clinical metadata and-prot Zero Resistance). The group resistome will allow the selection of different “risk ADR scenarios” that will be analysed by high-performance “omics” techniques generated by this consortium for (i) the stratification of patients in resistotypes (ResCap-SeqCapEZ), and enterotypes (kin-genomics, 16SRNA) ii) the analysis of the effects of the interventions (genome-resolved metagenomics and metaproteoms), and iii) the identification of biomarkers. The variables generated will feed a computational prediction system i. Project R+D+i multi (English)
12 October 2021
0 references
La résistance aux antibiotiques (RAM) est l’un des défis de la santé mondiale du XXIe siècle. En Europe, le programme de recherche 2020-25 sur la RAM vise la compression des processus d’acquisition (urgence), la transmission et la persistance des bactéries RAM qui permettent la mise en œuvre de stratégies d’intervention efficaces. Le risque d’acquisition et de transmission d’agents pathogènes opportunistes de l’ADR dans les hôpitaux se produit principalement dans les unités de soins intensifs et est associé aux caractéristiques individuelles de l’hôte et à des facteurs externes locaux (consommation antibiotique et autres médicaments, facteurs démographiques,..I) qui déterminent la structure et la fonction du microbiote intestinal au niveau individuel («résistance/sensibilité à la colonisation») et au niveau collectif («pression de colonisation»). L’absence d’outils de sensibilité et de spécificité élevés pour identifier les populations bactériennes minoritaires et sous-espèces; et la mise en place de systèmes de surveillance et de contrôle des infections hospitalières, pour la plupart rétrospectifs, a retardé la compréhension de ces processus. Ce projet propose une analyse des risques d’acquisition et de transmission de micro-organismes de résistance aux antimicrobiens, basée sur l’observation multidépartementale de l’écologie et de l’évolution des résistances en UTI pendant 6 mois (stratégies de mise en commun, systèmes d’avertissement) et l’étude clinique des patients (métadonnées cliniques numériques et résistance zéro prot). La résistance du groupe permettra la sélection de différents «scénarios d’ADR à risque» qui seront analysés par des techniques «omiques» à haute performance générées par ce consortium pour (i) la stratification des patients dans les résistotypes (RESCAP-SeqCapEZ), et les entérotypes (kin-génomique, 16SRNA) ii) l’analyse des effets des interventions (météonomie et métaprotéoms résolus au génome), et iii) l’identification des biomarqueurs. Les variables générées alimenteront un système de prévision computationnelle i. Projet R+D+i multi (French)
2 December 2021
0 references
Antibiotikaresistenz (RAM) ist eine der globalen Gesundheitsherausforderungen des 21. Jahrhunderts. In Europa zielt die Forschungsagenda von RAM 2020-25 auf die Komprimierung von Akquisitionsprozessen (Notfall), Übertragung und Persistenz von RAM-Bakterien ab, die die Umsetzung wirksamer Interventionsstrategien ermöglichen. Das Risiko des Erwerbs und der Übertragung opportunistischer ADR-Erreger in Krankenhäusern tritt überwiegend in ICU auf und ist mit individuellen Wirtsmerkmalen und lokalen externen Faktoren (Antibiotika und andere Drogenkonsum, demografische Faktoren,..I) verbunden, die die Struktur und Funktion der Darmmikrobiota auf individueller Ebene („Widerstand/Empfindlichkeit gegenüber Kolonisation“) und auf kollektiver Ebene („Kolonisationsdruck“) bestimmen. Das Fehlen hoher Sensitivitäts- und Spezifitätsinstrumente zur Identifizierung von bakteriellen Populationen auf Minderheiten- und Unterartenebene; und die Implementierung von meist retrospektiven Krankenhausinfektionsüberwachungs- und -kontrollsystemen hat das Verständnis dieser Prozesse verzögert. Dieses Projekt schlägt eine Analyse der Risiken des Erwerbs und der Übertragung von AMR-Mikroorganismen vor, die auf der multiabteilungalen Beobachtung der Ökologie und der Entwicklung von Resistenzen in einer ICU für 6 Monate (Pooling-Strategien, Warnsysteme) und der klinischen Studie von Patienten (digitale klinische Metadaten und-prot Zero Resistance) basiert. Das Gruppenresistenz ermöglicht die Auswahl verschiedener „Risiko-ADR-Szenarien“, die durch Hochleistungs-„omics“-Techniken analysiert werden, die von diesem Konsortium für i) die Schichtung von Patienten in Resistotypen (RESCAP-SeqCapEZ) und Enterotypen (kin-genomics, 16SRNA) ii) die Analyse der Auswirkungen der Interventionen (genome-aufgelöste Metagenomics und Metaproteoms) und iii) die Identifizierung von Biomarkern. Die erzeugten Variablen werden ein Rechenvorhersagesystem i. Projekt R+D+i multi (German)
9 December 2021
0 references
Antibioticaresistentie (RAM) is een van de 21e-eeuwse wereldwijde gezondheidsuitdagingen. In Europa is de onderzoeksagenda 2020-25 van RAM gericht op de compressie van acquisitieprocessen (noodsituatie), overdracht en persistentie van RAM-bacteriën die de implementatie van effectieve interventiestrategieën mogelijk maken. Het risico van verwerving en overdracht van opportunistische ADR-pathogenen in ziekenhuizen komt meestal voor in ICU’s en is geassocieerd met individuele gastheerkenmerken en lokale externe factoren (antibiotische en andere drugsconsumptie, demografische factoren,..I) die de structuur en functie van de darmmicrobiota op individueel niveau („resistentie/gevoeligheid voor kolonisatie”) en op collectief niveau („kolonisatiedruk”) bepalen. Het ontbreken van instrumenten met een hoge gevoeligheid en specificiteit om bacteriële populaties van minderheden en ondersoorten te identificeren; en de implementatie van meestal retrospectieve surveillance- en controlesystemen voor ziekenhuisinfecties heeft het inzicht in deze processen vertraagd. Dit project stelt een analyse voor van de risico’s van de verwerving en overdracht van AMR-micro-organismen, gebaseerd op de multidepartementale observatie van de ecologie en de evolutie van resistoma’s in een ICU gedurende 6 maanden (poolingstrategieën, waarschuwingssystemen) en de klinische studie van patiënten (digitale klinische metadata en-prot Zero Resistance). Het groepsresistoom zal de selectie mogelijk maken van verschillende „risico ADR-scenario’s” die zullen worden geanalyseerd door middel van krachtige „omics” technieken die door dit consortium worden gegenereerd voor (i) de stratificatie van patiënten in resistotypes (RESCAP-SeqCapEZ) en enterotypes (kin-genomica, 16SRNA) ii) de analyse van de effecten van de interventies (genoom-opgeloste metagenomica en metaproteoms), en iii) de identificatie van biomarkers. De gegenereerde variabelen voeden een rekenkundig voorspellingssysteem i. Project R+D+i multi (Dutch)
17 December 2021
0 references
La resistenza agli antibiotici (RAM) è una delle sfide sanitarie globali del XXI secolo. In Europa, l'agenda di ricerca della RAM 2020-25 è finalizzata alla compressione dei processi di acquisizione (emergenza), alla trasmissione e alla persistenza di batteri RAM che consentono l'attuazione di strategie di intervento efficaci. Il rischio di acquisizione e trasmissione di agenti patogeni ADR opportunistici negli ospedali si verifica principalmente nelle ICU ed è associato alle caratteristiche individuali dell'ospite e ai fattori esterni locali (consumo di farmaci antibiotici e di altro tipo, fattori demografici,..I) che determinano la struttura e la funzione del microbiota intestinale a livello individuale ("resistenza/sensibilità alla colonizzazione") e a livello collettivo ("pressione di colonizzazione"). La mancanza di strumenti di elevata sensibilità e specificità per identificare le popolazioni batteriche a livello di minoranza e sottospecie; e l'attuazione di sistemi per lo più retrospettivi di sorveglianza e controllo delle infezioni ospedaliere ha ritardato la comprensione di questi processi. Il progetto propone un'analisi dei rischi di acquisizione e trasmissione di microrganismi antimicrobici, basata sull'osservazione multidipartimentale dell'ecologia e dell'evoluzione dei resistomi in un'ICU per 6 mesi (strategie di pooling, sistemi di allerta) e sullo studio clinico dei pazienti (metadati clinici digitali e resistenza zero-prot). La resistenza di gruppo consentirà la selezione di diversi "scenari ADR di rischio" che saranno analizzati con tecniche "omiche" ad alte prestazioni generate da questo consorzio per (i) la stratificazione dei pazienti in resistotipi (RESCAP-SeqCapEZ), e enterotipi (kin-genomics, 16SRNA) ii) l'analisi degli effetti degli interventi (metagenomica e metaproteomi risolti genomi), e iii) l'identificazione dei biomarcatori. Le variabili generate alimentano un sistema di previsione computazionale i. Project R+D+i multi (Italian)
16 January 2022
0 references
Η αντοχή στα αντιβιοτικά (RAM) είναι μία από τις παγκόσμιες προκλήσεις για την υγεία του 21ου αιώνα. Στην Ευρώπη, το ερευνητικό θεματολόγιο της RAM για την περίοδο 2020-25 αποσκοπεί στη συμπίεση των διαδικασιών απόκτησης (έκτακτης ανάγκης), στη μετάδοση και την εμμονή των βακτηρίων RAM που επιτρέπουν την εφαρμογή αποτελεσματικών στρατηγικών παρέμβασης. Ο κίνδυνος απόκτησης και μετάδοσης ευκαιριακών παθογόνων παραγόντων ADR στα νοσοκομεία εμφανίζεται ως επί το πλείστον σε ΜΕΜ και συνδέεται με ατομικά χαρακτηριστικά ξενιστή και τοπικούς εξωτερικούς παράγοντες (κατανάλωση αντιβιοτικών και άλλων φαρμάκων, δημογραφικοί παράγοντες,..I) που καθορίζουν τη δομή και τη λειτουργία της εντερικής μικροβιώσης σε ατομικό επίπεδο («αντίσταση/ευαισθησία στον αποικισμό») και σε συλλογικό επίπεδο («πίεση αποικιοκρατίας»). Η έλλειψη εργαλείων υψηλής ευαισθησίας και εξειδίκευσης για τον εντοπισμό πληθυσμών βακτηρίων σε επίπεδο μειονοτήτων και υποείδους· και η εφαρμογή των ως επί το πλείστον αναδρομικών συστημάτων παρακολούθησης και ελέγχου νοσοκομειακών λοιμώξεων έχει καθυστερήσει την κατανόηση αυτών των διαδικασιών. Το έργο αυτό προτείνει μια ανάλυση των κινδύνων απόκτησης και μετάδοσης μικροοργανισμών μικροβιακής αντοχής, με βάση την πολυτομεακή παρατήρηση της οικολογίας και την εξέλιξη των αντιστάσεων σε μια ΜΕΘ για 6 μήνες (στρατηγικές συγκέντρωσης, συστήματα προειδοποίησης) και την κλινική μελέτη ασθενών (ψηφιακά κλινικά μεταδεδομένα και μηδενική αντίσταση προστασίας). Η ομαδική αντίσταση θα επιτρέψει την επιλογή διαφορετικών «σεναρίων επικινδυνότητας ADR» που θα αναλυθούν με τεχνικές «ωματικής» υψηλής απόδοσης που παράγονται από την εν λόγω κοινοπραξία για i) τη στρωματοποίηση ασθενών σε αντιστάσεις (RESCAP-SeqCapEZ), και εντεροτύπων (γονιδιωματική του δέρματος, 16SRNA) ii) την ανάλυση των επιδράσεων των παρεμβάσεων (μεταγεωματική και μεταπρωτεύματα που έχουν επιλυθεί στο γονιδίωμα) και iii) τον προσδιορισμό των βιοδεικτών. Οι μεταβλητές που δημιουργούνται θα τροφοδοτήσουν ένα υπολογιστικό σύστημα πρόβλεψης i. Project R+D+i multi (Greek)
17 August 2022
0 references
Antibiotikaresistens (RAM) er en af det 21. århundredes globale sundhedsudfordringer. I Europa er forskningsdagsordenen for RAM 2020-25 rettet mod komprimering af anskaffelsesprocesser (nød), transmission og persistens af RAM-bakterier, der gør det muligt at gennemføre effektive interventionsstrategier. Risikoen for erhvervelse og overførsel af opportunistiske ATB-patogener på hospitaler forekommer hovedsagelig i intensivafdelinger og er forbundet med individuelle værtskarakteristika og lokale eksterne faktorer (antibiotikum og andet lægemiddelforbrug, demografiske faktorer,.I), der bestemmer strukturen og funktionen af intestinal mikrobiota på individuelt niveau ("resistens/følsomhed over for kolonisering") og på kollektivt niveau ("koloniseringstryk"). Manglen på værktøjer til høj følsomhed og specificitet til at identificere bakteriebestande på minoritets- og underartsniveau og gennemførelsen af overvejende retrospektive systemer til overvågning af og kontrol med infektioner på hospitaler har forsinket forståelsen af disse processer. Dette projekt foreslår en analyse af risiciene ved erhvervelse og overførsel af AMR-mikroorganismer baseret på den multiafdelingelle observation af økologien og udviklingen af resistomer i en ICU i 6 måneder (poolingstrategier, advarselssystemer) og den kliniske undersøgelse af patienter (digitale kliniske metadata og prot Zero Resistance). Gruppens resistom gør det muligt at udvælge forskellige "risiko- ADR-scenarier", som vil blive analyseret ved hjælp af højtydende "omics"-teknikker, der genereres af dette konsortium, for i) stratificering af patienter i resistotyper (RESCAP-SeqCapEZ) og enterotyper (kin-genomforskning, 16SRNA) ii) analyse af virkningerne af interventionerne (genomopløst metagenomik og metaproteomer) og iii) identifikation af biomarkører. De genererede variabler vil give et beregningsmæssigt forudsigelsessystem i. Projekt R+D+i multi (Danish)
17 August 2022
0 references
Antibioottiresistenssi (RAM) on yksi 2000-luvun maailmanlaajuisista terveyshaasteista. Euroopassa vuosien 2020–25 RAM-muistien tutkimusohjelmalla pyritään tiivistämään RAM-bakteerien hankintaprosesseja (hätätilanteita), tarttumista ja pysyvyyttä, mikä mahdollistaa tehokkaiden interventiostrategioiden täytäntöönpanon. Riski opportunististen ADR-patogeenien hankinnasta ja leviämisestä sairaaloissa esiintyy enimmäkseen tehohoitoyksiköissä, ja se liittyy yksilöllisiin isäntäominaisuuksiin ja paikallisiin ulkoisiin tekijöihin (antibiootti ja muut huumeiden kulutus, demografiset tekijät..I), jotka määrittävät suoliston mikrobiotan rakenteen ja toiminnan yksilöllisellä tasolla (nk. kolonisaation sieto/herkkyys) ja kollektiivisella tasolla (”kolonisaatiopaine”). Vähemmistö- ja alalajitason bakteeripopulaatioiden tunnistamiseen tarkoitettujen korkean herkkyyden ja spesifisyyden välineiden puute; ja lähinnä retrospektiivisten sairaalatartuntojen seuranta- ja valvontajärjestelmien käyttöönotto on viivästyttänyt näiden prosessien ymmärtämistä. Tässä hankkeessa ehdotetaan mikrobilääkeresistenssin mikro-organismien hankintaan ja leviämiseen liittyvien riskien analysointia, joka perustuu ICU:ssa kuuden kuukauden ajan tehtyyn moniosastoiseen havaintoon resistoomien ekologiasta ja kehityksestä (yhdystysstrategiat, varoitusjärjestelmät) ja potilaiden kliiniseen tutkimukseen (digitaalinen kliininen metatieto ja nollasuoja). Ryhmävastuksen avulla voidaan valita erilaisia riskialttiita ADR-skenaarioita, joita analysoidaan tämän yhteenliittymän tuottamilla tehokkailla ”omiikkatekniikoilla” i) potilaiden osittamiseen resistotyypeissä (RESCAP-SeqCapEZ) ja enterotyyppeihin (kin-genomiikka, 16SRNA) ii) toimenpiteiden vaikutusten analysointiin (genome-ratkaistu metagenomiikka ja metaproteomit) ja iii) biomarkkerien tunnistamiseen. Tuotetut muuttujat syöttävät laskennallista ennustejärjestelmää i. Project R+D+i multi (Finnish)
17 August 2022
0 references
Ir-Reżistenza għall-Antibijotiċi (RAM) hija waħda mill-Isfidi Globali tas-Saħħa tas-seklu 21. Fl-Ewropa, l-aġenda ta’ riċerka tal-2020–25 tar-RAM hija mmirata lejn il-kompressjoni tal-proċessi ta’ akkwist (emerġenza), it-trażmissjoni u l-persistenza tal-batterji RAM li jippermettu l-implimentazzjoni ta’ strateġiji effettivi ta’ intervent. Ir-riskju tal-akkwist u t-trażmissjoni ta’ patoġeni opportunistiċi tal-ADR fl-isptarijiet iseħħ l-aktar fl-ICUs u huwa assoċjat ma’ karatteristiċi ospitanti individwali u fatturi esterni lokali (antibijotiċi u konsum ieħor ta’ mediċini, fatturi demografiċi,..I) li jiddeterminaw l-istruttura u l-funzjoni tal-mikrobijota intestinali fil-livell individwali (“reżistenza/sensittività għall-kolonizzazzjoni”) u fil-livell kollettiv (“pressjoni ta’ kolonizzazzjoni”). In-nuqqas ta’ għodod ta’ sensittività u speċifiċità għolja biex jiġu identifikati popolazzjonijiet batteriċi fil-livell ta’ minoranza u sottospeċi; u l-implimentazzjoni ta’ sistemi ta’ sorveljanza u kontroll tal-infezzjonijiet fl-isptarijiet fil-biċċa l-kbira retrospettivi ttardjat il-fehim ta’ dawn il-proċessi. Dan il-proġett jipproponi Analiżi tar-riskji tal-akkwist u t-trażmissjoni ta’ mikroorganiżmi AMR, abbażi tal-osservazzjoni multidipartimentali tal-ekoloġija u l-evoluzzjoni ta’ resistomi f’ICU għal 6 xhur (strateġiji ta’ ġbir flimkien, sistemi ta’ twissija) u l-istudju kliniku tal-pazjenti (metadata klinika diġitali u reżistenza żero tal-prot). Ir-reżisoma tal-grupp se tippermetti l-għażla ta’ “xenarji ADR ta’ riskju” differenti li se jiġu analizzati permezz ta’ tekniki ta’ “omika” ta’ prestazzjoni għolja ġġenerati minn dan il-konsorzju għal (i) l-istratifikazzjoni tal-pazjenti fir-reżistotipi (RESCAP-SeqCapEZ), u enterotipi (ġeni-ġilda, 16SRNA) ii) l-analiżi tal-effetti tal-interventi (metaġenomiċi u metaproteoms riżolti mill-ġenoma), u iii) l-identifikazzjoni tal-bijomarkaturi. Il-varjabbli ġġenerati se alimentazzjoni sistema ta ‘tbassir komputazzjoni i. Proġett R+D + i multi (Maltese)
17 August 2022
0 references
Rezistence pret antibiotikām (RAM) ir viena no 21. gadsimta globālajām veselības problēmām. Eiropā RAM 2020–25 pētniecības programma ir vērsta uz to, lai saspiestu iegūšanas procesus (ārkārtas), pārnesi un noturību pret RAM baktērijām, kas ļauj īstenot efektīvas intervences stratēģijas. Oportūnistisko ADR patogēnu iegūšanas un pārnešanas risks slimnīcās galvenokārt rodas SVV, un tas ir saistīts ar individuāliem saimniekorganisma raksturlielumiem un vietējiem ārējiem faktoriem (antibiotikas un citi narkotiku lietošana, demogrāfiskie faktori,..I), kas nosaka zarnu mikrobiotas struktūru un funkciju individuālā līmenī (“rezistence/jutīgums pret kolonizāciju”) un kopējā līmenī (“kolonizācijas spiediens”). Augstas jutības un specifiskuma instrumentu trūkums, lai noteiktu minoritāšu un pasugu baktēriju populācijas; un galvenokārt retrospektīvu slimnīcu infekcijas uzraudzības un kontroles sistēmu ieviešana ir kavējusi izpratni par šiem procesiem. Šajā projektā ir ierosināta AMR mikroorganismu iegūšanas un pārnešanas risku analīze, pamatojoties uz multidepartamenta novērošanu ekoloģijā un rezistences attīstību ICU 6 mēnešus (apvienošanas stratēģijas, brīdināšanas sistēmas) un pacientu klīnisko pētījumu (digitālie klīniskie metadati un droša nulles rezistence). Grupas pretestība ļaus izvēlēties dažādus “riska ADR scenārijus”, kurus analizēs, izmantojot augstas veiktspējas “omikas” paņēmienus, ko šis konsorcijs izstrādās i) pacientu stratifikācijai ar rezistotipiem (RESCAP-SeqCapEZ) un enterotipiem (kin-genomics, 16SRNA), ii) intervenču ietekmes analīzei (genome-resolved metagenomics un metaproteoms) un iii) biomarķieru identificēšanai. Radītie mainīgie tiks izmantoti skaitļošanas prognozēšanas sistēmā i. Projekta R+D+i multi (Latvian)
17 August 2022
0 references
Rezistencia voči antibiotikám (RAM) je jednou z globálnych výziev v oblasti zdravia 21. storočia. V Európe je výskumná agenda RAM na roky 2020 – 25 zameraná na kompresiu procesov nadobúdania (núdzová), prenos a pretrvávanie baktérií RAM, ktoré umožňujú vykonávanie účinných intervenčných stratégií. Riziko získania a prenosu oportúnnych patogénov ADR v nemocniciach sa vyskytuje väčšinou v ICU a je spojené s individuálnymi charakteristikami hostiteľa a miestnymi vonkajšími faktormi (spotreba antibiotík a iných liekov, demografickými faktormi,..I), ktoré určujú štruktúru a funkciu črevnej mikroflóry na individuálnej úrovni („rezistencia/citlivosť voči kolonizácii“) a na kolektívnej úrovni („kolonizačný tlak“). Nedostatok nástrojov vysokej citlivosti a špecifickosti na identifikáciu menšinových a poddruhových bakteriálnych populácií; a vykonávanie prevažne retrospektívnych systémov dohľadu a kontroly infekcií v nemocniciach viedlo k oneskorenému pochopeniu týchto procesov. V tomto projekte sa navrhuje Analýza rizík získavania a prenosu mikroorganizmov AMR na základe multidepartmentálneho pozorovania ekológie a vývoja rezistómov v ICU počas 6 mesiacov (stratégie združovania, varovné systémy) a klinickej štúdie pacientov (digitálne klinické metaúdaje a nulová rezistencia na ochranu). Rezistóm skupiny umožní výber rôznych „rizikových scenárov ADR“, ktoré sa analyzujú vysokovýkonnými „omickými“ technikami vytvorenými týmto konzorciom pre i) stratifikáciu pacientov v rezistentných typoch (RESCAP-SeqCapEZ) a enterotypoch (kin-genomics, 16SRNA) ii) analýzu účinkov intervencií (genómom vyriešených metagenomík a metaproteómov) a iii) identifikáciu biomarkerov. Generované premenné budú vkladať výpočtový predikčný systém i. Projekt R+D+i multi (Slovak)
17 August 2022
0 references
Tá frithsheasmhacht in aghaidh antaibheathach (RAM) ar cheann de na Dúshláin Dhomhanda Sláinte sa 21d haois. San Eoraip, tá clár taighde 2020-25 RAM dírithe ar chomhbhrú na bpróiseas fála (éigeandála), tarchur agus marthanacht baictéir RAM a cheadaíonn straitéisí éifeachtacha idirghabhála a chur chun feidhme. Is in ICUanna is mó a tharlaíonn an riosca a bhaineann le pataiginí ADR faille a fháil agus a tharchur in ospidéil agus baineann sé le saintréithe óstacha aonair agus le tosca seachtracha áitiúla (tomhailt antaibheathach agus eile drugaí, fachtóirí déimeagrafacha,..I) lena gcinntear struchtúr agus feidhm na micribhitheolaíochta intestinal ar an leibhéal aonair (“friotaíocht/íogaireacht i leith coilínithe”) agus ar an leibhéal comhchoiteann (“brú cóilíneach”). Easpa uirlisí ardíogaireachta agus sainiúlachta chun daonraí baictéaracha ar leibhéal mionlaigh agus fospeiceas a shainaithint; agus tá moill ar an tuiscint ar na próisis sin mar gheall ar chur chun feidhme córas cúlghabhálach faireachais agus rialaithe ionfhabhtuithe ospidéil den chuid is mó. Molann an tionscadal seo Anailís a dhéanamh ar na rioscaí a bhaineann le miocrorgánaigh AMR a fháil agus a tharchur, bunaithe ar bhreathnóireacht ilrannach ar éiceolaíocht agus éabhlóid friotachas in ICU ar feadh 6 mhí (straitéisí comhthiomsaithe, córais rabhaidh) agus staidéar cliniciúil na n-othar (meiteashonraí cliniciúla digiteacha agus-cosaint Zero Friotaíocht). Leis an bhfriotóm grúpa, beifear in ann “cásanna riosca ADR” éagsúla a roghnú a ndéanfar anailís orthu trí theicnící “maíochtaí” ardfheidhmíochta arna nginiúint ag an gcuibhreannas sin le haghaidh (i) srathú othar i bhfriotaíocht (ResCap-SeqCapEZ), agus eintreacha (cine-ghéanómaíocht, 16SRNA) ii) anailís a dhéanamh ar éifeachtaí na n-idirghabhálacha (meitigéanómaíocht ghéanóimithe agus meiteapróim), agus iii) bithmharcóirí a shainaithint. Beidh na hathróga a ghintear beatha córas tuar ríomhaireachtúil i. Project R+D+i il (Irish)
17 August 2022
0 references
Rezistence vůči antibiotikům (RAM) je jednou z globálních výzev v oblasti zdraví 21. století. V Evropě je výzkumný program RAM na období 2020–25 zaměřen na kompresi akvizičních procesů (nouzových), přenos a přetrvávání bakterií RAM, které umožňují provádění účinných intervenčních strategií. Riziko získání a přenosu oportunních patogenů ADR v nemocnicích se vyskytuje převážně v ICU a je spojeno s individuálními charakteristikami hostitele a místními vnějšími faktory (antibiotická a jiná spotřeba drog, demografické faktory,..I), které určují strukturu a funkci střevní mikrobioty na individuální úrovni („odolnost/citlivost vůči kolonizaci“) a na kolektivní úrovni („kolonizační tlak“). Nedostatek nástrojů vysoké citlivosti a specifičnosti pro identifikaci bakteriálních populací menšin a poddruhů; a zavedení většinou retrospektivních nemocničních systémů dohledu a kontroly infekcí zpozdilo pochopení těchto procesů. Tento projekt navrhuje analýzu rizik akvizice a přenosu mikroorganismů AMR, založenou na multidepartmentálním pozorování ekologie a evoluci rezistomů v ICU po dobu 6 měsíců (sdružení strategií, varovných systémů) a klinické studie pacientů (digitální klinická metadata a nulová rezistence prot). Skupinový rezistor umožní výběr různých „rizikových scénářů alternativního řešení sporů“, které budou analyzovány pomocí vysoce výkonných „omických“ technik generovaných tímto konsorciem pro i) stratifikaci pacientů v rezistotypech (RESCAP-SeqCapEZ) a enterotypy (kin-genomika, 16SRNA) ii) analýzu účinků intervencí (genomově vyřešená metagenomika a metaproteomy) a iii) identifikaci biomarkerů. Generované proměnné napájí výpočetní predikční systém i. Projekt R+D+i multi (Czech)
17 August 2022
0 references
A resistência aos antibióticos (RAM) é um dos desafios globais de saúde do século XXI. Na Europa, a agenda de pesquisa 2020-25 da RAM visa a compressão de processos de aquisição (emergência), transmissão e persistência de bactérias RAM que permitem a implementação de estratégias de intervenção eficazes. O risco de aquisição e transmissão de patógenos de RAM oportunistas em hospitais ocorre principalmente em UTI e está associado a características individuais do hospedeiro e fatores externos locais (consumo antibiótico e outros medicamentos, fatores demográficos,..I) que determinam a estrutura e a função da microbiota intestinal a nível individual («resistência/sensibilidade à colonização») e a nível coletivo («pressão de colonização»). A falta de instrumentos de elevada sensibilidade e especificidade para identificar populações bacterianas minoritárias e subespécies; e a implantação de sistemas retrospetivos de vigilância e controle de infeção hospitalar tem retardado a compreensão desses processos. Este projeto propõe uma Análise dos riscos de aquisição e transmissão de microrganismos RAM, com base na observação multidepartamental da ecologia e evolução de resistomas em uma UTI por 6 meses (estratégias de agrupamento, sistemas de alerta) e no estudo clínico de pacientes (metadados clínicos digitais e-prot Zero Resistance). O grupo resistome permitirá a seleção de diferentes «cenários de RAM de risco» que serão analisados por técnicas «ômicas» de alto desempenho geradas por este consórcio para (i) a estratificação de pacientes em resistótipos (RESCAP-SeqCapEZ) e enterótipos (kin-genomics, 16SRNA) ii) a análise dos efeitos das intervenções (metagenômica e metaproteomas resolvidos pelo genoma) e iii) a identificação de biomarcadores. As variáveis geradas alimentarão um sistema de predição computacional i. Projeto R+D+i multi (Portuguese)
17 August 2022
0 references
Antibiootikumiresistentsus (RAM) on üks 21. sajandi ülemaailmsetest terviseprobleemidest. Euroopas on RAMide 2020.–25. aasta teadusuuringute kava suunatud muutvate bakterite omandamise (hädaolukord), leviku ja püsivuse kokkusurumisele, mis võimaldab rakendada tõhusaid sekkumisstrateegiaid. Oportunistlike ADR-patogeenide omandamise ja edasikandumise risk haiglates esineb peamiselt ICUdes ning seda seostatakse individuaalsete peremeestunnuste ja kohalike väliste teguritega (antibiootikumid ja muud narkootikumide tarbimine, demograafilised tegurid,..I), mis määravad soolestiku mikrobiootikumide struktuuri ja funktsiooni individuaalsel tasandil (vastus/kolonisatsioonitundlikkus) ja kollektiivsel tasandil („kolonisatsioonisurve“). Suure tundlikkuse ja spetsiifilisuse vahendite puudumine vähemus- ja alamliikide bakteripopulatsioonide kindlakstegemiseks; ning enamasti retrospektiivsete haiglanakkuste seire- ja kontrollisüsteemide rakendamine on edasi lükanud nende protsesside mõistmist. Selles projektis tehakse ettepanek analüüsida antimikroobikumiresistentsuse mikroorganismide omandamise ja edasikandumise riske, mis põhinevad eri osakondades kuue kuu jooksul läbi viidud resistoomide ökoloogia ja arengu vaatlusel (koondamisstrateegiad, hoiatussüsteemid) ning patsientide kliinilisel uuringul (digitaalsed kliinilised metaandmed ja nullresistentsus). Rühm resistome võimaldab valida erinevaid „riskiga ADRi stsenaariume“, mida analüüsitakse selle konsortsiumi loodud suure jõudlusega „oomika“ tehnikate abil i) patsientide stratifitseerimiseks resistotüüpides (RESCAP-SeqCapEZ) ja enterotüüpides (kin-genoomika, 16SRNA), ii) sekkumiste (genoomiliselt lahendatud metagenoomika ja metaproteoomid) mõju analüüsimiseks ja iii) biomarkerite kindlakstegemiseks. Loodud muutujad toidavad arvutuslikku prognoosisüsteemi i. Projekt R+D+i multi (Estonian)
17 August 2022
0 references
Az antibiotikum-rezisztencia (RAM) egyike a 21. századi globális egészségügyi kihívásoknak. Európában a RAM 2020–25-ös kutatási programja a beszerzési folyamatok tömörítésére (vészhelyzet), a RAM-baktériumok átvitelére és tartósságára irányul, amelyek lehetővé teszik a hatékony beavatkozási stratégiák végrehajtását. A kórházakban előforduló opportunista ADR-kórokozók megszerzésének és átvitelének kockázata főként az intenzív klinikai egységekben fordul elő, és összefüggésbe hozható az egyéni gazdaszervezeti jellemzőkkel és a helyi külső tényezőkkel (antibiotikum és egyéb kábítószer-fogyasztás, demográfiai tényezők stb.), amelyek meghatározzák a bél mikrobióta struktúráját és funkcióját egyéni szinten („ellenállás/a kolonizációval szembeni érzékenység”) és kollektív szinten („kolonizációs nyomás”). A kisebbségi és alfaj szintű baktériumpopulációk azonosítására szolgáló magas érzékenységi és specificitási eszközök hiánya; és a többnyire visszamenőleges kórházi fertőzésfelügyeleti és -ellenőrzési rendszerek bevezetése késleltette e folyamatok megértését. Ez a projekt az antimikrobiális rezisztencia mikroorganizmusok megszerzésének és átvitelének kockázatainak elemzését javasolja az ellenállások ökológiájának és fejlődésének több részlegre kiterjedő megfigyelése alapján egy ICU-ban 6 hónapon keresztül (összevonási stratégiák, figyelmeztető rendszerek), valamint a betegek klinikai vizsgálatán (digitális klinikai metaadatok és biztonsági nulla rezisztencia). A csoport ellenállása lehetővé teszi a különböző „kockázati ADR-forgatókönyvek” kiválasztását, amelyeket a konzorcium által generált nagy teljesítményű „omikus” technikákkal elemeznek i. az ellenállástípusokban (RESCAP-SeqCapEZ) és enterotípusokban (bőrgenomika, 16SRNA) ii. a beavatkozások hatásainak elemzése (genome által megoldott metagenomika és metaproteomok) és iii. a biomarkerek azonosítása céljából. A generált változók számítógépes előrejelző rendszert táplálnak i. Projekt R+D+i multi (Hungarian)
17 August 2022
0 references
Антибиотичната резистентност (RAM) е едно от глобалните здравни предизвикателства на 21-ви век. В Европа програмата за научни изследвания на RAM за 2020—25 г. е насочена към компресиране на процесите на придобиване (спешност), предаване и устойчивост на RAM бактерии, които позволяват прилагането на ефективни стратегии за интервенция. Рискът от придобиване и предаване на опортюнистични патогени от НЛР в болниците се среща най-вече в ICU и е свързан с индивидуалните характеристики на гостоприемника и местните външни фактори (антибиотична и друга лекарствена консумация, демографски фактори,..I), които определят структурата и функцията на чревната микробиота на индивидуално ниво („устойчивост/чувствителност към колонизация„) и на колективно равнище („налягане на колонизация“). Липсата на инструменти с висока чувствителност и специфичност за идентифициране на малцинствени и подвидови бактериални популации; а прилагането на предимно ретроспективни болнични системи за наблюдение и контрол на инфекциите забави разбирането на тези процеси. Този проект предлага анализ на рисковете от придобиване и предаване на АМР микроорганизми въз основа на многоведомствено наблюдение на екологията и еволюцията на резтомите в интензивното отделение в продължение на 6 месеца (стратегии за обединяване, системи за предупреждение) и клинично проучване на пациенти (цифрови клинични метаданни и защита от нулева резистентност). Групата резистом ще позволи избора на различни „рискови сценарии за НЛР„, които ще бъдат анализирани чрез високопроизводителни „омика“ техники, генерирани от този консорциум за (i) стратификация на пациенти в резистотипи (RESCAP-SeqCapEZ), и ентеротипове (кожна геномика, 16SRNA) ii) анализ на ефектите от интервенциите (геном-решени метагеномия и метапротеоми), и iii) идентифициране на биомаркери. Генерираните променливи ще захранват изчислителна система за прогнозиране i. Project R+D+i multi (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
Atsparumas antibiotikams (RAM) yra vienas iš XXI amžiaus pasaulinių sveikatos problemų. Europoje RAM 2020–25 mokslinių tyrimų darbotvarke siekiama susilpninti RAM bakterijų įsigijimo procesus (skubumą), perdavimą ir patvarumą, kad būtų galima įgyvendinti veiksmingas intervencijos strategijas. Oportunistinių NRV patogenų įsigijimo ir perdavimo rizika ligoninėse dažniausiai kyla ICU ir yra susijusi su individualiomis šeimininko savybėmis ir vietiniais išoriniais veiksniais (antibiotikais ir kitais narkotikų vartojimu, demografiniais veiksniais..I), kurie lemia žarnyno mikrobiotos struktūrą ir funkciją individualiu lygmeniu („atsparumas/jautrumas kolonizacijai“) ir kolektyviniu lygmeniu („kolonizacijos slėgis“). Trūksta didelio jautrumo ir specifiškumo priemonių mažumų ir porūšių bakterijų populiacijoms nustatyti; ir dažniausiai retrospektyvinių infekcijų stebėjimo ir kontrolės sistemų įdiegimas uždelsė supratimą apie šiuos procesus. Pagal šį projektą siūloma atlikti AAM mikroorganizmų įsigijimo ir perdavimo rizikos analizę, pagrįstą daugiadepartiniu rezistorių ekologijos ir evoliucijos ICU stebėjimu 6 mėnesius (sutelkimo strategijos, įspėjimo sistemos) ir pacientų klinikiniu tyrimu (skaitmeniniai klinikiniai metaduomenys ir atsparumas nuliui). Grupė priešintis leis atrinkti įvairius „rizikos ADR scenarijus“, kurie bus analizuojami taikant šio konsorciumo sukurtus didelio našumo „omikos“ metodus, skirtus i) pacientų stratifikacijai rezistentotipuose (RESCAP-SeqCapEZ) ir enterotipams (kinų genomikai, 16SRNA) ii) intervencijų poveikio analizei (genome-išspręsta metagenomika ir metaproteoms) ir iii) biologinių žymenų nustatymui. Generuojami kintamieji maitins skaičiavimo prognozavimo sistemą i. Projekto R+D+i multi (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
Otpornost na antibiotike (RAM) jedan je od globalnih zdravstvenih izazova 21. stoljeća. U Europi je istraživački program RAM-a za razdoblje 2020. – 2025. usmjeren na kompresije procesa stjecanja (hitne situacije), prijenosa i postojanosti RAM bakterija koje omogućuju provedbu učinkovitih strategija intervencije. Rizik od pribavljanja i prijenosa oportunističkih patogena nuspojava u bolnicama javlja se uglavnom u ICU-ima i povezan je s individualnim karakteristikama domaćina i lokalnim vanjskim čimbenicima (antibiotičkom i drugom konzumacijom lijekova, demografskim čimbenicima..I) koji određuju strukturu i funkciju crijevne mikrobiote na individualnoj razini („otpornost/osjetljivost na kolonizaciju”) i na kolektivnoj razini („kolonizacijski tlak”). Nedostatak alata visoke osjetljivosti i specifičnosti za utvrđivanje populacija bakterija na razini manjina i podvrsta; a provedba uglavnom retrospektivnih sustava za nadzor i kontrolu bolničkih infekcija odgodila je razumijevanje tih procesa. Ovim se projektom predlaže analiza rizika od stjecanja i prijenosa mikroorganizama AMR-a na temelju višeodjelnog promatranja ekologije i evolucije otpornika u ICU tijekom 6 mjeseci (strategije udruživanja, sustavi upozoravanja) i klinička studija pacijenata (digitalni klinički metapodaci i nulta otpornost na zaštitu). Otpor skupine omogućit će odabir različitih „scenarija nuspojava na rizik” koji će se analizirati „omikama” visokih performansi koje generira ovaj konzorcij za i. stratifikaciju bolesnika u otpornicima (RESCAP-SeqCapEZ) i enterotipove (kin-genomika, 16SRNA) i ii. analizu učinaka intervencija (metagenomska i metaproteomska) i iii. identifikaciju biomarkera. Generirane varijable unijet će računalni sustav predviđanja i. Projekt R+D+i multi (Croatian)
17 August 2022
0 references
Antibiotikaresistens (RAM) är en av 2000-talets globala hälsoutmaningar. I Europa är forskningsagendan för RAM 2020–25 inriktad på komprimering av förvärvsprocesser (nödlägen), överföring och persistens av RAM-bakterier som gör det möjligt att genomföra effektiva interventionsstrategier. Risken för förvärv och överföring av opportunistiska ADR-patogener på sjukhus förekommer främst i ICU och är förknippad med enskilda värdens egenskaper och lokala yttre faktorer (antibiotisk och annan läkemedelskonsumtion, demografiska faktorer,..I) som bestämmer tarmmikrobiotas struktur och funktion på individuell nivå (”resistens/känslighet mot kolonisering”) och på kollektiv nivå (”kolonisationstryck”). Bristen på verktyg med hög känslighet och specificitet för att identifiera bakteriepopulationer på minoritetsnivå och underartsnivå. och införandet av främst retrospektiva system för övervakning och kontroll av sjukhusinfektioner har försenat förståelsen av dessa processer. I detta projekt föreslås en analys av riskerna med förvärv och överföring av mikroorganismer för antimikrobiell resistens, baserad på multidepartmental observation av ekologi och utveckling av resistom i en ICU under 6 månader (poolningsstrategier, varningssystem) och klinisk studie av patienter (digital klinisk metadata och nollresistens). Gruppens resistom kommer att göra det möjligt att välja olika ”riska ADR-scenarier” som kommer att analyseras med hjälp av högpresterande ”omik”-tekniker som genereras av detta konsortium för i) stratifiering av patienter i resistotyper (RESCAP-SeqCapEZ) och enterotyper (kin-genomik, 16SRNA) ii) analys av effekterna av interventionerna (genomlöst metagenomik och metaproteom) och iii) identifiering av biomarkörer. De variabler som genereras kommer att mata ett beräknings förutsägelsesystem i. Projekt R+D+i multi (Swedish)
17 August 2022
0 references
Rezistența la antibiotice (RAM) este una dintre provocările globale în materie de sănătate din secolul XXI. În Europa, agenda de cercetare 2020-25 a RAM vizează comprimarea proceselor de achiziție (urgență), transmiterea și persistența bacteriilor RAM care permit punerea în aplicare a unor strategii de intervenție eficace. Riscul de dobândire și transmitere a agenților patogeni ADR oportuniști în spitale apare în principal în UTI și este asociat cu caracteristicile gazdei individuale și cu factorii externi locali (consumul de medicamente antibiotice și alte medicamente, factorii demografici,..I) care determină structura și funcția microbiotei intestinale la nivel individual („rezistență/sensibilitate la colonizare”) și la nivel colectiv („presiune de colonizare”). Lipsa unor instrumente de înaltă sensibilitate și specificitate pentru identificarea populațiilor bacteriene minoritare și la nivel de subspecii; iar punerea în aplicare a sistemelor de supraveghere și control al infecțiilor spitalicești, în cea mai mare parte retrospectivă, a întârziat înțelegerea acestor procese. Acest proiect propune o analiză a riscurilor de achiziție și transmitere a microorganismelor RAM, bazată pe observarea multidepartamentală a ecologiei și evoluției rezistomurilor într-o UTI timp de 6 luni (strategii de punere în comun, sisteme de avertizare) și studiul clinic al pacienților (metadate clinice digitale și rezistență la zero prot). Rezistomul grupului va permite selectarea diferitelor „scenarii ADR de risc” care vor fi analizate prin tehnici „omice” de înaltă performanță generate de acest consorțiu pentru (i) stratificarea pacienților în rezistotipuri (RESCAP-SeqCapEZ) și enterotipuri (kin-genomics, 16SRNA) ii) analiza efectelor intervențiilor (metagenomica rezolvată prin genom și metaproteom) și iii) identificarea biomarkerilor. Variabilele generate vor alimenta un sistem de predicție computațională i. Proiectul R+D+i multi (Romanian)
17 August 2022
0 references
Odpornost na antibiotike (RAM) je eden od svetovnih zdravstvenih izzivov 21. stoletja. V Evropi je raziskovalni program RAM za obdobje 2020–25 namenjen stiskanju procesov pridobivanja (izrednih razmer), prenosu in obstojnosti bakterij RAM, ki omogočajo izvajanje učinkovitih intervencijskih strategij. Tveganje za pridobitev in prenos oportunističnih patogenov ADR v bolnišnicah se pojavlja predvsem v intenzivnih enotah in je povezano z značilnostmi posameznega gostitelja in lokalnimi zunanjimi dejavniki (antibiotična in druga poraba drog, demografski dejavniki,..I), ki določajo strukturo in funkcijo črevesne mikrobiote na individualni ravni („odpornost/občutljivost na kolonizacijo“) in na kolektivni ravni („kolonizacijski pritisk“). Pomanjkanje orodij za visoko občutljivost in specifičnost za opredelitev manjšinskih in podvrstnih bakterijskih populacij; izvajanje večinoma retrospektivnih bolnišničnih sistemov za spremljanje in kontrolo okužb pa je povzročilo zamudo pri razumevanju teh procesov. Ta projekt predlaga analizo tveganj za pridobivanje in prenos mikroorganizmov proti antimikrobikom, ki temelji na večoddelkovnem opazovanju ekologije in razvoja uporov v ICU za 6 mesecev (strategije združevanja, opozorilni sistemi) in klinične študije bolnikov (digitalni klinični metapodatki in-prot ničelna odpornost). Skupinska upornost bo omogočila izbiro različnih „tveganih scenarijev ARS“, ki bodo analizirani z visokozmogljivimi „omikami“, ki jih je ustvaril ta konzorcij, za (i) stratifikacijo bolnikov v uporotipih (RESCAP-SeqCapEZ) in enterotipe (genomika kože, 16SRNA), ii) analizo učinkov posegov (metagenomika, razrešena z genomom in metaproteom) in iii) opredelitev biomarkerjev. Ustvarjene spremenljivke bodo napajale računalniški sistem napovedovanja i. Projekt R+D+i multi (Slovenian)
17 August 2022
0 references
Odporność na antybiotyki (RAM) jest jednym z XXI wieku Global Health Challenges. W Europie program badań pamięci RAM na lata 2020-25 ma na celu kompresję procesów akwizycji (nagłych przypadków), transmisję i utrzymywanie się bakterii RAM, które umożliwiają wdrożenie skutecznych strategii interwencyjnych. Ryzyko nabycia i przenoszenia oportunistycznych patogenów ADR w szpitalach występuje głównie w OIOM i jest związane z indywidualnymi cechami żywiciela i lokalnymi czynnikami zewnętrznymi (spożycie antybiotyków i innych leków, czynniki demograficzne,.I), które określają strukturę i funkcję mikrobioty jelitowej na poziomie indywidualnym („oporność/wrażliwość na kolonizację”) oraz na poziomie zbiorowym („ciśnienie kolonizacyjne”). Brak narzędzi charakteryzujących się wysoką wrażliwością i specyfiką w celu identyfikacji populacji bakterii na poziomie mniejszości i podgatunków; a wdrożenie głównie retrospektywnych systemów nadzoru i kontroli zakażeń szpitalnych opóźniło zrozumienie tych procesów. W ramach tego projektu proponuje się analizę ryzyka związanego z pozyskiwaniem i przenoszeniem mikroorganizmów oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe w oparciu o wielodziałową obserwację ekologii i ewolucji rezystomy w OIOM przez 6 miesięcy (strategie łączenia, systemy ostrzegania) oraz badanie kliniczne pacjentów (cyfrowe metadane kliniczne i zerowa odporność na oporność na promieniowanie). Oporność grupy umożliwi wybór różnych „scenariuszy ADR ryzyka”, które będą analizowane za pomocą wysokowydajnych technik „omicznych” generowanych przez to konsorcjum w celu (i) stratyfikacji pacjentów w rezystotypach (RESCAP-SeqCapEZ) oraz enterotypów (genotypów skóry, 16SRNA) ii) analizy skutków interwencji (metagenomika rozwiązana genomem i metaproteomy) oraz iii) identyfikacji biomarkerów. Generowane zmienne będą zasilać system przewidywania obliczeniowego i. Projekt R+D+i multi (Polish)
17 August 2022
0 references
12 June 2023
0 references
Madrid
0 references
Identifiers
PI18_01942
0 references