miRNAs: potential biomarkers in for the diagnosis of post-surgical septic shock (biomiR). (Q3149711): Difference between revisions
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miRNA: potenziali biomarcatori per la diagnosi di shock settico post-chirurgico (biomiR). | |||||||||||||||
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In Spagna, la mortalità in caso di shock settico è inaccettabilmente alta che raggiunge il 50-60 % e non esiste ancora uno "standard d'oro" per la sua diagnosi. I biomarcatori esistenti possono aiutare la diagnosi clinica, ma in nessun caso sono raccomandati come test diagnostico definitivo. A causa delle loro caratteristiche molecolari, si postula che lo studio dei miRNA possa contribuire a risolvere definitivamente questo problema. L'obiettivo principale di questo progetto multicentrico (3 centri) è: definire un algoritmo differenziale di miRNAs microvesicolari con capacità diagnostica e prognostica di shock settico. Correla questi risultati con quelli del precedente studio di trascrizione del nostro gruppo (PI15/01451) e infine convalida gli algoritmi in una coorte indipendente. la metodologia per i primi due obiettivi analizzerà i 120 campioni (n=60 shock settico e n=60 shock non settico) inclusi nel lavoro precedente (PI15/01451). Eseguiremo l'isolamento dei microvescoli per precipitazione e ultrafiltrazione; quantificazione dei miRNA per quantificazione di massa e valutazione delle prestazioni da parte di Bioanalyzer e PCR quantitativa. L'analisi bioinformatica ci permetterà di definire l'algoritmo miRNAs rappresentativo di ogni braccio e la convalida sarà eseguita in una coorte indipendente di 108 pazienti (n=36 shock settico, n=36 shock non settico e n=36 controlli), seguendo lo stesso approccio sperimentale. I risultati ottenuti fornirebbero strumenti definitivi per una diagnosi accurata e precoce dello shock settico. Favorirebbe inoltre il coinvolgimento delle aziende biotecnologiche nel sistema sanitario nazionale in quanto vi è la possibilità di brevettare kit diagnostici, come sostenuto dal documento di interesse commerciale. (Italian) | |||||||||||||||
| Property / summary: In Spagna, la mortalità in caso di shock settico è inaccettabilmente alta che raggiunge il 50-60 % e non esiste ancora uno "standard d'oro" per la sua diagnosi. I biomarcatori esistenti possono aiutare la diagnosi clinica, ma in nessun caso sono raccomandati come test diagnostico definitivo. A causa delle loro caratteristiche molecolari, si postula che lo studio dei miRNA possa contribuire a risolvere definitivamente questo problema. L'obiettivo principale di questo progetto multicentrico (3 centri) è: definire un algoritmo differenziale di miRNAs microvesicolari con capacità diagnostica e prognostica di shock settico. Correla questi risultati con quelli del precedente studio di trascrizione del nostro gruppo (PI15/01451) e infine convalida gli algoritmi in una coorte indipendente. la metodologia per i primi due obiettivi analizzerà i 120 campioni (n=60 shock settico e n=60 shock non settico) inclusi nel lavoro precedente (PI15/01451). Eseguiremo l'isolamento dei microvescoli per precipitazione e ultrafiltrazione; quantificazione dei miRNA per quantificazione di massa e valutazione delle prestazioni da parte di Bioanalyzer e PCR quantitativa. L'analisi bioinformatica ci permetterà di definire l'algoritmo miRNAs rappresentativo di ogni braccio e la convalida sarà eseguita in una coorte indipendente di 108 pazienti (n=36 shock settico, n=36 shock non settico e n=36 controlli), seguendo lo stesso approccio sperimentale. I risultati ottenuti fornirebbero strumenti definitivi per una diagnosi accurata e precoce dello shock settico. Favorirebbe inoltre il coinvolgimento delle aziende biotecnologiche nel sistema sanitario nazionale in quanto vi è la possibilità di brevettare kit diagnostici, come sostenuto dal documento di interesse commerciale. (Italian) / rank | |||||||||||||||
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| Property / summary: In Spagna, la mortalità in caso di shock settico è inaccettabilmente alta che raggiunge il 50-60 % e non esiste ancora uno "standard d'oro" per la sua diagnosi. I biomarcatori esistenti possono aiutare la diagnosi clinica, ma in nessun caso sono raccomandati come test diagnostico definitivo. A causa delle loro caratteristiche molecolari, si postula che lo studio dei miRNA possa contribuire a risolvere definitivamente questo problema. L'obiettivo principale di questo progetto multicentrico (3 centri) è: definire un algoritmo differenziale di miRNAs microvesicolari con capacità diagnostica e prognostica di shock settico. Correla questi risultati con quelli del precedente studio di trascrizione del nostro gruppo (PI15/01451) e infine convalida gli algoritmi in una coorte indipendente. la metodologia per i primi due obiettivi analizzerà i 120 campioni (n=60 shock settico e n=60 shock non settico) inclusi nel lavoro precedente (PI15/01451). Eseguiremo l'isolamento dei microvescoli per precipitazione e ultrafiltrazione; quantificazione dei miRNA per quantificazione di massa e valutazione delle prestazioni da parte di Bioanalyzer e PCR quantitativa. L'analisi bioinformatica ci permetterà di definire l'algoritmo miRNAs rappresentativo di ogni braccio e la convalida sarà eseguita in una coorte indipendente di 108 pazienti (n=36 shock settico, n=36 shock non settico e n=36 controlli), seguendo lo stesso approccio sperimentale. I risultati ottenuti fornirebbero strumenti definitivi per una diagnosi accurata e precoce dello shock settico. Favorirebbe inoltre il coinvolgimento delle aziende biotecnologiche nel sistema sanitario nazionale in quanto vi è la possibilità di brevettare kit diagnostici, come sostenuto dal documento di interesse commerciale. (Italian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 16 January 2022
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Revision as of 12:06, 16 January 2022
Project Q3149711 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | miRNAs: potential biomarkers in for the diagnosis of post-surgical septic shock (biomiR). |
Project Q3149711 in Spain |
Statements
29,500.0 Euro
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59,000.0 Euro
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50.0 percent
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1 January 2019
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31 March 2022
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HOSPITAL CLINICO UNIVERSITARIO DE VALLADOLID
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41°39'7.67"N, 4°43'42.82"W
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47186
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En España, la mortalidad en el caso de shock séptico es inaceptablemente elevada llegando a cifras 50-60% y aún no existe un “gold standard” para su diagnóstico. Los biomarcadores existentes pueden ayudan al diagnóstico clínico, pero en ningún caso ser recomendados como un test diagnóstico definitivo. Debido a sus características moleculares, se postula que el estudio de los miRNAs puede contribuir a solventar definitivamente este problema. El objetivo principal de este proyecto multicéntrico (3 centros) es: definir un algoritmo diferencial de miRNAs microvesiculares con capacidad diagnóstica y pronóstica de shock séptico. Correlacionar estos resultados con los del estudio del transcriptoma previo de nuestro grupo (PI15/01451) y por último, validar los algoritmos en una cohorte independiente. la metodología para los dos primeros objetivos analizaremos las 120 muestras (n=60 shock séptico y n=60 shock no séptico) incluidas en el trabajo previo (PI15/01451). Realizaremos el aislamiento de las microvesículas por precipitación y ultrafiltración; cuantificación de los miRNAs por cuantificación masiva y valoración de su rendimiento por bioanalyzer y PCR cuantitativa. El análisis bioinformático nos permitirá definir el algoritmo de miRNAs representativo de cada brazo y la validación la realizaremos en una cohorte independiente de 108 pacientes (n=36 shock séptico, n=36 shock no séptico y n=36 controles), siguiendo la misma aproximación experimental. Los resultados obtenidos aportarían herramientas definitivas para realizar diagnóstico preciso y precoz del shock séptico. También favorecería la implicación de empresas biotecnológicas con el sistema nacional de salud ya que existe la posibilidad de patentar kits diagnóstico, como avala el documento de interés empresarial. (Spanish)
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In Spain, mortality in the case of septic shock is unacceptably high reaching 50-60 % and there is still no “gold standard” for its diagnosis. Existing biomarkers can help clinical diagnosis, but in no case be recommended as a definitive diagnostic test. Due to their molecular characteristics, it is postulated that the study of miRNAs can contribute to definitively solve this problem. The main objective of this multicenter project (3 centers) is: define a differential algorithm of microvesicular miRNAs with diagnostic and prognostic capacity of septic shock. Correlate these results with those of our group’s previous transcriptome study (PI15/01451) and finally validate algorithms in an independent cohort. the methodology for the first two objectives will analyse the 120 samples (n=60 septic shock and n=60 non-septic shock) included in the previous work (PI15/01451). We will perform the isolation of the microvesicles by precipitation and ultrafiltration; quantification of miRNAs by mass quantification and performance assessment by Bioanalyser and quantitative PCR. The bioinformatics analysis will allow us to define the miRNAs algorithm representative of each arm and the validation will be performed in an independent cohort of 108 patients (n=36 septic shock, n=36 non-septic shock and n=36 controls), following the same experimental approach. The results obtained would provide definitive tools for accurate and early diagnosis of septic shock. It would also favor the involvement of biotechnology companies with the national health system since there is the possibility of patenting diagnostic kits, as endorsed by the document of business interest. (English)
12 October 2021
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En Espagne, la mortalité en cas de choc septique est inacceptablement élevée, atteignant 50-60 % et il n’y a toujours pas de «norme d’or» pour son diagnostic. Les biomarqueurs existants peuvent aider au diagnostic clinique, mais en aucun cas être recommandés comme test diagnostique définitif. En raison de leurs caractéristiques moléculaires, il est postulé que l’étude des miRNAs peut contribuer à résoudre définitivement ce problème. L’objectif principal de ce projet multicentrique (3 centres) est: définir un algorithme différentiel de miRNA microvésiculaires avec la capacité diagnostique et pronostique du choc septique. Corréler ces résultats avec ceux de la précédente étude transcriptome de notre groupe (PI15/01451) et valider enfin les algorithmes dans une cohorte indépendante. la méthodologie pour les deux premiers objectifs analysera les 120 échantillons (n=60 choc septique et n=60 choc non septique) inclus dans les travaux précédents (PI15/01451). Nous effectuerons l’isolement des microvésicules par précipitation et ultrafiltration; quantification des miRNA par quantification de masse et évaluation des performances par Bioanalyse et PCR quantitative. L’analyse bioinformatique nous permettra de définir l’algorithme miRNAs représentatif de chaque bras et la validation sera effectuée dans une cohorte indépendante de 108 patients (n=36 choc septique, n=36 choc non septique et n=36 témoins), suivant la même approche expérimentale. Les résultats obtenus fourniraient des outils définitifs pour un diagnostic précis et précoce du choc septique. Elle favoriserait également la participation des entreprises de biotechnologie au système national de santé, étant donné qu’il existe la possibilité de breveter des kits de diagnostic, comme en témoigne le document présentant un intérêt commercial. (French)
2 December 2021
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In Spanien ist die Sterblichkeit bei septischen Schocks unannehmbar hoch und erreicht 50-60 % und es gibt noch keinen „Goldstandard“ für seine Diagnose. Vorhandene Biomarker können zur klinischen Diagnose beitragen, aber in keinem Fall als definitiver diagnostischer Test empfohlen werden. Aufgrund ihrer molekularen Eigenschaften wird postuliert, dass die Untersuchung von miRNAs dazu beitragen kann, dieses Problem endgültig zu lösen. Das Hauptziel dieses multizentrischen Projekts (3 Zentren) ist: definieren Sie einen Differentialalgorithmus miRNAs miRNAs mit diagnostischer und prognostischer Kapazität von septischen Schocks. Korreliert diese Ergebnisse mit denen der vorherigen Transkriptome-Studie unserer Gruppe (PI15/01451) und validiert schließlich Algorithmen in einer unabhängigen Kohorte. bei der Methodik für die ersten beiden Ziele werden die 120 Proben (n=60 septischer Schock und n=60 nicht-septischer Schock) analysiert, die in den vorangegangenen Arbeiten enthalten sind (PI15/01451). Wir werden die Isolierung der Mikroben durch Niederschlag und Ultrafiltration durchführen; Quantifizierung von miRNAs durch Massenquantifizierung und Leistungsbewertung durch Bioanalyser und quantitative PCR. Die Bioinformatik-Analyse ermöglicht es uns, den miRNAs-Algorithmus für jeden Arm zu definieren, und die Validierung wird in einer unabhängigen Kohorte von 108 Patienten (n=36 septischer Schock, n=36 nicht-septischer Schock und n=36 Kontrollen) nach demselben experimentellen Ansatz durchgeführt. Die erzielten Ergebnisse würden endgültige Instrumente für die genaue und frühzeitige Diagnose von septischen Schocks bieten. Es würde auch die Einbeziehung von Biotechnologie-Unternehmen in das nationale Gesundheitssystem begünstigen, da es die Möglichkeit gibt, Diagnose-Kits zu patentieren, wie sie durch das Dokument von geschäftlichem Interesse bestätigt werden. (German)
9 December 2021
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In Spanje is de sterfte in het geval van septische shock onaanvaardbaar hoog tot 50-60 % en is er nog steeds geen „gouden norm” voor de diagnose. Bestaande biomarkers kunnen helpen bij de klinische diagnose, maar in geen geval worden aanbevolen als definitieve diagnostische test. Vanwege hun moleculaire kenmerken, wordt gepostuleerd dat de studie van miRNAs kan bijdragen aan het definitief oplossen van dit probleem. De hoofddoelstelling van dit multicenter project (3 centra) is: definieer een differentiaalalgoritme van microvesiculaire miRNAs met diagnostische en prognostische capaciteit van septische shock. Correleer deze resultaten met die van de vorige transcriptoomstudie van onze groep (PI15/01451) en valideer uiteindelijk algoritmen in een onafhankelijk cohort. de methodologie voor de eerste twee doelstellingen analyseert de 120 monsters (n=60 septische shock en n=60 niet-septische shock) die in de vorige werkzaamheden zijn opgenomen (PI15/01451). We zullen de isolatie van de microvesicles uitvoeren door neerslag en ultrafiltratie; kwantificering van miRNA’s door massakwantificering en prestatiebeoordeling door bioanalysator en kwantitatieve PCR. De bio-informatica analyse zal ons in staat stellen om het miRNAs algoritme representatief voor elke arm te definiëren en de validatie zal worden uitgevoerd in een onafhankelijke cohort van 108 patiënten (n=36 septische shock, n=36 niet-septische shock en n=36 controles), volgens dezelfde experimentele aanpak. De verkregen resultaten zouden definitieve instrumenten bieden voor een nauwkeurige en vroegtijdige diagnose van septische shock. Het zou ook de betrokkenheid van biotechnologische bedrijven bij het nationale gezondheidsstelsel bevorderen, aangezien er de mogelijkheid bestaat om diagnostische kits te octrooieren, zoals bevestigd door het document van zakelijk belang. (Dutch)
17 December 2021
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In Spagna, la mortalità in caso di shock settico è inaccettabilmente alta che raggiunge il 50-60 % e non esiste ancora uno "standard d'oro" per la sua diagnosi. I biomarcatori esistenti possono aiutare la diagnosi clinica, ma in nessun caso sono raccomandati come test diagnostico definitivo. A causa delle loro caratteristiche molecolari, si postula che lo studio dei miRNA possa contribuire a risolvere definitivamente questo problema. L'obiettivo principale di questo progetto multicentrico (3 centri) è: definire un algoritmo differenziale di miRNAs microvesicolari con capacità diagnostica e prognostica di shock settico. Correla questi risultati con quelli del precedente studio di trascrizione del nostro gruppo (PI15/01451) e infine convalida gli algoritmi in una coorte indipendente. la metodologia per i primi due obiettivi analizzerà i 120 campioni (n=60 shock settico e n=60 shock non settico) inclusi nel lavoro precedente (PI15/01451). Eseguiremo l'isolamento dei microvescoli per precipitazione e ultrafiltrazione; quantificazione dei miRNA per quantificazione di massa e valutazione delle prestazioni da parte di Bioanalyzer e PCR quantitativa. L'analisi bioinformatica ci permetterà di definire l'algoritmo miRNAs rappresentativo di ogni braccio e la convalida sarà eseguita in una coorte indipendente di 108 pazienti (n=36 shock settico, n=36 shock non settico e n=36 controlli), seguendo lo stesso approccio sperimentale. I risultati ottenuti fornirebbero strumenti definitivi per una diagnosi accurata e precoce dello shock settico. Favorirebbe inoltre il coinvolgimento delle aziende biotecnologiche nel sistema sanitario nazionale in quanto vi è la possibilità di brevettare kit diagnostici, come sostenuto dal documento di interesse commerciale. (Italian)
16 January 2022
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Valladolid
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Identifiers
PI18_01238
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