Epigenetics and immunosuppression. Use of circulating histones and their post-translational modifications as biomarkers for diagnosis and prognosis in sepsis and septic shock. (Q3138351): Difference between revisions
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Epigenetica e immunosoppressione. Uso degli istoni circolanti e delle loro modifiche post-traduzionali come biomarcatori per la diagnosi e la prognosi in sepsi e shock settico. | |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
La sepsi ha un'incidenza in Europa di 200-300 casi ogni 100.000 abitanti/anno. Il 2 % dei pazienti ospedalizzati e il 75 % dei pazienti affetti da terapia intensiva sviluppano una sepsi, di cui il 30 % si evolve a shock settico (SS). Inoltre, molti dei sopravvissuti sviluppano un'immunosoppressione che li rende più sensibili alle nuove infezioni e porta ad un aumento della morbilità-mortalità a lungo termine. Recentemente, è stata raccomandata la ricerca di nuovi biomarcatori sensibili e specifici per la sepsi basata su modifiche epigenetiche, e soprattutto gli istoni sono stati postulati come biomarcatori in malattie con iperinfiammazione, traumi e infezioni. Pertanto, l'obiettivo di questo progetto è quello di identificare biomarcatori epigenetici e sviluppare strumenti diagnostici e prognostici per la classificazione di particolari fenotipi sepsi che consentono di prevedere gli stati di immunosoppressione. In questo progetto useremo una metodologia basata sulla spettrometria di massa per quantificare i livelli degli istoni circolanti e usarli come biomarcatori in sepsi. Inoltre, con studi ChIP-Seq e bioinformatica contribuiremo alla comprensione dei meccanismi epigenetici relativi all'immunosoppressione nei sopravvissuti di un episodio di sepsi. (Italian) | |||||||||||||||
| Property / summary: La sepsi ha un'incidenza in Europa di 200-300 casi ogni 100.000 abitanti/anno. Il 2 % dei pazienti ospedalizzati e il 75 % dei pazienti affetti da terapia intensiva sviluppano una sepsi, di cui il 30 % si evolve a shock settico (SS). Inoltre, molti dei sopravvissuti sviluppano un'immunosoppressione che li rende più sensibili alle nuove infezioni e porta ad un aumento della morbilità-mortalità a lungo termine. Recentemente, è stata raccomandata la ricerca di nuovi biomarcatori sensibili e specifici per la sepsi basata su modifiche epigenetiche, e soprattutto gli istoni sono stati postulati come biomarcatori in malattie con iperinfiammazione, traumi e infezioni. Pertanto, l'obiettivo di questo progetto è quello di identificare biomarcatori epigenetici e sviluppare strumenti diagnostici e prognostici per la classificazione di particolari fenotipi sepsi che consentono di prevedere gli stati di immunosoppressione. In questo progetto useremo una metodologia basata sulla spettrometria di massa per quantificare i livelli degli istoni circolanti e usarli come biomarcatori in sepsi. Inoltre, con studi ChIP-Seq e bioinformatica contribuiremo alla comprensione dei meccanismi epigenetici relativi all'immunosoppressione nei sopravvissuti di un episodio di sepsi. (Italian) / rank | |||||||||||||||
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| Property / summary: La sepsi ha un'incidenza in Europa di 200-300 casi ogni 100.000 abitanti/anno. Il 2 % dei pazienti ospedalizzati e il 75 % dei pazienti affetti da terapia intensiva sviluppano una sepsi, di cui il 30 % si evolve a shock settico (SS). Inoltre, molti dei sopravvissuti sviluppano un'immunosoppressione che li rende più sensibili alle nuove infezioni e porta ad un aumento della morbilità-mortalità a lungo termine. Recentemente, è stata raccomandata la ricerca di nuovi biomarcatori sensibili e specifici per la sepsi basata su modifiche epigenetiche, e soprattutto gli istoni sono stati postulati come biomarcatori in malattie con iperinfiammazione, traumi e infezioni. Pertanto, l'obiettivo di questo progetto è quello di identificare biomarcatori epigenetici e sviluppare strumenti diagnostici e prognostici per la classificazione di particolari fenotipi sepsi che consentono di prevedere gli stati di immunosoppressione. In questo progetto useremo una metodologia basata sulla spettrometria di massa per quantificare i livelli degli istoni circolanti e usarli come biomarcatori in sepsi. Inoltre, con studi ChIP-Seq e bioinformatica contribuiremo alla comprensione dei meccanismi epigenetici relativi all'immunosoppressione nei sopravvissuti di un episodio di sepsi. (Italian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 16 January 2022
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Revision as of 10:48, 16 January 2022
Project Q3138351 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Epigenetics and immunosuppression. Use of circulating histones and their post-translational modifications as biomarkers for diagnosis and prognosis in sepsis and septic shock. |
Project Q3138351 in Spain |
Statements
36,250.0 Euro
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72,500.0 Euro
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50.0 percent
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1 January 2017
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31 March 2020
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CENTRO DE INVESTIGACION BIOMEDICA EN RED (CIBER)
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39°28'10.96"N, 0°22'34.82"W
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46250
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La sepsis tiene una incidencia en Europa de 200-300 casos por cada 100.000 habitantes/año. Un 2% de los pacientes hospitalizados y el 75% de los pacientes de UCI desarrollan una sepsis, de los que un 30% evolucionan a shock séptico (SS). Además, muchos de los supervivientes desarrollán una inmunosupresión que los hace más sensibles a nuevas infecciones y que produce un incremento de la morbi-mortalidad a largo término. Recientemente, se ha recomendado la búsqueda de nuevos biomarcadores sensibles y específicos para la sepsis basados en modificaciones epigenéticas. y en especial las histonas se han postulado como biomarcadores en enfermedades que cursan con hiperinflamación, trauma e infecciones. Por ello el objetivo de este proyecto es Identificar biomarcadores epigenéticos y desarrollar herramientas de diagnóstico y pronóstico para la clasificación de los fenotipos particulares de la sepsis que permitan predecir los estados de inmunosupresión. En este proyecto usaremos metodología basada en la espectrometría de masas para cuantificar los niveles de histonas circulantes y usarlas como biomarcadores en sepsis. Además, con estudios de ChIP-Seq y el análisis bioinformático contribuiremos a la comprensión de los mecanismos epigenéticos relacionados con la inmunosupresión en los supervivientes de un episodio de sepsis. (Spanish)
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Sepsis has an incidence in Europe of 200-300 cases per 100,000 inhabitants/year. 2 % of hospitalised patients and 75 % of ICU patients develop a sepsis, of which 30 % evolve to septic shock (SS). In addition, many of the survivors develop an immunosuppression that makes them more sensitive to new infections and leads to an increase in long-term morbidity-mortality. Recently, it has been recommended the search for new sensitive and specific biomarkers for sepsis based on epigenetic modifications, and especially histones have been postulated as biomarkers in diseases with hyperinflammation, trauma and infections. Therefore, the objective of this project is to identify epigenetic biomarkers and to develop diagnostic and prognostic tools for the classification of particular sepsis phenotypes that allow predicting the immunosuppression states. In this project we will use methodology based on mass spectrometry to quantify the levels of circulating histones and use them as biomarkers in sepsis. In addition, with ChIP-Seq studies and bioinformatics we will contribute to the understanding of epigenetic mechanisms related to immunosuppression in survivors of a sepsis episode. (English)
12 October 2021
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L’incidence de la septicémie en Europe est de 200 à 300 cas pour 100 000 habitants/an. 2 % des patients hospitalisés et 75 % des patients en soins intensifs développent une septicémie, dont 30 % évoluent vers un choc septique (SS). De plus, bon nombre des survivants développent une immunosuppression qui les rend plus sensibles aux nouvelles infections et entraîne une augmentation de la morbidité et de la mortalité à long terme. Récemment, il a été recommandé de rechercher de nouveaux biomarqueurs sensibles et spécifiques pour la septicémie basés sur des modifications épigénétiques, et en particulier les histones ont été postulés comme biomarqueurs dans les maladies présentant une hyperinflammation, des traumatismes et des infections. Par conséquent, l’objectif de ce projet est d’identifier les biomarqueurs épigénétiques et de développer des outils diagnostiques et pronostiques pour la classification de phénotypes particuliers de sepsis qui permettent de prédire les états d’immunosuppression. Dans ce projet, nous utiliserons une méthodologie basée sur la spectrométrie de masse pour quantifier les niveaux d’histones circulant et les utiliser comme biomarqueurs dans la septicémie. En outre, avec les études ChIP-Seq et la bioinformatique, nous contribuerons à la compréhension des mécanismes épigénétiques liés à l’immunosuppression chez les survivants d’un épisode de septicémie. (French)
2 December 2021
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Sepsis hat eine Inzidenz von 200-300 Fällen pro 100.000 Einwohner/Jahr in Europa. 2 % der stationären Patienten und 75 % der ICU-Patienten entwickeln eine Sepsis, von denen sich 30 % zu septischen Schocks (SS) entwickeln. Darüber hinaus entwickeln viele Überlebende eine Immunsuppression, die sie empfindlicher auf neue Infektionen macht und zu einer Zunahme der Langzeitsterblichkeit führt. Vor kurzem wurde die Suche nach neuen sensiblen und spezifischen Biomarkern für Sepsis empfohlen, die auf epigenetischen Veränderungen basieren, und insbesondere Histone wurden als Biomarker bei Erkrankungen mit Hyperinflammation, Trauma und Infektionen postuliert. Ziel dieses Projekts ist es daher, epigenetische Biomarker zu identifizieren und diagnostische und prognostische Werkzeuge für die Klassifizierung bestimmter Sepsis-Phänotypen zu entwickeln, die eine Vorhersage der Immunsuppressionszustände ermöglichen. In diesem Projekt werden wir eine auf Massenspektrometrie basierende Methodik verwenden, um die Konzentrationen zirkulierender Histone zu quantifizieren und als Biomarker in Sepsis zu verwenden. Darüber hinaus werden wir mit ChIP-Seq-Studien und Bioinformatik zum Verständnis epigenetischer Mechanismen im Zusammenhang mit Immunsuppression bei Überlebenden einer Sepsis-Episode beitragen. (German)
9 December 2021
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Sepsis heeft een incidentie in Europa van 200-300 gevallen per 100.000 inwoners/jaar. 2 % van de in het ziekenhuis opgenomen patiënten en 75 % van de ICU-patiënten ontwikkelen een sepsis, waarvan 30 % zich ontwikkelt tot septische shock (SS). Bovendien ontwikkelen veel van de overlevenden een immunosuppressie die hen gevoeliger maakt voor nieuwe infecties en leidt tot een toename van de morbiditeit-mortaliteit op lange termijn. Onlangs is het aanbevolen de zoektocht naar nieuwe gevoelige en specifieke biomarkers voor sepsis op basis van epigenetische modificaties, en vooral histonen zijn gepostuleerd als biomarkers bij ziekten met hyperinflammatie, trauma en infecties. Daarom is het doel van dit project om epigenetische biomarkers te identificeren en diagnostische en prognostische hulpmiddelen te ontwikkelen voor de classificatie van specifieke sepsisfenotypen die het mogelijk maken de immunosuppressietoestanden te voorspellen. In dit project zullen we methodologie op basis van massaspectrometrie gebruiken om de niveaus van circulerende histonen te kwantificeren en ze te gebruiken als biomarkers in sepsis. Daarnaast zullen we met ChIP-Seq studies en bio-informatica bijdragen aan het begrip van epigenetische mechanismen gerelateerd aan immunosuppressie bij overlevenden van een sepsis episode. (Dutch)
17 December 2021
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La sepsi ha un'incidenza in Europa di 200-300 casi ogni 100.000 abitanti/anno. Il 2 % dei pazienti ospedalizzati e il 75 % dei pazienti affetti da terapia intensiva sviluppano una sepsi, di cui il 30 % si evolve a shock settico (SS). Inoltre, molti dei sopravvissuti sviluppano un'immunosoppressione che li rende più sensibili alle nuove infezioni e porta ad un aumento della morbilità-mortalità a lungo termine. Recentemente, è stata raccomandata la ricerca di nuovi biomarcatori sensibili e specifici per la sepsi basata su modifiche epigenetiche, e soprattutto gli istoni sono stati postulati come biomarcatori in malattie con iperinfiammazione, traumi e infezioni. Pertanto, l'obiettivo di questo progetto è quello di identificare biomarcatori epigenetici e sviluppare strumenti diagnostici e prognostici per la classificazione di particolari fenotipi sepsi che consentono di prevedere gli stati di immunosoppressione. In questo progetto useremo una metodologia basata sulla spettrometria di massa per quantificare i livelli degli istoni circolanti e usarli come biomarcatori in sepsi. Inoltre, con studi ChIP-Seq e bioinformatica contribuiremo alla comprensione dei meccanismi epigenetici relativi all'immunosoppressione nei sopravvissuti di un episodio di sepsi. (Italian)
16 January 2022
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Valencia
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Identifiers
PI16_01036
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