GENOMICS AND EVOLUTION OF HOST SPECIFICITY IN PSEUDOMONAS SAVASTANOI: THE RACE LEVEL (Q3208129): Difference between revisions

From EU Knowledge Graph
Jump to navigation Jump to search
(‎Changed an Item)
(‎Changed label, description and/or aliases in pt)
 
(2 intermediate revisions by the same user not shown)
label / ptlabel / pt
GENÓMICA E EVOLUÇÃO DA ESPECIFICIDADE DO HOSPEDEIRO EM PSEUDOMONAS SAVASTANOI: O NÍVEL DA CORRIDA
GENOMÍCIA E EVOLUÇÃO DA ESPECIFICIDADE DE ACOLHIMENTO EM PSEUDOMONAS SAVASTANOI: O NÍVEL DE RAÇA
Property / summary: BACTERIAL DISEASES OF PLANTS CAUSE SIGNIFICANT ECONOMIC LOSSES; THEIR CONTROL IS DIFFICULT, AND IS EXPECTED TO BE MORE DIFFICULT IN THE FUTURE DUE TO EU RESTRICTIONS ON THE AUTHORISATION OF ACTIVE SUBSTANCES AVAILABLE FOR INTEGRATED CONTROL. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PRODUCES AIR TUMORS IN THE HOST, CAUSING ONE OF THE MOST IMPORTANT OLIVE DISEASES, ALTHOUGH IT IS ALSO PATHOGENOUS IN A LARGE NUMBER OF PLANT SPECIES. IN ADDITION, PSV HAS RECENTLY BEEN REVEALED AS AN EMERGING PATHOGEN IN THE ORNAMENTAL SPECIES MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) IS A PATHOGEN OF ECONOMIC IMPORTANCE IN JUDIA AND ONE OF THE MOST RELEVANT RESEARCH MODELS IN PHYTOBACTERIOLOGY. ONE OF THE MOST DESIRABLE PPH CONTROL STRATEGIES IS THE USE OF RESISTANT JEWISH VARIETIES. PPH ISOLATES ARE CLASSIFIED INTO 9 BREEDS ACCORDING TO THEIR INTERACTIONS WITH 8 DIFFERENT JEWISH VARIETIES, WHICH HAVE BEEN EXPLAINED BY THE INTERACTION OF 5 PAIRS IN GENE-TO-GEN RELATIONSHIP, ALTHOUGH IT IS POSSIBLE TO MAKE A GREATER DIFFERENTIATION IN UP TO 14 BREEDS. BOTH PATHOSYSTEMS OFFER AN UNPRECEDENTED OPPORTUNITY TO STUDY THE MOLECULAR BASES OF GUEST SPECIFICITY. ON THE ONE HAND, ALTHOUGH PPH IS A GENETICALLY HOMOGENOUS PATOVAR, THE DIFFERENT ISOLATES SHOW DIFFERENCES IN THEIR VIRULENCE, AN ASPECT THAT REFLECTS THEIR RACE SPECIFICITY. ON THE OTHER HAND, THE DIFFERENT PATOVARES OF P. SAVASTANOI INDUCE SIMILAR SYMPTOMS (TUMORS) IN BOTH WOODY AND HERBACEOUS HOSTS. THE AVAILABILITY OF THE CLOSED GENOMES OF THE PPH 1448A AND PSV NCPPB 3335 STRAINS, AS WELL AS THE GENETIC AND FUNCTIONAL TOOLS DEVELOPED DURING THE EXECUTION OF OUR PREVIOUS PROJECTS, MAKE THESE BACTERIA IDEAL MODELS FOR THE ANALYSIS OF GUEST SPECIFICITY AND THE EVOLUTION OF VIRULENCE. THUS, THE COMPARATIVE AND FUNCTIONAL GENOMIC ANALYSIS OF PHYLOGENETICALLY RELATED BACTERIAL STRAINS WILL FACILITATE THE IDENTIFICATION OF PATHOGENICITY DETERMINANTS AT THE PATOVAR AND BREED LEVEL. THE MAIN OBJECTIVES OF THIS PROJECT ARE: 1) FUNCTIONALLY IDENTIFY AND CHARACTERISE DIFFERENCES IN THE SET OF VIRULENCE GENES OF PSV PATHOVARS AND PPH BREEDS RELATED TO HOST SPECIFICITY; AND 2) APPLY THE INFORMATION OBTAINED BY COMPARATIVE AND FUNCTIONAL GENOMIC FOR THE DEVELOPMENT OF DIAGNOSTIC TOOLS FOR THE PPH BREEDS AND THE EMERGING ISOLATED PSV IN MANDEVILLA. THE SPECIFIC OBJECTIVES ARE: 1) ASSIGN A PATOVAR TO P. SAVASTANOI STRAINS ISOLATED FROM M. SANDERI. 2) SEQUENCE AND RECORD GENOMES OF REPRESENTATIVE STRAINS OF PATOVARS AND BREEDS OF P. SAVASTANOI. 3) PERFORM A COMPARATIVE GENOMIC ANALYSIS AND A PHYLOGENETIC ANALYSIS OF PSV PATHOVARS AND PPH BREEDS. 4) STUDY THE BIOLOGY AND ROLE IN THE SPECIFICITY OF HOST OF THE PLASMAIDS OF THESE BACTERIAL STRAINS. 5) TO DEEPEN THE ROLE IN THE GUEST SPECIFICITY OF THE SECRETION SYSTEMS, OF THE EFFECTORS OF THE TYPE III SECRETION SYSTEM AND, 6) OF OTHER VIRULENCE FACTORS. 7) TO STUDY THE ROLE OF GENIC EXPRESSION IN THE SPECIFICITY OF GUESTS. 8) DEVELOP SPECIFIC DIAGNOSTIC TOOLS FOR MANDEVILLA ISOLATES AND PPH BREEDS. (English) / qualifier
 
readability score: 0.8177157781343469
Amount0.8177157781343469
Unit1
Property / summaryProperty / summary
AS DOENÇAS BACTERIANAS DAS PLANTAS CAUSAM PERDAS ECONÓMICAS SIGNIFICATIVAS; O SEU CONTROLO É DIFÍCIL E DEVERÁ SER MAIS DIFÍCIL NO FUTURO DEVIDO ÀS RESTRIÇÕES DA UE À AUTORIZAÇÃO DE SUBSTÂNCIAS ATIVAS DISPONÍVEIS PARA CONTROLO INTEGRADO. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PRODUZ TUMORES DE AR NO HOSPEDEIRO, CAUSANDO UMA DAS MAIS IMPORTANTES DOENÇAS OLEÍCOLAS, EMBORA TAMBÉM SEJA PATOGÊNICO EM UM GRANDE NÚMERO DE ESPÉCIES DE PLANTAS. ALÉM DISSO, O PSV FOI RECENTEMENTE REVELADO COMO UM PATÓGENO EMERGENTE NA ESPÉCIE ORNAMENTAL MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. O PHASEOLICOLA (PPH) É UM PATÓGENO DE IMPORTÂNCIA ECONÔMICA NA JUDIA E UM DOS MODELOS DE PESQUISA MAIS RELEVANTES EM FITOBACTERIOLOGIA. UMA DAS ESTRATÉGIAS DE CONTROLE DE PPH MAIS DESEJÁVEIS É O USO DE VARIEDADES JUDAICAS RESISTENTES. ISOLADOS DE PPH SÃO CLASSIFICADOS EM 9 RAÇAS DE ACORDO COM SUAS INTERAÇÕES COM 8 VARIEDADES JUDAICAS DIFERENTES, QUE FORAM EXPLICADAS PELA INTERAÇÃO DE 5 PARES NA RELAÇÃO GENE-GÊNERO, EMBORA SEJA POSSÍVEL FAZER UMA MAIOR DIFERENCIAÇÃO EM ATÉ 14 RAÇAS. AMBOS OS PATOSSISTEMAS OFERECEM UMA OPORTUNIDADE SEM PRECEDENTES PARA ESTUDAR AS BASES MOLECULARES DA ESPECIFICIDADE DOS HÓSPEDES. POR UM LADO, EMBORA A HPP SEJA UM PATOVAR GENETICAMENTE HOMOGÊNEO, OS DIFERENTES ISOLADOS MOSTRAM DIFERENÇAS EM SUA VIRULÊNCIA, ASPETO QUE REFLETE SUA ESPECIFICIDADE RACIAL. POR OUTRO LADO, OS DIFERENTES PATOVARES DE P. SAVASTANOI INDUZEM SINTOMAS SEMELHANTES (TUMORES) EM HOSPEDEIROS LENHOSOS E HERBÁCEOS. A DISPONIBILIDADE DOS GENOMAS FECHADOS DAS CEPAS PPH 1448A E PSV NCPPB 3335, BEM COMO AS FERRAMENTAS GENÉTICAS E FUNCIONAIS DESENVOLVIDAS DURANTE A EXECUÇÃO DE NOSSOS PROJETOS ANTERIORES, TORNAM ESSAS BACTÉRIAS MODELOS IDEAIS PARA A ANÁLISE DA ESPECIFICIDADE DO HÓSPEDE E A EVOLUÇÃO DA VIRULÊNCIA. ASSIM, A ANÁLISE GENÔMICA COMPARATIVA E FUNCIONAL DE CEPAS BACTERIANAS RELACIONADAS FILOGENÉTICA FACILITARÁ A IDENTIFICAÇÃO DE DETERMINANTES DE PATOGENICIDADE NO NÍVEL PATOVAR E RAÇA. OS PRINCIPAIS OBJETIVOS DESTE PROJETO SÃO OS SEGUINTES: 1) IDENTIFICAR E CARACTERIZAR FUNCIONALMENTE DIFERENÇAS NO CONJUNTO DE GENES DE VIRULÊNCIA DE PATOVARES DO PSV E RAÇAS PPH RELACIONADAS À ESPECIFICIDADE DO HOSPEDEIRO; E 2) APLICAR AS INFORMAÇÕES OBTIDAS POR GENÔMICO COMPARATIVO E FUNCIONAL PARA O DESENVOLVIMENTO DE FERRAMENTAS DE DIAGNÓSTICO PARA AS RAÇAS PPH E O PSV ISOLADO EMERGENTE EM MANDEVILLA. OS OBJETIVOS ESPECÍFICOS SÃO OS SEGUINTES: 1) ATRIBUIR UM PATOVAR ÀS CEPAS DE P. SAVASTANOI ISOLADAS DE M. SANDERI. 2) SEQUÊNCIA E REGISTO GENOMAS DE ESTIRPES REPRESENTATIVAS DE PATOVARS E RAÇAS DE P. SAVASTANOI. 3) REALIZAR UMA ANÁLISE GENÔMICA COMPARATIVA E UMA ANÁLISE FILOGENÉTICA DE PATOVARES PSV E RAÇAS PPH. 4) ESTUDAR A BIOLOGIA E O PAPEL NA ESPECIFICIDADE DO HOSPEDEIRO DO PLASMAIDS DESSAS CEPAS BACTERIANAS. 5) APROFUNDAR O PAPEL NA ESPECIFICIDADE DO HÓSPEDE DOS SISTEMAS DE SECREÇÃO, DOS EFETORES DO SISTEMA DE SECREÇÃO TIPO III E, 6) DE OUTROS FATORES DE VIRULÊNCIA. 7) ESTUDAR O PAPEL DA EXPRESSÃO GÊNICA NA ESPECIFICIDADE DOS HÓSPEDES. 8) DESENVOLVER FERRAMENTAS DIAGNÓSTICAS ESPECÍFICAS PARA ISOLADOS DE MANDEVILLA E RAÇAS PPH. (Portuguese)
DOENÇAS BACTERIAIS DAS PLANTAS CAUSAM PERDAS ECONÓMICAS SIGNIFICATIVAS; O seu controlo é difícil e espera-se que seja mais difícil no futuro devido às restrições da UE em matéria de autorização de substâncias ativas disponíveis para controlo integrado. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) produz tumores de ar no hospedeiro, causando uma das doenças oleosas mais importantes, embora também seja patogéneo em um grande número de espécies vegetais. Além disso, o PSV foi recentemente REVELADO COMO PATOGÉNIO EMERGENTE NA ESPÉCIE ORNAMENTAL MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) É UM PATOGÉNIO DE IMPORTÂNCIA ECONÓMICA NA JUDIA E UM DOS MODELOS DE INVESTIGAÇÃO MAIS RELEVANTES EM FITOBACTERIOLOGIA. Uma das estratégias de controlo de PPH mais desejáveis é a utilização de variedades judaicas resistentes. Os isolatos de fósforo são classificados em nove raças de acordo com as suas interacções com oito variedades judaicas diferentes, que foram explicadas pela interacção de cinco pares na relação genealógico-género, embora seja possível fazer uma maior diferença em 14 raças. Ambos os sistemas oferecem uma oportunidade não prevista para estudar as bases moleculares da especificidade desejada. Por um lado, embora o PPH seja um patovar geneticamente homogéneo, os diferentes isolatos apresentam diferenças na sua gravidade, um aspecto que reflecte a sua especificidade racial. Por outro lado, os diferentes patóvaros de P. SAVASTANOI induzem sintomas semelhantes (TUMORS) tanto em tecidos como em HERBACEOUS HOSTS. A disponibilidade dos genomas fechados das estirpes PPH 1448A e PSV NCPPB 3335, bem como as ferramentas genéticas e funcionais desenvolvidas durante a execução dos nossos projectos anteriores, tornam estas bactérias modelos ideais para a análise da especificidade do produto e a evolução da violência. A ANÁLISE GENÓMICA COMPARATIVA E FUNCIONAL DAS ESTRADAS BACTERIAIS FILOGENETICAMENTE RELACIONADAS FACILITARÁ A IDENTIFICAÇÃO DOS DETERMINANTES DE PATHOGENICIDADE A NÍVEL DO PATOVAR E DA CRIANÇA. OS PRINCIPAIS OBJECTIVOS DO PRESENTE PROJECTO SÃO: 1) IDENTIFICAR FUNCIONALMENTE E CARACTERIZAR AS DIFERENÇAS NO CONJUNTO DE GENES DE VIRULÊNCIA DOS PATHOVARS DO PSV E DOS PPH RELACIONADOS COM A ESPECIFICIDADE DO Acolhimento; E 2) APLICAR AS INFORMAÇÕES OBTIDAS PELA GENÓMICA COMPARATIVA E FUNCIONAL PARA O DESENVOLVIMENTO DE FERRAMENTAS DIAGNÓSTICAS PARA AS RAÇAS PPH E O PSV ISOLADO EM EMERGÊNCIA EM MANDEVILLA. OBJECTIVOS ESPECÍFICOS: 1) ATRIBUIR UM PATOVAR ÀS ESTRADAS DE P. SAVASTANOI ISOLADAS DE M. SANDERI. 2) GENÓMEOS DE SEQUÊNCIA E DE REGISTO DE ESTRADAS REPRESENTANTES DE PATOVARES E RAÇAS DE P. SAVASTANOI. 3) Efectuar uma análise genómica comparativa e uma análise filogenética de PATHOVARS PSV e PPH BREEDS. 4) Estudar a biologia e o papel na especificidade do hospedeiro dos plasmas destas estirpes bacterianas. 5) Aprofundar o papel na especificidade desejada dos sistemas de segurança, dos agentes do sistema de segurança do tipo III e, 6) de outros factores de violência. 7) Estudar o papel da expressão genética na especificidade dos convidados. 8) DESENVOLVER FERRAMENTAS DE DIAGNÓSTICO ESPECÍFICAS PARA ISOLATOS DE MANDEVILLA E PPH BREEDS. (Portuguese)

Latest revision as of 11:30, 8 October 2024

Project Q3208129 in Spain
Language Label Description Also known as
English
GENOMICS AND EVOLUTION OF HOST SPECIFICITY IN PSEUDOMONAS SAVASTANOI: THE RACE LEVEL
Project Q3208129 in Spain

    Statements

    country
    Spain
    0 references
    EU contribution
    125,180.55 Euro
    0 references
    budget
    229,900.0 Euro
    0 references
    co-financing rate
    54.45 percent
    0 references
    start time
    1 January 2015
    0 references
    end time
    30 September 2018
    0 references
    beneficiary name (string)
    UNIVERSIDAD PUBLICA DE NAVARRA
    0 references
    coordinate location

    42°48'16.74"N, 1°38'8.99"W
    inferred from
    postal code
    0 references
    postal code
    31006
    0 references
    summary
    LAS ENFERMEDADES BACTERIANAS DE LAS PLANTAS CAUSAN IMPORTANTES PERDIDAS ECONOMICAS; SU CONTROL ES DIFICIL, Y SE ESPERA QUE LO SEA MAS EN EL FUTURO DEBIDO A LAS RESTRICCIONES DE LA UE PARA LA AUTORIZACION DE MATERIAS ACTIVAS DISPONIBLES PARA CONTROL INTEGRADO. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PRODUCE TUMORES AEREOS EN EL HUESPED, PROVOCANDO UNA DE LAS ENFERMEDADES MAS IMPORTANTES DE OLIVO, AUNQUE TAMBIEN ES PATOGENO EN UN GRAN NUMERO DE ESPECIES DE PLANTAS. ADEMAS, PSV SE HA REVELADO RECIENTEMENTE COMO UN PATOGENO EMERGENTE EN LA ESPECIE ORNAMENTAL MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) ES UN PATOGENO DE IMPORTANCIA ECONOMICA EN JUDIA Y UNO DE LOS MODELOS DE INVESTIGACION MAS RELEVANTES EN FITOBACTERIOLOGIA. UNA DE LAS ESTRATEGIAS DE CONTROL DE PPH MAS DESEABLES ES EL USO DE VARIEDADES DE JUDIA RESISTENTES. LOS AISLADOS DE PPH SE CLASIFICAN EN 9 RAZAS EN FUNCION A SUS INTERACCIONES CON 8 VARIEDADES DIFERENTES DE JUDIA, QUE SE HAN EXPLICADO POR LA INTERACCION DE 5 PARES EN RELACION GEN A GEN, AUNQUE ES POSIBLE REALIZAR UNA MAYOR DIFERENCIACION EN HASTA 14 RAZAS. AMBOS PATOSISTEMAS OFRECEN UNA OPORTUNIDAD SIN PRECEDENTES PARA ESTUDIAR LAS BASES MOLECULARES DE LA ESPECIFICIDAD DE HUESPED. POR UN LADO, AUNQUE PPH ES UN PATOVAR GENETICAMENTE HOMOGENEO, LOS DIFERENTES AISLADOS MUESTRAN DIFERENCIAS EN SU VIRULENCIA, ASPECTO QUE REFLEJA LA ESPECIFICIDAD DE RAZA DE LOS MISMOS. DE OTRO LADO, LOS DIFERENTES PATOVARES DE P. SAVASTANOI INDUCEN SINTOMAS SIMILARES (TUMORES) TANTO EN HUESPEDES LEÑOSOS COMO HERBACEOS. LA DISPONIBILIDAD DE LOS GENOMAS CERRADOS DE LAS CEPAS MODELO PPH 1448A Y PSV NCPPB 3335, ASI COMO LAS HERRAMIENTAS GENETICAS Y FUNCIONALES DESARROLLADAS DURANTE LA EJECUCION DE NUESTROS PROYECTOS ANTERIORES, CONVIERTEN A ESTAS BACTERIAS EN MODELOS IDEALES PARA EL ANALISIS DE LA ESPECIFICIDAD DE HUESPED Y LA EVOLUCION DE LA VIRULENCIA. ASI, EL ANALISIS GENOMICO COMPARATIVO Y FUNCIONAL DE CEPAS BACTERIANAS FILOGENETICAMENTE RELACIONADAS FACILITARA LA IDENTIFICACION DE DETERMINANTES DE PATOGENICIDAD A NIVEL DE PATOVAR Y DE RAZA. LOS OBJETIVOS PRINCIPALES DE ESTE PROYECTO SON: 1) IDENTIFICAR Y CARACTERIZAR FUNCIONALMENTE DIFERENCIAS EN EL CONJUNTO DE GENES DE VIRULENCIA DE LOS PATOVARES DE PSV Y LAS RAZAS DE PPH RELACIONADAS CON LA ESPECIFICIDAD DE HUESPED; Y 2) APLICAR LA INFORMACION OBTENIDA MEDIANTE GENOMICA COMPARATIVA Y FUNCIONAL PARA EL DESARROLLO DE HERRAMIENTAS DE DIAGNOSTICO DE LAS RAZAS DE PPH Y DEL AISLADO EMERGENTE DE PSV EN MANDEVILLA. LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS SON: 1) ASIGNAR UN PATOVAR A LAS CEPAS DE P. SAVASTANOI AISLADAS DE M. SANDERI. 2) SECUENCIAR Y ANOTAR LOS GENOMAS DE CEPAS REPRESENTATIVAS DE LOS PATOVARES Y LAS RAZAS DE P. SAVASTANOI. 3) REALIZAR UN ANALISIS GENOMICO COMPARATIVO Y UN ANALISIS FILOGENETICO DE LOS PATOVARES DE PSV Y DE LAS RAZAS DE PPH. 4) ESTUDIAR LA BIOLOGIA Y PAPEL EN LA ESPECIFICIDAD DE HUESPED DE LOS PLASMIDOS DE ESTAS CEPAS BACTERIANAS. 5) PROFUNDIZAR EN EL PAPEL EN LA ESPECIFICIDAD DE HUESPED DE LOS SISTEMAS DE SECRECION, DE LOS EFECTORES DEL SISTEMA DE SECRECION TIPO III Y, 6) DE OTROS FACTORES DE VIRULENCIA. 7) ESTUDIAR EL PAPEL DE LA EXPRESION GENICA EN LA ESPECIFICIDAD DE HUESPED. 8) DESARROLLAR HERRAMIENTAS DE DIAGNOSTICO ESPECIFICAS PARA LOS AISLADOS DE MANDEVILLA Y PARA LAS RAZAS DE PPH. (Spanish)
    0 references
    BACTERIAL DISEASES OF PLANTS CAUSE SIGNIFICANT ECONOMIC LOSSES; THEIR CONTROL IS DIFFICULT, AND IS EXPECTED TO BE MORE DIFFICULT IN THE FUTURE DUE TO EU RESTRICTIONS ON THE AUTHORISATION OF ACTIVE SUBSTANCES AVAILABLE FOR INTEGRATED CONTROL. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PRODUCES AIR TUMORS IN THE HOST, CAUSING ONE OF THE MOST IMPORTANT OLIVE DISEASES, ALTHOUGH IT IS ALSO PATHOGENOUS IN A LARGE NUMBER OF PLANT SPECIES. IN ADDITION, PSV HAS RECENTLY BEEN REVEALED AS AN EMERGING PATHOGEN IN THE ORNAMENTAL SPECIES MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) IS A PATHOGEN OF ECONOMIC IMPORTANCE IN JUDIA AND ONE OF THE MOST RELEVANT RESEARCH MODELS IN PHYTOBACTERIOLOGY. ONE OF THE MOST DESIRABLE PPH CONTROL STRATEGIES IS THE USE OF RESISTANT JEWISH VARIETIES. PPH ISOLATES ARE CLASSIFIED INTO 9 BREEDS ACCORDING TO THEIR INTERACTIONS WITH 8 DIFFERENT JEWISH VARIETIES, WHICH HAVE BEEN EXPLAINED BY THE INTERACTION OF 5 PAIRS IN GENE-TO-GEN RELATIONSHIP, ALTHOUGH IT IS POSSIBLE TO MAKE A GREATER DIFFERENTIATION IN UP TO 14 BREEDS. BOTH PATHOSYSTEMS OFFER AN UNPRECEDENTED OPPORTUNITY TO STUDY THE MOLECULAR BASES OF GUEST SPECIFICITY. ON THE ONE HAND, ALTHOUGH PPH IS A GENETICALLY HOMOGENOUS PATOVAR, THE DIFFERENT ISOLATES SHOW DIFFERENCES IN THEIR VIRULENCE, AN ASPECT THAT REFLECTS THEIR RACE SPECIFICITY. ON THE OTHER HAND, THE DIFFERENT PATOVARES OF P. SAVASTANOI INDUCE SIMILAR SYMPTOMS (TUMORS) IN BOTH WOODY AND HERBACEOUS HOSTS. THE AVAILABILITY OF THE CLOSED GENOMES OF THE PPH 1448A AND PSV NCPPB 3335 STRAINS, AS WELL AS THE GENETIC AND FUNCTIONAL TOOLS DEVELOPED DURING THE EXECUTION OF OUR PREVIOUS PROJECTS, MAKE THESE BACTERIA IDEAL MODELS FOR THE ANALYSIS OF GUEST SPECIFICITY AND THE EVOLUTION OF VIRULENCE. THUS, THE COMPARATIVE AND FUNCTIONAL GENOMIC ANALYSIS OF PHYLOGENETICALLY RELATED BACTERIAL STRAINS WILL FACILITATE THE IDENTIFICATION OF PATHOGENICITY DETERMINANTS AT THE PATOVAR AND BREED LEVEL. THE MAIN OBJECTIVES OF THIS PROJECT ARE: 1) FUNCTIONALLY IDENTIFY AND CHARACTERISE DIFFERENCES IN THE SET OF VIRULENCE GENES OF PSV PATHOVARS AND PPH BREEDS RELATED TO HOST SPECIFICITY; AND 2) APPLY THE INFORMATION OBTAINED BY COMPARATIVE AND FUNCTIONAL GENOMIC FOR THE DEVELOPMENT OF DIAGNOSTIC TOOLS FOR THE PPH BREEDS AND THE EMERGING ISOLATED PSV IN MANDEVILLA. THE SPECIFIC OBJECTIVES ARE: 1) ASSIGN A PATOVAR TO P. SAVASTANOI STRAINS ISOLATED FROM M. SANDERI. 2) SEQUENCE AND RECORD GENOMES OF REPRESENTATIVE STRAINS OF PATOVARS AND BREEDS OF P. SAVASTANOI. 3) PERFORM A COMPARATIVE GENOMIC ANALYSIS AND A PHYLOGENETIC ANALYSIS OF PSV PATHOVARS AND PPH BREEDS. 4) STUDY THE BIOLOGY AND ROLE IN THE SPECIFICITY OF HOST OF THE PLASMAIDS OF THESE BACTERIAL STRAINS. 5) TO DEEPEN THE ROLE IN THE GUEST SPECIFICITY OF THE SECRETION SYSTEMS, OF THE EFFECTORS OF THE TYPE III SECRETION SYSTEM AND, 6) OF OTHER VIRULENCE FACTORS. 7) TO STUDY THE ROLE OF GENIC EXPRESSION IN THE SPECIFICITY OF GUESTS. 8) DEVELOP SPECIFIC DIAGNOSTIC TOOLS FOR MANDEVILLA ISOLATES AND PPH BREEDS. (English)
    point in time
    13 October 2021
    readability score
    0.8177157781343469
    0 references
    LES MALADIES BACTÉRIENNES DES PLANTES CAUSENT DES PERTES ÉCONOMIQUES IMPORTANTES; LEUR CONTRÔLE EST DIFFICILE ET DEVRAIT L’ÊTRE À L’AVENIR EN RAISON DES RESTRICTIONS IMPOSÉES PAR L’UE À L’AUTORISATION DES SUBSTANCES ACTIVES DISPONIBLES POUR LE CONTRÔLE INTÉGRÉ. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. LE SAVASTANOI (PSV) PRODUIT DES TUMEURS DE L’AIR DANS L’HÔTE, CAUSANT L’UNE DES MALADIES LES PLUS IMPORTANTES DE L’OLIVE, BIEN QU’IL SOIT ÉGALEMENT PATHOGÈNE CHEZ UN GRAND NOMBRE D’ESPÈCES VÉGÉTALES. EN OUTRE, LE VSP A RÉCEMMENT ÉTÉ RÉVÉLÉ COMME UN PATHOGÈNE ÉMERGENT CHEZ L’ESPÈCE ORNEMENTALE MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) EST UN AGENT PATHOGÈNE D’IMPORTANCE ÉCONOMIQUE EN JUDIA ET L’UN DES MODÈLES DE RECHERCHE LES PLUS PERTINENTS EN PHYSIOBACTÉRIOLOGIE. L’UNE DES STRATÉGIES DE LUTTE CONTRE LA PPH LES PLUS SOUHAITABLES EST L’UTILISATION DE VARIÉTÉS JUIVES RÉSISTANTES. LES ISOLATS DE PPH SONT CLASSÉS EN 9 RACES EN FONCTION DE LEURS INTERACTIONS AVEC 8 VARIÉTÉS JUIVES DIFFÉRENTES, CE QUI S’EXPLIQUE PAR L’INTERACTION DE 5 PAIRES DANS LA RELATION GÈNE-GEN, BIEN QU’IL SOIT POSSIBLE DE FAIRE UNE PLUS GRANDE DIFFÉRENCIATION CHEZ JUSQU’À 14 RACES. LES DEUX PATHOSYSTÈMES OFFRENT UNE OCCASION SANS PRÉCÉDENT D’ÉTUDIER LES BASES MOLÉCULAIRES DE LA SPÉCIFICITÉ DE L’INVITÉ. D’UNE PART, BIEN QUE LA PPH SOIT UN PATOVAR GÉNÉTIQUEMENT HOMOGÈNE, LES DIFFÉRENTS ISOLATS MONTRENT DES DIFFÉRENCES DANS LEUR VIRULENCE, UN ASPECT QUI REFLÈTE LEUR SPÉCIFICITÉ RACIALE. D’AUTRE PART, LES DIFFÉRENTS PATOVARES DE P. SAVASTANOI INDUISENT DES SYMPTÔMES SIMILAIRES (TUMEURS) CHEZ LES HÔTES LIGNEUX ET HERBACÉS. LA DISPONIBILITÉ DES GÉNOMES FERMÉS DES SOUCHES PPH 1448A ET PSV NCPPB 3335, AINSI QUE LES OUTILS GÉNÉTIQUES ET FONCTIONNELS DÉVELOPPÉS LORS DE L’EXÉCUTION DE NOS PROJETS PRÉCÉDENTS, FONT DE CES BACTÉRIES DES MODÈLES IDÉAUX POUR L’ANALYSE DE LA SPÉCIFICITÉ DE L’INVITÉ ET DE L’ÉVOLUTION DE LA VIRULENCE. AINSI, L’ANALYSE GÉNOMIQUE COMPARATIVE ET FONCTIONNELLE DES SOUCHES BACTÉRIENNES APPARENTÉES PHYLOGÉNÉTIQUEMENT FACILITERA L’IDENTIFICATION DES DÉTERMINANTS DE LA PATHOGÉNICITÉ AU NIVEAU PATOVAR ET AU NIVEAU DE LA RACE. LES PRINCIPAUX OBJECTIFS DE CE PROJET SONT LES SUIVANTS: 1) IDENTIFIER ET CARACTÉRISER FONCTIONNELLEMENT LES DIFFÉRENCES DANS L’ENSEMBLE DES GÈNES DE VIRULENCE DES PATHOVARS PSV ET DES RACES PPH LIÉES À LA SPÉCIFICITÉ DE L’HÔTE; ET 2) APPLIQUER LES INFORMATIONS OBTENUES PAR LA GÉNOMIQUE COMPARATIVE ET FONCTIONNELLE POUR LE DÉVELOPPEMENT D’OUTILS DE DIAGNOSTIC POUR LES RACES PPH ET LE PSV ISOLÉ ÉMERGENT CHEZ MANDEVILLA. LES OBJECTIFS SPÉCIFIQUES SONT LES SUIVANTS: 1) ASSIGNER UN PATOVAR À DES SOUCHES DE P. SAVASTANOI ISOLÉES DE M. SANDERI. 2) SÉQUENCE ET ENREGISTREMENT DES GÉNOMES DES SOUCHES REPRÉSENTATIVES DE PATOVARS ET DES RACES DE P. SAVASTANOI. 3) EFFECTUER UNE ANALYSE GÉNOMIQUE COMPARATIVE ET UNE ANALYSE PHYLOGÉNÉTIQUE DES PATHOGÈNES DU VSP ET DES RACES PPH. 4) ÉTUDIER LA BIOLOGIE ET LE RÔLE DANS LA SPÉCIFICITÉ DE L’HÔTE DU PLASMAIDS DE CES SOUCHES BACTÉRIENNES. 5) APPROFONDIR LE RÔLE DANS LA SPÉCIFICITÉ DE L’INVITÉ DES SYSTÈMES DE SÉCRÉTION, DES EFFECTEURS DU SYSTÈME DE SÉCRÉTION DE TYPE III ET, 6) D’AUTRES FACTEURS DE VIRULENCE. 7) ÉTUDIER LE RÔLE DE L’EXPRESSION GÉNIQUE DANS LA SPÉCIFICITÉ DES INVITÉS. 8) DÉVELOPPER DES OUTILS DE DIAGNOSTIC SPÉCIFIQUES POUR LES ISOLATS DE MANDEVILLA ET LES RACES PPH. (French)
    point in time
    5 December 2021
    0 references
    BAKTERIELLE KRANKHEITEN VON PFLANZEN VERURSACHEN ERHEBLICHE WIRTSCHAFTLICHE VERLUSTE; IHRE KONTROLLE IST SCHWIERIG UND DÜRFTE IN ZUKUNFT AUFGRUND DER BESCHRÄNKUNGEN DER EU FÜR DIE ZULASSUNG VON WIRKSTOFFEN, DIE FÜR EINE INTEGRIERTE KONTROLLE VERFÜGBAR SIND, SCHWIERIGER SEIN. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PRODUZIERT LUFTTUMOREN IM WIRT, WAS EINE DER WICHTIGSTEN OLIVENKRANKHEITEN VERURSACHT, OBWOHL ES AUCH IN EINER VIELZAHL VON PFLANZENARTEN PATHOGEN IST. DARÜBER HINAUS WURDE PSV KÜRZLICH ALS AUFKOMMENDER ERREGER IN DER ZIERART MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA) ENTDECKT. P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) IST EIN ERREGER VON WIRTSCHAFTLICHER BEDEUTUNG IN JUDIA UND EINES DER RELEVANTESTEN FORSCHUNGSMODELLE IN DER PHYTOBAKTERIOLOGIE. EINE DER BEGEHRTESTEN PPH-KONTROLLSTRATEGIEN IST DER EINSATZ RESISTENTER JÜDISCHER SORTEN. PPH-ISOLATE WERDEN IN 9 RASSEN NACH IHREN WECHSELWIRKUNGEN MIT 8 VERSCHIEDENEN JÜDISCHEN SORTEN KLASSIFIZIERT, DIE DURCH DIE WECHSELWIRKUNG VON 5 PAAREN IN GEN-ZU-GEN-BEZIEHUNG ERKLÄRT WURDEN, OBWOHL ES MÖGLICH IST, EINE GRÖSSERE DIFFERENZIERUNG BEI BIS ZU 14 RASSEN VORZUNEHMEN. BEIDE PATHOSYSTEME BIETEN EINE BEISPIELLOSE GELEGENHEIT, DIE MOLEKULAREN GRUNDLAGEN DER GASTSPEZIALITÄT ZU STUDIEREN. EINERSEITS, OBWOHL PPH EIN GENETISCH HOMOGENES PATOVAR IST, ZEIGEN DIE VERSCHIEDENEN ISOLATE UNTERSCHIEDE IN IHRER VIRULENZ, EIN ASPEKT, DER IHRE RASSENSPEZIALITÄT WIDERSPIEGELT. ANDERERSEITS VERURSACHEN DIE VERSCHIEDENEN PATOVARES VON P. SAVASTANOI ÄHNLICHE SYMPTOME (TUMOREN) SOWOHL BEI HOLZIGEN ALS AUCH KRAUTIGEN WIRTEN. DIE VERFÜGBARKEIT DER GESCHLOSSENEN GENOME DER PPH 1448A UND PSV NCPPB 3335 STÄMME SOWIE DIE GENETISCHEN UND FUNKTIONALEN WERKZEUGE, DIE BEI DER DURCHFÜHRUNG UNSERER BISHERIGEN PROJEKTE ENTWICKELT WURDEN, MACHEN DIESE BAKTERIEN IDEAL FÜR DIE ANALYSE DER GASTSPEZIALITÄT UND DIE ENTWICKLUNG DER VIRULENZ. SO WIRD DIE VERGLEICHENDE UND FUNKTIONELLE GENOMISCHE ANALYSE PHYLOGENETISCH VERWANDTER BAKTERIENSTÄMME DIE IDENTIFIZIERUNG VON PATHOGENITÄTSDETERMINANTEN AUF PATOVAR- UND RASSEEBENE ERLEICHTERN. DIE HAUPTZIELE DIESES PROJEKTS SIND: 1) FUNKTIONELL IDENTIFIZIEREN UND CHARAKTERISIEREN UNTERSCHIEDE IN DER GRUPPE VON VIRULENZGENEN VON PSV-POROVAREN UND PPH-ARTEN IM ZUSAMMENHANG MIT DER WIRTSSPEZIALITÄT; UND 2) DIE DURCH VERGLEICHENDE UND FUNKTIONALE GENOMIK GEWONNENEN INFORMATIONEN FÜR DIE ENTWICKLUNG VON DIAGNOSEWERKZEUGEN FÜR DIE PPH-ARTEN UND DIE SICH ABZEICHNENDE ISOLIERTE PSV IN MANDEVILLA ANWENDEN. DIE SPEZIFISCHEN ZIELE SIND: 1) ZUORDNUNG EINES PATOVAR ZU P. SAVASTANOI STÄMMEN, DIE VON M. SANDERI ISOLIERT SIND. 2) SEQUENZ UND AUFZEICHNUNG VON GENOME REPRÄSENTATIVER STÄMME VON PATOVARS UND RASSEN VON P. SAVASTANOI. 3) FÜHREN EINE VERGLEICHENDE GENOMISCHE ANALYSE UND EINE PHYLOGENETISCHE ANALYSE VON PSV PATHOVAREN UND PPH RASSEN DURCH. 4) STUDIUM DER BIOLOGIE UND ROLLE IN DER SPEZIFITÄT DES WIRTS DER PLASMAIDS DIESER BAKTERIENSTÄMME. 5) DIE ROLLE IN DER GASTSPEZIALITÄT DER SEKRETIONSSYSTEME, DER EFFEKTOREN DES TYPS III SEKRETIONSSYSTEM UND, 6) ANDERER VIRULENZFAKTOREN ZU VERTIEFEN. 7) DIE ROLLE DES GENGENAUSDRUCKS IN DER SPEZIFITÄT DER GÄSTE ZU UNTERSUCHEN. 8) ENTWICKELN SPEZIFISCHE DIAGNOSTISCHE WERKZEUGE FÜR MANDEVILLA ISOLATE UND PPH RASSEN. (German)
    point in time
    9 December 2021
    0 references
    BACTERIËLE ZIEKTEN VAN PLANTEN VEROORZAKEN AANZIENLIJKE ECONOMISCHE VERLIEZEN; DE CONTROLE ERVAN IS MOEILIJK EN ZAL NAAR VERWACHTING IN DE TOEKOMST MOEILIJKER WORDEN ALS GEVOLG VAN EU-BEPERKINGEN OP DE TOELATING VAN WERKZAME STOFFEN DIE BESCHIKBAAR ZIJN VOOR GEÏNTEGREERDE CONTROLE. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PRODUCEERT LUCHTTUMOREN IN DE GASTHEER, WAT EEN VAN DE BELANGRIJKSTE OLIJFZIEKTEN VEROORZAAKT, HOEWEL HET OOK PATHOGEEN IS BIJ EEN GROOT AANTAL PLANTENSOORTEN. DAARNAAST IS PSV ONLANGS ONTHULD ALS EEN OPKOMENDE ZIEKTEVERWEKKER IN DE SIERSOORT MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) IS EEN PATHOGEEN VAN ECONOMISCH BELANG IN JUDIA EN EEN VAN DE MEEST RELEVANTE ONDERZOEKSMODELLEN IN DE FYTOBACTERIOLOGIE. EEN VAN DE MEEST WENSELIJKE PPH CONTROLESTRATEGIEËN IS HET GEBRUIK VAN RESISTENTE JOODSE VARIËTEITEN. PPH ISOLATEN WORDEN INGEDEELD IN 9 RASSEN VOLGENS HUN INTERACTIES MET 8 VERSCHILLENDE JOODSE RASSEN, DIE ZIJN VERKLAARD DOOR DE INTERACTIE VAN 5 PAREN IN GEN-TOT-GEN RELATIE, HOEWEL HET MOGELIJK IS OM EEN GROTERE DIFFERENTIATIE TE MAKEN IN MAXIMAAL 14 RASSEN. BEIDE PATHOSYSTEMEN BIEDEN EEN ONGEKENDE KANS OM DE MOLECULAIRE BASEN VAN GASTSPECIFICITEIT TE BESTUDEREN. AAN DE ENE KANT, HOEWEL PPH EEN GENETISCH HOMOGEEN PATOVAR IS, VERTONEN DE VERSCHILLENDE ISOLATEN VERSCHILLEN IN HUN VIRULENTIE, EEN ASPECT DAT HUN RAS SPECIFICITEIT WEERSPIEGELT. ANDERZIJDS VEROORZAKEN DE VERSCHILLENDE PATOVARES VAN P. SAVASTANOI VERGELIJKBARE SYMPTOMEN (TUMOREN) BIJ ZOWEL HOUTACHTIGE ALS KRUIDACHTIGE GASTHEREN. DE BESCHIKBAARHEID VAN DE GESLOTEN GENOOM VAN DE PPH 1448A EN PSV NCPPB 3335 STAMMEN, EVENALS DE GENETISCHE EN FUNCTIONELE TOOLS ONTWIKKELD TIJDENS DE UITVOERING VAN ONZE VORIGE PROJECTEN, MAKEN DEZE BACTERIËN IDEALE MODELLEN VOOR DE ANALYSE VAN GASTSPECIFICITEIT EN DE EVOLUTIE VAN VIRULENTIE. ZO ZAL DE VERGELIJKENDE EN FUNCTIONELE GENOMISCHE ANALYSE VAN FYLOGENETISCH VERWANTE BACTERIËLE STAMMEN DE IDENTIFICATIE VAN PATHOGENITEITSDETERMINANTEN OP PATOVAR- EN RASNIVEAU VERGEMAKKELIJKEN. DE BELANGRIJKSTE DOELSTELLINGEN VAN DIT PROJECT ZIJN: 1) FUNCTIONEEL IDENTIFICEREN EN KARAKTERISEREN VERSCHILLEN IN DE REEKS VIRULENTIE GENEN VAN PSV PATHOVARS EN PPH RASSEN GERELATEERD AAN GASTHEER SPECIFICITEIT; EN 2) DE DOOR VERGELIJKENDE EN FUNCTIONELE GENOMIC VERKREGEN INFORMATIE TOEPASSEN VOOR DE ONTWIKKELING VAN DIAGNOSTISCHE HULPMIDDELEN VOOR DE PPH-RASSEN EN DE OPKOMENDE GEÏSOLEERDE PSV IN MANDEVILLA. DE SPECIFIEKE DOELSTELLINGEN ZIJN: 1) WIJS EEN PATOVAR TOE AAN P. SAVASTANOI STAMMEN GEÏSOLEERD VAN M. SANDERI. 2) SEQUENTIE EN RECORD GENOMEN VAN REPRESENTATIEVE STAMMEN VAN PATOVARS EN RASSEN VAN P. SAVASTANOI. 3) VOER EEN VERGELIJKENDE GENOMISCHE ANALYSE EN EEN FYLOGENETISCHE ANALYSE VAN PSV PATHOVARS EN PPH RASSEN UIT. 4) BESTUDEREN VAN DE BIOLOGIE EN ROL IN DE SPECIFICITEIT VAN DE GASTHEER VAN DE PLASMAIDS VAN DEZE BACTERIËLE STAMMEN. 5) OM DE ROL IN DE GASTSPECIFICITEIT VAN DE AFSCHEIDINGSSYSTEMEN, VAN DE EFFECTOREN VAN HET TYPE III AFSCHEIDINGSSYSTEEM EN, 6) VAN ANDERE VIRULENTIEFACTOREN TE VERDIEPEN. 7) OM DE ROL VAN GENIC EXPRESSIE IN DE SPECIFICITEIT VAN GASTEN TE BESTUDEREN. 8) ONTWIKKEL SPECIFIEKE KENMERKENDE HULPMIDDELEN VOOR MANDEVILLA-ISOLATEN EN PPH-RASSEN. (Dutch)
    point in time
    17 December 2021
    0 references
    LE MALATTIE BATTERICHE DELLE PIANTE CAUSANO PERDITE ECONOMICHE SIGNIFICATIVE; IL LORO CONTROLLO È DIFFICILE E DOVREBBE ESSERE PIÙ DIFFICILE IN FUTURO A CAUSA DELLE RESTRIZIONI DELL'UE ALL'AUTORIZZAZIONE DELLE SOSTANZE ATTIVE DISPONIBILI PER IL CONTROLLO INTEGRATO. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PRODUCE TUMORI DELL'ARIA NELL'OSPITE, CAUSANDO UNA DELLE PIÙ IMPORTANTI MALATTIE DELLE OLIVE, ANCHE SE È ANCHE PATOGENO IN UN GRAN NUMERO DI SPECIE VEGETALI. INOLTRE, IL PSV È STATO RECENTEMENTE RIVELATO COME UN AGENTE PATOGENO EMERGENTE NELLA SPECIE ORNAMENTALE MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) È UN PATOGENO DI IMPORTANZA ECONOMICA NEL JUDIA E UNO DEI MODELLI DI RICERCA PIÙ RILEVANTI IN FITOBATTERIOLOGIA. UNA DELLE STRATEGIE DI CONTROLLO PPH PIÙ DESIDERABILI È L'USO DI VARIETÀ EBRAICHE RESISTENTI. GLI ISOLATI PPH SONO CLASSIFICATI IN 9 RAZZE IN BASE ALLE LORO INTERAZIONI CON 8 DIVERSE VARIETÀ EBRAICHE, CHE SONO STATE SPIEGATE DALL'INTERAZIONE DI 5 COPPIE IN RELAZIONE GENE-GEN, ANCHE SE È POSSIBILE FARE UNA MAGGIORE DIFFERENZIAZIONE IN FINO A 14 RAZZE. ENTRAMBI I PATHOSYSTEM OFFRONO UN'OPPORTUNITÀ SENZA PRECEDENTI PER STUDIARE LE BASI MOLECOLARI DELLA SPECIFICITÀ DEGLI OSPITI. DA UN LATO, SEBBENE IL PPH SIA UN PATOVAR GENETICAMENTE OMOGENEO, I DIVERSI ISOLATI MOSTRANO DIFFERENZE NELLA LORO VIRULENZA, UN ASPETTO CHE RIFLETTE LA LORO SPECIFICITÀ RAZZIALE. D'ALTRA PARTE, I DIVERSI PATOVARES DI P. SAVASTANOI INDUCONO SINTOMI SIMILI (TUMORI) SIA IN OSPITI LEGNOSI CHE ERBACEI. LA DISPONIBILITÀ DEI GENOMI CHIUSI DEI CEPPI PPH 1448A E PSV NCPPB 3335, COSÌ COME GLI STRUMENTI GENETICI E FUNZIONALI SVILUPPATI DURANTE L'ESECUZIONE DEI NOSTRI PRECEDENTI PROGETTI, RENDONO QUESTI BATTERI MODELLI IDEALI PER L'ANALISI DELLA SPECIFICITÀ DEGLI OSPITI E L'EVOLUZIONE DELLA VIRULENZA. PERTANTO, L'ANALISI GENOMICA COMPARATIVA E FUNZIONALE DEI CEPPI BATTERICI FILOGENETICAMENTE CORRELATI FACILITERÀ L'IDENTIFICAZIONE DEI DETERMINANTI DI PATOGENICITÀ A LIVELLO DI PATOVAR E DI RAZZA. GLI OBIETTIVI PRINCIPALI DI QUESTO PROGETTO SONO: 1) IDENTIFICARE E CARATTERIZZARE FUNZIONALMENTE LE DIFFERENZE NELL'INSIEME DEI GENI DI VIRULENZA DEI PATHOVARS PSV E DELLE RAZZE PPH RELATIVE ALLA SPECIFICITÀ DELL'OSPITE; E 2) APPLICARE LE INFORMAZIONI OTTENUTE MEDIANTE GENOMICA COMPARATIVA E FUNZIONALE PER LO SVILUPPO DI STRUMENTI DIAGNOSTICI PER LE RAZZE PPH E IL PSV ISOLATO EMERGENTE A MANDEVILLA. GLI OBIETTIVI SPECIFICI SONO: 1) ASSEGNARE UN PATOVAR A CEPPI P. SAVASTANOI ISOLATI DA M. SANDERI. 2) SEQUENZA E REGISTRARE GENOMI DI CEPPI RAPPRESENTATIVI DI PATOVARS E RAZZE DI P. SAVASTANOI. 3) ESEGUIRE UN'ANALISI GENOMICA COMPARATIVA E UN'ANALISI FILOGENETICA DI PATOGENORI PSV E RAZZE PPH. 4) STUDIARE LA BIOLOGIA E IL RUOLO NELLA SPECIFICITÀ DELL'OSPITE DEL PLASMAIDS DI QUESTI CEPPI BATTERICI. 5) APPROFONDIRE IL RUOLO NELLA SPECIFICITÀ OSPITE DEI SISTEMI DI SECREZIONE, DEGLI EFFETTI DEL SISTEMA DI SECREZIONE DI TIPO III E, 6) DI ALTRI FATTORI DI VIRULENZA. 7) STUDIARE IL RUOLO DELL'ESPRESSIONE GENICA NELLA SPECIFICITÀ DEGLI OSPITI. 8) SVILUPPARE STRUMENTI DIAGNOSTICI SPECIFICI PER ISOLATI MANDEVILLA E RAZZE PPH. (Italian)
    point in time
    16 January 2022
    0 references
    TAIMEDE BAKTERIAALSED HAIGUSED PÕHJUSTAVAD MÄRKIMISVÄÄRSET MAJANDUSLIKKU KAHJU; NENDE KONTROLLIMINE ON KEERULINE JA TULEVIKUS ON SEE EELDATAVASTI KEERULISEM, KUNA ELIS KEHTIVAD PIIRANGUD INTEGREERITUD KONTROLLIKS KÄTTESAADAVATE TOIMEAINETE LUBAMISELE. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) TOODAB PEREMEESORGANISMIS ÕHUKASVAJAID, PÕHJUSTADES ÜHT KÕIGE OLULISEMAT OLIIVIHAIGUST, KUIGI SEE ON PATOGEENNE KA PALJUDEL TAIMELIIKIDEL. LISAKS SELLELE ON PSV HILJUTI AVASTATUD ARENEVA PATOGEENINA DEKORATIIVSES LIIGIS MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) ON JUDIAS MAJANDUSLIKULT OLULINE PATOGEEN JA ÜKS OLULISEMAID FÜTOBAKTERIOLOOGIA UURIMISMUDELEID. ÜKS SOOVITAVAMAID PPH KONTROLLISTRATEEGIAID ON RESISTENTSETE JUUDI SORTIDE KASUTAMINE. PPH ISOLAADID KLASSIFITSEERITAKSE 9 TÕUGU VASTAVALT NENDE KOOSTOIMELE 8 ERINEVA JUUDI SORDIGA, MIS ON SELETATAV 5 PAARI KOOSTOIMEGA GEENI-PÕLVKONNA SUHTES, KUIGI ON VÕIMALIK TEHA SUUREMAT DIFERENTSEERIMIST KUNI 14 TÕU PUHUL. MÕLEMAD PATOSÜSTEEMID PAKUVAD ENNEOLEMATUT VÕIMALUST UURIDA KÜLALISTE SPETSIIFILISUSE MOLEKULAARSEID ALUSEID. ÜHEST KÜLJEST, KUIGI PPH ON GENEETILISELT HOMOGEENNE PATOVAR, NÄITAVAD ERINEVAD ISOLAADID OMA VIRULENTSUST, MIS PEEGELDAB NENDE RASSI ERIPÄRA. TEISEST KÜLJEST PÕHJUSTAVAD P. SAVASTANOI ERINEVAD PATOVARESED SARNASEID SÜMPTOMEID (KASVAJAID) NII PUIT- KUI KA ROHTSETEL PEREMEESTEL. PPH 1448A JA PSV NCPPB 3335 TÜVEDE SULETUD GENOOMIDE KÄTTESAADAVUS NING MEIE VARASEMATE PROJEKTIDE ELLUVIIMISE KÄIGUS VÄLJA TÖÖTATUD GENEETILISED JA FUNKTSIONAALSED VAHENDID MUUDAVAD NEED BAKTERID IDEAALSETEKS MUDELITEKS KÜLALISTE SPETSIIFILISUSE JA VIRULENTSUSE ARENGU ANALÜÜSIMISEKS. SEEGA HÕLBUSTAB FÜLOGENEETILISELT SEOTUD BAKTERITÜVEDE VÕRDLEV JA FUNKTSIONAALNE GENOOMIANALÜÜS PATOGEENSUST MÄÄRAVATE TEGURITE KINDLAKSTEGEMIST PATOVARI JA TÕU TASANDIL. PROJEKTI PEAMISED EESMÄRGID ON JÄRGMISED: 1) FUNKTSIONAALSELT TUVASTADA JA ISELOOMUSTADA PEREMEESORGANISMI SPETSIIFILISUSEGA SEOTUD PSV PATOVIINIDE JA PPH-TÕUGUDE VIRULENTSUSE GEENIDE KOGUMI ERINEVUSI; JA 2) KOHALDADA VÕRDLEVALT JA FUNKTSIONAALSELT GENOOMILISELT SAADUD TEAVET, ET TÖÖTADA VÄLJA DIAGNOSTIKAVAHENDID PPH TÕUGUDE JA ARENEVA ISOLEERITUD PSV JAOKS MANDEVILLAS. ERIEESMÄRGID ON JÄRGMISED: 1) MÄÄRATA PATOVAR M. SANDERIST ERALDATUD P. SAVASTANOI TÜVEDELE. 2) PATOVARS’I TÜÜPILISTE TÜVEDE JA P. SAVASTANOI TÕUGUDE JÄRJESTUS JA GENOOMID. 3) TEHA VÕRDLEV GENOOMNE ANALÜÜS JA FÜLOGENEETILINE ANALÜÜS PSV PATHOVARS JA PPH TÕUD. 4) UURIDA BIOLOOGIA JA ROLLI SPETSIIFILISUS VASTUVÕTVA PLASMAIDS NENDE BAKTERITÜVEDE. 5) SÜVENDADA ROLLI KÜLALISE SPETSIIFILISUS SEKRETSIOONI SÜSTEEMID, MÕJURID III TÜÜPI SEKRETSIOONI SÜSTEEMI JA, 6) TEISTE VIRULENTSUS TEGURID. 7) UURIDA ROLLI GENEETILINE VÄLJENDUS ERIPÄRA KÜLALISED. 8) TÖÖTADA MANDEVILLA ISOLAATIDE JA PPH TÕUGUDE JAOKS VÄLJA SPETSIAALSED DIAGNOSTIKAVAHENDID. (Estonian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    BAKTERINĖS AUGALŲ LIGOS SUKELIA DIDELIUS EKONOMINIUS NUOSTOLIUS; JŲ KONTROLĖ YRA SUDĖTINGA IR TIKIMASI, KAD ATEITYJE JI BUS SUDĖTINGESNĖ DĖL ES APRIBOJIMŲ, TAIKOMŲ VEIKLIŲJŲ MEDŽIAGŲ, KURIAS GALIMA NAUDOTI INTEGRUOTAI KONTROLEI, AUTORIZACIJAI. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) GAMINA ORO NAVIKUS ŠEIMININKE, SUKELIA VIENĄ IŠ SVARBIAUSIŲ ALYVUOGIŲ LIGŲ, NORS JIS TAIP PAT YRA PATOGENIŠKAS DAUGELYJE AUGALŲ RŪŠIŲ. BE TO, PSV NESENIAI BUVO ATSKLEISTA KAIP ATSIRANDANTIS PATOGENAS DEKORATYVINIŲ RŪŠIŲ MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) YRA EKONOMINĖS SVARBOS PATOGENAS JUDIA IR VIENAS IŠ SVARBIAUSIŲ PHYTOBACTERIOLOGY MOKSLINIŲ TYRIMŲ MODELIŲ. VIENA IŠ LABIAUSIAI PAGEIDAUJAMŲ PPH KONTROLĖS STRATEGIJŲ YRA ATSPARIŲ ŽYDŲ VEISLIŲ NAUDOJIMAS. PPH IZOLIATAI SKIRSTOMI Į 9 VEISLES PAGAL JŲ SĄVEIKĄ SU 8 SKIRTINGOMIS ŽYDŲ VEISLĖMIS, KURIOS BUVO PAAIŠKINTOS 5 PORŲ SĄVEIKA GENŲ IR GENO SANTYKIUOSE, NORS GALIMA LABIAU DIFERENCIJUOTI IKI 14 VEISLIŲ. ABI PATOSYSTEMS SUTEIKIA PRECEDENTO NETURINČIĄ GALIMYBĘ STUDIJUOTI SVEČIŲ SPECIFIŠKUMO MOLEKULINES BAZES. VIENA VERTUS, NORS PPH YRA GENETIŠKAI HOMOGENIŠKAS PATOVAR, SKIRTINGŲ IZOLIATŲ VIRULENTIŠKUMAS SKIRIASI, O TAI ATSPINDI JŲ RASĖS SPECIFIŠKUMĄ. KITA VERTUS, SKIRTINGI P. SAVASTANOI PATOVARES SUKELIA PANAŠIUS SIMPTOMUS (NAVIKUS) TIEK SUMEDĖJUSIUOSE, TIEK ŽOLINIUOSE ŠEIMININKUOSE. DĖL UŽDARŲ PPH 1448A IR PSV NCPPB 3335 PADERMIŲ GENOMŲ, TAIP PAT GENETINIŲ IR FUNKCINIŲ PRIEMONIŲ, SUKURTŲ VYKDANT ANKSTESNIUS PROJEKTUS, ŠIOS BAKTERIJOS IDEALIAI TINKA SVEČIŲ SPECIFIŠKUMO ANALIZEI IR VIRULENTIŠKUMO EVOLIUCIJAI. TAIGI, LYGINAMOJI IR FUNKCINĖ GENOMINĖ FILOGENETIŠKAI SUSIJUSIŲ BAKTERIJŲ PADERMIŲ ANALIZĖ PALENGVINS PATOGENIŠKUMĄ LEMIANČIŲ VEIKSNIŲ IDENTIFIKAVIMĄ PATOVAR IR VEISLĖS LYGMENIU. PAGRINDINIAI ŠIO PROJEKTO TIKSLAI: 1) FUNKCINIU POŽIŪRIU NUSTATYTI IR APIBŪDINTI PSV PATOVARŲ IR PPH VEISLIŲ VIRULENTIŠKUMO GENŲ SKIRTUMUS, SUSIJUSIUS SU ŠEIMININKO SPECIFIŠKUMU; IR 2) TAIKYTI LYGINAMĄJĄ IR FUNKCINĘ GENOMINĘ INFORMACIJĄ KURIANT DIAGNOSTIKOS PRIEMONES PPH VEISLĖMS IR ATSIRANDANČIAM IZOLIUOTAM PSV MANDEVILOJE. KONKRETŪS TIKSLAI YRA ŠIE: 1) PRISKIRTI PATOVAR P. SAVASTANOI PADERMĖMS, IŠSKIRTOMS IŠ M. SANDERI. 2) SEKA IR ĮRAŠYTI GENOMAI REPREZENTACINIŲ PADERMIŲ PATOVARS IR VEISLIŲ P. SAVASTANOI. 3) ATLIKTI LYGINAMĄJĄ GENOMINĘ ANALIZĘ IR FILOGENETINĘ PSV PATOVARŲ IR PPH VEISLIŲ ANALIZĘ. 4) IŠTIRTI BIOLOGIJĄ IR VAIDMENĮ ŠEIMININKO ŠIŲ BAKTERIJŲ PADERMIŲ PLASMAIDS SPECIFIKOJE. 5) GILINTI VAIDMENĮ SVEČIŲ SPECIFIKOJE SEKRECIJOS SISTEMŲ, III TIPO SEKRECIJOS SISTEMOS EFEKTŲ IR, 6) KITŲ VIRULENTIŠKUMO VEIKSNIŲ. 7) IŠTIRTI GENINĖS IŠRAIŠKOS VAIDMENĮ SVEČIŲ SPECIFIŠKUMUI. 8) SUKURTI SPECIALIAS DIAGNOSTINES PRIEMONES MANDEVILLA IZOLIATAMS IR PPH VEISLĖMS. (Lithuanian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    BAKTERIJSKE BOLESTI BILJAKA UZROKUJU ZNATNE GOSPODARSKE GUBITKE; NJIHOVA JE KONTROLA TEŠKA I OČEKUJE SE DA ĆE U BUDUĆNOSTI BITI TEŽA ZBOG OGRANIČENJA EU-A U POGLEDU ODOBRAVANJA AKTIVNIH TVARI DOSTUPNIH ZA INTEGRIRANU KONTROLU. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PROIZVODI TUMORE ZRAKA U DOMAĆINU, UZROKUJUĆI JEDNU OD NAJVAŽNIJIH BOLESTI MASLINA, IAKO JE TAKOĐER PATOGENA U VELIKOM BROJU BILJNIH VRSTA. OSIM TOGA, PSV JE NEDAVNO OTKRIVEN KAO NOVI PATOGEN U UKRASNOJ VRSTI MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) JE PATOGEN OD GOSPODARSKE VAŽNOSTI U JUDIJI I JEDAN OD NAJRELEVANTNIJIH ISTRAŽIVAČKIH MODELA U PODRUČJU FITOBAKTERIOLOGIJE. JEDNA OD NAJPOŽELJNIJIH STRATEGIJA KONTROLE PPH-A JE UPORABA OTPORNIH ŽIDOVSKIH SORTI. PPH IZOLATI SU RAZVRSTANI U 9 PASMINA PREMA NJIHOVIM INTERAKCIJAMA S 8 RAZLIČITIH ŽIDOVSKIH SORTI, ŠTO JE OBJAŠNJENO MEĐUDJELOVANJEM 5 PAROVA U ODNOSU GENA I GENA, IAKO JE MOGUĆE NAPRAVITI VEĆU DIFERENCIJACIJU U DO 14 PASMINA. OBA PATOSUSTAVA NUDE NEVIĐENU PRILIKU ZA PROUČAVANJE MOLEKULARNIH BAZA SPECIFIČNOSTI GOSTA. S JEDNE STRANE, IAKO JE PPH GENETSKI HOMOGENI PATOVAR, RAZLIČITI IZOLATI POKAZUJU RAZLIKE U SVOJOJ VIRULENCIJI, ŠTO ODRAŽAVA NJIHOVU RASNU SPECIFIČNOST. S DRUGE STRANE, RAZLIČITI PATOVARES P. SAVASTANOI IZAZIVAJU SLIČNE SIMPTOME (TUMORE) U DRVENASTIH I ZELJASTIH DOMAĆINA. DOSTUPNOST ZATVORENIH GENOMA SOJEVA PPH 1448A I PSV NCPPB 3335, KAO I GENETSKI I FUNKCIONALNI ALATI RAZVIJENI TIJEKOM IZVOĐENJA NAŠIH PRETHODNIH PROJEKATA, ČINE OVE BAKTERIJE IDEALNIM MODELIMA ZA ANALIZU SPECIFIČNOSTI GOSTA I EVOLUCIJU VIRULENCIJE. DAKLE, KOMPARATIVNA I FUNKCIONALNA GENOMSKA ANALIZA FILOGENETSKI POVEZANIH BAKTERIJSKIH SOJEVA OLAKŠAT ĆE IDENTIFIKACIJU UZROČNIKA PATOGENOSTI NA RAZINI PATOVAR-A I PASMINE. GLAVNI SU CILJEVI OVOG PROJEKTA SLJEDEĆI: 1) FUNKCIONALNO IDENTIFICIRATI I KARAKTERIZIRATI RAZLIKE U SKUPU VIRULENCIJSKIH GENA PSV PATOVARA I PPH PASMINA POVEZANIH SA SPECIFIČNOŠĆU DOMAĆINA; I 2) PRIMIJENITI INFORMACIJE DOBIVENE USPOREDNIM I FUNKCIONALNIM GENOMSKIM ZA RAZVOJ DIJAGNOSTIČKIH ALATA ZA PPH PASMINE I NOVONASTALE IZOLIRANE PSV U MANDEVILLI. POSEBNI SU CILJEVI SLJEDEĆI: 1) DODIJELITI PATOVAR SOJEVIMA P. SAVASTANOI IZOLIRANIMA IZ M. SANDERI. 2) SLIJED I SNIMANJE GENOMA REPREZENTATIVNIH SOJEVA PATOVARS-A I PASMINA P. SAVASTANOI. 3) PROVESTI KOMPARATIVNU GENOMSKU ANALIZU I FILOGENETSKU ANALIZU PSV PATOVARA I PPH PASMINA. 4) PROUČAVATI BIOLOGIJU I ULOGU U SPECIFIČNOSTI DOMAĆINA PLASMAIDS-A OVIH BAKTERIJSKIH SOJEVA. 5) PRODUBITI ULOGU U GOST SPECIFIČNOSTI SUSTAVA IZLUČIVANJA, EFEKTORA SUSTAVA IZLUČIVANJA TIPA III I, 6) DRUGIH VIRULENCE FAKTORA. 7) PROUČAVATI ULOGU GENSKOG IZRAŽAVANJA U SPECIFIČNOSTI GOSTIJU. 8) RAZVITI SPECIFIČNE DIJAGNOSTIČKE ALATE ZA MANDEVILLA IZOLATE I PPH PASMINE. (Croatian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    ΟΙ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΈΣ ΑΣΘΈΝΕΙΕΣ ΤΩΝ ΦΥΤΏΝ ΠΡΟΚΑΛΟΎΝ ΣΗΜΑΝΤΙΚΈΣ ΟΙΚΟΝΟΜΙΚΈΣ ΑΠΏΛΕΙΕΣ· Ο ΈΛΕΓΧΌΣ ΤΟΥΣ ΕΊΝΑΙ ΔΎΣΚΟΛΟΣ ΚΑΙ ΑΝΑΜΈΝΕΤΑΙ ΝΑ ΕΊΝΑΙ ΔΥΣΚΟΛΌΤΕΡΟΣ ΣΤΟ ΜΈΛΛΟΝ ΛΌΓΩ ΤΩΝ ΠΕΡΙΟΡΙΣΜΏΝ ΤΗΣ ΕΕ ΌΣΟΝ ΑΦΟΡΆ ΤΗΝ ΈΓΚΡΙΣΗ ΔΡΑΣΤΙΚΏΝ ΟΥΣΙΏΝ ΠΟΥ ΔΙΑΤΊΘΕΝΤΑΙ ΓΙΑ ΟΛΟΚΛΗΡΩΜΈΝΟ ΈΛΕΓΧΟ. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. ΟΙ ΣΑΒΑΣΤΑΝΟΊ (PSV) ΠΑΡΆΓΟΥΝ ΌΓΚΟΥΣ ΑΈΡΑ ΣΤΟΝ ΞΕΝΙΣΤΉ, ΠΡΟΚΑΛΏΝΤΑΣ ΜΊΑ ΑΠΌ ΤΙΣ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌΤΕΡΕΣ ΑΣΘΈΝΕΙΕΣ ΤΗΣ ΕΛΙΆΣ, ΑΝ ΚΑΙ ΕΊΝΑΙ ΕΠΊΣΗΣ ΠΑΘΟΓΌΝΟΣ ΣΕ ΜΕΓΆΛΟ ΑΡΙΘΜΌ ΦΥΤΙΚΏΝ ΕΙΔΏΝ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, Ο PSV ΑΠΟΚΑΛΎΦΘΗΚΕ ΠΡΌΣΦΑΤΑ ΩΣ ΑΝΑΔΥΌΜΕΝΟ ΠΑΘΟΓΌΝΟΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑΣ ΣΤΟ ΚΑΛΛΩΠΙΣΤΙΚΌ ΕΊΔΟΣ MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. ΤΟ PHASEOLICOLA (PPH) ΕΊΝΑΙ ΠΑΘΟΓΌΝΟΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑΣ ΟΙΚΟΝΟΜΙΚΉΣ ΣΗΜΑΣΊΑΣ ΣΤΑ JUDIA ΚΑΙ ΈΝΑ ΑΠΌ ΤΑ ΠΙΟ ΣΗΜΑΝΤΙΚΆ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΆ ΜΟΝΤΈΛΑ ΣΤΗ ΦΥΤΟΒΑΚΤΗΡΙΟΛΟΓΊΑ. ΜΊΑ ΑΠΌ ΤΙΣ ΠΙΟ ΕΠΙΘΥΜΗΤΈΣ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΈΣ ΕΛΈΓΧΟΥ PPH ΕΊΝΑΙ Η ΧΡΉΣΗ ΑΝΘΕΚΤΙΚΏΝ ΕΒΡΑΪΚΏΝ ΠΟΙΚΙΛΙΏΝ. ΤΑ ΑΠΟΜΟΝΩΘΈΝΤΑ ΣΤΕΛΈΧΗ PPH ΤΑΞΙΝΟΜΟΎΝΤΑΙ ΣΕ 9 ΦΥΛΈΣ ΑΝΆΛΟΓΑ ΜΕ ΤΙΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ ΤΟΥΣ ΜΕ 8 ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΕΒΡΑΪΚΈΣ ΠΟΙΚΙΛΊΕΣ, ΟΙ ΟΠΟΊΕΣ ΈΧΟΥΝ ΕΞΗΓΗΘΕΊ ΑΠΌ ΤΗΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ 5 ΖΕΥΓΏΝ ΣΤΗ ΣΧΈΣΗ ΓΟΝΙΔΊΟΥ ΠΡΟΣ ΤΟ ΓΕΝΙΚΌ, ΑΝ ΚΑΙ ΕΊΝΑΙ ΔΥΝΑΤΌΝ ΝΑ ΓΊΝΕΙ ΜΕΓΑΛΎΤΕΡΗ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΊΗΣΗ ΣΕ ΈΩΣ ΚΑΙ 14 ΦΥΛΈΣ. ΚΑΙ ΤΑ ΔΎΟ ΠΑΘΟΣΥΣΤΉΜΑΤΑ ΠΡΟΣΦΈΡΟΥΝ ΜΙΑ ΆΝΕΥ ΠΡΟΗΓΟΥΜΈΝΟΥ ΕΥΚΑΙΡΊΑ ΝΑ ΜΕΛΕΤΉΣΟΥΝ ΤΙΣ ΜΟΡΙΑΚΈΣ ΒΆΣΕΙΣ ΤΗΣ ΕΞΕΙΔΊΚΕΥΣΗΣ ΤΩΝ ΕΠΙΣΚΕΠΤΏΝ. ΑΦΕΝΌΣ, ΑΝ ΚΑΙ ΤΟ PPH ΕΊΝΑΙ ΈΝΑ ΓΕΝΕΤΙΚΆ ΟΜΟΙΟΓΕΝΈΣ PATOVAR, ΤΑ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΆ ΑΠΟΜΟΝΩΘΈΝΤΑ ΣΤΕΛΈΧΗ ΠΑΡΟΥΣΙΆΖΟΥΝ ΔΙΑΦΟΡΈΣ ΣΤΗ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟΤΗΤΆ ΤΟΥΣ, ΜΙΑ ΠΤΥΧΉ ΠΟΥ ΑΝΤΙΚΑΤΟΠΤΡΊΖΕΙ ΤΗΝ ΙΔΙΑΙΤΕΡΌΤΗΤΑ ΤΗΣ ΦΥΛΉΣ ΤΟΥΣ. ΑΠΌ ΤΗΝ ΆΛΛΗ ΠΛΕΥΡΆ, ΤΑ ΔΙΆΦΟΡΑ PATOVARES P. SAVASTANOI ΠΡΟΚΑΛΟΎΝ ΠΑΡΌΜΟΙΑ ΣΥΜΠΤΏΜΑΤΑ (TUMORS) ΤΌΣΟ ΣΕ ΞΥΛΏΔΕΙΣ ΌΣΟ ΚΑΙ ΣΕ ΠΟΏΔΕΙΣ ΞΕΝΙΣΤΈΣ. Η ΔΙΑΘΕΣΙΜΌΤΗΤΑ ΤΩΝ ΚΛΕΙΣΤΏΝ ΓΟΝΙΔΙΩΜΆΤΩΝ ΤΩΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ PPH 1448A ΚΑΙ PSV NCPPB 3335, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΤΩΝ ΓΕΝΕΤΙΚΏΝ ΚΑΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΏΝ ΕΡΓΑΛΕΊΩΝ ΠΟΥ ΑΝΑΠΤΎΧΘΗΚΑΝ ΚΑΤΆ ΤΗΝ ΕΚΤΈΛΕΣΗ ΤΩΝ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΩΝ ΈΡΓΩΝ ΜΑΣ, ΚΑΘΙΣΤΟΎΝ ΑΥΤΆ ΤΑ ΒΑΚΤΉΡΙΑ ΙΔΑΝΙΚΆ ΜΟΝΤΈΛΑ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΗΣ ΙΔΙΑΙΤΕΡΌΤΗΤΑΣ ΤΩΝ ΕΠΙΣΚΕΠΤΏΝ ΚΑΙ ΤΗΝ ΕΞΈΛΙΞΗ ΤΗΣ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟΥ ΔΎΝΑΜΗΣ. ΈΤΣΙ, Η ΣΥΓΚΡΙΤΙΚΉ ΚΑΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΉ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΏΣ ΣΧΕΤΙΖΌΜΕΝΩΝ ΜΕ ΦΥΛΟΓΕΝΕΤΙΚΆ ΣΤΕΛΈΧΗ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΏΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ΘΑ ΔΙΕΥΚΟΛΎΝΕΙ ΤΟΝ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌ ΤΩΝ ΚΑΘΟΡΙΣΤΙΚΏΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ ΠΑΘΟΓΈΝΕΙΑΣ ΣΤΟ ΕΠΊΠΕΔΟ ΤΟΥ PATOVAR ΚΑΙ ΤΗΣ ΦΥΛΉΣ. ΟΙ ΚΎΡΙΟΙ ΣΤΌΧΟΙ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΣΧΕΔΊΟΥ ΕΊΝΑΙ: 1) ΝΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΣΕΙ ΚΑΙ ΝΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΣΕΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΆ ΤΙΣ ΔΙΑΦΟΡΈΣ ΣΤΟ ΣΎΝΟΛΟ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟΥ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑ ΤΩΝ ΠΑΘΟΓΟΝΙΔΙΏΝ PSV ΚΑΙ ΤΩΝ ΦΥΛΏΝ PPH ΠΟΥ ΣΧΕΤΊΖΟΝΤΑΙ ΜΕ ΤΗΝ ΙΔΙΑΙΤΕΡΌΤΗΤΑ ΤΟΥ ΞΕΝΙΣΤΉ· ΚΑΙ 2) ΝΑ ΕΦΑΡΜΌΣΕΙ ΤΙΣ ΠΛΗΡΟΦΟΡΊΕΣ ΠΟΥ ΛΑΜΒΆΝΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΗ ΣΥΓΚΡΙΤΙΚΉ ΚΑΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΉ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΔΙΑΓΝΩΣΤΙΚΏΝ ΕΡΓΑΛΕΊΩΝ ΓΙΑ ΤΙΣ ΦΥΛΈΣ PPH ΚΑΙ ΤΟ ΑΝΑΔΥΌΜΕΝΟ ΑΠΟΜΟΝΩΜΈΝΟ PSV ΣΤΗ MANDEVILLA. ΟΙ ΕΙΔΙΚΟΊ ΣΤΌΧΟΙ ΕΊΝΑΙ: 1) ΕΚΧΩΡΉΣΤΕ ΈΝΑ PATOVAR ΣΕ ΣΤΕΛΈΧΗ P. SAVASTANOI ΠΟΥ ΑΠΟΜΟΝΏΝΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ M. SANDERI. 2) ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΑ ΚΑΙ ΚΑΤΑΓΡΑΦΉ ΓΟΝΙΔΙΩΜΆΤΩΝ ΑΝΤΙΠΡΟΣΩΠΕΥΤΙΚΏΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ PATOVARS ΚΑΙ ΦΥΛΏΝ P. SAVASTANOI. 3) ΕΚΤΕΛΈΣΤΕ ΜΙΑ ΣΥΓΚΡΙΤΙΚΉ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ ΚΑΙ ΜΙΑ ΦΥΛΟΓΕΝΕΤΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΩΝ ΠΑΘΟΓΌΝΩΝ PSV ΚΑΙ ΤΩΝ ΦΥΛΏΝ PPH. 4) ΜΕΛΈΤΗ ΤΗΣ ΒΙΟΛΟΓΊΑΣ ΚΑΙ ΤΟΥ ΡΌΛΟΥ ΣΤΗΝ ΙΔΙΑΙΤΕΡΌΤΗΤΑ ΤΟΥ ΞΕΝΙΣΤΉ ΤΟΥ PLASMAIDS ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΏΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ. 5) ΓΙΑ ΝΑ ΕΜΒΑΘΎΝΕΙ ΤΟ ΡΌΛΟ ΣΤΗΝ ΙΔΙΑΙΤΕΡΌΤΗΤΑ ΤΩΝ ΕΠΙΣΚΕΠΤΏΝ ΤΩΝ ΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ ΈΚΚΡΙΣΗΣ, ΤΩΝ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΆΤΩΝ ΤΟΥ ΣΥΣΤΉΜΑΤΟΣ ΈΚΚΡΙΣΗΣ ΤΎΠΟΥ ΙΙΙ ΚΑΙ, 6) ΆΛΛΩΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟΥ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑ. 7) ΓΙΑ ΝΑ ΜΕΛΕΤΉΣΕΙ ΤΟ ΡΌΛΟ ΤΗΣ GENIC ΈΚΦΡΑΣΗΣ ΣΤΗΝ ΙΔΙΑΙΤΕΡΌΤΗΤΑ ΤΩΝ ΕΠΙΣΚΕΠΤΏΝ. 8) ΑΝΑΠΤΎΣΣΟΥΝ ΕΙΔΙΚΆ ΔΙΑΓΝΩΣΤΙΚΆ ΕΡΓΑΛΕΊΑ ΓΙΑ ΤΑ ΑΠΟΜΟΝΩΜΈΝΑ ΣΤΕΛΈΧΗ MANDEVILLA ΚΑΙ ΤΙΣ ΦΥΛΈΣ PPH. (Greek)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    BAKTERIÁLNE CHOROBY RASTLÍN SPÔSOBUJÚ ZNAČNÉ HOSPODÁRSKE STRATY; ICH KONTROLA JE ZLOŽITÁ A OČAKÁVA SA, ŽE V BUDÚCNOSTI BUDE V DÔSLEDKU OBMEDZENÍ EÚ TÝKAJÚCICH SA POVOĽOVANIA ÚČINNÝCH LÁTOK, KTORÉ SÚ K DISPOZÍCII NA INTEGROVANÚ KONTROLU, ZLOŽITEJŠIA. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PRODUKUJE NÁDORY VZDUCHU V HOSTITEĽOVI, ČO SPÔSOBUJE JEDNU Z NAJDÔLEŽITEJŠÍCH OCHORENÍ OLÍV, AJ KEĎ JE TIEŽ PATOGÉNNA VO VEĽKOM POČTE RASTLINNÝCH DRUHOV. OKREM TOHO, PSV BOL NEDÁVNO ODHALENÝ AKO VZNIKAJÚCI PATOGÉN V OKRASNÝCH DRUHOCH MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) JE PATOGÉN HOSPODÁRSKEHO VÝZNAMU V JUDII A JEDEN Z NAJDÔLEŽITEJŠÍCH VÝSKUMNÝCH MODELOV V OBLASTI FYTOBAKTERIOLÓGIE. JEDNOU Z NAJŽIADANEJŠÍCH STRATÉGIÍ KONTROLY PPH JE POUŽITIE ODOLNÝCH ŽIDOVSKÝCH ODRÔD. IZOLÁTY PPH SA KLASIFIKUJÚ DO 9 PLEMIEN PODĽA ICH INTERAKCIÍ S 8 RÔZNYMI ŽIDOVSKÝMI ODRODAMI, ČO BOLO VYSVETLENÉ INTERAKCIOU 5 PÁROV VO VZŤAHU MEDZI GÉNOM A GENOM, HOCI JE MOŽNÉ DOSIAHNUŤ VÄČŠIU DIFERENCIÁCIU AŽ U 14 PLEMIEN. OBA PATOSYSTÉMY PONÚKAJÚ NEBÝVALÚ PRÍLEŽITOSŤ NA ŠTÚDIUM MOLEKULÁRNYCH ZÁKLADOV ŠPECIFÍK HOSTÍ. NA JEDNEJ STRANE, HOCI PPH JE GENETICKY HOMOGÉNNY PATOVAR, RÔZNE IZOLÁTY VYKAZUJÚ ROZDIELY V ICH VIRULENCII, ČO JE ASPEKT, KTORÝ ODRÁŽA ICH RASOVÚ ŠPECIFICKOSŤ. NA DRUHEJ STRANE RÔZNE PATOVARES P. SAVASTANOI VYVOLÁVAJÚ PODOBNÉ PRÍZNAKY (NÁDORY) V DREVITÝCH AJ BYLINNÝCH HOSTITEĽOCH. DOSTUPNOSŤ UZAVRETÝCH GENÓMOV KMEŇOV PPH 1448A A PSV NCPPB 3335, AKO AJ GENETICKÝCH A FUNKČNÝCH NÁSTROJOV VYVINUTÝCH POČAS REALIZÁCIE NAŠICH PREDCHÁDZAJÚCICH PROJEKTOV ROBIA TIETO BAKTÉRIE IDEÁLNYMI MODELMI PRE ANALÝZU ŠPECIFICKOSTI HOSTÍ A VÝVOJ VIRULENCIE. KOMPARATÍVNA A FUNKČNÁ GENOMICKÁ ANALÝZA FYLOGENETICKY PRÍBUZNÝCH BAKTERIÁLNYCH KMEŇOV TEDA UĽAHČÍ IDENTIFIKÁCIU DETERMINANTOV PATOGENITY NA ÚROVNI PATOVAR A PLEMENA. HLAVNÝMI CIEĽMI TOHTO PROJEKTU SÚ: 1) FUNKČNE IDENTIFIKOVAŤ A CHARAKTERIZOVAŤ ROZDIELY V SÚBORE VIRULENTNÝCH GÉNOV PSV PATOGÉNOV A PLEMIEN PPH SÚVISIACICH SO ŠPECIFICKOSŤOU HOSTITEĽA; A 2) APLIKOVAŤ INFORMÁCIE ZÍSKANÉ KOMPARATÍVNOU A FUNKČNOU GENOMIKOU NA VÝVOJ DIAGNOSTICKÝCH NÁSTROJOV PRE PLEMENÁ PPH A VZNIKAJÚCE IZOLOVANÉ PSV V MANDEVILLI. KONKRÉTNE CIELE SÚ: 1) PRIRADIŤ PATOVAR KMEŇOM P. SAVASTANOI IZOLOVANÝM Z M. SANDERI. 2) SEKVENCIA A ZÁZNAM GENÓMOV REPREZENTATÍVNYCH KMEŇOV PATOVARS A PLEMIEN P. SAVASTANOI. 3) VYKONAŤ POROVNÁVACIU GENOMICKÚ ANALÝZU A FYLOGENETICKÉ ANALÝZY PSV PATOVARS A PPH PLEMIEN. 4) ŠTUDOVAŤ BIOLÓGIU A ÚLOHU V ŠPECIFICKOSTI HOSTITEĽA PLASMAIDS TÝCHTO BAKTERIÁLNYCH KMEŇOV. 5) PREHĹBIŤ ÚLOHU V HOSŤOVSKEJ ŠPECIFICKOSTI SEKRÉČNÝCH SYSTÉMOV, EFEKTOROV SEKRÉČNÉHO SYSTÉMU TYPU III A 6) INÝCH VIRULENČNÝCH FAKTOROV. 7) ŠTUDOVAŤ ÚLOHU GÉNOVÉHO PREJAVU V ŠPECIFICKOSTI HOSTÍ. 8) VYVINÚŤ ŠPECIFICKÉ DIAGNOSTICKÉ NÁSTROJE PRE MANDEVILLA IZOLÁTY A PPH PLEMENÁ. (Slovak)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    KASVIEN BAKTEERITAUDIT AIHEUTTAVAT MERKITTÄVIÄ TALOUDELLISIA TAPPIOITA; NIIDEN VALVONTA ON VAIKEAA, JA SEN ODOTETAAN TULEVAISUUDESSA OLEVAN VAIKEAMPAA, KOSKA EU:SSA ON RAJOITUKSIA SELLAISTEN TEHOAINEIDEN HYVÄKSYNNÄLLE, JOTKA OVAT SAATAVILLA YHDENNETTYYN VALVONTAAN. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) TUOTTAA ILMAN KASVAIMIA ISÄNTÄ, AIHEUTTAA YKSI TÄRKEIMMISTÄ OLIIVIN TAUTEJA, VAIKKA SE ON MYÖS PATOGEENINEN MONISSA KASVILAJEISSA. LISÄKSI PSV ON ÄSKETTÄIN PALJASTUNUT NOUSEVAKSI TAUDINAIHEUTTAJAKSI KORISTELAJISSA MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) ON TALOUDELLISESTI TÄRKEÄ TAUDINAIHEUTTAJA JUDIASSA JA YKSI MERKITTÄVIMMISTÄ TUTKIMUSMALLEISTA FYTOBAKTERIOLOGIASSA. YKSI TOIVOTTAVIMMISTA PPH-VALVONTASTRATEGIOISTA ON VASTUSTUSKYKYISTEN JUUTALAISTEN LAJIKKEIDEN KÄYTTÖ. PPH-ISOLAATIT LUOKITELLAAN YHDEKSÄÄN ROTUUN NIIDEN VUOROVAIKUTUKSEN MUKAAN 8 ERI JUUTALAISLAJIKKEEN KANSSA, JOTKA ON SELITETTY 5 PARIN VUOROVAIKUTUKSELLA GEENI-GEN-SUHTEESSA, VAIKKA ON MAHDOLLISTA TEHDÄ SUUREMPI EROTTELU JOPA 14 RODUSSA. MOLEMMAT PATOJÄRJESTELMÄT TARJOAVAT ENNENNÄKEMÄTTÖMÄN MAHDOLLISUUDEN TUTKIA VIERAIDEN SPESIFISYYDEN MOLEKYYLIPOHJAA. YHTÄÄLTÄ, VAIKKA PPH ON GENEETTISESTI HOMOGEENINEN PATOVAR, ERI ISOLAATTIEN VIRULENSSI ON ERILAINEN, MIKÄ KUVASTAA NIIDEN ROTUSPESIFISYYTTÄ. TOISAALTA, ERI PATOVARES P. SAVASTANOI AIHEUTTAA SAMANLAISIA OIREITA (KASVAIMIA) SEKÄ WOODY JA RUOHO ISÄNNÄT. PPH 1448A- JA PSV NCPPB 3335 -KANTOJEN SULJETTUJEN GENOMIEN SAATAVUUS SEKÄ AIEMPIEN PROJEKTIEMME AIKANA KEHITETYT GENEETTISET JA TOIMINNALLISET TYÖKALUT TEKEVÄT NÄISTÄ BAKTEEREISTA IHANTEELLISIA MALLEJA VIERASSPESIFISYYDEN JA VIRULENSSIN KEHITTYMISEN ANALYSOINTIIN. NÄIN OLLEN FYLOGENEETTISESTI SAMANKALTAISTEN BAKTEERIKANTOJEN VERTAILEVA JA TOIMINNALLINEN GENOMIANALYYSI HELPOTTAA PATOGEENISUUDEN TAUSTATEKIJÖIDEN TUNNISTAMISTA PATOVAR- JA ROTUTASOLLA. HANKKEEN PÄÄTAVOITTEET OVAT SEURAAVAT: 1) TUNNISTAA JA LUONNEHTIA TOIMINNALLISESTI EROT PSV-PATOVAREIDEN JA PPH-ROTUJEN VIRULENSSIGEENEISSÄ, JOTKA LIITTYVÄT ISÄNTÄSPESIFISYYTEEN; JA 2) SOVELTAA VERTAILEVALLA JA TOIMINNALLISELLA GENOMILLA SAATUJA TIETOJA PPH-ROTUJEN DIAGNOSTISTEN TYÖKALUJEN JA MANDEVILLASSA KEHITTYVÄN ERILLISEN PSV:N KEHITTÄMISEKSI. ERITYISTAVOITTEET OVAT SEURAAVAT: 1) ANTAA PATOVAR P. SAVASTANOI KANTOJA ERISTETTY M. SANDERI. 2) SEKVENSSI JA TALLENTAA EDUSTAVIA KANTOJA PATOVARS JA ROTUJEN P. SAVASTANOI. 3) SUORITA VERTAILEVA GENOMIANALYYSI JA FYLOGENEETTINEN ANALYYSI PSV-PATOVAREISTA JA PPH-RODUISTA. 4) TUTKIA BIOLOGIAN JA ROOLIN SPESIFISYYS ISÄNTÄ PLASMAIDS NÄIDEN BAKTEERIKANTOJEN. 5) SYVENTÄÄ ERITYSJÄRJESTELMIEN VIERASSPESIFISYYTTÄ, TYYPIN III ERITYSJÄRJESTELMÄN VAIKUTTAJIA JA 6) MUITA VIRULENSSITEKIJÖITÄ. 7) TUTKIA GEENISEN ILMENTYMÄN ROOLIA VIERAIDEN SPESIFISYYDESSÄ. 8) KEHITTÄÄ ERITYISIÄ DIAGNOSTISIA TYÖKALUJA MANDEVILLA ISOLAATTEJA JA PPH ROTUJA. (Finnish)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    CHOROBY BAKTERYJNE ROŚLIN POWODUJĄ ZNACZNE STRATY EKONOMICZNE; ICH KONTROLA JEST TRUDNA I OCZEKUJE SIĘ, ŻE BĘDZIE ONA W PRZYSZŁOŚCI TRUDNIEJSZA ZE WZGLĘDU NA OGRANICZENIA UE W ZAKRESIE ZATWIERDZANIA SUBSTANCJI CZYNNYCH DOSTĘPNYCH DO ZINTEGROWANEJ KONTROLI. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PRODUKUJE NOWOTWORY POWIETRZA U GOSPODARZA, POWODUJĄC JEDNĄ Z NAJWAŻNIEJSZYCH CHORÓB OLIWEK, CHOĆ JEST RÓWNIEŻ PATOGENNY W DUŻEJ LICZBIE GATUNKÓW ROŚLIN. PONADTO PSV ZOSTAŁ NIEDAWNO UJAWNIONY JAKO POJAWIAJĄCY SIĘ PATOGEN W GATUNKACH OZDOBNYCH MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) JEST PATOGENEM O ZNACZENIU EKONOMICZNYM W JUDII I JEDNYM Z NAJISTOTNIEJSZYCH MODELI BADAWCZYCH W FITOBAKTERIOLOGII. JEDNĄ Z NAJBARDZIEJ POŻĄDANYCH STRATEGII KONTROLI PPH JEST STOSOWANIE ODPORNYCH ODMIAN ŻYDOWSKICH. IZOLATY PPH SĄ KLASYFIKOWANE NA 9 RAS WEDŁUG ICH INTERAKCJI Z 8 RÓŻNYMI ODMIANAMI ŻYDOWSKIMI, KTÓRE ZOSTAŁY WYJAŚNIONE PRZEZ INTERAKCJĘ 5 PAR W RELACJI GEN-TO-GEN, CHOCIAŻ MOŻLIWE JEST WIĘKSZE ZRÓŻNICOWANIE W MAKSYMALNIE 14 RASACH. OBA PATOSYSTEMY OFERUJĄ BEZPRECEDENSOWĄ OKAZJĘ DO STUDIOWANIA MOLEKULARNYCH PODSTAW SPECYFIKI GOŚCIA. Z JEDNEJ STRONY, CHOCIAŻ PPH JEST GENETYCZNIE JEDNORODNYM PATOVAREM, RÓŻNE IZOLATY WYKAZUJĄ RÓŻNICE W ICH ZJADLIWOŚCI, CO ODZWIERCIEDLA ICH SPECYFIKĘ RASOWĄ. Z DRUGIEJ STRONY, RÓŻNE PATOVARES P. SAVASTANOI WYWOŁYWAĆ PODOBNE OBJAWY (NOWOTWORY) ZARÓWNO U GOSPODARZY DRZEWIASTYCH I ZIELNYCH. DOSTĘPNOŚĆ ZAMKNIĘTYCH GENOMÓW SZCZEPÓW PPH 1448A I PSV NCPPB 3335, A TAKŻE NARZĘDZI GENETYCZNYCH I FUNKCJONALNYCH OPRACOWANYCH PODCZAS REALIZACJI NASZYCH POPRZEDNICH PROJEKTÓW, SPRAWIAJĄ, ŻE TE BAKTERIE SĄ IDEALNE DO ANALIZY SPECYFIKI GOŚCIA I EWOLUCJI ZJADLIWOŚCI. W TEN SPOSÓB PORÓWNAWCZA I FUNKCJONALNA ANALIZA GENOMOWA SZCZEPÓW BAKTERII ZWIĄZANYCH FILOGENETYCZNIE UŁATWI IDENTYFIKACJĘ CZYNNIKÓW CHOROBOTWÓRCZYCH NA POZIOMIE PATOVAR I RASY. GŁÓWNE CELE TEGO PROJEKTU TO: 1) FUNKCJONALNIE ZIDENTYFIKOWAĆ I SCHARAKTERYZOWAĆ RÓŻNICE W ZESTAWIE GENÓW ZJADLIWOŚCI PATOWARÓW PSV I RAS PPH ZWIĄZANYCH ZE SPECYFIKĄ ŻYWICIELA; ORAZ 2) ZASTOSOWAĆ INFORMACJE UZYSKANE ZA POMOCĄ GENOMU PORÓWNAWCZEGO I FUNKCJONALNEGO W CELU OPRACOWANIA NARZĘDZI DIAGNOSTYCZNYCH DLA RAS PPH I POWSTAJĄCEGO IZOLOWANEGO PSV W MANDEVILLA. CELE SZCZEGÓŁOWE TO: 1) PRZYPISAĆ PATOVAR DO SZCZEPÓW P. SAVASTANOI WYIZOLOWANYCH Z M. SANDERI. 2) SEKWENCJA I ZAPIS GENOMÓW REPREZENTATYWNYCH SZCZEPÓW PATOVARS I RAS P. SAVASTANOI. 3) PRZEPROWADZIĆ ANALIZĘ GENOMOWĄ PORÓWNAWCZĄ I ANALIZĘ FILOGENETYCZNĄ PATOWARÓW PSV I RAS PPH. 4) ZBADAĆ BIOLOGIĘ I ROLĘ W SWOISTOŚCI GOSPODARZA PLASMAIDS TYCH SZCZEPÓW BAKTERYJNYCH. 5) DO POGŁĘBIENIA ROLI W SPECYFICE GOŚCIA SYSTEMÓW WYDZIELANIA, EFEKTORÓW SYSTEMU WYDZIELANIA TYPU III I 6) INNYCH CZYNNIKÓW ZJADLIWOŚCI. 7) STUDIOWAĆ ROLĘ EKSPRESJI GENETYCZNEJ W SWOISTOŚCI GOŚCI. 8) OPRACOWANIE SPECJALNYCH NARZĘDZI DIAGNOSTYCZNYCH DLA IZOLATÓW MANDEVILLA I RAS PPH. (Polish)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    A NÖVÉNYEK BAKTERIÁLIS BETEGSÉGEI JELENTŐS GAZDASÁGI VESZTESÉGEKET OKOZNAK; ELLENŐRZÉSÜK NEHÉZ, ÉS A JÖVŐBEN VÁRHATÓAN NEHEZEBB LESZ AZ INTEGRÁLT ELLENŐRZÉS CÉLJÁRA RENDELKEZÉSRE ÁLLÓ HATÓANYAGOK ENGEDÉLYEZÉSÉRE VONATKOZÓ UNIÓS KORLÁTOZÁSOK MIATT. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. A SAVASTANOI (PSV) LÉGDAGANATOKAT TERMEL A GAZDASZERVEZETBEN, AMI AZ EGYIK LEGFONTOSABB OLAJBOGYÓ-BETEGSÉGET OKOZZA, BÁR SZÁMOS NÖVÉNYFAJ KÓROKOZÓJA IS. EZENKÍVÜL A KÖZELMÚLTBAN A MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA) DÍSZFAJBAN ÚJONNAN MEGJELENŐ KÓROKOZÓKÉNT MUTATTÁK KI A PSV-T. P. SAVASTANOI PV. A PHASEOLICOLA (PPH) A JÚDIÁBAN GAZDASÁGI JELENTŐSÉGŰ KÓROKOZÓ, ÉS A FITOBAKTERIOLÓGIA EGYIK LEGRELEVÁNSABB KUTATÁSI MODELLJE. AZ EGYIK LEGKÍVÁNATOSABB PPH ELLENŐRZÉSI STRATÉGIA A REZISZTENS ZSIDÓ FAJTÁK HASZNÁLATA. A PPH IZOLÁTUMOKAT 9 FAJTÁBA SOROLJÁK A 8 KÜLÖNBÖZŐ ZSIDÓ FAJTÁVAL VALÓ KÖLCSÖNHATÁSUK ALAPJÁN, AMELYEKET A GÉN-GEN KAPCSOLAT 5 PÁRJÁNAK KÖLCSÖNHATÁSÁVAL MAGYARÁZTAK, BÁR LEHETŐSÉG VAN ARRA, HOGY AKÁR 14 FAJTÁNÁL NAGYOBB KÜLÖNBSÉGET TEGYENEK. MINDKÉT PATORENDSZER PÉLDÁTLAN LEHETŐSÉGET KÍNÁL A VENDÉGSPECIFIKUSSÁG MOLEKULÁRIS ALAPJAINAK TANULMÁNYOZÁSÁRA. EGYRÉSZT, BÁR A PPH GENETIKAILAG HOMOGÉN PATOVAR, A KÜLÖNBÖZŐ IZOLÁTUMOK KÜLÖNBÖZŐ VIRULENCIÁT MUTATNAK, AMI A FAJSPECIFIKUSSÁGUKAT TÜKRÖZI. MÁSRÉSZT A P. SAVASTANOI KÜLÖNBÖZŐ PATOVARES-JAI HASONLÓ TÜNETEKET (TUMOROKAT) IDÉZNEK ELŐ MIND FÁS, MIND LÁGYSZÁRÚ GAZDAÁLLATOKNÁL. A PPH 1448A ÉS PSV NCPPB 3335 TÖRZSEK ZÁRT GENOMJAINAK, VALAMINT A KORÁBBI PROJEKTJEINK VÉGREHAJTÁSA SORÁN KIFEJLESZTETT GENETIKAI ÉS FUNKCIONÁLIS ESZKÖZÖKNEK KÖSZÖNHETŐEN EZEK A BAKTÉRIUMOK IDEÁLIS MODELLEK A VENDÉGSPECIFIKUSSÁG ÉS A VIRULENCIA ALAKULÁSÁNAK ELEMZÉSÉHEZ. ÍGY A FILOGENETIKAILAG ROKON BAKTÉRIUMTÖRZSEK ÖSSZEHASONLÍTÓ ÉS FUNKCIONÁLIS GENOMIKUS ELEMZÉSE MEGKÖNNYÍTI A PATOGENITÁST MEGHATÁROZÓ TÉNYEZŐK AZONOSÍTÁSÁT A PATOVAR ÉS A FAJTA SZINTJÉN. A PROJEKT FŐ CÉLKITŰZÉSEI A KÖVETKEZŐK: 1) FUNKCIONÁLISAN AZONOSÍTSA ÉS JELLEMEZZE A PSV PATOVARS ÉS PPH FAJTÁK VIRULENCIA GÉNJEINEK KÜLÖNBSÉGEIT A GAZDASZERVEZET SPECIFIKUSSÁGÁVAL KAPCSOLATBAN; ÉS 2) ALKALMAZZA AZ ÖSSZEHASONLÍTÓ ÉS FUNKCIONÁLIS GENOMIKA ÁLTAL NYERT INFORMÁCIÓKAT A PPH FAJTÁK DIAGNOSZTIKAI ESZKÖZEINEK ÉS A MANDEVILLA ÚJONNAN MEGJELENŐ IZOLÁLT PSV-NEK A KIFEJLESZTÉSÉHEZ. A KONKRÉT CÉLKITŰZÉSEK A KÖVETKEZŐK: 1) RENDELJEN PATOVAR-T AZ M. SANDERI-BŐL IZOLÁLT P. SAVASTANOI TÖRZSEKHEZ. 2) A PATOVARS REPREZENTATÍV TÖRZSEINEK ÉS A P. SAVASTANOI FAJTÁINAK SZEKVENCIÁJA ÉS NYILVÁNTARTÁSA. 3) VÉGEZZEN ÖSSZEHASONLÍTÓ GENOMIKAI ELEMZÉST ÉS FILOGENETIKAI ELEMZÉST A PSV PATOVARS ÉS PPH FAJTÁKRÓL. 4) TANULMÁNYOZZA EZEKNEK A BAKTERIÁLIS TÖRZSEKNEK A PLASMAIDS GAZDASZERVEZETÉNEK BIOLÓGIÁJÁT ÉS SZEREPÉT. 5) A SZEKRÉCIÓS RENDSZEREK, A III-AS TÍPUSÚ SZEKRÉCIÓS RENDSZER ÉS 6) EGYÉB VIRULENCIA FAKTOROK VENDÉGSPECIFIKUSSÁGÁNAK ELMÉLYÍTÉSÉRE. 7) TANULMÁNYOZZA A GÉN KIFEJEZÉS SZEREPÉT A VENDÉGEK SAJÁTOSSÁGAIBAN. 8) SPECIÁLIS DIAGNOSZTIKAI ESZKÖZÖK KIFEJLESZTÉSE MANDEVILLA IZOLÁTUMOK ÉS PPH FAJTÁK SZÁMÁRA. (Hungarian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    BAKTERIÁLNÍ CHOROBY ROSTLIN ZPŮSOBUJÍ VÝZNAMNÉ EKONOMICKÉ ZTRÁTY; JEJICH KONTROLA JE OBTÍŽNÁ A OČEKÁVÁ SE, ŽE V BUDOUCNU BUDE OBTÍŽNĚJŠÍ VZHLEDEM K OMEZENÍM EU TÝKAJÍCÍM SE POVOLOVÁNÍ ÚČINNÝCH LÁTEK, KTERÉ JSOU K DISPOZICI PRO INTEGROVANOU KONTROLU. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PRODUKUJE V HOSTITELI NÁDORY VZDUCHU, COŽ ZPŮSOBUJE JEDNO Z NEJDŮLEŽITĚJŠÍCH ONEMOCNĚNÍ OLIV, I KDYŽ JE TAKÉ PATOGENNÍ U VELKÉHO POČTU ROSTLINNÝCH DRUHŮ. KROMĚ TOHO BYL PSV NEDÁVNO ODHALEN JAKO NOVĚ VZNIKAJÍCÍ PATOGEN U OKRASNÝCH DRUHŮ MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) JE PATOGEN EKONOMICKÉHO VÝZNAMU V JUDII A JEDEN Z NEJVÝZNAMNĚJŠÍCH VÝZKUMNÝCH MODELŮ V OBLASTI FYTOBAKTERIOLOGIE. JEDNOU Z NEJŽÁDANĚJŠÍCH STRATEGIÍ KONTROLY PPH JE POUŽITÍ ODOLNÝCH ŽIDOVSKÝCH ODRŮD. PPH IZOLÁTY JSOU ROZDĚLENY DO 9 PLEMEN PODLE JEJICH INTERAKCÍ S 8 RŮZNÝMI ŽIDOVSKÝMI ODRŮDAMI, KTERÉ BYLY VYSVĚTLENY INTERAKCÍ 5 PÁRŮ VE VZTAHU GEN-GEN, I KDYŽ JE MOŽNÉ PROVÉST VĚTŠÍ DIFERENCIACI AŽ U 14 PLEMEN. OBA PATOSYSTÉMY NABÍZEJÍ NEBÝVALOU PŘÍLEŽITOST STUDOVAT MOLEKULÁRNÍ ZÁKLADY SPECIFIČNOSTI HOSTA. NA JEDNÉ STRANĚ, AČKOLI PPH JE GENETICKY HOMOGENNÍ PATOVAR, RŮZNÉ IZOLÁTY VYKAZUJÍ ROZDÍLY V JEJICH VIRULENCI, COŽ JE ASPEKT, KTERÝ ODRÁŽÍ JEJICH RASOVOU SPECIFIČNOST. NA DRUHÉ STRANĚ RŮZNÉ PATOVARES P. SAVASTANOI VYVOLÁVAJÍ PODOBNÉ PŘÍZNAKY (NÁDORY) JAK U DŘEVNATÝCH, TAK U BYLINNÝCH HOSTITELŮ. DOSTUPNOST UZAVŘENÝCH GENOMŮ KMENŮ PPH 1448A A PSV NCPPB 3335, STEJNĚ JAKO GENETICKÉ A FUNKČNÍ NÁSTROJE VYVINUTÉ BĚHEM REALIZACE NAŠICH PŘEDCHOZÍCH PROJEKTŮ, ČINÍ TYTO BAKTERIE IDEÁLNÍMI MODELY PRO ANALÝZU SPECIFIČNOSTI HOSTŮ A EVOLUCI VIRULENCE. SROVNÁVACÍ A FUNKČNÍ GENOMOVÁ ANALÝZA FYLOGENETICKY PŘÍBUZNÝCH BAKTERIÁLNÍCH KMENŮ TAK USNADNÍ IDENTIFIKACI DETERMINANT PATOGENITY NA ÚROVNI PATOVAR A PLEMENE. HLAVNÍMI CÍLI TOHOTO PROJEKTU JSOU: 1) FUNKČNĚ IDENTIFIKOVAT A CHARAKTERIZOVAT ROZDÍLY V SOUBORU VIRULENČNÍCH GENŮ PSV PATOVARS A PPH PLEMEN SOUVISEJÍCÍCH S HOSTITELSKOU SPECIFICITOU; A 2) APLIKUJTE INFORMACE ZÍSKANÉ SROVNÁVACÍM A FUNKČNÍM GENOMEM PRO VÝVOJ DIAGNOSTICKÝCH NÁSTROJŮ PRO PLEMENA PPH A VZNIKAJÍCÍ IZOLOVANÉ PSV V MANDEVILLE. KONKRÉTNÍMI CÍLI JSOU: 1) PŘIŘADIT PATOVAR KMENŮM P. SAVASTANOI IZOLOVANÝM Z M. SANDERI. 2) SEKVENCE A ZÁZNAM GENOMŮ REPREZENTATIVNÍCH KMENŮ PATOVARS A PLEMEN P. SAVASTANOI. 3) PROVÉST SROVNÁVACÍ GENOMOVOU ANALÝZU A FYLOGENETICKOU ANALÝZU PSV PATOVARŮ A PPH PLEMEN. 4) STUDOVAT BIOLOGII A ROLI VE SPECIFIČNOSTI HOSTITELE PLASMAIDS TĚCHTO BAKTERIÁLNÍCH KMENŮ. 5) PROHLOUBIT ROLI V HOSTOVĚ SPECIFIČNOSTI SEKREČNÍCH SYSTÉMŮ, EFEKTORŮ SEKREČNÍHO SYSTÉMU TYPU III A 6) DALŠÍCH FAKTORŮ VIRULENCE. 7) STUDOVAT ROLI GENOVÉ EXPRESE VE SPECIFIČNOSTI HOSTŮ. 8) VYVINOUT SPECIFICKÉ DIAGNOSTICKÉ NÁSTROJE PRO IZOLÁTY MANDEVILLA A PPH PLEMENA. (Czech)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    BAKTERIĀLAS AUGU SLIMĪBAS RADA IEVĒROJAMUS EKONOMISKUS ZAUDĒJUMUS; TO KONTROLE IR SAREŽĢĪTA, UN PAREDZAMS, KA NĀKOTNĒ TĀ BŪS SAREŽĢĪTĀKA, ŅEMOT VĒRĀ ES IEROBEŽOJUMUS ATTIECĪBĀ UZ TĀDU AKTĪVO VIELU ATĻAUŠANU, KURAS IR PIEEJAMAS INTEGRĒTAI KONTROLEI. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVATANOI (PSV) RAŽO GAISA AUDZĒJUS SAIMNIEKORGANISMĀ, IZRAISOT VIENU NO SVARĪGĀKAJĀM OLĪVU SLIMĪBĀM, LAI GAN TAS IR PATOGĒNS DAUDZĀS AUGU SUGĀS. TURKLĀT PSV NESEN TIKA ATKLĀTS KĀ JAUNS PATOGĒNS DEKORATĪVAJĀS SUGĀS MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVATANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) IR EKONOMISKI NOZĪMĪGS PATOGĒNS JUDIJĀ UN VIENS NO SVARĪGĀKAJIEM PĒTĪJUMU MODEĻIEM FITOBAKTERIOLOĢIJĀ. VIENA NO VĒLAMĀKAJĀM PPH KONTROLES STRATĒĢIJĀM IR REZISTENTU EBREJU ŠĶIRŅU IZMANTOŠANA. PPH IZOLĀTI TIEK IEDALĪTI 9 ŠĶIRNĒS ATKARĪBĀ NO TO MIJIEDARBĪBAS AR 8 DAŽĀDĀM EBREJU ŠĶIRNĒM, KAS IR IZSKAIDROTAS AR 5 PĀRU MIJIEDARBĪBU GĒNU UN GENU ATTIECĪBĀS, LAI GAN IR IESPĒJAMS VEIKT LIELĀKU DIFERENCIĀCIJU LĪDZ 14 ŠĶIRNĒM. ABAS PATOSISTĒMAS PIEDĀVĀ VĒL NEBIJUŠU IESPĒJU IZPĒTĪT VIESU SPECIFISKUMA MOLEKULĀRĀS BĀZES. NO VIENAS PUSES, LAI GAN PPH IR ĢENĒTISKI VIENDABĪGS PATOVAR, DAŽĀDIE IZOLĀTI UZRĀDA ATŠĶIRĪBAS VIRULENCĒ, KAS ATSPOGUĻO TO RASES SPECIFIKU. NO OTRAS PUSES, DAŽĀDIE P. SAVATANOI PATOVARES IZRAISA LĪDZĪGUS SIMPTOMUS (AUDZĒJUS) GAN KOKSNES, GAN ZĀLAUGU SAIMNIEKAUGOS. PPH 1448A UN PSV NCPPB 3335 CELMU SLĒGTO GENOMU PIEEJAMĪBA, KĀ ARĪ MŪSU IEPRIEKŠĒJO PROJEKTU ĪSTENOŠANAS LAIKĀ IZSTRĀDĀTIE ĢENĒTISKIE UN FUNKCIONĀLIE RĪKI PADARA ŠĪS BAKTĒRIJAS IDEĀLUS MODEĻUS VIESU SPECIFISKUMA ANALĪZEI UN VIRULENCES EVOLŪCIJAI. TĀDĒJĀDI FITONĒTISKI SAISTĪTU BAKTĒRIJU CELMU SALĪDZINOŠĀ UN FUNKCIONĀLĀ GENOMISKĀ ANALĪZE ATVIEGLOS PATOGENITĀTES NOTEICOŠO FAKTORU IDENTIFICĒŠANU PATOVAR UN ŠĶIRNES LĪMENĪ. ŠĀ PROJEKTA GALVENIE MĒRĶI IR ŠĀDI: 1) FUNKCIONĀLI IDENTIFICĒT UN RAKSTUROT ATŠĶIRĪBAS PSV PATOVARU UN PPH ŠĶIRŅU VIRULENCES GĒNU KOPUMĀ, KAS SAISTĪTAS AR SAIMNIEKORGANISMA SPECIFIKU; UN 2) IZMANTOT INFORMĀCIJU, KAS IEGŪTA, IZMANTOJOT SALĪDZINOŠO UN FUNKCIONĀLO GENOMIKU, LAI IZSTRĀDĀTU DIAGNOSTIKAS INSTRUMENTUS PPH ŠĶIRNĒM UN TOPOŠAJAM IZOLĒTAJAM PSV MANDEVILLA. KONKRĒTIE MĒRĶI IR ŠĀDI: 1) PIEŠĶIR PATOVAR P. SAVATANOI CELMIEM, KAS IZOLĒTI NO M. SANDERI. 2) PATOVARS UN P. SAVASTANOI ŠĶIRŅU REPREZENTATĪVO CELMU SECĪBA UN IERAKSTS GENOMI. 3) VEIC SALĪDZINOŠO GENOMISKO ANALĪZI UN PSV PATOVARU UN PPH ŠĶIRŅU FILOGĒNISKO ANALĪZI. 4) PĒTA ŠO BAKTĒRIJU CELMU BIOLOĢIJU UN LOMU PLASMAIDS SAIMNIEKORGANISMA ĪPATNĪBĀ. 5) PADZIĻINĀT SEKRĒCIJAS SISTĒMU, III TIPA SEKRĒCIJAS SISTĒMAS EFEKTORU UN 6) CITU VIRULENCES FAKTORU LOMU VIESU SPECIFISKUMĀ. 7) IZPĒTĪT ĢENĒZES IZTEIKSMES LOMU VIESU ĪPATNĪBĀ. 8) IZSTRĀDĀT ĪPAŠUS DIAGNOSTIKAS INSTRUMENTUS MANDEVILLA IZOLĀTIEM UN PPH ŠĶIRNĒM. (Latvian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    TÁ GALAIR BHAICTÉARACHA PLANDAÍ INA GCÚIS LE CAILLTEANAIS SHUNTASACHA EACNAMAÍOCHA; TÁ SÉ DEACAIR IAD A RIALÚ, AGUS MEASTAR GO MBEIDH SÉ NÍOS DEACRA AMACH ANSEO MAR GHEALL AR SHRIANTA AE MAIDIR LE HÚDARÚ SUBSTAINTÍ GNÍOMHACHA ATÁ AR FÁIL LE HAGHAIDH RIALÚ COMHTHÁITE. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. TÁIRGEANN SAVASTANOI (PSV) SIADAÍ AEIR SA ÓSTACH, RUD A FHÁGANN GO BHFUIL SÉ AR CHEANN DE NA GALAIR OLÓIGE IS TÁBHACHTAÍ, CÉ GO BHFUIL SÉ PATAIGINEACH FREISIN I LÍON MÓR SPEICEAS PLANDAÍ. INA THEANNTA SIN, LÉIRÍODH PSV LE DÉANAÍ MAR PHATAIGIN ATÁ AG TEACHT CHUN CINN SA SPEICEAS ORNÁIDEACH MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. IS PATAIGIN DE THÁBHACHT EACNAMAÍOCH É PHASEOLICOLA (PPH) I JUDIA AGUS CEANN DE NA SAMHLACHA TAIGHDE IS ÁBHARTHA I PHYTOBACTERIOLOGY. CEANN DE NA STRAITÉISÍ RIALAITHE PPH IS INMHIANAITHE NÁ ÚSÁID A BHAINT AS CINEÁLACHA GIÚDACH RESISTANT. DÉANTAR AONRAÍ PPH A AICMIÚ I BPÓRTHA 9 DE RÉIR A N-IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ LE 8 CINEÁLACHA GIÚDACHA ÉAGSÚLA, A MÍNÍODH AG IDIRGHNÍOMHÚ PÉIRÍ 5 I GCAIDREAMH GÉIN-GO-GEN, CÉ GUR FÉIDIR IDIRDHEALÚ NÍOS MÓ A DHÉANAMH I SUAS LE 14 PÓRTHA. TUGANN AN DÁ PATHOSYSTEMS DEIS GAN FASACH CHUN STAIDÉAR A DHÉANAMH AR BHUNÁITEANNA MÓILÍNEACHA SAINIÚLACHT AOI. AR THAOBH AMHÁIN, CÉ GO BHFUIL PPH A PATOVAR GÉINITEACH AONCHINEÁLACH, LÉIRÍONN NA ISOLATES ÉAGSÚLA DIFRÍOCHTAÍ INA N-VIRULENCE, GNÉ A LÉIRÍONN A SAINIÚLACHT CINE. AR AN LÁIMH EILE, SPREAGANN PATOVARES ÉAGSÚLA P. SAVASTANOI COMHARTHAÍ DEN CHINEÁL CÉANNA (MEALLAIGH) I HÓSTACH WOODY AGUS LUIBHEACHA ARAON. INFHAIGHTEACHT NA GENOMES DÚNTA AN PPH 1448A AGUS PSV NCPPB 3335 TRÉITHCHINEÁLACHA, CHOMH MAITH LEIS NA HUIRLISÍ GÉINITEACHA AGUS FEIDHMIÚIL A FORBRAÍODH LE LINN FHORGHNÍOMHÚ ÁR DTIONSCADAIL ROIMHE SEO, A DHÉANAMH AR NA SAMHLACHA BAICTÉIR IDÉALACH CHUN ANAILÍS AOI-SAINIÚLACHT AGUS AN ÉABHLÓID VIRULENCE. DÁ BHRÍ SIN, ÉASCÓIDH AN ANAILÍS CHOMPARÁIDEACH AGUS FHEIDHMIÚIL GHÉANÓMAÍOCH AR THRÉITHCHINEÁLACHA BAICTÉARACHA A BHAINEANN LE FYLOGENETICALLY SAINAITHINT DEITÉARMANANT PATAIGINEACHTA AR LEIBHÉAL PATOVAR AGUS AR LEIBHÉAL PÓIR. IS IAD SEO A LEANAS PRÍOMHCHUSPÓIRÍ AN TIONSCADAIL SEO: 1) DIFRÍOCHTAÍ A AITHINT AGUS A THRÉITHRIÚ GO FEIDHMIÚIL I SRAITH NA NGÉINTE VIRULENCE DE PATHOVARS PSV AGUS PÓRTHA PPH A BHAINEANN LE SAINIÚLACHT ÓSTACH; AGUS 2) AN FHAISNÉIS A FHAIGHTEAR TRÍ GHÉANÓMAÍOCHT CHOMPARÁIDEACH AGUS FEIDHMIÚIL A CHUR I BHFEIDHM CHUN UIRLISÍ DIAGNÓISEACHA A FHORBAIRT DO PHÓRTHA PPH AGUS DON PSV SCOITE AMACH I MANDEVILLA. IS IAD SEO A LEANAS NA CUSPÓIRÍ SONRACHA: 1) PATOVAR A SHANNADH DO P. SAVASTANOI TRÉITHCHINEÁLACHA SCOITE AMACH Ó M. SANDERI. 2) GENOMES DE THRÉITHCHINEÁLACHA IONADAÍOCHA PATOVARS AGUS PÓRTHA DE P. SAVASTANOI A SHEICHEAMH AGUS A THAIFEADADH. 3) ANAILÍS GHÉANÓMAÍOCH CHOMPARÁIDEACH A DHÉANAMH AGUS ANAILÍS PHYLOGENETIC A DHÉANAMH AR CHONAIRÍ PSV AGUS PÓRTHA PPH. 4) STAIDÉAR A DHÉANAMH AR AN MBITHEOLAÍOCHT AGUS AR AN RÓL I SAINIÚLACHT ÓSTACH PLASMAIDS NA TRÉITHCHINEÁLACHA BAICTÉARACHA SEO. 5) AN RÓL I SAINIÚLACHT AOI NA GCÓRAS SECRETION A DHOIMHNIÚ, ÉIFEACHTAÍ AN CHÓRAIS SECRETION CINEÁL III AGUS, 6) FACHTÓIRÍ NIMHNEACHTA EILE. 7) CHUN STAIDÉAR A DHÉANAMH AR RÓL AN LÉIRITHE GENIC I SAINIÚLACHT NA N-AÍONNA. 8) UIRLISÍ DIAGNÓISEACHA SONRACHA A FHORBAIRT LE HAGHAIDH AONRAITHE MANDEVILLA AGUS PÓRTHA PPH. (Irish)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    BAKTERIJSKE BOLEZNI RASTLIN POVZROČAJO ZNATNE GOSPODARSKE IZGUBE; NADZOR NAD NJIMI JE TEŽAVEN IN PRIČAKUJE SE, DA BO V PRIHODNOSTI TEŽJE ZARADI OMEJITEV EU GLEDE REGISTRACIJE AKTIVNIH SNOVI, KI SO NA VOLJO ZA INTEGRIRAN NADZOR. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PROIZVAJA ZRAČNE TUMORJE V GOSTITELJU, KAR POVZROČA ENO NAJPOMEMBNEJŠIH OLJČNIH BOLEZNI, ČEPRAV JE TUDI PATOGEN PRI VELIKEM ŠTEVILU RASTLINSKIH VRST. POLEG TEGA JE BIL PSV NEDAVNO RAZKRIT KOT NASTAJAJOČI PATOGEN PRI OKRASNI VRSTI MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) JE PATOGEN GOSPODARSKEGA POMENA V JUDIJI IN EDEN NAJPOMEMBNEJŠIH RAZISKOVALNIH MODELOV V FITOBAKTERIOLOGIJI. ENA IZMED NAJBOLJ ZAŽELENIH STRATEGIJ ZA NADZOR PPH JE UPORABA ODPORNIH JUDOVSKIH SORT. IZOLATI PPH SO RAZVRŠČENI V 9 PASEM GLEDE NA NJIHOVE INTERAKCIJE Z 8 RAZLIČNIMI JUDOVSKIMI SORTAMI, KAR JE BILO POJASNJENO Z INTERAKCIJO 5 PAROV V RAZMERJU MED GENOM IN GENOM, ČEPRAV JE MOGOČE NAREDITI VEČJO DIFERENCIACIJO PRI DO 14 PASMAH. OBA PATOSISTEMA PONUJATA IZJEMNO PRILOŽNOST ZA PREUČEVANJE MOLEKULARNE BAZE SPECIFIČNOSTI GOSTOV. PO ENI STRANI, ČEPRAV JE PPH GENETSKO HOMOGEN PATOVAR, RAZLIČNI IZOLATI KAŽEJO RAZLIKE V SVOJI VIRULENCI, VIDIK, KI ODRAŽA NJIHOVO RASNO SPECIFIČNOST. PO DRUGI STRANI RAZLIČNI PATOVARES P. SAVASTANOI POVZROČAJO PODOBNE SIMPTOME (TUMORJE) TAKO PRI OLESENELIH KOT PRI ZELNATIH GOSTITELJIH. ZARADI RAZPOLOŽLJIVOSTI ZAPRTIH GENOMOV SEVOV PPH 1448A IN PSV NCPPB 3335 TER GENSKIH IN FUNKCIONALNIH ORODIJ, RAZVITIH MED IZVAJANJEM NAŠIH PREJŠNJIH PROJEKTOV, SO TE BAKTERIJE IDEALNE ZA ANALIZO SPECIFIČNOSTI GOSTOV IN RAZVOJA VIRULENCE. ZATO BO PRIMERJALNA IN FUNKCIONALNA GENOMSKA ANALIZA FILOGENETSKO SORODNIH BAKTERIJSKIH SEVOV OLAJŠALA IDENTIFIKACIJO DETERMINANT PATOGENOSTI NA RAVNI PATOVAR IN PASME. GLAVNI CILJI TEGA PROJEKTA SO: 1) FUNKCIONALNO OPREDELITI IN OPREDELITI RAZLIKE V NIZU VIRULACIJSKIH GENOV PSV PATOVARS IN PPH PASEM, POVEZANIH S SPECIFIČNOSTJO GOSTITELJA; IN 2) UPORABITI INFORMACIJE, PRIDOBLJENE S PRIMERJALNIM IN FUNKCIONALNIM GENOMOMOM, ZA RAZVOJ DIAGNOSTIČNIH ORODIJ ZA PASME PPH IN NASTAJAJOČE IZOLIRANE PSV V MANDEVILLI. POSEBNI CILJI SO: 1) DODELITI PATOVAR SEVOM P. SAVASTANOI, IZOLIRANIM IZ M. SANDERI. 2) ZAPOREDJE IN ZAPIS GENOMOV REPREZENTATIVNIH SEVOV PATOVARS IN PASEM P. SAVASTANOI. 3) IZVESTI PRIMERJALNO GENOMSKO ANALIZO IN FILOGENETSKO ANALIZO PSV PATOGENOV IN PPH PASEM. 4) PREUČI BIOLOGIJO IN VLOGO V SPECIFIČNOSTI GOSTITELJA PLASMAIDS TEH BAKTERIJSKIH SEVOV. 5) POGLOBITI VLOGO V GOST SPECIFIČNOSTI SISTEMOV IZLOČANJA, EFEKTORJEV SISTEMA IZLOČANJA TIPA III IN, 6) DRUGIH VIRULENČNIH DEJAVNIKOV. 7) PREUČITI VLOGO GENEGA IZRAŽANJA V SPECIFIČNOSTI GOSTOV. 8) RAZVITI POSEBNA DIAGNOSTIČNA ORODJA ZA IZOLATE MANDEVILLA IN PPH PASEM. (Slovenian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    БАКТЕРИАЛНИТЕ ЗАБОЛЯВАНИЯ НА РАСТЕНИЯТА ПРИЧИНЯВАТ ЗНАЧИТЕЛНИ ИКОНОМИЧЕСКИ ЗАГУБИ; ТЕХНИЯТ КОНТРОЛ Е ТРУДЕН И СЕ ОЧАКВА ДА БЪДЕ ПО-ТРУДЕН В БЪДЕЩЕ ПОРАДИ ОГРАНИЧЕНИЯТА НА ЕС ЗА РАЗРЕШАВАНЕ НА АКТИВНИ ВЕЩЕСТВА, КОИТО СА НА РАЗПОЛОЖЕНИЕ ЗА ИНТЕГРИРАН КОНТРОЛ. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) ПРОИЗВЕЖДА ВЪЗДУШНИ ТУМОРИ В ГОСТОПРИЕМНИКА, ПРИЧИНЯВАЙКИ ЕДИН ОТ НАЙ-ВАЖНИТЕ МАСЛИНОВИ ЗАБОЛЯВАНИЯ, ВЪПРЕКИ ЧЕ Е ПАТОГЕНЕН И ПРИ ГОЛЯМ БРОЙ РАСТИТЕЛНИ ВИДОВЕ. ОСВЕН ТОВА НАСКОРО БЕ УСТАНОВЕНО, ЧЕ PSV Е НОВОВЪЗНИКВАЩ ПАТОГЕН В ДЕКОРАТИВНИЯ ВИД MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) Е ПАТОГЕН С ИКОНОМИЧЕСКО ЗНАЧЕНИЕ В ЮДИЯТА И ЕДИН ОТ НАЙ-ПОДХОДЯЩИТЕ ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКИ МОДЕЛИ В ОБЛАСТТА НА ФИТОБАКТЕРИОЛОГИЯТА. ЕДНА ОТ НАЙ-ЖЕЛАНИТЕ СТРАТЕГИИ ЗА КОНТРОЛ НА PPH Е ИЗПОЛЗВАНЕТО НА УСТОЙЧИВИ ЕВРЕЙСКИ СОРТОВЕ. PPH ИЗОЛАТИ СЕ КЛАСИФИЦИРАТ В 9 ПОРОДИ В ЗАВИСИМОСТ ОТ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО ИМ С 8 РАЗЛИЧНИ ЕВРЕЙСКИ СОРТА, КОЕТО СЕ ОБЯСНЯВА С ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО НА 5 ДВОЙКИ В ОТНОШЕНИЯТА ГЕН-ГЕН, ВЪПРЕКИ ЧЕ Е ВЪЗМОЖНО ДА СЕ НАПРАВИ ПО-ГОЛЯМА ДИФЕРЕНЦИАЦИЯ ПРИ ДО 14 ПОРОДИ. И ДВЕТЕ ПАТОСИСТЕМИ ПРЕДЛАГАТ БЕЗПРЕЦЕДЕНТНА ВЪЗМОЖНОСТ ЗА ИЗУЧАВАНЕ НА МОЛЕКУЛЯРНИТЕ ОСНОВИ НА СПЕЦИФИКАТА НА ГОСТИТЕ. ОТ ЕДНА СТРАНА, ВЪПРЕКИ ЧЕ PPH Е ГЕНЕТИЧНО ХОМОГЕНЕН PATOVAR, РАЗЛИЧНИТЕ ИЗОЛАТИ ПОКАЗВАТ РАЗЛИКИ В ТЯХНАТА ВИРУЛЕНТНОСТ, АСПЕКТ, КОЙТО ОТРАЗЯВА ТЯХНАТА СПЕЦИФИЧНОСТ НА РАСАТА. ОТ ДРУГА СТРАНА, РАЗЛИЧНИТЕ PATOVARES НА P. SAVASTANOI ПРЕДИЗВИКВАТ СХОДНИ СИМПТОМИ (ТУМОРИ) КАКТО ПРИ ДЪРВЕСНИТЕ, ТАКА И ПРИ ТРЕВНИТЕ ГОСТОПРИЕМНИЦИ. НАЛИЧИЕТО НА ЗАТВОРЕНИ ГЕНОМИ НА ЩАМОВЕТЕ PPH 1448A И PSV NCPPB 3335, КАКТО И ГЕНЕТИЧНИТЕ И ФУНКЦИОНАЛНИТЕ ИНСТРУМЕНТИ, РАЗРАБОТЕНИ ПО ВРЕМЕ НА ИЗПЪЛНЕНИЕТО НА ПРЕДИШНИТЕ НИ ПРОЕКТИ, ПРАВЯТ ТЕЗИ БАКТЕРИИ ИДЕАЛНИ МОДЕЛИ ЗА АНАЛИЗ НА СПЕЦИФИКАТА НА ГОСТИТЕ И ЕВОЛЮЦИЯТА НА ВИРУЛЕНТНОСТТА. ПО ТОЗИ НАЧИН СРАВНИТЕЛНИЯТ И ФУНКЦИОНАЛЕН ГЕНОМЕН АНАЛИЗ НА ФИЛОГЕНЕТИЧНО СВЪРЗАНИ БАКТЕРИАЛНИ ЩАМОВЕ ЩЕ УЛЕСНИ ИДЕНТИФИЦИРАНЕТО НА ПАТОГЕННИ ДЕТЕРМИНАНТИ НА НИВО PATOVAR И ПОРОДА. ОСНОВНИТЕ ЦЕЛИ НА ТОЗИ ПРОЕКТ СА: 1) ФУНКЦИОНАЛНО ИДЕНТИФИЦИРАНЕ И ХАРАКТЕРИЗИРАНЕ НА РАЗЛИКИТЕ В НАБОРА ОТ ВИРУЛЕНТНИ ГЕНИ НА PSV PATOVARS И PPH ПОРОДИ, СВЪРЗАНИ СЪС СПЕЦИФИЧНОСТТА НА ГОСТОПРИЕМНИКА; И 2) ПРИЛАГА ИНФОРМАЦИЯТА, ПОЛУЧЕНА ЧРЕЗ СРАВНИТЕЛЕН И ФУНКЦИОНАЛЕН ГЕНОМ ЗА РАЗРАБОТВАНЕТО НА ДИАГНОСТИЧНИ ИНСТРУМЕНТИ ЗА ПОРОДИТЕ PPH И НОВОВЪЗНИКВАЩИ ИЗОЛИРАНИ PSV В МАНДЕВИЛЯ. КОНКРЕТНИТЕ ЦЕЛИ СА: 1) ЗАДАЙТЕ PATOVAR НА P. SAVASTANOI ЩАМОВЕ, ИЗОЛИРАНИ ОТ M. SANDERI. 2) ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТ И ЗАПИС ГЕНОМИ НА ПРЕДСТАВИТЕЛНИ ЩАМОВЕ НА PATOVARS И ПОРОДИ ОТ P. SAVASTANOI. 3) ИЗВЪРШВА СРАВНИТЕЛЕН ГЕНОМЕН АНАЛИЗ И ФИЛОГЕНЕТИЧЕН АНАЛИЗ НА PSV ПАТОВАРИ И PPH ПОРОДИ. 4) ПРОУЧВАНЕ НА БИОЛОГИЯТА И РОЛЯТА В СПЕЦИФИКАТА НА ГОСТОПРИЕМНИКА НА PLASMAIDS НА ТЕЗИ БАКТЕРИАЛНИ ЩАМОВЕ. 5) ЗА ЗАДЪЛБОЧАВАНЕ НА РОЛЯТА В СПЕЦИФИКАТА НА ГОСТА НА СЕКРЕЦИОННИТЕ СИСТЕМИ, НА ЕФЕКТОРИТЕ НА СЕКРЕЦИОННАТА СИСТЕМА ТИП III И 6) НА ДРУГИ ФАКТОРИ НА ВИРУЛЕНТНОСТ. 7) ДА ПРОУЧИ РОЛЯТА НА ГЕННОТО ИЗРАЗЯВАНЕ В СПЕЦИФИКАТА НА ГОСТИТЕ. 8) РАЗРАБОТВАНЕ НА СПЕЦИФИЧНИ ДИАГНОСТИЧНИ ИНСТРУМЕНТИ ЗА ИЗОЛАТИ MANDEVILLA И PPH ПОРОДИ. (Bulgarian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    IL-MARD BATTERIKU TAL-PJANTI JIKKAWŻA TELF EKONOMIKU SINIFIKANTI; IL-KONTROLL TAGĦHOM HUWA DIFFIĊLI, U HUWA MISTENNI LI JKUN AKTAR DIFFIĊLI FIL-FUTUR MINĦABBA RESTRIZZJONIJIET TAL-UE DWAR L-AWTORIZZAZZJONI TA’ SUSTANZI ATTIVI DISPONIBBLI GĦALL-KONTROLL INTEGRAT. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) JIPPRODUĊI TUMURI TAL-ARJA FL-OSPITANT, U JIKKAWŻA WAĦDA MILL-AKTAR MARD IMPORTANTI TAŻ-ŻEBBUĠ, GĦALKEMM HUWA WKOLL PATOĠENIKU F’GĦADD KBIR TA’ SPEĊIJIET TA’ PJANTI. BARRA MINN HEKK, IL-PSV DAN L-AĦĦAR ĠIE ŻVELAT BĦALA PATOĠENU EMERĠENTI FL-ISPEĊI ORNAMENTALI MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) HUWA PATOĠENU TA’ IMPORTANZA EKONOMIKA FIL-ĠUDIA U WIEĦED MILL-AKTAR MUDELLI TA’ RIĊERKA RILEVANTI FIL-FITOBATTERJOLOĠIJA. WAĦDA MILL-ISTRATEĠIJI TA ‘KONTROLL PPH AKTAR MIXTIEQA HUWA L-UŻU TA’ VARJETAJIET LHUDIJA REŻISTENTI. L-IŻOLATI PPH HUMA KKLASSIFIKATI F’9 RAZEZ SKONT L-INTERAZZJONIJIET TAGĦHOM MA’ 8 VARJETAJIET LHUD DIFFERENTI, LI ĠEW SPJEGATI MILL-INTERAZZJONI TA’ 5 PARI FIR-RELAZZJONI BEJN IL-ĠENE U L-GEN, GĦALKEMM HUWA POSSIBBLI LI SSIR DISTINZJONI AKBAR F’MHUX AKTAR MINN 14-IL RAZZA. IŻ-ŻEWĠ PATOSISTEMI JOFFRU OPPORTUNITÀ BLA PREĊEDENT BIEX JISTUDJAW IL-BAŻIJIET MOLEKULARI TA ‘SPEĊIFIĊITÀ MISTIEDEN. MINN NAĦA, GĦALKEMM PPH HUWA PATOVAR ĠENETIKAMENT OMOĠENJU, L-IŻOLATI DIFFERENTI JURU DIFFERENZI FIL-VIRULENZA TAGĦHOM, ASPETT LI JIRRIFLETTI L-ISPEĊIFIĊITÀ TAR-RAZZA TAGĦHOM. MIN-NAĦA L-OĦRA, IL-PATOVARES DIFFERENTI TA’ P. SAVASTANOI JIKKAĠUNAW SINTOMI SIMILI (TUMURI) KEMM FL-OSPITI TAL-INJAM KIF UKOLL F’DAWK ERBAĊEJ. ID-DISPONIBBILTÀ TAL-ĠENOMI MAGĦLUQA TAR-RAZEZ NCPPB 3335 PPH 1448A U PSV, KIF UKOLL L-GĦODOD ĠENETIĊI U FUNZJONALI ŻVILUPPATI MATUL L-EŻEKUZZJONI TAL-PROĠETTI PREĊEDENTI TAGĦNA, JAGĦMLU DAWN IL-MUDELLI IDEALI TAL-BATTERJI GĦALL-ANALIŻI TAL-ISPEĊIFIĊITÀ TAL-KLIJENTI U L-EVOLUZZJONI TAL-VIRULENZA. GĦALHEKK, L-ANALIŻI ĠENOMIĊI KOMPARATTIVA U FUNZJONALI TA’ RAZEZ BATTERIĊI RELATATI B’MOD FILOĠENETIKU SE TIFFAĊILITA L-IDENTIFIKAZZJONI TA’ DETERMINANTI TAL-PATOĠENIĊITÀ FIL-LIVELL TA’ PATOVAR U TAR-RAZZA. L-GĦANIJIET EWLENIN TA’ DAN IL-PROĠETT HUMA: 1) JIDENTIFIKA U JIKKARATTERIZZA B’MOD FUNZJONALI D-DIFFERENZI FIS-SETT TA’ ĠENI TA’ VIRULENZA TA’ PATOVARS PSV U RAZEZ PPH RELATATI MAL-ISPEĊIFIĊITÀ OSPITANTI; U 2) TAPPLIKA L-INFORMAZZJONI MIKSUBA PERMEZZ TA’ ĠENOMIKA KOMPARATTIVA U FUNZJONALI GĦALL-IŻVILUPP TA’ GĦODOD DIJANJOSTIĊI GĦAR-RAZEZ PPH U L-PSV IŻOLAT EMERĠENTI F’MANDEVILLA. L-GĦANIJIET SPEĊIFIĊI HUMA: 1) TASSENJA PATOVAR LIL RAZEZ TA’ P. SAVASTANOI IŻOLATI MINN M. SANDERI. 2) SEKWENZA U REKORD TA’ ĠENOMI TA’ RAZEZ RAPPREŻENTATTIVI TA’ PATOVARS U RAZEZ TA’ P. SAVASTANOI. 3) WETTAQ ANALIŻI ĠENOMIKA KOMPARATTIVA U ANALIŻI FILOĠENETIKA TA’ PATOVARS PSV U RAZEZ PPH. 4) TISTUDJA L-BIJOLOĠIJA U R-RWOL FL-ISPEĊIFIĊITÀ TA ‘L-OSPITANT TAL-PLASMAIDS TA’ DAWN IR-RAZEZ BATTERJALI. 5) LI JAPPROFONDIXXU R-RWOL FL-ISPEĊIFIĊITÀ TAL-MISTIEDEN TAS-SISTEMI TA’ TNIXXIJA, TAL-EFFETTURI TAS-SISTEMA TA’ TNIXXIJA TAT-TIP III U, 6) TA’ FATTURI OĦRA TA’ VIRULENZA. 7) BIEX TISTUDJA R-RWOL TAL-ESPRESSJONI ĠENIKA FL-ISPEĊIFIĊITÀ TAL-MISTEDNIN. 8) TIŻVILUPPA GĦODOD DIJANJOSTIĊI SPEĊIFIĊI GĦALL-IŻOLATI TA’ MANDEVILLA U GĦAR-RAZEZ PPH. (Maltese)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    DOENÇAS BACTERIAIS DAS PLANTAS CAUSAM PERDAS ECONÓMICAS SIGNIFICATIVAS; O seu controlo é difícil e espera-se que seja mais difícil no futuro devido às restrições da UE em matéria de autorização de substâncias ativas disponíveis para controlo integrado. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) produz tumores de ar no hospedeiro, causando uma das doenças oleosas mais importantes, embora também seja patogéneo em um grande número de espécies vegetais. Além disso, o PSV foi recentemente REVELADO COMO PATOGÉNIO EMERGENTE NA ESPÉCIE ORNAMENTAL MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) É UM PATOGÉNIO DE IMPORTÂNCIA ECONÓMICA NA JUDIA E UM DOS MODELOS DE INVESTIGAÇÃO MAIS RELEVANTES EM FITOBACTERIOLOGIA. Uma das estratégias de controlo de PPH mais desejáveis é a utilização de variedades judaicas resistentes. Os isolatos de fósforo são classificados em nove raças de acordo com as suas interacções com oito variedades judaicas diferentes, que foram explicadas pela interacção de cinco pares na relação genealógico-género, embora seja possível fazer uma maior diferença em 14 raças. Ambos os sistemas oferecem uma oportunidade não prevista para estudar as bases moleculares da especificidade desejada. Por um lado, embora o PPH seja um patovar geneticamente homogéneo, os diferentes isolatos apresentam diferenças na sua gravidade, um aspecto que reflecte a sua especificidade racial. Por outro lado, os diferentes patóvaros de P. SAVASTANOI induzem sintomas semelhantes (TUMORS) tanto em tecidos como em HERBACEOUS HOSTS. A disponibilidade dos genomas fechados das estirpes PPH 1448A e PSV NCPPB 3335, bem como as ferramentas genéticas e funcionais desenvolvidas durante a execução dos nossos projectos anteriores, tornam estas bactérias modelos ideais para a análise da especificidade do produto e a evolução da violência. A ANÁLISE GENÓMICA COMPARATIVA E FUNCIONAL DAS ESTRADAS BACTERIAIS FILOGENETICAMENTE RELACIONADAS FACILITARÁ A IDENTIFICAÇÃO DOS DETERMINANTES DE PATHOGENICIDADE A NÍVEL DO PATOVAR E DA CRIANÇA. OS PRINCIPAIS OBJECTIVOS DO PRESENTE PROJECTO SÃO: 1) IDENTIFICAR FUNCIONALMENTE E CARACTERIZAR AS DIFERENÇAS NO CONJUNTO DE GENES DE VIRULÊNCIA DOS PATHOVARS DO PSV E DOS PPH RELACIONADOS COM A ESPECIFICIDADE DO Acolhimento; E 2) APLICAR AS INFORMAÇÕES OBTIDAS PELA GENÓMICA COMPARATIVA E FUNCIONAL PARA O DESENVOLVIMENTO DE FERRAMENTAS DIAGNÓSTICAS PARA AS RAÇAS PPH E O PSV ISOLADO EM EMERGÊNCIA EM MANDEVILLA. OBJECTIVOS ESPECÍFICOS: 1) ATRIBUIR UM PATOVAR ÀS ESTRADAS DE P. SAVASTANOI ISOLADAS DE M. SANDERI. 2) GENÓMEOS DE SEQUÊNCIA E DE REGISTO DE ESTRADAS REPRESENTANTES DE PATOVARES E RAÇAS DE P. SAVASTANOI. 3) Efectuar uma análise genómica comparativa e uma análise filogenética de PATHOVARS PSV e PPH BREEDS. 4) Estudar a biologia e o papel na especificidade do hospedeiro dos plasmas destas estirpes bacterianas. 5) Aprofundar o papel na especificidade desejada dos sistemas de segurança, dos agentes do sistema de segurança do tipo III e, 6) de outros factores de violência. 7) Estudar o papel da expressão genética na especificidade dos convidados. 8) DESENVOLVER FERRAMENTAS DE DIAGNÓSTICO ESPECÍFICAS PARA ISOLATOS DE MANDEVILLA E PPH BREEDS. (Portuguese)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    BAKTERIELLE SYGDOMME HOS PLANTER FORÅRSAGER BETYDELIGE ØKONOMISKE TAB; DET ER VANSKELIGT AT KONTROLLERE DEM OG FORVENTES AT BLIVE VANSKELIGERE I FREMTIDEN PÅ GRUND AF EU'S BEGRÆNSNINGER I GODKENDELSEN AF AKTIVSTOFFER, DER ER TIL RÅDIGHED TIL INTEGRERET KONTROL. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PRODUCERER LUFTTUMORER I VÆRTEN, HVILKET FORÅRSAGER EN AF DE VIGTIGSTE OLIVENSYGDOMME, SELV OM DET OGSÅ ER PATOGENT I ET STORT ANTAL PLANTEARTER. DESUDEN ER PSV FOR NYLIG BLEVET AFSLØRET SOM ET FREMSPIRENDE PATOGEN I PRYDARTEN MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) ER ET PATOGEN AF ØKONOMISK BETYDNING I JUDIA OG EN AF DE MEST RELEVANTE FORSKNINGSMODELLER INDEN FOR FYTOBAKTERIOLOGI. EN AF DE MEST ØNSKELIGE PPH-KONTROLSTRATEGIER ER BRUGEN AF RESISTENTE JØDISKE SORTER. PPH ISOLATER ER KLASSIFICERET I 9 RACER EFTER DERES INTERAKTIONER MED 8 FORSKELLIGE JØDISKE SORTER, SOM ER BLEVET FORKLARET VED INTERAKTIONEN MELLEM 5 PAR I FORHOLDET MELLEM GEN-TIL-GEN, SELV OM DET ER MULIGT AT FORETAGE EN STØRRE DIFFERENTIERING I OP TIL 14 RACER. BEGGE PATOSYSTEMER GIVER EN HIDTIL USET MULIGHED FOR AT STUDERE DE MOLEKYLÆRE BASER AF GÆST SPECIFICITET. PÅ DEN ENE SIDE, SELV OM PPH ER EN GENETISK HOMOGEN PATOVAR, DE FORSKELLIGE ISOLATER VISER FORSKELLE I DERES VIRULENS, ET ASPEKT, DER AFSPEJLER DERES RACE SPECIFICITET. PÅ DEN ANDEN SIDE FREMKALDER DE FORSKELLIGE PATOVARES AF P. SAVASTANOI LIGNENDE SYMPTOMER (TUMORER) HOS BÅDE TRÆAGTIGE OG URTEAGTIGE VÆRTER. TILGÆNGELIGHEDEN AF DE LUKKEDE GENOMER AF STAMMERNE PPH 1448A OG PSV NCPPB 3335 SAMT DE GENETISKE OG FUNKTIONELLE VÆRKTØJER, DER BLEV UDVIKLET UNDER UDFØRELSEN AF VORES TIDLIGERE PROJEKTER, GØR DISSE BAKTERIER IDEELLE MODELLER TIL ANALYSE AF GÆSTESPECIFICITET OG UDVIKLING AF VIRULENS. DEN KOMPARATIVE OG FUNKTIONELLE GENOMANALYSE AF FYLOGENETISK BESLÆGTEDE BAKTERIESTAMMER VIL SÅLEDES GØRE DET LETTERE AT IDENTIFICERE PATOGENITETSDETERMINANTER PÅ PATOVAR- OG RACENIVEAU. DE VIGTIGSTE MÅL MED DETTE PROJEKT ER: 1) FUNKTIONELT IDENTIFICERE OG KARAKTERISERE FORSKELLE I SÆT AF VIRULENS GENER AF PSV PATOVARS OG PPH RACER RELATERET TIL VÆRT SPECIFICITET; OG 2) ANVENDE DE OPLYSNINGER, DER ER OPNÅET VED KOMPARATIV OG FUNKTIONEL GENOMFORSKNING, TIL UDVIKLING AF DIAGNOSTISKE VÆRKTØJER TIL PPH-RACERNE OG DEN NYE ISOLEREDE PSV I MANDEVILLA. DE SPECIFIKKE MÅL ER: 1) TILDELE EN P. SAVASTANOI STAMMER ISOLERET FRA M. SANDERI. 2) SEKVENS OG REGISTRERING GENOMER AF REPRÆSENTATIVE STAMMER AF PATOVARS OG RACER AF P. SAVASTANOI. 3) UDFØR EN KOMPARATIV GENOMANALYSE OG EN PHYLOGENETISK ANALYSE AF PSV-PATOVARS OG PPH-RACER. 4) STUDERE BIOLOGI OG ROLLE I SPECIFICITETEN AF VÆRTEN FOR PLASMAIDS AF DISSE BAKTERIESTAMMER. 5) AT UDDYBE ROLLEN I GÆST SPECIFICITET AF SEKRETIONSSYSTEMER, AF EFFEKTORERNE AF TYPE III SEKRETIONSSYSTEM OG, 6) AF ANDRE VIRULENS FAKTORER. 7) AT STUDERE ROLLEN SOM GENISK UDTRYK I SPECIFICITET AF GÆSTER. 8) UDVIKLE SPECIFIKKE DIAGNOSTISKE VÆRKTØJER TIL MANDEVILLA ISOLATER OG PPH RACER. (Danish)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    BOLILE BACTERIENE ALE PLANTELOR PROVOACĂ PIERDERI ECONOMICE SEMNIFICATIVE; CONTROLUL ACESTORA ESTE DIFICIL ȘI SE PRECONIZEAZĂ CĂ VA FI MAI DIFICIL ÎN VIITOR DIN CAUZA RESTRICȚIILOR UE PRIVIND AUTORIZAREA SUBSTANȚELOR ACTIVE DISPONIBILE PENTRU CONTROLUL INTEGRAT. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PRODUCE TUMORI AERIENE ÎN GAZDĂ, PROVOCÂND UNA DINTRE CELE MAI IMPORTANTE BOLI ALE MĂSLINELOR, DEȘI ESTE, DE ASEMENEA, PATOGENĂ ÎNTR-UN NUMĂR MARE DE SPECII DE PLANTE. ÎN PLUS, PSV A FOST DESCOPERIT RECENT CA AGENT PATOGEN EMERGENT LA SPECIA ORNAMENTALĂ MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) ESTE UN AGENT PATOGEN DE IMPORTANȚĂ ECONOMICĂ ÎN JUDIA ȘI UNUL DINTRE CELE MAI RELEVANTE MODELE DE CERCETARE ÎN FITOBACTERIOLOGIE. UNA DINTRE CELE MAI DORITE STRATEGII DE CONTROL AL PPH ESTE UTILIZAREA SOIURILOR EVREIEȘTI REZISTENTE. IZOLATELE PPH SUNT CLASIFICATE ÎN 9 RASE ÎN FUNCȚIE DE INTERACȚIUNILE LOR CU 8 SOIURI EVREIEȘTI DIFERITE, CARE S-AU EXPLICAT PRIN INTERACȚIUNEA A 5 PERECHI ÎN RELAȚIA GEN-LA-GEN, DEȘI ESTE POSIBIL SĂ SE FACĂ O DIFERENȚIERE MAI MARE LA PÂNĂ LA 14 RASE. AMBELE PATOSISTEME OFERĂ O OPORTUNITATE FĂRĂ PRECEDENT DE A STUDIA BAZELE MOLECULARE ALE SPECIFICITĂȚII OASPEȚILOR. PE DE O PARTE, DEȘI PPH ESTE UN PATOVAR OMOGEN DIN PUNCT DE VEDERE GENETIC, DIFERITELE IZOLATE PREZINTĂ DIFERENȚE ÎN VIRULENȚA LOR, ASPECT CARE REFLECTĂ SPECIFICITATEA RASEI. PE DE ALTĂ PARTE, DIFERITELE PATOVARES ALE P. SAVASTANOI INDUC SIMPTOME SIMILARE (TUMORI) ATÂT LA GAZDELE LEMNOASE, CÂT ȘI LA CELE ERBACEE. DISPONIBILITATEA GENOMULUI ÎNCHIS AL TULPINILOR PPH 1448A ȘI PSV NCPPB 3335, PRECUM ȘI INSTRUMENTELE GENETICE ȘI FUNCȚIONALE DEZVOLTATE ÎN TIMPUL REALIZĂRII PROIECTELOR NOASTRE ANTERIOARE, FAC DIN ACESTE BACTERII MODELE IDEALE PENTRU ANALIZA SPECIFICITĂȚII OASPEȚILOR ȘI EVOLUȚIA VIRULENȚEI. ASTFEL, ANALIZA GENOMICĂ COMPARATIVĂ ȘI FUNCȚIONALĂ A TULPINILOR BACTERIENE ÎNRUDITE FILOGENETIC VA FACILITA IDENTIFICAREA FACTORILOR DETERMINANȚI PATOGENI LA NIVELUL PATOVAR ȘI AL RASEI. PRINCIPALELE OBIECTIVE ALE ACESTUI PROIECT SUNT: 1) IDENTIFICAREA FUNCȚIONALĂ ȘI CARACTERIZAREA DIFERENȚELOR ÎN SETUL DE GENE DE VIRULENȚĂ ALE RASELOR PATOVARE PSV ȘI PPH LEGATE DE SPECIFICITATEA GAZDEI; ȘI 2) SĂ APLICE INFORMAȚIILE OBȚINUTE DE GENOMICA COMPARATIVĂ ȘI FUNCȚIONALĂ PENTRU DEZVOLTAREA INSTRUMENTELOR DE DIAGNOSTICARE PENTRU RASELE PPH ȘI PSV-UL IZOLAT EMERGENT DIN MANDEVILLA. OBIECTIVELE SPECIFICE SUNT: 1) ATRIBUIE UN PATOVAR TULPINILOR P. SAVASTANOI IZOLATE DE M. SANDERI. 2) SECVENȚA ȘI ÎNREGISTRAREA GENOMURILOR DE TULPINI REPREZENTATIVE DE PATOVARS ȘI RASE DE P. SAVASTANOI. 3) EFECTUAȚI O ANALIZĂ GENOMICĂ COMPARATIVĂ ȘI O ANALIZĂ FILOGENETICĂ A PATOVARILOR PSV ȘI A RASELOR PPH. 4) STUDIAȚI BIOLOGIA ȘI ROLUL ÎN SPECIFICITATEA GAZDEI PLASMAIDS A ACESTOR TULPINI BACTERIENE. 5) APROFUNDAREA ROLULUI ÎN SPECIFICITATEA OASPEȚILOR SISTEMELOR DE SECREȚIE, A EFECTORILOR SISTEMULUI DE SECREȚIE DE TIP III ȘI, 6) A ALTOR FACTORI DE VIRULENȚĂ. 7) SĂ STUDIEZE ROLUL EXPRESIEI GENICE ÎN SPECIFICITATEA OASPEȚILOR. 8) SĂ DEZVOLTE INSTRUMENTE SPECIFICE DE DIAGNOSTICARE PENTRU IZOLATELE MANDEVILLA ȘI RASELE PPH. (Romanian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    BAKTERIELLA VÄXTSJUKDOMAR ORSAKAR BETYDANDE EKONOMISKA FÖRLUSTER. DET ÄR SVÅRT ATT KONTROLLERA DEM OCH FÖRVÄNTAS BLI SVÅRARE I FRAMTIDEN PÅ GRUND AV EU:S BEGRÄNSNINGAR AV GODKÄNNANDET AV VERKSAMMA ÄMNEN SOM ÄR TILLGÄNGLIGA FÖR INTEGRERAD KONTROLL. PSEUDOMONAS SAVASTANOI PV. SAVASTANOI (PSV) PRODUCERAR LUFTTUMÖRER I VÄRDEN, VILKET ORSAKAR EN AV DE VIKTIGASTE OLIVSJUKDOMARNA, ÄVEN OM DEN OCKSÅ ÄR PATOGEN I ETT STORT ANTAL VÄXTARTER. DESSUTOM HAR PSV NYLIGEN AVSLÖJATS SOM EN FRAMVÄXANDE PATOGEN HOS PRYDNADSARTERNA MANDEVILLA SANDERI (DIPLADENIA). P. SAVASTANOI PV. PHASEOLICOLA (PPH) ÄR EN PATOGEN AV EKONOMISK BETYDELSE I JUDIA OCH EN AV DE MEST RELEVANTA FORSKNINGSMODELLERNA INOM FYTOBACTERIOLOGI. EN AV DE MEST ÖNSKVÄRDA PPH KONTROLLSTRATEGIER ÄR ANVÄNDNINGEN AV RESISTENTA JUDISKA SORTER. PPH ISOLAT KLASSIFICERAS I 9 RASER ENLIGT DERAS INTERAKTIONER MED 8 OLIKA JUDISKA SORTER, SOM HAR FÖRKLARATS AV INTERAKTIONEN MELLAN 5 PAR I GEN-TILL-GEN-FÖRHÅLLANDE, ÄVEN OM DET ÄR MÖJLIGT ATT GÖRA EN STÖRRE DIFFERENTIERING I UPP TILL 14 RASER. BÅDA PATOSYSTEMEN ERBJUDER EN OÖVERTRÄFFAD MÖJLIGHET ATT STUDERA GÄSTSPECIFICITETENS MOLEKYLÄRA BASER. Å ENA SIDAN, ÄVEN OM PPH ÄR EN GENETISKT HOMOGEN PATOVAR, DE OLIKA ISOLATEN VISAR SKILLNADER I DERAS VIRULENS, EN ASPEKT SOM ÅTERSPEGLAR DERAS RAS SPECIFICITET. Å ANDRA SIDAN, DE OLIKA PATOVARES AV P. SAVASTANOI INDUCERAR LIKNANDE SYMTOM (TUMÖRER) I BÅDE TRÄIGA OCH ÖRTARTADE VÄRDAR. TILLGÄNGLIGHETEN AV DE SLUTNA GENOMERNA AV PPH 1448A OCH PSV NCPPB 3335 STAMMAR, LIKSOM DE GENETISKA OCH FUNKTIONELLA VERKTYG SOM UTVECKLATS UNDER GENOMFÖRANDET AV VÅRA TIDIGARE PROJEKT, GÖR DESSA BAKTERIER IDEALISKA MODELLER FÖR ANALYS AV GÄSTSPECIFICITET OCH UTVECKLINGEN AV VIRULENS. DEN JÄMFÖRANDE OCH FUNKTIONELLA GENOMANALYSEN AV FYLOGENETISKT RELATERADE BAKTERIESTAMMAR KOMMER ATT UNDERLÄTTA IDENTIFIERINGEN AV PATOGENITETSDETERMINANTER PÅ PATOVAR- OCH RASNIVÅ. DE VIKTIGASTE MÅLEN FÖR DETTA PROJEKT ÄR FÖLJANDE: 1) FUNKTIONELLT IDENTIFIERA OCH KARAKTERISERA SKILLNADER I UPPSÄTTNINGEN AV VIRULENSGENER HOS PSV-PATOVARS OCH PPH-RASER RELATERADE TILL VÄRDSPECIFICITET; OCH 2) TILLÄMPA DEN INFORMATION SOM ERHÅLLS GENOM JÄMFÖRANDE OCH FUNKTIONELL GENOMIK FÖR UTVECKLING AV DIAGNOSVERKTYG FÖR PPH-RASER OCH DEN FRAMVÄXANDE ISOLERADE PSV I MANDEVILLA. DE SÄRSKILDA MÅLEN ÄR FÖLJANDE: 1) TILLDELA EN PATOVAR TILL P. SAVASTANOI STAMMAR ISOLERADE FRÅN M. SANDERI. 2) SEKVENS OCH REGISTERGENOM AV REPRESENTATIVA STAMMAR AV PATOVARS OCH RASER AV P. SAVASTANOI. 3) UTFÖRA EN JÄMFÖRANDE GENOMISK ANALYS OCH EN FYLOGENETISK ANALYS AV PSV-PATOVARS OCH PPH RASER. 4) STUDERA BIOLOGI OCH ROLL I SPECIFICITETEN HOS VÄRD FÖR PLASMAIDS AV DESSA BAKTERIESTAMMAR. 5) ATT FÖRDJUPA ROLLEN I GÄST SPECIFICITET AV SEKRETERINGSSYSTEM, AV EFFEKTORER AV TYP III SEKRET SYSTEM OCH, 6) AV ANDRA VIRULENS FAKTORER. 7) ATT STUDERA ROLLEN AV GENIC UTTRYCK I SPECIFICITETEN AV GÄSTER. 8) UTVECKLA SPECIFIKA DIAGNOSTISKA VERKTYG FÖR MANDEVILLA ISOLAT OCH PPH RASER. (Swedish)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    location (string)
    Pamplona/Iruña
    0 references
    date of last update
    21 December 2023
    0 references

    Identifiers

    Spanish Kohesio ID
    AGL2014-53242-C2-2-R
    0 references
     
    Retrieved from "https://linkedopendata.eu/w/index.php?title=Item:Q3208129&oldid=42444616"