HLA-G: GASTRIC CANCER AND ITS EVOLUTION (Q3166003): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(Changed an Item) |
(Set a claim value: summary (P836): O objetivo é estudar as variantes polimórficas da codificação genética para a molécula HLA-G, envolvidas na modulação da resposta imunitária contra tumores, num grupo de doentes com adenocarcinoma gástrico, e comparar a frequência de polimorfismos com um grupo de controlo, bem como determinar a presença de mutações somáticas que modificam estas variantes polimórficas no tecido tumoral de cada doente. Além disso, as variantes serão correlacionadas co...) |
||||||
| (One intermediate revision by the same user not shown) | |||||||
| Property / summary: The aim is to study the polymorphic variants of the gene encoding for the HLA-G molecule, involved in modulating the immune response against tumors, in a group of patients with gastric adenocarcinoma, and to compare the frequency of polymorphisms with a control group, as well as to determine the presence of somatic mutations that modify these polymorphic variants in the tumor tissue of each patient. In addition, variants will be correlated with the levels of expression (soluble and membrane) of the protein, as well as with the clinical evolution of patients. If the immune system’s response to the tumor is limited, the tumor is expected to progress faster, endangering the patient’s life. To do this, samples of tissue (tumoral and healthy) as well as blood samples from patients will be obtained. DNA will be extracted using the Nucleon BACC (GE Healthcare) kit and the relevant polymorphisms will be analysed using PCR and Sanger sequencing techniques, and their frequencies will be analysed through specialised software (ARLEQUIN, SNPStats). The levels of mRNA and protein in each patient’s healthy and tumor tissue shall be determined using qPCR, immunohistochemistry and immunofluorescence techniques, as well as soluble levels of it and cytokines using ELISA and flow cytometry, in both cases using specific monoclonal antibodies. The effect of the HLA-G molecule on lymphocyte activation phenomena in response to tumors will be determined. Finally, these parameters will be correlated with the clinical and survival of patients with statistical analysis programs (SPSS, GraphPad). (English) / qualifier | |||||||
readability score: 0.4584692472649166
| |||||||
| Property / summary | Property / summary | ||||||
O objetivo é estudar as variantes polimórficas da codificação genética para a molécula HLA-G, envolvidas na modulação da resposta imunitária contra tumores, num grupo de doentes com adenocarcinoma gástrico, e comparar a frequência de polimorfismos com um grupo de controlo, bem como determinar a presença de mutações somáticas que modificam estas variantes polimórficas no tecido tumoral de cada doente. Além disso, as variantes serão correlacionadas com os níveis de expressão (solúvel e membrana) da proteína, bem como com a evolução clínica dos doentes. Se a resposta do sistema imunitário ao tumor for limitada, prevê-se que o tumor progrida mais rapidamente, pondo em perigo a vida do doente. Para isso, serão obtidas amostras de tecido (tumoral e saudável), bem como amostras de sangue dos doentes. O ADN será extraído utilizando o kit Nucleon BACC (GE Healthcare) e os polimorfismos relevantes serão analisados utilizando técnicas de sequenciação PCR e Sanger, e as suas frequências serão analisadas através de software especializado (ARLEQUIN, SNPStats). Os níveis de ARNm e de proteína no tecido saudável e tumoral de cada doente devem ser determinados utilizando técnicas de qPCR, imuno-histoquímica e imunofluorescência, bem como os seus níveis solúveis e citocinas utilizando ELISA e citometria de fluxo, em ambos os casos utilizando anticorpos monoclonais específicos. O efeito da molécula de HLA-G nos fenómenos de activação dos linfócitos em resposta a tumores será determinado. Por fim, estes parâmetros serão correlacionados com a clínica e a sobrevida dos pacientes com programas de análise estatística (SPSS, GraphPad). (Portuguese) | |||||||
Latest revision as of 09:40, 11 October 2024
Project Q3166003 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | HLA-G: GASTRIC CANCER AND ITS EVOLUTION |
Project Q3166003 in Spain |
Statements
56,083.5 Euro
0 references
103,000.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2019
0 references
31 March 2022
0 references
UNIVERSIDAD COMPLUTENSE DE MADRID
0 references
Se pretenden estudiar las variantes polimórficas del gen que codifica para la molécula HLA-G, implicado en la modulación de la respuesta inmunitaria contra tumores, en un grupo de pacientes con adenocarcinoma gástrico, y comparar la frecuencia de los polimorfismos con un grupo control, así como determinar la presencia de mutaciones somáticas que modifiquen estas variantes polimórficas en el tejido tumoral de cada paciente. Además, se correlacionarán las variantes con los niveles de expresión (soluble y de membrana) de la proteína, así como con la evolución clínica de los pacientes. Si la respuesta del sistema inmunitaria frente al tumor se ve limitada, se prevé que el tumor progrese de una forma más rápida, poniendo en peligro la vida del paciente. Para ello, se obtendrán muestras de tejido (tumoral y sano) así como muestras de sangre de los pacientes. Se extraerá ADN mediante el kit Nucleon BACC ( GE Healthcare) y se analizarán los polimorfismos relevantes mediante técnicas de PCR y secuenciación Sanger, y se analizarán sus frecuencias a través de software especializado (ARLEQUIN, SNPStats). Se determinarán los niveles de mRNA y proteína en los tejido sano y tumoral de cada paciente, empleando técnicas de qPCR, inmunohistoquímica e inmunofluorescencia, así como los niveles solubles de la misma y de citocinas mediante ELISA y citometría de flujo, en ambos casos utilizando anticuerpos monoclonales específicos. Se determinará el efecto de la molécula de HLA-G en los fenómenos de activación linfocitaria en respuesta a tumores. Finalmente, se correlacionarán estos parámetros con la clínica y supervivencia de los pacientes con programas de análisis estadístico (SPSS, GraphPad). (Spanish)
0 references
The aim is to study the polymorphic variants of the gene encoding for the HLA-G molecule, involved in modulating the immune response against tumors, in a group of patients with gastric adenocarcinoma, and to compare the frequency of polymorphisms with a control group, as well as to determine the presence of somatic mutations that modify these polymorphic variants in the tumor tissue of each patient. In addition, variants will be correlated with the levels of expression (soluble and membrane) of the protein, as well as with the clinical evolution of patients. If the immune system’s response to the tumor is limited, the tumor is expected to progress faster, endangering the patient’s life. To do this, samples of tissue (tumoral and healthy) as well as blood samples from patients will be obtained. DNA will be extracted using the Nucleon BACC (GE Healthcare) kit and the relevant polymorphisms will be analysed using PCR and Sanger sequencing techniques, and their frequencies will be analysed through specialised software (ARLEQUIN, SNPStats). The levels of mRNA and protein in each patient’s healthy and tumor tissue shall be determined using qPCR, immunohistochemistry and immunofluorescence techniques, as well as soluble levels of it and cytokines using ELISA and flow cytometry, in both cases using specific monoclonal antibodies. The effect of the HLA-G molecule on lymphocyte activation phenomena in response to tumors will be determined. Finally, these parameters will be correlated with the clinical and survival of patients with statistical analysis programs (SPSS, GraphPad). (English)
12 October 2021
0.4584692472649166
0 references
L’objectif est d’étudier les variantes polymorphes du gène codant pour la molécule HLA-G, intervenant dans la modulation de la réponse immunitaire contre les tumeurs, chez un groupe de patients atteints d’adénocarcinome gastrique, de comparer la fréquence des polymorphismes avec un groupe témoin, ainsi que de déterminer la présence de mutations somatiques qui modifient ces variantes polymorphes dans le tissu tumoral de chaque patient. En outre, les variantes seront corrélées avec les niveaux d’expression (soluble et membranaire) de la protéine, ainsi qu’avec l’évolution clinique des patients. Si la réponse du système immunitaire à la tumeur est limitée, la tumeur devrait progresser plus rapidement, mettant en danger la vie du patient. Pour ce faire, des échantillons de tissus (tumorals et sains) ainsi que des échantillons sanguins de patients seront prélevés. L’ADN sera extrait à l’aide du kit Nucleon BACC (GE Healthcare) et les polymorphismes pertinents seront analysés à l’aide de techniques de séquençage PCR et Sanger, et leurs fréquences seront analysées au moyen de logiciels spécialisés (ARLEQUIN, SNPStats). Les teneurs en ARNm et en protéines dans le tissu sain et le tissu tumoral de chaque patient sont déterminées à l’aide de techniques de qPCR, d’immunohistochimie et d’immunofluorescence, ainsi que des niveaux solubles de celui-ci et des cytokines par ELISA et cytométrie de flux, dans les deux cas à l’aide d’anticorps monoclonaux spécifiques. L’effet de la molécule HLA-G sur les phénomènes d’activation des lymphocytes en réponse aux tumeurs sera déterminé. Enfin, ces paramètres seront corrélés avec la clinique et la survie des patients avec des programmes d’analyse statistique (SPSS, GraphPad). (French)
4 December 2021
0 references
Ziel ist es, die polymorphen Varianten der Genkodierung für das HLA-G-Molekül, die an der Modulation der Immunantwort gegen Tumore beteiligt sind, in einer Gruppe von Patienten mit Magen-Adenokarzinom zu untersuchen und die Häufigkeit von Polymorphismen mit einer Kontrollgruppe zu vergleichen sowie das Vorhandensein somatischer Mutationen zu bestimmen, die diese polymorphen Varianten im Tumorgewebe jedes Patienten verändern. Darüber hinaus werden Varianten mit den Expressionsgraden (löslich und Membran) des Proteins sowie mit der klinischen Entwicklung der Patienten korreliert. Wenn die Reaktion des Immunsystems auf den Tumor begrenzt ist, wird erwartet, dass der Tumor schneller voranschreiten wird, wodurch das Leben des Patienten gefährdet wird. Dazu werden Proben von Geweben (tumoralisch und gesund) sowie Blutproben von Patienten gewonnen. Die DNA wird mit dem Nucleon BACC (GE Healthcare) Kit extrahiert und die relevanten Polymorphismen werden mit PCR- und Sanger-Sequenzierungstechniken analysiert und ihre Frequenzen mittels spezialisierter Software (ARLEQUIN, SNPStats) analysiert. Die Werte von mRNA und Protein im gesunden und Tumorgewebe jedes Patienten werden mit Hilfe von qPCR, Immunhistochemie und Immunfluoreszenztechniken sowie löslichen Mengen davon und Zytokinen unter Verwendung von ELISA und Durchflusszytometrie bestimmt, wobei in beiden Fällen spezifische monoklonale Antikörper verwendet werden. Die Wirkung des HLA-G-Moleküls auf Lymphozytenaktivierungsphänomene als Reaktion auf Tumoren wird bestimmt. Schließlich werden diese Parameter mit der klinischen und dem Überleben von Patienten mit statistischen Analyseprogrammen (SPSS, GraphPad) korreliert. (German)
9 December 2021
0 references
Het doel is om de polymorfe varianten van het gen coderen voor het HLA-G molecuul, betrokken bij het moduleren van de immuunrespons tegen tumoren, in een groep patiënten met maag adenocarcinoom, en om de frequentie van polymorfismen te vergelijken met een controlegroep, evenals om de aanwezigheid van somatische mutaties die deze polymorfe varianten in het tumorweefsel van elke patiënt te wijzigen. Daarnaast zullen varianten gecorreleerd worden met de expressieniveaus (oplosbaar en membraan) van het eiwit, evenals met de klinische evolutie van patiënten. Als de reactie van het immuunsysteem op de tumor beperkt is, zal de tumor naar verwachting sneller vorderen, waardoor het leven van de patiënt in gevaar wordt gebracht. Om dit te doen, zullen monsters van weefsel (tumoraal en gezond) evenals bloedmonsters van patiënten worden verkregen. DNA zal worden geëxtraheerd met behulp van de Nucleon BACC (GE Healthcare) kit en de relevante polymorfismen zullen worden geanalyseerd met behulp van PCR en Sanger sequencing technieken, en hun frequenties zullen worden geanalyseerd door middel van gespecialiseerde software (ARLEQUIN, SNPStats). De niveaus van mRNA en eiwitten in het gezonde en tumorweefsel van elke patiënt worden bepaald aan de hand van qPCR-, immunohistochemie- en immunofluorescentietechnieken, alsook oplosbare niveaus ervan en cytokines met behulp van ELISA en flowcytometrie, in beide gevallen met behulp van specifieke monoklonale antilichamen. Het effect van het HLA-G-molecuul op lymfocytenactiveringsverschijnselen in reactie op tumoren zal worden bepaald. Ten slotte zullen deze parameters gecorreleerd worden met de klinische en overleving van patiënten met statistische analyseprogramma’s (SPSS, GraphPad). (Dutch)
17 December 2021
0 references
L'obiettivo è quello di studiare le varianti polimorfiche della codifica genica per la molecola HLA-G, coinvolti nella modulazione della risposta immunitaria contro i tumori, in un gruppo di pazienti con adenocarcinoma gastrico, e di confrontare la frequenza dei polimorfismi con un gruppo di controllo, nonché di determinare la presenza di mutazioni somatiche che modificano queste varianti polimorfe nel tessuto tumorale di ciascun paziente. Inoltre, le varianti saranno correlate con i livelli di espressione (solubile e membrana) della proteina, nonché con l'evoluzione clinica dei pazienti. Se la risposta del sistema immunitario al tumore è limitata, il tumore dovrebbe progredire più velocemente, mettendo in pericolo la vita del paziente. Per fare questo, saranno ottenuti campioni di tessuto (tumorale e sano) così come campioni di sangue dai pazienti. Il DNA verrà estratto utilizzando il kit Nucleon BACC (GE Healthcare) e i relativi polimorfismi saranno analizzati con tecniche di sequenziamento PCR e Sanger e le loro frequenze saranno analizzate attraverso software specializzati (ARLEQUIN, SNPStats). I livelli di mRNA e proteine nel tessuto sano e tumorale di ciascun paziente devono essere determinati utilizzando tecniche qPCR, immunoistochimica e immunofluorescenza, nonché livelli solubili di esso e citochine che utilizzano ELISA e citometria a flusso, in entrambi i casi utilizzando anticorpi monoclonali specifici. L'effetto della molecola HLA-G sui fenomeni di attivazione dei linfociti in risposta ai tumori sarà determinato. Infine, questi parametri saranno correlati con la clinica e la sopravvivenza dei pazienti con programmi di analisi statistica (SPSS, GraphPad). (Italian)
16 January 2022
0 references
Στόχος είναι να μελετηθούν οι πολυμορφικές παραλλαγές του γονιδίου που κωδικοποιούν το μόριο HLA-G, που εμπλέκονται στη διαμόρφωση της ανοσολογικής απόκρισης έναντι των όγκων, σε μια ομάδα ασθενών με γαστρικό αδενοκαρκίνωμα, και να συγκριθεί η συχνότητα των πολυμορφισμών με μια ομάδα ελέγχου, καθώς και να προσδιοριστεί η παρουσία σωματικών μεταλλάξεων που τροποποιούν αυτές τις πολυμορφικές παραλλαγές στον ιστό όγκου κάθε ασθενούς. Επιπλέον, οι παραλλαγές θα συσχετίζονται με τα επίπεδα έκφρασης (διαλυτή και μεμβράνη) της πρωτεΐνης, καθώς και με την κλινική εξέλιξη των ασθενών. Εάν η ανταπόκριση του ανοσοποιητικού συστήματος στον όγκο είναι περιορισμένη, ο όγκος αναμένεται να προχωρήσει ταχύτερα, θέτοντας σε κίνδυνο τη ζωή του ασθενούς. Για να γίνει αυτό, θα ληφθούν δείγματα ιστού (ογκώδης και υγιής) καθώς και δείγματα αίματος από ασθενείς. Το DNA θα εξαχθεί με τη χρήση του κιτ Nucleon BACC (GE Healthcare) και οι σχετικοί πολυμορφισμοί θα αναλυθούν με τη χρήση τεχνικών αλληλουχίας PCR και Sanger και οι συχνότητες τους θα αναλυθούν μέσω εξειδικευμένου λογισμικού (ARLEQUIN, SNPStats). Τα επίπεδα του mRNA και των πρωτεϊνών στον υγιή ιστό και στον ιστό των όγκων κάθε ασθενούς προσδιορίζονται με τη χρήση τεχνικών qPCR, ανοσοϊστοχημείας και ανοσοφθορισμού, καθώς και διαλυτών επιπέδων αυτού και κυτοκινών με ELISA και κυτταρομετρίας ροής, και στις δύο περιπτώσεις με τη χρήση ειδικών μονοκλωνικών αντισωμάτων. Η επίδραση του μορίου HLA-G στα φαινόμενα ενεργοποίησης των λεμφοκυττάρων σε απόκριση σε όγκους θα προσδιοριστεί. Τέλος, οι παράμετροι αυτές θα συσχετίζονται με την κλινική και επιβίωση των ασθενών με προγράμματα στατιστικής ανάλυσης (SPSS, GraphPad). (Greek)
18 August 2022
0 references
Målet er at studere de polymorfe varianter af genkodningen for HLA-G-molekylet, der er involveret i modulering af immunrespons mod tumorer, i en gruppe patienter med gastrisk adenocarcinom, og at sammenligne hyppigheden af polymorfier med en kontrolgruppe samt at bestemme tilstedeværelsen af somatiske mutationer, der ændrer disse polymorfe varianter i tumorvævet hos hver patient. Desuden vil varianter være korreleret med niveauet af ekspression (opløseligt og membran) af proteinet, samt med den kliniske udvikling af patienterne. Hvis immunsystemets reaktion på tumoren er begrænset, forventes tumoren at udvikle sig hurtigere, hvilket bringer patientens liv i fare. For at gøre dette vil der blive udtaget prøver af væv (tumoralt og sundt) samt blodprøver fra patienter. DNA vil blive ekstraheret ved hjælp af Nucleon BACC (GE Healthcare) kit, og de relevante polymorfier vil blive analyseret ved hjælp af PCR og Sanger sekventering teknikker, og deres frekvenser vil blive analyseret gennem specialiseret software (ARLEQUIN, SNPStats). Indholdet af mRNA og protein i hver patients sunde væv og tumorvæv bestemmes ved hjælp af qPCR-, immunhistokemi- og immunfluorescensteknikker samt opløselige niveauer af det og cytokiner ved hjælp af ELISA og flowcytometri, i begge tilfælde under anvendelse af specifikke monoklonale antistoffer. Virkningen af HLA-G-molekylet på lymfocytaktivering fænomener som reaktion på tumorer vil blive bestemt. Endelig vil disse parametre blive korreleret med den kliniske og overlevelse af patienter med statistiske analyseprogrammer (SPSS, GraphPad). (Danish)
18 August 2022
0 references
Tavoitteena on tutkia HLA-G-molekyyliin koodaavan geenin polymorfisia muunnelmia, jotka ovat mukana immuunivasteen muuntamisessa kasvaimia vastaan, ryhmässä potilaita, joilla on mahalaukun adenokarsinoomaa, ja verrata polymorfismin esiintymistiheyttä kontrolliryhmään sekä määrittää somaattisten mutaatioiden esiintyminen, jotka muuttavat näitä polymorfisia variantteja kunkin potilaan kasvainkudoksessa. Lisäksi muunnokset korreloivat proteiinin ilmenemistasojen (liukoinen ja kalvo) sekä potilaiden kliinisen kehityksen kanssa. Jos immuunijärjestelmän vaste kasvaimeen on rajallinen, kasvaimen odotetaan etenevän nopeammin, vaarantaen potilaan elämän. Voit tehdä tämän, näytteitä kudos (kasvain ja terve) sekä verinäytteet potilailta saadaan. DNA uutetaan Nucleon BACC (GE Healthcare) -sarjalla, ja asiaan liittyviä polymorfismia analysoidaan PCR- ja Sanger-sekvensointitekniikoilla, ja niiden taajuudet analysoidaan erikoistuneiden ohjelmistojen (ARLEQUIN, SNPStats) avulla. MRNA:n ja proteiinin pitoisuudet kunkin potilaan terveessä kudoksessa ja kasvainkudoksessa on määritettävä käyttäen qPCR-, immunohistokemia- ja immunofluoresenssitekniikoita sekä sen ja sytokiinien liukoisia pitoisuuksia käyttäen ELISA- ja virtaussytometriaa molemmissa tapauksissa käyttäen erityisiä monoklonaalisia vasta-aineita. HLA-G-molekyylin vaikutus lymfosyyttien aktivoitumisilmiöihin vasteena kasvaimiin määritetään. Nämä parametrit korreloivat tilastoanalyysiohjelmien (SPSS, GraphPad) kliinisen ja eloonjäämisen kanssa. (Finnish)
18 August 2022
0 references
L-għan huwa li jiġu studjati l-varjanti polimorfiċi tal-kodifikazzjoni tal-ġene għall-molekula HLA-G, involuta fil-modulazzjoni tar-rispons immunitarju kontra t-tumuri, fi grupp ta’ pazjenti b’adenokarċinoma gastrika, u li titqabbel il-frekwenza tal-polimorfiżmi ma’ grupp ta’ kontroll, kif ukoll li tiġi ddeterminata l-preżenza ta’ mutazzjonijiet somatiċi li jimmodifikaw dawn il-varjanti polimorfiċi fit-tessut tat-tumur ta’ kull pazjent. Barra minn hekk, il-varjanti ser ikunu korrelatati mal-livelli ta’ espressjoni (solubbli u membrana) tal-proteina, kif ukoll mal-evoluzzjoni klinika tal-pazjenti. Jekk ir-rispons tas-sistema immunitarja għat-tumur ikun limitat, it-tumur huwa mistenni li javvanza aktar malajr, u b’hekk jipperikola l-ħajja tal-pazjent. Biex tagħmel dan, se jinkisbu kampjuni ta’ tessuti (tumorali u b’saħħithom) kif ukoll kampjuni tad-demm mill-pazjenti. Id-DNA se jiġi estratt bl-użu tal-kit ta’ Nucleon BACC (GE Healthcare) u l-polimorfiżmi rilevanti se jiġu analizzati bl-użu ta’ tekniki ta’ sekwenzar ta’ PCR u Sanger, u l-frekwenzi tagħhom se jiġu analizzati permezz ta’ softwer speċjalizzat (ARLEQUIN, SNPStats). Il-livelli ta’ mRNA u proteini fit-tessut b’saħħtu u tat-tumur ta’ kull pazjent għandhom jiġu ddeterminati bl-użu ta’ qPCR, metodi ta’ immunoistokimika u immunofluworexxenza, kif ukoll livelli solubbli tiegħu u ċitokini bl-użu ta’ ELISA u ċitometrija tal-fluss, fiż-żewġ każijiet bl-użu ta’ antikorpi monoklonali speċifiċi. Ser jiġi stabbilit l-effett tal-molekula HLA-G fuq il-fenomeni ta’ attivazzjoni tal-limfoċiti b’rispons għat-tumuri. Fl-aħħar nett, dawn il-parametri se jkunu korrelatati mal-klinika u s-sopravivenza ta’ pazjenti bi programmi ta’ analiżi statistika (SPSS, GraphPad). (Maltese)
18 August 2022
0 references
Mērķis ir pētīt HLA-G molekulas gēna kodēšanas polimorfiskos variantus, kas iesaistīti imūnreakcijas modulēšanā pret audzējiem pacientu grupā ar kuņģa adenokarcinomu, un salīdzināt polimorfismu biežumu ar kontroles grupu, kā arī noteikt somatisko mutāciju klātbūtni, kas modificē šos polimorfiskos variantus katra pacienta audzēja audos. Turklāt varianti tiks saistīti ar olbaltumvielu izteiksmes līmeni (šķīstošo un membrānu), kā arī ar pacientu klīnisko attīstību. Ja imūnsistēmas reakcija uz audzēju ir ierobežota, audzējs ir paredzams progress ātrāk, apdraudot pacienta dzīvi. Lai to izdarītu, tiks iegūti paraugi audu (audzēju un veselīgu), kā arī asins paraugus no pacientiem. DNS tiks ekstrahēta, izmantojot Nucleon BACC (GE Healthcare) komplektu, un attiecīgie polimorfisms tiks analizēti, izmantojot PCR un Sanger sekvencēšanas paņēmienus, un to biežums tiks analizēts, izmantojot specializētu programmatūru (ARLEQUIN, SNPStats). MRNS un olbaltumvielu līmeni katra pacienta veselos un audzēja audos nosaka, izmantojot qPCR, imūnhistoķīmisko un imūnfluorescences metodi, kā arī tā un citokīnu šķīstošo līmeni, izmantojot ELISA un plūsmas citometriju, abos gadījumos izmantojot specifiskas monoklonālās antivielas. HLA-G molekulas ietekme uz limfocītu aktivācijas parādībām, reaģējot uz audzējiem, tiks noteikta. Visbeidzot, šie parametri būs saistīti ar klīnisko un dzīvildzi pacientiem ar statistiskās analīzes programmām (SPSS, GraphPad). (Latvian)
18 August 2022
0 references
Cieľom je študovať polymorfné varianty génu kódovania pre molekulu HLA-G, podieľajúci sa na modulácii imunitnej odpovede proti nádorom, v skupine pacientov s adenokarcinómom žalúdka, a porovnať frekvenciu polymorfizmov s kontrolnou skupinou, ako aj určiť prítomnosť somatických mutácií, ktoré modifikujú tieto polymorfné varianty v nádorovom tkanive každého pacienta. Okrem toho budú varianty korelované s úrovňami expresie (rozpustnej a membránovej) proteínu, ako aj s klinickým vývojom pacientov. Ak je odpoveď imunitného systému na nádor je obmedzená, očakáva sa, že nádor bude postupovať rýchlejšie, čo ohrozuje život pacienta. Na tento účel sa získajú vzorky tkaniva (tumorálne a zdravé), ako aj vzorky krvi od pacientov. DNA sa extrahuje pomocou súpravy Nucleon BACC (GE Healthcare) a príslušné polymorfizmy sa budú analyzovať pomocou techník sekvenovania PCR a Sanger a ich frekvencie sa budú analyzovať prostredníctvom špecializovaného softvéru (ARLEQUIN, SNPStats). Hladiny mRNA a proteínu v zdravom a nádorovom tkanive každého pacienta sa stanovia pomocou techník qPCR, imunohistochémie a imunofluorescencie, ako aj rozpustných hladín a cytokínov pomocou ELISA a prietokovej cytometrie, v oboch prípadoch pomocou špecifických monoklonálnych protilátok. Určí sa vplyv molekuly HLA-G na aktivačné javy lymfocytov v reakcii na nádory. Nakoniec, tieto parametre budú korelovať s klinickým a prežívaním pacientov s programami štatistickej analýzy (SPSS, GraphPad). (Slovak)
18 August 2022
0 references
Is é an aidhm ná staidéar a dhéanamh ar na leaganacha polamorfacha den ionchódú géine don mhóilín HLA-G, a bhfuil baint acu leis an bhfreagairt imdhíonachta i gcoinne siadaí a mhodhnú, i ngrúpa othar a bhfuil adenocarcinoma gastric acu, agus minicíocht na polymorphisms a chur i gcomparáid le grúpa rialaithe, chomh maith le láithreacht sóchán sómach a mhodhnú sna leaganacha polamorfacha seo i bhfíochán meall gach othar. Ina theannta sin, déanfar athraithigh a chomhghaolú le leibhéil léirithe (intuaslagtha agus scannáin) na próitéine, chomh maith le héabhlóid chliniciúil na n-othar. Má tá freagra an chórais imdhíonachta ar an meall teoranta, táthar ag súil go rachaidh an meall chun cinn níos tapúla, ag cur saol an othair i mbaol. Chun seo a dhéanamh, gheofar samplaí fíocháin (meall agus sláintiúil) chomh maith le samplaí fola ó othair. Bainfear DNA as trealamh Nucleon BACC (Cúram Sláinte GGE) agus déanfar anailís ar na polamorfaigh ábhartha trí theicnící PCR agus Seicheamhaithe Contúirt a úsáid, agus déanfar anailís ar a minicíochtaí trí bhogearraí speisialaithe (ARLEQUIN, SNPStats). Déanfar na leibhéil mRNA agus próitéine i bhfíochán sláintiúil agus meall gach othair a chinneadh trí úsáid a bhaint as qPCR, as teicnící imdhíoncheimice agus imdhíonfhluaraiseachta, chomh maith le leibhéil intuaslagtha ann agus as cíteacáin ina n-úsáidtear ELISA agus as cítiméadracht sreafa, agus úsáid á baint as antasubstaintí monaclóineacha sonracha sa dá chás. Cinnfear éifeacht an mhóilín HLA-G ar fheiniméin gníomhachtaithe lymphocyte mar fhreagra ar siadaí. Ar deireadh, beidh na paraiméadair seo a chomhghaolú le cliniciúil agus marthanais na n-othar le cláir anailíse staidrimh (SPSS, GraphPad). (Irish)
18 August 2022
0 references
Cílem je studovat polymorfní varianty genového kódování molekuly HLA-G, které se podílejí na modulaci imunitní reakce proti nádorům, ve skupině pacientů s adenokarcinomem žaludku, porovnat frekvenci polymorfismů s kontrolní skupinou a určit přítomnost somatických mutací, které tyto polymorfní varianty modifikují v nádorové tkáni každého pacienta. Kromě toho budou varianty korelovány s hladinami exprese (rozpustné a membrány) proteinu, stejně jako s klinickým vývojem pacientů. Pokud je reakce imunitního systému na nádor omezená, očekává se, že nádor bude postupovat rychleji, což ohrožuje život pacienta. K tomu budou získány vzorky tkáně (nádorové a zdravé), stejně jako krevní vzorky od pacientů. DNA bude extrahována pomocí sady Nucleon BACC (GE Healthcare) a příslušné polymorfismy budou analyzovány pomocí technik PCR a Sanger sekvenování a jejich frekvence budou analyzovány prostřednictvím specializovaného softwaru (ARLEQUIN, SNPStats). Hladiny mRNA a proteinu v zdravé a nádorové tkáni každého pacienta se stanoví pomocí qPCR, imunohistochemie a imunofluorescenčních technik, jakož i rozpustných hladin a cytokinů pomocí ELISA a průtokové cytometrie, v obou případech za použití specifických monoklonálních protilátek. Vliv molekuly HLA-G na jevy aktivace lymfocytů v reakci na nádory bude stanoven. Konečně, tyto parametry budou korelovat s klinickou a přežití pacientů s programy statistické analýzy (SPSS, GraphPad). (Czech)
18 August 2022
0 references
O objetivo é estudar as variantes polimórficas da codificação genética para a molécula HLA-G, envolvidas na modulação da resposta imunitária contra tumores, num grupo de doentes com adenocarcinoma gástrico, e comparar a frequência de polimorfismos com um grupo de controlo, bem como determinar a presença de mutações somáticas que modificam estas variantes polimórficas no tecido tumoral de cada doente. Além disso, as variantes serão correlacionadas com os níveis de expressão (solúvel e membrana) da proteína, bem como com a evolução clínica dos doentes. Se a resposta do sistema imunitário ao tumor for limitada, prevê-se que o tumor progrida mais rapidamente, pondo em perigo a vida do doente. Para isso, serão obtidas amostras de tecido (tumoral e saudável), bem como amostras de sangue dos doentes. O ADN será extraído utilizando o kit Nucleon BACC (GE Healthcare) e os polimorfismos relevantes serão analisados utilizando técnicas de sequenciação PCR e Sanger, e as suas frequências serão analisadas através de software especializado (ARLEQUIN, SNPStats). Os níveis de ARNm e de proteína no tecido saudável e tumoral de cada doente devem ser determinados utilizando técnicas de qPCR, imuno-histoquímica e imunofluorescência, bem como os seus níveis solúveis e citocinas utilizando ELISA e citometria de fluxo, em ambos os casos utilizando anticorpos monoclonais específicos. O efeito da molécula de HLA-G nos fenómenos de activação dos linfócitos em resposta a tumores será determinado. Por fim, estes parâmetros serão correlacionados com a clínica e a sobrevida dos pacientes com programas de análise estatística (SPSS, GraphPad). (Portuguese)
18 August 2022
0 references
Eesmärk on uurida HLA-G molekuli kodeeriva geeni polümorfseid variante, mis on seotud immuunvastuse muutmisega kasvajate vastu, mao adenokartsinoomiga patsientide rühmas, ning võrrelda polümorfismide sagedust kontrollrühmaga, samuti määrata kindlaks somaatiliste mutatsioonide olemasolu, mis muudavad neid polümorfseid variante iga patsiendi kasvajakoes. Lisaks on variandid korrelatsioonis valgu ekspressioonitasemega (lahustuv ja membraan) ning patsientide kliinilise arenguga. Kui immuunsüsteemi vastus kasvajale on piiratud, eeldatakse, et kasvaja progresseerub kiiremini, ohustades patsiendi elu. Selleks võetakse nii koeproovid (kasvaja- ja terved) kui ka vereproovid patsientidelt. DNA ekstraheeritakse Nucleon BACC (GE Healthcare) komplekti abil ning asjaomaseid polümorfisme analüüsitakse PCR- ja Sangeri sekveneerimise tehnikate abil ning nende sagedusi analüüsitakse spetsiaalse tarkvara (ARLEQUIN, SNPStats) abil. MRNA ja valkude sisaldus iga patsiendi terves ja kasvajakoes määratakse kindlaks qPCRi, immunohistokeemia ja immunofluorestsentstehnika abil, samuti lahustuva aine ja tsütokiinide sisaldus ELISA ja voolutsütomeetria abil, kasutades mõlemal juhul spetsiifilisi monoklonaalseid antikehi. Määratakse HLA-G molekuli mõju lümfotsüütide aktiveerimise nähtustele vastusena kasvajatele. Lõpuks on need parameetrid korrelatsioonis statistilise analüüsi programmidega (SPSS, GraphPad) patsientide kliinilise ja elulemusega. (Estonian)
18 August 2022
0 references
A cél a gyomor adenokarcinómában szenvedő betegek egy csoportjában a HLA-G molekulára kódoló gén polimorf variánsainak tanulmányozása, amelyek részt vesznek a tumorok elleni immunválasz modulálásában, és összehasonlítják a polimorfizmusok gyakoriságát egy kontrollcsoporttal, valamint meghatározzák az egyes betegek tumorszövetében ezeket a polimorf variánsokat módosító szomatikus mutációk jelenlétét. Emellett a variánsok korrelálnak a fehérje expressziójának szintjével (oldható és membrán), valamint a betegek klinikai fejlődésével. Ha az immunrendszer válasza a tumorra korlátozott, a tumor várhatóan gyorsabban fejlődik, veszélyeztetve a beteg életét. Ehhez mintát vesznek a szövetekből (tumorális és egészséges), valamint vérmintákat a betegektől. A DNS-t a Nucleon BACC (GE Healthcare) készlet segítségével nyerik ki, és a vonatkozó polimorfizmusokat PCR és Sanger szekvenálási technikák alkalmazásával elemzik, gyakoriságukat pedig speciális szoftverrel (ARLEQUIN, SNPStats) elemzik. Az mRNS- és fehérjeszinteket az egyes betegek egészséges és tumorszöveteiben a qPCR, az immunhisztokémia és az immunfluoreszcencia technikák, valamint az oldható szintek és a citokinek ELISA és áramlási citometriával történő felhasználásával kell meghatározni, mindkét esetben specifikus monoklonális antitestek felhasználásával. A HLA-G molekula hatása a lymphocyta-aktiválási jelenségekre a tumorokra adott válaszként kerül meghatározásra. Végül ezek a paraméterek korrelálnak a statisztikai elemzési programokkal (SPSS, GraphPad) rendelkező betegek klinikai és túlélési arányával. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
Целта е да се проучат полиморфните варианти на генното кодиране на молекулата HLA-G, участващи в модулирането на имунния отговор срещу тумори, в група пациенти със стомашен аденокарцином, и да се сравни честотата на полиморфизмите с контролна група, както и да се определи наличието на соматични мутации, които променят тези полиморфни варианти в туморната тъкан на всеки пациент. Освен това вариантите ще бъдат свързани с нивата на експресия (разтворим и мембранен) на протеина, както и с клиничната еволюция на пациентите. Ако реакцията на имунната система към тумора е ограничена, се очаква туморът да прогресира по-бързо, застрашавайки живота на пациента. За тази цел ще бъдат взети проби от тъкани (туморални и здрави), както и кръвни проби от пациенти. ДНК ще бъде извлечена с помощта на комплекта Nucleon BACC (GE Healthcare) и съответните полиморфизми ще бъдат анализирани с помощта на техники за секвениране на PCR и Sanger и тяхната честота ще бъде анализирана чрез специализиран софтуер (ARLEQUIN, SNPStats). Нивата на иРНК и протеина в здравата и туморната тъкан на всеки пациент се определят с помощта на qPCR, имунохистохимия и имунофлуоресцентни техники, както и разтворими нива на нея и цитокини, използващи ELISA и поточна цитометрия, като и в двата случая се използват специфични моноклонални антитела. Ще бъде определен ефектът на молекулата HLA-G върху явленията за активиране на лимфоцитите в отговор на туморите. И накрая, тези параметри ще бъдат свързани с клиничната и преживяемостта на пациенти със статистически програми за анализ (SPSS, GraphPad). (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
Tikslas – ištirti HLA-G molekulės koduojančio geno polimorfinius variantus, dalyvaujančius moduliuojant imuninį atsaką nuo navikų, pacientų, sergančių skrandžio adenokarcinoma, grupėje ir palyginti polimorfizmo dažnį su kontroline grupe, taip pat nustatyti somatinių mutacijų, kurios keičia šiuos polimorfinius variantus kiekvieno paciento naviko audinyje, buvimą. Be to, variantai bus susiję su baltymų ekspresijos (tirpios ir membranos) lygiais, taip pat su pacientų klinikine raida. Jei imuninės sistemos atsakas į naviką yra ribotas, tikimasi, kad navikas progresuos greičiau, keldamas pavojų paciento gyvenimui. Norėdami tai padaryti, bus gauti audinių mėginiai (navikinis ir sveikas), taip pat kraujo mėginiai iš pacientų. DNR bus išgauta naudojant Nucleon BACC (GE Healthcare) rinkinį, o atitinkami polimorfizmai bus analizuojami taikant PGR ir Sanger sekos nustatymo metodus, o jų dažnis bus analizuojamas naudojant specializuotą programinę įrangą (ARLEQUIN, SNPStats). MRNR ir baltymų kiekiai kiekvieno paciento sveikame ir navikiniame audinyje nustatomi taikant qPGR, imunohistocheminius ir imunofluorescencinius metodus, taip pat tirpius jų ir citokinų kiekius, naudojant ELISA ir srauto citometriją, abiem atvejais naudojant specifinius monokloninius antikūnus. Bus nustatytas HLA-G molekulės poveikis limfocitų aktyvacijos reiškiniams reaguojant į navikus. Galiausiai šie parametrai bus susiję su pacientų, kuriems taikomos statistinės analizės programos (SPSS, GraphPad), klinikiniu ir išgyvenamumu. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
Cilj je proučiti polimorfne varijante gena kodiranja za molekulu HLA-G, uključene u modulaciju imunološkog odgovora na tumore, u skupini bolesnika s adenokarcinomom želuca, te usporediti učestalost polimorfizama s kontrolnom skupinom, kao i utvrditi prisutnost somatskih mutacija koje modificiraju ove polimorfne varijante u tumorskom tkivu svakog pacijenta. Osim toga, varijante će biti u korelaciji s razinama ekspresije (topljive i membrane) proteina, kao i s kliničkom evolucijom bolesnika. Ako je odgovor imunološkog sustava na tumor ograničen, očekuje se da će tumor brže napredovati, ugrožavajući pacijentov život. Da biste to učinili, dobit će se uzorci tkiva (tumorni i zdravi), kao i uzorci krvi pacijenata. DNK će se ekstrahirati pomoću kompleta Nucleon BACC (GE Healthcare), a relevantni polimorfizmi analizirat će se pomoću tehnika sekvenciranja PCR-a i Sangera, a njihove će se frekvencije analizirati putem specijaliziranog softvera (ARLEQUIN, SNPStats). Razine mRNK i proteina u zdravom i tumorskom tkivu svakog bolesnika određuju se primjenom qPCR-a, imunohistokemije i imunofluorescencije, kao i topljivih razina tih tvari i citokina primjenom ELISA-e i protočne citometrije, u oba slučaja primjenom specifičnih monoklonskih protutijela. Utvrdit će se učinak molekule HLA-G na fenomene aktivacije limfocita kao odgovor na tumore. Konačno, ti će parametri biti u korelaciji s kliničkim i preživljavanjem bolesnika s programima statističke analize (SPSS, GraphPad). (Croatian)
18 August 2022
0 references
Syftet är att studera de polymorfiska varianterna av genkodningen för HLA-G-molekylen, involverad i modulering av immunsvaret mot tumörer, i en grupp patienter med gastrisk adenokarcinom, och att jämföra frekvensen av polymorfier med en kontrollgrupp, samt att bestämma förekomsten av somatiska mutationer som modifierar dessa polymorfiska varianter i tumörvävnaden hos varje patient. Dessutom kommer varianter att korreleras med nivåerna av uttryck (lösliga och membran) av proteinet, liksom med den kliniska utvecklingen av patienter. Om immunsystemets svar på tumören är begränsat, förväntas tumören fortskrida snabbare, vilket äventyrar patientens liv. För att göra detta kommer prover av vävnad (tumoral och frisk) samt blodprover från patienter att tas. DNA kommer att extraheras med hjälp av Nucleon BACC (GE Healthcare) kit och de relevanta polymorfismerna kommer att analyseras med PCR- och Sanger-sekvenseringstekniker, och deras frekvenser kommer att analyseras genom specialiserad programvara (ARLEQUIN, SNPStats). Nivåerna av mRNA och protein i varje patients friska vävnad och tumörvävnad ska bestämmas med hjälp av qPCR, immunohistokemi och immunofluorescens, liksom lösliga nivåer av den och cytokiner med hjälp av ELISA och flödescytometri, i båda fallen med användning av specifika monoklonala antikroppar. Effekten av HLA-G-molekylen på lymfocytaktiveringsfenomen som svar på tumörer kommer att bestämmas. Slutligen kommer dessa parametrar att korreleras med klinisk och överlevnad för patienter med statistiska analysprogram (SPSS, GraphPad). (Swedish)
18 August 2022
0 references
Scopul este de a studia variantele polimorfe ale genei codării moleculei HLA-G, implicate în modularea răspunsului imun împotriva tumorilor, într-un grup de pacienți cu adenocarcinom gastric, și de a compara frecvența polimorfismelor cu un grup de control, precum și de a determina prezența mutațiilor somatice care modifică aceste variante polimorfe în țesutul tumoral al fiecărui pacient. În plus, variantele vor fi corelate cu nivelurile de expresie (solubilă și membrană) ale proteinei, precum și cu evoluția clinică a pacienților. În cazul în care răspunsul sistemului imunitar la tumoare este limitat, tumora este de așteptat să progreseze mai repede, punând în pericol viața pacientului. Pentru a face acest lucru, se vor obține probe de țesut (tumoral și sănătos), precum și probe de sânge de la pacienți. ADN-ul va fi extras cu ajutorul kitului Nucleon BACC (GE Healthcare), iar polimorfismele relevante vor fi analizate folosind tehnici de secvențiere PCR și Sanger, iar frecvențele lor vor fi analizate prin software specializat (ARLEQUIN, SNPStats). Nivelurile de ARNm și proteine din țesutul sănătos și tumoral al fiecărui pacient se determină utilizându-se qPCR, tehnici de imunohistochimie și imunofluorescență, precum și nivelurile solubile ale acestuia și ale citokinelor utilizând ELISA și citometria de flux, în ambele cazuri utilizând anticorpi monoclonali specifici. Efectul moleculei HLA-G asupra fenomenelor de activare a limfocitelor ca răspuns la tumori va fi determinat. În cele din urmă, acești parametri vor fi corelați cu clinica și supraviețuirea pacienților cu programe de analiză statistică (SPSS, GraphPad). (Romanian)
18 August 2022
0 references
Cilj je preučiti polimorfne variante gena, kodiranega za molekulo HLA-G, ki sodelujejo pri modulaciji imunskega odziva proti tumorjem v skupini bolnikov z adenokarcinomom želodca, in primerjati pogostost polimorfizmov s kontrolno skupino ter določiti prisotnost somatskih mutacij, ki spreminjajo te polimorfne variante v tumorskem tkivu vsakega bolnika. Poleg tega bodo variante povezane z ravnmi izražanja (topno in membrano) beljakovine, pa tudi s kliničnim razvojem bolnikov. Če je odziv imunskega sistema na tumor omejen, se pričakuje, da bo tumor napredoval hitreje, kar bo ogrozilo bolnikovo življenje. V ta namen bodo pridobljeni vzorci tkiva (tumorsko in zdravo) ter vzorci krvi bolnikov. DNK se ekstrahira s kompletom Nucleon BACC (GE Healthcare), ustrezni polimorfizmi pa se analizirajo s tehnikami sekvenciranja PCR in Sanger, njihove frekvence pa se analizirajo s specializirano programsko opremo (ARLEQUIN, SNPStats). Ravni mRNA in beljakovin v zdravem in tumorskem tkivu vsakega bolnika se določijo z uporabo qPCR, imunohistokemijskih in imunofluorescenčnih tehnik ter topnih ravni citokinov z uporabo ELISA in pretočne citometrije, v obeh primerih z uporabo specifičnih monoklonskih protiteles. Določi se učinek molekule HLA-G na pojave aktivacije limfocitov kot odziv na tumorje. Nazadnje, ti parametri bodo povezani s kliničnim stanjem in preživetjem bolnikov s programi statistične analize (SPSS, GraphPad). (Slovenian)
18 August 2022
0 references
Celem jest zbadanie polimorficznych wariantów kodowania genu cząsteczki HLA-G, biorących udział w modulowaniu odpowiedzi immunologicznej przeciwko nowotworom, w grupie pacjentów z gruczolakiem żołądka, oraz porównanie częstości występowania polimorfizmów z grupą kontrolną, a także określenie obecności mutacji somatycznych, które modyfikują te warianty polimorficzne w tkance nowotworowej każdego pacjenta. Ponadto warianty będą skorelowane z poziomem ekspresji (rozpuszczalnym i błonowym) białka, a także z ewolucją kliniczną pacjentów. Jeśli odpowiedź układu odpornościowego na nowotwór jest ograniczona, oczekuje się, że guz będzie postępować szybciej, zagrażając życiu pacjenta. W tym celu zostaną pobrane próbki tkanek (tumoralnych i zdrowych) oraz próbki krwi od pacjentów. DNA będzie ekstrahowane za pomocą zestawu Nucleon BACC (GE Healthcare), a odpowiednie polimorfizmy będą analizowane przy użyciu technik sekwencjonowania PCR i Sangera, a ich częstotliwości będą analizowane za pomocą specjalistycznego oprogramowania (ARLEQUIN, SNPStats). Poziomy mRNA i białka w zdrowych tkankach i tkankach nowotworowych każdego pacjenta określa się za pomocą technik qPCR, immunohistochemii i immunofluorescencji, a także jego rozpuszczalnych poziomów i cytokin stosujących test ELISA i cytometrię przepływową, w obu przypadkach przy użyciu specyficznych przeciwciał monoklonalnych. Wpływ cząsteczki HLA-G na zjawiska aktywacji limfocytów w odpowiedzi na nowotwory zostaną określone. Ponadto parametry te będą skorelowane z klinicznym i przeżyciem pacjentów z programami analizy statystycznej (SPSS, GraphPad). (Polish)
18 August 2022
0 references
Madrid
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI18_00626
0 references