Influence of heart failure on the factors involved in nucleocytoplasmic transport of RNAs and its relationship to ventricular function. (Q3137984): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(Changed label, description and/or aliases in en) |
(Changed label, description and/or aliases in pt) |
||||||||||||||
| (15 intermediate revisions by 2 users not shown) | |||||||||||||||
| label / en | label / en | ||||||||||||||
Influence of heart failure on the factors involved in nucleocytoplasmic transport of RNAs and its relationship to ventricular function. | |||||||||||||||
| label / fr | label / fr | ||||||||||||||
Influence de l’insuffisance cardiaque sur les facteurs impliqués dans le transport nucléocytoplasmique des ARN et sa relation avec la fonction ventriculaire. | |||||||||||||||
| label / de | label / de | ||||||||||||||
Einfluss der Herzinsuffizienz auf die Faktoren, die am nukleozytoplasmischen Transport von RNAs und seiner Beziehung zur ventrikulären Funktion beteiligt sind. | |||||||||||||||
| label / nl | label / nl | ||||||||||||||
Invloed van hartfalen op de factoren die betrokken zijn bij nucleocytoplasmic transport van RNA’s en zijn relatie tot ventriculaire functie. | |||||||||||||||
| label / it | label / it | ||||||||||||||
Influenza dell'insufficienza cardiaca sui fattori coinvolti nel trasporto nucleocitoplasmico degli RNA e sulla sua relazione con la funzione ventricolare. | |||||||||||||||
| label / et | label / et | ||||||||||||||
Südamepuudulikkuse mõju RNA-de nukleotsütoplasma transporti mõjutavatele teguritele ja selle seosele ventrikulaarse funktsiooniga. | |||||||||||||||
| label / lt | label / lt | ||||||||||||||
Širdies nepakankamumo įtaka nukleocitoplazminio RNR pernešimo veiksniams ir jo santykiui su skilvelių funkcija. | |||||||||||||||
| label / hr | label / hr | ||||||||||||||
Utjecaj zatajenja srca na čimbenike koji su uključeni u nukleocitoplazmički prijenos RNK-a i njegovu povezanost s funkcijom klijetke. | |||||||||||||||
| label / el | label / el | ||||||||||||||
Επίδραση της καρδιακής ανεπάρκειας στους παράγοντες που εμπλέκονται στην νουκλεοκυτταροπλασματική μεταφορά των RNAs και στη σχέση της με την κοιλιακή λειτουργία. | |||||||||||||||
| label / sk | label / sk | ||||||||||||||
Vplyv srdcového zlyhania na faktory podieľajúce sa na nukleocytoplazmickom transporte RNAs a jeho vzťah k ventrikulárnej funkcii. | |||||||||||||||
| label / fi | label / fi | ||||||||||||||
Sydämen vajaatoiminnan vaikutus RNA: n nukleosytoplasmiseen kulkeutumiseen liittyviin tekijöihin ja sen suhde kammion toimintaan. | |||||||||||||||
| label / pl | label / pl | ||||||||||||||
Wpływ niewydolności serca na czynniki związane z transportem nukleocytoplazmatycznym RNA i jego związek z czynnością komorową. | |||||||||||||||
| label / hu | label / hu | ||||||||||||||
A szívelégtelenség hatása az RNS-ek nukleocitoplazmikus transzportjában és a kamrai funkcióval való kapcsolatában szerepet játszó tényezőkre. | |||||||||||||||
| label / cs | label / cs | ||||||||||||||
Vliv srdečního selhání na faktory podílející se na nukleocytoplasmickém přenosu RNA a jeho vztah k ventrikulární funkci. | |||||||||||||||
| label / lv | label / lv | ||||||||||||||
Sirds mazspējas ietekme uz faktoriem, kas saistīti ar RNS nukleocitoplazmas transportēšanu, un tās saistība ar kambaru funkciju. | |||||||||||||||
| label / ga | label / ga | ||||||||||||||
An tionchar a bhíonn ag cliseadh croí ar na tosca a bhaineann le hiompar núicléiceach RNAs agus a ghaolmhaireacht le feidhm ventricular. | |||||||||||||||
| label / sl | label / sl | ||||||||||||||
Vpliv srčnega popuščanja na dejavnike, ki so vključeni v nukleocitoplazmični transport RNK, in njegovo povezavo z ventrikularno funkcijo. | |||||||||||||||
| label / bg | label / bg | ||||||||||||||
Влияние на сърдечната недостатъчност върху факторите, участващи в нуклеоцитоплазмения пренос на РНК и връзката му с камерната функция. | |||||||||||||||
| label / mt | label / mt | ||||||||||||||
L-influwenza ta’ insuffiċjenza tal-qalb fuq il-fatturi involuti fit-trasport nuklejoċitoplasmiku ta’ RNAs u r-relazzjoni tiegħu mal-funzjoni ventrikulari. | |||||||||||||||
| label / pt | label / pt | ||||||||||||||
Influência da insuficiência cardíaca nos factores envolvidos no transporte nucleocytoplasmic de RNAs e sua relação à função ventricular. | |||||||||||||||
| label / da | label / da | ||||||||||||||
Indflydelse af hjertesvigt på de faktorer, der er involveret i nukleocytoplasmisk transport af RNA'er og dets forhold til ventrikulær funktion. | |||||||||||||||
| label / ro | label / ro | ||||||||||||||
Influența insuficienței cardiace asupra factorilor implicați în transportul nucleocitoplasmic al ARN-urilor și relația sa cu funcția ventriculară. | |||||||||||||||
| label / sv | label / sv | ||||||||||||||
Påverkan av hjärtsvikt på de faktorer som är involverade i nukleocytoplasmisk transport av RNA och dess förhållande till ventrikulär funktion. | |||||||||||||||
| description / bg | description / bg | ||||||||||||||
Проект Q3137984 в Испания | |||||||||||||||
| description / hr | description / hr | ||||||||||||||
Projekt Q3137984 u Španjolskoj | |||||||||||||||
| description / hu | description / hu | ||||||||||||||
Projekt Q3137984 Spanyolországban | |||||||||||||||
| description / cs | description / cs | ||||||||||||||
Projekt Q3137984 ve Španělsku | |||||||||||||||
| description / da | description / da | ||||||||||||||
Projekt Q3137984 i Spanien | |||||||||||||||
| description / nl | description / nl | ||||||||||||||
Project Q3137984 in Spanje | |||||||||||||||
| description / et | description / et | ||||||||||||||
Projekt Q3137984 Hispaanias | |||||||||||||||
| description / fi | description / fi | ||||||||||||||
Projekti Q3137984 Espanjassa | |||||||||||||||
| description / fr | description / fr | ||||||||||||||
Projet Q3137984 en Espagne | |||||||||||||||
| description / de | description / de | ||||||||||||||
Projekt Q3137984 in Spanien | |||||||||||||||
| description / el | description / el | ||||||||||||||
Έργο Q3137984 στην Ισπανία | |||||||||||||||
| description / ga | description / ga | ||||||||||||||
Tionscadal Q3137984 sa Spáinn | |||||||||||||||
| description / it | description / it | ||||||||||||||
Progetto Q3137984 in Spagna | |||||||||||||||
| description / lv | description / lv | ||||||||||||||
Projekts Q3137984 Spānijā | |||||||||||||||
| description / lt | description / lt | ||||||||||||||
Projektas Q3137984 Ispanijoje | |||||||||||||||
| description / mt | description / mt | ||||||||||||||
Proġett Q3137984 fi Spanja | |||||||||||||||
| description / pl | description / pl | ||||||||||||||
Projekt Q3137984 w Hiszpanii | |||||||||||||||
| description / pt | description / pt | ||||||||||||||
Projeto Q3137984 na Espanha | |||||||||||||||
| description / ro | description / ro | ||||||||||||||
Proiectul Q3137984 în Spania | |||||||||||||||
| description / sk | description / sk | ||||||||||||||
Projekt Q3137984 v Španielsku | |||||||||||||||
| description / sl | description / sl | ||||||||||||||
Projekt Q3137984 v Španiji | |||||||||||||||
| description / es | description / es | ||||||||||||||
Proyecto Q3137984 en España | |||||||||||||||
| description / sv | description / sv | ||||||||||||||
Projekt Q3137984 i Spanien | |||||||||||||||
| Property / budget | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / budget: 63,000.0 Euro / rank | |||||||||||||||
| Property / co-financing rate | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / co-financing rate: 50.0 percent / rank | |||||||||||||||
| Property / EU contribution | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / EU contribution: 31,500.0 Euro / rank | |||||||||||||||
| Property / postal code | |||||||||||||||
| Property / postal code: 46250 / rank | |||||||||||||||
| Property / location (string) | |||||||||||||||
| Property / location (string): Valencia / rank | |||||||||||||||
| Property / contained in Local Administrative Unit | |||||||||||||||
| Property / contained in Local Administrative Unit: València / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
The nuclear phase of gene expression in eukaryotes, including post-transcriptional modifications in mRNA and packaged in ribonucleoproteins (PMRN), ends with its transport to the cytoplasm through the nuclear pore for subsequent translation, and requires the presence of a number of factors for its completion. The objective of the project is to determine the expression, by RNA sequencing, of those molecules that coordinate the export of RNAs to cytoplasm in human heart failure (CI), such as the TREX (Transcription-export) protein complex; group THO, DEAD-box helicases, and Aly adapter), the NXF1:NXT1 factor (Tap:p15) and its GANP promoter, and the Dbp5 (DDX19) that facilitates the transport of mRNA (in the form of a NMR) to the cytoplasmic face of the nuclear pore. In addition, using microarrays, we will determine the expression of small RNAs that do not encode proteins (snoRNAs and scaRNAs) and play an important role in regulating gene expression; these RNAs share some transport factors with those of mRNA. Let’s compare the expression data of both types of RNAs in the same patients, and we will relate the results to the complexes and factors involved in their transport to the cytoplasm. 42 left ventricle samples will be used from patients with HF, of ischemic or dilated origin, who required a heart transplant, and 14 left ventricle samples from healthy individuals, who died from non-cardiac causes. The computational analysis of the data will allow us to obtain differentiated expression and functional analysis. The results will be validated by in situ hybridisation, qRT-PCR, western-blot, and immunocytochemistry, and the data obtained will be compared with ventricular function and cardiac remodeling. The project samples have already been obtained by the group. (English) | |||||||||||||||
| Property / summary: The nuclear phase of gene expression in eukaryotes, including post-transcriptional modifications in mRNA and packaged in ribonucleoproteins (PMRN), ends with its transport to the cytoplasm through the nuclear pore for subsequent translation, and requires the presence of a number of factors for its completion. The objective of the project is to determine the expression, by RNA sequencing, of those molecules that coordinate the export of RNAs to cytoplasm in human heart failure (CI), such as the TREX (Transcription-export) protein complex; group THO, DEAD-box helicases, and Aly adapter), the NXF1:NXT1 factor (Tap:p15) and its GANP promoter, and the Dbp5 (DDX19) that facilitates the transport of mRNA (in the form of a NMR) to the cytoplasmic face of the nuclear pore. In addition, using microarrays, we will determine the expression of small RNAs that do not encode proteins (snoRNAs and scaRNAs) and play an important role in regulating gene expression; these RNAs share some transport factors with those of mRNA. Let’s compare the expression data of both types of RNAs in the same patients, and we will relate the results to the complexes and factors involved in their transport to the cytoplasm. 42 left ventricle samples will be used from patients with HF, of ischemic or dilated origin, who required a heart transplant, and 14 left ventricle samples from healthy individuals, who died from non-cardiac causes. The computational analysis of the data will allow us to obtain differentiated expression and functional analysis. The results will be validated by in situ hybridisation, qRT-PCR, western-blot, and immunocytochemistry, and the data obtained will be compared with ventricular function and cardiac remodeling. The project samples have already been obtained by the group. (English) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: The nuclear phase of gene expression in eukaryotes, including post-transcriptional modifications in mRNA and packaged in ribonucleoproteins (PMRN), ends with its transport to the cytoplasm through the nuclear pore for subsequent translation, and requires the presence of a number of factors for its completion. The objective of the project is to determine the expression, by RNA sequencing, of those molecules that coordinate the export of RNAs to cytoplasm in human heart failure (CI), such as the TREX (Transcription-export) protein complex; group THO, DEAD-box helicases, and Aly adapter), the NXF1:NXT1 factor (Tap:p15) and its GANP promoter, and the Dbp5 (DDX19) that facilitates the transport of mRNA (in the form of a NMR) to the cytoplasmic face of the nuclear pore. In addition, using microarrays, we will determine the expression of small RNAs that do not encode proteins (snoRNAs and scaRNAs) and play an important role in regulating gene expression; these RNAs share some transport factors with those of mRNA. Let’s compare the expression data of both types of RNAs in the same patients, and we will relate the results to the complexes and factors involved in their transport to the cytoplasm. 42 left ventricle samples will be used from patients with HF, of ischemic or dilated origin, who required a heart transplant, and 14 left ventricle samples from healthy individuals, who died from non-cardiac causes. The computational analysis of the data will allow us to obtain differentiated expression and functional analysis. The results will be validated by in situ hybridisation, qRT-PCR, western-blot, and immunocytochemistry, and the data obtained will be compared with ventricular function and cardiac remodeling. The project samples have already been obtained by the group. (English) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 12 October 2021
| |||||||||||||||
| Property / summary: The nuclear phase of gene expression in eukaryotes, including post-transcriptional modifications in mRNA and packaged in ribonucleoproteins (PMRN), ends with its transport to the cytoplasm through the nuclear pore for subsequent translation, and requires the presence of a number of factors for its completion. The objective of the project is to determine the expression, by RNA sequencing, of those molecules that coordinate the export of RNAs to cytoplasm in human heart failure (CI), such as the TREX (Transcription-export) protein complex; group THO, DEAD-box helicases, and Aly adapter), the NXF1:NXT1 factor (Tap:p15) and its GANP promoter, and the Dbp5 (DDX19) that facilitates the transport of mRNA (in the form of a NMR) to the cytoplasmic face of the nuclear pore. In addition, using microarrays, we will determine the expression of small RNAs that do not encode proteins (snoRNAs and scaRNAs) and play an important role in regulating gene expression; these RNAs share some transport factors with those of mRNA. Let’s compare the expression data of both types of RNAs in the same patients, and we will relate the results to the complexes and factors involved in their transport to the cytoplasm. 42 left ventricle samples will be used from patients with HF, of ischemic or dilated origin, who required a heart transplant, and 14 left ventricle samples from healthy individuals, who died from non-cardiac causes. The computational analysis of the data will allow us to obtain differentiated expression and functional analysis. The results will be validated by in situ hybridisation, qRT-PCR, western-blot, and immunocytochemistry, and the data obtained will be compared with ventricular function and cardiac remodeling. The project samples have already been obtained by the group. (English) / qualifier | |||||||||||||||
readability score: 0.2545147828615033
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
La phase nucléaire de l’expression génique chez les eucaryotes, y compris les modifications post-transcriptionnelles de l’ARNm et conditionnées dans les ribonucléoprotéines (PMRN), se termine par son transport vers le cytoplasme à travers le pore nucléaire pour traduction ultérieure, et nécessite la présence d’un certain nombre de facteurs pour son achèvement. L’objectif du projet est de déterminer l’expression, par séquençage de l’ARN, des molécules qui coordonnent l’exportation d’ARN vers le cytoplasme dans l’insuffisance cardiaque humaine (IC), comme le complexe protéique TREX (Transcription-export); le groupe THO, les hélicases DEAD-box et l’adaptateur Aly), le facteur NXF1:NXT1 (Tap:p15) et son promoteur GANP, et le Dbp5 (DDX19) qui facilite le transport de l’ARNm (sous la forme d’une RMN) vers le visage cytoplasmique du porre nucléaire. En outre, en utilisant des microréseaux, nous déterminerons l’expression de petits ARN qui ne codent pas les protéines (snoRNAs et scaRNAs) et joueront un rôle important dans la régulation de l’expression des gènes; ces ARN partagent certains facteurs de transport avec ceux de l’ARNm. Comparons les données d’expression des deux types d’ARN chez les mêmes patients, et nous allons relier les résultats aux complexes et aux facteurs impliqués dans leur transport vers le cytoplasme. 42 échantillons de ventricule gauche seront utilisés chez des patients atteints de FH, d’origine ischémique ou dilatée, qui ont besoin d’une greffe cardiaque, et 14 échantillons de ventricule gauche provenant d’individus sains qui sont morts de causes non cardiaques. L’analyse computationnelle des données nous permettra d’obtenir une expression différenciée et une analyse fonctionnelle. Les résultats seront validés par hybridation in situ, qRT-PCR, Western-blot et immunocytochimie, et les données obtenues seront comparées à la fonction ventriculaire et au remodelage cardiaque. Les échantillons du projet ont déjà été obtenus par le groupe. (French) | |||||||||||||||
| Property / summary: La phase nucléaire de l’expression génique chez les eucaryotes, y compris les modifications post-transcriptionnelles de l’ARNm et conditionnées dans les ribonucléoprotéines (PMRN), se termine par son transport vers le cytoplasme à travers le pore nucléaire pour traduction ultérieure, et nécessite la présence d’un certain nombre de facteurs pour son achèvement. L’objectif du projet est de déterminer l’expression, par séquençage de l’ARN, des molécules qui coordonnent l’exportation d’ARN vers le cytoplasme dans l’insuffisance cardiaque humaine (IC), comme le complexe protéique TREX (Transcription-export); le groupe THO, les hélicases DEAD-box et l’adaptateur Aly), le facteur NXF1:NXT1 (Tap:p15) et son promoteur GANP, et le Dbp5 (DDX19) qui facilite le transport de l’ARNm (sous la forme d’une RMN) vers le visage cytoplasmique du porre nucléaire. En outre, en utilisant des microréseaux, nous déterminerons l’expression de petits ARN qui ne codent pas les protéines (snoRNAs et scaRNAs) et joueront un rôle important dans la régulation de l’expression des gènes; ces ARN partagent certains facteurs de transport avec ceux de l’ARNm. Comparons les données d’expression des deux types d’ARN chez les mêmes patients, et nous allons relier les résultats aux complexes et aux facteurs impliqués dans leur transport vers le cytoplasme. 42 échantillons de ventricule gauche seront utilisés chez des patients atteints de FH, d’origine ischémique ou dilatée, qui ont besoin d’une greffe cardiaque, et 14 échantillons de ventricule gauche provenant d’individus sains qui sont morts de causes non cardiaques. L’analyse computationnelle des données nous permettra d’obtenir une expression différenciée et une analyse fonctionnelle. Les résultats seront validés par hybridation in situ, qRT-PCR, Western-blot et immunocytochimie, et les données obtenues seront comparées à la fonction ventriculaire et au remodelage cardiaque. Les échantillons du projet ont déjà été obtenus par le groupe. (French) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: La phase nucléaire de l’expression génique chez les eucaryotes, y compris les modifications post-transcriptionnelles de l’ARNm et conditionnées dans les ribonucléoprotéines (PMRN), se termine par son transport vers le cytoplasme à travers le pore nucléaire pour traduction ultérieure, et nécessite la présence d’un certain nombre de facteurs pour son achèvement. L’objectif du projet est de déterminer l’expression, par séquençage de l’ARN, des molécules qui coordonnent l’exportation d’ARN vers le cytoplasme dans l’insuffisance cardiaque humaine (IC), comme le complexe protéique TREX (Transcription-export); le groupe THO, les hélicases DEAD-box et l’adaptateur Aly), le facteur NXF1:NXT1 (Tap:p15) et son promoteur GANP, et le Dbp5 (DDX19) qui facilite le transport de l’ARNm (sous la forme d’une RMN) vers le visage cytoplasmique du porre nucléaire. En outre, en utilisant des microréseaux, nous déterminerons l’expression de petits ARN qui ne codent pas les protéines (snoRNAs et scaRNAs) et joueront un rôle important dans la régulation de l’expression des gènes; ces ARN partagent certains facteurs de transport avec ceux de l’ARNm. Comparons les données d’expression des deux types d’ARN chez les mêmes patients, et nous allons relier les résultats aux complexes et aux facteurs impliqués dans leur transport vers le cytoplasme. 42 échantillons de ventricule gauche seront utilisés chez des patients atteints de FH, d’origine ischémique ou dilatée, qui ont besoin d’une greffe cardiaque, et 14 échantillons de ventricule gauche provenant d’individus sains qui sont morts de causes non cardiaques. L’analyse computationnelle des données nous permettra d’obtenir une expression différenciée et une analyse fonctionnelle. Les résultats seront validés par hybridation in situ, qRT-PCR, Western-blot et immunocytochimie, et les données obtenues seront comparées à la fonction ventriculaire et au remodelage cardiaque. Les échantillons du projet ont déjà été obtenus par le groupe. (French) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 2 December 2021
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Die Kernphase der Genexpression in Eukaryotes, einschließlich post-transkriptiver Modifikationen in mRNA und verpackt in Ribofukleoproteinen (PMRN), endet mit dem Transport zum Zytoplasma durch die Kernpore für die anschließende Übersetzung und erfordert das Vorhandensein einer Reihe von Faktoren für dessen Fertigstellung. Ziel des Projekts ist es, durch RNA-Sequenzierung den Ausdruck jener Moleküle zu bestimmen, die den Export von RNAs in Zytoplasma bei Herzinsuffizienz beim Menschen koordinieren, wie z. B. den TREX-Proteinkomplex TREX (Transcription-Export). Gruppe THO, DEAD-Box-Helicases und Aly-Adapter), der Faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) und sein GANP-Promotor und die Dbp5 (DDX19), die den Transport von mRNA (in Form eines NMR) zur zytoplasmischen Oberfläche der Kernpore erleichtert. Darüber hinaus werden wir mit Microarrays die Expression kleiner RNAs bestimmen, die keine Proteine (snoRNAs und scaRNAs) kodieren und eine wichtige Rolle bei der Regulierung der Genexpression spielen; diese RNAs teilen einige Transportfaktoren mit denen von mRNA. Lassen Sie uns die Expressionsdaten beider Arten von RNAs bei denselben Patienten vergleichen, und wir werden die Ergebnisse mit den Komplexen und Faktoren in Verbindung bringen, die an ihrem Transport zum Zytoplasma beteiligt sind. 42 linke Ventrikelproben werden von Patienten mit HF, ischämischem oder dilatiertem Ursprung, die eine Herztransplantation erforderten, und 14 linke Ventrikelproben von gesunden Personen, die an nicht kardialen Ursachen starben, angewendet. Die Rechenanalyse der Daten ermöglicht es uns, differenzierte Ausdrucks- und Funktionsanalysen zu erhalten. Die Ergebnisse werden durch In-situ-Hybridisierung, qRT-PCR, Westernblot und Immunozytochemie validiert, und die gewonnenen Daten werden mit ventrikulärer Funktion und Herzumgestaltung verglichen. Die Projektproben wurden bereits von der Gruppe gewonnen. (German) | |||||||||||||||
| Property / summary: Die Kernphase der Genexpression in Eukaryotes, einschließlich post-transkriptiver Modifikationen in mRNA und verpackt in Ribofukleoproteinen (PMRN), endet mit dem Transport zum Zytoplasma durch die Kernpore für die anschließende Übersetzung und erfordert das Vorhandensein einer Reihe von Faktoren für dessen Fertigstellung. Ziel des Projekts ist es, durch RNA-Sequenzierung den Ausdruck jener Moleküle zu bestimmen, die den Export von RNAs in Zytoplasma bei Herzinsuffizienz beim Menschen koordinieren, wie z. B. den TREX-Proteinkomplex TREX (Transcription-Export). Gruppe THO, DEAD-Box-Helicases und Aly-Adapter), der Faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) und sein GANP-Promotor und die Dbp5 (DDX19), die den Transport von mRNA (in Form eines NMR) zur zytoplasmischen Oberfläche der Kernpore erleichtert. Darüber hinaus werden wir mit Microarrays die Expression kleiner RNAs bestimmen, die keine Proteine (snoRNAs und scaRNAs) kodieren und eine wichtige Rolle bei der Regulierung der Genexpression spielen; diese RNAs teilen einige Transportfaktoren mit denen von mRNA. Lassen Sie uns die Expressionsdaten beider Arten von RNAs bei denselben Patienten vergleichen, und wir werden die Ergebnisse mit den Komplexen und Faktoren in Verbindung bringen, die an ihrem Transport zum Zytoplasma beteiligt sind. 42 linke Ventrikelproben werden von Patienten mit HF, ischämischem oder dilatiertem Ursprung, die eine Herztransplantation erforderten, und 14 linke Ventrikelproben von gesunden Personen, die an nicht kardialen Ursachen starben, angewendet. Die Rechenanalyse der Daten ermöglicht es uns, differenzierte Ausdrucks- und Funktionsanalysen zu erhalten. Die Ergebnisse werden durch In-situ-Hybridisierung, qRT-PCR, Westernblot und Immunozytochemie validiert, und die gewonnenen Daten werden mit ventrikulärer Funktion und Herzumgestaltung verglichen. Die Projektproben wurden bereits von der Gruppe gewonnen. (German) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Die Kernphase der Genexpression in Eukaryotes, einschließlich post-transkriptiver Modifikationen in mRNA und verpackt in Ribofukleoproteinen (PMRN), endet mit dem Transport zum Zytoplasma durch die Kernpore für die anschließende Übersetzung und erfordert das Vorhandensein einer Reihe von Faktoren für dessen Fertigstellung. Ziel des Projekts ist es, durch RNA-Sequenzierung den Ausdruck jener Moleküle zu bestimmen, die den Export von RNAs in Zytoplasma bei Herzinsuffizienz beim Menschen koordinieren, wie z. B. den TREX-Proteinkomplex TREX (Transcription-Export). Gruppe THO, DEAD-Box-Helicases und Aly-Adapter), der Faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) und sein GANP-Promotor und die Dbp5 (DDX19), die den Transport von mRNA (in Form eines NMR) zur zytoplasmischen Oberfläche der Kernpore erleichtert. Darüber hinaus werden wir mit Microarrays die Expression kleiner RNAs bestimmen, die keine Proteine (snoRNAs und scaRNAs) kodieren und eine wichtige Rolle bei der Regulierung der Genexpression spielen; diese RNAs teilen einige Transportfaktoren mit denen von mRNA. Lassen Sie uns die Expressionsdaten beider Arten von RNAs bei denselben Patienten vergleichen, und wir werden die Ergebnisse mit den Komplexen und Faktoren in Verbindung bringen, die an ihrem Transport zum Zytoplasma beteiligt sind. 42 linke Ventrikelproben werden von Patienten mit HF, ischämischem oder dilatiertem Ursprung, die eine Herztransplantation erforderten, und 14 linke Ventrikelproben von gesunden Personen, die an nicht kardialen Ursachen starben, angewendet. Die Rechenanalyse der Daten ermöglicht es uns, differenzierte Ausdrucks- und Funktionsanalysen zu erhalten. Die Ergebnisse werden durch In-situ-Hybridisierung, qRT-PCR, Westernblot und Immunozytochemie validiert, und die gewonnenen Daten werden mit ventrikulärer Funktion und Herzumgestaltung verglichen. Die Projektproben wurden bereits von der Gruppe gewonnen. (German) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 9 December 2021
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
De nucleaire fase van genexpressie in eukaryotes, met inbegrip van post-transcriptionele modificaties in mRNA en verpakt in ribonucleoproteïnen (PMRN), eindigt met zijn transport naar het cytoplasma door de nucleaire porie voor latere vertaling, en vereist de aanwezigheid van een aantal factoren voor de voltooiing ervan. Het doel van het project is het bepalen van de expressie, door RNA sequencing, van die moleculen die de uitvoer van RNA’s naar cytoplasma bij menselijk hartfalen (CI) coördineren, zoals het TREX (Transcription-export) eiwitcomplex; groep THO, DEAD-box helicases en Aly adapter), de NXF1:NXT1 factor (Tap:p15) en de GANP promotor, en de Dbp5 (DDX19) die het transport van mRNA (in de vorm van een NMR) naar het cytoplasma van de nucleaire porie vergemakkelijkt. Daarnaast zullen we met behulp van microarrays de expressie van kleine RNA’s bepalen die geen eiwitten (snoRNAs en scaRNAs) coderen en een belangrijke rol spelen bij het reguleren van genexpressie; deze RNAs delen sommige vervoersfactoren met die van mRNA. Laten we de expressiegegevens van beide soorten RNA’s in dezelfde patiënten vergelijken, en we zullen de resultaten koppelen aan de complexen en factoren die betrokken zijn bij hun transport naar het cytoplasma. 42 linker ventrikelmonsters zullen worden gebruikt van patiënten met HF, van ischemische of verwijde oorsprong, die een harttransplantatie nodig hadden, en 14 linker ventrikelmonsters van gezonde personen, die aan niet-cardiale oorzaken stierven. De computationele analyse van de gegevens zal ons in staat stellen om gedifferentieerde expressie en functionele analyse te verkrijgen. De resultaten worden gevalideerd door in situ hybridisatie, qRT-PCR, western-blot, en immunocytochemie, en de verkregen gegevens zullen worden vergeleken met ventriculaire functie en cardiale remodellering. De projectmonsters zijn reeds door de groep verkregen. (Dutch) | |||||||||||||||
| Property / summary: De nucleaire fase van genexpressie in eukaryotes, met inbegrip van post-transcriptionele modificaties in mRNA en verpakt in ribonucleoproteïnen (PMRN), eindigt met zijn transport naar het cytoplasma door de nucleaire porie voor latere vertaling, en vereist de aanwezigheid van een aantal factoren voor de voltooiing ervan. Het doel van het project is het bepalen van de expressie, door RNA sequencing, van die moleculen die de uitvoer van RNA’s naar cytoplasma bij menselijk hartfalen (CI) coördineren, zoals het TREX (Transcription-export) eiwitcomplex; groep THO, DEAD-box helicases en Aly adapter), de NXF1:NXT1 factor (Tap:p15) en de GANP promotor, en de Dbp5 (DDX19) die het transport van mRNA (in de vorm van een NMR) naar het cytoplasma van de nucleaire porie vergemakkelijkt. Daarnaast zullen we met behulp van microarrays de expressie van kleine RNA’s bepalen die geen eiwitten (snoRNAs en scaRNAs) coderen en een belangrijke rol spelen bij het reguleren van genexpressie; deze RNAs delen sommige vervoersfactoren met die van mRNA. Laten we de expressiegegevens van beide soorten RNA’s in dezelfde patiënten vergelijken, en we zullen de resultaten koppelen aan de complexen en factoren die betrokken zijn bij hun transport naar het cytoplasma. 42 linker ventrikelmonsters zullen worden gebruikt van patiënten met HF, van ischemische of verwijde oorsprong, die een harttransplantatie nodig hadden, en 14 linker ventrikelmonsters van gezonde personen, die aan niet-cardiale oorzaken stierven. De computationele analyse van de gegevens zal ons in staat stellen om gedifferentieerde expressie en functionele analyse te verkrijgen. De resultaten worden gevalideerd door in situ hybridisatie, qRT-PCR, western-blot, en immunocytochemie, en de verkregen gegevens zullen worden vergeleken met ventriculaire functie en cardiale remodellering. De projectmonsters zijn reeds door de groep verkregen. (Dutch) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: De nucleaire fase van genexpressie in eukaryotes, met inbegrip van post-transcriptionele modificaties in mRNA en verpakt in ribonucleoproteïnen (PMRN), eindigt met zijn transport naar het cytoplasma door de nucleaire porie voor latere vertaling, en vereist de aanwezigheid van een aantal factoren voor de voltooiing ervan. Het doel van het project is het bepalen van de expressie, door RNA sequencing, van die moleculen die de uitvoer van RNA’s naar cytoplasma bij menselijk hartfalen (CI) coördineren, zoals het TREX (Transcription-export) eiwitcomplex; groep THO, DEAD-box helicases en Aly adapter), de NXF1:NXT1 factor (Tap:p15) en de GANP promotor, en de Dbp5 (DDX19) die het transport van mRNA (in de vorm van een NMR) naar het cytoplasma van de nucleaire porie vergemakkelijkt. Daarnaast zullen we met behulp van microarrays de expressie van kleine RNA’s bepalen die geen eiwitten (snoRNAs en scaRNAs) coderen en een belangrijke rol spelen bij het reguleren van genexpressie; deze RNAs delen sommige vervoersfactoren met die van mRNA. Laten we de expressiegegevens van beide soorten RNA’s in dezelfde patiënten vergelijken, en we zullen de resultaten koppelen aan de complexen en factoren die betrokken zijn bij hun transport naar het cytoplasma. 42 linker ventrikelmonsters zullen worden gebruikt van patiënten met HF, van ischemische of verwijde oorsprong, die een harttransplantatie nodig hadden, en 14 linker ventrikelmonsters van gezonde personen, die aan niet-cardiale oorzaken stierven. De computationele analyse van de gegevens zal ons in staat stellen om gedifferentieerde expressie en functionele analyse te verkrijgen. De resultaten worden gevalideerd door in situ hybridisatie, qRT-PCR, western-blot, en immunocytochemie, en de verkregen gegevens zullen worden vergeleken met ventriculaire functie en cardiale remodellering. De projectmonsters zijn reeds door de groep verkregen. (Dutch) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 17 December 2021
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
La fase nucleare dell'espressione genica negli eucarioti, comprese le modifiche post-transcriptional nel mRNA e confezionate in ribonucleoproteine (PMRN), termina con il suo trasporto al citoplasma attraverso il poro nucleare per la successiva traduzione, e richiede la presenza di una serie di fattori per il suo completamento. L'obiettivo del progetto è determinare l'espressione, mediante sequenziamento dell'RNA, di quelle molecole che coordinano l'esportazione di RNA al citoplasma nell'insufficienza cardiaca umana (CI), come il complesso proteico TREX (Transcription-export); gruppo THO, elicasi DEAD-box e adattatore Aly), il fattore NXF1:NXT1 (Tap:p15) e il suo promotore GANP, e il Dbp5 (DDX19) che facilita il trasporto di mRNA (sotto forma di NMR) alla faccia citoplasmica del poro nucleare. Inoltre, utilizzando i microarray, determineremo l'espressione di piccoli RNA che non codificano le proteine (snoRNAs e scaRNAs) e svolgeranno un ruolo importante nella regolazione dell'espressione genica; questi RNA condividono alcuni fattori di trasporto con quelli di mRNA. Confrontiamo i dati espressivi di entrambi i tipi di RNA negli stessi pazienti, e metteremo in relazione i risultati con i complessi e i fattori coinvolti nel loro trasporto al citoplasma. 42 campioni di ventricolo sinistro saranno utilizzati da pazienti con HF, di origine ischemica o dilatata, che hanno richiesto un trapianto di cuore, e 14 campioni di ventricolo sinistro da individui sani, morti per cause non cardiache. L'analisi computazionale dei dati ci permetterà di ottenere l'espressione differenziata e l'analisi funzionale. I risultati saranno convalidati mediante ibridazione in situ, qRT-PCR, western-blot e immunocitochimica, e i dati ottenuti saranno confrontati con la funzione ventricolare e il rimodellamento cardiaco. I campioni di progetto sono già stati ottenuti dal gruppo. (Italian) | |||||||||||||||
| Property / summary: La fase nucleare dell'espressione genica negli eucarioti, comprese le modifiche post-transcriptional nel mRNA e confezionate in ribonucleoproteine (PMRN), termina con il suo trasporto al citoplasma attraverso il poro nucleare per la successiva traduzione, e richiede la presenza di una serie di fattori per il suo completamento. L'obiettivo del progetto è determinare l'espressione, mediante sequenziamento dell'RNA, di quelle molecole che coordinano l'esportazione di RNA al citoplasma nell'insufficienza cardiaca umana (CI), come il complesso proteico TREX (Transcription-export); gruppo THO, elicasi DEAD-box e adattatore Aly), il fattore NXF1:NXT1 (Tap:p15) e il suo promotore GANP, e il Dbp5 (DDX19) che facilita il trasporto di mRNA (sotto forma di NMR) alla faccia citoplasmica del poro nucleare. Inoltre, utilizzando i microarray, determineremo l'espressione di piccoli RNA che non codificano le proteine (snoRNAs e scaRNAs) e svolgeranno un ruolo importante nella regolazione dell'espressione genica; questi RNA condividono alcuni fattori di trasporto con quelli di mRNA. Confrontiamo i dati espressivi di entrambi i tipi di RNA negli stessi pazienti, e metteremo in relazione i risultati con i complessi e i fattori coinvolti nel loro trasporto al citoplasma. 42 campioni di ventricolo sinistro saranno utilizzati da pazienti con HF, di origine ischemica o dilatata, che hanno richiesto un trapianto di cuore, e 14 campioni di ventricolo sinistro da individui sani, morti per cause non cardiache. L'analisi computazionale dei dati ci permetterà di ottenere l'espressione differenziata e l'analisi funzionale. I risultati saranno convalidati mediante ibridazione in situ, qRT-PCR, western-blot e immunocitochimica, e i dati ottenuti saranno confrontati con la funzione ventricolare e il rimodellamento cardiaco. I campioni di progetto sono già stati ottenuti dal gruppo. (Italian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: La fase nucleare dell'espressione genica negli eucarioti, comprese le modifiche post-transcriptional nel mRNA e confezionate in ribonucleoproteine (PMRN), termina con il suo trasporto al citoplasma attraverso il poro nucleare per la successiva traduzione, e richiede la presenza di una serie di fattori per il suo completamento. L'obiettivo del progetto è determinare l'espressione, mediante sequenziamento dell'RNA, di quelle molecole che coordinano l'esportazione di RNA al citoplasma nell'insufficienza cardiaca umana (CI), come il complesso proteico TREX (Transcription-export); gruppo THO, elicasi DEAD-box e adattatore Aly), il fattore NXF1:NXT1 (Tap:p15) e il suo promotore GANP, e il Dbp5 (DDX19) che facilita il trasporto di mRNA (sotto forma di NMR) alla faccia citoplasmica del poro nucleare. Inoltre, utilizzando i microarray, determineremo l'espressione di piccoli RNA che non codificano le proteine (snoRNAs e scaRNAs) e svolgeranno un ruolo importante nella regolazione dell'espressione genica; questi RNA condividono alcuni fattori di trasporto con quelli di mRNA. Confrontiamo i dati espressivi di entrambi i tipi di RNA negli stessi pazienti, e metteremo in relazione i risultati con i complessi e i fattori coinvolti nel loro trasporto al citoplasma. 42 campioni di ventricolo sinistro saranno utilizzati da pazienti con HF, di origine ischemica o dilatata, che hanno richiesto un trapianto di cuore, e 14 campioni di ventricolo sinistro da individui sani, morti per cause non cardiache. L'analisi computazionale dei dati ci permetterà di ottenere l'espressione differenziata e l'analisi funzionale. I risultati saranno convalidati mediante ibridazione in situ, qRT-PCR, western-blot e immunocitochimica, e i dati ottenuti saranno confrontati con la funzione ventricolare e il rimodellamento cardiaco. I campioni di progetto sono già stati ottenuti dal gruppo. (Italian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 16 January 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Geeni ekspressiooni tuumafaas eukarüootides, sealhulgas transkriptsioonijärgsed modifikatsioonid mRNAs ja pakendatud ribonukleoproteiinidesse (PMRN), lõpeb selle edasikandumisega tsütoplasmasse tuuma pooride kaudu ja nõuab selle valmimiseks mitmete tegurite olemasolu. Projekti eesmärk on määrata RNA järjestuse abil kindlaks selliste molekulide ekspressioon, mis koordineerivad RNAde eksporti tsütoplasmasse inimese südamepuudulikkuse korral, nagu TREX (Transcription-export) valgukompleks; rühm THO, DEAD-box helikopterid ja Aly adapter), tegur NXF1:NXT1 (Tap:p15) ja selle GANP promootor ning Dbp5 (DDX19), mis hõlbustavad mRNA (NMR-vormis) transportimist tuuma pooride tsütoplasmasse. Lisaks määrame mikroarrayde abil väikeste RNAde ekspressiooni, mis ei kodeeri valke (snoRNAsid ja scaRNAsid) ja mängivad olulist rolli geeniekspressiooni reguleerimisel; need RNA-d jagavad mõningaid transporditegureid mRNA omadega. Võrdleme mõlemat tüüpi RNA-de ekspressiooniandmeid samadel patsientidel ja me seostame tulemused komplekside ja teguritega, mis on seotud nende ülekandmisega tsütoplasmasse. 42 vasaku vatsakese proovi kasutatakse HF, isheemilise või laienenud päritoluga patsientidelt, kes vajasid südame siirdamist, ja 14 vasaku vatsakese proovi tervetelt isikutelt, kes surid mittekardiaalsetel põhjustel. Andmete arvutuslik analüüs võimaldab meil saada diferentseeritud väljenduse ja funktsionaalse analüüsi. Tulemused valideeritakse in situ hübridiseerimise, qRT-PCRi, Western-blot’i ja immunotsütokeemia abil ning saadud andmeid võrreldakse vatsakese funktsiooni ja südame ümberkujundamisega. Rühm on projektivalimid juba saanud. (Estonian) | |||||||||||||||
| Property / summary: Geeni ekspressiooni tuumafaas eukarüootides, sealhulgas transkriptsioonijärgsed modifikatsioonid mRNAs ja pakendatud ribonukleoproteiinidesse (PMRN), lõpeb selle edasikandumisega tsütoplasmasse tuuma pooride kaudu ja nõuab selle valmimiseks mitmete tegurite olemasolu. Projekti eesmärk on määrata RNA järjestuse abil kindlaks selliste molekulide ekspressioon, mis koordineerivad RNAde eksporti tsütoplasmasse inimese südamepuudulikkuse korral, nagu TREX (Transcription-export) valgukompleks; rühm THO, DEAD-box helikopterid ja Aly adapter), tegur NXF1:NXT1 (Tap:p15) ja selle GANP promootor ning Dbp5 (DDX19), mis hõlbustavad mRNA (NMR-vormis) transportimist tuuma pooride tsütoplasmasse. Lisaks määrame mikroarrayde abil väikeste RNAde ekspressiooni, mis ei kodeeri valke (snoRNAsid ja scaRNAsid) ja mängivad olulist rolli geeniekspressiooni reguleerimisel; need RNA-d jagavad mõningaid transporditegureid mRNA omadega. Võrdleme mõlemat tüüpi RNA-de ekspressiooniandmeid samadel patsientidel ja me seostame tulemused komplekside ja teguritega, mis on seotud nende ülekandmisega tsütoplasmasse. 42 vasaku vatsakese proovi kasutatakse HF, isheemilise või laienenud päritoluga patsientidelt, kes vajasid südame siirdamist, ja 14 vasaku vatsakese proovi tervetelt isikutelt, kes surid mittekardiaalsetel põhjustel. Andmete arvutuslik analüüs võimaldab meil saada diferentseeritud väljenduse ja funktsionaalse analüüsi. Tulemused valideeritakse in situ hübridiseerimise, qRT-PCRi, Western-blot’i ja immunotsütokeemia abil ning saadud andmeid võrreldakse vatsakese funktsiooni ja südame ümberkujundamisega. Rühm on projektivalimid juba saanud. (Estonian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Geeni ekspressiooni tuumafaas eukarüootides, sealhulgas transkriptsioonijärgsed modifikatsioonid mRNAs ja pakendatud ribonukleoproteiinidesse (PMRN), lõpeb selle edasikandumisega tsütoplasmasse tuuma pooride kaudu ja nõuab selle valmimiseks mitmete tegurite olemasolu. Projekti eesmärk on määrata RNA järjestuse abil kindlaks selliste molekulide ekspressioon, mis koordineerivad RNAde eksporti tsütoplasmasse inimese südamepuudulikkuse korral, nagu TREX (Transcription-export) valgukompleks; rühm THO, DEAD-box helikopterid ja Aly adapter), tegur NXF1:NXT1 (Tap:p15) ja selle GANP promootor ning Dbp5 (DDX19), mis hõlbustavad mRNA (NMR-vormis) transportimist tuuma pooride tsütoplasmasse. Lisaks määrame mikroarrayde abil väikeste RNAde ekspressiooni, mis ei kodeeri valke (snoRNAsid ja scaRNAsid) ja mängivad olulist rolli geeniekspressiooni reguleerimisel; need RNA-d jagavad mõningaid transporditegureid mRNA omadega. Võrdleme mõlemat tüüpi RNA-de ekspressiooniandmeid samadel patsientidel ja me seostame tulemused komplekside ja teguritega, mis on seotud nende ülekandmisega tsütoplasmasse. 42 vasaku vatsakese proovi kasutatakse HF, isheemilise või laienenud päritoluga patsientidelt, kes vajasid südame siirdamist, ja 14 vasaku vatsakese proovi tervetelt isikutelt, kes surid mittekardiaalsetel põhjustel. Andmete arvutuslik analüüs võimaldab meil saada diferentseeritud väljenduse ja funktsionaalse analüüsi. Tulemused valideeritakse in situ hübridiseerimise, qRT-PCRi, Western-blot’i ja immunotsütokeemia abil ning saadud andmeid võrreldakse vatsakese funktsiooni ja südame ümberkujundamisega. Rühm on projektivalimid juba saanud. (Estonian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Genų ekspresijos eukariotuose branduolinė fazė, įskaitant mRNR po transkripcijos modifikacijas ir supakuotą į ribonukleoproteinus (PMRN), baigiasi pernešant į citoplazmą per branduolines poras, kad vėliau būtų galima ją išversti, ir jai užbaigti reikia tam tikrų veiksnių. Projekto tikslas – nustatyti tų molekulių, kurios koordinuoja RNR eksportavimą į citoplazmą esant žmogaus širdies nepakankamumui (CI), pvz., TREX (Transcription-eksporto) baltymų kompleksą, išraišką RNR sekos nustatymo būdu; grupė THO, DEAD-box helicases ir Aly adapteris), NXF1:NXT1 faktorius (Tap:p15) ir jo GANP promotorius ir Dbp5 (DDX19), kurie palengvina mRNR (kaip NMR) transportavimą į branduolinių porų citoplazminį veidą. Be to, naudojant mikromatricas, mes nustatysime mažų RNR, kurios nekoduoja baltymų (snoRNR ir scaRNR), ekspresiją ir atlieka svarbų vaidmenį reguliuojant genų ekspresiją; šios RNR turi tam tikrus transporto veiksnius su mRNR. Palyginkime abiejų RNR tipų išraiškos duomenis tiems patiems pacientams, ir mes siesime rezultatus su kompleksais ir veiksniais, susijusiais su jų transportavimu į citoplazmą. 42 kairiojo skilvelio mėginiai bus naudojami pacientams, sergantiems HF, išeminės ar išsiplėtusios kilmės, kuriems reikia širdies transplantacijos, ir 14 kairiojo skilvelio mėginių iš sveikų asmenų, kurie mirė nuo ne širdies priežasčių. Kompiuterinė duomenų analizė leis mums gauti diferencijuotą išraišką ir funkcinę analizę. Rezultatai bus patvirtinti taikant in situ hibridizaciją, qRT-PGR, vakarietišką blotą ir imunocitochemiją, o gauti duomenys bus lyginami su skilvelių funkcija ir širdies remodeliavimu. Grupė jau yra gavusi projekto pavyzdžių. (Lithuanian) | |||||||||||||||
| Property / summary: Genų ekspresijos eukariotuose branduolinė fazė, įskaitant mRNR po transkripcijos modifikacijas ir supakuotą į ribonukleoproteinus (PMRN), baigiasi pernešant į citoplazmą per branduolines poras, kad vėliau būtų galima ją išversti, ir jai užbaigti reikia tam tikrų veiksnių. Projekto tikslas – nustatyti tų molekulių, kurios koordinuoja RNR eksportavimą į citoplazmą esant žmogaus širdies nepakankamumui (CI), pvz., TREX (Transcription-eksporto) baltymų kompleksą, išraišką RNR sekos nustatymo būdu; grupė THO, DEAD-box helicases ir Aly adapteris), NXF1:NXT1 faktorius (Tap:p15) ir jo GANP promotorius ir Dbp5 (DDX19), kurie palengvina mRNR (kaip NMR) transportavimą į branduolinių porų citoplazminį veidą. Be to, naudojant mikromatricas, mes nustatysime mažų RNR, kurios nekoduoja baltymų (snoRNR ir scaRNR), ekspresiją ir atlieka svarbų vaidmenį reguliuojant genų ekspresiją; šios RNR turi tam tikrus transporto veiksnius su mRNR. Palyginkime abiejų RNR tipų išraiškos duomenis tiems patiems pacientams, ir mes siesime rezultatus su kompleksais ir veiksniais, susijusiais su jų transportavimu į citoplazmą. 42 kairiojo skilvelio mėginiai bus naudojami pacientams, sergantiems HF, išeminės ar išsiplėtusios kilmės, kuriems reikia širdies transplantacijos, ir 14 kairiojo skilvelio mėginių iš sveikų asmenų, kurie mirė nuo ne širdies priežasčių. Kompiuterinė duomenų analizė leis mums gauti diferencijuotą išraišką ir funkcinę analizę. Rezultatai bus patvirtinti taikant in situ hibridizaciją, qRT-PGR, vakarietišką blotą ir imunocitochemiją, o gauti duomenys bus lyginami su skilvelių funkcija ir širdies remodeliavimu. Grupė jau yra gavusi projekto pavyzdžių. (Lithuanian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Genų ekspresijos eukariotuose branduolinė fazė, įskaitant mRNR po transkripcijos modifikacijas ir supakuotą į ribonukleoproteinus (PMRN), baigiasi pernešant į citoplazmą per branduolines poras, kad vėliau būtų galima ją išversti, ir jai užbaigti reikia tam tikrų veiksnių. Projekto tikslas – nustatyti tų molekulių, kurios koordinuoja RNR eksportavimą į citoplazmą esant žmogaus širdies nepakankamumui (CI), pvz., TREX (Transcription-eksporto) baltymų kompleksą, išraišką RNR sekos nustatymo būdu; grupė THO, DEAD-box helicases ir Aly adapteris), NXF1:NXT1 faktorius (Tap:p15) ir jo GANP promotorius ir Dbp5 (DDX19), kurie palengvina mRNR (kaip NMR) transportavimą į branduolinių porų citoplazminį veidą. Be to, naudojant mikromatricas, mes nustatysime mažų RNR, kurios nekoduoja baltymų (snoRNR ir scaRNR), ekspresiją ir atlieka svarbų vaidmenį reguliuojant genų ekspresiją; šios RNR turi tam tikrus transporto veiksnius su mRNR. Palyginkime abiejų RNR tipų išraiškos duomenis tiems patiems pacientams, ir mes siesime rezultatus su kompleksais ir veiksniais, susijusiais su jų transportavimu į citoplazmą. 42 kairiojo skilvelio mėginiai bus naudojami pacientams, sergantiems HF, išeminės ar išsiplėtusios kilmės, kuriems reikia širdies transplantacijos, ir 14 kairiojo skilvelio mėginių iš sveikų asmenų, kurie mirė nuo ne širdies priežasčių. Kompiuterinė duomenų analizė leis mums gauti diferencijuotą išraišką ir funkcinę analizę. Rezultatai bus patvirtinti taikant in situ hibridizaciją, qRT-PGR, vakarietišką blotą ir imunocitochemiją, o gauti duomenys bus lyginami su skilvelių funkcija ir širdies remodeliavimu. Grupė jau yra gavusi projekto pavyzdžių. (Lithuanian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Nuklearna faza ekspresije gena u eukariotima, uključujući post-transkripcijske modifikacije mRNK-a i pakirana u ribonukleoproteine (PMRN), završava prijevozom do citoplazma kroz nuklearnu poru radi naknadnog prijevoda i zahtijeva prisutnost niza čimbenika za njezino dovršenje. Cilj je projekta utvrditi ekspresiju sekvenciranjem RNA onih molekula koje koordiniraju izvoz RNK u citoplazmu u slučaju zatajenja srca (CI), kao što je kompleks proteina TREX (Transcription-export); grupa THO, helikaze DEAD-box i Aly adapter), faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) i njegov promotor GANP-a te Dbp5 (DDX19) koji olakšava prijevoz mRNA (u obliku NMR-a) do citoplazmičnog lica nuklearne pore. Osim toga, pomoću mikroarrays, odredit ćemo ekspresiju malih RNK koji ne kodiraju proteine (snoRNA i scaRNA) i igraju važnu ulogu u reguliranju ekspresije gena; te RNA-e dijele neke čimbenike prijevoza s čimbenicima mRNA. Usporedimo ekspresijske podatke obje vrste RNK kod istih pacijenata, a rezultate ćemo povezati s kompleksima i čimbenicima uključenima u njihov transport do citoflazme. 42 uzorka lijeve klijetke koristit će se od bolesnika s HF-om, ishemijskim ili proširenim podrijetlom, kojima je bila potrebna transplantacija srca, i 14 uzoraka lijeve klijetke od zdravih pojedinaca koji su umrli od nesrdačnih uzroka. Računalna analiza podataka omogućit će nam da dobijemo diferenciranu ekspresiju i funkcionalnu analizu. Rezultati će biti potvrđeni in situ hibridizacijom, qRT-PCR, Western-blot i imunocitokemijom, a dobiveni podaci uspoređivat će se s ventrikularnom funkcijom i remodeliranjem srca. Skupina je već prikupila uzorke projekta. (Croatian) | |||||||||||||||
| Property / summary: Nuklearna faza ekspresije gena u eukariotima, uključujući post-transkripcijske modifikacije mRNK-a i pakirana u ribonukleoproteine (PMRN), završava prijevozom do citoplazma kroz nuklearnu poru radi naknadnog prijevoda i zahtijeva prisutnost niza čimbenika za njezino dovršenje. Cilj je projekta utvrditi ekspresiju sekvenciranjem RNA onih molekula koje koordiniraju izvoz RNK u citoplazmu u slučaju zatajenja srca (CI), kao što je kompleks proteina TREX (Transcription-export); grupa THO, helikaze DEAD-box i Aly adapter), faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) i njegov promotor GANP-a te Dbp5 (DDX19) koji olakšava prijevoz mRNA (u obliku NMR-a) do citoplazmičnog lica nuklearne pore. Osim toga, pomoću mikroarrays, odredit ćemo ekspresiju malih RNK koji ne kodiraju proteine (snoRNA i scaRNA) i igraju važnu ulogu u reguliranju ekspresije gena; te RNA-e dijele neke čimbenike prijevoza s čimbenicima mRNA. Usporedimo ekspresijske podatke obje vrste RNK kod istih pacijenata, a rezultate ćemo povezati s kompleksima i čimbenicima uključenima u njihov transport do citoflazme. 42 uzorka lijeve klijetke koristit će se od bolesnika s HF-om, ishemijskim ili proširenim podrijetlom, kojima je bila potrebna transplantacija srca, i 14 uzoraka lijeve klijetke od zdravih pojedinaca koji su umrli od nesrdačnih uzroka. Računalna analiza podataka omogućit će nam da dobijemo diferenciranu ekspresiju i funkcionalnu analizu. Rezultati će biti potvrđeni in situ hibridizacijom, qRT-PCR, Western-blot i imunocitokemijom, a dobiveni podaci uspoređivat će se s ventrikularnom funkcijom i remodeliranjem srca. Skupina je već prikupila uzorke projekta. (Croatian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Nuklearna faza ekspresije gena u eukariotima, uključujući post-transkripcijske modifikacije mRNK-a i pakirana u ribonukleoproteine (PMRN), završava prijevozom do citoplazma kroz nuklearnu poru radi naknadnog prijevoda i zahtijeva prisutnost niza čimbenika za njezino dovršenje. Cilj je projekta utvrditi ekspresiju sekvenciranjem RNA onih molekula koje koordiniraju izvoz RNK u citoplazmu u slučaju zatajenja srca (CI), kao što je kompleks proteina TREX (Transcription-export); grupa THO, helikaze DEAD-box i Aly adapter), faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) i njegov promotor GANP-a te Dbp5 (DDX19) koji olakšava prijevoz mRNA (u obliku NMR-a) do citoplazmičnog lica nuklearne pore. Osim toga, pomoću mikroarrays, odredit ćemo ekspresiju malih RNK koji ne kodiraju proteine (snoRNA i scaRNA) i igraju važnu ulogu u reguliranju ekspresije gena; te RNA-e dijele neke čimbenike prijevoza s čimbenicima mRNA. Usporedimo ekspresijske podatke obje vrste RNK kod istih pacijenata, a rezultate ćemo povezati s kompleksima i čimbenicima uključenima u njihov transport do citoflazme. 42 uzorka lijeve klijetke koristit će se od bolesnika s HF-om, ishemijskim ili proširenim podrijetlom, kojima je bila potrebna transplantacija srca, i 14 uzoraka lijeve klijetke od zdravih pojedinaca koji su umrli od nesrdačnih uzroka. Računalna analiza podataka omogućit će nam da dobijemo diferenciranu ekspresiju i funkcionalnu analizu. Rezultati će biti potvrđeni in situ hibridizacijom, qRT-PCR, Western-blot i imunocitokemijom, a dobiveni podaci uspoređivat će se s ventrikularnom funkcijom i remodeliranjem srca. Skupina je već prikupila uzorke projekta. (Croatian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Η πυρηνική φάση της γονιδιακής έκφρασης σε ευκαρυώτες, συμπεριλαμβανομένων μετα-μεταγραφικών τροποποιήσεων στο mRNA και συσκευασμένων σε ριβονουκλεοπρωτεΐνες (PMRN), τελειώνει με τη μεταφορά του στο κυτταρόπλασμα μέσω του πυρηνικού πόρου για μεταγενέστερη μετάφραση και απαιτεί την παρουσία ορισμένων παραγόντων για την ολοκλήρωσή του. Στόχος του έργου είναι να προσδιοριστεί η έκφραση, μέσω της αλληλουχίας του RNA, των μορίων που συντονίζουν την εξαγωγή RNA σε κυτταρόπλασμα στην ανθρώπινη καρδιακή ανεπάρκεια (CI), όπως το σύμπλεγμα πρωτεϊνών TREX (μεταγραφής-εξαγωγής)· Group THO, DEAD-box helicases, και Aly adapter), ο συντελεστής NXF1:NXT1 (Tap:p15) και ο υποστηρικτής του GANP, και ο Dbp5 (DDX19) που διευκολύνει τη μεταφορά του mRNA (με τη μορφή NMR) στο κυτταροπλασματικό πρόσωπο των πυρηνικών πόρων. Επιπλέον, χρησιμοποιώντας μικροσυστοιχίες, θα καθορίσουμε την έκφραση των μικρών RNA που δεν κωδικοποιούν πρωτεΐνες (snoRNAs και scaRNAs) και διαδραματίζουν σημαντικό ρόλο στη ρύθμιση της έκφρασης των γονιδίων. αυτοί οι RNA μοιράζονται ορισμένους παράγοντες μεταφοράς με εκείνους της mRNA. Ας συγκρίνουμε τα δεδομένα έκφρασης και των δύο τύπων RNA στους ίδιους ασθενείς, και θα συσχετίσουμε τα αποτελέσματα με τα σύμπλοκα και τους παράγοντες που εμπλέκονται στη μεταφορά τους στο κυτταρόπλασμα. 42 δείγματα αριστερής κοιλίας θα χρησιμοποιηθούν από ασθενείς με HF, ισχαιμικής ή διαστολής προέλευσης, οι οποίοι απαιτούν μεταμόσχευση καρδιάς, και 14 δείγματα αριστερής κοιλίας από υγιή άτομα, τα οποία πέθαναν από μη καρδιακές αιτίες. Η υπολογιστική ανάλυση των δεδομένων θα μας επιτρέψει να αποκτήσουμε διαφοροποιημένη έκφραση και λειτουργική ανάλυση. Τα αποτελέσματα θα επικυρωθούν με επί τόπου υβριδισμό, qRT-PCR, δυτική σταγόνα και ανοσοκυτταροχημεία, και τα δεδομένα που θα ληφθούν θα συγκριθούν με τη λειτουργία της κοιλίας και την καρδιακή αναμόρφωση. Τα δείγματα του έργου έχουν ήδη ληφθεί από την ομάδα. (Greek) | |||||||||||||||
| Property / summary: Η πυρηνική φάση της γονιδιακής έκφρασης σε ευκαρυώτες, συμπεριλαμβανομένων μετα-μεταγραφικών τροποποιήσεων στο mRNA και συσκευασμένων σε ριβονουκλεοπρωτεΐνες (PMRN), τελειώνει με τη μεταφορά του στο κυτταρόπλασμα μέσω του πυρηνικού πόρου για μεταγενέστερη μετάφραση και απαιτεί την παρουσία ορισμένων παραγόντων για την ολοκλήρωσή του. Στόχος του έργου είναι να προσδιοριστεί η έκφραση, μέσω της αλληλουχίας του RNA, των μορίων που συντονίζουν την εξαγωγή RNA σε κυτταρόπλασμα στην ανθρώπινη καρδιακή ανεπάρκεια (CI), όπως το σύμπλεγμα πρωτεϊνών TREX (μεταγραφής-εξαγωγής)· Group THO, DEAD-box helicases, και Aly adapter), ο συντελεστής NXF1:NXT1 (Tap:p15) και ο υποστηρικτής του GANP, και ο Dbp5 (DDX19) που διευκολύνει τη μεταφορά του mRNA (με τη μορφή NMR) στο κυτταροπλασματικό πρόσωπο των πυρηνικών πόρων. Επιπλέον, χρησιμοποιώντας μικροσυστοιχίες, θα καθορίσουμε την έκφραση των μικρών RNA που δεν κωδικοποιούν πρωτεΐνες (snoRNAs και scaRNAs) και διαδραματίζουν σημαντικό ρόλο στη ρύθμιση της έκφρασης των γονιδίων. αυτοί οι RNA μοιράζονται ορισμένους παράγοντες μεταφοράς με εκείνους της mRNA. Ας συγκρίνουμε τα δεδομένα έκφρασης και των δύο τύπων RNA στους ίδιους ασθενείς, και θα συσχετίσουμε τα αποτελέσματα με τα σύμπλοκα και τους παράγοντες που εμπλέκονται στη μεταφορά τους στο κυτταρόπλασμα. 42 δείγματα αριστερής κοιλίας θα χρησιμοποιηθούν από ασθενείς με HF, ισχαιμικής ή διαστολής προέλευσης, οι οποίοι απαιτούν μεταμόσχευση καρδιάς, και 14 δείγματα αριστερής κοιλίας από υγιή άτομα, τα οποία πέθαναν από μη καρδιακές αιτίες. Η υπολογιστική ανάλυση των δεδομένων θα μας επιτρέψει να αποκτήσουμε διαφοροποιημένη έκφραση και λειτουργική ανάλυση. Τα αποτελέσματα θα επικυρωθούν με επί τόπου υβριδισμό, qRT-PCR, δυτική σταγόνα και ανοσοκυτταροχημεία, και τα δεδομένα που θα ληφθούν θα συγκριθούν με τη λειτουργία της κοιλίας και την καρδιακή αναμόρφωση. Τα δείγματα του έργου έχουν ήδη ληφθεί από την ομάδα. (Greek) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Η πυρηνική φάση της γονιδιακής έκφρασης σε ευκαρυώτες, συμπεριλαμβανομένων μετα-μεταγραφικών τροποποιήσεων στο mRNA και συσκευασμένων σε ριβονουκλεοπρωτεΐνες (PMRN), τελειώνει με τη μεταφορά του στο κυτταρόπλασμα μέσω του πυρηνικού πόρου για μεταγενέστερη μετάφραση και απαιτεί την παρουσία ορισμένων παραγόντων για την ολοκλήρωσή του. Στόχος του έργου είναι να προσδιοριστεί η έκφραση, μέσω της αλληλουχίας του RNA, των μορίων που συντονίζουν την εξαγωγή RNA σε κυτταρόπλασμα στην ανθρώπινη καρδιακή ανεπάρκεια (CI), όπως το σύμπλεγμα πρωτεϊνών TREX (μεταγραφής-εξαγωγής)· Group THO, DEAD-box helicases, και Aly adapter), ο συντελεστής NXF1:NXT1 (Tap:p15) και ο υποστηρικτής του GANP, και ο Dbp5 (DDX19) που διευκολύνει τη μεταφορά του mRNA (με τη μορφή NMR) στο κυτταροπλασματικό πρόσωπο των πυρηνικών πόρων. Επιπλέον, χρησιμοποιώντας μικροσυστοιχίες, θα καθορίσουμε την έκφραση των μικρών RNA που δεν κωδικοποιούν πρωτεΐνες (snoRNAs και scaRNAs) και διαδραματίζουν σημαντικό ρόλο στη ρύθμιση της έκφρασης των γονιδίων. αυτοί οι RNA μοιράζονται ορισμένους παράγοντες μεταφοράς με εκείνους της mRNA. Ας συγκρίνουμε τα δεδομένα έκφρασης και των δύο τύπων RNA στους ίδιους ασθενείς, και θα συσχετίσουμε τα αποτελέσματα με τα σύμπλοκα και τους παράγοντες που εμπλέκονται στη μεταφορά τους στο κυτταρόπλασμα. 42 δείγματα αριστερής κοιλίας θα χρησιμοποιηθούν από ασθενείς με HF, ισχαιμικής ή διαστολής προέλευσης, οι οποίοι απαιτούν μεταμόσχευση καρδιάς, και 14 δείγματα αριστερής κοιλίας από υγιή άτομα, τα οποία πέθαναν από μη καρδιακές αιτίες. Η υπολογιστική ανάλυση των δεδομένων θα μας επιτρέψει να αποκτήσουμε διαφοροποιημένη έκφραση και λειτουργική ανάλυση. Τα αποτελέσματα θα επικυρωθούν με επί τόπου υβριδισμό, qRT-PCR, δυτική σταγόνα και ανοσοκυτταροχημεία, και τα δεδομένα που θα ληφθούν θα συγκριθούν με τη λειτουργία της κοιλίας και την καρδιακή αναμόρφωση. Τα δείγματα του έργου έχουν ήδη ληφθεί από την ομάδα. (Greek) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Jadrová fáza expresie génov v eukaryotoch vrátane posttranskripčných modifikácií v mRNA a zabalená do ribonukleoproteínov (PMRN) končí jeho transportom do cytoplazmu cez jadrový pór na následný preklad a vyžaduje si prítomnosť viacerých faktorov na jeho dokončenie. Cieľom projektu je stanoviť expresiu sekvenovania RNA tých molekúl, ktoré koordinujú vývoz RNA do cytoplazmu v ľudskom zlyhávaní srdca (CI), ako je proteínový komplex TREX (Transcription-export); Group THO, DEAD-box helicases a Aly adaptér), NXF1:NXT1 faktor (Tap:p15) a jeho promótor GANP a Dbp5 (DDX19), ktorý uľahčuje prepravu mRNA (vo forme NMR) do cytoplazmickej tváre jadrového póru. Okrem toho pomocou mikroarrays určíme expresiu malých RNA, ktoré nezakódujú proteíny (snoRNA a scaRNA) a budeme hrať dôležitú úlohu pri regulácii expresie génov; tieto RNA zdieľajú niektoré dopravné faktory s faktormi mRNA. Porovnajme údaje o expresii oboch typov RNA u rovnakých pacientov a výsledky budeme spájať s komplexmi a faktormi podieľajúcimi sa na ich transporte do cytoplazmu. 42 vzoriek ľavej komory sa použije od pacientov s HF, ischemického alebo rozšíreného pôvodu, ktorí vyžadovali transplantáciu srdca, a 14 vzoriek ľavej komory od zdravých jedincov, ktorí zomreli na nekardiálne príčiny. Výpočtová analýza údajov nám umožní získať diferencované vyjadrenie a funkčnú analýzu. Výsledky budú validované in situ hybridizáciou, qRT-PCR, western-blot a imunocytochémiou a získané údaje sa porovnajú s ventrikulárnou funkciou a remodeláciou srdca. Vzorky projektu už skupina získala. (Slovak) | |||||||||||||||
| Property / summary: Jadrová fáza expresie génov v eukaryotoch vrátane posttranskripčných modifikácií v mRNA a zabalená do ribonukleoproteínov (PMRN) končí jeho transportom do cytoplazmu cez jadrový pór na následný preklad a vyžaduje si prítomnosť viacerých faktorov na jeho dokončenie. Cieľom projektu je stanoviť expresiu sekvenovania RNA tých molekúl, ktoré koordinujú vývoz RNA do cytoplazmu v ľudskom zlyhávaní srdca (CI), ako je proteínový komplex TREX (Transcription-export); Group THO, DEAD-box helicases a Aly adaptér), NXF1:NXT1 faktor (Tap:p15) a jeho promótor GANP a Dbp5 (DDX19), ktorý uľahčuje prepravu mRNA (vo forme NMR) do cytoplazmickej tváre jadrového póru. Okrem toho pomocou mikroarrays určíme expresiu malých RNA, ktoré nezakódujú proteíny (snoRNA a scaRNA) a budeme hrať dôležitú úlohu pri regulácii expresie génov; tieto RNA zdieľajú niektoré dopravné faktory s faktormi mRNA. Porovnajme údaje o expresii oboch typov RNA u rovnakých pacientov a výsledky budeme spájať s komplexmi a faktormi podieľajúcimi sa na ich transporte do cytoplazmu. 42 vzoriek ľavej komory sa použije od pacientov s HF, ischemického alebo rozšíreného pôvodu, ktorí vyžadovali transplantáciu srdca, a 14 vzoriek ľavej komory od zdravých jedincov, ktorí zomreli na nekardiálne príčiny. Výpočtová analýza údajov nám umožní získať diferencované vyjadrenie a funkčnú analýzu. Výsledky budú validované in situ hybridizáciou, qRT-PCR, western-blot a imunocytochémiou a získané údaje sa porovnajú s ventrikulárnou funkciou a remodeláciou srdca. Vzorky projektu už skupina získala. (Slovak) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Jadrová fáza expresie génov v eukaryotoch vrátane posttranskripčných modifikácií v mRNA a zabalená do ribonukleoproteínov (PMRN) končí jeho transportom do cytoplazmu cez jadrový pór na následný preklad a vyžaduje si prítomnosť viacerých faktorov na jeho dokončenie. Cieľom projektu je stanoviť expresiu sekvenovania RNA tých molekúl, ktoré koordinujú vývoz RNA do cytoplazmu v ľudskom zlyhávaní srdca (CI), ako je proteínový komplex TREX (Transcription-export); Group THO, DEAD-box helicases a Aly adaptér), NXF1:NXT1 faktor (Tap:p15) a jeho promótor GANP a Dbp5 (DDX19), ktorý uľahčuje prepravu mRNA (vo forme NMR) do cytoplazmickej tváre jadrového póru. Okrem toho pomocou mikroarrays určíme expresiu malých RNA, ktoré nezakódujú proteíny (snoRNA a scaRNA) a budeme hrať dôležitú úlohu pri regulácii expresie génov; tieto RNA zdieľajú niektoré dopravné faktory s faktormi mRNA. Porovnajme údaje o expresii oboch typov RNA u rovnakých pacientov a výsledky budeme spájať s komplexmi a faktormi podieľajúcimi sa na ich transporte do cytoplazmu. 42 vzoriek ľavej komory sa použije od pacientov s HF, ischemického alebo rozšíreného pôvodu, ktorí vyžadovali transplantáciu srdca, a 14 vzoriek ľavej komory od zdravých jedincov, ktorí zomreli na nekardiálne príčiny. Výpočtová analýza údajov nám umožní získať diferencované vyjadrenie a funkčnú analýzu. Výsledky budú validované in situ hybridizáciou, qRT-PCR, western-blot a imunocytochémiou a získané údaje sa porovnajú s ventrikulárnou funkciou a remodeláciou srdca. Vzorky projektu už skupina získala. (Slovak) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Eukaryoottien geenien ilmentymisen ydinvaihe, mukaan lukien mRNA:n jälkeiset muutokset, jotka on pakattu ribonukleoproteiiniin (PMRN), päättyy sen siirtämiseen sytoplasmaan ydinhuokosen kautta myöhempää kääntämistä varten ja edellyttää, että sen loppuunsaattamiseksi on useita tekijöitä. Hankkeen tavoitteena on määrittää RNA-sekvensoinnin avulla ne molekyylit, jotka koordinoivat RNA:iden vientiä sytoplasmaan ihmisen sydämen vajaatoiminnassa (CI), kuten TREX-proteiinikompleksi (Transcription-export). ryhmä THO, DEAD-box-helikaasit ja Aly-sovitin, NXF1:NXT1 tekijä (Tap:p15) ja sen GANP-promoottori sekä Dbp5 (DDX19), joka helpottaa mRNA:n (NMR:n muodossa) kuljettamista ydinhuokosen sytoplasmiselle kasvoille. Lisäksi mikrorypäleillä määritetään sellaisten pienten RNA:iden ilmentymä, jotka eivät koodaa proteiineja (snoRNA- ja scaRNA-aineita) ja joilla on tärkeä rooli geenien ilmentymisen sääntelyssä; näillä RNA:illa on joitakin kuljetustekijöitä mRNA:n kanssa. Verrataan molempien RNA-tyyppien ilmaisutietoja samoilla potilailla, ja suhteutamme tulokset komplekseihin ja tekijöihin, jotka liittyvät niiden kuljetukseen sytoplasmaan. 42 vasemman kammion näytettä käytetään HF-potilailta, joilla on iskeeminen tai laajentunut alkuperä ja jotka vaativat sydämensiirron, ja 14 jäljellä olevaa kammionäytettä terveiltä yksilöiltä, jotka kuolivat ei-sydämen aiheuttamiin syihin. Tietojen laskennallisen analyysin avulla voimme saada eriytettyä ilmaisua ja toiminnallista analyysia. Tulokset validoidaan in situ hybridisaatiolla, qRT-PCR:llä, Western-blotilla ja immunosytokemialla, ja saatuja tietoja verrataan kammion toimintaan ja sydämen uudistamiseen. Ryhmä on jo hankkinut hankenäytteet. (Finnish) | |||||||||||||||
| Property / summary: Eukaryoottien geenien ilmentymisen ydinvaihe, mukaan lukien mRNA:n jälkeiset muutokset, jotka on pakattu ribonukleoproteiiniin (PMRN), päättyy sen siirtämiseen sytoplasmaan ydinhuokosen kautta myöhempää kääntämistä varten ja edellyttää, että sen loppuunsaattamiseksi on useita tekijöitä. Hankkeen tavoitteena on määrittää RNA-sekvensoinnin avulla ne molekyylit, jotka koordinoivat RNA:iden vientiä sytoplasmaan ihmisen sydämen vajaatoiminnassa (CI), kuten TREX-proteiinikompleksi (Transcription-export). ryhmä THO, DEAD-box-helikaasit ja Aly-sovitin, NXF1:NXT1 tekijä (Tap:p15) ja sen GANP-promoottori sekä Dbp5 (DDX19), joka helpottaa mRNA:n (NMR:n muodossa) kuljettamista ydinhuokosen sytoplasmiselle kasvoille. Lisäksi mikrorypäleillä määritetään sellaisten pienten RNA:iden ilmentymä, jotka eivät koodaa proteiineja (snoRNA- ja scaRNA-aineita) ja joilla on tärkeä rooli geenien ilmentymisen sääntelyssä; näillä RNA:illa on joitakin kuljetustekijöitä mRNA:n kanssa. Verrataan molempien RNA-tyyppien ilmaisutietoja samoilla potilailla, ja suhteutamme tulokset komplekseihin ja tekijöihin, jotka liittyvät niiden kuljetukseen sytoplasmaan. 42 vasemman kammion näytettä käytetään HF-potilailta, joilla on iskeeminen tai laajentunut alkuperä ja jotka vaativat sydämensiirron, ja 14 jäljellä olevaa kammionäytettä terveiltä yksilöiltä, jotka kuolivat ei-sydämen aiheuttamiin syihin. Tietojen laskennallisen analyysin avulla voimme saada eriytettyä ilmaisua ja toiminnallista analyysia. Tulokset validoidaan in situ hybridisaatiolla, qRT-PCR:llä, Western-blotilla ja immunosytokemialla, ja saatuja tietoja verrataan kammion toimintaan ja sydämen uudistamiseen. Ryhmä on jo hankkinut hankenäytteet. (Finnish) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Eukaryoottien geenien ilmentymisen ydinvaihe, mukaan lukien mRNA:n jälkeiset muutokset, jotka on pakattu ribonukleoproteiiniin (PMRN), päättyy sen siirtämiseen sytoplasmaan ydinhuokosen kautta myöhempää kääntämistä varten ja edellyttää, että sen loppuunsaattamiseksi on useita tekijöitä. Hankkeen tavoitteena on määrittää RNA-sekvensoinnin avulla ne molekyylit, jotka koordinoivat RNA:iden vientiä sytoplasmaan ihmisen sydämen vajaatoiminnassa (CI), kuten TREX-proteiinikompleksi (Transcription-export). ryhmä THO, DEAD-box-helikaasit ja Aly-sovitin, NXF1:NXT1 tekijä (Tap:p15) ja sen GANP-promoottori sekä Dbp5 (DDX19), joka helpottaa mRNA:n (NMR:n muodossa) kuljettamista ydinhuokosen sytoplasmiselle kasvoille. Lisäksi mikrorypäleillä määritetään sellaisten pienten RNA:iden ilmentymä, jotka eivät koodaa proteiineja (snoRNA- ja scaRNA-aineita) ja joilla on tärkeä rooli geenien ilmentymisen sääntelyssä; näillä RNA:illa on joitakin kuljetustekijöitä mRNA:n kanssa. Verrataan molempien RNA-tyyppien ilmaisutietoja samoilla potilailla, ja suhteutamme tulokset komplekseihin ja tekijöihin, jotka liittyvät niiden kuljetukseen sytoplasmaan. 42 vasemman kammion näytettä käytetään HF-potilailta, joilla on iskeeminen tai laajentunut alkuperä ja jotka vaativat sydämensiirron, ja 14 jäljellä olevaa kammionäytettä terveiltä yksilöiltä, jotka kuolivat ei-sydämen aiheuttamiin syihin. Tietojen laskennallisen analyysin avulla voimme saada eriytettyä ilmaisua ja toiminnallista analyysia. Tulokset validoidaan in situ hybridisaatiolla, qRT-PCR:llä, Western-blotilla ja immunosytokemialla, ja saatuja tietoja verrataan kammion toimintaan ja sydämen uudistamiseen. Ryhmä on jo hankkinut hankenäytteet. (Finnish) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Nuklearna faza ekspresji genów w eukariotach, w tym potranskrypcyjne modyfikacje w mRNA i pakowana w ribonukleoprotein (PMRN), kończy się jej transportem do cytoplazmy przez pory jądrowe w celu późniejszego przetłumaczenia i wymaga obecności szeregu czynników do jej ukończenia. Celem projektu jest określenie ekspresji sekwencjonowania RNA tych cząsteczek, które koordynują eksport RNA do cytoplazmy w niewydolności serca człowieka (CI), takich jak kompleks białek TREX (Transcription-export); Group THO, DEAD-box helicases i Aly adapter), współczynnik NXF1:NXT1 (Tap:p15) i jego promotor GANP oraz Dbp5 (DDX19), które ułatwiają transport mRNA (w postaci NMR) na stronę cytoplazmatyczną porów jądrowych. Ponadto, wykorzystując mikroarraye, określimy ekspresję małych RNA, które nie kodują białek (snoRNA i scaRNAs) i odgrywają ważną rolę w regulacji ekspresji genów; te RNA dzielą niektóre czynniki transportowe z czynnikami mRNA. Porównajmy dane ekspresji obu typów RNA u tych samych pacjentów, a wyniki odniesiemy do kompleksów i czynników związanych z ich transportem do cytoplazmy. 42 próbki lewej komory zostaną wykorzystane od pacjentów z HF, pochodzenia niedokrwiennego lub rozszerzonego, którzy wymagali przeszczepu serca, oraz 14 próbek lewej komory od zdrowych osób, którzy zmarli z przyczyn niezwiązanych z sercem. Analiza obliczeniowa danych pozwoli nam uzyskać zróżnicowane wyrażenie i analizę funkcjonalną. Wyniki zostaną potwierdzone hybrydyzacją in situ, qRT-PCR, blokiem zachodnim i immunocytochemią, a uzyskane dane zostaną porównane z czynnością komorową i przebudową serca. Grupa uzyskała już próbki projektów. (Polish) | |||||||||||||||
| Property / summary: Nuklearna faza ekspresji genów w eukariotach, w tym potranskrypcyjne modyfikacje w mRNA i pakowana w ribonukleoprotein (PMRN), kończy się jej transportem do cytoplazmy przez pory jądrowe w celu późniejszego przetłumaczenia i wymaga obecności szeregu czynników do jej ukończenia. Celem projektu jest określenie ekspresji sekwencjonowania RNA tych cząsteczek, które koordynują eksport RNA do cytoplazmy w niewydolności serca człowieka (CI), takich jak kompleks białek TREX (Transcription-export); Group THO, DEAD-box helicases i Aly adapter), współczynnik NXF1:NXT1 (Tap:p15) i jego promotor GANP oraz Dbp5 (DDX19), które ułatwiają transport mRNA (w postaci NMR) na stronę cytoplazmatyczną porów jądrowych. Ponadto, wykorzystując mikroarraye, określimy ekspresję małych RNA, które nie kodują białek (snoRNA i scaRNAs) i odgrywają ważną rolę w regulacji ekspresji genów; te RNA dzielą niektóre czynniki transportowe z czynnikami mRNA. Porównajmy dane ekspresji obu typów RNA u tych samych pacjentów, a wyniki odniesiemy do kompleksów i czynników związanych z ich transportem do cytoplazmy. 42 próbki lewej komory zostaną wykorzystane od pacjentów z HF, pochodzenia niedokrwiennego lub rozszerzonego, którzy wymagali przeszczepu serca, oraz 14 próbek lewej komory od zdrowych osób, którzy zmarli z przyczyn niezwiązanych z sercem. Analiza obliczeniowa danych pozwoli nam uzyskać zróżnicowane wyrażenie i analizę funkcjonalną. Wyniki zostaną potwierdzone hybrydyzacją in situ, qRT-PCR, blokiem zachodnim i immunocytochemią, a uzyskane dane zostaną porównane z czynnością komorową i przebudową serca. Grupa uzyskała już próbki projektów. (Polish) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Nuklearna faza ekspresji genów w eukariotach, w tym potranskrypcyjne modyfikacje w mRNA i pakowana w ribonukleoprotein (PMRN), kończy się jej transportem do cytoplazmy przez pory jądrowe w celu późniejszego przetłumaczenia i wymaga obecności szeregu czynników do jej ukończenia. Celem projektu jest określenie ekspresji sekwencjonowania RNA tych cząsteczek, które koordynują eksport RNA do cytoplazmy w niewydolności serca człowieka (CI), takich jak kompleks białek TREX (Transcription-export); Group THO, DEAD-box helicases i Aly adapter), współczynnik NXF1:NXT1 (Tap:p15) i jego promotor GANP oraz Dbp5 (DDX19), które ułatwiają transport mRNA (w postaci NMR) na stronę cytoplazmatyczną porów jądrowych. Ponadto, wykorzystując mikroarraye, określimy ekspresję małych RNA, które nie kodują białek (snoRNA i scaRNAs) i odgrywają ważną rolę w regulacji ekspresji genów; te RNA dzielą niektóre czynniki transportowe z czynnikami mRNA. Porównajmy dane ekspresji obu typów RNA u tych samych pacjentów, a wyniki odniesiemy do kompleksów i czynników związanych z ich transportem do cytoplazmy. 42 próbki lewej komory zostaną wykorzystane od pacjentów z HF, pochodzenia niedokrwiennego lub rozszerzonego, którzy wymagali przeszczepu serca, oraz 14 próbek lewej komory od zdrowych osób, którzy zmarli z przyczyn niezwiązanych z sercem. Analiza obliczeniowa danych pozwoli nam uzyskać zróżnicowane wyrażenie i analizę funkcjonalną. Wyniki zostaną potwierdzone hybrydyzacją in situ, qRT-PCR, blokiem zachodnim i immunocytochemią, a uzyskane dane zostaną porównane z czynnością komorową i przebudową serca. Grupa uzyskała już próbki projektów. (Polish) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Az eukariótákban a génexpresszió nukleáris fázisa, beleértve az mRNS-ben történő poszttrankripciós módosításokat és ribonukleoproteinekbe (PMRN) csomagolva, a citoplazmába történő szállításával végződik a nukleáris póruson keresztül a későbbi fordítás érdekében, és számos tényező jelenlétét igényli annak befejezéséhez. A projekt célja, hogy RNS szekvenálással meghatározza az RNS-ek citoplazmába történő exportját emberi szívelégtelenségben koordináló molekulákat, mint például a TREX (Transcription-export) fehérjekomplexet; a THO csoport, a DEAD-box helicases és az Aly adapter), a NXF1:NXT1 tényező (Tap:p15) és annak GANP-promóterje, valamint a Dbp5 (DDX19), amely megkönnyíti az mRNS (NMR formájában) a nukleáris pórus citoplazmikus felületére történő szállítását. Ezenkívül mikroarray-k használatával meghatározzuk azokat a kis RNS-eket, amelyek nem kódolnak fehérjéket (snoRNS és scaRNS), és fontos szerepet játszanak a génexpresszió szabályozásában; ezek az RNS-ek néhány szállítási tényezőt megosztanak az mRNS-szel. Hasonlítsuk össze mindkét típusú RNS-ek expressziós adatait ugyanabban a betegben, és az eredményeket a citoplazmához való transzportban szerepet játszó komplexekhez és tényezőkhöz kapcsoljuk. 42 bal kamra mintát használnak a betegek HF, ischaemiás vagy kitágult eredetű, akik szükség van egy szívátültetés, és 14 bal kamra minta egészséges egyének, akik meghaltak a nem szívbetegség okozta. Az adatok számítási elemzése lehetővé teszi számunkra, hogy differenciált kifejezést és funkcionális elemzést szerezzünk. Az eredményeket in situ hibridizáció, qRT-PCR, western-blot és immunocytochemistry validálják, és a kapott adatokat a kamrai funkcióval és a kardiovaszkuláris átalakítással hasonlítják össze. A projektmintákat a csoport már megszerezte. (Hungarian) | |||||||||||||||
| Property / summary: Az eukariótákban a génexpresszió nukleáris fázisa, beleértve az mRNS-ben történő poszttrankripciós módosításokat és ribonukleoproteinekbe (PMRN) csomagolva, a citoplazmába történő szállításával végződik a nukleáris póruson keresztül a későbbi fordítás érdekében, és számos tényező jelenlétét igényli annak befejezéséhez. A projekt célja, hogy RNS szekvenálással meghatározza az RNS-ek citoplazmába történő exportját emberi szívelégtelenségben koordináló molekulákat, mint például a TREX (Transcription-export) fehérjekomplexet; a THO csoport, a DEAD-box helicases és az Aly adapter), a NXF1:NXT1 tényező (Tap:p15) és annak GANP-promóterje, valamint a Dbp5 (DDX19), amely megkönnyíti az mRNS (NMR formájában) a nukleáris pórus citoplazmikus felületére történő szállítását. Ezenkívül mikroarray-k használatával meghatározzuk azokat a kis RNS-eket, amelyek nem kódolnak fehérjéket (snoRNS és scaRNS), és fontos szerepet játszanak a génexpresszió szabályozásában; ezek az RNS-ek néhány szállítási tényezőt megosztanak az mRNS-szel. Hasonlítsuk össze mindkét típusú RNS-ek expressziós adatait ugyanabban a betegben, és az eredményeket a citoplazmához való transzportban szerepet játszó komplexekhez és tényezőkhöz kapcsoljuk. 42 bal kamra mintát használnak a betegek HF, ischaemiás vagy kitágult eredetű, akik szükség van egy szívátültetés, és 14 bal kamra minta egészséges egyének, akik meghaltak a nem szívbetegség okozta. Az adatok számítási elemzése lehetővé teszi számunkra, hogy differenciált kifejezést és funkcionális elemzést szerezzünk. Az eredményeket in situ hibridizáció, qRT-PCR, western-blot és immunocytochemistry validálják, és a kapott adatokat a kamrai funkcióval és a kardiovaszkuláris átalakítással hasonlítják össze. A projektmintákat a csoport már megszerezte. (Hungarian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Az eukariótákban a génexpresszió nukleáris fázisa, beleértve az mRNS-ben történő poszttrankripciós módosításokat és ribonukleoproteinekbe (PMRN) csomagolva, a citoplazmába történő szállításával végződik a nukleáris póruson keresztül a későbbi fordítás érdekében, és számos tényező jelenlétét igényli annak befejezéséhez. A projekt célja, hogy RNS szekvenálással meghatározza az RNS-ek citoplazmába történő exportját emberi szívelégtelenségben koordináló molekulákat, mint például a TREX (Transcription-export) fehérjekomplexet; a THO csoport, a DEAD-box helicases és az Aly adapter), a NXF1:NXT1 tényező (Tap:p15) és annak GANP-promóterje, valamint a Dbp5 (DDX19), amely megkönnyíti az mRNS (NMR formájában) a nukleáris pórus citoplazmikus felületére történő szállítását. Ezenkívül mikroarray-k használatával meghatározzuk azokat a kis RNS-eket, amelyek nem kódolnak fehérjéket (snoRNS és scaRNS), és fontos szerepet játszanak a génexpresszió szabályozásában; ezek az RNS-ek néhány szállítási tényezőt megosztanak az mRNS-szel. Hasonlítsuk össze mindkét típusú RNS-ek expressziós adatait ugyanabban a betegben, és az eredményeket a citoplazmához való transzportban szerepet játszó komplexekhez és tényezőkhöz kapcsoljuk. 42 bal kamra mintát használnak a betegek HF, ischaemiás vagy kitágult eredetű, akik szükség van egy szívátültetés, és 14 bal kamra minta egészséges egyének, akik meghaltak a nem szívbetegség okozta. Az adatok számítási elemzése lehetővé teszi számunkra, hogy differenciált kifejezést és funkcionális elemzést szerezzünk. Az eredményeket in situ hibridizáció, qRT-PCR, western-blot és immunocytochemistry validálják, és a kapott adatokat a kamrai funkcióval és a kardiovaszkuláris átalakítással hasonlítják össze. A projektmintákat a csoport már megszerezte. (Hungarian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Jaderná fáze exprese genů u eukaryotů, včetně posttranskripčních modifikací mRNA a balených v ribonukleoproteinech (PMRN), končí transportem do cytoplazmy jaderným pórem pro následný překlad a vyžaduje přítomnost řady faktorů pro její dokončení. Cílem projektu je určit expresi molekul, které koordinují vývoz RNA do cytoplazmy v lidském srdečním selhání (CI), jako je TREX (Transcription-export) proteinový komplex, pomocí sekvenování RNA; skupina THO, helicases DEAD-box a adaptér Aly, faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) a jeho promotor GANP a Dbp5 (DDX19), který usnadňuje přepravu mRNA (ve formě NMR) do cytoplazmatické tváře jaderného póru. Kromě toho pomocí mikroarraye určíme expresi malých RNA, které nezakódují proteiny (snoRNA a scaRNA) a hrají důležitou roli při regulaci genové exprese; tyto RNA sdílejí některé dopravní faktory s faktory mRNA. Porovnejte expresní data obou typů RNA u stejných pacientů a výsledky spojíme s komplexy a faktory, které se podílejí na jejich transportu do cytoplazmy. 42 vzorků levé komory bude použito od pacientů s HF, ischemického nebo rozšířeného původu, kteří vyžadovali transplantaci srdce, a 14 vzorků levé komory od zdravých jedinců, kteří zemřeli na nekardiovaskulárních příčinách. Výpočetní analýza dat nám umožní získat diferencovanou expresní a funkční analýzu. Výsledky budou validovány hybridizací in situ, qRT-PCR, Western-blot a imunocytochemií a získané údaje budou porovnány s komorovou funkcí a remodelací srdce. Projektové vzorky již skupina získala. (Czech) | |||||||||||||||
| Property / summary: Jaderná fáze exprese genů u eukaryotů, včetně posttranskripčních modifikací mRNA a balených v ribonukleoproteinech (PMRN), končí transportem do cytoplazmy jaderným pórem pro následný překlad a vyžaduje přítomnost řady faktorů pro její dokončení. Cílem projektu je určit expresi molekul, které koordinují vývoz RNA do cytoplazmy v lidském srdečním selhání (CI), jako je TREX (Transcription-export) proteinový komplex, pomocí sekvenování RNA; skupina THO, helicases DEAD-box a adaptér Aly, faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) a jeho promotor GANP a Dbp5 (DDX19), který usnadňuje přepravu mRNA (ve formě NMR) do cytoplazmatické tváře jaderného póru. Kromě toho pomocí mikroarraye určíme expresi malých RNA, které nezakódují proteiny (snoRNA a scaRNA) a hrají důležitou roli při regulaci genové exprese; tyto RNA sdílejí některé dopravní faktory s faktory mRNA. Porovnejte expresní data obou typů RNA u stejných pacientů a výsledky spojíme s komplexy a faktory, které se podílejí na jejich transportu do cytoplazmy. 42 vzorků levé komory bude použito od pacientů s HF, ischemického nebo rozšířeného původu, kteří vyžadovali transplantaci srdce, a 14 vzorků levé komory od zdravých jedinců, kteří zemřeli na nekardiovaskulárních příčinách. Výpočetní analýza dat nám umožní získat diferencovanou expresní a funkční analýzu. Výsledky budou validovány hybridizací in situ, qRT-PCR, Western-blot a imunocytochemií a získané údaje budou porovnány s komorovou funkcí a remodelací srdce. Projektové vzorky již skupina získala. (Czech) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Jaderná fáze exprese genů u eukaryotů, včetně posttranskripčních modifikací mRNA a balených v ribonukleoproteinech (PMRN), končí transportem do cytoplazmy jaderným pórem pro následný překlad a vyžaduje přítomnost řady faktorů pro její dokončení. Cílem projektu je určit expresi molekul, které koordinují vývoz RNA do cytoplazmy v lidském srdečním selhání (CI), jako je TREX (Transcription-export) proteinový komplex, pomocí sekvenování RNA; skupina THO, helicases DEAD-box a adaptér Aly, faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) a jeho promotor GANP a Dbp5 (DDX19), který usnadňuje přepravu mRNA (ve formě NMR) do cytoplazmatické tváře jaderného póru. Kromě toho pomocí mikroarraye určíme expresi malých RNA, které nezakódují proteiny (snoRNA a scaRNA) a hrají důležitou roli při regulaci genové exprese; tyto RNA sdílejí některé dopravní faktory s faktory mRNA. Porovnejte expresní data obou typů RNA u stejných pacientů a výsledky spojíme s komplexy a faktory, které se podílejí na jejich transportu do cytoplazmy. 42 vzorků levé komory bude použito od pacientů s HF, ischemického nebo rozšířeného původu, kteří vyžadovali transplantaci srdce, a 14 vzorků levé komory od zdravých jedinců, kteří zemřeli na nekardiovaskulárních příčinách. Výpočetní analýza dat nám umožní získat diferencovanou expresní a funkční analýzu. Výsledky budou validovány hybridizací in situ, qRT-PCR, Western-blot a imunocytochemií a získané údaje budou porovnány s komorovou funkcí a remodelací srdce. Projektové vzorky již skupina získala. (Czech) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Gēnu ekspresijas kodolfāze eukaryotos, tostarp pēctranskripcijas modifikācijas mRNS un iepakota ribonukleoproteīnā (PMRN), beidzas ar tās transportēšanu uz citoplazmu caur kodolporu turpmākai pārtulkošanai un prasa vairāku faktoru klātbūtni tās pabeigšanai. Projekta mērķis ir noteikt to molekulu ekspresiju ar RNS sekvencēšanu, kas koordinē RNS eksportu uz citoplazmu cilvēka sirds mazspējas (CI) gadījumā, piemēram, TREX (transkripcijas eksporta) proteīnu kompleksu; grupa THO, DEAD-box helikopteri un Aly adapteri), NXF1:NXT1 faktors (Tap:p15) un tā GANP veicinātājs, un Dbp5 (DDX19), kas atvieglo mRNS (NMR veidā) transportēšanu uz kodolporas citoplazmas seju. Turklāt, izmantojot mikroblokus, mēs noteiksim nelielu RNS ekspresiju, kas neiekodē proteīnus (snoRNS un scaRNS) un kam ir svarīga loma gēnu ekspresijas regulēšanā; šīm RNS ir daži transporta faktori ar mRNS faktoriem. Salīdzināsim abu RNS veidu ekspresijas datus vieniem un tiem pašiem pacientiem, un mēs saistīsim rezultātus ar kompleksiem un faktoriem, kas saistīti ar to transportēšanu uz citoplazmu. 42 kreisā kambara paraugi tiks izmantoti no pacientiem ar HF, išēmiskas vai paplašinātas izcelsmes, kuriem bija nepieciešama sirds transplantācija, un 14 kreisā kambara paraugi no veseliem indivīdiem, kuri nomira no ne-kardiāliem cēloņiem. Datu skaitļošanas analīze ļaus mums iegūt diferencētu izteiksmi un funkcionālo analīzi. Rezultātus validēs ar in situ hibridizāciju, qRT-PCR, Western-bloot un imūncitoķīmiju, un iegūtos datus salīdzinās ar kambaru funkciju un sirds remodelāciju. Grupa jau ir ieguvusi projektu paraugus. (Latvian) | |||||||||||||||
| Property / summary: Gēnu ekspresijas kodolfāze eukaryotos, tostarp pēctranskripcijas modifikācijas mRNS un iepakota ribonukleoproteīnā (PMRN), beidzas ar tās transportēšanu uz citoplazmu caur kodolporu turpmākai pārtulkošanai un prasa vairāku faktoru klātbūtni tās pabeigšanai. Projekta mērķis ir noteikt to molekulu ekspresiju ar RNS sekvencēšanu, kas koordinē RNS eksportu uz citoplazmu cilvēka sirds mazspējas (CI) gadījumā, piemēram, TREX (transkripcijas eksporta) proteīnu kompleksu; grupa THO, DEAD-box helikopteri un Aly adapteri), NXF1:NXT1 faktors (Tap:p15) un tā GANP veicinātājs, un Dbp5 (DDX19), kas atvieglo mRNS (NMR veidā) transportēšanu uz kodolporas citoplazmas seju. Turklāt, izmantojot mikroblokus, mēs noteiksim nelielu RNS ekspresiju, kas neiekodē proteīnus (snoRNS un scaRNS) un kam ir svarīga loma gēnu ekspresijas regulēšanā; šīm RNS ir daži transporta faktori ar mRNS faktoriem. Salīdzināsim abu RNS veidu ekspresijas datus vieniem un tiem pašiem pacientiem, un mēs saistīsim rezultātus ar kompleksiem un faktoriem, kas saistīti ar to transportēšanu uz citoplazmu. 42 kreisā kambara paraugi tiks izmantoti no pacientiem ar HF, išēmiskas vai paplašinātas izcelsmes, kuriem bija nepieciešama sirds transplantācija, un 14 kreisā kambara paraugi no veseliem indivīdiem, kuri nomira no ne-kardiāliem cēloņiem. Datu skaitļošanas analīze ļaus mums iegūt diferencētu izteiksmi un funkcionālo analīzi. Rezultātus validēs ar in situ hibridizāciju, qRT-PCR, Western-bloot un imūncitoķīmiju, un iegūtos datus salīdzinās ar kambaru funkciju un sirds remodelāciju. Grupa jau ir ieguvusi projektu paraugus. (Latvian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Gēnu ekspresijas kodolfāze eukaryotos, tostarp pēctranskripcijas modifikācijas mRNS un iepakota ribonukleoproteīnā (PMRN), beidzas ar tās transportēšanu uz citoplazmu caur kodolporu turpmākai pārtulkošanai un prasa vairāku faktoru klātbūtni tās pabeigšanai. Projekta mērķis ir noteikt to molekulu ekspresiju ar RNS sekvencēšanu, kas koordinē RNS eksportu uz citoplazmu cilvēka sirds mazspējas (CI) gadījumā, piemēram, TREX (transkripcijas eksporta) proteīnu kompleksu; grupa THO, DEAD-box helikopteri un Aly adapteri), NXF1:NXT1 faktors (Tap:p15) un tā GANP veicinātājs, un Dbp5 (DDX19), kas atvieglo mRNS (NMR veidā) transportēšanu uz kodolporas citoplazmas seju. Turklāt, izmantojot mikroblokus, mēs noteiksim nelielu RNS ekspresiju, kas neiekodē proteīnus (snoRNS un scaRNS) un kam ir svarīga loma gēnu ekspresijas regulēšanā; šīm RNS ir daži transporta faktori ar mRNS faktoriem. Salīdzināsim abu RNS veidu ekspresijas datus vieniem un tiem pašiem pacientiem, un mēs saistīsim rezultātus ar kompleksiem un faktoriem, kas saistīti ar to transportēšanu uz citoplazmu. 42 kreisā kambara paraugi tiks izmantoti no pacientiem ar HF, išēmiskas vai paplašinātas izcelsmes, kuriem bija nepieciešama sirds transplantācija, un 14 kreisā kambara paraugi no veseliem indivīdiem, kuri nomira no ne-kardiāliem cēloņiem. Datu skaitļošanas analīze ļaus mums iegūt diferencētu izteiksmi un funkcionālo analīzi. Rezultātus validēs ar in situ hibridizāciju, qRT-PCR, Western-bloot un imūncitoķīmiju, un iegūtos datus salīdzinās ar kambaru funkciju un sirds remodelāciju. Grupa jau ir ieguvusi projektu paraugus. (Latvian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Críochnaíonn céim núicléach an léirithe géine in eukaryotes, lena n-áirítear modhnuithe iar-thrascrioptúla ar mRNA agus a dhéantar a phacáistiú i ribonucleoproteins (PMRN), lena iompar chuig an gcíteaplasm tríd an bpóir núicléach chun é a aistriú ina dhiaidh sin, agus ní mór roinnt tosca a bheith ann chun é a chur i gcrích. Is é cuspóir an tionscadail cinneadh a dhéanamh maidir le sloinneadh na móilíní sin, trí sheicheamhú RNA, lena gcomhordaítear onnmhairiú RNAs chuig citoplasm i gcliseadh croí an duine (CI), amhail coimpléasc próitéine TREX (onnmhairiú tras-scríofa); Group THO, DEAD-box helicases, agus Aly adapter), an fachtóir NXF1:NXT1 (Tap:p15) agus a thionscnóir GANP, agus an Dbp5 (DDX19) a éascaíonn iompar mRNA (i bhfoirm NMR) chuig aghaidh chíteaplasmic an pore núicléach. Ina theannta sin, trí úsáid a bhaint as microarrays, déanfaimid amach léiriú RNAs beaga nach n-ionchódaíonn próitéiní (snoRNAs agus scaRNAs) agus a bhfuil ról tábhachtach acu maidir le léiriú géine a rialáil; roinneann na RNAs seo roinnt fachtóirí iompair le fachtóirí mRNA. Déanaimis comparáid idir sonraí léirithe an dá chineál RNAs sna hothair chéanna, agus cuirfimid na torthaí i gcomparáid leis na coimpléisc agus na tosca a bhaineann lena n-iompar chuig an cytoplasm. Beidh 42 sampla ventricle chlé a úsáid ó othair a bhfuil HF, de bhunadh ischemic nó dilated, a bhí ag teastáil trasphlandú croí, agus 14 d’fhág samplaí ventricle ó dhaoine sláintiúla, a fuair bás ó chúiseanna neamh-cardiac. Tabharfaidh an anailís ríomhaireachtúil ar na sonraí deis dúinn léiriú difreáilte agus anailís fheidhmiúil a fháil. Déanfar na torthaí a bhailíochtú le hibridiú in situ, qRT-PCR, blot an iarthair, agus imdhíonchitriceimic, agus cuirfear na sonraí a fhaightear i gcomparáid le feidhm ventricular agus athmhúnlú cairdiach. Tá samplaí an tionscadail faighte cheana féin ag an ngrúpa. (Irish) | |||||||||||||||
| Property / summary: Críochnaíonn céim núicléach an léirithe géine in eukaryotes, lena n-áirítear modhnuithe iar-thrascrioptúla ar mRNA agus a dhéantar a phacáistiú i ribonucleoproteins (PMRN), lena iompar chuig an gcíteaplasm tríd an bpóir núicléach chun é a aistriú ina dhiaidh sin, agus ní mór roinnt tosca a bheith ann chun é a chur i gcrích. Is é cuspóir an tionscadail cinneadh a dhéanamh maidir le sloinneadh na móilíní sin, trí sheicheamhú RNA, lena gcomhordaítear onnmhairiú RNAs chuig citoplasm i gcliseadh croí an duine (CI), amhail coimpléasc próitéine TREX (onnmhairiú tras-scríofa); Group THO, DEAD-box helicases, agus Aly adapter), an fachtóir NXF1:NXT1 (Tap:p15) agus a thionscnóir GANP, agus an Dbp5 (DDX19) a éascaíonn iompar mRNA (i bhfoirm NMR) chuig aghaidh chíteaplasmic an pore núicléach. Ina theannta sin, trí úsáid a bhaint as microarrays, déanfaimid amach léiriú RNAs beaga nach n-ionchódaíonn próitéiní (snoRNAs agus scaRNAs) agus a bhfuil ról tábhachtach acu maidir le léiriú géine a rialáil; roinneann na RNAs seo roinnt fachtóirí iompair le fachtóirí mRNA. Déanaimis comparáid idir sonraí léirithe an dá chineál RNAs sna hothair chéanna, agus cuirfimid na torthaí i gcomparáid leis na coimpléisc agus na tosca a bhaineann lena n-iompar chuig an cytoplasm. Beidh 42 sampla ventricle chlé a úsáid ó othair a bhfuil HF, de bhunadh ischemic nó dilated, a bhí ag teastáil trasphlandú croí, agus 14 d’fhág samplaí ventricle ó dhaoine sláintiúla, a fuair bás ó chúiseanna neamh-cardiac. Tabharfaidh an anailís ríomhaireachtúil ar na sonraí deis dúinn léiriú difreáilte agus anailís fheidhmiúil a fháil. Déanfar na torthaí a bhailíochtú le hibridiú in situ, qRT-PCR, blot an iarthair, agus imdhíonchitriceimic, agus cuirfear na sonraí a fhaightear i gcomparáid le feidhm ventricular agus athmhúnlú cairdiach. Tá samplaí an tionscadail faighte cheana féin ag an ngrúpa. (Irish) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Críochnaíonn céim núicléach an léirithe géine in eukaryotes, lena n-áirítear modhnuithe iar-thrascrioptúla ar mRNA agus a dhéantar a phacáistiú i ribonucleoproteins (PMRN), lena iompar chuig an gcíteaplasm tríd an bpóir núicléach chun é a aistriú ina dhiaidh sin, agus ní mór roinnt tosca a bheith ann chun é a chur i gcrích. Is é cuspóir an tionscadail cinneadh a dhéanamh maidir le sloinneadh na móilíní sin, trí sheicheamhú RNA, lena gcomhordaítear onnmhairiú RNAs chuig citoplasm i gcliseadh croí an duine (CI), amhail coimpléasc próitéine TREX (onnmhairiú tras-scríofa); Group THO, DEAD-box helicases, agus Aly adapter), an fachtóir NXF1:NXT1 (Tap:p15) agus a thionscnóir GANP, agus an Dbp5 (DDX19) a éascaíonn iompar mRNA (i bhfoirm NMR) chuig aghaidh chíteaplasmic an pore núicléach. Ina theannta sin, trí úsáid a bhaint as microarrays, déanfaimid amach léiriú RNAs beaga nach n-ionchódaíonn próitéiní (snoRNAs agus scaRNAs) agus a bhfuil ról tábhachtach acu maidir le léiriú géine a rialáil; roinneann na RNAs seo roinnt fachtóirí iompair le fachtóirí mRNA. Déanaimis comparáid idir sonraí léirithe an dá chineál RNAs sna hothair chéanna, agus cuirfimid na torthaí i gcomparáid leis na coimpléisc agus na tosca a bhaineann lena n-iompar chuig an cytoplasm. Beidh 42 sampla ventricle chlé a úsáid ó othair a bhfuil HF, de bhunadh ischemic nó dilated, a bhí ag teastáil trasphlandú croí, agus 14 d’fhág samplaí ventricle ó dhaoine sláintiúla, a fuair bás ó chúiseanna neamh-cardiac. Tabharfaidh an anailís ríomhaireachtúil ar na sonraí deis dúinn léiriú difreáilte agus anailís fheidhmiúil a fháil. Déanfar na torthaí a bhailíochtú le hibridiú in situ, qRT-PCR, blot an iarthair, agus imdhíonchitriceimic, agus cuirfear na sonraí a fhaightear i gcomparáid le feidhm ventricular agus athmhúnlú cairdiach. Tá samplaí an tionscadail faighte cheana féin ag an ngrúpa. (Irish) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Jedrska faza izražanja genov v evkariontih, vključno s posttrankripcijskimi spremembami v mRNK in pakiranimi v ribonukleoproteine (PMRN), se konča s transportom v citoplazmo skozi jedrsko poro za kasnejši prevod in zahteva prisotnost številnih dejavnikov za njeno dokončanje. Cilj projekta je določiti izražanje molekul, ki usklajujejo izvoz RNK v citoplazmo pri človeškem srčnem popuščanju (CI), kot je proteinski kompleks TREX (Transcription-export) s sekvenciranjem RNK; skupina THO, DEAD-box helicases in Aly adapter), faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) in njegov promotor GANP ter Dbp5 (DDX19), ki omogoča prevoz mRNA (v obliki NMR) na citoplazmično površino jedrske pore. Poleg tega bomo z uporabo mikroarrayjev določili izražanje majhnih RNK, ki ne kodirajo beljakovin (snoRNA in scaRNA) in imajo pomembno vlogo pri uravnavanju izražanja genov; te RNA imajo nekatere dejavnike prevoza z mRNA. Primerjajmo ekspresivne podatke obeh vrst RNA pri istih bolnikih in rezultate bomo povezali s kompleksi in dejavniki, ki so vključeni v njihov transport v citoplazmo. 42 vzorcev levega prekata se bo uporabilo pri bolnikih s HF ishemičnega ali razširjenega izvora, ki so potrebovali presaditev srca, in 14 vzorcev levega prekata pri zdravih posameznikih, ki so umrli zaradi nekardiakalnih vzrokov. Računska analiza podatkov nam bo omogočila, da dobimo diferenciran izraz in funkcionalno analizo. Rezultati bodo potrjeni s hibridizacijo in situ, qRT-PCR, Western-blot in imunocitokemijo, pridobljeni podatki pa bodo primerjani z ventrikularno funkcijo in remodeliranjem srca. Vzorce projekta je skupina že pridobila. (Slovenian) | |||||||||||||||
| Property / summary: Jedrska faza izražanja genov v evkariontih, vključno s posttrankripcijskimi spremembami v mRNK in pakiranimi v ribonukleoproteine (PMRN), se konča s transportom v citoplazmo skozi jedrsko poro za kasnejši prevod in zahteva prisotnost številnih dejavnikov za njeno dokončanje. Cilj projekta je določiti izražanje molekul, ki usklajujejo izvoz RNK v citoplazmo pri človeškem srčnem popuščanju (CI), kot je proteinski kompleks TREX (Transcription-export) s sekvenciranjem RNK; skupina THO, DEAD-box helicases in Aly adapter), faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) in njegov promotor GANP ter Dbp5 (DDX19), ki omogoča prevoz mRNA (v obliki NMR) na citoplazmično površino jedrske pore. Poleg tega bomo z uporabo mikroarrayjev določili izražanje majhnih RNK, ki ne kodirajo beljakovin (snoRNA in scaRNA) in imajo pomembno vlogo pri uravnavanju izražanja genov; te RNA imajo nekatere dejavnike prevoza z mRNA. Primerjajmo ekspresivne podatke obeh vrst RNA pri istih bolnikih in rezultate bomo povezali s kompleksi in dejavniki, ki so vključeni v njihov transport v citoplazmo. 42 vzorcev levega prekata se bo uporabilo pri bolnikih s HF ishemičnega ali razširjenega izvora, ki so potrebovali presaditev srca, in 14 vzorcev levega prekata pri zdravih posameznikih, ki so umrli zaradi nekardiakalnih vzrokov. Računska analiza podatkov nam bo omogočila, da dobimo diferenciran izraz in funkcionalno analizo. Rezultati bodo potrjeni s hibridizacijo in situ, qRT-PCR, Western-blot in imunocitokemijo, pridobljeni podatki pa bodo primerjani z ventrikularno funkcijo in remodeliranjem srca. Vzorce projekta je skupina že pridobila. (Slovenian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Jedrska faza izražanja genov v evkariontih, vključno s posttrankripcijskimi spremembami v mRNK in pakiranimi v ribonukleoproteine (PMRN), se konča s transportom v citoplazmo skozi jedrsko poro za kasnejši prevod in zahteva prisotnost številnih dejavnikov za njeno dokončanje. Cilj projekta je določiti izražanje molekul, ki usklajujejo izvoz RNK v citoplazmo pri človeškem srčnem popuščanju (CI), kot je proteinski kompleks TREX (Transcription-export) s sekvenciranjem RNK; skupina THO, DEAD-box helicases in Aly adapter), faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) in njegov promotor GANP ter Dbp5 (DDX19), ki omogoča prevoz mRNA (v obliki NMR) na citoplazmično površino jedrske pore. Poleg tega bomo z uporabo mikroarrayjev določili izražanje majhnih RNK, ki ne kodirajo beljakovin (snoRNA in scaRNA) in imajo pomembno vlogo pri uravnavanju izražanja genov; te RNA imajo nekatere dejavnike prevoza z mRNA. Primerjajmo ekspresivne podatke obeh vrst RNA pri istih bolnikih in rezultate bomo povezali s kompleksi in dejavniki, ki so vključeni v njihov transport v citoplazmo. 42 vzorcev levega prekata se bo uporabilo pri bolnikih s HF ishemičnega ali razširjenega izvora, ki so potrebovali presaditev srca, in 14 vzorcev levega prekata pri zdravih posameznikih, ki so umrli zaradi nekardiakalnih vzrokov. Računska analiza podatkov nam bo omogočila, da dobimo diferenciran izraz in funkcionalno analizo. Rezultati bodo potrjeni s hibridizacijo in situ, qRT-PCR, Western-blot in imunocitokemijo, pridobljeni podatki pa bodo primerjani z ventrikularno funkcijo in remodeliranjem srca. Vzorce projekta je skupina že pridobila. (Slovenian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Ядрената фаза на генната експресия в еукариоти, включително посттранскрипционните модификации в mRNA и опаковани в рибонуклеопротеини (PMRN), завършва с транспортирането му до цитоплазмата през ядрената пора за последващ превод и изисква наличието на редица фактори за нейното завършване. Целта на проекта е да се определи експресията чрез секвениране на РНК на тези молекули, които координират износа на РНК към цитоплазма при човешка сърдечна недостатъчност (CI), като например протеиновия комплекс TREX (Transcription-export); Group THO, DEAD-box хеликоптери и Aly адаптер), коефициент NXF1:NXT1 (Tap:p15) и неговия GANP промотор, и Dbp5 (DDX19), който улеснява транспортирането на mRNA (под формата на ЯМР) до цитоплазмената повърхност на ядрената пора. Освен това, използвайки микроскопи, ще определим експресията на малки РНК, които не кодират протеини (сноРНК и scaRNAs) и ще играят важна роля в регулирането на генната експресия; тези РНК споделят някои транспортни фактори с тези на иРНК. Нека сравним данните за израза на двата вида РНК при едни и същи пациенти и ще свържем резултатите с комплексите и факторите, участващи в транспортирането им до цитоплазмата. Ще бъдат използвани 42 проби от лявата камера от пациенти с HF, с исхемичен или разширен произход, които са изисквали сърдечна трансплантация, и 14 проби от лявата камера от здрави индивиди, починали от несърдечни причини. Изчислителният анализ на данните ще ни позволи да получим диференциран израз и функционален анализ. Резултатите ще бъдат валидирани чрез in situ хибридизация, qRT-PCR, западно-блот и имуноцитохимия, а получените данни ще бъдат сравнени с камерната функция и сърдечната ремоделация. Извадките от проекта вече са получени от групата. (Bulgarian) | |||||||||||||||
| Property / summary: Ядрената фаза на генната експресия в еукариоти, включително посттранскрипционните модификации в mRNA и опаковани в рибонуклеопротеини (PMRN), завършва с транспортирането му до цитоплазмата през ядрената пора за последващ превод и изисква наличието на редица фактори за нейното завършване. Целта на проекта е да се определи експресията чрез секвениране на РНК на тези молекули, които координират износа на РНК към цитоплазма при човешка сърдечна недостатъчност (CI), като например протеиновия комплекс TREX (Transcription-export); Group THO, DEAD-box хеликоптери и Aly адаптер), коефициент NXF1:NXT1 (Tap:p15) и неговия GANP промотор, и Dbp5 (DDX19), който улеснява транспортирането на mRNA (под формата на ЯМР) до цитоплазмената повърхност на ядрената пора. Освен това, използвайки микроскопи, ще определим експресията на малки РНК, които не кодират протеини (сноРНК и scaRNAs) и ще играят важна роля в регулирането на генната експресия; тези РНК споделят някои транспортни фактори с тези на иРНК. Нека сравним данните за израза на двата вида РНК при едни и същи пациенти и ще свържем резултатите с комплексите и факторите, участващи в транспортирането им до цитоплазмата. Ще бъдат използвани 42 проби от лявата камера от пациенти с HF, с исхемичен или разширен произход, които са изисквали сърдечна трансплантация, и 14 проби от лявата камера от здрави индивиди, починали от несърдечни причини. Изчислителният анализ на данните ще ни позволи да получим диференциран израз и функционален анализ. Резултатите ще бъдат валидирани чрез in situ хибридизация, qRT-PCR, западно-блот и имуноцитохимия, а получените данни ще бъдат сравнени с камерната функция и сърдечната ремоделация. Извадките от проекта вече са получени от групата. (Bulgarian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Ядрената фаза на генната експресия в еукариоти, включително посттранскрипционните модификации в mRNA и опаковани в рибонуклеопротеини (PMRN), завършва с транспортирането му до цитоплазмата през ядрената пора за последващ превод и изисква наличието на редица фактори за нейното завършване. Целта на проекта е да се определи експресията чрез секвениране на РНК на тези молекули, които координират износа на РНК към цитоплазма при човешка сърдечна недостатъчност (CI), като например протеиновия комплекс TREX (Transcription-export); Group THO, DEAD-box хеликоптери и Aly адаптер), коефициент NXF1:NXT1 (Tap:p15) и неговия GANP промотор, и Dbp5 (DDX19), който улеснява транспортирането на mRNA (под формата на ЯМР) до цитоплазмената повърхност на ядрената пора. Освен това, използвайки микроскопи, ще определим експресията на малки РНК, които не кодират протеини (сноРНК и scaRNAs) и ще играят важна роля в регулирането на генната експресия; тези РНК споделят някои транспортни фактори с тези на иРНК. Нека сравним данните за израза на двата вида РНК при едни и същи пациенти и ще свържем резултатите с комплексите и факторите, участващи в транспортирането им до цитоплазмата. Ще бъдат използвани 42 проби от лявата камера от пациенти с HF, с исхемичен или разширен произход, които са изисквали сърдечна трансплантация, и 14 проби от лявата камера от здрави индивиди, починали от несърдечни причини. Изчислителният анализ на данните ще ни позволи да получим диференциран израз и функционален анализ. Резултатите ще бъдат валидирани чрез in situ хибридизация, qRT-PCR, западно-блот и имуноцитохимия, а получените данни ще бъдат сравнени с камерната функция и сърдечната ремоделация. Извадките от проекта вече са получени от групата. (Bulgarian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Il-fażi nukleari tal-espressjoni tal-ġeni fl-ewkarjoti, inklużi modifiki posttraskrizzjonali f’mRNA u ppakkjati fir-ribonukleoproteini (PMRN), tispiċċa bit-trasport tagħha lejn iċ-ċitoplażma permezz tal-pori nukleari għal traduzzjoni sussegwenti, u teħtieġ il-preżenza ta’ għadd ta’ fatturi għat-tlestija tagħha. L-għan tal-proġett huwa li jiddetermina l-espressjoni, permezz ta’ sekwenzar tal-RNA, ta’ dawk il-molekuli li jikkoordinaw l-esportazzjoni tal-RNAs għaċ-ċitoplażma f’insuffiċjenza tal-qalb tal-bniedem (CI), bħall-kumpless ta’ proteini TREX (Transcription-export); grupp THO, spirali tal-kaxxa DEAD, u adapter ta’ Aly), il-fattur NXF1:NXT1 (Tap:p15) u l-promotur GANP tiegħu, u d-Dbp5 (DDX19) li jiffaċilita t-trasport ta’ mRNA (fil-forma ta’ NMR) lejn il-wiċċ ċitoplasmiku tal-pori nukleari. Barra minn hekk, bl-użu ta’ mikroarrays, aħna se niddeterminaw l-espressjoni ta’ RNAs żgħar li ma jikkodifikawx proteini (snoRNAs u scaRNAs) u għandhom rwol importanti fir-regolazzjoni tal-espressjoni tal-ġeni; dawn l-RNAs jaqsmu xi fatturi tat-trasport ma’ dawk ta’ mRNA. Ejja jqabblu d-data espressjoni taż-żewġ tipi ta ‘RNAs fl-istess pazjenti, u aħna se jirrelataw ir-riżultati mal-kumplessi u l-fatturi involuti fit-trasport tagħhom għall-ċitoplażma. 42 kampjun ta ‘ventrikolu tax- xellug se jintużaw minn pazjenti b’ HF, ta’ oriġini iskemika jew dilatata, li kienu jeħtieġu trapjant tal- qalb, u 14- il kampjun ta ‘ventrikolu tax- xellug minn individwi b’ saħħithom, li mietu minn kawżi mhux kardijaċi. L-analiżi komputazzjonali tad-data se tippermettilna niksbu espressjoni differenzjata u analiżi funzjonali. Ir-riżultati se jiġu vvalidati permezz ta’ ibridizzazzjoni in situ, qRT-PCR, Punent-blot, u immunoċitokimika, u d-dejta miksuba tiġi mqabbla mal-funzjoni ventrikulari u l-immudellar mill-ġdid tal-qalb. Il-kampjuni tal-proġetti diġà nkisbu mill-grupp. (Maltese) | |||||||||||||||
| Property / summary: Il-fażi nukleari tal-espressjoni tal-ġeni fl-ewkarjoti, inklużi modifiki posttraskrizzjonali f’mRNA u ppakkjati fir-ribonukleoproteini (PMRN), tispiċċa bit-trasport tagħha lejn iċ-ċitoplażma permezz tal-pori nukleari għal traduzzjoni sussegwenti, u teħtieġ il-preżenza ta’ għadd ta’ fatturi għat-tlestija tagħha. L-għan tal-proġett huwa li jiddetermina l-espressjoni, permezz ta’ sekwenzar tal-RNA, ta’ dawk il-molekuli li jikkoordinaw l-esportazzjoni tal-RNAs għaċ-ċitoplażma f’insuffiċjenza tal-qalb tal-bniedem (CI), bħall-kumpless ta’ proteini TREX (Transcription-export); grupp THO, spirali tal-kaxxa DEAD, u adapter ta’ Aly), il-fattur NXF1:NXT1 (Tap:p15) u l-promotur GANP tiegħu, u d-Dbp5 (DDX19) li jiffaċilita t-trasport ta’ mRNA (fil-forma ta’ NMR) lejn il-wiċċ ċitoplasmiku tal-pori nukleari. Barra minn hekk, bl-użu ta’ mikroarrays, aħna se niddeterminaw l-espressjoni ta’ RNAs żgħar li ma jikkodifikawx proteini (snoRNAs u scaRNAs) u għandhom rwol importanti fir-regolazzjoni tal-espressjoni tal-ġeni; dawn l-RNAs jaqsmu xi fatturi tat-trasport ma’ dawk ta’ mRNA. Ejja jqabblu d-data espressjoni taż-żewġ tipi ta ‘RNAs fl-istess pazjenti, u aħna se jirrelataw ir-riżultati mal-kumplessi u l-fatturi involuti fit-trasport tagħhom għall-ċitoplażma. 42 kampjun ta ‘ventrikolu tax- xellug se jintużaw minn pazjenti b’ HF, ta’ oriġini iskemika jew dilatata, li kienu jeħtieġu trapjant tal- qalb, u 14- il kampjun ta ‘ventrikolu tax- xellug minn individwi b’ saħħithom, li mietu minn kawżi mhux kardijaċi. L-analiżi komputazzjonali tad-data se tippermettilna niksbu espressjoni differenzjata u analiżi funzjonali. Ir-riżultati se jiġu vvalidati permezz ta’ ibridizzazzjoni in situ, qRT-PCR, Punent-blot, u immunoċitokimika, u d-dejta miksuba tiġi mqabbla mal-funzjoni ventrikulari u l-immudellar mill-ġdid tal-qalb. Il-kampjuni tal-proġetti diġà nkisbu mill-grupp. (Maltese) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Il-fażi nukleari tal-espressjoni tal-ġeni fl-ewkarjoti, inklużi modifiki posttraskrizzjonali f’mRNA u ppakkjati fir-ribonukleoproteini (PMRN), tispiċċa bit-trasport tagħha lejn iċ-ċitoplażma permezz tal-pori nukleari għal traduzzjoni sussegwenti, u teħtieġ il-preżenza ta’ għadd ta’ fatturi għat-tlestija tagħha. L-għan tal-proġett huwa li jiddetermina l-espressjoni, permezz ta’ sekwenzar tal-RNA, ta’ dawk il-molekuli li jikkoordinaw l-esportazzjoni tal-RNAs għaċ-ċitoplażma f’insuffiċjenza tal-qalb tal-bniedem (CI), bħall-kumpless ta’ proteini TREX (Transcription-export); grupp THO, spirali tal-kaxxa DEAD, u adapter ta’ Aly), il-fattur NXF1:NXT1 (Tap:p15) u l-promotur GANP tiegħu, u d-Dbp5 (DDX19) li jiffaċilita t-trasport ta’ mRNA (fil-forma ta’ NMR) lejn il-wiċċ ċitoplasmiku tal-pori nukleari. Barra minn hekk, bl-użu ta’ mikroarrays, aħna se niddeterminaw l-espressjoni ta’ RNAs żgħar li ma jikkodifikawx proteini (snoRNAs u scaRNAs) u għandhom rwol importanti fir-regolazzjoni tal-espressjoni tal-ġeni; dawn l-RNAs jaqsmu xi fatturi tat-trasport ma’ dawk ta’ mRNA. Ejja jqabblu d-data espressjoni taż-żewġ tipi ta ‘RNAs fl-istess pazjenti, u aħna se jirrelataw ir-riżultati mal-kumplessi u l-fatturi involuti fit-trasport tagħhom għall-ċitoplażma. 42 kampjun ta ‘ventrikolu tax- xellug se jintużaw minn pazjenti b’ HF, ta’ oriġini iskemika jew dilatata, li kienu jeħtieġu trapjant tal- qalb, u 14- il kampjun ta ‘ventrikolu tax- xellug minn individwi b’ saħħithom, li mietu minn kawżi mhux kardijaċi. L-analiżi komputazzjonali tad-data se tippermettilna niksbu espressjoni differenzjata u analiżi funzjonali. Ir-riżultati se jiġu vvalidati permezz ta’ ibridizzazzjoni in situ, qRT-PCR, Punent-blot, u immunoċitokimika, u d-dejta miksuba tiġi mqabbla mal-funzjoni ventrikulari u l-immudellar mill-ġdid tal-qalb. Il-kampjuni tal-proġetti diġà nkisbu mill-grupp. (Maltese) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
A fase nuclear da expressão genética em eucariotas, incluindo modificações pós-transcricionais em ARNm e embalados em ribonucleoproteínas (PMRN), termina com o seu transporte para o citoplasma através do poro nuclear para posterior tradução, e requer a presença de uma série de factores para a sua conclusão. O objetivo do projeto é determinar a expressão, por sequenciação de ARN, das moléculas que coordenam a exportação de ARN para o citoplasma na insuficiência cardíaca humana (IC), como o complexo proteico TREX (Transcription-export); grupo THO, helicases DEAD-box e adaptador Aly), o fator NXF1:NXT1 (Tap:p15) e seu promotor GANP, e o Dbp5 (DDX19) que facilita o transporte de mRNA (sob a forma de uma RMN) para a face citoplasmática do poro nuclear. Além disso, utilizando microarrays, determinaremos a expressão de pequenos ARN que não codificam proteínas (snoRNAs e scaRNAs) e desempenham um papel importante na regulação da expressão genética; estes ARN partilham alguns factores de transporte com os do ARNm. Comparemos os dados de expressão de ambos os tipos de ARN nos mesmos doentes e relacionaremos os resultados com os complexos e fatores envolvidos no seu transporte para o citoplasma. Serão utilizadas 42 amostras de ventrículo esquerdo de pacientes com IC, de origem isquémica ou dilatada, que necessitaram de transplante cardíaco, e 14 amostras de ventrículo esquerdo de indivíduos saudáveis, que morreram por causas não cardíacas. A análise computacional dos dados permitir-nos-á obter expressão diferenciada e análise funcional. Os resultados serão validados por hibridação in situ, qRT-PCR, western-blot e imunocitoquímica, e os dados obtidos serão comparados com a função ventricular e o remodelamento cardíaco. As amostras do projeto já foram obtidas pelo grupo. (Portuguese) | |||||||||||||||
| Property / summary: A fase nuclear da expressão genética em eucariotas, incluindo modificações pós-transcricionais em ARNm e embalados em ribonucleoproteínas (PMRN), termina com o seu transporte para o citoplasma através do poro nuclear para posterior tradução, e requer a presença de uma série de factores para a sua conclusão. O objetivo do projeto é determinar a expressão, por sequenciação de ARN, das moléculas que coordenam a exportação de ARN para o citoplasma na insuficiência cardíaca humana (IC), como o complexo proteico TREX (Transcription-export); grupo THO, helicases DEAD-box e adaptador Aly), o fator NXF1:NXT1 (Tap:p15) e seu promotor GANP, e o Dbp5 (DDX19) que facilita o transporte de mRNA (sob a forma de uma RMN) para a face citoplasmática do poro nuclear. Além disso, utilizando microarrays, determinaremos a expressão de pequenos ARN que não codificam proteínas (snoRNAs e scaRNAs) e desempenham um papel importante na regulação da expressão genética; estes ARN partilham alguns factores de transporte com os do ARNm. Comparemos os dados de expressão de ambos os tipos de ARN nos mesmos doentes e relacionaremos os resultados com os complexos e fatores envolvidos no seu transporte para o citoplasma. Serão utilizadas 42 amostras de ventrículo esquerdo de pacientes com IC, de origem isquémica ou dilatada, que necessitaram de transplante cardíaco, e 14 amostras de ventrículo esquerdo de indivíduos saudáveis, que morreram por causas não cardíacas. A análise computacional dos dados permitir-nos-á obter expressão diferenciada e análise funcional. Os resultados serão validados por hibridação in situ, qRT-PCR, western-blot e imunocitoquímica, e os dados obtidos serão comparados com a função ventricular e o remodelamento cardíaco. As amostras do projeto já foram obtidas pelo grupo. (Portuguese) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: A fase nuclear da expressão genética em eucariotas, incluindo modificações pós-transcricionais em ARNm e embalados em ribonucleoproteínas (PMRN), termina com o seu transporte para o citoplasma através do poro nuclear para posterior tradução, e requer a presença de uma série de factores para a sua conclusão. O objetivo do projeto é determinar a expressão, por sequenciação de ARN, das moléculas que coordenam a exportação de ARN para o citoplasma na insuficiência cardíaca humana (IC), como o complexo proteico TREX (Transcription-export); grupo THO, helicases DEAD-box e adaptador Aly), o fator NXF1:NXT1 (Tap:p15) e seu promotor GANP, e o Dbp5 (DDX19) que facilita o transporte de mRNA (sob a forma de uma RMN) para a face citoplasmática do poro nuclear. Além disso, utilizando microarrays, determinaremos a expressão de pequenos ARN que não codificam proteínas (snoRNAs e scaRNAs) e desempenham um papel importante na regulação da expressão genética; estes ARN partilham alguns factores de transporte com os do ARNm. Comparemos os dados de expressão de ambos os tipos de ARN nos mesmos doentes e relacionaremos os resultados com os complexos e fatores envolvidos no seu transporte para o citoplasma. Serão utilizadas 42 amostras de ventrículo esquerdo de pacientes com IC, de origem isquémica ou dilatada, que necessitaram de transplante cardíaco, e 14 amostras de ventrículo esquerdo de indivíduos saudáveis, que morreram por causas não cardíacas. A análise computacional dos dados permitir-nos-á obter expressão diferenciada e análise funcional. Os resultados serão validados por hibridação in situ, qRT-PCR, western-blot e imunocitoquímica, e os dados obtidos serão comparados com a função ventricular e o remodelamento cardíaco. As amostras do projeto já foram obtidas pelo grupo. (Portuguese) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Den nukleare fase af genekspression i eukaryoter, herunder post-transkriptionelle modifikationer i mRNA og pakket i ribonucleoproteiner (PMRN), slutter med dets transport til cytoplasmen gennem den nukleare pore med henblik på efterfølgende oversættelse, og kræver tilstedeværelsen af en række faktorer for dens færdiggørelse. Formålet med projektet er at bestemme udtrykket ved RNA-sekventering af de molekyler, der koordinerer eksporten af RNA'er til cytoplasm ved humant hjertesvigt (CI), såsom TREX-proteinkomplekset (Transcription-export) gruppe THO, DEAD-box helicases og Aly adapter), NXF1:NXT1 faktor (Tap:p15) og dens GANP-promotor og Dbp5 (DDX19), der letter transporten af mRNA (i form af en NMR) til den cytoplasmiske overflade af den nukleare pore. Derudover vil vi ved hjælp af mikroarrays bestemme forekomsten af små RNA'er, der ikke koder proteiner (snoRNA'er og scaRNA'er) og spiller en vigtig rolle i reguleringen af genekspression. disse RNA'er deler visse transportfaktorer med mRNA's. Lad os sammenligne ekspressionsdata for begge typer af RNA'er hos de samme patienter, og vi vil relatere resultaterne til de komplekser og faktorer, der er involveret i deres transport, til cytoplasmen. 42 venstre ventrikelprøver vil blive brugt fra patienter med HF, af iskæmisk eller dilateret oprindelse, som krævede en hjertetransplantation, og 14 venstre ventrikel prøver fra raske individer, der døde af ikke- kardiale årsager. Den beregningsmæssige analyse af dataene vil give os mulighed for at opnå differentieret udtryk og funktionel analyse. Resultaterne vil blive valideret ved in situ hybridisering, qRT-PCR, Western-blot og immunocytochemistry, og de opnåede data vil blive sammenlignet med ventrikulær funktion og hjerte remodeling. Projektprøverne er allerede indhentet af gruppen. (Danish) | |||||||||||||||
| Property / summary: Den nukleare fase af genekspression i eukaryoter, herunder post-transkriptionelle modifikationer i mRNA og pakket i ribonucleoproteiner (PMRN), slutter med dets transport til cytoplasmen gennem den nukleare pore med henblik på efterfølgende oversættelse, og kræver tilstedeværelsen af en række faktorer for dens færdiggørelse. Formålet med projektet er at bestemme udtrykket ved RNA-sekventering af de molekyler, der koordinerer eksporten af RNA'er til cytoplasm ved humant hjertesvigt (CI), såsom TREX-proteinkomplekset (Transcription-export) gruppe THO, DEAD-box helicases og Aly adapter), NXF1:NXT1 faktor (Tap:p15) og dens GANP-promotor og Dbp5 (DDX19), der letter transporten af mRNA (i form af en NMR) til den cytoplasmiske overflade af den nukleare pore. Derudover vil vi ved hjælp af mikroarrays bestemme forekomsten af små RNA'er, der ikke koder proteiner (snoRNA'er og scaRNA'er) og spiller en vigtig rolle i reguleringen af genekspression. disse RNA'er deler visse transportfaktorer med mRNA's. Lad os sammenligne ekspressionsdata for begge typer af RNA'er hos de samme patienter, og vi vil relatere resultaterne til de komplekser og faktorer, der er involveret i deres transport, til cytoplasmen. 42 venstre ventrikelprøver vil blive brugt fra patienter med HF, af iskæmisk eller dilateret oprindelse, som krævede en hjertetransplantation, og 14 venstre ventrikel prøver fra raske individer, der døde af ikke- kardiale årsager. Den beregningsmæssige analyse af dataene vil give os mulighed for at opnå differentieret udtryk og funktionel analyse. Resultaterne vil blive valideret ved in situ hybridisering, qRT-PCR, Western-blot og immunocytochemistry, og de opnåede data vil blive sammenlignet med ventrikulær funktion og hjerte remodeling. Projektprøverne er allerede indhentet af gruppen. (Danish) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Den nukleare fase af genekspression i eukaryoter, herunder post-transkriptionelle modifikationer i mRNA og pakket i ribonucleoproteiner (PMRN), slutter med dets transport til cytoplasmen gennem den nukleare pore med henblik på efterfølgende oversættelse, og kræver tilstedeværelsen af en række faktorer for dens færdiggørelse. Formålet med projektet er at bestemme udtrykket ved RNA-sekventering af de molekyler, der koordinerer eksporten af RNA'er til cytoplasm ved humant hjertesvigt (CI), såsom TREX-proteinkomplekset (Transcription-export) gruppe THO, DEAD-box helicases og Aly adapter), NXF1:NXT1 faktor (Tap:p15) og dens GANP-promotor og Dbp5 (DDX19), der letter transporten af mRNA (i form af en NMR) til den cytoplasmiske overflade af den nukleare pore. Derudover vil vi ved hjælp af mikroarrays bestemme forekomsten af små RNA'er, der ikke koder proteiner (snoRNA'er og scaRNA'er) og spiller en vigtig rolle i reguleringen af genekspression. disse RNA'er deler visse transportfaktorer med mRNA's. Lad os sammenligne ekspressionsdata for begge typer af RNA'er hos de samme patienter, og vi vil relatere resultaterne til de komplekser og faktorer, der er involveret i deres transport, til cytoplasmen. 42 venstre ventrikelprøver vil blive brugt fra patienter med HF, af iskæmisk eller dilateret oprindelse, som krævede en hjertetransplantation, og 14 venstre ventrikel prøver fra raske individer, der døde af ikke- kardiale årsager. Den beregningsmæssige analyse af dataene vil give os mulighed for at opnå differentieret udtryk og funktionel analyse. Resultaterne vil blive valideret ved in situ hybridisering, qRT-PCR, Western-blot og immunocytochemistry, og de opnåede data vil blive sammenlignet med ventrikulær funktion og hjerte remodeling. Projektprøverne er allerede indhentet af gruppen. (Danish) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Faza nucleară a expresiei genelor în eucariote, inclusiv modificările post-transcriptionale ale ARNm și ambalate în ribonucleoproteine (PMRN), se termină cu transportul către citoplasmă prin porul nuclear pentru traducerea ulterioară și necesită prezența unui număr de factori pentru finalizarea acesteia. Obiectivul proiectului este de a determina expresia, prin secvențierea ARN, a moleculelor care coordonează exportul de ARN în citoplasmă în insuficiența cardiacă umană (CI), cum ar fi complexul proteic TREX (Transcription-export); grup THO, DEAD-box helicase și Aly adaptor), factorul NXF1:NXT1 (Tap:p15) și promotorul GANP al acestuia și Dbp5 (DDX19) care facilitează transportul de ARNm (sub formă de RMN) pe fața citoplasmică a porilor nucleari. În plus, folosind microarray-uri, vom determina expresia ARN-urilor mici care nu codifică proteinele (snoRNA și scaRNA) și joacă un rol important în reglarea expresiei genetice; aceste ARN au în comun anumiți factori de transport cu cei ai ARNm. Să comparăm datele de expresie ale ambelor tipuri de ARN la aceiași pacienți și vom raporta rezultatele la complexele și factorii implicați în transportul lor la citoplasmă. 42 de probe de ventricul stâng vor fi utilizate de la pacienți cu HF, de origine ischemică sau dilatată, care au necesitat un transplant de inimă și 14 probe de ventricul stâng de la persoane sănătoase, care au murit din cauze non-cardiace. Analiza computațională a datelor ne va permite să obținem o expresie diferențiată și o analiză funcțională. Rezultatele vor fi validate prin hibridizare in situ, qRT-PCR, vest-blot și imunocitochimie, iar datele obținute vor fi comparate cu funcția ventriculară și remodelarea cardiacă. Eșantioanele proiectului au fost deja obținute de grup. (Romanian) | |||||||||||||||
| Property / summary: Faza nucleară a expresiei genelor în eucariote, inclusiv modificările post-transcriptionale ale ARNm și ambalate în ribonucleoproteine (PMRN), se termină cu transportul către citoplasmă prin porul nuclear pentru traducerea ulterioară și necesită prezența unui număr de factori pentru finalizarea acesteia. Obiectivul proiectului este de a determina expresia, prin secvențierea ARN, a moleculelor care coordonează exportul de ARN în citoplasmă în insuficiența cardiacă umană (CI), cum ar fi complexul proteic TREX (Transcription-export); grup THO, DEAD-box helicase și Aly adaptor), factorul NXF1:NXT1 (Tap:p15) și promotorul GANP al acestuia și Dbp5 (DDX19) care facilitează transportul de ARNm (sub formă de RMN) pe fața citoplasmică a porilor nucleari. În plus, folosind microarray-uri, vom determina expresia ARN-urilor mici care nu codifică proteinele (snoRNA și scaRNA) și joacă un rol important în reglarea expresiei genetice; aceste ARN au în comun anumiți factori de transport cu cei ai ARNm. Să comparăm datele de expresie ale ambelor tipuri de ARN la aceiași pacienți și vom raporta rezultatele la complexele și factorii implicați în transportul lor la citoplasmă. 42 de probe de ventricul stâng vor fi utilizate de la pacienți cu HF, de origine ischemică sau dilatată, care au necesitat un transplant de inimă și 14 probe de ventricul stâng de la persoane sănătoase, care au murit din cauze non-cardiace. Analiza computațională a datelor ne va permite să obținem o expresie diferențiată și o analiză funcțională. Rezultatele vor fi validate prin hibridizare in situ, qRT-PCR, vest-blot și imunocitochimie, iar datele obținute vor fi comparate cu funcția ventriculară și remodelarea cardiacă. Eșantioanele proiectului au fost deja obținute de grup. (Romanian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Faza nucleară a expresiei genelor în eucariote, inclusiv modificările post-transcriptionale ale ARNm și ambalate în ribonucleoproteine (PMRN), se termină cu transportul către citoplasmă prin porul nuclear pentru traducerea ulterioară și necesită prezența unui număr de factori pentru finalizarea acesteia. Obiectivul proiectului este de a determina expresia, prin secvențierea ARN, a moleculelor care coordonează exportul de ARN în citoplasmă în insuficiența cardiacă umană (CI), cum ar fi complexul proteic TREX (Transcription-export); grup THO, DEAD-box helicase și Aly adaptor), factorul NXF1:NXT1 (Tap:p15) și promotorul GANP al acestuia și Dbp5 (DDX19) care facilitează transportul de ARNm (sub formă de RMN) pe fața citoplasmică a porilor nucleari. În plus, folosind microarray-uri, vom determina expresia ARN-urilor mici care nu codifică proteinele (snoRNA și scaRNA) și joacă un rol important în reglarea expresiei genetice; aceste ARN au în comun anumiți factori de transport cu cei ai ARNm. Să comparăm datele de expresie ale ambelor tipuri de ARN la aceiași pacienți și vom raporta rezultatele la complexele și factorii implicați în transportul lor la citoplasmă. 42 de probe de ventricul stâng vor fi utilizate de la pacienți cu HF, de origine ischemică sau dilatată, care au necesitat un transplant de inimă și 14 probe de ventricul stâng de la persoane sănătoase, care au murit din cauze non-cardiace. Analiza computațională a datelor ne va permite să obținem o expresie diferențiată și o analiză funcțională. Rezultatele vor fi validate prin hibridizare in situ, qRT-PCR, vest-blot și imunocitochimie, iar datele obținute vor fi comparate cu funcția ventriculară și remodelarea cardiacă. Eșantioanele proiectului au fost deja obținute de grup. (Romanian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
Den nukleära fasen av genuttryck i eukaryoter, inklusive post-transkriptionella modifieringar i mRNA och förpackade i ribonucleoproteiner (PMRN), slutar med dess transport till cytoplasman genom kärnporn för efterföljande översättning, och kräver närvaro av ett antal faktorer för dess slutförande. Syftet med projektet är att fastställa RNA-sekvenseringens uttryck för de molekyler som samordnar exporten av RNA till cytoplasma i human hjärtsvikt (CI), t.ex. proteinkomplexet TREX (Transcription-export). grupp THO, DEAD-box helicases, och Aly adapter, NXF1:NXT1 faktorn (Tap:p15) och dess GANP promotor, och Dbp5 (DDX19) som underlättar transport av mRNA (i form av en NMR) till cytoplasma ansiktet av kärnpor. Dessutom, med hjälp av mikroarrayer, kommer vi att bestämma uttrycket för små RNA som inte kodar proteiner (snoRNAs och scaRNAs) och spelar en viktig roll i regleringen av genuttryck; dessa RNA delar vissa transportfaktorer med mRNA. Låt oss jämföra uttrycksdata för båda typerna av RNA hos samma patienter, och vi kommer att relatera resultaten till de komplex och faktorer som är involverade i deras transport till cytoplasman. 42 vänsterkammarprover kommer att användas från patienter med HF, av ischemiskt eller dilaterat ursprung, som krävde en hjärttransplantation, och 14 vänsterkammarprov från friska individer som dog av icke-kardiella orsaker. Den beräkningsanalys av data kommer att göra det möjligt för oss att få differentierat uttryck och funktionell analys. Resultaten kommer att valideras genom in situ-hybridisering, qRT-PCR, Western-blot och immunocytochemistry, och de data som erhålls kommer att jämföras med ventrikulär funktion och hjärtremodeling. Projekturvalen har redan erhållits av gruppen. (Swedish) | |||||||||||||||
| Property / summary: Den nukleära fasen av genuttryck i eukaryoter, inklusive post-transkriptionella modifieringar i mRNA och förpackade i ribonucleoproteiner (PMRN), slutar med dess transport till cytoplasman genom kärnporn för efterföljande översättning, och kräver närvaro av ett antal faktorer för dess slutförande. Syftet med projektet är att fastställa RNA-sekvenseringens uttryck för de molekyler som samordnar exporten av RNA till cytoplasma i human hjärtsvikt (CI), t.ex. proteinkomplexet TREX (Transcription-export). grupp THO, DEAD-box helicases, och Aly adapter, NXF1:NXT1 faktorn (Tap:p15) och dess GANP promotor, och Dbp5 (DDX19) som underlättar transport av mRNA (i form av en NMR) till cytoplasma ansiktet av kärnpor. Dessutom, med hjälp av mikroarrayer, kommer vi att bestämma uttrycket för små RNA som inte kodar proteiner (snoRNAs och scaRNAs) och spelar en viktig roll i regleringen av genuttryck; dessa RNA delar vissa transportfaktorer med mRNA. Låt oss jämföra uttrycksdata för båda typerna av RNA hos samma patienter, och vi kommer att relatera resultaten till de komplex och faktorer som är involverade i deras transport till cytoplasman. 42 vänsterkammarprover kommer att användas från patienter med HF, av ischemiskt eller dilaterat ursprung, som krävde en hjärttransplantation, och 14 vänsterkammarprov från friska individer som dog av icke-kardiella orsaker. Den beräkningsanalys av data kommer att göra det möjligt för oss att få differentierat uttryck och funktionell analys. Resultaten kommer att valideras genom in situ-hybridisering, qRT-PCR, Western-blot och immunocytochemistry, och de data som erhålls kommer att jämföras med ventrikulär funktion och hjärtremodeling. Projekturvalen har redan erhållits av gruppen. (Swedish) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Den nukleära fasen av genuttryck i eukaryoter, inklusive post-transkriptionella modifieringar i mRNA och förpackade i ribonucleoproteiner (PMRN), slutar med dess transport till cytoplasman genom kärnporn för efterföljande översättning, och kräver närvaro av ett antal faktorer för dess slutförande. Syftet med projektet är att fastställa RNA-sekvenseringens uttryck för de molekyler som samordnar exporten av RNA till cytoplasma i human hjärtsvikt (CI), t.ex. proteinkomplexet TREX (Transcription-export). grupp THO, DEAD-box helicases, och Aly adapter, NXF1:NXT1 faktorn (Tap:p15) och dess GANP promotor, och Dbp5 (DDX19) som underlättar transport av mRNA (i form av en NMR) till cytoplasma ansiktet av kärnpor. Dessutom, med hjälp av mikroarrayer, kommer vi att bestämma uttrycket för små RNA som inte kodar proteiner (snoRNAs och scaRNAs) och spelar en viktig roll i regleringen av genuttryck; dessa RNA delar vissa transportfaktorer med mRNA. Låt oss jämföra uttrycksdata för båda typerna av RNA hos samma patienter, och vi kommer att relatera resultaten till de komplex och faktorer som är involverade i deras transport till cytoplasman. 42 vänsterkammarprover kommer att användas från patienter med HF, av ischemiskt eller dilaterat ursprung, som krävde en hjärttransplantation, och 14 vänsterkammarprov från friska individer som dog av icke-kardiella orsaker. Den beräkningsanalys av data kommer att göra det möjligt för oss att få differentierat uttryck och funktionell analys. Resultaten kommer att valideras genom in situ-hybridisering, qRT-PCR, Western-blot och immunocytochemistry, och de data som erhålls kommer att jämföras med ventrikulär funktion och hjärtremodeling. Projekturvalen har redan erhållits av gruppen. (Swedish) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / location (string) | |||||||||||||||
Valencia | |||||||||||||||
| Property / location (string): Valencia / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / coordinate location | |||||||||||||||
39°28'10.96"N, 0°22'34.82"W
| |||||||||||||||
| Property / coordinate location: 39°28'10.96"N, 0°22'34.82"W / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / coordinate location: 39°28'10.96"N, 0°22'34.82"W / qualifier | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS: Province of Valencia / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / budget | |||||||||||||||
63,000.0 Euro
| |||||||||||||||
| Property / budget: 63,000.0 Euro / rank | |||||||||||||||
Preferred rank | |||||||||||||||
| Property / EU contribution | |||||||||||||||
34,303.5 Euro
| |||||||||||||||
| Property / EU contribution: 34,303.5 Euro / rank | |||||||||||||||
Preferred rank | |||||||||||||||
| Property / co-financing rate | |||||||||||||||
54.45 percent
| |||||||||||||||
| Property / co-financing rate: 54.45 percent / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / date of last update | |||||||||||||||
20 December 2023
| |||||||||||||||
| Property / date of last update: 20 December 2023 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Latest revision as of 22:44, 9 October 2024
Project Q3137984 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Influence of heart failure on the factors involved in nucleocytoplasmic transport of RNAs and its relationship to ventricular function. |
Project Q3137984 in Spain |
Statements
34,303.5 Euro
0 references
63,000.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2018
0 references
31 March 2021
0 references
FUNDACION PARA LA INVESTIGACION DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO Y POLITECNICO LA FE DE LA CV. INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA LA FE
0 references
La fase nuclear de la expresión génica en eucariotas, incluyendo modificaciones postranscripcionales en ARNm y empaquetado en ribonucleoproteínas (RNPm), finaliza con su transporte al citoplasma a través del poro nuclear para su posterior traducción, y requiere la presencia de una serie de factores para su finalización. El objetivo del proyecto es determinar la expresión, mediante secuenciación ARN, de aquellas moléculas que coordinan la exportación de ARNs al citoplasma en la insuficiencia cardíaca (IC) humana, como el complejo proteico TREX (Transcription-export; grupo THO, DEAD-box helicasas, y adaptador Aly), el factor NXF1:NXT1 (Tap:p15) y su promotor GANP, y la Dbp5 (DDX19) que facilita el transporte de ARNm (en forma de RNPm) hacia la cara citoplasmática del poro nuclear. Además, mediante microarrays, determinaremos la expresión de ARNs de pequeño tamaño que no codifican proteínas (snoRNAs y scaRNAs) y representan un papel importante en la regulación de la expresión génica; estos ARNs comparten algunos factores de transporte con los de ARNm. Comparemos los datos de expresión de ambos tipos de ARNs en los mismos pacientes, y relacionaremos los resultados con los complejos y factores implicados en su transporte al citoplasma. Se utilizarán 42 muestras de ventrículo izquierdo de pacientes con IC, de origen isquémico y/o dilatado, que requirieron un trasplante cardíaco, y 14 muestras de ventrículo izquierdo de individuos sanos, que fallecieron por causas no cardíacas. El análisis computacional de los datos nos permitirá obtener la expresión diferenciada y su análisis funcional. Los resultados serán validados por hibridación in situ, qRT-PCR, western-blot, e inmunocitoquímica, y los datos obtenidos se compararán con la función ventricular y el remodelado cardiaco. Las muestras de proyecto ya se han obtenido por el grupo. (Spanish)
0 references
The nuclear phase of gene expression in eukaryotes, including post-transcriptional modifications in mRNA and packaged in ribonucleoproteins (PMRN), ends with its transport to the cytoplasm through the nuclear pore for subsequent translation, and requires the presence of a number of factors for its completion. The objective of the project is to determine the expression, by RNA sequencing, of those molecules that coordinate the export of RNAs to cytoplasm in human heart failure (CI), such as the TREX (Transcription-export) protein complex; group THO, DEAD-box helicases, and Aly adapter), the NXF1:NXT1 factor (Tap:p15) and its GANP promoter, and the Dbp5 (DDX19) that facilitates the transport of mRNA (in the form of a NMR) to the cytoplasmic face of the nuclear pore. In addition, using microarrays, we will determine the expression of small RNAs that do not encode proteins (snoRNAs and scaRNAs) and play an important role in regulating gene expression; these RNAs share some transport factors with those of mRNA. Let’s compare the expression data of both types of RNAs in the same patients, and we will relate the results to the complexes and factors involved in their transport to the cytoplasm. 42 left ventricle samples will be used from patients with HF, of ischemic or dilated origin, who required a heart transplant, and 14 left ventricle samples from healthy individuals, who died from non-cardiac causes. The computational analysis of the data will allow us to obtain differentiated expression and functional analysis. The results will be validated by in situ hybridisation, qRT-PCR, western-blot, and immunocytochemistry, and the data obtained will be compared with ventricular function and cardiac remodeling. The project samples have already been obtained by the group. (English)
12 October 2021
0.2545147828615033
0 references
La phase nucléaire de l’expression génique chez les eucaryotes, y compris les modifications post-transcriptionnelles de l’ARNm et conditionnées dans les ribonucléoprotéines (PMRN), se termine par son transport vers le cytoplasme à travers le pore nucléaire pour traduction ultérieure, et nécessite la présence d’un certain nombre de facteurs pour son achèvement. L’objectif du projet est de déterminer l’expression, par séquençage de l’ARN, des molécules qui coordonnent l’exportation d’ARN vers le cytoplasme dans l’insuffisance cardiaque humaine (IC), comme le complexe protéique TREX (Transcription-export); le groupe THO, les hélicases DEAD-box et l’adaptateur Aly), le facteur NXF1:NXT1 (Tap:p15) et son promoteur GANP, et le Dbp5 (DDX19) qui facilite le transport de l’ARNm (sous la forme d’une RMN) vers le visage cytoplasmique du porre nucléaire. En outre, en utilisant des microréseaux, nous déterminerons l’expression de petits ARN qui ne codent pas les protéines (snoRNAs et scaRNAs) et joueront un rôle important dans la régulation de l’expression des gènes; ces ARN partagent certains facteurs de transport avec ceux de l’ARNm. Comparons les données d’expression des deux types d’ARN chez les mêmes patients, et nous allons relier les résultats aux complexes et aux facteurs impliqués dans leur transport vers le cytoplasme. 42 échantillons de ventricule gauche seront utilisés chez des patients atteints de FH, d’origine ischémique ou dilatée, qui ont besoin d’une greffe cardiaque, et 14 échantillons de ventricule gauche provenant d’individus sains qui sont morts de causes non cardiaques. L’analyse computationnelle des données nous permettra d’obtenir une expression différenciée et une analyse fonctionnelle. Les résultats seront validés par hybridation in situ, qRT-PCR, Western-blot et immunocytochimie, et les données obtenues seront comparées à la fonction ventriculaire et au remodelage cardiaque. Les échantillons du projet ont déjà été obtenus par le groupe. (French)
2 December 2021
0 references
Die Kernphase der Genexpression in Eukaryotes, einschließlich post-transkriptiver Modifikationen in mRNA und verpackt in Ribofukleoproteinen (PMRN), endet mit dem Transport zum Zytoplasma durch die Kernpore für die anschließende Übersetzung und erfordert das Vorhandensein einer Reihe von Faktoren für dessen Fertigstellung. Ziel des Projekts ist es, durch RNA-Sequenzierung den Ausdruck jener Moleküle zu bestimmen, die den Export von RNAs in Zytoplasma bei Herzinsuffizienz beim Menschen koordinieren, wie z. B. den TREX-Proteinkomplex TREX (Transcription-Export). Gruppe THO, DEAD-Box-Helicases und Aly-Adapter), der Faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) und sein GANP-Promotor und die Dbp5 (DDX19), die den Transport von mRNA (in Form eines NMR) zur zytoplasmischen Oberfläche der Kernpore erleichtert. Darüber hinaus werden wir mit Microarrays die Expression kleiner RNAs bestimmen, die keine Proteine (snoRNAs und scaRNAs) kodieren und eine wichtige Rolle bei der Regulierung der Genexpression spielen; diese RNAs teilen einige Transportfaktoren mit denen von mRNA. Lassen Sie uns die Expressionsdaten beider Arten von RNAs bei denselben Patienten vergleichen, und wir werden die Ergebnisse mit den Komplexen und Faktoren in Verbindung bringen, die an ihrem Transport zum Zytoplasma beteiligt sind. 42 linke Ventrikelproben werden von Patienten mit HF, ischämischem oder dilatiertem Ursprung, die eine Herztransplantation erforderten, und 14 linke Ventrikelproben von gesunden Personen, die an nicht kardialen Ursachen starben, angewendet. Die Rechenanalyse der Daten ermöglicht es uns, differenzierte Ausdrucks- und Funktionsanalysen zu erhalten. Die Ergebnisse werden durch In-situ-Hybridisierung, qRT-PCR, Westernblot und Immunozytochemie validiert, und die gewonnenen Daten werden mit ventrikulärer Funktion und Herzumgestaltung verglichen. Die Projektproben wurden bereits von der Gruppe gewonnen. (German)
9 December 2021
0 references
De nucleaire fase van genexpressie in eukaryotes, met inbegrip van post-transcriptionele modificaties in mRNA en verpakt in ribonucleoproteïnen (PMRN), eindigt met zijn transport naar het cytoplasma door de nucleaire porie voor latere vertaling, en vereist de aanwezigheid van een aantal factoren voor de voltooiing ervan. Het doel van het project is het bepalen van de expressie, door RNA sequencing, van die moleculen die de uitvoer van RNA’s naar cytoplasma bij menselijk hartfalen (CI) coördineren, zoals het TREX (Transcription-export) eiwitcomplex; groep THO, DEAD-box helicases en Aly adapter), de NXF1:NXT1 factor (Tap:p15) en de GANP promotor, en de Dbp5 (DDX19) die het transport van mRNA (in de vorm van een NMR) naar het cytoplasma van de nucleaire porie vergemakkelijkt. Daarnaast zullen we met behulp van microarrays de expressie van kleine RNA’s bepalen die geen eiwitten (snoRNAs en scaRNAs) coderen en een belangrijke rol spelen bij het reguleren van genexpressie; deze RNAs delen sommige vervoersfactoren met die van mRNA. Laten we de expressiegegevens van beide soorten RNA’s in dezelfde patiënten vergelijken, en we zullen de resultaten koppelen aan de complexen en factoren die betrokken zijn bij hun transport naar het cytoplasma. 42 linker ventrikelmonsters zullen worden gebruikt van patiënten met HF, van ischemische of verwijde oorsprong, die een harttransplantatie nodig hadden, en 14 linker ventrikelmonsters van gezonde personen, die aan niet-cardiale oorzaken stierven. De computationele analyse van de gegevens zal ons in staat stellen om gedifferentieerde expressie en functionele analyse te verkrijgen. De resultaten worden gevalideerd door in situ hybridisatie, qRT-PCR, western-blot, en immunocytochemie, en de verkregen gegevens zullen worden vergeleken met ventriculaire functie en cardiale remodellering. De projectmonsters zijn reeds door de groep verkregen. (Dutch)
17 December 2021
0 references
La fase nucleare dell'espressione genica negli eucarioti, comprese le modifiche post-transcriptional nel mRNA e confezionate in ribonucleoproteine (PMRN), termina con il suo trasporto al citoplasma attraverso il poro nucleare per la successiva traduzione, e richiede la presenza di una serie di fattori per il suo completamento. L'obiettivo del progetto è determinare l'espressione, mediante sequenziamento dell'RNA, di quelle molecole che coordinano l'esportazione di RNA al citoplasma nell'insufficienza cardiaca umana (CI), come il complesso proteico TREX (Transcription-export); gruppo THO, elicasi DEAD-box e adattatore Aly), il fattore NXF1:NXT1 (Tap:p15) e il suo promotore GANP, e il Dbp5 (DDX19) che facilita il trasporto di mRNA (sotto forma di NMR) alla faccia citoplasmica del poro nucleare. Inoltre, utilizzando i microarray, determineremo l'espressione di piccoli RNA che non codificano le proteine (snoRNAs e scaRNAs) e svolgeranno un ruolo importante nella regolazione dell'espressione genica; questi RNA condividono alcuni fattori di trasporto con quelli di mRNA. Confrontiamo i dati espressivi di entrambi i tipi di RNA negli stessi pazienti, e metteremo in relazione i risultati con i complessi e i fattori coinvolti nel loro trasporto al citoplasma. 42 campioni di ventricolo sinistro saranno utilizzati da pazienti con HF, di origine ischemica o dilatata, che hanno richiesto un trapianto di cuore, e 14 campioni di ventricolo sinistro da individui sani, morti per cause non cardiache. L'analisi computazionale dei dati ci permetterà di ottenere l'espressione differenziata e l'analisi funzionale. I risultati saranno convalidati mediante ibridazione in situ, qRT-PCR, western-blot e immunocitochimica, e i dati ottenuti saranno confrontati con la funzione ventricolare e il rimodellamento cardiaco. I campioni di progetto sono già stati ottenuti dal gruppo. (Italian)
16 January 2022
0 references
Geeni ekspressiooni tuumafaas eukarüootides, sealhulgas transkriptsioonijärgsed modifikatsioonid mRNAs ja pakendatud ribonukleoproteiinidesse (PMRN), lõpeb selle edasikandumisega tsütoplasmasse tuuma pooride kaudu ja nõuab selle valmimiseks mitmete tegurite olemasolu. Projekti eesmärk on määrata RNA järjestuse abil kindlaks selliste molekulide ekspressioon, mis koordineerivad RNAde eksporti tsütoplasmasse inimese südamepuudulikkuse korral, nagu TREX (Transcription-export) valgukompleks; rühm THO, DEAD-box helikopterid ja Aly adapter), tegur NXF1:NXT1 (Tap:p15) ja selle GANP promootor ning Dbp5 (DDX19), mis hõlbustavad mRNA (NMR-vormis) transportimist tuuma pooride tsütoplasmasse. Lisaks määrame mikroarrayde abil väikeste RNAde ekspressiooni, mis ei kodeeri valke (snoRNAsid ja scaRNAsid) ja mängivad olulist rolli geeniekspressiooni reguleerimisel; need RNA-d jagavad mõningaid transporditegureid mRNA omadega. Võrdleme mõlemat tüüpi RNA-de ekspressiooniandmeid samadel patsientidel ja me seostame tulemused komplekside ja teguritega, mis on seotud nende ülekandmisega tsütoplasmasse. 42 vasaku vatsakese proovi kasutatakse HF, isheemilise või laienenud päritoluga patsientidelt, kes vajasid südame siirdamist, ja 14 vasaku vatsakese proovi tervetelt isikutelt, kes surid mittekardiaalsetel põhjustel. Andmete arvutuslik analüüs võimaldab meil saada diferentseeritud väljenduse ja funktsionaalse analüüsi. Tulemused valideeritakse in situ hübridiseerimise, qRT-PCRi, Western-blot’i ja immunotsütokeemia abil ning saadud andmeid võrreldakse vatsakese funktsiooni ja südame ümberkujundamisega. Rühm on projektivalimid juba saanud. (Estonian)
4 August 2022
0 references
Genų ekspresijos eukariotuose branduolinė fazė, įskaitant mRNR po transkripcijos modifikacijas ir supakuotą į ribonukleoproteinus (PMRN), baigiasi pernešant į citoplazmą per branduolines poras, kad vėliau būtų galima ją išversti, ir jai užbaigti reikia tam tikrų veiksnių. Projekto tikslas – nustatyti tų molekulių, kurios koordinuoja RNR eksportavimą į citoplazmą esant žmogaus širdies nepakankamumui (CI), pvz., TREX (Transcription-eksporto) baltymų kompleksą, išraišką RNR sekos nustatymo būdu; grupė THO, DEAD-box helicases ir Aly adapteris), NXF1:NXT1 faktorius (Tap:p15) ir jo GANP promotorius ir Dbp5 (DDX19), kurie palengvina mRNR (kaip NMR) transportavimą į branduolinių porų citoplazminį veidą. Be to, naudojant mikromatricas, mes nustatysime mažų RNR, kurios nekoduoja baltymų (snoRNR ir scaRNR), ekspresiją ir atlieka svarbų vaidmenį reguliuojant genų ekspresiją; šios RNR turi tam tikrus transporto veiksnius su mRNR. Palyginkime abiejų RNR tipų išraiškos duomenis tiems patiems pacientams, ir mes siesime rezultatus su kompleksais ir veiksniais, susijusiais su jų transportavimu į citoplazmą. 42 kairiojo skilvelio mėginiai bus naudojami pacientams, sergantiems HF, išeminės ar išsiplėtusios kilmės, kuriems reikia širdies transplantacijos, ir 14 kairiojo skilvelio mėginių iš sveikų asmenų, kurie mirė nuo ne širdies priežasčių. Kompiuterinė duomenų analizė leis mums gauti diferencijuotą išraišką ir funkcinę analizę. Rezultatai bus patvirtinti taikant in situ hibridizaciją, qRT-PGR, vakarietišką blotą ir imunocitochemiją, o gauti duomenys bus lyginami su skilvelių funkcija ir širdies remodeliavimu. Grupė jau yra gavusi projekto pavyzdžių. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
Nuklearna faza ekspresije gena u eukariotima, uključujući post-transkripcijske modifikacije mRNK-a i pakirana u ribonukleoproteine (PMRN), završava prijevozom do citoplazma kroz nuklearnu poru radi naknadnog prijevoda i zahtijeva prisutnost niza čimbenika za njezino dovršenje. Cilj je projekta utvrditi ekspresiju sekvenciranjem RNA onih molekula koje koordiniraju izvoz RNK u citoplazmu u slučaju zatajenja srca (CI), kao što je kompleks proteina TREX (Transcription-export); grupa THO, helikaze DEAD-box i Aly adapter), faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) i njegov promotor GANP-a te Dbp5 (DDX19) koji olakšava prijevoz mRNA (u obliku NMR-a) do citoplazmičnog lica nuklearne pore. Osim toga, pomoću mikroarrays, odredit ćemo ekspresiju malih RNK koji ne kodiraju proteine (snoRNA i scaRNA) i igraju važnu ulogu u reguliranju ekspresije gena; te RNA-e dijele neke čimbenike prijevoza s čimbenicima mRNA. Usporedimo ekspresijske podatke obje vrste RNK kod istih pacijenata, a rezultate ćemo povezati s kompleksima i čimbenicima uključenima u njihov transport do citoflazme. 42 uzorka lijeve klijetke koristit će se od bolesnika s HF-om, ishemijskim ili proširenim podrijetlom, kojima je bila potrebna transplantacija srca, i 14 uzoraka lijeve klijetke od zdravih pojedinaca koji su umrli od nesrdačnih uzroka. Računalna analiza podataka omogućit će nam da dobijemo diferenciranu ekspresiju i funkcionalnu analizu. Rezultati će biti potvrđeni in situ hibridizacijom, qRT-PCR, Western-blot i imunocitokemijom, a dobiveni podaci uspoređivat će se s ventrikularnom funkcijom i remodeliranjem srca. Skupina je već prikupila uzorke projekta. (Croatian)
4 August 2022
0 references
Η πυρηνική φάση της γονιδιακής έκφρασης σε ευκαρυώτες, συμπεριλαμβανομένων μετα-μεταγραφικών τροποποιήσεων στο mRNA και συσκευασμένων σε ριβονουκλεοπρωτεΐνες (PMRN), τελειώνει με τη μεταφορά του στο κυτταρόπλασμα μέσω του πυρηνικού πόρου για μεταγενέστερη μετάφραση και απαιτεί την παρουσία ορισμένων παραγόντων για την ολοκλήρωσή του. Στόχος του έργου είναι να προσδιοριστεί η έκφραση, μέσω της αλληλουχίας του RNA, των μορίων που συντονίζουν την εξαγωγή RNA σε κυτταρόπλασμα στην ανθρώπινη καρδιακή ανεπάρκεια (CI), όπως το σύμπλεγμα πρωτεϊνών TREX (μεταγραφής-εξαγωγής)· Group THO, DEAD-box helicases, και Aly adapter), ο συντελεστής NXF1:NXT1 (Tap:p15) και ο υποστηρικτής του GANP, και ο Dbp5 (DDX19) που διευκολύνει τη μεταφορά του mRNA (με τη μορφή NMR) στο κυτταροπλασματικό πρόσωπο των πυρηνικών πόρων. Επιπλέον, χρησιμοποιώντας μικροσυστοιχίες, θα καθορίσουμε την έκφραση των μικρών RNA που δεν κωδικοποιούν πρωτεΐνες (snoRNAs και scaRNAs) και διαδραματίζουν σημαντικό ρόλο στη ρύθμιση της έκφρασης των γονιδίων. αυτοί οι RNA μοιράζονται ορισμένους παράγοντες μεταφοράς με εκείνους της mRNA. Ας συγκρίνουμε τα δεδομένα έκφρασης και των δύο τύπων RNA στους ίδιους ασθενείς, και θα συσχετίσουμε τα αποτελέσματα με τα σύμπλοκα και τους παράγοντες που εμπλέκονται στη μεταφορά τους στο κυτταρόπλασμα. 42 δείγματα αριστερής κοιλίας θα χρησιμοποιηθούν από ασθενείς με HF, ισχαιμικής ή διαστολής προέλευσης, οι οποίοι απαιτούν μεταμόσχευση καρδιάς, και 14 δείγματα αριστερής κοιλίας από υγιή άτομα, τα οποία πέθαναν από μη καρδιακές αιτίες. Η υπολογιστική ανάλυση των δεδομένων θα μας επιτρέψει να αποκτήσουμε διαφοροποιημένη έκφραση και λειτουργική ανάλυση. Τα αποτελέσματα θα επικυρωθούν με επί τόπου υβριδισμό, qRT-PCR, δυτική σταγόνα και ανοσοκυτταροχημεία, και τα δεδομένα που θα ληφθούν θα συγκριθούν με τη λειτουργία της κοιλίας και την καρδιακή αναμόρφωση. Τα δείγματα του έργου έχουν ήδη ληφθεί από την ομάδα. (Greek)
4 August 2022
0 references
Jadrová fáza expresie génov v eukaryotoch vrátane posttranskripčných modifikácií v mRNA a zabalená do ribonukleoproteínov (PMRN) končí jeho transportom do cytoplazmu cez jadrový pór na následný preklad a vyžaduje si prítomnosť viacerých faktorov na jeho dokončenie. Cieľom projektu je stanoviť expresiu sekvenovania RNA tých molekúl, ktoré koordinujú vývoz RNA do cytoplazmu v ľudskom zlyhávaní srdca (CI), ako je proteínový komplex TREX (Transcription-export); Group THO, DEAD-box helicases a Aly adaptér), NXF1:NXT1 faktor (Tap:p15) a jeho promótor GANP a Dbp5 (DDX19), ktorý uľahčuje prepravu mRNA (vo forme NMR) do cytoplazmickej tváre jadrového póru. Okrem toho pomocou mikroarrays určíme expresiu malých RNA, ktoré nezakódujú proteíny (snoRNA a scaRNA) a budeme hrať dôležitú úlohu pri regulácii expresie génov; tieto RNA zdieľajú niektoré dopravné faktory s faktormi mRNA. Porovnajme údaje o expresii oboch typov RNA u rovnakých pacientov a výsledky budeme spájať s komplexmi a faktormi podieľajúcimi sa na ich transporte do cytoplazmu. 42 vzoriek ľavej komory sa použije od pacientov s HF, ischemického alebo rozšíreného pôvodu, ktorí vyžadovali transplantáciu srdca, a 14 vzoriek ľavej komory od zdravých jedincov, ktorí zomreli na nekardiálne príčiny. Výpočtová analýza údajov nám umožní získať diferencované vyjadrenie a funkčnú analýzu. Výsledky budú validované in situ hybridizáciou, qRT-PCR, western-blot a imunocytochémiou a získané údaje sa porovnajú s ventrikulárnou funkciou a remodeláciou srdca. Vzorky projektu už skupina získala. (Slovak)
4 August 2022
0 references
Eukaryoottien geenien ilmentymisen ydinvaihe, mukaan lukien mRNA:n jälkeiset muutokset, jotka on pakattu ribonukleoproteiiniin (PMRN), päättyy sen siirtämiseen sytoplasmaan ydinhuokosen kautta myöhempää kääntämistä varten ja edellyttää, että sen loppuunsaattamiseksi on useita tekijöitä. Hankkeen tavoitteena on määrittää RNA-sekvensoinnin avulla ne molekyylit, jotka koordinoivat RNA:iden vientiä sytoplasmaan ihmisen sydämen vajaatoiminnassa (CI), kuten TREX-proteiinikompleksi (Transcription-export). ryhmä THO, DEAD-box-helikaasit ja Aly-sovitin, NXF1:NXT1 tekijä (Tap:p15) ja sen GANP-promoottori sekä Dbp5 (DDX19), joka helpottaa mRNA:n (NMR:n muodossa) kuljettamista ydinhuokosen sytoplasmiselle kasvoille. Lisäksi mikrorypäleillä määritetään sellaisten pienten RNA:iden ilmentymä, jotka eivät koodaa proteiineja (snoRNA- ja scaRNA-aineita) ja joilla on tärkeä rooli geenien ilmentymisen sääntelyssä; näillä RNA:illa on joitakin kuljetustekijöitä mRNA:n kanssa. Verrataan molempien RNA-tyyppien ilmaisutietoja samoilla potilailla, ja suhteutamme tulokset komplekseihin ja tekijöihin, jotka liittyvät niiden kuljetukseen sytoplasmaan. 42 vasemman kammion näytettä käytetään HF-potilailta, joilla on iskeeminen tai laajentunut alkuperä ja jotka vaativat sydämensiirron, ja 14 jäljellä olevaa kammionäytettä terveiltä yksilöiltä, jotka kuolivat ei-sydämen aiheuttamiin syihin. Tietojen laskennallisen analyysin avulla voimme saada eriytettyä ilmaisua ja toiminnallista analyysia. Tulokset validoidaan in situ hybridisaatiolla, qRT-PCR:llä, Western-blotilla ja immunosytokemialla, ja saatuja tietoja verrataan kammion toimintaan ja sydämen uudistamiseen. Ryhmä on jo hankkinut hankenäytteet. (Finnish)
4 August 2022
0 references
Nuklearna faza ekspresji genów w eukariotach, w tym potranskrypcyjne modyfikacje w mRNA i pakowana w ribonukleoprotein (PMRN), kończy się jej transportem do cytoplazmy przez pory jądrowe w celu późniejszego przetłumaczenia i wymaga obecności szeregu czynników do jej ukończenia. Celem projektu jest określenie ekspresji sekwencjonowania RNA tych cząsteczek, które koordynują eksport RNA do cytoplazmy w niewydolności serca człowieka (CI), takich jak kompleks białek TREX (Transcription-export); Group THO, DEAD-box helicases i Aly adapter), współczynnik NXF1:NXT1 (Tap:p15) i jego promotor GANP oraz Dbp5 (DDX19), które ułatwiają transport mRNA (w postaci NMR) na stronę cytoplazmatyczną porów jądrowych. Ponadto, wykorzystując mikroarraye, określimy ekspresję małych RNA, które nie kodują białek (snoRNA i scaRNAs) i odgrywają ważną rolę w regulacji ekspresji genów; te RNA dzielą niektóre czynniki transportowe z czynnikami mRNA. Porównajmy dane ekspresji obu typów RNA u tych samych pacjentów, a wyniki odniesiemy do kompleksów i czynników związanych z ich transportem do cytoplazmy. 42 próbki lewej komory zostaną wykorzystane od pacjentów z HF, pochodzenia niedokrwiennego lub rozszerzonego, którzy wymagali przeszczepu serca, oraz 14 próbek lewej komory od zdrowych osób, którzy zmarli z przyczyn niezwiązanych z sercem. Analiza obliczeniowa danych pozwoli nam uzyskać zróżnicowane wyrażenie i analizę funkcjonalną. Wyniki zostaną potwierdzone hybrydyzacją in situ, qRT-PCR, blokiem zachodnim i immunocytochemią, a uzyskane dane zostaną porównane z czynnością komorową i przebudową serca. Grupa uzyskała już próbki projektów. (Polish)
4 August 2022
0 references
Az eukariótákban a génexpresszió nukleáris fázisa, beleértve az mRNS-ben történő poszttrankripciós módosításokat és ribonukleoproteinekbe (PMRN) csomagolva, a citoplazmába történő szállításával végződik a nukleáris póruson keresztül a későbbi fordítás érdekében, és számos tényező jelenlétét igényli annak befejezéséhez. A projekt célja, hogy RNS szekvenálással meghatározza az RNS-ek citoplazmába történő exportját emberi szívelégtelenségben koordináló molekulákat, mint például a TREX (Transcription-export) fehérjekomplexet; a THO csoport, a DEAD-box helicases és az Aly adapter), a NXF1:NXT1 tényező (Tap:p15) és annak GANP-promóterje, valamint a Dbp5 (DDX19), amely megkönnyíti az mRNS (NMR formájában) a nukleáris pórus citoplazmikus felületére történő szállítását. Ezenkívül mikroarray-k használatával meghatározzuk azokat a kis RNS-eket, amelyek nem kódolnak fehérjéket (snoRNS és scaRNS), és fontos szerepet játszanak a génexpresszió szabályozásában; ezek az RNS-ek néhány szállítási tényezőt megosztanak az mRNS-szel. Hasonlítsuk össze mindkét típusú RNS-ek expressziós adatait ugyanabban a betegben, és az eredményeket a citoplazmához való transzportban szerepet játszó komplexekhez és tényezőkhöz kapcsoljuk. 42 bal kamra mintát használnak a betegek HF, ischaemiás vagy kitágult eredetű, akik szükség van egy szívátültetés, és 14 bal kamra minta egészséges egyének, akik meghaltak a nem szívbetegség okozta. Az adatok számítási elemzése lehetővé teszi számunkra, hogy differenciált kifejezést és funkcionális elemzést szerezzünk. Az eredményeket in situ hibridizáció, qRT-PCR, western-blot és immunocytochemistry validálják, és a kapott adatokat a kamrai funkcióval és a kardiovaszkuláris átalakítással hasonlítják össze. A projektmintákat a csoport már megszerezte. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
Jaderná fáze exprese genů u eukaryotů, včetně posttranskripčních modifikací mRNA a balených v ribonukleoproteinech (PMRN), končí transportem do cytoplazmy jaderným pórem pro následný překlad a vyžaduje přítomnost řady faktorů pro její dokončení. Cílem projektu je určit expresi molekul, které koordinují vývoz RNA do cytoplazmy v lidském srdečním selhání (CI), jako je TREX (Transcription-export) proteinový komplex, pomocí sekvenování RNA; skupina THO, helicases DEAD-box a adaptér Aly, faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) a jeho promotor GANP a Dbp5 (DDX19), který usnadňuje přepravu mRNA (ve formě NMR) do cytoplazmatické tváře jaderného póru. Kromě toho pomocí mikroarraye určíme expresi malých RNA, které nezakódují proteiny (snoRNA a scaRNA) a hrají důležitou roli při regulaci genové exprese; tyto RNA sdílejí některé dopravní faktory s faktory mRNA. Porovnejte expresní data obou typů RNA u stejných pacientů a výsledky spojíme s komplexy a faktory, které se podílejí na jejich transportu do cytoplazmy. 42 vzorků levé komory bude použito od pacientů s HF, ischemického nebo rozšířeného původu, kteří vyžadovali transplantaci srdce, a 14 vzorků levé komory od zdravých jedinců, kteří zemřeli na nekardiovaskulárních příčinách. Výpočetní analýza dat nám umožní získat diferencovanou expresní a funkční analýzu. Výsledky budou validovány hybridizací in situ, qRT-PCR, Western-blot a imunocytochemií a získané údaje budou porovnány s komorovou funkcí a remodelací srdce. Projektové vzorky již skupina získala. (Czech)
4 August 2022
0 references
Gēnu ekspresijas kodolfāze eukaryotos, tostarp pēctranskripcijas modifikācijas mRNS un iepakota ribonukleoproteīnā (PMRN), beidzas ar tās transportēšanu uz citoplazmu caur kodolporu turpmākai pārtulkošanai un prasa vairāku faktoru klātbūtni tās pabeigšanai. Projekta mērķis ir noteikt to molekulu ekspresiju ar RNS sekvencēšanu, kas koordinē RNS eksportu uz citoplazmu cilvēka sirds mazspējas (CI) gadījumā, piemēram, TREX (transkripcijas eksporta) proteīnu kompleksu; grupa THO, DEAD-box helikopteri un Aly adapteri), NXF1:NXT1 faktors (Tap:p15) un tā GANP veicinātājs, un Dbp5 (DDX19), kas atvieglo mRNS (NMR veidā) transportēšanu uz kodolporas citoplazmas seju. Turklāt, izmantojot mikroblokus, mēs noteiksim nelielu RNS ekspresiju, kas neiekodē proteīnus (snoRNS un scaRNS) un kam ir svarīga loma gēnu ekspresijas regulēšanā; šīm RNS ir daži transporta faktori ar mRNS faktoriem. Salīdzināsim abu RNS veidu ekspresijas datus vieniem un tiem pašiem pacientiem, un mēs saistīsim rezultātus ar kompleksiem un faktoriem, kas saistīti ar to transportēšanu uz citoplazmu. 42 kreisā kambara paraugi tiks izmantoti no pacientiem ar HF, išēmiskas vai paplašinātas izcelsmes, kuriem bija nepieciešama sirds transplantācija, un 14 kreisā kambara paraugi no veseliem indivīdiem, kuri nomira no ne-kardiāliem cēloņiem. Datu skaitļošanas analīze ļaus mums iegūt diferencētu izteiksmi un funkcionālo analīzi. Rezultātus validēs ar in situ hibridizāciju, qRT-PCR, Western-bloot un imūncitoķīmiju, un iegūtos datus salīdzinās ar kambaru funkciju un sirds remodelāciju. Grupa jau ir ieguvusi projektu paraugus. (Latvian)
4 August 2022
0 references
Críochnaíonn céim núicléach an léirithe géine in eukaryotes, lena n-áirítear modhnuithe iar-thrascrioptúla ar mRNA agus a dhéantar a phacáistiú i ribonucleoproteins (PMRN), lena iompar chuig an gcíteaplasm tríd an bpóir núicléach chun é a aistriú ina dhiaidh sin, agus ní mór roinnt tosca a bheith ann chun é a chur i gcrích. Is é cuspóir an tionscadail cinneadh a dhéanamh maidir le sloinneadh na móilíní sin, trí sheicheamhú RNA, lena gcomhordaítear onnmhairiú RNAs chuig citoplasm i gcliseadh croí an duine (CI), amhail coimpléasc próitéine TREX (onnmhairiú tras-scríofa); Group THO, DEAD-box helicases, agus Aly adapter), an fachtóir NXF1:NXT1 (Tap:p15) agus a thionscnóir GANP, agus an Dbp5 (DDX19) a éascaíonn iompar mRNA (i bhfoirm NMR) chuig aghaidh chíteaplasmic an pore núicléach. Ina theannta sin, trí úsáid a bhaint as microarrays, déanfaimid amach léiriú RNAs beaga nach n-ionchódaíonn próitéiní (snoRNAs agus scaRNAs) agus a bhfuil ról tábhachtach acu maidir le léiriú géine a rialáil; roinneann na RNAs seo roinnt fachtóirí iompair le fachtóirí mRNA. Déanaimis comparáid idir sonraí léirithe an dá chineál RNAs sna hothair chéanna, agus cuirfimid na torthaí i gcomparáid leis na coimpléisc agus na tosca a bhaineann lena n-iompar chuig an cytoplasm. Beidh 42 sampla ventricle chlé a úsáid ó othair a bhfuil HF, de bhunadh ischemic nó dilated, a bhí ag teastáil trasphlandú croí, agus 14 d’fhág samplaí ventricle ó dhaoine sláintiúla, a fuair bás ó chúiseanna neamh-cardiac. Tabharfaidh an anailís ríomhaireachtúil ar na sonraí deis dúinn léiriú difreáilte agus anailís fheidhmiúil a fháil. Déanfar na torthaí a bhailíochtú le hibridiú in situ, qRT-PCR, blot an iarthair, agus imdhíonchitriceimic, agus cuirfear na sonraí a fhaightear i gcomparáid le feidhm ventricular agus athmhúnlú cairdiach. Tá samplaí an tionscadail faighte cheana féin ag an ngrúpa. (Irish)
4 August 2022
0 references
Jedrska faza izražanja genov v evkariontih, vključno s posttrankripcijskimi spremembami v mRNK in pakiranimi v ribonukleoproteine (PMRN), se konča s transportom v citoplazmo skozi jedrsko poro za kasnejši prevod in zahteva prisotnost številnih dejavnikov za njeno dokončanje. Cilj projekta je določiti izražanje molekul, ki usklajujejo izvoz RNK v citoplazmo pri človeškem srčnem popuščanju (CI), kot je proteinski kompleks TREX (Transcription-export) s sekvenciranjem RNK; skupina THO, DEAD-box helicases in Aly adapter), faktor NXF1:NXT1 (Tap:p15) in njegov promotor GANP ter Dbp5 (DDX19), ki omogoča prevoz mRNA (v obliki NMR) na citoplazmično površino jedrske pore. Poleg tega bomo z uporabo mikroarrayjev določili izražanje majhnih RNK, ki ne kodirajo beljakovin (snoRNA in scaRNA) in imajo pomembno vlogo pri uravnavanju izražanja genov; te RNA imajo nekatere dejavnike prevoza z mRNA. Primerjajmo ekspresivne podatke obeh vrst RNA pri istih bolnikih in rezultate bomo povezali s kompleksi in dejavniki, ki so vključeni v njihov transport v citoplazmo. 42 vzorcev levega prekata se bo uporabilo pri bolnikih s HF ishemičnega ali razširjenega izvora, ki so potrebovali presaditev srca, in 14 vzorcev levega prekata pri zdravih posameznikih, ki so umrli zaradi nekardiakalnih vzrokov. Računska analiza podatkov nam bo omogočila, da dobimo diferenciran izraz in funkcionalno analizo. Rezultati bodo potrjeni s hibridizacijo in situ, qRT-PCR, Western-blot in imunocitokemijo, pridobljeni podatki pa bodo primerjani z ventrikularno funkcijo in remodeliranjem srca. Vzorce projekta je skupina že pridobila. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
Ядрената фаза на генната експресия в еукариоти, включително посттранскрипционните модификации в mRNA и опаковани в рибонуклеопротеини (PMRN), завършва с транспортирането му до цитоплазмата през ядрената пора за последващ превод и изисква наличието на редица фактори за нейното завършване. Целта на проекта е да се определи експресията чрез секвениране на РНК на тези молекули, които координират износа на РНК към цитоплазма при човешка сърдечна недостатъчност (CI), като например протеиновия комплекс TREX (Transcription-export); Group THO, DEAD-box хеликоптери и Aly адаптер), коефициент NXF1:NXT1 (Tap:p15) и неговия GANP промотор, и Dbp5 (DDX19), който улеснява транспортирането на mRNA (под формата на ЯМР) до цитоплазмената повърхност на ядрената пора. Освен това, използвайки микроскопи, ще определим експресията на малки РНК, които не кодират протеини (сноРНК и scaRNAs) и ще играят важна роля в регулирането на генната експресия; тези РНК споделят някои транспортни фактори с тези на иРНК. Нека сравним данните за израза на двата вида РНК при едни и същи пациенти и ще свържем резултатите с комплексите и факторите, участващи в транспортирането им до цитоплазмата. Ще бъдат използвани 42 проби от лявата камера от пациенти с HF, с исхемичен или разширен произход, които са изисквали сърдечна трансплантация, и 14 проби от лявата камера от здрави индивиди, починали от несърдечни причини. Изчислителният анализ на данните ще ни позволи да получим диференциран израз и функционален анализ. Резултатите ще бъдат валидирани чрез in situ хибридизация, qRT-PCR, западно-блот и имуноцитохимия, а получените данни ще бъдат сравнени с камерната функция и сърдечната ремоделация. Извадките от проекта вече са получени от групата. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
Il-fażi nukleari tal-espressjoni tal-ġeni fl-ewkarjoti, inklużi modifiki posttraskrizzjonali f’mRNA u ppakkjati fir-ribonukleoproteini (PMRN), tispiċċa bit-trasport tagħha lejn iċ-ċitoplażma permezz tal-pori nukleari għal traduzzjoni sussegwenti, u teħtieġ il-preżenza ta’ għadd ta’ fatturi għat-tlestija tagħha. L-għan tal-proġett huwa li jiddetermina l-espressjoni, permezz ta’ sekwenzar tal-RNA, ta’ dawk il-molekuli li jikkoordinaw l-esportazzjoni tal-RNAs għaċ-ċitoplażma f’insuffiċjenza tal-qalb tal-bniedem (CI), bħall-kumpless ta’ proteini TREX (Transcription-export); grupp THO, spirali tal-kaxxa DEAD, u adapter ta’ Aly), il-fattur NXF1:NXT1 (Tap:p15) u l-promotur GANP tiegħu, u d-Dbp5 (DDX19) li jiffaċilita t-trasport ta’ mRNA (fil-forma ta’ NMR) lejn il-wiċċ ċitoplasmiku tal-pori nukleari. Barra minn hekk, bl-użu ta’ mikroarrays, aħna se niddeterminaw l-espressjoni ta’ RNAs żgħar li ma jikkodifikawx proteini (snoRNAs u scaRNAs) u għandhom rwol importanti fir-regolazzjoni tal-espressjoni tal-ġeni; dawn l-RNAs jaqsmu xi fatturi tat-trasport ma’ dawk ta’ mRNA. Ejja jqabblu d-data espressjoni taż-żewġ tipi ta ‘RNAs fl-istess pazjenti, u aħna se jirrelataw ir-riżultati mal-kumplessi u l-fatturi involuti fit-trasport tagħhom għall-ċitoplażma. 42 kampjun ta ‘ventrikolu tax- xellug se jintużaw minn pazjenti b’ HF, ta’ oriġini iskemika jew dilatata, li kienu jeħtieġu trapjant tal- qalb, u 14- il kampjun ta ‘ventrikolu tax- xellug minn individwi b’ saħħithom, li mietu minn kawżi mhux kardijaċi. L-analiżi komputazzjonali tad-data se tippermettilna niksbu espressjoni differenzjata u analiżi funzjonali. Ir-riżultati se jiġu vvalidati permezz ta’ ibridizzazzjoni in situ, qRT-PCR, Punent-blot, u immunoċitokimika, u d-dejta miksuba tiġi mqabbla mal-funzjoni ventrikulari u l-immudellar mill-ġdid tal-qalb. Il-kampjuni tal-proġetti diġà nkisbu mill-grupp. (Maltese)
4 August 2022
0 references
A fase nuclear da expressão genética em eucariotas, incluindo modificações pós-transcricionais em ARNm e embalados em ribonucleoproteínas (PMRN), termina com o seu transporte para o citoplasma através do poro nuclear para posterior tradução, e requer a presença de uma série de factores para a sua conclusão. O objetivo do projeto é determinar a expressão, por sequenciação de ARN, das moléculas que coordenam a exportação de ARN para o citoplasma na insuficiência cardíaca humana (IC), como o complexo proteico TREX (Transcription-export); grupo THO, helicases DEAD-box e adaptador Aly), o fator NXF1:NXT1 (Tap:p15) e seu promotor GANP, e o Dbp5 (DDX19) que facilita o transporte de mRNA (sob a forma de uma RMN) para a face citoplasmática do poro nuclear. Além disso, utilizando microarrays, determinaremos a expressão de pequenos ARN que não codificam proteínas (snoRNAs e scaRNAs) e desempenham um papel importante na regulação da expressão genética; estes ARN partilham alguns factores de transporte com os do ARNm. Comparemos os dados de expressão de ambos os tipos de ARN nos mesmos doentes e relacionaremos os resultados com os complexos e fatores envolvidos no seu transporte para o citoplasma. Serão utilizadas 42 amostras de ventrículo esquerdo de pacientes com IC, de origem isquémica ou dilatada, que necessitaram de transplante cardíaco, e 14 amostras de ventrículo esquerdo de indivíduos saudáveis, que morreram por causas não cardíacas. A análise computacional dos dados permitir-nos-á obter expressão diferenciada e análise funcional. Os resultados serão validados por hibridação in situ, qRT-PCR, western-blot e imunocitoquímica, e os dados obtidos serão comparados com a função ventricular e o remodelamento cardíaco. As amostras do projeto já foram obtidas pelo grupo. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
Den nukleare fase af genekspression i eukaryoter, herunder post-transkriptionelle modifikationer i mRNA og pakket i ribonucleoproteiner (PMRN), slutter med dets transport til cytoplasmen gennem den nukleare pore med henblik på efterfølgende oversættelse, og kræver tilstedeværelsen af en række faktorer for dens færdiggørelse. Formålet med projektet er at bestemme udtrykket ved RNA-sekventering af de molekyler, der koordinerer eksporten af RNA'er til cytoplasm ved humant hjertesvigt (CI), såsom TREX-proteinkomplekset (Transcription-export) gruppe THO, DEAD-box helicases og Aly adapter), NXF1:NXT1 faktor (Tap:p15) og dens GANP-promotor og Dbp5 (DDX19), der letter transporten af mRNA (i form af en NMR) til den cytoplasmiske overflade af den nukleare pore. Derudover vil vi ved hjælp af mikroarrays bestemme forekomsten af små RNA'er, der ikke koder proteiner (snoRNA'er og scaRNA'er) og spiller en vigtig rolle i reguleringen af genekspression. disse RNA'er deler visse transportfaktorer med mRNA's. Lad os sammenligne ekspressionsdata for begge typer af RNA'er hos de samme patienter, og vi vil relatere resultaterne til de komplekser og faktorer, der er involveret i deres transport, til cytoplasmen. 42 venstre ventrikelprøver vil blive brugt fra patienter med HF, af iskæmisk eller dilateret oprindelse, som krævede en hjertetransplantation, og 14 venstre ventrikel prøver fra raske individer, der døde af ikke- kardiale årsager. Den beregningsmæssige analyse af dataene vil give os mulighed for at opnå differentieret udtryk og funktionel analyse. Resultaterne vil blive valideret ved in situ hybridisering, qRT-PCR, Western-blot og immunocytochemistry, og de opnåede data vil blive sammenlignet med ventrikulær funktion og hjerte remodeling. Projektprøverne er allerede indhentet af gruppen. (Danish)
4 August 2022
0 references
Faza nucleară a expresiei genelor în eucariote, inclusiv modificările post-transcriptionale ale ARNm și ambalate în ribonucleoproteine (PMRN), se termină cu transportul către citoplasmă prin porul nuclear pentru traducerea ulterioară și necesită prezența unui număr de factori pentru finalizarea acesteia. Obiectivul proiectului este de a determina expresia, prin secvențierea ARN, a moleculelor care coordonează exportul de ARN în citoplasmă în insuficiența cardiacă umană (CI), cum ar fi complexul proteic TREX (Transcription-export); grup THO, DEAD-box helicase și Aly adaptor), factorul NXF1:NXT1 (Tap:p15) și promotorul GANP al acestuia și Dbp5 (DDX19) care facilitează transportul de ARNm (sub formă de RMN) pe fața citoplasmică a porilor nucleari. În plus, folosind microarray-uri, vom determina expresia ARN-urilor mici care nu codifică proteinele (snoRNA și scaRNA) și joacă un rol important în reglarea expresiei genetice; aceste ARN au în comun anumiți factori de transport cu cei ai ARNm. Să comparăm datele de expresie ale ambelor tipuri de ARN la aceiași pacienți și vom raporta rezultatele la complexele și factorii implicați în transportul lor la citoplasmă. 42 de probe de ventricul stâng vor fi utilizate de la pacienți cu HF, de origine ischemică sau dilatată, care au necesitat un transplant de inimă și 14 probe de ventricul stâng de la persoane sănătoase, care au murit din cauze non-cardiace. Analiza computațională a datelor ne va permite să obținem o expresie diferențiată și o analiză funcțională. Rezultatele vor fi validate prin hibridizare in situ, qRT-PCR, vest-blot și imunocitochimie, iar datele obținute vor fi comparate cu funcția ventriculară și remodelarea cardiacă. Eșantioanele proiectului au fost deja obținute de grup. (Romanian)
4 August 2022
0 references
Den nukleära fasen av genuttryck i eukaryoter, inklusive post-transkriptionella modifieringar i mRNA och förpackade i ribonucleoproteiner (PMRN), slutar med dess transport till cytoplasman genom kärnporn för efterföljande översättning, och kräver närvaro av ett antal faktorer för dess slutförande. Syftet med projektet är att fastställa RNA-sekvenseringens uttryck för de molekyler som samordnar exporten av RNA till cytoplasma i human hjärtsvikt (CI), t.ex. proteinkomplexet TREX (Transcription-export). grupp THO, DEAD-box helicases, och Aly adapter, NXF1:NXT1 faktorn (Tap:p15) och dess GANP promotor, och Dbp5 (DDX19) som underlättar transport av mRNA (i form av en NMR) till cytoplasma ansiktet av kärnpor. Dessutom, med hjälp av mikroarrayer, kommer vi att bestämma uttrycket för små RNA som inte kodar proteiner (snoRNAs och scaRNAs) och spelar en viktig roll i regleringen av genuttryck; dessa RNA delar vissa transportfaktorer med mRNA. Låt oss jämföra uttrycksdata för båda typerna av RNA hos samma patienter, och vi kommer att relatera resultaten till de komplex och faktorer som är involverade i deras transport till cytoplasman. 42 vänsterkammarprover kommer att användas från patienter med HF, av ischemiskt eller dilaterat ursprung, som krävde en hjärttransplantation, och 14 vänsterkammarprov från friska individer som dog av icke-kardiella orsaker. Den beräkningsanalys av data kommer att göra det möjligt för oss att få differentierat uttryck och funktionell analys. Resultaten kommer att valideras genom in situ-hybridisering, qRT-PCR, Western-blot och immunocytochemistry, och de data som erhålls kommer att jämföras med ventrikulär funktion och hjärtremodeling. Projekturvalen har redan erhållits av gruppen. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Valencia
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI17_01232
0 references