Identification of chromatin factors affecting meiotic crossover formation in plants (Q84329): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(Added qualifier: readability score (P590521): 0.7097317071819571) |
(Changed label, description and/or aliases in pt) |
||
| (One intermediate revision by the same user not shown) | |||
| label / pt | label / pt | ||
Identificação | Identificação de fatores de cromatina que afetam a formação de cruzamentos meióticos em plantas | ||
| Property / summary | Property / summary | ||
O crossover meiótico é um processo fundamental que desbloqueia e gera diversidade genética e, portanto, é um substrato importante para o melhoramento vegetal. Nesta proposta, procuramos caracterizar os fatores de cromatina que controlam o crossover meiótico em genomas vegetais. Em primeiro lugar, vamos desenvolver uma nova abordagem que irá permitir-nos estudar hotspots crossover selecionados em Arabidopsis com alta resolução. Isto será baseado na classificação de sementes recombinantes com Repórteres fluorescentes e sequenciamento sucessivo de intervalos que contêm crossover. A seguir, vamos testar diretamente os efeitos de dois tipos de modificação da cromatina na distribuição crossover: trimetilação da histona H3 com lisina 4 (H3K4me3) e acetilação da histona H4. Para este fim, vamos direcionar enzimas modificadoras de histonas para hotspots crossover dentro de nossos intervalos pelo sistema CRISPR/dCas9. Este projeto conduzirá a novas descobertas sobre o controlo cruzado e abrirá caminho à criação de pontos críticos de recombinação artificial para o melhoramento vegetal moderno. (Portuguese) | |||
Latest revision as of 22:03, 12 October 2024
Project Q84329 in Poland
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Identification of chromatin factors affecting meiotic crossover formation in plants |
Project Q84329 in Poland |
Statements
3,499,750.0 zloty
0 references
3,499,750.0 zloty
0 references
100.0 percent
0 references
1 December 2018
0 references
30 June 2023
0 references
UNIWERSYTET IM. ADAMA MICKIEWICZA W POZNANIU
0 references
Meiotic crossover is a fundamental process that unlocks and generates genetic diversity and is therefore an important substrate for crop breeding. In this proposal, we seek to characterize the chromatin factors controlling meiotic crossover in plant genomes. First, we will develop a new approach which will allow us to study selected crossover hotspots in Arabidopsis with high resolution. This will be based on recombinant seed sorting with fluorescent reporters and successive sequencing of crossover-containing intervals. Next, we will directly test effects of two types of chromatin modification on crossover distribution: histone H3 trimethylation at lysine 4 (H3K4me3), and histone H4 acetylation. For this purpose, we will target histone modifying enzymes to crossover hotspots within our intervals by CRISPR/dCas9 system. This project will lead to new discoveries on the crossover control and will pave a way to generate artificial recombination hotspots for modern plant breeding. (Polish)
0 references
Meiotic crossover is a fundamental process that unlocks and generates genetic diversity and is therefore an important substrate for crop breeding. In this proposal, we seek to characterise the chromatin factors controlling meiotic crossover in plant genomes. First, we will develop a new approach which will allow us to study selected crossover hotspots in Arabidopsis with high resolution. This will be based on recombinant seed sorting with fluorescent Reporters and successive sequencing of crossover-containing intervals. Next, we will directly test effects of two types of chromatin modification on crossover distribution: histone H3 trimethylation at lysine 4 (H3K4me3), and histone H4 acetylation. For this purpose, we will target histone modifying enzymes to crossover hotspots within our intervals by CRISPR/dCas9 system. This project will lead to new discoveries on the crossover control and will pave a way to generate artificial recombination hotspots for modern plant breeding. (English)
14 October 2020
0.7097317071819571
0 references
Le croisement méiotique est un processus fondamental qui déverrouille et génère la diversité génétique et constitue donc un substrat important pour la reproduction des cultures. Dans cette proposition, nous cherchons à caractériser les facteurs de chromatine qui contrôlent le croisement méiotique dans les génomes végétaux. Tout d’abord, nous allons développer une nouvelle approche qui nous permettra d’étudier des hotspots croisés sélectionnés dans Arabidopsis à haute résolution. Cela sera basé sur le tri des graines recombinantes avec des reporters fluorescents et le séquençage successif des intervalles de croisement. Ensuite, nous testerons directement les effets de deux types de modification de la chromatine sur la distribution croisée: la triméthylation de l’histone H3 à la lysine 4 (H3K4me3) et l’acétylation de l’histone H4. À cette fin, nous allons cibler les enzymes modifiant l’histone pour croiser les points chauds dans nos intervalles par le système CRISPR/dCas9. Ce projet mènera à de nouvelles découvertes sur le contrôle croisé et ouvrira la voie à la génération de points chauds de recombinaison artificielle pour la sélection végétale moderne. (French)
30 November 2021
0 references
Meiotischer Crossover ist ein grundlegender Prozess, der genetische Vielfalt freisetzt und erzeugt und somit ein wichtiges Substrat für die Pflanzenzüchtung ist. In diesem Vorschlag versuchen wir, die Chromatinfaktoren zu charakterisieren, die meiotische Kreuzungen in Pflanzengenomen steuern. Zunächst werden wir einen neuen Ansatz entwickeln, der es uns ermöglicht, ausgewählte Crossover-Hotspots in Arabidopsis mit hoher Auflösung zu untersuchen. Dies basiert auf einer rekombinanten Saatgutsortierung mit fluoreszierenden Reportern und einer sukzessiven Sequenzierung von Crossover-haltigen Intervallen. Als nächstes werden wir direkt testen Effekte von zwei Arten von Chromatin Modifikation auf Crossover-Verteilung: Histon H3 Trimethylierung bei Lysin 4 (H3K4me3) und Histon H4 Acetylierung. Zu diesem Zweck werden wir Histon modifizierende Enzyme auf Crossover-Hotspots innerhalb unserer Intervalle durch CRISPR/dCas9-System zielen. Dieses Projekt wird zu neuen Entdeckungen über die Crossover-Kontrolle führen und einen Weg zur Erzeugung künstlicher Rekombinationshotspots für die moderne Pflanzenzüchtung ebnen. (German)
7 December 2021
0 references
Meiotic crossover is een fundamenteel proces dat genetische diversiteit ontsluit en genereert en daarom een belangrijk substraat is voor de teelt van gewassen. In dit voorstel proberen we de chromatinefactoren te karakteriseren die de meiotische crossover in plantengenomen beheersen. Ten eerste zullen we een nieuwe aanpak ontwikkelen waarmee we geselecteerde crossover hotspots in Arabidopsis met hoge resolutie kunnen bestuderen. Dit zal gebaseerd zijn op recombinante zaadsortering met fluorescerende verslaggevers en opeenvolgende sequentie van crossover-bevattende intervallen. Vervolgens zullen we direct de effecten van twee soorten chromatinemodificatie op crossover distributie testen: histon H3 trimethylatie bij lysine 4 (H3K4me3) en histon H4 acetylation. Voor dit doel, zullen we histon wijzigen enzymen richten op crossover hotspots binnen onze intervallen met CRISPR/dCas9 systeem. Dit project zal leiden tot nieuwe ontdekkingen op de crossover controle en zal een manier effenen om kunstmatige hercombinatie hotspots voor moderne plantenveredeling te genereren. (Dutch)
16 December 2021
0 references
Il crossover meiotico è un processo fondamentale che sblocca e genera diversità genetica ed è quindi un importante substrato per l'allevamento delle colture. In questa proposta, cerchiamo di caratterizzare i fattori di cromatina che controllano il crossover meiotico nei genomi vegetali. In primo luogo, svilupperemo un nuovo approccio che ci permetterà di studiare gli hotspot crossover selezionati in Arabidopsis ad alta risoluzione. Questo sarà basato sulla selezione di semi ricombinanti con reporter fluorescenti e sul sequenziamento successivo di intervalli contenenti crossover. Successivamente, testeremo direttamente gli effetti di due tipi di modifica della cromatina sulla distribuzione crossover: istone H3 trimetilazione a lisina 4 (H3K4me3), e istone H4 acetilazione. A questo scopo, prenderemo di mira gli enzimi modificanti istone agli hotspot di crossover entro i nostri intervalli con il sistema CRISPR/dCas9. Questo progetto porterà a nuove scoperte sul controllo crossover e aprirà una strada per generare punti di ricombinazione artificiale per la moderna riproduzione vegetale. (Italian)
16 January 2022
0 references
El crossover meiótico es un proceso fundamental que desbloquea y genera diversidad genética y, por lo tanto, es un sustrato importante para la cría de cultivos. En esta propuesta, buscamos caracterizar los factores de cromatina que controlan el cruce meiótico en genomas vegetales. En primer lugar, desarrollaremos un nuevo enfoque que nos permitirá estudiar puntos críticos de crossover seleccionados en Arabidopsis con alta resolución. Esto se basará en la clasificación de semillas recombinantes con reporteros fluorescentes y la secuenciación sucesivas de intervalos que contienen cruces. A continuación, probaremos directamente los efectos de dos tipos de modificación de la cromatina en la distribución cruzada: trimetilación histona H3 en lisina 4 (H3K4me3) y acetilación histona H4. Para este propósito, nos dirigiremos a las enzimas de modificación de histonas a puntos de acceso cruzados dentro de nuestros intervalos por el sistema CRISPR/dCas9. Este proyecto conducirá a nuevos descubrimientos sobre el control de cruces y allanará el camino para generar puntos críticos de recombinación artificial para la mejora vegetal moderna. (Spanish)
19 January 2022
0 references
Meiootiline crossover on fundamentaalne protsess, mis avab ja genereerib geneetilist mitmekesisust ning on seega põllukultuuride kasvatamise oluline substraat. Käesolevas ettepanekus püüame iseloomustada kromatiinifaktoreid, mis kontrollivad meiootilist crossover’it taimede genoomides. Esiteks töötame välja uue lähenemisviisi, mis võimaldab meil uurida Arabidopsis valitud piiriüleseid esmase vastuvõtu keskusi suure resolutsiooniga. See põhineb rekombinantsel seemnete sortimisel fluorestseeruvate reporteritega ja ristuvate intervallide järjestikusel järjestusel. Seejärel testime otse kahte tüüpi kromatiini modifitseerimise mõju crossover jaotusele: histone H3 trimetülatsioon lüsiinis 4 (H3K4me3) ja histone H4 atsetüülimine. Sel eesmärgil sihime histone’i muundavaid ensüüme CRISPR/dCas9 süsteemi kaudu meie intervallide vahel. See projekt toob kaasa uued avastused ristkontrolli kohta ja sillutab teed kunstliku rekombinatsiooni levila loomiseks kaasaegse sordiaretuse jaoks. (Estonian)
13 August 2022
0 references
Mejozinis kryžminimas yra pagrindinis procesas, kuris atveria ir generuoja genetinę įvairovę, todėl yra svarbus pagrindas pasėlių veisimui. Šiame pasiūlyme siekiame apibūdinti chromatino faktorius, kontroliuojančius mejotinį kryžminimą augalų genomuose. Pirma, mes sukursime naują požiūrį, kuris leis mums ištirti pasirinktus kryžminius migrantų antplūdžio taškus Arabidopsyje su didele raiška. Tai bus grindžiama rekombinantinių sėklų rūšiavimu su fluorescuojančiais reporteriais ir nuoseklia kryžminių intervalų seka. Be to, mes tiesiogiai išbandysime dviejų tipų chromatino modifikavimo poveikį kryžminiam paskirstymui: Histone H3 trimetilinimas lizinu 4 (H3K4me3) ir histone H4 acetilinimas. Šiuo tikslu mes nukreipsime histone modifikuojančius fermentus į kryžminius taškus per mūsų intervalus CRISPR/dCas9 sistema. Šis projektas paskatins naujus kryžminės kontrolės atradimus ir padės sukurti dirbtinio rekombinavimo taškus šiuolaikiniam augalų selekcijai. (Lithuanian)
13 August 2022
0 references
Meiotski crossover temeljni je proces koji otključava i stvara genetsku raznolikost te je stoga važan supstrat za uzgoj usjeva. U ovom prijedlogu nastojimo okarakterizirati faktore kromatina koji kontroliraju meiotski crossover u biljnim genomima. Prvo, razvit ćemo novi pristup koji će nam omogućiti da proučavamo odabrane crossover žarišne točke u Arabidopsisu s visokom razlučivošću. To će se temeljiti na rekombinantnom sortiranju sjemena s fluorescentnim izvjestiteljima i uzastopnom sekvenciranju intervala koji sadrže crossover. Nadalje, izravno ćemo testirati učinke dviju vrsta modifikacija kromatina na križnu distribuciju: histon H3 trimetilacija kod lizina 4 (H3K4me3) i histonska H4 acetilacija. U tu svrhu ciljat ćemo enzime koji modificiraju histone kako bismo u našim intervalima križali hotspotove pomoću CRISPR/dCas9 sustava. Ovaj projekt će dovesti do novih otkrića na crossover kontroli i otvorit će način za stvaranje umjetnih žarišnih točaka rekombinacije za moderni uzgoj biljaka. (Croatian)
13 August 2022
0 references
Το meiotic crossover είναι μια θεμελιώδης διαδικασία που ξεκλειδώνει και δημιουργεί γενετική ποικιλότητα και, ως εκ τούτου, αποτελεί σημαντικό υπόστρωμα για την αναπαραγωγή των καλλιεργειών. Σε αυτή την πρόταση, επιδιώκουμε να χαρακτηρίσουμε τους παράγοντες χρωματίνης που ελέγχουν τη μειωτική διασταύρωση στα γονιδιώματα των φυτών. Πρώτον, θα αναπτύξουμε μια νέα προσέγγιση που θα μας επιτρέψει να μελετήσουμε επιλεγμένα διασταυρούμενα hotspots στο Arabidopsis με υψηλή ανάλυση. Αυτό θα βασίζεται στην ανασυνδυασμένη διαλογή των σπόρων με ρεπόρτερ φθορισμού και στη διαδοχική αλληλουχία των διασταυρούμενων διαστημάτων που περιέχουν. Στη συνέχεια, θα εξετάσουμε άμεσα τα αποτελέσματα δύο τύπων τροποποίησης χρωματίνης στη διασταυρούμενη κατανομή: τριμεθυλίωση Histone H3 στη λυσίνη 4 (H3K4me3) και ακετυλίωση H4. Για το σκοπό αυτό, θα στοχεύσουμε τα ένζυμα που τροποποιούν το histone σε διασταυρούμενα hotspots εντός των διαστημάτων μας από το σύστημα CRISPR/dCas9. Αυτό το έργο θα οδηγήσει σε νέες ανακαλύψεις σχετικά με τον διασταυρούμενο έλεγχο και θα ανοίξει έναν τρόπο για τη δημιουργία τεχνητών σημείων ανασυνδυασμού για τη σύγχρονη αναπαραγωγή φυτών. (Greek)
13 August 2022
0 references
Meiotický crossover je základný proces, ktorý odomkne a generuje genetickú diverzitu, a preto je dôležitým substrátom pre šľachtenie plodín. V tomto návrhu sa snažíme charakterizovať chromatínové faktory, ktoré kontrolujú meiotické crossovery v rastlinných genómoch. Po prvé, vypracujeme nový prístup, ktorý nám umožní študovať vybrané crossoverové hotspoty v Arabidopsis s vysokým rozlíšením. Bude to založené na rekombinantnom triedení semien s fluorescenčnými reportérmi a postupnom sekvenovaní intervalov obsahujúcich crossover. Ďalej budeme priamo testovať účinky dvoch typov modifikácie chromatínu na krížovú distribúciu: Histone H3 trimetylácia pri lyzínu 4 (H3K4me3) a histone H4 acetylácia. Na tento účel sa zameriame na histone modifikujúce enzýmy na crossover hotspoty v rámci našich intervalov pomocou systému CRISPR/dCas9. Tento projekt povedie k novým objavom v oblasti kontroly kríženia a pripraví spôsob, ako vytvoriť umelé rekombinačné hotspoty pre moderné šľachtenie rastlín. (Slovak)
13 August 2022
0 references
Meiotic crossover on perustavaa laatua oleva prosessi, joka avaa ja synnyttää geneettistä monimuotoisuutta ja on siksi tärkeä viljelyalusta. Tässä ehdotuksessa pyrimme luonnehtimaan kromatiinitekijöitä, jotka ohjaavat meioottista crossoveria kasvien genomeissa. Ensinnäkin kehitämme uuden lähestymistavan, jonka avulla voimme tutkia valittuja crossover-hotspoteja Arabidopsisissa korkealla resoluutiolla. Tämä perustuu yhdistelmäsiementen lajitteluun fluoresoivien toimittajien kanssa ja peräkkäiseen risteytysvälien sekvensointiin. Seuraavaksi testaamme suoraan kahden kromatiinin muuntamisen vaikutuksia crossover-jakaumaan: Histone H3 -trimetylaatio lysiinissä 4 (H3K4me3) ja histonen H4-asetylaatio. Tätä varten kohdistamme hikikiveä muokkaavia entsyymejä crossover-hotspoteihin CRISPR/dCas9-järjestelmän aikavälein. Tämä hanke johtaa uusiin löytöihin crossover-valvonnassa ja tasoittaa keinotekoisia rekombinaatiokeskuksia nykyaikaisia kasvinjalostusta varten. (Finnish)
13 August 2022
0 references
A meiotikus crossover egy alapvető folyamat, amely felszabadítja és generálja a genetikai sokféleséget, és ezért fontos szubsztrátja a növénynemesítésnek. Ebben a javaslatban arra törekszünk, hogy jellemezzük a növényi genomokban a meiotikus kereszteződést szabályozó kromatin faktorokat. Először is olyan új megközelítést fogunk kidolgozni, amely lehetővé teszi számunkra, hogy nagy felbontású, kiválasztott crossover hotspotokat tanulmányozzunk Arabidopsisban. Ez a fluoreszkáló riporterekkel végzett rekombináns vetőmagválogatáson és a crossover-tartalmú intervallumok egymást követő szekvenálásán alapul. Ezután közvetlenül teszteljük a kromatin módosításának hatását a crossover eloszlásra: histone H3 trimetiláció lizin 4 (H3K4me3) és histone H4 acetiláció. Ebből a célból a CRISPR/dCas9 rendszer segítségével a histone-módosító enzimeket a crossover hotspotokká fogjuk megcélozni. Ez a projekt új felfedezésekhez vezet a kereszteződésben, és előkészíti az utat a modern növénynemesítés mesterséges újrakombinációs csomópontjainak létrehozásához. (Hungarian)
13 August 2022
0 references
Meiotický crossover je základní proces, který odemyká a generuje genetickou rozmanitost, a je proto důležitým substrátem pro šlechtění plodin. V tomto návrhu se snažíme charakterizovat chromatinové faktory ovládající meiotický crossover v genomech rostlin. Za prvé, budeme rozvíjet nový přístup, který nám umožní studovat vybrané crossover hotspoty v Arabidopsis s vysokým rozlišením. To bude založeno na třídění rekombinantních semen s fluorescenčními reportéry a na postupném sekvenování intervalů obsahujících křížení. Dále budeme přímo testovat účinky dvou typů modifikace chromatinu na crossover distribuci: histone H3 trimethylace při lysinu 4 (H3K4me3) a acetylace histone H4. Za tímto účelem se zaměříme na enzymy modifikující histone na crossover hotspoty v našich intervalech pomocí systému CRISPR/dCas9. Tento projekt povede k novým objevům v oblasti kontroly křížení a připraví způsob, jak vytvořit umělé rekombinační hotspoty pro moderní šlechtění rostlin. (Czech)
13 August 2022
0 references
Meiotiska krustošanās ir fundamentāls process, kas atraisa un rada ģenētisko daudzveidību, un tāpēc ir svarīgs substrāts kultūraugu audzēšanai. Šajā priekšlikumā mēs cenšamies raksturot hromatīna faktorus, kas kontrolē meiotisko krustošanu augu genomā. Pirmkārt, mēs izstrādāsim jaunu pieeju, kas ļaus mums izpētīt atsevišķus krusteniskos karstos punktus Arabidopsis ar augstu izšķirtspēju. Tas balstīsies uz rekombinantu sēklu šķirošanu ar fluorescējošiem ziņotājiem un secīgu krustenisko intervālu sekvencēšanu. Tālāk mēs tieši testēsim divu veidu hromatīna modifikācijas ietekmi uz krustenisko izplatību: histone H3 trimetilēšana lizīna 4 (H3K4me3) un histone H4 acetilēšana. Šim nolūkam mēs ar CRISPR/dCas9 sistēmu pievērsīsimies histone modificējošiem fermentiem, lai šķērsotu karstos punktus mūsu intervālos. Šis projekts novedīs pie jauniem atklājumiem par krustu kontroli un bruģēs ceļu mākslīgās rekombinācijas karsto punktu radīšanai modernai augu selekcijai. (Latvian)
13 August 2022
0 references
Is próiseas bunúsach é crossover meiotic a dhíghlasálann agus a ghineann éagsúlacht ghéiniteach agus dá bhrí sin is foshraith thábhachtach é le haghaidh pórú barr. Sa togra seo, déanaimid iarracht na fachtóirí chromatin a rialaíonn crosiompar meiotic i ngéanóim plandaí a thréithriú. Ar an gcéad dul síos, forbróimid cur chuige nua a ligfidh dúinn staidéar a dhéanamh ar teophointí roghnaithe in Arabidopsis le réiteach ard. Beidh sé seo bunaithe ar shórtáil síolta athchuingreach le tuairisceoirí fluaraiseacha agus ar sheicheamhú leanúnach na n-eatramh tras-imeallacha. Ansin, déanfaimid tástáil dhíreach ar éifeachtaí dhá chineál modhnú chromatin ar dháileadh crossover: histone H3 trimethylation ag lísín 4 (H3K4me3), agus histone H4 aicéitliú. Chun na críche sin, beidh muid ag díriú histone einsímí a mhodhnú chun hotspots crossover laistigh dár n-eatramh ag córas CRISPR/dCas9. Beidh fionnachtana nua ar an rialú trasover mar thoradh ar an tionscadal seo agus réiteoidh sé bealach chun teophointí athchuingrithe saorga a ghiniúint le haghaidh pórú plandaí nua-aimseartha. (Irish)
13 August 2022
0 references
Meiotični crossover je temeljni proces, ki odklene in ustvarja genetsko raznolikost in je zato pomemben substrat za gojenje pridelkov. V tem predlogu si prizadevamo opredeliti kromatinske dejavnike, ki nadzorujejo meiotični crossover v rastlinskih genomih. Najprej bomo razvili nov pristop, ki nam bo omogočil, da z visoko ločljivostjo preučimo izbrane navzkrižne žariščne točke v Arabidopsisu. To bo temeljilo na rekombinantnem sortiranju semen s fluorescenčnimi poročevalci in zaporednem sekvenciranju intervalov, ki vsebujejo križ. Nato bomo neposredno testirali učinke dveh vrst modifikacije kromatina na navzkrižno porazdelitev: histon H3 trimetilacija pri lizinu 4 (H3K4me3) in histon H4 acetilacija. V ta namen bomo s sistemom CRISPR/dCas9 ciljali na encime, ki spreminjajo histone, da bi presegli žariščne točke v naših intervalih. Ta projekt bo privedel do novih odkritij na crossover kontroli in bo utrl pot ustvarjanju umetnih rekombinacijskih žarišč za sodobno žlahtnjenje rastlin. (Slovenian)
13 August 2022
0 references
Мейотичният кросоувър е основен процес, който отключва и генерира генетично разнообразие и следователно е важен субстрат за отглеждане на култури. В това предложение ние се стремим да характеризираме хроматинните фактори, които контролират мейотичния кросоувър в растителните геноми. Първо, ще разработим нов подход, който ще ни позволи да изучаваме избрани кръстосани горещи точки в Arabidopsis с висока разделителна способност. Това ще се основава на рекомбинантно сортиране на семена с флуоресцентни репортери и последователно последователност на интервалите, съдържащи кръстосано покритие. След това директно ще тестваме ефектите на два вида хроматинова модификация върху разпределението на кросоувъра: Histone H3 триметилиране при лизин 4 (H3K4me3) и хистон H4 ацетилиране. За тази цел, ние ще насочим хистон модифициращи ензими към кръстосани горещи точки в рамките на нашите интервали от системата CRISPR/dCas9. Този проект ще доведе до нови открития на кросоувър контрола и ще проправи път за генериране на изкуствени горещи точки за съвременно отглеждане на растения. (Bulgarian)
13 August 2022
0 references
Il-qsim mejotiku huwa proċess fundamentali li jiftaħ u jiġġenera d-diversità ġenetika u għalhekk huwa substrat importanti għat-trobbija tal-għelejjel. F’din il-proposta, aħna nfittxu li nikkaratterizzaw il-fatturi tal-kromatina li jikkontrollaw il-qsim mejotiku fil-ġenomi tal-pjanti. L-ewwel nett, se niżviluppaw approċċ ġdid li se jippermettilna nistudjaw hotspots magħżula tal-crossover fl-Għarbi b’riżoluzzjoni għolja. Dan se jkun ibbażat fuq l-issortjar taż-żerriegħa rikombinanti ma’ reporters fluworexxenti u s-sekwenzjar suċċessiv ta’ intervalli li jkun fihom il-crossover. Li jmiss, aħna se direttament test effetti ta ‘żewġ tipi ta’ modifika chromatin fuq distribuzzjoni crossover: histone H3 trimethylation fil lysine 4 (H3K4me3), u histone H4 acetylation. Għal dan il-għan, aħna se mira enzimi li jimmodifikaw histone li crossover hotspots fi ħdan l-intervalli tagħna billi sistema CRISPR/dCas9. Dan il-proġett se jwassal għal skoperti ġodda dwar il-kontroll tal-crossover u se jwitti t-triq biex jiġu ġġenerati hotspots ta’ rikombinazzjoni artifiċjali għat-tnissil modern tal-pjanti. (Maltese)
13 August 2022
0 references
O crossover meiótico é um processo fundamental que desbloqueia e gera diversidade genética e, portanto, é um substrato importante para o melhoramento vegetal. Nesta proposta, procuramos caracterizar os fatores de cromatina que controlam o crossover meiótico em genomas vegetais. Em primeiro lugar, vamos desenvolver uma nova abordagem que irá permitir-nos estudar hotspots crossover selecionados em Arabidopsis com alta resolução. Isto será baseado na classificação de sementes recombinantes com Repórteres fluorescentes e sequenciamento sucessivo de intervalos que contêm crossover. A seguir, vamos testar diretamente os efeitos de dois tipos de modificação da cromatina na distribuição crossover: trimetilação da histona H3 com lisina 4 (H3K4me3) e acetilação da histona H4. Para este fim, vamos direcionar enzimas modificadoras de histonas para hotspots crossover dentro de nossos intervalos pelo sistema CRISPR/dCas9. Este projeto conduzirá a novas descobertas sobre o controlo cruzado e abrirá caminho à criação de pontos críticos de recombinação artificial para o melhoramento vegetal moderno. (Portuguese)
13 August 2022
0 references
Meiotisk crossover er en grundlæggende proces, der låser op og genererer genetisk mangfoldighed og derfor er et vigtigt substrat for afgrødeavl. I dette forslag søger vi at karakterisere kromatinfaktorerne, der styrer meiotisk krydsning i plantegenomer. For det første vil vi udvikle en ny tilgang, som vil give os mulighed for at studere udvalgte crossover hotspots i Arabidopsis med høj opløsning. Dette vil være baseret på rekombinant frøsortering med fluorescerende reportere og successive sekventering af krydsende intervaller. Dernæst vil vi direkte teste virkningerne af to typer kromatin modifikation på crossover distribution: histone H3-trimethylering ved lysin 4 (H3K4me3) og histone H4 acetylation. Til dette formål vil vi målrette histonemodificerende enzymer til crossover hotspots inden for vores intervaller ved CRISPR/dCas9 system. Dette projekt vil føre til nye opdagelser på crossover-kontrollen og vil bane vej for at skabe kunstige rekombinationshotspots til moderne planteforædling. (Danish)
13 August 2022
0 references
Încrucișarea meiotică este un proces fundamental care deblochează și generează diversitatea genetică și, prin urmare, este un substrat important pentru creșterea culturilor. În această propunere, încercăm să caracterizăm factorii de cromatină care controlează încrucișarea meiotică în genomul plantelor. În primul rând, vom dezvolta o nouă abordare care ne va permite să studiem hotspoturile crossover selectate în Arabidopsis cu rezoluție înaltă. Aceasta se va baza pe sortarea semințelor recombinante cu reporteri fluorescenti și secvențierea succesivă a intervalelor care conțin încrucișare. Apoi, vom testa direct efectele a două tipuri de modificări ale cromatinei asupra distribuției încrucișate: histonă H3 trimetilare la lizină 4 (H3K4me3) și histonă H4 acetilație. În acest scop, vom direcționa enzimele de modificare histonică către hotspoturi încrucișate în intervalele noastre prin sistemul CRISPR/dCas9. Acest proiect va conduce la noi descoperiri privind controlul încrucișat și va deschide o modalitate de a genera hotspoturi de recombinare artificială pentru ameliorarea modernă a plantelor. (Romanian)
13 August 2022
0 references
Meiotic crossover är en grundläggande process som låser upp och genererar genetisk mångfald och är därför ett viktigt substrat för växtförädling. I detta förslag försöker vi karakterisera kromatinfaktorerna som kontrollerar meiotiska korsningar i växtgenom. För det första kommer vi att utveckla ett nytt tillvägagångssätt som gör det möjligt för oss att studera utvalda crossover hotspots i Arabidopsis med hög upplösning. Detta kommer att baseras på rekombinant frösortering med fluorescerande reportrar och successiv sekvensering av crossover-innehållande intervaller. Därefter kommer vi att direkt testa effekter av två typer av kromatin modifiering på crossover distribution: histone H3 trimetylering vid lysin 4 (H3K4me3) och histone H4 acetylering. För detta ändamål kommer vi att rikta histonemodifierande enzymer till crossover hotspots inom våra intervaller med CRISPR/dCas9-systemet. Detta projekt kommer att leda till nya upptäckter om crossover-kontrollen och kommer att bana väg för att generera artificiella rekombinationscentrum för modern växtförädling. (Swedish)
13 August 2022
0 references
Cały Kraj
0 references
6 July 2023
0 references
Identifiers
POIR.04.04.00-00-5C0F/17
0 references