MULTIFUNCTIONALITY OF PIPX AND SIGNALING NETWORKS IN THE CYANOBACTERIA MODEL SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 (Q3189332): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(Created claim: summary (P836): CYANOBACTERIA PERFORM OXIGENICAN PHOTOSYNTHESIS AND COLONISE THE MAJORITY OF ILLUMINATED ECOSYSTEMS, SO THEY HAVE A GREAT IMPACT ON GLOBAL CARBON AND NITROGEN CYCLES. HOWEVER, DESPITE ITS ECOLOGICAL SUCCESS AND BIOTECHNOLOGICAL IMPORTANCE, THE MECHANISMS RESPONSIBLE FOR THIS VERSATILITY AND CAPACITY FOR ENVIRONMENTAL ADAPTATION REMAIN UNKNOWN. IN THIS CONTEXT, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY GENETICAL MANIPUATION, IS...) |
(Changed label, description and/or aliases in pt) |
||||||||||||||
| (10 intermediate revisions by 2 users not shown) | |||||||||||||||
| label / fr | label / fr | ||||||||||||||
MULTIFONCTIONNALITÉ DU PIPX ET DES RÉSEAUX DE SIGNALISATION DANS LE MODÈLE CYANOBACTÉRIE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / de | label / de | ||||||||||||||
MULTIFUNKTIONALITÄT VON PIPX UND SIGNALNETZWERKEN IM CYANOBAKTERIENMODELL SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / nl | label / nl | ||||||||||||||
MULTIFUNCTIONALITEIT VAN PIPX EN SIGNAALNETWERKEN IN HET CYANOBACTERIA MODEL SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / it | label / it | ||||||||||||||
MULTIFUNZIONALITÀ DI PIPX E RETI DI SEGNALAZIONE NEL MODELLO DI CIANOBATTERI SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / et | label / et | ||||||||||||||
PIPX-I JA SIGNAALIVÕRKUDE MULTIFUNKTSIONAALSUS TSÜANOBAKTERITE MUDELIS SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / lt | label / lt | ||||||||||||||
PIPX IR SIGNALIZAVIMO TINKLŲ DAUGIAFUNKCIŠKUMAS CIANOBAKTERIJŲ MODELYJE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / hr | label / hr | ||||||||||||||
MULTIFUNKCIONALNOST PIPX I SIGNALNE MREŽE U CIJANOBAKTERIJA MODEL SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / el | label / el | ||||||||||||||
ΠΟΛΥΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΌΤΗΤΑ ΤΟΥ PIPX ΚΑΙ ΤΩΝ ΔΙΚΤΎΩΝ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΣΤΟ ΚΥΑΝΟΒΑΚΤΗΡΊΔΙΟ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / sk | label / sk | ||||||||||||||
MULTIFUNKČNOSŤ PIPX A SIGNALIZAČNÝCH SIETÍ V MODELI SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / fi | label / fi | ||||||||||||||
PIPX- JA SIGNAALIVERKOSTOJEN MONITOIMISUUS SYANOBAKTEERIMALLISSA SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / pl | label / pl | ||||||||||||||
WIELOFUNKCYJNOŚĆ SIECI PIPX I SYGNALIZACYJNYCH W MODELU CYJANOBAKTERII SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / hu | label / hu | ||||||||||||||
A PIPX ÉS A JELZŐHÁLÓZATOK MULTIFUNKCIONALITÁSA A SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP CIANOBAKTÉRIUM MODELLBEN. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / cs | label / cs | ||||||||||||||
MULTIFUNKČNOST PIPX A SIGNALIZAČNÍCH SÍTÍ V SINICOVÉM MODELU SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / lv | label / lv | ||||||||||||||
PIPX DAUDZFUNKCIONALITĀTE UN SIGNĀLU TĪKLI CYANOBACTERIA MODELĪ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / ga | label / ga | ||||||||||||||
ILFHEIDHMEACHT PIPX AGUS LÍONRAÍ COMHARTHAÍOCHTA SA TSAMHAIL CYANOBACTERIA SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / sl | label / sl | ||||||||||||||
VEČFUNKCIONALNOST PIPX IN SIGNALNA OMREŽJA V MODELU CIANOBAKTERIJE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / bg | label / bg | ||||||||||||||
МНОГОФУНКЦИОНАЛНОСТ НА PIPX И СИГНАЛНИ МРЕЖИ В ЦИАНОБАКТЕРИАЛНИЯ МОДЕЛ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / mt | label / mt | ||||||||||||||
IL-MULTIFUNZJONALITÀ TAL-PIPX U N-NETWERKS TAS-SINJALAR FIL-MUDELL TAĊ-ĊJANOBATTERJI SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / pt | label / pt | ||||||||||||||
MULTIFUNCIONALIDADE DAS REDES PIPX E DE SINALIZAÇÃO NO MODELO CYANOBACTERIA SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / da | label / da | ||||||||||||||
MULTIFUNKTIONALITET AF PIPX OG SIGNALERING NETVÆRK I CYANOBAKTERIER MODEL SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / ro | label / ro | ||||||||||||||
MULTIFUNCȚIONALITATEA PIPX ȘI REȚELELE DE SEMNALIZARE ÎN MODELUL CIANOBACTERIILOR SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| label / sv | label / sv | ||||||||||||||
MULTIFUNKTIONALITET AV PIPX OCH SIGNALNÄTVERK I CYANOBAKTERIER MODELLEN SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 | |||||||||||||||
| description / bg | description / bg | ||||||||||||||
Проект Q3189332 в Испания | |||||||||||||||
| description / hr | description / hr | ||||||||||||||
Projekt Q3189332 u Španjolskoj | |||||||||||||||
| description / hu | description / hu | ||||||||||||||
Projekt Q3189332 Spanyolországban | |||||||||||||||
| description / cs | description / cs | ||||||||||||||
Projekt Q3189332 ve Španělsku | |||||||||||||||
| description / da | description / da | ||||||||||||||
Projekt Q3189332 i Spanien | |||||||||||||||
| description / nl | description / nl | ||||||||||||||
Project Q3189332 in Spanje | |||||||||||||||
| description / et | description / et | ||||||||||||||
Projekt Q3189332 Hispaanias | |||||||||||||||
| description / fi | description / fi | ||||||||||||||
Projekti Q3189332 Espanjassa | |||||||||||||||
| description / fr | description / fr | ||||||||||||||
Projet Q3189332 en Espagne | |||||||||||||||
| description / de | description / de | ||||||||||||||
Projekt Q3189332 in Spanien | |||||||||||||||
| description / el | description / el | ||||||||||||||
Έργο Q3189332 στην Ισπανία | |||||||||||||||
| description / ga | description / ga | ||||||||||||||
Tionscadal Q3189332 sa Spáinn | |||||||||||||||
| description / it | description / it | ||||||||||||||
Progetto Q3189332 in Spagna | |||||||||||||||
| description / lv | description / lv | ||||||||||||||
Projekts Q3189332 Spānijā | |||||||||||||||
| description / lt | description / lt | ||||||||||||||
Projektas Q3189332 Ispanijoje | |||||||||||||||
| description / mt | description / mt | ||||||||||||||
Proġett Q3189332 fi Spanja | |||||||||||||||
| description / pl | description / pl | ||||||||||||||
Projekt Q3189332 w Hiszpanii | |||||||||||||||
| description / pt | description / pt | ||||||||||||||
Projeto Q3189332 na Espanha | |||||||||||||||
| description / ro | description / ro | ||||||||||||||
Proiectul Q3189332 în Spania | |||||||||||||||
| description / sk | description / sk | ||||||||||||||
Projekt Q3189332 v Španielsku | |||||||||||||||
| description / sl | description / sl | ||||||||||||||
Projekt Q3189332 v Španiji | |||||||||||||||
| description / es | description / es | ||||||||||||||
Proyecto Q3189332 en España | |||||||||||||||
| description / sv | description / sv | ||||||||||||||
Projekt Q3189332 i Spanien | |||||||||||||||
| Property / budget | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / budget: 130,438.0 Euro / rank | |||||||||||||||
| Property / co-financing rate | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / co-financing rate: 50.0 percent / rank | |||||||||||||||
| Property / EU contribution | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / EU contribution: 65,219.0 Euro / rank | |||||||||||||||
| Property / summary: CYANOBACTERIA PERFORM OXIGENICAN PHOTOSYNTHESIS AND COLONISE THE MAJORITY OF ILLUMINATED ECOSYSTEMS, SO THEY HAVE A GREAT IMPACT ON GLOBAL CARBON AND NITROGEN CYCLES. HOWEVER, DESPITE ITS ECOLOGICAL SUCCESS AND BIOTECHNOLOGICAL IMPORTANCE, THE MECHANISMS RESPONSIBLE FOR THIS VERSATILITY AND CAPACITY FOR ENVIRONMENTAL ADAPTATION REMAIN UNKNOWN. IN THIS CONTEXT, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY GENETICAL MANIPUATION, IS an EXCELLENT SYSTEM FOR THE STUDY OF THE REGULATING INTERACTIONS PERMITING THE CIANOBACTERIAS INTEGRATED AND RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ The primary proposition of this project is to characterise the MULTIFUNCIONAL PIPX PROTEIN, a UN FACTOR OF CIANOBACTERIAS CONCERNING transcriptional REGULators, Signalising PROTEINS AND METABOLICAL ENZIMAS IN A NETWORK OF COMPLETE AND DINAMIC INTERATIONS. USING IN VIVO CO-PURIFICATION TRIALS WITH THE FLAG-PIPX PROTEIN, WE AIM TO IDENTIFY NEW COMPONENTS OF THE SIGNALING PATHWAYS IN WHICH PIPX PARTICIPATES, IN ADDITION TO VALIDATING INTERACTIONS AND PREVIOUS RESULTS FROM DOUBLE HYBRIDISED PIPX (XIP PROTEINS), TRIPLE HYBRIDISATION (PXR, IDENTIFIED USING BOTH PII AND PIPX AS BAIT) OR IN SILICO ANALYSIS (ORF2060). TO CHARACTERISE INTERACTIONS (BETWEEN PROTEINS, AND WITH POSSIBLE EFFECTORS) IN GREATER DETAIL, WE WILL USE IN VITRO AND/OR DOUBLE (TRIPLE) HYBRID TRIALS WITH COMPLETE PROTEINS, MUTANT DERIVATIVES AND/OR SPECIFIC DOMAINS. WE WILL RESORT TO THE USE OF CONFOCAL MICROSCOPY TO DETERMINE WHETHER ANY OF THE PROTEINS STUDIED CO-LOCALISES IN THE POLAR SPOTLIGHTS OF PIPX, WHOSE DYNAMIC LOCATION RESPONDS TO DARK LIGHT CYCLES. TO DESCRIBE PIPX-REGULATED GENES INDEPENDENTLY OF NTCA, WE WILL PERFORM TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS WITH A STRAIN PANEL, UNDER DIFFERENT CULTURE CONDITIONS, WHICH INCLUDES VARIOUS TYPES OF DERIVATIVES OF THE PIPX GENE, AND OTHER RELATED GENES. THE DATA GENERATED WILL BE USED TO CLASSIFY DIFFERENTIALLY REGULATED GENES INTO GROUPS WITH COMMON REGULATORY STANDARDS, TO THEN ADDRESS THE DIFFERENT REGULATORY MECHANISMS INVOLVED. WE WILL INVESTIGATE THE PXR UNION SITES USING CHIP-SEQ, INFORMATION THAT WE WILL INTEGRATE WITH THAT FROM THE ANALYSIS OF TRANSCRIPTOMICA. WE WILL INVESTIGATE THE POSSIBLE METILACION OF ARGININS IN PIPX ALPHA-HELICE1 AND, WHERE APPROPRIATE, STUDY THE FUNCTIONAL MEANING AND GENETIC DETERMINANTS OF THE MODIFICATIONS. BOTH CANDIDATE METHYLASE(S) AND OTHER PROTEINS FOUND IN PROTEIN-PROTEIN AND/OR IN SILICO INTERACTIONS WILL BE ANALYSED. THE INTENTION IS TO INACTIVE THE CORRESPONDING GENES AND RELEVANT PHENOTYPIC ANALYSIS. _x000D_ we will also study MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, A dramatic adaptation to different types of environment, in which NBLR and NTCA-PIPX, enter other Regulators, Converge for the Promotor of the NBLA, ESENTIAL FOR THE DEGRAtation of Physiobilisomas. WE ARE INTERESTED IN DECIPHERING SOME OF THE REGULATORY COMPLEXITIES, SUCH AS THE MECHANISM OF ACTIVATION AND FUNCTION OF NBLR AND IN THE REGULATORY INTERACTIONS OF THE DIFFERENT WAYS THAT CONVERGE IN THE NBLA PROMOTER. MANY OF THE METHODOLOGICAL STRATEGIES PROPOSED IN RELATION TO PIPX, WILL ALSO BE USED WITH NBLR. (English) / qualifier | |||||||||||||||
readability score: 0.6318786073816945
| |||||||||||||||
| Property / postal code | |||||||||||||||
| Property / postal code: 03014 / rank | |||||||||||||||
| Property / location (string) | |||||||||||||||
| Property / location (string): Alicante/Alacant / rank | |||||||||||||||
| Property / coordinate location | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / coordinate location: 38°20'37.10"N, 0°29'17.41"W / rank | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS: Alicante / rank | |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
LES CYANOBACTÉRIES EFFECTUENT LA PHOTOSYNTHÈSE OXIGENICAN ET COLONISENT LA MAJORITÉ DES ÉCOSYSTÈMES ILLUMINÉS, DE SORTE QU’ELLES ONT UN GRAND IMPACT SUR LES CYCLES MONDIAUX DU CARBONE ET DE L’AZOTE. TOUTEFOIS, MALGRÉ SON SUCCÈS ÉCOLOGIQUE ET SON IMPORTANCE BIOTECHNOLOGIQUE, LES MÉCANISMES RESPONSABLES DE CETTE POLYVALENCE ET DE CETTE CAPACITÉ D’ADAPTATION À L’ENVIRONNEMENT RESTENT INCONNUS. DANS CE CONTEXTE, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, DE LA MANIPUATION GÉNÉRALE DE LA FACILITÉ RELATIVE, EST un SYSTÈME EXCELLENT POUR L’ÉTUDE DES INTERACTIONS RÉGLEMENTAIRES autorisant les CIANOBACTERIAS INTÉGRÉES ET RÉPONDERLES AUX DYSTEMES ENVIRONNEMENTAUX DYSTÈMES DYSTEMAUX._x000D_La proposition principale de ce projet est de caractériser le PROTEIN PIPX multifuncional, un FACTEUR UN DES CIANOBACTERIAS CONCERNANT les régulateurs transcriptionnels, les PROTÉINS DE Signalisation et les enzimes métaboliques dans un réseau d’interations COMPLETE ET DINAMIC. À L’AIDE D’ESSAIS IN VIVO DE CO-PURIFICATION AVEC LA PROTÉINE FLAG-PIPX, NOUS CHERCHONS À IDENTIFIER DE NOUVEAUX COMPOSANTS DES VOIES DE SIGNALISATION AUXQUELLES PIPX PARTICIPE, EN PLUS DE VALIDER LES INTERACTIONS ET LES RÉSULTATS ANTÉRIEURS DE LA DOUBLE PROTÉINE HYBRIDE PIPX (PROTÉINES XIP), DE LA TRIPLE HYBRIDATION (PXR, IDENTIFIÉE À LA FOIS PAR PII ET PIPX COMME APPÂT) OU DANS L’ANALYSE SILICO (ORF2060). POUR CARACTÉRISER PLUS EN DÉTAIL LES INTERACTIONS (ENTRE LES PROTÉINES, ET AVEC D’ÉVENTUELS EFFECTEURS), NOUS UTILISERONS DES ESSAIS HYBRIDES IN VITRO ET/OU DOUBLES (TRIPLES) AVEC DES PROTÉINES COMPLÈTES, DES DÉRIVÉS MUTANTS ET/OU DES DOMAINES SPÉCIFIQUES. NOUS ALLONS RECOURIR À LA MICROSCOPIE CONFOCALE POUR DÉTERMINER SI L’UNE DES PROTÉINES ÉTUDIÉES CO-LOCALISE DANS LES PROJECTEURS POLAIRES DE PIPX, DONT L’EMPLACEMENT DYNAMIQUE RÉPOND AUX CYCLES DE LUMIÈRE FONCÉE. POUR DÉCRIRE LES GÈNES RÉGLEMENTÉS PAR PIPX INDÉPENDAMMENT DU NTCA, NOUS EFFECTUERONS UNE ANALYSE TRANSCRIPTOMIQUE AVEC UN PANNEAU DE SOUCHE, DANS DIFFÉRENTES CONDITIONS DE CULTURE, QUI COMPREND DIFFÉRENTS TYPES DE DÉRIVÉS DU GÈNE PIPX ET D’AUTRES GÈNES APPARENTÉS. LES DONNÉES GÉNÉRÉES SERVIRONT À CLASSER LES GÈNES À RÉGULATION DIFFÉRENCIÉE EN GROUPES AYANT DES NORMES RÉGLEMENTAIRES COMMUNES, AFIN DE TRAITER ENSUITE DES DIFFÉRENTS MÉCANISMES DE RÉGLEMENTATION EN CAUSE. NOUS ÉTUDIERONS LES SITES DE PXR UNION À L’AIDE DE CHIP-SEQ, INFORMATIONS QUE NOUS INTÉGRERONS À CELLE DE L’ANALYSE DE TRANSCRIPTOMICA. NOUS ÉTUDIERONS LA POSSIBILITÉ DE METILACION D’ARGININS DANS PIPX ALPHA-HELICE1 ET, LE CAS ÉCHÉANT, ÉTUDIERONS LA SIGNIFICATION FONCTIONNELLE ET LES DÉTERMINANTS GÉNÉTIQUES DES MODIFICATIONS. LA OU LES MÉTHYLASES CANDIDATES ET D’AUTRES PROTÉINES PRÉSENTES DANS LES INTERACTIONS PROTÉINE-PROTÉINE ET/OU SILICO SERONT ANALYSÉES. L’INTENTION EST D’INACTIVER LES GÈNES CORRESPONDANTS ET L’ANALYSE PHÉNOTYPIQUE PERTINENTE. _x000D_ nous étudierons également les DÉTAILS MOLECULAIRES DANS LA SEMINALISATION FOIS LE PROCESSUS DE Chlorose, Une adaptation dramatique à différents types d’environnement, dans laquelle NBLR et NTCA-PIPX, entrent dans d’autres régulateurs, Converge pour le promoteur de la NBLA, esentiel POUR LA Dégratation des Physiobilisomas. NOUS SOMMES INTÉRESSÉS À DÉCHIFFRER CERTAINES DES COMPLEXITÉS RÉGLEMENTAIRES, COMME LE MÉCANISME D’ACTIVATION ET DE FONCTION DE LA NBLR ET LES INTERACTIONS RÉGLEMENTAIRES DES DIFFÉRENTES FAÇONS DE CONVERGER AVEC LE PROMOTEUR DE LA LNLB. BON NOMBRE DES STRATÉGIES MÉTHODOLOGIQUES PROPOSÉES PAR RAPPORT À PIPX SERONT ÉGALEMENT UTILISÉES AVEC LE NBLR. (French) | |||||||||||||||
| Property / summary: LES CYANOBACTÉRIES EFFECTUENT LA PHOTOSYNTHÈSE OXIGENICAN ET COLONISENT LA MAJORITÉ DES ÉCOSYSTÈMES ILLUMINÉS, DE SORTE QU’ELLES ONT UN GRAND IMPACT SUR LES CYCLES MONDIAUX DU CARBONE ET DE L’AZOTE. TOUTEFOIS, MALGRÉ SON SUCCÈS ÉCOLOGIQUE ET SON IMPORTANCE BIOTECHNOLOGIQUE, LES MÉCANISMES RESPONSABLES DE CETTE POLYVALENCE ET DE CETTE CAPACITÉ D’ADAPTATION À L’ENVIRONNEMENT RESTENT INCONNUS. DANS CE CONTEXTE, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, DE LA MANIPUATION GÉNÉRALE DE LA FACILITÉ RELATIVE, EST un SYSTÈME EXCELLENT POUR L’ÉTUDE DES INTERACTIONS RÉGLEMENTAIRES autorisant les CIANOBACTERIAS INTÉGRÉES ET RÉPONDERLES AUX DYSTEMES ENVIRONNEMENTAUX DYSTÈMES DYSTEMAUX._x000D_La proposition principale de ce projet est de caractériser le PROTEIN PIPX multifuncional, un FACTEUR UN DES CIANOBACTERIAS CONCERNANT les régulateurs transcriptionnels, les PROTÉINS DE Signalisation et les enzimes métaboliques dans un réseau d’interations COMPLETE ET DINAMIC. À L’AIDE D’ESSAIS IN VIVO DE CO-PURIFICATION AVEC LA PROTÉINE FLAG-PIPX, NOUS CHERCHONS À IDENTIFIER DE NOUVEAUX COMPOSANTS DES VOIES DE SIGNALISATION AUXQUELLES PIPX PARTICIPE, EN PLUS DE VALIDER LES INTERACTIONS ET LES RÉSULTATS ANTÉRIEURS DE LA DOUBLE PROTÉINE HYBRIDE PIPX (PROTÉINES XIP), DE LA TRIPLE HYBRIDATION (PXR, IDENTIFIÉE À LA FOIS PAR PII ET PIPX COMME APPÂT) OU DANS L’ANALYSE SILICO (ORF2060). POUR CARACTÉRISER PLUS EN DÉTAIL LES INTERACTIONS (ENTRE LES PROTÉINES, ET AVEC D’ÉVENTUELS EFFECTEURS), NOUS UTILISERONS DES ESSAIS HYBRIDES IN VITRO ET/OU DOUBLES (TRIPLES) AVEC DES PROTÉINES COMPLÈTES, DES DÉRIVÉS MUTANTS ET/OU DES DOMAINES SPÉCIFIQUES. NOUS ALLONS RECOURIR À LA MICROSCOPIE CONFOCALE POUR DÉTERMINER SI L’UNE DES PROTÉINES ÉTUDIÉES CO-LOCALISE DANS LES PROJECTEURS POLAIRES DE PIPX, DONT L’EMPLACEMENT DYNAMIQUE RÉPOND AUX CYCLES DE LUMIÈRE FONCÉE. POUR DÉCRIRE LES GÈNES RÉGLEMENTÉS PAR PIPX INDÉPENDAMMENT DU NTCA, NOUS EFFECTUERONS UNE ANALYSE TRANSCRIPTOMIQUE AVEC UN PANNEAU DE SOUCHE, DANS DIFFÉRENTES CONDITIONS DE CULTURE, QUI COMPREND DIFFÉRENTS TYPES DE DÉRIVÉS DU GÈNE PIPX ET D’AUTRES GÈNES APPARENTÉS. LES DONNÉES GÉNÉRÉES SERVIRONT À CLASSER LES GÈNES À RÉGULATION DIFFÉRENCIÉE EN GROUPES AYANT DES NORMES RÉGLEMENTAIRES COMMUNES, AFIN DE TRAITER ENSUITE DES DIFFÉRENTS MÉCANISMES DE RÉGLEMENTATION EN CAUSE. NOUS ÉTUDIERONS LES SITES DE PXR UNION À L’AIDE DE CHIP-SEQ, INFORMATIONS QUE NOUS INTÉGRERONS À CELLE DE L’ANALYSE DE TRANSCRIPTOMICA. NOUS ÉTUDIERONS LA POSSIBILITÉ DE METILACION D’ARGININS DANS PIPX ALPHA-HELICE1 ET, LE CAS ÉCHÉANT, ÉTUDIERONS LA SIGNIFICATION FONCTIONNELLE ET LES DÉTERMINANTS GÉNÉTIQUES DES MODIFICATIONS. LA OU LES MÉTHYLASES CANDIDATES ET D’AUTRES PROTÉINES PRÉSENTES DANS LES INTERACTIONS PROTÉINE-PROTÉINE ET/OU SILICO SERONT ANALYSÉES. L’INTENTION EST D’INACTIVER LES GÈNES CORRESPONDANTS ET L’ANALYSE PHÉNOTYPIQUE PERTINENTE. _x000D_ nous étudierons également les DÉTAILS MOLECULAIRES DANS LA SEMINALISATION FOIS LE PROCESSUS DE Chlorose, Une adaptation dramatique à différents types d’environnement, dans laquelle NBLR et NTCA-PIPX, entrent dans d’autres régulateurs, Converge pour le promoteur de la NBLA, esentiel POUR LA Dégratation des Physiobilisomas. NOUS SOMMES INTÉRESSÉS À DÉCHIFFRER CERTAINES DES COMPLEXITÉS RÉGLEMENTAIRES, COMME LE MÉCANISME D’ACTIVATION ET DE FONCTION DE LA NBLR ET LES INTERACTIONS RÉGLEMENTAIRES DES DIFFÉRENTES FAÇONS DE CONVERGER AVEC LE PROMOTEUR DE LA LNLB. BON NOMBRE DES STRATÉGIES MÉTHODOLOGIQUES PROPOSÉES PAR RAPPORT À PIPX SERONT ÉGALEMENT UTILISÉES AVEC LE NBLR. (French) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: LES CYANOBACTÉRIES EFFECTUENT LA PHOTOSYNTHÈSE OXIGENICAN ET COLONISENT LA MAJORITÉ DES ÉCOSYSTÈMES ILLUMINÉS, DE SORTE QU’ELLES ONT UN GRAND IMPACT SUR LES CYCLES MONDIAUX DU CARBONE ET DE L’AZOTE. TOUTEFOIS, MALGRÉ SON SUCCÈS ÉCOLOGIQUE ET SON IMPORTANCE BIOTECHNOLOGIQUE, LES MÉCANISMES RESPONSABLES DE CETTE POLYVALENCE ET DE CETTE CAPACITÉ D’ADAPTATION À L’ENVIRONNEMENT RESTENT INCONNUS. DANS CE CONTEXTE, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, DE LA MANIPUATION GÉNÉRALE DE LA FACILITÉ RELATIVE, EST un SYSTÈME EXCELLENT POUR L’ÉTUDE DES INTERACTIONS RÉGLEMENTAIRES autorisant les CIANOBACTERIAS INTÉGRÉES ET RÉPONDERLES AUX DYSTEMES ENVIRONNEMENTAUX DYSTÈMES DYSTEMAUX._x000D_La proposition principale de ce projet est de caractériser le PROTEIN PIPX multifuncional, un FACTEUR UN DES CIANOBACTERIAS CONCERNANT les régulateurs transcriptionnels, les PROTÉINS DE Signalisation et les enzimes métaboliques dans un réseau d’interations COMPLETE ET DINAMIC. À L’AIDE D’ESSAIS IN VIVO DE CO-PURIFICATION AVEC LA PROTÉINE FLAG-PIPX, NOUS CHERCHONS À IDENTIFIER DE NOUVEAUX COMPOSANTS DES VOIES DE SIGNALISATION AUXQUELLES PIPX PARTICIPE, EN PLUS DE VALIDER LES INTERACTIONS ET LES RÉSULTATS ANTÉRIEURS DE LA DOUBLE PROTÉINE HYBRIDE PIPX (PROTÉINES XIP), DE LA TRIPLE HYBRIDATION (PXR, IDENTIFIÉE À LA FOIS PAR PII ET PIPX COMME APPÂT) OU DANS L’ANALYSE SILICO (ORF2060). POUR CARACTÉRISER PLUS EN DÉTAIL LES INTERACTIONS (ENTRE LES PROTÉINES, ET AVEC D’ÉVENTUELS EFFECTEURS), NOUS UTILISERONS DES ESSAIS HYBRIDES IN VITRO ET/OU DOUBLES (TRIPLES) AVEC DES PROTÉINES COMPLÈTES, DES DÉRIVÉS MUTANTS ET/OU DES DOMAINES SPÉCIFIQUES. NOUS ALLONS RECOURIR À LA MICROSCOPIE CONFOCALE POUR DÉTERMINER SI L’UNE DES PROTÉINES ÉTUDIÉES CO-LOCALISE DANS LES PROJECTEURS POLAIRES DE PIPX, DONT L’EMPLACEMENT DYNAMIQUE RÉPOND AUX CYCLES DE LUMIÈRE FONCÉE. POUR DÉCRIRE LES GÈNES RÉGLEMENTÉS PAR PIPX INDÉPENDAMMENT DU NTCA, NOUS EFFECTUERONS UNE ANALYSE TRANSCRIPTOMIQUE AVEC UN PANNEAU DE SOUCHE, DANS DIFFÉRENTES CONDITIONS DE CULTURE, QUI COMPREND DIFFÉRENTS TYPES DE DÉRIVÉS DU GÈNE PIPX ET D’AUTRES GÈNES APPARENTÉS. LES DONNÉES GÉNÉRÉES SERVIRONT À CLASSER LES GÈNES À RÉGULATION DIFFÉRENCIÉE EN GROUPES AYANT DES NORMES RÉGLEMENTAIRES COMMUNES, AFIN DE TRAITER ENSUITE DES DIFFÉRENTS MÉCANISMES DE RÉGLEMENTATION EN CAUSE. NOUS ÉTUDIERONS LES SITES DE PXR UNION À L’AIDE DE CHIP-SEQ, INFORMATIONS QUE NOUS INTÉGRERONS À CELLE DE L’ANALYSE DE TRANSCRIPTOMICA. NOUS ÉTUDIERONS LA POSSIBILITÉ DE METILACION D’ARGININS DANS PIPX ALPHA-HELICE1 ET, LE CAS ÉCHÉANT, ÉTUDIERONS LA SIGNIFICATION FONCTIONNELLE ET LES DÉTERMINANTS GÉNÉTIQUES DES MODIFICATIONS. LA OU LES MÉTHYLASES CANDIDATES ET D’AUTRES PROTÉINES PRÉSENTES DANS LES INTERACTIONS PROTÉINE-PROTÉINE ET/OU SILICO SERONT ANALYSÉES. L’INTENTION EST D’INACTIVER LES GÈNES CORRESPONDANTS ET L’ANALYSE PHÉNOTYPIQUE PERTINENTE. _x000D_ nous étudierons également les DÉTAILS MOLECULAIRES DANS LA SEMINALISATION FOIS LE PROCESSUS DE Chlorose, Une adaptation dramatique à différents types d’environnement, dans laquelle NBLR et NTCA-PIPX, entrent dans d’autres régulateurs, Converge pour le promoteur de la NBLA, esentiel POUR LA Dégratation des Physiobilisomas. NOUS SOMMES INTÉRESSÉS À DÉCHIFFRER CERTAINES DES COMPLEXITÉS RÉGLEMENTAIRES, COMME LE MÉCANISME D’ACTIVATION ET DE FONCTION DE LA NBLR ET LES INTERACTIONS RÉGLEMENTAIRES DES DIFFÉRENTES FAÇONS DE CONVERGER AVEC LE PROMOTEUR DE LA LNLB. BON NOMBRE DES STRATÉGIES MÉTHODOLOGIQUES PROPOSÉES PAR RAPPORT À PIPX SERONT ÉGALEMENT UTILISÉES AVEC LE NBLR. (French) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 December 2021
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
CYANOBAKTERIEN FÜHREN OXIGENICAN PHOTOSYNTHESE DURCH UND KOLONISIEREN DIE MEISTEN BELEUCHTETEN ÖKOSYSTEME, SO DASS SIE EINEN GROSSEN EINFLUSS AUF GLOBALE KOHLENSTOFF- UND STICKSTOFFZYKLEN HABEN. TROTZ SEINES ÖKOLOGISCHEN ERFOLGS UND SEINER BIOTECHNOLOGISCHEN BEDEUTUNG BLEIBEN DIE MECHANISMEN, DIE FÜR DIESE VIELSEITIGKEIT UND DIE FÄHIGKEIT ZUR ANPASSUNG AN DIE UMWELT VERANTWORTLICH SIND, UNBEKANNT. IN DIESEM ZUSAMMENHANG SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY genetische MANIPUATION, ist ein EXCELLENT SYSTEM FÜR DIE STUDIE DER VERORDNUNG INTERACTIONEN, die das CIANOBACTERIAS INTEGRATED und RESPONDERLY ZU MEINE DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS erlauben._x000D_ Der primäre Vorschlag dieses Projekts ist die Charakterisierung des multifuncionalen PIPX PROTEIN, ein UN FACTOR OF CIANOBACTERIAS CONCERNING Transkriptionsregulatoren, Signalisierung von PROTEINS und metabolische enzimas in einem NETWORK OF COMPLETE UND DINAMIC Interationen. MIT HILFE VON IN-VIVO-KO-REINIGUNGSVERSUCHEN MIT DEM FLAG-PIPX-PROTEIN WOLLEN WIR NEUE KOMPONENTEN DER SIGNALWEGE IDENTIFIZIEREN, AN DENEN PIPX TEILNIMMT, NEBEN DER VALIDIERUNG VON WECHSELWIRKUNGEN UND FRÜHEREN ERGEBNISSEN AUS DOPPELT HYBRIDISIERTEN PIPX-PROTEINEN (XIP-PROTEINE), DREIFACHER HYBRIDISIERUNG (PXR, IDENTIFIZIERT MIT PII UND PIPX ALS KÖDER) ODER IN DER SILICO-ANALYSE (ORF2060). UM INTERAKTIONEN (ZWISCHEN PROTEINEN UND MÖGLICHEN EFFEKTOREN) IM DETAIL ZU CHARAKTERISIEREN, WERDEN WIR IN VITRO UND/ODER DOPPEL- (DREIFACHE) HYBRIDVERSUCHE MIT VOLLSTÄNDIGEN PROTEINEN, MUTANTENDERIVATEN UND/ODER BESTIMMTEN DOMÄNEN VERWENDEN. WIR WERDEN AUF DIE VERWENDUNG DER KONFOKALEN MIKROSKOPIE ZURÜCKGREIFEN, UM FESTZUSTELLEN, OB SICH EINES DER UNTERSUCHTEN PROTEINE IN DEN POLARSTRAHLERN VON PIPX BEFINDET, DEREN DYNAMISCHE LAGE AUF DUNKLE LICHTZYKLEN REAGIERT. UM PIPX-GEREGELTE GENE UNABHÄNGIG VON NTCA ZU BESCHREIBEN, WERDEN WIR EINE TRANSKRIPTOM-ANALYSE MIT EINEM STAMMPANEL UNTER UNTERSCHIEDLICHEN KULTURBEDINGUNGEN DURCHFÜHREN, DIE VERSCHIEDENE ARTEN VON DERIVATEN DES PIPX-GENS UND ANDERE VERWANDTE GENE UMFASST. DIE ERZEUGTEN DATEN WERDEN VERWENDET, UM UNTERSCHIEDLICH REGULIERTE GENE IN GRUPPEN MIT GEMEINSAMEN REGULIERUNGSSTANDARDS EINZUORDNEN, UM DANN DIE VERSCHIEDENEN BETEILIGTEN REGULIERUNGSMECHANISMEN ANZUGEHEN. WIR WERDEN DIE PXR-UNION-STANDORTE MIT CHIP-SEQ UNTERSUCHEN, INFORMATIONEN, DIE WIR AUS DER ANALYSE VON TRANSCRIPTOMICA INTEGRIEREN WERDEN. WIR WERDEN DIE MÖGLICHE METILACION VON ARGININS IN PIPX ALPHA-HELICE1 UNTERSUCHEN UND GEGEBENENFALLS DIE FUNKTIONALE BEDEUTUNG UND GENETISCHE DETERMINANTEN DER MODIFIKATIONEN UNTERSUCHEN. SOWOHL KANDIDATENMETHYLASE(S) ALS AUCH ANDERE PROTEINE, DIE IN PROTEIN-PROTEIN UND/ODER IN SILICO-INTERAKTIONEN GEFUNDEN WERDEN, WERDEN ANALYSIERT. DIE ABSICHT BESTEHT DARIN, DIE ENTSPRECHENDEN GENE UND RELEVANTE PHÄNOTYPISCHE ANALYSE INAKTIV ZU MACHEN. _x000D_ Wir werden auch MOLECULAR DETAILS IN DER SEMINALISATION DAS PROCESS der Chlorose untersuchen, Eine dramatische Anpassung an verschiedene Arten von Umgebungen, in denen NBLR und NTCA-PIPX, andere Regulatoren betreten, Converge for the Promotor of the NBLA, Esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. WIR SIND DARAN INTERESSIERT, EINIGE DER REGULATORISCHEN KOMPLEXITÄTEN ZU ENTSCHLÜSSELN, WIE Z. B. DEN AKTIVIERUNGS- UND FUNKTIONSMECHANISMUS DER NBLR UND DIE REGULATORISCHEN WECHSELWIRKUNGEN DER VERSCHIEDENEN ARTEN, DIE IM NBLA-PROMOTOR AUFEINANDERTREFFEN. VIELE DER IN BEZUG AUF PIPX VORGESCHLAGENEN METHODISCHEN STRATEGIEN WERDEN AUCH MIT DER NBLR GENUTZT. (German) | |||||||||||||||
| Property / summary: CYANOBAKTERIEN FÜHREN OXIGENICAN PHOTOSYNTHESE DURCH UND KOLONISIEREN DIE MEISTEN BELEUCHTETEN ÖKOSYSTEME, SO DASS SIE EINEN GROSSEN EINFLUSS AUF GLOBALE KOHLENSTOFF- UND STICKSTOFFZYKLEN HABEN. TROTZ SEINES ÖKOLOGISCHEN ERFOLGS UND SEINER BIOTECHNOLOGISCHEN BEDEUTUNG BLEIBEN DIE MECHANISMEN, DIE FÜR DIESE VIELSEITIGKEIT UND DIE FÄHIGKEIT ZUR ANPASSUNG AN DIE UMWELT VERANTWORTLICH SIND, UNBEKANNT. IN DIESEM ZUSAMMENHANG SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY genetische MANIPUATION, ist ein EXCELLENT SYSTEM FÜR DIE STUDIE DER VERORDNUNG INTERACTIONEN, die das CIANOBACTERIAS INTEGRATED und RESPONDERLY ZU MEINE DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS erlauben._x000D_ Der primäre Vorschlag dieses Projekts ist die Charakterisierung des multifuncionalen PIPX PROTEIN, ein UN FACTOR OF CIANOBACTERIAS CONCERNING Transkriptionsregulatoren, Signalisierung von PROTEINS und metabolische enzimas in einem NETWORK OF COMPLETE UND DINAMIC Interationen. MIT HILFE VON IN-VIVO-KO-REINIGUNGSVERSUCHEN MIT DEM FLAG-PIPX-PROTEIN WOLLEN WIR NEUE KOMPONENTEN DER SIGNALWEGE IDENTIFIZIEREN, AN DENEN PIPX TEILNIMMT, NEBEN DER VALIDIERUNG VON WECHSELWIRKUNGEN UND FRÜHEREN ERGEBNISSEN AUS DOPPELT HYBRIDISIERTEN PIPX-PROTEINEN (XIP-PROTEINE), DREIFACHER HYBRIDISIERUNG (PXR, IDENTIFIZIERT MIT PII UND PIPX ALS KÖDER) ODER IN DER SILICO-ANALYSE (ORF2060). UM INTERAKTIONEN (ZWISCHEN PROTEINEN UND MÖGLICHEN EFFEKTOREN) IM DETAIL ZU CHARAKTERISIEREN, WERDEN WIR IN VITRO UND/ODER DOPPEL- (DREIFACHE) HYBRIDVERSUCHE MIT VOLLSTÄNDIGEN PROTEINEN, MUTANTENDERIVATEN UND/ODER BESTIMMTEN DOMÄNEN VERWENDEN. WIR WERDEN AUF DIE VERWENDUNG DER KONFOKALEN MIKROSKOPIE ZURÜCKGREIFEN, UM FESTZUSTELLEN, OB SICH EINES DER UNTERSUCHTEN PROTEINE IN DEN POLARSTRAHLERN VON PIPX BEFINDET, DEREN DYNAMISCHE LAGE AUF DUNKLE LICHTZYKLEN REAGIERT. UM PIPX-GEREGELTE GENE UNABHÄNGIG VON NTCA ZU BESCHREIBEN, WERDEN WIR EINE TRANSKRIPTOM-ANALYSE MIT EINEM STAMMPANEL UNTER UNTERSCHIEDLICHEN KULTURBEDINGUNGEN DURCHFÜHREN, DIE VERSCHIEDENE ARTEN VON DERIVATEN DES PIPX-GENS UND ANDERE VERWANDTE GENE UMFASST. DIE ERZEUGTEN DATEN WERDEN VERWENDET, UM UNTERSCHIEDLICH REGULIERTE GENE IN GRUPPEN MIT GEMEINSAMEN REGULIERUNGSSTANDARDS EINZUORDNEN, UM DANN DIE VERSCHIEDENEN BETEILIGTEN REGULIERUNGSMECHANISMEN ANZUGEHEN. WIR WERDEN DIE PXR-UNION-STANDORTE MIT CHIP-SEQ UNTERSUCHEN, INFORMATIONEN, DIE WIR AUS DER ANALYSE VON TRANSCRIPTOMICA INTEGRIEREN WERDEN. WIR WERDEN DIE MÖGLICHE METILACION VON ARGININS IN PIPX ALPHA-HELICE1 UNTERSUCHEN UND GEGEBENENFALLS DIE FUNKTIONALE BEDEUTUNG UND GENETISCHE DETERMINANTEN DER MODIFIKATIONEN UNTERSUCHEN. SOWOHL KANDIDATENMETHYLASE(S) ALS AUCH ANDERE PROTEINE, DIE IN PROTEIN-PROTEIN UND/ODER IN SILICO-INTERAKTIONEN GEFUNDEN WERDEN, WERDEN ANALYSIERT. DIE ABSICHT BESTEHT DARIN, DIE ENTSPRECHENDEN GENE UND RELEVANTE PHÄNOTYPISCHE ANALYSE INAKTIV ZU MACHEN. _x000D_ Wir werden auch MOLECULAR DETAILS IN DER SEMINALISATION DAS PROCESS der Chlorose untersuchen, Eine dramatische Anpassung an verschiedene Arten von Umgebungen, in denen NBLR und NTCA-PIPX, andere Regulatoren betreten, Converge for the Promotor of the NBLA, Esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. WIR SIND DARAN INTERESSIERT, EINIGE DER REGULATORISCHEN KOMPLEXITÄTEN ZU ENTSCHLÜSSELN, WIE Z. B. DEN AKTIVIERUNGS- UND FUNKTIONSMECHANISMUS DER NBLR UND DIE REGULATORISCHEN WECHSELWIRKUNGEN DER VERSCHIEDENEN ARTEN, DIE IM NBLA-PROMOTOR AUFEINANDERTREFFEN. VIELE DER IN BEZUG AUF PIPX VORGESCHLAGENEN METHODISCHEN STRATEGIEN WERDEN AUCH MIT DER NBLR GENUTZT. (German) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: CYANOBAKTERIEN FÜHREN OXIGENICAN PHOTOSYNTHESE DURCH UND KOLONISIEREN DIE MEISTEN BELEUCHTETEN ÖKOSYSTEME, SO DASS SIE EINEN GROSSEN EINFLUSS AUF GLOBALE KOHLENSTOFF- UND STICKSTOFFZYKLEN HABEN. TROTZ SEINES ÖKOLOGISCHEN ERFOLGS UND SEINER BIOTECHNOLOGISCHEN BEDEUTUNG BLEIBEN DIE MECHANISMEN, DIE FÜR DIESE VIELSEITIGKEIT UND DIE FÄHIGKEIT ZUR ANPASSUNG AN DIE UMWELT VERANTWORTLICH SIND, UNBEKANNT. IN DIESEM ZUSAMMENHANG SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY genetische MANIPUATION, ist ein EXCELLENT SYSTEM FÜR DIE STUDIE DER VERORDNUNG INTERACTIONEN, die das CIANOBACTERIAS INTEGRATED und RESPONDERLY ZU MEINE DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS erlauben._x000D_ Der primäre Vorschlag dieses Projekts ist die Charakterisierung des multifuncionalen PIPX PROTEIN, ein UN FACTOR OF CIANOBACTERIAS CONCERNING Transkriptionsregulatoren, Signalisierung von PROTEINS und metabolische enzimas in einem NETWORK OF COMPLETE UND DINAMIC Interationen. MIT HILFE VON IN-VIVO-KO-REINIGUNGSVERSUCHEN MIT DEM FLAG-PIPX-PROTEIN WOLLEN WIR NEUE KOMPONENTEN DER SIGNALWEGE IDENTIFIZIEREN, AN DENEN PIPX TEILNIMMT, NEBEN DER VALIDIERUNG VON WECHSELWIRKUNGEN UND FRÜHEREN ERGEBNISSEN AUS DOPPELT HYBRIDISIERTEN PIPX-PROTEINEN (XIP-PROTEINE), DREIFACHER HYBRIDISIERUNG (PXR, IDENTIFIZIERT MIT PII UND PIPX ALS KÖDER) ODER IN DER SILICO-ANALYSE (ORF2060). UM INTERAKTIONEN (ZWISCHEN PROTEINEN UND MÖGLICHEN EFFEKTOREN) IM DETAIL ZU CHARAKTERISIEREN, WERDEN WIR IN VITRO UND/ODER DOPPEL- (DREIFACHE) HYBRIDVERSUCHE MIT VOLLSTÄNDIGEN PROTEINEN, MUTANTENDERIVATEN UND/ODER BESTIMMTEN DOMÄNEN VERWENDEN. WIR WERDEN AUF DIE VERWENDUNG DER KONFOKALEN MIKROSKOPIE ZURÜCKGREIFEN, UM FESTZUSTELLEN, OB SICH EINES DER UNTERSUCHTEN PROTEINE IN DEN POLARSTRAHLERN VON PIPX BEFINDET, DEREN DYNAMISCHE LAGE AUF DUNKLE LICHTZYKLEN REAGIERT. UM PIPX-GEREGELTE GENE UNABHÄNGIG VON NTCA ZU BESCHREIBEN, WERDEN WIR EINE TRANSKRIPTOM-ANALYSE MIT EINEM STAMMPANEL UNTER UNTERSCHIEDLICHEN KULTURBEDINGUNGEN DURCHFÜHREN, DIE VERSCHIEDENE ARTEN VON DERIVATEN DES PIPX-GENS UND ANDERE VERWANDTE GENE UMFASST. DIE ERZEUGTEN DATEN WERDEN VERWENDET, UM UNTERSCHIEDLICH REGULIERTE GENE IN GRUPPEN MIT GEMEINSAMEN REGULIERUNGSSTANDARDS EINZUORDNEN, UM DANN DIE VERSCHIEDENEN BETEILIGTEN REGULIERUNGSMECHANISMEN ANZUGEHEN. WIR WERDEN DIE PXR-UNION-STANDORTE MIT CHIP-SEQ UNTERSUCHEN, INFORMATIONEN, DIE WIR AUS DER ANALYSE VON TRANSCRIPTOMICA INTEGRIEREN WERDEN. WIR WERDEN DIE MÖGLICHE METILACION VON ARGININS IN PIPX ALPHA-HELICE1 UNTERSUCHEN UND GEGEBENENFALLS DIE FUNKTIONALE BEDEUTUNG UND GENETISCHE DETERMINANTEN DER MODIFIKATIONEN UNTERSUCHEN. SOWOHL KANDIDATENMETHYLASE(S) ALS AUCH ANDERE PROTEINE, DIE IN PROTEIN-PROTEIN UND/ODER IN SILICO-INTERAKTIONEN GEFUNDEN WERDEN, WERDEN ANALYSIERT. DIE ABSICHT BESTEHT DARIN, DIE ENTSPRECHENDEN GENE UND RELEVANTE PHÄNOTYPISCHE ANALYSE INAKTIV ZU MACHEN. _x000D_ Wir werden auch MOLECULAR DETAILS IN DER SEMINALISATION DAS PROCESS der Chlorose untersuchen, Eine dramatische Anpassung an verschiedene Arten von Umgebungen, in denen NBLR und NTCA-PIPX, andere Regulatoren betreten, Converge for the Promotor of the NBLA, Esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. WIR SIND DARAN INTERESSIERT, EINIGE DER REGULATORISCHEN KOMPLEXITÄTEN ZU ENTSCHLÜSSELN, WIE Z. B. DEN AKTIVIERUNGS- UND FUNKTIONSMECHANISMUS DER NBLR UND DIE REGULATORISCHEN WECHSELWIRKUNGEN DER VERSCHIEDENEN ARTEN, DIE IM NBLA-PROMOTOR AUFEINANDERTREFFEN. VIELE DER IN BEZUG AUF PIPX VORGESCHLAGENEN METHODISCHEN STRATEGIEN WERDEN AUCH MIT DER NBLR GENUTZT. (German) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 9 December 2021
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
CYANOBACTERIËN VOEREN OXIGENICAN FOTOSYNTHESE UIT EN KOLONISEREN DE MEESTE VERLICHTE ECOSYSTEMEN, ZODAT ZE EEN GROTE IMPACT HEBBEN OP DE WERELDWIJDE KOOLSTOF- EN STIKSTOFCYCLI. ONDANKS HET ECOLOGISCHE SUCCES EN HET BIOTECHNOLOGISCHE BELANG ERVAN, BLIJVEN DE MECHANISMEN DIE VERANTWOORDELIJK ZIJN VOOR DEZE VEELZIJDIGHEID EN CAPACITEIT VOOR MILIEUAANPASSING ONBEKEND. IN DIT VERBAND, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, VAN RELATIVELY FACILITY genetical MANIPUATION, is een EXCELLENT SYSTEM VOOR DE STUDIE VAN DE REGULATIE INTERACTIES die de CIANOBACTERIAS INTEGRATED en RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ De primaire stelling van dit project is om de multifuncional PIPX PROTEIN te karakteriseren, een UN FACTOR VAN CIANOBACTERIAS CONCERNING transcriptional regulators, Signaliserende PROTEINS EN metabolische enzimas in een NETWERK VAN COMPLETE EN DINAMIC interations. MET BEHULP VAN IN VIVO CO-PURIFICATIE PROEVEN MET HET VLAG-PIPX-EIWIT, STREVEN WE ERNAAR NIEUWE COMPONENTEN TE IDENTIFICEREN VAN DE SIGNALERINGSROUTES WAARAAN PIPX DEELNEEMT, NAAST HET VALIDEREN VAN INTERACTIES EN EERDERE RESULTATEN VAN DUBBELGE HYBRIDISEERDE PIPX (XIP-EIWITTEN), DRIEVOUDIGE HYBRIDISATIE (PXR, GEÏDENTIFICEERD MET ZOWEL PII ALS PIPX ALS AAS) OF IN SILICO-ANALYSE (ORF2060). OM INTERACTIES (TUSSEN EIWITTEN EN MET MOGELIJKE EFFECTOREN) IN MEER DETAIL TE KARAKTERISEREN, ZULLEN WE IN VITRO EN/OF DUBBELE (TRIPLE) HYBRIDE PROEVEN MET VOLLEDIGE EIWITTEN, MUTANTDERIVATEN EN/OF SPECIFIEKE DOMEINEN GEBRUIKEN. WE ZULLEN HUN TOEVLUCHT NEMEN TOT HET GEBRUIK VAN CONFOCALE MICROSCOPIE OM TE BEPALEN OF EEN VAN DE ONDERZOCHTE EIWITTEN COLOKALISEERT IN DE POOLSPOTS VAN PIPX, WAARVAN DE DYNAMISCHE LOCATIE REAGEERT OP DONKERE LICHTCYCLI. OM PIPX-GEREGULEERDE GENEN ONAFHANKELIJK VAN NTCA TE BESCHRIJVEN, ZULLEN WE TRANSCRIPTOMISCHE ANALYSE UITVOEREN MET EEN STAMPANEEL, ONDER VERSCHILLENDE CULTUUROMSTANDIGHEDEN, WAARONDER VERSCHILLENDE SOORTEN DERIVATEN VAN HET PIPX-GEN EN ANDERE VERWANTE GENEN. DE GEGENEREERDE GEGEVENS ZULLEN WORDEN GEBRUIKT OM VERSCHILLEND GEREGULEERDE GENEN TE CLASSIFICEREN IN GROEPEN MET GEMEENSCHAPPELIJKE REGELGEVINGSNORMEN, OM VERVOLGENS DE VERSCHILLENDE BETROKKEN REGELGEVINGSMECHANISMEN AAN TE PAKKEN. WE ZULLEN DE PXR UNION SITES ONDERZOEKEN MET BEHULP VAN CHIP-SEQ, INFORMATIE DIE WE ZULLEN INTEGREREN MET DIE VAN DE ANALYSE VAN TRANSCRIPTOMICA. WE ZULLEN DE MOGELIJKE METILACIE VAN ARGININS IN PIPX ALPHA-HELICE1 ONDERZOEKEN EN, INDIEN VAN TOEPASSING, DE FUNCTIONELE BETEKENIS EN GENETISCHE DETERMINANTEN VAN DE MODIFICATIES BESTUDEREN. ZOWEL KANDIDAAT METHYLASE(S) ALS ANDERE EIWITTEN GEVONDEN IN EIWIT-EIWIT EN/OF IN SILICO INTERACTIES WORDEN GEANALYSEERD. HET IS DE BEDOELING OM DE OVEREENKOMSTIGE GENEN EN RELEVANTE FENOTYPISCHE ANALYSE INACTIEF TE MAKEN. _x000D_ we zullen ook onderzoeken MOLECULAR DETAILS IN DE SEMINALISATIE DOES HET PROCESS VAN chlorose, Een dramatische aanpassing aan verschillende soorten omgeving, waarin NBLR en NTCA-PIPX, andere regulators, Converge voor de Promotor van de NBLA, esential voor de Degratatie van Physiobilisomas. WE ZIJN GEÏNTERESSEERD IN HET ONTCIJFEREN VAN EEN AANTAL VAN DE REGELGEVINGSCOMPLEXITEITEN, ZOALS HET MECHANISME VAN ACTIVERING EN FUNCTIE VAN NBLR EN IN DE REGELGEVENDE INTERACTIES VAN DE VERSCHILLENDE MANIEREN DIE CONVERGEREN IN DE NBLA-PROMOTOR. VEEL VAN DE VOORGESTELDE METHODOLOGISCHE STRATEGIEËN MET BETREKKING TOT PIPX ZULLEN OOK MET NBLR WORDEN GEBRUIKT. (Dutch) | |||||||||||||||
| Property / summary: CYANOBACTERIËN VOEREN OXIGENICAN FOTOSYNTHESE UIT EN KOLONISEREN DE MEESTE VERLICHTE ECOSYSTEMEN, ZODAT ZE EEN GROTE IMPACT HEBBEN OP DE WERELDWIJDE KOOLSTOF- EN STIKSTOFCYCLI. ONDANKS HET ECOLOGISCHE SUCCES EN HET BIOTECHNOLOGISCHE BELANG ERVAN, BLIJVEN DE MECHANISMEN DIE VERANTWOORDELIJK ZIJN VOOR DEZE VEELZIJDIGHEID EN CAPACITEIT VOOR MILIEUAANPASSING ONBEKEND. IN DIT VERBAND, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, VAN RELATIVELY FACILITY genetical MANIPUATION, is een EXCELLENT SYSTEM VOOR DE STUDIE VAN DE REGULATIE INTERACTIES die de CIANOBACTERIAS INTEGRATED en RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ De primaire stelling van dit project is om de multifuncional PIPX PROTEIN te karakteriseren, een UN FACTOR VAN CIANOBACTERIAS CONCERNING transcriptional regulators, Signaliserende PROTEINS EN metabolische enzimas in een NETWERK VAN COMPLETE EN DINAMIC interations. MET BEHULP VAN IN VIVO CO-PURIFICATIE PROEVEN MET HET VLAG-PIPX-EIWIT, STREVEN WE ERNAAR NIEUWE COMPONENTEN TE IDENTIFICEREN VAN DE SIGNALERINGSROUTES WAARAAN PIPX DEELNEEMT, NAAST HET VALIDEREN VAN INTERACTIES EN EERDERE RESULTATEN VAN DUBBELGE HYBRIDISEERDE PIPX (XIP-EIWITTEN), DRIEVOUDIGE HYBRIDISATIE (PXR, GEÏDENTIFICEERD MET ZOWEL PII ALS PIPX ALS AAS) OF IN SILICO-ANALYSE (ORF2060). OM INTERACTIES (TUSSEN EIWITTEN EN MET MOGELIJKE EFFECTOREN) IN MEER DETAIL TE KARAKTERISEREN, ZULLEN WE IN VITRO EN/OF DUBBELE (TRIPLE) HYBRIDE PROEVEN MET VOLLEDIGE EIWITTEN, MUTANTDERIVATEN EN/OF SPECIFIEKE DOMEINEN GEBRUIKEN. WE ZULLEN HUN TOEVLUCHT NEMEN TOT HET GEBRUIK VAN CONFOCALE MICROSCOPIE OM TE BEPALEN OF EEN VAN DE ONDERZOCHTE EIWITTEN COLOKALISEERT IN DE POOLSPOTS VAN PIPX, WAARVAN DE DYNAMISCHE LOCATIE REAGEERT OP DONKERE LICHTCYCLI. OM PIPX-GEREGULEERDE GENEN ONAFHANKELIJK VAN NTCA TE BESCHRIJVEN, ZULLEN WE TRANSCRIPTOMISCHE ANALYSE UITVOEREN MET EEN STAMPANEEL, ONDER VERSCHILLENDE CULTUUROMSTANDIGHEDEN, WAARONDER VERSCHILLENDE SOORTEN DERIVATEN VAN HET PIPX-GEN EN ANDERE VERWANTE GENEN. DE GEGENEREERDE GEGEVENS ZULLEN WORDEN GEBRUIKT OM VERSCHILLEND GEREGULEERDE GENEN TE CLASSIFICEREN IN GROEPEN MET GEMEENSCHAPPELIJKE REGELGEVINGSNORMEN, OM VERVOLGENS DE VERSCHILLENDE BETROKKEN REGELGEVINGSMECHANISMEN AAN TE PAKKEN. WE ZULLEN DE PXR UNION SITES ONDERZOEKEN MET BEHULP VAN CHIP-SEQ, INFORMATIE DIE WE ZULLEN INTEGREREN MET DIE VAN DE ANALYSE VAN TRANSCRIPTOMICA. WE ZULLEN DE MOGELIJKE METILACIE VAN ARGININS IN PIPX ALPHA-HELICE1 ONDERZOEKEN EN, INDIEN VAN TOEPASSING, DE FUNCTIONELE BETEKENIS EN GENETISCHE DETERMINANTEN VAN DE MODIFICATIES BESTUDEREN. ZOWEL KANDIDAAT METHYLASE(S) ALS ANDERE EIWITTEN GEVONDEN IN EIWIT-EIWIT EN/OF IN SILICO INTERACTIES WORDEN GEANALYSEERD. HET IS DE BEDOELING OM DE OVEREENKOMSTIGE GENEN EN RELEVANTE FENOTYPISCHE ANALYSE INACTIEF TE MAKEN. _x000D_ we zullen ook onderzoeken MOLECULAR DETAILS IN DE SEMINALISATIE DOES HET PROCESS VAN chlorose, Een dramatische aanpassing aan verschillende soorten omgeving, waarin NBLR en NTCA-PIPX, andere regulators, Converge voor de Promotor van de NBLA, esential voor de Degratatie van Physiobilisomas. WE ZIJN GEÏNTERESSEERD IN HET ONTCIJFEREN VAN EEN AANTAL VAN DE REGELGEVINGSCOMPLEXITEITEN, ZOALS HET MECHANISME VAN ACTIVERING EN FUNCTIE VAN NBLR EN IN DE REGELGEVENDE INTERACTIES VAN DE VERSCHILLENDE MANIEREN DIE CONVERGEREN IN DE NBLA-PROMOTOR. VEEL VAN DE VOORGESTELDE METHODOLOGISCHE STRATEGIEËN MET BETREKKING TOT PIPX ZULLEN OOK MET NBLR WORDEN GEBRUIKT. (Dutch) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: CYANOBACTERIËN VOEREN OXIGENICAN FOTOSYNTHESE UIT EN KOLONISEREN DE MEESTE VERLICHTE ECOSYSTEMEN, ZODAT ZE EEN GROTE IMPACT HEBBEN OP DE WERELDWIJDE KOOLSTOF- EN STIKSTOFCYCLI. ONDANKS HET ECOLOGISCHE SUCCES EN HET BIOTECHNOLOGISCHE BELANG ERVAN, BLIJVEN DE MECHANISMEN DIE VERANTWOORDELIJK ZIJN VOOR DEZE VEELZIJDIGHEID EN CAPACITEIT VOOR MILIEUAANPASSING ONBEKEND. IN DIT VERBAND, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, VAN RELATIVELY FACILITY genetical MANIPUATION, is een EXCELLENT SYSTEM VOOR DE STUDIE VAN DE REGULATIE INTERACTIES die de CIANOBACTERIAS INTEGRATED en RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ De primaire stelling van dit project is om de multifuncional PIPX PROTEIN te karakteriseren, een UN FACTOR VAN CIANOBACTERIAS CONCERNING transcriptional regulators, Signaliserende PROTEINS EN metabolische enzimas in een NETWERK VAN COMPLETE EN DINAMIC interations. MET BEHULP VAN IN VIVO CO-PURIFICATIE PROEVEN MET HET VLAG-PIPX-EIWIT, STREVEN WE ERNAAR NIEUWE COMPONENTEN TE IDENTIFICEREN VAN DE SIGNALERINGSROUTES WAARAAN PIPX DEELNEEMT, NAAST HET VALIDEREN VAN INTERACTIES EN EERDERE RESULTATEN VAN DUBBELGE HYBRIDISEERDE PIPX (XIP-EIWITTEN), DRIEVOUDIGE HYBRIDISATIE (PXR, GEÏDENTIFICEERD MET ZOWEL PII ALS PIPX ALS AAS) OF IN SILICO-ANALYSE (ORF2060). OM INTERACTIES (TUSSEN EIWITTEN EN MET MOGELIJKE EFFECTOREN) IN MEER DETAIL TE KARAKTERISEREN, ZULLEN WE IN VITRO EN/OF DUBBELE (TRIPLE) HYBRIDE PROEVEN MET VOLLEDIGE EIWITTEN, MUTANTDERIVATEN EN/OF SPECIFIEKE DOMEINEN GEBRUIKEN. WE ZULLEN HUN TOEVLUCHT NEMEN TOT HET GEBRUIK VAN CONFOCALE MICROSCOPIE OM TE BEPALEN OF EEN VAN DE ONDERZOCHTE EIWITTEN COLOKALISEERT IN DE POOLSPOTS VAN PIPX, WAARVAN DE DYNAMISCHE LOCATIE REAGEERT OP DONKERE LICHTCYCLI. OM PIPX-GEREGULEERDE GENEN ONAFHANKELIJK VAN NTCA TE BESCHRIJVEN, ZULLEN WE TRANSCRIPTOMISCHE ANALYSE UITVOEREN MET EEN STAMPANEEL, ONDER VERSCHILLENDE CULTUUROMSTANDIGHEDEN, WAARONDER VERSCHILLENDE SOORTEN DERIVATEN VAN HET PIPX-GEN EN ANDERE VERWANTE GENEN. DE GEGENEREERDE GEGEVENS ZULLEN WORDEN GEBRUIKT OM VERSCHILLEND GEREGULEERDE GENEN TE CLASSIFICEREN IN GROEPEN MET GEMEENSCHAPPELIJKE REGELGEVINGSNORMEN, OM VERVOLGENS DE VERSCHILLENDE BETROKKEN REGELGEVINGSMECHANISMEN AAN TE PAKKEN. WE ZULLEN DE PXR UNION SITES ONDERZOEKEN MET BEHULP VAN CHIP-SEQ, INFORMATIE DIE WE ZULLEN INTEGREREN MET DIE VAN DE ANALYSE VAN TRANSCRIPTOMICA. WE ZULLEN DE MOGELIJKE METILACIE VAN ARGININS IN PIPX ALPHA-HELICE1 ONDERZOEKEN EN, INDIEN VAN TOEPASSING, DE FUNCTIONELE BETEKENIS EN GENETISCHE DETERMINANTEN VAN DE MODIFICATIES BESTUDEREN. ZOWEL KANDIDAAT METHYLASE(S) ALS ANDERE EIWITTEN GEVONDEN IN EIWIT-EIWIT EN/OF IN SILICO INTERACTIES WORDEN GEANALYSEERD. HET IS DE BEDOELING OM DE OVEREENKOMSTIGE GENEN EN RELEVANTE FENOTYPISCHE ANALYSE INACTIEF TE MAKEN. _x000D_ we zullen ook onderzoeken MOLECULAR DETAILS IN DE SEMINALISATIE DOES HET PROCESS VAN chlorose, Een dramatische aanpassing aan verschillende soorten omgeving, waarin NBLR en NTCA-PIPX, andere regulators, Converge voor de Promotor van de NBLA, esential voor de Degratatie van Physiobilisomas. WE ZIJN GEÏNTERESSEERD IN HET ONTCIJFEREN VAN EEN AANTAL VAN DE REGELGEVINGSCOMPLEXITEITEN, ZOALS HET MECHANISME VAN ACTIVERING EN FUNCTIE VAN NBLR EN IN DE REGELGEVENDE INTERACTIES VAN DE VERSCHILLENDE MANIEREN DIE CONVERGEREN IN DE NBLA-PROMOTOR. VEEL VAN DE VOORGESTELDE METHODOLOGISCHE STRATEGIEËN MET BETREKKING TOT PIPX ZULLEN OOK MET NBLR WORDEN GEBRUIKT. (Dutch) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 17 December 2021
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
I CIANOBATTERI ESEGUONO LA FOTOSINTESI OXIGENICAN E COLONIZZANO LA MAGGIOR PARTE DEGLI ECOSISTEMI ILLUMINATI, QUINDI HANNO UN GRANDE IMPATTO SUI CICLI GLOBALI DEL CARBONIO E DELL'AZOTO. TUTTAVIA, NONOSTANTE IL SUCCESSO ECOLOGICO E L'IMPORTANZA BIOTECNOLOGICA, I MECCANISMI RESPONSABILI DI QUESTA VERSATILITÀ E CAPACITÀ DI ADATTAMENTO AMBIENTALE RIMANGONO SCONOSCIUTI. IN QUESTO CONTESTO, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, DI MANIPUAZIONE GENERALE DI FACILITÀ RELATIVE, È un SISTEMA ECCELLENTE PER LA STUDY DELLE INTERAZIONI REGULATIVE che consentono la CIANOBACTERIAS INTEGRATED E RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL._x000D_ La proposta primaria di questo progetto è quella di caratterizzare la PROTEIN PIPX multifunzione, un FATTORE UNO DI CIANOBACTERIAS CONCERNANTE regolatori trascrizionali, Signalising PROTEINS ED Enzimas metabolici in una rete di interazioni complete e DINAMiche. UTILIZZANDO STUDI DI CO-PURIFICAZIONE IN VIVO CON LA PROTEINA FLAG-PIPX, CI PROPONIAMO DI IDENTIFICARE NUOVI COMPONENTI DELLE VIE DI SEGNALAZIONE A CUI PARTECIPA PIPX, OLTRE A CONVALIDARE LE INTERAZIONI E I RISULTATI PRECEDENTI DA PIPX (PROTEINE XIP) IBRIDATE, TRIPLA IBRIDAZIONE (PXR, IDENTIFICATA UTILIZZANDO SIA PII CHE PIPX COME ESCA) O IN ANALISI SILICO (ORF2060). PER CARATTERIZZARE LE INTERAZIONI (TRA LE PROTEINE E CON POSSIBILI EFFETTIVI) IN MODO PIÙ DETTAGLIATO, USEREMO PROVE IBRIDE IN VITRO E/O DOPPIE (TRIPLE) CON PROTEINE COMPLETE, DERIVATI MUTANTI E/O DOMINI SPECIFICI. FAREMO RICORSO ALL'USO DELLA MICROSCOPIA CONFOCALE PER DETERMINARE SE UNA QUALSIASI DELLE PROTEINE STUDIATE CO-LOCALIZZA NEI FARETTI POLARI DI PIPX, LA CUI POSIZIONE DINAMICA RISPONDE AI CICLI DI LUCE SCURA. PER DESCRIVERE I GENI REGOLATI DA PIPX INDIPENDENTEMENTE DALL'NTCA, ESEGUIREMO UN'ANALISI TRASCRITTAMICA CON UN PANNELLO DI CEPPO, IN DIVERSE CONDIZIONI DI COLTURA, CHE INCLUDE VARI TIPI DI DERIVATI DEL GENE PIPX E ALTRI GENI CORRELATI. I DATI GENERATI SARANNO UTILIZZATI PER CLASSIFICARE I GENI REGOLATI DIFFERENZIALMENTE IN GRUPPI CON STANDARD NORMATIVI COMUNI, PER POI AFFRONTARE I DIVERSI MECCANISMI DI REGOLAMENTAZIONE COINVOLTI. ESAMINEREMO I SITI PXR UNION UTILIZZANDO CHIP-SEQ, INFORMAZIONI CHE INTEGREREMO CON QUELLE DALL'ANALISI DI TRANSCRIPTOMICA. ESAMINEREMO LA POSSIBILE METILACION DI ARGININS IN PIPX ALPHA-HELICE1 E, SE DEL CASO, STUDIEREMO IL SIGNIFICATO FUNZIONALE E I DETERMINANTI GENETICI DELLE MODIFICHE. SARANNO ANALIZZATE SIA LA METILASI(S) CANDIDATA(E) CHE LE ALTRE PROTEINE PRESENTI NELLA PROTEINA-PROTEINA E/O NELLE INTERAZIONI SILICO. L'INTENZIONE È DI INATTIVARE I GENI CORRISPONDENTI E L'ANALISI FENOTIPICA PERTINENTE. _x000D_ studieremo anche DETAILS MOLECULAR NEL SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, Un adattamento drammatico a diversi tipi di ambiente, in cui NBLR e NTCA-PIPX, entrano in altri regolatori, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. SIAMO INTERESSATI A DECIFRARE ALCUNE DELLE COMPLESSITÀ NORMATIVE, COME IL MECCANISMO DI ATTIVAZIONE E FUNZIONE DI NBLR E LE INTERAZIONI NORMATIVE DEI DIVERSI MODI CHE CONVERGONO NEL PROMOTORE NBLA. MOLTE DELLE STRATEGIE METODOLOGICHE PROPOSTE IN RELAZIONE AL PIPX SARANNO UTILIZZATE ANCHE CON NBLR. (Italian) | |||||||||||||||
| Property / summary: I CIANOBATTERI ESEGUONO LA FOTOSINTESI OXIGENICAN E COLONIZZANO LA MAGGIOR PARTE DEGLI ECOSISTEMI ILLUMINATI, QUINDI HANNO UN GRANDE IMPATTO SUI CICLI GLOBALI DEL CARBONIO E DELL'AZOTO. TUTTAVIA, NONOSTANTE IL SUCCESSO ECOLOGICO E L'IMPORTANZA BIOTECNOLOGICA, I MECCANISMI RESPONSABILI DI QUESTA VERSATILITÀ E CAPACITÀ DI ADATTAMENTO AMBIENTALE RIMANGONO SCONOSCIUTI. IN QUESTO CONTESTO, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, DI MANIPUAZIONE GENERALE DI FACILITÀ RELATIVE, È un SISTEMA ECCELLENTE PER LA STUDY DELLE INTERAZIONI REGULATIVE che consentono la CIANOBACTERIAS INTEGRATED E RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL._x000D_ La proposta primaria di questo progetto è quella di caratterizzare la PROTEIN PIPX multifunzione, un FATTORE UNO DI CIANOBACTERIAS CONCERNANTE regolatori trascrizionali, Signalising PROTEINS ED Enzimas metabolici in una rete di interazioni complete e DINAMiche. UTILIZZANDO STUDI DI CO-PURIFICAZIONE IN VIVO CON LA PROTEINA FLAG-PIPX, CI PROPONIAMO DI IDENTIFICARE NUOVI COMPONENTI DELLE VIE DI SEGNALAZIONE A CUI PARTECIPA PIPX, OLTRE A CONVALIDARE LE INTERAZIONI E I RISULTATI PRECEDENTI DA PIPX (PROTEINE XIP) IBRIDATE, TRIPLA IBRIDAZIONE (PXR, IDENTIFICATA UTILIZZANDO SIA PII CHE PIPX COME ESCA) O IN ANALISI SILICO (ORF2060). PER CARATTERIZZARE LE INTERAZIONI (TRA LE PROTEINE E CON POSSIBILI EFFETTIVI) IN MODO PIÙ DETTAGLIATO, USEREMO PROVE IBRIDE IN VITRO E/O DOPPIE (TRIPLE) CON PROTEINE COMPLETE, DERIVATI MUTANTI E/O DOMINI SPECIFICI. FAREMO RICORSO ALL'USO DELLA MICROSCOPIA CONFOCALE PER DETERMINARE SE UNA QUALSIASI DELLE PROTEINE STUDIATE CO-LOCALIZZA NEI FARETTI POLARI DI PIPX, LA CUI POSIZIONE DINAMICA RISPONDE AI CICLI DI LUCE SCURA. PER DESCRIVERE I GENI REGOLATI DA PIPX INDIPENDENTEMENTE DALL'NTCA, ESEGUIREMO UN'ANALISI TRASCRITTAMICA CON UN PANNELLO DI CEPPO, IN DIVERSE CONDIZIONI DI COLTURA, CHE INCLUDE VARI TIPI DI DERIVATI DEL GENE PIPX E ALTRI GENI CORRELATI. I DATI GENERATI SARANNO UTILIZZATI PER CLASSIFICARE I GENI REGOLATI DIFFERENZIALMENTE IN GRUPPI CON STANDARD NORMATIVI COMUNI, PER POI AFFRONTARE I DIVERSI MECCANISMI DI REGOLAMENTAZIONE COINVOLTI. ESAMINEREMO I SITI PXR UNION UTILIZZANDO CHIP-SEQ, INFORMAZIONI CHE INTEGREREMO CON QUELLE DALL'ANALISI DI TRANSCRIPTOMICA. ESAMINEREMO LA POSSIBILE METILACION DI ARGININS IN PIPX ALPHA-HELICE1 E, SE DEL CASO, STUDIEREMO IL SIGNIFICATO FUNZIONALE E I DETERMINANTI GENETICI DELLE MODIFICHE. SARANNO ANALIZZATE SIA LA METILASI(S) CANDIDATA(E) CHE LE ALTRE PROTEINE PRESENTI NELLA PROTEINA-PROTEINA E/O NELLE INTERAZIONI SILICO. L'INTENZIONE È DI INATTIVARE I GENI CORRISPONDENTI E L'ANALISI FENOTIPICA PERTINENTE. _x000D_ studieremo anche DETAILS MOLECULAR NEL SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, Un adattamento drammatico a diversi tipi di ambiente, in cui NBLR e NTCA-PIPX, entrano in altri regolatori, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. SIAMO INTERESSATI A DECIFRARE ALCUNE DELLE COMPLESSITÀ NORMATIVE, COME IL MECCANISMO DI ATTIVAZIONE E FUNZIONE DI NBLR E LE INTERAZIONI NORMATIVE DEI DIVERSI MODI CHE CONVERGONO NEL PROMOTORE NBLA. MOLTE DELLE STRATEGIE METODOLOGICHE PROPOSTE IN RELAZIONE AL PIPX SARANNO UTILIZZATE ANCHE CON NBLR. (Italian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: I CIANOBATTERI ESEGUONO LA FOTOSINTESI OXIGENICAN E COLONIZZANO LA MAGGIOR PARTE DEGLI ECOSISTEMI ILLUMINATI, QUINDI HANNO UN GRANDE IMPATTO SUI CICLI GLOBALI DEL CARBONIO E DELL'AZOTO. TUTTAVIA, NONOSTANTE IL SUCCESSO ECOLOGICO E L'IMPORTANZA BIOTECNOLOGICA, I MECCANISMI RESPONSABILI DI QUESTA VERSATILITÀ E CAPACITÀ DI ADATTAMENTO AMBIENTALE RIMANGONO SCONOSCIUTI. IN QUESTO CONTESTO, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, DI MANIPUAZIONE GENERALE DI FACILITÀ RELATIVE, È un SISTEMA ECCELLENTE PER LA STUDY DELLE INTERAZIONI REGULATIVE che consentono la CIANOBACTERIAS INTEGRATED E RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL._x000D_ La proposta primaria di questo progetto è quella di caratterizzare la PROTEIN PIPX multifunzione, un FATTORE UNO DI CIANOBACTERIAS CONCERNANTE regolatori trascrizionali, Signalising PROTEINS ED Enzimas metabolici in una rete di interazioni complete e DINAMiche. UTILIZZANDO STUDI DI CO-PURIFICAZIONE IN VIVO CON LA PROTEINA FLAG-PIPX, CI PROPONIAMO DI IDENTIFICARE NUOVI COMPONENTI DELLE VIE DI SEGNALAZIONE A CUI PARTECIPA PIPX, OLTRE A CONVALIDARE LE INTERAZIONI E I RISULTATI PRECEDENTI DA PIPX (PROTEINE XIP) IBRIDATE, TRIPLA IBRIDAZIONE (PXR, IDENTIFICATA UTILIZZANDO SIA PII CHE PIPX COME ESCA) O IN ANALISI SILICO (ORF2060). PER CARATTERIZZARE LE INTERAZIONI (TRA LE PROTEINE E CON POSSIBILI EFFETTIVI) IN MODO PIÙ DETTAGLIATO, USEREMO PROVE IBRIDE IN VITRO E/O DOPPIE (TRIPLE) CON PROTEINE COMPLETE, DERIVATI MUTANTI E/O DOMINI SPECIFICI. FAREMO RICORSO ALL'USO DELLA MICROSCOPIA CONFOCALE PER DETERMINARE SE UNA QUALSIASI DELLE PROTEINE STUDIATE CO-LOCALIZZA NEI FARETTI POLARI DI PIPX, LA CUI POSIZIONE DINAMICA RISPONDE AI CICLI DI LUCE SCURA. PER DESCRIVERE I GENI REGOLATI DA PIPX INDIPENDENTEMENTE DALL'NTCA, ESEGUIREMO UN'ANALISI TRASCRITTAMICA CON UN PANNELLO DI CEPPO, IN DIVERSE CONDIZIONI DI COLTURA, CHE INCLUDE VARI TIPI DI DERIVATI DEL GENE PIPX E ALTRI GENI CORRELATI. I DATI GENERATI SARANNO UTILIZZATI PER CLASSIFICARE I GENI REGOLATI DIFFERENZIALMENTE IN GRUPPI CON STANDARD NORMATIVI COMUNI, PER POI AFFRONTARE I DIVERSI MECCANISMI DI REGOLAMENTAZIONE COINVOLTI. ESAMINEREMO I SITI PXR UNION UTILIZZANDO CHIP-SEQ, INFORMAZIONI CHE INTEGREREMO CON QUELLE DALL'ANALISI DI TRANSCRIPTOMICA. ESAMINEREMO LA POSSIBILE METILACION DI ARGININS IN PIPX ALPHA-HELICE1 E, SE DEL CASO, STUDIEREMO IL SIGNIFICATO FUNZIONALE E I DETERMINANTI GENETICI DELLE MODIFICHE. SARANNO ANALIZZATE SIA LA METILASI(S) CANDIDATA(E) CHE LE ALTRE PROTEINE PRESENTI NELLA PROTEINA-PROTEINA E/O NELLE INTERAZIONI SILICO. L'INTENZIONE È DI INATTIVARE I GENI CORRISPONDENTI E L'ANALISI FENOTIPICA PERTINENTE. _x000D_ studieremo anche DETAILS MOLECULAR NEL SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, Un adattamento drammatico a diversi tipi di ambiente, in cui NBLR e NTCA-PIPX, entrano in altri regolatori, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. SIAMO INTERESSATI A DECIFRARE ALCUNE DELLE COMPLESSITÀ NORMATIVE, COME IL MECCANISMO DI ATTIVAZIONE E FUNZIONE DI NBLR E LE INTERAZIONI NORMATIVE DEI DIVERSI MODI CHE CONVERGONO NEL PROMOTORE NBLA. MOLTE DELLE STRATEGIE METODOLOGICHE PROPOSTE IN RELAZIONE AL PIPX SARANNO UTILIZZATE ANCHE CON NBLR. (Italian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 16 January 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
TSÜANOBAKTERID TEEVAD OXIGENICANI FOTOSÜNTEESI JA KOLONISEERIVAD ENAMIKU VALGUSTATUD ÖKOSÜSTEEMIDEST, NII ET NEIL ON SUUR MÕJU GLOBAALSETELE SÜSINIKU- JA LÄMMASTIKUTSÜKLITELE. VAATAMATA ÖKOLOOGILISELE EDULE JA BIOTEHNOLOOGILISELE TÄHTSUSELE EI OLE SELLE MITMEKÜLGSUSE JA KESKKONNAGA KOHANEMISE SUUTLIKKUSE EEST VASTUTAVAD MEHHANISMID SIISKI VEEL TEADA. SELLEGA SEOSES, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY geneetilist MANIPUATION, on EXCELLENT SÜSTEEMISED REGULATATING INTERACTIONS, mis lubavad CIANOBACTERIAS INTEGRATED JA RESPONDERLY TO MUY DÜSTEEMILINE KESKKONNAAL DYSTEMS._x000D_Esmane proposition on iseloomustada multifuncional PIPX PROTEIN, CIANOBACTERIASe CONCERNING transkriptsioneerivad regulaatorid, signaalimine PROTEINS JA metaboolsed ensüümid NETWORIK OF COMPLETE AND DINAMIC interations. KASUTADES IN VIVO KAASPUHASTAMISE KATSEID LIPU-PIPX-VALGUGA, PÜÜAME LISAKS TOPELTHÜBRIIDSETE PIPX-VALKUDE (XIP-VALGUD), KOLMEKORDSE HÜBRIDISEERIMISE (PXR, MIS ON KINDLAKS TEHTUD NII PII KUI PIPX SÖÖDANA) VÕI SILICO ANALÜÜSI (ORF2060) ABIL TUVASTADA UUSI SIGNAALRADADE KOMPONENTE, KUS PIPX OSALEB. ET ISELOOMUSTADA KOOSTOIMEID (VALKUDE JA VÕIMALIKE MÕJURITE VAHEL) ÜKSIKASJALIKUMALT, KASUTAME IN VITRO JA/VÕI KAHEKORDSEID (KOLMEKORDSEID) HÜBRIIDUURINGUID TÄIELIKE VALKUDE, MUTANTDERIVAATIDE JA/VÕI KONKREETSETE VALDKONDADEGA. KASUTAME KONFOKAALSET MIKROSKOOPIAT, ET TEHA KINDLAKS, KAS MÕNI UURITUD VALKUDEST PAIKNEB PIPX POLAARVALGUSES, MILLE DÜNAAMILINE ASUKOHT REAGEERIB TUMEDA VALGUSE TSÜKLITELE. PIPX-REGULEERITUD GEENIDE KIRJELDAMISEKS NTCA-ST SÕLTUMATULT TEOSTAME TÜVIPANEELIGA TRANSKRIPTOOMILIST ANALÜÜSI ERINEVATES KULTUURITINGIMUSTES, MIS SISALDAVAD PIPX-GEENI ERINEVAID TULETISI JA MUID SELLEGA SEOTUD GEENE. KOGUTUD ANDMEID KASUTATAKSE DIFERENTSIAALREGULEERITUD GEENIDE LIIGITAMISEKS RÜHMADESSE, KUS KEHTIVAD ÜHISED REGULATIIVSED STANDARDID, ET SEEJÄREL KÄSITLEDA ERINEVAID ASJAOMASEID REGULEERIMISMEHHANISME. ME UURIME PXR LIIDU SAITE KASUTADES KIIP-SEQ, TEAVET, ET ME INTEGREERIDA, ET ANALÜÜSI TRANSCRIPTOMICA. UURIME PIPX ALFA-HELICE1S ARGININSIDE VÕIMALIKKU METILACION’I NING UURIME VAJADUSE KORRAL MODIFIKATSIOONIDE FUNKTSIONAALSET TÄHENDUST JA GENEETILISI TEGUREID. ANALÜÜSITAKSE NII KANDIDAATMETÜÜLAAS(ID) KUI KA TEISI VALKE, MIDA LEIDUB VALGU-VALKUDES JA/VÕI RÄNIKOOSTOIMETES. EESMÄRK ON VASTAVATE GEENIDE JA ASJAKOHASE FENOTÜÜBILISE ANALÜÜSI INAKTIVEERIMINE. _x000D_ uurime ka MOLECULAR DETAILS SEMINALISATSIOONID Kloroosi PROCESS, dramaatiline kohanemine erinevate keskkonnatüüpidega, kus NBLR ja NTCA-PIPX sisenevad teistele reguleerivatele asutustele, lähenemine NBLA edendajale, oluline Physiobilisoomide degratatsiooniks. ME OLEME HUVITATUD MÕNE REGULATIIVSE KEERUKUSE DEŠIFREERIMISEST, NÄITEKS NBLRI AKTIVEERIMISE JA TOIMIMISE MEHHANISMIST NING NBLA EDENDAJA ERINEVATE LÄHENEMISVIISIDE REGULATIIVSEST VASTASMÕJUST. PALJUSID PIPXI KOHTA ESITATUD METOODILISI STRATEEGIAID KASUTATAKSE KA NBLRI PUHUL. (Estonian) | |||||||||||||||
| Property / summary: TSÜANOBAKTERID TEEVAD OXIGENICANI FOTOSÜNTEESI JA KOLONISEERIVAD ENAMIKU VALGUSTATUD ÖKOSÜSTEEMIDEST, NII ET NEIL ON SUUR MÕJU GLOBAALSETELE SÜSINIKU- JA LÄMMASTIKUTSÜKLITELE. VAATAMATA ÖKOLOOGILISELE EDULE JA BIOTEHNOLOOGILISELE TÄHTSUSELE EI OLE SELLE MITMEKÜLGSUSE JA KESKKONNAGA KOHANEMISE SUUTLIKKUSE EEST VASTUTAVAD MEHHANISMID SIISKI VEEL TEADA. SELLEGA SEOSES, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY geneetilist MANIPUATION, on EXCELLENT SÜSTEEMISED REGULATATING INTERACTIONS, mis lubavad CIANOBACTERIAS INTEGRATED JA RESPONDERLY TO MUY DÜSTEEMILINE KESKKONNAAL DYSTEMS._x000D_Esmane proposition on iseloomustada multifuncional PIPX PROTEIN, CIANOBACTERIASe CONCERNING transkriptsioneerivad regulaatorid, signaalimine PROTEINS JA metaboolsed ensüümid NETWORIK OF COMPLETE AND DINAMIC interations. KASUTADES IN VIVO KAASPUHASTAMISE KATSEID LIPU-PIPX-VALGUGA, PÜÜAME LISAKS TOPELTHÜBRIIDSETE PIPX-VALKUDE (XIP-VALGUD), KOLMEKORDSE HÜBRIDISEERIMISE (PXR, MIS ON KINDLAKS TEHTUD NII PII KUI PIPX SÖÖDANA) VÕI SILICO ANALÜÜSI (ORF2060) ABIL TUVASTADA UUSI SIGNAALRADADE KOMPONENTE, KUS PIPX OSALEB. ET ISELOOMUSTADA KOOSTOIMEID (VALKUDE JA VÕIMALIKE MÕJURITE VAHEL) ÜKSIKASJALIKUMALT, KASUTAME IN VITRO JA/VÕI KAHEKORDSEID (KOLMEKORDSEID) HÜBRIIDUURINGUID TÄIELIKE VALKUDE, MUTANTDERIVAATIDE JA/VÕI KONKREETSETE VALDKONDADEGA. KASUTAME KONFOKAALSET MIKROSKOOPIAT, ET TEHA KINDLAKS, KAS MÕNI UURITUD VALKUDEST PAIKNEB PIPX POLAARVALGUSES, MILLE DÜNAAMILINE ASUKOHT REAGEERIB TUMEDA VALGUSE TSÜKLITELE. PIPX-REGULEERITUD GEENIDE KIRJELDAMISEKS NTCA-ST SÕLTUMATULT TEOSTAME TÜVIPANEELIGA TRANSKRIPTOOMILIST ANALÜÜSI ERINEVATES KULTUURITINGIMUSTES, MIS SISALDAVAD PIPX-GEENI ERINEVAID TULETISI JA MUID SELLEGA SEOTUD GEENE. KOGUTUD ANDMEID KASUTATAKSE DIFERENTSIAALREGULEERITUD GEENIDE LIIGITAMISEKS RÜHMADESSE, KUS KEHTIVAD ÜHISED REGULATIIVSED STANDARDID, ET SEEJÄREL KÄSITLEDA ERINEVAID ASJAOMASEID REGULEERIMISMEHHANISME. ME UURIME PXR LIIDU SAITE KASUTADES KIIP-SEQ, TEAVET, ET ME INTEGREERIDA, ET ANALÜÜSI TRANSCRIPTOMICA. UURIME PIPX ALFA-HELICE1S ARGININSIDE VÕIMALIKKU METILACION’I NING UURIME VAJADUSE KORRAL MODIFIKATSIOONIDE FUNKTSIONAALSET TÄHENDUST JA GENEETILISI TEGUREID. ANALÜÜSITAKSE NII KANDIDAATMETÜÜLAAS(ID) KUI KA TEISI VALKE, MIDA LEIDUB VALGU-VALKUDES JA/VÕI RÄNIKOOSTOIMETES. EESMÄRK ON VASTAVATE GEENIDE JA ASJAKOHASE FENOTÜÜBILISE ANALÜÜSI INAKTIVEERIMINE. _x000D_ uurime ka MOLECULAR DETAILS SEMINALISATSIOONID Kloroosi PROCESS, dramaatiline kohanemine erinevate keskkonnatüüpidega, kus NBLR ja NTCA-PIPX sisenevad teistele reguleerivatele asutustele, lähenemine NBLA edendajale, oluline Physiobilisoomide degratatsiooniks. ME OLEME HUVITATUD MÕNE REGULATIIVSE KEERUKUSE DEŠIFREERIMISEST, NÄITEKS NBLRI AKTIVEERIMISE JA TOIMIMISE MEHHANISMIST NING NBLA EDENDAJA ERINEVATE LÄHENEMISVIISIDE REGULATIIVSEST VASTASMÕJUST. PALJUSID PIPXI KOHTA ESITATUD METOODILISI STRATEEGIAID KASUTATAKSE KA NBLRI PUHUL. (Estonian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: TSÜANOBAKTERID TEEVAD OXIGENICANI FOTOSÜNTEESI JA KOLONISEERIVAD ENAMIKU VALGUSTATUD ÖKOSÜSTEEMIDEST, NII ET NEIL ON SUUR MÕJU GLOBAALSETELE SÜSINIKU- JA LÄMMASTIKUTSÜKLITELE. VAATAMATA ÖKOLOOGILISELE EDULE JA BIOTEHNOLOOGILISELE TÄHTSUSELE EI OLE SELLE MITMEKÜLGSUSE JA KESKKONNAGA KOHANEMISE SUUTLIKKUSE EEST VASTUTAVAD MEHHANISMID SIISKI VEEL TEADA. SELLEGA SEOSES, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY geneetilist MANIPUATION, on EXCELLENT SÜSTEEMISED REGULATATING INTERACTIONS, mis lubavad CIANOBACTERIAS INTEGRATED JA RESPONDERLY TO MUY DÜSTEEMILINE KESKKONNAAL DYSTEMS._x000D_Esmane proposition on iseloomustada multifuncional PIPX PROTEIN, CIANOBACTERIASe CONCERNING transkriptsioneerivad regulaatorid, signaalimine PROTEINS JA metaboolsed ensüümid NETWORIK OF COMPLETE AND DINAMIC interations. KASUTADES IN VIVO KAASPUHASTAMISE KATSEID LIPU-PIPX-VALGUGA, PÜÜAME LISAKS TOPELTHÜBRIIDSETE PIPX-VALKUDE (XIP-VALGUD), KOLMEKORDSE HÜBRIDISEERIMISE (PXR, MIS ON KINDLAKS TEHTUD NII PII KUI PIPX SÖÖDANA) VÕI SILICO ANALÜÜSI (ORF2060) ABIL TUVASTADA UUSI SIGNAALRADADE KOMPONENTE, KUS PIPX OSALEB. ET ISELOOMUSTADA KOOSTOIMEID (VALKUDE JA VÕIMALIKE MÕJURITE VAHEL) ÜKSIKASJALIKUMALT, KASUTAME IN VITRO JA/VÕI KAHEKORDSEID (KOLMEKORDSEID) HÜBRIIDUURINGUID TÄIELIKE VALKUDE, MUTANTDERIVAATIDE JA/VÕI KONKREETSETE VALDKONDADEGA. KASUTAME KONFOKAALSET MIKROSKOOPIAT, ET TEHA KINDLAKS, KAS MÕNI UURITUD VALKUDEST PAIKNEB PIPX POLAARVALGUSES, MILLE DÜNAAMILINE ASUKOHT REAGEERIB TUMEDA VALGUSE TSÜKLITELE. PIPX-REGULEERITUD GEENIDE KIRJELDAMISEKS NTCA-ST SÕLTUMATULT TEOSTAME TÜVIPANEELIGA TRANSKRIPTOOMILIST ANALÜÜSI ERINEVATES KULTUURITINGIMUSTES, MIS SISALDAVAD PIPX-GEENI ERINEVAID TULETISI JA MUID SELLEGA SEOTUD GEENE. KOGUTUD ANDMEID KASUTATAKSE DIFERENTSIAALREGULEERITUD GEENIDE LIIGITAMISEKS RÜHMADESSE, KUS KEHTIVAD ÜHISED REGULATIIVSED STANDARDID, ET SEEJÄREL KÄSITLEDA ERINEVAID ASJAOMASEID REGULEERIMISMEHHANISME. ME UURIME PXR LIIDU SAITE KASUTADES KIIP-SEQ, TEAVET, ET ME INTEGREERIDA, ET ANALÜÜSI TRANSCRIPTOMICA. UURIME PIPX ALFA-HELICE1S ARGININSIDE VÕIMALIKKU METILACION’I NING UURIME VAJADUSE KORRAL MODIFIKATSIOONIDE FUNKTSIONAALSET TÄHENDUST JA GENEETILISI TEGUREID. ANALÜÜSITAKSE NII KANDIDAATMETÜÜLAAS(ID) KUI KA TEISI VALKE, MIDA LEIDUB VALGU-VALKUDES JA/VÕI RÄNIKOOSTOIMETES. EESMÄRK ON VASTAVATE GEENIDE JA ASJAKOHASE FENOTÜÜBILISE ANALÜÜSI INAKTIVEERIMINE. _x000D_ uurime ka MOLECULAR DETAILS SEMINALISATSIOONID Kloroosi PROCESS, dramaatiline kohanemine erinevate keskkonnatüüpidega, kus NBLR ja NTCA-PIPX sisenevad teistele reguleerivatele asutustele, lähenemine NBLA edendajale, oluline Physiobilisoomide degratatsiooniks. ME OLEME HUVITATUD MÕNE REGULATIIVSE KEERUKUSE DEŠIFREERIMISEST, NÄITEKS NBLRI AKTIVEERIMISE JA TOIMIMISE MEHHANISMIST NING NBLA EDENDAJA ERINEVATE LÄHENEMISVIISIDE REGULATIIVSEST VASTASMÕJUST. PALJUSID PIPXI KOHTA ESITATUD METOODILISI STRATEEGIAID KASUTATAKSE KA NBLRI PUHUL. (Estonian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
CIANOBAKTERIJOS ATLIEKA OXIGENICAN FOTOSINTEZĘ IR KOLONIZUOJA DAUGUMĄ APŠVIESTŲ EKOSISTEMŲ, TODĖL JOS TURI DIDELĮ POVEIKĮ PASAULINIAMS ANGLIES IR AZOTO CIKLAMS. TAČIAU, NEPAISANT JOS EKOLOGINĖS SĖKMĖS IR BIOTECHNOLOGINĖS SVARBOS, MECHANIZMAI, ATSAKINGI UŽ ŠĮ ĮVAIRIAPUSIŠKUMĄ IR GEBĖJIMĄ PRISITAIKYTI PRIE APLINKOS APSAUGOS, LIEKA NEŽINOMI. ŠIAME KONTEKSTE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY genetinės MANIPUACIJOS, yra puikus SISTEMA REGULATacinių INTERACIONŲ, leidžiančių CIANOBACTERIAS INTEGRATED ir RESPONDERLY SU MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Pagrindinis šio projekto pasiūlymas yra apibūdinti multifuncionalinį PIPX PROTEIN, JT CIANOBACTERIAS, dalyvaujantis transkripcijos reguliatoriams, signalizuojantiems PROTEINS IR metaboliniams fermentams, dalyvaujant komplemento ir DINAMIC intervencijų tinkleliams. ATLIKDAMI IN VIVO BENDRO GRYNINIMO BANDYMUS SU VĖLIAVŲ PIPX BALTYMU, SIEKIAME NUSTATYTI NAUJUS SIGNALIZAVIMO BŪDŲ, KURIUOSE DALYVAUJA PIPX, KOMPONENTUS, TAIP PAT PATVIRTINAME SĄVEIKĄ IR ANKSTESNIUS DVIGUBO HIBRIDIZUOTŲ PIPX (XIP BALTYMŲ), TRIGUBOS HIBRIDIZACIJOS (PXR, IDENTIFIKUOJAMOS NAUDOJANT PII IR PIPX KAIP MASALĄ) ARBA SILIKATO ANALIZĖS (ORF2060) REZULTATUS. NORĖDAMI IŠSAMIAU APIBŪDINTI SĄVEIKĄ (TARP BALTYMŲ IR GALIMŲ EFEKTŲ), MES NAUDOSIME IN VITRO IR (ARBA) DVIGUBUS (TRIGUBUS) HIBRIDINIUS TYRIMUS SU VISAIS BALTYMAIS, MUTANTAIS IR (ARBA) SPECIFINĖMIS SRITIMIS. MES KREIPSIMĖS Į KONFOKALINĖS MIKROSKOPIJOS NAUDOJIMĄ, KAD NUSTATYTUME, AR KURIS NORS IŠ BALTYMŲ TIRTAS KOLOKALIZĖS POLIARINIUOSE PIPX PROŽEKTORIUOSE, KURIŲ DINAMIŠKA VIETA REAGUOJA Į TAMSIOS ŠVIESOS CIKLUS. NORĖDAMI APIBŪDINTI PIPX REGULIUOJAMUS GENUS NEPRIKLAUSOMAI NUO NTCA, MES ATLIKSIME TRANSKRIPTOMINĘ ANALIZĘ SU PADERMĖS SKYDELIU SKIRTINGOMIS KULTŪROS SĄLYGOMIS, APIMANČIOMIS ĮVAIRIŲ TIPŲ PIPX GENO DARINIUS IR KITUS SUSIJUSIUS GENUS. GAUTI DUOMENYS BUS NAUDOJAMI KLASIFIKUOJANT SKIRTINGAI REGULIUOJAMUS GENUS Į GRUPES, KURIOMS TAIKOMI BENDRI REGULIAVIMO STANDARTAI, KAD BŪTŲ ATSIŽVELGTA Į ĮVAIRIUS SUSIJUSIUS REGULIAVIMO MECHANIZMUS. MES TIRSIME PXR SĄJUNGOS SVETAINES NAUDODAMI LUSTĄ-SEQ, INFORMACIJĄ, KURIĄ INTEGRUOSIME SU TRANSCRIPTOMICA ANALIZE. MES IŠTIRSIME GALIMĄ ARGININS METILACIONĄ PIPX ALFA-HELICE1 IR, JEI REIKIA, IŠNAGRINĖSIME PAKEITIMŲ FUNKCINĘ REIKŠMĘ IR GENETINIUS VEIKSNIUS. BUS ANALIZUOJAMOS IR POTENCIALIOS METILAZĖS (-Ų), IR KITŲ BALTYMŲ, APTINKAMŲ BALTYMŲ BALTYMUOSE IR (ARBA) SILIKAGOLIO SĄVEIKOSE, TYRIMAI. KETINAMA NEAKTYVINTI ATITINKAMUS GENUS IR ATITINKAMĄ FENOTIPINĘ ANALIZĘ. _x000D_ mes taip pat studijuos MOLECULAR DETAI SEMINALIZACIJOS PROCESAS chlorosis, dramatiškas prisitaikymas prie įvairių tipų aplinkos, kurioje NBLR ir NTCA-PIPX, įvesti kitus reguliuotojus, Konverge už NBLA Promotor, esential for The Degratation of Physiobilisomas. ESAME SUINTERESUOTI IŠŠIFRUOTI KAI KURIUOS REGULIAVIMO SUDĖTINGUMĄ, PVZ., NBLR AKTYVAVIMO IR FUNKCIJOS MECHANIZMĄ IR ĮVAIRIŲ BŪDŲ, KURIE SUSILIEJA SU NBLA PROJEKTO RENGĖJU, REGULIAVIMO SĄVEIKĄ. DAUGELIS SIŪLOMŲ METODOLOGINIŲ STRATEGIJŲ, SUSIJUSIŲ SU PIPX, TAIP PAT BUS TAIKOMOS SU NBLR. (Lithuanian) | |||||||||||||||
| Property / summary: CIANOBAKTERIJOS ATLIEKA OXIGENICAN FOTOSINTEZĘ IR KOLONIZUOJA DAUGUMĄ APŠVIESTŲ EKOSISTEMŲ, TODĖL JOS TURI DIDELĮ POVEIKĮ PASAULINIAMS ANGLIES IR AZOTO CIKLAMS. TAČIAU, NEPAISANT JOS EKOLOGINĖS SĖKMĖS IR BIOTECHNOLOGINĖS SVARBOS, MECHANIZMAI, ATSAKINGI UŽ ŠĮ ĮVAIRIAPUSIŠKUMĄ IR GEBĖJIMĄ PRISITAIKYTI PRIE APLINKOS APSAUGOS, LIEKA NEŽINOMI. ŠIAME KONTEKSTE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY genetinės MANIPUACIJOS, yra puikus SISTEMA REGULATacinių INTERACIONŲ, leidžiančių CIANOBACTERIAS INTEGRATED ir RESPONDERLY SU MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Pagrindinis šio projekto pasiūlymas yra apibūdinti multifuncionalinį PIPX PROTEIN, JT CIANOBACTERIAS, dalyvaujantis transkripcijos reguliatoriams, signalizuojantiems PROTEINS IR metaboliniams fermentams, dalyvaujant komplemento ir DINAMIC intervencijų tinkleliams. ATLIKDAMI IN VIVO BENDRO GRYNINIMO BANDYMUS SU VĖLIAVŲ PIPX BALTYMU, SIEKIAME NUSTATYTI NAUJUS SIGNALIZAVIMO BŪDŲ, KURIUOSE DALYVAUJA PIPX, KOMPONENTUS, TAIP PAT PATVIRTINAME SĄVEIKĄ IR ANKSTESNIUS DVIGUBO HIBRIDIZUOTŲ PIPX (XIP BALTYMŲ), TRIGUBOS HIBRIDIZACIJOS (PXR, IDENTIFIKUOJAMOS NAUDOJANT PII IR PIPX KAIP MASALĄ) ARBA SILIKATO ANALIZĖS (ORF2060) REZULTATUS. NORĖDAMI IŠSAMIAU APIBŪDINTI SĄVEIKĄ (TARP BALTYMŲ IR GALIMŲ EFEKTŲ), MES NAUDOSIME IN VITRO IR (ARBA) DVIGUBUS (TRIGUBUS) HIBRIDINIUS TYRIMUS SU VISAIS BALTYMAIS, MUTANTAIS IR (ARBA) SPECIFINĖMIS SRITIMIS. MES KREIPSIMĖS Į KONFOKALINĖS MIKROSKOPIJOS NAUDOJIMĄ, KAD NUSTATYTUME, AR KURIS NORS IŠ BALTYMŲ TIRTAS KOLOKALIZĖS POLIARINIUOSE PIPX PROŽEKTORIUOSE, KURIŲ DINAMIŠKA VIETA REAGUOJA Į TAMSIOS ŠVIESOS CIKLUS. NORĖDAMI APIBŪDINTI PIPX REGULIUOJAMUS GENUS NEPRIKLAUSOMAI NUO NTCA, MES ATLIKSIME TRANSKRIPTOMINĘ ANALIZĘ SU PADERMĖS SKYDELIU SKIRTINGOMIS KULTŪROS SĄLYGOMIS, APIMANČIOMIS ĮVAIRIŲ TIPŲ PIPX GENO DARINIUS IR KITUS SUSIJUSIUS GENUS. GAUTI DUOMENYS BUS NAUDOJAMI KLASIFIKUOJANT SKIRTINGAI REGULIUOJAMUS GENUS Į GRUPES, KURIOMS TAIKOMI BENDRI REGULIAVIMO STANDARTAI, KAD BŪTŲ ATSIŽVELGTA Į ĮVAIRIUS SUSIJUSIUS REGULIAVIMO MECHANIZMUS. MES TIRSIME PXR SĄJUNGOS SVETAINES NAUDODAMI LUSTĄ-SEQ, INFORMACIJĄ, KURIĄ INTEGRUOSIME SU TRANSCRIPTOMICA ANALIZE. MES IŠTIRSIME GALIMĄ ARGININS METILACIONĄ PIPX ALFA-HELICE1 IR, JEI REIKIA, IŠNAGRINĖSIME PAKEITIMŲ FUNKCINĘ REIKŠMĘ IR GENETINIUS VEIKSNIUS. BUS ANALIZUOJAMOS IR POTENCIALIOS METILAZĖS (-Ų), IR KITŲ BALTYMŲ, APTINKAMŲ BALTYMŲ BALTYMUOSE IR (ARBA) SILIKAGOLIO SĄVEIKOSE, TYRIMAI. KETINAMA NEAKTYVINTI ATITINKAMUS GENUS IR ATITINKAMĄ FENOTIPINĘ ANALIZĘ. _x000D_ mes taip pat studijuos MOLECULAR DETAI SEMINALIZACIJOS PROCESAS chlorosis, dramatiškas prisitaikymas prie įvairių tipų aplinkos, kurioje NBLR ir NTCA-PIPX, įvesti kitus reguliuotojus, Konverge už NBLA Promotor, esential for The Degratation of Physiobilisomas. ESAME SUINTERESUOTI IŠŠIFRUOTI KAI KURIUOS REGULIAVIMO SUDĖTINGUMĄ, PVZ., NBLR AKTYVAVIMO IR FUNKCIJOS MECHANIZMĄ IR ĮVAIRIŲ BŪDŲ, KURIE SUSILIEJA SU NBLA PROJEKTO RENGĖJU, REGULIAVIMO SĄVEIKĄ. DAUGELIS SIŪLOMŲ METODOLOGINIŲ STRATEGIJŲ, SUSIJUSIŲ SU PIPX, TAIP PAT BUS TAIKOMOS SU NBLR. (Lithuanian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: CIANOBAKTERIJOS ATLIEKA OXIGENICAN FOTOSINTEZĘ IR KOLONIZUOJA DAUGUMĄ APŠVIESTŲ EKOSISTEMŲ, TODĖL JOS TURI DIDELĮ POVEIKĮ PASAULINIAMS ANGLIES IR AZOTO CIKLAMS. TAČIAU, NEPAISANT JOS EKOLOGINĖS SĖKMĖS IR BIOTECHNOLOGINĖS SVARBOS, MECHANIZMAI, ATSAKINGI UŽ ŠĮ ĮVAIRIAPUSIŠKUMĄ IR GEBĖJIMĄ PRISITAIKYTI PRIE APLINKOS APSAUGOS, LIEKA NEŽINOMI. ŠIAME KONTEKSTE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY genetinės MANIPUACIJOS, yra puikus SISTEMA REGULATacinių INTERACIONŲ, leidžiančių CIANOBACTERIAS INTEGRATED ir RESPONDERLY SU MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Pagrindinis šio projekto pasiūlymas yra apibūdinti multifuncionalinį PIPX PROTEIN, JT CIANOBACTERIAS, dalyvaujantis transkripcijos reguliatoriams, signalizuojantiems PROTEINS IR metaboliniams fermentams, dalyvaujant komplemento ir DINAMIC intervencijų tinkleliams. ATLIKDAMI IN VIVO BENDRO GRYNINIMO BANDYMUS SU VĖLIAVŲ PIPX BALTYMU, SIEKIAME NUSTATYTI NAUJUS SIGNALIZAVIMO BŪDŲ, KURIUOSE DALYVAUJA PIPX, KOMPONENTUS, TAIP PAT PATVIRTINAME SĄVEIKĄ IR ANKSTESNIUS DVIGUBO HIBRIDIZUOTŲ PIPX (XIP BALTYMŲ), TRIGUBOS HIBRIDIZACIJOS (PXR, IDENTIFIKUOJAMOS NAUDOJANT PII IR PIPX KAIP MASALĄ) ARBA SILIKATO ANALIZĖS (ORF2060) REZULTATUS. NORĖDAMI IŠSAMIAU APIBŪDINTI SĄVEIKĄ (TARP BALTYMŲ IR GALIMŲ EFEKTŲ), MES NAUDOSIME IN VITRO IR (ARBA) DVIGUBUS (TRIGUBUS) HIBRIDINIUS TYRIMUS SU VISAIS BALTYMAIS, MUTANTAIS IR (ARBA) SPECIFINĖMIS SRITIMIS. MES KREIPSIMĖS Į KONFOKALINĖS MIKROSKOPIJOS NAUDOJIMĄ, KAD NUSTATYTUME, AR KURIS NORS IŠ BALTYMŲ TIRTAS KOLOKALIZĖS POLIARINIUOSE PIPX PROŽEKTORIUOSE, KURIŲ DINAMIŠKA VIETA REAGUOJA Į TAMSIOS ŠVIESOS CIKLUS. NORĖDAMI APIBŪDINTI PIPX REGULIUOJAMUS GENUS NEPRIKLAUSOMAI NUO NTCA, MES ATLIKSIME TRANSKRIPTOMINĘ ANALIZĘ SU PADERMĖS SKYDELIU SKIRTINGOMIS KULTŪROS SĄLYGOMIS, APIMANČIOMIS ĮVAIRIŲ TIPŲ PIPX GENO DARINIUS IR KITUS SUSIJUSIUS GENUS. GAUTI DUOMENYS BUS NAUDOJAMI KLASIFIKUOJANT SKIRTINGAI REGULIUOJAMUS GENUS Į GRUPES, KURIOMS TAIKOMI BENDRI REGULIAVIMO STANDARTAI, KAD BŪTŲ ATSIŽVELGTA Į ĮVAIRIUS SUSIJUSIUS REGULIAVIMO MECHANIZMUS. MES TIRSIME PXR SĄJUNGOS SVETAINES NAUDODAMI LUSTĄ-SEQ, INFORMACIJĄ, KURIĄ INTEGRUOSIME SU TRANSCRIPTOMICA ANALIZE. MES IŠTIRSIME GALIMĄ ARGININS METILACIONĄ PIPX ALFA-HELICE1 IR, JEI REIKIA, IŠNAGRINĖSIME PAKEITIMŲ FUNKCINĘ REIKŠMĘ IR GENETINIUS VEIKSNIUS. BUS ANALIZUOJAMOS IR POTENCIALIOS METILAZĖS (-Ų), IR KITŲ BALTYMŲ, APTINKAMŲ BALTYMŲ BALTYMUOSE IR (ARBA) SILIKAGOLIO SĄVEIKOSE, TYRIMAI. KETINAMA NEAKTYVINTI ATITINKAMUS GENUS IR ATITINKAMĄ FENOTIPINĘ ANALIZĘ. _x000D_ mes taip pat studijuos MOLECULAR DETAI SEMINALIZACIJOS PROCESAS chlorosis, dramatiškas prisitaikymas prie įvairių tipų aplinkos, kurioje NBLR ir NTCA-PIPX, įvesti kitus reguliuotojus, Konverge už NBLA Promotor, esential for The Degratation of Physiobilisomas. ESAME SUINTERESUOTI IŠŠIFRUOTI KAI KURIUOS REGULIAVIMO SUDĖTINGUMĄ, PVZ., NBLR AKTYVAVIMO IR FUNKCIJOS MECHANIZMĄ IR ĮVAIRIŲ BŪDŲ, KURIE SUSILIEJA SU NBLA PROJEKTO RENGĖJU, REGULIAVIMO SĄVEIKĄ. DAUGELIS SIŪLOMŲ METODOLOGINIŲ STRATEGIJŲ, SUSIJUSIŲ SU PIPX, TAIP PAT BUS TAIKOMOS SU NBLR. (Lithuanian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
CIJANOBAKTERIJE IZVODE OXIGENICAN FOTOSINTEZU I KOLONIZIRAJU VEĆINU OSVIJETLJENIH EKOSUSTAVA, TAKO DA IMAJU VELIK UTJECAJ NA GLOBALNE CIKLUSE UGLJIKA I DUŠIKA. MEĐUTIM, UNATOČ EKOLOŠKOM USPJEHU I BIOTEHNOLOŠKOJ VAŽNOSTI, MEHANIZMI KOJI SU ODGOVORNI ZA TU SVESTRANOST I SPOSOBNOST PRILAGODBE OKOLIŠA I DALJE SU NEPOZNATI. U TOM KONTEKSTU, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, Od RELATIVNO FACILITY genetički MANIPUATION, IZVJEŠĆE SUSTAVNI SUSTAV ZA STUDIJE REGULATING INTERACTIONS koji dopuštaju CIANOBACTERIAS INTEGRATED I RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Primarni prijedlog ovog projekta je karakterizirati multifuncionalni PIPX PROTEIN, a UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING transkripcijski regulatori, Signalizing PROTEINS I metabolički enzimas U MREŽU COMPLETE I DINAMIC interations. KORIŠTENJEM IN VIVO KO-PROČIŠĆAVANJA S PROTEINOM FLAG-PIPX NASTOJIMO IDENTIFICIRATI NOVE KOMPONENTE SIGNALNIH PUTOVA U KOJIMA SUDJELUJE PIPX, UZ VALIDACIJU INTERAKCIJA I PRETHODNIH REZULTATA DVOSTRUKO HIBRIDIZIRANIH PIPX (XIP PROTEINA), TROSTRUKE HIBRIDIZACIJE (PXR, IDENTIFICIRANE POMOĆU PII I PIPX KAO MAMAC) ILI U SILICO ANALIZI (ORF2060). KAKO BISMO DETALJNIJE OKARAKTERIZIRALI INTERAKCIJE (IZMEĐU PROTEINA I S MOGUĆIM EFEKTORIMA), KORISTIT ĆEMO IN VITRO I/ILI DVOSTRUKA (TROSTRUKA) HIBRIDNA ISPITIVANJA S POTPUNIM PROTEINIMA, DERIVATIMA MUTANATA I/ILI SPECIFIČNIM DOMENAMA. MI ĆEMO POSEGNUTI ZA KORIŠTENJEM KONFOKALNE MIKROSKOPIJE KAKO BISMO UTVRDILI JE LI BILO KOJI OD PROTEINA PROUČAVAN KO-LOKALIZIRA U POLARNIM REFLEKTORIMA PIPX, ČIJA DINAMIČKA LOKACIJA REAGIRA NA CIKLUSE TAMNE SVJETLOSTI. ZA OPIS GENA REGULIRANIH PIPX-OM NEOVISNO O NTCA, IZVRŠIT ĆEMO TRANSKRIPTOMSKU ANALIZU POMOĆU SOJA PLOČE, U RAZLIČITIM UVJETIMA KULTURE, KOJA UKLJUČUJE RAZLIČITE VRSTE DERIVATA PIPX GENA I DRUGE SRODNE GENE. DOBIVENI PODACI UPOTREBLJAVAT ĆE SE ZA RAZVRSTAVANJE RAZLIČITO REGULIRANIH GENA U SKUPINE SA ZAJEDNIČKIM REGULATORNIM STANDARDIMA, A ZATIM ZA RJEŠAVANJE RAZLIČITIH UKLJUČENIH REGULATORNIH MEHANIZAMA. ISTRAŽIT ĆEMO LOKACIJE PXR UNIJE KORISTEĆI ČIP-SEQ, INFORMACIJE KOJE ĆEMO S NJIMA INTEGRIRATI IZ ANALIZE TRANSCRIPTOMICA. ISTRAŽIT ĆEMO MOGUĆI METILACION ARGININS U PIPX ALFA-HELICE1 I, PREMA POTREBI, PROUČITI FUNKCIONALNO ZNAČENJE I GENETSKE ODREDNICE IZMJENA. ANALIZIRAT ĆE SE I METILAZE KANDIDATA I DRUGE BJELANČEVINE PRONAĐENE U INTERAKCIJAMA BJELANČEVINA I/ILI SILICIJA. NAMJERA JE NEAKTIVIRATI ODGOVARAJUĆE GENE I RELEVANTNU FENOTIPSKU ANALIZU. _x000D_ također ćemo proučavati MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS of chlorosis, A dramatična prilagodba različitim vrstama okoliša, u kojoj NBLR i NTCA-PIPX, ulaze u druge regulatore, Converge za Promotor NBLA, esencijal za degraciju fiziobilisoma. ZAINTERESIRANI SMO ZA DEŠIFRIRANJE NEKIH REGULATORNIH SLOŽENOSTI, KAO ŠTO SU MEHANIZAM AKTIVACIJE I FUNKCIJE NBLR-A TE REGULATORNE INTERAKCIJE RAZLIČITIH NAČINA KOJI SE KONVERGIRAJU U PROMOTORU NBLA-A. MNOGE METODOLOŠKE STRATEGIJE PREDLOŽENE U VEZI S PIPX-OM TAKOĐER ĆE SE KORISTITI S NBLR-OM. (Croatian) | |||||||||||||||
| Property / summary: CIJANOBAKTERIJE IZVODE OXIGENICAN FOTOSINTEZU I KOLONIZIRAJU VEĆINU OSVIJETLJENIH EKOSUSTAVA, TAKO DA IMAJU VELIK UTJECAJ NA GLOBALNE CIKLUSE UGLJIKA I DUŠIKA. MEĐUTIM, UNATOČ EKOLOŠKOM USPJEHU I BIOTEHNOLOŠKOJ VAŽNOSTI, MEHANIZMI KOJI SU ODGOVORNI ZA TU SVESTRANOST I SPOSOBNOST PRILAGODBE OKOLIŠA I DALJE SU NEPOZNATI. U TOM KONTEKSTU, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, Od RELATIVNO FACILITY genetički MANIPUATION, IZVJEŠĆE SUSTAVNI SUSTAV ZA STUDIJE REGULATING INTERACTIONS koji dopuštaju CIANOBACTERIAS INTEGRATED I RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Primarni prijedlog ovog projekta je karakterizirati multifuncionalni PIPX PROTEIN, a UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING transkripcijski regulatori, Signalizing PROTEINS I metabolički enzimas U MREŽU COMPLETE I DINAMIC interations. KORIŠTENJEM IN VIVO KO-PROČIŠĆAVANJA S PROTEINOM FLAG-PIPX NASTOJIMO IDENTIFICIRATI NOVE KOMPONENTE SIGNALNIH PUTOVA U KOJIMA SUDJELUJE PIPX, UZ VALIDACIJU INTERAKCIJA I PRETHODNIH REZULTATA DVOSTRUKO HIBRIDIZIRANIH PIPX (XIP PROTEINA), TROSTRUKE HIBRIDIZACIJE (PXR, IDENTIFICIRANE POMOĆU PII I PIPX KAO MAMAC) ILI U SILICO ANALIZI (ORF2060). KAKO BISMO DETALJNIJE OKARAKTERIZIRALI INTERAKCIJE (IZMEĐU PROTEINA I S MOGUĆIM EFEKTORIMA), KORISTIT ĆEMO IN VITRO I/ILI DVOSTRUKA (TROSTRUKA) HIBRIDNA ISPITIVANJA S POTPUNIM PROTEINIMA, DERIVATIMA MUTANATA I/ILI SPECIFIČNIM DOMENAMA. MI ĆEMO POSEGNUTI ZA KORIŠTENJEM KONFOKALNE MIKROSKOPIJE KAKO BISMO UTVRDILI JE LI BILO KOJI OD PROTEINA PROUČAVAN KO-LOKALIZIRA U POLARNIM REFLEKTORIMA PIPX, ČIJA DINAMIČKA LOKACIJA REAGIRA NA CIKLUSE TAMNE SVJETLOSTI. ZA OPIS GENA REGULIRANIH PIPX-OM NEOVISNO O NTCA, IZVRŠIT ĆEMO TRANSKRIPTOMSKU ANALIZU POMOĆU SOJA PLOČE, U RAZLIČITIM UVJETIMA KULTURE, KOJA UKLJUČUJE RAZLIČITE VRSTE DERIVATA PIPX GENA I DRUGE SRODNE GENE. DOBIVENI PODACI UPOTREBLJAVAT ĆE SE ZA RAZVRSTAVANJE RAZLIČITO REGULIRANIH GENA U SKUPINE SA ZAJEDNIČKIM REGULATORNIM STANDARDIMA, A ZATIM ZA RJEŠAVANJE RAZLIČITIH UKLJUČENIH REGULATORNIH MEHANIZAMA. ISTRAŽIT ĆEMO LOKACIJE PXR UNIJE KORISTEĆI ČIP-SEQ, INFORMACIJE KOJE ĆEMO S NJIMA INTEGRIRATI IZ ANALIZE TRANSCRIPTOMICA. ISTRAŽIT ĆEMO MOGUĆI METILACION ARGININS U PIPX ALFA-HELICE1 I, PREMA POTREBI, PROUČITI FUNKCIONALNO ZNAČENJE I GENETSKE ODREDNICE IZMJENA. ANALIZIRAT ĆE SE I METILAZE KANDIDATA I DRUGE BJELANČEVINE PRONAĐENE U INTERAKCIJAMA BJELANČEVINA I/ILI SILICIJA. NAMJERA JE NEAKTIVIRATI ODGOVARAJUĆE GENE I RELEVANTNU FENOTIPSKU ANALIZU. _x000D_ također ćemo proučavati MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS of chlorosis, A dramatična prilagodba različitim vrstama okoliša, u kojoj NBLR i NTCA-PIPX, ulaze u druge regulatore, Converge za Promotor NBLA, esencijal za degraciju fiziobilisoma. ZAINTERESIRANI SMO ZA DEŠIFRIRANJE NEKIH REGULATORNIH SLOŽENOSTI, KAO ŠTO SU MEHANIZAM AKTIVACIJE I FUNKCIJE NBLR-A TE REGULATORNE INTERAKCIJE RAZLIČITIH NAČINA KOJI SE KONVERGIRAJU U PROMOTORU NBLA-A. MNOGE METODOLOŠKE STRATEGIJE PREDLOŽENE U VEZI S PIPX-OM TAKOĐER ĆE SE KORISTITI S NBLR-OM. (Croatian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: CIJANOBAKTERIJE IZVODE OXIGENICAN FOTOSINTEZU I KOLONIZIRAJU VEĆINU OSVIJETLJENIH EKOSUSTAVA, TAKO DA IMAJU VELIK UTJECAJ NA GLOBALNE CIKLUSE UGLJIKA I DUŠIKA. MEĐUTIM, UNATOČ EKOLOŠKOM USPJEHU I BIOTEHNOLOŠKOJ VAŽNOSTI, MEHANIZMI KOJI SU ODGOVORNI ZA TU SVESTRANOST I SPOSOBNOST PRILAGODBE OKOLIŠA I DALJE SU NEPOZNATI. U TOM KONTEKSTU, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, Od RELATIVNO FACILITY genetički MANIPUATION, IZVJEŠĆE SUSTAVNI SUSTAV ZA STUDIJE REGULATING INTERACTIONS koji dopuštaju CIANOBACTERIAS INTEGRATED I RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Primarni prijedlog ovog projekta je karakterizirati multifuncionalni PIPX PROTEIN, a UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING transkripcijski regulatori, Signalizing PROTEINS I metabolički enzimas U MREŽU COMPLETE I DINAMIC interations. KORIŠTENJEM IN VIVO KO-PROČIŠĆAVANJA S PROTEINOM FLAG-PIPX NASTOJIMO IDENTIFICIRATI NOVE KOMPONENTE SIGNALNIH PUTOVA U KOJIMA SUDJELUJE PIPX, UZ VALIDACIJU INTERAKCIJA I PRETHODNIH REZULTATA DVOSTRUKO HIBRIDIZIRANIH PIPX (XIP PROTEINA), TROSTRUKE HIBRIDIZACIJE (PXR, IDENTIFICIRANE POMOĆU PII I PIPX KAO MAMAC) ILI U SILICO ANALIZI (ORF2060). KAKO BISMO DETALJNIJE OKARAKTERIZIRALI INTERAKCIJE (IZMEĐU PROTEINA I S MOGUĆIM EFEKTORIMA), KORISTIT ĆEMO IN VITRO I/ILI DVOSTRUKA (TROSTRUKA) HIBRIDNA ISPITIVANJA S POTPUNIM PROTEINIMA, DERIVATIMA MUTANATA I/ILI SPECIFIČNIM DOMENAMA. MI ĆEMO POSEGNUTI ZA KORIŠTENJEM KONFOKALNE MIKROSKOPIJE KAKO BISMO UTVRDILI JE LI BILO KOJI OD PROTEINA PROUČAVAN KO-LOKALIZIRA U POLARNIM REFLEKTORIMA PIPX, ČIJA DINAMIČKA LOKACIJA REAGIRA NA CIKLUSE TAMNE SVJETLOSTI. ZA OPIS GENA REGULIRANIH PIPX-OM NEOVISNO O NTCA, IZVRŠIT ĆEMO TRANSKRIPTOMSKU ANALIZU POMOĆU SOJA PLOČE, U RAZLIČITIM UVJETIMA KULTURE, KOJA UKLJUČUJE RAZLIČITE VRSTE DERIVATA PIPX GENA I DRUGE SRODNE GENE. DOBIVENI PODACI UPOTREBLJAVAT ĆE SE ZA RAZVRSTAVANJE RAZLIČITO REGULIRANIH GENA U SKUPINE SA ZAJEDNIČKIM REGULATORNIM STANDARDIMA, A ZATIM ZA RJEŠAVANJE RAZLIČITIH UKLJUČENIH REGULATORNIH MEHANIZAMA. ISTRAŽIT ĆEMO LOKACIJE PXR UNIJE KORISTEĆI ČIP-SEQ, INFORMACIJE KOJE ĆEMO S NJIMA INTEGRIRATI IZ ANALIZE TRANSCRIPTOMICA. ISTRAŽIT ĆEMO MOGUĆI METILACION ARGININS U PIPX ALFA-HELICE1 I, PREMA POTREBI, PROUČITI FUNKCIONALNO ZNAČENJE I GENETSKE ODREDNICE IZMJENA. ANALIZIRAT ĆE SE I METILAZE KANDIDATA I DRUGE BJELANČEVINE PRONAĐENE U INTERAKCIJAMA BJELANČEVINA I/ILI SILICIJA. NAMJERA JE NEAKTIVIRATI ODGOVARAJUĆE GENE I RELEVANTNU FENOTIPSKU ANALIZU. _x000D_ također ćemo proučavati MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS of chlorosis, A dramatična prilagodba različitim vrstama okoliša, u kojoj NBLR i NTCA-PIPX, ulaze u druge regulatore, Converge za Promotor NBLA, esencijal za degraciju fiziobilisoma. ZAINTERESIRANI SMO ZA DEŠIFRIRANJE NEKIH REGULATORNIH SLOŽENOSTI, KAO ŠTO SU MEHANIZAM AKTIVACIJE I FUNKCIJE NBLR-A TE REGULATORNE INTERAKCIJE RAZLIČITIH NAČINA KOJI SE KONVERGIRAJU U PROMOTORU NBLA-A. MNOGE METODOLOŠKE STRATEGIJE PREDLOŽENE U VEZI S PIPX-OM TAKOĐER ĆE SE KORISTITI S NBLR-OM. (Croatian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
ΚΥΑΝΟΒΑΚΤΉΡΙΑ ΕΚΤΕΛΟΎΝ OXIGENICAN ΦΩΤΟΣΎΝΘΕΣΗ ΚΑΙ ΑΠΟΙΚΊΖΟΥΝ ΤΗΝ ΠΛΕΙΟΨΗΦΊΑ ΤΩΝ ΦΩΤΙΣΜΈΝΩΝ ΟΙΚΟΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ, ΈΤΣΙ ΈΧΟΥΝ ΜΕΓΆΛΗ ΕΠΊΔΡΑΣΗ ΣΤΟΥΣ ΠΑΓΚΌΣΜΙΟΥΣ ΚΎΚΛΟΥΣ ΆΝΘΡΑΚΑ ΚΑΙ ΑΖΏΤΟΥ. ΩΣΤΌΣΟ, ΠΑΡΆ ΤΗΝ ΟΙΚΟΛΟΓΙΚΉ ΕΠΙΤΥΧΊΑ ΚΑΙ ΤΗ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΉ ΣΗΜΑΣΊΑ ΤΗΣ, ΟΙ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΥΠΕΎΘΥΝΟΙ ΓΙΑ ΑΥΤΉ ΤΗΝ ΕΥΕΛΙΞΊΑ ΚΑΙ ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΉΣ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉΣ ΠΑΡΑΜΈΝΟΥΝ ΆΓΝΩΣΤΟΙ. ΣΤΟ ΠΛΑΊΣΙΟ ΑΥΤΌ, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, ΤΗΣ ΣΧΕΤΙΚΑ ΜΕ ΤΗΝ γενετική ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗ ΤΩΝ ΚΙΑΝΟΒΑΚΤΗΡΙΩΝ, είναι ένα εξαιρετικό σύστημα για τη Μελέτη των REGULATING INTERACTIONS που επιτρέπουν τη CIANOBACTERIAS INTEGRATED ΚΑΙ RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL DYSTEMS._x000D_ Η κύρια πρόταση αυτού του έργου είναι να χαρακτηρίσει το πολυφουγκονικό PIPX PROTEIN, ΕΝΑΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΚΙΑΝΟΒΑΚΤΕΡΙΩΝ ΣΧΕΤΙΚΑ ΜΕ ΡΥΘΜΙΣΤΕΣ μεταγραφής, Σήμανση ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ και μεταβολικά ενζυμα σε ΔΙΚΤΥΟ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΩΝ και ΔΡΑΜΙΚΩΝ ΔΙΑΤΑΞΕΩΝ. ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ ΔΟΚΙΜΈΣ ΣΥΝ-ΚΑΘΑΡΙΣΜΟΎ IN VIVO ΜΕ ΤΗΝ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΗ FLAG-PIPX, ΣΤΟΧΕΎΟΥΜΕ ΣΤΟΝ ΕΝΤΟΠΙΣΜΌ ΝΈΩΝ ΣΥΣΤΑΤΙΚΏΝ ΤΩΝ ΟΔΏΝ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΣΤΙΣ ΟΠΟΊΕΣ ΣΥΜΜΕΤΈΧΕΙ ΤΟ PIPX, ΕΚΤΌΣ ΑΠΌ ΤΗΝ ΕΠΙΚΎΡΩΣΗ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΩΝ ΚΑΙ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΩΝ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΆΤΩΝ ΑΠΌ ΔΙΠΛΌ ΥΒΡΙΔΟΠΟΙΗΜΈΝΟ PIPX (ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ XIP), ΤΡΙΠΛΌ ΥΒΡΙΔΙΣΜΌ (PXR, ΠΟΥ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΖΕΤΑΙ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΤΌΣΟ PII ΌΣΟ ΚΑΙ PIPX ΩΣ ΔΌΛΩΜΑ) Ή ΣΕ ΑΝΆΛΥΣΗ SILICO (ORF2060). ΓΙΑ ΝΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΣΟΥΜΕ ΛΕΠΤΟΜΕΡΈΣΤΕΡΑ ΤΙΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ (ΜΕΤΑΞΎ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ ΚΑΙ ΜΕ ΠΙΘΑΝΟΎΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ), ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΉΣΟΥΜΕ IN VITRO Ή/ΚΑΙ ΔΙΠΛΈΣ (ΤΡΙΠΛΈΣ) ΥΒΡΙΔΙΚΈΣ ΔΟΚΙΜΈΣ ΜΕ ΠΛΉΡΕΙΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ, ΠΑΡΆΓΩΓΑ ΜΕΤΆΛΛΑΞΗΣ Ή/ΚΑΙ ΕΙΔΙΚΟΎΣ ΤΟΜΕΊΣ. ΘΑ ΚΑΤΑΦΎΓΟΥΜΕ ΣΤΗ ΧΡΉΣΗ ΤΗΣ ΣΥΝΟΜΟΣΠΟΝΔΙΑΚΉΣ ΜΙΚΡΟΣΚΟΠΊΑΣ ΓΙΑ ΝΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΣΟΥΜΕ ΑΝ ΚΆΠΟΙΑ ΑΠΌ ΤΙΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΠΟΥ ΜΕΛΕΤΉΘΗΚΑΝ ΑΠΌ ΚΟΙΝΟΎ ΕΝΤΟΠΊΖΕΤΑΙ ΣΤΟΥΣ ΠΟΛΙΚΟΎΣ ΠΡΟΒΟΛΕΊΣ ΤΟΥ PIPX, Η ΔΥΝΑΜΙΚΉ ΘΈΣΗ ΤΟΥ ΟΠΟΊΟΥ ΑΝΤΑΠΟΚΡΊΝΕΤΑΙ ΣΕ ΚΎΚΛΟΥΣ ΣΚΟΤΕΙΝΟΎ ΦΩΤΌΣ. ΓΙΑ ΝΑ ΠΕΡΙΓΡΆΨΟΥΜΕ ΤΑ ΓΟΝΊΔΙΑ ΠΟΥ ΡΥΘΜΊΖΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ PIPX ΑΝΕΞΆΡΤΗΤΑ ΑΠΌ ΤΟ NTCA, ΘΑ ΕΚΤΕΛΈΣΟΥΜΕ ΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ ΜΕ ΜΙΑ ΟΜΆΔΑ ΣΤΕΛΕΧΏΝ, ΥΠΌ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑΣ, Η ΟΠΟΊΑ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΕΙ ΔΙΆΦΟΡΟΥΣ ΤΎΠΟΥΣ ΠΑΡΑΓΏΓΩΝ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΊΟΥ PIPX ΚΑΙ ΆΛΛΑ ΣΥΝΑΦΉ ΓΟΝΊΔΙΑ. ΤΑ ΠΑΡΑΓΌΜΕΝΑ ΔΕΔΟΜΈΝΑ ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΓΙΑ ΤΗΝ ΤΑΞΙΝΌΜΗΣΗ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΠΟΥ ΥΠΌΚΕΙΝΤΑΙ ΣΕ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΙΗΜΈΝΗ ΡΎΘΜΙΣΗ ΣΕ ΟΜΆΔΕΣ ΜΕ ΚΟΙΝΆ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΆ ΠΡΌΤΥΠΑ, ΏΣΤΕ ΝΑ ΑΝΤΙΜΕΤΩΠΙΣΤΟΎΝ ΟΙ ΔΙΆΦΟΡΟΙ ΣΧΕΤΙΚΟΊ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΟΊ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ. ΘΑ ΔΙΕΡΕΥΝΉΣΟΥΜΕ ΤΙΣ ΤΟΠΟΘΕΣΊΕΣ PXR UNION ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ CHIP-SEQ, ΠΛΗΡΟΦΟΡΊΕΣ ΠΟΥ ΘΑ ΕΝΣΩΜΑΤΏΣΟΥΜΕ ΜΕ ΑΥΤΈΣ ΑΠΌ ΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΗΣ TRANSCRIPTOMICA. ΘΑ ΔΙΕΡΕΥΝΉΣΟΥΜΕ ΤΗΝ ΠΙΘΑΝΉ ΜΕΤΡΗΣΗ ΑΡΓΙΝΙΟΝΩΝ ΣΤΟ PIPX ALPHA-HELICE1 ΚΑΙ, ΚΑΤΆ ΠΕΡΊΠΤΩΣΗ, ΘΑ ΜΕΛΕΤΉΣΟΥΜΕ ΤΗ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΉ ΣΗΜΑΣΊΑ ΚΑΙ ΤΟΥΣ ΓΕΝΕΤΙΚΟΎΣ ΚΑΘΟΡΙΣΤΙΚΟΎΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ ΤΩΝ ΤΡΟΠΟΠΟΙΉΣΕΩΝ. ΘΑ ΑΝΑΛΥΘΟΎΝ ΤΌΣΟ Η ΥΠΟΨΉΦΙΑ ΜΕΘΥΛΆΣΗ ΌΣΟ ΚΑΙ ΆΛΛΕΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΠΟΥ ΒΡΊΣΚΟΝΤΑΙ ΣΕ ΠΡΩΤΕΪΝΙΚΈΣ-ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΚΑΙ/Ή ΣΕ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ ΜΕ ΠΥΡΊΤΙΟ. Η ΠΡΌΘΕΣΗ ΕΊΝΑΙ ΝΑ ΑΔΡΑΝΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΤΑ ΑΝΤΊΣΤΟΙΧΑ ΓΟΝΊΔΙΑ ΚΑΙ Η ΣΧΕΤΙΚΉ ΦΑΙΝΟΤΥΠΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ. _x000D_ θα μελετήσουμε επίσης MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, Μια δραματική προσαρμογή σε διάφορους τύπους περιβάλλοντος, στο οποίο το NBLR και το NTCA-PIPX, εισέρχονται σε άλλους ρυθμιστές, συγκλίνουν για την προώθηση του NBLA, απαραίτητη για την απογοήτευση των Φυσιοβιλισωμάτων. ΜΑΣ ΕΝΔΙΑΦΈΡΕΙ ΝΑ ΑΠΟΚΡΥΠΤΟΓΡΑΦΉΣΟΥΜΕ ΟΡΙΣΜΈΝΕΣ ΑΠΌ ΤΙΣ ΚΑΝΟΝΙΣΤΙΚΈΣ ΠΟΛΥΠΛΟΚΌΤΗΤΕΣ, ΌΠΩΣ Ο ΜΗΧΑΝΙΣΜΌΣ ΕΝΕΡΓΟΠΟΊΗΣΗΣ ΚΑΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑΣ ΤΗΣ NBLR ΚΑΙ ΟΙ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΈΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ ΤΩΝ ΔΙΑΦΌΡΩΝ ΤΡΌΠΩΝ ΠΟΥ ΣΥΓΚΛΊΝΟΥΝ ΣΤΟΝ ΦΟΡΈΑ ΠΡΟΏΘΗΣΗΣ ΤΗΣ NBLA. ΠΟΛΛΈΣ ΑΠΌ ΤΙΣ ΜΕΘΟΔΟΛΟΓΙΚΈΣ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΈΣ ΠΟΥ ΠΡΟΤΕΊΝΟΝΤΑΙ ΣΕ ΣΧΈΣΗ ΜΕ ΤΟ PIPX ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΕΠΊΣΗΣ ΜΕ ΤΟ NBLR. (Greek) | |||||||||||||||
| Property / summary: ΚΥΑΝΟΒΑΚΤΉΡΙΑ ΕΚΤΕΛΟΎΝ OXIGENICAN ΦΩΤΟΣΎΝΘΕΣΗ ΚΑΙ ΑΠΟΙΚΊΖΟΥΝ ΤΗΝ ΠΛΕΙΟΨΗΦΊΑ ΤΩΝ ΦΩΤΙΣΜΈΝΩΝ ΟΙΚΟΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ, ΈΤΣΙ ΈΧΟΥΝ ΜΕΓΆΛΗ ΕΠΊΔΡΑΣΗ ΣΤΟΥΣ ΠΑΓΚΌΣΜΙΟΥΣ ΚΎΚΛΟΥΣ ΆΝΘΡΑΚΑ ΚΑΙ ΑΖΏΤΟΥ. ΩΣΤΌΣΟ, ΠΑΡΆ ΤΗΝ ΟΙΚΟΛΟΓΙΚΉ ΕΠΙΤΥΧΊΑ ΚΑΙ ΤΗ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΉ ΣΗΜΑΣΊΑ ΤΗΣ, ΟΙ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΥΠΕΎΘΥΝΟΙ ΓΙΑ ΑΥΤΉ ΤΗΝ ΕΥΕΛΙΞΊΑ ΚΑΙ ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΉΣ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉΣ ΠΑΡΑΜΈΝΟΥΝ ΆΓΝΩΣΤΟΙ. ΣΤΟ ΠΛΑΊΣΙΟ ΑΥΤΌ, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, ΤΗΣ ΣΧΕΤΙΚΑ ΜΕ ΤΗΝ γενετική ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗ ΤΩΝ ΚΙΑΝΟΒΑΚΤΗΡΙΩΝ, είναι ένα εξαιρετικό σύστημα για τη Μελέτη των REGULATING INTERACTIONS που επιτρέπουν τη CIANOBACTERIAS INTEGRATED ΚΑΙ RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL DYSTEMS._x000D_ Η κύρια πρόταση αυτού του έργου είναι να χαρακτηρίσει το πολυφουγκονικό PIPX PROTEIN, ΕΝΑΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΚΙΑΝΟΒΑΚΤΕΡΙΩΝ ΣΧΕΤΙΚΑ ΜΕ ΡΥΘΜΙΣΤΕΣ μεταγραφής, Σήμανση ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ και μεταβολικά ενζυμα σε ΔΙΚΤΥΟ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΩΝ και ΔΡΑΜΙΚΩΝ ΔΙΑΤΑΞΕΩΝ. ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ ΔΟΚΙΜΈΣ ΣΥΝ-ΚΑΘΑΡΙΣΜΟΎ IN VIVO ΜΕ ΤΗΝ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΗ FLAG-PIPX, ΣΤΟΧΕΎΟΥΜΕ ΣΤΟΝ ΕΝΤΟΠΙΣΜΌ ΝΈΩΝ ΣΥΣΤΑΤΙΚΏΝ ΤΩΝ ΟΔΏΝ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΣΤΙΣ ΟΠΟΊΕΣ ΣΥΜΜΕΤΈΧΕΙ ΤΟ PIPX, ΕΚΤΌΣ ΑΠΌ ΤΗΝ ΕΠΙΚΎΡΩΣΗ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΩΝ ΚΑΙ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΩΝ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΆΤΩΝ ΑΠΌ ΔΙΠΛΌ ΥΒΡΙΔΟΠΟΙΗΜΈΝΟ PIPX (ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ XIP), ΤΡΙΠΛΌ ΥΒΡΙΔΙΣΜΌ (PXR, ΠΟΥ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΖΕΤΑΙ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΤΌΣΟ PII ΌΣΟ ΚΑΙ PIPX ΩΣ ΔΌΛΩΜΑ) Ή ΣΕ ΑΝΆΛΥΣΗ SILICO (ORF2060). ΓΙΑ ΝΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΣΟΥΜΕ ΛΕΠΤΟΜΕΡΈΣΤΕΡΑ ΤΙΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ (ΜΕΤΑΞΎ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ ΚΑΙ ΜΕ ΠΙΘΑΝΟΎΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ), ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΉΣΟΥΜΕ IN VITRO Ή/ΚΑΙ ΔΙΠΛΈΣ (ΤΡΙΠΛΈΣ) ΥΒΡΙΔΙΚΈΣ ΔΟΚΙΜΈΣ ΜΕ ΠΛΉΡΕΙΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ, ΠΑΡΆΓΩΓΑ ΜΕΤΆΛΛΑΞΗΣ Ή/ΚΑΙ ΕΙΔΙΚΟΎΣ ΤΟΜΕΊΣ. ΘΑ ΚΑΤΑΦΎΓΟΥΜΕ ΣΤΗ ΧΡΉΣΗ ΤΗΣ ΣΥΝΟΜΟΣΠΟΝΔΙΑΚΉΣ ΜΙΚΡΟΣΚΟΠΊΑΣ ΓΙΑ ΝΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΣΟΥΜΕ ΑΝ ΚΆΠΟΙΑ ΑΠΌ ΤΙΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΠΟΥ ΜΕΛΕΤΉΘΗΚΑΝ ΑΠΌ ΚΟΙΝΟΎ ΕΝΤΟΠΊΖΕΤΑΙ ΣΤΟΥΣ ΠΟΛΙΚΟΎΣ ΠΡΟΒΟΛΕΊΣ ΤΟΥ PIPX, Η ΔΥΝΑΜΙΚΉ ΘΈΣΗ ΤΟΥ ΟΠΟΊΟΥ ΑΝΤΑΠΟΚΡΊΝΕΤΑΙ ΣΕ ΚΎΚΛΟΥΣ ΣΚΟΤΕΙΝΟΎ ΦΩΤΌΣ. ΓΙΑ ΝΑ ΠΕΡΙΓΡΆΨΟΥΜΕ ΤΑ ΓΟΝΊΔΙΑ ΠΟΥ ΡΥΘΜΊΖΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ PIPX ΑΝΕΞΆΡΤΗΤΑ ΑΠΌ ΤΟ NTCA, ΘΑ ΕΚΤΕΛΈΣΟΥΜΕ ΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ ΜΕ ΜΙΑ ΟΜΆΔΑ ΣΤΕΛΕΧΏΝ, ΥΠΌ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑΣ, Η ΟΠΟΊΑ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΕΙ ΔΙΆΦΟΡΟΥΣ ΤΎΠΟΥΣ ΠΑΡΑΓΏΓΩΝ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΊΟΥ PIPX ΚΑΙ ΆΛΛΑ ΣΥΝΑΦΉ ΓΟΝΊΔΙΑ. ΤΑ ΠΑΡΑΓΌΜΕΝΑ ΔΕΔΟΜΈΝΑ ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΓΙΑ ΤΗΝ ΤΑΞΙΝΌΜΗΣΗ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΠΟΥ ΥΠΌΚΕΙΝΤΑΙ ΣΕ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΙΗΜΈΝΗ ΡΎΘΜΙΣΗ ΣΕ ΟΜΆΔΕΣ ΜΕ ΚΟΙΝΆ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΆ ΠΡΌΤΥΠΑ, ΏΣΤΕ ΝΑ ΑΝΤΙΜΕΤΩΠΙΣΤΟΎΝ ΟΙ ΔΙΆΦΟΡΟΙ ΣΧΕΤΙΚΟΊ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΟΊ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ. ΘΑ ΔΙΕΡΕΥΝΉΣΟΥΜΕ ΤΙΣ ΤΟΠΟΘΕΣΊΕΣ PXR UNION ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ CHIP-SEQ, ΠΛΗΡΟΦΟΡΊΕΣ ΠΟΥ ΘΑ ΕΝΣΩΜΑΤΏΣΟΥΜΕ ΜΕ ΑΥΤΈΣ ΑΠΌ ΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΗΣ TRANSCRIPTOMICA. ΘΑ ΔΙΕΡΕΥΝΉΣΟΥΜΕ ΤΗΝ ΠΙΘΑΝΉ ΜΕΤΡΗΣΗ ΑΡΓΙΝΙΟΝΩΝ ΣΤΟ PIPX ALPHA-HELICE1 ΚΑΙ, ΚΑΤΆ ΠΕΡΊΠΤΩΣΗ, ΘΑ ΜΕΛΕΤΉΣΟΥΜΕ ΤΗ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΉ ΣΗΜΑΣΊΑ ΚΑΙ ΤΟΥΣ ΓΕΝΕΤΙΚΟΎΣ ΚΑΘΟΡΙΣΤΙΚΟΎΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ ΤΩΝ ΤΡΟΠΟΠΟΙΉΣΕΩΝ. ΘΑ ΑΝΑΛΥΘΟΎΝ ΤΌΣΟ Η ΥΠΟΨΉΦΙΑ ΜΕΘΥΛΆΣΗ ΌΣΟ ΚΑΙ ΆΛΛΕΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΠΟΥ ΒΡΊΣΚΟΝΤΑΙ ΣΕ ΠΡΩΤΕΪΝΙΚΈΣ-ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΚΑΙ/Ή ΣΕ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ ΜΕ ΠΥΡΊΤΙΟ. Η ΠΡΌΘΕΣΗ ΕΊΝΑΙ ΝΑ ΑΔΡΑΝΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΤΑ ΑΝΤΊΣΤΟΙΧΑ ΓΟΝΊΔΙΑ ΚΑΙ Η ΣΧΕΤΙΚΉ ΦΑΙΝΟΤΥΠΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ. _x000D_ θα μελετήσουμε επίσης MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, Μια δραματική προσαρμογή σε διάφορους τύπους περιβάλλοντος, στο οποίο το NBLR και το NTCA-PIPX, εισέρχονται σε άλλους ρυθμιστές, συγκλίνουν για την προώθηση του NBLA, απαραίτητη για την απογοήτευση των Φυσιοβιλισωμάτων. ΜΑΣ ΕΝΔΙΑΦΈΡΕΙ ΝΑ ΑΠΟΚΡΥΠΤΟΓΡΑΦΉΣΟΥΜΕ ΟΡΙΣΜΈΝΕΣ ΑΠΌ ΤΙΣ ΚΑΝΟΝΙΣΤΙΚΈΣ ΠΟΛΥΠΛΟΚΌΤΗΤΕΣ, ΌΠΩΣ Ο ΜΗΧΑΝΙΣΜΌΣ ΕΝΕΡΓΟΠΟΊΗΣΗΣ ΚΑΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑΣ ΤΗΣ NBLR ΚΑΙ ΟΙ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΈΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ ΤΩΝ ΔΙΑΦΌΡΩΝ ΤΡΌΠΩΝ ΠΟΥ ΣΥΓΚΛΊΝΟΥΝ ΣΤΟΝ ΦΟΡΈΑ ΠΡΟΏΘΗΣΗΣ ΤΗΣ NBLA. ΠΟΛΛΈΣ ΑΠΌ ΤΙΣ ΜΕΘΟΔΟΛΟΓΙΚΈΣ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΈΣ ΠΟΥ ΠΡΟΤΕΊΝΟΝΤΑΙ ΣΕ ΣΧΈΣΗ ΜΕ ΤΟ PIPX ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΕΠΊΣΗΣ ΜΕ ΤΟ NBLR. (Greek) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: ΚΥΑΝΟΒΑΚΤΉΡΙΑ ΕΚΤΕΛΟΎΝ OXIGENICAN ΦΩΤΟΣΎΝΘΕΣΗ ΚΑΙ ΑΠΟΙΚΊΖΟΥΝ ΤΗΝ ΠΛΕΙΟΨΗΦΊΑ ΤΩΝ ΦΩΤΙΣΜΈΝΩΝ ΟΙΚΟΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ, ΈΤΣΙ ΈΧΟΥΝ ΜΕΓΆΛΗ ΕΠΊΔΡΑΣΗ ΣΤΟΥΣ ΠΑΓΚΌΣΜΙΟΥΣ ΚΎΚΛΟΥΣ ΆΝΘΡΑΚΑ ΚΑΙ ΑΖΏΤΟΥ. ΩΣΤΌΣΟ, ΠΑΡΆ ΤΗΝ ΟΙΚΟΛΟΓΙΚΉ ΕΠΙΤΥΧΊΑ ΚΑΙ ΤΗ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΉ ΣΗΜΑΣΊΑ ΤΗΣ, ΟΙ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΥΠΕΎΘΥΝΟΙ ΓΙΑ ΑΥΤΉ ΤΗΝ ΕΥΕΛΙΞΊΑ ΚΑΙ ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΉΣ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉΣ ΠΑΡΑΜΈΝΟΥΝ ΆΓΝΩΣΤΟΙ. ΣΤΟ ΠΛΑΊΣΙΟ ΑΥΤΌ, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, ΤΗΣ ΣΧΕΤΙΚΑ ΜΕ ΤΗΝ γενετική ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗ ΤΩΝ ΚΙΑΝΟΒΑΚΤΗΡΙΩΝ, είναι ένα εξαιρετικό σύστημα για τη Μελέτη των REGULATING INTERACTIONS που επιτρέπουν τη CIANOBACTERIAS INTEGRATED ΚΑΙ RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL DYSTEMS._x000D_ Η κύρια πρόταση αυτού του έργου είναι να χαρακτηρίσει το πολυφουγκονικό PIPX PROTEIN, ΕΝΑΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΚΙΑΝΟΒΑΚΤΕΡΙΩΝ ΣΧΕΤΙΚΑ ΜΕ ΡΥΘΜΙΣΤΕΣ μεταγραφής, Σήμανση ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ και μεταβολικά ενζυμα σε ΔΙΚΤΥΟ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΩΝ και ΔΡΑΜΙΚΩΝ ΔΙΑΤΑΞΕΩΝ. ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ ΔΟΚΙΜΈΣ ΣΥΝ-ΚΑΘΑΡΙΣΜΟΎ IN VIVO ΜΕ ΤΗΝ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΗ FLAG-PIPX, ΣΤΟΧΕΎΟΥΜΕ ΣΤΟΝ ΕΝΤΟΠΙΣΜΌ ΝΈΩΝ ΣΥΣΤΑΤΙΚΏΝ ΤΩΝ ΟΔΏΝ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΣΤΙΣ ΟΠΟΊΕΣ ΣΥΜΜΕΤΈΧΕΙ ΤΟ PIPX, ΕΚΤΌΣ ΑΠΌ ΤΗΝ ΕΠΙΚΎΡΩΣΗ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΩΝ ΚΑΙ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΩΝ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΆΤΩΝ ΑΠΌ ΔΙΠΛΌ ΥΒΡΙΔΟΠΟΙΗΜΈΝΟ PIPX (ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ XIP), ΤΡΙΠΛΌ ΥΒΡΙΔΙΣΜΌ (PXR, ΠΟΥ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΖΕΤΑΙ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΤΌΣΟ PII ΌΣΟ ΚΑΙ PIPX ΩΣ ΔΌΛΩΜΑ) Ή ΣΕ ΑΝΆΛΥΣΗ SILICO (ORF2060). ΓΙΑ ΝΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΣΟΥΜΕ ΛΕΠΤΟΜΕΡΈΣΤΕΡΑ ΤΙΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ (ΜΕΤΑΞΎ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ ΚΑΙ ΜΕ ΠΙΘΑΝΟΎΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ), ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΉΣΟΥΜΕ IN VITRO Ή/ΚΑΙ ΔΙΠΛΈΣ (ΤΡΙΠΛΈΣ) ΥΒΡΙΔΙΚΈΣ ΔΟΚΙΜΈΣ ΜΕ ΠΛΉΡΕΙΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ, ΠΑΡΆΓΩΓΑ ΜΕΤΆΛΛΑΞΗΣ Ή/ΚΑΙ ΕΙΔΙΚΟΎΣ ΤΟΜΕΊΣ. ΘΑ ΚΑΤΑΦΎΓΟΥΜΕ ΣΤΗ ΧΡΉΣΗ ΤΗΣ ΣΥΝΟΜΟΣΠΟΝΔΙΑΚΉΣ ΜΙΚΡΟΣΚΟΠΊΑΣ ΓΙΑ ΝΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΣΟΥΜΕ ΑΝ ΚΆΠΟΙΑ ΑΠΌ ΤΙΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΠΟΥ ΜΕΛΕΤΉΘΗΚΑΝ ΑΠΌ ΚΟΙΝΟΎ ΕΝΤΟΠΊΖΕΤΑΙ ΣΤΟΥΣ ΠΟΛΙΚΟΎΣ ΠΡΟΒΟΛΕΊΣ ΤΟΥ PIPX, Η ΔΥΝΑΜΙΚΉ ΘΈΣΗ ΤΟΥ ΟΠΟΊΟΥ ΑΝΤΑΠΟΚΡΊΝΕΤΑΙ ΣΕ ΚΎΚΛΟΥΣ ΣΚΟΤΕΙΝΟΎ ΦΩΤΌΣ. ΓΙΑ ΝΑ ΠΕΡΙΓΡΆΨΟΥΜΕ ΤΑ ΓΟΝΊΔΙΑ ΠΟΥ ΡΥΘΜΊΖΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ PIPX ΑΝΕΞΆΡΤΗΤΑ ΑΠΌ ΤΟ NTCA, ΘΑ ΕΚΤΕΛΈΣΟΥΜΕ ΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ ΜΕ ΜΙΑ ΟΜΆΔΑ ΣΤΕΛΕΧΏΝ, ΥΠΌ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑΣ, Η ΟΠΟΊΑ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΕΙ ΔΙΆΦΟΡΟΥΣ ΤΎΠΟΥΣ ΠΑΡΑΓΏΓΩΝ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΊΟΥ PIPX ΚΑΙ ΆΛΛΑ ΣΥΝΑΦΉ ΓΟΝΊΔΙΑ. ΤΑ ΠΑΡΑΓΌΜΕΝΑ ΔΕΔΟΜΈΝΑ ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΓΙΑ ΤΗΝ ΤΑΞΙΝΌΜΗΣΗ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΠΟΥ ΥΠΌΚΕΙΝΤΑΙ ΣΕ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΙΗΜΈΝΗ ΡΎΘΜΙΣΗ ΣΕ ΟΜΆΔΕΣ ΜΕ ΚΟΙΝΆ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΆ ΠΡΌΤΥΠΑ, ΏΣΤΕ ΝΑ ΑΝΤΙΜΕΤΩΠΙΣΤΟΎΝ ΟΙ ΔΙΆΦΟΡΟΙ ΣΧΕΤΙΚΟΊ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΟΊ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ. ΘΑ ΔΙΕΡΕΥΝΉΣΟΥΜΕ ΤΙΣ ΤΟΠΟΘΕΣΊΕΣ PXR UNION ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ CHIP-SEQ, ΠΛΗΡΟΦΟΡΊΕΣ ΠΟΥ ΘΑ ΕΝΣΩΜΑΤΏΣΟΥΜΕ ΜΕ ΑΥΤΈΣ ΑΠΌ ΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΗΣ TRANSCRIPTOMICA. ΘΑ ΔΙΕΡΕΥΝΉΣΟΥΜΕ ΤΗΝ ΠΙΘΑΝΉ ΜΕΤΡΗΣΗ ΑΡΓΙΝΙΟΝΩΝ ΣΤΟ PIPX ALPHA-HELICE1 ΚΑΙ, ΚΑΤΆ ΠΕΡΊΠΤΩΣΗ, ΘΑ ΜΕΛΕΤΉΣΟΥΜΕ ΤΗ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΉ ΣΗΜΑΣΊΑ ΚΑΙ ΤΟΥΣ ΓΕΝΕΤΙΚΟΎΣ ΚΑΘΟΡΙΣΤΙΚΟΎΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ ΤΩΝ ΤΡΟΠΟΠΟΙΉΣΕΩΝ. ΘΑ ΑΝΑΛΥΘΟΎΝ ΤΌΣΟ Η ΥΠΟΨΉΦΙΑ ΜΕΘΥΛΆΣΗ ΌΣΟ ΚΑΙ ΆΛΛΕΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΠΟΥ ΒΡΊΣΚΟΝΤΑΙ ΣΕ ΠΡΩΤΕΪΝΙΚΈΣ-ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΚΑΙ/Ή ΣΕ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ ΜΕ ΠΥΡΊΤΙΟ. Η ΠΡΌΘΕΣΗ ΕΊΝΑΙ ΝΑ ΑΔΡΑΝΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΤΑ ΑΝΤΊΣΤΟΙΧΑ ΓΟΝΊΔΙΑ ΚΑΙ Η ΣΧΕΤΙΚΉ ΦΑΙΝΟΤΥΠΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ. _x000D_ θα μελετήσουμε επίσης MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, Μια δραματική προσαρμογή σε διάφορους τύπους περιβάλλοντος, στο οποίο το NBLR και το NTCA-PIPX, εισέρχονται σε άλλους ρυθμιστές, συγκλίνουν για την προώθηση του NBLA, απαραίτητη για την απογοήτευση των Φυσιοβιλισωμάτων. ΜΑΣ ΕΝΔΙΑΦΈΡΕΙ ΝΑ ΑΠΟΚΡΥΠΤΟΓΡΑΦΉΣΟΥΜΕ ΟΡΙΣΜΈΝΕΣ ΑΠΌ ΤΙΣ ΚΑΝΟΝΙΣΤΙΚΈΣ ΠΟΛΥΠΛΟΚΌΤΗΤΕΣ, ΌΠΩΣ Ο ΜΗΧΑΝΙΣΜΌΣ ΕΝΕΡΓΟΠΟΊΗΣΗΣ ΚΑΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑΣ ΤΗΣ NBLR ΚΑΙ ΟΙ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΈΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ ΤΩΝ ΔΙΑΦΌΡΩΝ ΤΡΌΠΩΝ ΠΟΥ ΣΥΓΚΛΊΝΟΥΝ ΣΤΟΝ ΦΟΡΈΑ ΠΡΟΏΘΗΣΗΣ ΤΗΣ NBLA. ΠΟΛΛΈΣ ΑΠΌ ΤΙΣ ΜΕΘΟΔΟΛΟΓΙΚΈΣ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΈΣ ΠΟΥ ΠΡΟΤΕΊΝΟΝΤΑΙ ΣΕ ΣΧΈΣΗ ΜΕ ΤΟ PIPX ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΕΠΊΣΗΣ ΜΕ ΤΟ NBLR. (Greek) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
CYANOBAKTÉRIE VYKONÁVAJÚ FOTOSYNTÉZU OXIGENICAN A KOLONIZUJÚ VÄČŠINU OSVETLENÝCH EKOSYSTÉMOV, TAKŽE MAJÚ VEĽKÝ VPLYV NA GLOBÁLNE CYKLY UHLÍKA A DUSÍKA. NAPRIEK SVOJMU EKOLOGICKÉMU ÚSPECHU A BIOTECHNOLOGICKÉMU VÝZNAMU VŠAK MECHANIZMY ZODPOVEDNÉ ZA TÚTO VŠESTRANNOSŤ A SCHOPNOSŤ PRISPÔSOBIŤ SA ŽIVOTNÉMU PROSTREDIU ZOSTÁVAJÚ NEZNÁME. V TEJTO SÚVISLOSTI SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, Z RELATIVELY FACILITY genetické MANIPUATION, je EXCELLENT SYSTEM pre ŠTUDY REGULATNÉ INTERACTIONS umožňujúce CIANOBACTERIAS INTEGRATED A RESPONDERLY MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Primárnym návrhom tohto projektu je charakterizovať multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING transkripčných regulátorov, Signalizačné PROTEINY a metabolické zážiny v sieti COMPLETE a DINAMIC interakciách. POMOCOU SKÚŠOK KOPURIFIKÁCIE IN VIVO S PROTEÍNOM FLAG-PIPX SA SNAŽÍME IDENTIFIKOVAŤ NOVÉ ZLOŽKY SIGNALIZAČNÝCH DRÁH, NA KTORÝCH SA PIPX ZÚČASTŇUJE, OKREM VALIDÁCIE INTERAKCIÍ A PREDCHÁDZAJÚCICH VÝSLEDKOV Z DVOJITEJ HYBRIDNEJ PIPX (XIP PROTEÍNOV), TROJITEJ HYBRIDIZÁCIE (PXR, IDENTIFIKOVANEJ POMOCOU PII AJ PIPX AKO NÁVNADY) ALEBO IN SILICO ANALÝZY (ORF2060). NA PODROBNEJŠIE CHARAKTERIZOVANIE INTERAKCIÍ (MEDZI PROTEÍNMI A MOŽNÝMI EFEKTORMI) POUŽIJEME IN VITRO A/ALEBO DVOJITÉ (TRIPLE) HYBRIDNÉ ŠTÚDIE S KOMPLETNÝMI PROTEÍNMI, MUTANTNÝMI DERIVÁTMI A/ALEBO ŠPECIFICKÝMI DOMÉNAMI. UCHÝLIME SA K POUŽITIU KONFOKÁLNEJ MIKROSKOPIE, ABY SME ZISTILI, ČI NIEKTORÝ Z SKÚMANÝCH PROTEÍNOV SPOLULOKUJE V POLÁRNYCH REFLEKTOROCH PIPX, KTORÝCH DYNAMICKÁ POLOHA REAGUJE NA CYKLY TMAVÉHO SVETLA. AK CHCETE OPÍSAŤ PIPX-REGULOVANÉ GÉNY NEZÁVISLE OD NTCA, VYKONÁME TRANSKRIPTOMICKÚ ANALÝZU S KMEŇOVÝM PANELOM ZA RÔZNYCH KULTIVAČNÝCH PODMIENOK, KTORÝ ZAHŔŇA RÔZNE TYPY DERIVÁTOV GÉNU PIPX A ĎALŠIE SÚVISIACE GÉNY. ZÍSKANÉ ÚDAJE SA POUŽIJÚ NA KLASIFIKÁCIU DIFERENCOVANE REGULOVANÝCH GÉNOV DO SKUPÍN SO SPOLOČNÝMI REGULAČNÝMI NORMAMI, ABY SA POTOM RIEŠILI RÔZNE PRÍSLUŠNÉ REGULAČNÉ MECHANIZMY. BUDEME SKÚMAŤ STRÁNKY PXR UNION POMOCOU ČIP-SEQ, INFORMÁCIE, KTORÉ BUDEME INTEGROVAŤ S TÝM Z ANALÝZY TRANSCRIPTOMICA. PRESKÚMAME MOŽNÝ METILACION ARGININS V PIPX ALFA-HELICE1 A V PRÍPADE POTREBY PRESKÚMAME FUNKČNÝ VÝZNAM A GENETICKÉ DETERMINANTY MODIFIKÁCIÍ. ANALYZUJÚ SA TAK KANDIDÁTSKE METYLÁZY, AKO AJ INÉ PROTEÍNY, KTORÉ SA NACHÁDZAJÚ V PROTEÍNOVÝCH A/ALEBO SILIKOVÝCH INTERAKCIÁCH. ZÁMEROM JE NEAKTIVOVAŤ ZODPOVEDAJÚCE GÉNY A PRÍSLUŠNÚ FENOTYPOVÚ ANALÝZU. _x000D_ budeme tiež študovať MOLECULAR DETAILS V SEMINALIZÁCIA robí PROCESS of chlorosis, Dramatická adaptácia na rôzne typy prostredia, v ktorom NBLR a NTCA-PIPX, vstúpiť do iných regulátorov, Converge for the Promotor of the NBLA, esential for the Degratation of Physiobilisomas. MÁME ZÁUJEM O DEŠIFROVANIE NIEKTORÝCH REGULAČNÝCH KOMPLEXOV, AKO JE MECHANIZMUS AKTIVÁCIE A FUNKCIE NBLR A REGULAČNÉ INTERAKCIE RÔZNYCH SPÔSOBOV, KTORÉ SA ZBLIŽUJÚ V PODPOROVATEĽOVI NBLA. MNOHÉ Z METODICKÝCH STRATÉGIÍ NAVRHNUTÝCH V SÚVISLOSTI S PIPX SA POUŽIJÚ AJ V PRÍPADE NBLR. (Slovak) | |||||||||||||||
| Property / summary: CYANOBAKTÉRIE VYKONÁVAJÚ FOTOSYNTÉZU OXIGENICAN A KOLONIZUJÚ VÄČŠINU OSVETLENÝCH EKOSYSTÉMOV, TAKŽE MAJÚ VEĽKÝ VPLYV NA GLOBÁLNE CYKLY UHLÍKA A DUSÍKA. NAPRIEK SVOJMU EKOLOGICKÉMU ÚSPECHU A BIOTECHNOLOGICKÉMU VÝZNAMU VŠAK MECHANIZMY ZODPOVEDNÉ ZA TÚTO VŠESTRANNOSŤ A SCHOPNOSŤ PRISPÔSOBIŤ SA ŽIVOTNÉMU PROSTREDIU ZOSTÁVAJÚ NEZNÁME. V TEJTO SÚVISLOSTI SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, Z RELATIVELY FACILITY genetické MANIPUATION, je EXCELLENT SYSTEM pre ŠTUDY REGULATNÉ INTERACTIONS umožňujúce CIANOBACTERIAS INTEGRATED A RESPONDERLY MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Primárnym návrhom tohto projektu je charakterizovať multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING transkripčných regulátorov, Signalizačné PROTEINY a metabolické zážiny v sieti COMPLETE a DINAMIC interakciách. POMOCOU SKÚŠOK KOPURIFIKÁCIE IN VIVO S PROTEÍNOM FLAG-PIPX SA SNAŽÍME IDENTIFIKOVAŤ NOVÉ ZLOŽKY SIGNALIZAČNÝCH DRÁH, NA KTORÝCH SA PIPX ZÚČASTŇUJE, OKREM VALIDÁCIE INTERAKCIÍ A PREDCHÁDZAJÚCICH VÝSLEDKOV Z DVOJITEJ HYBRIDNEJ PIPX (XIP PROTEÍNOV), TROJITEJ HYBRIDIZÁCIE (PXR, IDENTIFIKOVANEJ POMOCOU PII AJ PIPX AKO NÁVNADY) ALEBO IN SILICO ANALÝZY (ORF2060). NA PODROBNEJŠIE CHARAKTERIZOVANIE INTERAKCIÍ (MEDZI PROTEÍNMI A MOŽNÝMI EFEKTORMI) POUŽIJEME IN VITRO A/ALEBO DVOJITÉ (TRIPLE) HYBRIDNÉ ŠTÚDIE S KOMPLETNÝMI PROTEÍNMI, MUTANTNÝMI DERIVÁTMI A/ALEBO ŠPECIFICKÝMI DOMÉNAMI. UCHÝLIME SA K POUŽITIU KONFOKÁLNEJ MIKROSKOPIE, ABY SME ZISTILI, ČI NIEKTORÝ Z SKÚMANÝCH PROTEÍNOV SPOLULOKUJE V POLÁRNYCH REFLEKTOROCH PIPX, KTORÝCH DYNAMICKÁ POLOHA REAGUJE NA CYKLY TMAVÉHO SVETLA. AK CHCETE OPÍSAŤ PIPX-REGULOVANÉ GÉNY NEZÁVISLE OD NTCA, VYKONÁME TRANSKRIPTOMICKÚ ANALÝZU S KMEŇOVÝM PANELOM ZA RÔZNYCH KULTIVAČNÝCH PODMIENOK, KTORÝ ZAHŔŇA RÔZNE TYPY DERIVÁTOV GÉNU PIPX A ĎALŠIE SÚVISIACE GÉNY. ZÍSKANÉ ÚDAJE SA POUŽIJÚ NA KLASIFIKÁCIU DIFERENCOVANE REGULOVANÝCH GÉNOV DO SKUPÍN SO SPOLOČNÝMI REGULAČNÝMI NORMAMI, ABY SA POTOM RIEŠILI RÔZNE PRÍSLUŠNÉ REGULAČNÉ MECHANIZMY. BUDEME SKÚMAŤ STRÁNKY PXR UNION POMOCOU ČIP-SEQ, INFORMÁCIE, KTORÉ BUDEME INTEGROVAŤ S TÝM Z ANALÝZY TRANSCRIPTOMICA. PRESKÚMAME MOŽNÝ METILACION ARGININS V PIPX ALFA-HELICE1 A V PRÍPADE POTREBY PRESKÚMAME FUNKČNÝ VÝZNAM A GENETICKÉ DETERMINANTY MODIFIKÁCIÍ. ANALYZUJÚ SA TAK KANDIDÁTSKE METYLÁZY, AKO AJ INÉ PROTEÍNY, KTORÉ SA NACHÁDZAJÚ V PROTEÍNOVÝCH A/ALEBO SILIKOVÝCH INTERAKCIÁCH. ZÁMEROM JE NEAKTIVOVAŤ ZODPOVEDAJÚCE GÉNY A PRÍSLUŠNÚ FENOTYPOVÚ ANALÝZU. _x000D_ budeme tiež študovať MOLECULAR DETAILS V SEMINALIZÁCIA robí PROCESS of chlorosis, Dramatická adaptácia na rôzne typy prostredia, v ktorom NBLR a NTCA-PIPX, vstúpiť do iných regulátorov, Converge for the Promotor of the NBLA, esential for the Degratation of Physiobilisomas. MÁME ZÁUJEM O DEŠIFROVANIE NIEKTORÝCH REGULAČNÝCH KOMPLEXOV, AKO JE MECHANIZMUS AKTIVÁCIE A FUNKCIE NBLR A REGULAČNÉ INTERAKCIE RÔZNYCH SPÔSOBOV, KTORÉ SA ZBLIŽUJÚ V PODPOROVATEĽOVI NBLA. MNOHÉ Z METODICKÝCH STRATÉGIÍ NAVRHNUTÝCH V SÚVISLOSTI S PIPX SA POUŽIJÚ AJ V PRÍPADE NBLR. (Slovak) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: CYANOBAKTÉRIE VYKONÁVAJÚ FOTOSYNTÉZU OXIGENICAN A KOLONIZUJÚ VÄČŠINU OSVETLENÝCH EKOSYSTÉMOV, TAKŽE MAJÚ VEĽKÝ VPLYV NA GLOBÁLNE CYKLY UHLÍKA A DUSÍKA. NAPRIEK SVOJMU EKOLOGICKÉMU ÚSPECHU A BIOTECHNOLOGICKÉMU VÝZNAMU VŠAK MECHANIZMY ZODPOVEDNÉ ZA TÚTO VŠESTRANNOSŤ A SCHOPNOSŤ PRISPÔSOBIŤ SA ŽIVOTNÉMU PROSTREDIU ZOSTÁVAJÚ NEZNÁME. V TEJTO SÚVISLOSTI SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, Z RELATIVELY FACILITY genetické MANIPUATION, je EXCELLENT SYSTEM pre ŠTUDY REGULATNÉ INTERACTIONS umožňujúce CIANOBACTERIAS INTEGRATED A RESPONDERLY MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Primárnym návrhom tohto projektu je charakterizovať multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING transkripčných regulátorov, Signalizačné PROTEINY a metabolické zážiny v sieti COMPLETE a DINAMIC interakciách. POMOCOU SKÚŠOK KOPURIFIKÁCIE IN VIVO S PROTEÍNOM FLAG-PIPX SA SNAŽÍME IDENTIFIKOVAŤ NOVÉ ZLOŽKY SIGNALIZAČNÝCH DRÁH, NA KTORÝCH SA PIPX ZÚČASTŇUJE, OKREM VALIDÁCIE INTERAKCIÍ A PREDCHÁDZAJÚCICH VÝSLEDKOV Z DVOJITEJ HYBRIDNEJ PIPX (XIP PROTEÍNOV), TROJITEJ HYBRIDIZÁCIE (PXR, IDENTIFIKOVANEJ POMOCOU PII AJ PIPX AKO NÁVNADY) ALEBO IN SILICO ANALÝZY (ORF2060). NA PODROBNEJŠIE CHARAKTERIZOVANIE INTERAKCIÍ (MEDZI PROTEÍNMI A MOŽNÝMI EFEKTORMI) POUŽIJEME IN VITRO A/ALEBO DVOJITÉ (TRIPLE) HYBRIDNÉ ŠTÚDIE S KOMPLETNÝMI PROTEÍNMI, MUTANTNÝMI DERIVÁTMI A/ALEBO ŠPECIFICKÝMI DOMÉNAMI. UCHÝLIME SA K POUŽITIU KONFOKÁLNEJ MIKROSKOPIE, ABY SME ZISTILI, ČI NIEKTORÝ Z SKÚMANÝCH PROTEÍNOV SPOLULOKUJE V POLÁRNYCH REFLEKTOROCH PIPX, KTORÝCH DYNAMICKÁ POLOHA REAGUJE NA CYKLY TMAVÉHO SVETLA. AK CHCETE OPÍSAŤ PIPX-REGULOVANÉ GÉNY NEZÁVISLE OD NTCA, VYKONÁME TRANSKRIPTOMICKÚ ANALÝZU S KMEŇOVÝM PANELOM ZA RÔZNYCH KULTIVAČNÝCH PODMIENOK, KTORÝ ZAHŔŇA RÔZNE TYPY DERIVÁTOV GÉNU PIPX A ĎALŠIE SÚVISIACE GÉNY. ZÍSKANÉ ÚDAJE SA POUŽIJÚ NA KLASIFIKÁCIU DIFERENCOVANE REGULOVANÝCH GÉNOV DO SKUPÍN SO SPOLOČNÝMI REGULAČNÝMI NORMAMI, ABY SA POTOM RIEŠILI RÔZNE PRÍSLUŠNÉ REGULAČNÉ MECHANIZMY. BUDEME SKÚMAŤ STRÁNKY PXR UNION POMOCOU ČIP-SEQ, INFORMÁCIE, KTORÉ BUDEME INTEGROVAŤ S TÝM Z ANALÝZY TRANSCRIPTOMICA. PRESKÚMAME MOŽNÝ METILACION ARGININS V PIPX ALFA-HELICE1 A V PRÍPADE POTREBY PRESKÚMAME FUNKČNÝ VÝZNAM A GENETICKÉ DETERMINANTY MODIFIKÁCIÍ. ANALYZUJÚ SA TAK KANDIDÁTSKE METYLÁZY, AKO AJ INÉ PROTEÍNY, KTORÉ SA NACHÁDZAJÚ V PROTEÍNOVÝCH A/ALEBO SILIKOVÝCH INTERAKCIÁCH. ZÁMEROM JE NEAKTIVOVAŤ ZODPOVEDAJÚCE GÉNY A PRÍSLUŠNÚ FENOTYPOVÚ ANALÝZU. _x000D_ budeme tiež študovať MOLECULAR DETAILS V SEMINALIZÁCIA robí PROCESS of chlorosis, Dramatická adaptácia na rôzne typy prostredia, v ktorom NBLR a NTCA-PIPX, vstúpiť do iných regulátorov, Converge for the Promotor of the NBLA, esential for the Degratation of Physiobilisomas. MÁME ZÁUJEM O DEŠIFROVANIE NIEKTORÝCH REGULAČNÝCH KOMPLEXOV, AKO JE MECHANIZMUS AKTIVÁCIE A FUNKCIE NBLR A REGULAČNÉ INTERAKCIE RÔZNYCH SPÔSOBOV, KTORÉ SA ZBLIŽUJÚ V PODPOROVATEĽOVI NBLA. MNOHÉ Z METODICKÝCH STRATÉGIÍ NAVRHNUTÝCH V SÚVISLOSTI S PIPX SA POUŽIJÚ AJ V PRÍPADE NBLR. (Slovak) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
SYANOBAKTEERIT SUORITTAVAT OXIGENICAN FOTOSYNTEESIN JA KOLONISOIVAT SUURIMMAN OSAN VALAISTUISTA EKOSYSTEEMEISTÄ, JOTEN NIILLÄ ON SUURI VAIKUTUS MAAILMANLAAJUISIIN HIILI- JA TYPPIKIERTOIHIN. EKOLOGISESTA MENESTYKSESTÄ JA BIOTEKNOLOGISESTA MERKITYKSESTÄ HUOLIMATTA TÄHÄN MONIPUOLISUUTEEN JA KYKYYN SOPEUTUA YMPÄRISTÖÖN LIITTYVIÄ MEKANISMEJA EI TUNNETA. TÄSSÄ YHTEYDESSÄ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY FACILITY MAKSUT, on ERITYINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN KOSKEVAT KÄYTTÖJÄRJESTELMÄT, jotka sallivat CIANOBACTERIAAT INTEGRATTI JA VASTAUKSEN KÄYTTÖN DYSTEMSÄ._x000D_ Tämän hankkeen ensisijainen ehdotus on luonnehtia monifuncional PIPX PROTEIN, CIANOBACTERIAS CONCERNING transkriptionaaliset säätimet, jotka merkitsevät PROTEINeja ja metabolisia entsiomaja COMPLETE- ja DINAMIC-interferaatioissa. KÄYTTÄMÄLLÄ IN VIVO -YHTEISPUHDISTUSKOKEITA LIPPU-PIPX-PROTEIININ KANSSA PYRIMME TUNNISTAMAAN UUSIA KOMPONENTTEJA SIGNAALIREITEILLÄ, JOIHIN PIPX OSALLISTUU, SEN LISÄKSI, ETTÄ VALIDOIDAAN VUOROVAIKUTUKSET JA AIEMMAT TULOKSET KAKSOISHYBRIDOIDUISTA PIPX-PROTEIINEISTA (XIP-PROTEIINEISTA), KOLMINKERTAISESTA HYBRIDISAATIOSTA (PXR, JOKA TUNNISTETAAN SEKÄ PII:N ETTÄ PIPX:N AVULLA SYÖTIKSI) TAI SILIKOANALYYSISTA (ORF2060). INTERAKTIOIDEN (PROTEIINIEN JA MAHDOLLISTEN VAIKUTTIMIEN) LUONNEHTIMISEKSI YKSITYISKOHTAISEMMIN KÄYTÄMME IN VITRO – JA/TAI KAKSOISHYBRIDITUTKIMUKSIA, JOISSA KÄYTETÄÄN KOKONAISIA PROTEIINEJA, MUTANTTIJOHDANNAISIA JA/TAI TIETTYJÄ VERKKOTUNNUKSIA. KÄYTÄMME KONFOKAALISTA MIKROSKOPIAA SELVITTÄÄKSEMME, ONKO JOKIN TUTKITUISTA PROTEIINEISTA PAIKANNETTU PIPX: N NAPAVALOISSA, JOIDEN DYNAAMINEN SIJAINTI REAGOI TUMMAN VALON SYKLEIHIN. KUVATAKSEMME PIPX-SÄÄNNELLYT GEENIT NTCA: STA RIIPPUMATTA, SUORITAMME TRANSKRIMAATTIANALYYSIN KANTAPANEELILLA ERILAISISSA VILJELYOLOSUHTEISSA, JOIHIN SISÄLTYY ERILAISIA PIPX-GEENIN JOHDANNAISIA JA MUITA VASTAAVIA GEENEJÄ. TUOTETTUJA TIETOJA KÄYTETÄÄN ERIYTETYSTI SÄÄNNELTYJEN GEENIEN LUOKITTELEMISEEN RYHMIIN, JOILLA ON YHTEISET SÄÄNTELYSTANDARDIT, JOTTA VOIDAAN KÄSITELLÄ ASIAAN LIITTYVIÄ ERILAISIA SÄÄNTELYMEKANISMEJA. TUTKIMME PXR UNIONIN SIVUSTOJA KÄYTTÄEN SIRU-SEQ, TIETOJA, JOTKA INTEGROIMME ETTÄ ANALYYSI TRANSCRIPIPTOMICA. TUTKIMME ARGININS-VALMISTEEN MAHDOLLISTA METILACIONIA PIPX ALFA-HELICE1:SSÄ JA TUTKIMME TARVITTAESSA MUUTOSTEN TOIMINNALLISTA MERKITYSTÄ JA GENEETTISIÄ TAUSTATEKIJÖITÄ. SEKÄ EHDOKASMETYYLIAASI(T) ETTÄ MUUT PROTEIINI-PROTEIININ JA/TAI PIIN VUOROVAIKUTUKSESSA ESIINTYVÄT PROTEIINIT ANALYSOIDAAN. TARKOITUKSENA ON OLLA INAKTIIVISESTI VASTAAVAT GEENIT JA ASIAANKUULUVA FENOTYYPPINEN ANALYYSI. _x000D_ tutkimme myös MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, A dramaattista sopeutumista erityyppisiin ympäristöihin, joissa NBLR ja NTCA-PIPX tulevat muihin sääntelyviranomaisiin, lähentyvät NBLA: n edistäjää, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. OLEMME KIINNOSTUNEITA TULKITSEMAAN JOITAKIN SÄÄNTELYYN LIITTYVIÄ MONIMUTKAISUUKSIA, KUTEN NBLR:N AKTIVOINTI- JA TOIMINTAMEKANISMIA SEKÄ NBLA-PROMOOTTORISSA LÄHENTYVIEN ERI TAPOJEN SÄÄNTELYYN LIITTYVÄÄ VUOROVAIKUTUSTA. MONIA PIPX-MENETELMÄÄ VARTEN EHDOTETTUJA MENETELMIÄ KÄYTETÄÄN MYÖS YHDESSÄ NBLR:N KANSSA. (Finnish) | |||||||||||||||
| Property / summary: SYANOBAKTEERIT SUORITTAVAT OXIGENICAN FOTOSYNTEESIN JA KOLONISOIVAT SUURIMMAN OSAN VALAISTUISTA EKOSYSTEEMEISTÄ, JOTEN NIILLÄ ON SUURI VAIKUTUS MAAILMANLAAJUISIIN HIILI- JA TYPPIKIERTOIHIN. EKOLOGISESTA MENESTYKSESTÄ JA BIOTEKNOLOGISESTA MERKITYKSESTÄ HUOLIMATTA TÄHÄN MONIPUOLISUUTEEN JA KYKYYN SOPEUTUA YMPÄRISTÖÖN LIITTYVIÄ MEKANISMEJA EI TUNNETA. TÄSSÄ YHTEYDESSÄ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY FACILITY MAKSUT, on ERITYINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN KOSKEVAT KÄYTTÖJÄRJESTELMÄT, jotka sallivat CIANOBACTERIAAT INTEGRATTI JA VASTAUKSEN KÄYTTÖN DYSTEMSÄ._x000D_ Tämän hankkeen ensisijainen ehdotus on luonnehtia monifuncional PIPX PROTEIN, CIANOBACTERIAS CONCERNING transkriptionaaliset säätimet, jotka merkitsevät PROTEINeja ja metabolisia entsiomaja COMPLETE- ja DINAMIC-interferaatioissa. KÄYTTÄMÄLLÄ IN VIVO -YHTEISPUHDISTUSKOKEITA LIPPU-PIPX-PROTEIININ KANSSA PYRIMME TUNNISTAMAAN UUSIA KOMPONENTTEJA SIGNAALIREITEILLÄ, JOIHIN PIPX OSALLISTUU, SEN LISÄKSI, ETTÄ VALIDOIDAAN VUOROVAIKUTUKSET JA AIEMMAT TULOKSET KAKSOISHYBRIDOIDUISTA PIPX-PROTEIINEISTA (XIP-PROTEIINEISTA), KOLMINKERTAISESTA HYBRIDISAATIOSTA (PXR, JOKA TUNNISTETAAN SEKÄ PII:N ETTÄ PIPX:N AVULLA SYÖTIKSI) TAI SILIKOANALYYSISTA (ORF2060). INTERAKTIOIDEN (PROTEIINIEN JA MAHDOLLISTEN VAIKUTTIMIEN) LUONNEHTIMISEKSI YKSITYISKOHTAISEMMIN KÄYTÄMME IN VITRO – JA/TAI KAKSOISHYBRIDITUTKIMUKSIA, JOISSA KÄYTETÄÄN KOKONAISIA PROTEIINEJA, MUTANTTIJOHDANNAISIA JA/TAI TIETTYJÄ VERKKOTUNNUKSIA. KÄYTÄMME KONFOKAALISTA MIKROSKOPIAA SELVITTÄÄKSEMME, ONKO JOKIN TUTKITUISTA PROTEIINEISTA PAIKANNETTU PIPX: N NAPAVALOISSA, JOIDEN DYNAAMINEN SIJAINTI REAGOI TUMMAN VALON SYKLEIHIN. KUVATAKSEMME PIPX-SÄÄNNELLYT GEENIT NTCA: STA RIIPPUMATTA, SUORITAMME TRANSKRIMAATTIANALYYSIN KANTAPANEELILLA ERILAISISSA VILJELYOLOSUHTEISSA, JOIHIN SISÄLTYY ERILAISIA PIPX-GEENIN JOHDANNAISIA JA MUITA VASTAAVIA GEENEJÄ. TUOTETTUJA TIETOJA KÄYTETÄÄN ERIYTETYSTI SÄÄNNELTYJEN GEENIEN LUOKITTELEMISEEN RYHMIIN, JOILLA ON YHTEISET SÄÄNTELYSTANDARDIT, JOTTA VOIDAAN KÄSITELLÄ ASIAAN LIITTYVIÄ ERILAISIA SÄÄNTELYMEKANISMEJA. TUTKIMME PXR UNIONIN SIVUSTOJA KÄYTTÄEN SIRU-SEQ, TIETOJA, JOTKA INTEGROIMME ETTÄ ANALYYSI TRANSCRIPIPTOMICA. TUTKIMME ARGININS-VALMISTEEN MAHDOLLISTA METILACIONIA PIPX ALFA-HELICE1:SSÄ JA TUTKIMME TARVITTAESSA MUUTOSTEN TOIMINNALLISTA MERKITYSTÄ JA GENEETTISIÄ TAUSTATEKIJÖITÄ. SEKÄ EHDOKASMETYYLIAASI(T) ETTÄ MUUT PROTEIINI-PROTEIININ JA/TAI PIIN VUOROVAIKUTUKSESSA ESIINTYVÄT PROTEIINIT ANALYSOIDAAN. TARKOITUKSENA ON OLLA INAKTIIVISESTI VASTAAVAT GEENIT JA ASIAANKUULUVA FENOTYYPPINEN ANALYYSI. _x000D_ tutkimme myös MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, A dramaattista sopeutumista erityyppisiin ympäristöihin, joissa NBLR ja NTCA-PIPX tulevat muihin sääntelyviranomaisiin, lähentyvät NBLA: n edistäjää, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. OLEMME KIINNOSTUNEITA TULKITSEMAAN JOITAKIN SÄÄNTELYYN LIITTYVIÄ MONIMUTKAISUUKSIA, KUTEN NBLR:N AKTIVOINTI- JA TOIMINTAMEKANISMIA SEKÄ NBLA-PROMOOTTORISSA LÄHENTYVIEN ERI TAPOJEN SÄÄNTELYYN LIITTYVÄÄ VUOROVAIKUTUSTA. MONIA PIPX-MENETELMÄÄ VARTEN EHDOTETTUJA MENETELMIÄ KÄYTETÄÄN MYÖS YHDESSÄ NBLR:N KANSSA. (Finnish) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: SYANOBAKTEERIT SUORITTAVAT OXIGENICAN FOTOSYNTEESIN JA KOLONISOIVAT SUURIMMAN OSAN VALAISTUISTA EKOSYSTEEMEISTÄ, JOTEN NIILLÄ ON SUURI VAIKUTUS MAAILMANLAAJUISIIN HIILI- JA TYPPIKIERTOIHIN. EKOLOGISESTA MENESTYKSESTÄ JA BIOTEKNOLOGISESTA MERKITYKSESTÄ HUOLIMATTA TÄHÄN MONIPUOLISUUTEEN JA KYKYYN SOPEUTUA YMPÄRISTÖÖN LIITTYVIÄ MEKANISMEJA EI TUNNETA. TÄSSÄ YHTEYDESSÄ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY FACILITY MAKSUT, on ERITYINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN KOSKEVAT KÄYTTÖJÄRJESTELMÄT, jotka sallivat CIANOBACTERIAAT INTEGRATTI JA VASTAUKSEN KÄYTTÖN DYSTEMSÄ._x000D_ Tämän hankkeen ensisijainen ehdotus on luonnehtia monifuncional PIPX PROTEIN, CIANOBACTERIAS CONCERNING transkriptionaaliset säätimet, jotka merkitsevät PROTEINeja ja metabolisia entsiomaja COMPLETE- ja DINAMIC-interferaatioissa. KÄYTTÄMÄLLÄ IN VIVO -YHTEISPUHDISTUSKOKEITA LIPPU-PIPX-PROTEIININ KANSSA PYRIMME TUNNISTAMAAN UUSIA KOMPONENTTEJA SIGNAALIREITEILLÄ, JOIHIN PIPX OSALLISTUU, SEN LISÄKSI, ETTÄ VALIDOIDAAN VUOROVAIKUTUKSET JA AIEMMAT TULOKSET KAKSOISHYBRIDOIDUISTA PIPX-PROTEIINEISTA (XIP-PROTEIINEISTA), KOLMINKERTAISESTA HYBRIDISAATIOSTA (PXR, JOKA TUNNISTETAAN SEKÄ PII:N ETTÄ PIPX:N AVULLA SYÖTIKSI) TAI SILIKOANALYYSISTA (ORF2060). INTERAKTIOIDEN (PROTEIINIEN JA MAHDOLLISTEN VAIKUTTIMIEN) LUONNEHTIMISEKSI YKSITYISKOHTAISEMMIN KÄYTÄMME IN VITRO – JA/TAI KAKSOISHYBRIDITUTKIMUKSIA, JOISSA KÄYTETÄÄN KOKONAISIA PROTEIINEJA, MUTANTTIJOHDANNAISIA JA/TAI TIETTYJÄ VERKKOTUNNUKSIA. KÄYTÄMME KONFOKAALISTA MIKROSKOPIAA SELVITTÄÄKSEMME, ONKO JOKIN TUTKITUISTA PROTEIINEISTA PAIKANNETTU PIPX: N NAPAVALOISSA, JOIDEN DYNAAMINEN SIJAINTI REAGOI TUMMAN VALON SYKLEIHIN. KUVATAKSEMME PIPX-SÄÄNNELLYT GEENIT NTCA: STA RIIPPUMATTA, SUORITAMME TRANSKRIMAATTIANALYYSIN KANTAPANEELILLA ERILAISISSA VILJELYOLOSUHTEISSA, JOIHIN SISÄLTYY ERILAISIA PIPX-GEENIN JOHDANNAISIA JA MUITA VASTAAVIA GEENEJÄ. TUOTETTUJA TIETOJA KÄYTETÄÄN ERIYTETYSTI SÄÄNNELTYJEN GEENIEN LUOKITTELEMISEEN RYHMIIN, JOILLA ON YHTEISET SÄÄNTELYSTANDARDIT, JOTTA VOIDAAN KÄSITELLÄ ASIAAN LIITTYVIÄ ERILAISIA SÄÄNTELYMEKANISMEJA. TUTKIMME PXR UNIONIN SIVUSTOJA KÄYTTÄEN SIRU-SEQ, TIETOJA, JOTKA INTEGROIMME ETTÄ ANALYYSI TRANSCRIPIPTOMICA. TUTKIMME ARGININS-VALMISTEEN MAHDOLLISTA METILACIONIA PIPX ALFA-HELICE1:SSÄ JA TUTKIMME TARVITTAESSA MUUTOSTEN TOIMINNALLISTA MERKITYSTÄ JA GENEETTISIÄ TAUSTATEKIJÖITÄ. SEKÄ EHDOKASMETYYLIAASI(T) ETTÄ MUUT PROTEIINI-PROTEIININ JA/TAI PIIN VUOROVAIKUTUKSESSA ESIINTYVÄT PROTEIINIT ANALYSOIDAAN. TARKOITUKSENA ON OLLA INAKTIIVISESTI VASTAAVAT GEENIT JA ASIAANKUULUVA FENOTYYPPINEN ANALYYSI. _x000D_ tutkimme myös MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, A dramaattista sopeutumista erityyppisiin ympäristöihin, joissa NBLR ja NTCA-PIPX tulevat muihin sääntelyviranomaisiin, lähentyvät NBLA: n edistäjää, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. OLEMME KIINNOSTUNEITA TULKITSEMAAN JOITAKIN SÄÄNTELYYN LIITTYVIÄ MONIMUTKAISUUKSIA, KUTEN NBLR:N AKTIVOINTI- JA TOIMINTAMEKANISMIA SEKÄ NBLA-PROMOOTTORISSA LÄHENTYVIEN ERI TAPOJEN SÄÄNTELYYN LIITTYVÄÄ VUOROVAIKUTUSTA. MONIA PIPX-MENETELMÄÄ VARTEN EHDOTETTUJA MENETELMIÄ KÄYTETÄÄN MYÖS YHDESSÄ NBLR:N KANSSA. (Finnish) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
CYJANOBAKTERIE WYKONUJĄ FOTOSYNTEZĘ OXIGENICAN I KOLONIZUJĄ WIĘKSZOŚĆ PODŚWIETLONYCH EKOSYSTEMÓW, DZIĘKI CZEMU MAJĄ OGROMNY WPŁYW NA ŚWIATOWY CYKL WĘGLOWY I AZOTOWY. NIEMNIEJ JEDNAK, POMIMO SUKCESU EKOLOGICZNEGO I ZNACZENIA BIOTECHNOLOGICZNEGO, MECHANIZMY ODPOWIEDZIALNE ZA TĘ WSZECHSTRONNOŚĆ I ZDOLNOŚĆ DO PRZYSTOSOWANIA SIĘ DO ŚRODOWISKA POZOSTAJĄ NIEZNANE. W TYM KONTEKŚCIE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY genetyczna MANIPUATION, JEST EXCELLENT SYSTEM FOR THE STUDY OF THE REGULATING INTERACTIONS pozwalając CIANOBACTERIAS INTEGRATED I RESPONDERLY DO MUY DYSTEMALNE DYSTEMALNE ŚRODKI._x000D_ Podstawową propozycją tego projektu jest scharakteryzowanie multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING regulatorów transkrypcyjnych, sygnalizujących i enzimas metabolicznych w NETWORK COMPLETE I DINAMIC interations. WYKORZYSTUJĄC BADANIA IN VIVO KO-OCZYSZCZANIA BIAŁKA FLAG-PIPX, STARAMY SIĘ ZIDENTYFIKOWAĆ NOWE SKŁADNIKI ŚCIEŻEK SYGNALIZACYJNYCH, W KTÓRYCH UCZESTNICZY PIPX, OPRÓCZ WALIDOWANIA INTERAKCJI I WCZEŚNIEJSZYCH WYNIKÓW Z PODWÓJNEJ HYBRYDYZACJI PIPX (BIAŁKA XIP), POTRÓJNEJ HYBRYDYZACJI (PXR, IDENTYFIKOWANEJ ZA POMOCĄ ZARÓWNO PII, JAK I PIPX JAKO PRZYNĘTY) LUB ANALIZY SILICO (ORF2060). ABY BARDZIEJ SZCZEGÓŁOWO SCHARAKTERYZOWAĆ INTERAKCJE (POMIĘDZY BIAŁKAMI I MOŻLIWYMI EFEKTORAMI), WYKORZYSTAMY BADANIA IN VITRO I/LUB PODWÓJNE (POTRÓJNE) HYBRYDOWE Z KOMPLETNYMI BIAŁKAMI, POCHODNYMI MUTACJI I/LUB KONKRETNYMI DOMENAMI. SKORZYSTAMY Z MIKROSKOPII KONFOKALNEJ, ABY USTALIĆ, CZY KTÓREKOLWIEK Z BADANYCH BIAŁEK WSPÓŁLOKUJE SIĘ W POLARNYCH REFLEKTORACH PIPX, KTÓRYCH DYNAMICZNA LOKALIZACJA REAGUJE NA CYKLE CIEMNEGO ŚWIATŁA. ABY OPISAĆ GENY REGULOWANE PRZEZ PIPX NIEZALEŻNIE OD NTCA, PRZEPROWADZIMY ANALIZĘ TRANSKRYPTOMICZNĄ Z PANELEM SZCZEPÓW, W RÓŻNYCH WARUNKACH KULTUROWYCH, KTÓRA OBEJMUJE RÓŻNE RODZAJE POCHODNYCH GENU PIPX I INNE POWIĄZANE GENY. UZYSKANE DANE ZOSTANĄ WYKORZYSTANE DO KLASYFIKACJI GENÓW UREGULOWANYCH W RÓŻNY SPOSÓB NA GRUPY O WSPÓLNYCH NORMACH REGULACYJNYCH, ABY NASTĘPNIE UWZGLĘDNIĆ RÓŻNE MECHANIZMY REGULACYJNE. ZBADAMY STRONY PXR UNION Z WYKORZYSTANIEM CHIP-SEQ, INFORMACJE, KTÓRE ZINTEGRUJEMY Z TYM Z ANALIZY TRANSCRIPTOMICA. ZBADAMY EWENTUALNĄ METILACJĘ ARGININS W PIPX ALPHA-HELICE1 I, W STOSOWNYCH PRZYPADKACH, ZBADAMY ZNACZENIE FUNKCJONALNE I GENETYCZNE WYZNACZNIKI MODYFIKACJI. ANALIZOWANE BĘDĄ ZARÓWNO KANDYDACKIE METYLAZY, JAK I INNE BIAŁKA WYSTĘPUJĄCE W INTERAKCJACH BIAŁKOWO-BIAŁKOWYCH I (LUB) IN SILICO. INTENCJĄ JEST NIEAKTYWNE ODPOWIEDNIE GENY I ODPOWIEDNIA ANALIZA FENOTYPOWA. _x000D_ będziemy również badać MOLECULAR DETAILS W SEMINALIZACJI DO PROCESU chlorozy, dramatyczna adaptacja do różnych typów środowiska, w którym NBLR i NTCA-PIPX, wchodzą do innych regulatorów, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. JESTEŚMY ZAINTERESOWANI ROZSZYFROWANIEM NIEKTÓRYCH ZAWIŁOŚCI REGULACYJNYCH, TAKICH JAK MECHANIZM AKTYWACJI I FUNKCJONOWANIA NBLR ORAZ INTERAKCJE REGULACYJNE RÓŻNYCH SPOSOBÓW ZBIEŻNOŚCI W PROMOTORZE NBLA. WIELE STRATEGII METODOLOGICZNYCH ZAPROPONOWANYCH W ODNIESIENIU DO PIPX ZOSTANIE RÓWNIEŻ WYKORZYSTANYCH WRAZ Z NBLR. (Polish) | |||||||||||||||
| Property / summary: CYJANOBAKTERIE WYKONUJĄ FOTOSYNTEZĘ OXIGENICAN I KOLONIZUJĄ WIĘKSZOŚĆ PODŚWIETLONYCH EKOSYSTEMÓW, DZIĘKI CZEMU MAJĄ OGROMNY WPŁYW NA ŚWIATOWY CYKL WĘGLOWY I AZOTOWY. NIEMNIEJ JEDNAK, POMIMO SUKCESU EKOLOGICZNEGO I ZNACZENIA BIOTECHNOLOGICZNEGO, MECHANIZMY ODPOWIEDZIALNE ZA TĘ WSZECHSTRONNOŚĆ I ZDOLNOŚĆ DO PRZYSTOSOWANIA SIĘ DO ŚRODOWISKA POZOSTAJĄ NIEZNANE. W TYM KONTEKŚCIE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY genetyczna MANIPUATION, JEST EXCELLENT SYSTEM FOR THE STUDY OF THE REGULATING INTERACTIONS pozwalając CIANOBACTERIAS INTEGRATED I RESPONDERLY DO MUY DYSTEMALNE DYSTEMALNE ŚRODKI._x000D_ Podstawową propozycją tego projektu jest scharakteryzowanie multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING regulatorów transkrypcyjnych, sygnalizujących i enzimas metabolicznych w NETWORK COMPLETE I DINAMIC interations. WYKORZYSTUJĄC BADANIA IN VIVO KO-OCZYSZCZANIA BIAŁKA FLAG-PIPX, STARAMY SIĘ ZIDENTYFIKOWAĆ NOWE SKŁADNIKI ŚCIEŻEK SYGNALIZACYJNYCH, W KTÓRYCH UCZESTNICZY PIPX, OPRÓCZ WALIDOWANIA INTERAKCJI I WCZEŚNIEJSZYCH WYNIKÓW Z PODWÓJNEJ HYBRYDYZACJI PIPX (BIAŁKA XIP), POTRÓJNEJ HYBRYDYZACJI (PXR, IDENTYFIKOWANEJ ZA POMOCĄ ZARÓWNO PII, JAK I PIPX JAKO PRZYNĘTY) LUB ANALIZY SILICO (ORF2060). ABY BARDZIEJ SZCZEGÓŁOWO SCHARAKTERYZOWAĆ INTERAKCJE (POMIĘDZY BIAŁKAMI I MOŻLIWYMI EFEKTORAMI), WYKORZYSTAMY BADANIA IN VITRO I/LUB PODWÓJNE (POTRÓJNE) HYBRYDOWE Z KOMPLETNYMI BIAŁKAMI, POCHODNYMI MUTACJI I/LUB KONKRETNYMI DOMENAMI. SKORZYSTAMY Z MIKROSKOPII KONFOKALNEJ, ABY USTALIĆ, CZY KTÓREKOLWIEK Z BADANYCH BIAŁEK WSPÓŁLOKUJE SIĘ W POLARNYCH REFLEKTORACH PIPX, KTÓRYCH DYNAMICZNA LOKALIZACJA REAGUJE NA CYKLE CIEMNEGO ŚWIATŁA. ABY OPISAĆ GENY REGULOWANE PRZEZ PIPX NIEZALEŻNIE OD NTCA, PRZEPROWADZIMY ANALIZĘ TRANSKRYPTOMICZNĄ Z PANELEM SZCZEPÓW, W RÓŻNYCH WARUNKACH KULTUROWYCH, KTÓRA OBEJMUJE RÓŻNE RODZAJE POCHODNYCH GENU PIPX I INNE POWIĄZANE GENY. UZYSKANE DANE ZOSTANĄ WYKORZYSTANE DO KLASYFIKACJI GENÓW UREGULOWANYCH W RÓŻNY SPOSÓB NA GRUPY O WSPÓLNYCH NORMACH REGULACYJNYCH, ABY NASTĘPNIE UWZGLĘDNIĆ RÓŻNE MECHANIZMY REGULACYJNE. ZBADAMY STRONY PXR UNION Z WYKORZYSTANIEM CHIP-SEQ, INFORMACJE, KTÓRE ZINTEGRUJEMY Z TYM Z ANALIZY TRANSCRIPTOMICA. ZBADAMY EWENTUALNĄ METILACJĘ ARGININS W PIPX ALPHA-HELICE1 I, W STOSOWNYCH PRZYPADKACH, ZBADAMY ZNACZENIE FUNKCJONALNE I GENETYCZNE WYZNACZNIKI MODYFIKACJI. ANALIZOWANE BĘDĄ ZARÓWNO KANDYDACKIE METYLAZY, JAK I INNE BIAŁKA WYSTĘPUJĄCE W INTERAKCJACH BIAŁKOWO-BIAŁKOWYCH I (LUB) IN SILICO. INTENCJĄ JEST NIEAKTYWNE ODPOWIEDNIE GENY I ODPOWIEDNIA ANALIZA FENOTYPOWA. _x000D_ będziemy również badać MOLECULAR DETAILS W SEMINALIZACJI DO PROCESU chlorozy, dramatyczna adaptacja do różnych typów środowiska, w którym NBLR i NTCA-PIPX, wchodzą do innych regulatorów, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. JESTEŚMY ZAINTERESOWANI ROZSZYFROWANIEM NIEKTÓRYCH ZAWIŁOŚCI REGULACYJNYCH, TAKICH JAK MECHANIZM AKTYWACJI I FUNKCJONOWANIA NBLR ORAZ INTERAKCJE REGULACYJNE RÓŻNYCH SPOSOBÓW ZBIEŻNOŚCI W PROMOTORZE NBLA. WIELE STRATEGII METODOLOGICZNYCH ZAPROPONOWANYCH W ODNIESIENIU DO PIPX ZOSTANIE RÓWNIEŻ WYKORZYSTANYCH WRAZ Z NBLR. (Polish) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: CYJANOBAKTERIE WYKONUJĄ FOTOSYNTEZĘ OXIGENICAN I KOLONIZUJĄ WIĘKSZOŚĆ PODŚWIETLONYCH EKOSYSTEMÓW, DZIĘKI CZEMU MAJĄ OGROMNY WPŁYW NA ŚWIATOWY CYKL WĘGLOWY I AZOTOWY. NIEMNIEJ JEDNAK, POMIMO SUKCESU EKOLOGICZNEGO I ZNACZENIA BIOTECHNOLOGICZNEGO, MECHANIZMY ODPOWIEDZIALNE ZA TĘ WSZECHSTRONNOŚĆ I ZDOLNOŚĆ DO PRZYSTOSOWANIA SIĘ DO ŚRODOWISKA POZOSTAJĄ NIEZNANE. W TYM KONTEKŚCIE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY genetyczna MANIPUATION, JEST EXCELLENT SYSTEM FOR THE STUDY OF THE REGULATING INTERACTIONS pozwalając CIANOBACTERIAS INTEGRATED I RESPONDERLY DO MUY DYSTEMALNE DYSTEMALNE ŚRODKI._x000D_ Podstawową propozycją tego projektu jest scharakteryzowanie multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING regulatorów transkrypcyjnych, sygnalizujących i enzimas metabolicznych w NETWORK COMPLETE I DINAMIC interations. WYKORZYSTUJĄC BADANIA IN VIVO KO-OCZYSZCZANIA BIAŁKA FLAG-PIPX, STARAMY SIĘ ZIDENTYFIKOWAĆ NOWE SKŁADNIKI ŚCIEŻEK SYGNALIZACYJNYCH, W KTÓRYCH UCZESTNICZY PIPX, OPRÓCZ WALIDOWANIA INTERAKCJI I WCZEŚNIEJSZYCH WYNIKÓW Z PODWÓJNEJ HYBRYDYZACJI PIPX (BIAŁKA XIP), POTRÓJNEJ HYBRYDYZACJI (PXR, IDENTYFIKOWANEJ ZA POMOCĄ ZARÓWNO PII, JAK I PIPX JAKO PRZYNĘTY) LUB ANALIZY SILICO (ORF2060). ABY BARDZIEJ SZCZEGÓŁOWO SCHARAKTERYZOWAĆ INTERAKCJE (POMIĘDZY BIAŁKAMI I MOŻLIWYMI EFEKTORAMI), WYKORZYSTAMY BADANIA IN VITRO I/LUB PODWÓJNE (POTRÓJNE) HYBRYDOWE Z KOMPLETNYMI BIAŁKAMI, POCHODNYMI MUTACJI I/LUB KONKRETNYMI DOMENAMI. SKORZYSTAMY Z MIKROSKOPII KONFOKALNEJ, ABY USTALIĆ, CZY KTÓREKOLWIEK Z BADANYCH BIAŁEK WSPÓŁLOKUJE SIĘ W POLARNYCH REFLEKTORACH PIPX, KTÓRYCH DYNAMICZNA LOKALIZACJA REAGUJE NA CYKLE CIEMNEGO ŚWIATŁA. ABY OPISAĆ GENY REGULOWANE PRZEZ PIPX NIEZALEŻNIE OD NTCA, PRZEPROWADZIMY ANALIZĘ TRANSKRYPTOMICZNĄ Z PANELEM SZCZEPÓW, W RÓŻNYCH WARUNKACH KULTUROWYCH, KTÓRA OBEJMUJE RÓŻNE RODZAJE POCHODNYCH GENU PIPX I INNE POWIĄZANE GENY. UZYSKANE DANE ZOSTANĄ WYKORZYSTANE DO KLASYFIKACJI GENÓW UREGULOWANYCH W RÓŻNY SPOSÓB NA GRUPY O WSPÓLNYCH NORMACH REGULACYJNYCH, ABY NASTĘPNIE UWZGLĘDNIĆ RÓŻNE MECHANIZMY REGULACYJNE. ZBADAMY STRONY PXR UNION Z WYKORZYSTANIEM CHIP-SEQ, INFORMACJE, KTÓRE ZINTEGRUJEMY Z TYM Z ANALIZY TRANSCRIPTOMICA. ZBADAMY EWENTUALNĄ METILACJĘ ARGININS W PIPX ALPHA-HELICE1 I, W STOSOWNYCH PRZYPADKACH, ZBADAMY ZNACZENIE FUNKCJONALNE I GENETYCZNE WYZNACZNIKI MODYFIKACJI. ANALIZOWANE BĘDĄ ZARÓWNO KANDYDACKIE METYLAZY, JAK I INNE BIAŁKA WYSTĘPUJĄCE W INTERAKCJACH BIAŁKOWO-BIAŁKOWYCH I (LUB) IN SILICO. INTENCJĄ JEST NIEAKTYWNE ODPOWIEDNIE GENY I ODPOWIEDNIA ANALIZA FENOTYPOWA. _x000D_ będziemy również badać MOLECULAR DETAILS W SEMINALIZACJI DO PROCESU chlorozy, dramatyczna adaptacja do różnych typów środowiska, w którym NBLR i NTCA-PIPX, wchodzą do innych regulatorów, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. JESTEŚMY ZAINTERESOWANI ROZSZYFROWANIEM NIEKTÓRYCH ZAWIŁOŚCI REGULACYJNYCH, TAKICH JAK MECHANIZM AKTYWACJI I FUNKCJONOWANIA NBLR ORAZ INTERAKCJE REGULACYJNE RÓŻNYCH SPOSOBÓW ZBIEŻNOŚCI W PROMOTORZE NBLA. WIELE STRATEGII METODOLOGICZNYCH ZAPROPONOWANYCH W ODNIESIENIU DO PIPX ZOSTANIE RÓWNIEŻ WYKORZYSTANYCH WRAZ Z NBLR. (Polish) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
A CIANOBAKTÉRIUMOK OXIGENICAN FOTOSZINTÉZIST VÉGEZNEK ÉS TELEPÍTIK A MEGVILÁGÍTOTT ÖKOSZISZTÉMÁK TÖBBSÉGÉT, ÍGY NAGY HATÁSSAL VANNAK A GLOBÁLIS SZÉN- ÉS NITROGÉNCIKLUSOKRA. ÖKOLÓGIAI SIKERE ÉS BIOTECHNOLÓGIAI JELENTŐSÉGE ELLENÉRE AZONBAN A SOKOLDALÚSÁGÉRT ÉS A KÖRNYEZETI ALKALMAZKODÁSI KÉPESSÉGÉRT FELELŐS MECHANIZMUSOK TOVÁBBRA SEM ISMERTEK. EBBEN AZ ÖSSZEFÜGGÉSBEN A SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, A RELATIVELY FACILITY genetikális MANIPUATION, Ez egy KELLENES RENDELKEZÉSI RENDELKEZÉSEK A RENDELKEZŐ INTERACCIÓK A CSOMAGOLÁSI INTERACCIÓK lehetővé teszik a CIANOBACTERIAS INTEGRATAL ÉS RESPONDERÁCIÓK, hogy MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ A projekt elsődleges javaslata a multifunkcionális PIPX PROTEIN jellemzése, egy UN FACTOR A CIANOBACTERIAS CONCERNING transzkripciós szabályozók, Signalising PROTEINS ÉS metabolikus enzimek a NETWORK A COMPLETE ÉS DINAMIC interstrukciók. A ZÁSZLÓ-PIPX FEHÉRJÉVEL VÉGZETT IN VIVO KOTISZTULÁSI VIZSGÁLATOK SEGÍTSÉGÉVEL CÉLUNK, HOGY AZONOSÍTSUK A JELÁTVITELI ÚTVONALAK ÚJ ÖSSZETEVŐIT, AMELYEKBEN A PIPX RÉSZT VESZ, A KETTŐS HIBRIDIZÁLT PIPX (XIP FEHÉRJÉK), A HÁRMAS HIBRIDIZÁCIÓ (PXR, A PII ÉS A PIPX MINT CSALI) VAGY AZ IN SILICO ANALÍZIS (ORF2060) VALIDÁLÁSA MELLETT. AZ INTERAKCIÓK (FEHÉRJÉK ÉS LEHETSÉGES EFFEKTOROK KÖZÖTTI) RÉSZLETESEBB JELLEMZÉSÉRE IN VITRO ÉS/VAGY KETTŐS (HÁROM) HIBRID KÍSÉRLETEKET ALKALMAZUNK TELJES FEHÉRJÉKKEL, MUTÁNS SZÁRMAZÉKOKKAL ÉS/VAGY SPECIFIKUS TERÜLETEKKEL. IGÉNYBE VESSZÜK A KONFOKÁLIS MIKROSZKÓPIA HASZNÁLATÁT ANNAK MEGÁLLAPÍTÁSÁRA, HOGY A FEHÉRJÉK A PIPX POLÁRIS REFLEKTORFÉNYEIBEN TANULMÁNYOZTÁK-E A KO-LOKALISES-T, AMELYNEK DINAMIKUS ELHELYEZKEDÉSE REAGÁL A SÖTÉT FÉNY CIKLUSAIRA. A PIPX-SZABÁLYOZOTT GÉNEK NTCA-TÓL FÜGGETLENÜL TÖRTÉNŐ LEÍRÁSÁHOZ TRANSZKRIPTOMIKUS ELEMZÉST VÉGZÜNK EGY TÖRZSPANELLEL, KÜLÖNBÖZŐ TENYÉSZTÉSI KÖRÜLMÉNYEK KÖZÖTT, AMELY MAGÁBAN FOGLALJA A PIPX GÉN KÜLÖNBÖZŐ SZÁRMAZÉKAIT ÉS MÁS KAPCSOLÓDÓ GÉNEKET. A GENERÁLT ADATOKAT ARRA HASZNÁLJÁK FEL, HOGY A KÜLÖNBÖZŐKÉPPEN SZABÁLYOZOTT GÉNEKET KÖZÖS SZABÁLYOZÁSI STANDARDOKKAL RENDELKEZŐ CSOPORTOKBA SOROLJÁK, HOGY AZTÁN FOGLALKOZZANAK AZ ÉRINTETT KÜLÖNBÖZŐ SZABÁLYOZÁSI MECHANIZMUSOKKAL. A PXR UNIÓS OLDALAKAT A CHIP-SEQ SEGÍTSÉGÉVEL VIZSGÁLJUK MEG, AZOKAT AZ INFORMÁCIÓKAT, AMELYEKET A TRANSCRIPTOMICA ELEMZÉSÉBŐL INTEGRÁLUNK. MEGVIZSGÁLJUK AZ ARGININS LEHETSÉGES METILACION-JÁT A PIPX ALFA-HELICE1-BEN, ÉS ADOTT ESETBEN MEGVIZSGÁLJUK A MÓDOSÍTÁSOK FUNKCIONÁLIS JELENTÉSÉT ÉS GENETIKAI MEGHATÁROZÓIT. MIND A JAVASOLT METILÁZ(OK)AT, MIND A FEHÉRJE-FEHÉRJE ÉS/VAGY IN SILICO KÖLCSÖNHATÁSOKBAN TALÁLHATÓ EGYÉB FEHÉRJÉKET ELEMEZNI KELL. A CÉL A MEGFELELŐ GÉNEK ÉS A VONATKOZÓ FENOTÍPUSOS ELEMZÉS INAKTÍVVÁ TÉTELE. _x000D_ azt is tanulmányozni MOLECULAR DETAILS A SEMINALISATION DOES A PROCESS of klórózis, A drámai adaptáció a különböző típusú környezet, amelyben NBLR és NTCA-PIPX, belépnek más szabályozók, Converge for the Promotor of the NBLA, esential for The Degratation of Physiobilisomas. ÉRDEKLŐDÜNK A SZABÁLYOZÁSI KOMPLEXITÁSOK NÉMELYIKÉNEK MEGFEJTÉSE IRÁNT, MINT PÉLDÁUL AZ NBLR AKTIVÁLÁSÁNAK ÉS FUNKCIÓJÁNAK MECHANIZMUSA, VALAMINT AZ NBLA-PROMÓTERBEN KONVERGÁLÓ KÜLÖNBÖZŐ MÓDOK SZABÁLYOZÁSI KÖLCSÖNHATÁSAI. A PIPX-SZEL KAPCSOLATBAN JAVASOLT MÓDSZERTANI STRATÉGIÁK KÖZÜL SOK AZ NBLR-REL EGYÜTT IS ALKALMAZÁSRA KERÜL. (Hungarian) | |||||||||||||||
| Property / summary: A CIANOBAKTÉRIUMOK OXIGENICAN FOTOSZINTÉZIST VÉGEZNEK ÉS TELEPÍTIK A MEGVILÁGÍTOTT ÖKOSZISZTÉMÁK TÖBBSÉGÉT, ÍGY NAGY HATÁSSAL VANNAK A GLOBÁLIS SZÉN- ÉS NITROGÉNCIKLUSOKRA. ÖKOLÓGIAI SIKERE ÉS BIOTECHNOLÓGIAI JELENTŐSÉGE ELLENÉRE AZONBAN A SOKOLDALÚSÁGÉRT ÉS A KÖRNYEZETI ALKALMAZKODÁSI KÉPESSÉGÉRT FELELŐS MECHANIZMUSOK TOVÁBBRA SEM ISMERTEK. EBBEN AZ ÖSSZEFÜGGÉSBEN A SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, A RELATIVELY FACILITY genetikális MANIPUATION, Ez egy KELLENES RENDELKEZÉSI RENDELKEZÉSEK A RENDELKEZŐ INTERACCIÓK A CSOMAGOLÁSI INTERACCIÓK lehetővé teszik a CIANOBACTERIAS INTEGRATAL ÉS RESPONDERÁCIÓK, hogy MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ A projekt elsődleges javaslata a multifunkcionális PIPX PROTEIN jellemzése, egy UN FACTOR A CIANOBACTERIAS CONCERNING transzkripciós szabályozók, Signalising PROTEINS ÉS metabolikus enzimek a NETWORK A COMPLETE ÉS DINAMIC interstrukciók. A ZÁSZLÓ-PIPX FEHÉRJÉVEL VÉGZETT IN VIVO KOTISZTULÁSI VIZSGÁLATOK SEGÍTSÉGÉVEL CÉLUNK, HOGY AZONOSÍTSUK A JELÁTVITELI ÚTVONALAK ÚJ ÖSSZETEVŐIT, AMELYEKBEN A PIPX RÉSZT VESZ, A KETTŐS HIBRIDIZÁLT PIPX (XIP FEHÉRJÉK), A HÁRMAS HIBRIDIZÁCIÓ (PXR, A PII ÉS A PIPX MINT CSALI) VAGY AZ IN SILICO ANALÍZIS (ORF2060) VALIDÁLÁSA MELLETT. AZ INTERAKCIÓK (FEHÉRJÉK ÉS LEHETSÉGES EFFEKTOROK KÖZÖTTI) RÉSZLETESEBB JELLEMZÉSÉRE IN VITRO ÉS/VAGY KETTŐS (HÁROM) HIBRID KÍSÉRLETEKET ALKALMAZUNK TELJES FEHÉRJÉKKEL, MUTÁNS SZÁRMAZÉKOKKAL ÉS/VAGY SPECIFIKUS TERÜLETEKKEL. IGÉNYBE VESSZÜK A KONFOKÁLIS MIKROSZKÓPIA HASZNÁLATÁT ANNAK MEGÁLLAPÍTÁSÁRA, HOGY A FEHÉRJÉK A PIPX POLÁRIS REFLEKTORFÉNYEIBEN TANULMÁNYOZTÁK-E A KO-LOKALISES-T, AMELYNEK DINAMIKUS ELHELYEZKEDÉSE REAGÁL A SÖTÉT FÉNY CIKLUSAIRA. A PIPX-SZABÁLYOZOTT GÉNEK NTCA-TÓL FÜGGETLENÜL TÖRTÉNŐ LEÍRÁSÁHOZ TRANSZKRIPTOMIKUS ELEMZÉST VÉGZÜNK EGY TÖRZSPANELLEL, KÜLÖNBÖZŐ TENYÉSZTÉSI KÖRÜLMÉNYEK KÖZÖTT, AMELY MAGÁBAN FOGLALJA A PIPX GÉN KÜLÖNBÖZŐ SZÁRMAZÉKAIT ÉS MÁS KAPCSOLÓDÓ GÉNEKET. A GENERÁLT ADATOKAT ARRA HASZNÁLJÁK FEL, HOGY A KÜLÖNBÖZŐKÉPPEN SZABÁLYOZOTT GÉNEKET KÖZÖS SZABÁLYOZÁSI STANDARDOKKAL RENDELKEZŐ CSOPORTOKBA SOROLJÁK, HOGY AZTÁN FOGLALKOZZANAK AZ ÉRINTETT KÜLÖNBÖZŐ SZABÁLYOZÁSI MECHANIZMUSOKKAL. A PXR UNIÓS OLDALAKAT A CHIP-SEQ SEGÍTSÉGÉVEL VIZSGÁLJUK MEG, AZOKAT AZ INFORMÁCIÓKAT, AMELYEKET A TRANSCRIPTOMICA ELEMZÉSÉBŐL INTEGRÁLUNK. MEGVIZSGÁLJUK AZ ARGININS LEHETSÉGES METILACION-JÁT A PIPX ALFA-HELICE1-BEN, ÉS ADOTT ESETBEN MEGVIZSGÁLJUK A MÓDOSÍTÁSOK FUNKCIONÁLIS JELENTÉSÉT ÉS GENETIKAI MEGHATÁROZÓIT. MIND A JAVASOLT METILÁZ(OK)AT, MIND A FEHÉRJE-FEHÉRJE ÉS/VAGY IN SILICO KÖLCSÖNHATÁSOKBAN TALÁLHATÓ EGYÉB FEHÉRJÉKET ELEMEZNI KELL. A CÉL A MEGFELELŐ GÉNEK ÉS A VONATKOZÓ FENOTÍPUSOS ELEMZÉS INAKTÍVVÁ TÉTELE. _x000D_ azt is tanulmányozni MOLECULAR DETAILS A SEMINALISATION DOES A PROCESS of klórózis, A drámai adaptáció a különböző típusú környezet, amelyben NBLR és NTCA-PIPX, belépnek más szabályozók, Converge for the Promotor of the NBLA, esential for The Degratation of Physiobilisomas. ÉRDEKLŐDÜNK A SZABÁLYOZÁSI KOMPLEXITÁSOK NÉMELYIKÉNEK MEGFEJTÉSE IRÁNT, MINT PÉLDÁUL AZ NBLR AKTIVÁLÁSÁNAK ÉS FUNKCIÓJÁNAK MECHANIZMUSA, VALAMINT AZ NBLA-PROMÓTERBEN KONVERGÁLÓ KÜLÖNBÖZŐ MÓDOK SZABÁLYOZÁSI KÖLCSÖNHATÁSAI. A PIPX-SZEL KAPCSOLATBAN JAVASOLT MÓDSZERTANI STRATÉGIÁK KÖZÜL SOK AZ NBLR-REL EGYÜTT IS ALKALMAZÁSRA KERÜL. (Hungarian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: A CIANOBAKTÉRIUMOK OXIGENICAN FOTOSZINTÉZIST VÉGEZNEK ÉS TELEPÍTIK A MEGVILÁGÍTOTT ÖKOSZISZTÉMÁK TÖBBSÉGÉT, ÍGY NAGY HATÁSSAL VANNAK A GLOBÁLIS SZÉN- ÉS NITROGÉNCIKLUSOKRA. ÖKOLÓGIAI SIKERE ÉS BIOTECHNOLÓGIAI JELENTŐSÉGE ELLENÉRE AZONBAN A SOKOLDALÚSÁGÉRT ÉS A KÖRNYEZETI ALKALMAZKODÁSI KÉPESSÉGÉRT FELELŐS MECHANIZMUSOK TOVÁBBRA SEM ISMERTEK. EBBEN AZ ÖSSZEFÜGGÉSBEN A SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, A RELATIVELY FACILITY genetikális MANIPUATION, Ez egy KELLENES RENDELKEZÉSI RENDELKEZÉSEK A RENDELKEZŐ INTERACCIÓK A CSOMAGOLÁSI INTERACCIÓK lehetővé teszik a CIANOBACTERIAS INTEGRATAL ÉS RESPONDERÁCIÓK, hogy MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ A projekt elsődleges javaslata a multifunkcionális PIPX PROTEIN jellemzése, egy UN FACTOR A CIANOBACTERIAS CONCERNING transzkripciós szabályozók, Signalising PROTEINS ÉS metabolikus enzimek a NETWORK A COMPLETE ÉS DINAMIC interstrukciók. A ZÁSZLÓ-PIPX FEHÉRJÉVEL VÉGZETT IN VIVO KOTISZTULÁSI VIZSGÁLATOK SEGÍTSÉGÉVEL CÉLUNK, HOGY AZONOSÍTSUK A JELÁTVITELI ÚTVONALAK ÚJ ÖSSZETEVŐIT, AMELYEKBEN A PIPX RÉSZT VESZ, A KETTŐS HIBRIDIZÁLT PIPX (XIP FEHÉRJÉK), A HÁRMAS HIBRIDIZÁCIÓ (PXR, A PII ÉS A PIPX MINT CSALI) VAGY AZ IN SILICO ANALÍZIS (ORF2060) VALIDÁLÁSA MELLETT. AZ INTERAKCIÓK (FEHÉRJÉK ÉS LEHETSÉGES EFFEKTOROK KÖZÖTTI) RÉSZLETESEBB JELLEMZÉSÉRE IN VITRO ÉS/VAGY KETTŐS (HÁROM) HIBRID KÍSÉRLETEKET ALKALMAZUNK TELJES FEHÉRJÉKKEL, MUTÁNS SZÁRMAZÉKOKKAL ÉS/VAGY SPECIFIKUS TERÜLETEKKEL. IGÉNYBE VESSZÜK A KONFOKÁLIS MIKROSZKÓPIA HASZNÁLATÁT ANNAK MEGÁLLAPÍTÁSÁRA, HOGY A FEHÉRJÉK A PIPX POLÁRIS REFLEKTORFÉNYEIBEN TANULMÁNYOZTÁK-E A KO-LOKALISES-T, AMELYNEK DINAMIKUS ELHELYEZKEDÉSE REAGÁL A SÖTÉT FÉNY CIKLUSAIRA. A PIPX-SZABÁLYOZOTT GÉNEK NTCA-TÓL FÜGGETLENÜL TÖRTÉNŐ LEÍRÁSÁHOZ TRANSZKRIPTOMIKUS ELEMZÉST VÉGZÜNK EGY TÖRZSPANELLEL, KÜLÖNBÖZŐ TENYÉSZTÉSI KÖRÜLMÉNYEK KÖZÖTT, AMELY MAGÁBAN FOGLALJA A PIPX GÉN KÜLÖNBÖZŐ SZÁRMAZÉKAIT ÉS MÁS KAPCSOLÓDÓ GÉNEKET. A GENERÁLT ADATOKAT ARRA HASZNÁLJÁK FEL, HOGY A KÜLÖNBÖZŐKÉPPEN SZABÁLYOZOTT GÉNEKET KÖZÖS SZABÁLYOZÁSI STANDARDOKKAL RENDELKEZŐ CSOPORTOKBA SOROLJÁK, HOGY AZTÁN FOGLALKOZZANAK AZ ÉRINTETT KÜLÖNBÖZŐ SZABÁLYOZÁSI MECHANIZMUSOKKAL. A PXR UNIÓS OLDALAKAT A CHIP-SEQ SEGÍTSÉGÉVEL VIZSGÁLJUK MEG, AZOKAT AZ INFORMÁCIÓKAT, AMELYEKET A TRANSCRIPTOMICA ELEMZÉSÉBŐL INTEGRÁLUNK. MEGVIZSGÁLJUK AZ ARGININS LEHETSÉGES METILACION-JÁT A PIPX ALFA-HELICE1-BEN, ÉS ADOTT ESETBEN MEGVIZSGÁLJUK A MÓDOSÍTÁSOK FUNKCIONÁLIS JELENTÉSÉT ÉS GENETIKAI MEGHATÁROZÓIT. MIND A JAVASOLT METILÁZ(OK)AT, MIND A FEHÉRJE-FEHÉRJE ÉS/VAGY IN SILICO KÖLCSÖNHATÁSOKBAN TALÁLHATÓ EGYÉB FEHÉRJÉKET ELEMEZNI KELL. A CÉL A MEGFELELŐ GÉNEK ÉS A VONATKOZÓ FENOTÍPUSOS ELEMZÉS INAKTÍVVÁ TÉTELE. _x000D_ azt is tanulmányozni MOLECULAR DETAILS A SEMINALISATION DOES A PROCESS of klórózis, A drámai adaptáció a különböző típusú környezet, amelyben NBLR és NTCA-PIPX, belépnek más szabályozók, Converge for the Promotor of the NBLA, esential for The Degratation of Physiobilisomas. ÉRDEKLŐDÜNK A SZABÁLYOZÁSI KOMPLEXITÁSOK NÉMELYIKÉNEK MEGFEJTÉSE IRÁNT, MINT PÉLDÁUL AZ NBLR AKTIVÁLÁSÁNAK ÉS FUNKCIÓJÁNAK MECHANIZMUSA, VALAMINT AZ NBLA-PROMÓTERBEN KONVERGÁLÓ KÜLÖNBÖZŐ MÓDOK SZABÁLYOZÁSI KÖLCSÖNHATÁSAI. A PIPX-SZEL KAPCSOLATBAN JAVASOLT MÓDSZERTANI STRATÉGIÁK KÖZÜL SOK AZ NBLR-REL EGYÜTT IS ALKALMAZÁSRA KERÜL. (Hungarian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
SINIC PROVÁDÍ OXIGENICAN FOTOSYNTÉZU A KOLONIZUJE VĚTŠINU OSVĚTLENÝCH EKOSYSTÉMŮ, TAKŽE MAJÍ VELKÝ DOPAD NA GLOBÁLNÍ UHLÍKOVÉ A DUSÍKOVÉ CYKLY. NAVZDORY SVÉMU EKOLOGICKÉMU ÚSPĚCHU A BIOTECHNOLOGICKÉMU VÝZNAMU VŠAK MECHANISMY ODPOVĚDNÉ ZA TUTO VŠESTRANNOST A SCHOPNOST PŘIZPŮSOBIT SE ŽIVOTNÍMU PROSTŘEDÍ ZŮSTÁVAJÍ NEZNÁMÉ. V TÉTO SOUVISLOSTI SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY genetické MANIPUACE, je vynikajícím systémem pro STUDY REGULATING INTERACTIONS umožňující CIANOBACTERIAS INTEGRATED a RESPONDERLY MUYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Primárním návrhem tohoto projektu je charakterizovat multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING transkripční regulátory, Signalizační PROTEINS A metabolické enzimy v NETWORK COMPLETE a DINAMIC interations. POMOCÍ IN VIVO VYČISTĚNÝCH ZKOUŠEK S PROTEINEM FLAG-PIPX SE SNAŽÍME IDENTIFIKOVAT NOVÉ SLOŽKY SIGNALIZAČNÍCH DRAH, NA KTERÝCH SE PIPX PODÍLÍ, KROMĚ VALIDACE INTERAKCÍ A PŘEDCHOZÍCH VÝSLEDKŮ Z DVOJITÉ HYBRIDIZOVANÉ PIPX (XIP PROTEINY), TROJITÉ HYBRIDIZACE (PXR, IDENTIFIKOVANÉ POMOCÍ PII I PIPX JAKO NÁVNADY) NEBO IN SILIKO ANALÝZY (ORF2060). PRO PODROBNĚJŠÍ CHARAKTERIZACI INTERAKCÍ (MEZI PROTEINY A MOŽNÝMI ÚČINKY) BUDEME POUŽÍVAT IN VITRO A/NEBO DVOJITÉ (TROJNÁSOBNÉ) HYBRIDNÍ STUDIE S KOMPLETNÍMI PROTEINY, DERIVÁTY MUTANTŮ A/NEBO SPECIFICKÝMI DOMÉNAMI. UCHÝLÍME SE K POUŽITÍ KONFOKÁLNÍ MIKROSKOPIE K URČENÍ, ZDA NĚKTERÝ ZE STUDOVANÝCH PROTEINŮ SPOLULOKALIZUJE V POLÁRNÍCH REFLEKTORECH PIPX, JEJICHŽ DYNAMICKÁ POLOHA REAGUJE NA CYKLY TMAVÉHO SVĚTLA. ABYCHOM POPSALI PIPX-REGULOVANÉ GENY NEZÁVISLE NA NTCA, PROVEDEME TRANSKRIPTOMICKOU ANALÝZU S KMENOVÝM PANELEM ZA RŮZNÝCH KULTURNÍCH PODMÍNEK, KTERÝ ZAHRNUJE RŮZNÉ TYPY DERIVÁTŮ PIPX GENU A DALŠÍCH SOUVISEJÍCÍCH GENŮ. ZÍSKANÉ ÚDAJE BUDOU POUŽITY K ZAŘAZENÍ DIFERENCIÁLNĚ REGULOVANÝCH GENŮ DO SKUPIN SE SPOLEČNÝMI REGULAČNÍMI NORMAMI A NÁSLEDNĚ K ŘEŠENÍ RŮZNÝCH PŘÍSLUŠNÝCH REGULAČNÍCH MECHANISMŮ. BUDEME ZKOUMAT PXR UNION STRÁNKY POMOCÍ CHIP-SEQ, INFORMACE, KTERÉ BUDEME INTEGROVAT S TÍM Z ANALÝZY TRANSCRIPTOMICA. PROZKOUMÁME MOŽNOU METILACION ARGININS V PIPX ALFA-HELICE1 A PŘÍPADNĚ PROZKOUMÁME FUNKČNÍ VÝZNAM A GENETICKÉ DETERMINANTY MODIFIKACÍ. ANALYZOVÁNY BUDOU JAK KANDIDÁTSKÉ METHYLÁZY, TAK JINÉ BÍLKOVINY NALEZENÉ V INTERAKCÍCH PROTEIN-PROTEIN A/NEBO IN SILIKO. ZÁMĚREM JE NEAKTIVOVAT ODPOVÍDAJÍCÍ GENY A PŘÍSLUŠNOU FENOTYPOVOU ANALÝZU. _x000D_ budeme také studovat MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DO PROCESS of chlorosis, dramatická adaptace na různé typy prostředí, ve kterém NBLR a NTCA-PIPX, vstoupit do jiných regulátorů, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation Physiobilisomas. MÁME ZÁJEM ROZLUŠTIT NĚKTERÉ REGULAČNÍ KOMPLEXNOSTI, JAKO JE MECHANISMUS AKTIVACE A FUNKCE NBLR A REGULAČNÍ INTERAKCE RŮZNÝCH ZPŮSOBŮ, KTERÉ SE SBLIŽUJÍ V PROMOTÉRU NBLA. MNOHO METODICKÝCH STRATEGIÍ NAVRŽENÝCH V SOUVISLOSTI S PIPX BUDE ROVNĚŽ POUŽITO SPOLU S NBLR. (Czech) | |||||||||||||||
| Property / summary: SINIC PROVÁDÍ OXIGENICAN FOTOSYNTÉZU A KOLONIZUJE VĚTŠINU OSVĚTLENÝCH EKOSYSTÉMŮ, TAKŽE MAJÍ VELKÝ DOPAD NA GLOBÁLNÍ UHLÍKOVÉ A DUSÍKOVÉ CYKLY. NAVZDORY SVÉMU EKOLOGICKÉMU ÚSPĚCHU A BIOTECHNOLOGICKÉMU VÝZNAMU VŠAK MECHANISMY ODPOVĚDNÉ ZA TUTO VŠESTRANNOST A SCHOPNOST PŘIZPŮSOBIT SE ŽIVOTNÍMU PROSTŘEDÍ ZŮSTÁVAJÍ NEZNÁMÉ. V TÉTO SOUVISLOSTI SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY genetické MANIPUACE, je vynikajícím systémem pro STUDY REGULATING INTERACTIONS umožňující CIANOBACTERIAS INTEGRATED a RESPONDERLY MUYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Primárním návrhem tohoto projektu je charakterizovat multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING transkripční regulátory, Signalizační PROTEINS A metabolické enzimy v NETWORK COMPLETE a DINAMIC interations. POMOCÍ IN VIVO VYČISTĚNÝCH ZKOUŠEK S PROTEINEM FLAG-PIPX SE SNAŽÍME IDENTIFIKOVAT NOVÉ SLOŽKY SIGNALIZAČNÍCH DRAH, NA KTERÝCH SE PIPX PODÍLÍ, KROMĚ VALIDACE INTERAKCÍ A PŘEDCHOZÍCH VÝSLEDKŮ Z DVOJITÉ HYBRIDIZOVANÉ PIPX (XIP PROTEINY), TROJITÉ HYBRIDIZACE (PXR, IDENTIFIKOVANÉ POMOCÍ PII I PIPX JAKO NÁVNADY) NEBO IN SILIKO ANALÝZY (ORF2060). PRO PODROBNĚJŠÍ CHARAKTERIZACI INTERAKCÍ (MEZI PROTEINY A MOŽNÝMI ÚČINKY) BUDEME POUŽÍVAT IN VITRO A/NEBO DVOJITÉ (TROJNÁSOBNÉ) HYBRIDNÍ STUDIE S KOMPLETNÍMI PROTEINY, DERIVÁTY MUTANTŮ A/NEBO SPECIFICKÝMI DOMÉNAMI. UCHÝLÍME SE K POUŽITÍ KONFOKÁLNÍ MIKROSKOPIE K URČENÍ, ZDA NĚKTERÝ ZE STUDOVANÝCH PROTEINŮ SPOLULOKALIZUJE V POLÁRNÍCH REFLEKTORECH PIPX, JEJICHŽ DYNAMICKÁ POLOHA REAGUJE NA CYKLY TMAVÉHO SVĚTLA. ABYCHOM POPSALI PIPX-REGULOVANÉ GENY NEZÁVISLE NA NTCA, PROVEDEME TRANSKRIPTOMICKOU ANALÝZU S KMENOVÝM PANELEM ZA RŮZNÝCH KULTURNÍCH PODMÍNEK, KTERÝ ZAHRNUJE RŮZNÉ TYPY DERIVÁTŮ PIPX GENU A DALŠÍCH SOUVISEJÍCÍCH GENŮ. ZÍSKANÉ ÚDAJE BUDOU POUŽITY K ZAŘAZENÍ DIFERENCIÁLNĚ REGULOVANÝCH GENŮ DO SKUPIN SE SPOLEČNÝMI REGULAČNÍMI NORMAMI A NÁSLEDNĚ K ŘEŠENÍ RŮZNÝCH PŘÍSLUŠNÝCH REGULAČNÍCH MECHANISMŮ. BUDEME ZKOUMAT PXR UNION STRÁNKY POMOCÍ CHIP-SEQ, INFORMACE, KTERÉ BUDEME INTEGROVAT S TÍM Z ANALÝZY TRANSCRIPTOMICA. PROZKOUMÁME MOŽNOU METILACION ARGININS V PIPX ALFA-HELICE1 A PŘÍPADNĚ PROZKOUMÁME FUNKČNÍ VÝZNAM A GENETICKÉ DETERMINANTY MODIFIKACÍ. ANALYZOVÁNY BUDOU JAK KANDIDÁTSKÉ METHYLÁZY, TAK JINÉ BÍLKOVINY NALEZENÉ V INTERAKCÍCH PROTEIN-PROTEIN A/NEBO IN SILIKO. ZÁMĚREM JE NEAKTIVOVAT ODPOVÍDAJÍCÍ GENY A PŘÍSLUŠNOU FENOTYPOVOU ANALÝZU. _x000D_ budeme také studovat MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DO PROCESS of chlorosis, dramatická adaptace na různé typy prostředí, ve kterém NBLR a NTCA-PIPX, vstoupit do jiných regulátorů, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation Physiobilisomas. MÁME ZÁJEM ROZLUŠTIT NĚKTERÉ REGULAČNÍ KOMPLEXNOSTI, JAKO JE MECHANISMUS AKTIVACE A FUNKCE NBLR A REGULAČNÍ INTERAKCE RŮZNÝCH ZPŮSOBŮ, KTERÉ SE SBLIŽUJÍ V PROMOTÉRU NBLA. MNOHO METODICKÝCH STRATEGIÍ NAVRŽENÝCH V SOUVISLOSTI S PIPX BUDE ROVNĚŽ POUŽITO SPOLU S NBLR. (Czech) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: SINIC PROVÁDÍ OXIGENICAN FOTOSYNTÉZU A KOLONIZUJE VĚTŠINU OSVĚTLENÝCH EKOSYSTÉMŮ, TAKŽE MAJÍ VELKÝ DOPAD NA GLOBÁLNÍ UHLÍKOVÉ A DUSÍKOVÉ CYKLY. NAVZDORY SVÉMU EKOLOGICKÉMU ÚSPĚCHU A BIOTECHNOLOGICKÉMU VÝZNAMU VŠAK MECHANISMY ODPOVĚDNÉ ZA TUTO VŠESTRANNOST A SCHOPNOST PŘIZPŮSOBIT SE ŽIVOTNÍMU PROSTŘEDÍ ZŮSTÁVAJÍ NEZNÁMÉ. V TÉTO SOUVISLOSTI SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY genetické MANIPUACE, je vynikajícím systémem pro STUDY REGULATING INTERACTIONS umožňující CIANOBACTERIAS INTEGRATED a RESPONDERLY MUYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Primárním návrhem tohoto projektu je charakterizovat multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING transkripční regulátory, Signalizační PROTEINS A metabolické enzimy v NETWORK COMPLETE a DINAMIC interations. POMOCÍ IN VIVO VYČISTĚNÝCH ZKOUŠEK S PROTEINEM FLAG-PIPX SE SNAŽÍME IDENTIFIKOVAT NOVÉ SLOŽKY SIGNALIZAČNÍCH DRAH, NA KTERÝCH SE PIPX PODÍLÍ, KROMĚ VALIDACE INTERAKCÍ A PŘEDCHOZÍCH VÝSLEDKŮ Z DVOJITÉ HYBRIDIZOVANÉ PIPX (XIP PROTEINY), TROJITÉ HYBRIDIZACE (PXR, IDENTIFIKOVANÉ POMOCÍ PII I PIPX JAKO NÁVNADY) NEBO IN SILIKO ANALÝZY (ORF2060). PRO PODROBNĚJŠÍ CHARAKTERIZACI INTERAKCÍ (MEZI PROTEINY A MOŽNÝMI ÚČINKY) BUDEME POUŽÍVAT IN VITRO A/NEBO DVOJITÉ (TROJNÁSOBNÉ) HYBRIDNÍ STUDIE S KOMPLETNÍMI PROTEINY, DERIVÁTY MUTANTŮ A/NEBO SPECIFICKÝMI DOMÉNAMI. UCHÝLÍME SE K POUŽITÍ KONFOKÁLNÍ MIKROSKOPIE K URČENÍ, ZDA NĚKTERÝ ZE STUDOVANÝCH PROTEINŮ SPOLULOKALIZUJE V POLÁRNÍCH REFLEKTORECH PIPX, JEJICHŽ DYNAMICKÁ POLOHA REAGUJE NA CYKLY TMAVÉHO SVĚTLA. ABYCHOM POPSALI PIPX-REGULOVANÉ GENY NEZÁVISLE NA NTCA, PROVEDEME TRANSKRIPTOMICKOU ANALÝZU S KMENOVÝM PANELEM ZA RŮZNÝCH KULTURNÍCH PODMÍNEK, KTERÝ ZAHRNUJE RŮZNÉ TYPY DERIVÁTŮ PIPX GENU A DALŠÍCH SOUVISEJÍCÍCH GENŮ. ZÍSKANÉ ÚDAJE BUDOU POUŽITY K ZAŘAZENÍ DIFERENCIÁLNĚ REGULOVANÝCH GENŮ DO SKUPIN SE SPOLEČNÝMI REGULAČNÍMI NORMAMI A NÁSLEDNĚ K ŘEŠENÍ RŮZNÝCH PŘÍSLUŠNÝCH REGULAČNÍCH MECHANISMŮ. BUDEME ZKOUMAT PXR UNION STRÁNKY POMOCÍ CHIP-SEQ, INFORMACE, KTERÉ BUDEME INTEGROVAT S TÍM Z ANALÝZY TRANSCRIPTOMICA. PROZKOUMÁME MOŽNOU METILACION ARGININS V PIPX ALFA-HELICE1 A PŘÍPADNĚ PROZKOUMÁME FUNKČNÍ VÝZNAM A GENETICKÉ DETERMINANTY MODIFIKACÍ. ANALYZOVÁNY BUDOU JAK KANDIDÁTSKÉ METHYLÁZY, TAK JINÉ BÍLKOVINY NALEZENÉ V INTERAKCÍCH PROTEIN-PROTEIN A/NEBO IN SILIKO. ZÁMĚREM JE NEAKTIVOVAT ODPOVÍDAJÍCÍ GENY A PŘÍSLUŠNOU FENOTYPOVOU ANALÝZU. _x000D_ budeme také studovat MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DO PROCESS of chlorosis, dramatická adaptace na různé typy prostředí, ve kterém NBLR a NTCA-PIPX, vstoupit do jiných regulátorů, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation Physiobilisomas. MÁME ZÁJEM ROZLUŠTIT NĚKTERÉ REGULAČNÍ KOMPLEXNOSTI, JAKO JE MECHANISMUS AKTIVACE A FUNKCE NBLR A REGULAČNÍ INTERAKCE RŮZNÝCH ZPŮSOBŮ, KTERÉ SE SBLIŽUJÍ V PROMOTÉRU NBLA. MNOHO METODICKÝCH STRATEGIÍ NAVRŽENÝCH V SOUVISLOSTI S PIPX BUDE ROVNĚŽ POUŽITO SPOLU S NBLR. (Czech) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
CIANBAKTĒRIJAS VEIC OXIGENICAN FOTOSINTĒZI UN KOLONIZĒ LIELĀKO DAĻU APGAISMOTO EKOSISTĒMU, TĀPĒC TĀM IR LIELA IETEKME UZ GLOBĀLAJIEM OGLEKĻA UN SLĀPEKĻA CIKLIEM. TOMĒR, NERAUGOTIES UZ EKOLOĢISKAJIEM PANĀKUMIEM UN BIOTEHNOLOĢISKO NOZĪMI, MEHĀNISMI, KAS IR ATBILDĪGI PAR ŠO DAUDZPUSĪBU UN SPĒJU PIELĀGOTIES VIDEI, JOPROJĀM NAV ZINĀMI. ŠAJĀ KONTEKSTĀ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, ATLAIDĪGI FACILITY ģenētiskā MANIPUĀCIJA, ir ekskluzīvs SISTĒMAS REGULĒŠANAS INTERACTIONS, kas ļauj CIANOBACTERIAS INTEGRATED UN RESPONDERLY MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Šī projekta primārais ierosinājums ir raksturot multifuncionālo PIPX PROTEIN, CIANOBACTERIAS SADARBINĀŠANAS transkripcijas regulatoru UN APSTIPRINĀŠANAS PROTEINĀJUMI UN vielmaiņas enzimas KOPĒJĀ UN DINAMIKAS interācijā. IZMANTOJOT IN VIVO KO-ATTĪRĪŠANAS IZMĒĢINĀJUMUS AR KARODZIŅU-PIPX PROTEĪNU, MŪSU MĒRĶIS IR IDENTIFICĒT JAUNUS SIGNĀLU CEĻU KOMPONENTUS, KUROS PIEDALĀS PIPX, PAPILDUS MIJIEDARBĪBAS UN IEPRIEKŠĒJO REZULTĀTU VALIDĒŠANAI NO DUBULTAS HIBRIDIZĒTAS PIPX (XIP PROTEĪNI), TRĪSKĀRŠAS HIBRIDIZĀCIJAS (PXR, KAS IDENTIFICĒTI, IZMANTOJOT GAN PII, GAN PIPX KĀ ĒSMU) VAI SILIKO ANALĪZĒ (ORF2060). LAI SĪKĀK RAKSTUROTU MIJIEDARBĪBU (STARP OLBALTUMVIELĀM UN IESPĒJAMIEM EFEKTIEM), MĒS IZMANTOSIM IN VITRO UN/VAI DUBULTUS (TRĪSKĀRŠUS) HIBRĪDA PĒTĪJUMUS AR PILNĪGIEM PROTEĪNIEM, MUTANTU ATVASINĀJUMIEM UN/VAI SPECIFISKĀM JOMĀM. MĒS IZMANTOSIM KONFOKĀLO MIKROSKOPIJU, LAI NOTEIKTU, VAI KĀDS NO PĒTĪTAJIEM PROTEĪNIEM LĪDZLOKALIZĒJAS PIPX POLĀRAJOS PROŽEKTOROS, KURU DINAMISKĀ ATRAŠANĀS VIETA REAĢĒ UZ TUMŠĀS GAISMAS CIKLIEM. LAI APRAKSTĪTU PIPX REGULĒTOS GĒNUS NEATKARĪGI NO NTCA, MĒS VEIKSIM TRANSKRIPTOMISKU ANALĪZI AR CELMA PANELI DAŽĀDOS KULTŪRAS APSTĀKĻOS, KAS IETVER DAŽĀDA VEIDA PIPX GĒNA ATVASINĀJUMUS UN CITUS SAISTĪTUS GĒNUS. IEGŪTOS DATUS IZMANTOS, LAI DIFERENCĒTI REGULĒTUS GĒNUS KLASIFICĒTU GRUPĀS AR KOPĪGIEM REGULATĪVIEM STANDARTIEM, LAI PĒC TAM PIEVĒRSTOS DAŽĀDIEM IESAISTĪTAJIEM REGULATĪVAJIEM MEHĀNISMIEM. MĒS IZMEKLĒSIM PXR UNION VIETNES, IZMANTOJOT MIKROSHĒMU-SEQ, INFORMĀCIJU, KO MĒS INTEGRĒSIM AR TO NO TRANSCRIPTOMICA ANALĪZES. MĒS IZPĒTĪSIM IESPĒJAMO ARGININS METILACION IN PIPX ALFA-HELICE1 UN, JA NEPIECIEŠAMS, PĒTĪSIM MODIFIKĀCIJU FUNKCIONĀLO NOZĪMI UN ĢENĒTISKOS FAKTORUS. TIKS ANALIZĒTA GAN POTENCIĀLĀ(-ĀS) METILĀZE(-S), GAN CITI PROTEĪNI, KAS ATRODAMI OLBALTUMVIELU OLBALTUMVIELĀS UN/VAI SILĪCIJA MIJIEDARBĪBĀ. NOLŪKS IR NEAKTĪVOS ATBILSTOŠOS GĒNUS UN ATTIECĪGO FENOTIPISKO ANALĪZI. _x000D_ mēs arī pētīsim MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES PROCESS of hloroze, dramatiska pielāgošanās dažāda veida videi, kurā NBLR un NTCA-PIPX, ievadiet citus regulatorus, Converge for the Promotor of the NBLA, esential For The Degratation of Physiobilisomas. MĒS ESAM IEINTERESĒTI ATŠIFRĒT DAŽUS REGULATĪVOS SAREŽĢĪJUMUS, PIEMĒRAM, NBLR AKTIVIZĒŠANAS UN DARBĪBAS MEHĀNISMU, KĀ ARĪ DAŽĀDU VEIDU REGULATĪVO MIJIEDARBĪBU, KAS APVIENOJAS NBLA VEICINĀTĀJĀ. DAUDZAS METODOLOĢISKĀS STRATĒĢIJAS, KAS IEROSINĀTAS SAISTĪBĀ AR PIPX, TIKS IZMANTOTAS ARĪ KOPĀ AR NBLR. (Latvian) | |||||||||||||||
| Property / summary: CIANBAKTĒRIJAS VEIC OXIGENICAN FOTOSINTĒZI UN KOLONIZĒ LIELĀKO DAĻU APGAISMOTO EKOSISTĒMU, TĀPĒC TĀM IR LIELA IETEKME UZ GLOBĀLAJIEM OGLEKĻA UN SLĀPEKĻA CIKLIEM. TOMĒR, NERAUGOTIES UZ EKOLOĢISKAJIEM PANĀKUMIEM UN BIOTEHNOLOĢISKO NOZĪMI, MEHĀNISMI, KAS IR ATBILDĪGI PAR ŠO DAUDZPUSĪBU UN SPĒJU PIELĀGOTIES VIDEI, JOPROJĀM NAV ZINĀMI. ŠAJĀ KONTEKSTĀ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, ATLAIDĪGI FACILITY ģenētiskā MANIPUĀCIJA, ir ekskluzīvs SISTĒMAS REGULĒŠANAS INTERACTIONS, kas ļauj CIANOBACTERIAS INTEGRATED UN RESPONDERLY MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Šī projekta primārais ierosinājums ir raksturot multifuncionālo PIPX PROTEIN, CIANOBACTERIAS SADARBINĀŠANAS transkripcijas regulatoru UN APSTIPRINĀŠANAS PROTEINĀJUMI UN vielmaiņas enzimas KOPĒJĀ UN DINAMIKAS interācijā. IZMANTOJOT IN VIVO KO-ATTĪRĪŠANAS IZMĒĢINĀJUMUS AR KARODZIŅU-PIPX PROTEĪNU, MŪSU MĒRĶIS IR IDENTIFICĒT JAUNUS SIGNĀLU CEĻU KOMPONENTUS, KUROS PIEDALĀS PIPX, PAPILDUS MIJIEDARBĪBAS UN IEPRIEKŠĒJO REZULTĀTU VALIDĒŠANAI NO DUBULTAS HIBRIDIZĒTAS PIPX (XIP PROTEĪNI), TRĪSKĀRŠAS HIBRIDIZĀCIJAS (PXR, KAS IDENTIFICĒTI, IZMANTOJOT GAN PII, GAN PIPX KĀ ĒSMU) VAI SILIKO ANALĪZĒ (ORF2060). LAI SĪKĀK RAKSTUROTU MIJIEDARBĪBU (STARP OLBALTUMVIELĀM UN IESPĒJAMIEM EFEKTIEM), MĒS IZMANTOSIM IN VITRO UN/VAI DUBULTUS (TRĪSKĀRŠUS) HIBRĪDA PĒTĪJUMUS AR PILNĪGIEM PROTEĪNIEM, MUTANTU ATVASINĀJUMIEM UN/VAI SPECIFISKĀM JOMĀM. MĒS IZMANTOSIM KONFOKĀLO MIKROSKOPIJU, LAI NOTEIKTU, VAI KĀDS NO PĒTĪTAJIEM PROTEĪNIEM LĪDZLOKALIZĒJAS PIPX POLĀRAJOS PROŽEKTOROS, KURU DINAMISKĀ ATRAŠANĀS VIETA REAĢĒ UZ TUMŠĀS GAISMAS CIKLIEM. LAI APRAKSTĪTU PIPX REGULĒTOS GĒNUS NEATKARĪGI NO NTCA, MĒS VEIKSIM TRANSKRIPTOMISKU ANALĪZI AR CELMA PANELI DAŽĀDOS KULTŪRAS APSTĀKĻOS, KAS IETVER DAŽĀDA VEIDA PIPX GĒNA ATVASINĀJUMUS UN CITUS SAISTĪTUS GĒNUS. IEGŪTOS DATUS IZMANTOS, LAI DIFERENCĒTI REGULĒTUS GĒNUS KLASIFICĒTU GRUPĀS AR KOPĪGIEM REGULATĪVIEM STANDARTIEM, LAI PĒC TAM PIEVĒRSTOS DAŽĀDIEM IESAISTĪTAJIEM REGULATĪVAJIEM MEHĀNISMIEM. MĒS IZMEKLĒSIM PXR UNION VIETNES, IZMANTOJOT MIKROSHĒMU-SEQ, INFORMĀCIJU, KO MĒS INTEGRĒSIM AR TO NO TRANSCRIPTOMICA ANALĪZES. MĒS IZPĒTĪSIM IESPĒJAMO ARGININS METILACION IN PIPX ALFA-HELICE1 UN, JA NEPIECIEŠAMS, PĒTĪSIM MODIFIKĀCIJU FUNKCIONĀLO NOZĪMI UN ĢENĒTISKOS FAKTORUS. TIKS ANALIZĒTA GAN POTENCIĀLĀ(-ĀS) METILĀZE(-S), GAN CITI PROTEĪNI, KAS ATRODAMI OLBALTUMVIELU OLBALTUMVIELĀS UN/VAI SILĪCIJA MIJIEDARBĪBĀ. NOLŪKS IR NEAKTĪVOS ATBILSTOŠOS GĒNUS UN ATTIECĪGO FENOTIPISKO ANALĪZI. _x000D_ mēs arī pētīsim MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES PROCESS of hloroze, dramatiska pielāgošanās dažāda veida videi, kurā NBLR un NTCA-PIPX, ievadiet citus regulatorus, Converge for the Promotor of the NBLA, esential For The Degratation of Physiobilisomas. MĒS ESAM IEINTERESĒTI ATŠIFRĒT DAŽUS REGULATĪVOS SAREŽĢĪJUMUS, PIEMĒRAM, NBLR AKTIVIZĒŠANAS UN DARBĪBAS MEHĀNISMU, KĀ ARĪ DAŽĀDU VEIDU REGULATĪVO MIJIEDARBĪBU, KAS APVIENOJAS NBLA VEICINĀTĀJĀ. DAUDZAS METODOLOĢISKĀS STRATĒĢIJAS, KAS IEROSINĀTAS SAISTĪBĀ AR PIPX, TIKS IZMANTOTAS ARĪ KOPĀ AR NBLR. (Latvian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: CIANBAKTĒRIJAS VEIC OXIGENICAN FOTOSINTĒZI UN KOLONIZĒ LIELĀKO DAĻU APGAISMOTO EKOSISTĒMU, TĀPĒC TĀM IR LIELA IETEKME UZ GLOBĀLAJIEM OGLEKĻA UN SLĀPEKĻA CIKLIEM. TOMĒR, NERAUGOTIES UZ EKOLOĢISKAJIEM PANĀKUMIEM UN BIOTEHNOLOĢISKO NOZĪMI, MEHĀNISMI, KAS IR ATBILDĪGI PAR ŠO DAUDZPUSĪBU UN SPĒJU PIELĀGOTIES VIDEI, JOPROJĀM NAV ZINĀMI. ŠAJĀ KONTEKSTĀ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, ATLAIDĪGI FACILITY ģenētiskā MANIPUĀCIJA, ir ekskluzīvs SISTĒMAS REGULĒŠANAS INTERACTIONS, kas ļauj CIANOBACTERIAS INTEGRATED UN RESPONDERLY MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Šī projekta primārais ierosinājums ir raksturot multifuncionālo PIPX PROTEIN, CIANOBACTERIAS SADARBINĀŠANAS transkripcijas regulatoru UN APSTIPRINĀŠANAS PROTEINĀJUMI UN vielmaiņas enzimas KOPĒJĀ UN DINAMIKAS interācijā. IZMANTOJOT IN VIVO KO-ATTĪRĪŠANAS IZMĒĢINĀJUMUS AR KARODZIŅU-PIPX PROTEĪNU, MŪSU MĒRĶIS IR IDENTIFICĒT JAUNUS SIGNĀLU CEĻU KOMPONENTUS, KUROS PIEDALĀS PIPX, PAPILDUS MIJIEDARBĪBAS UN IEPRIEKŠĒJO REZULTĀTU VALIDĒŠANAI NO DUBULTAS HIBRIDIZĒTAS PIPX (XIP PROTEĪNI), TRĪSKĀRŠAS HIBRIDIZĀCIJAS (PXR, KAS IDENTIFICĒTI, IZMANTOJOT GAN PII, GAN PIPX KĀ ĒSMU) VAI SILIKO ANALĪZĒ (ORF2060). LAI SĪKĀK RAKSTUROTU MIJIEDARBĪBU (STARP OLBALTUMVIELĀM UN IESPĒJAMIEM EFEKTIEM), MĒS IZMANTOSIM IN VITRO UN/VAI DUBULTUS (TRĪSKĀRŠUS) HIBRĪDA PĒTĪJUMUS AR PILNĪGIEM PROTEĪNIEM, MUTANTU ATVASINĀJUMIEM UN/VAI SPECIFISKĀM JOMĀM. MĒS IZMANTOSIM KONFOKĀLO MIKROSKOPIJU, LAI NOTEIKTU, VAI KĀDS NO PĒTĪTAJIEM PROTEĪNIEM LĪDZLOKALIZĒJAS PIPX POLĀRAJOS PROŽEKTOROS, KURU DINAMISKĀ ATRAŠANĀS VIETA REAĢĒ UZ TUMŠĀS GAISMAS CIKLIEM. LAI APRAKSTĪTU PIPX REGULĒTOS GĒNUS NEATKARĪGI NO NTCA, MĒS VEIKSIM TRANSKRIPTOMISKU ANALĪZI AR CELMA PANELI DAŽĀDOS KULTŪRAS APSTĀKĻOS, KAS IETVER DAŽĀDA VEIDA PIPX GĒNA ATVASINĀJUMUS UN CITUS SAISTĪTUS GĒNUS. IEGŪTOS DATUS IZMANTOS, LAI DIFERENCĒTI REGULĒTUS GĒNUS KLASIFICĒTU GRUPĀS AR KOPĪGIEM REGULATĪVIEM STANDARTIEM, LAI PĒC TAM PIEVĒRSTOS DAŽĀDIEM IESAISTĪTAJIEM REGULATĪVAJIEM MEHĀNISMIEM. MĒS IZMEKLĒSIM PXR UNION VIETNES, IZMANTOJOT MIKROSHĒMU-SEQ, INFORMĀCIJU, KO MĒS INTEGRĒSIM AR TO NO TRANSCRIPTOMICA ANALĪZES. MĒS IZPĒTĪSIM IESPĒJAMO ARGININS METILACION IN PIPX ALFA-HELICE1 UN, JA NEPIECIEŠAMS, PĒTĪSIM MODIFIKĀCIJU FUNKCIONĀLO NOZĪMI UN ĢENĒTISKOS FAKTORUS. TIKS ANALIZĒTA GAN POTENCIĀLĀ(-ĀS) METILĀZE(-S), GAN CITI PROTEĪNI, KAS ATRODAMI OLBALTUMVIELU OLBALTUMVIELĀS UN/VAI SILĪCIJA MIJIEDARBĪBĀ. NOLŪKS IR NEAKTĪVOS ATBILSTOŠOS GĒNUS UN ATTIECĪGO FENOTIPISKO ANALĪZI. _x000D_ mēs arī pētīsim MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES PROCESS of hloroze, dramatiska pielāgošanās dažāda veida videi, kurā NBLR un NTCA-PIPX, ievadiet citus regulatorus, Converge for the Promotor of the NBLA, esential For The Degratation of Physiobilisomas. MĒS ESAM IEINTERESĒTI ATŠIFRĒT DAŽUS REGULATĪVOS SAREŽĢĪJUMUS, PIEMĒRAM, NBLR AKTIVIZĒŠANAS UN DARBĪBAS MEHĀNISMU, KĀ ARĪ DAŽĀDU VEIDU REGULATĪVO MIJIEDARBĪBU, KAS APVIENOJAS NBLA VEICINĀTĀJĀ. DAUDZAS METODOLOĢISKĀS STRATĒĢIJAS, KAS IEROSINĀTAS SAISTĪBĀ AR PIPX, TIKS IZMANTOTAS ARĪ KOPĀ AR NBLR. (Latvian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
DÉANANN CYANOBACTERIA FÓTAISINTÉIS OXIGENICAN AGUS DÉANANN SÉ FORMHÓR NA N-ÉICEACHÓRAS SOILSITHE A CHOILÍNIÚ, IONAS GO MBEIDH TIONCHAR MÓR ACU AR THIMTHRIALLTA CARBÓIN AGUS NÍTRIGINE DOMHANDA. MAR SIN FÉIN, IN AINNEOIN GO BHFUIL RATH AIR Ó THAOBH NA HÉICEOLAÍOCHTA AGUS NA TÁBHACHTA BITEICNEOLAÍOCHTA DE, NÍ FIOS FÓS CÉ NA SÁSRAÍ ATÁ FREAGRACH AS AN SOLÚBTHACHT AGUS AS AN ACMHAINN SIN CHUN OIRIÚNÚ DON CHOMHSHAOL. SA CHOMHTHÉACS SEO, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, AN GINEARÁLTA GINEARÁLTA GINEARÁLTA, AN CÓRAS MAIDIR LE STIÚRTHÓIREACHT NA hÉIREANN LE hAGHAIDH RIALTAIS LE hAGHAIDH GINEARÁLTA NA hEORPA AGUS LEIS AN RÉIGIÚN A DHÉANAMH DYSTEMS._x000D_ Is é príomhthairiscint an tionscadail seo promhaidh Pipx Ilghonta a thréithriú, a FACTOR NA CIANOBACTERIAS CONCERNING rialtóirí tras-scríbhneoirí, signizing PROTEINS AGUS ENZIMAS meitibileach I NETWORK OF COMPLETE AND DINAMICIC interations. AG BAINT ÚSÁIDE AS TRIALACHA COMH-ÍONÚCHÁIN IN VIVO LEIS AN BPRÓITÉIN BRATACH-PIPX, TÁ SÉ MAR AIDHM AGAINN COMHPHÁIRTEANNA NUA DE NA CONAIRÍ COMHARTHAÍOCHTA INA NGLACANN PIPX PÁIRT A AITHINT, CHOMH MAITH LE HIDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ AGUS TORTHAÍ ROIMHE SEO Ó PIPX HIBRIDITHE DÚBAILTE (XIP PRÓITÉINÍ), HIBRIDIÚ TRIPLE (PXR, SAINAITHEANTA AG BAINT ÚSÁIDE AS PII AGUS PIPX ARAON MAR BHAOITE) NÓ IN ANAILÍS SILICO (ORF2060). CHUN IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ A THRÉITHRIÚ (IDIR PRÓITÉINÍ, AGUS LE HÉIFEACHTÓIRÍ FÉIDEARTHA) AR BHEALACH NÍOS MIONSONRAITHE, BAINFIMID ÚSÁID AS TRIALACHA HIBRIDEACHA IN VITRO AGUS/NÓ DÚBAILTE (TRÍLE) LE PRÓITÉINÍ IOMLÁNA, DÍORTHAIGH SHÓITEÁIN AGUS/NÓ RÉIMSÍ SONRACHA. DÉANFAIMID SAOIRE CHUN ÚSÁID A BHAINT AS MICREASCÓPACHT CONFOCAL CHUN A CHINNEADH AN BHFUIL AON CHEANN DE NA PRÓITÉINÍ A NDEARNADH STAIDÉAR ORTHU AG COMH-LOGÁNÚ I MBOLSCÁN PIPX, A BHFREAGRAÍONN A SUÍOMH DINIMICIÚIL DO THIMTHRIALLTA SOLAIS DORCHA. CHUN CUR SÍOS A DHÉANAMH AR GÉINTE PIPX-RIALAITHE NEAMHSPLEÁCH AR NTCA, DÉANFAIMID ANAILÍS TRAS-SCRÍBHINNE LE PAINÉAL BRÚ, FAOI CHOINNÍOLLACHA CULTÚIR ÉAGSÚLA, LENA N-ÁIRÍTEAR CINEÁLACHA ÉAGSÚLA DÍORTHAIGH DEN GHÉIN PIPX, AGUS GÉINTE GAOLMHARA EILE. ÚSÁIDFEAR NA SONRAÍ A GHINTEAR CHUN GÉINTE A RIALAÍTEAR GO DIFREÁLACH A AICMIÚ I NGRÚPAÍ A BHFUIL COMHCHAIGHDEÁIN RIALÁLA ACU, CHUN AGHAIDH A THABHAIRT ANSIN AR NA SÁSRAÍ RIALÁLA ÉAGSÚLA ATÁ I GCEIST. DÉANFAIMID IMSCRÚDÚ AR SHUÍOMHANNA PXR UNION AG BAINT ÚSÁIDE AS SLISEANNA-SEQ, FAISNÉIS A CHOMHTHÁTHÓIMID LEIS SIN ÓN ANAILÍS AR TRANSCRIPTOMICA. DÉANFAIMID IMSCRÚDÚ AR AN METILACION FÉIDEARTHA ARGININS I PIPX ALPHA-HELICE1 AGUS, NUAIR IS CUÍ, STAIDÉAR A DHÉANAMH AR AN BHRÍ FEIDHME AGUS DEITÉARMANAINT GHÉINITEACH NA MODHNUITHE. DÉANFAR ANAILÍS AR MHEITIOLÁIS(Í) IARRTHÓRA AGUS PRÓITÉINÍ EILE A FHAIGHTEAR I BPRÓITÉIN PRÓITÉINE AGUS/NÓ IN IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ SILICO. TÁ SÉ I GCEIST NA GÉINTE COMHFHREAGRACHA AGUS AN ANAILÍS FHEINITÍOPACH ÁBHARTHA A NEAMHGHNÍOMHÚ. cé gurbh iad Avondale rogha na coitianta tháinig buachaillí GCM le plean agus chuireadar I bhfeidhm é. TÁ SUIM AGAINN CUID DE NA CASTACHTAÍ RIALÁLA A BHAINT AMACH, AMHAIL SÁSRA GNÍOMHACHTAITHE AGUS FEIDHM NBLR AGUS IN IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ RIALÁLA NA MBEALAÍ ÉAGSÚLA A THAGANN LE CHÉILE I DTIONSCNÓIR AN NBLA. ÚSÁIDFEAR GO LEOR DE NA STRAITÉISÍ MODHEOLAÍOCHTA A MHOLTAR I NDÁIL LE PIPX LE NBLR FREISIN. (Irish) | |||||||||||||||
| Property / summary: DÉANANN CYANOBACTERIA FÓTAISINTÉIS OXIGENICAN AGUS DÉANANN SÉ FORMHÓR NA N-ÉICEACHÓRAS SOILSITHE A CHOILÍNIÚ, IONAS GO MBEIDH TIONCHAR MÓR ACU AR THIMTHRIALLTA CARBÓIN AGUS NÍTRIGINE DOMHANDA. MAR SIN FÉIN, IN AINNEOIN GO BHFUIL RATH AIR Ó THAOBH NA HÉICEOLAÍOCHTA AGUS NA TÁBHACHTA BITEICNEOLAÍOCHTA DE, NÍ FIOS FÓS CÉ NA SÁSRAÍ ATÁ FREAGRACH AS AN SOLÚBTHACHT AGUS AS AN ACMHAINN SIN CHUN OIRIÚNÚ DON CHOMHSHAOL. SA CHOMHTHÉACS SEO, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, AN GINEARÁLTA GINEARÁLTA GINEARÁLTA, AN CÓRAS MAIDIR LE STIÚRTHÓIREACHT NA hÉIREANN LE hAGHAIDH RIALTAIS LE hAGHAIDH GINEARÁLTA NA hEORPA AGUS LEIS AN RÉIGIÚN A DHÉANAMH DYSTEMS._x000D_ Is é príomhthairiscint an tionscadail seo promhaidh Pipx Ilghonta a thréithriú, a FACTOR NA CIANOBACTERIAS CONCERNING rialtóirí tras-scríbhneoirí, signizing PROTEINS AGUS ENZIMAS meitibileach I NETWORK OF COMPLETE AND DINAMICIC interations. AG BAINT ÚSÁIDE AS TRIALACHA COMH-ÍONÚCHÁIN IN VIVO LEIS AN BPRÓITÉIN BRATACH-PIPX, TÁ SÉ MAR AIDHM AGAINN COMHPHÁIRTEANNA NUA DE NA CONAIRÍ COMHARTHAÍOCHTA INA NGLACANN PIPX PÁIRT A AITHINT, CHOMH MAITH LE HIDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ AGUS TORTHAÍ ROIMHE SEO Ó PIPX HIBRIDITHE DÚBAILTE (XIP PRÓITÉINÍ), HIBRIDIÚ TRIPLE (PXR, SAINAITHEANTA AG BAINT ÚSÁIDE AS PII AGUS PIPX ARAON MAR BHAOITE) NÓ IN ANAILÍS SILICO (ORF2060). CHUN IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ A THRÉITHRIÚ (IDIR PRÓITÉINÍ, AGUS LE HÉIFEACHTÓIRÍ FÉIDEARTHA) AR BHEALACH NÍOS MIONSONRAITHE, BAINFIMID ÚSÁID AS TRIALACHA HIBRIDEACHA IN VITRO AGUS/NÓ DÚBAILTE (TRÍLE) LE PRÓITÉINÍ IOMLÁNA, DÍORTHAIGH SHÓITEÁIN AGUS/NÓ RÉIMSÍ SONRACHA. DÉANFAIMID SAOIRE CHUN ÚSÁID A BHAINT AS MICREASCÓPACHT CONFOCAL CHUN A CHINNEADH AN BHFUIL AON CHEANN DE NA PRÓITÉINÍ A NDEARNADH STAIDÉAR ORTHU AG COMH-LOGÁNÚ I MBOLSCÁN PIPX, A BHFREAGRAÍONN A SUÍOMH DINIMICIÚIL DO THIMTHRIALLTA SOLAIS DORCHA. CHUN CUR SÍOS A DHÉANAMH AR GÉINTE PIPX-RIALAITHE NEAMHSPLEÁCH AR NTCA, DÉANFAIMID ANAILÍS TRAS-SCRÍBHINNE LE PAINÉAL BRÚ, FAOI CHOINNÍOLLACHA CULTÚIR ÉAGSÚLA, LENA N-ÁIRÍTEAR CINEÁLACHA ÉAGSÚLA DÍORTHAIGH DEN GHÉIN PIPX, AGUS GÉINTE GAOLMHARA EILE. ÚSÁIDFEAR NA SONRAÍ A GHINTEAR CHUN GÉINTE A RIALAÍTEAR GO DIFREÁLACH A AICMIÚ I NGRÚPAÍ A BHFUIL COMHCHAIGHDEÁIN RIALÁLA ACU, CHUN AGHAIDH A THABHAIRT ANSIN AR NA SÁSRAÍ RIALÁLA ÉAGSÚLA ATÁ I GCEIST. DÉANFAIMID IMSCRÚDÚ AR SHUÍOMHANNA PXR UNION AG BAINT ÚSÁIDE AS SLISEANNA-SEQ, FAISNÉIS A CHOMHTHÁTHÓIMID LEIS SIN ÓN ANAILÍS AR TRANSCRIPTOMICA. DÉANFAIMID IMSCRÚDÚ AR AN METILACION FÉIDEARTHA ARGININS I PIPX ALPHA-HELICE1 AGUS, NUAIR IS CUÍ, STAIDÉAR A DHÉANAMH AR AN BHRÍ FEIDHME AGUS DEITÉARMANAINT GHÉINITEACH NA MODHNUITHE. DÉANFAR ANAILÍS AR MHEITIOLÁIS(Í) IARRTHÓRA AGUS PRÓITÉINÍ EILE A FHAIGHTEAR I BPRÓITÉIN PRÓITÉINE AGUS/NÓ IN IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ SILICO. TÁ SÉ I GCEIST NA GÉINTE COMHFHREAGRACHA AGUS AN ANAILÍS FHEINITÍOPACH ÁBHARTHA A NEAMHGHNÍOMHÚ. cé gurbh iad Avondale rogha na coitianta tháinig buachaillí GCM le plean agus chuireadar I bhfeidhm é. TÁ SUIM AGAINN CUID DE NA CASTACHTAÍ RIALÁLA A BHAINT AMACH, AMHAIL SÁSRA GNÍOMHACHTAITHE AGUS FEIDHM NBLR AGUS IN IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ RIALÁLA NA MBEALAÍ ÉAGSÚLA A THAGANN LE CHÉILE I DTIONSCNÓIR AN NBLA. ÚSÁIDFEAR GO LEOR DE NA STRAITÉISÍ MODHEOLAÍOCHTA A MHOLTAR I NDÁIL LE PIPX LE NBLR FREISIN. (Irish) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: DÉANANN CYANOBACTERIA FÓTAISINTÉIS OXIGENICAN AGUS DÉANANN SÉ FORMHÓR NA N-ÉICEACHÓRAS SOILSITHE A CHOILÍNIÚ, IONAS GO MBEIDH TIONCHAR MÓR ACU AR THIMTHRIALLTA CARBÓIN AGUS NÍTRIGINE DOMHANDA. MAR SIN FÉIN, IN AINNEOIN GO BHFUIL RATH AIR Ó THAOBH NA HÉICEOLAÍOCHTA AGUS NA TÁBHACHTA BITEICNEOLAÍOCHTA DE, NÍ FIOS FÓS CÉ NA SÁSRAÍ ATÁ FREAGRACH AS AN SOLÚBTHACHT AGUS AS AN ACMHAINN SIN CHUN OIRIÚNÚ DON CHOMHSHAOL. SA CHOMHTHÉACS SEO, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, AN GINEARÁLTA GINEARÁLTA GINEARÁLTA, AN CÓRAS MAIDIR LE STIÚRTHÓIREACHT NA hÉIREANN LE hAGHAIDH RIALTAIS LE hAGHAIDH GINEARÁLTA NA hEORPA AGUS LEIS AN RÉIGIÚN A DHÉANAMH DYSTEMS._x000D_ Is é príomhthairiscint an tionscadail seo promhaidh Pipx Ilghonta a thréithriú, a FACTOR NA CIANOBACTERIAS CONCERNING rialtóirí tras-scríbhneoirí, signizing PROTEINS AGUS ENZIMAS meitibileach I NETWORK OF COMPLETE AND DINAMICIC interations. AG BAINT ÚSÁIDE AS TRIALACHA COMH-ÍONÚCHÁIN IN VIVO LEIS AN BPRÓITÉIN BRATACH-PIPX, TÁ SÉ MAR AIDHM AGAINN COMHPHÁIRTEANNA NUA DE NA CONAIRÍ COMHARTHAÍOCHTA INA NGLACANN PIPX PÁIRT A AITHINT, CHOMH MAITH LE HIDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ AGUS TORTHAÍ ROIMHE SEO Ó PIPX HIBRIDITHE DÚBAILTE (XIP PRÓITÉINÍ), HIBRIDIÚ TRIPLE (PXR, SAINAITHEANTA AG BAINT ÚSÁIDE AS PII AGUS PIPX ARAON MAR BHAOITE) NÓ IN ANAILÍS SILICO (ORF2060). CHUN IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ A THRÉITHRIÚ (IDIR PRÓITÉINÍ, AGUS LE HÉIFEACHTÓIRÍ FÉIDEARTHA) AR BHEALACH NÍOS MIONSONRAITHE, BAINFIMID ÚSÁID AS TRIALACHA HIBRIDEACHA IN VITRO AGUS/NÓ DÚBAILTE (TRÍLE) LE PRÓITÉINÍ IOMLÁNA, DÍORTHAIGH SHÓITEÁIN AGUS/NÓ RÉIMSÍ SONRACHA. DÉANFAIMID SAOIRE CHUN ÚSÁID A BHAINT AS MICREASCÓPACHT CONFOCAL CHUN A CHINNEADH AN BHFUIL AON CHEANN DE NA PRÓITÉINÍ A NDEARNADH STAIDÉAR ORTHU AG COMH-LOGÁNÚ I MBOLSCÁN PIPX, A BHFREAGRAÍONN A SUÍOMH DINIMICIÚIL DO THIMTHRIALLTA SOLAIS DORCHA. CHUN CUR SÍOS A DHÉANAMH AR GÉINTE PIPX-RIALAITHE NEAMHSPLEÁCH AR NTCA, DÉANFAIMID ANAILÍS TRAS-SCRÍBHINNE LE PAINÉAL BRÚ, FAOI CHOINNÍOLLACHA CULTÚIR ÉAGSÚLA, LENA N-ÁIRÍTEAR CINEÁLACHA ÉAGSÚLA DÍORTHAIGH DEN GHÉIN PIPX, AGUS GÉINTE GAOLMHARA EILE. ÚSÁIDFEAR NA SONRAÍ A GHINTEAR CHUN GÉINTE A RIALAÍTEAR GO DIFREÁLACH A AICMIÚ I NGRÚPAÍ A BHFUIL COMHCHAIGHDEÁIN RIALÁLA ACU, CHUN AGHAIDH A THABHAIRT ANSIN AR NA SÁSRAÍ RIALÁLA ÉAGSÚLA ATÁ I GCEIST. DÉANFAIMID IMSCRÚDÚ AR SHUÍOMHANNA PXR UNION AG BAINT ÚSÁIDE AS SLISEANNA-SEQ, FAISNÉIS A CHOMHTHÁTHÓIMID LEIS SIN ÓN ANAILÍS AR TRANSCRIPTOMICA. DÉANFAIMID IMSCRÚDÚ AR AN METILACION FÉIDEARTHA ARGININS I PIPX ALPHA-HELICE1 AGUS, NUAIR IS CUÍ, STAIDÉAR A DHÉANAMH AR AN BHRÍ FEIDHME AGUS DEITÉARMANAINT GHÉINITEACH NA MODHNUITHE. DÉANFAR ANAILÍS AR MHEITIOLÁIS(Í) IARRTHÓRA AGUS PRÓITÉINÍ EILE A FHAIGHTEAR I BPRÓITÉIN PRÓITÉINE AGUS/NÓ IN IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ SILICO. TÁ SÉ I GCEIST NA GÉINTE COMHFHREAGRACHA AGUS AN ANAILÍS FHEINITÍOPACH ÁBHARTHA A NEAMHGHNÍOMHÚ. cé gurbh iad Avondale rogha na coitianta tháinig buachaillí GCM le plean agus chuireadar I bhfeidhm é. TÁ SUIM AGAINN CUID DE NA CASTACHTAÍ RIALÁLA A BHAINT AMACH, AMHAIL SÁSRA GNÍOMHACHTAITHE AGUS FEIDHM NBLR AGUS IN IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ RIALÁLA NA MBEALAÍ ÉAGSÚLA A THAGANN LE CHÉILE I DTIONSCNÓIR AN NBLA. ÚSÁIDFEAR GO LEOR DE NA STRAITÉISÍ MODHEOLAÍOCHTA A MHOLTAR I NDÁIL LE PIPX LE NBLR FREISIN. (Irish) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
CIANOBAKTERIJE OPRAVLJAJO FOTOSINTEZO OXIGENICAN IN KOLONIZIRAJO VEČINO OSVETLJENIH EKOSISTEMOV, TAKO DA IMAJO VELIK VPLIV NA GLOBALNE OGLJIKOVE IN DUŠIKOVE CIKLE. KLJUB EKOLOŠKEMU USPEHU IN BIOTEHNOLOŠKEMU POMENU PA MEHANIZMI, KI SO ODGOVORNI ZA TO VSESTRANSKOST IN SPOSOBNOST PRILAGAJANJA OKOLJU, OSTAJAJO NEZNANI. V ZVEZI S TEM, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVENO FACILITY genetsko MANIPUATION, je EXCELLENT SYSTEM ZA STUDY REGULATING INTERACTION, ki dovoljujejo CIANOBACTERIAS INTEGRATED IN RESPONDERALNO NA DIMENALNE ENVIRONMENTALNE DYSTEMS._x000D_ Glavni predlog tega projekta je, da se označi multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS KONCERNING transkripcijskih regulatorjev, Signalizirajoče PROTEINS IN presnovne enzime V NETWORKU ZAČETNIH IN DINAMIČNIH intermisij. Z UPORABO POSKUSOV KOČIŠČENJA IN VIVO Z BELJAKOVINO FLAG-PIPX ŽELIMO IDENTIFICIRATI NOVE KOMPONENTE SIGNALNIH POTI, V KATERIH SODELUJE PIPX, POLEG POTRJEVANJA INTERAKCIJ IN PREJŠNJIH REZULTATOV IZ DVOJNO HIBRIDIZIRANIH PIPX (XIP PROTEINOV), TROJNE HIBRIDIZACIJE (PXR, IDENTIFICIRANE Z UPORABO PII IN PIPX KOT VABE) ALI ANALIZE IN SILICIJA (ORF2060). ZA NATANČNEJŠO OPREDELITEV INTERAKCIJ (MED BELJAKOVINAMI IN MOŽNIMI EFEKTORJI) BOMO UPORABILI IN VITRO IN/ALI DVOJNO (TRIPLE) HIBRIDNA PRESKUŠANJA S POPOLNIMI BELJAKOVINAMI, MUTANTNIMI DERIVATI IN/ALI SPECIFIČNIMI PODROČJI. ZATEKLI BOMO K UPORABI KONFOKALNE MIKROSKOPIJE, DA UGOTOVIMO, ALI KATERI OD PREUČEVANIH BELJAKOVIN SOLOKALIZIRA V POLARNIH REFLEKTORJIH PIPX, KATERIH DINAMIČNA LOKACIJA SE ODZIVA NA TEMNE SVETLOBE. ZA OPIS PIPX-REGULIRANIH GENOV NEODVISNO OD NTCA BOMO IZVEDLI TRANSKRIPTOMSKO ANALIZO S SEVOM POD RAZLIČNIMI POGOJI KULTURE, KI VKLJUČUJE RAZLIČNE VRSTE DERIVATOV GENA PIPX IN DRUGIH SORODNIH GENOV. PRIDOBLJENI PODATKI SE BODO UPORABILI ZA RAZVRŠČANJE RAZLIČNO REGULIRANIH GENOV V SKUPINE S SKUPNIMI REGULATIVNIMI STANDARDI, DA BI SE OBRAVNAVALI RAZLIČNI REGULATIVNI MEHANIZMI. PREISKALI BOMO SPLETNA MESTA PXR UNION Z UPORABO ČIPOV, KI JIH BOMO POVEZALI S TISTIMI IZ ANALIZE TRANSCRIPTOMICA. RAZISKALI BOMO MOŽNO METILACION ARGININS V PIPX ALFA-HELICE1 IN PO POTREBI PREUČILI FUNKCIONALNI POMEN IN GENETSKE DETERMINANTE SPREMEMB. ANALIZIRALI BOMO KANDIDATNE METILAZE IN DRUGE BELJAKOVINE, KI JIH NAJDEMO V INTERAKCIJAH MED BELJAKOVINAMI IN/ALI SILICIJEM. NAMEN JE NEAKTIVIRATI USTREZNE GENE IN USTREZNO FENOTIPSKO ANALIZO. _x000D_ bomo preučili tudi MOLECULARNE DETAILVE V SEMINALISACIJI ZA PROCES kloroze, dramatično prilagoditev različnim vrstam okolja, v katerem NBLR in NTCA-PIPX vstopita v druge regulatorje, Konvergirajte za Promotor NBLA, Esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. ZANIMA NAS DEŠIFRIRANJE NEKATERIH REGULATIVNIH ZAPLETENOSTI, KOT SO MEHANIZEM AKTIVACIJE IN DELOVANJA NBLR TER REGULATIVNE INTERAKCIJE RAZLIČNIH NAČINOV, KI SE ZBLIŽUJEJO V PROMOTORJU NBLA. ŠTEVILNE METODOLOŠKE STRATEGIJE, PREDLAGANE V ZVEZI S PIPX, SE BODO UPORABLJALE TUDI Z NBLR. (Slovenian) | |||||||||||||||
| Property / summary: CIANOBAKTERIJE OPRAVLJAJO FOTOSINTEZO OXIGENICAN IN KOLONIZIRAJO VEČINO OSVETLJENIH EKOSISTEMOV, TAKO DA IMAJO VELIK VPLIV NA GLOBALNE OGLJIKOVE IN DUŠIKOVE CIKLE. KLJUB EKOLOŠKEMU USPEHU IN BIOTEHNOLOŠKEMU POMENU PA MEHANIZMI, KI SO ODGOVORNI ZA TO VSESTRANSKOST IN SPOSOBNOST PRILAGAJANJA OKOLJU, OSTAJAJO NEZNANI. V ZVEZI S TEM, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVENO FACILITY genetsko MANIPUATION, je EXCELLENT SYSTEM ZA STUDY REGULATING INTERACTION, ki dovoljujejo CIANOBACTERIAS INTEGRATED IN RESPONDERALNO NA DIMENALNE ENVIRONMENTALNE DYSTEMS._x000D_ Glavni predlog tega projekta je, da se označi multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS KONCERNING transkripcijskih regulatorjev, Signalizirajoče PROTEINS IN presnovne enzime V NETWORKU ZAČETNIH IN DINAMIČNIH intermisij. Z UPORABO POSKUSOV KOČIŠČENJA IN VIVO Z BELJAKOVINO FLAG-PIPX ŽELIMO IDENTIFICIRATI NOVE KOMPONENTE SIGNALNIH POTI, V KATERIH SODELUJE PIPX, POLEG POTRJEVANJA INTERAKCIJ IN PREJŠNJIH REZULTATOV IZ DVOJNO HIBRIDIZIRANIH PIPX (XIP PROTEINOV), TROJNE HIBRIDIZACIJE (PXR, IDENTIFICIRANE Z UPORABO PII IN PIPX KOT VABE) ALI ANALIZE IN SILICIJA (ORF2060). ZA NATANČNEJŠO OPREDELITEV INTERAKCIJ (MED BELJAKOVINAMI IN MOŽNIMI EFEKTORJI) BOMO UPORABILI IN VITRO IN/ALI DVOJNO (TRIPLE) HIBRIDNA PRESKUŠANJA S POPOLNIMI BELJAKOVINAMI, MUTANTNIMI DERIVATI IN/ALI SPECIFIČNIMI PODROČJI. ZATEKLI BOMO K UPORABI KONFOKALNE MIKROSKOPIJE, DA UGOTOVIMO, ALI KATERI OD PREUČEVANIH BELJAKOVIN SOLOKALIZIRA V POLARNIH REFLEKTORJIH PIPX, KATERIH DINAMIČNA LOKACIJA SE ODZIVA NA TEMNE SVETLOBE. ZA OPIS PIPX-REGULIRANIH GENOV NEODVISNO OD NTCA BOMO IZVEDLI TRANSKRIPTOMSKO ANALIZO S SEVOM POD RAZLIČNIMI POGOJI KULTURE, KI VKLJUČUJE RAZLIČNE VRSTE DERIVATOV GENA PIPX IN DRUGIH SORODNIH GENOV. PRIDOBLJENI PODATKI SE BODO UPORABILI ZA RAZVRŠČANJE RAZLIČNO REGULIRANIH GENOV V SKUPINE S SKUPNIMI REGULATIVNIMI STANDARDI, DA BI SE OBRAVNAVALI RAZLIČNI REGULATIVNI MEHANIZMI. PREISKALI BOMO SPLETNA MESTA PXR UNION Z UPORABO ČIPOV, KI JIH BOMO POVEZALI S TISTIMI IZ ANALIZE TRANSCRIPTOMICA. RAZISKALI BOMO MOŽNO METILACION ARGININS V PIPX ALFA-HELICE1 IN PO POTREBI PREUČILI FUNKCIONALNI POMEN IN GENETSKE DETERMINANTE SPREMEMB. ANALIZIRALI BOMO KANDIDATNE METILAZE IN DRUGE BELJAKOVINE, KI JIH NAJDEMO V INTERAKCIJAH MED BELJAKOVINAMI IN/ALI SILICIJEM. NAMEN JE NEAKTIVIRATI USTREZNE GENE IN USTREZNO FENOTIPSKO ANALIZO. _x000D_ bomo preučili tudi MOLECULARNE DETAILVE V SEMINALISACIJI ZA PROCES kloroze, dramatično prilagoditev različnim vrstam okolja, v katerem NBLR in NTCA-PIPX vstopita v druge regulatorje, Konvergirajte za Promotor NBLA, Esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. ZANIMA NAS DEŠIFRIRANJE NEKATERIH REGULATIVNIH ZAPLETENOSTI, KOT SO MEHANIZEM AKTIVACIJE IN DELOVANJA NBLR TER REGULATIVNE INTERAKCIJE RAZLIČNIH NAČINOV, KI SE ZBLIŽUJEJO V PROMOTORJU NBLA. ŠTEVILNE METODOLOŠKE STRATEGIJE, PREDLAGANE V ZVEZI S PIPX, SE BODO UPORABLJALE TUDI Z NBLR. (Slovenian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: CIANOBAKTERIJE OPRAVLJAJO FOTOSINTEZO OXIGENICAN IN KOLONIZIRAJO VEČINO OSVETLJENIH EKOSISTEMOV, TAKO DA IMAJO VELIK VPLIV NA GLOBALNE OGLJIKOVE IN DUŠIKOVE CIKLE. KLJUB EKOLOŠKEMU USPEHU IN BIOTEHNOLOŠKEMU POMENU PA MEHANIZMI, KI SO ODGOVORNI ZA TO VSESTRANSKOST IN SPOSOBNOST PRILAGAJANJA OKOLJU, OSTAJAJO NEZNANI. V ZVEZI S TEM, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVENO FACILITY genetsko MANIPUATION, je EXCELLENT SYSTEM ZA STUDY REGULATING INTERACTION, ki dovoljujejo CIANOBACTERIAS INTEGRATED IN RESPONDERALNO NA DIMENALNE ENVIRONMENTALNE DYSTEMS._x000D_ Glavni predlog tega projekta je, da se označi multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS KONCERNING transkripcijskih regulatorjev, Signalizirajoče PROTEINS IN presnovne enzime V NETWORKU ZAČETNIH IN DINAMIČNIH intermisij. Z UPORABO POSKUSOV KOČIŠČENJA IN VIVO Z BELJAKOVINO FLAG-PIPX ŽELIMO IDENTIFICIRATI NOVE KOMPONENTE SIGNALNIH POTI, V KATERIH SODELUJE PIPX, POLEG POTRJEVANJA INTERAKCIJ IN PREJŠNJIH REZULTATOV IZ DVOJNO HIBRIDIZIRANIH PIPX (XIP PROTEINOV), TROJNE HIBRIDIZACIJE (PXR, IDENTIFICIRANE Z UPORABO PII IN PIPX KOT VABE) ALI ANALIZE IN SILICIJA (ORF2060). ZA NATANČNEJŠO OPREDELITEV INTERAKCIJ (MED BELJAKOVINAMI IN MOŽNIMI EFEKTORJI) BOMO UPORABILI IN VITRO IN/ALI DVOJNO (TRIPLE) HIBRIDNA PRESKUŠANJA S POPOLNIMI BELJAKOVINAMI, MUTANTNIMI DERIVATI IN/ALI SPECIFIČNIMI PODROČJI. ZATEKLI BOMO K UPORABI KONFOKALNE MIKROSKOPIJE, DA UGOTOVIMO, ALI KATERI OD PREUČEVANIH BELJAKOVIN SOLOKALIZIRA V POLARNIH REFLEKTORJIH PIPX, KATERIH DINAMIČNA LOKACIJA SE ODZIVA NA TEMNE SVETLOBE. ZA OPIS PIPX-REGULIRANIH GENOV NEODVISNO OD NTCA BOMO IZVEDLI TRANSKRIPTOMSKO ANALIZO S SEVOM POD RAZLIČNIMI POGOJI KULTURE, KI VKLJUČUJE RAZLIČNE VRSTE DERIVATOV GENA PIPX IN DRUGIH SORODNIH GENOV. PRIDOBLJENI PODATKI SE BODO UPORABILI ZA RAZVRŠČANJE RAZLIČNO REGULIRANIH GENOV V SKUPINE S SKUPNIMI REGULATIVNIMI STANDARDI, DA BI SE OBRAVNAVALI RAZLIČNI REGULATIVNI MEHANIZMI. PREISKALI BOMO SPLETNA MESTA PXR UNION Z UPORABO ČIPOV, KI JIH BOMO POVEZALI S TISTIMI IZ ANALIZE TRANSCRIPTOMICA. RAZISKALI BOMO MOŽNO METILACION ARGININS V PIPX ALFA-HELICE1 IN PO POTREBI PREUČILI FUNKCIONALNI POMEN IN GENETSKE DETERMINANTE SPREMEMB. ANALIZIRALI BOMO KANDIDATNE METILAZE IN DRUGE BELJAKOVINE, KI JIH NAJDEMO V INTERAKCIJAH MED BELJAKOVINAMI IN/ALI SILICIJEM. NAMEN JE NEAKTIVIRATI USTREZNE GENE IN USTREZNO FENOTIPSKO ANALIZO. _x000D_ bomo preučili tudi MOLECULARNE DETAILVE V SEMINALISACIJI ZA PROCES kloroze, dramatično prilagoditev različnim vrstam okolja, v katerem NBLR in NTCA-PIPX vstopita v druge regulatorje, Konvergirajte za Promotor NBLA, Esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. ZANIMA NAS DEŠIFRIRANJE NEKATERIH REGULATIVNIH ZAPLETENOSTI, KOT SO MEHANIZEM AKTIVACIJE IN DELOVANJA NBLR TER REGULATIVNE INTERAKCIJE RAZLIČNIH NAČINOV, KI SE ZBLIŽUJEJO V PROMOTORJU NBLA. ŠTEVILNE METODOLOŠKE STRATEGIJE, PREDLAGANE V ZVEZI S PIPX, SE BODO UPORABLJALE TUDI Z NBLR. (Slovenian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
ЦИАНОБАКТЕРИИТЕ ИЗВЪРШВАТ ФОТОСИНТЕЗА OXIGENICAN И КОЛОНИЗИРАТ ПО-ГОЛЯМАТА ЧАСТ ОТ ОСВЕТЕНИТЕ ЕКОСИСТЕМИ, ТАКА ЧЕ ТЕ ОКАЗВАТ ГОЛЯМО ВЪЗДЕЙСТВИЕ ВЪРХУ ГЛОБАЛНИЯ ВЪГЛЕРОДЕН И АЗОТЕН ЦИКЪЛ. ВЪПРЕКИ СВОЯ ЕКОЛОГИЧЕН УСПЕХ И БИОТЕХНОЛОГИЧНО ЗНАЧЕНИЕ ОБАЧЕ МЕХАНИЗМИТЕ, ОТГОВОРНИ ЗА ТАЗИ ГЪВКАВОСТ И КАПАЦИТЕТ ЗА АДАПТИРАНЕ КЪМ ОКОЛНАТА СРЕДА, ОСТАВАТ НЕИЗВЕСТНИ. В ТОЗИ КОНТЕКСТ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, НА РЕЛАТИВНА ФАЦИЛНОСТ генетична МАНИПУАЦИЯ, Е ИЗКЛЮЧЕНА СИСТЕМА ЗА СЪТРУДНИЧЕСТВОТО НА РЕГЛАМЕНТ НА РЕГЛАМЕНТНОТО И РЕГЛАМЕНТНО РЕГЛАМЕНТНО РЕГЛАМЕНТНО ПРЕДСТАВЯНЕ НА РЕГЛАМЕНТНОТО ИЗПЪЛНЕНИЕ НА КОМПЪЛНИТЕЛНОТО ПРЕДСТАВЯНЕ НА ПРЕДСТАВЯНЕТО НА РЕГЛАМЕНТ НА РЕГЛАМЕНТ НА РЕГУЛНИТЕ ВЪЗДАЖЕНИЯТА НА РЕГЛАМЕНТНОТО ИЗПЪЛНИТЕЛЯНЕТО НА ТЕГЛИЧЕСКАТА И РЕЗОПЪЛНА ПРЕЖДАЖДАВАНЕ НА ИЗВЪНИТЕЛЯНЕТО НА РЕГЛАМЕНОТО ОБРАЗОВЕНОСТ._x000D_Главното предложение на този проект е да се характеризира мултифункционалният PIPX PROTEIN, орган на ООН за защита на транскрипционните регулатори, сигнализационните продукти и метаболитните енцими в мрежа от комплемента и динамики. ИЗПОЛЗВАЙКИ IN VIVO ИЗПИТВАНИЯ ЗА СЪВМЕСТНО ПРЕЧИСТВАНЕ С БЕЛТЪКА НА ФЛАГА-PIPX, НИЕ СЕ СТРЕМИМ ДА ИДЕНТИФИЦИРАМЕ НОВИ КОМПОНЕНТИ НА СИГНАЛНИТЕ ПЪТЕКИ, В КОИТО УЧАСТВА PIPX, В ДОПЪЛНЕНИЕ КЪМ ВАЛИДИРАНЕТО НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ И ПРЕДИШНИ РЕЗУЛТАТИ ОТ ДВОЙНО ХИБРИДИЗИРАНИ PIPX (XIP ПРОТЕИНИ), ТРОЙНА ХИБРИДИЗАЦИЯ (PXR, ИДЕНТИФИЦИРАНА ЧРЕЗ PII И PIPX КАТО ПРИМАМКА) ИЛИ IN SILICO АНАЛИЗ (ORF2060). ЗА ДА ХАРАКТЕРИЗИРАМЕ ПО-ПОДРОБНО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯТА (МЕЖДУ ПРОТЕИНИТЕ И С ВЪЗМОЖНИТЕ ЕФЕКТИОРИ), ЩЕ ИЗПОЛЗВАМЕ IN VITRO И/ИЛИ ДВОЙНИ (ТРОЙНИ) ХИБРИДНИ ИЗПИТВАНИЯ С ПЪЛНИ ПРОТЕИНИ, ПРОИЗВОДНИ НА МУТАНТИТЕ И/ИЛИ СПЕЦИФИЧНИ ОБЛАСТИ. ЩЕ ПРИБЕГНЕМ ДО ИЗПОЛЗВАНЕТО НА КОНФОКАЛНА МИКРОСКОПИЯ, ЗА ДА ОПРЕДЕЛИМ ДАЛИ НЯКОЙ ОТ ИЗСЛЕДВАНИТЕ ПРОТЕИНИ СЕ НАМИРА В ПОЛЯРНИТЕ ПРОЖЕКТОРИ НА PIPX, ЧИЕТО ДИНАМИЧНО МЕСТОПОЛОЖЕНИЕ ОТГОВАРЯ НА ЦИКЛИТЕ НА ТЪМНА СВЕТЛИНА. ЗА ДА ОПИШЕМ ГЕНИТЕ, РЕГУЛИРАНИ ОТ PIPX, НЕЗАВИСИМО ОТ NTCA, ЩЕ ИЗВЪРШИМ ТРАНСКРИПТОМИЧЕН АНАЛИЗ С ЩАМОВ ПАНЕЛ, ПРИ РАЗЛИЧНИ УСЛОВИЯ НА КУЛТУРАТА, КОЙТО ВКЛЮЧВА РАЗЛИЧНИ ВИДОВЕ ПРОИЗВОДНИ НА PIPX ГЕНА И ДРУГИ СВЪРЗАНИ ГЕНИ. ГЕНЕРИРАНИТЕ ДАННИ ЩЕ СЕ ИЗПОЛЗВАТ ЗА КЛАСИФИЦИРАНЕ НА ДИФЕРЕНЦИРАНО РЕГУЛИРАНИТЕ ГЕНИ В ГРУПИ С ОБЩИ РЕГУЛАТОРНИ СТАНДАРТИ, СЛЕД КОЕТО ЩЕ БЪДАТ РАЗГЛЕДАНИ РАЗЛИЧНИТЕ РЕГУЛАТОРНИ МЕХАНИЗМИ. ЩЕ ПРОУЧИМ САЙТОВЕТЕ НА PXR UNION С ПОМОЩТА НА ЧИП-SEQ, ИНФОРМАЦИЯ, КОЯТО ЩЕ ИНТЕГРИРАМЕ С ТАЗИ ОТ АНАЛИЗА НА TRANSCRIPTOMICA. ЩЕ ПРОУЧИМ ВЪЗМОЖНОТО МЕТИЛАЗИОН НА ARGININS В PIPX АЛФА-HELICE1 И, КЪДЕТО Е УМЕСТНО, ЩЕ ПРОУЧИМ ФУНКЦИОНАЛНИЯ СМИСЪЛ И ГЕНЕТИЧНИТЕ ДЕТЕРМИНАНТИ НА МОДИФИКАЦИИТЕ. ЩЕ БЪДАТ АНАЛИЗИРАНИ КАКТО КАНДИДАТ-МЕТИЛАЗА(И), ТАКА И ДРУГИ ПРОТЕИНИ, ОТКРИТИ ВЪВ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯТА ПРОТЕИН-ПРОТЕИН И/ИЛИ В СИЛИКО. ЦЕЛТА Е ДА СЕ НЕАКТИВНИ СЪОТВЕТНИТЕ ГЕНИ И СЪОТВЕТНИЯ ФЕНОТИПЕН АНАЛИЗ. _x000D_ също така ще проучим MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, А драматична адаптация към различни видове околна среда, в която NBLR и NTCA-PIPX влизат в други регулатори, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. ИНТЕРЕСУВАМЕ СЕ ОТ ДЕШИФРИРАНЕ НА НЯКОИ ОТ РЕГУЛАТОРНИТЕ УСЛОЖНЕНИЯ, КАТО НАПРИМЕР МЕХАНИЗМА ЗА АКТИВИРАНЕ И ФУНКЦИОНИРАНЕ НА NBLR И РЕГУЛАТОРНИТЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ НА РАЗЛИЧНИТЕ НАЧИНИ, КОИТО СЕ СБЛИЖАВАТ В ОРГАНИЗАТОРА НА NBLA. МНОГО ОТ МЕТОДОЛОГИЧНИТЕ СТРАТЕГИИ, ПРЕДЛОЖЕНИ ВЪВ ВРЪЗКА С PIPX, ЩЕ БЪДАТ ИЗПОЛЗВАНИ И С NBLR. (Bulgarian) | |||||||||||||||
| Property / summary: ЦИАНОБАКТЕРИИТЕ ИЗВЪРШВАТ ФОТОСИНТЕЗА OXIGENICAN И КОЛОНИЗИРАТ ПО-ГОЛЯМАТА ЧАСТ ОТ ОСВЕТЕНИТЕ ЕКОСИСТЕМИ, ТАКА ЧЕ ТЕ ОКАЗВАТ ГОЛЯМО ВЪЗДЕЙСТВИЕ ВЪРХУ ГЛОБАЛНИЯ ВЪГЛЕРОДЕН И АЗОТЕН ЦИКЪЛ. ВЪПРЕКИ СВОЯ ЕКОЛОГИЧЕН УСПЕХ И БИОТЕХНОЛОГИЧНО ЗНАЧЕНИЕ ОБАЧЕ МЕХАНИЗМИТЕ, ОТГОВОРНИ ЗА ТАЗИ ГЪВКАВОСТ И КАПАЦИТЕТ ЗА АДАПТИРАНЕ КЪМ ОКОЛНАТА СРЕДА, ОСТАВАТ НЕИЗВЕСТНИ. В ТОЗИ КОНТЕКСТ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, НА РЕЛАТИВНА ФАЦИЛНОСТ генетична МАНИПУАЦИЯ, Е ИЗКЛЮЧЕНА СИСТЕМА ЗА СЪТРУДНИЧЕСТВОТО НА РЕГЛАМЕНТ НА РЕГЛАМЕНТНОТО И РЕГЛАМЕНТНО РЕГЛАМЕНТНО РЕГЛАМЕНТНО ПРЕДСТАВЯНЕ НА РЕГЛАМЕНТНОТО ИЗПЪЛНЕНИЕ НА КОМПЪЛНИТЕЛНОТО ПРЕДСТАВЯНЕ НА ПРЕДСТАВЯНЕТО НА РЕГЛАМЕНТ НА РЕГЛАМЕНТ НА РЕГУЛНИТЕ ВЪЗДАЖЕНИЯТА НА РЕГЛАМЕНТНОТО ИЗПЪЛНИТЕЛЯНЕТО НА ТЕГЛИЧЕСКАТА И РЕЗОПЪЛНА ПРЕЖДАЖДАВАНЕ НА ИЗВЪНИТЕЛЯНЕТО НА РЕГЛАМЕНОТО ОБРАЗОВЕНОСТ._x000D_Главното предложение на този проект е да се характеризира мултифункционалният PIPX PROTEIN, орган на ООН за защита на транскрипционните регулатори, сигнализационните продукти и метаболитните енцими в мрежа от комплемента и динамики. ИЗПОЛЗВАЙКИ IN VIVO ИЗПИТВАНИЯ ЗА СЪВМЕСТНО ПРЕЧИСТВАНЕ С БЕЛТЪКА НА ФЛАГА-PIPX, НИЕ СЕ СТРЕМИМ ДА ИДЕНТИФИЦИРАМЕ НОВИ КОМПОНЕНТИ НА СИГНАЛНИТЕ ПЪТЕКИ, В КОИТО УЧАСТВА PIPX, В ДОПЪЛНЕНИЕ КЪМ ВАЛИДИРАНЕТО НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ И ПРЕДИШНИ РЕЗУЛТАТИ ОТ ДВОЙНО ХИБРИДИЗИРАНИ PIPX (XIP ПРОТЕИНИ), ТРОЙНА ХИБРИДИЗАЦИЯ (PXR, ИДЕНТИФИЦИРАНА ЧРЕЗ PII И PIPX КАТО ПРИМАМКА) ИЛИ IN SILICO АНАЛИЗ (ORF2060). ЗА ДА ХАРАКТЕРИЗИРАМЕ ПО-ПОДРОБНО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯТА (МЕЖДУ ПРОТЕИНИТЕ И С ВЪЗМОЖНИТЕ ЕФЕКТИОРИ), ЩЕ ИЗПОЛЗВАМЕ IN VITRO И/ИЛИ ДВОЙНИ (ТРОЙНИ) ХИБРИДНИ ИЗПИТВАНИЯ С ПЪЛНИ ПРОТЕИНИ, ПРОИЗВОДНИ НА МУТАНТИТЕ И/ИЛИ СПЕЦИФИЧНИ ОБЛАСТИ. ЩЕ ПРИБЕГНЕМ ДО ИЗПОЛЗВАНЕТО НА КОНФОКАЛНА МИКРОСКОПИЯ, ЗА ДА ОПРЕДЕЛИМ ДАЛИ НЯКОЙ ОТ ИЗСЛЕДВАНИТЕ ПРОТЕИНИ СЕ НАМИРА В ПОЛЯРНИТЕ ПРОЖЕКТОРИ НА PIPX, ЧИЕТО ДИНАМИЧНО МЕСТОПОЛОЖЕНИЕ ОТГОВАРЯ НА ЦИКЛИТЕ НА ТЪМНА СВЕТЛИНА. ЗА ДА ОПИШЕМ ГЕНИТЕ, РЕГУЛИРАНИ ОТ PIPX, НЕЗАВИСИМО ОТ NTCA, ЩЕ ИЗВЪРШИМ ТРАНСКРИПТОМИЧЕН АНАЛИЗ С ЩАМОВ ПАНЕЛ, ПРИ РАЗЛИЧНИ УСЛОВИЯ НА КУЛТУРАТА, КОЙТО ВКЛЮЧВА РАЗЛИЧНИ ВИДОВЕ ПРОИЗВОДНИ НА PIPX ГЕНА И ДРУГИ СВЪРЗАНИ ГЕНИ. ГЕНЕРИРАНИТЕ ДАННИ ЩЕ СЕ ИЗПОЛЗВАТ ЗА КЛАСИФИЦИРАНЕ НА ДИФЕРЕНЦИРАНО РЕГУЛИРАНИТЕ ГЕНИ В ГРУПИ С ОБЩИ РЕГУЛАТОРНИ СТАНДАРТИ, СЛЕД КОЕТО ЩЕ БЪДАТ РАЗГЛЕДАНИ РАЗЛИЧНИТЕ РЕГУЛАТОРНИ МЕХАНИЗМИ. ЩЕ ПРОУЧИМ САЙТОВЕТЕ НА PXR UNION С ПОМОЩТА НА ЧИП-SEQ, ИНФОРМАЦИЯ, КОЯТО ЩЕ ИНТЕГРИРАМЕ С ТАЗИ ОТ АНАЛИЗА НА TRANSCRIPTOMICA. ЩЕ ПРОУЧИМ ВЪЗМОЖНОТО МЕТИЛАЗИОН НА ARGININS В PIPX АЛФА-HELICE1 И, КЪДЕТО Е УМЕСТНО, ЩЕ ПРОУЧИМ ФУНКЦИОНАЛНИЯ СМИСЪЛ И ГЕНЕТИЧНИТЕ ДЕТЕРМИНАНТИ НА МОДИФИКАЦИИТЕ. ЩЕ БЪДАТ АНАЛИЗИРАНИ КАКТО КАНДИДАТ-МЕТИЛАЗА(И), ТАКА И ДРУГИ ПРОТЕИНИ, ОТКРИТИ ВЪВ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯТА ПРОТЕИН-ПРОТЕИН И/ИЛИ В СИЛИКО. ЦЕЛТА Е ДА СЕ НЕАКТИВНИ СЪОТВЕТНИТЕ ГЕНИ И СЪОТВЕТНИЯ ФЕНОТИПЕН АНАЛИЗ. _x000D_ също така ще проучим MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, А драматична адаптация към различни видове околна среда, в която NBLR и NTCA-PIPX влизат в други регулатори, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. ИНТЕРЕСУВАМЕ СЕ ОТ ДЕШИФРИРАНЕ НА НЯКОИ ОТ РЕГУЛАТОРНИТЕ УСЛОЖНЕНИЯ, КАТО НАПРИМЕР МЕХАНИЗМА ЗА АКТИВИРАНЕ И ФУНКЦИОНИРАНЕ НА NBLR И РЕГУЛАТОРНИТЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ НА РАЗЛИЧНИТЕ НАЧИНИ, КОИТО СЕ СБЛИЖАВАТ В ОРГАНИЗАТОРА НА NBLA. МНОГО ОТ МЕТОДОЛОГИЧНИТЕ СТРАТЕГИИ, ПРЕДЛОЖЕНИ ВЪВ ВРЪЗКА С PIPX, ЩЕ БЪДАТ ИЗПОЛЗВАНИ И С NBLR. (Bulgarian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: ЦИАНОБАКТЕРИИТЕ ИЗВЪРШВАТ ФОТОСИНТЕЗА OXIGENICAN И КОЛОНИЗИРАТ ПО-ГОЛЯМАТА ЧАСТ ОТ ОСВЕТЕНИТЕ ЕКОСИСТЕМИ, ТАКА ЧЕ ТЕ ОКАЗВАТ ГОЛЯМО ВЪЗДЕЙСТВИЕ ВЪРХУ ГЛОБАЛНИЯ ВЪГЛЕРОДЕН И АЗОТЕН ЦИКЪЛ. ВЪПРЕКИ СВОЯ ЕКОЛОГИЧЕН УСПЕХ И БИОТЕХНОЛОГИЧНО ЗНАЧЕНИЕ ОБАЧЕ МЕХАНИЗМИТЕ, ОТГОВОРНИ ЗА ТАЗИ ГЪВКАВОСТ И КАПАЦИТЕТ ЗА АДАПТИРАНЕ КЪМ ОКОЛНАТА СРЕДА, ОСТАВАТ НЕИЗВЕСТНИ. В ТОЗИ КОНТЕКСТ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, НА РЕЛАТИВНА ФАЦИЛНОСТ генетична МАНИПУАЦИЯ, Е ИЗКЛЮЧЕНА СИСТЕМА ЗА СЪТРУДНИЧЕСТВОТО НА РЕГЛАМЕНТ НА РЕГЛАМЕНТНОТО И РЕГЛАМЕНТНО РЕГЛАМЕНТНО РЕГЛАМЕНТНО ПРЕДСТАВЯНЕ НА РЕГЛАМЕНТНОТО ИЗПЪЛНЕНИЕ НА КОМПЪЛНИТЕЛНОТО ПРЕДСТАВЯНЕ НА ПРЕДСТАВЯНЕТО НА РЕГЛАМЕНТ НА РЕГЛАМЕНТ НА РЕГУЛНИТЕ ВЪЗДАЖЕНИЯТА НА РЕГЛАМЕНТНОТО ИЗПЪЛНИТЕЛЯНЕТО НА ТЕГЛИЧЕСКАТА И РЕЗОПЪЛНА ПРЕЖДАЖДАВАНЕ НА ИЗВЪНИТЕЛЯНЕТО НА РЕГЛАМЕНОТО ОБРАЗОВЕНОСТ._x000D_Главното предложение на този проект е да се характеризира мултифункционалният PIPX PROTEIN, орган на ООН за защита на транскрипционните регулатори, сигнализационните продукти и метаболитните енцими в мрежа от комплемента и динамики. ИЗПОЛЗВАЙКИ IN VIVO ИЗПИТВАНИЯ ЗА СЪВМЕСТНО ПРЕЧИСТВАНЕ С БЕЛТЪКА НА ФЛАГА-PIPX, НИЕ СЕ СТРЕМИМ ДА ИДЕНТИФИЦИРАМЕ НОВИ КОМПОНЕНТИ НА СИГНАЛНИТЕ ПЪТЕКИ, В КОИТО УЧАСТВА PIPX, В ДОПЪЛНЕНИЕ КЪМ ВАЛИДИРАНЕТО НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ И ПРЕДИШНИ РЕЗУЛТАТИ ОТ ДВОЙНО ХИБРИДИЗИРАНИ PIPX (XIP ПРОТЕИНИ), ТРОЙНА ХИБРИДИЗАЦИЯ (PXR, ИДЕНТИФИЦИРАНА ЧРЕЗ PII И PIPX КАТО ПРИМАМКА) ИЛИ IN SILICO АНАЛИЗ (ORF2060). ЗА ДА ХАРАКТЕРИЗИРАМЕ ПО-ПОДРОБНО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯТА (МЕЖДУ ПРОТЕИНИТЕ И С ВЪЗМОЖНИТЕ ЕФЕКТИОРИ), ЩЕ ИЗПОЛЗВАМЕ IN VITRO И/ИЛИ ДВОЙНИ (ТРОЙНИ) ХИБРИДНИ ИЗПИТВАНИЯ С ПЪЛНИ ПРОТЕИНИ, ПРОИЗВОДНИ НА МУТАНТИТЕ И/ИЛИ СПЕЦИФИЧНИ ОБЛАСТИ. ЩЕ ПРИБЕГНЕМ ДО ИЗПОЛЗВАНЕТО НА КОНФОКАЛНА МИКРОСКОПИЯ, ЗА ДА ОПРЕДЕЛИМ ДАЛИ НЯКОЙ ОТ ИЗСЛЕДВАНИТЕ ПРОТЕИНИ СЕ НАМИРА В ПОЛЯРНИТЕ ПРОЖЕКТОРИ НА PIPX, ЧИЕТО ДИНАМИЧНО МЕСТОПОЛОЖЕНИЕ ОТГОВАРЯ НА ЦИКЛИТЕ НА ТЪМНА СВЕТЛИНА. ЗА ДА ОПИШЕМ ГЕНИТЕ, РЕГУЛИРАНИ ОТ PIPX, НЕЗАВИСИМО ОТ NTCA, ЩЕ ИЗВЪРШИМ ТРАНСКРИПТОМИЧЕН АНАЛИЗ С ЩАМОВ ПАНЕЛ, ПРИ РАЗЛИЧНИ УСЛОВИЯ НА КУЛТУРАТА, КОЙТО ВКЛЮЧВА РАЗЛИЧНИ ВИДОВЕ ПРОИЗВОДНИ НА PIPX ГЕНА И ДРУГИ СВЪРЗАНИ ГЕНИ. ГЕНЕРИРАНИТЕ ДАННИ ЩЕ СЕ ИЗПОЛЗВАТ ЗА КЛАСИФИЦИРАНЕ НА ДИФЕРЕНЦИРАНО РЕГУЛИРАНИТЕ ГЕНИ В ГРУПИ С ОБЩИ РЕГУЛАТОРНИ СТАНДАРТИ, СЛЕД КОЕТО ЩЕ БЪДАТ РАЗГЛЕДАНИ РАЗЛИЧНИТЕ РЕГУЛАТОРНИ МЕХАНИЗМИ. ЩЕ ПРОУЧИМ САЙТОВЕТЕ НА PXR UNION С ПОМОЩТА НА ЧИП-SEQ, ИНФОРМАЦИЯ, КОЯТО ЩЕ ИНТЕГРИРАМЕ С ТАЗИ ОТ АНАЛИЗА НА TRANSCRIPTOMICA. ЩЕ ПРОУЧИМ ВЪЗМОЖНОТО МЕТИЛАЗИОН НА ARGININS В PIPX АЛФА-HELICE1 И, КЪДЕТО Е УМЕСТНО, ЩЕ ПРОУЧИМ ФУНКЦИОНАЛНИЯ СМИСЪЛ И ГЕНЕТИЧНИТЕ ДЕТЕРМИНАНТИ НА МОДИФИКАЦИИТЕ. ЩЕ БЪДАТ АНАЛИЗИРАНИ КАКТО КАНДИДАТ-МЕТИЛАЗА(И), ТАКА И ДРУГИ ПРОТЕИНИ, ОТКРИТИ ВЪВ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯТА ПРОТЕИН-ПРОТЕИН И/ИЛИ В СИЛИКО. ЦЕЛТА Е ДА СЕ НЕАКТИВНИ СЪОТВЕТНИТЕ ГЕНИ И СЪОТВЕТНИЯ ФЕНОТИПЕН АНАЛИЗ. _x000D_ също така ще проучим MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, А драматична адаптация към различни видове околна среда, в която NBLR и NTCA-PIPX влизат в други регулатори, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. ИНТЕРЕСУВАМЕ СЕ ОТ ДЕШИФРИРАНЕ НА НЯКОИ ОТ РЕГУЛАТОРНИТЕ УСЛОЖНЕНИЯ, КАТО НАПРИМЕР МЕХАНИЗМА ЗА АКТИВИРАНЕ И ФУНКЦИОНИРАНЕ НА NBLR И РЕГУЛАТОРНИТЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ НА РАЗЛИЧНИТЕ НАЧИНИ, КОИТО СЕ СБЛИЖАВАТ В ОРГАНИЗАТОРА НА NBLA. МНОГО ОТ МЕТОДОЛОГИЧНИТЕ СТРАТЕГИИ, ПРЕДЛОЖЕНИ ВЪВ ВРЪЗКА С PIPX, ЩЕ БЪДАТ ИЗПОЛЗВАНИ И С NBLR. (Bulgarian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
IĊ-ĊJANOBATTERJI JWETTQU FOTOSINTESI OXIGENICAN U JIKKOLONIZZAW IL-MAĠĠORANZA TAL-EKOSISTEMI ILLUMINATI, SABIEX IKOLLHOM IMPATT KBIR FUQ IĊ-ĊIKLI GLOBALI TAL-KARBONJU U TAN-NITROĠENU. MADANKOLLU, MINKEJJA S-SUĊĊESS EKOLOĠIKU U L-IMPORTANZA BIJOTEKNOLOĠIKA TAGĦHA, IL-MEKKANIŻMI RESPONSABBLI GĦAL DIN IL-VERSATILITÀ U L-KAPAĊITÀ GĦALL-ADATTAMENT AMBJENTALI GĦADHOM MHUX MAGĦRUFA. F’DAN IL-KUNTEST, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, TA ‘MANIPUAZZJONI ġenetika RELATIVELY FACILITY, hija SISTEMA ESĊELLENTI GĦALL-ISTUDJA TA’ L-INTERAZZJONIJIET REĠENTI LI Jippermettu L-INTEGRATED U RISPONDERLY TAĊ-ĊIABATTIVA U RISPONDERLY għad-DySTEMs VENRONMENTALI DYSTEMALI DYSTEMAL DYSTEMALI._x000D_ Il-propożizzjoni primarja ta ‘dan il-proġett hija li tikkaratterizza l-PROTEIN PIPX multifuncional, fattur UN TA’ CIANOBACTERIAS CONCERNING regulaturi traskrizzjonali, PROTEINI Sinjalizzanti U enzimi metaboliċi F’NETWORK TAL-interazzjonijiet KOMPETIĊI U DINAMIC. BL-UŻU TA’ PROVI TA’ KOPURIFIKAZZJONI IN VIVO BIL-PROTEINA BANDIERA-PIPX, AĦNA NIMMIRAW LI NIDENTIFIKAW KOMPONENTI ĠODDA TAL-MOGĦDIJIET TAS-SINJALAR LI FIHOM JIPPARTEĊIPA PIPX, MINBARRA L-VALIDAZZJONI TAL-INTERAZZJONIJIET U R-RIŻULTATI PREĊEDENTI MINN PIPX IBRIDIZZAT DOPPJU (PROTEINI XIP), IBRIDIZZAZZJONI TRIPLA (PXR, IDENTIFIKATA BL-UŻU KEMM TA’ PII KIF UKOLL TA’ PIPX BĦALA LIXKA) JEW FL-ANALIŻI SILICO (ORF2060). BIEX NIKKARATTERIZZAW L-INTERAZZJONIJIET (BEJN IL-PROTEINI, U B’EFFETTURI POSSIBBLI) F’AKTAR DETTALL, SE NUŻAW PROVI IBRIDI IN VITRO U/JEW DOPPJI (TRIPLI) BI PROTEINI KOMPLUTI, DERIVATTIVI MUTANTI U/JEW OQSMA SPEĊIFIĊI. AĦNA SE JIRRIKORRU GĦALL-UŻU TA ‘MIKROSKOPIJA KONFOKALI BIEX JIDDETERMINAW JEKK XI WIEĦED MILL-PROTEINI STUDJATI KO-LOKALIZZAZZJONI FIL-SPOTLIGHTS POLARI TA’ PIPX, LI L-POST DINAMIKU JIRRISPONDI GĦAL ĊIKLI TAD-DAWL DLAM. BIEX TIDDESKRIVI L-ĠENI RREGOLATI MINN PIPX INDIPENDENTEMENT MINN NTCA, AĦNA SE TWETTAQ ANALIŻI TRASKRISTOMIKA B’PANNELL TA ‘RAZZA, TAĦT KUNDIZZJONIJIET DIFFERENTI TA’ KULTURA, LI TINKLUDI DIVERSI TIPI TA ‘DERIVATTIVI TAL-ĠENE PIPX, U ĠENI RELATATI OĦRA. ID-DEJTA ĠĠENERATA SE TINTUŻA BIEX TIKKLASSIFIKA ĠENI RREGOLATI B’MOD DIFFERENZJALI FI GRUPPI BI STANDARDS REGOLATORJI KOMUNI, BIEX IMBAGĦAD JIĠU INDIRIZZATI L-MEKKANIŻMI REGOLATORJI DIFFERENTI INVOLUTI. AĦNA SE NINVESTIGAW IS-SITI TAL-UNJONI PXR BL-UŻU TA’ CHIP-SEQ, INFORMAZZJONI LI SE NINTEGRAW MA’ DIK MILL-ANALIŻI TA’ TRANSCRIPTOMICA. AĦNA SE TINVESTIGA L-METILACION POSSIBBLI TA ‘ARGININS FIL PIPX ALPHA-HELICE1 U, FEJN XIERAQ, JISTUDJAW IT-TIFSIRA FUNZJONALI U D-DETERMINANTI ĠENETIĊI TAL-MODIFIKI. KEMM METHYLASE(S) KANDIDAT(I) KIF UKOLL PROTEINI OĦRA LI JINSABU FIL-PROTEINA-PROTEINA U/JEW INTERAZZJONIJIET IN SILICO SE JIĠU ANALIZZATI. L-INTENZJONI HIJA LI JIĠU INATTIVI L-ĠENI KORRISPONDENTI U L-ANALIŻI FENOTIPIKA RILEVANTI. _x000D_ se nistudjaw ukoll id-DETTALJI MOLECULAR FIL-SEMINALISAZZJONI DWAR IL-PROĊESS TAL-klorożi, Adattament drammatiku għal tipi differenti ta’ ambjent, fejn NBLR u NTCA-PIPX, jidħlu Regolaturi oħra, Konverġenza għall-Promotur tal-NBLA, esenzjali għad-Degratazzjoni tal-Fiżjobilisomas. AĦNA INTERESSATI LI NIDDEĊIFRAW UĦUD MILL-KUMPLESSITAJIET REGOLATORJI, BĦALL-MEKKANIŻMU TA’ ATTIVAZZJONI U L-FUNZJONI TAL-NBLR U FL-INTERAZZJONIJIET REGOLATORJI TAL-MODI DIFFERENTI LI JIKKONVERĠU FIL-PROMOTUR TAL-NBLA. ĦAFNA MILL-ISTRATEĠIJI METODOLOĠIĊI PROPOSTI FIR-RIGWARD TAL-PIPX, SE JINTUŻAW UKOLL MAL-NBLR. (Maltese) | |||||||||||||||
| Property / summary: IĊ-ĊJANOBATTERJI JWETTQU FOTOSINTESI OXIGENICAN U JIKKOLONIZZAW IL-MAĠĠORANZA TAL-EKOSISTEMI ILLUMINATI, SABIEX IKOLLHOM IMPATT KBIR FUQ IĊ-ĊIKLI GLOBALI TAL-KARBONJU U TAN-NITROĠENU. MADANKOLLU, MINKEJJA S-SUĊĊESS EKOLOĠIKU U L-IMPORTANZA BIJOTEKNOLOĠIKA TAGĦHA, IL-MEKKANIŻMI RESPONSABBLI GĦAL DIN IL-VERSATILITÀ U L-KAPAĊITÀ GĦALL-ADATTAMENT AMBJENTALI GĦADHOM MHUX MAGĦRUFA. F’DAN IL-KUNTEST, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, TA ‘MANIPUAZZJONI ġenetika RELATIVELY FACILITY, hija SISTEMA ESĊELLENTI GĦALL-ISTUDJA TA’ L-INTERAZZJONIJIET REĠENTI LI Jippermettu L-INTEGRATED U RISPONDERLY TAĊ-ĊIABATTIVA U RISPONDERLY għad-DySTEMs VENRONMENTALI DYSTEMALI DYSTEMAL DYSTEMALI._x000D_ Il-propożizzjoni primarja ta ‘dan il-proġett hija li tikkaratterizza l-PROTEIN PIPX multifuncional, fattur UN TA’ CIANOBACTERIAS CONCERNING regulaturi traskrizzjonali, PROTEINI Sinjalizzanti U enzimi metaboliċi F’NETWORK TAL-interazzjonijiet KOMPETIĊI U DINAMIC. BL-UŻU TA’ PROVI TA’ KOPURIFIKAZZJONI IN VIVO BIL-PROTEINA BANDIERA-PIPX, AĦNA NIMMIRAW LI NIDENTIFIKAW KOMPONENTI ĠODDA TAL-MOGĦDIJIET TAS-SINJALAR LI FIHOM JIPPARTEĊIPA PIPX, MINBARRA L-VALIDAZZJONI TAL-INTERAZZJONIJIET U R-RIŻULTATI PREĊEDENTI MINN PIPX IBRIDIZZAT DOPPJU (PROTEINI XIP), IBRIDIZZAZZJONI TRIPLA (PXR, IDENTIFIKATA BL-UŻU KEMM TA’ PII KIF UKOLL TA’ PIPX BĦALA LIXKA) JEW FL-ANALIŻI SILICO (ORF2060). BIEX NIKKARATTERIZZAW L-INTERAZZJONIJIET (BEJN IL-PROTEINI, U B’EFFETTURI POSSIBBLI) F’AKTAR DETTALL, SE NUŻAW PROVI IBRIDI IN VITRO U/JEW DOPPJI (TRIPLI) BI PROTEINI KOMPLUTI, DERIVATTIVI MUTANTI U/JEW OQSMA SPEĊIFIĊI. AĦNA SE JIRRIKORRU GĦALL-UŻU TA ‘MIKROSKOPIJA KONFOKALI BIEX JIDDETERMINAW JEKK XI WIEĦED MILL-PROTEINI STUDJATI KO-LOKALIZZAZZJONI FIL-SPOTLIGHTS POLARI TA’ PIPX, LI L-POST DINAMIKU JIRRISPONDI GĦAL ĊIKLI TAD-DAWL DLAM. BIEX TIDDESKRIVI L-ĠENI RREGOLATI MINN PIPX INDIPENDENTEMENT MINN NTCA, AĦNA SE TWETTAQ ANALIŻI TRASKRISTOMIKA B’PANNELL TA ‘RAZZA, TAĦT KUNDIZZJONIJIET DIFFERENTI TA’ KULTURA, LI TINKLUDI DIVERSI TIPI TA ‘DERIVATTIVI TAL-ĠENE PIPX, U ĠENI RELATATI OĦRA. ID-DEJTA ĠĠENERATA SE TINTUŻA BIEX TIKKLASSIFIKA ĠENI RREGOLATI B’MOD DIFFERENZJALI FI GRUPPI BI STANDARDS REGOLATORJI KOMUNI, BIEX IMBAGĦAD JIĠU INDIRIZZATI L-MEKKANIŻMI REGOLATORJI DIFFERENTI INVOLUTI. AĦNA SE NINVESTIGAW IS-SITI TAL-UNJONI PXR BL-UŻU TA’ CHIP-SEQ, INFORMAZZJONI LI SE NINTEGRAW MA’ DIK MILL-ANALIŻI TA’ TRANSCRIPTOMICA. AĦNA SE TINVESTIGA L-METILACION POSSIBBLI TA ‘ARGININS FIL PIPX ALPHA-HELICE1 U, FEJN XIERAQ, JISTUDJAW IT-TIFSIRA FUNZJONALI U D-DETERMINANTI ĠENETIĊI TAL-MODIFIKI. KEMM METHYLASE(S) KANDIDAT(I) KIF UKOLL PROTEINI OĦRA LI JINSABU FIL-PROTEINA-PROTEINA U/JEW INTERAZZJONIJIET IN SILICO SE JIĠU ANALIZZATI. L-INTENZJONI HIJA LI JIĠU INATTIVI L-ĠENI KORRISPONDENTI U L-ANALIŻI FENOTIPIKA RILEVANTI. _x000D_ se nistudjaw ukoll id-DETTALJI MOLECULAR FIL-SEMINALISAZZJONI DWAR IL-PROĊESS TAL-klorożi, Adattament drammatiku għal tipi differenti ta’ ambjent, fejn NBLR u NTCA-PIPX, jidħlu Regolaturi oħra, Konverġenza għall-Promotur tal-NBLA, esenzjali għad-Degratazzjoni tal-Fiżjobilisomas. AĦNA INTERESSATI LI NIDDEĊIFRAW UĦUD MILL-KUMPLESSITAJIET REGOLATORJI, BĦALL-MEKKANIŻMU TA’ ATTIVAZZJONI U L-FUNZJONI TAL-NBLR U FL-INTERAZZJONIJIET REGOLATORJI TAL-MODI DIFFERENTI LI JIKKONVERĠU FIL-PROMOTUR TAL-NBLA. ĦAFNA MILL-ISTRATEĠIJI METODOLOĠIĊI PROPOSTI FIR-RIGWARD TAL-PIPX, SE JINTUŻAW UKOLL MAL-NBLR. (Maltese) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: IĊ-ĊJANOBATTERJI JWETTQU FOTOSINTESI OXIGENICAN U JIKKOLONIZZAW IL-MAĠĠORANZA TAL-EKOSISTEMI ILLUMINATI, SABIEX IKOLLHOM IMPATT KBIR FUQ IĊ-ĊIKLI GLOBALI TAL-KARBONJU U TAN-NITROĠENU. MADANKOLLU, MINKEJJA S-SUĊĊESS EKOLOĠIKU U L-IMPORTANZA BIJOTEKNOLOĠIKA TAGĦHA, IL-MEKKANIŻMI RESPONSABBLI GĦAL DIN IL-VERSATILITÀ U L-KAPAĊITÀ GĦALL-ADATTAMENT AMBJENTALI GĦADHOM MHUX MAGĦRUFA. F’DAN IL-KUNTEST, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, TA ‘MANIPUAZZJONI ġenetika RELATIVELY FACILITY, hija SISTEMA ESĊELLENTI GĦALL-ISTUDJA TA’ L-INTERAZZJONIJIET REĠENTI LI Jippermettu L-INTEGRATED U RISPONDERLY TAĊ-ĊIABATTIVA U RISPONDERLY għad-DySTEMs VENRONMENTALI DYSTEMALI DYSTEMAL DYSTEMALI._x000D_ Il-propożizzjoni primarja ta ‘dan il-proġett hija li tikkaratterizza l-PROTEIN PIPX multifuncional, fattur UN TA’ CIANOBACTERIAS CONCERNING regulaturi traskrizzjonali, PROTEINI Sinjalizzanti U enzimi metaboliċi F’NETWORK TAL-interazzjonijiet KOMPETIĊI U DINAMIC. BL-UŻU TA’ PROVI TA’ KOPURIFIKAZZJONI IN VIVO BIL-PROTEINA BANDIERA-PIPX, AĦNA NIMMIRAW LI NIDENTIFIKAW KOMPONENTI ĠODDA TAL-MOGĦDIJIET TAS-SINJALAR LI FIHOM JIPPARTEĊIPA PIPX, MINBARRA L-VALIDAZZJONI TAL-INTERAZZJONIJIET U R-RIŻULTATI PREĊEDENTI MINN PIPX IBRIDIZZAT DOPPJU (PROTEINI XIP), IBRIDIZZAZZJONI TRIPLA (PXR, IDENTIFIKATA BL-UŻU KEMM TA’ PII KIF UKOLL TA’ PIPX BĦALA LIXKA) JEW FL-ANALIŻI SILICO (ORF2060). BIEX NIKKARATTERIZZAW L-INTERAZZJONIJIET (BEJN IL-PROTEINI, U B’EFFETTURI POSSIBBLI) F’AKTAR DETTALL, SE NUŻAW PROVI IBRIDI IN VITRO U/JEW DOPPJI (TRIPLI) BI PROTEINI KOMPLUTI, DERIVATTIVI MUTANTI U/JEW OQSMA SPEĊIFIĊI. AĦNA SE JIRRIKORRU GĦALL-UŻU TA ‘MIKROSKOPIJA KONFOKALI BIEX JIDDETERMINAW JEKK XI WIEĦED MILL-PROTEINI STUDJATI KO-LOKALIZZAZZJONI FIL-SPOTLIGHTS POLARI TA’ PIPX, LI L-POST DINAMIKU JIRRISPONDI GĦAL ĊIKLI TAD-DAWL DLAM. BIEX TIDDESKRIVI L-ĠENI RREGOLATI MINN PIPX INDIPENDENTEMENT MINN NTCA, AĦNA SE TWETTAQ ANALIŻI TRASKRISTOMIKA B’PANNELL TA ‘RAZZA, TAĦT KUNDIZZJONIJIET DIFFERENTI TA’ KULTURA, LI TINKLUDI DIVERSI TIPI TA ‘DERIVATTIVI TAL-ĠENE PIPX, U ĠENI RELATATI OĦRA. ID-DEJTA ĠĠENERATA SE TINTUŻA BIEX TIKKLASSIFIKA ĠENI RREGOLATI B’MOD DIFFERENZJALI FI GRUPPI BI STANDARDS REGOLATORJI KOMUNI, BIEX IMBAGĦAD JIĠU INDIRIZZATI L-MEKKANIŻMI REGOLATORJI DIFFERENTI INVOLUTI. AĦNA SE NINVESTIGAW IS-SITI TAL-UNJONI PXR BL-UŻU TA’ CHIP-SEQ, INFORMAZZJONI LI SE NINTEGRAW MA’ DIK MILL-ANALIŻI TA’ TRANSCRIPTOMICA. AĦNA SE TINVESTIGA L-METILACION POSSIBBLI TA ‘ARGININS FIL PIPX ALPHA-HELICE1 U, FEJN XIERAQ, JISTUDJAW IT-TIFSIRA FUNZJONALI U D-DETERMINANTI ĠENETIĊI TAL-MODIFIKI. KEMM METHYLASE(S) KANDIDAT(I) KIF UKOLL PROTEINI OĦRA LI JINSABU FIL-PROTEINA-PROTEINA U/JEW INTERAZZJONIJIET IN SILICO SE JIĠU ANALIZZATI. L-INTENZJONI HIJA LI JIĠU INATTIVI L-ĠENI KORRISPONDENTI U L-ANALIŻI FENOTIPIKA RILEVANTI. _x000D_ se nistudjaw ukoll id-DETTALJI MOLECULAR FIL-SEMINALISAZZJONI DWAR IL-PROĊESS TAL-klorożi, Adattament drammatiku għal tipi differenti ta’ ambjent, fejn NBLR u NTCA-PIPX, jidħlu Regolaturi oħra, Konverġenza għall-Promotur tal-NBLA, esenzjali għad-Degratazzjoni tal-Fiżjobilisomas. AĦNA INTERESSATI LI NIDDEĊIFRAW UĦUD MILL-KUMPLESSITAJIET REGOLATORJI, BĦALL-MEKKANIŻMU TA’ ATTIVAZZJONI U L-FUNZJONI TAL-NBLR U FL-INTERAZZJONIJIET REGOLATORJI TAL-MODI DIFFERENTI LI JIKKONVERĠU FIL-PROMOTUR TAL-NBLA. ĦAFNA MILL-ISTRATEĠIJI METODOLOĠIĊI PROPOSTI FIR-RIGWARD TAL-PIPX, SE JINTUŻAW UKOLL MAL-NBLR. (Maltese) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
A Cianobactéria realiza a Fotossíntese Oxigenica e Coloniza a Maioria dos ECOSSISTEMAS ILUMINADOS, de modo que eles têm um grande impacto sobre o Carbono Global e os Ciclos de Azoto. No entanto, apesar do seu sucesso ecológico e da sua importância biotecnológica, os mecanismos responsáveis por esta variedade e a capacidade de adaptação ambiental permanecem desconhecidos. Neste contexto, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, DE MANIPUAÇÃO GENÉTICA RELATIVAMENTE FACILITÁRIA, É UM SISTEMA EXCELENTE PARA O ESTUDO DAS INTERACÇÕES REGULAMENTARES QUE PERMITEM A INTEGRAÇÃO DAS CIANOBACTERIAS E RESPONSABILIDADE AOS MUITOS SISTEMAS AMBIENTAIS DISTÉMICOS._x000D_ A proposta principal deste projecto é caracterizar a PROTEÍNA PIPX MULTIFUNCIONAL, FATOR UNO DAS CIANOBACTERIAS RELATIVAS A REGULAMENTADORES TRANSCRITÓNICOS, A SIGNIFICAR PROTEÍNAS E ENZIMAS METABÓLICAS NUMA REDE DE INTERAÇÕES COMPLETAS E DINÂMICAS. Utilizando os testes de co-purificação da VIVO com a proteína FLAG-PIPX, pretendemos identificar novos componentes dos percursos de sinalização em que a PIPX participa, para além das interacções de validação e dos resultados anteriores da dupla hibridação da PIPX (proteínas XIP), da tripla hibridação (PXR, identificando ambas as PII e PIPX como base) ou da análise SILICO (ORF2060). Para caracterizar as interacções (entre proteínas, e com possíveis efeitos) em maior detalhe, vamos usar em VITRO e / ou duplo (tríplice) testes híbridos com proteínas completas, derivados mutantes e / ou dominações específicas. Resolveremos a utilização da microscopia confocal para determinar se alguma das proteínas continha CO-LOCALIZAÇÕES nas esponjas polares de PIPX, cuja localização dinâmica corresponde a ciclos de luz escura. Para descrevê-los independentemente da NTCA, realizaremos uma análise transcriptomímica com um painel de estirpes, em diferentes condições de cultura, que incluem vários tipos de derivados do gene PIPX e outros genes relacionados. Os dados obtidos serão utilizados para classificar os génes reguláveis de forma diferente em grupos com normas de regulação comuns, abordando em seguida os diferentes mecanismos de regulação envolvidos. Iremos investigar os sítios da PXR UNION usando CHIP-SEQ, informação que iremos integrar com isso a partir da análise da Transcriptomia. Iremos investigar a possível metilação de argínicos em PIPX ALPHA-HELICE1 e, se for caso disso, estudar o significado funcional e os determinantes genéticos das modificações. O(s) METILASE(S) CANDIDATO(S) E OUTRAS PROTEÍNAS CONSTITUÍDAS EM PROTEÍNAS E/OU EM INTERACÇÕES SILICOS SERÃO ANÁLISEADOS. A INTENÇÃO É INCENTIVAR OS GÉNEROS CORRESPONDENTES E A ANÁLISE FENÓTIPICA RELEVANTE. _x000D_ também estudaremos DETALHES MOLECULARES NA SEMINALIZAÇÃO DO PROCESSO DE clorose, Uma adaptação dramática a diferentes tipos de ambiente, em que NBLR e NTCA-PIPX, entram noutros Reguladores, Convergem para o Promotor da NBLA, ESENTIAL PARA A DEGRAtação de Fisiobilisomas. Estamos interessados em determinar algumas das COMPLEXIDADES REGULAMENTARES, como o MECANISMO DE ATIVAÇÃO E FUNÇÃO DA NBLR e as INTERACÇÕES REGULAMENTARES das diferentes vias que convergem no promotor da NBLA. MUITAS DAS ESTRATÉGIAS METODOLOGICAS PROPOSTAS EM RELAÇÃO AO PIX, SERÃO TAMBÉM UTILIZADAS COM O NBLR. (Portuguese) | |||||||||||||||
| Property / summary: A Cianobactéria realiza a Fotossíntese Oxigenica e Coloniza a Maioria dos ECOSSISTEMAS ILUMINADOS, de modo que eles têm um grande impacto sobre o Carbono Global e os Ciclos de Azoto. No entanto, apesar do seu sucesso ecológico e da sua importância biotecnológica, os mecanismos responsáveis por esta variedade e a capacidade de adaptação ambiental permanecem desconhecidos. Neste contexto, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, DE MANIPUAÇÃO GENÉTICA RELATIVAMENTE FACILITÁRIA, É UM SISTEMA EXCELENTE PARA O ESTUDO DAS INTERACÇÕES REGULAMENTARES QUE PERMITEM A INTEGRAÇÃO DAS CIANOBACTERIAS E RESPONSABILIDADE AOS MUITOS SISTEMAS AMBIENTAIS DISTÉMICOS._x000D_ A proposta principal deste projecto é caracterizar a PROTEÍNA PIPX MULTIFUNCIONAL, FATOR UNO DAS CIANOBACTERIAS RELATIVAS A REGULAMENTADORES TRANSCRITÓNICOS, A SIGNIFICAR PROTEÍNAS E ENZIMAS METABÓLICAS NUMA REDE DE INTERAÇÕES COMPLETAS E DINÂMICAS. Utilizando os testes de co-purificação da VIVO com a proteína FLAG-PIPX, pretendemos identificar novos componentes dos percursos de sinalização em que a PIPX participa, para além das interacções de validação e dos resultados anteriores da dupla hibridação da PIPX (proteínas XIP), da tripla hibridação (PXR, identificando ambas as PII e PIPX como base) ou da análise SILICO (ORF2060). Para caracterizar as interacções (entre proteínas, e com possíveis efeitos) em maior detalhe, vamos usar em VITRO e / ou duplo (tríplice) testes híbridos com proteínas completas, derivados mutantes e / ou dominações específicas. Resolveremos a utilização da microscopia confocal para determinar se alguma das proteínas continha CO-LOCALIZAÇÕES nas esponjas polares de PIPX, cuja localização dinâmica corresponde a ciclos de luz escura. Para descrevê-los independentemente da NTCA, realizaremos uma análise transcriptomímica com um painel de estirpes, em diferentes condições de cultura, que incluem vários tipos de derivados do gene PIPX e outros genes relacionados. Os dados obtidos serão utilizados para classificar os génes reguláveis de forma diferente em grupos com normas de regulação comuns, abordando em seguida os diferentes mecanismos de regulação envolvidos. Iremos investigar os sítios da PXR UNION usando CHIP-SEQ, informação que iremos integrar com isso a partir da análise da Transcriptomia. Iremos investigar a possível metilação de argínicos em PIPX ALPHA-HELICE1 e, se for caso disso, estudar o significado funcional e os determinantes genéticos das modificações. O(s) METILASE(S) CANDIDATO(S) E OUTRAS PROTEÍNAS CONSTITUÍDAS EM PROTEÍNAS E/OU EM INTERACÇÕES SILICOS SERÃO ANÁLISEADOS. A INTENÇÃO É INCENTIVAR OS GÉNEROS CORRESPONDENTES E A ANÁLISE FENÓTIPICA RELEVANTE. _x000D_ também estudaremos DETALHES MOLECULARES NA SEMINALIZAÇÃO DO PROCESSO DE clorose, Uma adaptação dramática a diferentes tipos de ambiente, em que NBLR e NTCA-PIPX, entram noutros Reguladores, Convergem para o Promotor da NBLA, ESENTIAL PARA A DEGRAtação de Fisiobilisomas. Estamos interessados em determinar algumas das COMPLEXIDADES REGULAMENTARES, como o MECANISMO DE ATIVAÇÃO E FUNÇÃO DA NBLR e as INTERACÇÕES REGULAMENTARES das diferentes vias que convergem no promotor da NBLA. MUITAS DAS ESTRATÉGIAS METODOLOGICAS PROPOSTAS EM RELAÇÃO AO PIX, SERÃO TAMBÉM UTILIZADAS COM O NBLR. (Portuguese) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: A Cianobactéria realiza a Fotossíntese Oxigenica e Coloniza a Maioria dos ECOSSISTEMAS ILUMINADOS, de modo que eles têm um grande impacto sobre o Carbono Global e os Ciclos de Azoto. No entanto, apesar do seu sucesso ecológico e da sua importância biotecnológica, os mecanismos responsáveis por esta variedade e a capacidade de adaptação ambiental permanecem desconhecidos. Neste contexto, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, DE MANIPUAÇÃO GENÉTICA RELATIVAMENTE FACILITÁRIA, É UM SISTEMA EXCELENTE PARA O ESTUDO DAS INTERACÇÕES REGULAMENTARES QUE PERMITEM A INTEGRAÇÃO DAS CIANOBACTERIAS E RESPONSABILIDADE AOS MUITOS SISTEMAS AMBIENTAIS DISTÉMICOS._x000D_ A proposta principal deste projecto é caracterizar a PROTEÍNA PIPX MULTIFUNCIONAL, FATOR UNO DAS CIANOBACTERIAS RELATIVAS A REGULAMENTADORES TRANSCRITÓNICOS, A SIGNIFICAR PROTEÍNAS E ENZIMAS METABÓLICAS NUMA REDE DE INTERAÇÕES COMPLETAS E DINÂMICAS. Utilizando os testes de co-purificação da VIVO com a proteína FLAG-PIPX, pretendemos identificar novos componentes dos percursos de sinalização em que a PIPX participa, para além das interacções de validação e dos resultados anteriores da dupla hibridação da PIPX (proteínas XIP), da tripla hibridação (PXR, identificando ambas as PII e PIPX como base) ou da análise SILICO (ORF2060). Para caracterizar as interacções (entre proteínas, e com possíveis efeitos) em maior detalhe, vamos usar em VITRO e / ou duplo (tríplice) testes híbridos com proteínas completas, derivados mutantes e / ou dominações específicas. Resolveremos a utilização da microscopia confocal para determinar se alguma das proteínas continha CO-LOCALIZAÇÕES nas esponjas polares de PIPX, cuja localização dinâmica corresponde a ciclos de luz escura. Para descrevê-los independentemente da NTCA, realizaremos uma análise transcriptomímica com um painel de estirpes, em diferentes condições de cultura, que incluem vários tipos de derivados do gene PIPX e outros genes relacionados. Os dados obtidos serão utilizados para classificar os génes reguláveis de forma diferente em grupos com normas de regulação comuns, abordando em seguida os diferentes mecanismos de regulação envolvidos. Iremos investigar os sítios da PXR UNION usando CHIP-SEQ, informação que iremos integrar com isso a partir da análise da Transcriptomia. Iremos investigar a possível metilação de argínicos em PIPX ALPHA-HELICE1 e, se for caso disso, estudar o significado funcional e os determinantes genéticos das modificações. O(s) METILASE(S) CANDIDATO(S) E OUTRAS PROTEÍNAS CONSTITUÍDAS EM PROTEÍNAS E/OU EM INTERACÇÕES SILICOS SERÃO ANÁLISEADOS. A INTENÇÃO É INCENTIVAR OS GÉNEROS CORRESPONDENTES E A ANÁLISE FENÓTIPICA RELEVANTE. _x000D_ também estudaremos DETALHES MOLECULARES NA SEMINALIZAÇÃO DO PROCESSO DE clorose, Uma adaptação dramática a diferentes tipos de ambiente, em que NBLR e NTCA-PIPX, entram noutros Reguladores, Convergem para o Promotor da NBLA, ESENTIAL PARA A DEGRAtação de Fisiobilisomas. Estamos interessados em determinar algumas das COMPLEXIDADES REGULAMENTARES, como o MECANISMO DE ATIVAÇÃO E FUNÇÃO DA NBLR e as INTERACÇÕES REGULAMENTARES das diferentes vias que convergem no promotor da NBLA. MUITAS DAS ESTRATÉGIAS METODOLOGICAS PROPOSTAS EM RELAÇÃO AO PIX, SERÃO TAMBÉM UTILIZADAS COM O NBLR. (Portuguese) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
CYANOBAKTERIER UDFØRER OXIGENICAN FOTOSYNTESE OG KOLONISERER STØRSTEDELEN AF DE OPLYSTE ØKOSYSTEMER, SÅ DE HAR EN STOR INDVIRKNING PÅ GLOBALE KULSTOF- OG KVÆLSTOFKREDSLØB. PÅ TRODS AF DENS ØKOLOGISKE SUCCES OG BIOTEKNOLOGISKE BETYDNING ER DE MEKANISMER, DER ER ANSVARLIGE FOR DENNE ALSIDIGHED OG EVNE TIL MILJØTILPASNING, IMIDLERTID UKENDTE. I DEN FORBINDELSE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, AF RELATIVELY FACILITY genetisk MANIPUATION, er en EKSELLENT SYSTEM TIL STUDY af REGULATING INTERACTIONS tillader CIANOBACTERIAS INTEGRATED og RESPONDERLY TIL MUY DYRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Det primære forslag til dette projekt er at karakterisere den multifuncional PIPX PROTEIN, en UN FACTOR AF CIANOBACTERIAS KONCERNING transskriptionelle regulatorer, Signalizing PROTEINS OG metaboliske enzimas i en NETWORK af COMPLETE OG DINAMIC interations. VED HJÆLP AF IN VIVO-SAMRENSNINGSFORSØG MED FLAG-PIPX-PROTEINET SIGTER VI MOD AT IDENTIFICERE NYE KOMPONENTER I DE SIGNALVEJE, SOM PIPX DELTAGER I, UD OVER VALIDERING AF INTERAKTIONER OG TIDLIGERE RESULTATER FRA DOBBELT HYBRIDISEREDE PIPX (XIP-PROTEINER), TREDOBBELT HYBRIDISERING (PXR, IDENTIFICERET VED HJÆLP AF BÅDE PII OG PIPX SOM LOKKEMAD) ELLER I SILICOANALYSE (ORF2060). FOR AT KARAKTERISERE INTERAKTIONER (MELLEM PROTEINER, OG MED MULIGE EFFEKTORER) VIL VI BRUGE IN VITRO OG/ELLER DOBBELT (TREDOBBELT) HYBRID FORSØG MED KOMPLETTE PROTEINER, MUTANTDERIVATER OG/ELLER SPECIFIKKE DOMÆNER. VI VIL TY TIL BRUGEN AF KONFOKAL MIKROSKOPI TIL AT AFGØRE, OM NOGEN AF DE UNDERSØGTE PROTEINER CO-LOKALISERER I DE POLARE SPOTLIGHTS AF PIPX, HVIS DYNAMISKE PLACERING REAGERER PÅ MØRKE LYS CYKLUSSER. FOR AT BESKRIVE PIPX-REGULEREDE GENER UAFHÆNGIGT AF NTCA VIL VI UDFØRE TRANSSKRIPTOMISK ANALYSE MED ET STAMMEPANEL UNDER FORSKELLIGE DYRKNINGSFORHOLD, SOM OMFATTER FORSKELLIGE TYPER AF DERIVATER AF PIPX-GENET OG ANDRE RELATEREDE GENER. DE DATA, DER GENERERES, VIL BLIVE ANVENDT TIL AT KLASSIFICERE DIFFERENTIERET REGULEREDE GENER I GRUPPER MED FÆLLES REGULERINGSSTANDARDER FOR DEREFTER AT TAGE FAT PÅ DE FORSKELLIGE REGULERINGSMEKANISMER, DER ER INVOLVERET. VI VIL UNDERSØGE PXR UNION SITES VED HJÆLP AF CHIP-SEQ, OPLYSNINGER, SOM VI VIL INTEGRERE MED DEN FRA ANALYSEN AF TRANSCRIPTOMICA. VI VIL UNDERSØGE DEN MULIGE METILACION AF ARGININS I PIPX ALPHA-HELICE1 OG, HVOR DET ER RELEVANT, UNDERSØGE DEN FUNKTIONELLE BETYDNING OG GENETISKE DETERMINANTER FOR ÆNDRINGERNE. BÅDE KANDIDATMETHYLASE(R) OG ANDRE PROTEINER, DER FINDES I PROTEIN-PROTEIN OG/ELLER I SILICO INTERAKTIONER, VIL BLIVE ANALYSERET. HENSIGTEN ER AT INAKTIVE DE TILSVARENDE GENER OG RELEVANTE FÆNOTYPISKE ANALYSER. _x000D_ Vi vil også studere MOLECULAR DETAILS I SEMINALISATION ER PROCESSEN af chlorose, En dramatisk tilpasning til forskellige typer af miljø, hvor NBLR og NTCA-PIPX, indtaste andre regulatorer, Konverge for Promotor af NBLA, esential FOR DEN Tillykke af Physiobilisomas. VI ER INTERESSERET I AT DECHIFRERE NOGLE AF DE LOVGIVNINGSMÆSSIGE KOMPLEKSITETER, SÅSOM MEKANISMEN FOR AKTIVERING OG FUNKTION AF NBLR OG I DE REGULERINGSMÆSSIGE INTERAKTIONER AF DE FORSKELLIGE MÅDER, DER KONVERGERER I NBLA-PROMOTOREN. MANGE AF DE FORESLÅEDE METODOLOGISKE STRATEGIER I FORBINDELSE MED PIPX VIL OGSÅ BLIVE ANVENDT SAMMEN MED NBLR. (Danish) | |||||||||||||||
| Property / summary: CYANOBAKTERIER UDFØRER OXIGENICAN FOTOSYNTESE OG KOLONISERER STØRSTEDELEN AF DE OPLYSTE ØKOSYSTEMER, SÅ DE HAR EN STOR INDVIRKNING PÅ GLOBALE KULSTOF- OG KVÆLSTOFKREDSLØB. PÅ TRODS AF DENS ØKOLOGISKE SUCCES OG BIOTEKNOLOGISKE BETYDNING ER DE MEKANISMER, DER ER ANSVARLIGE FOR DENNE ALSIDIGHED OG EVNE TIL MILJØTILPASNING, IMIDLERTID UKENDTE. I DEN FORBINDELSE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, AF RELATIVELY FACILITY genetisk MANIPUATION, er en EKSELLENT SYSTEM TIL STUDY af REGULATING INTERACTIONS tillader CIANOBACTERIAS INTEGRATED og RESPONDERLY TIL MUY DYRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Det primære forslag til dette projekt er at karakterisere den multifuncional PIPX PROTEIN, en UN FACTOR AF CIANOBACTERIAS KONCERNING transskriptionelle regulatorer, Signalizing PROTEINS OG metaboliske enzimas i en NETWORK af COMPLETE OG DINAMIC interations. VED HJÆLP AF IN VIVO-SAMRENSNINGSFORSØG MED FLAG-PIPX-PROTEINET SIGTER VI MOD AT IDENTIFICERE NYE KOMPONENTER I DE SIGNALVEJE, SOM PIPX DELTAGER I, UD OVER VALIDERING AF INTERAKTIONER OG TIDLIGERE RESULTATER FRA DOBBELT HYBRIDISEREDE PIPX (XIP-PROTEINER), TREDOBBELT HYBRIDISERING (PXR, IDENTIFICERET VED HJÆLP AF BÅDE PII OG PIPX SOM LOKKEMAD) ELLER I SILICOANALYSE (ORF2060). FOR AT KARAKTERISERE INTERAKTIONER (MELLEM PROTEINER, OG MED MULIGE EFFEKTORER) VIL VI BRUGE IN VITRO OG/ELLER DOBBELT (TREDOBBELT) HYBRID FORSØG MED KOMPLETTE PROTEINER, MUTANTDERIVATER OG/ELLER SPECIFIKKE DOMÆNER. VI VIL TY TIL BRUGEN AF KONFOKAL MIKROSKOPI TIL AT AFGØRE, OM NOGEN AF DE UNDERSØGTE PROTEINER CO-LOKALISERER I DE POLARE SPOTLIGHTS AF PIPX, HVIS DYNAMISKE PLACERING REAGERER PÅ MØRKE LYS CYKLUSSER. FOR AT BESKRIVE PIPX-REGULEREDE GENER UAFHÆNGIGT AF NTCA VIL VI UDFØRE TRANSSKRIPTOMISK ANALYSE MED ET STAMMEPANEL UNDER FORSKELLIGE DYRKNINGSFORHOLD, SOM OMFATTER FORSKELLIGE TYPER AF DERIVATER AF PIPX-GENET OG ANDRE RELATEREDE GENER. DE DATA, DER GENERERES, VIL BLIVE ANVENDT TIL AT KLASSIFICERE DIFFERENTIERET REGULEREDE GENER I GRUPPER MED FÆLLES REGULERINGSSTANDARDER FOR DEREFTER AT TAGE FAT PÅ DE FORSKELLIGE REGULERINGSMEKANISMER, DER ER INVOLVERET. VI VIL UNDERSØGE PXR UNION SITES VED HJÆLP AF CHIP-SEQ, OPLYSNINGER, SOM VI VIL INTEGRERE MED DEN FRA ANALYSEN AF TRANSCRIPTOMICA. VI VIL UNDERSØGE DEN MULIGE METILACION AF ARGININS I PIPX ALPHA-HELICE1 OG, HVOR DET ER RELEVANT, UNDERSØGE DEN FUNKTIONELLE BETYDNING OG GENETISKE DETERMINANTER FOR ÆNDRINGERNE. BÅDE KANDIDATMETHYLASE(R) OG ANDRE PROTEINER, DER FINDES I PROTEIN-PROTEIN OG/ELLER I SILICO INTERAKTIONER, VIL BLIVE ANALYSERET. HENSIGTEN ER AT INAKTIVE DE TILSVARENDE GENER OG RELEVANTE FÆNOTYPISKE ANALYSER. _x000D_ Vi vil også studere MOLECULAR DETAILS I SEMINALISATION ER PROCESSEN af chlorose, En dramatisk tilpasning til forskellige typer af miljø, hvor NBLR og NTCA-PIPX, indtaste andre regulatorer, Konverge for Promotor af NBLA, esential FOR DEN Tillykke af Physiobilisomas. VI ER INTERESSERET I AT DECHIFRERE NOGLE AF DE LOVGIVNINGSMÆSSIGE KOMPLEKSITETER, SÅSOM MEKANISMEN FOR AKTIVERING OG FUNKTION AF NBLR OG I DE REGULERINGSMÆSSIGE INTERAKTIONER AF DE FORSKELLIGE MÅDER, DER KONVERGERER I NBLA-PROMOTOREN. MANGE AF DE FORESLÅEDE METODOLOGISKE STRATEGIER I FORBINDELSE MED PIPX VIL OGSÅ BLIVE ANVENDT SAMMEN MED NBLR. (Danish) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: CYANOBAKTERIER UDFØRER OXIGENICAN FOTOSYNTESE OG KOLONISERER STØRSTEDELEN AF DE OPLYSTE ØKOSYSTEMER, SÅ DE HAR EN STOR INDVIRKNING PÅ GLOBALE KULSTOF- OG KVÆLSTOFKREDSLØB. PÅ TRODS AF DENS ØKOLOGISKE SUCCES OG BIOTEKNOLOGISKE BETYDNING ER DE MEKANISMER, DER ER ANSVARLIGE FOR DENNE ALSIDIGHED OG EVNE TIL MILJØTILPASNING, IMIDLERTID UKENDTE. I DEN FORBINDELSE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, AF RELATIVELY FACILITY genetisk MANIPUATION, er en EKSELLENT SYSTEM TIL STUDY af REGULATING INTERACTIONS tillader CIANOBACTERIAS INTEGRATED og RESPONDERLY TIL MUY DYRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Det primære forslag til dette projekt er at karakterisere den multifuncional PIPX PROTEIN, en UN FACTOR AF CIANOBACTERIAS KONCERNING transskriptionelle regulatorer, Signalizing PROTEINS OG metaboliske enzimas i en NETWORK af COMPLETE OG DINAMIC interations. VED HJÆLP AF IN VIVO-SAMRENSNINGSFORSØG MED FLAG-PIPX-PROTEINET SIGTER VI MOD AT IDENTIFICERE NYE KOMPONENTER I DE SIGNALVEJE, SOM PIPX DELTAGER I, UD OVER VALIDERING AF INTERAKTIONER OG TIDLIGERE RESULTATER FRA DOBBELT HYBRIDISEREDE PIPX (XIP-PROTEINER), TREDOBBELT HYBRIDISERING (PXR, IDENTIFICERET VED HJÆLP AF BÅDE PII OG PIPX SOM LOKKEMAD) ELLER I SILICOANALYSE (ORF2060). FOR AT KARAKTERISERE INTERAKTIONER (MELLEM PROTEINER, OG MED MULIGE EFFEKTORER) VIL VI BRUGE IN VITRO OG/ELLER DOBBELT (TREDOBBELT) HYBRID FORSØG MED KOMPLETTE PROTEINER, MUTANTDERIVATER OG/ELLER SPECIFIKKE DOMÆNER. VI VIL TY TIL BRUGEN AF KONFOKAL MIKROSKOPI TIL AT AFGØRE, OM NOGEN AF DE UNDERSØGTE PROTEINER CO-LOKALISERER I DE POLARE SPOTLIGHTS AF PIPX, HVIS DYNAMISKE PLACERING REAGERER PÅ MØRKE LYS CYKLUSSER. FOR AT BESKRIVE PIPX-REGULEREDE GENER UAFHÆNGIGT AF NTCA VIL VI UDFØRE TRANSSKRIPTOMISK ANALYSE MED ET STAMMEPANEL UNDER FORSKELLIGE DYRKNINGSFORHOLD, SOM OMFATTER FORSKELLIGE TYPER AF DERIVATER AF PIPX-GENET OG ANDRE RELATEREDE GENER. DE DATA, DER GENERERES, VIL BLIVE ANVENDT TIL AT KLASSIFICERE DIFFERENTIERET REGULEREDE GENER I GRUPPER MED FÆLLES REGULERINGSSTANDARDER FOR DEREFTER AT TAGE FAT PÅ DE FORSKELLIGE REGULERINGSMEKANISMER, DER ER INVOLVERET. VI VIL UNDERSØGE PXR UNION SITES VED HJÆLP AF CHIP-SEQ, OPLYSNINGER, SOM VI VIL INTEGRERE MED DEN FRA ANALYSEN AF TRANSCRIPTOMICA. VI VIL UNDERSØGE DEN MULIGE METILACION AF ARGININS I PIPX ALPHA-HELICE1 OG, HVOR DET ER RELEVANT, UNDERSØGE DEN FUNKTIONELLE BETYDNING OG GENETISKE DETERMINANTER FOR ÆNDRINGERNE. BÅDE KANDIDATMETHYLASE(R) OG ANDRE PROTEINER, DER FINDES I PROTEIN-PROTEIN OG/ELLER I SILICO INTERAKTIONER, VIL BLIVE ANALYSERET. HENSIGTEN ER AT INAKTIVE DE TILSVARENDE GENER OG RELEVANTE FÆNOTYPISKE ANALYSER. _x000D_ Vi vil også studere MOLECULAR DETAILS I SEMINALISATION ER PROCESSEN af chlorose, En dramatisk tilpasning til forskellige typer af miljø, hvor NBLR og NTCA-PIPX, indtaste andre regulatorer, Konverge for Promotor af NBLA, esential FOR DEN Tillykke af Physiobilisomas. VI ER INTERESSERET I AT DECHIFRERE NOGLE AF DE LOVGIVNINGSMÆSSIGE KOMPLEKSITETER, SÅSOM MEKANISMEN FOR AKTIVERING OG FUNKTION AF NBLR OG I DE REGULERINGSMÆSSIGE INTERAKTIONER AF DE FORSKELLIGE MÅDER, DER KONVERGERER I NBLA-PROMOTOREN. MANGE AF DE FORESLÅEDE METODOLOGISKE STRATEGIER I FORBINDELSE MED PIPX VIL OGSÅ BLIVE ANVENDT SAMMEN MED NBLR. (Danish) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
CIANOBACTERIILE EFECTUEAZĂ FOTOSINTEZA OXIGENICAN ȘI COLONIZEAZĂ MAJORITATEA ECOSISTEMELOR ILUMINATE, ASTFEL ÎNCÂT ACESTEA AU UN IMPACT MARE ASUPRA CICLURILOR GLOBALE DE CARBON ȘI AZOT. CU TOATE ACESTEA, ÎN CIUDA SUCCESULUI ECOLOGIC ȘI A IMPORTANȚEI SALE BIOTEHNOLOGICE, MECANISMELE RESPONSABILE PENTRU ACEASTĂ VERSATILITATE ȘI CAPACITATEA DE ADAPTARE LA MEDIU RĂMÂN NECUNOSCUTE. ÎN ACEST CONTEXT, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY genetical MANIPUATION, este un sistem excelent pentru STUDIA INTERACȚIUNILOR REGULAMENTARE care permit CIANOBACTERIAS INTEGRAT ȘI RESPONDERAL DYSTEMS DYSTEMAL MEDRONMENTAL._x000D_ Propunerea principală a acestui proiect este de a caracteriza PROTEINUL PIPX multifuncțional, un FACTOR al CIANOBACTERIAS CONCERNING regulatori transcripționale, Semnalizarea PROTEINS ȘI enzime metabolice într-o NETWORK de interventii complete si DINAMIC. FOLOSIND TESTE DE CO-PURIFICARE IN VIVO CU PROTEINA FLAG-PIPX, NE PROPUNEM SĂ IDENTIFICĂM NOI COMPONENTE ALE CĂILOR DE SEMNALIZARE LA CARE PARTICIPĂ PIPX, PE LÂNGĂ VALIDAREA INTERACȚIUNILOR ȘI A REZULTATELOR ANTERIOARE DIN PIPX HIBRIDIZAT DUBLU (PROTEINE XIP), HIBRIDIZARE TRIPLĂ (PXR, IDENTIFICATĂ FOLOSIND ATÂT PII, CÂT ȘI PIPX CA MOMEALĂ) SAU ÎN ANALIZA SILICO (ORF2060). PENTRU A CARACTERIZA INTERACȚIUNILE (ÎNTRE PROTEINE ȘI CU POSIBILI EFECTORI) ÎN DETALIU, VOM UTILIZA STUDII HIBRIDE IN VITRO ȘI/SAU DUBLU (TRIPLU) CU PROTEINE COMPLETE, DERIVAȚI MUTANȚI ȘI/SAU DOMENII SPECIFICE. VOM RECURGE LA UTILIZAREA MICROSCOPIEI CONFOCALE PENTRU A DETERMINA DACĂ ORICARE DINTRE PROTEINELE STUDIATE CO-LOCALIZEAZĂ ÎN SPOTURILE POLARE ALE PIPX, A CĂRUI LOCAȚIE DINAMICĂ RĂSPUNDE LA CICLURILE DE LUMINĂ ÎNTUNECATĂ. PENTRU A DESCRIE GENELE REGLEMENTATE PIPX INDEPENDENT DE NTCA, VOM EFECTUA ANALIZE TRANSCRIPTOMIC CU UN PANOU DE TULPINĂ, ÎN DIFERITE CONDIȚII DE CULTURĂ, CARE INCLUDE DIFERITE TIPURI DE DERIVAȚI AI GENEI PIPX, ȘI ALTE GENE ÎNRUDITE. DATELE GENERATE VOR FI UTILIZATE PENTRU A CLASIFICA GENELE REGLEMENTATE DIFERENȚIAT ÎN GRUPURI CU STANDARDE DE REGLEMENTARE COMUNE, PENTRU A ABORDA APOI DIFERITELE MECANISME DE REGLEMENTARE IMPLICATE. VOM INVESTIGA SITURILE UNIUNII PXR FOLOSIND CHIP-SEQ, INFORMAȚII PE CARE LE VOM INTEGRA CU CELE DIN ANALIZA TRANSCRIPTOMICA. VOM INVESTIGA POSIBILA METIALIZIE A ARGININSLOR ÎN PIPX ALFA-HELICE1 ȘI, DUPĂ CAZ, VOM STUDIA SEMNIFICAȚIA FUNCȚIONALĂ ȘI FACTORII GENETICI DETERMINANȚI AI MODIFICĂRILOR. SE ANALIZEAZĂ ATÂT METILAZELE CANDIDATE, CÂT ȘI ALTE PROTEINE CARE SE GĂSESC ÎN INTERACȚIUNILE PROTEIN-PROTEINE ȘI/SAU SILICO. INTENȚIA ESTE DE A INACTIVA GENELE CORESPUNZĂTOARE ȘI ANALIZA FENOTIPICĂ RELEVANTĂ. _x000D_ vom studia, de asemenea, MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, O adaptare dramatică la diferite tipuri de mediu, în care NBLR și NTCA-PIPX, introduceți alte autorități de reglementare, Converge pentru Promotorul NBLA, esential pentru Degratation of Physiobilisomas. SUNTEM INTERESAȚI SĂ DESCIFRĂM O PARTE DIN COMPLEXITATEA REGLEMENTĂRII, CUM AR FI MECANISMUL DE ACTIVARE ȘI FUNCȚIONARE AL NBLR ȘI INTERACȚIUNILE DE REGLEMENTARE ALE DIFERITELOR MODURI CARE CONVERG ÎN PROMOTORUL NBLA. MULTE DINTRE STRATEGIILE METODOLOGICE PROPUSE ÎN LEGĂTURĂ CU PIPX VOR FI, DE ASEMENEA, UTILIZATE ÎMPREUNĂ CU NBLR. (Romanian) | |||||||||||||||
| Property / summary: CIANOBACTERIILE EFECTUEAZĂ FOTOSINTEZA OXIGENICAN ȘI COLONIZEAZĂ MAJORITATEA ECOSISTEMELOR ILUMINATE, ASTFEL ÎNCÂT ACESTEA AU UN IMPACT MARE ASUPRA CICLURILOR GLOBALE DE CARBON ȘI AZOT. CU TOATE ACESTEA, ÎN CIUDA SUCCESULUI ECOLOGIC ȘI A IMPORTANȚEI SALE BIOTEHNOLOGICE, MECANISMELE RESPONSABILE PENTRU ACEASTĂ VERSATILITATE ȘI CAPACITATEA DE ADAPTARE LA MEDIU RĂMÂN NECUNOSCUTE. ÎN ACEST CONTEXT, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY genetical MANIPUATION, este un sistem excelent pentru STUDIA INTERACȚIUNILOR REGULAMENTARE care permit CIANOBACTERIAS INTEGRAT ȘI RESPONDERAL DYSTEMS DYSTEMAL MEDRONMENTAL._x000D_ Propunerea principală a acestui proiect este de a caracteriza PROTEINUL PIPX multifuncțional, un FACTOR al CIANOBACTERIAS CONCERNING regulatori transcripționale, Semnalizarea PROTEINS ȘI enzime metabolice într-o NETWORK de interventii complete si DINAMIC. FOLOSIND TESTE DE CO-PURIFICARE IN VIVO CU PROTEINA FLAG-PIPX, NE PROPUNEM SĂ IDENTIFICĂM NOI COMPONENTE ALE CĂILOR DE SEMNALIZARE LA CARE PARTICIPĂ PIPX, PE LÂNGĂ VALIDAREA INTERACȚIUNILOR ȘI A REZULTATELOR ANTERIOARE DIN PIPX HIBRIDIZAT DUBLU (PROTEINE XIP), HIBRIDIZARE TRIPLĂ (PXR, IDENTIFICATĂ FOLOSIND ATÂT PII, CÂT ȘI PIPX CA MOMEALĂ) SAU ÎN ANALIZA SILICO (ORF2060). PENTRU A CARACTERIZA INTERACȚIUNILE (ÎNTRE PROTEINE ȘI CU POSIBILI EFECTORI) ÎN DETALIU, VOM UTILIZA STUDII HIBRIDE IN VITRO ȘI/SAU DUBLU (TRIPLU) CU PROTEINE COMPLETE, DERIVAȚI MUTANȚI ȘI/SAU DOMENII SPECIFICE. VOM RECURGE LA UTILIZAREA MICROSCOPIEI CONFOCALE PENTRU A DETERMINA DACĂ ORICARE DINTRE PROTEINELE STUDIATE CO-LOCALIZEAZĂ ÎN SPOTURILE POLARE ALE PIPX, A CĂRUI LOCAȚIE DINAMICĂ RĂSPUNDE LA CICLURILE DE LUMINĂ ÎNTUNECATĂ. PENTRU A DESCRIE GENELE REGLEMENTATE PIPX INDEPENDENT DE NTCA, VOM EFECTUA ANALIZE TRANSCRIPTOMIC CU UN PANOU DE TULPINĂ, ÎN DIFERITE CONDIȚII DE CULTURĂ, CARE INCLUDE DIFERITE TIPURI DE DERIVAȚI AI GENEI PIPX, ȘI ALTE GENE ÎNRUDITE. DATELE GENERATE VOR FI UTILIZATE PENTRU A CLASIFICA GENELE REGLEMENTATE DIFERENȚIAT ÎN GRUPURI CU STANDARDE DE REGLEMENTARE COMUNE, PENTRU A ABORDA APOI DIFERITELE MECANISME DE REGLEMENTARE IMPLICATE. VOM INVESTIGA SITURILE UNIUNII PXR FOLOSIND CHIP-SEQ, INFORMAȚII PE CARE LE VOM INTEGRA CU CELE DIN ANALIZA TRANSCRIPTOMICA. VOM INVESTIGA POSIBILA METIALIZIE A ARGININSLOR ÎN PIPX ALFA-HELICE1 ȘI, DUPĂ CAZ, VOM STUDIA SEMNIFICAȚIA FUNCȚIONALĂ ȘI FACTORII GENETICI DETERMINANȚI AI MODIFICĂRILOR. SE ANALIZEAZĂ ATÂT METILAZELE CANDIDATE, CÂT ȘI ALTE PROTEINE CARE SE GĂSESC ÎN INTERACȚIUNILE PROTEIN-PROTEINE ȘI/SAU SILICO. INTENȚIA ESTE DE A INACTIVA GENELE CORESPUNZĂTOARE ȘI ANALIZA FENOTIPICĂ RELEVANTĂ. _x000D_ vom studia, de asemenea, MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, O adaptare dramatică la diferite tipuri de mediu, în care NBLR și NTCA-PIPX, introduceți alte autorități de reglementare, Converge pentru Promotorul NBLA, esential pentru Degratation of Physiobilisomas. SUNTEM INTERESAȚI SĂ DESCIFRĂM O PARTE DIN COMPLEXITATEA REGLEMENTĂRII, CUM AR FI MECANISMUL DE ACTIVARE ȘI FUNCȚIONARE AL NBLR ȘI INTERACȚIUNILE DE REGLEMENTARE ALE DIFERITELOR MODURI CARE CONVERG ÎN PROMOTORUL NBLA. MULTE DINTRE STRATEGIILE METODOLOGICE PROPUSE ÎN LEGĂTURĂ CU PIPX VOR FI, DE ASEMENEA, UTILIZATE ÎMPREUNĂ CU NBLR. (Romanian) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: CIANOBACTERIILE EFECTUEAZĂ FOTOSINTEZA OXIGENICAN ȘI COLONIZEAZĂ MAJORITATEA ECOSISTEMELOR ILUMINATE, ASTFEL ÎNCÂT ACESTEA AU UN IMPACT MARE ASUPRA CICLURILOR GLOBALE DE CARBON ȘI AZOT. CU TOATE ACESTEA, ÎN CIUDA SUCCESULUI ECOLOGIC ȘI A IMPORTANȚEI SALE BIOTEHNOLOGICE, MECANISMELE RESPONSABILE PENTRU ACEASTĂ VERSATILITATE ȘI CAPACITATEA DE ADAPTARE LA MEDIU RĂMÂN NECUNOSCUTE. ÎN ACEST CONTEXT, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY genetical MANIPUATION, este un sistem excelent pentru STUDIA INTERACȚIUNILOR REGULAMENTARE care permit CIANOBACTERIAS INTEGRAT ȘI RESPONDERAL DYSTEMS DYSTEMAL MEDRONMENTAL._x000D_ Propunerea principală a acestui proiect este de a caracteriza PROTEINUL PIPX multifuncțional, un FACTOR al CIANOBACTERIAS CONCERNING regulatori transcripționale, Semnalizarea PROTEINS ȘI enzime metabolice într-o NETWORK de interventii complete si DINAMIC. FOLOSIND TESTE DE CO-PURIFICARE IN VIVO CU PROTEINA FLAG-PIPX, NE PROPUNEM SĂ IDENTIFICĂM NOI COMPONENTE ALE CĂILOR DE SEMNALIZARE LA CARE PARTICIPĂ PIPX, PE LÂNGĂ VALIDAREA INTERACȚIUNILOR ȘI A REZULTATELOR ANTERIOARE DIN PIPX HIBRIDIZAT DUBLU (PROTEINE XIP), HIBRIDIZARE TRIPLĂ (PXR, IDENTIFICATĂ FOLOSIND ATÂT PII, CÂT ȘI PIPX CA MOMEALĂ) SAU ÎN ANALIZA SILICO (ORF2060). PENTRU A CARACTERIZA INTERACȚIUNILE (ÎNTRE PROTEINE ȘI CU POSIBILI EFECTORI) ÎN DETALIU, VOM UTILIZA STUDII HIBRIDE IN VITRO ȘI/SAU DUBLU (TRIPLU) CU PROTEINE COMPLETE, DERIVAȚI MUTANȚI ȘI/SAU DOMENII SPECIFICE. VOM RECURGE LA UTILIZAREA MICROSCOPIEI CONFOCALE PENTRU A DETERMINA DACĂ ORICARE DINTRE PROTEINELE STUDIATE CO-LOCALIZEAZĂ ÎN SPOTURILE POLARE ALE PIPX, A CĂRUI LOCAȚIE DINAMICĂ RĂSPUNDE LA CICLURILE DE LUMINĂ ÎNTUNECATĂ. PENTRU A DESCRIE GENELE REGLEMENTATE PIPX INDEPENDENT DE NTCA, VOM EFECTUA ANALIZE TRANSCRIPTOMIC CU UN PANOU DE TULPINĂ, ÎN DIFERITE CONDIȚII DE CULTURĂ, CARE INCLUDE DIFERITE TIPURI DE DERIVAȚI AI GENEI PIPX, ȘI ALTE GENE ÎNRUDITE. DATELE GENERATE VOR FI UTILIZATE PENTRU A CLASIFICA GENELE REGLEMENTATE DIFERENȚIAT ÎN GRUPURI CU STANDARDE DE REGLEMENTARE COMUNE, PENTRU A ABORDA APOI DIFERITELE MECANISME DE REGLEMENTARE IMPLICATE. VOM INVESTIGA SITURILE UNIUNII PXR FOLOSIND CHIP-SEQ, INFORMAȚII PE CARE LE VOM INTEGRA CU CELE DIN ANALIZA TRANSCRIPTOMICA. VOM INVESTIGA POSIBILA METIALIZIE A ARGININSLOR ÎN PIPX ALFA-HELICE1 ȘI, DUPĂ CAZ, VOM STUDIA SEMNIFICAȚIA FUNCȚIONALĂ ȘI FACTORII GENETICI DETERMINANȚI AI MODIFICĂRILOR. SE ANALIZEAZĂ ATÂT METILAZELE CANDIDATE, CÂT ȘI ALTE PROTEINE CARE SE GĂSESC ÎN INTERACȚIUNILE PROTEIN-PROTEINE ȘI/SAU SILICO. INTENȚIA ESTE DE A INACTIVA GENELE CORESPUNZĂTOARE ȘI ANALIZA FENOTIPICĂ RELEVANTĂ. _x000D_ vom studia, de asemenea, MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, O adaptare dramatică la diferite tipuri de mediu, în care NBLR și NTCA-PIPX, introduceți alte autorități de reglementare, Converge pentru Promotorul NBLA, esential pentru Degratation of Physiobilisomas. SUNTEM INTERESAȚI SĂ DESCIFRĂM O PARTE DIN COMPLEXITATEA REGLEMENTĂRII, CUM AR FI MECANISMUL DE ACTIVARE ȘI FUNCȚIONARE AL NBLR ȘI INTERACȚIUNILE DE REGLEMENTARE ALE DIFERITELOR MODURI CARE CONVERG ÎN PROMOTORUL NBLA. MULTE DINTRE STRATEGIILE METODOLOGICE PROPUSE ÎN LEGĂTURĂ CU PIPX VOR FI, DE ASEMENEA, UTILIZATE ÎMPREUNĂ CU NBLR. (Romanian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / summary | |||||||||||||||
CYANOBAKTERIER UTFÖR OXIGENICAN FOTOSYNTES OCH KOLONISERA MAJORITETEN AV UPPLYSTA EKOSYSTEM, SÅ DE HAR EN STOR INVERKAN PÅ GLOBALA KOL- OCH KVÄVECYKLER. TROTS SIN EKOLOGISKA FRAMGÅNG OCH BIOTEKNISKA BETYDELSE ÄR DE MEKANISMER SOM LIGGER TILL GRUND FÖR DENNA MÅNGSIDIGHET OCH KAPACITET FÖR MILJÖANPASSNING FORTFARANDE OKÄNDA. I DETTA SAMMANHANG, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, AV RELATIVELY FACILITY genetisk MANIPUATION, ÄR en EXCELLENT SYSTEM FÖR STUDY of the REGULATING INTERACTIONS som tillåter CIANOBACTERIAS INTEGRATED OCH RESPONDERLY TILL MUYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Det primära förslaget i detta projekt är att karakterisera den multifuncional PIPX PROTEIN, en UN FACTOR OF CIANOBACTERIAS CONCERNING transkriptionella regulatorer, Signalizing PROTEINS OCH metabolical enzimas i en NÄTVERK AV COMPLETE OCH DINAMIC Interations. MED HJÄLP AV SAMRENINGSFÖRSÖK IN VIVO MED FLAGG-PIPX-PROTEINET STRÄVAR VI EFTER ATT IDENTIFIERA NYA KOMPONENTER I DE SIGNALVÄGAR SOM PIPX DELTAR I, FÖRUTOM ATT VALIDERA INTERAKTIONER OCH TIDIGARE RESULTAT FRÅN DUBBELHYBRIDISERAD PIPX (XIP-PROTEINER), TRIPPELHYBRIDISERING (PXR, IDENTIFIERAD MED BÅDE PII OCH PIPX SOM BETE) ELLER I SILICO-ANALYS (ORF2060). FÖR ATT BESKRIVA INTERAKTIONER (MELLAN PROTEINER, OCH MED MÖJLIGA EFFEKTORER) MER I DETALJ, KOMMER VI ATT ANVÄNDA IN VITRO OCH/ELLER DUBBLA (TRIPEL) HYBRIDFÖRSÖK MED KOMPLETTA PROTEINER, MUTANTDERIVAT OCH/ELLER SPECIFIKA DOMÄNER. VI KOMMER ATT ANVÄNDA KONFOKAL MIKROSKOPI FÖR ATT AVGÖRA OM NÅGOT AV DE STUDERADE PROTEINERNA SAMLOKALISERAS I POLÄRA SPOTLIGHTS I PIPX, VARS DYNAMISKA LÄGE SVARAR PÅ MÖRKA LJUSCYKLER. FÖR ATT BESKRIVA PIPX-REGLERADE GENER OBEROENDE AV NTCA, KOMMER VI ATT UTFÖRA TRANSKRIPTOMISK ANALYS MED EN STAMPANEL, UNDER OLIKA ODLINGSFÖRHÅLLANDEN, VILKET INKLUDERAR OLIKA TYPER AV DERIVAT AV PIPX-GENEN, OCH ANDRA RELATERADE GENER. DE DATA SOM GENERERAS KOMMER ATT ANVÄNDAS FÖR ATT KLASSIFICERA OLIKA REGLERADE GENER I GRUPPER MED GEMENSAMMA REGLERINGSSTANDARDER, FÖR ATT SEDAN TA ITU MED DE OLIKA REGLERINGSMEKANISMER SOM BERÖRS. VI KOMMER ATT UNDERSÖKA PXR UNIONS WEBBPLATSER MED HJÄLP AV CHIP-SEQ, INFORMATION SOM VI KOMMER ATT INTEGRERA MED DEN FRÅN ANALYSEN AV TRANSCRIPTOMICA. VI KOMMER ATT UNDERSÖKA MÖJLIG METILACION AV ARGININS I PIPX ALFA-HELICE1 OCH, DÄR SÅ ÄR LÄMPLIGT, STUDERA ÄNDRINGARNAS FUNKTIONELLA BETYDELSE OCH GENETISKA BESTÄMNINGSFAKTORER. BÅDE KANDIDATMETYLAS(ER) OCH ANDRA PROTEINER SOM FINNS I PROTEIN-PROTEIN OCH/ELLER SILICO INTERAKTIONER KOMMER ATT ANALYSERAS. AVSIKTEN ÄR ATT INAKTIVA MOTSVARANDE GENER OCH RELEVANT FENOTYPISK ANALYS. _x000D_ vi kommer också att studera MOLECULAR DETAILS I SEMINALISATIONEN FÖR PROCESSEN av kloros, En dramatisk anpassning till olika typer av miljö, där NBLR och NTCA-PIPX, in i andra Tillsynsmyndigheter, Konverge för Promotorn av NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. VI ÄR INTRESSERADE AV ATT DECHIFFRERA NÅGRA AV REGLERINGSKOMPLEXITETERNA, SÅSOM MEKANISMEN FÖR AKTIVERING OCH FUNKTION AV NBLR OCH I REGLERINGSSAMSPELET MELLAN DE OLIKA SÄTT SOM KONVERGERAR I NBLA-PROMOTORN. MÅNGA AV DE METODOLOGISKA STRATEGIER SOM FÖRESLÅS I FÖRHÅLLANDE TILL PIPX, KOMMER OCKSÅ ATT ANVÄNDAS MED NBLR. (Swedish) | |||||||||||||||
| Property / summary: CYANOBAKTERIER UTFÖR OXIGENICAN FOTOSYNTES OCH KOLONISERA MAJORITETEN AV UPPLYSTA EKOSYSTEM, SÅ DE HAR EN STOR INVERKAN PÅ GLOBALA KOL- OCH KVÄVECYKLER. TROTS SIN EKOLOGISKA FRAMGÅNG OCH BIOTEKNISKA BETYDELSE ÄR DE MEKANISMER SOM LIGGER TILL GRUND FÖR DENNA MÅNGSIDIGHET OCH KAPACITET FÖR MILJÖANPASSNING FORTFARANDE OKÄNDA. I DETTA SAMMANHANG, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, AV RELATIVELY FACILITY genetisk MANIPUATION, ÄR en EXCELLENT SYSTEM FÖR STUDY of the REGULATING INTERACTIONS som tillåter CIANOBACTERIAS INTEGRATED OCH RESPONDERLY TILL MUYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Det primära förslaget i detta projekt är att karakterisera den multifuncional PIPX PROTEIN, en UN FACTOR OF CIANOBACTERIAS CONCERNING transkriptionella regulatorer, Signalizing PROTEINS OCH metabolical enzimas i en NÄTVERK AV COMPLETE OCH DINAMIC Interations. MED HJÄLP AV SAMRENINGSFÖRSÖK IN VIVO MED FLAGG-PIPX-PROTEINET STRÄVAR VI EFTER ATT IDENTIFIERA NYA KOMPONENTER I DE SIGNALVÄGAR SOM PIPX DELTAR I, FÖRUTOM ATT VALIDERA INTERAKTIONER OCH TIDIGARE RESULTAT FRÅN DUBBELHYBRIDISERAD PIPX (XIP-PROTEINER), TRIPPELHYBRIDISERING (PXR, IDENTIFIERAD MED BÅDE PII OCH PIPX SOM BETE) ELLER I SILICO-ANALYS (ORF2060). FÖR ATT BESKRIVA INTERAKTIONER (MELLAN PROTEINER, OCH MED MÖJLIGA EFFEKTORER) MER I DETALJ, KOMMER VI ATT ANVÄNDA IN VITRO OCH/ELLER DUBBLA (TRIPEL) HYBRIDFÖRSÖK MED KOMPLETTA PROTEINER, MUTANTDERIVAT OCH/ELLER SPECIFIKA DOMÄNER. VI KOMMER ATT ANVÄNDA KONFOKAL MIKROSKOPI FÖR ATT AVGÖRA OM NÅGOT AV DE STUDERADE PROTEINERNA SAMLOKALISERAS I POLÄRA SPOTLIGHTS I PIPX, VARS DYNAMISKA LÄGE SVARAR PÅ MÖRKA LJUSCYKLER. FÖR ATT BESKRIVA PIPX-REGLERADE GENER OBEROENDE AV NTCA, KOMMER VI ATT UTFÖRA TRANSKRIPTOMISK ANALYS MED EN STAMPANEL, UNDER OLIKA ODLINGSFÖRHÅLLANDEN, VILKET INKLUDERAR OLIKA TYPER AV DERIVAT AV PIPX-GENEN, OCH ANDRA RELATERADE GENER. DE DATA SOM GENERERAS KOMMER ATT ANVÄNDAS FÖR ATT KLASSIFICERA OLIKA REGLERADE GENER I GRUPPER MED GEMENSAMMA REGLERINGSSTANDARDER, FÖR ATT SEDAN TA ITU MED DE OLIKA REGLERINGSMEKANISMER SOM BERÖRS. VI KOMMER ATT UNDERSÖKA PXR UNIONS WEBBPLATSER MED HJÄLP AV CHIP-SEQ, INFORMATION SOM VI KOMMER ATT INTEGRERA MED DEN FRÅN ANALYSEN AV TRANSCRIPTOMICA. VI KOMMER ATT UNDERSÖKA MÖJLIG METILACION AV ARGININS I PIPX ALFA-HELICE1 OCH, DÄR SÅ ÄR LÄMPLIGT, STUDERA ÄNDRINGARNAS FUNKTIONELLA BETYDELSE OCH GENETISKA BESTÄMNINGSFAKTORER. BÅDE KANDIDATMETYLAS(ER) OCH ANDRA PROTEINER SOM FINNS I PROTEIN-PROTEIN OCH/ELLER SILICO INTERAKTIONER KOMMER ATT ANALYSERAS. AVSIKTEN ÄR ATT INAKTIVA MOTSVARANDE GENER OCH RELEVANT FENOTYPISK ANALYS. _x000D_ vi kommer också att studera MOLECULAR DETAILS I SEMINALISATIONEN FÖR PROCESSEN av kloros, En dramatisk anpassning till olika typer av miljö, där NBLR och NTCA-PIPX, in i andra Tillsynsmyndigheter, Konverge för Promotorn av NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. VI ÄR INTRESSERADE AV ATT DECHIFFRERA NÅGRA AV REGLERINGSKOMPLEXITETERNA, SÅSOM MEKANISMEN FÖR AKTIVERING OCH FUNKTION AV NBLR OCH I REGLERINGSSAMSPELET MELLAN DE OLIKA SÄTT SOM KONVERGERAR I NBLA-PROMOTORN. MÅNGA AV DE METODOLOGISKA STRATEGIER SOM FÖRESLÅS I FÖRHÅLLANDE TILL PIPX, KOMMER OCKSÅ ATT ANVÄNDAS MED NBLR. (Swedish) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: CYANOBAKTERIER UTFÖR OXIGENICAN FOTOSYNTES OCH KOLONISERA MAJORITETEN AV UPPLYSTA EKOSYSTEM, SÅ DE HAR EN STOR INVERKAN PÅ GLOBALA KOL- OCH KVÄVECYKLER. TROTS SIN EKOLOGISKA FRAMGÅNG OCH BIOTEKNISKA BETYDELSE ÄR DE MEKANISMER SOM LIGGER TILL GRUND FÖR DENNA MÅNGSIDIGHET OCH KAPACITET FÖR MILJÖANPASSNING FORTFARANDE OKÄNDA. I DETTA SAMMANHANG, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, AV RELATIVELY FACILITY genetisk MANIPUATION, ÄR en EXCELLENT SYSTEM FÖR STUDY of the REGULATING INTERACTIONS som tillåter CIANOBACTERIAS INTEGRATED OCH RESPONDERLY TILL MUYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Det primära förslaget i detta projekt är att karakterisera den multifuncional PIPX PROTEIN, en UN FACTOR OF CIANOBACTERIAS CONCERNING transkriptionella regulatorer, Signalizing PROTEINS OCH metabolical enzimas i en NÄTVERK AV COMPLETE OCH DINAMIC Interations. MED HJÄLP AV SAMRENINGSFÖRSÖK IN VIVO MED FLAGG-PIPX-PROTEINET STRÄVAR VI EFTER ATT IDENTIFIERA NYA KOMPONENTER I DE SIGNALVÄGAR SOM PIPX DELTAR I, FÖRUTOM ATT VALIDERA INTERAKTIONER OCH TIDIGARE RESULTAT FRÅN DUBBELHYBRIDISERAD PIPX (XIP-PROTEINER), TRIPPELHYBRIDISERING (PXR, IDENTIFIERAD MED BÅDE PII OCH PIPX SOM BETE) ELLER I SILICO-ANALYS (ORF2060). FÖR ATT BESKRIVA INTERAKTIONER (MELLAN PROTEINER, OCH MED MÖJLIGA EFFEKTORER) MER I DETALJ, KOMMER VI ATT ANVÄNDA IN VITRO OCH/ELLER DUBBLA (TRIPEL) HYBRIDFÖRSÖK MED KOMPLETTA PROTEINER, MUTANTDERIVAT OCH/ELLER SPECIFIKA DOMÄNER. VI KOMMER ATT ANVÄNDA KONFOKAL MIKROSKOPI FÖR ATT AVGÖRA OM NÅGOT AV DE STUDERADE PROTEINERNA SAMLOKALISERAS I POLÄRA SPOTLIGHTS I PIPX, VARS DYNAMISKA LÄGE SVARAR PÅ MÖRKA LJUSCYKLER. FÖR ATT BESKRIVA PIPX-REGLERADE GENER OBEROENDE AV NTCA, KOMMER VI ATT UTFÖRA TRANSKRIPTOMISK ANALYS MED EN STAMPANEL, UNDER OLIKA ODLINGSFÖRHÅLLANDEN, VILKET INKLUDERAR OLIKA TYPER AV DERIVAT AV PIPX-GENEN, OCH ANDRA RELATERADE GENER. DE DATA SOM GENERERAS KOMMER ATT ANVÄNDAS FÖR ATT KLASSIFICERA OLIKA REGLERADE GENER I GRUPPER MED GEMENSAMMA REGLERINGSSTANDARDER, FÖR ATT SEDAN TA ITU MED DE OLIKA REGLERINGSMEKANISMER SOM BERÖRS. VI KOMMER ATT UNDERSÖKA PXR UNIONS WEBBPLATSER MED HJÄLP AV CHIP-SEQ, INFORMATION SOM VI KOMMER ATT INTEGRERA MED DEN FRÅN ANALYSEN AV TRANSCRIPTOMICA. VI KOMMER ATT UNDERSÖKA MÖJLIG METILACION AV ARGININS I PIPX ALFA-HELICE1 OCH, DÄR SÅ ÄR LÄMPLIGT, STUDERA ÄNDRINGARNAS FUNKTIONELLA BETYDELSE OCH GENETISKA BESTÄMNINGSFAKTORER. BÅDE KANDIDATMETYLAS(ER) OCH ANDRA PROTEINER SOM FINNS I PROTEIN-PROTEIN OCH/ELLER SILICO INTERAKTIONER KOMMER ATT ANALYSERAS. AVSIKTEN ÄR ATT INAKTIVA MOTSVARANDE GENER OCH RELEVANT FENOTYPISK ANALYS. _x000D_ vi kommer också att studera MOLECULAR DETAILS I SEMINALISATIONEN FÖR PROCESSEN av kloros, En dramatisk anpassning till olika typer av miljö, där NBLR och NTCA-PIPX, in i andra Tillsynsmyndigheter, Konverge för Promotorn av NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. VI ÄR INTRESSERADE AV ATT DECHIFFRERA NÅGRA AV REGLERINGSKOMPLEXITETERNA, SÅSOM MEKANISMEN FÖR AKTIVERING OCH FUNKTION AV NBLR OCH I REGLERINGSSAMSPELET MELLAN DE OLIKA SÄTT SOM KONVERGERAR I NBLA-PROMOTORN. MÅNGA AV DE METODOLOGISKA STRATEGIER SOM FÖRESLÅS I FÖRHÅLLANDE TILL PIPX, KOMMER OCKSÅ ATT ANVÄNDAS MED NBLR. (Swedish) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 4 August 2022
| |||||||||||||||
| Property / location (string) | |||||||||||||||
Alicante/Alacant | |||||||||||||||
| Property / location (string): Alicante/Alacant / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / postal code | |||||||||||||||
3080 | |||||||||||||||
| Property / postal code: 3080 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS: Alicante / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS: Alicante / qualifier | |||||||||||||||
| Property / contained in Local Administrative Unit | |||||||||||||||
| Property / contained in Local Administrative Unit: Alacant / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / coordinate location | |||||||||||||||
38°23'0.06"N, 0°32'14.50"W
| |||||||||||||||
| Property / coordinate location: 38°23'0.06"N, 0°32'14.50"W / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / coordinate location: 38°23'0.06"N, 0°32'14.50"W / qualifier | |||||||||||||||
| Property / budget | |||||||||||||||
130,438.0 Euro
| |||||||||||||||
| Property / budget: 130,438.0 Euro / rank | |||||||||||||||
Preferred rank | |||||||||||||||
| Property / EU contribution | |||||||||||||||
71,023.49 Euro
| |||||||||||||||
| Property / EU contribution: 71,023.49 Euro / rank | |||||||||||||||
Preferred rank | |||||||||||||||
| Property / co-financing rate | |||||||||||||||
54.45 percent
| |||||||||||||||
| Property / co-financing rate: 54.45 percent / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / date of last update | |||||||||||||||
20 December 2023
| |||||||||||||||
| Property / date of last update: 20 December 2023 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Latest revision as of 23:05, 9 October 2024
Project Q3189332 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | MULTIFUNCTIONALITY OF PIPX AND SIGNALING NETWORKS IN THE CYANOBACTERIA MODEL SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942 |
Project Q3189332 in Spain |
Statements
71,023.49 Euro
0 references
130,438.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2016
0 references
31 December 2018
0 references
UNIVERSIDAD DE ALICANTE
0 references
3080
0 references
LAS CIANOBACTERIAS REALIZAN FOTOSINTESIS OXIGENICA Y COLONIZAN LA MAYORIA DE ECOSISTEMAS ILUMINADOS, POR LO QUE TIENEN UN GRAN IMPACTO EN LOS CICLOS GLOBALES DE CARBONO Y NITROGENO. SIN EMBARGO, A PESAR DE SU EXITO ECOLOGICO E IMPORTANCIA BIOTECNOLOGICA, LOS MECANISMOS RESPONSABLES DE ESTA VERSATILIDAD Y CAPACIDAD DE ADAPTACION AMBIENTAL PERMANECEN DESCONOCIDOS. EN ESTE CONTEXTO, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, DE RELATIVAMENTE FACIL MANIPULACION GENETICA, ES UN EXCELENTE SISTEMA MODELO PARA EL ESTUDIO DE LAS INTERACCIONES REGULADORAS QUE PERMITEN A LAS CIANOBACTERIAS INTEGRAR Y RESPONDER ADECUADAMENTE A MUY DISTINTAS SEÑALES AMBIENTALES._x000D_ EL PROPOSITO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO ES CARACTERIZAR LA PROTEINA MULTIFUNCIONAL PIPX, UN FACTOR UNICO DE CIANOBACTERIAS QUE CONECTA REGULADORES TRANSCRIPCIONALES, PROTEINAS SEÑALIZADORAS Y ENZIMAS METABOLICAS EN UNA RED DE INTERACCIONES COMPLEJA Y DINAMICA. MEDIANTE ENSAYOS IN VIVO DE CO-PURIFICACION CON LA PROTEINA FLAG-PIPX PRETENDEMOS IDENTIFICAR NUEVOS COMPONENTES DE LAS VIAS DE SEÑALIZACION EN LAS QUE PARTICIPA PIPX, ADEMAS DE VALIDAR INTERACCIONES Y RESULTADOS PREVIOS PROCEDENTES DE ESCRUTINIOS DOBLE HIBRIDO CON PIPX (PROTEINAS XIP), TRIPLE HIBRIDO (PXR, IDENTIFICADO USANDO A LA VEZ PII Y PIPX COMO CEBO) O DE ANALISIS IN SILICO (ORF2060). PARA CARACTERIZAR LAS INTERACCIONES (ENTRE PROTEINAS, Y CON POSIBLES EFECTORES) EN MAYOR DETALLE, UTILIZAREMOS ENSAYOS IN VITRO Y/O DOBLE(TRIPLE) HIBRIDO CON PROTEINAS COMPLETAS, DERIVADOS MUTANTES Y/O DOMINIOS CONCRETOS. RECURRIREMOS AL USO DE MICROSCOPIA CONFOCAL PARA DETERMINAR SI ALGUNA DE LAS PROTEINAS ESTUDIADAS CO-LOCALIZA EN LOS FOCOS POLARES DE PIPX, CUYA LOCALIZACION DINAMICA RESPONDE A CICLOS DE LUZ OSCURIDAD. PARA DESCRIBIR LOS GENES REGULADOS POR PIPX INDEPENDIENTEMENTE DE NTCA, LLEVAREMOS A CABO ANALISIS TRANSCRIPTOMICOS CON UN PANEL DE ESTIRPES, EN DISTINTAS CONDICIONES DE CULTIVO, QUE INCLUYE DIVERSOS TIPOS DE DERIVADOS DEL GEN PIPX, Y DE OTROS GENES RELACIONADOS. LOS DATOS GENERADOS SERAN UTILIZADOS PARA CLASIFICAR GENES DIFERENCIALMENTE REGULADOS EN GRUPOS CON PATRONES DE REGULACION COMUNES, PARA DESPUES ABORDAR LOS DISTINTOS MECANISMOS DE REGULACION IMPLICADOS. INVESTIGAREMOS LOS SITIOS DE UNION DE PXR MEDIANTE CHIP-SEQ, INFORMACION QUE INTEGRAREMOS CON LA PROCEDENTE DEL ANALISIS DE LA TRANSCRIPTOMICA. INVESTIGAREMOS LA POSIBLE METILACION DE ARGININAS EN LA ALFA-HELICE1 DE PIPX Y EN SU CASO, ESTUDIAREMOS EL SIGNIFICADO FUNCIONAL Y DETERMINANTES GENETICOS DE LAS MODIFICACIONES. TANTO LAS METILASA(S) CANDIDATA(S) COMO OTRAS PROTEINAS HALLADAS EN LAS BUSQUEDAS DE INTERACCIONES PROTEINA-PROTEINA Y/O IN SILICO, SERAN OBJETO DE ANALISIS. SE PRETENDE LA INACTIVACION DE LOS CORRESPONDIENTES GENES Y ANALISIS FENOTIPICOS PERTINENTES. _x000D_ ESTUDIAREMOS TAMBIEN DETALLES MOLECULARES EN LA SEÑALIZACION HACIA EL PROCESO DE LA CLOROSIS, UNA ADAPTACION DRAMATICA A DISTINTOS TIPOS DE ESTRES AMBIENTALES, EN EL QUE NBLR Y NTCA-PIPX, ENTRE OTROS REGULADORES, CONVERGEN PARA EL PROMOTOR DEL GEN NBLA, ESENCIAL PARA LA DEGRADACION DE FICOBILISOMAS. ESTAMOS INTERESADOS EN DESCIFRAR ALGUNAS DE LAS COMPLEJIDADES REGULADORAS, COMO EL MECANISMO DE ACTIVACION Y FUNCION DE NBLR Y EN LAS INTERACCIONES REGULADORAS DE LAS DISTINTAS VIAS QUE CONVERGEN EN EL PROMOTOR NBLA. MUCHAS DE LAS ESTRATEGIAS METODOLOGICAS PROPUESTAS EN RELACION A PIPX, SERAN TAMBIEN UTILIZADAS CON NBLR. (Spanish)
0 references
CYANOBACTERIA PERFORM OXIGENICAN PHOTOSYNTHESIS AND COLONISE THE MAJORITY OF ILLUMINATED ECOSYSTEMS, SO THEY HAVE A GREAT IMPACT ON GLOBAL CARBON AND NITROGEN CYCLES. HOWEVER, DESPITE ITS ECOLOGICAL SUCCESS AND BIOTECHNOLOGICAL IMPORTANCE, THE MECHANISMS RESPONSIBLE FOR THIS VERSATILITY AND CAPACITY FOR ENVIRONMENTAL ADAPTATION REMAIN UNKNOWN. IN THIS CONTEXT, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY GENETICAL MANIPUATION, IS an EXCELLENT SYSTEM FOR THE STUDY OF THE REGULATING INTERACTIONS PERMITING THE CIANOBACTERIAS INTEGRATED AND RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ The primary proposition of this project is to characterise the MULTIFUNCIONAL PIPX PROTEIN, a UN FACTOR OF CIANOBACTERIAS CONCERNING transcriptional REGULators, Signalising PROTEINS AND METABOLICAL ENZIMAS IN A NETWORK OF COMPLETE AND DINAMIC INTERATIONS. USING IN VIVO CO-PURIFICATION TRIALS WITH THE FLAG-PIPX PROTEIN, WE AIM TO IDENTIFY NEW COMPONENTS OF THE SIGNALING PATHWAYS IN WHICH PIPX PARTICIPATES, IN ADDITION TO VALIDATING INTERACTIONS AND PREVIOUS RESULTS FROM DOUBLE HYBRIDISED PIPX (XIP PROTEINS), TRIPLE HYBRIDISATION (PXR, IDENTIFIED USING BOTH PII AND PIPX AS BAIT) OR IN SILICO ANALYSIS (ORF2060). TO CHARACTERISE INTERACTIONS (BETWEEN PROTEINS, AND WITH POSSIBLE EFFECTORS) IN GREATER DETAIL, WE WILL USE IN VITRO AND/OR DOUBLE (TRIPLE) HYBRID TRIALS WITH COMPLETE PROTEINS, MUTANT DERIVATIVES AND/OR SPECIFIC DOMAINS. WE WILL RESORT TO THE USE OF CONFOCAL MICROSCOPY TO DETERMINE WHETHER ANY OF THE PROTEINS STUDIED CO-LOCALISES IN THE POLAR SPOTLIGHTS OF PIPX, WHOSE DYNAMIC LOCATION RESPONDS TO DARK LIGHT CYCLES. TO DESCRIBE PIPX-REGULATED GENES INDEPENDENTLY OF NTCA, WE WILL PERFORM TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS WITH A STRAIN PANEL, UNDER DIFFERENT CULTURE CONDITIONS, WHICH INCLUDES VARIOUS TYPES OF DERIVATIVES OF THE PIPX GENE, AND OTHER RELATED GENES. THE DATA GENERATED WILL BE USED TO CLASSIFY DIFFERENTIALLY REGULATED GENES INTO GROUPS WITH COMMON REGULATORY STANDARDS, TO THEN ADDRESS THE DIFFERENT REGULATORY MECHANISMS INVOLVED. WE WILL INVESTIGATE THE PXR UNION SITES USING CHIP-SEQ, INFORMATION THAT WE WILL INTEGRATE WITH THAT FROM THE ANALYSIS OF TRANSCRIPTOMICA. WE WILL INVESTIGATE THE POSSIBLE METILACION OF ARGININS IN PIPX ALPHA-HELICE1 AND, WHERE APPROPRIATE, STUDY THE FUNCTIONAL MEANING AND GENETIC DETERMINANTS OF THE MODIFICATIONS. BOTH CANDIDATE METHYLASE(S) AND OTHER PROTEINS FOUND IN PROTEIN-PROTEIN AND/OR IN SILICO INTERACTIONS WILL BE ANALYSED. THE INTENTION IS TO INACTIVE THE CORRESPONDING GENES AND RELEVANT PHENOTYPIC ANALYSIS. _x000D_ we will also study MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, A dramatic adaptation to different types of environment, in which NBLR and NTCA-PIPX, enter other Regulators, Converge for the Promotor of the NBLA, ESENTIAL FOR THE DEGRAtation of Physiobilisomas. WE ARE INTERESTED IN DECIPHERING SOME OF THE REGULATORY COMPLEXITIES, SUCH AS THE MECHANISM OF ACTIVATION AND FUNCTION OF NBLR AND IN THE REGULATORY INTERACTIONS OF THE DIFFERENT WAYS THAT CONVERGE IN THE NBLA PROMOTER. MANY OF THE METHODOLOGICAL STRATEGIES PROPOSED IN RELATION TO PIPX, WILL ALSO BE USED WITH NBLR. (English)
13 October 2021
0.6318786073816945
0 references
LES CYANOBACTÉRIES EFFECTUENT LA PHOTOSYNTHÈSE OXIGENICAN ET COLONISENT LA MAJORITÉ DES ÉCOSYSTÈMES ILLUMINÉS, DE SORTE QU’ELLES ONT UN GRAND IMPACT SUR LES CYCLES MONDIAUX DU CARBONE ET DE L’AZOTE. TOUTEFOIS, MALGRÉ SON SUCCÈS ÉCOLOGIQUE ET SON IMPORTANCE BIOTECHNOLOGIQUE, LES MÉCANISMES RESPONSABLES DE CETTE POLYVALENCE ET DE CETTE CAPACITÉ D’ADAPTATION À L’ENVIRONNEMENT RESTENT INCONNUS. DANS CE CONTEXTE, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, DE LA MANIPUATION GÉNÉRALE DE LA FACILITÉ RELATIVE, EST un SYSTÈME EXCELLENT POUR L’ÉTUDE DES INTERACTIONS RÉGLEMENTAIRES autorisant les CIANOBACTERIAS INTÉGRÉES ET RÉPONDERLES AUX DYSTEMES ENVIRONNEMENTAUX DYSTÈMES DYSTEMAUX._x000D_La proposition principale de ce projet est de caractériser le PROTEIN PIPX multifuncional, un FACTEUR UN DES CIANOBACTERIAS CONCERNANT les régulateurs transcriptionnels, les PROTÉINS DE Signalisation et les enzimes métaboliques dans un réseau d’interations COMPLETE ET DINAMIC. À L’AIDE D’ESSAIS IN VIVO DE CO-PURIFICATION AVEC LA PROTÉINE FLAG-PIPX, NOUS CHERCHONS À IDENTIFIER DE NOUVEAUX COMPOSANTS DES VOIES DE SIGNALISATION AUXQUELLES PIPX PARTICIPE, EN PLUS DE VALIDER LES INTERACTIONS ET LES RÉSULTATS ANTÉRIEURS DE LA DOUBLE PROTÉINE HYBRIDE PIPX (PROTÉINES XIP), DE LA TRIPLE HYBRIDATION (PXR, IDENTIFIÉE À LA FOIS PAR PII ET PIPX COMME APPÂT) OU DANS L’ANALYSE SILICO (ORF2060). POUR CARACTÉRISER PLUS EN DÉTAIL LES INTERACTIONS (ENTRE LES PROTÉINES, ET AVEC D’ÉVENTUELS EFFECTEURS), NOUS UTILISERONS DES ESSAIS HYBRIDES IN VITRO ET/OU DOUBLES (TRIPLES) AVEC DES PROTÉINES COMPLÈTES, DES DÉRIVÉS MUTANTS ET/OU DES DOMAINES SPÉCIFIQUES. NOUS ALLONS RECOURIR À LA MICROSCOPIE CONFOCALE POUR DÉTERMINER SI L’UNE DES PROTÉINES ÉTUDIÉES CO-LOCALISE DANS LES PROJECTEURS POLAIRES DE PIPX, DONT L’EMPLACEMENT DYNAMIQUE RÉPOND AUX CYCLES DE LUMIÈRE FONCÉE. POUR DÉCRIRE LES GÈNES RÉGLEMENTÉS PAR PIPX INDÉPENDAMMENT DU NTCA, NOUS EFFECTUERONS UNE ANALYSE TRANSCRIPTOMIQUE AVEC UN PANNEAU DE SOUCHE, DANS DIFFÉRENTES CONDITIONS DE CULTURE, QUI COMPREND DIFFÉRENTS TYPES DE DÉRIVÉS DU GÈNE PIPX ET D’AUTRES GÈNES APPARENTÉS. LES DONNÉES GÉNÉRÉES SERVIRONT À CLASSER LES GÈNES À RÉGULATION DIFFÉRENCIÉE EN GROUPES AYANT DES NORMES RÉGLEMENTAIRES COMMUNES, AFIN DE TRAITER ENSUITE DES DIFFÉRENTS MÉCANISMES DE RÉGLEMENTATION EN CAUSE. NOUS ÉTUDIERONS LES SITES DE PXR UNION À L’AIDE DE CHIP-SEQ, INFORMATIONS QUE NOUS INTÉGRERONS À CELLE DE L’ANALYSE DE TRANSCRIPTOMICA. NOUS ÉTUDIERONS LA POSSIBILITÉ DE METILACION D’ARGININS DANS PIPX ALPHA-HELICE1 ET, LE CAS ÉCHÉANT, ÉTUDIERONS LA SIGNIFICATION FONCTIONNELLE ET LES DÉTERMINANTS GÉNÉTIQUES DES MODIFICATIONS. LA OU LES MÉTHYLASES CANDIDATES ET D’AUTRES PROTÉINES PRÉSENTES DANS LES INTERACTIONS PROTÉINE-PROTÉINE ET/OU SILICO SERONT ANALYSÉES. L’INTENTION EST D’INACTIVER LES GÈNES CORRESPONDANTS ET L’ANALYSE PHÉNOTYPIQUE PERTINENTE. _x000D_ nous étudierons également les DÉTAILS MOLECULAIRES DANS LA SEMINALISATION FOIS LE PROCESSUS DE Chlorose, Une adaptation dramatique à différents types d’environnement, dans laquelle NBLR et NTCA-PIPX, entrent dans d’autres régulateurs, Converge pour le promoteur de la NBLA, esentiel POUR LA Dégratation des Physiobilisomas. NOUS SOMMES INTÉRESSÉS À DÉCHIFFRER CERTAINES DES COMPLEXITÉS RÉGLEMENTAIRES, COMME LE MÉCANISME D’ACTIVATION ET DE FONCTION DE LA NBLR ET LES INTERACTIONS RÉGLEMENTAIRES DES DIFFÉRENTES FAÇONS DE CONVERGER AVEC LE PROMOTEUR DE LA LNLB. BON NOMBRE DES STRATÉGIES MÉTHODOLOGIQUES PROPOSÉES PAR RAPPORT À PIPX SERONT ÉGALEMENT UTILISÉES AVEC LE NBLR. (French)
4 December 2021
0 references
CYANOBAKTERIEN FÜHREN OXIGENICAN PHOTOSYNTHESE DURCH UND KOLONISIEREN DIE MEISTEN BELEUCHTETEN ÖKOSYSTEME, SO DASS SIE EINEN GROSSEN EINFLUSS AUF GLOBALE KOHLENSTOFF- UND STICKSTOFFZYKLEN HABEN. TROTZ SEINES ÖKOLOGISCHEN ERFOLGS UND SEINER BIOTECHNOLOGISCHEN BEDEUTUNG BLEIBEN DIE MECHANISMEN, DIE FÜR DIESE VIELSEITIGKEIT UND DIE FÄHIGKEIT ZUR ANPASSUNG AN DIE UMWELT VERANTWORTLICH SIND, UNBEKANNT. IN DIESEM ZUSAMMENHANG SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY genetische MANIPUATION, ist ein EXCELLENT SYSTEM FÜR DIE STUDIE DER VERORDNUNG INTERACTIONEN, die das CIANOBACTERIAS INTEGRATED und RESPONDERLY ZU MEINE DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS erlauben._x000D_ Der primäre Vorschlag dieses Projekts ist die Charakterisierung des multifuncionalen PIPX PROTEIN, ein UN FACTOR OF CIANOBACTERIAS CONCERNING Transkriptionsregulatoren, Signalisierung von PROTEINS und metabolische enzimas in einem NETWORK OF COMPLETE UND DINAMIC Interationen. MIT HILFE VON IN-VIVO-KO-REINIGUNGSVERSUCHEN MIT DEM FLAG-PIPX-PROTEIN WOLLEN WIR NEUE KOMPONENTEN DER SIGNALWEGE IDENTIFIZIEREN, AN DENEN PIPX TEILNIMMT, NEBEN DER VALIDIERUNG VON WECHSELWIRKUNGEN UND FRÜHEREN ERGEBNISSEN AUS DOPPELT HYBRIDISIERTEN PIPX-PROTEINEN (XIP-PROTEINE), DREIFACHER HYBRIDISIERUNG (PXR, IDENTIFIZIERT MIT PII UND PIPX ALS KÖDER) ODER IN DER SILICO-ANALYSE (ORF2060). UM INTERAKTIONEN (ZWISCHEN PROTEINEN UND MÖGLICHEN EFFEKTOREN) IM DETAIL ZU CHARAKTERISIEREN, WERDEN WIR IN VITRO UND/ODER DOPPEL- (DREIFACHE) HYBRIDVERSUCHE MIT VOLLSTÄNDIGEN PROTEINEN, MUTANTENDERIVATEN UND/ODER BESTIMMTEN DOMÄNEN VERWENDEN. WIR WERDEN AUF DIE VERWENDUNG DER KONFOKALEN MIKROSKOPIE ZURÜCKGREIFEN, UM FESTZUSTELLEN, OB SICH EINES DER UNTERSUCHTEN PROTEINE IN DEN POLARSTRAHLERN VON PIPX BEFINDET, DEREN DYNAMISCHE LAGE AUF DUNKLE LICHTZYKLEN REAGIERT. UM PIPX-GEREGELTE GENE UNABHÄNGIG VON NTCA ZU BESCHREIBEN, WERDEN WIR EINE TRANSKRIPTOM-ANALYSE MIT EINEM STAMMPANEL UNTER UNTERSCHIEDLICHEN KULTURBEDINGUNGEN DURCHFÜHREN, DIE VERSCHIEDENE ARTEN VON DERIVATEN DES PIPX-GENS UND ANDERE VERWANDTE GENE UMFASST. DIE ERZEUGTEN DATEN WERDEN VERWENDET, UM UNTERSCHIEDLICH REGULIERTE GENE IN GRUPPEN MIT GEMEINSAMEN REGULIERUNGSSTANDARDS EINZUORDNEN, UM DANN DIE VERSCHIEDENEN BETEILIGTEN REGULIERUNGSMECHANISMEN ANZUGEHEN. WIR WERDEN DIE PXR-UNION-STANDORTE MIT CHIP-SEQ UNTERSUCHEN, INFORMATIONEN, DIE WIR AUS DER ANALYSE VON TRANSCRIPTOMICA INTEGRIEREN WERDEN. WIR WERDEN DIE MÖGLICHE METILACION VON ARGININS IN PIPX ALPHA-HELICE1 UNTERSUCHEN UND GEGEBENENFALLS DIE FUNKTIONALE BEDEUTUNG UND GENETISCHE DETERMINANTEN DER MODIFIKATIONEN UNTERSUCHEN. SOWOHL KANDIDATENMETHYLASE(S) ALS AUCH ANDERE PROTEINE, DIE IN PROTEIN-PROTEIN UND/ODER IN SILICO-INTERAKTIONEN GEFUNDEN WERDEN, WERDEN ANALYSIERT. DIE ABSICHT BESTEHT DARIN, DIE ENTSPRECHENDEN GENE UND RELEVANTE PHÄNOTYPISCHE ANALYSE INAKTIV ZU MACHEN. _x000D_ Wir werden auch MOLECULAR DETAILS IN DER SEMINALISATION DAS PROCESS der Chlorose untersuchen, Eine dramatische Anpassung an verschiedene Arten von Umgebungen, in denen NBLR und NTCA-PIPX, andere Regulatoren betreten, Converge for the Promotor of the NBLA, Esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. WIR SIND DARAN INTERESSIERT, EINIGE DER REGULATORISCHEN KOMPLEXITÄTEN ZU ENTSCHLÜSSELN, WIE Z. B. DEN AKTIVIERUNGS- UND FUNKTIONSMECHANISMUS DER NBLR UND DIE REGULATORISCHEN WECHSELWIRKUNGEN DER VERSCHIEDENEN ARTEN, DIE IM NBLA-PROMOTOR AUFEINANDERTREFFEN. VIELE DER IN BEZUG AUF PIPX VORGESCHLAGENEN METHODISCHEN STRATEGIEN WERDEN AUCH MIT DER NBLR GENUTZT. (German)
9 December 2021
0 references
CYANOBACTERIËN VOEREN OXIGENICAN FOTOSYNTHESE UIT EN KOLONISEREN DE MEESTE VERLICHTE ECOSYSTEMEN, ZODAT ZE EEN GROTE IMPACT HEBBEN OP DE WERELDWIJDE KOOLSTOF- EN STIKSTOFCYCLI. ONDANKS HET ECOLOGISCHE SUCCES EN HET BIOTECHNOLOGISCHE BELANG ERVAN, BLIJVEN DE MECHANISMEN DIE VERANTWOORDELIJK ZIJN VOOR DEZE VEELZIJDIGHEID EN CAPACITEIT VOOR MILIEUAANPASSING ONBEKEND. IN DIT VERBAND, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, VAN RELATIVELY FACILITY genetical MANIPUATION, is een EXCELLENT SYSTEM VOOR DE STUDIE VAN DE REGULATIE INTERACTIES die de CIANOBACTERIAS INTEGRATED en RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ De primaire stelling van dit project is om de multifuncional PIPX PROTEIN te karakteriseren, een UN FACTOR VAN CIANOBACTERIAS CONCERNING transcriptional regulators, Signaliserende PROTEINS EN metabolische enzimas in een NETWERK VAN COMPLETE EN DINAMIC interations. MET BEHULP VAN IN VIVO CO-PURIFICATIE PROEVEN MET HET VLAG-PIPX-EIWIT, STREVEN WE ERNAAR NIEUWE COMPONENTEN TE IDENTIFICEREN VAN DE SIGNALERINGSROUTES WAARAAN PIPX DEELNEEMT, NAAST HET VALIDEREN VAN INTERACTIES EN EERDERE RESULTATEN VAN DUBBELGE HYBRIDISEERDE PIPX (XIP-EIWITTEN), DRIEVOUDIGE HYBRIDISATIE (PXR, GEÏDENTIFICEERD MET ZOWEL PII ALS PIPX ALS AAS) OF IN SILICO-ANALYSE (ORF2060). OM INTERACTIES (TUSSEN EIWITTEN EN MET MOGELIJKE EFFECTOREN) IN MEER DETAIL TE KARAKTERISEREN, ZULLEN WE IN VITRO EN/OF DUBBELE (TRIPLE) HYBRIDE PROEVEN MET VOLLEDIGE EIWITTEN, MUTANTDERIVATEN EN/OF SPECIFIEKE DOMEINEN GEBRUIKEN. WE ZULLEN HUN TOEVLUCHT NEMEN TOT HET GEBRUIK VAN CONFOCALE MICROSCOPIE OM TE BEPALEN OF EEN VAN DE ONDERZOCHTE EIWITTEN COLOKALISEERT IN DE POOLSPOTS VAN PIPX, WAARVAN DE DYNAMISCHE LOCATIE REAGEERT OP DONKERE LICHTCYCLI. OM PIPX-GEREGULEERDE GENEN ONAFHANKELIJK VAN NTCA TE BESCHRIJVEN, ZULLEN WE TRANSCRIPTOMISCHE ANALYSE UITVOEREN MET EEN STAMPANEEL, ONDER VERSCHILLENDE CULTUUROMSTANDIGHEDEN, WAARONDER VERSCHILLENDE SOORTEN DERIVATEN VAN HET PIPX-GEN EN ANDERE VERWANTE GENEN. DE GEGENEREERDE GEGEVENS ZULLEN WORDEN GEBRUIKT OM VERSCHILLEND GEREGULEERDE GENEN TE CLASSIFICEREN IN GROEPEN MET GEMEENSCHAPPELIJKE REGELGEVINGSNORMEN, OM VERVOLGENS DE VERSCHILLENDE BETROKKEN REGELGEVINGSMECHANISMEN AAN TE PAKKEN. WE ZULLEN DE PXR UNION SITES ONDERZOEKEN MET BEHULP VAN CHIP-SEQ, INFORMATIE DIE WE ZULLEN INTEGREREN MET DIE VAN DE ANALYSE VAN TRANSCRIPTOMICA. WE ZULLEN DE MOGELIJKE METILACIE VAN ARGININS IN PIPX ALPHA-HELICE1 ONDERZOEKEN EN, INDIEN VAN TOEPASSING, DE FUNCTIONELE BETEKENIS EN GENETISCHE DETERMINANTEN VAN DE MODIFICATIES BESTUDEREN. ZOWEL KANDIDAAT METHYLASE(S) ALS ANDERE EIWITTEN GEVONDEN IN EIWIT-EIWIT EN/OF IN SILICO INTERACTIES WORDEN GEANALYSEERD. HET IS DE BEDOELING OM DE OVEREENKOMSTIGE GENEN EN RELEVANTE FENOTYPISCHE ANALYSE INACTIEF TE MAKEN. _x000D_ we zullen ook onderzoeken MOLECULAR DETAILS IN DE SEMINALISATIE DOES HET PROCESS VAN chlorose, Een dramatische aanpassing aan verschillende soorten omgeving, waarin NBLR en NTCA-PIPX, andere regulators, Converge voor de Promotor van de NBLA, esential voor de Degratatie van Physiobilisomas. WE ZIJN GEÏNTERESSEERD IN HET ONTCIJFEREN VAN EEN AANTAL VAN DE REGELGEVINGSCOMPLEXITEITEN, ZOALS HET MECHANISME VAN ACTIVERING EN FUNCTIE VAN NBLR EN IN DE REGELGEVENDE INTERACTIES VAN DE VERSCHILLENDE MANIEREN DIE CONVERGEREN IN DE NBLA-PROMOTOR. VEEL VAN DE VOORGESTELDE METHODOLOGISCHE STRATEGIEËN MET BETREKKING TOT PIPX ZULLEN OOK MET NBLR WORDEN GEBRUIKT. (Dutch)
17 December 2021
0 references
I CIANOBATTERI ESEGUONO LA FOTOSINTESI OXIGENICAN E COLONIZZANO LA MAGGIOR PARTE DEGLI ECOSISTEMI ILLUMINATI, QUINDI HANNO UN GRANDE IMPATTO SUI CICLI GLOBALI DEL CARBONIO E DELL'AZOTO. TUTTAVIA, NONOSTANTE IL SUCCESSO ECOLOGICO E L'IMPORTANZA BIOTECNOLOGICA, I MECCANISMI RESPONSABILI DI QUESTA VERSATILITÀ E CAPACITÀ DI ADATTAMENTO AMBIENTALE RIMANGONO SCONOSCIUTI. IN QUESTO CONTESTO, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, DI MANIPUAZIONE GENERALE DI FACILITÀ RELATIVE, È un SISTEMA ECCELLENTE PER LA STUDY DELLE INTERAZIONI REGULATIVE che consentono la CIANOBACTERIAS INTEGRATED E RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL._x000D_ La proposta primaria di questo progetto è quella di caratterizzare la PROTEIN PIPX multifunzione, un FATTORE UNO DI CIANOBACTERIAS CONCERNANTE regolatori trascrizionali, Signalising PROTEINS ED Enzimas metabolici in una rete di interazioni complete e DINAMiche. UTILIZZANDO STUDI DI CO-PURIFICAZIONE IN VIVO CON LA PROTEINA FLAG-PIPX, CI PROPONIAMO DI IDENTIFICARE NUOVI COMPONENTI DELLE VIE DI SEGNALAZIONE A CUI PARTECIPA PIPX, OLTRE A CONVALIDARE LE INTERAZIONI E I RISULTATI PRECEDENTI DA PIPX (PROTEINE XIP) IBRIDATE, TRIPLA IBRIDAZIONE (PXR, IDENTIFICATA UTILIZZANDO SIA PII CHE PIPX COME ESCA) O IN ANALISI SILICO (ORF2060). PER CARATTERIZZARE LE INTERAZIONI (TRA LE PROTEINE E CON POSSIBILI EFFETTIVI) IN MODO PIÙ DETTAGLIATO, USEREMO PROVE IBRIDE IN VITRO E/O DOPPIE (TRIPLE) CON PROTEINE COMPLETE, DERIVATI MUTANTI E/O DOMINI SPECIFICI. FAREMO RICORSO ALL'USO DELLA MICROSCOPIA CONFOCALE PER DETERMINARE SE UNA QUALSIASI DELLE PROTEINE STUDIATE CO-LOCALIZZA NEI FARETTI POLARI DI PIPX, LA CUI POSIZIONE DINAMICA RISPONDE AI CICLI DI LUCE SCURA. PER DESCRIVERE I GENI REGOLATI DA PIPX INDIPENDENTEMENTE DALL'NTCA, ESEGUIREMO UN'ANALISI TRASCRITTAMICA CON UN PANNELLO DI CEPPO, IN DIVERSE CONDIZIONI DI COLTURA, CHE INCLUDE VARI TIPI DI DERIVATI DEL GENE PIPX E ALTRI GENI CORRELATI. I DATI GENERATI SARANNO UTILIZZATI PER CLASSIFICARE I GENI REGOLATI DIFFERENZIALMENTE IN GRUPPI CON STANDARD NORMATIVI COMUNI, PER POI AFFRONTARE I DIVERSI MECCANISMI DI REGOLAMENTAZIONE COINVOLTI. ESAMINEREMO I SITI PXR UNION UTILIZZANDO CHIP-SEQ, INFORMAZIONI CHE INTEGREREMO CON QUELLE DALL'ANALISI DI TRANSCRIPTOMICA. ESAMINEREMO LA POSSIBILE METILACION DI ARGININS IN PIPX ALPHA-HELICE1 E, SE DEL CASO, STUDIEREMO IL SIGNIFICATO FUNZIONALE E I DETERMINANTI GENETICI DELLE MODIFICHE. SARANNO ANALIZZATE SIA LA METILASI(S) CANDIDATA(E) CHE LE ALTRE PROTEINE PRESENTI NELLA PROTEINA-PROTEINA E/O NELLE INTERAZIONI SILICO. L'INTENZIONE È DI INATTIVARE I GENI CORRISPONDENTI E L'ANALISI FENOTIPICA PERTINENTE. _x000D_ studieremo anche DETAILS MOLECULAR NEL SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, Un adattamento drammatico a diversi tipi di ambiente, in cui NBLR e NTCA-PIPX, entrano in altri regolatori, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. SIAMO INTERESSATI A DECIFRARE ALCUNE DELLE COMPLESSITÀ NORMATIVE, COME IL MECCANISMO DI ATTIVAZIONE E FUNZIONE DI NBLR E LE INTERAZIONI NORMATIVE DEI DIVERSI MODI CHE CONVERGONO NEL PROMOTORE NBLA. MOLTE DELLE STRATEGIE METODOLOGICHE PROPOSTE IN RELAZIONE AL PIPX SARANNO UTILIZZATE ANCHE CON NBLR. (Italian)
16 January 2022
0 references
TSÜANOBAKTERID TEEVAD OXIGENICANI FOTOSÜNTEESI JA KOLONISEERIVAD ENAMIKU VALGUSTATUD ÖKOSÜSTEEMIDEST, NII ET NEIL ON SUUR MÕJU GLOBAALSETELE SÜSINIKU- JA LÄMMASTIKUTSÜKLITELE. VAATAMATA ÖKOLOOGILISELE EDULE JA BIOTEHNOLOOGILISELE TÄHTSUSELE EI OLE SELLE MITMEKÜLGSUSE JA KESKKONNAGA KOHANEMISE SUUTLIKKUSE EEST VASTUTAVAD MEHHANISMID SIISKI VEEL TEADA. SELLEGA SEOSES, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY geneetilist MANIPUATION, on EXCELLENT SÜSTEEMISED REGULATATING INTERACTIONS, mis lubavad CIANOBACTERIAS INTEGRATED JA RESPONDERLY TO MUY DÜSTEEMILINE KESKKONNAAL DYSTEMS._x000D_Esmane proposition on iseloomustada multifuncional PIPX PROTEIN, CIANOBACTERIASe CONCERNING transkriptsioneerivad regulaatorid, signaalimine PROTEINS JA metaboolsed ensüümid NETWORIK OF COMPLETE AND DINAMIC interations. KASUTADES IN VIVO KAASPUHASTAMISE KATSEID LIPU-PIPX-VALGUGA, PÜÜAME LISAKS TOPELTHÜBRIIDSETE PIPX-VALKUDE (XIP-VALGUD), KOLMEKORDSE HÜBRIDISEERIMISE (PXR, MIS ON KINDLAKS TEHTUD NII PII KUI PIPX SÖÖDANA) VÕI SILICO ANALÜÜSI (ORF2060) ABIL TUVASTADA UUSI SIGNAALRADADE KOMPONENTE, KUS PIPX OSALEB. ET ISELOOMUSTADA KOOSTOIMEID (VALKUDE JA VÕIMALIKE MÕJURITE VAHEL) ÜKSIKASJALIKUMALT, KASUTAME IN VITRO JA/VÕI KAHEKORDSEID (KOLMEKORDSEID) HÜBRIIDUURINGUID TÄIELIKE VALKUDE, MUTANTDERIVAATIDE JA/VÕI KONKREETSETE VALDKONDADEGA. KASUTAME KONFOKAALSET MIKROSKOOPIAT, ET TEHA KINDLAKS, KAS MÕNI UURITUD VALKUDEST PAIKNEB PIPX POLAARVALGUSES, MILLE DÜNAAMILINE ASUKOHT REAGEERIB TUMEDA VALGUSE TSÜKLITELE. PIPX-REGULEERITUD GEENIDE KIRJELDAMISEKS NTCA-ST SÕLTUMATULT TEOSTAME TÜVIPANEELIGA TRANSKRIPTOOMILIST ANALÜÜSI ERINEVATES KULTUURITINGIMUSTES, MIS SISALDAVAD PIPX-GEENI ERINEVAID TULETISI JA MUID SELLEGA SEOTUD GEENE. KOGUTUD ANDMEID KASUTATAKSE DIFERENTSIAALREGULEERITUD GEENIDE LIIGITAMISEKS RÜHMADESSE, KUS KEHTIVAD ÜHISED REGULATIIVSED STANDARDID, ET SEEJÄREL KÄSITLEDA ERINEVAID ASJAOMASEID REGULEERIMISMEHHANISME. ME UURIME PXR LIIDU SAITE KASUTADES KIIP-SEQ, TEAVET, ET ME INTEGREERIDA, ET ANALÜÜSI TRANSCRIPTOMICA. UURIME PIPX ALFA-HELICE1S ARGININSIDE VÕIMALIKKU METILACION’I NING UURIME VAJADUSE KORRAL MODIFIKATSIOONIDE FUNKTSIONAALSET TÄHENDUST JA GENEETILISI TEGUREID. ANALÜÜSITAKSE NII KANDIDAATMETÜÜLAAS(ID) KUI KA TEISI VALKE, MIDA LEIDUB VALGU-VALKUDES JA/VÕI RÄNIKOOSTOIMETES. EESMÄRK ON VASTAVATE GEENIDE JA ASJAKOHASE FENOTÜÜBILISE ANALÜÜSI INAKTIVEERIMINE. _x000D_ uurime ka MOLECULAR DETAILS SEMINALISATSIOONID Kloroosi PROCESS, dramaatiline kohanemine erinevate keskkonnatüüpidega, kus NBLR ja NTCA-PIPX sisenevad teistele reguleerivatele asutustele, lähenemine NBLA edendajale, oluline Physiobilisoomide degratatsiooniks. ME OLEME HUVITATUD MÕNE REGULATIIVSE KEERUKUSE DEŠIFREERIMISEST, NÄITEKS NBLRI AKTIVEERIMISE JA TOIMIMISE MEHHANISMIST NING NBLA EDENDAJA ERINEVATE LÄHENEMISVIISIDE REGULATIIVSEST VASTASMÕJUST. PALJUSID PIPXI KOHTA ESITATUD METOODILISI STRATEEGIAID KASUTATAKSE KA NBLRI PUHUL. (Estonian)
4 August 2022
0 references
CIANOBAKTERIJOS ATLIEKA OXIGENICAN FOTOSINTEZĘ IR KOLONIZUOJA DAUGUMĄ APŠVIESTŲ EKOSISTEMŲ, TODĖL JOS TURI DIDELĮ POVEIKĮ PASAULINIAMS ANGLIES IR AZOTO CIKLAMS. TAČIAU, NEPAISANT JOS EKOLOGINĖS SĖKMĖS IR BIOTECHNOLOGINĖS SVARBOS, MECHANIZMAI, ATSAKINGI UŽ ŠĮ ĮVAIRIAPUSIŠKUMĄ IR GEBĖJIMĄ PRISITAIKYTI PRIE APLINKOS APSAUGOS, LIEKA NEŽINOMI. ŠIAME KONTEKSTE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY genetinės MANIPUACIJOS, yra puikus SISTEMA REGULATacinių INTERACIONŲ, leidžiančių CIANOBACTERIAS INTEGRATED ir RESPONDERLY SU MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Pagrindinis šio projekto pasiūlymas yra apibūdinti multifuncionalinį PIPX PROTEIN, JT CIANOBACTERIAS, dalyvaujantis transkripcijos reguliatoriams, signalizuojantiems PROTEINS IR metaboliniams fermentams, dalyvaujant komplemento ir DINAMIC intervencijų tinkleliams. ATLIKDAMI IN VIVO BENDRO GRYNINIMO BANDYMUS SU VĖLIAVŲ PIPX BALTYMU, SIEKIAME NUSTATYTI NAUJUS SIGNALIZAVIMO BŪDŲ, KURIUOSE DALYVAUJA PIPX, KOMPONENTUS, TAIP PAT PATVIRTINAME SĄVEIKĄ IR ANKSTESNIUS DVIGUBO HIBRIDIZUOTŲ PIPX (XIP BALTYMŲ), TRIGUBOS HIBRIDIZACIJOS (PXR, IDENTIFIKUOJAMOS NAUDOJANT PII IR PIPX KAIP MASALĄ) ARBA SILIKATO ANALIZĖS (ORF2060) REZULTATUS. NORĖDAMI IŠSAMIAU APIBŪDINTI SĄVEIKĄ (TARP BALTYMŲ IR GALIMŲ EFEKTŲ), MES NAUDOSIME IN VITRO IR (ARBA) DVIGUBUS (TRIGUBUS) HIBRIDINIUS TYRIMUS SU VISAIS BALTYMAIS, MUTANTAIS IR (ARBA) SPECIFINĖMIS SRITIMIS. MES KREIPSIMĖS Į KONFOKALINĖS MIKROSKOPIJOS NAUDOJIMĄ, KAD NUSTATYTUME, AR KURIS NORS IŠ BALTYMŲ TIRTAS KOLOKALIZĖS POLIARINIUOSE PIPX PROŽEKTORIUOSE, KURIŲ DINAMIŠKA VIETA REAGUOJA Į TAMSIOS ŠVIESOS CIKLUS. NORĖDAMI APIBŪDINTI PIPX REGULIUOJAMUS GENUS NEPRIKLAUSOMAI NUO NTCA, MES ATLIKSIME TRANSKRIPTOMINĘ ANALIZĘ SU PADERMĖS SKYDELIU SKIRTINGOMIS KULTŪROS SĄLYGOMIS, APIMANČIOMIS ĮVAIRIŲ TIPŲ PIPX GENO DARINIUS IR KITUS SUSIJUSIUS GENUS. GAUTI DUOMENYS BUS NAUDOJAMI KLASIFIKUOJANT SKIRTINGAI REGULIUOJAMUS GENUS Į GRUPES, KURIOMS TAIKOMI BENDRI REGULIAVIMO STANDARTAI, KAD BŪTŲ ATSIŽVELGTA Į ĮVAIRIUS SUSIJUSIUS REGULIAVIMO MECHANIZMUS. MES TIRSIME PXR SĄJUNGOS SVETAINES NAUDODAMI LUSTĄ-SEQ, INFORMACIJĄ, KURIĄ INTEGRUOSIME SU TRANSCRIPTOMICA ANALIZE. MES IŠTIRSIME GALIMĄ ARGININS METILACIONĄ PIPX ALFA-HELICE1 IR, JEI REIKIA, IŠNAGRINĖSIME PAKEITIMŲ FUNKCINĘ REIKŠMĘ IR GENETINIUS VEIKSNIUS. BUS ANALIZUOJAMOS IR POTENCIALIOS METILAZĖS (-Ų), IR KITŲ BALTYMŲ, APTINKAMŲ BALTYMŲ BALTYMUOSE IR (ARBA) SILIKAGOLIO SĄVEIKOSE, TYRIMAI. KETINAMA NEAKTYVINTI ATITINKAMUS GENUS IR ATITINKAMĄ FENOTIPINĘ ANALIZĘ. _x000D_ mes taip pat studijuos MOLECULAR DETAI SEMINALIZACIJOS PROCESAS chlorosis, dramatiškas prisitaikymas prie įvairių tipų aplinkos, kurioje NBLR ir NTCA-PIPX, įvesti kitus reguliuotojus, Konverge už NBLA Promotor, esential for The Degratation of Physiobilisomas. ESAME SUINTERESUOTI IŠŠIFRUOTI KAI KURIUOS REGULIAVIMO SUDĖTINGUMĄ, PVZ., NBLR AKTYVAVIMO IR FUNKCIJOS MECHANIZMĄ IR ĮVAIRIŲ BŪDŲ, KURIE SUSILIEJA SU NBLA PROJEKTO RENGĖJU, REGULIAVIMO SĄVEIKĄ. DAUGELIS SIŪLOMŲ METODOLOGINIŲ STRATEGIJŲ, SUSIJUSIŲ SU PIPX, TAIP PAT BUS TAIKOMOS SU NBLR. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
CIJANOBAKTERIJE IZVODE OXIGENICAN FOTOSINTEZU I KOLONIZIRAJU VEĆINU OSVIJETLJENIH EKOSUSTAVA, TAKO DA IMAJU VELIK UTJECAJ NA GLOBALNE CIKLUSE UGLJIKA I DUŠIKA. MEĐUTIM, UNATOČ EKOLOŠKOM USPJEHU I BIOTEHNOLOŠKOJ VAŽNOSTI, MEHANIZMI KOJI SU ODGOVORNI ZA TU SVESTRANOST I SPOSOBNOST PRILAGODBE OKOLIŠA I DALJE SU NEPOZNATI. U TOM KONTEKSTU, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, Od RELATIVNO FACILITY genetički MANIPUATION, IZVJEŠĆE SUSTAVNI SUSTAV ZA STUDIJE REGULATING INTERACTIONS koji dopuštaju CIANOBACTERIAS INTEGRATED I RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Primarni prijedlog ovog projekta je karakterizirati multifuncionalni PIPX PROTEIN, a UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING transkripcijski regulatori, Signalizing PROTEINS I metabolički enzimas U MREŽU COMPLETE I DINAMIC interations. KORIŠTENJEM IN VIVO KO-PROČIŠĆAVANJA S PROTEINOM FLAG-PIPX NASTOJIMO IDENTIFICIRATI NOVE KOMPONENTE SIGNALNIH PUTOVA U KOJIMA SUDJELUJE PIPX, UZ VALIDACIJU INTERAKCIJA I PRETHODNIH REZULTATA DVOSTRUKO HIBRIDIZIRANIH PIPX (XIP PROTEINA), TROSTRUKE HIBRIDIZACIJE (PXR, IDENTIFICIRANE POMOĆU PII I PIPX KAO MAMAC) ILI U SILICO ANALIZI (ORF2060). KAKO BISMO DETALJNIJE OKARAKTERIZIRALI INTERAKCIJE (IZMEĐU PROTEINA I S MOGUĆIM EFEKTORIMA), KORISTIT ĆEMO IN VITRO I/ILI DVOSTRUKA (TROSTRUKA) HIBRIDNA ISPITIVANJA S POTPUNIM PROTEINIMA, DERIVATIMA MUTANATA I/ILI SPECIFIČNIM DOMENAMA. MI ĆEMO POSEGNUTI ZA KORIŠTENJEM KONFOKALNE MIKROSKOPIJE KAKO BISMO UTVRDILI JE LI BILO KOJI OD PROTEINA PROUČAVAN KO-LOKALIZIRA U POLARNIM REFLEKTORIMA PIPX, ČIJA DINAMIČKA LOKACIJA REAGIRA NA CIKLUSE TAMNE SVJETLOSTI. ZA OPIS GENA REGULIRANIH PIPX-OM NEOVISNO O NTCA, IZVRŠIT ĆEMO TRANSKRIPTOMSKU ANALIZU POMOĆU SOJA PLOČE, U RAZLIČITIM UVJETIMA KULTURE, KOJA UKLJUČUJE RAZLIČITE VRSTE DERIVATA PIPX GENA I DRUGE SRODNE GENE. DOBIVENI PODACI UPOTREBLJAVAT ĆE SE ZA RAZVRSTAVANJE RAZLIČITO REGULIRANIH GENA U SKUPINE SA ZAJEDNIČKIM REGULATORNIM STANDARDIMA, A ZATIM ZA RJEŠAVANJE RAZLIČITIH UKLJUČENIH REGULATORNIH MEHANIZAMA. ISTRAŽIT ĆEMO LOKACIJE PXR UNIJE KORISTEĆI ČIP-SEQ, INFORMACIJE KOJE ĆEMO S NJIMA INTEGRIRATI IZ ANALIZE TRANSCRIPTOMICA. ISTRAŽIT ĆEMO MOGUĆI METILACION ARGININS U PIPX ALFA-HELICE1 I, PREMA POTREBI, PROUČITI FUNKCIONALNO ZNAČENJE I GENETSKE ODREDNICE IZMJENA. ANALIZIRAT ĆE SE I METILAZE KANDIDATA I DRUGE BJELANČEVINE PRONAĐENE U INTERAKCIJAMA BJELANČEVINA I/ILI SILICIJA. NAMJERA JE NEAKTIVIRATI ODGOVARAJUĆE GENE I RELEVANTNU FENOTIPSKU ANALIZU. _x000D_ također ćemo proučavati MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS of chlorosis, A dramatična prilagodba različitim vrstama okoliša, u kojoj NBLR i NTCA-PIPX, ulaze u druge regulatore, Converge za Promotor NBLA, esencijal za degraciju fiziobilisoma. ZAINTERESIRANI SMO ZA DEŠIFRIRANJE NEKIH REGULATORNIH SLOŽENOSTI, KAO ŠTO SU MEHANIZAM AKTIVACIJE I FUNKCIJE NBLR-A TE REGULATORNE INTERAKCIJE RAZLIČITIH NAČINA KOJI SE KONVERGIRAJU U PROMOTORU NBLA-A. MNOGE METODOLOŠKE STRATEGIJE PREDLOŽENE U VEZI S PIPX-OM TAKOĐER ĆE SE KORISTITI S NBLR-OM. (Croatian)
4 August 2022
0 references
ΚΥΑΝΟΒΑΚΤΉΡΙΑ ΕΚΤΕΛΟΎΝ OXIGENICAN ΦΩΤΟΣΎΝΘΕΣΗ ΚΑΙ ΑΠΟΙΚΊΖΟΥΝ ΤΗΝ ΠΛΕΙΟΨΗΦΊΑ ΤΩΝ ΦΩΤΙΣΜΈΝΩΝ ΟΙΚΟΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ, ΈΤΣΙ ΈΧΟΥΝ ΜΕΓΆΛΗ ΕΠΊΔΡΑΣΗ ΣΤΟΥΣ ΠΑΓΚΌΣΜΙΟΥΣ ΚΎΚΛΟΥΣ ΆΝΘΡΑΚΑ ΚΑΙ ΑΖΏΤΟΥ. ΩΣΤΌΣΟ, ΠΑΡΆ ΤΗΝ ΟΙΚΟΛΟΓΙΚΉ ΕΠΙΤΥΧΊΑ ΚΑΙ ΤΗ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΉ ΣΗΜΑΣΊΑ ΤΗΣ, ΟΙ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΥΠΕΎΘΥΝΟΙ ΓΙΑ ΑΥΤΉ ΤΗΝ ΕΥΕΛΙΞΊΑ ΚΑΙ ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΉΣ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉΣ ΠΑΡΑΜΈΝΟΥΝ ΆΓΝΩΣΤΟΙ. ΣΤΟ ΠΛΑΊΣΙΟ ΑΥΤΌ, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, ΤΗΣ ΣΧΕΤΙΚΑ ΜΕ ΤΗΝ γενετική ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗ ΤΩΝ ΚΙΑΝΟΒΑΚΤΗΡΙΩΝ, είναι ένα εξαιρετικό σύστημα για τη Μελέτη των REGULATING INTERACTIONS που επιτρέπουν τη CIANOBACTERIAS INTEGRATED ΚΑΙ RESPONDERLY TO MUY DYSTEMAL DYSTEMS._x000D_ Η κύρια πρόταση αυτού του έργου είναι να χαρακτηρίσει το πολυφουγκονικό PIPX PROTEIN, ΕΝΑΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΚΙΑΝΟΒΑΚΤΕΡΙΩΝ ΣΧΕΤΙΚΑ ΜΕ ΡΥΘΜΙΣΤΕΣ μεταγραφής, Σήμανση ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ και μεταβολικά ενζυμα σε ΔΙΚΤΥΟ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΩΝ και ΔΡΑΜΙΚΩΝ ΔΙΑΤΑΞΕΩΝ. ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ ΔΟΚΙΜΈΣ ΣΥΝ-ΚΑΘΑΡΙΣΜΟΎ IN VIVO ΜΕ ΤΗΝ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΗ FLAG-PIPX, ΣΤΟΧΕΎΟΥΜΕ ΣΤΟΝ ΕΝΤΟΠΙΣΜΌ ΝΈΩΝ ΣΥΣΤΑΤΙΚΏΝ ΤΩΝ ΟΔΏΝ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΣΤΙΣ ΟΠΟΊΕΣ ΣΥΜΜΕΤΈΧΕΙ ΤΟ PIPX, ΕΚΤΌΣ ΑΠΌ ΤΗΝ ΕΠΙΚΎΡΩΣΗ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΩΝ ΚΑΙ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΩΝ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΆΤΩΝ ΑΠΌ ΔΙΠΛΌ ΥΒΡΙΔΟΠΟΙΗΜΈΝΟ PIPX (ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ XIP), ΤΡΙΠΛΌ ΥΒΡΙΔΙΣΜΌ (PXR, ΠΟΥ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΖΕΤΑΙ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΤΌΣΟ PII ΌΣΟ ΚΑΙ PIPX ΩΣ ΔΌΛΩΜΑ) Ή ΣΕ ΑΝΆΛΥΣΗ SILICO (ORF2060). ΓΙΑ ΝΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΣΟΥΜΕ ΛΕΠΤΟΜΕΡΈΣΤΕΡΑ ΤΙΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ (ΜΕΤΑΞΎ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ ΚΑΙ ΜΕ ΠΙΘΑΝΟΎΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ), ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΉΣΟΥΜΕ IN VITRO Ή/ΚΑΙ ΔΙΠΛΈΣ (ΤΡΙΠΛΈΣ) ΥΒΡΙΔΙΚΈΣ ΔΟΚΙΜΈΣ ΜΕ ΠΛΉΡΕΙΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ, ΠΑΡΆΓΩΓΑ ΜΕΤΆΛΛΑΞΗΣ Ή/ΚΑΙ ΕΙΔΙΚΟΎΣ ΤΟΜΕΊΣ. ΘΑ ΚΑΤΑΦΎΓΟΥΜΕ ΣΤΗ ΧΡΉΣΗ ΤΗΣ ΣΥΝΟΜΟΣΠΟΝΔΙΑΚΉΣ ΜΙΚΡΟΣΚΟΠΊΑΣ ΓΙΑ ΝΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΣΟΥΜΕ ΑΝ ΚΆΠΟΙΑ ΑΠΌ ΤΙΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΠΟΥ ΜΕΛΕΤΉΘΗΚΑΝ ΑΠΌ ΚΟΙΝΟΎ ΕΝΤΟΠΊΖΕΤΑΙ ΣΤΟΥΣ ΠΟΛΙΚΟΎΣ ΠΡΟΒΟΛΕΊΣ ΤΟΥ PIPX, Η ΔΥΝΑΜΙΚΉ ΘΈΣΗ ΤΟΥ ΟΠΟΊΟΥ ΑΝΤΑΠΟΚΡΊΝΕΤΑΙ ΣΕ ΚΎΚΛΟΥΣ ΣΚΟΤΕΙΝΟΎ ΦΩΤΌΣ. ΓΙΑ ΝΑ ΠΕΡΙΓΡΆΨΟΥΜΕ ΤΑ ΓΟΝΊΔΙΑ ΠΟΥ ΡΥΘΜΊΖΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ PIPX ΑΝΕΞΆΡΤΗΤΑ ΑΠΌ ΤΟ NTCA, ΘΑ ΕΚΤΕΛΈΣΟΥΜΕ ΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ ΜΕ ΜΙΑ ΟΜΆΔΑ ΣΤΕΛΕΧΏΝ, ΥΠΌ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑΣ, Η ΟΠΟΊΑ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΕΙ ΔΙΆΦΟΡΟΥΣ ΤΎΠΟΥΣ ΠΑΡΑΓΏΓΩΝ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΊΟΥ PIPX ΚΑΙ ΆΛΛΑ ΣΥΝΑΦΉ ΓΟΝΊΔΙΑ. ΤΑ ΠΑΡΑΓΌΜΕΝΑ ΔΕΔΟΜΈΝΑ ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΓΙΑ ΤΗΝ ΤΑΞΙΝΌΜΗΣΗ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΠΟΥ ΥΠΌΚΕΙΝΤΑΙ ΣΕ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΙΗΜΈΝΗ ΡΎΘΜΙΣΗ ΣΕ ΟΜΆΔΕΣ ΜΕ ΚΟΙΝΆ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΆ ΠΡΌΤΥΠΑ, ΏΣΤΕ ΝΑ ΑΝΤΙΜΕΤΩΠΙΣΤΟΎΝ ΟΙ ΔΙΆΦΟΡΟΙ ΣΧΕΤΙΚΟΊ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΟΊ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ. ΘΑ ΔΙΕΡΕΥΝΉΣΟΥΜΕ ΤΙΣ ΤΟΠΟΘΕΣΊΕΣ PXR UNION ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ CHIP-SEQ, ΠΛΗΡΟΦΟΡΊΕΣ ΠΟΥ ΘΑ ΕΝΣΩΜΑΤΏΣΟΥΜΕ ΜΕ ΑΥΤΈΣ ΑΠΌ ΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΗΣ TRANSCRIPTOMICA. ΘΑ ΔΙΕΡΕΥΝΉΣΟΥΜΕ ΤΗΝ ΠΙΘΑΝΉ ΜΕΤΡΗΣΗ ΑΡΓΙΝΙΟΝΩΝ ΣΤΟ PIPX ALPHA-HELICE1 ΚΑΙ, ΚΑΤΆ ΠΕΡΊΠΤΩΣΗ, ΘΑ ΜΕΛΕΤΉΣΟΥΜΕ ΤΗ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΉ ΣΗΜΑΣΊΑ ΚΑΙ ΤΟΥΣ ΓΕΝΕΤΙΚΟΎΣ ΚΑΘΟΡΙΣΤΙΚΟΎΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ ΤΩΝ ΤΡΟΠΟΠΟΙΉΣΕΩΝ. ΘΑ ΑΝΑΛΥΘΟΎΝ ΤΌΣΟ Η ΥΠΟΨΉΦΙΑ ΜΕΘΥΛΆΣΗ ΌΣΟ ΚΑΙ ΆΛΛΕΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΠΟΥ ΒΡΊΣΚΟΝΤΑΙ ΣΕ ΠΡΩΤΕΪΝΙΚΈΣ-ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΚΑΙ/Ή ΣΕ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ ΜΕ ΠΥΡΊΤΙΟ. Η ΠΡΌΘΕΣΗ ΕΊΝΑΙ ΝΑ ΑΔΡΑΝΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΤΑ ΑΝΤΊΣΤΟΙΧΑ ΓΟΝΊΔΙΑ ΚΑΙ Η ΣΧΕΤΙΚΉ ΦΑΙΝΟΤΥΠΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ. _x000D_ θα μελετήσουμε επίσης MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, Μια δραματική προσαρμογή σε διάφορους τύπους περιβάλλοντος, στο οποίο το NBLR και το NTCA-PIPX, εισέρχονται σε άλλους ρυθμιστές, συγκλίνουν για την προώθηση του NBLA, απαραίτητη για την απογοήτευση των Φυσιοβιλισωμάτων. ΜΑΣ ΕΝΔΙΑΦΈΡΕΙ ΝΑ ΑΠΟΚΡΥΠΤΟΓΡΑΦΉΣΟΥΜΕ ΟΡΙΣΜΈΝΕΣ ΑΠΌ ΤΙΣ ΚΑΝΟΝΙΣΤΙΚΈΣ ΠΟΛΥΠΛΟΚΌΤΗΤΕΣ, ΌΠΩΣ Ο ΜΗΧΑΝΙΣΜΌΣ ΕΝΕΡΓΟΠΟΊΗΣΗΣ ΚΑΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑΣ ΤΗΣ NBLR ΚΑΙ ΟΙ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΈΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ ΤΩΝ ΔΙΑΦΌΡΩΝ ΤΡΌΠΩΝ ΠΟΥ ΣΥΓΚΛΊΝΟΥΝ ΣΤΟΝ ΦΟΡΈΑ ΠΡΟΏΘΗΣΗΣ ΤΗΣ NBLA. ΠΟΛΛΈΣ ΑΠΌ ΤΙΣ ΜΕΘΟΔΟΛΟΓΙΚΈΣ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΈΣ ΠΟΥ ΠΡΟΤΕΊΝΟΝΤΑΙ ΣΕ ΣΧΈΣΗ ΜΕ ΤΟ PIPX ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΕΠΊΣΗΣ ΜΕ ΤΟ NBLR. (Greek)
4 August 2022
0 references
CYANOBAKTÉRIE VYKONÁVAJÚ FOTOSYNTÉZU OXIGENICAN A KOLONIZUJÚ VÄČŠINU OSVETLENÝCH EKOSYSTÉMOV, TAKŽE MAJÚ VEĽKÝ VPLYV NA GLOBÁLNE CYKLY UHLÍKA A DUSÍKA. NAPRIEK SVOJMU EKOLOGICKÉMU ÚSPECHU A BIOTECHNOLOGICKÉMU VÝZNAMU VŠAK MECHANIZMY ZODPOVEDNÉ ZA TÚTO VŠESTRANNOSŤ A SCHOPNOSŤ PRISPÔSOBIŤ SA ŽIVOTNÉMU PROSTREDIU ZOSTÁVAJÚ NEZNÁME. V TEJTO SÚVISLOSTI SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, Z RELATIVELY FACILITY genetické MANIPUATION, je EXCELLENT SYSTEM pre ŠTUDY REGULATNÉ INTERACTIONS umožňujúce CIANOBACTERIAS INTEGRATED A RESPONDERLY MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Primárnym návrhom tohto projektu je charakterizovať multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING transkripčných regulátorov, Signalizačné PROTEINY a metabolické zážiny v sieti COMPLETE a DINAMIC interakciách. POMOCOU SKÚŠOK KOPURIFIKÁCIE IN VIVO S PROTEÍNOM FLAG-PIPX SA SNAŽÍME IDENTIFIKOVAŤ NOVÉ ZLOŽKY SIGNALIZAČNÝCH DRÁH, NA KTORÝCH SA PIPX ZÚČASTŇUJE, OKREM VALIDÁCIE INTERAKCIÍ A PREDCHÁDZAJÚCICH VÝSLEDKOV Z DVOJITEJ HYBRIDNEJ PIPX (XIP PROTEÍNOV), TROJITEJ HYBRIDIZÁCIE (PXR, IDENTIFIKOVANEJ POMOCOU PII AJ PIPX AKO NÁVNADY) ALEBO IN SILICO ANALÝZY (ORF2060). NA PODROBNEJŠIE CHARAKTERIZOVANIE INTERAKCIÍ (MEDZI PROTEÍNMI A MOŽNÝMI EFEKTORMI) POUŽIJEME IN VITRO A/ALEBO DVOJITÉ (TRIPLE) HYBRIDNÉ ŠTÚDIE S KOMPLETNÝMI PROTEÍNMI, MUTANTNÝMI DERIVÁTMI A/ALEBO ŠPECIFICKÝMI DOMÉNAMI. UCHÝLIME SA K POUŽITIU KONFOKÁLNEJ MIKROSKOPIE, ABY SME ZISTILI, ČI NIEKTORÝ Z SKÚMANÝCH PROTEÍNOV SPOLULOKUJE V POLÁRNYCH REFLEKTOROCH PIPX, KTORÝCH DYNAMICKÁ POLOHA REAGUJE NA CYKLY TMAVÉHO SVETLA. AK CHCETE OPÍSAŤ PIPX-REGULOVANÉ GÉNY NEZÁVISLE OD NTCA, VYKONÁME TRANSKRIPTOMICKÚ ANALÝZU S KMEŇOVÝM PANELOM ZA RÔZNYCH KULTIVAČNÝCH PODMIENOK, KTORÝ ZAHŔŇA RÔZNE TYPY DERIVÁTOV GÉNU PIPX A ĎALŠIE SÚVISIACE GÉNY. ZÍSKANÉ ÚDAJE SA POUŽIJÚ NA KLASIFIKÁCIU DIFERENCOVANE REGULOVANÝCH GÉNOV DO SKUPÍN SO SPOLOČNÝMI REGULAČNÝMI NORMAMI, ABY SA POTOM RIEŠILI RÔZNE PRÍSLUŠNÉ REGULAČNÉ MECHANIZMY. BUDEME SKÚMAŤ STRÁNKY PXR UNION POMOCOU ČIP-SEQ, INFORMÁCIE, KTORÉ BUDEME INTEGROVAŤ S TÝM Z ANALÝZY TRANSCRIPTOMICA. PRESKÚMAME MOŽNÝ METILACION ARGININS V PIPX ALFA-HELICE1 A V PRÍPADE POTREBY PRESKÚMAME FUNKČNÝ VÝZNAM A GENETICKÉ DETERMINANTY MODIFIKÁCIÍ. ANALYZUJÚ SA TAK KANDIDÁTSKE METYLÁZY, AKO AJ INÉ PROTEÍNY, KTORÉ SA NACHÁDZAJÚ V PROTEÍNOVÝCH A/ALEBO SILIKOVÝCH INTERAKCIÁCH. ZÁMEROM JE NEAKTIVOVAŤ ZODPOVEDAJÚCE GÉNY A PRÍSLUŠNÚ FENOTYPOVÚ ANALÝZU. _x000D_ budeme tiež študovať MOLECULAR DETAILS V SEMINALIZÁCIA robí PROCESS of chlorosis, Dramatická adaptácia na rôzne typy prostredia, v ktorom NBLR a NTCA-PIPX, vstúpiť do iných regulátorov, Converge for the Promotor of the NBLA, esential for the Degratation of Physiobilisomas. MÁME ZÁUJEM O DEŠIFROVANIE NIEKTORÝCH REGULAČNÝCH KOMPLEXOV, AKO JE MECHANIZMUS AKTIVÁCIE A FUNKCIE NBLR A REGULAČNÉ INTERAKCIE RÔZNYCH SPÔSOBOV, KTORÉ SA ZBLIŽUJÚ V PODPOROVATEĽOVI NBLA. MNOHÉ Z METODICKÝCH STRATÉGIÍ NAVRHNUTÝCH V SÚVISLOSTI S PIPX SA POUŽIJÚ AJ V PRÍPADE NBLR. (Slovak)
4 August 2022
0 references
SYANOBAKTEERIT SUORITTAVAT OXIGENICAN FOTOSYNTEESIN JA KOLONISOIVAT SUURIMMAN OSAN VALAISTUISTA EKOSYSTEEMEISTÄ, JOTEN NIILLÄ ON SUURI VAIKUTUS MAAILMANLAAJUISIIN HIILI- JA TYPPIKIERTOIHIN. EKOLOGISESTA MENESTYKSESTÄ JA BIOTEKNOLOGISESTA MERKITYKSESTÄ HUOLIMATTA TÄHÄN MONIPUOLISUUTEEN JA KYKYYN SOPEUTUA YMPÄRISTÖÖN LIITTYVIÄ MEKANISMEJA EI TUNNETA. TÄSSÄ YHTEYDESSÄ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY FACILITY MAKSUT, on ERITYINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN SYSTEMINEN KOSKEVAT KÄYTTÖJÄRJESTELMÄT, jotka sallivat CIANOBACTERIAAT INTEGRATTI JA VASTAUKSEN KÄYTTÖN DYSTEMSÄ._x000D_ Tämän hankkeen ensisijainen ehdotus on luonnehtia monifuncional PIPX PROTEIN, CIANOBACTERIAS CONCERNING transkriptionaaliset säätimet, jotka merkitsevät PROTEINeja ja metabolisia entsiomaja COMPLETE- ja DINAMIC-interferaatioissa. KÄYTTÄMÄLLÄ IN VIVO -YHTEISPUHDISTUSKOKEITA LIPPU-PIPX-PROTEIININ KANSSA PYRIMME TUNNISTAMAAN UUSIA KOMPONENTTEJA SIGNAALIREITEILLÄ, JOIHIN PIPX OSALLISTUU, SEN LISÄKSI, ETTÄ VALIDOIDAAN VUOROVAIKUTUKSET JA AIEMMAT TULOKSET KAKSOISHYBRIDOIDUISTA PIPX-PROTEIINEISTA (XIP-PROTEIINEISTA), KOLMINKERTAISESTA HYBRIDISAATIOSTA (PXR, JOKA TUNNISTETAAN SEKÄ PII:N ETTÄ PIPX:N AVULLA SYÖTIKSI) TAI SILIKOANALYYSISTA (ORF2060). INTERAKTIOIDEN (PROTEIINIEN JA MAHDOLLISTEN VAIKUTTIMIEN) LUONNEHTIMISEKSI YKSITYISKOHTAISEMMIN KÄYTÄMME IN VITRO – JA/TAI KAKSOISHYBRIDITUTKIMUKSIA, JOISSA KÄYTETÄÄN KOKONAISIA PROTEIINEJA, MUTANTTIJOHDANNAISIA JA/TAI TIETTYJÄ VERKKOTUNNUKSIA. KÄYTÄMME KONFOKAALISTA MIKROSKOPIAA SELVITTÄÄKSEMME, ONKO JOKIN TUTKITUISTA PROTEIINEISTA PAIKANNETTU PIPX: N NAPAVALOISSA, JOIDEN DYNAAMINEN SIJAINTI REAGOI TUMMAN VALON SYKLEIHIN. KUVATAKSEMME PIPX-SÄÄNNELLYT GEENIT NTCA: STA RIIPPUMATTA, SUORITAMME TRANSKRIMAATTIANALYYSIN KANTAPANEELILLA ERILAISISSA VILJELYOLOSUHTEISSA, JOIHIN SISÄLTYY ERILAISIA PIPX-GEENIN JOHDANNAISIA JA MUITA VASTAAVIA GEENEJÄ. TUOTETTUJA TIETOJA KÄYTETÄÄN ERIYTETYSTI SÄÄNNELTYJEN GEENIEN LUOKITTELEMISEEN RYHMIIN, JOILLA ON YHTEISET SÄÄNTELYSTANDARDIT, JOTTA VOIDAAN KÄSITELLÄ ASIAAN LIITTYVIÄ ERILAISIA SÄÄNTELYMEKANISMEJA. TUTKIMME PXR UNIONIN SIVUSTOJA KÄYTTÄEN SIRU-SEQ, TIETOJA, JOTKA INTEGROIMME ETTÄ ANALYYSI TRANSCRIPIPTOMICA. TUTKIMME ARGININS-VALMISTEEN MAHDOLLISTA METILACIONIA PIPX ALFA-HELICE1:SSÄ JA TUTKIMME TARVITTAESSA MUUTOSTEN TOIMINNALLISTA MERKITYSTÄ JA GENEETTISIÄ TAUSTATEKIJÖITÄ. SEKÄ EHDOKASMETYYLIAASI(T) ETTÄ MUUT PROTEIINI-PROTEIININ JA/TAI PIIN VUOROVAIKUTUKSESSA ESIINTYVÄT PROTEIINIT ANALYSOIDAAN. TARKOITUKSENA ON OLLA INAKTIIVISESTI VASTAAVAT GEENIT JA ASIAANKUULUVA FENOTYYPPINEN ANALYYSI. _x000D_ tutkimme myös MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, A dramaattista sopeutumista erityyppisiin ympäristöihin, joissa NBLR ja NTCA-PIPX tulevat muihin sääntelyviranomaisiin, lähentyvät NBLA: n edistäjää, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. OLEMME KIINNOSTUNEITA TULKITSEMAAN JOITAKIN SÄÄNTELYYN LIITTYVIÄ MONIMUTKAISUUKSIA, KUTEN NBLR:N AKTIVOINTI- JA TOIMINTAMEKANISMIA SEKÄ NBLA-PROMOOTTORISSA LÄHENTYVIEN ERI TAPOJEN SÄÄNTELYYN LIITTYVÄÄ VUOROVAIKUTUSTA. MONIA PIPX-MENETELMÄÄ VARTEN EHDOTETTUJA MENETELMIÄ KÄYTETÄÄN MYÖS YHDESSÄ NBLR:N KANSSA. (Finnish)
4 August 2022
0 references
CYJANOBAKTERIE WYKONUJĄ FOTOSYNTEZĘ OXIGENICAN I KOLONIZUJĄ WIĘKSZOŚĆ PODŚWIETLONYCH EKOSYSTEMÓW, DZIĘKI CZEMU MAJĄ OGROMNY WPŁYW NA ŚWIATOWY CYKL WĘGLOWY I AZOTOWY. NIEMNIEJ JEDNAK, POMIMO SUKCESU EKOLOGICZNEGO I ZNACZENIA BIOTECHNOLOGICZNEGO, MECHANIZMY ODPOWIEDZIALNE ZA TĘ WSZECHSTRONNOŚĆ I ZDOLNOŚĆ DO PRZYSTOSOWANIA SIĘ DO ŚRODOWISKA POZOSTAJĄ NIEZNANE. W TYM KONTEKŚCIE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY genetyczna MANIPUATION, JEST EXCELLENT SYSTEM FOR THE STUDY OF THE REGULATING INTERACTIONS pozwalając CIANOBACTERIAS INTEGRATED I RESPONDERLY DO MUY DYSTEMALNE DYSTEMALNE ŚRODKI._x000D_ Podstawową propozycją tego projektu jest scharakteryzowanie multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING regulatorów transkrypcyjnych, sygnalizujących i enzimas metabolicznych w NETWORK COMPLETE I DINAMIC interations. WYKORZYSTUJĄC BADANIA IN VIVO KO-OCZYSZCZANIA BIAŁKA FLAG-PIPX, STARAMY SIĘ ZIDENTYFIKOWAĆ NOWE SKŁADNIKI ŚCIEŻEK SYGNALIZACYJNYCH, W KTÓRYCH UCZESTNICZY PIPX, OPRÓCZ WALIDOWANIA INTERAKCJI I WCZEŚNIEJSZYCH WYNIKÓW Z PODWÓJNEJ HYBRYDYZACJI PIPX (BIAŁKA XIP), POTRÓJNEJ HYBRYDYZACJI (PXR, IDENTYFIKOWANEJ ZA POMOCĄ ZARÓWNO PII, JAK I PIPX JAKO PRZYNĘTY) LUB ANALIZY SILICO (ORF2060). ABY BARDZIEJ SZCZEGÓŁOWO SCHARAKTERYZOWAĆ INTERAKCJE (POMIĘDZY BIAŁKAMI I MOŻLIWYMI EFEKTORAMI), WYKORZYSTAMY BADANIA IN VITRO I/LUB PODWÓJNE (POTRÓJNE) HYBRYDOWE Z KOMPLETNYMI BIAŁKAMI, POCHODNYMI MUTACJI I/LUB KONKRETNYMI DOMENAMI. SKORZYSTAMY Z MIKROSKOPII KONFOKALNEJ, ABY USTALIĆ, CZY KTÓREKOLWIEK Z BADANYCH BIAŁEK WSPÓŁLOKUJE SIĘ W POLARNYCH REFLEKTORACH PIPX, KTÓRYCH DYNAMICZNA LOKALIZACJA REAGUJE NA CYKLE CIEMNEGO ŚWIATŁA. ABY OPISAĆ GENY REGULOWANE PRZEZ PIPX NIEZALEŻNIE OD NTCA, PRZEPROWADZIMY ANALIZĘ TRANSKRYPTOMICZNĄ Z PANELEM SZCZEPÓW, W RÓŻNYCH WARUNKACH KULTUROWYCH, KTÓRA OBEJMUJE RÓŻNE RODZAJE POCHODNYCH GENU PIPX I INNE POWIĄZANE GENY. UZYSKANE DANE ZOSTANĄ WYKORZYSTANE DO KLASYFIKACJI GENÓW UREGULOWANYCH W RÓŻNY SPOSÓB NA GRUPY O WSPÓLNYCH NORMACH REGULACYJNYCH, ABY NASTĘPNIE UWZGLĘDNIĆ RÓŻNE MECHANIZMY REGULACYJNE. ZBADAMY STRONY PXR UNION Z WYKORZYSTANIEM CHIP-SEQ, INFORMACJE, KTÓRE ZINTEGRUJEMY Z TYM Z ANALIZY TRANSCRIPTOMICA. ZBADAMY EWENTUALNĄ METILACJĘ ARGININS W PIPX ALPHA-HELICE1 I, W STOSOWNYCH PRZYPADKACH, ZBADAMY ZNACZENIE FUNKCJONALNE I GENETYCZNE WYZNACZNIKI MODYFIKACJI. ANALIZOWANE BĘDĄ ZARÓWNO KANDYDACKIE METYLAZY, JAK I INNE BIAŁKA WYSTĘPUJĄCE W INTERAKCJACH BIAŁKOWO-BIAŁKOWYCH I (LUB) IN SILICO. INTENCJĄ JEST NIEAKTYWNE ODPOWIEDNIE GENY I ODPOWIEDNIA ANALIZA FENOTYPOWA. _x000D_ będziemy również badać MOLECULAR DETAILS W SEMINALIZACJI DO PROCESU chlorozy, dramatyczna adaptacja do różnych typów środowiska, w którym NBLR i NTCA-PIPX, wchodzą do innych regulatorów, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. JESTEŚMY ZAINTERESOWANI ROZSZYFROWANIEM NIEKTÓRYCH ZAWIŁOŚCI REGULACYJNYCH, TAKICH JAK MECHANIZM AKTYWACJI I FUNKCJONOWANIA NBLR ORAZ INTERAKCJE REGULACYJNE RÓŻNYCH SPOSOBÓW ZBIEŻNOŚCI W PROMOTORZE NBLA. WIELE STRATEGII METODOLOGICZNYCH ZAPROPONOWANYCH W ODNIESIENIU DO PIPX ZOSTANIE RÓWNIEŻ WYKORZYSTANYCH WRAZ Z NBLR. (Polish)
4 August 2022
0 references
A CIANOBAKTÉRIUMOK OXIGENICAN FOTOSZINTÉZIST VÉGEZNEK ÉS TELEPÍTIK A MEGVILÁGÍTOTT ÖKOSZISZTÉMÁK TÖBBSÉGÉT, ÍGY NAGY HATÁSSAL VANNAK A GLOBÁLIS SZÉN- ÉS NITROGÉNCIKLUSOKRA. ÖKOLÓGIAI SIKERE ÉS BIOTECHNOLÓGIAI JELENTŐSÉGE ELLENÉRE AZONBAN A SOKOLDALÚSÁGÉRT ÉS A KÖRNYEZETI ALKALMAZKODÁSI KÉPESSÉGÉRT FELELŐS MECHANIZMUSOK TOVÁBBRA SEM ISMERTEK. EBBEN AZ ÖSSZEFÜGGÉSBEN A SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, A RELATIVELY FACILITY genetikális MANIPUATION, Ez egy KELLENES RENDELKEZÉSI RENDELKEZÉSEK A RENDELKEZŐ INTERACCIÓK A CSOMAGOLÁSI INTERACCIÓK lehetővé teszik a CIANOBACTERIAS INTEGRATAL ÉS RESPONDERÁCIÓK, hogy MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ A projekt elsődleges javaslata a multifunkcionális PIPX PROTEIN jellemzése, egy UN FACTOR A CIANOBACTERIAS CONCERNING transzkripciós szabályozók, Signalising PROTEINS ÉS metabolikus enzimek a NETWORK A COMPLETE ÉS DINAMIC interstrukciók. A ZÁSZLÓ-PIPX FEHÉRJÉVEL VÉGZETT IN VIVO KOTISZTULÁSI VIZSGÁLATOK SEGÍTSÉGÉVEL CÉLUNK, HOGY AZONOSÍTSUK A JELÁTVITELI ÚTVONALAK ÚJ ÖSSZETEVŐIT, AMELYEKBEN A PIPX RÉSZT VESZ, A KETTŐS HIBRIDIZÁLT PIPX (XIP FEHÉRJÉK), A HÁRMAS HIBRIDIZÁCIÓ (PXR, A PII ÉS A PIPX MINT CSALI) VAGY AZ IN SILICO ANALÍZIS (ORF2060) VALIDÁLÁSA MELLETT. AZ INTERAKCIÓK (FEHÉRJÉK ÉS LEHETSÉGES EFFEKTOROK KÖZÖTTI) RÉSZLETESEBB JELLEMZÉSÉRE IN VITRO ÉS/VAGY KETTŐS (HÁROM) HIBRID KÍSÉRLETEKET ALKALMAZUNK TELJES FEHÉRJÉKKEL, MUTÁNS SZÁRMAZÉKOKKAL ÉS/VAGY SPECIFIKUS TERÜLETEKKEL. IGÉNYBE VESSZÜK A KONFOKÁLIS MIKROSZKÓPIA HASZNÁLATÁT ANNAK MEGÁLLAPÍTÁSÁRA, HOGY A FEHÉRJÉK A PIPX POLÁRIS REFLEKTORFÉNYEIBEN TANULMÁNYOZTÁK-E A KO-LOKALISES-T, AMELYNEK DINAMIKUS ELHELYEZKEDÉSE REAGÁL A SÖTÉT FÉNY CIKLUSAIRA. A PIPX-SZABÁLYOZOTT GÉNEK NTCA-TÓL FÜGGETLENÜL TÖRTÉNŐ LEÍRÁSÁHOZ TRANSZKRIPTOMIKUS ELEMZÉST VÉGZÜNK EGY TÖRZSPANELLEL, KÜLÖNBÖZŐ TENYÉSZTÉSI KÖRÜLMÉNYEK KÖZÖTT, AMELY MAGÁBAN FOGLALJA A PIPX GÉN KÜLÖNBÖZŐ SZÁRMAZÉKAIT ÉS MÁS KAPCSOLÓDÓ GÉNEKET. A GENERÁLT ADATOKAT ARRA HASZNÁLJÁK FEL, HOGY A KÜLÖNBÖZŐKÉPPEN SZABÁLYOZOTT GÉNEKET KÖZÖS SZABÁLYOZÁSI STANDARDOKKAL RENDELKEZŐ CSOPORTOKBA SOROLJÁK, HOGY AZTÁN FOGLALKOZZANAK AZ ÉRINTETT KÜLÖNBÖZŐ SZABÁLYOZÁSI MECHANIZMUSOKKAL. A PXR UNIÓS OLDALAKAT A CHIP-SEQ SEGÍTSÉGÉVEL VIZSGÁLJUK MEG, AZOKAT AZ INFORMÁCIÓKAT, AMELYEKET A TRANSCRIPTOMICA ELEMZÉSÉBŐL INTEGRÁLUNK. MEGVIZSGÁLJUK AZ ARGININS LEHETSÉGES METILACION-JÁT A PIPX ALFA-HELICE1-BEN, ÉS ADOTT ESETBEN MEGVIZSGÁLJUK A MÓDOSÍTÁSOK FUNKCIONÁLIS JELENTÉSÉT ÉS GENETIKAI MEGHATÁROZÓIT. MIND A JAVASOLT METILÁZ(OK)AT, MIND A FEHÉRJE-FEHÉRJE ÉS/VAGY IN SILICO KÖLCSÖNHATÁSOKBAN TALÁLHATÓ EGYÉB FEHÉRJÉKET ELEMEZNI KELL. A CÉL A MEGFELELŐ GÉNEK ÉS A VONATKOZÓ FENOTÍPUSOS ELEMZÉS INAKTÍVVÁ TÉTELE. _x000D_ azt is tanulmányozni MOLECULAR DETAILS A SEMINALISATION DOES A PROCESS of klórózis, A drámai adaptáció a különböző típusú környezet, amelyben NBLR és NTCA-PIPX, belépnek más szabályozók, Converge for the Promotor of the NBLA, esential for The Degratation of Physiobilisomas. ÉRDEKLŐDÜNK A SZABÁLYOZÁSI KOMPLEXITÁSOK NÉMELYIKÉNEK MEGFEJTÉSE IRÁNT, MINT PÉLDÁUL AZ NBLR AKTIVÁLÁSÁNAK ÉS FUNKCIÓJÁNAK MECHANIZMUSA, VALAMINT AZ NBLA-PROMÓTERBEN KONVERGÁLÓ KÜLÖNBÖZŐ MÓDOK SZABÁLYOZÁSI KÖLCSÖNHATÁSAI. A PIPX-SZEL KAPCSOLATBAN JAVASOLT MÓDSZERTANI STRATÉGIÁK KÖZÜL SOK AZ NBLR-REL EGYÜTT IS ALKALMAZÁSRA KERÜL. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
SINIC PROVÁDÍ OXIGENICAN FOTOSYNTÉZU A KOLONIZUJE VĚTŠINU OSVĚTLENÝCH EKOSYSTÉMŮ, TAKŽE MAJÍ VELKÝ DOPAD NA GLOBÁLNÍ UHLÍKOVÉ A DUSÍKOVÉ CYKLY. NAVZDORY SVÉMU EKOLOGICKÉMU ÚSPĚCHU A BIOTECHNOLOGICKÉMU VÝZNAMU VŠAK MECHANISMY ODPOVĚDNÉ ZA TUTO VŠESTRANNOST A SCHOPNOST PŘIZPŮSOBIT SE ŽIVOTNÍMU PROSTŘEDÍ ZŮSTÁVAJÍ NEZNÁMÉ. V TÉTO SOUVISLOSTI SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVELY FACILITY genetické MANIPUACE, je vynikajícím systémem pro STUDY REGULATING INTERACTIONS umožňující CIANOBACTERIAS INTEGRATED a RESPONDERLY MUYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Primárním návrhem tohoto projektu je charakterizovat multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS CONCERNING transkripční regulátory, Signalizační PROTEINS A metabolické enzimy v NETWORK COMPLETE a DINAMIC interations. POMOCÍ IN VIVO VYČISTĚNÝCH ZKOUŠEK S PROTEINEM FLAG-PIPX SE SNAŽÍME IDENTIFIKOVAT NOVÉ SLOŽKY SIGNALIZAČNÍCH DRAH, NA KTERÝCH SE PIPX PODÍLÍ, KROMĚ VALIDACE INTERAKCÍ A PŘEDCHOZÍCH VÝSLEDKŮ Z DVOJITÉ HYBRIDIZOVANÉ PIPX (XIP PROTEINY), TROJITÉ HYBRIDIZACE (PXR, IDENTIFIKOVANÉ POMOCÍ PII I PIPX JAKO NÁVNADY) NEBO IN SILIKO ANALÝZY (ORF2060). PRO PODROBNĚJŠÍ CHARAKTERIZACI INTERAKCÍ (MEZI PROTEINY A MOŽNÝMI ÚČINKY) BUDEME POUŽÍVAT IN VITRO A/NEBO DVOJITÉ (TROJNÁSOBNÉ) HYBRIDNÍ STUDIE S KOMPLETNÍMI PROTEINY, DERIVÁTY MUTANTŮ A/NEBO SPECIFICKÝMI DOMÉNAMI. UCHÝLÍME SE K POUŽITÍ KONFOKÁLNÍ MIKROSKOPIE K URČENÍ, ZDA NĚKTERÝ ZE STUDOVANÝCH PROTEINŮ SPOLULOKALIZUJE V POLÁRNÍCH REFLEKTORECH PIPX, JEJICHŽ DYNAMICKÁ POLOHA REAGUJE NA CYKLY TMAVÉHO SVĚTLA. ABYCHOM POPSALI PIPX-REGULOVANÉ GENY NEZÁVISLE NA NTCA, PROVEDEME TRANSKRIPTOMICKOU ANALÝZU S KMENOVÝM PANELEM ZA RŮZNÝCH KULTURNÍCH PODMÍNEK, KTERÝ ZAHRNUJE RŮZNÉ TYPY DERIVÁTŮ PIPX GENU A DALŠÍCH SOUVISEJÍCÍCH GENŮ. ZÍSKANÉ ÚDAJE BUDOU POUŽITY K ZAŘAZENÍ DIFERENCIÁLNĚ REGULOVANÝCH GENŮ DO SKUPIN SE SPOLEČNÝMI REGULAČNÍMI NORMAMI A NÁSLEDNĚ K ŘEŠENÍ RŮZNÝCH PŘÍSLUŠNÝCH REGULAČNÍCH MECHANISMŮ. BUDEME ZKOUMAT PXR UNION STRÁNKY POMOCÍ CHIP-SEQ, INFORMACE, KTERÉ BUDEME INTEGROVAT S TÍM Z ANALÝZY TRANSCRIPTOMICA. PROZKOUMÁME MOŽNOU METILACION ARGININS V PIPX ALFA-HELICE1 A PŘÍPADNĚ PROZKOUMÁME FUNKČNÍ VÝZNAM A GENETICKÉ DETERMINANTY MODIFIKACÍ. ANALYZOVÁNY BUDOU JAK KANDIDÁTSKÉ METHYLÁZY, TAK JINÉ BÍLKOVINY NALEZENÉ V INTERAKCÍCH PROTEIN-PROTEIN A/NEBO IN SILIKO. ZÁMĚREM JE NEAKTIVOVAT ODPOVÍDAJÍCÍ GENY A PŘÍSLUŠNOU FENOTYPOVOU ANALÝZU. _x000D_ budeme také studovat MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DO PROCESS of chlorosis, dramatická adaptace na různé typy prostředí, ve kterém NBLR a NTCA-PIPX, vstoupit do jiných regulátorů, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation Physiobilisomas. MÁME ZÁJEM ROZLUŠTIT NĚKTERÉ REGULAČNÍ KOMPLEXNOSTI, JAKO JE MECHANISMUS AKTIVACE A FUNKCE NBLR A REGULAČNÍ INTERAKCE RŮZNÝCH ZPŮSOBŮ, KTERÉ SE SBLIŽUJÍ V PROMOTÉRU NBLA. MNOHO METODICKÝCH STRATEGIÍ NAVRŽENÝCH V SOUVISLOSTI S PIPX BUDE ROVNĚŽ POUŽITO SPOLU S NBLR. (Czech)
4 August 2022
0 references
CIANBAKTĒRIJAS VEIC OXIGENICAN FOTOSINTĒZI UN KOLONIZĒ LIELĀKO DAĻU APGAISMOTO EKOSISTĒMU, TĀPĒC TĀM IR LIELA IETEKME UZ GLOBĀLAJIEM OGLEKĻA UN SLĀPEKĻA CIKLIEM. TOMĒR, NERAUGOTIES UZ EKOLOĢISKAJIEM PANĀKUMIEM UN BIOTEHNOLOĢISKO NOZĪMI, MEHĀNISMI, KAS IR ATBILDĪGI PAR ŠO DAUDZPUSĪBU UN SPĒJU PIELĀGOTIES VIDEI, JOPROJĀM NAV ZINĀMI. ŠAJĀ KONTEKSTĀ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, ATLAIDĪGI FACILITY ģenētiskā MANIPUĀCIJA, ir ekskluzīvs SISTĒMAS REGULĒŠANAS INTERACTIONS, kas ļauj CIANOBACTERIAS INTEGRATED UN RESPONDERLY MUY DYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Šī projekta primārais ierosinājums ir raksturot multifuncionālo PIPX PROTEIN, CIANOBACTERIAS SADARBINĀŠANAS transkripcijas regulatoru UN APSTIPRINĀŠANAS PROTEINĀJUMI UN vielmaiņas enzimas KOPĒJĀ UN DINAMIKAS interācijā. IZMANTOJOT IN VIVO KO-ATTĪRĪŠANAS IZMĒĢINĀJUMUS AR KARODZIŅU-PIPX PROTEĪNU, MŪSU MĒRĶIS IR IDENTIFICĒT JAUNUS SIGNĀLU CEĻU KOMPONENTUS, KUROS PIEDALĀS PIPX, PAPILDUS MIJIEDARBĪBAS UN IEPRIEKŠĒJO REZULTĀTU VALIDĒŠANAI NO DUBULTAS HIBRIDIZĒTAS PIPX (XIP PROTEĪNI), TRĪSKĀRŠAS HIBRIDIZĀCIJAS (PXR, KAS IDENTIFICĒTI, IZMANTOJOT GAN PII, GAN PIPX KĀ ĒSMU) VAI SILIKO ANALĪZĒ (ORF2060). LAI SĪKĀK RAKSTUROTU MIJIEDARBĪBU (STARP OLBALTUMVIELĀM UN IESPĒJAMIEM EFEKTIEM), MĒS IZMANTOSIM IN VITRO UN/VAI DUBULTUS (TRĪSKĀRŠUS) HIBRĪDA PĒTĪJUMUS AR PILNĪGIEM PROTEĪNIEM, MUTANTU ATVASINĀJUMIEM UN/VAI SPECIFISKĀM JOMĀM. MĒS IZMANTOSIM KONFOKĀLO MIKROSKOPIJU, LAI NOTEIKTU, VAI KĀDS NO PĒTĪTAJIEM PROTEĪNIEM LĪDZLOKALIZĒJAS PIPX POLĀRAJOS PROŽEKTOROS, KURU DINAMISKĀ ATRAŠANĀS VIETA REAĢĒ UZ TUMŠĀS GAISMAS CIKLIEM. LAI APRAKSTĪTU PIPX REGULĒTOS GĒNUS NEATKARĪGI NO NTCA, MĒS VEIKSIM TRANSKRIPTOMISKU ANALĪZI AR CELMA PANELI DAŽĀDOS KULTŪRAS APSTĀKĻOS, KAS IETVER DAŽĀDA VEIDA PIPX GĒNA ATVASINĀJUMUS UN CITUS SAISTĪTUS GĒNUS. IEGŪTOS DATUS IZMANTOS, LAI DIFERENCĒTI REGULĒTUS GĒNUS KLASIFICĒTU GRUPĀS AR KOPĪGIEM REGULATĪVIEM STANDARTIEM, LAI PĒC TAM PIEVĒRSTOS DAŽĀDIEM IESAISTĪTAJIEM REGULATĪVAJIEM MEHĀNISMIEM. MĒS IZMEKLĒSIM PXR UNION VIETNES, IZMANTOJOT MIKROSHĒMU-SEQ, INFORMĀCIJU, KO MĒS INTEGRĒSIM AR TO NO TRANSCRIPTOMICA ANALĪZES. MĒS IZPĒTĪSIM IESPĒJAMO ARGININS METILACION IN PIPX ALFA-HELICE1 UN, JA NEPIECIEŠAMS, PĒTĪSIM MODIFIKĀCIJU FUNKCIONĀLO NOZĪMI UN ĢENĒTISKOS FAKTORUS. TIKS ANALIZĒTA GAN POTENCIĀLĀ(-ĀS) METILĀZE(-S), GAN CITI PROTEĪNI, KAS ATRODAMI OLBALTUMVIELU OLBALTUMVIELĀS UN/VAI SILĪCIJA MIJIEDARBĪBĀ. NOLŪKS IR NEAKTĪVOS ATBILSTOŠOS GĒNUS UN ATTIECĪGO FENOTIPISKO ANALĪZI. _x000D_ mēs arī pētīsim MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES PROCESS of hloroze, dramatiska pielāgošanās dažāda veida videi, kurā NBLR un NTCA-PIPX, ievadiet citus regulatorus, Converge for the Promotor of the NBLA, esential For The Degratation of Physiobilisomas. MĒS ESAM IEINTERESĒTI ATŠIFRĒT DAŽUS REGULATĪVOS SAREŽĢĪJUMUS, PIEMĒRAM, NBLR AKTIVIZĒŠANAS UN DARBĪBAS MEHĀNISMU, KĀ ARĪ DAŽĀDU VEIDU REGULATĪVO MIJIEDARBĪBU, KAS APVIENOJAS NBLA VEICINĀTĀJĀ. DAUDZAS METODOLOĢISKĀS STRATĒĢIJAS, KAS IEROSINĀTAS SAISTĪBĀ AR PIPX, TIKS IZMANTOTAS ARĪ KOPĀ AR NBLR. (Latvian)
4 August 2022
0 references
DÉANANN CYANOBACTERIA FÓTAISINTÉIS OXIGENICAN AGUS DÉANANN SÉ FORMHÓR NA N-ÉICEACHÓRAS SOILSITHE A CHOILÍNIÚ, IONAS GO MBEIDH TIONCHAR MÓR ACU AR THIMTHRIALLTA CARBÓIN AGUS NÍTRIGINE DOMHANDA. MAR SIN FÉIN, IN AINNEOIN GO BHFUIL RATH AIR Ó THAOBH NA HÉICEOLAÍOCHTA AGUS NA TÁBHACHTA BITEICNEOLAÍOCHTA DE, NÍ FIOS FÓS CÉ NA SÁSRAÍ ATÁ FREAGRACH AS AN SOLÚBTHACHT AGUS AS AN ACMHAINN SIN CHUN OIRIÚNÚ DON CHOMHSHAOL. SA CHOMHTHÉACS SEO, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, AN GINEARÁLTA GINEARÁLTA GINEARÁLTA, AN CÓRAS MAIDIR LE STIÚRTHÓIREACHT NA hÉIREANN LE hAGHAIDH RIALTAIS LE hAGHAIDH GINEARÁLTA NA hEORPA AGUS LEIS AN RÉIGIÚN A DHÉANAMH DYSTEMS._x000D_ Is é príomhthairiscint an tionscadail seo promhaidh Pipx Ilghonta a thréithriú, a FACTOR NA CIANOBACTERIAS CONCERNING rialtóirí tras-scríbhneoirí, signizing PROTEINS AGUS ENZIMAS meitibileach I NETWORK OF COMPLETE AND DINAMICIC interations. AG BAINT ÚSÁIDE AS TRIALACHA COMH-ÍONÚCHÁIN IN VIVO LEIS AN BPRÓITÉIN BRATACH-PIPX, TÁ SÉ MAR AIDHM AGAINN COMHPHÁIRTEANNA NUA DE NA CONAIRÍ COMHARTHAÍOCHTA INA NGLACANN PIPX PÁIRT A AITHINT, CHOMH MAITH LE HIDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ AGUS TORTHAÍ ROIMHE SEO Ó PIPX HIBRIDITHE DÚBAILTE (XIP PRÓITÉINÍ), HIBRIDIÚ TRIPLE (PXR, SAINAITHEANTA AG BAINT ÚSÁIDE AS PII AGUS PIPX ARAON MAR BHAOITE) NÓ IN ANAILÍS SILICO (ORF2060). CHUN IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ A THRÉITHRIÚ (IDIR PRÓITÉINÍ, AGUS LE HÉIFEACHTÓIRÍ FÉIDEARTHA) AR BHEALACH NÍOS MIONSONRAITHE, BAINFIMID ÚSÁID AS TRIALACHA HIBRIDEACHA IN VITRO AGUS/NÓ DÚBAILTE (TRÍLE) LE PRÓITÉINÍ IOMLÁNA, DÍORTHAIGH SHÓITEÁIN AGUS/NÓ RÉIMSÍ SONRACHA. DÉANFAIMID SAOIRE CHUN ÚSÁID A BHAINT AS MICREASCÓPACHT CONFOCAL CHUN A CHINNEADH AN BHFUIL AON CHEANN DE NA PRÓITÉINÍ A NDEARNADH STAIDÉAR ORTHU AG COMH-LOGÁNÚ I MBOLSCÁN PIPX, A BHFREAGRAÍONN A SUÍOMH DINIMICIÚIL DO THIMTHRIALLTA SOLAIS DORCHA. CHUN CUR SÍOS A DHÉANAMH AR GÉINTE PIPX-RIALAITHE NEAMHSPLEÁCH AR NTCA, DÉANFAIMID ANAILÍS TRAS-SCRÍBHINNE LE PAINÉAL BRÚ, FAOI CHOINNÍOLLACHA CULTÚIR ÉAGSÚLA, LENA N-ÁIRÍTEAR CINEÁLACHA ÉAGSÚLA DÍORTHAIGH DEN GHÉIN PIPX, AGUS GÉINTE GAOLMHARA EILE. ÚSÁIDFEAR NA SONRAÍ A GHINTEAR CHUN GÉINTE A RIALAÍTEAR GO DIFREÁLACH A AICMIÚ I NGRÚPAÍ A BHFUIL COMHCHAIGHDEÁIN RIALÁLA ACU, CHUN AGHAIDH A THABHAIRT ANSIN AR NA SÁSRAÍ RIALÁLA ÉAGSÚLA ATÁ I GCEIST. DÉANFAIMID IMSCRÚDÚ AR SHUÍOMHANNA PXR UNION AG BAINT ÚSÁIDE AS SLISEANNA-SEQ, FAISNÉIS A CHOMHTHÁTHÓIMID LEIS SIN ÓN ANAILÍS AR TRANSCRIPTOMICA. DÉANFAIMID IMSCRÚDÚ AR AN METILACION FÉIDEARTHA ARGININS I PIPX ALPHA-HELICE1 AGUS, NUAIR IS CUÍ, STAIDÉAR A DHÉANAMH AR AN BHRÍ FEIDHME AGUS DEITÉARMANAINT GHÉINITEACH NA MODHNUITHE. DÉANFAR ANAILÍS AR MHEITIOLÁIS(Í) IARRTHÓRA AGUS PRÓITÉINÍ EILE A FHAIGHTEAR I BPRÓITÉIN PRÓITÉINE AGUS/NÓ IN IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ SILICO. TÁ SÉ I GCEIST NA GÉINTE COMHFHREAGRACHA AGUS AN ANAILÍS FHEINITÍOPACH ÁBHARTHA A NEAMHGHNÍOMHÚ. cé gurbh iad Avondale rogha na coitianta tháinig buachaillí GCM le plean agus chuireadar I bhfeidhm é. TÁ SUIM AGAINN CUID DE NA CASTACHTAÍ RIALÁLA A BHAINT AMACH, AMHAIL SÁSRA GNÍOMHACHTAITHE AGUS FEIDHM NBLR AGUS IN IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ RIALÁLA NA MBEALAÍ ÉAGSÚLA A THAGANN LE CHÉILE I DTIONSCNÓIR AN NBLA. ÚSÁIDFEAR GO LEOR DE NA STRAITÉISÍ MODHEOLAÍOCHTA A MHOLTAR I NDÁIL LE PIPX LE NBLR FREISIN. (Irish)
4 August 2022
0 references
CIANOBAKTERIJE OPRAVLJAJO FOTOSINTEZO OXIGENICAN IN KOLONIZIRAJO VEČINO OSVETLJENIH EKOSISTEMOV, TAKO DA IMAJO VELIK VPLIV NA GLOBALNE OGLJIKOVE IN DUŠIKOVE CIKLE. KLJUB EKOLOŠKEMU USPEHU IN BIOTEHNOLOŠKEMU POMENU PA MEHANIZMI, KI SO ODGOVORNI ZA TO VSESTRANSKOST IN SPOSOBNOST PRILAGAJANJA OKOLJU, OSTAJAJO NEZNANI. V ZVEZI S TEM, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, RELATIVENO FACILITY genetsko MANIPUATION, je EXCELLENT SYSTEM ZA STUDY REGULATING INTERACTION, ki dovoljujejo CIANOBACTERIAS INTEGRATED IN RESPONDERALNO NA DIMENALNE ENVIRONMENTALNE DYSTEMS._x000D_ Glavni predlog tega projekta je, da se označi multifuncional PIPX PROTEIN, UN FACTOR CIANOBACTERIAS KONCERNING transkripcijskih regulatorjev, Signalizirajoče PROTEINS IN presnovne enzime V NETWORKU ZAČETNIH IN DINAMIČNIH intermisij. Z UPORABO POSKUSOV KOČIŠČENJA IN VIVO Z BELJAKOVINO FLAG-PIPX ŽELIMO IDENTIFICIRATI NOVE KOMPONENTE SIGNALNIH POTI, V KATERIH SODELUJE PIPX, POLEG POTRJEVANJA INTERAKCIJ IN PREJŠNJIH REZULTATOV IZ DVOJNO HIBRIDIZIRANIH PIPX (XIP PROTEINOV), TROJNE HIBRIDIZACIJE (PXR, IDENTIFICIRANE Z UPORABO PII IN PIPX KOT VABE) ALI ANALIZE IN SILICIJA (ORF2060). ZA NATANČNEJŠO OPREDELITEV INTERAKCIJ (MED BELJAKOVINAMI IN MOŽNIMI EFEKTORJI) BOMO UPORABILI IN VITRO IN/ALI DVOJNO (TRIPLE) HIBRIDNA PRESKUŠANJA S POPOLNIMI BELJAKOVINAMI, MUTANTNIMI DERIVATI IN/ALI SPECIFIČNIMI PODROČJI. ZATEKLI BOMO K UPORABI KONFOKALNE MIKROSKOPIJE, DA UGOTOVIMO, ALI KATERI OD PREUČEVANIH BELJAKOVIN SOLOKALIZIRA V POLARNIH REFLEKTORJIH PIPX, KATERIH DINAMIČNA LOKACIJA SE ODZIVA NA TEMNE SVETLOBE. ZA OPIS PIPX-REGULIRANIH GENOV NEODVISNO OD NTCA BOMO IZVEDLI TRANSKRIPTOMSKO ANALIZO S SEVOM POD RAZLIČNIMI POGOJI KULTURE, KI VKLJUČUJE RAZLIČNE VRSTE DERIVATOV GENA PIPX IN DRUGIH SORODNIH GENOV. PRIDOBLJENI PODATKI SE BODO UPORABILI ZA RAZVRŠČANJE RAZLIČNO REGULIRANIH GENOV V SKUPINE S SKUPNIMI REGULATIVNIMI STANDARDI, DA BI SE OBRAVNAVALI RAZLIČNI REGULATIVNI MEHANIZMI. PREISKALI BOMO SPLETNA MESTA PXR UNION Z UPORABO ČIPOV, KI JIH BOMO POVEZALI S TISTIMI IZ ANALIZE TRANSCRIPTOMICA. RAZISKALI BOMO MOŽNO METILACION ARGININS V PIPX ALFA-HELICE1 IN PO POTREBI PREUČILI FUNKCIONALNI POMEN IN GENETSKE DETERMINANTE SPREMEMB. ANALIZIRALI BOMO KANDIDATNE METILAZE IN DRUGE BELJAKOVINE, KI JIH NAJDEMO V INTERAKCIJAH MED BELJAKOVINAMI IN/ALI SILICIJEM. NAMEN JE NEAKTIVIRATI USTREZNE GENE IN USTREZNO FENOTIPSKO ANALIZO. _x000D_ bomo preučili tudi MOLECULARNE DETAILVE V SEMINALISACIJI ZA PROCES kloroze, dramatično prilagoditev različnim vrstam okolja, v katerem NBLR in NTCA-PIPX vstopita v druge regulatorje, Konvergirajte za Promotor NBLA, Esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. ZANIMA NAS DEŠIFRIRANJE NEKATERIH REGULATIVNIH ZAPLETENOSTI, KOT SO MEHANIZEM AKTIVACIJE IN DELOVANJA NBLR TER REGULATIVNE INTERAKCIJE RAZLIČNIH NAČINOV, KI SE ZBLIŽUJEJO V PROMOTORJU NBLA. ŠTEVILNE METODOLOŠKE STRATEGIJE, PREDLAGANE V ZVEZI S PIPX, SE BODO UPORABLJALE TUDI Z NBLR. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
ЦИАНОБАКТЕРИИТЕ ИЗВЪРШВАТ ФОТОСИНТЕЗА OXIGENICAN И КОЛОНИЗИРАТ ПО-ГОЛЯМАТА ЧАСТ ОТ ОСВЕТЕНИТЕ ЕКОСИСТЕМИ, ТАКА ЧЕ ТЕ ОКАЗВАТ ГОЛЯМО ВЪЗДЕЙСТВИЕ ВЪРХУ ГЛОБАЛНИЯ ВЪГЛЕРОДЕН И АЗОТЕН ЦИКЪЛ. ВЪПРЕКИ СВОЯ ЕКОЛОГИЧЕН УСПЕХ И БИОТЕХНОЛОГИЧНО ЗНАЧЕНИЕ ОБАЧЕ МЕХАНИЗМИТЕ, ОТГОВОРНИ ЗА ТАЗИ ГЪВКАВОСТ И КАПАЦИТЕТ ЗА АДАПТИРАНЕ КЪМ ОКОЛНАТА СРЕДА, ОСТАВАТ НЕИЗВЕСТНИ. В ТОЗИ КОНТЕКСТ SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, НА РЕЛАТИВНА ФАЦИЛНОСТ генетична МАНИПУАЦИЯ, Е ИЗКЛЮЧЕНА СИСТЕМА ЗА СЪТРУДНИЧЕСТВОТО НА РЕГЛАМЕНТ НА РЕГЛАМЕНТНОТО И РЕГЛАМЕНТНО РЕГЛАМЕНТНО РЕГЛАМЕНТНО ПРЕДСТАВЯНЕ НА РЕГЛАМЕНТНОТО ИЗПЪЛНЕНИЕ НА КОМПЪЛНИТЕЛНОТО ПРЕДСТАВЯНЕ НА ПРЕДСТАВЯНЕТО НА РЕГЛАМЕНТ НА РЕГЛАМЕНТ НА РЕГУЛНИТЕ ВЪЗДАЖЕНИЯТА НА РЕГЛАМЕНТНОТО ИЗПЪЛНИТЕЛЯНЕТО НА ТЕГЛИЧЕСКАТА И РЕЗОПЪЛНА ПРЕЖДАЖДАВАНЕ НА ИЗВЪНИТЕЛЯНЕТО НА РЕГЛАМЕНОТО ОБРАЗОВЕНОСТ._x000D_Главното предложение на този проект е да се характеризира мултифункционалният PIPX PROTEIN, орган на ООН за защита на транскрипционните регулатори, сигнализационните продукти и метаболитните енцими в мрежа от комплемента и динамики. ИЗПОЛЗВАЙКИ IN VIVO ИЗПИТВАНИЯ ЗА СЪВМЕСТНО ПРЕЧИСТВАНЕ С БЕЛТЪКА НА ФЛАГА-PIPX, НИЕ СЕ СТРЕМИМ ДА ИДЕНТИФИЦИРАМЕ НОВИ КОМПОНЕНТИ НА СИГНАЛНИТЕ ПЪТЕКИ, В КОИТО УЧАСТВА PIPX, В ДОПЪЛНЕНИЕ КЪМ ВАЛИДИРАНЕТО НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ И ПРЕДИШНИ РЕЗУЛТАТИ ОТ ДВОЙНО ХИБРИДИЗИРАНИ PIPX (XIP ПРОТЕИНИ), ТРОЙНА ХИБРИДИЗАЦИЯ (PXR, ИДЕНТИФИЦИРАНА ЧРЕЗ PII И PIPX КАТО ПРИМАМКА) ИЛИ IN SILICO АНАЛИЗ (ORF2060). ЗА ДА ХАРАКТЕРИЗИРАМЕ ПО-ПОДРОБНО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯТА (МЕЖДУ ПРОТЕИНИТЕ И С ВЪЗМОЖНИТЕ ЕФЕКТИОРИ), ЩЕ ИЗПОЛЗВАМЕ IN VITRO И/ИЛИ ДВОЙНИ (ТРОЙНИ) ХИБРИДНИ ИЗПИТВАНИЯ С ПЪЛНИ ПРОТЕИНИ, ПРОИЗВОДНИ НА МУТАНТИТЕ И/ИЛИ СПЕЦИФИЧНИ ОБЛАСТИ. ЩЕ ПРИБЕГНЕМ ДО ИЗПОЛЗВАНЕТО НА КОНФОКАЛНА МИКРОСКОПИЯ, ЗА ДА ОПРЕДЕЛИМ ДАЛИ НЯКОЙ ОТ ИЗСЛЕДВАНИТЕ ПРОТЕИНИ СЕ НАМИРА В ПОЛЯРНИТЕ ПРОЖЕКТОРИ НА PIPX, ЧИЕТО ДИНАМИЧНО МЕСТОПОЛОЖЕНИЕ ОТГОВАРЯ НА ЦИКЛИТЕ НА ТЪМНА СВЕТЛИНА. ЗА ДА ОПИШЕМ ГЕНИТЕ, РЕГУЛИРАНИ ОТ PIPX, НЕЗАВИСИМО ОТ NTCA, ЩЕ ИЗВЪРШИМ ТРАНСКРИПТОМИЧЕН АНАЛИЗ С ЩАМОВ ПАНЕЛ, ПРИ РАЗЛИЧНИ УСЛОВИЯ НА КУЛТУРАТА, КОЙТО ВКЛЮЧВА РАЗЛИЧНИ ВИДОВЕ ПРОИЗВОДНИ НА PIPX ГЕНА И ДРУГИ СВЪРЗАНИ ГЕНИ. ГЕНЕРИРАНИТЕ ДАННИ ЩЕ СЕ ИЗПОЛЗВАТ ЗА КЛАСИФИЦИРАНЕ НА ДИФЕРЕНЦИРАНО РЕГУЛИРАНИТЕ ГЕНИ В ГРУПИ С ОБЩИ РЕГУЛАТОРНИ СТАНДАРТИ, СЛЕД КОЕТО ЩЕ БЪДАТ РАЗГЛЕДАНИ РАЗЛИЧНИТЕ РЕГУЛАТОРНИ МЕХАНИЗМИ. ЩЕ ПРОУЧИМ САЙТОВЕТЕ НА PXR UNION С ПОМОЩТА НА ЧИП-SEQ, ИНФОРМАЦИЯ, КОЯТО ЩЕ ИНТЕГРИРАМЕ С ТАЗИ ОТ АНАЛИЗА НА TRANSCRIPTOMICA. ЩЕ ПРОУЧИМ ВЪЗМОЖНОТО МЕТИЛАЗИОН НА ARGININS В PIPX АЛФА-HELICE1 И, КЪДЕТО Е УМЕСТНО, ЩЕ ПРОУЧИМ ФУНКЦИОНАЛНИЯ СМИСЪЛ И ГЕНЕТИЧНИТЕ ДЕТЕРМИНАНТИ НА МОДИФИКАЦИИТЕ. ЩЕ БЪДАТ АНАЛИЗИРАНИ КАКТО КАНДИДАТ-МЕТИЛАЗА(И), ТАКА И ДРУГИ ПРОТЕИНИ, ОТКРИТИ ВЪВ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯТА ПРОТЕИН-ПРОТЕИН И/ИЛИ В СИЛИКО. ЦЕЛТА Е ДА СЕ НЕАКТИВНИ СЪОТВЕТНИТЕ ГЕНИ И СЪОТВЕТНИЯ ФЕНОТИПЕН АНАЛИЗ. _x000D_ също така ще проучим MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, А драматична адаптация към различни видове околна среда, в която NBLR и NTCA-PIPX влизат в други регулатори, Converge for the Promotor of the NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. ИНТЕРЕСУВАМЕ СЕ ОТ ДЕШИФРИРАНЕ НА НЯКОИ ОТ РЕГУЛАТОРНИТЕ УСЛОЖНЕНИЯ, КАТО НАПРИМЕР МЕХАНИЗМА ЗА АКТИВИРАНЕ И ФУНКЦИОНИРАНЕ НА NBLR И РЕГУЛАТОРНИТЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ НА РАЗЛИЧНИТЕ НАЧИНИ, КОИТО СЕ СБЛИЖАВАТ В ОРГАНИЗАТОРА НА NBLA. МНОГО ОТ МЕТОДОЛОГИЧНИТЕ СТРАТЕГИИ, ПРЕДЛОЖЕНИ ВЪВ ВРЪЗКА С PIPX, ЩЕ БЪДАТ ИЗПОЛЗВАНИ И С NBLR. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
IĊ-ĊJANOBATTERJI JWETTQU FOTOSINTESI OXIGENICAN U JIKKOLONIZZAW IL-MAĠĠORANZA TAL-EKOSISTEMI ILLUMINATI, SABIEX IKOLLHOM IMPATT KBIR FUQ IĊ-ĊIKLI GLOBALI TAL-KARBONJU U TAN-NITROĠENU. MADANKOLLU, MINKEJJA S-SUĊĊESS EKOLOĠIKU U L-IMPORTANZA BIJOTEKNOLOĠIKA TAGĦHA, IL-MEKKANIŻMI RESPONSABBLI GĦAL DIN IL-VERSATILITÀ U L-KAPAĊITÀ GĦALL-ADATTAMENT AMBJENTALI GĦADHOM MHUX MAGĦRUFA. F’DAN IL-KUNTEST, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, TA ‘MANIPUAZZJONI ġenetika RELATIVELY FACILITY, hija SISTEMA ESĊELLENTI GĦALL-ISTUDJA TA’ L-INTERAZZJONIJIET REĠENTI LI Jippermettu L-INTEGRATED U RISPONDERLY TAĊ-ĊIABATTIVA U RISPONDERLY għad-DySTEMs VENRONMENTALI DYSTEMALI DYSTEMAL DYSTEMALI._x000D_ Il-propożizzjoni primarja ta ‘dan il-proġett hija li tikkaratterizza l-PROTEIN PIPX multifuncional, fattur UN TA’ CIANOBACTERIAS CONCERNING regulaturi traskrizzjonali, PROTEINI Sinjalizzanti U enzimi metaboliċi F’NETWORK TAL-interazzjonijiet KOMPETIĊI U DINAMIC. BL-UŻU TA’ PROVI TA’ KOPURIFIKAZZJONI IN VIVO BIL-PROTEINA BANDIERA-PIPX, AĦNA NIMMIRAW LI NIDENTIFIKAW KOMPONENTI ĠODDA TAL-MOGĦDIJIET TAS-SINJALAR LI FIHOM JIPPARTEĊIPA PIPX, MINBARRA L-VALIDAZZJONI TAL-INTERAZZJONIJIET U R-RIŻULTATI PREĊEDENTI MINN PIPX IBRIDIZZAT DOPPJU (PROTEINI XIP), IBRIDIZZAZZJONI TRIPLA (PXR, IDENTIFIKATA BL-UŻU KEMM TA’ PII KIF UKOLL TA’ PIPX BĦALA LIXKA) JEW FL-ANALIŻI SILICO (ORF2060). BIEX NIKKARATTERIZZAW L-INTERAZZJONIJIET (BEJN IL-PROTEINI, U B’EFFETTURI POSSIBBLI) F’AKTAR DETTALL, SE NUŻAW PROVI IBRIDI IN VITRO U/JEW DOPPJI (TRIPLI) BI PROTEINI KOMPLUTI, DERIVATTIVI MUTANTI U/JEW OQSMA SPEĊIFIĊI. AĦNA SE JIRRIKORRU GĦALL-UŻU TA ‘MIKROSKOPIJA KONFOKALI BIEX JIDDETERMINAW JEKK XI WIEĦED MILL-PROTEINI STUDJATI KO-LOKALIZZAZZJONI FIL-SPOTLIGHTS POLARI TA’ PIPX, LI L-POST DINAMIKU JIRRISPONDI GĦAL ĊIKLI TAD-DAWL DLAM. BIEX TIDDESKRIVI L-ĠENI RREGOLATI MINN PIPX INDIPENDENTEMENT MINN NTCA, AĦNA SE TWETTAQ ANALIŻI TRASKRISTOMIKA B’PANNELL TA ‘RAZZA, TAĦT KUNDIZZJONIJIET DIFFERENTI TA’ KULTURA, LI TINKLUDI DIVERSI TIPI TA ‘DERIVATTIVI TAL-ĠENE PIPX, U ĠENI RELATATI OĦRA. ID-DEJTA ĠĠENERATA SE TINTUŻA BIEX TIKKLASSIFIKA ĠENI RREGOLATI B’MOD DIFFERENZJALI FI GRUPPI BI STANDARDS REGOLATORJI KOMUNI, BIEX IMBAGĦAD JIĠU INDIRIZZATI L-MEKKANIŻMI REGOLATORJI DIFFERENTI INVOLUTI. AĦNA SE NINVESTIGAW IS-SITI TAL-UNJONI PXR BL-UŻU TA’ CHIP-SEQ, INFORMAZZJONI LI SE NINTEGRAW MA’ DIK MILL-ANALIŻI TA’ TRANSCRIPTOMICA. AĦNA SE TINVESTIGA L-METILACION POSSIBBLI TA ‘ARGININS FIL PIPX ALPHA-HELICE1 U, FEJN XIERAQ, JISTUDJAW IT-TIFSIRA FUNZJONALI U D-DETERMINANTI ĠENETIĊI TAL-MODIFIKI. KEMM METHYLASE(S) KANDIDAT(I) KIF UKOLL PROTEINI OĦRA LI JINSABU FIL-PROTEINA-PROTEINA U/JEW INTERAZZJONIJIET IN SILICO SE JIĠU ANALIZZATI. L-INTENZJONI HIJA LI JIĠU INATTIVI L-ĠENI KORRISPONDENTI U L-ANALIŻI FENOTIPIKA RILEVANTI. _x000D_ se nistudjaw ukoll id-DETTALJI MOLECULAR FIL-SEMINALISAZZJONI DWAR IL-PROĊESS TAL-klorożi, Adattament drammatiku għal tipi differenti ta’ ambjent, fejn NBLR u NTCA-PIPX, jidħlu Regolaturi oħra, Konverġenza għall-Promotur tal-NBLA, esenzjali għad-Degratazzjoni tal-Fiżjobilisomas. AĦNA INTERESSATI LI NIDDEĊIFRAW UĦUD MILL-KUMPLESSITAJIET REGOLATORJI, BĦALL-MEKKANIŻMU TA’ ATTIVAZZJONI U L-FUNZJONI TAL-NBLR U FL-INTERAZZJONIJIET REGOLATORJI TAL-MODI DIFFERENTI LI JIKKONVERĠU FIL-PROMOTUR TAL-NBLA. ĦAFNA MILL-ISTRATEĠIJI METODOLOĠIĊI PROPOSTI FIR-RIGWARD TAL-PIPX, SE JINTUŻAW UKOLL MAL-NBLR. (Maltese)
4 August 2022
0 references
A Cianobactéria realiza a Fotossíntese Oxigenica e Coloniza a Maioria dos ECOSSISTEMAS ILUMINADOS, de modo que eles têm um grande impacto sobre o Carbono Global e os Ciclos de Azoto. No entanto, apesar do seu sucesso ecológico e da sua importância biotecnológica, os mecanismos responsáveis por esta variedade e a capacidade de adaptação ambiental permanecem desconhecidos. Neste contexto, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, DE MANIPUAÇÃO GENÉTICA RELATIVAMENTE FACILITÁRIA, É UM SISTEMA EXCELENTE PARA O ESTUDO DAS INTERACÇÕES REGULAMENTARES QUE PERMITEM A INTEGRAÇÃO DAS CIANOBACTERIAS E RESPONSABILIDADE AOS MUITOS SISTEMAS AMBIENTAIS DISTÉMICOS._x000D_ A proposta principal deste projecto é caracterizar a PROTEÍNA PIPX MULTIFUNCIONAL, FATOR UNO DAS CIANOBACTERIAS RELATIVAS A REGULAMENTADORES TRANSCRITÓNICOS, A SIGNIFICAR PROTEÍNAS E ENZIMAS METABÓLICAS NUMA REDE DE INTERAÇÕES COMPLETAS E DINÂMICAS. Utilizando os testes de co-purificação da VIVO com a proteína FLAG-PIPX, pretendemos identificar novos componentes dos percursos de sinalização em que a PIPX participa, para além das interacções de validação e dos resultados anteriores da dupla hibridação da PIPX (proteínas XIP), da tripla hibridação (PXR, identificando ambas as PII e PIPX como base) ou da análise SILICO (ORF2060). Para caracterizar as interacções (entre proteínas, e com possíveis efeitos) em maior detalhe, vamos usar em VITRO e / ou duplo (tríplice) testes híbridos com proteínas completas, derivados mutantes e / ou dominações específicas. Resolveremos a utilização da microscopia confocal para determinar se alguma das proteínas continha CO-LOCALIZAÇÕES nas esponjas polares de PIPX, cuja localização dinâmica corresponde a ciclos de luz escura. Para descrevê-los independentemente da NTCA, realizaremos uma análise transcriptomímica com um painel de estirpes, em diferentes condições de cultura, que incluem vários tipos de derivados do gene PIPX e outros genes relacionados. Os dados obtidos serão utilizados para classificar os génes reguláveis de forma diferente em grupos com normas de regulação comuns, abordando em seguida os diferentes mecanismos de regulação envolvidos. Iremos investigar os sítios da PXR UNION usando CHIP-SEQ, informação que iremos integrar com isso a partir da análise da Transcriptomia. Iremos investigar a possível metilação de argínicos em PIPX ALPHA-HELICE1 e, se for caso disso, estudar o significado funcional e os determinantes genéticos das modificações. O(s) METILASE(S) CANDIDATO(S) E OUTRAS PROTEÍNAS CONSTITUÍDAS EM PROTEÍNAS E/OU EM INTERACÇÕES SILICOS SERÃO ANÁLISEADOS. A INTENÇÃO É INCENTIVAR OS GÉNEROS CORRESPONDENTES E A ANÁLISE FENÓTIPICA RELEVANTE. _x000D_ também estudaremos DETALHES MOLECULARES NA SEMINALIZAÇÃO DO PROCESSO DE clorose, Uma adaptação dramática a diferentes tipos de ambiente, em que NBLR e NTCA-PIPX, entram noutros Reguladores, Convergem para o Promotor da NBLA, ESENTIAL PARA A DEGRAtação de Fisiobilisomas. Estamos interessados em determinar algumas das COMPLEXIDADES REGULAMENTARES, como o MECANISMO DE ATIVAÇÃO E FUNÇÃO DA NBLR e as INTERACÇÕES REGULAMENTARES das diferentes vias que convergem no promotor da NBLA. MUITAS DAS ESTRATÉGIAS METODOLOGICAS PROPOSTAS EM RELAÇÃO AO PIX, SERÃO TAMBÉM UTILIZADAS COM O NBLR. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
CYANOBAKTERIER UDFØRER OXIGENICAN FOTOSYNTESE OG KOLONISERER STØRSTEDELEN AF DE OPLYSTE ØKOSYSTEMER, SÅ DE HAR EN STOR INDVIRKNING PÅ GLOBALE KULSTOF- OG KVÆLSTOFKREDSLØB. PÅ TRODS AF DENS ØKOLOGISKE SUCCES OG BIOTEKNOLOGISKE BETYDNING ER DE MEKANISMER, DER ER ANSVARLIGE FOR DENNE ALSIDIGHED OG EVNE TIL MILJØTILPASNING, IMIDLERTID UKENDTE. I DEN FORBINDELSE SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, AF RELATIVELY FACILITY genetisk MANIPUATION, er en EKSELLENT SYSTEM TIL STUDY af REGULATING INTERACTIONS tillader CIANOBACTERIAS INTEGRATED og RESPONDERLY TIL MUY DYRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Det primære forslag til dette projekt er at karakterisere den multifuncional PIPX PROTEIN, en UN FACTOR AF CIANOBACTERIAS KONCERNING transskriptionelle regulatorer, Signalizing PROTEINS OG metaboliske enzimas i en NETWORK af COMPLETE OG DINAMIC interations. VED HJÆLP AF IN VIVO-SAMRENSNINGSFORSØG MED FLAG-PIPX-PROTEINET SIGTER VI MOD AT IDENTIFICERE NYE KOMPONENTER I DE SIGNALVEJE, SOM PIPX DELTAGER I, UD OVER VALIDERING AF INTERAKTIONER OG TIDLIGERE RESULTATER FRA DOBBELT HYBRIDISEREDE PIPX (XIP-PROTEINER), TREDOBBELT HYBRIDISERING (PXR, IDENTIFICERET VED HJÆLP AF BÅDE PII OG PIPX SOM LOKKEMAD) ELLER I SILICOANALYSE (ORF2060). FOR AT KARAKTERISERE INTERAKTIONER (MELLEM PROTEINER, OG MED MULIGE EFFEKTORER) VIL VI BRUGE IN VITRO OG/ELLER DOBBELT (TREDOBBELT) HYBRID FORSØG MED KOMPLETTE PROTEINER, MUTANTDERIVATER OG/ELLER SPECIFIKKE DOMÆNER. VI VIL TY TIL BRUGEN AF KONFOKAL MIKROSKOPI TIL AT AFGØRE, OM NOGEN AF DE UNDERSØGTE PROTEINER CO-LOKALISERER I DE POLARE SPOTLIGHTS AF PIPX, HVIS DYNAMISKE PLACERING REAGERER PÅ MØRKE LYS CYKLUSSER. FOR AT BESKRIVE PIPX-REGULEREDE GENER UAFHÆNGIGT AF NTCA VIL VI UDFØRE TRANSSKRIPTOMISK ANALYSE MED ET STAMMEPANEL UNDER FORSKELLIGE DYRKNINGSFORHOLD, SOM OMFATTER FORSKELLIGE TYPER AF DERIVATER AF PIPX-GENET OG ANDRE RELATEREDE GENER. DE DATA, DER GENERERES, VIL BLIVE ANVENDT TIL AT KLASSIFICERE DIFFERENTIERET REGULEREDE GENER I GRUPPER MED FÆLLES REGULERINGSSTANDARDER FOR DEREFTER AT TAGE FAT PÅ DE FORSKELLIGE REGULERINGSMEKANISMER, DER ER INVOLVERET. VI VIL UNDERSØGE PXR UNION SITES VED HJÆLP AF CHIP-SEQ, OPLYSNINGER, SOM VI VIL INTEGRERE MED DEN FRA ANALYSEN AF TRANSCRIPTOMICA. VI VIL UNDERSØGE DEN MULIGE METILACION AF ARGININS I PIPX ALPHA-HELICE1 OG, HVOR DET ER RELEVANT, UNDERSØGE DEN FUNKTIONELLE BETYDNING OG GENETISKE DETERMINANTER FOR ÆNDRINGERNE. BÅDE KANDIDATMETHYLASE(R) OG ANDRE PROTEINER, DER FINDES I PROTEIN-PROTEIN OG/ELLER I SILICO INTERAKTIONER, VIL BLIVE ANALYSERET. HENSIGTEN ER AT INAKTIVE DE TILSVARENDE GENER OG RELEVANTE FÆNOTYPISKE ANALYSER. _x000D_ Vi vil også studere MOLECULAR DETAILS I SEMINALISATION ER PROCESSEN af chlorose, En dramatisk tilpasning til forskellige typer af miljø, hvor NBLR og NTCA-PIPX, indtaste andre regulatorer, Konverge for Promotor af NBLA, esential FOR DEN Tillykke af Physiobilisomas. VI ER INTERESSERET I AT DECHIFRERE NOGLE AF DE LOVGIVNINGSMÆSSIGE KOMPLEKSITETER, SÅSOM MEKANISMEN FOR AKTIVERING OG FUNKTION AF NBLR OG I DE REGULERINGSMÆSSIGE INTERAKTIONER AF DE FORSKELLIGE MÅDER, DER KONVERGERER I NBLA-PROMOTOREN. MANGE AF DE FORESLÅEDE METODOLOGISKE STRATEGIER I FORBINDELSE MED PIPX VIL OGSÅ BLIVE ANVENDT SAMMEN MED NBLR. (Danish)
4 August 2022
0 references
CIANOBACTERIILE EFECTUEAZĂ FOTOSINTEZA OXIGENICAN ȘI COLONIZEAZĂ MAJORITATEA ECOSISTEMELOR ILUMINATE, ASTFEL ÎNCÂT ACESTEA AU UN IMPACT MARE ASUPRA CICLURILOR GLOBALE DE CARBON ȘI AZOT. CU TOATE ACESTEA, ÎN CIUDA SUCCESULUI ECOLOGIC ȘI A IMPORTANȚEI SALE BIOTEHNOLOGICE, MECANISMELE RESPONSABILE PENTRU ACEASTĂ VERSATILITATE ȘI CAPACITATEA DE ADAPTARE LA MEDIU RĂMÂN NECUNOSCUTE. ÎN ACEST CONTEXT, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, OF RELATIVELY FACILITY genetical MANIPUATION, este un sistem excelent pentru STUDIA INTERACȚIUNILOR REGULAMENTARE care permit CIANOBACTERIAS INTEGRAT ȘI RESPONDERAL DYSTEMS DYSTEMAL MEDRONMENTAL._x000D_ Propunerea principală a acestui proiect este de a caracteriza PROTEINUL PIPX multifuncțional, un FACTOR al CIANOBACTERIAS CONCERNING regulatori transcripționale, Semnalizarea PROTEINS ȘI enzime metabolice într-o NETWORK de interventii complete si DINAMIC. FOLOSIND TESTE DE CO-PURIFICARE IN VIVO CU PROTEINA FLAG-PIPX, NE PROPUNEM SĂ IDENTIFICĂM NOI COMPONENTE ALE CĂILOR DE SEMNALIZARE LA CARE PARTICIPĂ PIPX, PE LÂNGĂ VALIDAREA INTERACȚIUNILOR ȘI A REZULTATELOR ANTERIOARE DIN PIPX HIBRIDIZAT DUBLU (PROTEINE XIP), HIBRIDIZARE TRIPLĂ (PXR, IDENTIFICATĂ FOLOSIND ATÂT PII, CÂT ȘI PIPX CA MOMEALĂ) SAU ÎN ANALIZA SILICO (ORF2060). PENTRU A CARACTERIZA INTERACȚIUNILE (ÎNTRE PROTEINE ȘI CU POSIBILI EFECTORI) ÎN DETALIU, VOM UTILIZA STUDII HIBRIDE IN VITRO ȘI/SAU DUBLU (TRIPLU) CU PROTEINE COMPLETE, DERIVAȚI MUTANȚI ȘI/SAU DOMENII SPECIFICE. VOM RECURGE LA UTILIZAREA MICROSCOPIEI CONFOCALE PENTRU A DETERMINA DACĂ ORICARE DINTRE PROTEINELE STUDIATE CO-LOCALIZEAZĂ ÎN SPOTURILE POLARE ALE PIPX, A CĂRUI LOCAȚIE DINAMICĂ RĂSPUNDE LA CICLURILE DE LUMINĂ ÎNTUNECATĂ. PENTRU A DESCRIE GENELE REGLEMENTATE PIPX INDEPENDENT DE NTCA, VOM EFECTUA ANALIZE TRANSCRIPTOMIC CU UN PANOU DE TULPINĂ, ÎN DIFERITE CONDIȚII DE CULTURĂ, CARE INCLUDE DIFERITE TIPURI DE DERIVAȚI AI GENEI PIPX, ȘI ALTE GENE ÎNRUDITE. DATELE GENERATE VOR FI UTILIZATE PENTRU A CLASIFICA GENELE REGLEMENTATE DIFERENȚIAT ÎN GRUPURI CU STANDARDE DE REGLEMENTARE COMUNE, PENTRU A ABORDA APOI DIFERITELE MECANISME DE REGLEMENTARE IMPLICATE. VOM INVESTIGA SITURILE UNIUNII PXR FOLOSIND CHIP-SEQ, INFORMAȚII PE CARE LE VOM INTEGRA CU CELE DIN ANALIZA TRANSCRIPTOMICA. VOM INVESTIGA POSIBILA METIALIZIE A ARGININSLOR ÎN PIPX ALFA-HELICE1 ȘI, DUPĂ CAZ, VOM STUDIA SEMNIFICAȚIA FUNCȚIONALĂ ȘI FACTORII GENETICI DETERMINANȚI AI MODIFICĂRILOR. SE ANALIZEAZĂ ATÂT METILAZELE CANDIDATE, CÂT ȘI ALTE PROTEINE CARE SE GĂSESC ÎN INTERACȚIUNILE PROTEIN-PROTEINE ȘI/SAU SILICO. INTENȚIA ESTE DE A INACTIVA GENELE CORESPUNZĂTOARE ȘI ANALIZA FENOTIPICĂ RELEVANTĂ. _x000D_ vom studia, de asemenea, MOLECULAR DETAILS IN THE SEMINALISATION DOES THE PROCESS OF chlorosis, O adaptare dramatică la diferite tipuri de mediu, în care NBLR și NTCA-PIPX, introduceți alte autorități de reglementare, Converge pentru Promotorul NBLA, esential pentru Degratation of Physiobilisomas. SUNTEM INTERESAȚI SĂ DESCIFRĂM O PARTE DIN COMPLEXITATEA REGLEMENTĂRII, CUM AR FI MECANISMUL DE ACTIVARE ȘI FUNCȚIONARE AL NBLR ȘI INTERACȚIUNILE DE REGLEMENTARE ALE DIFERITELOR MODURI CARE CONVERG ÎN PROMOTORUL NBLA. MULTE DINTRE STRATEGIILE METODOLOGICE PROPUSE ÎN LEGĂTURĂ CU PIPX VOR FI, DE ASEMENEA, UTILIZATE ÎMPREUNĂ CU NBLR. (Romanian)
4 August 2022
0 references
CYANOBAKTERIER UTFÖR OXIGENICAN FOTOSYNTES OCH KOLONISERA MAJORITETEN AV UPPLYSTA EKOSYSTEM, SÅ DE HAR EN STOR INVERKAN PÅ GLOBALA KOL- OCH KVÄVECYKLER. TROTS SIN EKOLOGISKA FRAMGÅNG OCH BIOTEKNISKA BETYDELSE ÄR DE MEKANISMER SOM LIGGER TILL GRUND FÖR DENNA MÅNGSIDIGHET OCH KAPACITET FÖR MILJÖANPASSNING FORTFARANDE OKÄNDA. I DETTA SAMMANHANG, SYNECHOCOCCUS ELONGATUS SP. PCC 7942, AV RELATIVELY FACILITY genetisk MANIPUATION, ÄR en EXCELLENT SYSTEM FÖR STUDY of the REGULATING INTERACTIONS som tillåter CIANOBACTERIAS INTEGRATED OCH RESPONDERLY TILL MUYSTEMAL ENVIRONMENTAL DYSTEMS._x000D_ Det primära förslaget i detta projekt är att karakterisera den multifuncional PIPX PROTEIN, en UN FACTOR OF CIANOBACTERIAS CONCERNING transkriptionella regulatorer, Signalizing PROTEINS OCH metabolical enzimas i en NÄTVERK AV COMPLETE OCH DINAMIC Interations. MED HJÄLP AV SAMRENINGSFÖRSÖK IN VIVO MED FLAGG-PIPX-PROTEINET STRÄVAR VI EFTER ATT IDENTIFIERA NYA KOMPONENTER I DE SIGNALVÄGAR SOM PIPX DELTAR I, FÖRUTOM ATT VALIDERA INTERAKTIONER OCH TIDIGARE RESULTAT FRÅN DUBBELHYBRIDISERAD PIPX (XIP-PROTEINER), TRIPPELHYBRIDISERING (PXR, IDENTIFIERAD MED BÅDE PII OCH PIPX SOM BETE) ELLER I SILICO-ANALYS (ORF2060). FÖR ATT BESKRIVA INTERAKTIONER (MELLAN PROTEINER, OCH MED MÖJLIGA EFFEKTORER) MER I DETALJ, KOMMER VI ATT ANVÄNDA IN VITRO OCH/ELLER DUBBLA (TRIPEL) HYBRIDFÖRSÖK MED KOMPLETTA PROTEINER, MUTANTDERIVAT OCH/ELLER SPECIFIKA DOMÄNER. VI KOMMER ATT ANVÄNDA KONFOKAL MIKROSKOPI FÖR ATT AVGÖRA OM NÅGOT AV DE STUDERADE PROTEINERNA SAMLOKALISERAS I POLÄRA SPOTLIGHTS I PIPX, VARS DYNAMISKA LÄGE SVARAR PÅ MÖRKA LJUSCYKLER. FÖR ATT BESKRIVA PIPX-REGLERADE GENER OBEROENDE AV NTCA, KOMMER VI ATT UTFÖRA TRANSKRIPTOMISK ANALYS MED EN STAMPANEL, UNDER OLIKA ODLINGSFÖRHÅLLANDEN, VILKET INKLUDERAR OLIKA TYPER AV DERIVAT AV PIPX-GENEN, OCH ANDRA RELATERADE GENER. DE DATA SOM GENERERAS KOMMER ATT ANVÄNDAS FÖR ATT KLASSIFICERA OLIKA REGLERADE GENER I GRUPPER MED GEMENSAMMA REGLERINGSSTANDARDER, FÖR ATT SEDAN TA ITU MED DE OLIKA REGLERINGSMEKANISMER SOM BERÖRS. VI KOMMER ATT UNDERSÖKA PXR UNIONS WEBBPLATSER MED HJÄLP AV CHIP-SEQ, INFORMATION SOM VI KOMMER ATT INTEGRERA MED DEN FRÅN ANALYSEN AV TRANSCRIPTOMICA. VI KOMMER ATT UNDERSÖKA MÖJLIG METILACION AV ARGININS I PIPX ALFA-HELICE1 OCH, DÄR SÅ ÄR LÄMPLIGT, STUDERA ÄNDRINGARNAS FUNKTIONELLA BETYDELSE OCH GENETISKA BESTÄMNINGSFAKTORER. BÅDE KANDIDATMETYLAS(ER) OCH ANDRA PROTEINER SOM FINNS I PROTEIN-PROTEIN OCH/ELLER SILICO INTERAKTIONER KOMMER ATT ANALYSERAS. AVSIKTEN ÄR ATT INAKTIVA MOTSVARANDE GENER OCH RELEVANT FENOTYPISK ANALYS. _x000D_ vi kommer också att studera MOLECULAR DETAILS I SEMINALISATIONEN FÖR PROCESSEN av kloros, En dramatisk anpassning till olika typer av miljö, där NBLR och NTCA-PIPX, in i andra Tillsynsmyndigheter, Konverge för Promotorn av NBLA, esential FOR THE Degratation of Physiobilisomas. VI ÄR INTRESSERADE AV ATT DECHIFFRERA NÅGRA AV REGLERINGSKOMPLEXITETERNA, SÅSOM MEKANISMEN FÖR AKTIVERING OCH FUNKTION AV NBLR OCH I REGLERINGSSAMSPELET MELLAN DE OLIKA SÄTT SOM KONVERGERAR I NBLA-PROMOTORN. MÅNGA AV DE METODOLOGISKA STRATEGIER SOM FÖRESLÅS I FÖRHÅLLANDE TILL PIPX, KOMMER OCKSÅ ATT ANVÄNDAS MED NBLR. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Alicante/Alacant
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BFU2015-66360-P
0 references