PATHOGENICITY OF BETANODAVIRUS IN CULTURED SOLE (SOLEA SENEGALENSIS) AND ITS RELATION TO HOST IMMUNE RESPONSE (Q3134591): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(Changed label, description and/or aliases in et, lt, hr, el, sk, fi, pl, hu, cs, lv, ga, sl, bg, mt, pt, da, ro, sv, nl, fr, de, it, es, and other parts: Adding translations: et, lt, hr, el, sk, fi, pl, hu, cs, lv, ga, sl, bg, mt, pt, da, ro, sv,) |
(Changed label, description and/or aliases in pt) |
||||||||||||||
| (5 intermediate revisions by 2 users not shown) | |||||||||||||||
| label / pt | label / pt | ||||||||||||||
PATHOGENICITY OF BETANODAVIRUS IN CULTURED SOLE (SOLEA SENEGALENSIS) AND SUA RELAÇÃO COM A RESPOSTA IMUNE DO Acolhimento | |||||||||||||||
| Property / budget | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / budget: 169,400.0 Euro / rank | |||||||||||||||
| Property / co-financing rate | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / co-financing rate: 80.0 percent / rank | |||||||||||||||
| Property / EU contribution | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / EU contribution: 135,520.0 Euro / rank | |||||||||||||||
| Property / summary: VIRAL NERVE NECROSIS (NNV) IS A DISEASE THAT AFFECTS A VARIETY OF FISH WORLDWIDE, CAUSING HIGH MORTALITY RATES, ESPECIALLY IN LARVAE AND JUVENILES. THE ETHIOLOGIC AGENT OF THE DISEASE IS A BETANODAVIRUS, WHICH HAS A BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOME COMPOSED OF RNA1, WHICH ENCODES VIRAL POLYMERASE, AND RNA2, WHICH ENCODES THE CAPSIDE PROTEIN. IN ADDITION, THEY SYNTHESISE A SUBGENOMIC RNA, RNA3, WHICH ENCODES PROTEINS B1 (ANTI-NECROTIC FACTOR) AND B2 (PROTECTION OF VIRAL REPLICATION AGAINST CELLULAR INTERFERING RNA). BETANODAVIRUSES ARE CLASSIFIED INTO 4 GENOTYPES ACCORDING TO THE T4 SEQUENCE OF RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV AND RGNNV. HOWEVER, IN RECENT YEARS THE ISOLATION OF NATURAL RECOMBINANTS RG/SJ (RNA1 TYPE RGNNV AND RNA2 SJNNV) HAS BEEN DOCUMENTED IN SOUTHERN EUROPE. ALL ISOLATED RECOMBINANTS OF SOLE AND GOLD GROWN IN THE IBERIAN PENINSULA HAVE A CAPSIDE PROTEIN WITH 3 DIFFERENT AMINOACIDIC POSITIONS COMPARED TO THAT OF SJNNV, 2 OF THEM AT THE END C-TERMINAL, REGION DETERMINING HOST SPECIFICITY, WHICH HAS BEEN SHOWN TO PLAY AN IMPORTANT ROLE IN VIRULENCE, AND ONE IN THE N-TERMINAL REGION. IN ADDITION, THESE RECOMBINANTS PRESENT IN POLYMERASE 19 DIFFERENT AMIOACIDIC RESIDUES WITH RESPECT TO POLYMERASE OF THE RG-TYPE STRAIN, AND IN THE NON-CODING REGIONS OF BOTH GENOMIC SEGMENTS A TOTAL OF 4 NUCLEOTIDES THAT DO NOT COINCIDE WITH THE RG (RNA1) AND SJ (RNA2) TYPE STRAINS. ALL THESE CHANGES CAN PLAY AN IMPORTANT ROLE IN VIRULENCE AND REPLICATIVE CAPACITY. THE STUDY OF VIRULENCE DETERMINANTS (ADDITIONALLY RELATED, WITH POLYMERASE AND WITH ORF B1 AND B2) IS FUNDAMENTAL TO UNDERSTANDING AND CONTROLLING THE DISEASE, ASPECTS THAT WILL BE ADDRESSED BY THE USC RESEARCH TEAM. IT IS WELL KNOWN THAT THE DEVELOPMENT OF THE DISEASE DOES NOT DEPEND ONLY ON THE PATHOGEN, BEING DETERMINED BY VIRUS-HOST INTERACTION. THE IMPLICATION OF THE HOST IS BASED ON THE STIMULATION OF THE IMMUNE SYSTEM, WHICH WILL BE CHARACTERISED BY THE RESEARCH TEAM OF THE UMA. THE VIRIC INFECTION INDUCES THE ACTIVATION OF BOTH THE INNATE IMMUNE SYSTEM AND THE ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM. STUDIES ON THE ACTIVATION OF THE IMMUNE SYSTEM TO BE CARRIED OUT INCLUDE PERFORMING A MASSIVE TRANSCRIPTOMIC SEQUENCING (RNA-SEQ) IN RESPONSE TO VIRUS INFECTIONS OF DIFFERENT VIRULENCE FOR SOLE. This STUDY will generate a VALIOSISIM INFORMATION ON Immunogens IMPLICED IN ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, THE TIME that will allow the design of OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TIME WITH TaqMan SOUNDS to be used to study, a LEVEL OF GENICAL EXPENDITURE, THE RESPONSE OF THE IMMUNE SYSTEM OF LINKING TO RECOMMENDANT VIRUS, OBTENTED BY GENETICA INVERSA, WITH DYSTEM LIVEL OF VIRULENCE._x000D_ Attention to this hypothesis, the PRINCIPAL OBJECTIVE OF THE PRESENT PROJECT is to analyse the FACTORS IMPLICED IN THE VIRULENCE OF Betanodavirus IN LENGUATED AND RELATION TO THE IMMUNE RESPONSE OF THE host. (English) / qualifier | |||||||||||||||
readability score: 0.7888821905586588
| |||||||||||||||
| Property / summary | Property / summary | ||||||||||||||
A neurose nervosa viral (NNV) é uma doença que afeta uma variedade de peixes em todo o mundo, causando altas taxas de mortalidade, especialmente em larvas e juvenis. O agente etiológico da doença é um betanodavirose, que tem um genoma de ARN MONOCATENÁRIO BISEGMENTADO composto de ARN1, que codifica a polimerização viral, e ARN2, que codifica a proteína cápside. Além disso, sintetizam um ARN subgenómico, o ARN3, que codifica as proteínas B1 (fator anti-necrótico) e B2 (proteção da replicação viral contra o ARN de interferência celular). CLASSIFICAM-SE OS BETANODAVÍRIOS EM 4 GENÓTIPOS DE ACORDO COM A SEQUÊNCIA T4 DO ARN2: SJNNV, TPNNV, BFNNV E RGNNV. No entanto, em anos recentes, a ISOLAÇÃO DE RECOMBINANTES NATURAIS RG/SJ (Tipo de ARN1 RGNNV e ARN2 SJNNV) foi DOCUMENTADA na Europa do Sul. Todos os recombinantes isolados de só e de ouro cultivados na pENÍNSULA IBERIA têm uma proteína cápside com 3 posições aminoacídicas diferentes em comparação com a de SJNNV, 2 delas no final do C-terminal, região que determina a especificidade do hospedeiro, que foi mostrado para jogar um papel importante em virulência, e uma na região N-terminal. Além disso, estes recombinantes estão presentes na polimerização 19 diferentes resíduos amioacídicos no que diz respeito à polimerização da estirpe do tipo RG e, nas regiões não codificantes de ambos os segmentos genéticos, um total de 4 nucleótidos que não coincidam com as estirpes do tipo RG (RNA1) e SJ (RNA2). Todas estas mudanças podem desempenhar um papel importante na violência e na capacidade de resposta. O estudo dos DETERMINANTES DE VIRULÊNCIA (ADDICIONALMENTE RELACIONADOS, COM POLIMERASE E COM ORF B1 E B2) é fundamental para compreender e controlar a doença, aspectos que serão abordados pela equipa de investigação do USC. É sabido que o desenvolvimento da doença não depende apenas do patogéneo, sendo determinado pela interacção com o vírus. A implantação do hospedeiro baseia-se na estabilização do sistema de imunização, que será caracterizado pela equipa de investigação da UMA. A INFEÇÃO VIRICA INDUZ A ATIVAÇÃO DO SISTEMA INNATE IMMUNE E DO SISTEMA ADAPTIVE IMMUNE. ESTUDOS SOBRE A ATIVAÇÃO DO SISTEMA DE IMUNAS A REALIZAR INCLUINDO A REALIZAÇÃO DE UMA SEQUÊNCIA TRANSCRIPTÓMICA MASSIVA (RNA-SEQ) EM RESPOSTA A INFEÇÕES VÍRUS DE DIFERENTES VIRULÊNCIAS POR SOLA. Este ESTUDO irá gerar uma INFORMAÇÃO VALIOSÍSIMA SOBRE Imunogénios IMPLICADOS EM RUAS ANTIVIÁRIAS DE DEFENSA, O TEMPO que permitirá o desenho de OPENARRAYS BASEADOS EM PCR EM TEMPO REAL COM SOMES TaqMan a serem utilizados para estudar, um NÍVEL DE DESPESAS GENICAS, A RESPOSTA DO SISTEMA IMUNO DE LIGAÇÃO A VÍRUS RECOMENDANTES, OBTENCIONADO PELA GENETICA INVERSA, COM UM SISTEMA DE VIRULÊNCIA._x000D_ Atenção a esta hipótese, o OBJETIVO PRINCIPAL DO PRESENTE PROJETO é analisar os FATORES IMPLICADOS NA VIRULÊNCIA DE Betanodavírus EM LENGUADO E RELACIONADO À RESPOSSÃO IMUNTA DO anfitrião. (Portuguese) | |||||||||||||||
| Property / postal code | |||||||||||||||
| Property / postal code: 29067 / rank | |||||||||||||||
| Property / location (string) | |||||||||||||||
| Property / location (string): Málaga / rank | |||||||||||||||
| Property / coordinate location | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / coordinate location: 36°43'16.68"N, 4°25'17.90"W / rank | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS: Málaga Province / rank | |||||||||||||||
| Property / location (string) | |||||||||||||||
Málaga | |||||||||||||||
| Property / location (string): Málaga / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / postal code | |||||||||||||||
29071 | |||||||||||||||
| Property / postal code: 29071 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS: Málaga Province / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS: Málaga Province / qualifier | |||||||||||||||
| Property / contained in Local Administrative Unit | |||||||||||||||
| Property / contained in Local Administrative Unit: Málaga / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / contained in Local Administrative Unit: Málaga / qualifier | |||||||||||||||
| Property / coordinate location | |||||||||||||||
36°42'53.86"N, 4°29'15.36"W
| |||||||||||||||
| Property / coordinate location: 36°42'53.86"N, 4°29'15.36"W / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / coordinate location: 36°42'53.86"N, 4°29'15.36"W / qualifier | |||||||||||||||
| Property / budget | |||||||||||||||
169,400.0 Euro
| |||||||||||||||
| Property / budget: 169,400.0 Euro / rank | |||||||||||||||
Preferred rank | |||||||||||||||
| Property / EU contribution | |||||||||||||||
136,468.64 Euro
| |||||||||||||||
| Property / EU contribution: 136,468.64 Euro / rank | |||||||||||||||
Preferred rank | |||||||||||||||
| Property / co-financing rate | |||||||||||||||
80.56 percent
| |||||||||||||||
| Property / co-financing rate: 80.56 percent / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / date of last update | |||||||||||||||
20 December 2023
| |||||||||||||||
| Property / date of last update: 20 December 2023 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Latest revision as of 22:43, 9 October 2024
Project Q3134591 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | PATHOGENICITY OF BETANODAVIRUS IN CULTURED SOLE (SOLEA SENEGALENSIS) AND ITS RELATION TO HOST IMMUNE RESPONSE |
Project Q3134591 in Spain |
Statements
136,468.64 Euro
0 references
169,400.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
1 January 2015
0 references
31 December 2018
0 references
UNIVERSIDAD DE MALAGA
0 references
29071
0 references
LA NECROSIS NERVIOSA VIRAL (NNV) ES UNA ENFERMEDAD QUE AFECTA A GRAN VARIEDAD DE PECES EN TODO EL MUNDO, CAUSANDO ELEVADAS TASAS DE MORTALIDAD, SOBRE TODO EN LARVAS Y JUVENILES. EL AGENTE ETIOLOLOGICO DE LA ENFERMEDAD ES UN BETANODAVIRUS, QUE POSEE UN GENOMA RNA MONOCATENARIO BISEGMENTADO COMPUESTO POR EL RNA1, QUE CODIFICA LA POLIMERASA VIRAL, Y EL RNA2, QUE CODIFICA LA PROTEINA DE LA CAPSIDE. ADEMAS, SINTETIZAN UN RNA SUBGENOMICO, RNA3, QUE CODIFICA LAS PROTEINAS B1 (FACTOR ANTI-NECROTICO) Y B2 (PROTECCION DE LA REPLICACION VIRAL FRENTE A RNA INTERFERENTES CELULARES). LOS BETANODAVIRUS SE CLASIFICAN EN 4 GENOTIPOS SEGUN LA SECUENCIA T4 DEL RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV Y RGNNV. SIN EMBARGO EN LOS ULTIMOS AÑOS SE HA DOCUMENTADO EL AISLAMIENTO DE RECOMBINANTES NATURALES RG/SJ (RNA1 TIPO RGNNV Y RNA2 SJNNV) EN EL SUR DE EUROPA. TODOS LOS RECOMBINATES AISLADOS DE LENGUADO Y DORADA CULTIVADOS EN LA PENINSULA IBERICA TIENEN UNA PROTEINA DE LA CAPSIDE CON 3 POSICIONES AMINOACIDICAS DIFERENTES RESPECTO A LA DE SJNNV, 2 DE ELLAS EN EL EXTREMO C-TERMINAL, REGION DETERMINANTE DE ESPECIFICIDAD DE HOSPEDADOR, QUE SE HA DEMOSTRADO JUEGAN UN PAPEL IMPORTANTE EN LA VIRULENCIA, Y UNA EN LA REGION N-TERMINAL. ASIMISMO, ESTOS RECOMBINANTES PRESENTAN EN LA POLIMERASA 19 RESIDUOS AMIOACIDICOS DIFERENTES CON RESPECTO A LA POLIMERASA DE LA CEPA TIPO RG, Y EN LAS REGIONES NO CODIFICANTES DE AMBOS SEGMENTOS GENOMICOS UN TOTAL DE 4 NUCLEOTIDOS QUE NO COINCIDEN CON LAS CEPAS TIPO RG (RNA1) Y SJ (RNA2). TODOS ESTOS CAMBIOS PUEDEN DESEMPEÑAR UN PAPEL IMPORTANTE EN LA VIRULENCIA Y EN LA CAPACIDAD REPLICATIVA. EL ESTUDIO DE LOS DETERMINANTES DE VIRULENCIA (RELACIONADA ADEMAS, CON LA POLIMERASA Y CON LOS ORF B1 Y B2) ES FUNDAMENTAL PARA ENTENDER Y CONTROLAR LA ENFERMEDAD, ASPECTOS QUE SERAN ABORDADOS POR EL EQUIPO DE INVESTIGACION DE LA USC. ES BIEN SABIDO QUE EL DESARROLLO DE LA ENFERMEDAD NO DEPENDE SOLO DEL PATOGENO, ESTANDO DETERMINADO POR LA INTERACCION VIRUS-HOSPEDADOR. LA IMPLICACION DEL HOSPEDADOR ESTA BASADA EN LA ESTIMULACION DEL SISTEMA INMUNE, QUE SERA CARACTERIZADO POR EL EQUIPO DE INVESTIGACION DE LA UMA. LA INFECCION VIRICA INDUCE LA ACTIVACION TANTO DEL SISTEMA INMUNE INNATO COMO DEL ADAPTATIVO. LOS ESTUDIOS SOBRE LA ACTIVACION DEL SISTEMA INMUNE QUE SE LLEVARAN A CABO INCLUYEN LA REALIZACION DE UNA SECUENCIACION MASIVA TRANSCRIPTOMICA (RNA-SEQ) EN RESPUESTA A INFECCIONES POR VIRUS DE DISTINTA VIRULENCIA PARA LENGUADO. ESTE ESTUDIO GENERARA UNA INFORMACION VALIOSISIMA SOBRE LOS INMUNOGENES IMPLICADOS EN RUTAS DE DEFENSA ANTIVIRICAS, AL TIEMPO QUE PERMITIRA EL DISEÑO DE OPENARRAYS BASADOS EN PCR A TIEMPO REAL CON SONDAS TAQMAN QUE SE UTILIZARAN PARA ESTUDIAR, A NIVEL DE EXPESION GENICA, LA RESPUESTA DEL SISTEMA INMUNE DE LENGUADO FRENTE A VIRUS RECOMBINANTES, OBTENIDOS POR GENETICA INVERSA, CON DISTINTO NIVEL DE VIRULENCIA._x000D_ ATENDIENDO A ESTA HIPOTESIS, EL OBJETIVO PRINCIPAL DEL PRESENTE PROYECTO ES ANALIZAR LOS FACTORES IMPLICADOS EN LA VIRULENCIA DE BETANODAVIRUS EN LENGUADO Y SU RELACION CON LA RESPUESTA INMUNE DEL HOSPEDADOR. (Spanish)
0 references
VIRAL NERVE NECROSIS (NNV) IS A DISEASE THAT AFFECTS A VARIETY OF FISH WORLDWIDE, CAUSING HIGH MORTALITY RATES, ESPECIALLY IN LARVAE AND JUVENILES. THE ETHIOLOGIC AGENT OF THE DISEASE IS A BETANODAVIRUS, WHICH HAS A BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOME COMPOSED OF RNA1, WHICH ENCODES VIRAL POLYMERASE, AND RNA2, WHICH ENCODES THE CAPSIDE PROTEIN. IN ADDITION, THEY SYNTHESISE A SUBGENOMIC RNA, RNA3, WHICH ENCODES PROTEINS B1 (ANTI-NECROTIC FACTOR) AND B2 (PROTECTION OF VIRAL REPLICATION AGAINST CELLULAR INTERFERING RNA). BETANODAVIRUSES ARE CLASSIFIED INTO 4 GENOTYPES ACCORDING TO THE T4 SEQUENCE OF RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV AND RGNNV. HOWEVER, IN RECENT YEARS THE ISOLATION OF NATURAL RECOMBINANTS RG/SJ (RNA1 TYPE RGNNV AND RNA2 SJNNV) HAS BEEN DOCUMENTED IN SOUTHERN EUROPE. ALL ISOLATED RECOMBINANTS OF SOLE AND GOLD GROWN IN THE IBERIAN PENINSULA HAVE A CAPSIDE PROTEIN WITH 3 DIFFERENT AMINOACIDIC POSITIONS COMPARED TO THAT OF SJNNV, 2 OF THEM AT THE END C-TERMINAL, REGION DETERMINING HOST SPECIFICITY, WHICH HAS BEEN SHOWN TO PLAY AN IMPORTANT ROLE IN VIRULENCE, AND ONE IN THE N-TERMINAL REGION. IN ADDITION, THESE RECOMBINANTS PRESENT IN POLYMERASE 19 DIFFERENT AMIOACIDIC RESIDUES WITH RESPECT TO POLYMERASE OF THE RG-TYPE STRAIN, AND IN THE NON-CODING REGIONS OF BOTH GENOMIC SEGMENTS A TOTAL OF 4 NUCLEOTIDES THAT DO NOT COINCIDE WITH THE RG (RNA1) AND SJ (RNA2) TYPE STRAINS. ALL THESE CHANGES CAN PLAY AN IMPORTANT ROLE IN VIRULENCE AND REPLICATIVE CAPACITY. THE STUDY OF VIRULENCE DETERMINANTS (ADDITIONALLY RELATED, WITH POLYMERASE AND WITH ORF B1 AND B2) IS FUNDAMENTAL TO UNDERSTANDING AND CONTROLLING THE DISEASE, ASPECTS THAT WILL BE ADDRESSED BY THE USC RESEARCH TEAM. IT IS WELL KNOWN THAT THE DEVELOPMENT OF THE DISEASE DOES NOT DEPEND ONLY ON THE PATHOGEN, BEING DETERMINED BY VIRUS-HOST INTERACTION. THE IMPLICATION OF THE HOST IS BASED ON THE STIMULATION OF THE IMMUNE SYSTEM, WHICH WILL BE CHARACTERISED BY THE RESEARCH TEAM OF THE UMA. THE VIRIC INFECTION INDUCES THE ACTIVATION OF BOTH THE INNATE IMMUNE SYSTEM AND THE ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM. STUDIES ON THE ACTIVATION OF THE IMMUNE SYSTEM TO BE CARRIED OUT INCLUDE PERFORMING A MASSIVE TRANSCRIPTOMIC SEQUENCING (RNA-SEQ) IN RESPONSE TO VIRUS INFECTIONS OF DIFFERENT VIRULENCE FOR SOLE. This STUDY will generate a VALIOSISIM INFORMATION ON Immunogens IMPLICED IN ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, THE TIME that will allow the design of OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TIME WITH TaqMan SOUNDS to be used to study, a LEVEL OF GENICAL EXPENDITURE, THE RESPONSE OF THE IMMUNE SYSTEM OF LINKING TO RECOMMENDANT VIRUS, OBTENTED BY GENETICA INVERSA, WITH DYSTEM LIVEL OF VIRULENCE._x000D_ Attention to this hypothesis, the PRINCIPAL OBJECTIVE OF THE PRESENT PROJECT is to analyse the FACTORS IMPLICED IN THE VIRULENCE OF Betanodavirus IN LENGUATED AND RELATION TO THE IMMUNE RESPONSE OF THE host. (English)
12 October 2021
0.7888821905586588
0 references
LA NÉCROSE NERVEUSE VIRALE (NNV) EST UNE MALADIE QUI TOUCHE UNE VARIÉTÉ DE POISSONS DANS LE MONDE ENTIER, PROVOQUANT DES TAUX DE MORTALITÉ ÉLEVÉS, EN PARTICULIER CHEZ LES LARVES ET LES JUVÉNILES. L’AGENT ETHIOLOGIQUE DE LA MALADIE EST UN BETANODAVIRUS, QUI A UN GÉNOME DE L’ARN MONOCATENAIRE BISEGMENTÉ COMPOSÉ DE L’ARN1, QUI CODE LA POLYMÉRASE VIRALE, ET DE L’ARN2, QUI CODE LA PROTÉINE CAPSIDE. EN OUTRE, ILS SYNTHÉTISENT UN ARN SUBGÉNOMIQUE, L’ARN3, QUI CODE LES PROTÉINES B1 (FACTEUR ANTINÉCROTIQUE) ET B2 (PROTECTION DE LA RÉPLICATION VIRALE CONTRE L’ARN INTERFÉRENTIEL CELLULAIRE). LES BETANODAVIRUSES SONT CLASSÉS EN 4 GÉNOTYPES SELON LA SÉQUENCE T4 DE L’ARN2: SJNNV, TPNNV, BFNNV ET RGNNV. TOUTEFOIS, CES DERNIÈRES ANNÉES, L’ISOLEMENT DES RECOMBINANTS NATURELS RG/SJ (RNA1 DE TYPE RGNNV ET RNA2 SJNNV) A ÉTÉ DOCUMENTÉ DANS LE SUD DE L’EUROPE. TOUS LES RECOMBINANTS ISOLÉS DE SOLE ET D’OR CULTIVÉS DANS LA PÉNINSULE IBÉRIQUE ONT UNE PROTÉINE DE CAPSIDE AVEC 3 POSITIONS AMINOACIDES DIFFÉRENTES PAR RAPPORT À CELLES DE SJNNV, DONT 2 À LA FIN DU C-TERMINAL, RÉGION DÉTERMINANT LA SPÉCIFICITÉ DE L’HÔTE, QUI A ÉTÉ DÉMONTRÉE POUR JOUER UN RÔLE IMPORTANT DANS LA VIRULENCE, ET UN DANS LA RÉGION N-TERMINALE. EN OUTRE, CES RECOMBINANTS PRÉSENTENT DANS LA POLYMÉRASE 19 RÉSIDUS AMIOACIDIC DIFFÉRENTS PAR RAPPORT À LA POLYMÉRASE DE LA SOUCHE DE TYPE RG, ET DANS LES RÉGIONS NON CODANTES DES DEUX SEGMENTS GÉNOMIQUES, UN TOTAL DE 4 NUCLÉOTIDES QUI NE COÏNCIDENT PAS AVEC LES SOUCHES DE TYPE RG (RNA1) ET SJ (RNA2). TOUS CES CHANGEMENTS PEUVENT JOUER UN RÔLE IMPORTANT DANS LA VIRULENCE ET LA CAPACITÉ DE REPRODUCTION. L’ÉTUDE DES DÉTERMINANTS DE LA VIRULENCE (SUPPLÉMENT LIÉES À LA POLYMÉRASE ET À L’ORF B1 ET B2) EST FONDAMENTALE POUR COMPRENDRE ET CONTRÔLER LA MALADIE, ASPECTS QUI SERONT ABORDÉS PAR L’ÉQUIPE DE RECHERCHE DE L’USC. IL EST BIEN CONNU QUE LE DÉVELOPPEMENT DE LA MALADIE NE DÉPEND PAS SEULEMENT DE L’AGENT PATHOGÈNE, ÉTANT DÉTERMINÉ PAR L’INTERACTION VIRUS-HÔTE. L’IMPLICATION DE L’HÔTE EST BASÉE SUR LA STIMULATION DU SYSTÈME IMMUNITAIRE, QUI SERA CARACTÉRISÉE PAR L’ÉQUIPE DE RECHERCHE DE L’UMA. L’INFECTION VIRALE INDUIT L’ACTIVATION À LA FOIS DU SYSTÈME IMMUNITAIRE INNÉ ET DU SYSTÈME IMMUNITAIRE ADAPTATIF. LES ÉTUDES SUR L’ACTIVATION DU SYSTÈME IMMUNITAIRE À RÉALISER COMPRENNENT LA RÉALISATION D’UN SÉQUENÇAGE TRANSCRIPTOMIQUE MASSIF (ARN-SEQ) EN RÉPONSE À DES INFECTIONS VIRALES DE VIRULENCE DIFFÉRENTE POUR LA SOLE. Cette ÉTUDE générera une INFORMATION VALIOSISIME SUR LES immunogènes impliqués DANS LES RUTS ANTIVIRICES DE DEFENSA, LE TEMPS qui permettra de concevoir des OPENARRAYS BASED DANS LE TEMPS REAL AVEC TaqMan à utiliser pour étudier, un NIVEAU DE DÉPENDITURE GÉNIQUE, la RÉPONSE DU SYSTÈME IMMUNE DE LINKING TO RECOMMENDANT VIRUS, OBTENTED PAR GENETICA inversa, AVEC DYSTÈME VIRULENCE._x000D_ Attention à cette hypothèse, l’OBJECTIVE PRINCIPALE DU PROJET PRESENT consiste à analyser les FACTORS impliqués dans la VIRULENCE DU Bétanodavirus EN LÉGUÉ ET LA RELATION À LA RÉPONSE IMMUINE DE L’hôte. (French)
2 December 2021
0 references
VIRALE NERVENNEKROSE (NNV) IST EINE KRANKHEIT, DIE EINE VIELZAHL VON FISCHEN WELTWEIT BETRIFFT UND HOHE STERBLICHKEITSRATEN VERURSACHT, INSBESONDERE BEI LARVEN UND JUNGFISCHEN. DER ETHIOLOGIC-AGENT DER KRANKHEIT IST EIN BETANODAVIRUS, DAS EIN BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOM HAT, DAS AUS RNA1 BESTEHT, DAS VIRALE POLYMERASE KODIERT, UND RNA2, DAS DAS CAPSIDE-PROTEIN KODIERT. DARÜBER HINAUS SYNTHETISIEREN SIE EINE SUBGENOMISCHE RNA, RNA3, DIE PROTEINE B1 (ANTINEKROTIKFAKTOR) UND B2 (SCHUTZ DER VIRUSREPLIKATION GEGEN ZELLULÄRE INTERFERING RNA) KODIERT. BETANODAVIRUSES WERDEN GEMÄSS DER T4-SEQUENZ VON RNA2 IN 4 GENOTYPEN EINGESTUFT: SJNNV, TPNNV, BFNNV UND RGNNV. IN DEN LETZTEN JAHREN WURDE JEDOCH DIE ISOLIERUNG DER NATÜRLICHEN REKOMBINANTEN RG/SJ (RNA1 TYP RGNNV UND RNA2 SJNNV) IN SÜDEUROPA DOKUMENTIERT. ALLE ISOLIERTEN REKOMBINANTEN VON SOHLE UND GOLD, DIE AUF DER IBERISCHEN HALBINSEL ANGEBAUT WERDEN, HABEN EIN CAPSIDE-PROTEIN MIT 3 VERSCHIEDENEN AMINOAZIDISCHEN POSITIONEN IM VERGLEICH ZU DER VON SJNNV, 2 DAVON AM ENDE C-TERMINAL, VON DENEN 2 AM ENDE DER C-TERMINALREGION, DIE DIE WIRTSSPEZIALITÄT BESTIMMT, EINE WICHTIGE ROLLE IN DER VIRULENZ SPIELEN, UND EINES IN DER N-TERMINAL-REGION. DARÜBER HINAUS ENTHALTEN DIESE REKOMBINANZIEN IN DER POLYMERASE 19 VERSCHIEDENE AMIOACIDIC-RÜCKSTÄNDE IN BEZUG AUF POLYMERASE DES RG-TYPSSTAMMS UND IN DEN NICHTKODIERUNGSREGIONEN BEIDER GENOMISCHEN SEGMENTE INSGESAMT 4 NUKLEOTIDE, DIE NICHT MIT DEN STÄMMEN RG (RNA1) UND SJ (RNA2) ÜBEREINSTIMMEN. ALL DIESE VERÄNDERUNGEN KÖNNEN EINE WICHTIGE ROLLE BEI VIRULENZ UND REPLIKATIONSFÄHIGKEIT SPIELEN. DIE UNTERSUCHUNG VON VIRULENZDETERMINANTEN (ZUSÄTZLICH MIT POLYMERASE UND MIT ORF B1 UND B2) IST VON GRUNDLEGENDER BEDEUTUNG FÜR DAS VERSTÄNDNIS UND DIE KONTROLLE DER KRANKHEIT, ASPEKTE, DIE VOM USC-FORSCHUNGSTEAM BEHANDELT WERDEN. ES IST BEKANNT, DASS DIE ENTWICKLUNG DER KRANKHEIT NICHT NUR VON DEM ERREGER ABHÄNGT, DER DURCH DIE WECHSELWIRKUNG ZWISCHEN VIREN UND WIRTS BESTIMMT WIRD. DIE IMPLIKATION DES WIRTS BASIERT AUF DER STIMULATION DES IMMUNSYSTEMS, DAS SICH DURCH DAS FORSCHUNGSTEAM DER UMA AUSZEICHNEN WIRD. DIE VIRISCHE INFEKTION INDUZIERT DIE AKTIVIERUNG SOWOHL DES ANGEBORENEN IMMUNSYSTEMS ALS AUCH DES ADAPTIVEN IMMUNSYSTEMS. STUDIEN ZUR AKTIVIERUNG DES ZU DURCHFÜHRENDEN IMMUNSYSTEMS UMFASSEN DIE DURCHFÜHRUNG EINER MASSIVEN TRANSKRIPTOM-SEQUENZIERUNG (RNA-SEQ) ALS REAKTION AUF VIRUSINFEKTIONEN UNTERSCHIEDLICHER VIRULENZ FÜR DIE SEEZUNGE. Diese STUDY wird eine VALIOSISIM-Informationen über Immunogene erzeugen, die in ANTIVIRIC RUTS von DEFENSA, der Zeit, die das Design von OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TIME mit Taqman-Sounds verwendet werden, verwendet werden, um zu studieren, ein LEVEL GENICAL EXPENDITURE, DIE RESPONSE DES IMMUNE SYSTEMS DER LINKING FÜR EMPFEHLUNG VIRUS, OBTENTED BY GENETICA inversa, MIT DYSTEM livel OF VIRULENCE._x000D_ Achtung dieser Hypothese, das PRINCIPAL OBJECT DES PRÄSENTS PROJEKT ist es, die FACTOREN zu analysieren, die in der VIRULENCE des Betanodavirus in LENGUATED und RELATION an die IMMUNE RESPONSE des Gastgebers enthalten sind. (German)
9 December 2021
0 references
VIRALE ZENUWNECROSE (NNV) IS EEN ZIEKTE DIE WERELDWIJD EEN VERSCHEIDENHEID AAN VISSEN TREFT EN HOGE STERFTECIJFERS VEROORZAAKT, VOORAL BIJ LARVEN EN JUVENIELEN. HET ETHIOLOGISCHE AGENS VAN DE ZIEKTE IS EEN BETANODAVIRUS, DAT EEN BISEGMENTED MONOCATENARY RNA-GENOOM HEEFT DAT BESTAAT UIT RNA1, DAT VIRALE POLYMERASE CODEERT, EN RNA2, DAT HET CAPSIDE-EIWIT CODEERT. DAARNAAST SYNTHETISEREN ZIJ EEN SUBGENOMIC RNA, RNA3, DAT EIWITTEN B1 (ANTI-NECROTISCHE FACTOR) EN B2 (BESCHERMING VAN VIRALE REPLICATIE TEGEN CELLULAIR INTERFERING RNA) CODEERT. BETANODAVIRUSES WORDEN INGEDEELD IN 4 GENOTYPES VOLGENS DE T4-SEQUENTIE VAN RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV EN RGNNV. IN DE AFGELOPEN JAREN IS DE ISOLATIE VAN NATUURLIJKE RECOMBINANTEN RG/SJ (RNA1 TYPE RGNNV EN RNA2 SJNNV) ECHTER GEDOCUMENTEERD IN ZUID-EUROPA. ALLE GEÏSOLEERDE RECOMBINANTEN VAN TONG EN GOUD DIE OP HET IBERISCH SCHIEREILAND WORDEN GETEELD, HEBBEN EEN CAPSIDE-EIWIT MET 3 VERSCHILLENDE AMINOZUURPOSITIES IN VERGELIJKING MET DIE VAN SJNNV, 2 VAN HEN AAN HET EIND VAN DE C-TERMINAL, REGIO DIE DE SPECIFICITEIT VAN DE GASTHEER BEPAALT, DIE EEN BELANGRIJKE ROL IN VIRULENTIE HEEFT AANGETOOND, EN ÉÉN IN DE N-TERMINALREGIO. BOVENDIEN BEVATTEN DEZE RECOMBINANTEN IN POLYMERASE 19 VERSCHILLENDE AMIOACIDIC-RESIDUEN MET BETREKKING TOT POLYMERASE VAN HET RG-TYPE STAM, EN IN DE NIET-CODERENDE GEBIEDEN VAN BEIDE GENOMISCHE SEGMENTEN EEN TOTAAL VAN 4 NUCLEOTIDEN DIE NIET SAMENVALLEN MET DE STAMMEN VAN HET RG-TYPE (RNA1) EN SJ (RNA2). AL DEZE VERANDERINGEN KUNNEN EEN BELANGRIJKE ROL SPELEN IN VIRULENTIE EN REPLICATIECAPACITEIT. DE STUDIE VAN VIRULENTIEDETERMINANTEN (AANVULLEND GERELATEERD, MET POLYMERASE EN MET ORF B1 EN B2) IS VAN FUNDAMENTEEL BELANG VOOR HET BEGRIJPEN EN BEHEERSEN VAN DE ZIEKTE, ASPECTEN DIE DOOR HET USC-ONDERZOEKSTEAM ZULLEN WORDEN AANGEPAKT. HET IS ALGEMEEN BEKEND DAT DE ONTWIKKELING VAN DE ZIEKTE NIET ALLEEN AFHANGT VAN HET PATHOGEEN, WORDT BEPAALD DOOR VIRUS-HOST INTERACTIE. DE IMPLICATIE VAN DE GASTHEER IS GEBASEERD OP DE STIMULATIE VAN HET IMMUUNSYSTEEM, DAT ZAL WORDEN GEKENMERKT DOOR HET ONDERZOEKSTEAM VAN DE UMA. DE VIRIC INFECTIE INDUCEERT DE ACTIVERING VAN ZOWEL HET AANGEBOREN IMMUUNSYSTEEM ALS HET ADAPTIEVE IMMUUNSYSTEEM. STUDIES NAAR DE ACTIVERING VAN HET UIT TE VOEREN IMMUUNSYSTEEM OMVATTEN HET UITVOEREN VAN EEN MASSIEVE TRANSCRIPTOMISCHE SEQUENCING (RNA-SEQ) IN REACTIE OP VIRUSINFECTIES VAN VERSCHILLENDE VIRULENTIE VOOR TONG. Deze STUDIE zal een VALIOSISIM INFORMATIE genereren over immunogenen die betrokken zijn in ANTIVIRIC RUTS VAN DEFENSA, DE TIJD waarmee het ontwerp van OPENARRAYS in PCR REAL TIJD MET TaqMan SOUNDS kan worden gebruikt om te bestuderen, een LEVEL VAN GENICALE EXPENDITURE, de RESPONSE VAN DE IMMUNE SYSTEM VAN LINKING AANBEVELENDE VIRUS, OBTENTED BY GENETICA inversa, MET DYSTEM livel OF VIRULENCE._x000D_ Aandacht voor deze hypothese, de PRINCIPAL OBJECTIVE van het PRESENT PROJECT is het analyseren van de FACTORS betrokken in de VIRULENCE van Betanodavirus IN LENGUATE EN RELATIE op de IMMUNE RESPONSE van de gastheer. (Dutch)
17 December 2021
0 references
LA NECROSI NERVOSA VIRALE (NNV) È UNA MALATTIA CHE COLPISCE UNA VARIETÀ DI PESCI IN TUTTO IL MONDO, CAUSANDO ALTI TASSI DI MORTALITÀ, SOPRATTUTTO NELLE LARVE E NEL NOVELLAME. L'AGENTE ETIOLOGO DELLA MALATTIA È UN BETANODAVIRUS, CHE HA UN GENOMA MONOCATENARY RNA BISEGMENTATO COMPOSTO DA RNA1, CHE CODIFICA LA POLIMERASI VIRALE, E RNA2, CHE CODIFICA LA PROTEINA CAPSIDE. INOLTRE, SINTETIZZANO UN RNA SUBGENOMICO, RNA3, CHE CODIFICA LE PROTEINE B1 (FATTORE ANTINECROTICO) E B2 (PROTEZIONE DELLA REPLICAZIONE VIRALE CONTRO L'RNA INTERFERENTE CELLULARE). I BETANODAVIRUSES SONO CLASSIFICATI IN 4 GENOTIPI SECONDO LA SEQUENZA T4 DI RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV E RGNNV. TUTTAVIA, NEGLI ULTIMI ANNI L'ISOLAMENTO DEI RICOMBINANTI NATURALI RG/SJ (RNA1 TIPO RGNNV E RNA2 SJNNV) È STATO DOCUMENTATO NELL'EUROPA MERIDIONALE. TUTTI I RICOMBINANTI ISOLATI DI SOGLIOLA E ORO COLTIVATI NELLA PENISOLA IBERICA HANNO UNA PROTEINA CAPSIDE CON 3 DIVERSE POSIZIONI AMINOACIDE RISPETTO A QUELLA DEL SJNNV, DI CUI 2 ALLA FINE DEL C-TERMINALE, REGIONE CHE DETERMINA LA SPECIFICITÀ DELL'OSPITE, CHE HA DIMOSTRATO DI SVOLGERE UN RUOLO IMPORTANTE NELLA VIRULENZA, E UNA NELLA REGIONE TERMINALE N. INOLTRE, QUESTI RICOMBINANTI PRESENTI NELLA POLIMERASI 19 DIVERSI RESIDUI DI AMIOACIDIC RISPETTO ALLA POLIMERASI DEL CEPPO DI TIPO RG E NELLE REGIONI NON CODIFICANTI DI ENTRAMBI I SEGMENTI GENOMICI UN TOTALE DI 4 NUCLEOTIDI CHE NON COINCIDONO CON I CEPPI DI TIPO RG (RNA1) E SJ (RNA2). TUTTI QUESTI CAMBIAMENTI POSSONO SVOLGERE UN RUOLO IMPORTANTE NELLA VIRULENZA E NELLA CAPACITÀ REPLICATIVA. LO STUDIO DEI DETERMINANTI DELLA VIRULENZA (ANCHE CORRELATI, CON LA POLIMERASI E CON ORF B1 E B2) È FONDAMENTALE PER COMPRENDERE E CONTROLLARE LA MALATTIA, ASPETTI CHE SARANNO AFFRONTATI DAL TEAM DI RICERCA USC. È NOTO CHE LO SVILUPPO DELLA MALATTIA NON DIPENDE SOLO DALL'AGENTE PATOGENO, ESSENDO DETERMINATO DALL'INTERAZIONE VIRUS-OSPITE. L'IMPLICAZIONE DELL'OSPITE SI BASA SULLA STIMOLAZIONE DEL SISTEMA IMMUNITARIO, CHE SARÀ CARATTERIZZATA DAL TEAM DI RICERCA DELL'UMA. L'INFEZIONE VIRIC INDUCE L'ATTIVAZIONE SIA DEL SISTEMA IMMUNITARIO INNATO CHE DEL SISTEMA IMMUNITARIO ADATTIVO. GLI STUDI SULL'ATTIVAZIONE DEL SISTEMA IMMUNITARIO DA EFFETTUARE INCLUDONO L'ESECUZIONE DI UN SEQUENZIAMENTO TRASCRITTOMICO MASSICCIO (RNA-SEQ) IN RISPOSTA A INFEZIONI VIRALI DI DIVERSA VIRULENZA PER LA SOGLIOLA. Questo STUDY genererà un VALIOSISIM INFORMAZIONI SULL'immunogeni impliced IN RUTS ANTIVIRICI DI DEFENSA, IL TEMPO che permetterà la progettazione di OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TEMPO CON TAQMAN SOUNDS da utilizzare per studiare, un LEVELLO DI SPESE GENICALE, LA RISPONSA DEL SISTEMA IMMUNE DI LINKING TO RECOMENDANT VIRUS, OBTENTED DA GENETICA inversa, CON DYSTEM livel DI VIRULENCE._x000D_ Attenzione a questa ipotesi, l'OBIETTIVO PRINCIPALE DEL PROGETTO PRESENTE è quello di analizzare i FACTORS implicizzati nella VIRULENCE DI Betanodavirus in LENGUATED E RELAZIONE ALL'IMMUNE RESPONSE dell'ospite. (Italian)
16 January 2022
0 references
VIIRUSNÄRVI NEKROOS (NNV) ON HAIGUS, MIS MÕJUTAB ERINEVAID KALU KOGU MAAILMAS, PÕHJUSTADES KÕRGET SUREMUST, ERITI VASTSETE JA NOORLOOMADE PUHUL. HAIGUSE ETHIOLOGIC ON BETANODAVIRUS, MILLEL ON BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOOMI, MIS KOOSNEB RNA1, MIS KODEERIB VIIRUSE POLÜMERAASI, JA RNA2, MIS KODEERIB CAPSIDE VALKU. LISAKS SÜNTEESIVAD NAD SUBGENOOMILIST RNA-D, RNA3, MIS KODEERIB VALKE B1 (ANTINEKROOTILINE TEGUR) JA B2 (VIIRUSE REPLIKATSIOONI KAITSE RAKULISE SEGAVA RNA VASTU). BETANODAVIRUSES LIIGITATAKSE 4 GENOTÜÜBIKS VASTAVALT RNA2 T4 JÄRJESTUSELE: SJNNV, TPNNV, BFNNV JA RGNNV. KUID VIIMASTEL AASTATEL ON LÕUNA-EUROOPAS DOKUMENTEERITUD LOODUSLIKE REKOMBINANTIDE RG/SJ (RNA1 TÜÜPI RGNNV JA RNA2 SJNNV) ISOLEERIMINE. KÕIGIL PÜRENEE POOLSAAREL KASVATATUD TALLA JA KULLA ISOLEERITUD REKOMBINANTIDEL ON CAPSIDE’I VALK, MILLEL ON SJNNV-GA VÕRRELDES KOLM ERINEVAT AMINOHAPPELIST ASENDIT, NEIST 2 C-TERMINALI LÕPUS, MIS MÄÄRAB KINDLAKS PEREMEESORGANISMI SPETSIIFILISUSE, MILLEL ON VIRULENTSUSES OLULINE ROLL, JA ÜKS N-TERMINAALSES PIIRKONNAS. LISAKS ESINEVAD NEED REKOMBINANDID 19 ERINEVAS AMIOACIDIC-JÄÄGIS RG-TÜÜPI TÜVE POLÜMERAASI SUHTES JA MÕLEMA GENOOMISEGMENDI MITTEKODEERIVATES PIIRKONDADES KOKKU 4 NUKLEOTIIDI, MIS EI LANGE KOKKU RG- (RNA1) JA SJ (RNA2) TÜÜPI TÜVEDEGA. KÕIK NEED MUUTUSED VÕIVAD MÄNGIDA OLULIST ROLLI VIRULENTSUSE JA REPLIKATSIOONIVÕIME. VIRULENTSUST MÄÄRAVATE TEGURITE (TÄIENDAVALT SEOTUD, POLÜMERAASIGA NING ORF B1 JA B2-GA) UURING ON HAIGUSE MÕISTMISEKS JA KONTROLLIKS VÄGA OLULINE, SEST NEID ASPEKTE KÄSITLEB USC UURIMISRÜHM. ON HÄSTI TEADA, ET HAIGUSE ARENG EI SÕLTU AINULT PATOGEENIST, MIS MÄÄRATAKSE KINDLAKS VIIRUSE JA VASTUVÕTJA KOOSTOIMEGA. PEREMEESORGANISMI MÕJU PÕHINEB IMMUUNSÜSTEEMI STIMULEERIMISEL, MIDA ISELOOMUSTAB UMA UURIMISRÜHM. VIRIC INFEKTSIOON INDUTSEERIB NII KAASASÜNDINUD IMMUUNSÜSTEEMI KUI KA ADAPTIIVSE IMMUUNSÜSTEEMI AKTIVEERUMIST. IMMUUNSÜSTEEMI AKTIVEERIMISE UURINGUD HÕLMAVAD MASSIIVSET TRANSKRIPTOOMSET SEKVENEERIMIST (RNA-SEQ) VASTUSENA VIIRUSINFEKTSIOONIDELE, MILLE VIRULENTSUS ON MERIKEELE SUHTES ERINEV. See STUDY genereerib VALIOSISIM INFORMATION ON immunogens kaasatud ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, AEG, mis võimaldab disaini OPENARRAYS BASED PCR REAL AEG WITH TaqMan SOUNDS, et uurida, LEVEL OF GENICAL EXPENDITURE, IMMUNE SÜSTEEMI SÜSTEEMI KOHUSTUSLIK VIRULENCE._x000D_ Tähelepanu sellele hüpoteesile, on PROJEKTi PRINCIPAL OBJEKTIVE analüüsida betanodaviirusega seotud FACTOReid, mis on seotud betanodaviiruse VIRULENENCE’i ja RELESiga vastuvõtva riigi IMMUNE RESPONTSIOONIDELE. (Estonian)
4 August 2022
0 references
VIRUSINĖ NERVŲ NEKROZĖ (NNV) YRA LIGA, KURI PAVEIKIA ĮVAIRIAS ŽUVIS VISAME PASAULYJE IR SUKELIA DIDELĮ MIRTINGUMĄ, YPAČ LERVŲ IR JAUNIKLIŲ. ETHIOLOGIC LIGOS SUKĖLĖJAS YRA BETANODAVIRUS, KURIO SUDĖTYJE YRA BISEGMENTED MONOCATENARY RNR GENOMAS, SUDARYTAS IŠ RNR1, KURIS KODUOJA VIRUSINĘ POLIMERAZĘ, IR RNR2, KURIS KODUOJA CAPSIDE BALTYMĄ. BE TO, JIE SINTETINA SUBGENOMINĘ RNR, RNR3, KURI KODUOJA BALTYMUS B1 (ANTIKROZINIS FAKTORIUS) IR B2 (VIRUSŲ REPLIKACIJOS APSAUGA NUO LĄSTELIŲ TRUKDANČIOS RNR). BETANODAVIRUSES SKIRSTOMI Į 4 GENOTIPUS PAGAL RNR2 T4 SEKĄ: SJNNV, TPNNV, BFNNV IR RGNNV. TAČIAU PASTARAISIAIS METAIS NATŪRALIŲ REKOMBINANTŲ RG/SJ (RNA1 TIPO RGNNV IR RNA2 SJNNV) IZOLIAVIMAS BUVO UŽFIKSUOTAS PIETŲ EUROPOJE. VISI IBERIJOS PUSIASALYJE IŠAUGINTI IZOLIUOTI PAPRASTŲJŲ PADŲ IR AUKSO REKOMBINANTAI TURI CAPSIDE BALTYMĄ SU 3 SKIRTINGOMIS AMINORŪGŠTIES POZICIJOMIS, PALYGINTI SU SJNNV, 2 IŠ JŲ – C TERMINALO PABAIGOJE, REGIONE, LEMIANČIAME ŠEIMININKO SPECIFIŠKUMĄ, KURIS, KAIP ĮRODYTA, ATLIEKA SVARBŲ VAIDMENĮ VIRULENTIŠKUMUI, IR VIENAS N-TERMINALO REGIONE. BE TO, ŠIŲ REKOMBINANTŲ, ESANČIŲ POLIMERAZĖS 19 SKIRTINGŲ AMIOACIDIC LIKUČIŲ RG PADERMĖS POLIMERAZĖS ATŽVILGIU, IR ABIEJŲ GENOMINIŲ SEGMENTŲ NEKODUOJANČIOSE SRITYSE IŠ VISO YRA 4 NUKLEOTIDŲ, KURIE NESUTAMPA SU RG (RNR1) IR SJ (RNR2) TIPŲ PADERMĖMIS. VISI ŠIE POKYČIAI GALI VAIDINTI SVARBŲ VAIDMENĮ VIRULENTIŠKUMO IR REPLIKACIJOS PAJĖGUMŲ. VIRULENTIŠKUMO DETERMINANTŲ (PAPILDOMAI SUSIJUSIŲ, SU POLIMERAZE IR SU ORF B1 IR B2) TYRIMAS YRA ESMINIS NORINT SUPRASTI IR KONTROLIUOTI LIGĄ, ASPEKTUS, KURIUOS SPRĘS USC MOKSLINIŲ TYRIMŲ GRUPĖ. GERAI ŽINOMA, KAD LIGOS VYSTYMASIS PRIKLAUSO NE TIK NUO PATOGENO, KURĮ LEMIA VIRUSO IR ŠEIMININKO SĄVEIKA. ŠEIMININKO POVEIKIS GRINDŽIAMAS IMUNINĖS SISTEMOS STIMULIAVIMU, KURĮ APIBŪDINS UMA TYRIMŲ KOMANDA. VIRUSINĖ INFEKCIJA SKATINA TIEK ĮGIMTOS IMUNINĖS SISTEMOS, TIEK ADAPTYVIOS IMUNINĖS SISTEMOS AKTYVAVIMĄ. ATLIKTINI IMUNINĖS SISTEMOS AKTYVACIJOS TYRIMAI APIMA MASINĮ TRANSKRIPTOGRAFINĮ SEKOS NUSTATYMĄ (RNR-SEQ) ATSAKANT Į SKIRTINGO VIRULENTIŠKUMO VIRUSO INFEKCIJAS. Šis STUDIJA generuos VALIOSISIM INFORMACIJA Imunogenų, susijusių su ANTIVIRIC RUTS DEFENSA, LAIKAS, kuri leis sukurti OPENARRAYS, PGR REAL TIME su TaqMan SOUNDS, naudotinas tyrimui, GENICAL EXPENDITURE LEVEL, IMMUNO SISTEMOS REKOMENDACIJOS VIRANIUS, OBTENTED BY GENETICA inversa, SU VIRULENCE._x000D_ Dėmesio į šią hipotezę, PRESENTO PROJEKTO PRINCIPINĖ KONKRETĖ ATSAKTYBĖ yra analizuoti su Betanodaviruso VIRULENCIJA, LENGUATED ir RELATION į priimančiojo IMMUNE RESPONIJA, PRINCIPINĖ KONKRETOJO PRIEMONĖ. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
VIRUSNA NEKROZA ŽIVACA (NNV) JE BOLEST KOJA POGAĐA RAZNE RIBE DILJEM SVIJETA, UZROKUJUĆI VISOKE STOPE SMRTNOSTI, OSOBITO U LIČINKI I MLADIH. ETHIOLOGIC AGENS BOLESTI JE BETANODAVIRUS, KOJI IMA BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOM SASTAVLJEN OD RNA1, KOJI KODIRA VIRUSNU POLIMERAZU, I RNA2, KOJI KODIRA PROTEIN CAPSIDE. OSIM TOGA, ONI SINTETIZIRAJU SUBGENOMSKU RNK, RNA3, KOJA KODIRA PROTEINE B1 (ANTINEKROTIČKI FAKTOR) I B2 (ZAŠTITA VIRUSNE REPLIKACIJE PROTIV STANIČNE INTERFERIRAJUĆE RNK). BETANODAVIRUSES SE RAZVRSTAVA U 4 GENOTIPA PREMA T4 SLIJEDU RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV I RGNNV. MEĐUTIM, POSLJEDNJIH JE GODINA U JUŽNOJ EUROPI DOKUMENTIRANA IZOLACIJA PRIRODNIH REKOMBINANATA RG/SJ (RNA1 TIP RGNNV I RNA2 SJNNV). SVI IZOLIRANI REKOMBINANTI LISTA I ZLATA KOJI SE UZGAJAJU NA IBERSKOM POLUOTOKU IMAJU CAPSIDE PROTEIN S 3 RAZLIČITA AMINOACIDIČNA POLOŽAJA U USPOREDBI SA SJNNV-OM, 2 NA KRAJU C-TERMINALA, REGIJA KOJA ODREĐUJE SPECIFIČNOST DOMAĆINA, ZA KOJU SE POKAZALO DA IMA VAŽNU ULOGU U VIRULENCI, A JEDAN U N-TERMINALU. OSIM TOGA, TI REKOMBINANTI PRISUTNI SU U POLIMERAZI 19 RAZLIČITIH OSTATAKA AMIOACIDIC-A U ODNOSU NA POLIMERAZU SOJA TIPA RG, A U NEKODIRAJUĆIM REGIJAMA OBA GENOMSKA SEGMENTA UKUPNO SU 4 NUKLEOTIDA KOJI SE NE PODUDARAJU SA SOJEVIMA TIPA RG (RNA1) I SJ (RNA2). SVE TE PROMJENE MOGU IGRATI VAŽNU ULOGU U VIRULENCIJE I REPLIKACIJE KAPACITETA. STUDIJA VIRULENCIJE DETERMINANTA (DODATNO POVEZANA, S POLIMERAZOM I ORF B1 I B2) KLJUČNA JE ZA RAZUMIJEVANJE I KONTROLU BOLESTI, ASPEKATA KOJIMA ĆE SE BAVITI ISTRAŽIVAČKI TIM USC-A. POZNATO JE DA RAZVOJ BOLESTI NE OVISI SAMO O PATOGENU, KOJI JE ODREĐEN INTERAKCIJOM VIRUSA I DOMAĆINA. IMPLIKACIJA DOMAĆINA TEMELJI SE NA STIMULACIJI IMUNOLOŠKOG SUSTAVA, KOJI ĆE KARAKTERIZIRATI ISTRAŽIVAČKI TIM UME. VIRIC INFEKCIJA IZAZIVA AKTIVACIJU I UROĐENOG IMUNOLOŠKOG SUSTAVA I ADAPTIVNOG IMUNOLOŠKOG SUSTAVA. ISPITIVANJA AKTIVACIJE IMUNOSNOG SUSTAVA KOJA ĆE SE PROVESTI UKLJUČUJU IZVOĐENJE MASOVNOG TRANSKRIPTOMSKOG SEKVENCIRANJA (RNA-SEQ) KAO ODGOVOR NA VIRUSNE INFEKCIJE RAZLIČITIH VIRULENCIJE ZA JEDINI. Ova STUDIJA će generirati VALIOSISIM INFORMACIJE o imunogenima impliciranih u ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, TIME koji će omogućiti dizajn OPENARRAYS BASED U PCR REAL TIME S TaqMan SOUNDS koji će se koristiti za proučavanje, LEVEL GENICAL EXPENDITURE, odgovor IMMUNE SUSTAV U PREPORUČUJU VIRUSA, OBTENTED BY GENETICA inversa, S DYSTEM livel of VIRULENCE._x000D_ Pozornost na ovu hipotezu, PRINCIPAL OBJEKT PRESENT PROJECT je analizirati FACTORS implicirane u VIRULENCIJU Betanodavirusa u LENGUATEDNOM I RELATIONU IMMUNE RESPONSE domaćina. (Croatian)
4 August 2022
0 references
Η ΝΈΚΡΩΣΗ ΤΟΥ ΙΟΎ ΤΩΝ ΝΕΎΡΩΝ (NNV) ΕΊΝΑΙ ΜΙΑ ΝΌΣΟΣ ΠΟΥ ΕΠΗΡΕΆΖΕΙ ΜΙΑ ΠΟΙΚΙΛΊΑ ΨΑΡΙΏΝ ΠΑΓΚΟΣΜΊΩΣ, ΠΡΟΚΑΛΏΝΤΑΣ ΥΨΗΛΆ ΠΟΣΟΣΤΆ ΘΝΗΣΙΜΌΤΗΤΑΣ, ΙΔΊΩΣ ΣΤΙΣ ΠΡΟΝΎΜΦΕΣ ΚΑΙ ΣΤΑ ΝΕΑΡΆ ΖΏΑ. Ο ETHIOLOGIC ΠΑΡΆΓΟΝΤΑΣ ΤΗΣ ΝΌΣΟΥ ΕΊΝΑΙ ΈΝΑ BETANODAVIRUS, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΈΧΕΙ ΈΝΑ BISEGMENTED MONOCATENARY RNA ΓΟΝΙΔΊΩΜΑ ΠΟΥ ΑΠΟΤΕΛΕΊΤΑΙ ΑΠΌ RNA1, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΚΩΔΙΚΟΠΟΙΕΊ ΤΗΝ ΙΟΓΕΝΉ ΠΟΛΥΜΕΡΆΣΗ, ΚΑΙ RNA2, Η ΟΠΟΊΑ ΚΩΔΙΚΟΠΟΙΕΊ ΤΗΝ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΗ CAPSIDE. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΣΥΝΘΈΤΟΥΝ ΈΝΑ ΥΠΟΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΌ RNA, ΤΟ RNA3, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΚΩΔΙΚΟΠΟΙΕΊ ΤΙΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ Β1 (ΑΝΤΙ-ΝΕΚΡΩΤΙΚΌΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑΣ) ΚΑΙ Β2 (ΠΡΟΣΤΑΣΊΑ ΤΗΣ ΙΙΚΉΣ ΑΝΤΙΓΡΑΦΉΣ ΑΠΌ ΚΥΤΤΑΡΙΚΉ ΠΑΡΕΜΒΟΛΉ RNA). ΤΟ BETANODAVIRUSES ΤΑΞΙΝΟΜΕΊΤΑΙ ΣΕ 4 ΓΟΝΌΤΥΠΟΥΣ ΣΎΜΦΩΝΑ ΜΕ ΤΗΝ ΑΚΟΛΟΥΘΊΑ Τ4 ΤΟΥ RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV ΚΑΙ RGNNV. ΩΣΤΌΣΟ, ΤΑ ΤΕΛΕΥΤΑΊΑ ΧΡΌΝΙΑ Η ΑΠΟΜΌΝΩΣΗ ΤΩΝ ΦΥΣΙΚΏΝ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΈΝΩΝ RG/SJ (RNA1 ΤΎΠΟΥ RGNNV ΚΑΙ RNA2 SJNNV) ΈΧΕΙ ΤΕΚΜΗΡΙΩΘΕΊ ΣΤΗ ΝΌΤΙΑ ΕΥΡΏΠΗ. ΌΛΟΙ ΟΙ ΑΠΟΜΟΝΩΜΈΝΟΙ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΟΊ ΓΛΏΣΣΑΣ ΚΑΙ ΧΡΥΣΟΎ ΠΟΥ ΚΑΛΛΙΕΡΓΟΎΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΙΒΗΡΙΚΉ ΧΕΡΣΌΝΗΣΟ ΈΧΟΥΝ ΜΙΑ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΗ CAPSIDE ΜΕ 3 ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΑΜΙΝΟΞΈΕΣ ΘΈΣΕΙΣ ΣΕ ΣΎΓΚΡΙΣΗ ΜΕ ΕΚΕΊΝΗ ΤΟΥ SJNNV, 2 ΑΠΌ ΑΥΤΈΣ ΣΤΟ ΤΈΛΟΣ ΤΟΥ ΤΕΡΜΑΤΙΚΟΎ C, ΠΕΡΙΟΧΉ ΠΟΥ ΚΑΘΟΡΊΖΕΙ ΤΗΝ ΙΔΙΑΙΤΕΡΌΤΗΤΑ ΤΟΥ ΞΕΝΙΣΤΉ, Η ΟΠΟΊΑ ΈΧΕΙ ΑΠΟΔΕΙΧΘΕΊ ΌΤΙ ΔΙΑΔΡΑΜΑΤΊΖΕΙ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌ ΡΌΛΟ ΣΤΗ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟ ΔΡΆΣΗ, ΚΑΙ ΜΊΑ ΣΤΗΝ ΠΕΡΙΟΧΉ N-ΤΕΡΜΑΤΙΚΌ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΑΥΤΈΣ ΟΙ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΈΝΕΣ ΟΥΣΊΕΣ ΠΟΥ ΠΕΡΙΈΧΟΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΠΟΛΥΜΕΡΆΣΗ 19 ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΆ ΥΠΟΛΕΊΜΜΑΤΑ AMIOACIDIC ΣΕ ΣΧΈΣΗ ΜΕ ΤΗΝ ΠΟΛΥΜΕΡΆΣΗ ΤΟΥ ΣΤΕΛΈΧΟΥΣ ΤΎΠΟΥ RG, ΚΑΙ ΣΤΙΣ ΜΗ ΚΩΔΙΚΟΠΟΙΗΜΈΝΕΣ ΠΕΡΙΟΧΈΣ ΚΑΙ ΤΩΝ ΔΎΟ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΏΝ ΤΜΗΜΆΤΩΝ, ΣΥΝΟΛΙΚΆ 4 ΝΟΥΚΛΕΟΤΊΔΙΑ ΠΟΥ ΔΕΝ ΣΥΜΠΊΠΤΟΥΝ ΜΕ ΤΑ ΣΤΕΛΈΧΗ ΤΎΠΟΥ RG (RNA1) ΚΑΙ SJ (RNA2). ΌΛΕΣ ΑΥΤΈΣ ΟΙ ΑΛΛΑΓΈΣ ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΔΙΑΔΡΑΜΑΤΊΣΟΥΝ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌ ΡΌΛΟ ΣΤΗ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟ ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΚΑΙ ΣΤΗΝ ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΉΣ. Η ΜΕΛΈΤΗ ΤΩΝ ΚΑΘΟΡΙΣΤΙΚΏΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟΥ ΔΎΝΑΜΗΣ (ΕΠΙΠΛΈΟΝ ΣΧΕΤΙΖΌΜΕΝΩΝ, ΜΕ ΠΟΛΥΜΕΡΆΣΗ ΚΑΙ ΜΕ ORF B1 ΚΑΙ B2) ΕΊΝΑΙ ΘΕΜΕΛΙΏΔΟΥΣ ΣΗΜΑΣΊΑΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΚΑΤΑΝΌΗΣΗ ΚΑΙ ΤΟΝ ΈΛΕΓΧΟ ΤΗΣ ΝΌΣΟΥ, ΠΤΥΧΈΣ ΠΟΥ ΘΑ ΕΞΕΤΑΣΤΟΎΝ ΑΠΌ ΤΗΝ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΉ ΟΜΆΔΑ ΤΟΥ USC. ΕΊΝΑΙ ΓΝΩΣΤΌ ΌΤΙ Η ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΤΗΣ ΝΌΣΟΥ ΔΕΝ ΕΞΑΡΤΆΤΑΙ ΜΌΝΟ ΑΠΌ ΤΟ ΠΑΘΟΓΌΝΟ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑ, ΠΟΥ ΚΑΘΟΡΊΖΕΤΑΙ ΑΠΌ ΤΗΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ ΙΟΎ-ΞΕΝΙΣΤΉ. Η ΕΠΊΠΤΩΣΗ ΤΟΥ ΞΕΝΙΣΤΉ ΒΑΣΊΖΕΤΑΙ ΣΤΗ ΔΙΈΓΕΡΣΗ ΤΟΥ ΑΝΟΣΟΠΟΙΗΤΙΚΟΎ ΣΥΣΤΉΜΑΤΟΣ, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΘΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΖΕΤΑΙ ΑΠΌ ΤΗΝ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΉ ΟΜΆΔΑ ΤΗΣ ΟΎΜΑ. Η ΛΟΊΜΩΞΗ ΤΟΥ VIRIC ΠΡΟΚΑΛΕΊ ΤΗΝ ΕΝΕΡΓΟΠΟΊΗΣΗ ΤΌΣΟ ΤΟΥ ΈΜΦΥΤΟΥ ΑΝΟΣΟΠΟΙΗΤΙΚΟΎ ΣΥΣΤΉΜΑΤΟΣ ΌΣΟ ΚΑΙ ΤΟΥ ΠΡΟΣΑΡΜΟΖΌΜΕΝΟΥ ΑΝΟΣΟΠΟΙΗΤΙΚΟΎ ΣΥΣΤΉΜΑΤΟΣ. ΟΙ ΜΕΛΈΤΕΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΝΕΡΓΟΠΟΊΗΣΗ ΤΟΥ ΑΝΟΣΟΠΟΙΗΤΙΚΟΎ ΣΥΣΤΉΜΑΤΟΣ ΠΟΥ ΠΡΌΚΕΙΤΑΙ ΝΑ ΔΙΕΞΑΧΘΟΎΝ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΟΥΝ ΤΗΝ ΕΚΤΈΛΕΣΗ ΜΙΑΣ ΜΑΖΙΚΉΣ ΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΉΣ ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΑΣ (RNA-SEQ) ΩΣ ΑΠΆΝΤΗΣΗ ΣΕ ΙΙΚΈΣ ΛΟΙΜΏΞΕΙΣ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΉΣ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟΥ ΔΎΝΑΜΗΣ ΓΙΑ ΤΗ ΓΛΏΣΣΑ. Αυτή η ΜΕΛΕΤΗ θα δημιουργήσει ένα VALIOSISIM ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΕΣ για τα ανοσογόνα που εμπλέκονται σε ΑΝΤΙΒΙΙΚΙΚΕΣ ΡΥΘΜΙΣΕΙΣ ΤΗΣ DEFENSA, Ο ΧΡΟΝΟΣ που θα επιτρέψει τον σχεδιασμό των OPENARRAYS BASED σε PCR REAL TIME ΜΕ TaqMan SOUNDS που θα χρησιμοποιηθούν για τη μελέτη, ένα επίπεδο ΓΕΝΙΚΗΣ ΔΑΠΑΝΗΣ, ΑΝΤΙΚΕΙΜΕΝΟ ΤΟΥ ΣΥΣΤΗΜΑΤΟΣ IMMUNE LINKING TO RECOMMENDANT VIRUS, OBTENTED by GENETICA inversa, ΜΕ ΤΟ ΔΥΣΤΜΗ ΖΩΗΣ ΤΗΣ ΒΙRULENCE._x000D_ Προσοχή σε αυτή την υπόθεση, ο ΠΡΟΔΙΚΑΣΤΙΚΟΣ ΣΤΟΧΟΣ του ΠΡΟΕΔΡΕΤΙΚΟΥ ΕΡΓΟΥ είναι να αναλύσει τους παράγοντες που εμπλέκονται στην εξοικείωση του Betanodavirus σε LENGUATED και RELATION TO THE IMMUNE RESPONSE OF THE IMMUNE RESPONSE of the host. (Greek)
4 August 2022
0 references
VÍRUSOVÁ NERVOVÁ NEKRÓZA (NNV) JE OCHORENIE, KTORÉ POSTIHUJE CELÝ RAD RÝB NA CELOM SVETE A SPÔSOBUJE VYSOKÚ ÚMRTNOSŤ, NAJMÄ U LARIEV A JUVENILNÝCH JEDINCOV. ETHIOLOGICKÝ PÔVODCA OCHORENIA JE BETANODAVIRUS, KTORÝ MÁ BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENÓM ZLOŽENÝ Z RNA1, KTORÝ KÓDUJE VÍRUSOVÚ POLYMERÁZU, A RNA2, KTORÝ KÓDUJE CAPSIDEOV PROTEÍN. OKREM TOHO SYNTETIZUJÚ SUBGENOMICKÚ RNA, RNA3, KTORÁ KÓDUJE PROTEÍNY B1 (ANTINEKROTICKÝ FAKTOR) A B2 (OCHRANA VÍRUSOVEJ REPLIKÁCIE PROTI BUNKOVEJ INTERFERUJÚCEJ RNA). BETANODAVIRUSES SÚ KLASIFIKOVANÉ DO 4 GENOTYPOV PODĽA T4 SEKVENCIE RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV A RGNNV. V POSLEDNÝCH ROKOCH VŠAK BOLA IZOLÁCIA PRÍRODNÝCH REKOMBINANTOV RG/SJ (RNA1 TYPU RGNNV A RNA2 SJNNV) ZDOKUMENTOVANÁ V JUŽNEJ EURÓPE. VŠETKY IZOLOVANÉ REKOMBINANTY SOLEY A ZLATA VYPESTOVANÉ NA PYRENEJSKOM POLOSTROVE MAJÚ CAPSIDE PROTEÍN S 3 ODLIŠNÝMI AMINOCÍDNYMI POZÍCIAMI V POROVNANÍ SO SJNNV, 2 Z NICH NA KONCI TERMINÁLU C, REGIÓN URČUJÚCI ŠPECIFICKOSŤ HOSTITEĽA, KTORÝ PREUKÁZATEĽNE ZOHRÁVA DÔLEŽITÚ ÚLOHU VO VIRULENCII, A JEDEN V REGIÓNE N-TERMINÁL. OKREM TOHO TIETO REKOMBINANTY PRÍTOMNÉ V POLYMERÁZE 19 RÔZNYCH REZÍDUÍ AMIOACIDIC VZHĽADOM NA POLYMERÁZU KMEŇA RG A V NEKÓDUJÚCICH OBLASTIACH OBOCH GENOMICKÝCH SEGMENTOV CELKOVO 4 NUKLEOTIDY, KTORÉ SA NEZHODUJÚ S KMEŇMI TYPU RG (RNA1) A SJ (RNA2). VŠETKY TIETO ZMENY MÔŽU ZOHRÁVAŤ DÔLEŽITÚ ÚLOHU PRI VIRULENCII A REPLIKAČNEJ KAPACITE. ŠTÚDIUM VIRULENTNÝCH DETERMINANTOV (DODATOČNE SÚVISIACICH, S POLYMERÁZOU A ORF B1 A B2) JE ZÁKLADOM PRE POCHOPENIE A KONTROLU OCHORENIA, ASPEKTOV, KTORÝMI SA BUDE ZAOBERAŤ VÝSKUMNÝ TÍM USC. JE DOBRE ZNÁME, ŽE VÝVOJ OCHORENIA NEZÁVISÍ LEN OD PATOGÉNU, KTORÝ JE URČENÝ INTERAKCIOU MEDZI VÍRUSOM A HOSTITEĽOM. VPLYV HOSTITEĽA JE ZALOŽENÝ NA STIMULÁCII IMUNITNÉHO SYSTÉMU, KTORÝ BUDE CHARAKTERIZOVANÝ VÝSKUMNÝM TÍMOM UMY. INFEKCIA VÍRUSOM INDUKUJE AKTIVÁCIU VRODENÉHO IMUNITNÉHO SYSTÉMU A ADAPTÍVNEHO IMUNITNÉHO SYSTÉMU. ŠTÚDIE O AKTIVÁCII IMUNITNÉHO SYSTÉMU, KTORÉ SA MAJÚ VYKONAŤ, ZAHŔŇAJÚ VYKONANIE MASÍVNEHO TRANSKRIPTOMICKÉHO SEKVENOVANIA (RNA-SEQ) V REAKCII NA VÍRUSOVÉ INFEKCIE RÔZNEJ VIRULENCIE U SOLEY. Tento ŠTUDY vygeneruje VALIOSISIM INFORMÁCIE o imunogenoch implikovaných v ANTIVIRICKÝCH RUTS OF DEFENSA, TIME, ktorý umožní návrh OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TIME S Taqmanovými SOUNDS, ktoré sa majú použiť na štúdium, LEVEL OF GENICAL EXPENDITURE, RESPONSE of the IMMUNE SYSTEM of LINKING TO RECOMMENDANTANTENTED BY GENETICA inversa, S DYSTEM Livel of VIRULENCE._x000D_ Pozor na túto hypotézu, PRINCIPAL OBJECTIVE PRESENTNÉHO PROJEKTU je analyzovať FACTORS uvalený na VIRULENCE betaanodavírusu v LENGUATED A RELÁCIE NA IMMUNE RESPONSE hostiteľa. (Slovak)
4 August 2022
0 references
VIRUSHERMONEKROOSI (NNV) ON SAIRAUS, JOKA VAIKUTTAA MONIIN KALOIHIN MAAILMANLAAJUISESTI JA AIHEUTTAA SUURTA KUOLLEISUUTTA ERITYISESTI TOUKISSA JA NUORILLA. TAUDIN ETHIOLOGIC-AGENTTI ON BETANODAVIRUS, JOLLA ON BISEGMENTED MONOCATENARY RNA -GENOMI, JOKA KOOSTUU RNA1:STA, JOKA KOODAA VIRUSPOLYMERAASIN, JA RNA2, JOKA KOODAA CAPSIDE-PROTEIINIA. LISÄKSI NE SYNTETISOIVAT SUBGENOMISEN RNA:N, RNA3, JOKA KOODAA PROTEIINEJA B1 (ANTI-NEKROOTTINEN TEKIJÄ) JA B2 (VIRUKSEN REPLIKAATION SUOJAAMINEN SOLUJA HÄIRITSEVÄÄ RNA:TA VASTAAN). BETANODAVIRUSES LUOKITELLAAN NELJÄÄN GENOTYYPPIIN RNA2:N T4-SEKVENSSIN MUKAAN: SJNNV, TPNNV, BFNNV JA RGNNV. VIIME VUOSINA ETELÄ-EUROOPASSA ON KUITENKIN DOKUMENTOITU LUONNOLLISTEN REKOMBINANTTIEN RG/SJ (RNA1 TYYPPI RGNNV JA RNA2 SJNNV) ERISTÄMINEN. KAIKILLA IBERIAN NIEMIMAALLA VILJELLYILLÄ MERIANTURAN JA KULLAN ERISTETYILLÄ REKOMBINANTEILLA ON CAPSIDE-PROTEIINI, JOSSA ON KOLME ERI AMINOASIDISTA KUIN SJNNV:LLÄ, JOISTA KAKSI ON C-TERMINAALIN LOPUSSA, JOKA MÄÄRITTÄÄ ISÄNTÄSPESIFISYYDEN, JOLLA ON OSOITETTU OLEVAN TÄRKEÄ ROOLI VIRULENSSISSA, JA YKSI N-TERMINAALIALUEELLA. LISÄKSI NÄITÄ REKOMBINANTTEJA ESIINTYY POLYMERAASISSA 19 ERI AMIOACIDIC-JÄÄMISSÄ RG-TYYPPISEN KANNAN POLYMERAASIN SUHTEEN JA MOLEMPIEN GENOMISEGMENTTIEN KOODAAMATTOMILLA ALUEILLA YHTEENSÄ 4 NUKLEOTIDIA, JOTKA EIVÄT VASTAA RG- (RNA1) JA SJ (RNA2) -TYYPPISIÄ KANTOJA. KAIKILLA NÄILLÄ MUUTOKSILLA VOI OLLA TÄRKEÄ ROOLI VIRULENSSISSA JA REPLIKAATIOKYVYSSÄ. VIRULENSSIN TAUSTA-AINEIDEN (LISÄÄNTYNEESTI LIITTYVÄT, POLYMERAASIN JA ORF B1:N JA B2:N KANSSA) TUTKIMUS ON OLENNAISEN TÄRKEÄÄ SAIRAUDEN YMMÄRTÄMISEKSI JA HALLITSEMISEKSI, JOITA USC-TUTKIMUSRYHMÄ KÄSITTELEE. ON TUNNETTUA, ETTÄ TAUDIN KEHITTYMINEN EI RIIPU VAIN TAUDINAIHEUTTAJASTA, JOKA MÄÄRÄYTYY VIRUKSEN JA ISÄNTÄN VUOROVAIKUTUKSEN PERUSTEELLA. ISÄNTÄN VAIKUTUS PERUSTUU IMMUUNIJÄRJESTELMÄN STIMULAATIOON, JOTA LUONNEHTII UMAN TUTKIMUSRYHMÄ. VIRUSINFEKTIO AKTIVOI SEKÄ SYNNYNNÄISEN IMMUUNIJÄRJESTELMÄN ETTÄ MUKAUTUVAN IMMUUNIJÄRJESTELMÄN. IMMUUNIJÄRJESTELMÄN AKTIVAATIOTA KOSKEVIIN TUTKIMUKSIIN KUULUU MASSIIVISEN TRANSCRIPTOMISEN SEKVENSOINNIN (RNA-SEQ) SUORITTAMINEN VASTAUKSENA VIRUSINFEKTIOIHIN, JOILLA ON ERI VIRULENSSIPOHJA. Tämä STUDY tuottaa VALIOSISIM INFORMATION ON Immunogens impliced in ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, TIME, joka mahdollistaa suunnittelun OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TIME WITH TaqMan SOUNDS voidaan käyttää tutkimukseen, LEVEL OF GENICAL EXPENDITURE, IMMUNE SYSTEMIN SYSTEMIN SYVÄKSYNTÄ SUOSITUS VIRUS, OBTENTED BY GENETICA inversa, joka on VIRULENCE: n DYSTEM livel._x000D_ Huomio tähän oletukseen, PRESENT PROJECTIN PRINCIPAL OBJECTIVE on analysoida betanodaviruksen virityksessä ilmeneviä FACTOReja, jotka ovat peräisin LENGUATEDISTA ja RAHOITUKSEKSI isäntävaltion IMMUNE RESPONSE: lle. (Finnish)
4 August 2022
0 references
MARTWICA NERWÓW WIRUSOWYCH (NNV) JEST CHOROBĄ, KTÓRA DOTYKA RÓŻNE RYBY NA CAŁYM ŚWIECIE, POWODUJĄC WYSOKĄ ŚMIERTELNOŚĆ, ZWŁASZCZA U LARW I MŁODYCH OSOBNIKÓW. ETHIOLOGIC CZYNNIKIEM CHOROBY JEST BETANODAVIRUS, KTÓRY MA BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOM ZŁOŻONY Z RNA1, KTÓRY KODUJE POLIMERAZĘ WIRUSOWĄ I RNA2, KTÓRY KODUJE BIAŁKO CAPSIDE. PONADTO SYNTETYZUJĄ PODGENOMICZNY RNA, RNA3, KTÓRY KODUJE BIAŁKA B1 (WSPÓŁCZYNNIK ANTY-NEKROTYCZNY) I B2 (OCHRONA REPLIKACJI WIRUSOWEJ PRZED ZAKŁÓCAJĄCYMI KOMÓRKI RNA). BETANODAVIRUSES SĄ KLASYFIKOWANE NA 4 GENOTYPY ZGODNIE Z SEKWENCJĄ T4 RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV I RGNNV. JEDNAK W OSTATNICH LATACH W EUROPIE POŁUDNIOWEJ UDOKUMENTOWANO IZOLACJĘ NATURALNYCH REKOMBINANTÓW RG/SJ (TYP RNA1 RGNNV I RNA2 SJNNV). WSZYSTKIE IZOLOWANE REKOMBINACJE SOLI I ZŁOTA UPRAWIANE NA PÓŁWYSPIE IBERYJSKIM MAJĄ BIAŁKO CAPSIDE O 3 RÓŻNYCH POZYCJACH AMINOKWASOWYCH W PORÓWNANIU Z SJNNV, 2 Z NICH NA KOŃCU C-TERMINALU, REGION OKREŚLAJĄCY SPECYFICZNOŚĆ ŻYWICIELA, KTÓRY OKAZAŁ SIĘ ODGRYWAĆ WAŻNĄ ROLĘ W ZJADLIWOŚCI, A JEDEN W REGIONIE N-TERMINALU. PONADTO REKOMBINACJE TE WYSTĘPUJĄ W 19 RÓŻNYCH POZOSTAŁOŚCIACH POLIMERAZY AMIOACIDIC W ODNIESIENIU DO POLIMERAZY SZCZEPU TYPU RG, A W REGIONACH NIEKODUJĄCYCH OBU SEGMENTÓW GENOMOWYCH ŁĄCZNIE 4 NUKLEOTYDY, KTÓRE NIE POKRYWAJĄ SIĘ ZE SZCZEPAMI TYPU RG (RNA1) I SJ (RNA2). WSZYSTKIE TE ZMIANY MOGĄ ODGRYWAĆ WAŻNĄ ROLĘ W ZJADLIWOŚCI I ZDOLNOŚCI REPLIKACJI. BADANIE DETERMINANTÓW ZJADLIWOŚCI (DODATKOWO ZWIĄZANYCH, Z POLIMERAZĄ I ORF B1 I B2) MA ZASADNICZE ZNACZENIE DLA ZROZUMIENIA I KONTROLOWANIA CHOROBY, ASPEKTÓW, KTÓRE ZOSTANĄ OMÓWIONE PRZEZ ZESPÓŁ BADAWCZY USC. POWSZECHNIE WIADOMO, ŻE ROZWÓJ CHOROBY NIE ZALEŻY TYLKO OD PATOGENU, KTÓRY JEST OKREŚLANY PRZEZ INTERAKCJĘ MIĘDZY WIRUSEM A GOSPODARZEM. IMPLIKACJA GOSPODARZA OPIERA SIĘ NA STYMULACJI UKŁADU ODPORNOŚCIOWEGO, KTÓRY BĘDZIE CHARAKTERYZOWAŁ ZESPÓŁ BADAWCZY UMA. ZAKAŻENIE WIRUSEM VIRIC INDUKUJE AKTYWACJĘ ZARÓWNO WRODZONEGO UKŁADU ODPORNOŚCIOWEGO, JAK I ADAPTACYJNEGO UKŁADU ODPORNOŚCIOWEGO. BADANIA NAD AKTYWACJĄ UKŁADU ODPORNOŚCIOWEGO, KTÓRE MAJĄ BYĆ PRZEPROWADZONE, OBEJMUJĄ WYKONANIE MASOWEGO SEKWENCJONOWANIA TRANSKRYPTOMICZNEGO (RNA-SEQ) W ODPOWIEDZI NA INFEKCJE WIRUSOWE O RÓŻNEJ ZJADLIWOŚCI NA PODESZWĘ. Ten STUDY wygeneruje WALIOSISIM INFORMACJI ON immunogenów zaangażowanych w ANTIVIRIC RUTS DEFENSA, TIME, który pozwoli na zaprojektowanie OPENARRAYS pokrytych w czasie rzeczywistym z TaqMan SOUNDS do badania, LEVEL OF GENICAL EXPENDITURE, RESPONSE OF THE IMMUNE SYSTEM OF LINKING TO RECOMMENDANT VIRUS, OBTENTED BY GENETICA inversa, WITH DYSTEM livel OF VIRULENCE._x000D_ Uwagi na tę hipotezę, CENNCIPAL OBJECTWO PREZYDENTEGO PROJEKTU polega na przeanalizowaniu FACTORÓW zamieszanych w VIRULENCE Betanodavirusa w LENGUATEDOWANIU IELACJI DO IMMUNE RESPONSE gospodarza. (Polish)
4 August 2022
0 references
A VÍRUSOS IDEGNEKRÓZIS (NNV) OLYAN BETEGSÉG, AMELY VILÁGSZERTE SZÁMOS HALAT ÉRINT, ÉS MAGAS MORTALITÁST OKOZ, KÜLÖNÖSEN A LÁRVÁKBAN ÉS A FIATAL EGYEDEKBEN. A BETEGSÉG ETHIOLOGIC KÓROKOZÓJA EGY BETANODAVIRUS, AMELYNEK BISEGMENTES MONOCATENARY RNS GENOMJA VAN, AMELY RNS1-BŐL ÁLL, AMELY VÍRUSPOLIMERÁZT KÓDOL, ÉS RNA2, AMELY A CAPSIDE FEHÉRJÉT KÓDOLJA. EMELLETT SZINTETIZÁLNAK EGY SZUBGENOMIKUS RNS-T, RNS3-AT, AMELY B1 (ANTINEKROTIKUS FAKTOR) ÉS B2 (A VÍRUSREPLIKÁCIÓNAK A SEJTINTERFERÁLÓ RNS ELLENI VÉDELME) FEHÉRJÉKET KÓDOL. A BETANODAVIRUSES AZ RNA2 T4 SZEKVENCIÁJA SZERINT 4 GENOTÍPUSBA SOROLHATÓ: SJNNV, TPNNV, BFNNV ÉS RGNNV. AZ ELMÚLT ÉVEKBEN AZONBAN DÉL-EURÓPÁBAN DOKUMENTÁLTÁK A TERMÉSZETES REKOMBINÁNSOK (RGNNV ÉS RNA2 SJNNV) IZOLÁLÁSÁT. AZ IBÉRIAI-FÉLSZIGETEN TERMESZTETT NYELVHAL ÉS ARANY VALAMENNYI IZOLÁLT REKOMBINÁNSÁNAK CAPSIDE-FEHÉRJE 3 KÜLÖNBÖZŐ AMINOACIDOS, MINT AZ SJNNV, EZEK KÖZÜL KETTŐ A C-TERMINÁL VÉGÉN, A GAZDA-SPECIFIKUSSÁGOT MEGHATÁROZÓ RÉGIÓ, AMELY BIZONYÍTOTTAN FONTOS SZEREPET JÁTSZIK A VIRULENCIÁBAN, ÉS EGY AZ N-TERMINÁLIS RÉGIÓBAN. EZEN TÚLMENŐEN EZEK A REKOMBINÁNSOK 19 KÜLÖNBÖZŐ AMIOACIDIC-MARADÉKOT TARTALMAZNAK A POLIMERÁZBAN AZ RG-TÍPUSÚ TÖRZS POLIMERÁZA TEKINTETÉBEN, ÉS MINDKÉT GENOMSZEGMENS NEM KÓDOLÓ RÉGIÓJÁBAN ÖSSZESEN 4 NUKLEOTID VAN JELEN, AMELYEK NEM ESNEK EGYBE AZ RG (RNS1) ÉS AZ SJ (RNA2) TÍPUSÚ TÖRZSEKKEL. MINDEZEK A VÁLTOZÁSOK FONTOS SZEREPET JÁTSZHATNAK A VIRULENCIA ÉS A REPLIKÁCIÓS KÉPESSÉG TERÉN. A VIRULENCIA DETERMINÁNSOK TANULMÁNYOZÁSA (TOVÁBBI ÖSSZEFÜGGÉSBEN A POLIMERÁZZAL ÉS AZ ORF B1 ÉS B2) ALAPVETŐ FONTOSSÁGÚ A BETEGSÉG MEGÉRTÉSÉHEZ ÉS KONTROLLÁLÁSÁHOZ, AZ USC KUTATÓCSOPORT ÁLTAL KEZELT SZEMPONTOKHOZ. KÖZTUDOTT, HOGY A BETEGSÉG KIALAKULÁSA NEM CSAK A KÓROKOZÓTÓL FÜGG, AMELYET A VÍRUS ÉS A GAZDASZERVEZET KÖZÖTTI KÖLCSÖNHATÁS HATÁROZ MEG. A GAZDATEST HATÁSA AZ IMMUNRENDSZER STIMULÁCIÓJÁN ALAPUL, AMELYET AZ UMA KUTATÓCSOPORTJA JELLEMEZ. A VIRIC FERTŐZÉS MIND A VELESZÜLETETT IMMUNRENDSZER, MIND AZ ADAPTÍV IMMUNRENDSZER AKTIVÁLÁSÁT INDUKÁLJA. AZ IMMUNRENDSZER AKTIVÁLÁSÁRA IRÁNYULÓ VIZSGÁLATOK KÖZÉ TARTOZIK EGY MASSZÍV TRANSZKRIPTOMIKUS SZEKVENÁLÁS (RNS-SEQ) ELVÉGZÉSE A KÖZÖNSÉGES NYELVHAL KÜLÖNBÖZŐ VIRULENCIÁJÚ VÍRUSFERTŐZÉSEIRE ADOTT VÁLASZKÉNT. Ez a STUDY létre fog hozni egy VALIOSISIM INFORMÁCIÓK A DEFENSA ANTIVIRIC RUTS-ban érintett immunogénekkel, A TIME, amely lehetővé teszi a PCR REAL TIME-ben engedélyezett OPENARRAY-ok megtervezését a tanulmányozáshoz használt Taqman SOUNDS-okkal, a GENICAL EXPENDITURE LEVELE, az IMMUNE SYSTEM AJÁNLÁSA, A GENETICA inversa által, a VIRULENCE DYSTEM ÉLETÉBEN._x000D_ E hipotézisre való figyelemmel a PRINCIPAL OBJECT IRÁNYELVE a Betanodavírus VIRÁGÁBAN és a fogadó szervezet IMMUNE RESPONÁLIS KÖVETKEZETÉBEN érintett FACTORS-ok elemzését jelenti. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
VIROVÁ NERVOVÁ NEKRÓZA (NNV) JE ONEMOCNĚNÍ, KTERÉ POSTIHUJE CELOU ŘADU RYB PO CELÉM SVĚTĚ A ZPŮSOBUJE VYSOKOU ÚMRTNOST, ZEJMÉNA U LARVY A NEDOSPĚLÝCH JEDINCŮ. ETHIOLOGIC AGENTEM CHOROBY JE BETANODAVIRUS, KTERÝ MÁ BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOM SLOŽENÝ Z RNA1, KTERÝ KÓDUJE VIROVOU POLYMERÁZU, A RNA2, KTERÝ KÓDUJE CAPSIDE PROTEIN. KROMĚ TOHO SYNTETIZUJÍ SUBGENOMICKOU RNA, RNA3, KTERÁ KÓDUJE PROTEINY B1 (ANTINEKROTICKÝ FAKTOR) A B2 (OCHRANA REPLIKACE VIRŮ PROTI BUNĚČNÉ INTERFERUJÍCÍ RNA). BETANODAVIRUSY JSOU KLASIFIKOVÁNY DO 4 GENOTYPŮ PODLE T4 SEKVENCE RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV A RGNNV. V POSLEDNÍCH LETECH VŠAK BYLA IZOLACE PŘÍRODNÍCH REKOMBINANTŮ RG/SJ (RNA1 TYPU RGNNV A RNA2 SJNNV) ZDOKUMENTOVÁNA V JIŽNÍ EVROPĚ. VŠECHNY IZOLOVANÉ REKOMBINANTY JAZYKA A ZLATA PĚSTOVANÉ NA PYRENEJSKÉM POLOOSTROVĚ MAJÍ CAPSIDE PROTEIN SE TŘEMI ODLIŠNÝMI AMINOACIDICKÝMI POZICEMI NEŽ SJNNV, 2 Z NICH NA KONCI C-TERMINAL, REGION URČUJÍCÍ SPECIFIČNOST HOSTITELE, KTERÝ SE UKÁZAL, ŽE HRAJE DŮLEŽITOU ROLI V VIRULENCI, A JEDEN V REGIONU N-TERMINAL. KROMĚ TOHO SE TYTO REKOMBINANTY VYSKYTUJÍ V POLYMERÁZOVÝCH 19 RŮZNÝCH REZIDUÍCH AMIOACIDIC, POKUD JDE O POLYMERÁZU KMENE RG, A V NEKÓDUJÍCÍCH OBLASTECH OBOU GENOMICKÝCH SEGMENTŮ CELKEM 4 NUKLEOTIDY, KTERÉ SE NESHODUJÍ S KMENY TYPU RG (RNA1) A SJ (RNA2). VŠECHNY TYTO ZMĚNY MOHOU HRÁT DŮLEŽITOU ROLI V VIRULENCE A REPLIKAČNÍ KAPACITĚ. STUDIE DETERMINANT VIRULENCE (DOPLŇKOVĚ SOUVISEJÍCÍCH, S POLYMERÁZOU A S ORF B1 A B2) JE ZÁSADNÍ PRO POCHOPENÍ A KONTROLU ONEMOCNĚNÍ, COŽ JSOU ASPEKTY, KTERÝMI SE BUDE ZABÝVAT VÝZKUMNÝ TÝM USC. JE DOBŘE ZNÁMO, ŽE VÝVOJ ONEMOCNĚNÍ NEZÁVISÍ POUZE NA PATOGENU, KTERÝ JE URČEN INTERAKCÍ VIRU A HOSTITELE. DŮSLEDKY HOSTITELE JSOU ZALOŽENY NA STIMULACI IMUNITNÍHO SYSTÉMU, KTERÝ BUDE CHARAKTERIZOVÁN VÝZKUMNÝM TÝMEM UMY. VIROVÁ INFEKCE VYVOLÁVÁ AKTIVACI JAK VROZENÉHO IMUNITNÍHO SYSTÉMU, TAK ADAPTIVNÍHO IMUNITNÍHO SYSTÉMU. STUDIE O AKTIVACI IMUNITNÍHO SYSTÉMU, KTERÉ MAJÍ BÝT PROVEDENY, ZAHRNUJÍ PROVEDENÍ MASIVNÍHO TRANSKRIPTOMICKÉHO SEKVENOVÁNÍ (RNA-SEQ) V REAKCI NA VIROVÉ INFEKCE RŮZNÉ VIRULENCE U JAZYKA OBECNÉHO. Tato STUDIE vytvoří VALIOSISIM INFORMACE O imunogenech zapojených do ANTIVIRICKÝCH RUTCH DEFENSA, TIME, které umožní navrhnout OPENARRAYS BASED V PCR REAL TIME S Taqmanovými SOUNDS, které mají být použity ke studiu, LEVEL GENICAL EXPENDITURE, doporučení IMMUNE SYSTÉMU LINKOVÁNÍ VIRUSE, OBTENTED BY GENETICA inversa, s dystémem živě VIRULENCE._x000D_ Pozor na tuto hypotézu, PRINCIPAL OBJEKT PRESENTNÍHO PROJEKTU je analyzovat FACTORy zapojené do VIRULENCE Betanodavirus v LENGUATED A ZPRÁVY NA IMMUNE RESPONSE hostitele. (Czech)
4 August 2022
0 references
VĪRUSU NERVA NEKROZE (NNV) IR SLIMĪBA, KAS SKAR DAŽĀDAS ZIVIS VISĀ PASAULĒ, IZRAISOT AUGSTU MIRSTĪBAS LĪMENI, JO ĪPAŠI KĀPURIEM UN MAZUĻIEM. SLIMĪBAS ETHIOLOGIC IEROSINĀTĀJS IR BETANODAVIRUS, KURAM IR BISEGMENTED MONOCATENARY RNS GENOMS, KAS SASTĀV NO RNS1, KAS KODĒ VĪRUSU POLIMERĀZI, UN RNS2, KAS KODĒ CAPSIDE PROTEĪNU. TURKLĀT TIE SINTEZĒ SUBGENOMISKU RNS, RNS3, KAS KODĒ PROTEĪNUS B1 (ANTINEKROTISKO FAKTORU) UN B2 (VĪRUSU REPLIKĀCIJAS AIZSARDZĪBA PRET ŠŪNU TRAUCĒJOŠO RNS). BETANODAVIRUSES IEDALA 4 GENOTIPOS SASKAŅĀ AR RNA2 T4 SECĪBU: SJNNV, TPNNV, BFNNV UN RGNNV. TOMĒR PĒDĒJOS GADOS DIENVIDEIROPĀ IR DOKUMENTĒTA DABISKO REKOMBINANTU RG/SJ (RNA1 TIPS RGNNV UN RNA2 SJNNV) IZOLĀCIJA. VISIEM IZOLĒTAJIEM JŪRASMĒLES UN ZELTA REKOMBINANTIEM, KAS AUDZĒTI IBĒRIJAS PUSSALĀ, IR CAPSIDE PROTEĪNS AR 3 DAŽĀDIEM AMINOSKĀBJU STĀVOKĻIEM SALĪDZINĀJUMĀ AR SJNNV, 2 NO TIEM BEIGĀS C-TERMINĀLS, REĢIONS, KAS NOSAKA SAIMNIEKORGANISMA SPECIFIKU, KAS IR PIERĀDĪTS, KA TAM IR SVARĪGA LOMA VIRULENCE, UN VIENS N-TERMINĀLĀ REĢIONĀ. TURKLĀT ŠIE REKOMBINANTI, KAS ATRODAS POLIMERĀZI 19 DAŽĀDĀS AMIOACIDIC ATLIEKĀS ATTIECĪBĀ UZ RG TIPA CELMA POLIMERĀZI, UN ABU GENOMISKO SEGMENTU NEKODĒŠANAS REĢIONOS KOPĀ IR 4 NUKLEOTĪDI, KAS NESAKRĪT AR RG (RNA1) UN SJ (RNA2) TIPA CELMIEM. VISĀM ŠĪM IZMAIŅĀM VAR BŪT LIELA NOZĪME VIRULENCES UN REPLIKĀCIJAS SPĒJAS NODROŠINĀŠANĀ. VIRULENCES DETERMINANTU PĒTĪJUMS (PAPILDUS SAISTĪTS, AR POLIMERĀZI UN AR ORF B1 UN B2) IR BŪTISKS, LAI IZPRASTU UN KONTROLĒTU SLIMĪBU, ASPEKTUS, KURIEM PIEVĒRSĪSIES USC PĒTNIECĪBAS GRUPA. IR LABI ZINĀMS, KA SLIMĪBAS ATTĪSTĪBA NAV ATKARĪGA TIKAI NO PATOGĒNA, KO NOSAKA VĪRUSA UN UZŅĒMĒJAS MIJIEDARBĪBA. UZŅĒMĒJA IETEKME IR BALSTĪTA UZ IMŪNSISTĒMAS STIMULĀCIJAS, KO RAKSTUROS UMA PĒTNIECĪBAS KOMANDA. VĪRUSA INFEKCIJA INDUCĒ GAN IEDZIMTĀS IMŪNSISTĒMAS, GAN ADAPTĪVĀS IMŪNSISTĒMAS AKTIVĀCIJU. VEICAMIE PĒTĪJUMI PAR IMŪNSISTĒMAS AKTIVĀCIJU IETVER MASVEIDA TRANSKRIPTOMIKAS SEKVENCĒŠANAS (RNS-SEQ) VEIKŠANU, REAĢĒJOT UZ DAŽĀDU VIRULENCES VĪRUSU INFEKCIJĀM. Šī STUDY ģenerēs VALIOSISIM INFORMĀCIJA par imūngēniem, kas iesaistīti DEFENSA ANTIVIRIC RUTS, LAIKS, kas ļaus izstrādāt OPENARRAYS BASED PCR REAL TIME ar TaqMan SOUNDS izmantot, lai pētītu ĢENICĀLĀS IZDEVUMIEM, IMMUNE SYSTEM OF LINKING TO IETEIKUMAM VIRUS, OBTENTED BY GENETICA inversa, AR VIRULENCE DYSTEM livel._x000D_ Uzmanību šai hipotēzei, PRINCIPAL OBJECTIVE of the IESENT PROJECT ir analizēt tos FACTORS, kas iesaistīti Betanodavīrusa VIRULENCE LIETOTĀJIEM UN RELĀCIJAI uz uzņēmēja IMMUNE RESPONSE. (Latvian)
4 August 2022
0 references
IS GALAR É NECRÓIS NÉARÓG VÍREASACH (NNV) A THÉANN I BHFEIDHM AR ÉAGSÚLACHT NA N-IASC AR FUD AN DOMHAIN, RUD A FHÁGANN RÁTAÍ MORTLAÍOCHTA ARDA, GO HÁIRITHE I LARBHAÍ AGUS IN ÓGÁNAIGH. IS É AN GNÍOMHAIRE ETHIOLOGIC AN GHALAIR A BETANODAVIRUS, A BHFUIL GENOME MONOCATENARY BISEGMENTED COMHDHÉANTA DE RNA1, A IONCHÓDAÍONN POLAIMÉIR VÍREASACH, AGUS RNA2, A IONCHÓDAÍONN AN PRÓITÉIN CAPSIDE. INA THEANNTA SIN, SINTÉISÍONN SIAD RNA SUBGENOMIC, RNA3, A IONCHÓDAÍONN PRÓITÉINÍ B1 (FACHTÓIR FRITH-NECROTIC) AGUS B2 (COSAINT MHACASAMHLÚ VÍREASACH I GCOINNE CUR ISTEACH CEALLACH RNA). AICMÍTEAR BETANODAVIRUSES I 4 GHÉINITÍOPA DE RÉIR SHEICHEAMH T4 RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV AGUS RGNNV. MAR SIN FÉIN, LE BLIANTA BEAGA ANUAS TÁ AONRÚ NA N-ATHCHUINGNEOIRÍ NÁDÚRTHA RG/SJ (RNA1 CINEÁL RGNNV AGUS RNA2 SJNNV) DOICIMÉADAITHE I NDEISCEART NA HEORPA. TÁ GACH RECOMBINANTS SCOITE AONAIR AGUS ÓR TAR ÉIS FÁS I LEITHINIS NA HIBÉIRE PRÓITÉIN CAPSIDE LE 3 POIST AMINOACIDIC ÉAGSÚLA I GCOMPARÁID LEIS SIN DE SJNNV, 2 ACU AG AN DEIREADH C-CRÍOCHFORT, RÉIGIÚN A CHINNEADH SAINIÚLACHT ÓSTACH, ATÁ LÉIRITHE A IMIRT RÓL TÁBHACHTACH I NIMHNEACHT, AGUS CEANN AMHÁIN SA RÉIGIÚN N-CRÍOCHFORT. INA THEANNTA SIN, TÁ NA HATHCHUINGIR SIN I BPOLAIMÉARÁIS 19 IARMHAR AMIOACIDIC ÉAGSÚLA I NDÁIL LE POLAIMÉARÁIS DEN TRÉITHCHINEÁL DE CHINEÁL RG, AGUS I RÉIGIÚIN NEAMHCHÓDAITHE AN DÁ DHEIGHLEOG GHÉANÓMAÍOCHA, TÁ 4 NÚICLÉITÍDÍ ANN NACH BHFUIL I GCOMHTHRÁTH LEIS NA TRÉITHCHINEÁLACHA DE CHINEÁL RG (RNA1) AGUS SJ (RNA2). D’FHÉADFADH RÓL TÁBHACHTACH A BHEITH AG NA HATHRUITHE SIN GO LÉIR SA NIMHNEACHT AGUS SA CHUMAS MACASAMHLAITHEACH. TÁ AN STAIDÉAR AR DHEITÉARMANAINT VIRULENCE (A BHAINEANN GO BREISE, LE POLAIMÉIREAS AGUS LE ORF B1 AGUS B2) RÍTHÁBHACHTACH CHUN AN GALAR A THUISCINT AGUS A RIALÚ, GNÉITHE A DTABHARFAIDH FOIREANN TAIGHDE MSU AGHAIDH ORTHU. TÁ SÉ AR EOLAS GO MAITH NACH MBRAITHEANN FORBAIRT AN GHALAIR ACH AR AN BPATAIGIN, AGUS É Á CHINNEADH AG IDIRGHNÍOMHAÍOCHT VÍREAS-ÓSTACH. TÁ IMPLEACHT AN ÓSTAIGH BUNAITHE AR SPREAGADH AN CHÓRAIS IMDHÍONACHTA, A MBEIDH FOIREANN TAIGHDE AN UMA MAR SHAINTRÉITH ACU. SPREAGANN IONFHABHTÚ VIRIC GNÍOMHACHTÚ AN CHÓRAIS IMDHÍONACHTA DHÚCHASAIGH AGUS AN CHÓRAIS IMDHÍONACHTA OIRIÚNAITHEACH ARAON. ÁIRÍTEAR AR NA STAIDÉIR AR GHNÍOMHACHTÚ AN CHÓRAIS IMDHÍONACHTA ATÁ LE DÉANAMH SEICHEAMHÚ OLLMHÓR TRAS-SCRÍBHINNE (RNA-SEQ) A DHÉANAMH MAR FHREAGAIRT AR IONFHABHTUITHE VÍREAS A BHFUIL NIMHNEACHT ÉAGSÚIL ACU DON SÓL. Ginfidh an STUD seo faisnéis VALIOSISIM maidir le himdhíoniginí a chuirtear i bhfeidhm i ruts ANTIVIRIC DEFENSA, AN TIME a cheadóidh dearadh OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TIME LE SOUNDS TaqMan le húsáid chun staidéar a dhéanamh, TÁBHÁIL GINEARÁLTA GINEARÁLTA, aird a thabhairt ar an hipitéis seo, a bhaineann le Géiniteacha, le Dystem livel of VIRULENCE._x000D_ aird a thabhairt ar an hipitéis seo, is é an PRINCIPAL OF THE PRINCIPAL OF THE PRIOECT STIÚRTHÓIREACHT GNÍOMHAÍOCHTA an óstaigh a anailísiú. (Irish)
4 August 2022
0 references
VIRUSNA NEKROZA ŽIVCEV (NNV) JE BOLEZEN, KI PRIZADENE RAZLIČNE RIBE PO VSEM SVETU IN POVZROČA VISOKO STOPNJO UMRLJIVOSTI, ZLASTI PRI LIČINKAH IN MLADIČIH. ETHIOLOGIC POVZROČITELJ BOLEZNI JE BETANODAVIRUS, KI IMA BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOM SESTAVLJEN IZ RNA1, KI KODIRA VIRUSNO POLIMERAZO, IN RNA2, KI KODIRA BELJAKOVINO CAPSIDE. POLEG TEGA SINTETIZIRAJO SUBGENOMSKO RNK, RNA3, KI KODIRA BELJAKOVINE B1 (ANTINEKROTIČNI FAKTOR) IN B2 (ZAŠČITA REPLIKACIJE VIRUSOV PRED CELIČNO MOTEČE RNK). BETANODAVIRUSES SE RAZVRSTIJO V 4 GENOTIPE V SKLADU Z ZAPOREDJEM T4 RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV IN RGNNV. VENDAR JE BILA V ZADNJIH LETIH V JUŽNI EVROPI DOKUMENTIRANA IZOLACIJA NARAVNIH REKOMBINANTOV RG/SJ (RNA1 TIPA RGNNV IN RNA2 SJNNV). VSE IZOLIRANE REKOMBINANTE MORSKEGA LISTA IN ZLATA, KI SE GOJIJO NA IBERSKEM POLOTOKU, IMAJO BELJAKOVINO CAPSIDE S 3 RAZLIČNIMI AMINOKISLINSKIMI POLOŽAJI V PRIMERJAVI S SJNNV, 2 OD NJIH NA KONCU C-TERMINAL, REGIJA, KI DOLOČA SPECIFIČNOST GOSTITELJA, KI SE JE IZKAZALA ZA POMEMBNO VLOGO PRI VIRULENCI, IN ENA V REGIJI N-TERMINAL. POLEG TEGA SO TI REKOMBINANTI PRISOTNI V POLIMERAZI 19 RAZLIČNIH OSTANKOV AMIOACIDIC GLEDE NA POLIMERAZO SEVA TIPA RG, V NEKODIRNIH OBMOČJIH OBEH GENOMSKIH SEGMENTOV PA SKUPNO 4 NUKLEOTIDI, KI NE SOVPADAJO S SEVOMA TIPA RG (RNA1) IN SJ (RNA2). VSE TE SPREMEMBE IMAJO LAHKO POMEMBNO VLOGO PRI VIRULENCI IN REPLIKACIJSKI SPOSOBNOSTI. ŠTUDIJA DETERMINANT VIRULENCE (DODATNO POVEZANA, S POLIMERAZO IN Z ORF B1 IN B2) JE BISTVENA ZA RAZUMEVANJE IN OBVLADOVANJE BOLEZNI, VIDIKOV, KI JIH BO OBRAVNAVALA RAZISKOVALNA SKUPINA USC. ZNANO JE, DA RAZVOJ BOLEZNI NI ODVISEN LE OD PATOGENA, KI GA DOLOČA INTERAKCIJA MED VIRUSOM IN GOSTITELJEM. POSLEDICE GOSTITELJA TEMELJIJO NA STIMULACIJI IMUNSKEGA SISTEMA, ZA KATEREGA BO ZNAČILNA RAZISKOVALNA SKUPINA UMA. OKUŽBA Z VIRUSOM VIRIC SPROŽI AKTIVIRANJE TAKO PRIROJENEGA IMUNSKEGA SISTEMA KOT TUDI PRILAGODLJIVEGA IMUNSKEGA SISTEMA. ŠTUDIJE O AKTIVACIJI IMUNSKEGA SISTEMA, KI JIH JE TREBA IZVESTI, VKLJUČUJEJO IZVAJANJE MASIVNEGA TRANSKRIPTOMSKEGA SEKVENCIRANJA (RNA-SEQ) KOT ODZIV NA VIRUSNE OKUŽBE Z RAZLIČNO VIRULENCO ZA PODPLAT. Ta STUDIJA bo ustvarila VALIOSISIM INFORMACIJA O imunogenih genih, vključenih v ANTIVIRIC RUTS DEFENSA, TIME, ki bo omogočal oblikovanje OPENARRAYS, ki se uporabljajo v PCR REAL TIME WITH TaqMan SOUNDS, za preučevanje, RESPONSE IMMUNE SYSTEM LINKING TO PRIPOROČILA VIRUSA, OBVESTITEV GENETICA inversa, Z DYSTEMom živahno VIRULENCE._x000D_ Pozor na to hipotezo, PRINCIPALNI OBJEKTI PREDSTAVNIK PREDSTAVNIKA je analizirati FACTOR, ki so vključeni v VIRULENCE Betanodavirus V LENGUATED IN RELATION to IMMUNE RESPONSE gostitelja. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
ВИРУСНАТА НЕКРОЗА (NNV) Е ЗАБОЛЯВАНЕ, КОЕТО ЗАСЯГА РАЗЛИЧНИ РИБИ В СВЕТОВЕН МАЩАБ, ПРИЧИНЯВАЙКИ ВИСОКА СМЪРТНОСТ, ОСОБЕНО ПРИ ЛАРВИТЕ И МЛАДИТЕ ЕКЗЕМПЛЯРИ. ETHIOLOGIC АГЕНТЪТ НА ЗАБОЛЯВАНЕТО Е BETANODAVIRUS, КОЙТО ИМА BISEGMENTED MONOCATENARY RNA ГЕНОМ, СЪСТАВЕН ОТ РНК1, КОЙТО КОДИРА ВИРУСНАТА ПОЛИМЕРАЗА, И РНК2, КОЙТО КОДИРА ПРОТЕИНА CAPSIDE. ОСВЕН ТОВА ТЕ СИНТЕЗИРАТ СУБГЕНОМНА РНК, РНК3, КОЯТО КОДИРА ПРОТЕИНИ В1 (АНТИНЕКРОТИЧЕН ФАКТОР) И В2 (ЗАЩИТА НА ВИРУСНАТА РЕПЛИКАЦИЯ СРЕЩУ КЛЕТЪЧНА ИНТЕРФЕРИРАЩА РНК). BETANODAVIRUSES СЕ КЛАСИФИЦИРАТ В 4 ГЕНОТИПА В СЪОТВЕТСТВИЕ С ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТТА T4 НА РНК2: SJNNV, TPNNV, BFNNV И RGNNV. ПРЕЗ ПОСЛЕДНИТЕ ГОДИНИ ОБАЧЕ ИЗОЛИРАНЕТО НА ЕСТЕСТВЕНИ РЕКОМБИНАНТИ RG/SJ (RNA1 ТИП RGNNV И RNA2 SJNNV) Е ДОКУМЕНТИРАНО В ЮЖНА ЕВРОПА. ВСИЧКИ ИЗОЛИРАНИ РЕКОМБИНАНТИ НА МОРСКИ ЕЗИК И ЗЛАТО, ОТГЛЕЖДАНИ НА ИБЕРИЙСКИЯ ПОЛУОСТРОВ, ИМАТ ПРОТЕИН CAPSIDE С 3 РАЗЛИЧНИ АМИНОАЦИДНИ ПОЗИЦИИ В СРАВНЕНИЕ С ТЕЗИ НА SJNNV, 2 ОТ ТЯХ В КРАЯ НА C-ТЕРМИНАЛА, РЕГИОН, ОПРЕДЕЛЯЩ СПЕЦИФИЧНОСТТА НА ГОСТОПРИЕМНИКА, ЗА КОЙТО Е ДОКАЗАНО, ЧЕ ИГРАЕ ВАЖНА РОЛЯ ВЪВ ВИРУЛЕНТНОСТТА, И ЕДИН В РЕГИОНА НА N-ТЕРМИНАЛА. ОСВЕН ТОВА ТЕЗИ РЕКОМБИНАНТИ ПРИСЪСТВАТ В ПОЛИМЕРАЗА 19 РАЗЛИЧНИ ОСТАТЪЦИ ОТ AMIOACIDIC ПО ОТНОШЕНИЕ НА ПОЛИМЕРАЗАТА НА ЩАМА ТИП RG, А В НЕКОДИРАЩИТЕ РЕГИОНИ НА ДВАТА ГЕНОМНИ СЕГМЕНТА — ОБЩО 4 НУКЛЕОТИДА, КОИТО НЕ СЪВПАДАТ С ЩАМОВЕТЕ ТИП RG (RNA1) И SJ (RNA2). ВСИЧКИ ТЕЗИ ПРОМЕНИ МОГАТ ДА ИГРАЯТ ВАЖНА РОЛЯ ВЪВ ВИРУЛЕНТНОСТТА И КАПАЦИТЕТА ЗА ВЪЗПРОИЗВЕЖДАНЕ. ПРОУЧВАНЕТО НА ДЕТЕРМИНАНТИТЕ НА ВИРУЛЕНТНОСТТА (ДОПЪЛНИТЕЛНО СВЪРЗАНИ С ПОЛИМЕРАЗАТА И С ORF B1 И B2) Е ОТ ОСНОВНО ЗНАЧЕНИЕ ЗА РАЗБИРАНЕТО И КОНТРОЛИРАНЕТО НА БОЛЕСТТА — АСПЕКТИ, КОИТО ЩЕ БЪДАТ РАЗГЛЕДАНИ ОТ ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКИЯ ЕКИП НА USC. ДОБРЕ ИЗВЕСТНО Е, ЧЕ РАЗВИТИЕТО НА ЗАБОЛЯВАНЕТО НЕ ЗАВИСИ САМО ОТ ПАТОГЕНА, КОЙТО СЕ ОПРЕДЕЛЯ ОТ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО ВИРУС-ГОСТОПРИЕМНИК. ВЛИЯНИЕТО НА ГОСТОПРИЕМНИКА СЕ ОСНОВАВА НА СТИМУЛИРАНЕТО НА ИМУННАТА СИСТЕМА, КОЯТО ЩЕ СЕ ХАРАКТЕРИЗИРА С ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКИЯ ЕКИП НА УМА. ВИРУСНАТА ИНФЕКЦИЯ ИНДУЦИРА АКТИВИРАНЕТО КАКТО НА ВРОДЕНАТА ИМУННА СИСТЕМА, ТАКА И НА АДАПТИВНАТА ИМУННА СИСТЕМА. ПРОУЧВАНИЯТА ЗА АКТИВИРАНЕ НА ИМУННАТА СИСТЕМА, КОИТО ТРЯБВА ДА СЕ ИЗВЪРШАТ, ВКЛЮЧВАТ ИЗВЪРШВАНЕ НА МАСИВНА ТРАНСКРИПТОМНА СЕКВЕНЦИЯ (РНК-SEQ) В ОТГОВОР НА ВИРУСНИ ИНФЕКЦИИ С РАЗЛИЧНА ВИРУЛЕНТНОСТ ЗА МОРСКИ ЕЗИК. Тази статия ще генерира VALIOSISIM ИНФОРМАЦИОННА ИНФОРМАЦИЯ относно имуногените, замесени в ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, TIME, които ще позволят да се използва дизайнът на ОТВЪРЖДАВИТЕЛНИ ИНФОРМАЦИИ В PCR REAL TIME с TaqMan SOUNDS да се използва за изследване, НИВО НА ГЕНИКАЛНИТЕ ЕКСПОНДИЦИИ, препоръка НА СИСТЕМА НА ИМОНАТА СЛЕДВАНЕ НА ПРЕПОРЪЧАНЕ НА ВИПУС, Обединена от Дженетика инверса, С дистема жива на VIRULENCE._x000D_ Внимание към тази хипотеза, PRINCIPAL OBJECTIVE НА ПРЕДСТАВИТЕЛЯ НА ПРЕДСТАВИТЕЛЯ е да се анализират FACTORS, замесени във ВЗЕХАНИЯТА НА Бетанодавируса ВЪЗЛОЖЕНИЯ И ПРЕЛАТ НА ИЗВЪНИТЕЛНОТО ПРЕДСТАВЕНИЕ НА домакина. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
IN-NEKROŻI TAN-NERVITURI VIRALI (NNV) HIJA MARDA LI TAFFETTWA VARJETÀ TA’ ĦUT MADWAR ID-DINJA, LI TIKKAWŻA RATI GĦOLJIN TA’ MORTALITÀ, SPEĊJALMENT FIL-LARVI U Ż-ŻGĦAR. L-AĠENT ETHIOLOGIC TAL-MARDA HUWA BETANODAVIRUS, LI GĦANDU ĠENOMA BISEGMENTED MONOCATENARY RNA KOMPOST MINN RNA1, LI JIKKODIFIKA L-POLYMERASE VIRALI, U RNA2, LI JIKKODIFIKA L-PROTEINA CAPSIDE. BARRA MINN HEKK, HUMA JISSINTETIZZAW RNA SUBĠENOMIKA, RNA3, LI TIKKODIFIKA L-PROTEINI B1 (FATTUR ANTINEKROTIKU) U B2 (PROTEZZJONI TAR-REPLIKAZZJONI VIRALI KONTRA L-RNA LI JINTERFERIXXI FIĊ-ĊELLULI). BETANODAVIRUSES HUMA KKLASSIFIKATI F’4 ĠENOTIPI SKONT IS-SEKWENZA T4 TA’ RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV U RGNNV. MADANKOLLU, F’DAWN L-AĦĦAR SNIN L-IŻOLAMENT TAR-RIKOMBINANTI NATURALI RG/SJ (RNA1 TIP RGNNV U RNA2 SJNNV) ĠIE DDOKUMENTAT FIN-NOFSINHAR TAL-EWROPA. IR-RIKOMBINANTI IŻOLATI KOLLHA TAL-LINGWATA U TAD-DEHEB IMKABBRA FIL-PENIŻOLA IBERIKA GĦANDHOM PROTEINA CAPSIDE BI 3 POŻIZZJONIJIET AMMINAĊIDIĊI DIFFERENTI META MQABBLA MA’ DIK TA’ SJNNV, 2 MINNHOM FL-AĦĦAR C-TERMINAL, IR-REĠJUN LI JIDDETERMINA L-ISPEĊIFIĊITÀ OSPITANTI, LI NTWERA LI GĦANDU RWOL IMPORTANTI FIL-VIRULENZA, U WIEĦED FIR-REĠJUN N-TERMINAL. BARRA MINN HEKK, DAWN IR-RIKOMBINANTI PREŻENTI FIL-POLIMERAŻI 19 RESIDWI DIFFERENTI TA’ AMIOACIDIC FIR-RIGWARD TAL-POLIMERAŻI TAR-RAZZA TAT-TIP RG, U FIR-REĠJUNI MHUX IKKODIFIKATI TAŻ-ŻEWĠ SEGMENTI ĠENOMIĊI, TOTAL TA’ 4 NUKLEOTIDI LI MA JIKKOINĊIDUX MAR-RAZEZ TAT-TIP RG (RNA1) U SJ (RNA2). DAWN IL-BIDLIET KOLLHA JISTA’ JKOLLHOM RWOL IMPORTANTI FIL-KAPAĊITÀ TA’ VIRULENZA U REPLIKAZZJONI. L-ISTUDJU TAD-DETERMINANTI TAL-VIRULENZA (ADDIZZJONALMENT RELATATI, MAL-POLIMERAŻI U MAL-ORF B1 U B2) HUWA FUNDAMENTALI GĦALL-FEHIM U L-KONTROLL TAL-MARDA, ASPETTI LI SE JIĠU INDIRIZZATI MIT-TIM TA’ RIĊERKA TAL-USC. HUWA MAGĦRUF SEW LI L-IŻVILUPP TAL-MARDA MA JIDDEPENDIX BISS FUQ IL-PATOĠENU, LI JIĠI DETERMINAT MILL-INTERAZZJONI TAL-VIRUS MAL-OSPITANT. L-IMPLIKAZZJONI TAL-OSPITANT HIJA BBAŻATA FUQ L-ISTIMULAZZJONI TAS-SISTEMA IMMUNITARJA, LI SE TKUN IKKARATTERIZZATA MIT-TIM TA ‘RIĊERKA TAL-UMA. L-INFEZZJONI VIRIC TINDUĊI L-ATTIVAZZJONI KEMM TAS-SISTEMA IMMUNITARJA INNATA KIF UKOLL TAS-SISTEMA IMMUNITARJA ADATTIVA. STUDJI DWAR L-ATTIVAZZJONI TAS-SISTEMA IMMUNITARJA LI GĦANDHA TITWETTAQ JINKLUDU T-TWETTIQ TA’ SEKWENZJAR TRASKRITOMIKU MASSIV (RNA-SEQ) B’RISPONS GĦAL INFEZZJONIJIET VIRALI TA’ VIRULENZA DIFFERENTI GĦAL-LINGWATA. Din l-ISTUDJA se tiġġenera INFORMAZZJONI VALIOSISIM DWAR l-immunoġeni implikati fir-RUTS ANTIVIRIC TA’ DEFENSA, IL-ĦIN li se jippermetti d-disinn ta’ l-OPENARRAYS BASED F’TIEM REAL TAL-PCR li għandu jintuża għall-istudju, LIVELL TA’ NEFQA ĠENIKALI, RISPONZA TA’ L-IMMMUNE SISTEMA LI GĦANDHA JIRRAKKOMANDA VIRJU, OBTENTED BY ĠENETTI inversa, BIL-Ivel DYSTEM TA ‘VIRULENZA._x000D_ Attenzjoni għal din l-ipoteżi, l-OBJETTIVA PRINCIPAL TAL-PRJETTIVA PRESENTI huwa li tanalizza l-FACTORs implikati fil-VERITÀ tal-Betanodavirus fil-LENGUATED U RELAZZJONI GĦAR-RISPONZA IMUNE TAL-ospitant. (Maltese)
4 August 2022
0 references
A neurose nervosa viral (NNV) é uma doença que afeta uma variedade de peixes em todo o mundo, causando altas taxas de mortalidade, especialmente em larvas e juvenis. O agente etiológico da doença é um betanodavirose, que tem um genoma de ARN MONOCATENÁRIO BISEGMENTADO composto de ARN1, que codifica a polimerização viral, e ARN2, que codifica a proteína cápside. Além disso, sintetizam um ARN subgenómico, o ARN3, que codifica as proteínas B1 (fator anti-necrótico) e B2 (proteção da replicação viral contra o ARN de interferência celular). CLASSIFICAM-SE OS BETANODAVÍRIOS EM 4 GENÓTIPOS DE ACORDO COM A SEQUÊNCIA T4 DO ARN2: SJNNV, TPNNV, BFNNV E RGNNV. No entanto, em anos recentes, a ISOLAÇÃO DE RECOMBINANTES NATURAIS RG/SJ (Tipo de ARN1 RGNNV e ARN2 SJNNV) foi DOCUMENTADA na Europa do Sul. Todos os recombinantes isolados de só e de ouro cultivados na pENÍNSULA IBERIA têm uma proteína cápside com 3 posições aminoacídicas diferentes em comparação com a de SJNNV, 2 delas no final do C-terminal, região que determina a especificidade do hospedeiro, que foi mostrado para jogar um papel importante em virulência, e uma na região N-terminal. Além disso, estes recombinantes estão presentes na polimerização 19 diferentes resíduos amioacídicos no que diz respeito à polimerização da estirpe do tipo RG e, nas regiões não codificantes de ambos os segmentos genéticos, um total de 4 nucleótidos que não coincidam com as estirpes do tipo RG (RNA1) e SJ (RNA2). Todas estas mudanças podem desempenhar um papel importante na violência e na capacidade de resposta. O estudo dos DETERMINANTES DE VIRULÊNCIA (ADDICIONALMENTE RELACIONADOS, COM POLIMERASE E COM ORF B1 E B2) é fundamental para compreender e controlar a doença, aspectos que serão abordados pela equipa de investigação do USC. É sabido que o desenvolvimento da doença não depende apenas do patogéneo, sendo determinado pela interacção com o vírus. A implantação do hospedeiro baseia-se na estabilização do sistema de imunização, que será caracterizado pela equipa de investigação da UMA. A INFEÇÃO VIRICA INDUZ A ATIVAÇÃO DO SISTEMA INNATE IMMUNE E DO SISTEMA ADAPTIVE IMMUNE. ESTUDOS SOBRE A ATIVAÇÃO DO SISTEMA DE IMUNAS A REALIZAR INCLUINDO A REALIZAÇÃO DE UMA SEQUÊNCIA TRANSCRIPTÓMICA MASSIVA (RNA-SEQ) EM RESPOSTA A INFEÇÕES VÍRUS DE DIFERENTES VIRULÊNCIAS POR SOLA. Este ESTUDO irá gerar uma INFORMAÇÃO VALIOSÍSIMA SOBRE Imunogénios IMPLICADOS EM RUAS ANTIVIÁRIAS DE DEFENSA, O TEMPO que permitirá o desenho de OPENARRAYS BASEADOS EM PCR EM TEMPO REAL COM SOMES TaqMan a serem utilizados para estudar, um NÍVEL DE DESPESAS GENICAS, A RESPOSTA DO SISTEMA IMUNO DE LIGAÇÃO A VÍRUS RECOMENDANTES, OBTENCIONADO PELA GENETICA INVERSA, COM UM SISTEMA DE VIRULÊNCIA._x000D_ Atenção a esta hipótese, o OBJETIVO PRINCIPAL DO PRESENTE PROJETO é analisar os FATORES IMPLICADOS NA VIRULÊNCIA DE Betanodavírus EM LENGUADO E RELACIONADO À RESPOSSÃO IMUNTA DO anfitrião. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
VIRAL NERVENEKROSE (NNV) ER EN SYGDOM, DER PÅVIRKER EN RÆKKE FISK VERDEN OVER, HVILKET FORÅRSAGER HØJ DØDELIGHED, ISÆR HOS LARVER OG UNGE. DEN ETHIOLOGIC AGENS AF SYGDOMMEN ER EN BETANODAVIRUS, SOM HAR EN BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOM BESTÅENDE AF RNA1, SOM KODER VIRAL POLYMERASE, OG RNA2, SOM KODER CAPSIDE PROTEINET. DERUDOVER SYNTETISERER DE EN SUBGENOMISK RNA, RNA3, SOM INDKODER PROTEINERNE B1 (ANTINEKROTISK FAKTOR) OG B2 (BESKYTTELSE AF VIRAL REPLIKATION MOD CELLEINTERFERERENDE RNA). BETANODAVIRUSES KLASSIFICERES I 4 GENOTYPER EFTER T4-SEKVENSEN AF RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV OG RGNNV. I DE SENERE ÅR ER ISOLERINGEN AF NATURLIGE REKOMBINANTER RG/SJ (RNA1-TYPE RGNNV OG RNA2 SJNNV) IMIDLERTID BLEVET DOKUMENTERET I SYDEUROPA. ALLE ISOLEREDE REKOMBINANTER AF TUNGE OG GULD DYRKET PÅ DEN IBERISKE HALVØ HAR ET CAPSIDE-PROTEIN MED 3 FORSKELLIGE AMINOACIDISKE POSITIONER SAMMENLIGNET MED SJNNV'S, 2 AF DEM I SLUTNINGEN C-TERMINAL, REGION, DER BESTEMMER VÆRTSSPECIFICITET, SOM HAR VIST SIG AT SPILLE EN VIGTIG ROLLE I VIRULENS, OG EN I N-TERMINAL-REGIONEN. DESUDEN ER DISSE REKOMBINANTER TIL STEDE I POLYMERASE 19 FORSKELLIGE AMIOACIDIC RESTKONCENTRATIONER MED HENSYN TIL POLYMERASE AF RG-TYPEN STAMMEN, OG I DE IKKE-KODENDE REGIONER I BEGGE GENOMISKE SEGMENTER I ALT 4 NUKLEOTIDER, DER IKKE FALDER SAMMEN MED RG (RNA1) OG SJ (RNA2) TYPE STAMMER. ALLE DISSE ÆNDRINGER KAN SPILLE EN VIGTIG ROLLE FOR VIRULENS OG REPLIKATORISK KAPACITET. UNDERSØGELSEN AF VIRULENSDETERMINANTER (YDERLIGERE BESLÆGTET MED POLYMERASE OG ORF B1 OG B2) ER AFGØRENDE FOR AT FORSTÅ OG KONTROLLERE SYGDOMMEN, SOM VIL BLIVE BEHANDLET AF USC'S FORSKNINGSTEAM. DET ER VELKENDT, AT UDVIKLINGEN AF SYGDOMMEN IKKE KUN AFHÆNGER AF PATOGENET, BESTEMMES AF VIRUS-VÆRT INTERAKTION. IMPLIKATIONEN AF VÆRTEN ER BASERET PÅ STIMULERING AF IMMUNSYSTEMET, SOM VIL BLIVE KARAKTERISERET AF UMA'S FORSKERHOLD. DEN VIRIC INFEKTION INDUCERER AKTIVERING AF BÅDE DET MEDFØDTE IMMUNSYSTEM OG DET ADAPTIVE IMMUNSYSTEM. UNDERSØGELSER AF AKTIVERINGEN AF IMMUNSYSTEMET, DER SKAL UDFØRES, OMFATTER UDFØRELSE AF EN MASSIV TRANSSKRIPTOMISK SEKVENTERING (RNA-SEQ) SOM REAKTION PÅ VIRUSINFEKTIONER AF FORSKELLIG VIRULENS FOR SÅL. Denne STUDY vil generere en VALIOSISIM INFORMATION OM immungener impliceret i ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, TIME, der vil gøre det muligt at designe OPENARRAYS BASED I PCR REAL TIME MED TaqMan SOUNDS, der skal anvendes til at studere, en LEVEL AF GENICAL EXPENDITURE, resultatet af IMMUNE SYSTEM AF VIRULENCE._x000D_ Under hensyntagen til denne hypotese er PRINCIPAL OBJECTIVE FOR PRESENT PROJEKTET at analysere de FAKTER, der er impliceret i VIRULENCE._x000D_ Under hensyntagen til denne hypotese, er PRINCIPAL OBJEKTET FOR DEN OPLYSNING AF værten at analysere de FAKTER, der er impliceret i VIRULENCE af Betanodavirus i LENGUATED OG RELATION AF værtens IMMUNE RESPONSE. (Danish)
4 August 2022
0 references
NECROZA NERVOASĂ VIRALĂ (NNV) ESTE O BOALĂ CARE AFECTEAZĂ O VARIETATE DE PEȘTI DIN ÎNTREAGA LUME, PROVOCÂND RATE RIDICATE ALE MORTALITĂȚII, ÎN SPECIAL ÎN CAZUL LARVELOR ȘI AL PUIETULUI. AGENTUL ETHIOLOGIC AL BOLII ESTE UN BETANODAVIRUS, CARE ARE UN GENOM BISEGMENTAT MONOCATENARY COMPUS DIN ARN1, CARE CODIFICĂ POLIMERAZA VIRALĂ ȘI ARN2, CARE CODIFICĂ PROTEINA CAPSIDE. ÎN PLUS, ACESTEA SINTETIZEAZĂ UN ARN SUBGENOMIC, ARN3, CARE CODIFICĂ PROTEINELE B1 (FACTOR ANTINECROTIC) ȘI B2 (PROTECȚIA REPLICĂRII VIRALE ÎMPOTRIVA ARN-ULUI CARE INTERFEREAZĂ CELULAR). BETANODAVIRUSES SUNT CLASIFICATE ÎN 4 GENOTIPURI ÎN CONFORMITATE CU SECVENȚA T4 A ARN2: SJNNV, TPNNV, BFNNV ȘI RGNNV. CU TOATE ACESTEA, ÎN ULTIMII ANI, IZOLAREA RECOMBINANȚILOR NATURALI RG/SJ (RNA1 TIP RGNNV ȘI RNA2 SJNNV) A FOST DOCUMENTATĂ ÎN SUDUL EUROPEI. TOATE RECOMBINANȚII IZOLAȚI DE LIMBĂ-DE-MARE ȘI AUR CULTIVAȚI ÎN PENINSULA IBERICĂ AU O PROTEINĂ CAPSIDE CU 3 POZIȚII AMINOACIDE DIFERITE FAȚĂ DE CEA A SJNNV, 2 DINTRE ELE LA TERMINALUL C FINAL, REGIUNE CARE DETERMINĂ SPECIFICITATEA GAZDĂ, CARE S-A DOVEDIT A JUCA UN ROL IMPORTANT ÎN VIRULENȚĂ, ȘI UNA ÎN REGIUNEA N-TERMINAL. ÎN PLUS, ACEȘTI RECOMBINANȚI PREZINTĂ ÎN POLIMERAZĂ 19 REZIDUURI AMIOACIDIC DIFERITE ÎN CEEA CE PRIVEȘTE POLIMERAZA TULPINII DE TIP RG, IAR ÎN REGIUNILE NECODIFICATE ALE AMBELOR SEGMENTE GENOMICE UN TOTAL DE 4 NUCLEOTIDE CARE NU COINCID CU TULPINILE DE TIP RG (ARN1) ȘI SJ (ARN2). TOATE ACESTE SCHIMBĂRI POT JUCA UN ROL IMPORTANT ÎN VIRULENȚĂ ȘI CAPACITATEA DE REPLICARE. STUDIUL FACTORILOR DETERMINANȚI AI VIRULENȚEI (ASOCIAȚI SUPLIMENTAR, CU POLIMERAZĂ ȘI CU ORF B1 ȘI B2) ESTE FUNDAMENTAL PENTRU ÎNȚELEGEREA ȘI CONTROLUL BOLII, ASPECTE CARE VOR FI ABORDATE DE ECHIPA DE CERCETARE USC. ESTE BINE CUNOSCUT FAPTUL CĂ DEZVOLTAREA BOLII NU DEPINDE NUMAI DE AGENTUL PATOGEN, FIIND DETERMINATĂ DE INTERACȚIUNEA VIRUS-GAZDĂ. IMPLICAREA GAZDEI SE BAZEAZĂ PE STIMULAREA SISTEMULUI IMUNITAR, CARE VA FI CARACTERIZATĂ DE ECHIPA DE CERCETARE A UMA. INFECȚIA CU VIRIC INDUCE ACTIVAREA ATÂT A SISTEMULUI IMUNITAR ÎNNĂSCUT, CÂT ȘI A SISTEMULUI IMUNITAR ADAPTIV. STUDIILE PRIVIND ACTIVAREA SISTEMULUI IMUNITAR CARE URMEAZĂ SĂ FIE EFECTUATE INCLUD EFECTUAREA UNEI SECVENȚE TRANSCRIMINICE MASIVE (ARN-SEQ) CA RĂSPUNS LA INFECȚIILE VIRALE CU VIRULENȚĂ DIFERITĂ PENTRU LIMBĂ-DE-MARE. Această STUDIE va genera o INFORMAȚII VALIOSISIMĂ privind imunogenii implicați în RUTurile ANTIVIRICE ale DEFENSA, TIMPUL care va permite proiectarea OPENARRAYS BASED ÎN TIMPUL REAL PCR cu sounele Taqman care urmează să fie utilizate pentru a studia, o LEVEL DE EXPENDITURĂ GENICALĂ, REZONSEA SISTEMULUI IUNUNĂRII LINKING LA VIRUSUL RECOMANDANT, OBTENTED BY GENETICA inversa, CU DYSTEMUL VIRULENȚEI._x000D_ Atenție la această ipoteză, OBJECTIVUL PRINCIPAL al PREZENTULUI PROIECT este de a analiza FACTORII implicați în VIRULENȚA Betanodavirusului în LENGUATE ȘI RELAȚIE LA RESPONSE IUNUNĂ a gazdei. (Romanian)
4 August 2022
0 references
VIRAL NERVNEKROS (NNV) ÄR EN SJUKDOM SOM DRABBAR EN MÄNGD OLIKA FISKAR VÄRLDEN ÖVER OCH ORSAKAR HÖG DÖDLIGHET, SÄRSKILT HOS LARVER OCH UNGA EXEMPLAR. DEN ETHIOLOGIC MEDEL AV SJUKDOMEN ÄR EN BETANODAVIRUS, SOM HAR ETT BISEGMENTED MONOCATENARY RNA GENOM SOM BESTÅR AV RNA1, SOM KODAR VIRAL POLYMERAS, OCH RNA2, SOM KODAR CAPSIDE PROTEIN. DESSUTOM SYNTETISERAR DE EN SUBGENOMISK RNA, RNA3, SOM KODAR PROTEINERNA B1 (ANTI-NEKROTISK FAKTOR) OCH B2 (SKYDD AV VIRUSREPLIKATION MOT CELLULÄR STÖRANDE RNA). BETANODAVIRUSES KLASSIFICERAS I 4 GENOTYPER ENLIGT T4-SEKVENSEN AV RNA2: SJNNV, TPNNV, BFNNV OCH RGNNV. UNDER DE SENASTE ÅREN HAR DOCK ISOLERINGEN AV NATURLIGA REKOMBINANTER RG/SJ (RNA1 TYP RGNNV OCH RNA2 SJNNV) DOKUMENTERATS I SÖDRA EUROPA. ALLA ISOLERADE REKOMBINANTER AV SULA OCH GULD SOM ODLAS PÅ DEN IBERISKA HALVÖN HAR ETT CAPSIDE-PROTEIN MED 3 OLIKA AMINOSYRAPOSITIONER JÄMFÖRT MED SJNNV, VARAV TVÅ I SLUTET AV C-TERMINALEN, REGION SOM BESTÄMMER VÄRDSPECIFICITETEN, VILKET HAR VISAT SIG SPELA EN VIKTIG ROLL FÖR VIRULENS, OCH EN I N-TERMINALREGIONEN. DESSUTOM FÖREKOMMER DESSA REKOMBINANTER I POLYMERAS 19 OLIKA AMIOACIDIC-RESTER MED AVSEENDE PÅ POLYMERAS AV RG-TYP OCH I DE ICKE-KODANDE REGIONERNA I BÅDA GENOMSEGMENTEN TOTALT 4 NUKLEOTIDER SOM INTE SAMMANFALLER MED STAMMARNA RG (RNA1) OCH SJ (RNA2). ALLA DESSA FÖRÄNDRINGAR KAN SPELA EN VIKTIG ROLL FÖR VIRULENS OCH REPLIKERINGSFÖRMÅGA. STUDIEN AV VIRULENSDETERMINANTER (YTTERLIGARE RELATERADE, MED POLYMERAS OCH MED ORF B1 OCH B2) ÄR GRUNDLÄGGANDE FÖR ATT FÖRSTÅ OCH KONTROLLERA SJUKDOMEN, ASPEKTER SOM KOMMER ATT BEHANDLAS AV USC:S FORSKARGRUPP. DET ÄR VÄL KÄNT ATT UTVECKLINGEN AV SJUKDOMEN INTE BARA BEROR PÅ PATOGENEN, SOM BESTÄMS AV VIRUS-VÄRDINTERAKTION. IMPLIKATIONEN AV VÄRDEN BYGGER PÅ STIMULERING AV IMMUNSYSTEMET, SOM KOMMER ATT KARAKTERISERAS AV FORSKARGRUPPEN I UMA. VIRIC-INFEKTIONEN INDUCERAR AKTIVERING AV BÅDE DET MEDFÖDDA IMMUNSYSTEMET OCH DET ADAPTIVA IMMUNSYSTEMET. STUDIER PÅ AKTIVERING AV IMMUNSYSTEMET SOM SKA UTFÖRAS INKLUDERAR ATT UTFÖRA EN MASSIV TRANSKRIPTOMISK SEKVENSERING (RNA-SEQ) SOM SVAR PÅ VIRUSINFEKTIONER AV OLIKA VIRULENS MOT SULA. Denna STUDY kommer att generera en VALIOSISIM INFORMATION OM immunogener inblandade i ANTIVIRIC RUTS OF DEFENSA, den tid som kommer att göra det möjligt att utforma OPENARRAYS BASED IN PCR REAL TIME MED TaqMan SOUNDS att användas för att studera, en LEVEL OF GENICAL EXPENDITURE, IMMUNE SYSTEM AV VIRULENCE._x000D_ Uppmärksamhet till denna hypotes är det PRINCIPAL OBJEKTIV AV PRESENT PROJEKT att analysera de FACTORS som är inblandade i Betanodavirusets VIRULENCE i LENGUATED OCH RELATION TILL IMMUNE RESPONSE AV värden. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Málaga
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
AGL2014-54532-C2-1-R
0 references