Application OF GENOMA EDITION (CRISPR-Cas9), Massive Sequencing AND GENERATION OF iPSCs IN THE STUDIO OF POSTLOCUTIVE HEREDITARIAL DEAcuses (Q3141148): Difference between revisions
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Aplicação | Aplicação da EDIÇÃO DE GENOMA (CRISPR-Cas9), sequenciação maciça e geração de iPSCs no estudo de alterações hereditárias pós-locutivas | ||||||||||||||
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Property / summary: (Continues. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Recruiting new families with hereditary hearing loss (HHP). 2) Identification of new genes. 3) Design of a new version of the OTO-NGS-Panel for the detection of mutations (SNPs and CNVs). 4) Pathophysiology of DIAPH1 and new identified deafness genes. 5) Generation of knock-in mice for two KITLG mutations associated with unilateral hearing loss. 6) Therapeutic approaches for hearing loss DFNA50 in knock-in mice generated with miR96 mutations. 7) Generation of iPSC lines in patients with miR96 mutations. Met.:1) Obtaining blood samples, nasal epithelium and fibroblasts with informed consent. 2) Genetic analysis: A) Identification of new HHP genes using WES. Generation of the OTO-NGS-Panel-V2 version using capture system (ITD probes) and bioinformatics analysis using Sophia Genetics software. 3) Functional tests: Implementation of molecular and cell biology techniques (transient transfections, immunohisto- and -cytochemistry,..) 4) knock-in mouse (KITLG): generation using CRISPR-Cas9 technology in collaboration with the group of Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Morphological and auditory internal ear analysis by PEATC and OEAs (collaboration with Prof. Karen Steel). 5. Therapies for hearing loss DFNA50: analysis of RNA-Seq (internal ear and nasal epithelium) in two knock-in mice with the human mutations of miR96. Identification of common pathways and modulable genes (spied software) by drugs. 6) Generation of iPSCs: from fibroblasts in patients with miR96 mutations using non-integrative Sendai virus. (English) / qualifier | |||||||||||||||
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(Continua. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Recrutamento de novas famílias com perda auditiva hereditária (HHP). 2) Identificação de novos genes. 3) Conceção de uma nova versão do OTO-NGS-Panel para a deteção de mutações (SNPs e CNVs). 4) Fisiopatologia do DIAPH1 e novos genes de surdez identificados. 5) Geração de ratos knock-in para duas mutações KITLG associadas à perda auditiva unilateral. 6) Abordagens terapêuticas para a perda auditiva DFNA50 em ratinhos knock-in gerados com mutações miR96. 7) Geração de linhas iPSC em doentes com mutações miR96. Met.:1) Obtenção de amostras de sangue, epitélio nasal e fibroblastos com consentimento informado. 2) Análise genética: A) Identificação de novos genes HHP através do WES. Geração da versão OTO-NGS-Panel-V2 utilizando o sistema de captura (sondas IDT) e análise bioinformática utilizando o software Sophia Genetics. 3) Testes funcionais: Aplicação de técnicas de biologia molecular e celular (transfecções transitórias, imuno-histoquímica e citoquímica, etc.) 4) no rato (KITLG): geração que utiliza a tecnologia CRISPR-Cas9 em colaboração com o grupo do Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Análise morfológica e auditiva da orelha interna pelo PEATC e OEAs (colaboração com a Prof. Karen Steel). 5. Terapias para a perda auditiva DFNA50: análise de RNA-Seq (orelha interna e epitélio nasal) em dois ratos knock-in com as mutações humanas de miR96. Identificação de vias comuns e genes moduláveis (software espiado) por fármacos. 6) Geração de iPSCs: a partir de fibroblastos em doentes com mutações miR96 utilizando o vírus Sendai não integrado. (Portuguese) | |||||||||||||||
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Project Q3141148 in Spain
Language | Label | Description | Also known as |
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English | Application OF GENOMA EDITION (CRISPR-Cas9), Massive Sequencing AND GENERATION OF iPSCs IN THE STUDIO OF POSTLOCUTIVE HEREDITARIAL DEAcuses |
Project Q3141148 in Spain |
Statements
90,250.88 Euro
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165,750.0 Euro
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54.45 percent
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1 January 2018
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31 March 2021
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FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL RAMON Y CAJAL
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(Continua. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Reclutar nuevas familias con hipoacusia hereditaria postlocutiva (HHP). 2) Identificación de nuevos genes. 3) Diseño de una nueva versión del OTO-NGS-Panel para la detección de mutaciones (SNPs y CNVs). 4) Patofisiología de DIAPH1 y de los nuevos genes de sordera identificados. 5) Generación de ratones knock-in para dos mutaciones en KITLG asociadas a hipoacusia unilateral. 6) Abordajes terapéuticos para la hipoacusia DFNA50 en ratones knock-in generados con mutaciones en miR96. 7) Generación de lineas iPSC en pacientes con mutaciones en miR96. Met.:1) Obtención de muestras de sangre, epitelio nasal y fibroblastos previo consentimiento informado. 2) Análisis genético: A) Identificación de nuevos genes de HHP mediante WES. B) Generación de la versión OTO-NGS-Panel-V2 mediante sistema de captura (sondas IDT) y análisis bioinformático con software de Sophia Genetics. 3) Pruebas funcionales: Implementación de técnicas de biología molecular y celular (transfecciones transitorias, inmunohisto- y -citoquímica,..) 4) Ratones knock-in (KITLG): generación mediante tecnología CRISPR-Cas9 en colaboración con el grupo del Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Análisis del oído interno morfológico y auditivo por PEATC y OEAs (colaboración con Prof. Karen Steel). 5) Terapias para la hipoacusia DFNA50: análisis de RNA-Seq (oido interno y en epitelio nasal) en dos ratones knock-in con las mutaciones humanas de miR96. Identificación pathways comunes y genes modulables (SPIED software) por fármacos. 6) Generación de iPSCs: a partir de fibroblastos de pacientes con mutaciones en miR96 mediante virus Sendai no integrativos. (Spanish)
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(Continues. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Recruiting new families with hereditary hearing loss (HHP). 2) Identification of new genes. 3) Design of a new version of the OTO-NGS-Panel for the detection of mutations (SNPs and CNVs). 4) Pathophysiology of DIAPH1 and new identified deafness genes. 5) Generation of knock-in mice for two KITLG mutations associated with unilateral hearing loss. 6) Therapeutic approaches for hearing loss DFNA50 in knock-in mice generated with miR96 mutations. 7) Generation of iPSC lines in patients with miR96 mutations. Met.:1) Obtaining blood samples, nasal epithelium and fibroblasts with informed consent. 2) Genetic analysis: A) Identification of new HHP genes using WES. Generation of the OTO-NGS-Panel-V2 version using capture system (ITD probes) and bioinformatics analysis using Sophia Genetics software. 3) Functional tests: Implementation of molecular and cell biology techniques (transient transfections, immunohisto- and -cytochemistry,..) 4) knock-in mouse (KITLG): generation using CRISPR-Cas9 technology in collaboration with the group of Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Morphological and auditory internal ear analysis by PEATC and OEAs (collaboration with Prof. Karen Steel). 5. Therapies for hearing loss DFNA50: analysis of RNA-Seq (internal ear and nasal epithelium) in two knock-in mice with the human mutations of miR96. Identification of common pathways and modulable genes (spied software) by drugs. 6) Generation of iPSCs: from fibroblasts in patients with miR96 mutations using non-integrative Sendai virus. (English)
12 October 2021
0.3053443072145553
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(Continue. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Recrutement de nouvelles familles ayant une déficience auditive héréditaire (HHP). 2) Identification de nouveaux gènes. 3) Conception d’une nouvelle version de l’OTO-NGS-Panel pour la détection des mutations (SNP et CNV). 4) Pathophysiologie du DIAPH1 et de nouveaux gènes de surdité identifiés. 5) Génération de souris KITLG pour deux mutations KITLG associées à une perte auditive unilatérale. 6) Approches thérapeutiques pour la perte auditive DFNA50 chez les souris en contact avec des mutations miR96. 7) Génération de lignées iPSC chez les patients atteints de mutations miR96. Met.: 1) Obtention d’échantillons de sang, d’épithélium nasal et de fibroblastes avec le consentement éclairé. 2) Analyse génétique: A) Identification de nouveaux gènes HHP à l’aide de WES. Génération de la version OTO-NGS-Panel-V2 à l’aide du système de capture (Sondes ITD) et de l’analyse bioinformatique à l’aide du logiciel Sophia Genetics. 3) Essais fonctionnels: Mise en œuvre de techniques de biologie moléculaire et cellulaire (transfections transitoires, immunohisto- et -cytochimie,...) 4) souris à cogner (KITLG): génération utilisant la technologie CRISPR-Cas9 en collaboration avec le groupe de Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Analyse morphologique et auditive de l’oreille interne par PEATC et OEAS (collaboration avec le professeur Karen Steel). 5. Thérapies pour la perte auditive DFNA50: analyse de l’ARN-Seq (oreille interne et épithélium nasal) chez deux souris avec les mutations humaines de miR96. Identification des voies communes et des gènes modulables (logiciel occupé) par les médicaments. 6) Génération d’IPSC: à partir de fibroblastes chez les patients atteints de mutations miR96 utilisant le virus Sendai non-intégratif. (French)
2 December 2021
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(Weiterhin. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Neue Familien mit erblichem Hörverlust (HHP) einstellen. 2) Identifizierung neuer Gene. 3) Entwurf einer neuen Version des OTO-NGS-Panels zur Erkennung von Mutationen (SNPs und CNV). 4) Pathophysiologie von DIAPH1 und neuen identifizierten Taubheitsgenen. 5) Generierung von Knock-in-Mäusen für zwei KITLG-Mutationen im Zusammenhang mit einseitigem Hörverlust. 6) Therapeutische Ansätze für Hörverlust DFNA50 in Knock-in-Mäusen, die mit miR96-Mutationen erzeugt werden. 7) Generierung von iPSC-Linien bei Patienten mit miR96 Mutationen. Met.:1) Die Aufnahme von Blutproben, Nasenepithel und Fibroblasten mit Einwilligung nach Aufklärung. 2) Genetische Analyse: A) Identifizierung neuer HHP-Gene unter Verwendung von WES. Generierung der OTO-NGS-Panel-V2-Version mittels Erfassungssystem (ITD-Sonden) und Bioinformatik-Analyse mit Sophia Genetics Software. 3) Funktionstests: Implementierung von molekularen und zellbiologischen Techniken (transiente Transfektionen, Immunohisto- und -zytochemie,..) 4) Klopfmaus (KITLG): Generierung mit CRISPR-Cas9-Technologie in Zusammenarbeit mit der Gruppe von Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Morphologische und auditive interne Ohranalyse durch PEATC und OEAS (Zusammenarbeit mit Prof. Karen Steel). 5. Therapien für Hörverlust DFNA50: Analyse von RNA-Seq (Innenohr und Nasenepithel) in zwei Knock-in-Mäusen mit den menschlichen Mutationen von miR96. Identifizierung gemeinsamer Pfade und modulierbarer Gene (spied software) durch Medikamente. 6) Erzeugung von iPSCs: von Fibroblasten bei Patienten mit miR96 Mutationen mit nicht-integrativem Sendai-Virus. (German)
9 December 2021
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(Vervolgt. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Aanwerving van nieuwe gezinnen met erfelijk gehoorverlies (HHP). 2) Identificatie van nieuwe genen. 3) Ontwerp van een nieuwe versie van het OTO-NGS-Panel voor de detectie van mutaties (SNP’s en CNV’s). 4) Pathofysiologie van DIAPH1 en nieuwe geïdentificeerde doofheidgenen. 5) Generatie van knock-in muizen voor twee KITLG-mutaties geassocieerd met eenzijdig gehoorverlies. 6) Therapeutische benaderingen voor gehoorverlies DFNA50 in knock-in muizen gegenereerd met miR96 mutaties. 7) Generatie van iPSC-lijnen bij patiënten met miR96-mutaties. Met.:1) met geïnformeerde toestemming bloedmonsters, nasale epitheel en fibroblasten te verkrijgen. 2) Genetische analyse: A) Identificatie van nieuwe HHP-genen die WES gebruiken. Generatie van de OTO-NGS-Panel-V2 versie met behulp van capture systeem (ITD probes) en bio-informatica analyse met behulp van Sophia Genetics software. 3) Functionele tests: Implementatie van moleculaire en celbiologietechnieken (transiënte transfecties, immunohisto- en -cytochemie,..) 4) knock-in muis (KITLG): generatie met behulp van CRISPR-Cas9 technologie in samenwerking met de groep Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Morfologische en auditieve interne ooranalyse door PEATC en OEAS (samenwerking met Prof. Karen Steel). 5. Therapies voor gehoorverlies DFNA50: analyse van RNA-Seq (intern oor en neus epitheel) in twee knock-in muizen met de menselijke mutaties van miR96. Identificatie van gemeenschappelijke wegen en moduleerbare genen (gespied software) door drugs. 6) Generatie van iPSC’s: van fibroblasten bij patiënten met miR96-mutaties met niet-integratief Sendai-virus. (Dutch)
17 December 2021
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(Continua. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Assunzione di nuove famiglie con perdita dell'udito ereditaria (HHP). 2) Identificazione di nuovi geni. 3) Progettazione di una nuova versione del pannello OTO-NGS per la rilevazione delle mutazioni (SNP e CNV). 4) Pathofisiologia di DIAPH1 e nuovi geni di sordità identificati. 5) Generazione di topi knock-in per due mutazioni KITLG associate alla perdita dell'udito unilaterale. 6) Approcci terapeutici per la perdita dell'udito DFNA50 in topi knock-in generati con mutazioni miR96. 7) Generazione di linee iPSC in pazienti con mutazioni miR96. Met.:1) Ottenere campioni di sangue, epitelio nasale e fibroblasti con il consenso informato. 2) Analisi genetica: A) Identificazione di nuovi geni HHP utilizzando WES. Generazione della versione OTO-NGS-Panel-V2 utilizzando il sistema di acquisizione (ITD sonde) e l'analisi bioinformatica utilizzando il software Sophia Genetics. 3) Prove funzionali: Implementazione di tecniche di biologia molecolare e cellulare (transizioni transienti, immunoistochimica e -citochimica,..) 4) topo knock-in (KITLG): generazione con tecnologia CRISPR-Cas9 in collaborazione con il gruppo del Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Analisi morfologica e uditiva interna dell'orecchio da parte di PEATC e OEAS (collaborazione con la Prof.ssa Karen Steel). 5. Terapie per la perdita dell'udito DFNA50: analisi di RNA-Seq (orecchio interno e epitelio nasale) in due topi knock-in con le mutazioni umane del miR96. Identificazione di percorsi comuni e geni modulabili (software spiato) tramite farmaci. 6) Generazione di iPSC: da fibroblasti in pazienti con mutazioni miR96 che utilizzano virus Sendai non integrati. (Italian)
16 January 2022
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(Συνέχεια. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Πρόσληψη νέων οικογενειών με κληρονομική απώλεια ακοής (HHP). 2) Ταυτοποίηση νέων γονιδίων. 3) Σχεδιασμός νέας έκδοσης της OTO-NGS-Panel για την ανίχνευση μεταλλάξεων (SNPs και CNVs). 4) Παθοφυσιολογία του DIAPH1 και των νέων αναγνωρισμένων γονιδίων κώφωσης. 5) Δημιουργία μυϊκών ποντικιών για δύο μεταλλάξεις KITLG που σχετίζονται με μονομερή απώλεια ακοής. 6) Θεραπευτικές προσεγγίσεις για την απώλεια ακοής DFNA50 σε ποντίκια που δημιουργούνται με μεταλλάξεις miR96. 7) Δημιουργία γραμμών iPSC σε ασθενείς με μεταλλάξεις miR96. Met.:1) Λαμβάνοντας δείγματα αίματος, ρινικό επιθήλιο και ινοβλάστες με εν επιγνώσει συναίνεση. 2) Γενετική ανάλυση: Α) Ταυτοποίηση νέων γονιδίων HHP με χρήση WES. Δημιουργία της έκδοσης OTO-NGS-Panel-V2 χρησιμοποιώντας σύστημα σύλληψης (ITD ανιχνευτές) και ανάλυση βιοπληροφορικής με τη χρήση λογισμικού Sophia Genetics. 3) Λειτουργικές δοκιμές: Εφαρμογή τεχνικών μοριακής και κυτταρικής βιολογίας (παροδικές transfections, immunohisto- and -cytochemistry,..) 4) knock-in mouse (KITLG): παραγωγή με χρήση της τεχνολογίας CRISPR-Cas9 σε συνεργασία με την ομάδα του Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Μορφολογική και ακουστική ανάλυση εσωτερικών αυτιών από το PEATC και τον OEAS (συνεργασία με τον καθηγητή Karen Steel). 5. Θεραπείες για απώλεια ακοής DFNA50: ανάλυση του RNA-Seq (εσωτερικό αυτί και ρινικό επιθήλιο) σε δύο μυϊκά ποντίκια με τις ανθρώπινες μεταλλάξεις του miR96. Ταυτοποίηση κοινών οδών και τροποποιήσιμων γονιδίων (λογισμικό κατασκοπείας) από φάρμακα. 6) Δημιουργία iPSC: από ινοβλάστες σε ασθενείς με μεταλλάξεις miR96 που χρησιμοποιούν μη ολοκληρωμένο ιό Sendai. (Greek)
17 August 2022
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(Fortsat. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Ansættelse af nye familier med arveligt høretab (HHP). 2) Identifikation af nye gener. 3) Design af en ny version af OTO-NGS-Panel til påvisning af mutationer (SNP'er og CNV'er). 4) Pathofysiologi af DIAPH1 og nye identificerede døvhed gener. 5) Generation af knock-in mus til to KITLG mutationer forbundet med ensidigt høretab. 6) Terapeutiske tilgange til høretab DFNA50 i knock-in mus genereret med miR96 mutationer. 7) Generation af iPSC-linjer hos patienter med miR96 mutationer. Met.:1) Indhentning af blodprøver, næseepitel og fibroblaster med informeret samtykke. 2) Genetisk analyse: A) Identifikation af nye HHP gener ved hjælp af WES. Generering af OTO-NGS-Panel-V2-versionen ved hjælp af capture system (ITD-sonder) og bioinformatik analyse ved hjælp af Sophia Genetics software. 3) Funktionelle test: Gennemførelse af molekylære og cellebiologiske teknikker (transiente transfektioner, immunhisto- og -cytokemi,..) 4) knock-in mus (KITLG): produktion ved hjælp af CRISPR-Cas9-teknologi i samarbejde med Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Morfologisk og auditiv intern øreanalyse foretaget af PEATC og OEAS (samarbejde med prof. Karen Steel). 5. Behandlinger til høretab DFNA50: analyse af RNA-Seq (internt øre- og næseepitel) hos to knock-in mus med human mutationer af miR96. Identifikation af almindelige veje og modulerbare gener (spied software) ved hjælp af lægemidler. 6) Generation af iPSC'er: fra fibroblaster hos patienter med miR96-mutationer med ikke-integreret Sendai-virus. (Danish)
17 August 2022
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(Jatkuu. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Uudet perheet, joilla on perinnöllinen kuulon heikkeneminen (HHP). 2) uusien geenien tunnistaminen. 3) Suunniteltu uusi versio OTO-NGS-paneelista mutaatioiden (SNPs ja CNV) havaitsemiseksi. 4) DIAPH1-patofysiologia ja uudet tunnistetut kuurogeenit. 5) KITLG-mutaatioiden syntyminen yksipuoliseen kuulon heikkenemiseen liittyville hiirille. 6) Terapeuttiset lähestymistavat kuulon heikkenemiseen DFNA50-hiirillä, jotka syntyvät miR96-mutaatioilla. 7) iPSC-linjojen muodostuminen potilailla, joilla on miR96-mutaatioita. Met.:1) Verinäytteiden, nenäepiteelin ja fibroblastien hankkiminen tietoisella suostumuksella. 2) Geneettinen analyysi: A) uusien HHP-geenien tunnistaminen WES:llä. OTO-NGS-Panel-V2-version luominen käyttäen kaappausjärjestelmää (ITD-anturit) ja bioinformatiikka-analyysiä Sophia Genetics -ohjelmiston avulla. 3) Toiminnalliset testit: Molekyyli- ja solubiologian tekniikoiden (transient transfections, immunohisto- ja -sytokemia,..) 4) koputus hiiri (KITLG): CRISPR-Cas9-teknologiaa hyödyntävä tuotanto yhteistyössä Lluis Montoliun (CNB-CIBERER) ryhmän kanssa. PEATC:n ja OEAS:n morfologinen ja kuuloinen sisäinen korvaanalyysi (yhteistyö professori Karen Steelin kanssa). 5. Terapiat kuulon heikkenemiseen DFNA50: RNA-Seq:n (sisäkorvan ja nenän epiteelin) analyysi kahdessa hiiressä, joilla on miR96:n ihmisen mutaatiot. Yleisten reittien ja moduloitujen geenien (spied software) tunnistaminen lääkkeillä. 6) iPSC:n luominen: fibroblasteista potilailla, joilla on miR96-mutaatioita, jotka käyttävät ei-integratiivista Sendai-virusta. (Finnish)
17 August 2022
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(Kontinwazzjonijiet. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Ir-reklutaġġ ta’ familji ġodda b’telf ta’ smigħ ereditarju (HHP). 2) Identifikazzjoni ta ‘ġeni ġodda. 3) Disinn ta’ verżjoni ġdida tal-Panel OTO-NGS għall-identifikazzjoni ta’ mutazzjonijiet (SNPs u CNVs). 4) Patofiżjoloġija ta ‘DIAPH1 u ġeni ta’ truxija identifikati ġodda. 5) Ġenerazzjoni ta ‘ġrieden knock-in għal żewġ mutazzjonijiet KITLG assoċjati ma’ telf ta ‘smigħ unilaterali. 6) Approċċi terapewtiċi għal telf ta ‘smigħ DFNA50 fi ġrieden knock-in iġġenerati b’mutazzjonijiet miR96. 7) Ġenerazzjoni ta ' linji iPSC f’ pazjenti b’ mutazzjonijiet miR96. Met.:1) Il-kisba ta’ kampjuni tad-demm, epitelju nażali u fibroblasti b’kunsens infurmat. 2) Analiżi ġenetika: A) Identifikazzjoni ta’ ġeni HHP ġodda bl-użu ta’ WES. Ġenerazzjoni tal-verżjoni OTO-NGS-Panel-V2 bl-użu ta’ sistema ta’ qbid (sondi ITD) u analiżi bijoinformatika bl-użu ta’ softwer Sophia Genetics. 3) Testijiet funzjonali: L-implimentazzjoni ta’ tekniki ta’ bijoloġija molekulari u taċ-ċelloli (trasfezzjonijiet tranżitorji, immunoistokimika u ċitokimika,.) 4) knock-in mouse (KITLG): ġenerazzjoni li tuża t-teknoloġija CRISPR-Cas9 f’kollaborazzjoni mal-grupp ta’ Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Analiżi talwidna interna morfoloġika u awditorja minn PEATC u OEAS (kollaborazzjoni mal-Prof. Karen Steel). 5. Terapiji għal telf ta ‘smigħ DFNA50: analiżi ta’ RNA-Seq (widna interna u epitelju nażali) f’żewġ ġrieden knock-in bil-mutazzjonijiet umani ta’ miR96. L-identifikazzjoni ta’ passaġġi komuni u ġeni modulabbli (softwer imtella’) mid-drogi. 6) Ġenerazzjoni ta’ iPSCs: minn fibroblasts f’pazjenti b’mutazzjonijiet miR96 bl-użu tal-virus ta’ Sendai mhux integrattiv. (Maltese)
17 August 2022
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(Turpinājums. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) pieņemt darbā jaunas ģimenes ar iedzimtu dzirdes zudumu (HHP). 2) Jaunu gēnu identifikācija. 3) OTO-NGS-paneļa jaunās versijas izstrāde mutāciju (SNP un CNV) noteikšanai. 4) DIAPH1 patofizioloģija un jauni identificēti kurluma gēni. 5) KITLG divu KITLG mutāciju radīšana, kas saistītas ar vienpusēju dzirdes zudumu. 6) Terapeitiskās pieejas dzirdes zudumam DFNA50 pieklauvē pelēm, kas rodas ar miR96 mutācijām. 7) IPSC līniju veidošanās pacientiem ar miR96 mutācijām. Met.:1) Asins paraugu, deguna epitēlija un fibroblastu iegūšana ar informētu piekrišanu. 2) Ģenētiskā analīze: A) jaunu HHP gēnu identifikācija, izmantojot WES. OTO-NGS-Panel-V2 versijas ģenerēšana, izmantojot uztveršanas sistēmu (ITD zondes) un bioinformātikas analīzi, izmantojot programmatūru Sophia Genetics. 3) Funkcionālie testi: Molekulāro un šūnu bioloģijas metožu ieviešana (pārejošas transfekcijas, imūnhisto- un -cytoķīmija,..) 4) ievadāmās peles (KITLG): paaudze, izmantojot CRISPR-Cas9 tehnoloģiju sadarbībā ar Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER) grupu. Morfoloģiskā un dzirdes iekšējā ausu analīze, ko veic PEATC un OEAS (sadarbība ar prof. Karen Steel). 5. Dzirdes zuduma terapija DFNA50: RNS-Seq (iekšējās auss un deguna epitēlija) analīze divās knock-in pelēm ar miR96 cilvēka mutācijām. Kopīgu ceļu un pielāgojamu gēnu (spied programmatūra) noteikšana ar narkotikām. 6) IPSC ģenerēšana: no fibroblastiem pacientiem ar miR96 mutācijām, izmantojot neintegratīvu Sendai vīrusu. (Latvian)
17 August 2022
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(Pokračuje. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Prijímanie nových rodín s dedičnou poruchou sluchu (HHP). 2) Identifikácia nových génov. 3) Návrh novej verzie OTO-NGS-Panel pre detekciu mutácií (SNP a CNV). 4) Patofyziológia DIAPH1 a nové identifikované gény hluchoty. 5) Generácia knock-in myší pre dve mutácie KITLG spojené s jednostrannou stratou sluchu. 6) Terapeutické prístupy k strate sluchu DFNA50 u knock-in myší generovaných mutáciami miR96. 7) Generácia iPSC línií u pacientov s mutáciami miR96. Met.:1) Získanie vzoriek krvi, nosového epitelu a fibroblastov s informovaným súhlasom. 2) Genetická analýza: A) Identifikácia nových génov HHP pomocou WES. Generovanie verzie OTO-NGS-Panel-V2 pomocou snímacieho systému (ITD sondy) a bioinformatickej analýzy pomocou softvéru Sophia Genetics. 3) Funkčné testy: Implementácia molekulárnych a bunkových biologických techník (prechodné prechody, imunohisto- a -cytochémia,..) 4) knock-in myš (KITLG): generácia využívajúca technológiu CRISPR-Cas9 v spolupráci so skupinou Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Morfologická a sluchová interná ušná analýza PEATC a OEAS (spolupráca s prof. Karen Steel). 5. Liečba straty sluchu DFNA50: analýza RNA-Seq (vnútorného ucha a nosového epitelu) u dvoch myší s ľudskými mutáciami miR96. Identifikácia spoločných ciest a modulovateľných génov (spied software) podľa liekov. 6) Vytváranie iPSC: z fibroblastov u pacientov s mutáciami miR96 s použitím neintegračného vírusu Sendai. (Slovak)
17 August 2022
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2 Jur: Réamhaithrisím (fíorais). CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Teaghlaigh nua a bhfuil caillteanas éisteachta oidhreachtúil (HHP) acu a earcú. 2) Aithint géinte nua. 3) Leagan nua den OTO-NGS-Painéal a dhearadh chun sócháin (SNPanna agus CNVanna) a bhrath. 4) Pathophysiology DIAPH1 agus géinte bodhaire aitheanta nua. 5) Giniúint lucha cnag ar feadh dhá shócháin KITLG a bhaineann le caillteanas éisteachta aontaobhach. 6) Cur chuige teiripeach le haghaidh caillteanas éisteachta DFNA50 i lucha cnagtha a ghintear le sócháin miR96. 7) Giniúint línte iPSC in othair a bhfuil sócháin miR96 acu. Met.:1) Samplaí fola, epithelium nasal agus fibroblasts a fháil le toiliú feasach. 2) Anailís ghéiniteach: A) Aithint géinte HHP nua ag baint úsáide as WES. Giniúint leagan OTO-NGS-Panel-V2 ag baint úsáide as an gcóras gabhála (probes ITD) agus anailís bhithfhaisnéisíochta ag baint úsáide as bogearraí Sophia Genetics. 3) Tástálacha Feidhme: Cur chun feidhme teicnící bitheolaíochta móilíneacha agus cille (trasfhabhtuithe neamhbhuan, immunohisto- agus -cytochemistry,..) 4) luch cnag (KITLG): giniúint ag baint úsáide as teicneolaíocht CRISPR-Cas9 i gcomhar leis an ngrúpa Dr Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Anailís inmheánach moirfeolaíoch agus éisteachta ag PEATC agus OEAS (comhoibriú leis an Ollamh Karen Steel). 5. Teiripí le haghaidh caillteanas éisteachta DFNA50: anailís ar RNA-Seq (cluas inmheánach agus epithelium nasal) in dhá lucha cnag le sócháin dhaonna miR96. Bealaí coitianta agus géinte modúlacha (bogearraí píopaithe) a shainaithint ag drugaí. 6) Glúin de iPSCanna: ó fibroblasts in othair le sócháin miR96 ag baint úsáide as víreas Sendai neamh-chomhtháite. (Irish)
17 August 2022
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(Pokračuje. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Přijímání nových rodin s dědičnou ztrátou sluchu (HHP). 2) Identifikace nových genů. 3) Návrh nové verze OTO-NGS-Panelu pro detekci mutací (SNP a CNV). 4) Patofyziologie DIAPH1 a nové identifikované geny hluchoty. 5) Generace myší pro dvě mutace KITLG spojené s jednostrannou ztrátou sluchu. 6) Terapeutické přístupy ke ztrátě sluchu DFNA50 u myší generovaných mutacemi miR96. 7) Generace iPSC linií u pacientů s mutacemi miR96. Met.:1) Získání krevních vzorků, nosního epitelu a fibroblastů s informovaným souhlasem. 2) Genetická analýza: A) Identifikace nových genů HHP pomocí WES. Generování verze OTO-NGS-Panel-V2 pomocí zachycovacího systému (ITD sond) a bioinformatické analýzy pomocí softwaru Sophia Genetics. 3) Funkční zkoušky: Implementace molekulární a buněčné biologické techniky (přechodné transfekce, imunohisto- a -cytochemie,..) 4) knock-in myší (KITLG): generace využívající technologii CRISPR-Cas9 ve spolupráci se skupinou Dr. Lluise Montoliu (CNB-CIBERER). Morfologická a sluchová interní analýza ucha PEATC a OEAS (spolupráce s prof. Karen Steel). 5. Terapie pro ztrátu sluchu DFNA50: analýza RNA-Seq (vnitřní ucho a nosní epitel) u dvou myší s lidskými mutacemi miR96. Identifikace běžných cest a modulovatelných genů (spied software) pomocí léků. 6) generování iPSC: z fibroblastů u pacientů s mutacemi miR96 používajících neintegrativní virus Sendai. (Czech)
17 August 2022
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(Continua. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Recrutamento de novas famílias com perda auditiva hereditária (HHP). 2) Identificação de novos genes. 3) Conceção de uma nova versão do OTO-NGS-Panel para a deteção de mutações (SNPs e CNVs). 4) Fisiopatologia do DIAPH1 e novos genes de surdez identificados. 5) Geração de ratos knock-in para duas mutações KITLG associadas à perda auditiva unilateral. 6) Abordagens terapêuticas para a perda auditiva DFNA50 em ratinhos knock-in gerados com mutações miR96. 7) Geração de linhas iPSC em doentes com mutações miR96. Met.:1) Obtenção de amostras de sangue, epitélio nasal e fibroblastos com consentimento informado. 2) Análise genética: A) Identificação de novos genes HHP através do WES. Geração da versão OTO-NGS-Panel-V2 utilizando o sistema de captura (sondas IDT) e análise bioinformática utilizando o software Sophia Genetics. 3) Testes funcionais: Aplicação de técnicas de biologia molecular e celular (transfecções transitórias, imuno-histoquímica e citoquímica, etc.) 4) no rato (KITLG): geração que utiliza a tecnologia CRISPR-Cas9 em colaboração com o grupo do Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Análise morfológica e auditiva da orelha interna pelo PEATC e OEAs (colaboração com a Prof. Karen Steel). 5. Terapias para a perda auditiva DFNA50: análise de RNA-Seq (orelha interna e epitélio nasal) em dois ratos knock-in com as mutações humanas de miR96. Identificação de vias comuns e genes moduláveis (software espiado) por fármacos. 6) Geração de iPSCs: a partir de fibroblastos em doentes com mutações miR96 utilizando o vírus Sendai não integrado. (Portuguese)
17 August 2022
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(Jätkub. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Uute perede värbamine päriliku kuulmislangusega (HHP). 2) Uute geenide identifitseerimine. 3) OTO-NGS-Paneli uue versiooni kujundamine mutatsioonide (SNP ja CNV) avastamiseks. 4) DIAPH1 patofüsioloogia ja uued tuvastatud kurtusgeenid. 5) Pööratud hiirte genereerimine kahele KITLG mutatsioonile, mis on seotud ühepoolse kuulmislangusega. 6) terapeutiline lähenemine kuulmiskaole DFNA50 miR96 mutatsioonidega loodud hiirtel. 7) IPSC-liinide genereerimine miR96 mutatsioonidega patsientidel. Met.:1) vereproovide, ninaepiteeli ja fibroblastide võtmine teadlikul nõusolekul. 2) Geneetiline analüüs: A) uute HHP geenide kindlakstegemine WESi abil. OTO-NGS-Panel-V2 versiooni loomine, kasutades kogumissüsteemi (ITD sondid) ja bioinformaatika analüüsi Sophia Genetics tarkvara abil. 3) Funktsionaalsed testid: Molekulaar- ja rakubioloogia tehnikate rakendamine (ajutised transfektsioonid, immunohisto- ja -tsütokeemia,..) 4) koputanud hiir (KITLG): CRISPR-Cas9 tehnoloogiat kasutav põlvkond koostöös Dr. Lluis Montoliu rühmaga (CNB-CIBERER). Morfoloogiline ja kuuldav sisekõrva analüüs PEATCi ja OEASi poolt (koostöö prof Karen Steeliga). 5. Kuulmislanguse ravi DFNA50: RNA-Seqi (sisekõrva ja nina epiteeli) analüüs kahel miR96 inimese mutatsiooniga hiirel. Üldlevinud radade ja moduleeritavate geenide (spied software) kindlakstegemine ravimite abil. 6) IPSCde loomine: fibroblastidelt miR96 mutatsioonidega patsientidel, kes kasutavad mitteintegratiivset Sendai viirust. (Estonian)
17 August 2022
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(Továbbra is.) CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Új családok felvétele örökletes halláskárosodással (HHP). 2) Új gének azonosítása. 3) Az OTO-NGS-panel új verziójának kialakítása a mutációk (SNP-k és CNV-k) kimutatására. 4) A DIAPH1 és az új azonosított süketség gének patofiziológiája. 5) A beütő egerek generációja két KITLG mutációhoz, amely egyoldalú halláskárosodással jár. 6) Terápiás megközelítések halláskárosodásra DFNA50 a miR96 mutációkkal generált kopogó egerekben. 7) iPSC vonalak generációja a miR96 mutációban szenvedő betegeknél. Met.:1) Vérminták, orrhámok és fibroblasztok gyűjtése tájékoztatáson alapuló beleegyezéssel. 2) Genetikai elemzés: A) Az új HHP gének azonosítása WES használatával. Az OTO-NGS-Panel-V2 verzió generálása rögzítési rendszerrel (ITD szondákkal) és bioinformatikai elemzéssel Sophia Genetics szoftver segítségével. 3) Funkcionális vizsgálatok: Molekuláris és sejtbiológiai technikák alkalmazása (tranziens transzfektiók, immunhiszto- és citokémia,..) 4) kopogtató egér (KITLG): CRISPR-Cas9 technológiát alkalmazó generáció Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER) csoportjával együttműködve. A PEATC és az OEAS morfológiai és halló belső fülelemzése (együttműködés Karen Steel professzorral). 5. Halláskárosodás terápiái DFNA50: az RNS-Seq (belső fül és orrhám) elemzése két, miR96 humán mutációval rendelkező bekopogtató egerben. A közös útvonalak és a modulálható gének (spied software) meghatározása kábítószerekkel. 6) iPSC-k létrehozása: miR96 mutációban szenvedő, nem integratív Sendai vírust alkalmazó betegek fibroblasztjaiból. (Hungarian)
17 August 2022
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(Продължава. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Набиране на нови семейства с наследствена загуба на слуха (HHP). 2) Идентифициране на нови гени. 3) Проектиране на нова версия на OTO-NGS-Panel за откриване на мутации (SNP и CNVs). 4) Патофизиология на DIAPH1 и нови идентифицирани гени за глухота. 5) Генериране на удари мишки за две KITLG мутации, свързани с едностранна загуба на слуха. 6) Терапевтични подходи за загуба на слуха DFNA50 при почукване мишки, генерирани с miR96 мутации. 7) Генериране на iPSC линии при пациенти с miR96 мутации. Met.:1) Получаване на кръвни проби, назален епител и фибробласти с информирано съгласие. 2) Генетичен анализ: А) Идентифициране на нови HHP гени с помощта на WES. Генериране на версията OTO-NGS-Panel-V2 с използване на система за улавяне (ITD сонди) и биоинформатичен анализ с помощта на софтуер Sophia Genetics. 3) Функционални тестове: Прилагане на техники за молекулярна и клетъчна биология (преходни трансфекции, имунохистохимия и цитохимия,..) 4) мишка с взлом (KITLG): производство, използващо технологията CRISPR-Cas9 в сътрудничество с групата на д-р Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Морфологичен и слухов анализ на вътрешните уши от PEATC и OEAS (сътрудничество с проф. Карън Стийл). 5. Терапии за загуба на слуха DFNA50: анализ на РНК-Seq (вътрешно ухо и назален епител) при две почукани мишки с човешки мутации на miR96. Идентифициране на често срещани пътища и модулируеми гени (шпионски софтуер) по лекарства. 6) Генериране на iPSCs: от фибробласти при пациенти с miR96 мутации, използващи неинтегративен Sendai вирус. (Bulgarian)
17 August 2022
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(Tęsinys. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Įdarbinant naujas šeimas su paveldimu klausos praradimu (HHP). 2) Naujų genų identifikavimas. 3) naujos OTO-NGS grupės versijos kūrimas mutacijoms (SNP ir CNV) aptikti. 4) DIAPH1 patofiziologija ir nauji nustatyti kurtumo genai. 5) Pelių generavimas dviem KITLG mutacijoms, susijusioms su vienašaliu klausos praradimu. 6) Terapinis požiūris į klausos praradimą DFNA50 pelėms, sukurtoms su miR96 mutacijomis. 7) IPSC linijų generavimas pacientams su miR96 mutacijomis. Met.:1) Gavimas kraujo mėginių, nosies epitelio ir fibroblastų gavus informuoto sutikimo. 2) Genetinė analizė: A) Naujų HHP genų identifikavimas naudojant WES. OTO-NGS-Panel-V2 versijos generavimas naudojant fiksavimo sistemą (ITD zondus) ir bioinformatikos analizę naudojant Sophia Genetics programinę įrangą. 3) funkciniai bandymai: Molekulinės ir ląstelių biologijos metodų (laikinųjų transfekcijų, imunohisto- ir citochemijos,..) 4) įkišimo į pelę (KITLG) įgyvendinimas: generavimas naudojant CRISPR-Cas9 technologiją, bendradarbiaujant su Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER) grupe. Morfologinė ir klausos vidinė ausų analizė, atliekama PEATC ir OEAS (bendradarbiavimas su prof. Karen Steel). 5. Klausos praradimo gydymas DFNA50: RNR-Seq (vidinės ausies ir nosies epitelio) analizė dviejose pelėse su žmogaus miR96 mutacijomis. Bendrų kelių ir moduliuojamų genų (spied programinės įrangos) nustatymas pagal narkotikus. 6) IPSC generavimas: iš fibroblastų pacientams su miR96 mutacijomis naudojant neintegracinį Sendajaus virusą. (Lithuanian)
17 August 2022
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(Nastavlja. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Zapošljavanje novih obitelji s nasljednim gubitkom sluha (HHP). 2) Identifikacija novih gena. 3) Dizajn nove verzije OTO-NGS-Panel za otkrivanje mutacija (SNPs i CNVs). 4) Patofiziologija DIAPH1 i novi identificirani geni gluhoće. 5) Generacija knock-in miševa za dvije mutacije KITLG povezane s jednostranim gubitkom sluha. 6) Terapijski pristupi za gubitak sluha DFNA50 u knock-in miševa generiranih miR96 mutacijama. 7) Generacija linija iPSC-a u bolesnika s mutacijama miR96. Met.:1) Pribavljanje uzoraka krvi, nosnog epitela i fibroblasta uz informirani pristanak. 2) Genetska analiza: A) Identifikacija novih HHP gena pomoću WES-a. Generiranje verzije OTO-NGS-Panel-V2 pomoću sustava za snimanje (ITD sonde) i bioinformatičke analize pomoću softvera Sophia Genetics. 3) Funkcionalna ispitivanja: Primjena molekularne i stanične biologije tehnika (prolazne transfekcije, imunohisto- i -citokemija,..) 4) knock-in miša (KITLG): generacija koristi CRISPR-Cas9 tehnologiju u suradnji s grupom Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Morfološka i slušna analiza unutarnjeg uha PEATC-a i OEAS-a (suradnja s prof. Karen Steel). 5. Terapije za gubitak sluha DFNA50: analiza RNK-Seq (unutarnjeg uha i nosnog epitela) u dva knock-in miša s ljudskim mutacijama miR96. Identifikacija uobičajenih putova i modulabilnih gena (spirirani softver) po lijekovima. 6) Generacija iPSC-ova: od fibroblasta u bolesnika s mutacijama miR96 koji koriste neintegrativni Sendai virus. (Croatian)
17 August 2022
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(Fortsätter. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Rekrytering av nya familjer med ärftlig hörselnedsättning (HHP). 2) Identifiering av nya gener. 3) Design av en ny version av OTO-NGS-panelen för detektion av mutationer (SNP och CNV). 4) Pathophysiology of DIAPH1 och nya identifierade dövhetsgener. 5) Generation av knock-in möss för två KITLG-mutationer i samband med unilateral hörselnedsättning. 6) Terapeutiska metoder för hörselnedsättning DFNA50 i knock-in möss genereras med miR96 mutationer. 7) Generation av iPSC linjer hos patienter med miR96 mutationer. Met.:1) Ta blodprover, näsepitel och fibroblaster med informerat samtycke. 2) Genetisk analys: A) Identifiering av nya HHP-gener med hjälp av WES. Generering av OTO-NGS-Panel-V2-versionen med hjälp av infångningssystem (ITD-sonder) och bioinformatikanalys med Sophia Genetics-programvara. 3) Funktionella tester: Implementering av molekylär- och cellbiologitekniker (övergående transfektioner, immunohisto- och -cytokemi,..) 4) knock-in mus (KITLG): generation med CRISPR-Cas9-teknik i samarbete med Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Morfologisk och auditiv intern öronanalys av PEATC och OEAS (samarbete med professor Karen Steel). 5. Behandlingar för hörselnedsättning DFNA50: analys av RNA-Seq (inre örat och nasala epitel) i två knock-in möss med humana mutationer av miR96. Identifiering av gemensamma vägar och modulerbara gener (pied software) av droger. 6) generation av iPSC: från fibroblaster hos patienter med miR96-mutationer som använder icke-integrativ Sendai-virus. (Swedish)
17 August 2022
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(Continuă. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Recrutarea de noi familii cu pierderea auzului ereditar (HHP). 2) Identificarea genelor noi. 3) Proiectarea unei noi versiuni a Panelului OTO-NGS pentru detectarea mutațiilor (SNP-uri și CNV). 4) Pathofiziologia DIAPH1 și noile gene de surditate identificate. 5) Generarea de șoareci knock-in pentru două mutații KITLG asociate cu pierderea unilaterală a auzului. 6) Abordări terapeutice pentru pierderea auzului DFNA50 la șoareci knock-in generate cu mutații miR96. 7) Generarea liniilor iPSC la pacienții cu mutații miR96. Met.:1) Obținerea de probe de sânge, epiteliu nazal și fibroblaste cu consimțământul informat. 2) Analiza genetică: A) Identificarea noilor gene HHP folosind WES. Generarea versiunii OTO-NGS-Panel-V2 folosind sistemul de captare (sonde ITD) și analiza bioinformatică utilizând software-ul Sophia Genetics. 3) Teste funcționale: Implementarea tehnicilor de biologie moleculară și celulară (tranzacții tranzitorii, imunohisto- și -citochimie,..) 4) șoarece (KITLG): generare folosind tehnologia CRISPR-Cas9 în colaborare cu grupul Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Analiza urechii interne morfologice și auditive de către PEATC și OEAS (colaborare cu prof. Karen Steel). 5. Terapii pentru pierderea auzului DFNA50: analiza ARN-Seq (ureche internă și epiteliu nazal) la doi șoareci knock-in cu mutațiile umane ale miR96. Identificarea căilor comune și a genelor modulabile (software-ul stupefiat) de către medicamente. 6) Generarea de IPSC-uri: din fibroblaste la pacienții cu mutații miR96 care utilizează virusul Sendai non-integrativ. (Romanian)
17 August 2022
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(Nadaljevanje. CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Zaposlovanje novih družin z dedno izgubo sluha (HHP). 2) Identifikacija novih genov. 3) Oblikovanje nove različice OTO-NGS-Panel za odkrivanje mutacij (SNP in CNV). 4) Pathofiziologija DIAPH1 in novih opredeljenih genov gluhosti. 5) Vzpostavitev miši, ki so vklopljene, za dve mutaciji KITLG, povezani z enostranskim izgubo sluha. 6) Terapevtski pristopi k izgubi sluha DFNA50 pri miših, ki so nastale z mutacijami miR96. 7) generacija linij iPSC pri bolnikih z mutacijami miR96. Met.:1) Pridobivanje vzorcev krvi, nosnega epitelija in fibroblastov z informiranim soglasjem. 2) Genetična analiza: A) Identifikacija novih genov HHP z uporabo WES. Generiranje različice OTO-NGS-Panel-V2 z uporabo sistema za zajemanje (ITD sonde) in bioinformatike z uporabo programske opreme Sophia Genetics. 3) Funkcionalni preskusi: Izvajanje molekularne in celične biološke tehnike (prehodne transfekcije, imunohisto- in -citokemija,..) 4) vklop miške (KITLG): generacija, ki uporablja tehnologijo CRISPR-Cas9 v sodelovanju s skupino dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Morfološka in slušna notranja analiza ušes, ki jo opravita PEATC in OEAS (sodelovanje s prof. Karen Steel). 5. Terapije za izgubo sluha DFNA50: analiza RNA-Seq (notranji ušesni in nosni epitelij) pri dveh miših, ki trkajo, s človeškimi mutacijami miR96. Opredelitev skupnih poti in modulabilnih genov (splošna programska oprema) po drogah. 6) generacija iPSC: fibroblasti pri bolnikih z mutacijami miR96, ki uporabljajo neintegrativni virus Sendai. (Slovenian)
17 August 2022
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(Ciąg dalszy). CP03/0014, PI08/0045, PI11/1215, PI14/0948) 1) Rekrutacja nowych rodzin z dziedzicznym ubytkiem słuchu (HHP). 2) Identyfikacja nowych genów. 3) Zaprojektowanie nowej wersji OTO-NGS-Panel do wykrywania mutacji (SNP i CNV). 4) Pathofizjologia DIAPH1 i nowych zidentyfikowanych genów głuchoty. 5) Generowanie myszy knock-in dla dwóch mutacji KITLG związanych z jednostronnym ubytkiem słuchu. 6) Podejście terapeutyczne do ubytku słuchu DFNA50 u myszy typu knock-in generowanych mutacjami miR96. 7) Generowanie linii iPSC u pacjentów z mutacjami miR96. Met.:1) Uzyskiwanie próbek krwi, nabłonka nosowego i fibroblastów za świadomą zgodą. 2) Analiza genetyczna: A) Identyfikacja nowych genów HHP przy użyciu WES. Generowanie wersji OTO-NGS-Panel-V2 przy użyciu systemu przechwytywania (sondy ITD) i analizy bioinformatycznej przy użyciu oprogramowania Sophia Genetics. 3) Testy funkcjonalne: Wdrożenie technik biologii molekularnej i komórkowej (przemijające transfekcje, immunohisto- i -cytochemia,..) 4) myszy typu knock-in (KITLG): generacja wykorzystująca technologię CRISPR-Cas9 we współpracy z grupą Dr. Lluis Montoliu (CNB-CIBERER). Morfologiczna i słuchowa analiza ucha wewnętrznego PEATC i OEAS (współpraca z prof. Karen Steel). 5. Terapie ubytków słuchu DFNA50: analiza RNA-Seq (ucha wewnętrznego i nabłonka nosowego) u dwóch myszy z mutacją miR96 u człowieka. Identyfikacja powszechnych ścieżek i genów modulowalnych (oprogramowanie spadkowe) za pomocą leków. 6) Generowanie iPSC: z fibroblastów u pacjentów z mutacjami miR96 z wykorzystaniem nieintegratywnego wirusa Sendai. (Polish)
17 August 2022
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Madrid
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20 December 2023
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Identifiers
PI17_01659
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