Study of gliomas: large-scale sequencing analysis, molecular techniques, imaging techniques and clinical data analysis. Generation of a diagnostic platform. (Q3209282): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(BatchIngestion) |
(Added qualifier: readability score (P590521): 0.5647262203941245) |
||||||||||||||
| (2 intermediate revisions by the same user not shown) | |||||||||||||||
| Property / budget | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / budget: 66,000.0 Euro / rank | |||||||||||||||
| Property / co-financing rate | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / co-financing rate: 80.0 percent / rank | |||||||||||||||
| Property / EU contribution | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / EU contribution: 52,800.0 Euro / rank | |||||||||||||||
| Property / summary: Gliomas constitute a clinically heterogeneous tumor entity, encompassing various histological subtypes and degrees. Although they are not yet included in the WHO diagnostic criteria, specific molecular alterations have been identified in some glioma subtypes, such as 1p/19q co-deletion in oligodendroglial tumors associated with better prognosis and response to treatment. Another marker of good prognosis is mutation in IDH genes, an early event in gliomagenesis. This mutation has recently been shown to cause generalised hypermethylation of the genome (CIMP+ phenotype). Our group has described that this hypermethylator phenotype is modulated by the loss of 1p/19q (collectively CD-CIMP+ phenotype). Therefore, cases of good prognosis have HDI mutation, 1p/19q loss and CD-CIMP+ phenotype. However, little is known of the molecular alterations associated with the HDI mutation in the absence of co-lection, and molecular alterations of tumors without HDI mutation are totally unknown. Recent large-scale sequencing work on gliomas has identified new recurrent mutations in some genes (CIC, ATRX, H3F3A among others). Our hypothesis is that glial tumors can be classified according to the combination of molecular alterations they present, having different prognosis and thus conditioning treatment. The main objectives are: (I) analyse the molecular alterations of gliomas by simultaneous mutational analysis of a large number of genes in a mass analysis platform, determining their diagnostic value, prognosis and correlation with imaging tests; (II) identify new molecular alterations in tumors without HDI mutation by sequencing the exome in selected cases; (III) Generate a sequencing platform specifically designed for the diagnosis and study of gliomas. (English) / qualifier | |||||||||||||||
readability score: 0.5647262203941245
| |||||||||||||||
| Property / postal code | |||||||||||||||
| Property / postal code: 45168 / rank | |||||||||||||||
| Property / location (string) | |||||||||||||||
| Property / location (string): Toledo / rank | |||||||||||||||
| Property / coordinate location | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| Property / coordinate location: 39°51'21.85"N, 4°1'26.26"W / rank | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS: Toledo Province / rank | |||||||||||||||
| Property / location (string) | |||||||||||||||
Toledo | |||||||||||||||
| Property / location (string): Toledo / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / coordinate location | |||||||||||||||
39°51'21.85"N, 4°1'26.26"W
| |||||||||||||||
| Property / coordinate location: 39°51'21.85"N, 4°1'26.26"W / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / coordinate location: 39°51'21.85"N, 4°1'26.26"W / qualifier | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS | |||||||||||||||
| Property / contained in NUTS: Toledo Province / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / budget | |||||||||||||||
66,000.0 Euro
| |||||||||||||||
| Property / budget: 66,000.0 Euro / rank | |||||||||||||||
Preferred rank | |||||||||||||||
| Property / EU contribution | |||||||||||||||
53,169.6 Euro
| |||||||||||||||
| Property / EU contribution: 53,169.6 Euro / rank | |||||||||||||||
Preferred rank | |||||||||||||||
| Property / co-financing rate | |||||||||||||||
80.56 percent
| |||||||||||||||
| Property / co-financing rate: 80.56 percent / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / date of last update | |||||||||||||||
21 December 2023
| |||||||||||||||
| Property / date of last update: 21 December 2023 / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
Revision as of 14:29, 12 March 2024
Project Q3209282 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Study of gliomas: large-scale sequencing analysis, molecular techniques, imaging techniques and clinical data analysis. Generation of a diagnostic platform. |
Project Q3209282 in Spain |
Statements
53,169.6 Euro
0 references
66,000.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
1 January 2014
0 references
31 March 2018
0 references
FUNDACION DEL HOSPITAL NACIONAL DE PARAPLEJICOS
0 references
Los gliomas constituyen una entidad tumoral clínicamente heterogénea, que engloba diversos subtipos y grados histológicos. Aunque todavía no se incluyen entre los criterios diagnósticos de la OMS, se han identificado alteraciones moleculares específicas en algunos subtipos de gliomas, como la codeleción de 1p/19q en tumores oligodendrogliales que se relaciona con un mejor pronóstico y respuesta al tratamiento. Otro marcador de buen pronóstico es la mutación en los genes IDH, un evento temprano en la gliomagénesis. Recientemente se ha demostrado que esta mutación provoca una hipermetilación generalizada del genoma (fenotipo CIMP+). Nuestro grupo ha descrito que este fenotipo hipermetilador es modulado por la pérdida de 1p/19q (fenotipo codelecionado CD-CIMP+). Por tanto, los casos de buen pronóstico presentan mutación de IDH, pérdida de 1p/19q y fenotipo CD-CIMP+. Sin embargo, se conoce poco de las alteraciones moleculares que se asocian a la mutación de IDH en ausencia de codeleción, y se desconocen totalmente as alteraciones moleculares de los tumores sin mutación de IDH. Los trabajos recientes de secuenciación a gran escala en gliomas han identificando nuevas mutaciones recurrentes en algunos genes (CIC, ATRX, H3F3A entre otros). Nuestra hipótesis es que los tumores gliales pueden clasificarse según la combinación de alteraciones moleculares que presenten, teniendo distinto pronóstico y condicionando así el tratamiento. Los objetivos principales son: (i) analizar las alteraciones moleculares de los gliomas mediante el análisis mutacional simultáneo de un gran número de genes en una plataforma de análisis masivo, determinando su valor diagnóstico, pronóstico y la correlación con pruebas de imagen; (ii) identificar nuevas alteraciones moleculares en tumores sin mutación de IDH mediante la secuenciación del exoma en casos seleccionados; (iii) Generar una plataforma de secuenciación diseñada específicamente para el diagnóstico y estudio de los gliomas. (Spanish)
0 references
Gliomas constitute a clinically heterogeneous tumor entity, encompassing various histological subtypes and degrees. Although they are not yet included in the WHO diagnostic criteria, specific molecular alterations have been identified in some glioma subtypes, such as 1p/19q co-deletion in oligodendroglial tumors associated with better prognosis and response to treatment. Another marker of good prognosis is mutation in IDH genes, an early event in gliomagenesis. This mutation has recently been shown to cause generalised hypermethylation of the genome (CIMP+ phenotype). Our group has described that this hypermethylator phenotype is modulated by the loss of 1p/19q (collectively CD-CIMP+ phenotype). Therefore, cases of good prognosis have HDI mutation, 1p/19q loss and CD-CIMP+ phenotype. However, little is known of the molecular alterations associated with the HDI mutation in the absence of co-lection, and molecular alterations of tumors without HDI mutation are totally unknown. Recent large-scale sequencing work on gliomas has identified new recurrent mutations in some genes (CIC, ATRX, H3F3A among others). Our hypothesis is that glial tumors can be classified according to the combination of molecular alterations they present, having different prognosis and thus conditioning treatment. The main objectives are: (I) analyse the molecular alterations of gliomas by simultaneous mutational analysis of a large number of genes in a mass analysis platform, determining their diagnostic value, prognosis and correlation with imaging tests; (II) identify new molecular alterations in tumors without HDI mutation by sequencing the exome in selected cases; (III) Generate a sequencing platform specifically designed for the diagnosis and study of gliomas. (English)
14 October 2021
0.5647262203941245
0 references
Les gliomes constituent une entité tumorale cliniquement hétérogène, englobant divers sous-types et degrés histologiques. Bien qu’elles ne soient pas encore incluses dans les critères diagnostiques de l’OMS, des altérations moléculaires spécifiques ont été identifiées dans certains sous-types de gliomes, comme la co-sélétion 1p/19q dans les tumeurs oligodendrogliales associées à un meilleur pronostic et une meilleure réponse au traitement. Un autre marqueur d’un bon pronostic est la mutation des gènes IDH, un événement précoce dans la gliomagenésie. Cette mutation a récemment été démontrée comme cause d’hyperméthylation généralisée du génome (phénotype CIMP+). Notre groupe a décrit que ce phénotype hyperméthylateur est modulé par la perte de 1p/19q (collectivement le phénotype CD-CIMP+). Par conséquent, les cas de bon pronostic ont une mutation de l’IDH, une perte de 1p/19q et un phénotype CD-CIMP+. Cependant, les altérations moléculaires associées à la mutation HDI en l’absence de co-lection sont peu connues et les altérations moléculaires des tumeurs sans mutation HDI sont totalement inconnues. Des travaux récents de séquençage à grande échelle sur les gliomes ont permis d’identifier de nouvelles mutations récurrentes dans certains gènes (CIC, ATRX, H3F3A, entre autres). Notre hypothèse est que les tumeurs gliales peuvent être classées en fonction de la combinaison des altérations moléculaires qu’elles présentent, ayant un pronostic différent et donc un traitement de conditionnement. Les principaux objectifs sont les suivants: (I) analyser les altérations moléculaires des gliomes par une analyse mutationnelle simultanée d’un grand nombre de gènes dans une plate-forme d’analyse de masse, en déterminant leur valeur diagnostique, leur pronostic et leur corrélation avec des tests d’imagerie; II) identifier de nouvelles altérations moléculaires des tumeurs sans mutation HDI en séquençant l’exome dans des cas sélectionnés; (III) Générer une plate-forme de séquençage spécialement conçue pour le diagnostic et l’étude des gliomes. (French)
5 December 2021
0 references
Gliomen bilden eine klinisch heterogene Tumor Entität, die verschiedene histologische Subtypen und Grad umfasst. Obwohl sie noch nicht in den WHO-Diagnostikkriterien enthalten sind, wurden bei einigen Gliomsubtypen spezifische molekulare Veränderungen festgestellt, wie z. B. 1p/19q Ko-Streichung bei Oligodendroglialtumoren, die mit einer besseren Prognose und Reaktion auf die Behandlung verbunden sind. Ein weiterer Marker guter Prognose ist die Mutation in IDH-Genen, ein frühes Ereignis in der Gliomagenese. Diese Mutation hat sich kürzlich gezeigt, dass sie eine generalisierte Hypermethylierung des Genoms (CIMP+ Phänotyp) hervorruft. Unsere Gruppe hat beschrieben, dass dieser Hypermethylator-Phänotyp durch den Verlust von 1p/19q (zusammen CD-CIMP+ Phänotyp) moduliert wird. Daher haben Fälle von guter Prognose HDI-Mutation, 1p/19q Verlust und CD-CIMP+ Phänotyp. Allerdings ist wenig bekannt über die molekularen Veränderungen, die mit der HDI-Mutation in Ermangelung einer Ko-Lektion verbunden sind, und molekulare Veränderungen von Tumoren ohne HDI-Mutation sind völlig unbekannt. Bei einigen Genen (u. a. CIC, ATRX, H3F3A) haben die jüngsten groß angelegten Sequenzierungsarbeiten an Gliomen neue rezidivierende Mutationen identifiziert. Unsere Hypothese ist, dass Glialtumoren nach der Kombination von molekularen Veränderungen klassifiziert werden können, die sie mit unterschiedlicher Prognose und damit konditionierender Behandlung haben. Die Hauptziele sind: I) die molekularen Veränderungen von Gliomen durch gleichzeitige Mutationsanalyse einer großen Anzahl von Genen in einer Massenanalyseplattform analysieren und ihren diagnostischen Wert, ihre Prognose und Korrelation mit bildgebenden Tests bestimmen; (II) Identifizierung neuer molekularer Veränderungen bei Tumoren ohne HDI-Mutation durch Sequenzierung des Exome in ausgewählten Fällen; (III) Generieren Sie eine Sequenzierungsplattform, die speziell für die Diagnose und Untersuchung von Gliomen entwickelt wurde. (German)
9 December 2021
0 references
Gliomas vormen een klinisch heterogene tumor-entiteit, die verschillende histologische subtypes en graden omvat. Hoewel ze nog niet zijn opgenomen in de WHO-diagnosecriteria, zijn specifieke moleculaire veranderingen geïdentificeerd in sommige glioomsubtypes, zoals 1p/19q co-deletion in oligodendrogliale tumoren geassocieerd met betere prognose en respons op behandeling. Een andere marker van goede prognose is mutatie in IDH genen, een vroege gebeurtenis in gliomagenesis. Deze mutatie is onlangs aangetoond om gegeneraliseerde hypermethylation van het genoom (CIMP+ fenotype) te veroorzaken. Onze groep heeft beschreven dat dit hypermethylatorfenotype wordt gemoduleerd door het verlies van 1p/19q (gezamenlijk CD-CIMP+ fenotype). Daarom hebben gevallen van goede prognose HDI-mutatie, 1p/19q verlies en CD-CIMP+ fenotype. Echter, weinig is bekend van de moleculaire veranderingen geassocieerd met de HDI mutatie in de afwezigheid van co-lection, en moleculaire veranderingen van tumoren zonder HDI-mutatie zijn totaal onbekend. Recente grootschalige sequencing werk aan gliomas heeft nieuwe terugkerende mutaties in sommige genen (CIC, ATRX, H3F3A onder anderen) geïdentificeerd. Onze hypothese is dat glial tumoren kunnen worden ingedeeld volgens de combinatie van moleculaire veranderingen die ze presenteren, met verschillende prognose en dus conditionering behandeling. De belangrijkste doelstellingen zijn: I) de moleculaire veranderingen van gliomen analyseren door gelijktijdige mutatieanalyse van een groot aantal genen in een massaanalyseplatform, waarbij de diagnostische waarde, prognose en correlatie met beeldvormingstests worden bepaald; (II) nieuwe moleculaire veranderingen in tumoren zonder HDI-mutatie identificeren door het exoom in geselecteerde gevallen te rangschikken; (III) Genereer een sequencing platform speciaal ontworpen voor de diagnose en studie van gliomas. (Dutch)
17 December 2021
0 references
I gliomi costituiscono un'entità tumorale clinicamente eterogenea, che comprende vari sottotipi istologici e gradi. Sebbene non siano ancora inclusi nei criteri diagnostici dell'OMS, sono state identificate alterazioni molecolari specifiche in alcuni sottotipi del glioma, come la co-delezione 1p/19q nei tumori oligodendrogliali associati a una migliore prognosi e risposta al trattamento. Un altro marcatore di buona prognosi è la mutazione nei geni IDH, un evento precoce nella gliomagenesi. Questa mutazione ha recentemente dimostrato di causare l'ipermetilazione generalizzata del genoma (fenotipo CIMP+). Il nostro gruppo ha descritto che questo fenotipo ipermetilatore è modulato dalla perdita di 1p/19q (collettivamente fenotipo CD-CIMP+). Pertanto, i casi di buona prognosi hanno mutazione HDI, perdita 1p/19q e fenotipo CD-CIMP+. Tuttavia, si sa poco delle alterazioni molecolari associate alla mutazione HDI in assenza di co-lezione, e le alterazioni molecolari dei tumori senza mutazione HDI sono del tutto sconosciute. Recenti lavori di sequenziamento su larga scala sui gliomi hanno identificato nuove mutazioni ricorrenti in alcuni geni (CIC, ATRX, H3F3A, tra gli altri). La nostra ipotesi è che i tumori gliali possano essere classificati in base alla combinazione di alterazioni molecolari che presentano, avendo prognosi diversa e quindi trattamento condizionante. Gli obiettivi principali sono: I) analizzare le alterazioni molecolari dei gliomi mediante analisi mutazionale simultanea di un gran numero di geni in una piattaforma di analisi di massa, determinandone il valore diagnostico, la prognosi e la correlazione con i test di imaging; (II) identificare nuove alterazioni molecolari nei tumori senza mutazione HDI sequenziando l'esoma in casi selezionati; (III) Generare una piattaforma di sequenziamento appositamente progettata per la diagnosi e lo studio dei gliomi. (Italian)
16 January 2022
0 references
Τα γλιώματα αποτελούν μια κλινικά ετερογενή οντότητα όγκου, η οποία περιλαμβάνει διάφορους ιστολογικούς υποτύπους και βαθμούς. Αν και δεν περιλαμβάνονται ακόμη στα διαγνωστικά κριτήρια του ΠΟΥ, έχουν εντοπιστεί συγκεκριμένες μοριακές αλλοιώσεις σε ορισμένους υποτύπους γλοιώματος, όπως η συνδιαγραφή 1p/19q σε ολιγοδενδρογλιικούς όγκους που σχετίζονται με καλύτερη πρόγνωση και ανταπόκριση στη θεραπεία. Ένας άλλος δείκτης καλής πρόγνωσης είναι η μετάλλαξη στα γονίδια IDH, ένα πρώιμο συμβάν στη γλιομαγένεση. Αυτή η μετάλλαξη έχει πρόσφατα αποδειχθεί ότι προκαλεί γενικευμένη υπερμεθυλίωση του γονιδιώματος (CIMP+ φαινότυπος). Η ομάδα μας έχει περιγράψει ότι αυτός ο φαινότυπος υπερμεθυλιωτής διαμορφώνεται από την απώλεια 1p/19q (συλλογικά CD-CIMP+ φαινότυπος). Ως εκ τούτου, οι περιπτώσεις καλής πρόγνωσης έχουν μετάλλαξη HDI, απώλεια 1p/19q και φαινότυπο CD-CIMP+. Ωστόσο, λίγα είναι γνωστά για τις μοριακές αλλοιώσεις που σχετίζονται με τη μετάλλαξη HDI ελλείψει συνεκβολής, και οι μοριακές αλλοιώσεις των όγκων χωρίς μετάλλαξη HDI είναι εντελώς άγνωστες. Πρόσφατες μεγάλης κλίμακας εργασίες αλληλουχίας για γλιώματα έχουν εντοπίσει νέες επαναλαμβανόμενες μεταλλάξεις σε ορισμένα γονίδια (CIC, ATRX, H3F3A μεταξύ άλλων). Η υπόθεσή μας είναι ότι οι glial όγκοι μπορούν να ταξινομηθούν ανάλογα με το συνδυασμό των μοριακών αλλοιώσεων που παρουσιάζουν, έχοντας διαφορετική πρόγνωση και συνεπώς θεραπεία προετοιμασίας. Οι κύριοι στόχοι είναι: I) αναλύει τις μοριακές αλλοιώσεις των γλειωμάτων με ταυτόχρονη μεταλλαξιολογική ανάλυση μεγάλου αριθμού γονιδίων σε πλατφόρμα μαζικής ανάλυσης, καθορίζοντας τη διαγνωστική τους αξία, την πρόγνωση και τη συσχέτιση τους με τις δοκιμές απεικόνισης· Προσδιορισμός νέων μοριακών αλλοιώσεων στους όγκους χωρίς μετάλλαξη HDI με την αλληλουχία του εξωμίου σε επιλεγμένες περιπτώσεις. (III) Δημιουργήστε μια πλατφόρμα αλληλουχίας ειδικά σχεδιασμένη για τη διάγνωση και τη μελέτη γλιωμάτων. (Greek)
18 August 2022
0 references
Gliomas udgør en klinisk heterogen tumor enhed, der omfatter forskellige histologiske undertyper og grader. Selv om de endnu ikke er inkluderet i WHO's diagnostiske kriterier, er specifikke molekylære ændringer blevet identificeret i nogle glioma-undertyper, såsom 1p/19q co-deletion i oligodendrogliale tumorer forbundet med bedre prognose og respons på behandling. En anden markør for god prognose er mutation i IDH-gener, en tidlig begivenhed i gliomagenesis. Denne mutation har for nylig vist sig at forårsage generaliseret hypermethylering af genomet (CIMP+ fænotype). Vores gruppe har beskrevet, at denne hypermethylator fænotype moduleres af tabet af 1p/19q (kollektivt CD-CIMP + fænotype). Derfor har tilfælde af god prognose HDI-mutation, 1p/19q tab og CD-CIMP + fænotype. Der er dog kun lidt kendskab til de molekylære ændringer, der er forbundet med HDI-mutationen i mangel af co-lektion, og molekylære ændringer af tumorer uden HDI-mutation er helt ukendte. Nylige omfattende sekventeringsarbejde på gliomas har identificeret nye tilbagevendende mutationer i nogle gener (bl.a. CIC, ATRX, H3F3A). Vores hypotese er, at glial tumorer kan klassificeres i henhold til kombinationen af molekylære ændringer, de har forskellige prognose og dermed konditionering behandling. De vigtigste mål er: Analysere de molekylære ændringer af gliomas ved samtidig mutationsanalyse af et stort antal gener i en masseanalyseplatform med henblik på at bestemme deres diagnostiske værdi, prognose og korrelation med billeddannelsestest (II) identificere nye molekylære ændringer i tumorer uden HDI-mutation ved at sekventere exomet i udvalgte tilfælde; (III) Generere en sekventeringsplatform, der er specielt designet til diagnosticering og undersøgelse af gliomas. (Danish)
18 August 2022
0 references
Glioomat muodostavat kliinisesti heterogeenisen kasvainkokonaisuuden, joka käsittää erilaisia histologisia alatyyppejä ja asteita. Vaikka ne eivät vielä sisälly WHO:n diagnostisiin kriteereihin, spesifisiä molekyylimuutoksia on havaittu joillakin gliooma-alatyypeillä, kuten 1p/19q-yhdistyminen oligodendroglial-kasvaimissa, joihin liittyy parempi ennuste ja hoitovaste. Toinen merkki hyvä ennuste on mutaatio IDH-geeneissä, varhainen tapahtuma gliomagenesis. Tämän mutaation on äskettäin osoitettu aiheuttavan yleistynyttä genomin hypermetylaatiota (CIMP+ fenotyyppi). Ryhmämme on kuvannut, että tämä hypermetyyliator fenotyyppi on moduloitu menetys 1p/19q (yhdessä CD-CIMP + fenotyyppi). Siksi hyvä ennuste on HDI mutaatio, 1p/19q menetys ja CD-CIMP+ fenotyyppi. Kuitenkin tiedetään vähän HDI-mutaatioon liittyvistä molekyylimuutoksista ilman yhteisäänitystä, ja kasvainten molekyylimuutokset ilman HDI-mutaatiota ovat täysin tuntemattomia. Viimeaikaisessa laajamittaisessa sekvensointityössä on havaittu uusia toistuvia mutaatioita joissakin geeneissä (muun muassa CIC, ATRX, H3F3A). Meidän hypoteesi on, että glial kasvaimet voidaan luokitella yhdistelmä molekyylimuutoksia ne esiintyvät, joilla on erilainen ennuste ja siten hoitava hoito. Päätavoitteet ovat seuraavat: I) analysoida glioomien molekyylimuutoksia massaanalyysialustalla olevan suuren määrän geenien samanaikaisella mutaatioanalyysilla ja määrittää niiden diagnostinen arvo, ennuste ja korrelaatio kuvantamistestien kanssa; II) tunnistaa uudet molekyylimuutokset kasvaimissa ilman HDI-mutaatiota sekvensoimalla eksome valikoiduissa tapauksissa; III) Luo sekvensointialusta, joka on erityisesti suunniteltu glioomien diagnosointiin ja tutkimukseen. (Finnish)
18 August 2022
0 references
Il-glijomi jikkostitwixxu entità klinikament eteroġenja tat-tumur, li tinkludi diversi sottotipi u gradi istoloġiċi. Għalkemm għadhom mhumiex inklużi fil-kriterji dijanjostiċi tal-WHO, alterazzjonijiet molekulari speċifiċi ġew identifikati f’xi sottotipi ta’ glijoma, bħal 1p/19q ko-tħassir f’tumuri oligodendrogliali assoċjati ma’ pronjosi aħjar u rispons għall-kura. Indikatur ieħor ta ‘pronjosi tajba huwa l-mutazzjoni fil-ġeni IDH, avveniment bikri fil-glijomaġenesi. Dan l-aħħar intwera li din il-mutazzjoni tikkawża ipermetilazzjoni ġeneralizzata tal-ġenoma (CIMP+ fenotip). Il-grupp tagħna ddeskriva li dan il-fenotip ta’ ipermetilatur huwa mmodulat bit-telf ta’ 1p/19q (kollettivament fenotip CD-CIMP+). Għalhekk, każijiet ta’ pronjosi tajba għandhom mutazzjoni ta’ HDI, telf ta’ 1p/19q u fenotip CD-CIMP+. Madankollu, ftit huwa magħruf dwar l-alterazzjonijiet molekulari assoċjati mal-mutazzjoni HDI fin-nuqqas ta’ kolezzjoni, u alterazzjonijiet molekulari ta’ tumuri mingħajr mutazzjoni HDI huma totalment mhux magħrufa. Xogħol riċenti ta’ sekwenzar fuq skala kbira fuq il-glijomi identifika mutazzjonijiet rikorrenti ġodda f’xi ġeni (CIC, ATRX, H3F3A fost l-oħrajn). Ipoteżi tagħna hija li glial tumuri jistgħu jiġu kklassifikati skont il-kombinazzjoni ta ‘alterazzjonijiet molekulari huma preżenti, li jkollhom pronjosi differenti u b’hekk trattament kondizzjonament. L-għanijiet ewlenin huma: (I) janalizza l-alterazzjonijiet molekulari tal-glijomi permezz ta’ analiżi simultanja ta’ mutazzjoni ta’ numru kbir ta’ ġeni fi pjattaforma ta’ analiżi tal-massa, filwaqt li jiddetermina l-valur dijanjostiku, il-pronjosi u l-korrelazzjoni tagħhom mat-testijiet tal-immaġini; (II) jidentifika alterazzjonijiet molekulari ġodda f’tumuri mingħajr mutazzjoni HDI billi jissekwenza l-eżoma f’każijiet magħżula; (III) Iġġenera pjattaforma ta’ sekwenzar imfassla speċifikament għad-dijanjożi u l-istudju tal-glijomi. (Maltese)
18 August 2022
0 references
Gliomas veido klīniski neviendabīgu audzēja vienību, kas ietver dažādus histoloģiskos apakštipus un grādus. Lai gan tās vēl nav iekļautas PVO diagnostikas kritērijos, dažos gliomas apakštipos ir konstatētas specifiskas molekulārās izmaiņas, piemēram, 1p/19q vienlaicīga eliminācija oligodendrogliālajiem audzējiem, kas saistīti ar labākām prognozēm un atbildes reakciju uz ārstēšanu. Vēl viens labas prognozes marķieris ir mutācija IDH gēnos, agrīnais notikums gliomagenēzē. Nesen ir pierādīts, ka šī mutācija izraisa genoma ģeneralizētu hipermetilāciju (CIMP+ fenotips). Mūsu grupa ir aprakstījusi, ka šo hipermetilatora fenotipu modulē, zaudējot 1p/19q (kopā CD-CIMP+ fenotips). Tādēļ labas prognozes gadījumos ir HDI mutācija, 1p/19q zudums un CD-CIMP+ fenotips. Tomēr maz ir zināms par molekulārajām izmaiņām, kas saistītas ar HDI mutāciju, ja nav kolekcijas, un audzēju molekulārās izmaiņas bez HDI mutācijas ir pilnīgi nezināmas. Nesen veiktajā plaša mēroga sekvencēšanas darbā ar gliomām ir konstatētas jaunas atkārtotas mutācijas dažos gēnos (CIC, ATRX, H3F3A, cita starpā). Mūsu hipotēze ir tāda, ka glial audzējus var klasificēt pēc molekulāro izmaiņu kombinācijas, ko tie uzrāda, kam ir dažādas prognozes un tādējādi kondicionēšanas ārstēšana. Galvenie mērķi ir šādi: I) analizē gliomas molekulārās izmaiņas, masas analīzes platformā vienlaicīgi veicot daudzu gēnu mutāciju analīzi, nosakot to diagnostikas vērtību, prognozi un korelāciju ar attēlveidošanas testiem; II) noteikt jaunas molekulārās izmaiņas audzējos bez HDI mutācijas, atsevišķos gadījumos nosakot eksomea sekvencēšanu; (III) Izveidot sekvencēšanas platformu, kas īpaši paredzēta gliomu diagnostikai un izpētei. (Latvian)
18 August 2022
0 references
Gliómy predstavujú klinicky heterogénne nádorovú entitu, ktorá zahŕňa rôzne histologické podtypy a stupne. Hoci ešte nie sú zahrnuté do diagnostických kritérií WHO, v niektorých podtypoch gliómu boli identifikované špecifické molekulárne zmeny, ako je kodelecia 1p/19q v oligodendrogliálnych nádoroch spojených s lepšou prognózou a odpoveďou na liečbu. Ďalším markerom dobrej prognózy je mutácia v génoch IDH, čo je skorá udalosť v gliomagenéze. Nedávno sa preukázalo, že táto mutácia spôsobuje generalizovanú hypermetyláciu genómu (CIMP+ fenotyp). Naša skupina opísala, že tento fenotyp hypermetylátora je modulovaný stratou 1p/19q (spolu CD-CIMP+ fenotyp). Preto majú prípady dobrej prognózy mutáciu HDI, stratu 1p/19q a fenotyp CD-CIMP+. Avšak, málo je známe o molekulárnych zmien spojených s mutáciou HDI v neprítomnosti ko-lection, a molekulárne zmeny nádorov bez mutácie HDI sú úplne neznáme. Nedávne rozsiahle sekvenčné práce na gliómoch identifikovali nové opakujúce sa mutácie v niektorých génoch (CIC, ATRX, H3F3A okrem iného). Naša hypotéza je, že gliálne nádory môžu byť klasifikované podľa kombinácie molekulárnych zmien, ktoré predstavujú, majú rôznu prognózu a tým kondicionujú liečbu. Hlavnými cieľmi sú: I) analyzovať molekulárne zmeny gliómov simultánnou mutagénnou analýzou veľkého počtu génov na platforme hmotnostnej analýzy, pričom určí ich diagnostickú hodnotu, prognózu a koreláciu so zobrazovacími testami; II) identifikovať nové molekulárne zmeny v nádoroch bez mutácie HDI sekvenovaním exómu vo vybraných prípadoch; (III) Generovať sekvenčnú platformu špeciálne určenú na diagnostiku a štúdium gliómov. (Slovak)
18 August 2022
0 references
Is éard atá i gceist le gliomas ná aonán meall ilchineálach go cliniciúil, lena gcuimsítear fochineálacha agus céimeanna histeolaíocha éagsúla. Cé nach bhfuil siad san áireamh go fóill i gcritéir dhiagnóiseacha EDS, sainaithníodh athruithe móilíneacha sonracha i bhfochineálacha gliúma áirithe, amhail comhshcrios 1p/19q i siadaí oligodendroglial a bhaineann le prognóis níos fearr agus freagairt ar chóireáil. Is é an marcóir eile de prognóis maith sóchán i géinte IDH, imeacht luath i gliomagenesis. Tá sé léirithe le déanaí go bhfuil an sóchán seo ina chúis le hipitrealú ginearálaithe an ghéanóm (feinitíopaCIMP+). Tá cur síos ar ár ngrúpa go bhfuil an phenotype hypermethylator modhnaithe ag an caillteanas de 1p/19q (i dteannta a chéile CD-CIMP + feinitíopa). Dá bhrí sin, tá cásanna prognóis maith sóchán HDI, caillteanas 1p/19q agus feinitíopa CD-CIMP +. Mar sin féin, is beag atá ar eolas faoi na hathruithe móilíneacha a bhaineann leis an mutation HDI in éagmais comhlection, agus tá athruithe móilíneacha siadaí gan sóchán HDI anaithnid go hiomlán. D’aithin obair sheicheamhaithe ar scála mór le déanaí ar gliomas sócháin athfhillteacha nua i roinnt géinte (CIC, ATRX, H3F3A i measc daoine eile). Is é ár hipitéis gur féidir siadaí glial a aicmiú de réir an teaglaim de athruithe móilíneach i láthair siad, a bhfuil prognóis éagsúla agus dá bhrí sin cóireáil aeroiriúnaithe. Is iad seo a leanas na príomhchuspóirí: (I) anailís a dhéanamh ar athruithe móilíneacha gliomas trí anailís chomhuaineach sócháin ar líon mór géinte in ardán anailíse maise, lena gcinntear a luach diagnóiseach, a prognóis agus a gcomhghaolú le tástálacha íomháithe; (II) athruithe móilíneacha nua i siadaí gan sóchán HDI a shainaithint tríd an exome a sheicheamhú i gcásanna roghnaithe; (III) Gin ardán seicheamhaithe atá deartha go sonrach chun gliomas a dhiagnóisiú agus chun staidéar a dhéanamh orthu. (Irish)
18 August 2022
0 references
Gliomy představují klinicky heterogenní nádorovou entitu, zahrnující různé histologické podtypy a stupně. Ačkoli dosud nejsou zahrnuty do diagnostických kritérií WHO, byly zjištěny specifické molekulární změny u některých subtypů gliomů, jako je kodelece 1p/19q u oligodendrogliálních nádorů spojených s lepší prognózou a odpovědí na léčbu. Dalším markerem dobré prognózy je mutace v genech IDH, časná událost u gliomageneze. Nedávno bylo prokázáno, že tato mutace způsobuje generalizovanou hypermethylaci genomu (CIMP+ fenotyp). Naše skupina popsala, že tento hypermethylator fenotyp je modulován ztrátou 1p/19q (společně CD-CIMP+ fenotyp). Proto mají případy dobré prognózy mutaci HDI, ztrátu 1p/19q a fenotyp CD-CIMP+. O molekulárních změnách spojených s mutací HDI v nepřítomnosti koleku je však známo jen málo a molekulární změny nádorů bez HDI mutace jsou zcela neznámé. Nedávná rozsáhlá sekvenační práce na gliomech identifikovala nové recidivující mutace v některých genech (mimo jiné CIC, ATRX, H3F3A). Naší hypotézou je, že gliální nádory lze klasifikovat podle kombinace molekulárních změn, které představují, s různou prognózou a tedy podmíněnou léčbou. Hlavními cíli jsou: I) analyzovat molekulární změny gliomů simultánní mutací velkého počtu genů v platformě pro hmotnostní analýzu, určit jejich diagnostickou hodnotu, prognózu a korelaci se zobrazovacími testy; II) identifikovat nové molekulární změny v nádorech bez mutace HDI sekvenováním exomu ve vybraných případech; (III) Generovat sekvenační platformu speciálně určenou pro diagnostiku a studium gliomů. (Czech)
18 August 2022
0 references
Os gliomas constituem uma entidade tumoral clinicamente heterogênea, englobando vários subtipos e graus histológicos. Embora ainda não estejam incluídas nos critérios diagnósticos da OMS, alterações moleculares específicas têm sido identificadas em alguns subtipos de glioma, como a coleção 1p/19q em tumores oligodendrogliais, associadas a melhor prognóstico e resposta ao tratamento. Outro marcador de bom prognóstico é a mutação nos genes IDH, um evento precoce na gliomagênese. Esta mutação demonstrou recentemente causar hipermetilação generalizada do genoma (fenótipo CIMP+). Nosso grupo descreveu que esse fenótipo do hipermetilador é modulado pela perda de 1p/19q (coletivamente fenótipo CD-CIMP+). Portanto, os casos de bom prognóstico apresentam mutação do IDH, perda 1p/19q e fenótipo CD-CIMP+. No entanto, pouco se sabe das alterações moleculares associadas à mutação do IDH na ausência de coleção, e as alterações moleculares de tumores sem mutação do IDH são totalmente desconhecidas. O trabalho recente de sequenciamento em larga escala em gliomas identificou novas mutações recorrentes em alguns genes (CIC, ATRX, H3F3A, entre outros). Nossa hipótese é que os tumores gliais podem ser classificados de acordo com a combinação de alterações moleculares que apresentam, tendo prognóstico diferente e, assim, condicionando o tratamento. Os principais objetivos são os seguintes: I) Analisar as alterações moleculares dos gliomas através de uma análise mutacional simultânea de um grande número de genes numa plataforma de análise de massa, determinando o seu valor diagnóstico, prognóstico e correlação com exames de imagem; (II) identificar novas alterações moleculares em tumores sem mutação do IDH sequenciando o exoma em casos selecionados; (III) Gerar uma plataforma de sequenciamento especificamente concebida para o diagnóstico e estudo de gliomas. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
Glioomid moodustavad kliiniliselt heterogeense kasvajakeha, mis hõlmab erinevaid histoloogilist alatüüpi ja kraadi. Kuigi neid ei ole veel Maailma Terviseorganisatsiooni diagnostiliste kriteeriumidega hõlmatud, on mõnedes glioomi alatüüpides tuvastatud spetsiifilised molekulaarmuutused, näiteks 1p/19q oligodendrogliaalsete kasvajate puhul, mis on seotud parema prognoosi ja ravivastusega. Teine hea prognoosi marker on mutatsioon IDH geenides, mis on varajane sündmus gliomageneesis. See mutatsioon on hiljuti näidanud, et see põhjustab genoomi generaliseerunud hüpermetülatsiooni (CIMP+ fenotüüp). Meie grupp on kirjeldanud, et seda hüpermetüülaatori fenotüüpi moduleeritakse 1p/19q kadumisega (ühiselt CD-CIMP+ fenotüüp). Seetõttu on hea prognoosi korral HDI mutatsioon, 1p/19q kadu ja CD-CIMP+ fenotüüp. Siiski on vähe teada molekulaarsed muutused, mis on seotud HDI mutatsiooni puudumisel kooslektsiooni ja molekulaarne muutused kasvajad ilma HDI mutatsiooni on täiesti teadmata. Hiljutised suuremahulised järjestustööd glioomidega on tuvastanud uusi korduvaid mutatsioone mõnedes geenides (muu hulgas CIC, ATRX, H3F3A). Meie hüpotees on, et glialkasvajaid saab liigitada vastavalt nende molekulaarsete muutuste kombinatsioonile, millel on erinev prognoos ja seega ravi konditsioneerimine. Peamised eesmärgid on järgmised: I) analüüsida glioomi molekulaarseid muutusi massianalüüsiplatvormil oleva suure hulga geenide samaaegse mutatsioonianalüüsi abil, määrates kindlaks nende diagnostilise väärtuse, prognoosi ja korrelatsiooni kujutistestidega; II) teha kindlaks kasvajate uued molekulaarmuutused ilma HDI mutatsioonita, järjestades valitud juhtudel eksome; III) Loo sekveneerimisplatvorm, mis on spetsiaalselt ette nähtud glioomide diagnoosimiseks ja uurimiseks. (Estonian)
18 August 2022
0 references
Gliomák alkotják a klinikailag heterogén tumor entitás, amely magában foglalja a különböző szövettani altípusok és fok. Bár ezek még nem szerepelnek a WHO diagnosztikai kritériumaiban, specifikus molekuláris elváltozásokat azonosítottak néhány glioma altípusban, mint például az 1p/19q kodeletio oligodendroglialis daganatokban, amelyek jobb prognózissal és a kezelésre adott válaszokkal járnak. Egy másik marker jó prognózis a mutáció az IDH gének, egy korai esemény gliomagenesis. Ez a mutáció a közelmúltban a genom (CIMP+ fenotípus) generalizált hipermetilációját okozza. Csoportunk leírta, hogy ezt a hipermetilátor fenotípust 1p/19q vesztesége (együttesen CD-CIMP+ fenotípus) modulálja. Ezért jó prognózis esetén HDI mutáció, 1p/19q veszteség és CD-CIMP+ fenotípus van. A HDI mutációhoz társuló molekuláris változásokról azonban keveset tudunk társlekció hiányában, és a tumorok HDI-mutáció nélküli molekuláris változásai teljesen ismeretlenek. A gliomákkal kapcsolatos közelmúltbeli nagyléptékű szekvenálás egyes gének (többek között CIC, ATRX, H3F3A) új, visszatérő mutációit azonosította. Feltételezésünk szerint a glial tumorok a molekuláris változások kombinációja szerint osztályozhatók, különböző prognózissal és kondicionáló kezeléssel. A fő célkitűzések a következők: A gliómák molekuláris változásainak elemzése nagyszámú gén egyidejű mutációs elemzésével tömegelemzési platformon, diagnosztikai értékük, prognózisuk és képalkotó vizsgálatokkal való korrelációjuk meghatározása révén; A HDI-mutáció nélküli daganatok új molekuláris elváltozásainak azonosítása kiválasztott esetekben az exom szekvenálásával; (III) Kifejezetten gliómák diagnosztizálására és vizsgálatára kialakított szekvenáló platform létrehozása. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
Глиомите представляват клинично разнородно туморно образувание, обхващащо различни хистологични подтипове и степени. Въпреки че все още не са включени в диагностичните критерии на СЗО, са установени специфични молекулярни промени в някои подтипове глиом, като например 1p/19q ко-заличаване на олигодендроглиални тумори, свързани с по-добра прогноза и отговор на лечението. Друг маркер за добра прогноза е мутацията в IDH гените, ранно събитие при глиомагенеза. Наскоро е доказано, че тази мутация причинява генерализирана хиперметилация на генома (CIMP+ фенотип). Нашата група е описала, че този хиперметилатор фенотип се модулира от загубата на 1p/19q (общо CD-CIMP + фенотип). Следователно, случаите на добра прогноза имат HDI мутация, 1p/19q загуба и CD-CIMP + фенотип. Въпреки това, малко е известно за молекулярните промени, свързани с HDI мутацията при липса на ко-ликция, а молекулярните промени на тумори без HDI мутация са напълно непознати. Неотдавнашната широкомащабна секвениране на глиоми идентифицира нови повтарящи се мутации в някои гени (CIC, ATRX, H3F3A, наред с други). Нашата хипотеза е, че глиалните тумори могат да бъдат класифицирани в зависимост от комбинацията от молекулярни изменения, които те представят, имайки различна прогноза и по този начин кондициониращо лечение. Основните цели са: I) анализира молекулярните изменения на глиоми чрез едновременен мутационен анализ на голям брой гени в платформа за масов анализ, като определя тяхната диагностична стойност, прогноза и корелация с образните тестове; II) идентифицира нови молекулярни промени в туморите без HDI мутация чрез секвениране на екзома в избрани случаи; III) Генериране на платформа за секвениране, специално проектирана за диагностика и изследване на глиоми. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
Gliomas yra kliniškai heterogeninis naviko subjektas, apimantis įvairius histologinius potipius ir laipsnius. Nors jie dar neįtraukti į PSO diagnostinius kriterijus, kai kuriuose gliomos potipiuose buvo nustatyti konkretūs molekuliniai pakitimai, pvz., 1p/19q oligodendroglialinių navikų, susijusių su geresne prognoze ir atsaku į gydymą, išskyrimas. Kitas geros prognozės žymuo yra IDH genų mutacija, ankstyvas gliomagenezės įvykis. Neseniai nustatyta, kad ši mutacija sukelia generalizuotą genomo hipermetilinimą (CIMP+ fenotipas). Mūsų grupė apibūdino, kad šis hipermetilatoriaus fenotipas yra moduliuojamas 1p/19q (kartu CD-CIMP+ fenotipas) praradimu. Todėl geros prognozės atvejai turi HDI mutaciją, 1p/19q praradimą ir CD-CIMP+ fenotipas. Tačiau mažai žinoma apie molekulinius pokyčius, susijusius su HDI mutacija, nesant kolektavimo, o navikų molekuliniai pokyčiai be HDI mutacijos yra visiškai nežinomi. Neseniai atliktas didelio masto gliomų sekos nustatymo darbas nustatė naujas pasikartojančias mutacijas kai kuriuose genuose (CIC, ATRX, H3F3A ir kt.). Mūsų hipotezė yra ta, kad glial navikai gali būti klasifikuojami pagal molekulinių pokyčių, kuriuos jie pateikia, derinys, turintys skirtingą prognozę ir tokiu būdu kondicionavimo gydymą. Pagrindiniai tikslai yra šie: I) analizuoti gliomų molekulinius pokyčius, tuo pačiu metu atliekant daugelio genų mutacijos analizę masės analizės platformoje, nustatant jų diagnostinę vertę, prognozę ir koreliacijos su vaizdo gavimo bandymais analizę; II) nustatyti naujus molekulinius pokyčius navikuose be HDI mutacijos, nustatant egzomos seką pasirinktais atvejais; III) Sukurkite sekos nustatymo platformą, specialiai sukurtą gliomų diagnozavimui ir tyrimui. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
Gliomi čine klinički heterogeni tumorski entitet koji obuhvaća različite histološke podtipove i stupnjeve. Iako još nisu uključene u dijagnostičke kriterije WHO-a, određene molekularne promjene utvrđene su u nekim podtipovima glioma, kao što je 1p/19q ko-delecija u oligodendroglialnim tumorima povezanima s boljom prognozom i odgovorom na liječenje. Drugi marker dobre prognoze je mutacija gena IDH, rani događaj u gliomagenezi. Nedavno se pokazalo da ova mutacija uzrokuje generaliziranu hipermetilaciju genoma (CIMP+ fenotip). Naša grupa je opisala da je ovaj hipermetilator fenotip moduliran gubitkom 1p/19q (kolektivno CD-CIMP+ fenotip). Stoga, slučajevi dobre prognoze imaju HDI mutaciju, 1p/19q gubitak i CD-CIMP+ fenotip. Međutim, malo se zna za molekularne promjene povezane s mutacijom HDI u nedostatku sulecije, a molekularne promjene tumora bez HDI mutacije potpuno su nepoznate. Nedavni veliki sekvencirajući rad na gliomima identificirao je nove rekurentne mutacije u nekim genima (među ostalima CIC, ATRX, H3F3A). Naša hipoteza je da se glijalni tumori mogu klasificirati prema kombinaciji molekularnih promjena koje predstavljaju, imaju različite prognoze, a time i kondicioniranje liječenja. Glavni su ciljevi sljedeći: (I) analizirati molekularne promjene glioma simultacijskom analizom velikog broja gena u platformi za analizu mase, određujući njihovu dijagnostičku vrijednost, prognozu i korelaciju s testovima snimanja; Ii. utvrditi nove molekularne promjene tumora bez HDI mutacije sekvenciranjem egzoma u odabranim slučajevima; (III) Generirati platformu za sekvenciranje posebno dizajniranu za dijagnozu i proučavanje glioma. (Croatian)
18 August 2022
0 references
Gliomas utgör en kliniskt heterogen tumörenhet, som omfattar olika histologiska subtyper och grader. Även om de ännu inte ingår i WHO:s diagnostiska kriterier, har specifika molekylära förändringar identifierats i vissa gliomsubtyper, såsom 1p/19q co-deletion i oligodendroglial tumörer i samband med bättre prognos och svar på behandling. En annan markör för god prognos är mutation i IDH-gener, en tidig händelse i gliomagenesis. Denna mutation har nyligen visat sig orsaka generaliserad hypermetylering av genomet (CIMP+ fenotyp). Vår grupp har beskrivit att denna hypermetylator fenotyp moduleras av förlusten av 1p/19q (kollektivt CD-CIMP+ fenotyp). Fall av god prognos har därför HDI-mutation, 1p/19q-förlust och CD-CIMP±fenotyp. Det är dock lite känt om de molekylära förändringar som är förknippade med HDI-mutationen i frånvaro av samlektion, och molekylära förändringar av tumörer utan HDI-mutation är helt okända. Den senaste storskaliga sekvenseringen av gliomas har identifierat nya återkommande mutationer i vissa gener (CIC, ATRX, H3F3A m.fl.). Vår hypotes är att gliala tumörer kan klassificeras enligt kombinationen av molekylära förändringar de presenterar, med olika prognos och därmed konditionering behandling. Huvudmålen är följande: I) analysera de molekylära förändringarna av gliomas genom samtidig mutationsanalys av ett stort antal gener i en massanalysplattform och fastställa deras diagnostiska värde, prognos och korrelation med avbildningstester, II) identifiera nya molekylära förändringar i tumörer utan HDI-mutation genom att sekvensera exomen i utvalda fall; (III) Skapa en sekvenseringsplattform speciellt utformad för diagnos och studie av gliomas. (Swedish)
18 August 2022
0 references
Glioamele constituie o entitate tumorală eterogenă clinic, cuprinzând diferite subtipuri și grade histologice. Deși acestea nu sunt încă incluse în criteriile de diagnostic OMS, au fost identificate modificări moleculare specifice în unele subtipuri de gliom, cum ar fi co-deleția 1p/19q în tumorile oligodendrogliale asociate cu un prognostic mai bun și un răspuns mai bun la tratament. Un alt marker al prognosticului bun este mutația genelor IDH, un eveniment precoce în gliomageneză. Recent, s-a demonstrat că această mutație determină hipermetilarea generalizată a genomului (fenotipul CIMP+). Grupul nostru a descris că acest fenotip hipermetilator este modulat de pierderea 1p/19q (colectiv CD-CIMP + fenotip). Prin urmare, cazurile de prognostic bun au mutație HDI, pierdere 1p/19q și fenotip CD-CIMP+. Cu toate acestea, se cunosc puține modificări moleculare asociate cu mutația HDI în absența co-lecției, iar modificările moleculare ale tumorilor fără mutație HDI sunt total necunoscute. Activitatea recentă de secvențiere pe scară largă a glioamelor a identificat mutații recurente noi în unele gene (CIC, ATRX, H3F3A, printre altele). Ipoteza noastră este că tumorile gliale pot fi clasificate în funcție de combinația de modificări moleculare pe care le prezintă, având prognostic diferit și, astfel, condiționarea tratamentului. Principalele obiective sunt: (I) să analizeze modificările moleculare ale glioamelor prin analiza mutațială simultană a unui număr mare de gene într-o platformă de analiză a masei, determinând valoarea diagnostică, prognosticul și corelarea acestora cu testele imagistice; (II) identificarea unor noi modificări moleculare în tumori fără mutație HDI prin secvențierea exomului în cazuri selectate; (III) Generați o platformă de secvențiere special concepută pentru diagnosticarea și studiul glioamelor. (Romanian)
18 August 2022
0 references
Gliomi predstavljajo klinično heterogeno tumorsko entiteto, ki obsega različne histološke podtipe in stopnje. Čeprav še niso vključeni v diagnostična merila SZO, so bile pri nekaterih podtipih glioma, kot je sočrtanje 1p/19q pri oligodendroglialnih tumorjih, ugotovljene specifične molekularne spremembe, povezane z boljšo prognozo in odzivom na zdravljenje. Drug označevalec dobre prognoze je mutacija v genih IDH, zgodnji dogodek v gliomagenezi. Nedavno so dokazali, da ta mutacija povzroča generalizirano hipermetilacijo genoma (CIMP+ fenotip). Naša skupina je opisala, da se ta fenotip hipermetilatorja modulira z izgubo 1p/19q (skupaj CD-CIMP+ fenotip). Zato imajo primeri dobre prognoze mutacijo HDI, izgubo 1p/19q in fenotip CD-CIMP+. Vendar pa je malo znanega o molekularnih spremembah, povezanih z mutacijo HDI v odsotnosti kolekcije, molekularne spremembe tumorjev brez mutacije HDI pa so popolnoma neznane. Nedavno obsežno sekvenciranje gliomov je odkrilo nove ponavljajoče se mutacije v nekaterih genih (med drugim CIC, ATRX, H3F3A). Naša hipoteza je, da lahko glialne tumorje razvrstimo glede na kombinacijo molekularnih sprememb, ki jih predstavljajo, imajo različne prognoze in s tem kondicionirajo zdravljenje. Glavni cilji so: (I) analizira molekularne spremembe gliomov s hkratno mutacijsko analizo velikega števila genov na platformi za analizo mase, pri čemer določi njihovo diagnostično vrednost, prognozo in korelacijo s slikovnimi testi; (II) identificirati nove molekularne spremembe tumorjev brez mutacije HDI s sekvenciranjem eksoma v izbranih primerih; (III) Ustvarite platformo za sekvenciranje, ki je posebej zasnovana za diagnosticiranje in preučevanje gliomov. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
Glejaki stanowią klinicznie niejednorodny organizm nowotworowy, obejmujący różne podtypy i stopnie histologiczne. Chociaż nie zostały one jeszcze uwzględnione w kryteriach diagnostycznych WHO, w niektórych podtypach glejaka zidentyfikowano specyficzne zmiany molekularne, takie jak współdelecja 1p/19q w guzach oligodendroglialnych związanych z lepszym prognozowaniem i odpowiedzią na leczenie. Innym markerem dobrych rokowań jest mutacja genów IDH, wczesne zdarzenie w gliomagenezie. Ostatnio wykazano, że mutacja ta powoduje uogólnioną hipermetylację genomu (CIMP + fenotyp). Nasza grupa opisała, że fenotyp hipermetylowy jest modulowany przez utratę 1p/19q (łącznie fenotyp CD-CIMP+). Dlatego przypadki dobrej prognozy mają mutację HDI, utratę 1p/19q i fenotyp CD-CIMP+. Jednak niewiele wiadomo o zmianach molekularnych związanych z mutacją HDI przy braku współlekcji, a zmiany molekularne guzów bez mutacji HDI są całkowicie nieznane. Ostatnie prace sekwencjonowania glejaków na dużą skalę zidentyfikowały nowe nawracające mutacje w niektórych genach (m.in. CIC, ATRX, H3F3A). Nasza hipoteza jest taka, że guzy glejakowe mogą być klasyfikowane zgodnie z kombinacją zmian molekularnych, które występują, mając różne prognozy, a tym samym leczenie kondycjonujące. Główne cele to: Analizować zmiany molekularne glejaków poprzez równoczesną analizę mutacji dużej liczby genów na platformie analizy masowej, określając ich wartość diagnostyczną, prognozowanie i korelację z badaniami obrazowymi; Identyfikacja nowych zmian molekularnych nowotworów bez mutacji HDI poprzez sekwencjonowanie exomu w wybranych przypadkach; (III) Wygenerowanie platformy sekwencjonowania specjalnie zaprojektowanej do diagnozowania i badania glejaków. (Polish)
18 August 2022
0 references
Toledo
0 references
21 December 2023
0 references
Identifiers
PI13_00800
0 references