Development of a research centre for functional and genomic analysis of special cells at the University of Pécs (Q3923195): Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
(Changed an Item: fix budget) |
(Changed an Item: Change because item Q3959590 was merged with Q3961733) |
||
| Property / beneficiary | Property / beneficiary | ||
Q3961733 (Deleted Item) | |||
Revision as of 12:35, 23 May 2022
Project Q3923195 in Hungary
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Development of a research centre for functional and genomic analysis of special cells at the University of Pécs |
Project Q3923195 in Hungary |
Statements
737,586,000.0 forint
0 references
737,586,000.0 forint
0 references
100.0 percent
0 references
1 March 2017
0 references
22 September 2020
0 references
PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM
0 references
Q3961733 (Deleted Item)
0 references
46°4'35.72"N, 18°13'40.94"E
0 references
A projekt során megvalósítani kívánt feladatok: A kis mennyiségben előforduló speciális sejtek sok betegségben játszanak kritikus szerepet, mint a rákos folyamatok progressziójában a rák őssejtek, vagy őssejthez hasonló sejtek. Az ismert, hogy a citosztatikus kezelés a túlélő rák sejtekben megnöveli a rák őssejtek transzkripciós faktorainak a kifejeződését, amelyek meghatározó szerepet játszanak a citosztatikus rezisztencia kialakulásában, metasztázisok képződésében és a kezelés hatékonyságának lecsökkenésében. Ezért a rák őssejtek, vagy őssejthez hasonló sejtek kialakulása nagy hatással van a betegek túlélési esélyeire. Ugyanakkor e kis számban előforduló speciális sejtek tanulmányozása technikai akadályokba ütközik, amennyiben a kis mennyiségek kimutatása speciális eszközparkot igényel. Másfelől, a vonatkozó vizsgálatok azt is megkövetelik, hogy dedikált eszközrendszeren, a steril körülmények és szállítási útvonalak minőségellenőrzött biztosítása is rendelkezésre álljon. Ez indokolja annak a szükségességét, hogy egy olyan specializált kutatóközpont létrehozására van szükség a PTE-n, amely ezeknek a kis számban előforduló speciális sejteknek az elválasztását, és ezt követően tulajdonságaik megismerését lehetővé teszi. A mitokondrim állapotának a hatása az őssejt markerek kifejeződésére. A rák őssejtek, vagy őssejthez hasonló sejtek nagytisztaságú elválasztása a Flow-citométer, sejt szorter rendszerrel történik, a metabolikus vizsgálatokat a Seahorse készülékkel hajtjuk végre és az izolált kis mennyiségben meglévő sejtek analízisét steril körülmények közt (pl. hosszú távú mitokondriális funkció változásának vizsgálata) a CO2 termosztáthoz kapcsolt fluoreszcens mikroszkóp (ImageXpress Micro XLS High Content Screening rendszer)-el végezzük. A citostatikus kezelés hatására a rák sejtekből kiszabaduló mikropartikulumok és plazma membrán fragmentumok összefüggésben vannak a sejthalállal és a sejtek transzformációival mely adatok alapján új információt kapunk a citosztatikumok sejthalált okozó hatásairól. Ezek a vizsgálatok feltárják a mitokondium szerepét a citosztatikum indukálta rák őssejtek, vagy őssejthez hasonló sejtek reprogramozásáról és hozzá járulnak a mitokondriális regulációs lehetőségek megismeréséhez. A mitokondrium funkció változásának a hatása a rák őssejtek, vagy őssejthez hasonló sejtek expressziós profiljának a változásához. A szerény mennyiségben lévő sejtekből reprodukálható RNS és DNS izolálás az AS4500 Maxwell RSC System DNS RNS izoláló automata rendszerrel történik és RNS minőség analízisét az Agilent 2100 Bioanalyzer speciális berendezéssel végezzük el a mRNS profilt. Az mRNS profilt vagy az Illumina MiniSeq rendszerrrel mérjük meg, vagy az Affimetrix array rendszerével, az eredmények validálása a membrán rendszer állapotának hatása a rák sejtek őssejtté történő reprogramozásának. Ezen felül ezek a fejlesztések teszik lehetővé az expressziós profilok változásának analízisét, amellyel információt kaphatunk arra vonatkozóan, hogyan tudjuk eltüntetni a rákos őssejtekre jellemző expressziós profilt. Továbbá, vizsgálni fogjuk a citosztatikus kezelés által indukált mutációk kialakulását, amely folyamat kiemelt fontosságú a tumor és áttételképződésben, ennek vizsgálata a 384 lyukú qPCR rendszerrel történik. Ezen adatok alapján határozhatjuk meg a mitokondriális jelátviteli utakat melyek elvezetnek a génexpressziók mitokondiális szabályozásához. A mitokondriális állapotok és a membrán potenciál szabályozásának lehetősége szintetikus kismolekulákkal. Számos publikáció igazolta, hogy mitokondriumok is fontos szerepet játszanak a rák sejtek őssejt jellegének („stemness”) fenntartásában, így felvetődik az a lehetőség, hogy a mitokondriális membrán potenciál megváltoztatása a mitokondriumba irányított molekulákon keresztül megváltoztathatná a ráksejtek őssejt jellegét. Korábban végzett vizsgálatainkban már jelezték, hogy a mitokondriumba irányított molekulák kedvezően hatnak a rák sejtekre, nevezetesen a sejthalál irányába tolják el a jelátviteli folyamatokat. Ezek az adatok jelzik a mitokondriumba irányított molekuláknak a lehetséges szerepét a citosztatikum rezisztencia megszüntetésében, így az N-oxil-pirrolidin-hoz kapcsolt foszfóniumsók esetében. Ezen a területen rendelkezünk olyan kutatási tapasztalatokkal, amelyek birtokában sikerrel kísérelhetjük meg az új típusú, minkét szerkezeti elemet tartalmazó konjugátumok szintézisét. Ezen vizsgálatok kimutathatják azokat a kémiai lehetőségeket, melyeken keresztül a rák sejtek elpusztíthatók a rák őssejté alakulása előtt. A szintetikus kémiai lehetőségek tovább fejlesztése, mitokondriumba irányított molekulák szintézise. A mitokondrium destabilizációját okozó célvegyületek között több funkcionalizált karbonsavamid, laktám, aldehid, kis moláris tömegű királis vegyület, királis építőelem szerepel, amelyek szintézise az előkísérletek ismeretében megvalósítható. A munkacsoport több évtizedes, heterociklusos vegyületek szintézise területén szerzett tapa (Hungarian)
0 references
Tasks to be implemented in the course of the project: Small-scale specialised cells play a critical role in many diseases, such as cancer stem cells or stem cells in the progression of cancer processes. Cytostatic therapy in surviving cancer cells is known to increase the expression of cancer stem cell transcription factors, which play a decisive role in the development of cytostatic resistance, metastases and reduced treatment effectiveness. Therefore, the development of cancer stem cells or cells similar to stem cells has a major impact on patients’ chances of survival. However, there are technical barriers to the study of these small numbers of special cells if the detection of small quantities requires a special set of devices. On the other hand, the relevant studies also require the availability of a dedicated system of equipment, the quality control of sterile conditions and transport routes. This justifies the need to set up a specialised research centre at the PTE to separate these small numbers of special cells and subsequently learn about their properties. The effect of mitochondrim on the expression of stem cell markers. The high purity separation of cancer stem cells or stem cell-like cells is performed by the Flow-citometer, cell sorter system, the metabolic studies are performed with Seahorse and the analysis of isolated small amounts of existing cells is performed under sterile conditions (e.g. examination of changes in long-term mitochondrial function) using the fluorescent microscope (ImageXpress Micro XLS High Content Screening system) connected to the CO2 thermostat. Microparticles and plasma membrane fragments released from cancer cells as a result of cytostatic therapy are associated with cell death and cell transformations, which provide new information on the cell death effects of cytostatics. These studies reveal the role of mitochondium in reprogramming cytostatic-induced cancer stem cells or stem cell-like cells and contribute to understanding mitochondrial regulation possibilities. The effect of changes in mitochondrium function on changes in the expression profile of cancer stem cells or stem cells. Reproducible RNA and DNA isolation from modest cells are performed by the AS4500 Maxwell RSC System DNA RNA isolation automatic system and the quality analysis of RNA is performed using the Agilent 2100 Bioanalyser special equipment for the mRNA profile. The mRNA profile is measured either by the Illumina MiniSeq system or by the Affimetrix array system, the validation of results is the effect of the reprogramming of cancer cells into stem cells. In addition, these improvements make it possible to analyse changes in expression profiles, which can provide information on how to remove the expression profile typical of cancer stem cells. In addition, we will investigate the development of mutations induced by cytostatic therapy, a process that is of paramount importance in tumor and transmission formation, which is tested with the 384 hole qPCR system. Based on these data, we can determine mitochondrial transmission paths that lead to mitochondial regulation of gene expressions. The possibility of controlling mitochondrial states and membrane potential with synthetic small molecules. Several publications have shown that mitochondria also play an important role in maintaining the stem cell character of cancer cells, thus raising the possibility that changing the mitochondrial membrane potential through molecules directed into mitochondrium could change the stem cell character of cancer cells. In our previous studies, it has already been indicated that molecules directed into mitochondrium have a positive effect on cancer cells, namely shifting signalling processes towards cell death. These data indicate the potential role of mitochondrium-directed molecules in the elimination of cytostatic resistance, such as phosphonium salts associated with N-oxylpyrrolidine. In this area, we have research experience that will enable us to successfully attempt the synthesis of new types of conjugates containing both structural elements. These studies may show the chemical potential through which cancer cells can be destroyed before the cancer develops into stem cells. Further development of synthetic chemical potential, synthesis of molecules directed into mitochondrium. The target compounds that cause the destabilisation of mitochondrium include several functionalised carboxylic acidamides, lactams, aldehyde, small molar mass kiral compounds, chiral building blocks, the synthesis of which can be achieved in advance. Tapa acquired in the field of the synthesis of heterocyclic compounds for decades (English)
8 February 2022
0 references
Tâches à mettre en œuvre dans le cadre du projet: Les cellules spécialisées à petite échelle jouent un rôle critique dans de nombreuses maladies, telles que les cellules souches cancéreuses ou les cellules souches dans la progression des processus de cancer. La thérapie cytostatique dans les cellules cancéreuses survivantes est connue pour augmenter l’expression des facteurs de transcription des cellules souches cancéreuses, qui jouent un rôle décisif dans le développement de la résistance cytostatique, les métastases et la réduction de l’efficacité du traitement. Par conséquent, le développement de cellules souches cancéreuses ou de cellules similaires aux cellules souches a un impact majeur sur les chances de survie des patients. Toutefois, il existe des obstacles techniques à l’étude de ces petits nombres de cellules spéciales si la détection de petites quantités nécessite un ensemble spécial de dispositifs. D’autre part, les études pertinentes exigent également la disponibilité d’un système spécifique d’équipements, le contrôle de la qualité des conditions stériles et les itinéraires de transport. Cela justifie la nécessité de mettre en place un centre de recherche spécialisé au PTE pour séparer ces petits nombres de cellules spéciales et en apprendre davantage sur leurs propriétés. L’effet du mitochondrim sur l’expression des marqueurs de cellules souches. La séparation de haute pureté des cellules souches cancéreuses ou des cellules semblables à des cellules souches est effectuée par le Citomètre à flux, système de triage cellulaire, les études métaboliques sont effectuées avec Seahorse et l’analyse de petites quantités isolées de cellules existantes est effectuée dans des conditions stériles (par exemple, examen des modifications de la fonction mitochondriale à long terme) à l’aide du microscope fluorescent (ImageXpress Micro XLS High Content Screening System) connecté au thermostat CO2. Les microparticules et les fragments de membrane plasmatique libérés par les cellules cancéreuses à la suite d’une thérapie cytostatique sont associés à la mort cellulaire et aux transformations cellulaires, qui fournissent de nouvelles informations sur les effets de la mort cellulaire des cytostatiques. Ces études révèlent le rôle du mitochondium dans la reprogrammation de cellules souches cancéreuses induites par cytostatique ou de cellules semblables à des cellules souches et contribuent à comprendre les possibilités de régulation mitochondriale. L’effet des changements dans la fonction du mitochondrium sur les changements dans le profil d’expression des cellules souches cancéreuses ou des cellules souches. L’isolement reproductible de l’ARN et de l’ADN à partir de cellules modestes est effectué par le système automatique d’isolement automatique de l’ARN d’ADN AS4500 Maxwell et l’analyse de la qualité de l’ARN est réalisée à l’aide de l’équipement spécial Agilent 2100 Bioanalyseur pour le profil d’ARNm. Le profil de l’ARNm est mesuré soit par le système Illumina MiniSeq, soit par le système Affimetrix, la validation des résultats est l’effet de la reprogrammation des cellules cancéreuses en cellules souches. En outre, ces améliorations permettent d’analyser les changements dans les profils d’expression, qui peuvent fournir des informations sur la manière de supprimer le profil d’expression typique des cellules souches cancéreuses. En outre, nous étudierons le développement des mutations induites par la thérapie cytostatique, un processus qui est d’une importance primordiale dans la formation de tumeurs et de transmission, qui est testé avec le système qPCR de 384 trous. Sur la base de ces données, nous pouvons déterminer les voies de transmission mitochondriale qui conduisent à la régulation mitochondiale des expressions géniques. La possibilité de contrôler les états mitochondriaux et le potentiel membranaire avec de petites molécules synthétiques. Plusieurs publications ont montré que les mitochondries jouent également un rôle important dans le maintien du caractère de cellules souches des cellules cancéreuses, ce qui augmente la possibilité que la modification du potentiel membranaire mitochondrial par des molécules dirigées vers le mitochondrium puisse modifier le caractère des cellules souches des cellules cancéreuses. Dans nos études précédentes, il a déjà été indiqué que les molécules dirigées vers le mitochondrium ont un effet positif sur les cellules cancéreuses, à savoir le déplacement des processus de signalisation vers la mort cellulaire. Ces données indiquent le rôle potentiel des molécules dirigées par le mitochondrium dans l’élimination de la résistance cytostatique, comme les sels de phosphonium associés à la N-oxylpyrrolidine. Dans ce domaine, nous disposons d’une expérience de recherche qui nous permettra d’essayer avec succès la synthèse de nouveaux types de conjugués contenant les deux éléments structurels. Ces études peuvent montrer le potentiel chimique par lequel les cellules cancéreu... (French)
10 February 2022
0 references
Pécs, Baranya
0 references
Identifiers
GINOP-2.3.3-15-2016-00025
0 references