TRANSMISSION SOURCES OF ESCHERICHIA COLI PANDEMIC CLONAL GROUP ST131. MOLECULAR CHARACTERISATION OF THE PATHOGEN AND ITS VIRULENCE IN VIVO, RISK ASSESSMENT AND CONTROL (Q3136046): Difference between revisions
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FONTI DI TRASMISSIONE DEL GRUPPO CLONALE PANDEMICO ESCHERICHIA COLI ST131. CARATTERIZZAZIONE MOLECOLARE DELL'AGENTE PATOGENO E SUA VIRULENZA IN VIVO, VALUTAZIONE E CONTROLLO DEL RISCHIO | |||||||||||||||
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LO STUDIO DI RICERCA PROPOSTO IN QUESTA APPLICAZIONE RIENTRA NELLA SFIDA "SICUREZZA E QUALITÀ DEGLI ALIMENTI". IL GRUPPO CLONALE DI E. COLI ST131 ROMPE IL PARADIGMA DELL'INCOMPATIBILITÀ DEI GENI DELLA RESISTENZA AGLI ANTIBIOTICI E QUELLI DELLA VIRULENZA IN QUELLI DEI PATOGENI EXTRAINTESTINALI DI E. COLI (PREVEDI). SIN DALLA SUA IDENTIFICAZIONE A LIVELLO INTERCONTINENTALE, NEL 2008, QUESTO GRUPPO CLONALE HA AVUTO UNA SPETTACOLARE ESPANSIONE, ATTUALMENTE RAPPRESENTANDO OLTRE IL 50 % DEI CEPPI DI LATTAMASI A SPETTRO ESTESO (ESBL) CHE PRODUCONO BETA E OLTRE IL 30 % DEI CEPPI DI EXPEC RESISTENTI AI FARMACI. IN QUESTO PROGETTO VOGLIAMO DEFINIRE CHIARAMENTE LE VIE E LE FONTI DI TRASMISSIONE DEL GRUPPO CLONALE ST131, SE ESISTE UN RISCHIO, E QUALE GRADO DI RISCHIO NEL CONSUMO DI CARNE PROVENIENTE DA ANIMALI DA PRODUZIONE E QUALI MISURE DI CONTROLLO POSSONO ESSERE APPLICATE NELLA CATENA ALIMENTARE. VOGLIAMO ANCHE ANALIZZARE IL RUOLO DELLA FAUNA SELVATICA NELLA MANUTENZIONE E NELLA DIFFUSIONE DEI CEPPI ST131. NELLO SPECIFICO STUDIEREMO UCCELLI SELVATICI, VOLPI E GIABALIE, CHE A CAUSA DELLA LORO ESPLOSIONE DEMOGRAFICA MANTENGONO ATTUALMENTE UN IMPORTANTE CONTATTO CON GLI ANIMALI DI PRODUZIONE E GLI INSEDIAMENTI UMANI. SECONDO I NOSTRI DATI QUESTA È LA PRIMA VOLTA CHE VOLPI E JABALIES SONO INDAGATI COME PORTATORI DI CEPPI ST131, E ANCHE SE SE ST131 CEPPI DI UCCELLI SELVATICI SONO STATI ISOLATI IN DIVERSI PAESI, I LORO VIROTIPOS NON SONO STATI STABILITI NÉ CONFRONTATI CON I CEPPI RESPONSABILI DELLE INFEZIONI NELL'UOMO. ESEGUIREMO UNA DETTAGLIATA CARATTERIZZAZIONE MOLECOLARE (MLST, PFGE, SEQUENZIAMENTO COMPLETO DEL GENOMA PER DEFINIRE I GENI DELLA VIRULENZA E LE ISOLE DI PATOGENICITÀ) DEI CEPPI ST131 ISOLATI DAL CIBO E DAGLI ANIMALI, E DETERMINEREMO LA LORO VIRULENZA IN VIVO IN UN MODELLO DI SEPSI MURINA. CONFRONTIAMO I DATI OTTENUTI CON QUELLI DEI CEPPI ST131 CHE CAUSANO PATOLOGIA NELL'UOMO. L'OBIETTIVO È CHE I RISULTATI ABBIANO UN IMPATTO SULLA SALUTE PUBBLICA E SULLA SICUREZZA ALIMENTARE ATTRAVERSO UNA MAGGIORE CONOSCENZA DEI MECCANISMI CHE RENDONO QUESTO GRUPPO CLONALE EFFICACE DAL PUNTO DI VISTA DELLA VIRULENZA E DELLA DIFFUSIONE. L'IMPATTO SCIENTIFICO DEI RISULTATI È PIENAMENTE GARANTITO E ACCREDITATO DALL'INDICE AD ALTO IMPATTO DELLE PUBBLICAZIONI CHE ABBIAMO PRODOTTO DAL 2008 FORMASEMOS PARTE DEL CONSORZIO INTERNAZIONALE CHE HA DIMOSTRATO LA DISTRIBUZIONE INTERCONTINENTALE DEL GRUPPO CLONALE ST131. (Italian) | |||||||||||||||
| Property / summary: LO STUDIO DI RICERCA PROPOSTO IN QUESTA APPLICAZIONE RIENTRA NELLA SFIDA "SICUREZZA E QUALITÀ DEGLI ALIMENTI". IL GRUPPO CLONALE DI E. COLI ST131 ROMPE IL PARADIGMA DELL'INCOMPATIBILITÀ DEI GENI DELLA RESISTENZA AGLI ANTIBIOTICI E QUELLI DELLA VIRULENZA IN QUELLI DEI PATOGENI EXTRAINTESTINALI DI E. COLI (PREVEDI). SIN DALLA SUA IDENTIFICAZIONE A LIVELLO INTERCONTINENTALE, NEL 2008, QUESTO GRUPPO CLONALE HA AVUTO UNA SPETTACOLARE ESPANSIONE, ATTUALMENTE RAPPRESENTANDO OLTRE IL 50 % DEI CEPPI DI LATTAMASI A SPETTRO ESTESO (ESBL) CHE PRODUCONO BETA E OLTRE IL 30 % DEI CEPPI DI EXPEC RESISTENTI AI FARMACI. IN QUESTO PROGETTO VOGLIAMO DEFINIRE CHIARAMENTE LE VIE E LE FONTI DI TRASMISSIONE DEL GRUPPO CLONALE ST131, SE ESISTE UN RISCHIO, E QUALE GRADO DI RISCHIO NEL CONSUMO DI CARNE PROVENIENTE DA ANIMALI DA PRODUZIONE E QUALI MISURE DI CONTROLLO POSSONO ESSERE APPLICATE NELLA CATENA ALIMENTARE. VOGLIAMO ANCHE ANALIZZARE IL RUOLO DELLA FAUNA SELVATICA NELLA MANUTENZIONE E NELLA DIFFUSIONE DEI CEPPI ST131. NELLO SPECIFICO STUDIEREMO UCCELLI SELVATICI, VOLPI E GIABALIE, CHE A CAUSA DELLA LORO ESPLOSIONE DEMOGRAFICA MANTENGONO ATTUALMENTE UN IMPORTANTE CONTATTO CON GLI ANIMALI DI PRODUZIONE E GLI INSEDIAMENTI UMANI. SECONDO I NOSTRI DATI QUESTA È LA PRIMA VOLTA CHE VOLPI E JABALIES SONO INDAGATI COME PORTATORI DI CEPPI ST131, E ANCHE SE SE ST131 CEPPI DI UCCELLI SELVATICI SONO STATI ISOLATI IN DIVERSI PAESI, I LORO VIROTIPOS NON SONO STATI STABILITI NÉ CONFRONTATI CON I CEPPI RESPONSABILI DELLE INFEZIONI NELL'UOMO. ESEGUIREMO UNA DETTAGLIATA CARATTERIZZAZIONE MOLECOLARE (MLST, PFGE, SEQUENZIAMENTO COMPLETO DEL GENOMA PER DEFINIRE I GENI DELLA VIRULENZA E LE ISOLE DI PATOGENICITÀ) DEI CEPPI ST131 ISOLATI DAL CIBO E DAGLI ANIMALI, E DETERMINEREMO LA LORO VIRULENZA IN VIVO IN UN MODELLO DI SEPSI MURINA. CONFRONTIAMO I DATI OTTENUTI CON QUELLI DEI CEPPI ST131 CHE CAUSANO PATOLOGIA NELL'UOMO. L'OBIETTIVO È CHE I RISULTATI ABBIANO UN IMPATTO SULLA SALUTE PUBBLICA E SULLA SICUREZZA ALIMENTARE ATTRAVERSO UNA MAGGIORE CONOSCENZA DEI MECCANISMI CHE RENDONO QUESTO GRUPPO CLONALE EFFICACE DAL PUNTO DI VISTA DELLA VIRULENZA E DELLA DIFFUSIONE. L'IMPATTO SCIENTIFICO DEI RISULTATI È PIENAMENTE GARANTITO E ACCREDITATO DALL'INDICE AD ALTO IMPATTO DELLE PUBBLICAZIONI CHE ABBIAMO PRODOTTO DAL 2008 FORMASEMOS PARTE DEL CONSORZIO INTERNAZIONALE CHE HA DIMOSTRATO LA DISTRIBUZIONE INTERCONTINENTALE DEL GRUPPO CLONALE ST131. (Italian) / rank | |||||||||||||||
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| Property / summary: LO STUDIO DI RICERCA PROPOSTO IN QUESTA APPLICAZIONE RIENTRA NELLA SFIDA "SICUREZZA E QUALITÀ DEGLI ALIMENTI". IL GRUPPO CLONALE DI E. COLI ST131 ROMPE IL PARADIGMA DELL'INCOMPATIBILITÀ DEI GENI DELLA RESISTENZA AGLI ANTIBIOTICI E QUELLI DELLA VIRULENZA IN QUELLI DEI PATOGENI EXTRAINTESTINALI DI E. COLI (PREVEDI). SIN DALLA SUA IDENTIFICAZIONE A LIVELLO INTERCONTINENTALE, NEL 2008, QUESTO GRUPPO CLONALE HA AVUTO UNA SPETTACOLARE ESPANSIONE, ATTUALMENTE RAPPRESENTANDO OLTRE IL 50 % DEI CEPPI DI LATTAMASI A SPETTRO ESTESO (ESBL) CHE PRODUCONO BETA E OLTRE IL 30 % DEI CEPPI DI EXPEC RESISTENTI AI FARMACI. IN QUESTO PROGETTO VOGLIAMO DEFINIRE CHIARAMENTE LE VIE E LE FONTI DI TRASMISSIONE DEL GRUPPO CLONALE ST131, SE ESISTE UN RISCHIO, E QUALE GRADO DI RISCHIO NEL CONSUMO DI CARNE PROVENIENTE DA ANIMALI DA PRODUZIONE E QUALI MISURE DI CONTROLLO POSSONO ESSERE APPLICATE NELLA CATENA ALIMENTARE. VOGLIAMO ANCHE ANALIZZARE IL RUOLO DELLA FAUNA SELVATICA NELLA MANUTENZIONE E NELLA DIFFUSIONE DEI CEPPI ST131. NELLO SPECIFICO STUDIEREMO UCCELLI SELVATICI, VOLPI E GIABALIE, CHE A CAUSA DELLA LORO ESPLOSIONE DEMOGRAFICA MANTENGONO ATTUALMENTE UN IMPORTANTE CONTATTO CON GLI ANIMALI DI PRODUZIONE E GLI INSEDIAMENTI UMANI. SECONDO I NOSTRI DATI QUESTA È LA PRIMA VOLTA CHE VOLPI E JABALIES SONO INDAGATI COME PORTATORI DI CEPPI ST131, E ANCHE SE SE ST131 CEPPI DI UCCELLI SELVATICI SONO STATI ISOLATI IN DIVERSI PAESI, I LORO VIROTIPOS NON SONO STATI STABILITI NÉ CONFRONTATI CON I CEPPI RESPONSABILI DELLE INFEZIONI NELL'UOMO. ESEGUIREMO UNA DETTAGLIATA CARATTERIZZAZIONE MOLECOLARE (MLST, PFGE, SEQUENZIAMENTO COMPLETO DEL GENOMA PER DEFINIRE I GENI DELLA VIRULENZA E LE ISOLE DI PATOGENICITÀ) DEI CEPPI ST131 ISOLATI DAL CIBO E DAGLI ANIMALI, E DETERMINEREMO LA LORO VIRULENZA IN VIVO IN UN MODELLO DI SEPSI MURINA. CONFRONTIAMO I DATI OTTENUTI CON QUELLI DEI CEPPI ST131 CHE CAUSANO PATOLOGIA NELL'UOMO. L'OBIETTIVO È CHE I RISULTATI ABBIANO UN IMPATTO SULLA SALUTE PUBBLICA E SULLA SICUREZZA ALIMENTARE ATTRAVERSO UNA MAGGIORE CONOSCENZA DEI MECCANISMI CHE RENDONO QUESTO GRUPPO CLONALE EFFICACE DAL PUNTO DI VISTA DELLA VIRULENZA E DELLA DIFFUSIONE. L'IMPATTO SCIENTIFICO DEI RISULTATI È PIENAMENTE GARANTITO E ACCREDITATO DALL'INDICE AD ALTO IMPATTO DELLE PUBBLICAZIONI CHE ABBIAMO PRODOTTO DAL 2008 FORMASEMOS PARTE DEL CONSORZIO INTERNAZIONALE CHE HA DIMOSTRATO LA DISTRIBUZIONE INTERCONTINENTALE DEL GRUPPO CLONALE ST131. (Italian) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 16 January 2022
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Revision as of 10:41, 16 January 2022
Project Q3136046 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | TRANSMISSION SOURCES OF ESCHERICHIA COLI PANDEMIC CLONAL GROUP ST131. MOLECULAR CHARACTERISATION OF THE PATHOGEN AND ITS VIRULENCE IN VIVO, RISK ASSESSMENT AND CONTROL |
Project Q3136046 in Spain |
Statements
91,960.0 Euro
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114,950.0 Euro
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80.0 percent
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1 January 2014
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30 June 2017
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UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA
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43°2'46.39"N, 7°28'26.36"W
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27028
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EL ESTUDIO DE INVESTIGACION PROPUESTO EN LA PRESENTE SOLICITUD SE ENMARCA DENTRO DEL RETO "SEGURIDAD Y CALIDAD ALIMENTARIA". EL GRUPO CLONAL DE E. COLI ST131 ROMPE EL PARADIGMA DE LA INCOMPATIBILIDAD DE LOS GENES DE RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS Y LOS DE VIRULENCIA EN LOS DE E. COLI PATOGENOS EXTRAINTESTINALES (EXPEC). DESDE SU IDENTIFICACION A NIVEL INTERCONTINENTAL, EN EL AÑO 2008, ESTE GRUPO CLONAL HA TENIDO UNA EXPANSION ESPECTACULAR, REPRESENTANDO EN LA ACTUALIDAD MAS DEL 50% DE LAS CEPAS PRODUCTORAS DE BETA LACTAMASAS DE ESPECTRO EXTENDIDO (ESBL) Y MAS DEL 30% DE LAS CEPAS DE EXPEC MULTIRRESISTENTES. EN EL PRESENTE PROYECTO QUEREMOS DEFINIR CLARAMENTE CUALES SON LAS RUTAS Y FUENTES DE TRANSMISION DEL GRUPO CLONAL ST131, SI EXISTE RIESGO, Y QUE GRADO DE RIESGO EN EL CONSUMO DE CARNE DE ANIMALES DE PRODUCCION, Y QUE MEDIDAS DE CONTROL SE PUEDEN APLICAR EN LA CADENA ALIMENTARIA. QUEREMOS ANALIZAR TAMBIEN EL PAPEL DE LA FAUNA SILVESTRE EN EL MANTENIMIENTO Y DISEMINACION DE CEPAS ST131. CONCRETAMENTE ESTUDIAREMOS AVES SILVESTRES, ZORROS Y JABALIES, QUE POR SU EXPLOSION DEMOGRAFICA MANTIENEN ACTUALMENTE UN IMPORTANTE CONTACTO CON ANIMALES DE PRODUCCION Y ASENTAMIENTOS HUMANOS. SEGUN NUESTROS DATOS ES LA PRIMERA VEZ SE INVESTIGAN LOS ZORROS Y LOS JABALIES COMO PORTADORES DE CEPAS ST131, Y AUNQUE SI SE HAN AISLADO CEPAS ST131 DE AVES SILVESTRES EN VARIOS PAISES, NO SE HAN ESTABLECIDO SUS VIROTIPOS NI SE HAN COMPARADO CON LAS CEPAS RESPONSABLES DE INFECCIONES EN SERES HUMANOS. VAMOS A REALIZAR UNA DETALLADA CARACTERIZACION MOLECULAR (MLST, PFGE, SECUENCIACION COMPLETA DEL GENOMA PARA DEFINIR GENES DE VIRULENCIA E ISLAS DE PATOGENICIDAD) DE LAS CEPAS ST131 AISLADAS DE ALIMENTOS Y ANIMALES, Y DETERMINAREMOS SU VIRULENCIA IN VIVO EN UN MODELO DE SEPSIS MURINO. COMPARAREMOS LOS DATOS OBTENIDOS CON LOS DE LAS CEPAS ST131 CAUSANTES DE PATOLOGIA EN SERES HUMANOS. EL OBJETIVO ES QUE LOS RESULTADOS REPERCUTAN EN LA SALUD PUBLICA Y LA SEGURIDAD ALIMENTARIA A TRAVES DE UN MAYOR CONOCIMIENTO DE LOS MECANISMOS QUE HACEN EXITOSO A ESTE GRUPO CLONAL DESDE EL PUNTO DE VISTA DE LA VIRULENCIA Y LA DISEMINACION. EL IMPACTO CIENTIFICO DE LOS RESULTADOS ESTA TOTALMENTE ASEGURADO Y ACREDITADO POR EL ELEVADO INDICE DE IMPACTO DE LAS PUBLICACIONES QUE VENIMOS REALIZADO DESDE QUE EN EL AÑO 2008 FORMASEMOS PARTE DEL CONSORCIO INTERNACIONAL QUE EVIDENCIO LA DISTRIBUCION INTERCONTINENTAL DEL GRUPO CLONAL ST131. (Spanish)
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THE RESEARCH STUDY PROPOSED IN THIS APPLICATION FALLS WITHIN THE “FOOD SAFETY AND QUALITY” CHALLENGE. THE CLONAL GROUP OF E. COLI ST131 BREAKS THE PARADIGM OF THE INCOMPATIBILITY OF ANTIBIOTIC RESISTANCE GENES AND THOSE OF VIRULENCE IN THOSE OF E. COLI EXTRAINTESTINAL PATHOGENS (EXPEC). SINCE ITS IDENTIFICATION AT THE INTERCONTINENTAL LEVEL, IN 2008, THIS CLONAL GROUP HAS HAD A SPECTACULAR EXPANSION, CURRENTLY ACCOUNTING FOR MORE THAN 50 % OF THE BETA-PRODUCING STRAINS OF EXTENDED SPECTRUM LACTAMASES (ESBL) AND MORE THAN 30 % OF MULTIDRUG RESISTANT EXPEC STRAINS. IN THIS PROJECT WE WANT TO CLEARLY DEFINE THE ROUTES AND SOURCES OF TRANSMISSION OF THE CLONAL GROUP ST131, IF THERE IS A RISK, AND WHAT DEGREE OF RISK IN THE CONSUMPTION OF MEAT FROM PRODUCTION ANIMALS, AND WHICH CONTROL MEASURES CAN BE APPLIED IN THE FOOD CHAIN. WE ALSO WANT TO ANALYSE THE ROLE OF WILDLIFE IN THE MAINTENANCE AND DISSEMINATION OF ST131 STRAINS. SPECIFICALLY WE WILL STUDY WILD BIRDS, FOXES AND JABALIES, WHICH DUE TO THEIR DEMOGRAPHIC EXPLOSION CURRENTLY MAINTAIN IMPORTANT CONTACT WITH ANIMALS OF PRODUCTION AND HUMAN SETTLEMENTS. ACCORDING TO OUR DATA THIS IS THE FIRST TIME FOXES AND JABALIES ARE INVESTIGATED AS CARRIERS OF STRAINS ST131, AND ALTHOUGH IF ST131 STRAINS OF WILD BIRDS HAVE BEEN ISOLATED IN SEVERAL COUNTRIES, THEIR VIROTIPOS HAVE NOT BEEN ESTABLISHED NOR COMPARED TO THE STRAINS RESPONSIBLE FOR INFECTIONS IN HUMANS. WE WILL PERFORM A DETAILED MOLECULAR CHARACTERISATION (MLST, PFGE, COMPLETE GENOME SEQUENCING TO DEFINE VIRULENCE GENES AND ISLANDS OF PATHOGENICITY) OF ST131 STRAINS ISOLATED FROM FOOD AND ANIMALS, AND WE WILL DETERMINE THEIR VIRULENCE IN VIVO IN A MODEL OF MURINE SEPSIS. WE WILL COMPARE THE DATA OBTAINED WITH THOSE OF THE ST131 STRAINS CAUSING PATHOLOGY IN HUMANS. THE OBJECTIVE IS THAT THE RESULTS HAVE AN IMPACT ON PUBLIC HEALTH AND FOOD SAFETY THROUGH GREATER KNOWLEDGE OF THE MECHANISMS THAT MAKE THIS CLONAL GROUP SUCCESSFUL FROM THE POINT OF VIEW OF VIRULENCE AND DISSEMINATION. THE SCIENTIFIC IMPACT OF THE RESULTS IS FULLY ASSURED AND ACCREDITED BY THE HIGH IMPACT INDEX OF THE PUBLICATIONS THAT WE HAVE PRODUCED SINCE 2008 FORMASEMOS PART OF THE INTERNATIONAL CONSORTIUM THAT DEMONSTRATED THE INTERCONTINENTAL DISTRIBUTION OF THE CLONAL GROUP ST131. (English)
12 October 2021
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L’ÉTUDE DE RECHERCHE PROPOSÉE DANS LA PRÉSENTE DEMANDE RELÈVE DU DÉFI DE LA «SÉCURITÉ ET DE LA QUALITÉ DES ALIMENTS». LE GROUPE CLONAL D’E. COLI ST131 ROMPT LE PARADIGME DE L’INCOMPATIBILITÉ DES GÈNES DE RÉSISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES ET CEUX DE LA VIRULENCE CHEZ LES PATHOGÈNES EXTRA-INTESTINAUX D’E. COLI (EXPEC). DEPUIS SON IDENTIFICATION AU NIVEAU INTERCONTINENTAL, EN 2008, CE GROUPE CLONAL A CONNU UNE EXPANSION SPECTACULAIRE, REPRÉSENTANT ACTUELLEMENT PLUS DE 50 % DES SOUCHES PRODUCTRICES DE LACTAMASES À SPECTRE ÉTENDU (ESBL) ET PLUS DE 30 % DES SOUCHES EXPEC MULTIRÉSISTANTES. DANS CE PROJET, NOUS VOULONS DÉFINIR CLAIREMENT LES VOIES ET LES SOURCES DE TRANSMISSION DU GROUPE CLONAL ST131, S’IL Y A UN RISQUE, ET QUEL DEGRÉ DE RISQUE DANS LA CONSOMMATION DE VIANDE PROVENANT D’ANIMAUX DE PRODUCTION, ET QUELLES MESURES DE CONTRÔLE PEUVENT ÊTRE APPLIQUÉES DANS LA CHAÎNE ALIMENTAIRE. NOUS VOULONS ÉGALEMENT ANALYSER LE RÔLE DE LA FAUNE DANS L’ENTRETIEN ET LA DIFFUSION DES SOUCHES ST131. PLUS PRÉCISÉMENT, NOUS ÉTUDIERONS LES OISEAUX SAUVAGES, LES RENARDS ET LES JABALIES, QUI, EN RAISON DE LEUR EXPLOSION DÉMOGRAPHIQUE, ENTRETIENNENT ACTUELLEMENT DES CONTACTS IMPORTANTS AVEC LES ANIMAUX DE PRODUCTION ET LES ÉTABLISSEMENTS HUMAINS. SELON NOS DONNÉES, C’EST LA PREMIÈRE FOIS QUE LES RENARDS ET LES JABALIES SONT ÉTUDIÉS COMME PORTEURS DES SOUCHES ST131, ET BIEN QUE SI DES SOUCHES ST131 D’OISEAUX SAUVAGES AIENT ÉTÉ ISOLÉES DANS PLUSIEURS PAYS, LEUR VIROTIPOS N’A PAS ÉTÉ ÉTABLI NI COMPARÉ AUX SOUCHES RESPONSABLES DES INFECTIONS CHEZ L’HOMME. NOUS EFFECTUERONS UNE CARACTÉRISATION MOLÉCULAIRE DÉTAILLÉE (MLST, PFGE, SÉQUENÇAGE COMPLET DU GÉNOME POUR DÉFINIR LES GÈNES DE VIRULENCE ET LES ÎLES DE PATHOGÉNICITÉ) DES SOUCHES ST131 ISOLÉES DES ALIMENTS ET DES ANIMAUX, ET NOUS DÉTERMINERONS LEUR VIRULENCE IN VIVO DANS UN MODÈLE DE SEPSIS MURINE. NOUS COMPARERONS LES DONNÉES OBTENUES AVEC CELLES DES SOUCHES ST131 CAUSANT UNE PATHOLOGIE CHEZ L’HOMME. L’OBJECTIF EST QUE LES RÉSULTATS AIENT UN IMPACT SUR LA SANTÉ PUBLIQUE ET LA SÉCURITÉ ALIMENTAIRE GRÂCE À UNE MEILLEURE CONNAISSANCE DES MÉCANISMES QUI PERMETTENT À CE GROUPE CLONAL DE RÉUSSIR DU POINT DE VUE DE LA VIRULENCE ET DE LA DIFFUSION. L’IMPACT SCIENTIFIQUE DES RÉSULTATS EST PLEINEMENT ASSURÉ ET ACCRÉDITÉ PAR L’INDICE D’IMPACT ÉLEVÉ DES PUBLICATIONS QUE NOUS AVONS PRODUITES DEPUIS 2008 FORMASEMOS FAISANT PARTIE DU CONSORTIUM INTERNATIONAL QUI A DÉMONTRÉ LA DISTRIBUTION INTERCONTINENTALE DU GROUPE CLONAL ST131. (French)
2 December 2021
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DIE IN DIESER ANWENDUNG VORGESCHLAGENE FORSCHUNGSSTUDIE FÄLLT UNTER DIE HERAUSFORDERUNG „LEBENSMITTELSICHERHEIT UND -QUALITÄT“. DIE KLONALE GRUPPE VON E. COLI ST131 BRICHT DAS PARADIGMA DER INKOMPATIBILITÄT VON ANTIBIOTIKARESISTENZGENEN UND DER VIRULENZ IN DENEN VON E. COLI EXTRAINTESTINALEN KRANKHEITSERREGERN (EXPEC). SEIT IHRER IDENTIFIZIERUNG AUF INTERKONTINENTALER EBENE IM JAHR 2008 HAT DIESE KLONALE GRUPPE EINE SPEKTAKULÄRE EXPANSION VERZEICHNET, AUF DIE DERZEIT MEHR ALS 50 % DER BETA-PRODUZIERENDEN STÄMME VON VERLÄNGERTEN SPEKTRUMS LAKTAMASEN (ESBL) UND MEHR ALS 30 % DER MULTIRESISTENTEN EXPEC-STÄMME ENTFALLEN. IN DIESEM PROJEKT WOLLEN WIR DIE WEGE UND QUELLEN DER ÜBERTRAGUNG DER KLONGRUPPE ST131 KLAR DEFINIEREN, WENN EIN RISIKO BESTEHT UND WELCHES RISIKO BEIM VERZEHR VON FLEISCH VON NUTZTIEREN BESTEHT UND WELCHE KONTROLLMASSNAHMEN IN DER LEBENSMITTELKETTE ANGEWENDET WERDEN KÖNNEN. WIR WOLLEN AUCH DIE ROLLE VON WILDTIEREN BEI DER ERHALTUNG UND VERBREITUNG VON ST131-STÄMMEN ANALYSIEREN. SPEZIELL WERDEN WIR WILDVÖGEL, FÜCHSE UND JABALIES UNTERSUCHEN, DIE AUFGRUND IHRER DEMOGRAFISCHEN EXPLOSION DERZEIT EINEN WICHTIGEN KONTAKT MIT NUTZTIEREN UND MENSCHLICHEN SIEDLUNGEN HABEN. NACH UNSEREN DATEN SIND DIES DAS ERSTE MAL, DASS FÜCHSE UND JABALIES ALS TRÄGER VON STÄMMEN ST131 UNTERSUCHT WERDEN UND OBWOHL ST131 STÄMME VON WILDVÖGELN IN MEHREREN LÄNDERN ISOLIERT WURDEN, IHRE VIROTIPOS WEDER NACHGEWIESEN NOCH MIT DEN STÄMMEN VERGLICHEN WURDEN, DIE FÜR INFEKTIONEN BEIM MENSCHEN VERANTWORTLICH SIND. WIR WERDEN EINE DETAILLIERTE MOLEKULARE CHARAKTERISIERUNG (MLST, PFGE, KOMPLETTE GENOMSEQUENZIERUNG ZUR DEFINITION VON VIRULENZGENEN UND INSELN DER PATHOGENITÄT) VON ST131 STÄMMEN DURCHFÜHREN, DIE VON LEBENSMITTELN UND TIEREN ISOLIERT SIND, UND WIR WERDEN IHRE VIRULENZ IN VIVO IN EINEM MODELL DER MURINE SEPSIS BESTIMMEN. WIR WERDEN DIE GEWONNENEN DATEN MIT DENEN DER ST131-STÄMME VERGLEICHEN, DIE PATHOLOGIE BEIM MENSCHEN VERURSACHEN. ZIEL IST, DASS SICH DIE ERGEBNISSE AUF DIE ÖFFENTLICHE GESUNDHEIT UND DIE LEBENSMITTELSICHERHEIT AUSWIRKEN, INDEM SIE BESSER ÜBER DIE MECHANISMEN INFORMIERT WERDEN, DIE DIESE KLONGRUPPE UNTER DEM GESICHTSPUNKT DER VIRULENZ UND VERBREITUNG ERFOLGREICH MACHEN. DIE WISSENSCHAFTLICHE WIRKUNG DER ERGEBNISSE WIRD DURCH DEN HOHEN WIRKUNGSINDEX DER PUBLIKATIONEN, DIE WIR SEIT 2008 PRODUZIERT HABEN, VOLLSTÄNDIG GESICHERT UND AKKREDITIERT. FORMASEMOS TEIL DES INTERNATIONALEN KONSORTIUMS, DAS DIE INTERKONTINENTALE VERTEILUNG DER KLONGRUPPE ST131 DEMONSTRIERTE. (German)
9 December 2021
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DE IN DEZE AANVRAAG VOORGESTELDE STUDIE VALT ONDER DE UITDAGING „VOEDSELVEILIGHEID EN -KWALITEIT”. DE CLONALE GROEP VAN E. COLI ST131 BREEKT HET PARADIGMA VAN DE ONVERENIGBAARHEID VAN ANTIBIOTICARESISTENTIEGENEN EN DIE VAN VIRULENTIE IN DIE VAN E. COLI EXTRA-INTESTINALE PATHOGENEN (EXPEC). SINDS DE IDENTIFICATIE OP INTERCONTINENTAAL NIVEAU, IN 2008, HEEFT DEZE KLOONGROEP EEN SPECTACULAIRE EXPANSIE GEHAD, DIE MOMENTEEL GOED IS VOOR MEER DAN 50 % VAN DE BÈTAPRODUCERENDE STAMMEN VAN UITGEBREIDE SPECTRUMLACTAMASEN (ESBL) EN MEER DAN 30 % VAN MULTIDRUG RESISTENTE EXPEC STAMMEN. IN DIT PROJECT WILLEN WE DUIDELIJK DE ROUTES EN BRONNEN VAN OVERDRACHT VAN DE KLONALE GROEP ST131 DEFINIËREN, ALS ER EEN RISICO IS, EN WELKE MATE VAN RISICO BIJ DE CONSUMPTIE VAN VLEES VAN PRODUCTIEDIEREN, EN WELKE CONTROLEMAATREGELEN IN DE VOEDSELKETEN KUNNEN WORDEN TOEGEPAST. WE WILLEN OOK DE ROL VAN WILDE DIEREN IN HET ONDERHOUD EN DE VERSPREIDING VAN ST131 STAMMEN ANALYSEREN. IN HET BIJZONDER BESTUDEREN WE WILDE VOGELS, VOSSEN EN JABALIES, DIE DOOR HUN DEMOGRAFISCHE EXPLOSIE MOMENTEEL EEN BELANGRIJK CONTACT ONDERHOUDEN MET PRODUCTIEVE DIEREN EN MENSELIJKE NEDERZETTINGEN. VOLGENS ONZE GEGEVENS IS DIT DE EERSTE KEER DAT VOSSEN EN JABALIES WORDEN ONDERZOCHT ALS DRAGERS VAN STAMMEN ST131, EN HOEWEL ALS ST131 STAMMEN VAN WILDE VOGELS IN VERSCHILLENDE LANDEN ZIJN GEÏSOLEERD, HUN VIROTIPOS NIET ZIJN VASTGESTELD NOCH VERGELEKEN MET DE STAMMEN DIE VERANTWOORDELIJK ZIJN VOOR INFECTIES BIJ MENSEN. WE ZULLEN EEN GEDETAILLEERDE MOLECULAIRE KARAKTERISERING UITVOEREN (MLST, PFGE, VOLLEDIGE GENOOMSEQUENCING OM VIRULENTIEGENEN EN EILANDEN VAN PATHOGENITEIT TE DEFINIËREN) VAN ST131 STAMMEN GEÏSOLEERD VAN VOEDSEL EN DIEREN, EN WE ZULLEN HUN VIRULENTIE IN VIVO BEPALEN IN EEN MODEL VAN MURINE SEPSIS. WE ZULLEN DE VERKREGEN GEGEVENS VERGELIJKEN MET DIE VAN DE ST131 STAMMEN DIE PATHOLOGIE BIJ MENSEN VEROORZAKEN. HET DOEL IS DAT DE RESULTATEN GEVOLGEN HEBBEN VOOR DE VOLKSGEZONDHEID EN DE VOEDSELVEILIGHEID DOOR EEN BETERE KENNIS VAN DE MECHANISMEN DIE DEZE KLONALE GROEP SUCCESVOL MAKEN VANUIT HET OOGPUNT VAN VIRULENTIE EN VERSPREIDING. DE WETENSCHAPPELIJKE IMPACT VAN DE RESULTATEN IS VOLLEDIG VERZEKERD EN GEACCREDITEERD DOOR DE HIGH IMPACT INDEX VAN DE PUBLICATIES DIE WE SINDS 2008 HEBBEN GEPRODUCEERD FORMASEMOS ONDERDEEL VAN HET INTERNATIONALE CONSORTIUM DAT DE INTERCONTINENTALE DISTRIBUTIE VAN DE KLONALE GROEP ST131 DEMONSTREERDE. (Dutch)
17 December 2021
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LO STUDIO DI RICERCA PROPOSTO IN QUESTA APPLICAZIONE RIENTRA NELLA SFIDA "SICUREZZA E QUALITÀ DEGLI ALIMENTI". IL GRUPPO CLONALE DI E. COLI ST131 ROMPE IL PARADIGMA DELL'INCOMPATIBILITÀ DEI GENI DELLA RESISTENZA AGLI ANTIBIOTICI E QUELLI DELLA VIRULENZA IN QUELLI DEI PATOGENI EXTRAINTESTINALI DI E. COLI (PREVEDI). SIN DALLA SUA IDENTIFICAZIONE A LIVELLO INTERCONTINENTALE, NEL 2008, QUESTO GRUPPO CLONALE HA AVUTO UNA SPETTACOLARE ESPANSIONE, ATTUALMENTE RAPPRESENTANDO OLTRE IL 50 % DEI CEPPI DI LATTAMASI A SPETTRO ESTESO (ESBL) CHE PRODUCONO BETA E OLTRE IL 30 % DEI CEPPI DI EXPEC RESISTENTI AI FARMACI. IN QUESTO PROGETTO VOGLIAMO DEFINIRE CHIARAMENTE LE VIE E LE FONTI DI TRASMISSIONE DEL GRUPPO CLONALE ST131, SE ESISTE UN RISCHIO, E QUALE GRADO DI RISCHIO NEL CONSUMO DI CARNE PROVENIENTE DA ANIMALI DA PRODUZIONE E QUALI MISURE DI CONTROLLO POSSONO ESSERE APPLICATE NELLA CATENA ALIMENTARE. VOGLIAMO ANCHE ANALIZZARE IL RUOLO DELLA FAUNA SELVATICA NELLA MANUTENZIONE E NELLA DIFFUSIONE DEI CEPPI ST131. NELLO SPECIFICO STUDIEREMO UCCELLI SELVATICI, VOLPI E GIABALIE, CHE A CAUSA DELLA LORO ESPLOSIONE DEMOGRAFICA MANTENGONO ATTUALMENTE UN IMPORTANTE CONTATTO CON GLI ANIMALI DI PRODUZIONE E GLI INSEDIAMENTI UMANI. SECONDO I NOSTRI DATI QUESTA È LA PRIMA VOLTA CHE VOLPI E JABALIES SONO INDAGATI COME PORTATORI DI CEPPI ST131, E ANCHE SE SE ST131 CEPPI DI UCCELLI SELVATICI SONO STATI ISOLATI IN DIVERSI PAESI, I LORO VIROTIPOS NON SONO STATI STABILITI NÉ CONFRONTATI CON I CEPPI RESPONSABILI DELLE INFEZIONI NELL'UOMO. ESEGUIREMO UNA DETTAGLIATA CARATTERIZZAZIONE MOLECOLARE (MLST, PFGE, SEQUENZIAMENTO COMPLETO DEL GENOMA PER DEFINIRE I GENI DELLA VIRULENZA E LE ISOLE DI PATOGENICITÀ) DEI CEPPI ST131 ISOLATI DAL CIBO E DAGLI ANIMALI, E DETERMINEREMO LA LORO VIRULENZA IN VIVO IN UN MODELLO DI SEPSI MURINA. CONFRONTIAMO I DATI OTTENUTI CON QUELLI DEI CEPPI ST131 CHE CAUSANO PATOLOGIA NELL'UOMO. L'OBIETTIVO È CHE I RISULTATI ABBIANO UN IMPATTO SULLA SALUTE PUBBLICA E SULLA SICUREZZA ALIMENTARE ATTRAVERSO UNA MAGGIORE CONOSCENZA DEI MECCANISMI CHE RENDONO QUESTO GRUPPO CLONALE EFFICACE DAL PUNTO DI VISTA DELLA VIRULENZA E DELLA DIFFUSIONE. L'IMPATTO SCIENTIFICO DEI RISULTATI È PIENAMENTE GARANTITO E ACCREDITATO DALL'INDICE AD ALTO IMPATTO DELLE PUBBLICAZIONI CHE ABBIAMO PRODOTTO DAL 2008 FORMASEMOS PARTE DEL CONSORZIO INTERNAZIONALE CHE HA DIMOSTRATO LA DISTRIBUZIONE INTERCONTINENTALE DEL GRUPPO CLONALE ST131. (Italian)
16 January 2022
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Lugo
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Identifiers
AGL2013-47852-R
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