The role of the burial environment in biomolecular archeology and ancient tuberculosis research processes (Q3056348): Difference between revisions
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(Created claim: summary (P836): L’archéologie biomoléculaire a un énorme potentiel dans la recherche d’agents pathogènes anciens, qui peuvent fournir des connaissances sur leurs processus d’évolution et de gratification. Ces connaissances peuvent être utilisées dans les modèles modernes de maladies infectieuses et dans l’élaboration de stratégies de lutte contre divers agents pathogènes. La tuberculose est une maladie d’au moins 8000 ans et la recherche sur l’évolution et la p...) |
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L’archéologie biomoléculaire a un énorme potentiel dans la recherche d’agents pathogènes anciens, qui peuvent fournir des connaissances sur leurs processus d’évolution et de gratification. Ces connaissances peuvent être utilisées dans les modèles modernes de maladies infectieuses et dans l’élaboration de stratégies de lutte contre divers agents pathogènes. La tuberculose est une maladie d’au moins 8000 ans et la recherche sur l’évolution et la propagation de Mycobacterium tuberculosis, son agent causal, peut aider à élaborer de nouvelles stratégies pour lutter efficacement contre cette maladie infectieuse. Des études montrent qu’il est possible de détecter et d’analyser les séquences d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons archéologiques, mais il est difficile de détecter et d’analyser des mycobactéries de l’environnement dans les sépultures. Caractériser l’effet du microbiome du sol dans les recherches anciennes sur l’ADN et étudier la présence du génome de l’agent tuberculeux dans des échantillons de matériel archéologique des XVe et XVIIIe siècles. Des scientifiques du Centre letton de recherche biomédicale et de l’Institut d’histoire letton de l’Université de Lettonie participeront au projet, représentant les secteurs de la biologie moléculaire et de la biomédicale et de l’archéologie. Le projet correspond à 3.5. «Autres sciences médicales» et 6.1. «Histoire et archéologie» pour les disciplines scientifiques et non liées à l’activité économique. Coûts du projet: 648 648 EUR (montant de l’aide du FEDER: 551 351 EUR), durée du projet: 36 mois (01.03.2017-29.02.2020). Dans le cadre du projet, trois études paléopathologiques et des analyses biomoléculaires de matériaux anthropiques (échantillons d’os et de tartre) obtenues à partir d’excavations du 15 au XVIIIe siècle sont prévues.2. Caractérisation bioarchéologique de l’environnement et microbiome environnemental.3. Caractérisation de la présence de microorganismes environnementaux et d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons archéologiques. La mise en œuvre de ce projet fournira de nouvelles connaissances sur le degré de contamination des échantillons archéologiques par des micro-organismes environnementaux, un enjeu très important pour le développement de la paléopathologie et de la recherche sur les agents pathogènes anciens. En outre, les études envisagées dans le projet, au cours desquelles les technologies de séquençage de la prochaine génération seront utilisées, fourniront un aperçu de la présence de M. tuberculosis dans le matériel anthropique letton. Dans le cadre du projet, plusieurs articles scientifiques originaux seront soumis pour publication, ainsi que les résultats seront présentés lors de conférences internationales. En général, la mise en œuvre du projet fournira des informations sur la présence d’ADN de micro-organismes environnementaux dans des échantillons archéologiques médiévaux, ce qui aidera à comprendre leur impact sur la recherche d’agents pathogènes anciens. Les tentatives de détection et de caractérisation de la présence d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons de matériel archéologique du XVe et XVIIIe siècle aideront à confirmer et à améliorer le diagnostic paléopathologique de la tuberculose et fourniront de nouvelles connaissances sur les processus de distribution de la tuberculose en Lettonie. Microbiome, bioarchéologie, ADN ancien, tuberculose. (French) | |||||||||||||||
| Property / summary: L’archéologie biomoléculaire a un énorme potentiel dans la recherche d’agents pathogènes anciens, qui peuvent fournir des connaissances sur leurs processus d’évolution et de gratification. Ces connaissances peuvent être utilisées dans les modèles modernes de maladies infectieuses et dans l’élaboration de stratégies de lutte contre divers agents pathogènes. La tuberculose est une maladie d’au moins 8000 ans et la recherche sur l’évolution et la propagation de Mycobacterium tuberculosis, son agent causal, peut aider à élaborer de nouvelles stratégies pour lutter efficacement contre cette maladie infectieuse. Des études montrent qu’il est possible de détecter et d’analyser les séquences d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons archéologiques, mais il est difficile de détecter et d’analyser des mycobactéries de l’environnement dans les sépultures. Caractériser l’effet du microbiome du sol dans les recherches anciennes sur l’ADN et étudier la présence du génome de l’agent tuberculeux dans des échantillons de matériel archéologique des XVe et XVIIIe siècles. Des scientifiques du Centre letton de recherche biomédicale et de l’Institut d’histoire letton de l’Université de Lettonie participeront au projet, représentant les secteurs de la biologie moléculaire et de la biomédicale et de l’archéologie. Le projet correspond à 3.5. «Autres sciences médicales» et 6.1. «Histoire et archéologie» pour les disciplines scientifiques et non liées à l’activité économique. Coûts du projet: 648 648 EUR (montant de l’aide du FEDER: 551 351 EUR), durée du projet: 36 mois (01.03.2017-29.02.2020). Dans le cadre du projet, trois études paléopathologiques et des analyses biomoléculaires de matériaux anthropiques (échantillons d’os et de tartre) obtenues à partir d’excavations du 15 au XVIIIe siècle sont prévues.2. Caractérisation bioarchéologique de l’environnement et microbiome environnemental.3. Caractérisation de la présence de microorganismes environnementaux et d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons archéologiques. La mise en œuvre de ce projet fournira de nouvelles connaissances sur le degré de contamination des échantillons archéologiques par des micro-organismes environnementaux, un enjeu très important pour le développement de la paléopathologie et de la recherche sur les agents pathogènes anciens. En outre, les études envisagées dans le projet, au cours desquelles les technologies de séquençage de la prochaine génération seront utilisées, fourniront un aperçu de la présence de M. tuberculosis dans le matériel anthropique letton. Dans le cadre du projet, plusieurs articles scientifiques originaux seront soumis pour publication, ainsi que les résultats seront présentés lors de conférences internationales. En général, la mise en œuvre du projet fournira des informations sur la présence d’ADN de micro-organismes environnementaux dans des échantillons archéologiques médiévaux, ce qui aidera à comprendre leur impact sur la recherche d’agents pathogènes anciens. Les tentatives de détection et de caractérisation de la présence d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons de matériel archéologique du XVe et XVIIIe siècle aideront à confirmer et à améliorer le diagnostic paléopathologique de la tuberculose et fourniront de nouvelles connaissances sur les processus de distribution de la tuberculose en Lettonie. Microbiome, bioarchéologie, ADN ancien, tuberculose. (French) / rank | |||||||||||||||
Normal rank | |||||||||||||||
| Property / summary: L’archéologie biomoléculaire a un énorme potentiel dans la recherche d’agents pathogènes anciens, qui peuvent fournir des connaissances sur leurs processus d’évolution et de gratification. Ces connaissances peuvent être utilisées dans les modèles modernes de maladies infectieuses et dans l’élaboration de stratégies de lutte contre divers agents pathogènes. La tuberculose est une maladie d’au moins 8000 ans et la recherche sur l’évolution et la propagation de Mycobacterium tuberculosis, son agent causal, peut aider à élaborer de nouvelles stratégies pour lutter efficacement contre cette maladie infectieuse. Des études montrent qu’il est possible de détecter et d’analyser les séquences d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons archéologiques, mais il est difficile de détecter et d’analyser des mycobactéries de l’environnement dans les sépultures. Caractériser l’effet du microbiome du sol dans les recherches anciennes sur l’ADN et étudier la présence du génome de l’agent tuberculeux dans des échantillons de matériel archéologique des XVe et XVIIIe siècles. Des scientifiques du Centre letton de recherche biomédicale et de l’Institut d’histoire letton de l’Université de Lettonie participeront au projet, représentant les secteurs de la biologie moléculaire et de la biomédicale et de l’archéologie. Le projet correspond à 3.5. «Autres sciences médicales» et 6.1. «Histoire et archéologie» pour les disciplines scientifiques et non liées à l’activité économique. Coûts du projet: 648 648 EUR (montant de l’aide du FEDER: 551 351 EUR), durée du projet: 36 mois (01.03.2017-29.02.2020). Dans le cadre du projet, trois études paléopathologiques et des analyses biomoléculaires de matériaux anthropiques (échantillons d’os et de tartre) obtenues à partir d’excavations du 15 au XVIIIe siècle sont prévues.2. Caractérisation bioarchéologique de l’environnement et microbiome environnemental.3. Caractérisation de la présence de microorganismes environnementaux et d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons archéologiques. La mise en œuvre de ce projet fournira de nouvelles connaissances sur le degré de contamination des échantillons archéologiques par des micro-organismes environnementaux, un enjeu très important pour le développement de la paléopathologie et de la recherche sur les agents pathogènes anciens. En outre, les études envisagées dans le projet, au cours desquelles les technologies de séquençage de la prochaine génération seront utilisées, fourniront un aperçu de la présence de M. tuberculosis dans le matériel anthropique letton. Dans le cadre du projet, plusieurs articles scientifiques originaux seront soumis pour publication, ainsi que les résultats seront présentés lors de conférences internationales. En général, la mise en œuvre du projet fournira des informations sur la présence d’ADN de micro-organismes environnementaux dans des échantillons archéologiques médiévaux, ce qui aidera à comprendre leur impact sur la recherche d’agents pathogènes anciens. Les tentatives de détection et de caractérisation de la présence d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons de matériel archéologique du XVe et XVIIIe siècle aideront à confirmer et à améliorer le diagnostic paléopathologique de la tuberculose et fourniront de nouvelles connaissances sur les processus de distribution de la tuberculose en Lettonie. Microbiome, bioarchéologie, ADN ancien, tuberculose. (French) / qualifier | |||||||||||||||
point in time: 25 November 2021
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Revision as of 19:33, 25 November 2021
Project Q3056348 in Latvia
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | The role of the burial environment in biomolecular archeology and ancient tuberculosis research processes |
Project Q3056348 in Latvia |
Statements
550,823.15 Euro
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648,027.24 Euro
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85.0 percent
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1 March 2017
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29 February 2020
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Atvasināta publiska persona "Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs"
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56°58'59.81"N, 24°1'53.44"E
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56°57'10.22"N, 24°6'48.53"E
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56°58'32.05"N, 24°11'23.93"E
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Biomolekulārai arheoloģijai ir milzīgs potenciāls seno patogēnu izpētē, kas var sniegt zināšanas par to evolūcijas un izpatīšanas procesiem. Šis zināšanas var tikt izmantotas mūsdienu infekciju slimību modeļos un dažādu patogēnu apkarošanas stratēģiju izveidē. Tuberkuloze ir vismaz 8000 gadus veca slimība, un tās izraisītāja Mycobacterium tuberculosis evolūcijas un izplatības izpēte var palīdzēt izveidot jaunas stratēģijas šīs infekcijas slimības veiksmīgai apkarošanai. Pētījumi liecina, ka M. tuberculosis DNS sekvenču detektēšana un analīze arheoloģiskos paraugos ir iespējama, tomēr tā ir apgrūtināta ar vides mikobaktēriju iespējamo klātbūtni apbedījumos.Projekta mērķis: Raksturot augsnes mikrobioma efektu senās DNS izpētes procesos un izpētīt tuberkulozes izraisītāja genoma klātbūtni 15.-18. gadsimta arheologiska materiāla paraugos.Mērķa sasniegšanai ir plānoti fundamentāli, starpdisciplināri pētījumi sadarbības projekta ietvaros. Projektā piedalīsies zinātnieki no Latvijas Biomedicīnas Pētījumu Centra un Latvijas Universitātes Latvijas Vēstures Institūta, kas pārstāv Molekulārās bioloģijas un biomedicīnas un Arheoloģijas sektorus. Projekts atbilst 3.5. “Cita medicīnas zinātne” un 6.1. “Vēsture un Arheoloģija” zinātnes nozarēm un nav saistīts ar saimniecisku darbību. Projekta izmaksas: 648 648 EUR (ERAF atbalsta apjoms: 551 351 EUR), projekta ilgums: 36 mēneši (01.03.2017 – 29.02.2020). Projekta ietvaros ir paredzētas trīs aktivitātes:1.Arheoloģiskajos izrakumos iegūtā 15.-18. gadsimta antropoģiska materiāla (kaulu un zobakmens paraugu) paleopatoloģiskā izpēte un biomolekulārā analīze.2.Apbedījuma vides bioarheoloģiskā raksturošana un vides mikrobioma izpēte.3.Vides mikroorganismu un M. tuberculosis DNS klātbūtnes raksturošana arheoloģiskos paraugos.Šī projekta izpilde sniegs jaunas zināšanas par arheoloģisko paraugu kontaminācijas pakāpi ar vides mikroorganismiem, kas šobrīd ir ļoti svarīgs jautājums paleopatoloģijas un seno patogēnu izpētes attīstībai. Turklāt projektā paredzētie pētījumi, kuru laikā tiks izmantotas nākošās pāaudzes sekvenēšanas tehnoloģijas, dos ieskatu par M. tuberculosis klātbūtni Latvijas antropoģiska materiālā. Projekta ietvaros publicēšanai tiks iesniegti vairāki oriģināli zinātniskie raksti, kā arī rezultāti tiks prezentēti starptautiskās konferencēs.Kopumā, projekta izpilde sniegs informāciju par vides mikroorganismu DNS klātbūtni Viduslaiku arheoloģiskos paraugos, kas palīdzēs izprast to ietekmi uz seno patogēnu pētījumiem. Projektā paredzētie mēģinājumi veikt M. tuberculosis DNS klātbūtnes noteikšanu un raksturošanu 15.-18. gadsimta arheologiska materiāla paraugos palīdzēs apstiprināt un uzlabot tuberkulozes paleopatoloģisku diagnozi un sniegs jaunas zināšanas par tuberkulozes izplatības procesiem Latvijā.Atslēgas vārdi: Mikrobioms, bioarheoloģija, senā DNS, tuberkuloze. (Latvian)
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Biomolecular archaeology has enormous potential in researching ancient pathogens, which can provide knowledge of their evolution and spoiling processes. This knowledge can be used in modern models of infectious diseases and in developing strategies to combat various pathogens. Tuberculosis is at least 8000 years old and research into the evolution and spread of Mycobacterium tuberculosis may help to develop new strategies for the successful control of this infectious disease. Research has shown that detection and analysis of M. tuberculosis DNA sequences in archaeological samples is possible, but it is difficult with the possible presence of environmental mycobacteria in burials. To characterise the effect of soil microbiome in ancient DNA research processes and to investigate the presence of tuberculosis-causing genome in samples of 15th-18th century archaeology material. The project will be attended by scientists from Latvian Biomedical Research Centre and University of Latvia Institute of History, which represents Molecular Biology and Biomedical and Archaeology sectors. The project is in line with 3.5. “Other medical science” and 6.1. “History and Archaeology” in scientific fields and not related to economic activity. Project costs: EUR 648648 (the amount of the ERDF aid: EUR 551351), duration of the project: 36 months (01.03.2017-29.02.2020). Three activities are planned within the framework of the project: 1.Paleopathological research and biomolecular analysis of anthropogenic material (bone and tartar samples) obtained from archaeological excavations.2. Bioarcheological characterisation of burial environment and environmental microbiome.3. characterisation of environmental microorganisms and M. tuberculosis DNA in archaeological samples. Moreover, the studies envisaged in the project, during which the technologies for sequencing the next generation will be used, will provide an insight into the presence of M. tuberculosis in Latvian anthropological material. Within the framework of the project several original scientific articles will be submitted for publication, as well as the results will be presented at international conferences.In general, the implementation of the project will provide information on the presence of environmental micro-organism DNA in Medieval archaeological samples, which will help to understand their impact on the research of ancient pathogens. The project’s attempts to detect and characterise the presence of M. tuberculosis DNA in samples of 15th-18th century archaeological material will help confirm and improve the paleopathological diagnosis of tuberculosis and provide new knowledge about tuberculosis spread processes in Latvia. Microbiome, bioarcheology, ancient DNA, tuberculosis. (English)
15 July 2021
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L’archéologie biomoléculaire a un énorme potentiel dans la recherche d’agents pathogènes anciens, qui peuvent fournir des connaissances sur leurs processus d’évolution et de gratification. Ces connaissances peuvent être utilisées dans les modèles modernes de maladies infectieuses et dans l’élaboration de stratégies de lutte contre divers agents pathogènes. La tuberculose est une maladie d’au moins 8000 ans et la recherche sur l’évolution et la propagation de Mycobacterium tuberculosis, son agent causal, peut aider à élaborer de nouvelles stratégies pour lutter efficacement contre cette maladie infectieuse. Des études montrent qu’il est possible de détecter et d’analyser les séquences d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons archéologiques, mais il est difficile de détecter et d’analyser des mycobactéries de l’environnement dans les sépultures. Caractériser l’effet du microbiome du sol dans les recherches anciennes sur l’ADN et étudier la présence du génome de l’agent tuberculeux dans des échantillons de matériel archéologique des XVe et XVIIIe siècles. Des scientifiques du Centre letton de recherche biomédicale et de l’Institut d’histoire letton de l’Université de Lettonie participeront au projet, représentant les secteurs de la biologie moléculaire et de la biomédicale et de l’archéologie. Le projet correspond à 3.5. «Autres sciences médicales» et 6.1. «Histoire et archéologie» pour les disciplines scientifiques et non liées à l’activité économique. Coûts du projet: 648 648 EUR (montant de l’aide du FEDER: 551 351 EUR), durée du projet: 36 mois (01.03.2017-29.02.2020). Dans le cadre du projet, trois études paléopathologiques et des analyses biomoléculaires de matériaux anthropiques (échantillons d’os et de tartre) obtenues à partir d’excavations du 15 au XVIIIe siècle sont prévues.2. Caractérisation bioarchéologique de l’environnement et microbiome environnemental.3. Caractérisation de la présence de microorganismes environnementaux et d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons archéologiques. La mise en œuvre de ce projet fournira de nouvelles connaissances sur le degré de contamination des échantillons archéologiques par des micro-organismes environnementaux, un enjeu très important pour le développement de la paléopathologie et de la recherche sur les agents pathogènes anciens. En outre, les études envisagées dans le projet, au cours desquelles les technologies de séquençage de la prochaine génération seront utilisées, fourniront un aperçu de la présence de M. tuberculosis dans le matériel anthropique letton. Dans le cadre du projet, plusieurs articles scientifiques originaux seront soumis pour publication, ainsi que les résultats seront présentés lors de conférences internationales. En général, la mise en œuvre du projet fournira des informations sur la présence d’ADN de micro-organismes environnementaux dans des échantillons archéologiques médiévaux, ce qui aidera à comprendre leur impact sur la recherche d’agents pathogènes anciens. Les tentatives de détection et de caractérisation de la présence d’ADN de M. tuberculosis dans des échantillons de matériel archéologique du XVe et XVIIIe siècle aideront à confirmer et à améliorer le diagnostic paléopathologique de la tuberculose et fourniront de nouvelles connaissances sur les processus de distribution de la tuberculose en Lettonie. Microbiome, bioarchéologie, ADN ancien, tuberculose. (French)
25 November 2021
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Rātsupītes iela 1 k-1, Rīga, LV-1067
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Kalpaka bulvāris 4, Rīga, LV-1050
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Lielvārdes iela 24, Rīga, LV-1006
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Identifiers
1.1.1.1/16/A/101
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